View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12838_low_13 (Length: 270)

Name: NF12838_low_13
Description: NF12838
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12838_low_13
NF12838_low_13
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (18-260)||(11325955-11326197)
chr5 (18-260)||(13184407-13184649)
chr5 (18-260)||(13440253-13440495)
chr5 (18-260)||(33877408-33877650)
chr5 (18-257)||(22888631-22888870)
chr5 (18-260)||(29888841-29889083)
chr5 (18-255)||(25199190-25199427)
chr5 (18-260)||(23892367-23892609)
chr5 (18-260)||(9548302-9548544)
chr5 (18-260)||(24687916-24688158)
chr5 (18-260)||(11549515-11549757)
chr5 (18-260)||(22998873-22999115)
chr5 (18-260)||(23717747-23717989)
chr5 (18-260)||(23752209-23752451)
chr5 (18-260)||(30934794-30935036)
chr5 (18-260)||(24970179-24970421)
chr5 (18-260)||(15658519-15658761)
chr5 (18-239)||(33777648-33777869)
chr5 (18-260)||(18500489-18500731)
chr5 (18-260)||(28649396-28649638)
chr5 (18-260)||(33516517-33516759)
chr5 (18-260)||(9317612-9317854)
chr5 (18-260)||(12132316-12132558)
chr5 (18-260)||(13324588-13324830)
chr5 (18-260)||(30152179-30152421)
chr5 (18-260)||(31431601-31431843)
chr5 (18-260)||(40473308-40473550)
chr5 (18-260)||(43078413-43078655)
chr5 (18-190)||(31826236-31826408)
chr5 (18-260)||(18375171-18375413)
chr5 (18-260)||(24681601-24681843)
chr5 (18-260)||(24724128-24724370)
chr5 (18-260)||(29966825-29967067)
chr5 (18-260)||(30029576-30029818)
chr5 (18-260)||(37755141-37755383)
chr5 (18-239)||(8665255-8665476)
chr5 (18-239)||(15758637-15758858)
chr5 (18-187)||(32599304-32599473)
chr5 (18-190)||(37358472-37358644)
chr5 (18-190)||(37671312-37671484)
chr5 (18-260)||(3789702-3789944)
chr5 (18-260)||(34616679-34616921)
chr5 (18-190)||(2511212-2511384)
chr5 (18-190)||(26480553-26480725)
chr5 (18-169)||(28959636-28959787)
chr5 (18-260)||(5638071-5638313)
chr5 (18-260)||(6874466-6874708)
chr5 (18-260)||(30168630-30168872)
chr5 (18-188)||(37770818-37770988)
chr5 (18-239)||(41674870-41675091)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (18-260)||(31088212-31088454)
chr7 (18-260)||(45733613-45733855)
chr7 (18-260)||(2108753-2108995)
chr7 (18-260)||(26484847-26485089)
chr7 (18-260)||(2775512-2775754)
chr7 (18-260)||(39210771-39211013)
chr7 (18-260)||(4200700-4200942)
chr7 (18-260)||(16449746-16449988)
chr7 (18-260)||(26682748-26682990)
chr7 (18-260)||(16041476-16041718)
chr7 (18-239)||(16518185-16518406)
chr7 (18-239)||(10916637-10916858)
chr7 (18-239)||(16503149-16503370)
chr7 (18-260)||(2154726-2154968)
chr7 (18-260)||(11424524-11424766)
chr7 (18-260)||(5128145-5128387)
chr7 (18-260)||(26274842-26275084)
chr7 (18-260)||(3445459-3445701)
chr7 (18-260)||(26435410-26435652)
chr7 (18-260)||(26537618-26537860)
chr7 (18-260)||(4144871-4145113)
chr7 (18-260)||(26669662-26669904)
chr7 (18-260)||(31564138-31564380)
chr7 (18-260)||(5147088-5147330)
chr7 (18-260)||(11441725-11441967)
chr7 (18-260)||(24592289-24592531)
chr7 (18-260)||(26319617-26319859)
chr7 (18-190)||(45387496-45387668)
chr7 (18-260)||(9618804-9619046)
chr7 (33-190)||(16736278-16736435)
chr7 (33-190)||(16751332-16751489)
chr7 (33-190)||(17523700-17523857)
chr7 (33-190)||(17529358-17529515)
chr7 (18-260)||(31125073-31125315)
chr7 (18-253)||(18540952-18541187)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (18-260)||(3784802-3785044)
chr2 (18-260)||(34157159-34157400)
chr2 (18-256)||(16163747-16163985)
chr2 (18-260)||(27118836-27119078)
chr2 (18-260)||(31891179-31891421)
chr2 (18-260)||(21703015-21703257)
chr2 (18-257)||(19456275-19456514)
chr2 (18-256)||(34303158-34303396)
chr2 (18-260)||(22925879-22926121)
chr2 (18-260)||(9349833-9350075)
chr2 (18-260)||(27434295-27434537)
chr2 (18-260)||(28882362-28882604)
chr2 (18-260)||(23128417-23128659)
chr2 (18-260)||(12655690-12655932)
chr2 (18-260)||(20838066-20838308)
chr2 (18-260)||(12586958-12587200)
chr2 (18-239)||(40233659-40233880)
chr2 (18-169)||(27393117-27393268)
chr2 (18-260)||(13936395-13936637)
chr2 (18-260)||(27777370-27777612)
chr2 (18-260)||(27817128-27817370)
chr2 (18-260)||(16829189-16829431)
chr2 (18-260)||(16892050-16892292)
chr2 (18-260)||(32049946-32050188)
chr2 (18-239)||(37375309-37375530)
chr2 (18-260)||(27803855-27804097)
chr2 (18-260)||(34286502-34286744)
chr2 (18-260)||(34291562-34291804)
chr2 (18-260)||(34861828-34862070)
chr2 (18-260)||(39051673-39051915)
chr2 (18-260)||(12716453-12716695)
chr2 (18-260)||(37685760-37686002)
chr2 (18-260)||(37701025-37701267)
chr2 (18-260)||(37925641-37925883)
chr2 (18-169)||(260695-260846)
chr2 (18-260)||(21677033-21677275)
chr2 (18-260)||(39890222-39890464)
chr2 (18-239)||(31876429-31876650)
chr2 (18-260)||(19416350-19416592)
chr2 (33-260)||(11635037-11635264)
chr2 (33-260)||(11641226-11641453)
chr2 (18-115)||(34279597-34279694)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (18-260)||(24460467-24460709)
chr4 (18-257)||(15284793-15285032)
chr4 (18-257)||(1900424-1900663)
chr4 (18-257)||(15228037-15228276)
chr4 (18-253)||(14235394-14235629)
chr4 (18-260)||(14665185-14665427)
chr4 (18-260)||(17014167-17014409)
chr4 (18-260)||(24592176-24592418)
chr4 (18-256)||(15391204-15391442)
chr4 (18-260)||(36344377-36344619)
chr4 (18-260)||(18800475-18800717)
chr4 (18-260)||(5006040-5006282)
chr4 (18-260)||(6570020-6570262)
chr4 (18-260)||(31126380-31126622)
chr4 (18-260)||(14763166-14763408)
chr4 (18-260)||(27163179-27163421)
chr4 (18-260)||(40105500-40105742)
chr4 (18-260)||(14098708-14098950)
chr4 (18-260)||(21969868-21970110)
chr4 (18-260)||(33673660-33673902)
chr4 (18-260)||(39850805-39851047)
chr4 (18-260)||(54833554-54833796)
chr4 (18-260)||(30753921-30754163)
chr4 (18-253)||(34188829-34189064)
chr4 (18-253)||(24112829-24113064)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (18-260)||(8892116-8892357)
chr6 (18-260)||(8903351-8903592)
chr6 (18-260)||(14143090-14143332)
chr6 (18-260)||(26788093-26788335)
chr6 (18-260)||(27196466-27196708)
chr6 (18-260)||(27252532-27252774)
chr6 (18-260)||(28162806-28163048)
chr6 (18-260)||(13521878-13522120)
chr6 (18-260)||(33374061-33374303)
chr6 (18-224)||(22456775-22456981)
chr6 (18-260)||(27290175-27290417)
chr6 (18-260)||(24863866-24864108)
chr6 (18-260)||(13298756-13298998)
chr6 (18-260)||(22934685-22934927)
chr6 (18-260)||(23857130-23857372)
chr6 (18-260)||(24304423-24304665)
chr6 (18-260)||(26989150-26989392)
chr6 (18-239)||(16750003-16750224)
chr6 (18-260)||(15424122-15424364)
chr6 (18-260)||(29549624-29549866)
chr6 (18-260)||(26918529-26918771)
chr6 (18-260)||(27272385-27272627)
chr6 (18-190)||(27000222-27000394)
chr6 (18-260)||(30557821-30558063)
chr6 (18-260)||(3696230-3696472)
chr6 (18-260)||(27359797-27360039)
chr6 (18-260)||(27450140-27450382)
chr6 (18-260)||(29573162-29573404)
chr6 (18-260)||(34463151-34463393)
chr6 (33-190)||(20160865-20161022)
chr6 (33-190)||(22171809-22171966)
chr6 (18-190)||(4757913-4758085)
chr6 (18-190)||(4773155-4773327)
chr6 (75-257)||(17092248-17092430)
chr6 (18-260)||(27007876-27008118)
chr6 (18-239)||(16674288-16674509)
chr6 (18-239)||(17025426-17025647)
chr6 (18-98)||(22477240-22477320)
chr6 (18-190)||(28207603-28207775)
chr6 (18-260)||(4545580-4545822)
chr6 (18-260)||(16943832-16944074)
chr6 (18-260)||(29501564-29501806)
chr6 (18-190)||(4525435-4525607)
chr6 (18-190)||(26116285-26116457)
chr6 (18-169)||(26777511-26777662)
chr6 (18-260)||(4723939-4724181)
chr6 (18-260)||(27485278-27485520)
chr6 (18-260)||(27044536-27044779)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (18-260)||(4626057-4626299)
chr3 (18-260)||(5713340-5713582)
chr3 (18-260)||(5724250-5724492)
chr3 (18-260)||(5756985-5757227)
chr3 (18-260)||(5767876-5768118)
chr3 (18-260)||(31034020-31034262)
chr3 (18-260)||(32292865-32293107)
chr3 (18-260)||(5652500-5652742)
chr3 (18-260)||(17993687-17993929)
chr3 (18-257)||(16626412-16626651)
chr3 (18-255)||(18530501-18530738)
chr3 (18-260)||(8296085-8296327)
chr3 (18-260)||(15740997-15741239)
chr3 (18-260)||(6192429-6192671)
chr3 (18-260)||(15892609-15892851)
chr3 (18-260)||(18330782-18331024)
chr3 (18-260)||(29148658-29148900)
chr3 (19-260)||(18051376-18051617)
chr3 (18-260)||(8301170-8301412)
chr3 (18-260)||(4796556-4796798)
chr3 (18-228)||(22387513-22387723)
chr3 (33-260)||(4417047-4417274)
chr3 (18-260)||(7073325-7073567)
chr3 (18-260)||(29664873-29665115)
chr3 (18-260)||(35880879-35881121)
chr3 (18-260)||(4721744-4721986)
chr3 (18-260)||(11110252-11110494)
chr3 (18-260)||(20576750-20576992)
chr3 (18-260)||(28021388-28021630)
chr3 (18-260)||(28115857-28116099)
chr3 (18-239)||(8211851-8212072)
chr3 (18-260)||(10396246-10396488)
chr3 (18-260)||(18292256-18292498)
chr3 (18-260)||(48466040-48466282)
chr3 (18-260)||(4346590-4346832)
chr3 (18-260)||(5467098-5467340)
chr3 (18-260)||(18276955-18277197)
chr3 (18-260)||(18307557-18307799)
chr3 (18-260)||(21674806-21675048)
chr3 (18-260)||(22870759-22871001)
chr3 (18-260)||(22885818-22886060)
chr3 (18-260)||(36996980-36997222)
chr3 (18-260)||(51782136-51782378)
chr3 (18-239)||(51797226-51797447)
chr3 (18-260)||(24328272-24328514)
chr3 (18-260)||(5013825-5014067)
chr3 (18-260)||(18242852-18243094)
chr3 (18-239)||(31964397-31964618)
chr3 (18-239)||(47023566-47023787)
chr3 (18-239)||(50133995-50134216)
chr3 (18-190)||(5596330-5596502)
chr3 (18-190)||(7996675-7996847)
chr3 (18-190)||(10643183-10643355)
chr3 (18-190)||(17984929-17985101)
chr3 (18-260)||(5609225-5609467)
chr3 (18-260)||(6542365-6542607)
chr3 (18-260)||(28339415-28339657)
chr3 (18-139)||(18225304-18225425)
chr3 (18-250)||(32439267-32439499)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (18-260)||(44563253-44563493)
chr8 (18-260)||(19658861-19659102)
chr8 (18-260)||(33244817-33245059)
chr8 (18-260)||(18710738-18710980)
chr8 (18-256)||(22080703-22080941)
chr8 (18-260)||(19688250-19688492)
chr8 (18-239)||(27608747-27608968)
chr8 (30-260)||(16283613-16283843)
chr8 (18-260)||(14557776-14558018)
chr8 (18-260)||(16277706-16277948)
chr8 (18-260)||(2137080-2137322)
chr8 (28-260)||(189256-189488)
chr8 (18-260)||(31489571-31489813)
chr8 (18-190)||(12092615-12092787)
chr8 (18-260)||(29829474-29829716)
chr8 (33-260)||(19674608-19674835)
chr8 (18-260)||(3329328-3329570)
chr8 (18-260)||(19208181-19208423)
chr8 (18-260)||(19286614-19286856)
chr8 (18-260)||(28361776-28362018)
chr8 (18-239)||(31354676-31354897)
chr8 (18-260)||(9354774-9355017)
chr8 (18-260)||(33258875-33259117)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (18-260)||(28152013-28152255)
chr1 (18-260)||(20340197-20340439)
chr1 (18-257)||(16207896-16208135)
chr1 (18-257)||(20461232-20461471)
chr1 (18-260)||(51638369-51638611)
chr1 (18-260)||(10962821-10963063)
chr1 (18-260)||(28585132-28585374)
chr1 (18-260)||(41793170-41793412)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (18-260)||(2520-2762)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (18-194)||(1846-2021)
scaffold0415 (18-260)||(6165-6408)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (18-194)||(20540-20715)
scaffold0124 (18-260)||(30604-30846)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (18-259)||(27444-27685)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (18-260)||(39931-40173)
scaffold0089 (18-260)||(46847-47089)
scaffold0089 (21-260)||(29918-30157)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (18-252)||(488-722)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (18-239)||(12-233)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (18-149)||(1-132)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-256)||(21713-21951)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (18-260)||(9718-9960)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (18-260)||(26063-26305)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (18-260)||(7101-7343)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (18-260)||(14792-15034)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (18-260)||(8928-9170)
scaffold0159 (18-260)||(20167-20409)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (18-190)||(8101-8273)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (54-168)||(46756-46872)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 11325955 - 11326197
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11325955 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 11326054  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326055 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 11326154  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326155 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 11326197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13184649 - 13184407
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13184649 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13184550  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184549 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13184450  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13184449 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 13184407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13440495 - 13440253
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13440495 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13440396  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440395 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13440296  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13440295 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctg 13440253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 33877408 - 33877650
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33877408 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 33877507  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |  |||| ||| ||||    
T  33877508 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 33877607  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33877608 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 33877650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 22888631 - 22888870
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  22888631 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 22888730  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||| ||||| |||||||    
T  22888731 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaac 22888830  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  22888831 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctct 22888870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29889083 - 29888841
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  29889083 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 29888984  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  29888983 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 29888884  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29888883 tcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctg 29888841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 25199190 - 25199427
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  25199190 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 25199289  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  25199290 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 25199389  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcct 255  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  25199390 tcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcct 25199427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 23892367 - 23892609
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  23892367 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 23892466  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  23892467 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 23892566  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23892567 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 23892609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9548544 - 9548302
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9548544 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 9548445  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  9548444 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9548345  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548344 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctg 9548302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24688158 - 24687916
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24688158 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24688059  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||||||||    
T  24688058 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 24687959  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24687958 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24687916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 11549515 - 11549757
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11549515 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11549614  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  11549615 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11549714  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11549715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11549757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22999115 - 22998873
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22999115 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22999016  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  22999015 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22998916  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  22998915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22998873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23717989 - 23717747
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23717989 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23717890  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  23717889 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23717790  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  23717789 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23717747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23752451 - 23752209
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23752451 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23752352  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  23752351 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23752252  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  23752251 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23752209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30934794 - 30935036
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30934794 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 30934893  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||  | |||||    
T  30934894 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaac 30934993  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  30934994 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 30935036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 24970179 - 24970421
