View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12913_low_19 (Length: 421)

Name: NF12913_low_19
Description: NF12913
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12913_low_19
NF12913_low_19
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-406)||(9690-10105)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (1-406)||(33574916-33575330)
chr5 (1-402)||(15532208-15532618)
chr5 (1-402)||(15542390-15542800)
chr5 (1-311)||(26712439-26712760)
chr5 (1-311)||(26982177-26982498)
chr5 (1-339)||(34405676-34406023)
chr5 (1-339)||(14616499-14616846)
chr5 (1-339)||(7650012-7650359)
chr5 (1-395)||(22159572-22159977)
chr5 (150-331)||(11988942-11989127)
chr5 (305-402)||(26711472-26711567)
chr5 (305-402)||(26981209-26981304)
chr5 (8-70)||(11989166-11989228)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-402)||(22626320-22626729)
chr3 (1-402)||(11138578-11138987)
chr3 (1-402)||(39563518-39563928)
chr3 (1-243)||(13979314-13979565)
chr3 (65-224)||(46731386-46731555)
chr3 (46-116)||(35366249-35366319)
chr3 (265-344)||(20536401-20536479)
chr3 (248-339)||(35366459-35366549)
chr3 (70-116)||(47412079-47412125)
chr3 (213-286)||(50096830-50096903)
chr3 (299-339)||(46731589-46731629)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-402)||(13017197-13017607)
chr6 (1-406)||(22221551-22221963)
chr6 (1-406)||(22247386-22247798)
chr6 (74-299)||(30978321-30978557)
chr6 (1-339)||(14790446-14790793)
chr6 (1-339)||(14795474-14795821)
chr6 (1-243)||(32704421-32704672)
chr6 (1-334)||(19664741-19665082)
chr6 (1-285)||(20527286-20527580)
chr6 (8-283)||(16883510-16883795)
chr6 (40-339)||(15534923-15535230)
chr6 (1-229)||(1838302-1838539)
chr6 (1-110)||(15538049-15538158)
chr6 (26-127)||(12983670-12983771)
chr6 (42-127)||(12980783-12980868)
chr6 (149-242)||(27649087-27649180)
chr6 (1-78)||(32427194-32427271)
chr6 (168-339)||(15540574-15540744)
chr6 (149-224)||(32427286-32427362)
chr6 (287-402)||(1838598-1838712)
chr6 (213-283)||(11183962-11184032)
chr6 (137-210)||(7769588-7769660)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (1-402)||(31528217-31528627)
chr2 (12-400)||(31626388-31626784)
chr2 (1-339)||(16294727-16295073)
chr2 (14-402)||(40017818-40018216)
chr2 (1-402)||(13709898-13710307)
chr2 (1-339)||(23673415-23673762)
chr2 (8-209)||(32575887-32576097)
chr2 (10-260)||(36326759-36327022)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-402)||(23759617-23760026)
chr7 (1-402)||(11279320-11279728)
chr7 (1-402)||(46846320-46846730)
chr7 (1-402)||(36222317-36222720)
chr7 (1-395)||(33312822-33313224)
chr7 (1-402)||(294692-295098)
chr7 (1-339)||(6966975-6967322)
chr7 (1-339)||(17866424-17866771)
chr7 (1-302)||(17863202-17863512)
chr7 (1-316)||(24783236-24783560)
chr7 (1-282)||(23107815-23108106)
chr7 (1-212)||(36843135-36843355)
chr7 (1-348)||(3861968-3862320)
chr7 (8-287)||(23313382-23313671)
chr7 (26-229)||(9765645-9765867)
chr7 (25-66)||(27796686-27796727)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-402)||(12171810-12172210)
chr4 (1-339)||(647274-647621)
chr4 (1-339)||(650546-650893)
chr4 (1-339)||(26062762-26063111)
chr4 (1-402)||(2541712-2542120)
chr4 (1-218)||(26060415-26060641)
chr4 (153-214)||(11649429-11649490)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-406)||(24189-24601)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (1-339)||(13493090-13493437)
chr1 (1-339)||(32505931-32506272)
chr1 (1-287)||(34066172-34066468)
chr1 (1-339)||(13495815-13496162)
chr1 (1-339)||(39546070-39546417)
chr1 (1-212)||(27282305-27282525)
chr1 (83-339)||(10764829-10765094)
chr1 (1-339)||(1936455-1936804)
chr1 (1-127)||(23990380-23990506)
chr1 (1-127)||(21153083-21153209)
chr1 (26-127)||(22453427-22453528)
chr1 (26-288)||(16190299-16190575)
chr1 (26-118)||(22456792-22456883)
chr1 (1-107)||(22104683-22104787)
chr1 (26-127)||(15297185-15297286)
chr1 (213-286)||(8435285-8435358)
chr1 (158-203)||(22456699-22456744)
chr1 (158-203)||(49147891-49147936)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (1-402)||(12575308-12575717)
chr8 (1-224)||(13096849-13097081)
chr8 (39-287)||(41778864-41779121)
chr8 (149-339)||(14418450-14418639)
chr8 (10-224)||(44008138-44008356)
chr8 (153-214)||(41836418-41836479)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-224)||(7177-7410)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (1-224)||(2519-2754)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (12-214)||(2799-3010)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-224)||(5995-6228)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (149-339)||(79-268)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (1-62)||(1-62)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 9690 - 10105
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9690 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 9789  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9790 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 9889  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9890 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattatttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggggaccaat 9989  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9990 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttattacttcgatcgaatttgatt 10089  T
Q  391 cacttaccaaatttct 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  10090 cacttgccaaatttct 10105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 33574916 - 33575330
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33574916 ttatgatatagggattaacattcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaag 33575015  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33575016 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcga 33575115  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575116 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 33575215  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33575216 ataaatttatacatcctttttaataataaaattgctaaatagaagttaaatacagtcctcgtgaaaacgaatt-ttttattacttcgattgaatttggtt 33575314  T
Q  391 cacttaccaaatttct 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  33575315 cacttgccaaatttct 33575330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15532618 - 15532208
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15532618 ttatgatatagggattaacgttcgtt-aatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 15532520  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15532519 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcga 15532420  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532419 aggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 15532320  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15532319 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggt 15532221  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||| | ||||||    
T  15532220 tcacatgccaaat 15532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15542800 - 15542390
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15542800 ttatgatatagggattaacgttcgtt-aatacctccattggtttcgaattcacttaagagatcaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 15542702  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15542701 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcga 15542602  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542601 aggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 15542502  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15542501 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgttaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggt 15542403  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||||| ||||||    
T  15542402 tcacttgccaaat 15542390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26712760 - 26712439
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26712760 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 26712661  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  26712660 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcga 26712562  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26712561 aagacttaaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcacta 26712463  T
Q  289 atataaa-tttatacatccttttt 311  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  26712462 atataaattttacacatccttttt 26712439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26982498 - 26982177
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26982498 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 26982399  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  26982398 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcga 26982300  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26982299 aagacttaaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcacta 26982201  T
Q  289 atataaa-tttatacatccttttt 311  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  26982200 atataaattttacacatccttttt 26982177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 34405676 - 34406023
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34405676 ttatgagatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaag 34405775  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||    
T  34405776 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggatttga 34405874  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||    
T  34405875 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-acaacaactcaactgcctagggcaatca 34405972  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  34405973 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 34406023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14616846 - 14616499
