View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12884_low_1 (Length: 659)

Name: NF12884_low_1
Description: NF12884
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12884_low_1
NF12884_low_1
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (18-640)||(27876637-27877259)
chr6 (453-640)||(8481627-8481814)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (18-640)||(42267670-42268292)
chr4 (18-640)||(48699749-48700371)
chr4 (18-642)||(30948109-30948733)
chr4 (26-642)||(2000660-2001268)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (18-640)||(5821203-5821825)
chr3 (18-637)||(2815194-2815813)
chr3 (26-642)||(42586726-42587342)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (16-640)||(827244-827868)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (18-640)||(9442020-9442642)
chr8 (26-642)||(24596414-24597030)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (18-642)||(34353777-34354401)
chr5 (18-642)||(41720177-41720801)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (61-213)||(8136818-8136971)
chr7 (208-408)||(8134716-8134907)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27877259 - 27876637
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877259 catcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 27877160  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877159 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 27877060  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27877059 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcagatgtgttt 27876960  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876959 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcgagt 27876860  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27876859 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 27876760  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876759 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 27876660  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27876659 acggcgattgatttgaagacacc 27876637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8481814 - 8481627
Alignment:
Q  453 caattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgtagaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaa 552  Q
    |||||||| ||| || |||| ||||| || |||||| | ||||||||  |||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  8481814 caattcacagttccatatacgcctcaacataatggtatagcagagcgattgaataaaactctcctagataaaacaagagttatgcagagaacagcaggaa 8481715  T
Q  553 tggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatcaacggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||| || | |||| |||| | |||||  || |||||||| || ||||| || |||| ||| || |||| |||||| |||||    
T  8481714 tggccaagtcttttttggcaaaagctgcgaaaatggcatgttatgtgatcaatcgatctccataaactgcaattggtttgaaaacacc 8481627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 640
Target Start/End: Original strand, 42267670 - 42268292
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267670 catcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 42267769  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267770 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 42267869  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42267870 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcagatgtgttt 42267969  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42267970 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcgagt 42268069  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42268070 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 42268169  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268170 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 42268269  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42268270 acggcgattgatttgaagacacc 42268292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 48700371 - 48699749
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700371 catcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 48700272  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700271 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 48700172  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48700171 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcagatgtgttt 48700072  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48700071 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcgagt 48699972  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48699971 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 48699872  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699871 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 48699772  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48699771 acggcgattgatttgaagacacc 48699749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 30948733 - 30948109
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948733 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 30948634  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948633 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 30948534  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30948533 aaaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattctagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcggatgtgttt 30948434  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948433 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 30948334  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30948333 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 30948234  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948233 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcggaaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 30948134  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacaccaa 642  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  30948133 acgacgattgatttgaagacaccaa 30948109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 642
Target Start/End: Original strand, 2000660 - 2001268
Alignment:
Q  26 actaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagcactgtgtg 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||  ||||| || |  |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||    
T  2000660 actaggccatatgtcggaacatggtttgaaagctcttgcggaacaaaatcttctacctgggctcaagacaatgaatttgtctttctgtgagcactgtgtg 2000759  T
Q  126 ataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcaccagaaatat 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2000760 acaagcaagcaacatagattgaagttttctatagtaactactagaagcaaatacatacttgacttaatacattctgatgtgtgggagtcgccacaaatat 2000859  T
Q  226 ctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgtttccagtatt 325  Q
    |   ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2000860 ccatgggaggagcaaaatattttgtgtcatttattgatgaccactctaggagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcaaatgtgtttacagtatt 2000959  T