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  24970179 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatg 24970278  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||  |||||||||||| |||   || ||  ||||| |  ||||    
T  24970279 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24970378  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  24970379 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 24970421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15658761 - 15658519
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15658761 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15658662  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  15658661 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15658562  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  15658561 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctg 15658519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 33777648 - 33777869
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33777648 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 33777747  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  33777748 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 33777847  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  33777848 tcctctggtgcctctacacatc 33777869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18500731 - 18500489
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  18500731 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18500632  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||  | | ||  ||||||| |||||    
T  18500631 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaac 18500532  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18500531 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18500489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28649396 - 28649638
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28649396 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28649495  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28649496 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28649595  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28649596 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28649638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 33516517 - 33516759
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  33516517 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33516616  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  33516617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33516716  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  33516717 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33516759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 9317612 - 9317854
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  9317612 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9317711  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  9317712 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9317811  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  9317812 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9317854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 12132316 - 12132558
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  12132316 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12132415  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  12132416 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12132515  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  12132516 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12132558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13324830 - 13324588
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  13324830 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 13324731  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  13324730 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13324631  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
     ||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  13324630 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13324588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30152179 - 30152421
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  30152179 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30152278  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  30152279 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 30152378  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||||||    
T  30152379 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 30152421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 31431601 - 31431843
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  31431601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31431700  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  31431701 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31431800  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || || ||| || ||||| |||| ||||||    
T  31431801 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 31431843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40473550 - 40473308
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  40473550 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 40473451  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  40473450 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40473351  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  40473350 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 40473308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 43078413 - 43078655
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  43078413 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 43078512  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  43078513 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 43078612  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  43078613 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 43078655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31826408 - 31826236
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31826408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31826309  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  31826308 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcc 31826236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18375413 - 18375171
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  18375413 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18375314  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  18375313 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18375214  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18375213 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 24681601 - 24681843
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  24681601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24681700  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  24681701 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24681800  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24681801 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24681843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 24724128 - 24724370
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  24724128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24724227  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  24724228 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24724327  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24724328 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24724370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29967067 - 29966825
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  29967067 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29966968  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  29966967 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29966868  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29966867 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29966825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30029576 - 30029818
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  30029576 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30029675  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  30029676 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30029775  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30029776 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30029818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 37755141 - 37755383
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  37755141 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37755240  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  37755241 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37755340  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||||||    
T  37755341 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 37755383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8665476 - 8665255
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  8665476 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8665377  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  8665376 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8665277  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  8665276 tcctctggtgcctctgcacatc 8665255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15758858 - 15758637
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  15758858 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 15758759  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  15758758 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15758659  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  15758658 tcctctggtgcctctgcacatc 15758637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32599473 - 32599304
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  32599473 catcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32599374  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 187  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||    
T  32599373 tcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagc 32599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37358644 - 37358472
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||      
T  37358644 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataata 37358545  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  37358544 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 37358472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37671484 - 37671312
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  37671484 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37671385  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  37671384 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 37671312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 3789702 - 3789944
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  3789702 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3789801  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  3789802 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3789901  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||| ||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  3789902 tcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3789944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 34616679 - 34616921
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  34616679 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34616778  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  34616779 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34616878  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  34616879 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34616921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 2511212 - 2511384
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  2511212 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 2511311  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  2511312 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 2511384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 26480553 - 26480725
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26480553 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26480652  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||||||    
T  26480653 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 26480725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28959787 - 28959636
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28959787 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28959688  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 169  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  28959687 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgat 28959636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5638071 - 5638313
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| |    
T  5638071 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatg 5638170  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  5638171 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5638270  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  5638271 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5638313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 6874466 - 6874708
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  6874466 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6874565  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  6874566 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6874665  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  6874666 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6874708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30168630 - 30168872
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  30168630 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatg 30168729  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||| ||| |||| |||   || ||  | || || |||||    
T  30168730 tcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30168829  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30168830 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30168872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37770988 - 37770818
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  37770988 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37770889  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagct 188  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||    
T  37770888 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagct 37770818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 41674870 - 41675091
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  41674870 catcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41674969  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  41674970 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 41675069  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  41675070 tcctctggtgcctctacacatc 41675091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31088454 - 31088212
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31088454 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 31088355  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088354 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31088255  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088254 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 31088212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 45733613 - 45733855
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45733613 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 45733712  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733713 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 45733812  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733813 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 45733855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2108995 - 2108753
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108995 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2108896  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||| ||| ||||    
T  2108895 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaac 2108796  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2108795 tcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctg 2108753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485089
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26484847 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26484946  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  26484947 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26485046  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26485047 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26485089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 2775512 - 2775754
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2775512 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2775611  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  2775612 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 2775711  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2775712 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 2775754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39211013 - 39210771
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39211013 catcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 39210914  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  39210913 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 39210814  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39210813 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 39210771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 4200700 - 4200942
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4200700 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 4200799  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  4200800 tccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 4200899  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4200900 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 4200942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16449988 - 16449746
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16449988 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacg 16449889  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||    
T  16449888 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaac 16449789  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16449788 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctg 16449746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26682990 - 26682748