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14616846 ttatgacatatggattaacgttttgttaaaacctccaacggtttcgaattcactcaagagattaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaag 14616747  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  14616746 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcaa 14616648  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggg-cacca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | ||    
T  14616647 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaacttcctagggtaatca 14616550  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  14616549 atataaattcatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 14616499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7650359 - 7650012
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7650359 ttatgacatagggattaaccttctattaaaacctccagcgatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtaaag 7650260  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||  |           |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  7650259 agattgagtagaattaccttgttaatctatctttaaactagataatcattgattgaatt-aggagtgcaaattaccatagaagaacttcgtaggattcaa 7650161  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    | | |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  7650160 atgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaagcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatca 7650063  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  7650062 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaaattaa 7650012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 22159572 - 22159977
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  22159572 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaag 22159671  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||   |||        ||| |||||||||| |  ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |    
T  22159672 agattgggtagagttactttgttaatctatcgttgaactagatagtcattgattg-aactaggagtgcgatttaccataggagaacttcggaggattcaa 22159770  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgtta-ctaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||   |  |||||  |||   ||| |||  ||||||||||||||| |     
T  22159771 aggtcttaaccatatttctctctaatattcttaaaaccaatt-tttattgttttatttacgtttactttataaaaaccaatccaactgcctagggcaacc 22159869  T
Q  289 atataaatt--tatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaattt 386  Q
     |  || ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22159870 tttgaatttaatatacatcctttttgacaaagaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaattt 22159968  T
Q  387 ggttcactt 395  Q
    ||| |||||    
T  22159969 ggtacactt 22159977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11989127 - 11988942
Alignment:
Q  150 taggagtgcaaattgccata--ggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa 246  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||    
T  11989127 taggagtgcaaattaccatataggagaactttggaggattcgaaggtcttaaccttacttctctctaattttct-aaaatcaatcttttatcgtttttaa 11989029  T
Q  247 tcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatt--tatacatcctttttaataatgaaattgctaagta 331  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11989028 tctgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctaggggacc-attgaatttaatatacgtccttattactaatgaaattgctaagta 11988942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26711567 - 26711472
Alignment:
Q  305 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttaccaaat 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  26711567 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttgccaaat 26711472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26981304 - 26981209
Alignment:
Q  305 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttaccaaat 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  26981304 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttgccaaat 26981209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11989228 - 11989166
Alignment:
Q  8 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggt 70  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11989228 atagagattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggt 11989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22626729 - 22626320
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22626729 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 22626630  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22626629 agattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcga 22626530  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626529 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaat-ccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 22626431  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22626430 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggtt 22626332  T
Q  391 cacttaccaaat 402  Q
    ||||| ||||||    
T  22626331 cacttgccaaat 22626320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11138987 - 11138578
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11138987 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctcctatggtttcgaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 11138888  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11138887 agattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcga 11138788  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138787 aggacttaaccatacttctctcaattttctgaat-ccaattctatattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 11138689  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11138688 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggtt 11138590  T
Q  391 cacttaccaaat 402  Q
    ||||| ||||||    
T  11138589 cacttgccaaat 11138578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39563928 - 39563518
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39563928 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 39563829  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  39563828 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataaccattgattgaatt-aggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcga 39563730  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39563729 aggacttaaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcacta 39563631  T
Q  289 atataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttg 387  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  || |||||||    
T  39563630 atataaattttacacatccttttttataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattactttgattgaatttg 39563533  T
Q  388 gttcacttaccaaat 402  Q
    |||||||| ||||||    
T  39563532 gttcacttgccaaat 39563518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13979314 - 13979565
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13979314 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcgaacgatttcgaattcacttaagagattaagaggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 13979413  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
     |||||| |||| |||||||||||||| ||          ||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13979414 ggattggatagagttactaagttaatctgtcatgaaactaaataatcattgtttgaactt-ggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaa 13979512  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  13979513 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttt 13979565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Original strand, 46731386 - 46731555
Alignment:
Q  65 aggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttagga 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||  ||           |||||||||||||| ||| ||||    
T  46731386 aggggttgttacttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatatgtcgttgaactagataatcattgattgaatt-agga 46731484  T
Q  155 gtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 224  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  46731485 gtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccttacatctctctaattttctaaaa 46731555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 35366249 - 35366319
Alignment:
Q  46 gaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35366249 gaattcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttctaggtcaagagattgagtagaatta 35366319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20536479 - 20536401
Alignment:
Q  265 tcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta-tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaataca 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20536479 tcaacccaactgcctagggcacccttg--aatttactacatcctttttaataatgaaatttctaagtagaagttaaataca 20536401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 339
Target Start/End: Original strand, 35366459 - 35366549
Alignment:
Q  248 cagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35366459 cagtttatgttacaaataccaactcgactgcctagggcaacc-taaaatttaatacatccttttta-taatgaaattgctaagtagaagttaa 35366549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 116
Target Start/End: Original strand, 47412079 - 47412125
Alignment:
Q  70 ttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47412079 ttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaatta 47412125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 286
Target Start/End: Original strand, 50096830 - 50096903
Alignment:
Q  213 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctagggcac 286  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50096830 aattttctaaaaaccaact-tttactgtttttattacgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcttagggcac 50096903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 339
Target Start/End: Original strand, 46731589 - 46731629
Alignment:
Q  299 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46731589 atacatcctttttgataaagaaattgctgagtagaagttaa 46731629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13017607 - 13017197
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13017607 ttatgatatagggattaacgttcgtt-aatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 13017509  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13017508 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcatatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcga 13017409  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017408 aggacttaaccatacttctctcaattttctgaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 13017309  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  13017308 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatatagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggt 13017210  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||||| ||||||    
T  13017209 tcacttgccaaat 13017197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 22221551 - 22221963
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22221551 ttatgatatatggattaacgtttgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 22221650  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22221651 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcga 22221750  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221751 aggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 22221848  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||||||||| | ||| |||||| || |  ||||||     
T  22221849 aataatttatacatcctttttaataatgaaattgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt-tattactacttcgatagcttttggta 22221947  T
Q  391 cacttaccaaatttct 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22221948 cacttgccaaatttct 22221963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 22247386 - 22247798
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22247386 ttatgatatatggattaacgtttgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 22247485  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22247486 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcga 22247585  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247586 aggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 22247683  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||||||||| | ||| |||||| || |  ||||||     
T  22247684 aataatttatacatcctttttaataatgaaattgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt-tattactacttcgatagcttttggta 22247782  T
Q  391 cacttaccaaatttct 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22247783 cacttgccaaatttct 22247798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30978557 - 30978321
Alignment:
Q  74 cacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaatt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978557 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatt 30978458  T
Q  164 gccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 262  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978457 accataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 30978358  T
Q  263 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978357 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 30978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 14790446 - 14790793
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14790446 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 14790545  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14790546 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 14790644  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  14790645 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatca 14790742  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  14790743 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 14790793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 14795474 - 14795821
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14795474 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 14795573  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14795574 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 14795672  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  14795673 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatca 14795770  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  14795771 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 14795821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32704672 - 32704421
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  32704672 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaag 32704573  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  32704572 agattgggtagaattactctgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 32704474  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  32704473 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgtttt 32704421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19665082 - 19664741
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  19665082 ttatgacatagggattaacgttctattaaaatctccaatgatttcgaattcacttaagagattaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaag 19664983  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt---------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaa 191  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||| ||          |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19664982 atattgggtagagttactttgttaatctgtcgtgaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaa 19664884  T
Q  192 ggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || | |||  ||||||||||||||| |      
T  19664883 ggtcttaaccatacatctctctaattttct-taaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttacaaataccaatccaactgcctagggcaac-c 19664786  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaa 334  Q
    |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  19664785 ttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaa 19664741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20527580 - 20527286
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20527580 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcaaattcacttaagagattaaggg-ttgttacttgcggggagaattctaggtcaag 20527482  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||| | ||| |  ||||||| ||           |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20527481 agattgggtaaagttaatttgttaatctgtcgtgaagttagataatcattgattgaatt-aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 20527383  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatca-gtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggca 285  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20527382 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttatttatgtttacgttacaaaaatcaattcaactgcctagggca 20527286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 16883510 - 16883795
Alignment:
Q  8 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 107  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16883510 atagggattaatgttctgttaaaacctccaacggttttgaattcacataagagattaaggggttgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgg 16883609  T
Q  108 gtagaattactaagttaatc---------cgta-ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggactt 197  Q
    ||||  ||| |  |||||||         | || |||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||    
T  16883610 gtagggttattgtgttaatctttcgtgaacatagataatcattgtttgaatt-agtagtgcaaattaccataggagaacttcgaaggattcgaatgtctt 16883708  T
Q  198 aaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctaggg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16883709 aaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctaggg 16883795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 339
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535230
Alignment:
Q  40 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt--------- 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||| ||             
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatctgtcgttgaact 15535022  T
Q  131 -aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacca 228  Q
      |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | | |||||| | |||||||    
T  15535023 agataatcattgattg-aattaggaatgcaaattaccataggaaaacttcggaggatttgaaggtcttaaccatacatcactttaattttgt-aaaacca 15535120  T
Q  229 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaa 328  Q
    |   ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  15535121 aacttttattgtttttaatctatttgttttacaaaatcaactcaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatccttttttataaagaaatggctga 15535219  T
Q  329 gtagaagttaa 339  Q
    |||||||||||    
T  15535220 gtagaagttaa 15535230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 1838302 - 1838539
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  1838302 ttatgacatagggattaacgttatgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaag 1838401  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||          ||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1838402 agattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactaaataatcgttgattg-aactaggagtgcgaatt-acataggagaacttcggaggattcga 1838499  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaa 229  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  1838500 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaa 1838539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 15538049 - 15538158
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15538049 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggagaactctaggtcaag 15538148  T
Q  101 agattgggta 110  Q
    ||||||||||    
T  15538149 agattgggta 15538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12983771 - 12983670
