View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12882_high_6 (Length: 683)

Name: NF12882_high_6
Description: NF12882
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12882_high_6
NF12882_high_6
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (19-674)||(1330193-1330860)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (395-676)||(22361019-22361312)
chr3 (395-676)||(22365406-22365699)
chr3 (447-611)||(23397192-23397357)
chr3 (628-676)||(36028864-36028912)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (395-676)||(200588-200870)
chr5 (395-676)||(196209-196491)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (395-676)||(7162477-7162773)
chr8 (395-669)||(30045121-30045411)
chr8 (395-669)||(30049524-30049814)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (395-664)||(3941379-3941664)
chr4 (395-664)||(3945778-3946063)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (395-676)||(39949361-39949652)
chr7 (395-676)||(39953753-39954044)
[»] scaffold1453 (1 HSPs)
scaffold1453 (554-676)||(1-123)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 591; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 674
Target Start/End: Original strand, 1330193 - 1330860
Alignment:
Q  19 agatggagaagaagcaaaggttactagttgaagaacagctgatttggcagcaatatgaaagggatcgcgtacaaggacatgctgcacttaagcaacaacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1330193 agatggagaagaagcaaaggttactagttgaagaacagctgatttggcagcaatatgaaagggatcgcgtacaaggacatgctgcacttaagcaacaacc 1330292  T
Q  119 tggtagtaataactcctatatgggaggctatcaacagaactatggcaattaccaccgttgactagaataattttttattagttggaactctttttcttca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1330293 tggtagtaataactcctatatgggaggctatcaacagaactatggcaattaccaccgttgactagaataattttttattagttggaactctttttcttca 1330392  T
Q  219 ttccaaggcaggcaattttatccaccttcattagaaaagcttgttctcaagtcttgttagaactttgaagattaatgtgataacccctctcctaagaaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1330393 ttccaaggcaggcaattttatccaccttcattagaaaagcttgttctcaagtcttgttagaactttgaagattaatgtgatatcccctctcctaagaaac 1330492  T
Q  319 acttgtttttctttcttagtttctttgcccctttcagaaaactagtaaaaaattattcatcattgattagcaatattgttgactgattgacctataaaac 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1330493 acttgtttttctttcttagtttctttgcccctttcagaaaactagtaaaaaattattcatcattgattagcaatattgttgactaattgacctataaaac 1330592  T
Q  419 ttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaactatgctgcacaagtaatgttatc 506  Q
    |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1330593 ttgtctgaatactttattgtttatgttactctattgcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttgttagtaaaactatactgcacaagtaatgttatc 1330692  T
Q  507 tgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaagaaggatgtaaggat 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1330693 tgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagtataggttgagtcattagtaagtatttgactataagtatgtaagaaggatgtaaggat 1330792  T
Q  607 ggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttct 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1330793 ggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttct 1330860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Original strand, 22361019 - 22361312
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  22361019 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaag 22361118  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 582  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361119 ctatgctgcacaagtaaggttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagctaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 22361218  T
Q  583 agtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361219 agtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 22361312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Original strand, 22365406 - 22365699
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22365406 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 22365505  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 582  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22365506 ctatgctgcataagtaaggttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcaactaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 22365605  T
Q  583 agtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22365606 agtatgtaagaaggatgtatggatgatatgtatcaaatttgcagtatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 22365699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 447 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 23397357 - 23397192
Alignment:
Q  447 tgtgtgtaatcattttaactt-gttttatcagtaaaactatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagca 545  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||| | |||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  23397357 tgtgtgtaatgattttaacttagttttgtcggtaatactttcctgcacaagtaaggtgttctgtacaagttaaataggtttatgtcgtatgacatcaaca 23397258  T
Q  546 aagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtat 611  Q
    ||| ||| | |  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  23397257 aagtataagttatgtcattactaagtatttgactctaaatatgtaagaaagatgtatggatggtat 23397192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 628 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 36028912 - 36028864
Alignment:
Q  628 atagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028912 atagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 36028864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 200870 - 200588
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatact-ttattgtttagcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaactatgctgcac 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  200870 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaattatgttactttattgtttatgtgtgtaatcattttaacttgttttgttagtaaaactatgctgcac 200771  T
Q  494 aagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaaga 593  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200770 aagtaaggttatctgcacaagttaagtaggtttacctcatatgacatcagctaagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaaga 200671  T
Q  594 aggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200670 aggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 200588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 196491 - 196209
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatact-ttattgtttagcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaactatgctgcac 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  196491 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaattatgttactttattgtttatgtgtgtaatcattttaacttgttttgttagtaaaactatgctgcac 196392  T