Q  326 caaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagtttctagca 425  Q
    ||||| ||||||||||||  | || ||||||||| | || | ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||         
T  2000960 caaggaattcaaagcacacgtggaacttgaaactagtaaaagaataaagtgcttaagaacaaacaatggagcagaatatgtagatggtgactttc----- 2001054  T
Q  426 ttttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgtagaaagaa 525  Q
       || ||||| || ||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  2001055 ---tgcaaacatgaaggtattacaagacaattcacagttccacatacgcctcaacagaatggtgtagcagagcggatgaatataactctcctatatagaa 2001151  T
Q  526 caagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatcaacggcgat 625  Q
    ||||||| ||| ||| |||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||| || ||    
T  2001152 caagagccatgttgagaacaacaggagtggctaagtctttctgggcagaagctgtgaaaactgcctattacgtgatcaatcgatctccatcaaccgcaat 2001251  T
Q  626 tgatttgaagacaccaa 642  Q
    || |||||| |||||||    
T  2001252 tggtttgaaaacaccaa 2001268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 5821825 - 5821203
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821825 catcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 5821726  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821725 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 5821626  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5821625 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcagatgtgttt 5821526  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821525 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcgagt 5821426  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5821425 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 5821326  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821325 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 5821226  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5821225 acggcgattgatttgaagacacc 5821203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 2815813 - 2815194
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2815813 catcaaagactaggccatatgtcataacgtggcttgaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaattcagtaaatttaccattttgtgagc 2815714  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815713 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 2815614  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  2815613 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtaaccaatcaagaagaagtcagttgtgttt 2815514  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2815513 ccagtattcaaggcattaaaagcacaaatagagcttgaaactgggaaaaagattaagtgcttgaggatagataatggaggataatatgtagatgacgagt 2815414  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2815413 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcactgttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatataactctcct 2815314  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815313 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 2815214  T
Q  618 acggcgattgatttgaagac 637  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  2815213 acgttgattgatttgaagac 2815194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 642
Target Start/End: Original strand, 42586726 - 42587342
Alignment:
Q  26 actaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagcactgtgtg 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||  ||||| || |  |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||    
T  42586726 actaggccatatgtcggaacgtggtttgaaagctcttgcggaacaaaatcttctacctgggctcaagacaatgaatttgtctttctgtgagcactgtgtg 42586825  T
Q  126 ataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcaccagaaatat 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42586826 acaagcaagcaacatagattgaagttttccagagtaactactagaagcaaatacatacttgacttgatacattctgatgtgtgggagtcaccacaaatat 42586925  T
Q  226 ctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgtttccagtatt 325  Q
    |   ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||  | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||    
T  42586926 ccatgggaggagcaaaatattttgtgtcatttattgatgatcactctaggagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcaaatgtgtttaccgtatt 42587025  T
Q  326 caaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagtttctagca 425  Q
    ||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||    
T  42587026 caaggaattcaaaccacaagtggaacttgaaactggtaaaagaataaagtgcttaagaacagacaatggaggagaatatgtagatggtgattttttgaca 42587125  T
Q  426 ttttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgtagaaagaa 525  Q
    || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  42587126 ttctgcaaacatgagggtattacaagacaattcacagttccacatacgcctcaacagaatggtgtagcagagcggatgaatagaactctcttagataaaa 42587225  T
Q  526 caagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatcaacggcgat 625  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||    
T  42587226 caagagccatgttgagaacagcagtagtggctaagtctttctgggcagaagctgtgaaaaccgcctgttacgtgatcaatcgatctccatcaaccgcaat 42587325  T
Q  626 tgatttgaagacaccaa 642  Q
    || |||| | |||||||    
T  42587326 tggtttgtaaacaccaa 42587342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 581; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 640
Target Start/End: Original strand, 827244 - 827868
Alignment:
Q  16 gacatcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827244 gacatcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtga 827343  T
Q  116 gcactgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827344 gcactgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtca 827443  T
Q  216 ccagaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgt 315  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  827444 ccagaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcggatgtgt 827543  T
Q  316 ttccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  827544 ttccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcga 827643  T
Q  416 gtttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctc 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827644 gtttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctc 827743  T
Q  516 gtagaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccat 615  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827744 ctagaaagaacaagagttatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgtgcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccat 827843  T
Q  616 caacggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  827844 caacggcgattgatttgaagacacc 827868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 579; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 9442642 - 9442020
