View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1290_low_13 (Length: 430)

Name: NF1290_low_13
Description: NF1290
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1290_low_13
NF1290_low_13
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (30-409)||(25637342-25637722)
chr3 (30-417)||(3617355-3617742)
chr3 (30-417)||(4598399-4598785)
chr3 (30-417)||(10211301-10211687)
chr3 (30-417)||(4600620-4601006)
chr3 (30-417)||(10209081-10209467)
chr3 (30-417)||(10056125-10056511)
chr3 (30-417)||(10058347-10058733)
chr3 (30-417)||(10060569-10060955)
chr3 (30-417)||(10062791-10063177)
chr3 (30-417)||(10065013-10065399)
chr3 (33-409)||(54635039-54635412)
chr3 (32-409)||(45282897-45283276)
chr3 (33-409)||(6716414-6716789)
chr3 (222-417)||(10067235-10067431)
chr3 (33-409)||(801005-801376)
chr3 (33-360)||(7779883-7780208)
chr3 (34-409)||(23200020-23200398)
chr3 (36-409)||(23197823-23198199)
chr3 (291-409)||(6718598-6718718)
chr3 (30-195)||(10067435-10067598)
chr3 (152-406)||(45095075-45095335)
chr3 (152-406)||(5258140-5258402)
chr3 (149-406)||(9636119-9636385)
chr3 (152-406)||(5260319-5260581)
chr3 (37-322)||(19683774-19684054)
chr3 (152-325)||(7762265-7762437)
chr3 (152-325)||(37408458-37408630)
chr3 (152-406)||(9581193-9581454)
chr3 (152-314)||(7764476-7764636)
chr3 (152-325)||(34491212-34491383)
chr3 (161-325)||(4569952-4570115)
chr3 (149-325)||(49199462-49199638)
chr3 (152-325)||(29196383-29196555)
chr3 (152-322)||(39153358-39153526)
chr3 (149-325)||(43401794-43401970)
chr3 (149-234)||(43403737-43403821)
chr3 (152-325)||(40734498-40734669)
chr3 (159-325)||(41819526-41819691)
chr3 (152-325)||(44331545-44331716)
chr3 (165-321)||(30236129-30236283)
chr3 (163-322)||(22835010-22835167)
chr3 (159-325)||(6095603-6095767)
chr3 (152-325)||(40735383-40735554)
chr3 (176-322)||(760850-760995)
chr3 (152-307)||(51398833-51398985)
chr3 (159-325)||(54593704-54593868)
chr3 (152-406)||(29682269-29682530)
chr3 (152-325)||(44700476-44700646)
chr3 (152-234)||(16499120-16499200)
chr3 (164-323)||(31314447-31314604)
chr3 (149-222)||(40913395-40913467)
chr3 (167-325)||(46860474-46860631)
chr3 (163-325)||(53921511-53921671)
chr3 (152-325)||(5236454-5236624)
chr3 (152-306)||(29813083-29813234)
chr3 (164-223)||(27305719-27305777)
chr3 (176-305)||(29810889-29811016)
chr3 (165-306)||(46173377-46173515)
chr3 (161-234)||(47304342-47304413)
chr3 (159-224)||(55301975-55302040)
chr3 (163-323)||(32891105-32891264)
chr3 (152-307)||(32744433-32744584)
chr3 (152-307)||(9666463-9666616)
chr3 (155-320)||(4055763-4055926)
chr3 (253-325)||(5433971-5434046)
chr3 (161-224)||(2075081-2075143)
chr3 (152-234)||(23391906-23391986)
chr3 (180-240)||(33191916-33191974)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (30-417)||(6594434-6594819)
chr7 (30-417)||(18392072-18392457)
chr7 (30-417)||(18388636-18389021)
chr7 (30-417)||(6592216-6592601)
chr7 (30-417)||(32060198-32060587)
chr7 (59-409)||(20343811-20344158)
chr7 (88-409)||(24789755-24790074)
chr7 (29-248)||(1560540-1560757)
chr7 (255-417)||(1562103-1562265)
chr7 (34-409)||(39731283-39731656)
chr7 (33-409)||(43504036-43504409)
chr7 (149-406)||(35853825-35854089)
chr7 (149-409)||(25766953-25767215)
chr7 (152-406)||(29990965-29991225)
chr7 (149-409)||(48408709-48408979)
chr7 (37-393)||(25615785-25616137)
chr7 (152-325)||(34310712-34310884)
chr7 (152-325)||(23555039-23555212)
chr7 (159-325)||(22269973-22270137)
chr7 (152-406)||(4178685-4178945)
chr7 (152-325)||(14069830-14070001)
chr7 (152-325)||(14379858-14380029)
chr7 (152-406)||(19502088-19502350)
chr7 (152-325)||(41317431-41317602)
chr7 (159-325)||(8359319-8359485)
chr7 (159-325)||(29608737-29608901)
chr7 (163-325)||(30024740-30024900)
chr7 (159-271)||(32358058-32358167)
chr7 (176-325)||(48491579-48491727)
chr7 (152-325)||(27347817-27347988)
chr7 (152-306)||(41649008-41649158)
chr7 (159-325)||(48599338-48599502)
chr7 (159-325)||(3258995-3259159)
chr7 (149-307)||(2390301-2390456)
chr7 (160-325)||(6431971-6432134)
chr7 (161-325)||(43864244-43864406)
chr7 (165-325)||(4253538-4253697)
chr7 (152-325)||(8153342-8153513)
chr7 (152-325)||(18126644-18126815)
chr7 (161-325)||(2360978-2361140)
chr7 (164-393)||(47673953-47674189)
chr7 (159-325)||(4508710-4508874)
chr7 (152-307)||(31732966-31733118)
chr7 (152-325)||(48489431-48489602)
chr7 (161-325)||(4586161-4586323)
chr7 (161-304)||(22328395-22328538)
chr7 (163-306)||(23565069-23565210)
chr7 (163-325)||(47676144-47676304)
chr7 (152-325)||(36146405-36146576)
chr7 (152-406)||(38671219-38671480)
chr7 (161-224)||(18396418-18396481)
chr7 (161-224)||(30814536-30814598)
chr7 (34-92)||(24790230-24790288)
chr7 (253-325)||(23343975-23344048)
chr7 (161-234)||(24525508-24525579)
chr7 (254-325)||(24525992-24526065)
chr7 (161-322)||(31105399-31105558)
chr7 (163-234)||(31518993-31519063)
chr7 (159-234)||(4510552-4510625)
chr7 (159-234)||(4512394-4512467)
chr7 (161-240)||(5513673-5513749)
chr7 (161-271)||(36574522-36574629)
chr7 (176-234)||(496003-496060)
chr7 (165-234)||(2759207-2759274)
chr7 (174-234)||(1113748-1113807)
chr7 (152-220)||(12097864-12097931)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (30-417)||(12647262-12647647)
chr2 (29-346)||(13655904-13656221)
chr2 (33-409)||(6266605-6266979)
chr2 (34-409)||(32289479-32289853)
chr2 (34-409)||(4484211-4484592)
chr2 (34-409)||(30833252-30833633)
chr2 (152-406)||(45099665-45099926)
chr2 (35-406)||(4503017-4503390)
chr2 (152-406)||(36205661-36205921)
chr2 (152-406)||(5723252-5723512)
chr2 (37-406)||(36987961-36988333)
chr2 (152-325)||(2334414-2334586)
chr2 (159-325)||(45726929-45727093)
chr2 (152-306)||(6595002-6595154)
chr2 (152-393)||(34139767-34140017)
chr2 (161-325)||(29867869-29868031)
chr2 (161-320)||(33648176-33648335)
chr2 (152-307)||(723741-723893)
chr2 (154-325)||(24398055-24398228)
chr2 (152-396)||(38312159-38312411)
chr2 (164-307)||(14633834-14633975)
chr2 (159-306)||(35446888-35447032)
chr2 (176-406)||(42362262-42362500)
chr2 (159-325)||(1631736-1631900)
chr2 (152-325)||(36773562-36773733)
chr2 (152-234)||(17057366-17057446)
chr2 (152-234)||(17085349-17085429)
chr2 (152-325)||(11151588-11151759)
chr2 (190-325)||(13121769-13121901)
chr2 (152-325)||(36318006-36318177)
chr2 (152-224)||(39284936-39285007)
chr2 (161-271)||(17490154-17490261)
chr2 (161-325)||(26353184-26353346)
chr2 (152-224)||(17450678-17450748)
chr2 (152-307)||(11067324-11067476)
chr2 (152-307)||(33162447-33162599)
chr2 (167-219)||(28672036-28672088)
chr2 (161-224)||(42288117-42288178)
chr2 (159-224)||(7451218-7451281)
chr2 (179-224)||(42412118-42412162)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (30-417)||(44203539-44203924)
chr1 (32-409)||(9036331-9036706)
chr1 (33-409)||(40282291-40282664)
chr1 (33-409)||(21053872-21054245)
chr1 (33-409)||(9987116-9987489)
chr1 (33-409)||(20622118-20622492)
chr1 (34-409)||(51765302-51765684)
chr1 (152-326)||(13316348-13316521)
chr1 (37-322)||(8550670-8550952)
chr1 (152-406)||(20762582-20762844)
chr1 (152-325)||(3189330-3189502)
chr1 (152-325)||(3198147-3198319)
chr1 (152-325)||(3206986-3207158)
chr1 (159-325)||(37168297-37168462)
chr1 (159-325)||(13547093-13547257)
chr1 (149-325)||(42297968-42298143)
chr1 (159-325)||(13549004-13549168)
chr1 (159-325)||(29136247-29136412)
chr1 (159-325)||(47255343-47255508)
chr1 (152-325)||(28220223-28220394)
chr1 (159-325)||(7482234-7482399)
chr1 (161-325)||(44455160-44455322)
chr1 (159-325)||(11348698-11348862)
chr1 (152-322)||(834164-834332)
chr1 (152-325)||(3156865-3157036)
chr1 (152-325)||(4552634-4552805)
chr1 (152-306)||(28265551-28265702)
chr1 (159-325)||(47115171-47115337)
chr1 (159-307)||(31925711-31925856)
chr1 (152-325)||(37033068-37033241)
chr1 (176-325)||(37503577-37503722)
chr1 (152-325)||(49918350-49918521)
chr1 (152-325)||(28223418-28223589)
chr1 (159-234)||(28242396-28242469)
chr1 (152-325)||(45644351-45644523)
chr1 (160-307)||(34603595-34603740)
chr1 (152-234)||(13659333-13659413)
chr1 (180-320)||(22079322-22079461)
chr1 (159-224)||(193711-193775)
chr1 (161-325)||(19754494-19754657)
chr1 (163-325)||(50169218-50169378)
chr1 (176-325)||(23555286-23555433)
chr1 (152-325)||(31659238-31659409)
chr1 (152-325)||(50167172-50167343)
chr1 (152-234)||(46065009-46065089)
chr1 (179-325)||(1833522-1833667)
chr1 (152-393)||(3847118-3847367)
chr1 (182-271)||(6808507-6808595)
chr1 (159-224)||(37876770-37876834)
chr1 (184-271)||(5459961-5460046)
chr1 (165-306)||(37282701-37282841)
chr1 (163-306)||(196915-197056)
chr1 (176-307)||(15820326-15820455)
chr1 (152-325)||(19752685-19752857)
chr1 (249-307)||(32736952-32737009)
chr1 (176-234)||(36683771-36683828)
chr1 (161-304)||(927982-928123)
chr1 (167-224)||(8871074-8871130)
chr1 (253-320)||(12318618-12318685)
chr1 (152-224)||(13137973-13138044)
chr1 (216-271)||(25652141-25652195)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (30-417)||(2480-2865)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (30-417)||(25421211-25421598)
chr6 (30-417)||(6027154-6027538)
chr6 (30-417)||(33341979-33342367)
chr6 (29-417)||(34166986-34167373)
chr6 (33-409)||(16554783-16555159)
chr6 (33-409)||(16631339-16631715)
chr6 (33-409)||(16653026-16653402)
chr6 (33-409)||(16578396-16578772)
chr6 (33-409)||(16616608-16616984)
chr6 (30-417)||(34164764-34165150)
chr6 (30-352)||(13153886-13154207)
chr6 (33-409)||(27647777-27648141)
chr6 (54-409)||(412016-412369)
chr6 (33-409)||(3072639-3073014)
chr6 (52-409)||(6097349-6097695)
chr6 (149-409)||(2171525-2171792)
chr6 (152-406)||(31404671-31404932)
chr6 (159-406)||(30834539-30834794)
chr6 (152-406)||(5406196-5406456)
chr6 (152-406)||(5410521-5410781)
chr6 (152-402)||(16452325-16452583)
chr6 (163-325)||(5413401-5413561)
chr6 (159-325)||(21588931-21589095)
chr6 (159-325)||(21593664-21593828)
chr6 (54-325)||(33160254-33160521)
chr6 (149-325)||(3808701-3808877)
chr6 (163-234)||(5409076-5409146)
chr6 (159-322)||(17758026-17758188)
chr6 (159-325)||(17762990-17763155)
chr6 (159-325)||(2972943-2973107)
chr6 (152-325)||(9183028-9183199)
chr6 (152-406)||(16568953-16569193)
chr6 (159-323)||(26830127-26830289)
chr6 (159-325)||(22424829-22424995)
chr6 (167-325)||(28137420-28137576)
chr6 (159-305)||(5043648-5043792)
chr6 (152-322)||(26954283-26954450)
chr6 (152-234)||(33211182-33211262)
chr6 (163-234)||(26800679-26800748)
chr6 (206-325)||(4045423-4045542)
chr6 (30-67)||(6136179-6136216)
chr6 (149-224)||(603082-603156)
chr6 (179-325)||(3038926-3039071)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (30-417)||(3602-3987)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (30-417)||(25078026-25078413)
chr5 (30-417)||(25135995-25136382)
chr5 (30-417)||(40379998-40380383)
chr5 (30-417)||(40382209-40382594)
chr5 (30-417)||(16544315-16544703)
chr5 (30-417)||(16546537-16546925)
chr5 (30-409)||(10593172-10593550)
chr5 (35-413)||(22536174-22536545)
chr5 (33-409)||(29751040-29751414)
chr5 (37-409)||(29720278-29720647)
chr5 (37-409)||(29722438-29722807)
chr5 (33-409)||(9789104-9789478)
chr5 (33-409)||(18441524-18441902)
chr5 (34-409)||(16409389-16409764)
chr5 (54-409)||(26177797-26178150)
chr5 (101-409)||(26170688-26170983)
chr5 (152-406)||(25412672-25412932)
chr5 (152-406)||(13342971-13343232)
chr5 (54-406)||(30182499-30182852)
chr5 (152-406)||(36074039-36074302)
chr5 (152-306)||(37439161-37439313)
chr5 (46-393)||(13239674-13240025)
chr5 (159-325)||(213465-213630)
chr5 (159-325)||(40147261-40147425)
chr5 (154-325)||(28278316-28278485)
chr5 (152-325)||(32636824-32636995)
chr5 (179-325)||(13695713-13695859)
chr5 (152-325)||(42428427-42428598)
chr5 (161-325)||(13488203-13488365)
chr5 (159-234)||(5058136-5058209)
chr5 (159-325)||(27637616-27637781)
chr5 (161-406)||(31182883-31183133)
chr5 (163-406)||(30682930-30683178)
chr5 (135-406)||(33831590-33831866)
chr5 (152-325)||(533769-533940)
chr5 (152-224)||(19806463-19806534)
chr5 (152-393)||(8565943-8566192)
chr5 (161-271)||(16452135-16452242)
chr5 (177-224)||(16640961-16641008)
chr5 (161-325)||(28750661-28750823)
chr5 (152-322)||(39468546-39468714)
chr5 (165-319)||(316769-316922)
chr5 (161-221)||(4160702-4160762)
chr5 (176-325)||(42426255-42426403)
chr5 (159-234)||(27015614-27015687)
chr5 (161-271)||(33906035-33906144)
chr5 (163-322)||(538028-538185)
chr5 (167-271)||(9049354-9049455)
chr5 (207-271)||(10054867-10054929)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (30-409)||(6188-6567)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (30-417)||(8393302-8393687)
chr4 (30-417)||(8395511-8395896)
chr4 (30-417)||(7124807-7125194)
chr4 (30-417)||(7122588-7122975)
chr4 (30-417)||(5138196-5138583)
chr4 (30-417)||(5135970-5136358)
chr4 (33-393)||(31495188-31495556)
chr4 (152-406)||(13992289-13992544)
chr4 (159-406)||(29999809-30000063)
chr4 (152-393)||(56178633-56178882)
chr4 (154-325)||(52095361-52095530)
chr4 (152-311)||(5370079-5370237)
chr4 (152-325)||(48143042-48143215)
chr4 (149-321)||(2209717-2209889)
chr4 (159-325)||(41964415-41964580)
chr4 (164-325)||(9927467-9927626)
chr4 (159-325)||(46703500-46703666)
chr4 (149-305)||(12119559-12119714)
chr4 (152-325)||(47038408-47038577)
chr4 (152-325)||(12739547-12739718)
chr4 (152-306)||(12743922-12744073)
chr4 (152-306)||(12745311-12745462)
chr4 (161-325)||(26364236-26364398)
chr4 (161-325)||(40632445-40632607)
chr4 (159-307)||(6655975-6656120)
chr4 (159-325)||(12073392-12073557)
chr4 (159-325)||(41639426-41639590)
chr4 (159-271)||(50673851-50673960)
chr4 (176-325)||(8665408-8665556)
chr4 (152-325)||(26175633-26175804)
chr4 (161-299)||(26699447-26699585)
chr4 (152-325)||(34570411-34570582)
chr4 (152-325)||(36463386-36463557)
chr4 (161-318)||(5207848-5208003)
chr4 (161-325)||(36994524-36994686)
chr4 (161-325)||(54883020-54883182)
chr4 (163-307)||(379399-379541)
chr4 (165-325)||(37229731-37229890)
chr4 (152-323)||(46147388-46147557)
chr4 (159-325)||(8648139-8648303)
chr4 (164-325)||(27416974-27417133)
chr4 (164-325)||(37740625-37740784)
chr4 (152-325)||(45687179-45687351)
chr4 (152-271)||(48893635-48893751)
chr4 (161-306)||(6542185-6542328)
chr4 (149-271)||(50262694-50262814)
chr4 (152-325)||(5429679-5429850)
chr4 (164-271)||(35662496-35662600)
chr4 (176-325)||(54199926-54200074)
chr4 (161-271)||(4588014-4588121)
chr4 (152-234)||(5871911-5871991)
chr4 (152-225)||(52467351-52467423)
chr4 (196-306)||(12744087-12744195)
chr4 (180-271)||(33989899-33989989)
chr4 (161-271)||(31474206-31474313)
chr4 (253-325)||(12747851-12747924)
chr4 (196-307)||(12745476-12745585)
chr4 (152-224)||(29254594-29254665)
chr4 (182-238)||(33089966-33090021)
chr4 (152-200)||(52082660-52082708)
chr4 (224-321)||(48142444-48142542)
chr4 (176-234)||(13009464-13009521)
chr4 (253-325)||(52082752-52082825)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (30-417)||(15290430-15290816)
chr8 (30-417)||(15470799-15471185)
chr8 (30-417)||(42575201-42575586)
chr8 (33-413)||(25689865-25690243)
chr8 (33-409)||(3439418-3439791)
chr8 (34-409)||(2627649-2628024)
chr8 (152-406)||(17982563-17982825)
chr8 (152-406)||(34254327-34254586)
chr8 (35-406)||(31218167-31218541)
chr8 (152-406)||(34256503-34256762)
chr8 (54-325)||(42498193-42498459)
chr8 (152-406)||(44303764-44304027)
chr8 (153-306)||(1746216-1746366)
chr8 (152-325)||(19945355-19945529)
chr8 (159-325)||(42434995-42435159)
chr8 (152-325)||(15212786-15212957)
chr8 (152-323)||(40321082-40321251)
chr8 (159-325)||(4283524-4283688)
chr8 (152-325)||(33352150-33352321)
chr8 (152-325)||(43036423-43036594)
chr8 (159-325)||(18655400-18655564)
chr8 (152-325)||(27811278-27811449)
chr8 (152-307)||(12702631-12702783)
chr8 (152-325)||(3303667-3303838)
chr8 (152-252)||(4743211-4743308)
chr8 (161-325)||(40221745-40221907)
chr8 (176-271)||(1345391-1345484)
chr8 (182-322)||(40328782-40328922)
chr8 (152-271)||(5689326-5689442)
chr8 (161-224)||(10930205-10930267)
chr8 (162-325)||(18141821-18141981)
chr8 (176-319)||(30143346-30143488)
chr8 (162-271)||(41366622-41366727)
chr8 (152-322)||(6598975-6599143)
chr8 (152-322)||(6674428-6674596)
chr8 (164-325)||(30291606-30291767)
chr8 (152-325)||(4731658-4731829)
chr8 (161-224)||(4733806-4733868)
chr8 (162-325)||(1292471-1292631)
chr8 (161-325)||(8965697-8965859)
chr8 (206-325)||(9765745-9765863)
chr8 (159-307)||(11384004-11384149)
chr8 (163-271)||(7597669-7597776)
chr8 (161-271)||(10015136-10015241)
chr8 (194-322)||(44353796-44353923)
chr8 (60-97)||(32902096-32902133)
chr8 (161-307)||(4162516-4162658)
chr8 (161-271)||(18106087-18106191)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (30-188)||(1-157)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (34-409)||(11042-11423)
scaffold0491 (34-327)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (154-406)||(434443-434703)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (152-406)||(827-1087)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (149-325)||(11557-11732)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (152-325)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (159-306)||(18007-18151)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (159-325)||(7327-7491)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (161-224)||(10589-10651)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (161-325)||(20421-20583)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (152-234)||(149094-149174)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (167-271)||(27453-27556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25637722 - 25637342
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaa-caatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25637722 tattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagaggga 25637623  T
Q  129 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637622 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25637523  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637522 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25637423  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637422 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3617742 - 3617355
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3617742 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 3617645  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617644 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 3617546  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617545 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 3617446  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617445 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 3617355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 4598399 - 4598785
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598399 tattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4598496  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598497 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 4598595  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598596 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 4598695  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4598696 cactcaatgattctctctacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 4598785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10211687 - 10211301
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211687 tattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 10211590  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211589 gatgaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10211491  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211490 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10211391  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10211390 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 10211301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 4600620 - 4601006
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600620 tattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4600717  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600718 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 4600816  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600817 gttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 4600916  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4600917 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 4601006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10209467 - 10209081
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209467 tattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 10209370  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209369 gatgaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10209271  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209270 gttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10209171  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10209170 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 10209081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10056511 - 10056125
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10056511 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10056415  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10056414 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10056316  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056315 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10056216  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10056215 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10056125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10058733 - 10058347
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10058733 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10058637  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10058636 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10058538  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058537 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10058438  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10058437 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10058347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10060955 - 10060569
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10060955 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10060859  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10060858 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10060760  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060759 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10060660  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10060659 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10060569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10063177 - 10062791