Q  494 aagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaaga 593  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  196391 aagtaaggttatctgcacgagttaagtaggtttacgtcatatgacatcagctaagcataggctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaaga 196292  T
Q  594 aggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  196291 aggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtctctttctcttccatttcttttcttctct 196209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Original strand, 7162477 - 7162773
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  7162477 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaatcattttaacttattttgttagtaaaa 7162576  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaat---gttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggct 579  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7162577 ctatgctgcacaagtaataaggttatctgcacaagttaagcaggtttatgtcatatgacatcagctaagcataggctgagtcattactaagtatttggct 7162676  T
Q  580 ataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7162677 ataagtatgtaagaaggatgtatggatggtttgtattaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 7162773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 395 - 669
Target Start/End: Original strand, 30045121 - 30045411
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30045121 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 30045220  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatat----gacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggc 578  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30045221 ctatgctgcacaagtaagattatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatatatgacatcagctaagcataggctgagtcattacttagtatttggc 30045320  T
Q  579 tataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttctttt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30045321 tataagtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttttttt 30045411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 395 - 669
Target Start/End: Original strand, 30049524 - 30049814
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30049524 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 30049623  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatat----gacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggc 578  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30049624 ctatgctgcacaagtaagattatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatatatgacatcagctaagcataggctgagtcattacttagtatttggc 30049723  T
Q  579 tataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttctttt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30049724 tataagtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttttttt 30049814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 395 - 664
Target Start/End: Original strand, 3941379 - 3941664
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  3941379 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 3941478  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatat----gacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggc 578  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3941479 ctatgctgcacaagtaagattatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatatatgacatcagctaagcataggctgagtcattacttagtatttggc 3941578  T
Q  579 tataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccattt 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941579 tataagtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccattt 3941664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 395 - 664
Target Start/End: Original strand, 3945778 - 3946063
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  3945778 tgttgactaattgacctataaaacttttctgaatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 3945877  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatat----gacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggc 578  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3945878 ctatgctgcacaagtaagattatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatatatgacatcagctaagcataggctgagtcattacttagtatttggc 3945977  T
Q  579 tataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccattt 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3945978 tataagtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccattt 3946063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 39949652 - 39949361
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39949652 tgttgactaattgacctataaaacttttctttatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 39949553  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39949552 ctatgctgcacaagtaaggttatctgca--agttaagtaggtttatgtcatatgacatcagctaaacataggctgagttattactaagtatttggctata 39949455  T
Q  583 agtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39949454 agtatgtaagaaggatgtatggatgatatataaaaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 39949361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 395 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 39954044 - 39953753
Alignment:
Q  395 tgttgactgattgacctataaaacttgtctgaatactttattgttta------------gcttatgtgtgtaatcattttaacttgttttatcagtaaaa 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39954044 tgttgactaattgacctataaaacttttctttatactttattgtttatgttactttattgcttatgtgtgtaattattttaacttgttttgttagtaaaa 39953945  T
Q  483 ctatgctgcacaagtaatgttatctgcacaagttaagtaggtttatgtcatatgacatcagcaaagcataggctgagtcattactaagtatttggctata 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39953944 ctatgctgcacaagtaaggttatctgca--agttaagtaggtttatgtcatatgacatcagctaaacatagactgagttattactaagtatttggctata 39953847  T
Q  583 agtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39953846 agtatgtaagaaggatgtatggatgatatataaaaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtccctttctcttccatttcttttcttctct 39953753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1453 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1453
Description:

Target: scaffold1453; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 554 - 676
Target Start/End: Original strand, 1 - 123
Alignment:
Q  554 gctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaagaaggatgtaaggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtcccttt 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gctgagtcattactaagtatttggctataagtatgtaagaaggatgtatggatggtatgtatcaaatttgcagcatagtaaacattgttattgtcccttt 100  T
Q  654 ctcttccatttcttttcttctct 676  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  101 ctcttccatttcttttcttctct 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University