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26682990 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 26682891  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  26682890 tccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26682791  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26682790 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26682748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 16041476 - 16041718
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| || |    
T  16041476 catcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 16041575  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||    
T  16041576 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 16041675  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  16041676 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctg 16041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16518406 - 16518185
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16518406 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 16518307  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || || |||||||| |||||    
T  16518306 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16518207  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  16518206 tcctctggtgcctctacacatc 16518185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10916858 - 10916637
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10916858 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 10916759  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  10916758 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 10916659  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  10916658 tcctctggtgcctctacacatc 10916637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16503370 - 16503149
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16503370 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16503271  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || || |||||||| |||||    
T  16503270 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16503171  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  16503170 tcctctggtgcctctacacatc 16503149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154968
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2154726 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2154825  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  2154826 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2154925  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  2154926 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 2154968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11424766 - 11424524
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11424766 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11424667  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  11424666 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11424567  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11424566 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11424524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5128145 - 5128387
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5128145 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 5128244  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||   |||||| | |||    
T  5128245 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaac 5128344  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  5128345 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 5128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26275084 - 26274842
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26275084 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26274985  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26274984 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26274885  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26274884 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26274842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 3445459 - 3445701
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  3445459 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3445558  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||   || ||  | || || |||||    
T  3445559 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 3445658  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  3445659 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3445701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 26435410 - 26435652
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  26435410 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26435509  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26435510 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26435609  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26435610 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26435652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26537860 - 26537618
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26537860 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26537761  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26537760 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26537661  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26537660 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26537618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4145113 - 4144871
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  4145113 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 4145014  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  4145013 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4144914  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4144913 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4144871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26669904 - 26669662
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26669904 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26669805  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26669804 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26669705  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26669704 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26669662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31564380 - 31564138
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  31564380 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31564281  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  31564280 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31564181  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  31564180 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31564138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5147330 - 5147088
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  5147330 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 5147231  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||   || ||  | ||||| | |||    
T  5147230 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 5147131  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  5147130 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5147088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 11441725 - 11441967
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  11441725 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 11441824  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  11441825 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 11441924  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11441925 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11441967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24592531 - 24592289
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  24592531 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24592432  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  24592431 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24592332  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24592331 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24592289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26319859 - 26319617
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26319859 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26319760  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26319759 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26319660  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26319659 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26319617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 45387496 - 45387668
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  45387496 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 45387595  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||||||    
T  45387596 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 45387668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 9618804 - 9619046
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  9618804 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9618903  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  9618904 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9619003  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  9619004 tcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9619046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16736435 - 16736278
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  16736435 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16736336  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  16736335 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 16736278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16751489 - 16751332
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  16751489 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16751390  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  16751389 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 16751332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 17523700 - 17523857
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  17523700 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17523799  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  17523800 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 17523857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17529515 - 17529358
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  17529515 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17529416  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  17529415 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 17529358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 31125073 - 31125315
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31125073 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31125172  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||  |||| ||    
T  31125173 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccac 31125272  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  31125273 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31125315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Original strand, 18540952 - 18541187
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  18540952 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 18541051  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  18541052 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 18541151  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagc 253  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  18541152 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagc 18541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 3784802 - 3785044
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3784802 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 3784901  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784902 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 3785001  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3785002 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 3785044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 34157159 - 34157400
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34157159 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34157257  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 34157357  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157358 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 34157400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 16163747 - 16163985
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16163747 catcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16163846  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163847 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 16163946  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163947 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 16163985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27118836 - 27119078
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27118836 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 27118935  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27118936 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaac 27119035  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27119036 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27119078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31891421 - 31891179
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  31891421 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacg 31891322  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891321 tccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31891222  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891221 tcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctg 31891179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21703257 - 21703015
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| || |    
T  21703257 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 21703158  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||    
T  21703157 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 21703058  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21703057 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctg 21703015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19456514 - 19456275
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19456514 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19456415  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||    
T  19456414 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 19456315  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19456314 tcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 19456275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34303396 - 34303158
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34303396 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34303297  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  34303296 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 34303197  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 256  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34303196 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 34303158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22926121 - 22925879
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  22926121 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 22926022  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  22926021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 22925922  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22925921 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 22925879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9350075 - 9349833
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9350075 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 9349976  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||  |||| ||| ||||    
T  9349975 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaac 9349876  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
     ||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  9349875 ccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9349833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27434537 - 27434295
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27434537 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27434438  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  27434437 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27434338  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27434337 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27434295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28882362 - 28882604
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  28882362 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 28882461  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  28882462 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 28882561  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28882562 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28882604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23128659 - 23128417
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23128659 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23128560  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  23128559 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23128460  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||| ||||||  ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  23128459 tcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23128417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 12655690 - 12655932
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12655690 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 12655789  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  12655790 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 12655889  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  12655890 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12655932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 20838066 - 20838308
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||| | |||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaac 20838265  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  20838266 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20838308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 12586958 - 12587200
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  12586958 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12587057  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  12587058 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12587157  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  12587158 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12587200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 40233659 - 40233880