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 125  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  12983771 ttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaa 12983672  T
Q  126 tc 127  Q
    ||    
T  12983671 tc 12983670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12980868 - 12980783
Alignment:
Q  42 tttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12980868 tttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 12980783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 27649087 - 27649180
Alignment:
Q  149 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgttt 242  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  27649087 ttagaagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttcgctctaattttcttaaaaccaact-tttattgttt 27649180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 32427194 - 32427271
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcactt 78  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427194 ttatgacatagggattaacattctgttaatacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 339
Target Start/End: Original strand, 15540574 - 15540744
Alignment:
Q  168 taggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatc 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||   || | ||||||||||||||||  ||||| |||  |||||    
T  15540574 taggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccataaatctctttaattttctaaaactaaact-tttattgtttttaatccctttattttagaaaatc 15540672  T
Q  267 aactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | |  |  || || ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15540673 aactcaactgcctagggaaac-cttgaatttaatacatcctttttgatatagaaattgctgagtagaagttaa 15540744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 224
Target Start/End: Original strand, 32427286 - 32427362
Alignment:
Q  149 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  32427286 ttaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcaaaggtcttaatcaaacatctctctaattttctaaaa 32427362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 402
Target Start/End: Original strand, 1838598 - 1838712
Alignment:
Q  287 caatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaattt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||  ||  ||| || ||| |||||||  ||||||||||| ||  | |||    
T  1838598 caatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtccttgtggatacgaatttatttattacttcgat-aatttt 1838696  T
Q  387 ggttcacttaccaaat 402  Q
    ||||||||| ||||||    
T  1838697 ggttcacttgccaaat 1838712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11184032 - 11183962
Alignment:
Q  213 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctaggg 283  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11184032 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattacgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctaggg 11183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7769660 - 7769588
Alignment:
Q  137 cattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 210  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7769660 cattgattgaattgagg-gtgcaaattaccatataagagcatcggaggattcgaaggtcttaaccatatttctc 7769588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 31528217 - 31528627
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31528217 ttatgatatagggattaacgttcgtt-aatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 31528315  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31528316 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcga 31528415  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528416 aggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 31528515  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31528516 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaatttggt 31528614  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||||| ||||||    
T  31528615 tcacttgccaaat 31528627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Original strand, 31626388 - 31626784
Alignment:
Q  12 ggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtag 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31626388 ggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtag 31626487  T
Q  112 aattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaacc 201  Q
    |||||||||||||||| ||          |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31626488 aattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataataattgattgaatt-aggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaatgacttaacc 31626586  T
Q  202 atacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-ttt 298  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31626587 attcttctctcagattttct-aaaaccaatcctttattatttttaattccttttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttt 31626685  T
Q  299 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttacc 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31626686 acacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcattgaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttggttcacttacc 31626782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 16294727 - 16295073
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16294727 ttatgacatagggattaacgttc-tttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 16294825  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16294826 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattaaact-aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 16294924  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattcttta-ttgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16294925 aggacttaaccatacttctctcaattttctgaaaactaa-tctttatttgtttttaatcggtttatgatacaaaatcaactcaactgcctagggcatcaa 16295023  T
Q  290 tataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  16295024 tataaattttatacatcc-tttcgataacgaaattgctgagtagaaattaa 16295073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 40017818 - 40018216
Alignment:
Q  14 attaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaa 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  40017818 attaacgttcttttaatacctccaacagtttcgaattcacttaagagaataaggg-ttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaa 40017916  T
Q  114 ttactaagttaatccgt-------------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaac 200  Q
     |||| |||||||| ||             ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40017917 gtactgagttaatctgtcgtaaaacttataaataatcattggttgaatt-aggagtgcaaattaccataggagagtttcggaggattcgaaggtcttaac 40018015  T
Q  201 catacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-ttta 299  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40018016 catacttctctcaatttttcttaaaccagtctcttattgtttttaatccgtttatgttac-aaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaatttta 40018114  T
Q  300 tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttacca 399  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| || ||| || | |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  40018115 tacatcctttttaataaaaaaattgccaagtcgaagttaaatgcactccttgtgaaaacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttgcca 40018213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 13709898 - 13710307
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  13709898 ttatgacatagggattaacgttttgttaaaacctccaacgatttcgaattcactaaagagattatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaag 13709997  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt-cggaggattcg 189  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||           ||||||||||  |  ||| |||||||||||||  ||||||||||||| | || |||| |    
T  13709998 agatcgggtagaattactttgttaatctgttgttgaactagataatcattgcctaaatt-aggagtgcaaattatcataggagagctttcagatgatttg 13710096  T
Q  190 aaggacttaaccatacttctctcaa-ttttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||  |||| ||    
T  13710097 aaggtcttaaccatacttctctcaaattttctaaaa-ccaatcttttattgtttttaatccgtttatgttac-aactcaactcaacttcctcaggcatca 13710194  T
Q  289 atataaattt-atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttg 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |   ||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  13710195 atataaattttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagttctcgtaaaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttg 13710292  T
Q  388 gttcacttaccaaat 402  Q
    |||||||| ||||||    
T  13710293 gttcacttgccaaat 13710307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23673762 - 23673415
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23673762 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaactgtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 23673663  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||           |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23673662 agattgggtagaattactttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 23673564  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaat--caactcaactgcctagggcacc 287  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||  ||||||||||||||| |    
T  23673563 aggtcttaaccatacatctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttac-aaatgccaatccaactgcctagggcaac 23673466  T
Q  288 aatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
      |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  23673465 -cttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaaattaa 23673415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32576097 - 32575887
Alignment:
Q  8 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |    
T  32576097 atagggattaacgttcttttaatacctccaacaatttcgaattcagtcaagagattaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttg 32575998  T
