View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12928_low_23 (Length: 254)

Name: NF12928_low_23
Description: NF12928
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12928_low_23
NF12928_low_23
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (18-223)||(29938059-29938265)
chr8 (18-215)||(18594544-18594741)
chr8 (18-225)||(14422699-14422907)
chr8 (18-215)||(144401-144598)
chr8 (18-215)||(2042527-2042724)
chr8 (18-215)||(24113169-24113366)
chr8 (18-215)||(39206593-39206790)
chr8 (18-223)||(35118034-35118240)
chr8 (22-215)||(10836762-10836955)
chr8 (18-215)||(13110411-13110608)
chr8 (18-215)||(22260633-22260830)
chr8 (18-215)||(7791418-7791615)
chr8 (18-215)||(33278407-33278604)
chr8 (19-215)||(38167159-38167355)
chr8 (20-215)||(34679462-34679657)
chr8 (18-212)||(7774774-7774968)
chr8 (18-215)||(34842368-34842565)
chr8 (18-215)||(39218784-39218981)
chr8 (18-212)||(7812005-7812199)
chr8 (18-215)||(4035854-4036051)
chr8 (18-215)||(41575520-41575717)
chr8 (18-215)||(6144276-6144473)
chr8 (18-211)||(44804947-44805140)
chr8 (18-223)||(5320562-5320768)
chr8 (18-214)||(34998899-34999095)
chr8 (18-215)||(8021726-8021915)
chr8 (18-215)||(42571601-42571795)
chr8 (18-211)||(28639289-28639484)
chr8 (18-215)||(36491164-36491361)
chr8 (66-215)||(40117903-40118052)
chr8 (18-215)||(33287040-33287225)
chr8 (83-215)||(26783801-26783933)
chr8 (17-143)||(9807339-9807465)
chr8 (18-212)||(66182-66377)
chr8 (71-215)||(2322068-2322212)
chr8 (94-215)||(5005173-5005294)
chr8 (71-211)||(39220267-39220407)
chr8 (135-215)||(9806880-9806960)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (18-215)||(8042609-8042806)
chr3 (18-215)||(37698132-37698329)
chr3 (18-225)||(25999379-25999587)
chr3 (20-215)||(32244122-32244317)
chr3 (18-215)||(20842337-20842534)
chr3 (18-215)||(42307894-42308091)
chr3 (20-215)||(54870165-54870360)
chr3 (18-215)||(15520131-15520328)
chr3 (18-215)||(22174979-22175176)
chr3 (22-215)||(38856095-38856288)
chr3 (18-215)||(46452151-46452348)
chr3 (20-215)||(29445490-29445685)
chr3 (18-211)||(12117647-12117840)
chr3 (18-215)||(21581044-21581241)
chr3 (18-215)||(35226449-35226646)
chr3 (18-215)||(38933948-38934144)
chr3 (18-215)||(50528931-50529128)
chr3 (18-225)||(25494274-25494482)
chr3 (18-215)||(32359261-32359458)
chr3 (18-215)||(44609322-44609519)
chr3 (21-213)||(42104963-42105155)
chr3 (18-215)||(15520638-15520835)
chr3 (18-215)||(20699151-20699348)
chr3 (18-215)||(26122816-26123013)
chr3 (18-215)||(48924992-48925187)
chr3 (18-215)||(54534317-54534512)
chr3 (22-212)||(34700346-34700536)
chr3 (18-193)||(44688785-44688959)
chr3 (22-215)||(24835692-24835885)
chr3 (18-211)||(2895191-2895388)
chr3 (65-215)||(35643219-35643369)
chr3 (18-215)||(53028227-53028416)
chr3 (22-173)||(16354390-16354541)
chr3 (18-193)||(12915931-12916105)
chr3 (83-215)||(50529827-50529959)
chr3 (18-101)||(24366145-24366228)
chr3 (18-96)||(13696914-13696992)
chr3 (89-215)||(49128051-49128177)
chr3 (20-61)||(50528873-50528914)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (18-225)||(33359083-33359291)
chr7 (18-211)||(933295-933488)
chr7 (18-215)||(3511329-3511526)
chr7 (18-215)||(5280866-5281063)
chr7 (18-215)||(43067966-43068163)
chr7 (18-215)||(12097583-12097780)
chr7 (18-215)||(12101171-12101368)
chr7 (18-215)||(20346494-20346691)
chr7 (18-215)||(24792325-24792522)