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  40233659 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40233758  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| | |||    
T  40233759 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 40233858  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  40233859 tcctctggtacctctacacatc 40233880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 27393117 - 27393268
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| || |    
T  27393117 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 27393216  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 169  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27393217 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgat 27393268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13936637 - 13936395
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  13936637 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 13936538  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  13936537 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13936438  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  13936437 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13936395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27777370 - 27777612
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  27777370 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27777469  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  27777470 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27777569  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27777570 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27777612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27817128 - 27817370
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  27817128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27817227  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  27817228 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27817327  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27817328 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27817370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16829431 - 16829189
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  16829431 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16829332  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  16829331 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16829232  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  16829231 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16829189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 16892050 - 16892292
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  16892050 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16892149  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  16892150 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16892249  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  16892250 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16892292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 32049946 - 32050188
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  32049946 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32050045  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  32050046 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 32050145  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  32050146 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 32050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 37375309 - 37375530
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  37375309 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37375408  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | || ||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  37375409 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37375508  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  37375509 tcctctggtgcctctacacatc 37375530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27803855 - 27804097
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  27803855 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27803954  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || |   | ||||| |||||    
T  27803955 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaac 27804054  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27804055 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27804097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 34286502 - 34286744
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  34286502 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34286601  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  34286602 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34286701  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  34286702 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34286744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 34291562 - 34291804
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  34291562 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34291661  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  34291662 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34291761  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  34291762 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34291804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 34861828 - 34862070
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  34861828 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34861927  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  34861928 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaac 34862027  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  34862028 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34862070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39051915 - 39051673
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  39051915 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39051816  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  39051815 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 39051716  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  39051715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39051673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12716695 - 12716453
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  12716695 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12716596  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  12716595 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 12716496  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  12716495 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12716453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37686002 - 37685760
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  37686002 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37685903  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  37685902 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37685803  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  37685802 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37685760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37701267 - 37701025
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  37701267 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37701168  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  37701167 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37701068  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  37701067 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37701025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 37925641 - 37925883
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  37925641 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37925740  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  37925741 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37925840  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  37925841 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37925883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 260846 - 260695
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  260846 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 260747  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 169  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  260746 tcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 260695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21677275 - 21677033
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  21677275 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21677176  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  21677175 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21677076  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  21677075 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21677033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 39890222 - 39890464
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||| |||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  39890222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 39890321  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  39890322 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39890421  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  39890422 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39890464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 31876429 - 31876650
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31876429 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31876528  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  31876529 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31876628  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  31876629 tcctctggtacctctacacatc 31876650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19416592 - 19416350
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  19416592 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19416493  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  19416492 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19416393  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  19416392 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19416350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11635264 - 11635037
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccact 232  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||||||||||| || ||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11635065  T
Q  233 acacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11635064 acacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11635037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11641453 - 11641226
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccact 232  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||||||||||| || ||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11641254  T
Q  233 acacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11641253 acacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11641226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Original strand, 34279597 - 34279694
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataa 115  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34279597 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 34279694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24460709 - 24460467
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24460709 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 24460610  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460609 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 24460510  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460509 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 24460467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15285032 - 15284793
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15285032 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 15284933  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||    
T  15284932 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 15284833  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15284832 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 15284793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 1900424 - 1900663
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1900424 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatg 1900523  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||  |||| |||||||    
T  1900524 tcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1900624 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctct 1900663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 15228037 - 15228276
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||    
T  15228037 catcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacg 15228136  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  15228137 tccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaac 15228236  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15228237 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 15228276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14235629 - 14235394
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  14235629 catcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 14235530  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||    |||||| |||||||||| ||    
T  14235529 tccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgac 14235430  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagc 253  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  14235429 tcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagc 14235394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 14665185 - 14665427
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||      
T  14665185 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataata 14665284  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  14665285 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14665384  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  14665385 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 17014167 - 17014409
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 17014366  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  17014367 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24592418 - 24592176
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24592418 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24592319  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  24592318 tcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24592219  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24592218 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24592176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15391442 - 15391204
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| || |    
T  15391442 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatg 15391343  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    |||| |||| ||||||    ||| |  |||| ||||||||    
T  15391342 tccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagagtcatgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaac 15391243  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 256  Q
    ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  15391242 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 15391204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36344619 - 36344377
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  36344619 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 36344520  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  36344519 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 36344420  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  36344419 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 36344377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18800717 - 18800475
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  18800717 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18800618  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  18800617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18800518  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18800517 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18800475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5006040 - 5006282
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5006040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatg 5006139  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  5006140 tcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5006239  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  5006240 tcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctg 5006282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 6570020 - 6570262
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  6570020 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6570119  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  6570120 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6570219  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  6570220 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6570262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31126622 - 31126380
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  31126622 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31126523  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  31126522 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31126423  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  31126422 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31126380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14763408 - 14763166
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  14763408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 14763309  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  14763308 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14763209  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  14763208 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14763166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27163421 - 27163179
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  27163421 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27163322  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  27163321 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27163222  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  27163221 tcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 27163179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40105742 - 40105500