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10063177 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10063081  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10063080 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10062982  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062981 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10062882  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10062881 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10062791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10065399 - 10065013
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10065399 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10065303  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10065302 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10065204  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065203 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10065104  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10065103 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10065013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 54635412 - 54635039
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  54635412 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 54635316  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54635315 gaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 54635217  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54635216 tt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 54635118  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635117 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 32 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45283276 - 45282897
Alignment:
Q  32 ttgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283276 ttgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaacaaggagagggaaga 45283178  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283177 agaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 45283079  T
Q  232 cttt--acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45283078 cttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagaca 45282979  T
Q  330 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282978 ctcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6716789 - 6716414
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6716789 tgtgcaagcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaa--aggggagggaaga 6716692  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6716691 agaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagtt 6716593  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 331  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6716592 ctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacact 6716494  T
Q  332 caatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716493 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 222 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067235
Alignment:
Q  222 caaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  321 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10067235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 801376 - 801005
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaag 130  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  801376 tgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca---caata--cacaagataaa--aggagagggaag 801285  T
Q  131 aagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagt 230  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  801284 aagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagt 801187  T
Q  231 tctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    || ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  801186 tc-ttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaaga 801089  T
Q  328 cactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801088 cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Original strand, 7779883 - 7780208
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaag 130  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  7779883 tgtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaag 7779979  T
Q  131 aagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagt 230  Q
    | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7779980 aggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagt 7780077  T
Q  231 tctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7780078 tc-ttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagaca 7780175  T
Q  330 ctcaatga--ttctctctacaaggtgtttccca 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7780176 ctcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Original strand, 23200020 - 23200398
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  23200020 gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcataagataaa--aggagagggaagaa 23200116  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23200117 gaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc 23200213  T
Q  233 tttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------c 323  Q
     ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |    
T  23200214 -ttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaac 23200310  T
Q  324 aagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200311 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 409
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198199
Alignment:
Q  36 gcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 134  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagagaagagga 23197919  T
Q  135 aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  23197920 aaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-t 23198015  T
Q  235 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caa 325  Q
    |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||    
T  23198016 tacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaa 23198113  T
Q  326 gacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198114 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  291 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  389 aaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10067598 - 10067435
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10067598 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 10067502  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 195  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067501 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095075
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 45095239  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  45095238 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 45095140  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095139 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 5258140 - 5258402
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||     
T  5258140 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 5258236  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  5258237 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 5258335  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258336 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 406
Target Start/End: Original strand, 9636119 - 9636385
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  9636119 aagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatac 9636215  T
Q  249 aaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctc-------accaagacactcaatga 337  Q
    || | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||       |||||||||||||||||    
T  9636216 aaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatga 9636314  T
Q  338 --ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
      ||| |||  |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636315 ttttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 5260319 - 5260581
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||     
T  5260319 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 5260415  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 338  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||  |    
T  5260416 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattt 5260514  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260515 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 134  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 19683869  T
Q  135 aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19683870 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-t 19683965  T
Q  235 tacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683966 tac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 7762341  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762340 agagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37408630 - 37408458
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  37408630 agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 37408534  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408533 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581193
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 9581358  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 342  Q
      ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||    
T  9581357 tgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttc 9581259  T
Q  343 tct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581258 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7764636 - 7764476
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  7764636 agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 7764540  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 314  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7764539 agagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 34491288  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491287 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4570115 - 4569952
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  4570115 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 4570019  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570018 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 325
Target Start/End: Original strand, 49199462 - 49199638
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  49199462 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 49199558  T
Q  249 aaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199559 aaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 29196478  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     || || |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196479 tgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||     
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctt--ataaagggatacaaa 39153453  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153454 tgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 325
Target Start/End: Original strand, 43401794 - 43401970
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||     
T  43401794 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagataa 43401890  T
Q  249 aaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401891 aaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43403821
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttctt 43403821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 40734574  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734573 tgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 41819526 - 41819691
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  41819526 tcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||     
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-taagttctt-acaaa-gagatacaaa 44331621  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     || ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331620 tggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30236283 - 30236129
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaa 263  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  30236283 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttacaagaa 30236188  T
Q  264 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 321  Q
    ||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236187 attagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaag 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaag 22835105  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835106 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 6095603 - 6095767
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  6095603 tcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 6095698  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||| |||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6095699 caagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735383
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 40735459  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  40735458 ctggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 40735383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 760995 - 760850
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  760995 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 760899  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    |||| |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  760898 caagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51398985 - 51398833
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 51398890  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
     | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51398889 tgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctaccc 51398833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54593868 - 54593704
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  54593868 tcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 54593773  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  54593772 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682269
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 29682435  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
      ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  29682434 tgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgatttt 29682336  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682335 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 44700570  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44700571 taggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16499120
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 16499120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31314604 - 31314447
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  31314604 cagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaa-agatacaaatgggttacaaga 31314509  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 323  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314508 aattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40913467 - 40913395
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 222  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40913467 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 40913395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860474
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaat 265  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-attac-aaagagatacaaatgggttacaagaaat 46860535  T
Q  266 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  46860534 tagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaag 261  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||  | ||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaatg-atacaaatgagttacaag 53921606  T
Q  262 aaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  53921607 aaattagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 5236454 - 5236624
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  5236454 agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 5236548  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236549 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813083
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| | ||    
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagagatgcaaa 29813139  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813138 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810889
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 29810920  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctac 305  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  29810919 caagttcacaaagaac-aactctaatttctac 29810889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173377
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaa 263  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 46173420  T
Q  264 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173419 attagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47304413 - 47304342
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47304413 acccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 47304342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 55301975 - 55302040
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55301975 tcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 55302040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaag 261  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| |||||||  | ||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttacaag 32891169  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 323  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32891168 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744584
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||     
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctt-acaaa-gtgatacaaa 32744528  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  32744529 tgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctaccc 32744584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666616
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-agggatacaa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||| |     
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattc-ttacaaagaggtataaat 9666559  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9666560 ga-gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctaccc 9666616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 320
Target Start/End: Original strand, 4055763 - 4055926
Alignment:
Q  155 ttggtcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaa--g 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||  |    
T  4055763 ttggttacccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaa-tgagtttcttacaaa-gagatacaaaag 4055858  T
Q  252 aggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 320  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055859 aggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  253 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 2075081 - 2075143
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075081 acccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23391986
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttctt 23391986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33191974 - 33191916
Alignment:
Q  180 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa 240  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33191974 tgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttacaaa 33191916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 6594434 - 6594819
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6594434 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 6594531  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594532 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 6594630  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594631 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 6594730  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594731 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 18392072 - 18392457
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18392072 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 18392169  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392170 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 18392268  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392269 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 18392368  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392369 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 18392457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 18388636 - 18389021
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18388636 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaagagagggaa 18388733  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388734 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 18388832  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388833 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 18388932  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388933 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 18389021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 6592216 - 6592601
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  6592216 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggag--ggaa 6592313  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592314 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 6592412  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6592413 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagac 6592512  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592513 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6592601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 32060198 - 32060587
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32060198 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 32060295  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060296 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 32060394  T
Q  229 gttctttacaaaa--gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060395 gttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 32060494  T