Q  108 gtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggactt 197  Q
    ||||| |||||||||||||| ||          ||||||||||  ||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32575997 gtagagttactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattttttg-aactaggagtgcaaattatcataggagagcttcggaggattcgaaggtctt 32575899  T
Q  198 aaccatacttct 209  Q
    ||||||||||||    
T  32575898 aaccatacttct 32575887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 36326759 - 36327022
Alignment:
Q  10 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttc----gaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagatt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36326759 agggattaacgttctgttaatacctccaacagtttcaaattaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagatt 36326858  T
Q  106 gggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggac 195  Q
    |||||||||||||  |||||||   |||        |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |    
T  36326859 gggtagaattactttgttaatctatcgttaaattagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtc 36326957  T
Q  196 ttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac 260  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36326958 ttaaccatacatctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttac 36327022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23760026 - 23759617
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23760026 ttatgatatagggattaacgttcgtt-aatacctccaatggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaag 23759928  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23759927 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcga 23759828  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23759827 aggacttaaccatacttctctcgattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 23759728  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  23759727 tataaatttatacatcctttttaa-aatgaatttgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtagaaacgaact-ttttattacttcgattgaatttggt 23759630  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||||| ||||||    
T  23759629 tcacttgccaaat 23759617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 11279320 - 11279728
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11279320 ttatgacatagagattaacgttcatt-aatacctccaacggtttcagattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaag 11279418  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||    
T  11279419 agattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcatttattgaact-aggagtgcaaattaccagaggagaacttcgaaagattcga 11279517  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttatt-gtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279518 aggacttaaccatacttctctcaatcttctaaaaaccaa-tctttattcgtttttaatcagtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 11279616  T
Q  290 tataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttgg 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||| |||  |||||||||||| || ||||||||    
T  11279617 tataaattttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaaattaaatatagtccttgtggaaacaaat--ttttattacttcgattgaatttgg 11279714  T
Q  389 ttcacttaccaaat 402  Q
    ||||||| ||||||    
T  11279715 ttcacttgccaaat 11279728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 46846730 - 46846320
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46846730 ttatgacatagggattaacgatcttttaaaacctccaacgttttcgaattcagttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 46846631  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||          ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  46846630 agattgggtagaattattaggttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattgaact-aggagtgcaaattaccatagaagaacttcggaggattcga 46846532  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgt-ttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  46846531 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaatcttttattgttttttagtcagtttataataagaattcaactcaactgcctagggcaccaa 46846432  T
Q  290 tataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttgg 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||  ||  |||||||||||| || |||| ||     
T  46846431 tataaattttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaaattaaatacagtcctcgtggaaac--atatttttattacttcgattgaatctga 46846334  T
Q  389 ttcacttaccaaat 402  Q
    ||||||| ||||||    
T  46846333 ttcacttgccaaat 46846320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36222720 - 36222317
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||    
T  36222720 ttatgacatagagattaacgttc-ttaaatacttccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaag 36222627  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||          |||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36222626 agattaggtaaaattactaagttaatttgtagtgaaactaaataatcattgattgaact-aggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcga 36222528  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222527 aggacttaaccatacttctctcaatcttctaaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgttagaaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 36222428  T
Q  291 ataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | || |||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  36222427 ataaattttatacatcctttttaataatgaaattgctacgtagaaattaaatacaatcctcgtggtaacgaat--ttttattacttcaattgaatttggt 36222330  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    ||| || ||||||    
T  36222329 tcatttgccaaat 36222317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 33312822 - 33313224
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33312822 ttatgacatatggattaacgttcttttaatacctccgccggtttcgaattcatttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaa 33312921  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33312922 agattgggtagaattactaagttaattcgtcgtgaaactaaataatcattgattgaatt-aggaaagcaaattaccataggagagcttcagaggattcga 33313020  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaat-cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33313021 aggacttaaccatttttctctcagattttctaaaa-ccaatcctttattatttttaattccgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcacca 33313119  T
Q  289 atataaa-tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttg 387  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  33313120 atataaattttacacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtagaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttg 33313216  T
Q  388 gttcactt 395  Q
     |||||||    
T  33313217 tttcactt 33313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 294692 - 295098
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  294692 ttatgacatagggattaacgttttgttaaaacatccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaag 294791  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||           |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  294792 agattgggtataattactttgttaatctgtcgttgaattagataatcattgattgcatt-aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 294890  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||| ||||    
T  294891 aagacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaccaatccttatttgcttttaaccagcttatgttac-aaaacaact--actgcctcgggcatcaat 294986  T
Q  291 ataaattta-tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| || |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  294987 ataaatttattacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggacacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggt 295085  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
    |||||| ||||||    
T  295086 tcacttgccaaat 295098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6966975 - 6967322
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6966975 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaag 6967074  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   |||        |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  6967075 agattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 6967173  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  6967174 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatca 6967271  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  6967272 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 6967322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17866771 - 17866424
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17866771 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 17866672  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17866671 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 17866573  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||    
T  17866572 aggtctaaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatca 17866475  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  17866474 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 17866424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17863512 - 17863202
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17863512 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 17863413  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17863412 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 17863314  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||    
T  17863313 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatca 17863216  T
Q  289 atataaatttatac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  17863215 atataaatttatac 17863202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 24783236 - 24783560