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  40105742 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40105643  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  40105642 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40105543  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  40105542 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 40105500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 14098708 - 14098950
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  14098708 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14098807  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  14098808 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14098907  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  14098908 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14098950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 21969868 - 21970110
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  21969868 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 21969967  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||  | | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  21969968 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21970067  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  21970068 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21970110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33673902 - 33673660
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  33673902 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33673803  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  33673802 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33673703  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  33673702 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33673660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 39850805 - 39851047
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  39850805 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39850904  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  39850905 ttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39851004  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  39851005 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39851047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 54833554 - 54833796
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  54833554 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 54833653  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  54833654 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 54833753  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  54833754 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 54833796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30753921 - 30754163
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  30753921 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30754020  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  30754021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30754120  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30754121 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34189064 - 34188829
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  34189064 catcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 34188965  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  34188964 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34188865  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagc 253  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  34188864 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagc 34188829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Original strand, 24112829 - 24113064
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  24112829 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 24112928  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  24112929 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 24113028  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagc 253  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  24113029 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagc 24113064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8892357 - 8892116
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8892357 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8892259  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8892159  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892158 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 8892116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8903592 - 8903351
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8903592 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8903494  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903493 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8903394  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903393 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 8903351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14143332 - 14143090
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14143332 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 14143233  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  14143232 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 14143133  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14143132 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 14143090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 26788093 - 26788335
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26788093 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26788192  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  26788193 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26788292  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26788293 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26788335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27196466 - 27196708
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27196466 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27196565  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  27196566 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27196665  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27196666 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27196708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27252774 - 27252532
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27252774 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27252675  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  27252674 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27252575  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27252574 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27252532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28162806 - 28163048
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28162806 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 28162905  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162906 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 28163005  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28163006 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctg 28163048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13522120 - 13521878
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13522120 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 13522021  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |  |||| ||| ||||    
T  13522020 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 13521921  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13521920 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 13521878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33374303 - 33374061
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33374303 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacg 33374204  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374203 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 33374104  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33374103 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctg 33374061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22456981 - 22456775
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  22456981 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatt 22456882  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  22456881 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 22456782  T
Q  218 tcctctg 224  Q
    |||||||    
T  22456781 tcctctg 22456775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27290417 - 27290175
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  27290417 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 27290318  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  27290317 tccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27290218  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27290217 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27290175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 24863866 - 24864108
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24863866 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24863965  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  24863966 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24864065  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| || ||||||||    
T  24864066 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctg 24864108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13298998 - 13298756
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13298998 catcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 13298899  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  13298898 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 13298799  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  13298798 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13298756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22934927 - 22934685
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  22934927 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 22934828  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  22934827 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22934728  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  22934727 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23857372 - 23857130
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  23857372 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 23857273  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  23857272 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23857173  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  23857172 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23857130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24304665 - 24304423
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24304665 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24304566  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||| |  ||||    
T  24304565 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24304466  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24304465 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24304423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 26989150 - 26989392
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26989150 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26989249  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  26989250 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26989349  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||| | ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26989350 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26989392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 16750003 - 16750224
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16750003 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16750102  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || |   | ||||| |||||    
T  16750103 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaac 16750202  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  16750203 tcctctggtgcctctacacatc 16750224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15424364 - 15424122
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15424364 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15424265  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  | |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  15424264 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15424165  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  15424164 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15424122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 29549624 - 29549866
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29549624 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29549723  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || | ||||||||||||  ||   || ||  ||||||| |||||    
T  29549724 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaac 29549823  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29549824 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29549866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 26918529 - 26918771
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26918529 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26918628  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  26918629 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26918728  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  26918729 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26918771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27272627 - 27272385
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||| |    
T  27272627 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 27272528  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||| |||||| |||   || ||  ||||||||| |||    
T  27272527 ttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaac 27272428  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  27272427 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 27272385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 27000222 - 27000394
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27000222 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27000321  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000322 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30558063 - 30557821
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  30558063 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30557964  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  30557963 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30557864  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30557863 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30557821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 3696230 - 3696472
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  3696230 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3696329  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  3696330 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3696429  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  3696430 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3696472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27360039 - 27359797
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  27360039 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27359940  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||    || ||||| ||    
T  27359939 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27359840  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||||    
T  27359839 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctg 27359797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27450382 - 27450140
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  27450382 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27450283  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||    || ||||| ||    
T  27450282 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27450183  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||||    
T  27450182 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctg 27450140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 29573162 - 29573404
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  29573162 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29573261  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  29573262 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29573361  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29573362 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29573404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34463393 - 34463151
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  34463393 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 34463294  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  34463293 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34463194  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  34463193 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34463151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 20160865 - 20161022
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  20160865 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 20160964  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || || | ||||||||||||    
T  20160965 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 20161022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171809
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  22171966 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 22171867  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || || | ||||||||||||    
T  22171866 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 22171809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 4757913 - 4758085
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  4757913 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4758012  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  4758013 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 4758085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 4773155 - 4773327
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  4773155 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4773254  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  4773255 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 4773327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092248
Alignment:
Q  75 aagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgagg 174  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  175 tatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    ||| |||||||||| ||| |   || ||  | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctct 17092248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27007876 - 27008118