Q  327 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32060495 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccct 32060587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 59 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20344158 - 20343811
Alignment:
Q  59 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20344158 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 20344062  T
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20344061 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaaggttac 20343964  T
Q  259 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20343963 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 20343864  T
Q  357 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343863 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 88 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789755
Alignment:
Q  88 gaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 186  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 24789979  T
Q  187 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24789978 ctctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtt-tttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaat 24789881  T
Q  286 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 383  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789880 gaacaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 24789781  T
Q  384 taatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24789780 taatcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Original strand, 1560540 - 1560757
Alignment:
Q  29 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560540 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 1560639  T
Q  129 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560640 agaagaaaacaaatacacc-aagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 1560738  T
Q  229 gttctttacaaaagggatac 248  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1560739 gttc-ttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 255 - 417
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562265
Alignment:
Q  255 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 1562202  T
Q  355 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562203 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 1562265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731283
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 39731560  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39731559 ggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 39731463  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39731462 c-ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagaca 39731365  T
Q  330 ctcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731364 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 43504036 - 43504409
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  43504036 tgtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 43504130  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43504131 ggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagtt 43504228  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43504229 c-ttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagac 43504326  T
Q  329 actcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504327 actcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35854089 - 35853825
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  35854089 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 35853993  T
Q  249 aaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga- 337  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||     
T  35853992 aaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 35853894  T
Q  338 -ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853893 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 409
Target Start/End: Original strand, 25766953 - 25767215
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  25766953 aagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaaagagatac 25767049  T
Q  249 --aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc----accaagacactcaatga--t 338  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    | |||||||||||||||  |    
T  25767050 aaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattt 25767148  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767149 tcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990965
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    |||| |||||||     
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatt--agaaagagatacaaa 29991129  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  29991128 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 29991030  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991029 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48408979 - 48408709
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  48408979 aagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt-caaaagagatac 48408882  T
Q  249 --aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga 337  Q
      ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  48408881 aaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 48408783  T
Q  338 --ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
      ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408782 ttttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaacc-aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 134  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| | |||| |||||||||||      ||| ||||||||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaa------gagagaagaaga 25616044  T
Q  135 ---aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
       |||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25616043 gagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagtt 25615947  T
Q  232 ctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    | ||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||    
T  25615946 c-ttacaaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagac 25615853  T
Q  329 actcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    ||||||||||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615852 actcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||     
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaag-atacaaa 34310808  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310809 tgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23555039
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagagg-tacaaa 23555116  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555115 agtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22270137 - 22269973
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  22270137 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 22270042  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270041 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4178945 - 4178685
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||     
T  4178945 agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 4178850  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 339  Q
    | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  4178849 agggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 4178751  T
Q  340 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178750 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070001
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 14069925  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069926 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380029
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 14379953  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379954 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19502350 - 19502088
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  19502350 agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 19502254  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattc 340  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| ||||||||| ||   |||| |||||||||       ||||||||||||||||||    
T  19502253 agagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattc 19502155  T
Q  341 t--ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    |  |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502154 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 41317526  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
     || ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317527 tggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 8359319 - 8359485
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  8359319 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8359416 acaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29608901 - 29608737
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  29608901 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 29608806  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608805 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024900
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaag 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaag 30024835  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024836 aaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 32358058 - 32358167
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  32358058 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 32358153  T
Q  258 caagaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||||    
T  32358154 caagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttt--caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 48491631  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491630 caagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27347988 - 27347817
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  27347988 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 27347893  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347892 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649158
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 41649103  T
Q  251 gaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
      ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649104 tgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 48599338 - 48599502
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||||  | ||||    
T  48599338 tcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagctctt--ccaaagagatacaaatgagtta 48599433  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599434 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3259159 - 3258995
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||  | ||||    
T  3259159 tcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtt-tttac-aaagagatacaaatgagtta 3259064  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3259063 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2390456 - 2390301
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||  |||| |||| |||||    
T  2390456 aagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagtt-attac-aaagagatac 2390361  T
Q  249 -aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
     ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390360 aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  160 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttac 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttac 6432039  T
Q  259 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6432038 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43864406 - 43864244
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  43864406 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttaca 43864311  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864310 ggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 4253538 - 4253697
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaa 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| | |||| || ||| ||||| |||    
T  4253538 agttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttctttccaaa-gagatataaaagggttacatgaa 4253634  T
Q  264 attagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253635 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||     
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-attac-aaagagatacaaa 8153418  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153417 tgagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18126815 - 18126644
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  18126815 agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 18126720  T
Q  251 gaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  18126719 tgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 2361073  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2361074 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 393
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 47674047  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaag 350  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    ||||    
T  47674048 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaag 47674146  T
Q  351 gtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674147 gtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 4508710 - 4508874
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  4508710 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 4508805  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508806 caagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733118
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 31733061  T
Q  251 gaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
      ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31733062 tgggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 31733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489431
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||    |||| ||||| ||    
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttatt--gcaaagagatacaaa 48489507  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48489506 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586161
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||  || |||||    
T  4586323 acccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagataaaaatgggttaca 4586228  T
Q  260 agaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
    | |||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4586227 aaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328538
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||| || | |||| ||||||| || ||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactat-taatgacttccttgc-aaagagatacaaaagagttaca 22328492  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 304  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  22328493 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 22328538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 306
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaag 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagagttacaag 23565164  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565165 aaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 47676144 - 47676304
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaag 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  47676144 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaag 47676239  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  47676240 aaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146576
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 36146500  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36146501 tgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671480
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gtgatacaaa 38671314  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
     | ||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  38671315 tgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatttt 38671413  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38671414 cgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 38671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396418
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30814598 - 30814536
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30814598 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24790288 - 24790230
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaac 92  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  24790288 gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  253 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525579
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 24525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 325
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  254 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Original strand, 31105399 - 31105558
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  31105399 acccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatacaaatgggttaca 31105494  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31105495 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518993
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttctt 31518993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Original strand, 4510552 - 4510625
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4510552 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctt 4510625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Original strand, 4512394 - 4512467
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4512394 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctt 4512467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 5513673 - 5513749
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa 240  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  5513673 acccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattg-attctccaattcagtgtc-aatgagttctttacaaa 5513749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 36574522 - 36574629
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||| |||||    
T  36574522 acccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaa-tgagttctttacaaa-gagatataaaagggttaca 36574617  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  36574618 agaaattagctt 36574629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Original strand, 496003 - 496060
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  496003 aacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 496060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 2759207 - 2759274
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2759207 agttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatc-aatgagttctt 2759274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1113807 - 1113748
Alignment:
Q  174 caaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1113807 caaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctt 1113748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12097931
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 220  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 12647262 - 12647647
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12647262 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 12647359  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647360 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 12647458  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647459 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 12647558  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647559 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 12647647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 346
Target Start/End: Original strand, 13655904 - 13656221
Alignment:
Q  29 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655904 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 13656003  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656004 agaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 13656103  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656104 agttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 13656202  T
Q  328 cactcaatgattctctcta 346  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13656203 cactcaatgattctctcta 13656221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6266979 - 6266605
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6266979 tgtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaa 6266883  T
Q  133 gaaaacaaaag-caccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6266882 gaaaacaaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagtt 6266785  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 330  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6266784 c-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 6266686  T
Q  331 tcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266685 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32289853 - 32289479
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  32289853 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 32289757  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||| ||||||||    
T  32289756 ggaaaacaaggacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagtt 32289658  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32289657 c-ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagaca 32289561  T
Q  330 ctcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289560 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Original strand, 4484211 - 4484592
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaag-caacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||  | |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4484211 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaa-gtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaaga 4484307  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4484308 agaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 4484404  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac----- 322  Q
    | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||         
T  4484405 c-ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaaga 4484502  T
Q  323 -caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
     |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484503 acaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30833633 - 30833252