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24783236 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaatctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaag 24783335  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||   |||        |||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |    
T  24783336 agattgggtataattactttgttaatctctcgttaaactagataatcattgattg-aattaggaatgaaaattaccatatgagaacttcggaggattcaa 24783434  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   | |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | ||    
T  24783435 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgttttatttaagtttatgttac-aaaacaactcaactgccttggacaatca 24783532  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24783533 atataaatttatacatcctttttgataa 24783560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23107815 - 23108106
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  23107815 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcaaacaatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattatagctcaag 23107914  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
      |||||||||| |||||||||||||| ||          ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23107915 gaattgggtagagttactaagttaatctgttgtgaaactaaataatcattgtttg-aactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggatgattcga 23108013  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagg 282  Q
    ||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  23108014 aggtcttaaccacatttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaactcaactgtctagg 23108106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36843355 - 36843135
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  36843355 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaag 36843256  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| ||           |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36843255 agattgggtagagttaatttgttaatctgtcgttgaactagataatcattgattg-aagtaggagtgcgaattaccataggagaacttcggaggattcga 36843157  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  36843156 aggtcttaaccatacttctctc 36843135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3862320 - 3861968
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaa----ggggttgtcacttgcggggagaattctaggt 96  Q
    |||||||||||||||||| |  || |||| || |||||  |||| |||||||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862320 ttatgatatagggattaaaggacggttaaaacttccaacagttttgaattcacttaagacattaattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggt 3862221  T
Q  97 taagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggat 186  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||  ||| ||| |||||||||        ||||||| ||||| |||||    
T  3862220 caagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataatcatttcttgaatt-aggagtgca--------taggagaacttcgaaggat 3862130  T
Q  187 tcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac--taaatcaactcaactgcctaggg 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||    
T  3862129 tcgaaggtcttaatcatacttctctctaattttataaaa-ccaatcttttattgtttttaatcagtttatgttacaaaaaatcaattgaactgcctaggg 3862031  T
Q  284 caccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatcc 348  Q
    || | ||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3862030 catc-attgaatttaatacatcc-ttttaataatgaaattgctaagtagaagttaataacaatcc 3861968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23313671 - 23313382
Alignment:
Q  8 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 107  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23313671 ataggggttaacgttctgttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagattgg 23313572  T
Q  108 gtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggactt 197  Q
    ||||| ||||   ||||||  ||           |||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  23313571 gtagagttacagtgttaatatgttgtgaacctagataatcattgtttgaatt-agtagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtctt 23313473  T
Q  198 aaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23313472 aaccatacttctctctaattttct-aaaaccattcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactacctagggcacc 23313382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 9765645 - 9765867
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    
T  9765645 ttaaaacctctaatggtttcgaattcacttaagagattaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaa 9765744  T
Q  126 tccg------------------ta-ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 206  Q
    || |                  || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9765745 tctgccgtgaaactcgtgaaactagataatcattgcttgaatt-aggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 9765843  T
Q  207 tctctc-aattttctaaaaaccaa 229  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||    
T  9765844 tctctctaatattcttaaaaccaa 9765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Original strand, 27796686 - 27796727
Alignment:
Q  25 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaag 66  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27796686 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaag 27796727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 12171810 - 12172210
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12171810 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaag 12171909  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  12171910 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattaccataggcgagcttcggaagattcca 12172009  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    |||||||||||||||||||           | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172010 aggacttaaccatacttct-----------agaaaccaaatctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 12172098  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12172099 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgatcttttttattacttcgatcgaatttggtt 12172198  T
Q  391 cacttaccaaat 402  Q
    ||||| ||||||    
T  12172199 cacttgccaaat 12172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 647621 - 647274
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  647621 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 647522  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  647521 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 647423  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||    
T  647422 agatcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatca 647325  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  647324 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 647274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 650893 - 650546
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  650893 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 650794  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  650793 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 650695  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||    
T  650694 aggtcttaaccatacttctctctaatattatgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatca 650597  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| ||||    
T  650596 atataaatttatacatcctttttgatatagaaattgccgagtagaaattaa 650546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26063111 - 26062762
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  26063111 ttatgacatatggataaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaag 26063012  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||           |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  26063011 agattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaa 26062913  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc---aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcac 286  Q
    ||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || | |||  ||||| |||||||||     
T  26062912 aggtcttaaccatacatctctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttacaaataccaatccaactacctagggcaa 26062814  T
Q  287 caatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  26062813 c-cttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaagttaa 26062762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 2541712 - 2542120
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||| | || || | |||||| ||||| |||    
T  2541712 ttatgatatagggattaacggactgttaaaaccttcaatggttttgaattcatttaagagattaatggattgttatttccgagaagaattttaggtcaag 2541811  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | | |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  2541812 agattggataaaattactttgttaatctgtcgtttaactagataatcattgcttgaaat-aggagtacaaattaccataagagaacttcagaggattcga 2541910  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta-aatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    ||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  2541911 aggtcttaaccatacctcttt-aattttcaaaaaacctatattttattgtttttaatccgtttatgttacaagaataaactcaactgcctagggcaccat 2542009  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggt 389  Q
    |  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||  ||||||||||| || || ||||||    
T  2542010 tg-aatttaatacatcctttttaataatgaaattgctcagtagaagttaaatacagtcctcgtggatacgaatt-atttattacttcgattgactttggt 2542107  T
Q  390 tcacttaccaaat 402  Q
     ||||| ||||||    
T  2542108 acacttgccaaat 2542120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 26060415 - 26060641
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||    
T  26060415 ttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagacattaaggggttgttatttgcagggagaattctaggtcaag 26060514  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cg------ta-ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||   ||      || |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26060515 agattgggtagagttactttgttaatctatcgggaagctagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 26060613  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaatttt 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26060614 aggtcttaaccatgcttctctcaatttt 26060641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11649490 - 11649429