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  27007876 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatg 27007975  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | | |||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  27007976 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27008075  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27008076 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27008118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 16674288 - 16674509
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  16674288 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16674387  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| | |||    
T  16674388 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 16674487  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  16674488 tcctctggtacctctacacatc 16674509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 17025426 - 17025647
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  17025426 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 17025525  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  17025526 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17025625  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  17025626 tcctctggtgcctctgcacatc 17025647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22477320 - 22477240
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22477320 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 28207603 - 28207775
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28207603 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28207702  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  28207703 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 28207775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4545822 - 4545580
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  4545822 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4545723  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  4545722 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4545623  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4545622 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4545580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16944074 - 16943832
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  16944074 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16943975  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| ||  |||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  16943974 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16943875  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  16943874 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16943832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 29501564 - 29501806
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  29501564 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29501663  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  29501664 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29501763  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29501764 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29501806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 4525435 - 4525607
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  4525435 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4525534  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  4525535 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 4525607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26116457 - 26116285
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  26116457 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26116358  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  26116357 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 26116285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26777662 - 26777511
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26777662 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26777563  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 169  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||    
T  26777562 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgat 26777511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4724181 - 4723939
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  4724181 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4724082  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  4724081 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4723982  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4723981 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4723939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27485278 - 27485520
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  27485278 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27485377  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||    || ||  | ||||| |||||    
T  27485378 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 27485477  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  27485478 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27485520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 27044536 - 27044779
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct-atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataac 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || | |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  27044536 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataat 27044635  T
Q  117 gtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaa 216  Q
    || || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| |    
T  27044636 gttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcca 27044735  T
Q  217 ctcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||||||    
T  27044736 ctcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 27044779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 4626057 - 4626299
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4626057 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 4626156  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626157 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 4626256  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4626257 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctg 4626299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5713340 - 5713582
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5713340 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5713439  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713440 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5713539  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713540 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5713582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5724250 - 5724492
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5724250 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5724349  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724350 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5724449  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724450 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5724492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5757227 - 5756985
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5757227 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5757128  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757127 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5757028  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757027 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5756985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5768118 - 5767876
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5768118 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5768019  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768018 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5767919  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5767918 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5767876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31034262 - 31034020
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31034262 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 31034163  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  31034162 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 31034063  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31034062 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 31034020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 32292865 - 32293107
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32292865 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 32292964  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  32292965 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 32293064  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32293065 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 32293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5652500 - 5652742
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5652500 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 5652599  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5652600 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 5652699  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5652700 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 5652742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17993929 - 17993687
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17993929 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 17993830  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993829 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 17993730  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  17993729 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17993687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16626651 - 16626412
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16626651 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16626552  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  16626551 tccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaac 16626452  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16626451 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 16626412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 18530501 - 18530738
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18530501 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 18530600  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    | ||| |||| ||||||||    
T  18530601 tccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaac 18530700  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcct 255  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  18530701 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcct 18530738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 8296085 - 8296327
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8296085 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 8296184  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8296185 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8296284  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  8296285 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8296327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15741239 - 15740997
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15741239 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15741140  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  15741139 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15741040  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  15741039 tcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15740997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 6192429 - 6192671
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6192429 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 6192528  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  6192529 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 6192628  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  6192629 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15892851 - 15892609
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15892851 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15892752  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||  ||||    
T  15892751 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 15892652  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  15892651 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15892609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 18330782 - 18331024
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18330782 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18330881  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  18330882 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 18330981  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  18330982 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 18331024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29148900 - 29148658
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29148900 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29148801  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||  ||||    
T  29148800 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 29148701  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29148700 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29148658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Original strand, 18051376 - 18051617
Alignment:
Q  19 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgt 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18051376 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 18051475  T
Q  119 ccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaact 218  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||   || ||  ||||  | ||||||    
T  18051476 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaact 18051575  T
Q  219 cctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  18051576 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 18051617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8301412 - 8301170
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8301412 catcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 8301313  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8301312 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8301213  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  8301212 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8301170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4796798 - 4796556
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4796798 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 4796699  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  4796698 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 4796599  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4796598 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4796556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22387723 - 22387513
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22387723 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22387624  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  22387623 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22387524  T
Q  218 tcctctggtgc 228  Q
    |||||||||||    
T  22387523 tcctctggtgc 22387513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 260
Target Start/End: Original strand, 4417047 - 4417274
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  4417047 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 4417146  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccact 232  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||||||||||| || ||    
T  4417147 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 4417246  T
Q  233 acacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||| || | ||| |||||||||||    
T  4417247 acacatcaagctgtgcaaagcctctctg 4417274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 7073325 - 7073567
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  7073325 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 7073424  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  7073425 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7073524  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  7073525 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 7073567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29665115 - 29664873
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  29665115 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29665016  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  29665015 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29664916  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29664915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29664873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 35880879 - 35881121
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35880879 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 35880978  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  35880979 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 35881078  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  35881079 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 35881121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 4721744 - 4721986
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  4721744 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatg 4721843  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  4721844 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaac 4721943  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4721944 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4721986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11110494 - 11110252
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  11110494 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 11110395  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  11110394 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 11110295  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  11110294 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20576992 - 20576750
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  20576992 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 20576893  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  20576892 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 20576793  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  20576792 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20576750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28021388 - 28021630