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30833633 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 30833537  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30833536 ggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 30833440  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac----- 322  Q
    | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||         
T  30833439 c-ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T
Q  323 -caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
     |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30833341 acaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagag 30833252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45099926 - 45099665
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||     
T  45099926 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 45099831  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  45099830 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 45099732  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099731 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Original strand, 4503017 - 4503390
Alignment:
Q  35 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||     
T  4503017 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagag 4503111  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
      |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4503112 agaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 4503208  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctc-------a 321  Q
    ||    |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||       |    
T  4503209 tt---caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatga 4503304  T
Q  322 ccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503305 acaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 36205661 - 36205921
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||    |||| |||||||     
T  36205661 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 36205756  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 339  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  36205757 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 36205855  T
Q  340 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205856 cactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723512
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5723348  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5723349 aaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5723447  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723448 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 406
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988333
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 134  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 36988056  T
Q  135 aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36988057 aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-t 36988152  T
Q  235 tacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------ca 324  Q
    ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||       ||    
T  36988153 tac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaaca 36988250  T
Q  325 agacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988251 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334586
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 2334510  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2334511 agagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45727093 - 45726929
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||    
T  45727093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 45726998  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726997 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 6595002 - 6595154
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||| |||     
T  6595002 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttac-aaagagattcaaa 6595098  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595099 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 393
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34140017
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggataca-a 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagggatacata 34139863  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  34139864 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatttt 34139962  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139963 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867869
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  29868031 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 29867936  T
Q  260 agaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867935 agaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttaca 259  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||    
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttac-aaagaaatacaaaagggttaca 33648238  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 320  Q
     |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648237 ggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 723741 - 723893
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 723836  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723837 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  154 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga- 252  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |     
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaag 24398131  T
Q  253 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398130 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312159
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||| ||    
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatc-ttac-aaagagatacaaa 38312316  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
      |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  38312315 tgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 38312217  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 396  Q
    | ||   ||||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38312216 cactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaacc 38312159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 307
Target Start/End: Original strand, 14633834 - 14633975
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  14633834 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttc-ttacaaaagggatacaaatgggttacaaga 14633930  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    |||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||    
T  14633931 aattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctaccc 14633975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Original strand, 35446888 - 35447032
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  35446888 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 35446983  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  35446984 caagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctacc 35447032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 42362404  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatg 362  Q
    |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||    
T  42362403 caagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatg 42362305  T
Q  363 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362304 tttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 1631736 - 1631900
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  1631736 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 1631831  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  1631832 caagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773562
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||     
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaa-gagatacaaa 36773638  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  36773637 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057446
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085429
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17085429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151759
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||| ||    
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttc-ttac-aaagtgatacaaa 11151683  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11151684 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  190 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaa 288  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | |||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtt-tctacaaa-gagatacaa-aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaa 13121806  T
Q  289 caaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121805 caaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318177
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 36318101  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||| ||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  36318102 tgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 17490154 - 17490261
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||| || ||||||    
T  17490154 acccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagttacaaaagagttaca 17490249  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  17490250 agaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26353346 - 26353184
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| || ||||||    
T  26353346 acccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagtac-ttacaaaa-agatacaaaagtgttaca 26353251  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  26353250 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067324
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 11067381  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| |||||||||||||    
T  11067380 tgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctaccc 11067324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162599
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||    
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttac-agagagatacaaa 33162542  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  33162543 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 33162599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 219  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288178
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaa 42288178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7451281 - 7451218
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  7451281 tcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaa 7451218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  179 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44203924 - 44203539
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44203924 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 44203827  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203826 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 44203728  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203727 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 44203628  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203627 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 44203539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 32 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9036706 - 9036331
Alignment:
Q  32 ttgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036706 ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaaga 9036608  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9036607 agaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagtt 9036510  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 331  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9036509 ctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacact 9036411  T
Q  332 caatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036410 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9036331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 40282664 - 40282291
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40282664 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 40282568  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40282567 gaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 40282470  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40282469 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacact 40282371  T
Q  332 caatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282370 caatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21054245 - 21053872
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21054245 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 21054149  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21054148 gaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 21054051  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21054050 -ttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacact 21053952  T
Q  332 caatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053951 caatgattttttctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9987489 - 9987116
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9987489 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 9987393  T
Q  133 gaaaacaaaag-caccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9987392 gaaaacaaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagtt 9987295  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 330  Q
    | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9987294 c-ttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 9987197  T
Q  331 tcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987196 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 20622118 - 20622492
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20622118 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 20622214  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20622215 gaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 20622312  T
Q  233 tt-tacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 330  Q
    ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20622313 ttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacag 20622411  T
Q  331 tcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622412 tcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51765684 - 51765302
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51765684 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 51765588  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51765587 ggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 51765491  T
Q  232 ctttacaaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac---- 322  Q
    | ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||        
T  51765490 c-ttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaag 51765392  T
Q  323 --caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
      |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765391 aacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||     
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 13316444  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 326  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316445 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-ag 133  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||| | |||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaaga--gagaag-aagagag 8550766  T
Q  134 aaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 233  Q
    ||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  8550767 aaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc- 8550862  T
Q  234 ttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550863 ttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20762844 - 20762582
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  20762844 agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-gaagagatacaaa 20762748  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||       ||||| |||||||||  |    
T  20762747 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattt 20762649  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762648 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3189502 - 3189330
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||     
T  3189502 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatacaaa 3189406  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189405 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3198319 - 3198147
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||     
T  3198319 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatacaaa 3198223  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198222 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3207158 - 3206986
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||     
T  3207158 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatacaaa 3207062  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207061 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37168462 - 37168297
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  37168462 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 37168367  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168366 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 13547093 - 13547257
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  13547093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 13547188  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547189 caagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 325
Target Start/End: Original strand, 42297968 - 42298143
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||    
T  42297968 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatac 42298064  T
Q  249 aagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42298065 aaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 13549004 - 13549168
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  13549004 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 13549099  T
Q  258 caagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || ||||||| | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13549100 catgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29136412 - 29136247
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  ||||     
T  29136412 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 47255343 - 47255508
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  47255343 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220394
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 28220318  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220319 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 7482234 - 7482399
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  7482234 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 7482329  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482330 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455160
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||  | ||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaag-atacaaatgagttaca 44455227  T
Q  260 agaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44455226 agaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11348862 - 11348698
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    |||| ||||| ||  |||||    
T  11348862 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt--agaaagagatacaaatgggtta 11348767  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11348766 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834332
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 834259  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 322  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834260 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3157036 - 3156865
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  3157036 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 3156941  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  3156940 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552805
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 4552729  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4552730 ggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265702
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||    
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 28265646  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265647 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47115337 - 47115171
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||| |  ||||    
T  47115337 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaa-tgggtt-tttacaaa-gagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Original strand, 31925711 - 31925856
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  31925711 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 31925806  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31925807 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctaccc 31925856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatgcaaa 37033164  T
Q  252 a--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |  | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37033165 atggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Original strand, 37503577 - 37503722
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gac 274  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  37503577 aacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagataca--aggttacaagaaattagcttcaac 37503671  T
Q  275 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37503672 aagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918350
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 49918426  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918425 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223589
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 28223513  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28223514 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28242469 - 28242396
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28242469 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 28242396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 45644446  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45644447 tgagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603595