Alignment:
Q  153 gagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 214  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11649490 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 11649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24601 - 24189
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24601 ttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatggtttcgaattcacataagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 24502  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24501 agattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtatttaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcga 24402  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24401 aggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaat 24304  T
Q  291 ataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggtt 390  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| | ||| |||||| || |  ||||||     
T  24303 aataatttatacatcctttttaataatgaaattgttgagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-tattactacttcgatagcttttggta 24205  T
Q  391 cacttaccaaatttct 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24204 cacttgccaaatttct 24189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13493090 - 13493437
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13493090 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaag 13493189  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  13493190 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcga 13493288  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  13493289 aggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatca 13493386  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  13493387 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 13493437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32506272 - 32505931
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32506272 ttatgacatagggattaacgttctgttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 32506173  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32506172 agattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 32506074  T
Q  191 aggacttaaccatacttctct-caattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaa 289  Q
    ||| |||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |||      |||||||||   ||| |||    
T  32506073 aggtcttaaccacacttctctataatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaattcgtttatgttagaaaa------caactgcctcacgcatcaa 32505981  T
Q  290 tataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||    
T  32505980 tataaatttatacatcctttttgataaagaaattgtcgagtagaagttaa 32505931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 34066172 - 34066468
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  34066172 ttatgacatagagattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaag 34066271  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cgtaa-------taatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||| |       ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  34066272 agattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgattgaatt-aggagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcga 34066370  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 287  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34066371 aggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 34066468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13495815 - 13496162
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13495815 ttatgacatagggattaacgttctgctaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaag 13495914  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||| || |||||||   |||||| ||           |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  13495915 agattggatataattactttcttaatctgtcgttaaagtagataatcattgattgaatt-aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaa 13496013  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-acca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | | ||    
T  13496014 aggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaattcaactgcctaggacaatca 13496111  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  13496112 atataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 13496162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 39546070 - 39546417
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  39546070 ttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaag 39546169  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  39546170 agattgggtagagttactttgttaatctgtcgtgaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcga 39546268  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||   |  ||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  39546269 aggtcttaaccatacttctctctaatatttttaaaaccaact-tttattgttttatttgcgtttacgttacaaaaaccaatccaactgcctagggcaaca 39546367  T
Q  289 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||  || || |||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  39546368 attgaatttaatacatcc-tttcgataatgaaattgctgagtaaaagttaa 39546417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27282525 - 27282305
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27282525 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 27282426  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27282425 agattgggtagaattactttgttaatcggtcgttgaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggagaattcga 27282327  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc 212  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  27282326 aagtcttaaccatacttctctc 27282305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 339
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10765094
Alignment:
Q  83 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccatagga 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaatt-aggagtgcaagttaccatagga 10764927  T
Q  173 gagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactc 271  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  10764928 gaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactc 10765025  T
Q  272 aactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  10765026 aactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 10765094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 1936455 - 1936804
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||  | |||    
T  1936455 ttatgacatagggaataacattcttttaaaacctcaaacg-tttcaaattcacttaagagattaagggattgttacttgcggggagaactataaatcaag 1936553  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc---cgtaa-------taatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||   ||| |       ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1936554 agatttggtagagttactttgttaatctttcgtgaagctagataatcattgattgaact-aggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcga 1936652  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttacta-aatcaactcaactgcctagggc-ac 286  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  1936653 aggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaaaattttaccgtttttaattcagtttatgatacaacaatcaactcaactgcctaggtcaac 1936751  T
Q  287 caatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
    | ||  || || ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1936752 ccattgaatttaatacatcgttattactaatgaaattgccaagtagaagttaa 1936804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23990506 - 23990380
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23990506 ttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagtttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 23990407  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc 127  Q
     |||||||||||||||||  |||||||    
T  23990406 tgattgggtagaattactttgttaatc 23990380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21153083 - 21153209
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21153083 ttatgatttagggattaacggactattaaaacctccaaaggtttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaag 21153182  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc 127  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||    
T  21153183 agattgagtagaattactgtgttaatc 21153209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22453528 - 22453427
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 125  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  22453528 ttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaa 22453429  T
Q  126 tc 127  Q
    ||    
T  22453428 tc 22453427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16190575 - 16190299
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaa----ggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga-attactaa 120  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||| |      
T  16190575 ttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggtatatattatttt 16190476  T
Q  121 gttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 210  Q
    ||||||  ||           |||||||||| ||| ||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16190475 gttaatttgtcgttaaactagataatcattgcttgaattaag-agtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctc 16190377  T
Q  211 -tcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcacca 288  Q
     | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  16190376 tttaattttct-aaaaccaa-tctttattgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaactcaatttcctagggcacca 16190299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22456883 - 22456792