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28021388 catcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28021487  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28021488 tcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28021587  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28021588 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28021630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28116099 - 28115857
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  28116099 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatg 28116000  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28115999 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28115900  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28115899 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28115857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 8211851 - 8212072
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  8211851 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8211950  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  8211951 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8212050  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  8212051 tcctctggtgcctctacacatc 8212072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 10396246 - 10396488
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| |    
T  10396246 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 10396345  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||| | |||||    
T  10396346 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaac 10396445  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||| | ||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  10396446 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctg 10396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18292498 - 18292256
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  18292498 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18292399  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  18292398 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18292299  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  18292298 tcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 18292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 48466040 - 48466282
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48466040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 48466139  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  48466140 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 48466239  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  48466240 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 48466282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4346832 - 4346590
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  4346832 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4346733  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  4346732 tcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4346633  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4346632 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4346590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5467098 - 5467340
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  5467098 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatg 5467197  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  5467198 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5467297  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  5467298 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5467340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18277197 - 18276955
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  18277197 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18277098  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  18277097 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18276998  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18276997 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18276955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18307799 - 18307557
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  18307799 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18307700  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  18307699 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18307600  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18307599 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18307557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 21674806 - 21675048
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  21674806 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21674905  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
      || |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  21674906 ctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21675005  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  21675006 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21675048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22871001 - 22870759
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  22871001 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22870902  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  22870901 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22870802  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  22870801 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22870759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22886060 - 22885818
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  22886060 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22885961  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  22885960 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22885861  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  22885860 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22885818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36997222 - 36996980
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  36997222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 36997123  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||  ||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||   || ||  | || || |||||    
T  36997122 tcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 36997023  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  36997022 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 36996980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 51782136 - 51782378
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  51782136 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51782235  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  51782236 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51782335  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  51782336 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 51782378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 51797226 - 51797447
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  51797226 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51797325  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  51797326 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51797425  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  51797426 tcctctggtgcctctgcacatc 51797447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 24328272 - 24328514
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  24328272 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24328371  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  24328372 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24328471  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  24328472 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24328514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 5013825 - 5014067
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5013825 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5013924  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  5013925 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5014024  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  5014025 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5014067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 18242852 - 18243094
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  18242852 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18242951  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  18242952 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 18243051  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  18243052 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18243094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31964618 - 31964397
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31964618 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31964519  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  31964518 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31964419  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  31964418 tcctctggtgcctctgcacatc 31964397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 47023566 - 47023787
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  47023566 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 47023665  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| ||  |||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  47023666 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 47023765  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  47023766 tcctctggtacctctacacatc 47023787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50134216 - 50133995
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  50134216 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 50134117  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  50134116 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 50134017  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  50134016 tcctctggtgcctctgcacatc 50133995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5596502 - 5596330
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5596502 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5596403  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  5596402 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 5596330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 7996675 - 7996847
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  7996675 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7996774  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||||||    
T  7996775 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 7996847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 10643183 - 10643355
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  10643183 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10643282  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||||||    
T  10643283 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 10643355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17985101 - 17984929
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17985101 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 17985002  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||||||    
T  17985001 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 17984929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5609467 - 5609225
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5609467 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5609368  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||    || ||  | ||||| |||||    
T  5609367 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 5609268  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  5609267 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5609225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6542607 - 6542365
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || |    
T  6542607 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 6542508  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | | |||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  6542507 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 6542408  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  6542407 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6542365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28339415 - 28339657
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28339415 catcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28339514  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28339515 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28339614  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28339615 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28339657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 18225304 - 18225425
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  18225304 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18225403  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcc 139  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  18225404 tcccacatgtcctcgacaatcc 18225425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 32439267 - 32439499
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  32439267 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 32439366  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| || | |||||    ||| ||  | || ||||||||    
T  32439367 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 32439466  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgcca 250  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  32439467 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgcca 32439499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 44563253 - 44563493
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563253 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 44563351  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44563352 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa-catgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaac 44563450  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44563451 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 44563493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19659102 - 19658861
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19659102 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19659004  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19659003 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 19658904  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19658903 tcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctg 19658861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 33244817 - 33245059
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33244817 catcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 33244916  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33244917 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaac 33245016  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33245017 tcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctg 33245059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 18710738 - 18710980
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18710738 catcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18710837  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  18710838 tcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 18710937  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710938 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 18710980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22080941 - 22080703
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  22080941 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 22080842  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||| |||| ||||||    |||||| |||| ||||||||    
T  22080841 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaac 22080742  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 256  Q
    ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  22080741 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 22080703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 19688250 - 19688492
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19688250 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 19688349  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  19688350 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 19688449  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  19688450 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19688492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27608968 - 27608747
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27608968 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27608869  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  27608868 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27608769  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  27608768 tcctctggtgcctctacacatc 27608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 16283613 - 16283843
Alignment:
Q  30 ctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcg 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16283613 ctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 16283712  T
Q  130 tcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcc 229  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||   |  ||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  16283713 tcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcc 16283812  T
Q  230 actacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
     ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16283813 tctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 16283843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 14557776 - 14558018
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14557776 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 14557875  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  14557876 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14557975  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  14557976 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14558018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 16277706 - 16277948
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16277706 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16277805  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  16277806 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 16277905  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  16277906 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16277948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2137322 - 2137080