chr7 (18-215)||(30181017-30181214)
chr7 (18-215)||(42964989-42965186)
chr7 (22-225)||(22649691-22649895)
chr7 (20-215)||(7164190-7164385)
chr7 (18-215)||(33846522-33846714)
chr7 (18-212)||(6394760-6394954)
chr7 (22-223)||(25748484-25748686)
chr7 (18-215)||(42204160-42204358)
chr7 (18-215)||(1803032-1803229)
chr7 (18-215)||(4477314-4477511)
chr7 (18-215)||(9452596-9452793)
chr7 (18-215)||(32041548-32041745)
chr7 (18-215)||(43156719-43156916)
chr7 (18-215)||(15655918-15656115)
chr7 (18-189)||(48865662-48865836)
chr7 (18-215)||(8630672-8630869)
chr7 (18-215)||(36890823-36891019)
chr7 (22-215)||(38866550-38866743)
chr7 (18-215)||(42673471-42673664)
chr7 (22-215)||(46891336-46891530)
chr7 (18-215)||(4347279-4347475)
chr7 (18-215)||(46134297-46134494)
chr7 (18-227)||(17753593-17753803)
chr7 (20-189)||(16894502-16894671)
chr7 (18-215)||(43021573-43021766)
chr7 (76-211)||(19828280-19828415)
chr7 (71-215)||(37005857-37006001)
chr7 (126-215)||(37704986-37705075)
chr7 (71-211)||(43405030-43405170)
chr7 (87-215)||(20163825-20163953)
chr7 (78-165)||(36849590-36849677)
chr7 (71-215)||(15655458-15655602)
chr7 (71-225)||(30075277-30075429)
chr7 (127-211)||(27691428-27691512)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (18-215)||(3347526-3347723)
chr6 (18-215)||(26946879-26947076)
chr6 (18-215)||(6086602-6086799)
chr6 (18-215)||(9459570-9459767)
chr6 (18-215)||(2837552-2837749)
chr6 (18-215)||(11167247-11167444)
chr6 (18-215)||(30691858-30692055)
chr6 (18-215)||(26704342-26704539)
chr6 (18-215)||(17261076-17261273)
chr6 (18-215)||(18613545-18613742)
chr6 (18-205)||(21893472-21893659)
chr6 (18-212)||(1153603-1153797)
chr6 (18-225)||(20726787-20726991)
chr6 (18-215)||(34887295-34887492)
chr6 (31-215)||(3955782-3955966)
chr6 (20-215)||(30698934-30699129)
chr6 (22-215)||(16307015-16307208)
chr6 (18-215)||(28199511-28199709)
chr6 (18-211)||(35198295-35198487)
chr6 (18-152)||(33464399-33464533)
chr6 (66-215)||(52843-52992)
chr6 (18-129)||(53001-53112)
chr6 (144-215)||(33463708-33463779)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (18-215)||(1165604-1165801)
chr5 (18-215)||(1579044-1579241)
chr5 (18-215)||(1605574-1605771)
chr5 (18-215)||(9008060-9008257)
chr5 (18-215)||(24105674-24105871)
chr5 (19-215)||(27420866-27421062)
chr5 (18-215)||(8374342-8374538)
chr5 (18-215)||(16069361-16069558)
chr5 (18-211)||(16737450-16737643)
chr5 (18-215)||(27679172-27679369)
chr5 (18-215)||(31883152-31883349)
chr5 (22-215)||(3386493-3386686)
chr5 (18-215)||(33491199-33491396)
chr5 (18-215)||(4120945-4121142)
chr5 (18-215)||(19358534-19358731)
chr5 (18-211)||(33991152-33991345)
chr5 (18-215)||(38598453-38598650)
chr5 (18-225)||(5202969-5203177)
chr5 (18-215)||(3921589-3921786)
chr5 (18-211)||(20992149-20992342)
chr5 (18-215)||(35782647-35782844)
chr5 (18-189)||(26602945-26603116)
chr5 (18-174)||(27025005-27025161)
chr5 (18-215)||(31410484-31410681)
chr5 (88-215)||(20992354-20992485)
chr5 (82-215)||(33284642-33284775)
chr5 (87-193)||(31638175-31638281)
chr5 (18-69)||(35420427-35420478)
chr5 (88-157)||(41818536-41818605)
chr5 (22-53)||(27024822-27024853)
chr5 (71-212)||(25634593-25634732)
chr5 (89-173)||(19516044-19516128)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (18-224)||(19913621-19913828)
chr4 (18-215)||(15241019-15241216)
chr4 (18-215)||(20877052-20877249)