Alignment:
Q  160 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtta 257  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||| || |  |||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttc-ttac-aaagagataaaaaatgggtta 34603645  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34603644 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34603595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659413
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13659413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  180 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaag 277  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaag 22079364  T
Q  278 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 320  Q
     |||| | ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22079363 ctcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 193775 - 193711
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  193775 tcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaa 193711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19754657 - 19754494
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttaca 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||    
T  19754657 acccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatcggttaca 19754562  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  19754561 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 50169218 - 50169378
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaag 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||  | ||||||||    
T  50169218 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagtac-ttac-aaagagatacaaatgagttacaag 50169313  T
Q  262 aaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  50169314 aaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagcttga- 273  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |||| |||||||||| || |     
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttataagaaattagtttcaa 23555381  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23555382 caagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||| ||    
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaa 31659314  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31659313 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167343
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 50167267  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  50167268 tgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46065009
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctt 46065009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  179 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagcttgacaag 277  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |  ||    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatag 1833571  T
Q  278 -ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1833570 attcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 393
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847367
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 3847213  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
      |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  3847214 tgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatttt 3847312  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3847313 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 3847367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  182 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 271  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttac-aaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 37876770 - 37876834
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37876770 tcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaa 37876834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  184 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt 271  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctttacaaa-gaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282841
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaa 263  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||| | ||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttac-aaagagatgcaaaagggttaccataa 37282797  T
Q  264 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37282798 attagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc 37282841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 306
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197056
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaa 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||    
T  196915 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgagttacaa 197010  T
Q  261 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  197011 gaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctt--aaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaa 15820359  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820358 caagctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 19752762  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  19752761 tcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32737009 - 32736952
Alignment:
Q  249 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737009 aagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683771
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctt 36683771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 927982 - 928123
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||| ||| |||||    
T  927982 acccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtt-tttacaaa-gagatccaaaagggttaca 928077  T
Q  260 agaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 304  Q
    |||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928078 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 320
Target Start/End: Original strand, 12318618 - 12318685
Alignment:
Q  253 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 320  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318618 ggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138044
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaa 13138044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652141
Alignment:
Q  216 cactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25652195 cactatcaaa-gagttctttacaaa-gagatacaagagagttacaagaaattagctt 25652141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 2480 - 2865
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2480 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 2577  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578 gaagaaaacaataaacacaaaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 2676  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 2776  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25421598 - 25421211
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25421598 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 25421501  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421500 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25421402  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421401 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25421302  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421301 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 25421211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6027538 - 6027154
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  6027538 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa-atg--gagggaa 6027442  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027441 gaagaaaacaataaaca-caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 6027343  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027342 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 6027243  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027242 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6027154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 33341979 - 33342367
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa-ggagaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  33341979 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagaggg 33342076  T
Q  128 aagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 226  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342077 aagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 33342175  T
Q  227 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342176 gagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 33342275  T
Q  326 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342276 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 33342367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 29 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34167373 - 34166986
Alignment:
Q  29 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34167373 atattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagaggga 34167276  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  34167275 agaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaata 34167177  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167176 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 34167077  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34167076 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 34166986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16555159 - 16554783
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555159 tgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaa 16555061  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555060 gaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc 16554961  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16554960 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 16554862  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554861 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16554783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16631715 - 16631339
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631715 tgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaa 16631617  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631616 gaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc 16631517  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16631516 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 16631418  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631417 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16631339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16653402 - 16653026
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653402 tgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaa 16653304  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653303 gaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc 16653204  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16653203 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactc 16653105  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653104 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16653026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 16578396 - 16578772
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578396 tgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaa 16578494  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578495 gaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc 16578594  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16578595 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 16578693  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578694 aatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16578772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16616984 - 16616608
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616984 tgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaa 16616886  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616885 gaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc 16616786  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16616785 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 16616687  T
Q  333 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616686 aatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16616608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34165150 - 34164764
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34165150 tattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggga 34165054  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34165053 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 34164955  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164954 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 34164855  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34164854 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 34164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13154207 - 13153886
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13154207 tattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 13154110  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154109 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 13154011  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154010 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 13153911  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13153910 cactcaatgattctctctacaaggt 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27648141 - 27647777
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||       |||||||||  ||||||||||||||    
T  27648141 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaataca-------caagataaa--aggagagggaagaa 27648051  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27648050 gaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 27647953  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27647952 tt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 27647854  T
Q  333 aatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647853 aatgattctctctacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412016
Alignment:
Q  54 aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagag 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagag 412273  T
Q  154 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga- 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |     
T  412272 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaaa 412175  T
Q  253 -ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 348  Q
      |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  412174 gagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttca 412076  T
Q  349 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412075 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 3072639 - 3073014
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  3072639 tgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 3072735  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3072736 ggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagtt 3072833  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3072834 c-ttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagac 3072931  T
Q  329 actcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072932 actcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Original strand, 6097349 - 6097695
Alignment:
Q  52 aaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 150  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  ||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  6097349 aaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaagtggaaaaacacaataca-caatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaa 6097445  T
Q  151 gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaa 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||            
T  6097446 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag-------- 6097535  T
Q  251 gaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 347  Q
       |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  |    
T  6097536 --agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcacc 6097632  T
Q  348 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097633 aaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 409
Target Start/End: Original strand, 2171525 - 2171792
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  2171525 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 2171621  T
Q  249 aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga-- 337  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||      
T  2171622 aaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 2171720  T
Q  338 ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171721 ttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 31404671 - 31404932
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  31404671 agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 31404767  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  31404768 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttc 31404866  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404867 actcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 406
Target Start/End: Original strand, 30834539 - 30834794
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggtta 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| | |||||    
T  30834539 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaagggtta 30834635  T
Q  258 caagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||     
T  30834636 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 30834734  T
Q  346 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834735 ccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 5406196 - 5406456
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  5406196 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5406292  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5406293 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5406391  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406392 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 5410521 - 5410781
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  5410521 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5410617  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5410618 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5410716  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410717 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 402
Target Start/End: Original strand, 16452325 - 16452583
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggata-caa 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||  ||    
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatatgaa 16452421  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  16452422 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 16452520  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 402  Q
    || |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452521 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413561
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttacaag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5413497  T
Q  262 aaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5413498 aaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21589095 - 21588931
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  21589095 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21589000  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588999 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21593828 - 21593664
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  21593828 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21593733  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593732 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160521
Alignment:
Q  54 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 152  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  || |||||| | |||| || |||||||| ||||||||  ||||   |||||||  |||||||||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa-aaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga 33160350  T
Q  153 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 252  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |    
T  33160351 --ttgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 33160445  T
Q  253 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160446 gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 325
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3808877
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 3808797  T
Q  249 aaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3808798 aaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409146
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5409146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17758188 - 17758026
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  17758188 tcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17763155 - 17762990
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||  | |||  |||||||  | ||||    
T  17763155 tcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaaaagatacaaatgagtta 17763059  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 2972943 - 2973107
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  2972943 tcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 2973038  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973039 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183199
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 9183123  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183124 tgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568953
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaa------------ 16569109  T
Q  252 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---a 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||        
T  16569108 aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttacc 16569012  T
Q  347 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569011 caaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Original strand, 26830127 - 26830289
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-tta 257  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  || |||    