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2137322 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2137223  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    || | |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || |||| ||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  2137222 tctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2137123  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  2137122 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 2137080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189488
Alignment:
Q  28 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgt 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  128 cgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtg 227  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtg 189455  T
Q  228 ccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  189456 cctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 189488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31489813 - 31489571
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31489813 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31489714  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  31489713 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31489614  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  31489613 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31489571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12092787 - 12092615
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  12092787 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12092688  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  12092687 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 12092615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 29829474 - 29829716
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  29829474 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29829573  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  29829574 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 29829673  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  29829674 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29829716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 260
Target Start/End: Original strand, 19674608 - 19674835
Alignment:
Q  33 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcg 132  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  133 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccact 232  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || || ||||||||||||||||| ||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 19674807  T
Q  233 acacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
     |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  19674808 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19674835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3329570 - 3329328
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  3329570 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatg 3329471  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  3329470 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 3329371  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  3329370 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3329328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19208423 - 19208181
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  19208423 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19208324  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  19208323 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19208224  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  19208223 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19208181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 19286614 - 19286856
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  19286614 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19286713  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  19286714 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 19286813  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  19286814 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19286856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28362018 - 28361776
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28362018 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28361919  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28361918 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28361819  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28361818 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28361776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 31354676 - 31354897
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  31354676 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31354775  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||||   || ||  | ||||| |||||    
T  31354776 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31354875  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  31354876 tcctctggtgcctctgcacatc 31354897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 9354774 - 9355017
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaag-ctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataac 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  9354774 catcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataat 9354873  T
Q  117 gtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaa 216  Q
    || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||   || ||  | ||||| ||||    
T  9354874 gttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaa 9354973  T
Q  217 ctcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  9354974 ctcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9355017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 33258875 - 33259117
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  33258875 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 33258974  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || | ||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  33258975 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33259074  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  33259075 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33259117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28152013 - 28152255
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28152013 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 28152112  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||  |||| ||| ||||    
T  28152113 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 28152212  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28152213 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 28152255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20340439 - 20340197
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  20340439 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 20340340  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||| ||| ||||    
T  20340339 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 20340240  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20340239 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 20340197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16208135 - 16207896
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  16208135 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 16208036  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  16208035 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 16207936  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  16207935 tcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctct 16207896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 20461232 - 20461471
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  20461232 catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcg 20461331  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||   || ||| ||||| |||||||    
T  20461332 tccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaac 20461431  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  20461432 tcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctct 20461471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 51638369 - 51638611
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  51638369 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 51638468  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || || |||||    
T  51638469 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 51638568  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  51638569 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 51638611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 10962821 - 10963063
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  10962821 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10962920  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  10962921 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 10963020  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  10963021 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 10963063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 28585132 - 28585374
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28585132 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28585231  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  28585232 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28585331  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  28585332 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28585374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41793412 - 41793170
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  41793412 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41793313  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    | || |||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  41793312 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 41793213  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  41793212 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 41793170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2520
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  2762 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 2663  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||| ||| ||||    
T  2662 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 2563  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2562 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 2520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2021 - 1846
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || |    
T  2021 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 1923  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1922 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccaga 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 6165 - 6408
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt-gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataac 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| || || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||     
T  6165 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataat 6264  T
Q  117 gtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaa 216  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||  | | ||  ||||||| ||||    
T  6265 gtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaa 6364  T
Q  217 ctcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  6365 ctcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20715
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || |    
T  20540 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 20638  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20639 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccaga 20715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 30604 - 30846
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |    
T  30604 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30703  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| | |||    
T  30704 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaac 30803  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30804 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 27444 - 27685
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27444 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27543  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || || |||||||| |||||    
T  27544 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 27643  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctct 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  27644 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 27685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39931
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40173 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 40074  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||||||||    
T  40073 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 39974  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  39973 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47089 - 46847
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  47089 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 46990  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  |||| || |||||    
T  46989 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaac 46890  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  46889 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 46847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 29918 - 30157
Alignment:
Q  21 caaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtcc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  121 ctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcc 220  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||  |||   || ||  ||||||| ||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 30117  T
Q  221 tctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  30118 tctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 722 - 488
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  722 catcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatg 623  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||| |||| ||||||    |||||  |||| ||||||||    
T  622 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaac 523  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaag 252  Q
    ||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  522 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaag 488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 12
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  233 catcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 134  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  133 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 34  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  33 tcctctggtgcctctacacatc 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||| ||||    
T  132 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacg 33  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaat 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 21713 - 21951
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |    
T  21713 catcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatg 21812  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||  ||| |||| |    || ||  |||| ||||||||    
T  21813 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaac 21912  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 256  Q
    ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  21913 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 21951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 9718 - 9960
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  9718 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9817  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | || ||||| ||    
T  9818 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 9917  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||| ||||    
T  9918 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctg 9960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26305 - 26063
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26305 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26206  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  26205 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26106  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  26105 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 7101
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  7343 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7244  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || || | ||| |||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  7243 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7144  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  7143 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14792
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  15034 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14935  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || || | |||||||||||| |||   || ||  | ||||| |||||    
T  14934 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14835  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  14834 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9170 - 8928
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  9170 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9071  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||    || ||  | ||||| |||||    
T  9070 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 8971  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  8970 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 20167 - 20409
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  20167 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 20266  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||    || ||  | ||||| |||||    
T  20267 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 20366  T
Q  218 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 260  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||    
T  20367 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 8101 - 8273
Alignment:
Q  18 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 117  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  8101 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8200  T
Q  118 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 190  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  8201 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46872 - 46756
Alignment:
Q  54 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa-gttgactttt-gagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatca 151  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  152 cgctgctgtaaacatga 168  Q
     ||||||||||| ||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatga 46756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University