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442642 catcaaagactaggccatatgtctgaacgtggcttgaaagtccttgtggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 9442543  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442542 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 9442443  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9442442 agaattatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcagatgtgttt 9442343  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442342 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgtagatggcgagt 9442243  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9442242 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 9442143  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442142 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 9442043  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacacc 640  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  9442042 acggtgattgatttgaagacacc 9442020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 24597030 - 24596414
Alignment:
Q  26 actaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagcactgtgtg 125  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||  |||| |||||  ||||| || |  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  24597030 actaggccatatatcggaacgtggtttgaaagctcttgaggaacaaaatcttctacctgggctcaagacagtgaatttgtctttctgtgagcactgtgtg 24596931  T
Q  126 ataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcaccagaaatat 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24596930 acaagcaagcaacatagattgaagttttccagagtaactactagaagcaaatacatacttgacttgatacattctgatgtgtgggagtcaccacaaatat 24596831  T
Q  226 ctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgtttccagtatt 325  Q
    |   ||||||||||| | | || |||||||| ||||||||  | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  24596830 ccatgggaggagcaaaacattttgtgtcatttattgatgatcactctaggagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcaaatgtgtttacagtatt 24596731  T
Q  326 caaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagtttctagca 425  Q
    ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||    
T  24596730 caaggaattcaaagcacaagtggaacttgaaactggtaaaagaataaagtgcttaagaacagacaatggaggagaatatgtagatggtgattttttgaca 24596631  T
Q  426 ttttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgtagaaagaa 525  Q
    || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  24596630 ttctgcaaacatgagggtattacaagacaattcacagttccacatacgcctcaacagaatggtgtagcagagcggatgaatagaactctcttaaataaaa 24596531  T
Q  526 caagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatcaacggcgat 625  Q
     |||||| ||| ||| ||||||   | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  24596530 aaagagccatgttgagaacagcaatagtggctaagtctttctgggcagaagctgtgaaaaccgcctattacgtgatcaatcgatctacatcaaccgcaat 24596431  T
Q  626 tgatttgaagacaccaa 642  Q
    || |||||| |||||||    
T  24596430 tggtttgaaaacaccaa 24596414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 573; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 642
Target Start/End: Original strand, 34353777 - 34354401
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34353777 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttgaaagtccttgctgaacgcaatctccttcacgggctcaaggcagtaaatttaccattttgtgagc 34353876  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353877 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactaaaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 34353976  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34353977 agaaatatctctgggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcggatgtgttt 34354076  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354077 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 34354176  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34354177 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgcggcagagcggatgaatagaactctcct 34354276  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354277 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcaggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 34354376  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacaccaa 642  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  34354377 acgacaattgatttgaagacaccaa 34354401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 642
Target Start/End: Original strand, 41720177 - 41720801
Alignment:
Q  18 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttaaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41720177 catcaaagactaggccatatgtcagaacgtggcttgaaagtccttgcggaacgcaatctccttcacgggctcaaggcagtaaatttaccattttgtgagc 41720276  T
Q  118 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720277 actgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagagtaactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagtcacc 41720376  T
Q  218 agaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtcggatgtgttt 317  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41720377 agaaatatctctaggaggagcaagatattttgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacccaatcaagaagaagtcggatgtgttt 41720476  T
Q  318 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgtagatggcgagt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41720477 ccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactaggaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatatagatggcgagt 41720576  T
Q  418 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41720577 ttctagcattttgtaaacaagagggtattgtaaggcaattcacggttgcacatacacctcagcagaatggtgtggcagagcggatgaatagaactctcct 41720676  T
Q  518 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcggtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720677 agaaagaacaagagctatgctgaaaacagcgggaatggccaagtcgttctgggcagaagcagtgaaaaccgcctgttatgtaataaatcgctcaccatca 41720776  T
Q  618 acggcgattgatttgaagacaccaa 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41720777 acggcgattgatttgaagacaccaa 41720801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8136971 - 8136818
Alignment:
Q  61 ttgcggaacgcaatctcctt-cacgggctcaagacagtaaatttaccattctgtgagcactgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8136971 ttgcggaacgcaatctcctttcacaggctgaagacggtaaacttaccattctgtgagcactgtgtgataagcaagcaacatagattgaagtttgctagag 8136872  T
Q  160 taactactagaagcaaacacatactagacttgatacattctgatgtgtgggagt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8136871 taactactagaagcaaacatatactagacttgatccattatgatgtgtgggagt 8136818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8134907 - 8134716
Alignment:
Q  208 gggagtcaccagaaatatctcagggaggagcaagatacttcgtgtcattcattgatgactattccagaagattatgggtgtacctaatcaagaagaagtc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8134907 gggagtcaccagaaatatctctgggaggggcaagatatttcgtctcattcattgattactattccagaagattatgggtgtacccaattaagaagaagtc 8134808  T
Q  308 ggatgtgtttccagtattcaaggcattcaaagcacaaatagagcttgaaactgggaagaaaattaagtgcttgaggacagacaatggaggagaatatgta 407  Q
     ||||||||| ||||         |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8134807 agatgtgttttcagt---------attcaaagcacaaataaagcgtgaaattgagaagaaaattaagtgcttgaggacagataatggaggagaatatgta 8134717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University