T  26830127 tcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatggatta 26830222  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  26830223 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 22424829 - 22424995
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga---ggt 255  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||| |   |||    
T  22424829 tcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt-acaaa-gagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  256 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137576
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaat 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaat 28137515  T
Q  266 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137516 tagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5043792 - 5043648
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  5043792 tcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 305  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5043695 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 5043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggataca-a 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaga 26954378  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 322  Q
       ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954379 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211262
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctt 33211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800679
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 26800679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  206 ctctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttct 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| || | | ||||||||||||||||| | |||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaa-tgagttatttacaaa-gagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttct 4045445  T
Q  304 acccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||  |||||||||||| ||||    
T  4045444 accattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 6136179 - 6136216
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136179 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 224
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603156
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaa 603156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 325
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  179 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaa 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  | ||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaa 3039022  T
Q  277 gttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3039023 gctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 3602 - 3987
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3602 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 3699  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3700 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatga 3798  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3799 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 3898  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3899 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 3987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25078413 - 25078026
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25078413 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25078316  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078315 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25078217  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078216 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25078117  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078116 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 25078026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25136382 - 25135995
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25136382 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25136285  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136284 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25136186  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136185 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25136086  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136085 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 25135995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40380383 - 40379998
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40380383 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 40380286  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40380285 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatga 40380187  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380186 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 40380087  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380086 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 40379998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40382594 - 40382209
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40382594 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 40382497  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40382496 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatga 40382398  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382397 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagac 40382298  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382297 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 40382209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16544703 - 16544315
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa-ggagaggg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16544703 tattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagaggg 16544606  T
Q  128 aagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 226  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544605 aagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16544507  T
Q  227 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544506 gagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 16544407  T
Q  326 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544406 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 16544315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16546925 - 16546537
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa-ggagaggg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16546925 tattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagaggg 16546828  T
Q  128 aagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 226  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546827 aagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16546729  T
Q  227 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16546728 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaa 16546629  T
Q  326 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546628 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 16546537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 30 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10593550 - 10593172
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593550 tattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaa 10593452  T
Q  130 gaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 229  Q
    | ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593451 gtagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 10593353  T
Q  230 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10593352 ttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagaca 10593254  T
Q  330 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593253 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10593172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Original strand, 22536174 - 22536545
Alignment:
Q  35 tgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 134  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  22536174 tgcaagcaacaatcaacaaaaaac-acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggggagggaagaaga 22536269  T
Q  135 aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22536270 aaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttctt 22536367  T
Q  235 tacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaa 334  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22536368 -acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaa 22536466  T
Q  335 tgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 413  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536467 tgattctctctgcagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 29751040 - 29751414
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||   || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29751040 tgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 29751136  T
Q  133 gaaaacaaaag-caccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29751137 gaaaacaaaagacacc-aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagtt 29751234  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 330  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29751235 c-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 29751333  T
Q  331 tcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751334 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29720647 - 29720278
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaa 136  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29720647 caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaa 29720551  T
Q  137 acaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttta 236  Q
    |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29720550 acaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-a 29720454  T
Q  237 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaat 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29720453 caaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaat 29720354  T
Q  336 gatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720353 gattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29722807 - 29722438
Alignment:
Q  37 caagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaa 136  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29722807 caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaa 29722711  T
Q  137 acaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttta 236  Q
    |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29722710 acaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-a 29722614  T
Q  237 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaat 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29722613 caaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaat 29722514  T
Q  336 gatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722513 gattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 9789104 - 9789478
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  9789104 tgtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagag 9789200  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9789201 gaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 9789299  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 330  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9789300 -ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacac 9789397  T
Q  331 tcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789398 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Original strand, 18441524 - 18441902
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaa----cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||    |||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18441524 tgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagaggga 18441620  T
Q  129 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18441621 agaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatga 18441719  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18441720 gttc-ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaag 18441817  T
Q  327 acactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441818 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16409764 - 16409389
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16409764 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 16409668  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16409667 ggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 16409569  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 329  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16409568 c-ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagaca 16409471  T
Q  330 ctcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409470 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26177797
Alignment:
Q  54 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  153 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 26177956  T
Q  253 g-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 348  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||    
T  26177955 gagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacca 26177858  T
Q  349 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177857 aggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26170983 - 26170688
Alignment:
Q  101 acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170983 acaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 26170886  T
Q  201 ttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  26170885 ttgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaat 26170799  T
Q  300 ttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 396  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| ||     
T  26170798 ttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-act 26170701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25412932 - 25412672
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  25412932 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 25412836  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  25412835 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 25412737  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412736 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||     
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 13343137  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  13343136 aggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 13343038  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343037 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30182852 - 30182499
Alignment:
Q  54 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||   |||||||  |||||||||    
T  30182852 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga 30182758  T
Q  153 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 252  Q
      ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||| || |    
T  30182757 --ttgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatagaaaa 30182663  T
Q  253 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  30182662 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 30182564  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182563 actcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 36074039 - 36074302
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||     
T  36074039 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 36074134  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga- 337  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       |||||||||||||||     
T  36074135 agagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 36074233  T
Q  338 -ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074234 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 37439217  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439216 agagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13240025 - 13239674
Alignment:
Q  46 aacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaag 143  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||   |||||||      
T  13240025 aacaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaaca 13239930  T
Q  144 caccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 243  Q
    ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  13239929 caccaaaaa--ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaaga 13239835  T
Q  244 gatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactca 333  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||       |||||||||||    
T  13239834 gatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactca 13239736  T
Q  334 atga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    ||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239735 atgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 213630 - 213465
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  213630 tcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  258 caagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40147425 - 40147261
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  40147425 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 40147330  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147329 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  154 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aaga 252  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||      
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatg 28278390  T
Q  253 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278389 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32636995 - 32636824
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||    
T  32636995 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 32636900  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636899 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 325
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  179 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caa 276  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||    
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaa-gagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaa 13695810  T
Q  277 gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695811 gctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 42428522  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428523 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 13488270  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488269 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5058209 - 5058136
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5058209 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5058136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 27637616 - 27637781
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  27637616 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 27637711  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  27637712 acaagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31183133 - 31182883
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  31183133 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctt-acaaa-gggatacaaatggttacaa 31183038  T
Q  261 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ac--aa 349  Q
    ||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || || ||  ||    
T  31183037 gaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaa 31182939  T
Q  350 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182938 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 406
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagt-tctttacaaaagggatacaaga-ggttacaa 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||  |||||| | ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaa 30683026  T
Q  261 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaa 349  Q
    |||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 30683122  T
Q  350 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683123 ggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831590
Alignment:
Q  135 aaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  33831866 aaacaaaaacaccaaaga--ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttc-t 33831772  T
Q  235 tacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------ca 324  Q
    ||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||        |    
T  33831771 tac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaata 33831674  T
Q  325 agacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    ||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831673 agacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533769
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 533845  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  533844 tgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 393
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566192
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-agagggatacaaa 8566038  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 341  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  8566039 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatttt 8566137  T
Q  342 ctct---acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    | ||    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8566138 cactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 8566192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16452242 - 16452135
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  16452242 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 16452147  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  16452146 agaaattagctt 16452135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641008
Alignment:
Q  177 acttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 16641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750823
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-agatacaaatgggttaca 28750756  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     ||||||| |||  |||| ||||  | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28750757 ggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 39468641  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39468642 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 316922 - 316769