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattact 118  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22456883 ttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaagag-ttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattact 22456792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22104787 - 22104683
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22104787 ttatgacatagggattaacgttc-tttaatacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggtct-gtcacttacggggagaattctaggtcaag 22104690  T
Q  101 agattgg 107  Q
    |||||||    
T  22104689 agattgg 22104683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Original strand, 15297185 - 15297286
Alignment:
Q  26 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 125  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  15297185 ttaaaacctccaacagtttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaa 15297284  T
Q  126 tc 127  Q
    ||    
T  15297285 tc 15297286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 286
Target Start/End: Original strand, 8435285 - 8435358
Alignment:
Q  213 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctagggcac 286  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8435285 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattatgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctagggcac 8435358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22456744 - 22456699
Alignment:
Q  158 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 203  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22456744 caaatttccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 22456699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Original strand, 49147891 - 49147936
Alignment:
Q  158 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 203  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  49147891 caaatttccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 49147936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12575717 - 12575308
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtt-aa 99  Q
    |||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12575717 ttatgatataaggattaacgtattgttaaaacctccaatggtttctaattcacttaagagattaaggg-ttgttacttgcggggagaattctaggtttaa 12575619  T
Q  100 gagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcg 189  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||           || ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||     
T  12575618 gagattaggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagattatcattgcttgaatt-aggagtgcaaattaccataagaaaacttcggaggattca 12575520  T
Q  190 aaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 287  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12575519 atggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa-ccaatcttttattgtttttaatcaatttatgttacaaaaatcaactcaactgcctagggcacc 12575421  T
Q  288 aatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttg 387  Q
     ||  || || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||| |||  | ||| |||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  12575420 -attgaatttaatacatcctttttaataatgaacttgttgagtagaagttaacaacagtcctcgtggatacgaatt-atttattacttcgattgaatttg 12575323  T
Q  388 gttcacttaccaaat 402  Q
    || ||||| ||||||    
T  12575322 gtacacttgccaaat 12575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13096849 - 13097081
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13096849 ttatgacatagggatttacgttctgttaaaacctcccacggtttcaaattcacttaagacattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaag 13096948  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatc----------cgtaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||          |   |||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  13096949 agattgggtagaattactttgttaatctttcattgaactagataatcattgctt-aaattaggagtgcaaatt-acataggataacttcggaggattcga 13097046  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 224  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13097047 aggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 13097081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41779121 - 41778864
Alignment:
Q  39 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt-------- 130  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||            
T  41779121 tggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacc 41779022  T
Q  131 --aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacc 227  Q
       |||||||||| ||| | |||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |    
T  41779021 tagataatcattgtttg-aattactagtgcaaattagcataggagaacttcggaagatttgaaggtcttaaccatacttctctttaatcttct--aaatc 41778925  T
Q  228 aattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 287  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41778924 aatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 41778864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 339
Target Start/End: Original strand, 14418450 - 14418639
Alignment:
Q  149 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14418450 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 14418548  T
Q  248 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14418549 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 14418639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 44008138 - 44008356
Alignment:
Q  10 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||    
T  44008138 agggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcaaattcacttatgagattaaggagttgtcacttgc-gggagaattctaggtcgagggatttggt 44008236  T
Q  110 agaattactaagtta-----atccgtaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccata 204  Q
    ||| |||||||  ||     |  |  ||||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44008237 agagttactaatctatcgtgaaactaaataatcattgtttg-aactaggagtgcagattaccaaaggcgagcttcggaggattcgaaggtcataaccata 44008335  T
Q  205 cttctctc-aattttctaaaa 224  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  44008336 attctttctaattttctaaaa 44008356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41836479 - 41836418
Alignment:
Q  153 gagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 214  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41836479 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 41836418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7410 - 7177
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7410 ttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaag 7311  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  7310 agattgaatagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtacaaattaccataggagagtatcagaggattcga 7212  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctca-attttctaaaa 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7211 aggacttaaccattcttctctcagattttctaaaa 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2519 - 2754
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2519 ttatgacatagggatcaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagatttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaag 2618  T
Q  101 agattgggtaga--attactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattc 188  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||    
T  2619 agattgagtagaatattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaagttaccataggagagtatcagaggattc 2717  T
Q  189 gaaggacttaaccatacttctctca-attttctaaaa 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2718 gaaggacttaaccattcttctctcagattttctaaaa 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3010 - 2799
Alignment:
Q  12 ggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtag 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3010 ggattaacgttcttttaatacctccaatagttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagatttggtag 2911  T
Q  112 aattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaacc 201  Q
    ||||||||  ||||||   |||        |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  2910 aattactaccttaatctttcgtgaaactatataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaacg 2812  T
Q  202 atacttctctcaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  2811 atacttctctcaa 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6228 - 5995
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaag 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  6228 ttatgacatagggtttaacgttctgttaaaacctccaatgattttgaattcacttaagagattaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaag 6129  T
Q  101 agattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcga 190  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| ||           |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  6128 agattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacctagataatcattgtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacctcggaggattcga 6030  T
Q  191 aggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 224  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6029 aggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 79
Alignment:
Q  149 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  268 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 170  T
Q  248 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 339  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  169 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 1
Alignment:
Q  1 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagat 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  62 ttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University