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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12841_low_2 (Length: 732)

Name: NF12841_low_2
Description: NF12841
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12841_low_2
NF12841_low_2
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (15-714)||(33505208-33505896)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 566; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 714
Target Start/End: Original strand, 33505208 - 33505896
Alignment:
Q  15 atgaataggagagtattaatattacgtactgtgcacatctagcaacaacatcctcagcaatggaggatagatacttgagcttcatcgccataaccgtttg 114  Q
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T  33505208 atgaataggagagtattaatattacgtactgtgcacatctagcaacaacatcctcagcaatggaggatagatacttgagcttcatcgccataaccgtttg 33505307  T
Q  115 tttgcagttaatttcttatttcctctcttgatctctttgatgctaagtaatatatatgagacaccgaaagggtgatacgtgggagggattagtaggtgcc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33505308 tttgcagttaatttcttatttcctctcttgatctctttgatgctaagtaatatatatgagacaccgaaagggtgatacgtgggagggattagtaggtgcc 33505407  T
Q  215 acgtgttaatagccatgcaacgcaagcatgcaacacgtacatggttatttgcctcctgcttaacnnnnnnnnnn-cttttcggtaaaaggaatagaacaa 313  Q
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T  33505408 acgtgttaatagccatgcaatgcaagcatgcaacacgtacatggttatttgcctcctgcttaactttttttttttcttttcggtaaaaggaatagaacaa 33505507  T
Q  314 taatatttcctgtttattaattcatcacatatatatctaatatctc--tctattctcttatagcggtcgctagatgatttatattataaagtatcaaatt 411  Q
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T  33505508 taatatttcctgtt-attaattcatcacatatatatctaatatctctctctattcttttatagcggtcgctagatgatttatattataaagtatcaaatt 33505606  T
Q  412 tgaattctatttctgttaattaactgtttttactctgaattttagattagcatttatcaccgatgaatccaacattttgtggttagatttaatttatatt 511  Q
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T  33505607 tgaattctatttctgttaattaactgtttttactctgaattctagattagcttttgtcaccgatgaatccaacattttgtggttagatttaatttatatt 33505706  T
Q  512 taagtacaattatttgactgtatagaatgttagatttattgaaaaattacattaaaattgatgtatcccttattgtaggtatttagatatggatatcttt 611  Q
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T  33505707 taagtacaactatttgattgtatagaatgttagatttattgaaaaattacattaaaattgatgtatcccttattgtaggtatttagatatggatatcttt 33505806  T
Q  612 caatcttttggatcagtacatatttttcctttattggaaaatgttcaagatagtgatagtgatgatagactcatcatcgtttttctttcgagaggatata 711  Q
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T  33505807 caatcttttggatcagtacatatttttcctttattggaaaatg-------------tattgatgatagacttatcatcgtttttctttcgagaggatata 33505893  T

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