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaa 263  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  316922 agttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaaggattacaagaa 316825  T
Q  264 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatct 319  Q
    ||||||||  ||||| || | | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  316824 attagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 221  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Original strand, 42426255 - 42426403
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga- 273  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  || || |||||||||||||| |     
T  42426255 aacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaa 42426351  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  42426352 caatttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27015687 - 27015614
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  27015687 tcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttctt 27015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 33906035 - 33906144
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||    
T  33906035 acccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaaggattaca 33906132  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    |||| |||||||    
T  33906133 agaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 538028
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaag 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  538185 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaag 538090  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  538089 aaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049455
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaat 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaat 9049449  T
Q  266 tagctt 271  Q
    ||||||    
T  9049450 tagctt 9049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  207 tctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt 271  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaa-tgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6567 - 6188
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa-caaggagaggga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6567 tattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagaggga 6468  T
Q  129 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6467 agaagaaaacaataacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 6369  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6368 gttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 6269  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6268 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8393687 - 8393302
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8393687 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8393589  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393588 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 8393490  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8393489 gttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagac 8393391  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8393390 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccct 8393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8395896 - 8395511
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8395896 tattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8395798  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395797 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 8395699  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8395698 gttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagac 8395600  T
Q  329 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395599 actcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 8395511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7125194 - 7124807
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7125194 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7125097  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125096 gaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 7124998  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124997 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 7124898  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124897 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 7124807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7122975 - 7122588
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7122975 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7122878  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122877 gaagaaaacaataaacac-aaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 7122779  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122778 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 7122679  T
Q  329 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122678 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 7122588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5138583 - 5138196
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagaggg 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  5138583 tattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagaggg 5138487  T
Q  128 aagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 226  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5138486 aagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 5138388  T
Q  227 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138387 gagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5138288  T
Q  326 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138287 gacactcaatgattctctctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 5138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5136358 - 5135970
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagaggg 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  5136358 tattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagaggg 5136262  T
Q  128 aagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 226  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5136261 aagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 5136163  T
Q  227 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136162 gagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5136063  T
Q  326 gacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136062 gacactcaatgattctctctacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 5135970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 393
Target Start/End: Original strand, 31495188 - 31495556
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac------aaggagag 125  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||       ||||||||    
T  31495188 tgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggataaaaggagag 31495286  T
Q  126 ggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 225  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  31495287 ggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aa 31495384  T
Q  226 tgagttctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31495385 tgagttc-ttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcac 31495482  T
Q  323 caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31495483 caagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 13992289 - 13992544
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||     
T  13992289 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---acaagagatacaaa 13992384  T
Q  252 ag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctct 345  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  13992385 agagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactca 13992483  T
Q  346 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 406
Target Start/End: Original strand, 29999809 - 30000063
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||    
T  29999809 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaaagatacaaaagagtta 29999906  T
Q  258 caagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctac 347  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||| ||  ||| |||  |    
T  29999907 caagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacc 30000005  T
Q  348 aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000006 aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 393
Target Start/End: Original strand, 56178633 - 56178882
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  56178633 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 56178729  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 339  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  56178730 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 56178828  T
Q  340 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 393  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178829 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095530
Alignment:
Q  154 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aaga 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||| ||      
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttc-ttac-aaagagatacaaatg 52095456  T
Q  253 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095457 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370237
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5370175  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 311  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370176 agggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48143215 - 48143042
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||     ||| |||||||     
T  48143215 agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt--atgaagagatacaaa 48143119  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143118 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2209889 - 2209717
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  2209889 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 2209793  T
Q  249 aaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 321  Q
    || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209792 aaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaaatgggtt 41964485  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964484 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Original strand, 9927467 - 9927626
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  9927467 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 9927562  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927563 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46703666 - 46703500
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggtt 256  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||    
T  46703666 tcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  257 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119559
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12119714 aagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttac-aaagagatac 12119618  T
Q  249 aaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 305  Q
    || | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119617 aaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038577
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||  |||||||     
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgag-tccttac-aaacagatacaaa 47038503  T
Q  252 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038504 tgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739718
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||  ||||| ||    
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-atac-aaatagatacaaa 12739642  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 325  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739643 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 12744017  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744018 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 12745406  T
Q  251 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745407 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26364398 - 26364236
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  26364398 acccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 26364303  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364302 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632445
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||    
T  40632607 acccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttaca 40632512  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632511 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6656120 - 6655975
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  6656120 tcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 6656025  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656024 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12073557 - 12073392
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  12073557 tcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  258 caagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
    ||| |||||||||| | |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41639590 - 41639426
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||| ||  |||||    
T  41639590 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttc-ttac-aaatagatacaaatgggtta 41639495  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639494 caagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 50673851 - 50673960
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  50673851 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagtta 50673946  T
Q  258 caagaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||||    
T  50673947 caagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 8665460  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8665459 caagctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175804
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 26175728  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  26175729 tgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttac-aaagagatacaaaagagttaca 26699544  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaat 299  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26699545 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 34570411 - 34570582
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaa- 250  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  34570411 agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaat 34570506  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570507 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||| ||    
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 36463481  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463482 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 318
Target Start/End: Original strand, 5207848 - 5208003
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-agggatacaagaggttaca 259  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||| ||    
T  5207848 acccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaatagatatacaag-ggttgca 5207943  T
Q  260 agaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 318  Q
    | |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207944 ataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36994686 - 36994524
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||    
T  36994686 acccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 36994591  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994590 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54883182 - 54883020
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  54883182 acccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 54883087  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883086 agaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379399
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaag 261  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttc-ttac-aaagcgatacaaatgggttacaag 379445  T
Q  262 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  379444 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 379399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 37229731 - 37229890
Alignment:
Q  165 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-agggatacaagaggttacaagaa 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||| ||  |||||||| ||    
T  37229731 agttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctt-acaaagagatataaaaagggttacaacaa 37229827  T
Q  264 attagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||| |||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229828 atttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 323
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||     
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaa-gagatacaaa 46147483  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 323  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147484 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8648303 - 8648139
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  8648303 tcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 8648208  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 325  Q
     |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  8648207 taagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417133
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 27417069  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27417070 aattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740625
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 37740689  T
Q  263 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  37740688 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||     
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatagatacaaa 45687274  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     | |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45687275 tgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893751
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||     
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaa-gagatacaaa 48893730  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt 271  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  48893731 tgagttacaagaaattagctt 48893751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Original strand, 6542185 - 6542328
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||| | |||    
T  6542185 acccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttac-aaagagatacaaaaggctaaca 6542280  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6542281 agaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 271
Target Start/End: Original strand, 50262694 - 50262814
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  50262694 aagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatac 50262790  T
Q  249 -aagaggttacaagaaattagctt 271  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  50262791 aaatgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429679
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||| ||    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatagatacaaa 5429755  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  5429754 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662496
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaaga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttacaaga 35662505  T
Q  263 aattagctt 271  Q
    |||||||||    
T  35662504 aattagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Original strand, 54199926 - 54200074
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  54199926 aacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 54200022  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54200023 caagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4588121 - 4588014
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggttaca 259  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||    
T  4588121 acccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttaca 4588026  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  4588025 agaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871911
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttctt 5871911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467423
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 225  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa 52467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 306
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  196 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaac 293  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12744182  T
Q  294 cctaatttctacc 306  Q
    |||||||||||||    
T  12744183 cctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  180 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttac-aaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31474313 - 31474206
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  31474313 acccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 31474218  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  31474217 agaaattagctt 31474206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Original strand, 12747851 - 12747924
Alignment:
Q  253 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747851 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745585
Alignment:
Q  196 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaac 293  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aac 12745571  T
Q  294 cctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||||    
T  12745572 cctaatttctaccc 12745585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254594
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29254665 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaa 29254594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089966
Alignment:
Q  182 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttaca 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttaca 33089966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082708
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 200  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagaga 52082708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 321
Target Start/End: Original strand, 48142444 - 48142542
Alignment:
Q  224 aatgagttctttacaaa-agggatacaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctca 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  48142444 aatgagttctttacaaagagatatacaag-ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Original strand, 13009464 - 13009521
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13009464 aacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13009521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Original strand, 52082752 - 52082825
Alignment:
Q  253 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52082752 ggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaa-ccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15290816 - 15290430
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290816 tattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 15290719  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290718 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15290620  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290619 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15290520  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15290519 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 15290430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15471185 - 15470799
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15471185 tattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 15471088  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 228  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471087 gaagaaaacaataaacac-aaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15470989  T
Q  229 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470988 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15470889  T
Q  328 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15470888 cactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 15470799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 42575201 - 42575586
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  42575201 tattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaaccaaacacaagata--caaggagaggga 42575296  T
Q  129 agaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 227  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42575297 agaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 42575395  T
Q  228 agttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575396 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 42575495  T
Q  327 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42575496 acactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccct 42575586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 33 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25690243 - 25689865
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25690243 tgtgcaagcaagaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-cactcacaagataaa--aggggagggaagaa 25690147  T
Q  133 gaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25690146 gaaaacaacaaacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagtt 25690048  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 331  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25690047 ctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacact 25689949  T
Q  332 caatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 413  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689948 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 33 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3439791 - 3439418
Alignment:
Q  33 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3439791 tgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaa 3439695  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3439694 gaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc 3439596  T
Q  233 tttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 332  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3439595 -ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 3439497  T
Q  333 aatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439496 aatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2628024 - 2627649
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  2628024 gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 2627928  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2627927 ggaaaacaaagacaccaa-gagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 2627830  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 328  Q
    | ||||| ||| ||||||| |   ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2627829 c-ttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagac 2627732  T
Q  329 actcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627731 actcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17982825 - 17982563
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||     
T  17982825 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 17982729  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 338  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  17982728 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 17982630  T
Q  339 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982629 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 34254327 - 34254586
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||     
T  34254327 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaa 34254423  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34254424 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34254522  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254523 actcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31218541 - 31218167
Alignment:
Q  35 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 132  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||  || |||||||||||  |||||||  ||||     
T  31218541 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacat-aagcacaagataaa--aggagag--aagag 31218447  T
Q  133 gaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 232  Q
      |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31218446 agaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttc 31218350  T
Q  233 tttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcac------ 322  Q
    ||  | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||          
T  31218349 tt--ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatga 31218253  T
Q  323 -caagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218252 acaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 34256503 - 34256762
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  34256503 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 34256599  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34256600 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34256698  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     | |  |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256699 acacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498193
Alignment:
Q  54 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  |||| | |||||||  |||||||||    
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagggaaacaaacacaccaaaga 42498364  T
Q  153 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 252  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  42498363 --ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaaa 42498269  T
Q  253 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 325  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498268 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44304027 - 44303764
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||     
T  44304027 agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--aaaaagagatacaaa 44303931  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga-- 337  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||||||||||      
T  44303930 aggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 44303832  T
Q  338 ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303831 ttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746366
Alignment:
Q  153 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||| ||||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 1746311  T
Q  253 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746312 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 19945355 - 19945529
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac--a 249  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||  |    
T  19945355 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 19945451  T
Q  250 agaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19945452 agtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 42434995 - 42435159
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  42434995 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 42435090  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212786
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 15212862  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212861 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtt-tttac-aaagagatactaa 40321156  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 323  Q
      ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321155 tgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4283688 - 4283524
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  4283688 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 4283593  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 33352226  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352225 tgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036423
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 43036499  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     |  |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43036498 tgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18655564 - 18655400
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  18655564 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 18655469  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18655468 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||| ||    
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttc-ttac-aaagagatacaaa 27811354  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811353 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702783
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| || ||||     
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttc-ttac-aaagagacacaaa 12702726  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702727 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303838
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 3303762  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 325  Q
     | ||||||||||||||| || | |||| |||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3303763 tgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaact-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743308
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgggttacaag 4743307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221745
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 40221812  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40221811 agaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 271
Target Start/End: Original strand, 1345391 - 1345484
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggataca-agaggttacaagaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1345391 aacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt--caaagagatacatatgggttacaagaaattagctt 1345484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  182 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||  |||||     
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagc 40328826  T
Q  279 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40328825 tcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689326
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5689347  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt 271  Q
      |||||||||||||||||||    
T  5689346 tgggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 10930205 - 10930267
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10930205 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 10930267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  162 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 260  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagtgatacaaatgggttacaa 18141886  T
Q  261 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18141885 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143346
Alignment:
Q  176 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 273  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 30143392  T
Q  274 caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatct 319  Q
    |||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30143391 caagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366727
Alignment:
Q  162 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||    
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagggatacaaataggttaaaa 41366716  T
Q  261 gaaattagctt 271  Q
    |||||||||||    
T  41366717 gaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598975
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaa 6599048  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6599047 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674428
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 250  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaa 6674501  T
Q  251 gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6674500 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291606
Alignment:
Q  164 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaag 261  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||  | ||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattctt-acaaa-gtgatacaaatgagttacaag 30291672  T
Q  262 aaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||| | |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30291671 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4731829 - 4731658
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  4731829 agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaa 4731734  T
Q  252 agg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
     || |||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4731733 tgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4733868 - 4733806
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  4733868 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaa 4733806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 325
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  162 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttacaa 1292565  T
Q  261 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1292566 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 8965697 - 8965859
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| | |||| || ||| ||| |    
T  8965697 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatataaaagggttata 8965792  T
Q  260 agaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    |||||||| ||| | |||  |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965793 agaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  206 ctctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttct 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttct 9765768  T
Q  304 accc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  9765767 acccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11384149 - 11384004
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||||||  | ||||    
T  11384149 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatc-aatgggttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 11384054  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11384053 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 11384004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597669
Alignment:
Q  163 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagagg-ttacaag 261  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgcattctttac-aaagagatacaaaaggattataag 7597679  T
Q  262 aaattagctt 271  Q
    ||||||||||    
T  7597678 aaattagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015136
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| |||||||  | ||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatc-aatgagttcct---aaaagagatacaaatgagttaca 10015148  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  10015147 agaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  194 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaa 291  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-a 44353828  T
Q  292 accctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44353827 accctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 97
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902133
Alignment:
Q  60 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaa 32902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4162658 - 4162516
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  4162658 acccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 4162564  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 307  Q
    ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162563 agaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||  | ||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttctt-acaaaag--atacaaatgagttaca 18106179  T
Q  260 agaaattagctt 271  Q
    ||||||||||||    
T  18106180 agaaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 157 - 1
Alignment:
Q  30 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  157 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 60  T
Q  130 gaagaaaacaa-aagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 188  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 gaagaaaacaataaaca-caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11423
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 11138  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  11139 ggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagtt 11235  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac----- 322  Q
    | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||         
T  11236 c-ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 11333  T
Q  323 -caagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 409  Q
     |||||||||||||||||  | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11334 acaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8907
Alignment:
Q  34 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 131  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--agaagagggaaga 8712  T
Q  132 agaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 231  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  8713 ggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagtt 8809  T
Q  232 ctttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 327  Q
    | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8810 c-ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 434703 - 434443
Alignment:
Q  154 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga- 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |     
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaag 434607  T
Q  253 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  434606 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 434508  T
Q  341 tctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
     |||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434507 actcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    |||| |||||||     
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt---caaagagatacaaa 992  T
Q  252 a-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac------caagacactcaatga--tt 339  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  ||    
T  991 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttt 893  T
Q  340 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 406  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  892 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11732 - 11557
Alignment:
Q  149 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||    
T  11732 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatac 11636  T
Q  249 aagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11635 aaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaag 251  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 114678  T
Q  252 ag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114677 agcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18151
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gtta 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||  | ||||    
T  18007 tcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagtt--ttacaaa-gagatacaaatgagtta 18102  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 306  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7327
Alignment:
Q  159 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 257  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||    
T  7491 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 7396  T
Q  258 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7395 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10589
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10651 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 20421 - 20583
Alignment:
Q  161 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  20421 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 20516  T
Q  260 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 325  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20517 agaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149174
Alignment:
Q  152 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 149174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27556
Alignment:
Q  167 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaat 265  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||  | ||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttatttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaat 27550  T
Q  266 tagctt 271  Q
    ||||||    
T  27551 tagctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University