chr4 (18-226)||(38055150-38055359)
chr4 (18-215)||(53717455-53717652)
chr4 (18-215)||(54189550-54189747)
chr4 (20-215)||(14987797-14987992)
chr4 (18-215)||(1617089-1617286)
chr4 (18-215)||(1756755-1756952)
chr4 (18-215)||(23776450-23776647)
chr4 (22-227)||(50353793-50353999)
chr4 (18-215)||(6611351-6611548)
chr4 (18-215)||(16700786-16700983)
chr4 (18-215)||(23704200-23704397)
chr4 (18-211)||(33703850-33704043)
chr4 (18-211)||(37464730-37464923)
chr4 (18-215)||(53875662-53875859)
chr4 (18-215)||(54412633-54412830)
chr4 (20-215)||(45424527-45424722)
chr4 (24-215)||(50055098-50055289)
chr4 (22-212)||(28032707-28032897)
chr4 (18-215)||(27488639-27488836)
chr4 (18-215)||(30423556-30423752)
chr4 (18-215)||(44379178-44379375)
chr4 (18-205)||(31969696-31969883)
chr4 (17-215)||(52139208-52139406)
chr4 (18-215)||(2481399-2481596)
chr4 (18-215)||(15669188-15669385)
chr4 (18-215)||(30171585-30171782)
chr4 (18-211)||(40428711-40428904)
chr4 (18-215)||(43289951-43290148)
chr4 (18-215)||(44784908-44785105)
chr4 (18-215)||(48909851-48910048)
chr4 (18-210)||(8591083-8591275)
chr4 (18-212)||(37968748-37968942)
chr4 (18-215)||(11639569-11639766)
chr4 (18-215)||(35490764-35490961)
chr4 (18-215)||(27536095-27536288)
chr4 (25-215)||(19164971-19165160)
chr4 (18-215)||(6688618-6688809)
chr4 (18-215)||(47632039-47632237)
chr4 (18-215)||(8932169-8932366)
chr4 (17-198)||(16703843-16704024)
chr4 (18-215)||(40680029-40680226)
chr4 (24-215)||(44375850-44376041)
chr4 (18-215)||(53353060-53353265)
chr4 (18-215)||(27583623-27583820)
chr4 (49-215)||(28360435-28360602)
chr4 (18-211)||(55344816-55345009)
chr4 (31-211)||(38071327-38071504)
chr4 (18-143)||(23269037-23269162)
chr4 (71-215)||(50053448-50053592)
chr4 (18-101)||(53408138-53408222)
chr4 (135-215)||(23265865-23265945)
chr4 (18-118)||(9595893-9595982)
chr4 (72-154)||(51780763-51780845)
chr4 (18-78)||(23261877-23261937)
chr4 (71-206)||(44548185-44548320)
chr4 (18-61)||(50055304-50055347)
chr4 (18-81)||(48748197-48748260)
chr4 (71-213)||(17493340-17493482)
chr4 (18-49)||(55344684-55344715)
chr4 (87-225)||(46257269-46257407)
chr4 (76-129)||(55344724-55344777)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (18-215)||(36710-36907)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (18-215)||(6174831-6175028)
chr2 (18-215)||(42937724-42937922)
chr2 (18-226)||(31517218-31517427)
chr2 (18-215)||(18806887-18807084)
chr2 (18-215)||(3873247-3873444)
chr2 (22-215)||(33906054-33906247)
chr2 (18-215)||(4016044-4016241)
chr2 (18-215)||(39635457-39635654)
chr2 (18-212)||(5733407-5733601)
chr2 (18-215)||(26323189-26323386)
chr2 (35-222)||(1108277-1108464)
chr2 (22-215)||(4232149-4232342)
chr2 (22-215)||(30270686-30270879)
chr2 (18-206)||(19383938-19384126)
chr2 (23-211)||(16066302-16066490)
chr2 (20-215)||(28329844-28330037)
chr2 (20-215)||(19901143-19901337)
chr2 (18-212)||(1482906-1483099)
chr2 (18-215)||(30420182-30420367)
chr2 (18-173)||(2178772-2178927)
chr2 (18-215)||(851002-851199)
chr2 (22-215)||(16588783-16588976)
chr2 (18-211)||(44947552-44947738)
chr2 (19-173)||(429863-430017)
chr2 (71-215)||(42446625-42446769)
chr2 (78-173)||(22101210-22101305)
chr2 (71-173)||(3585337-3585439)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (18-215)||(33510489-33510686)
chr1 (18-223)||(42370798-42371004)
chr1 (18-215)||(1170447-1170644)
chr1 (18-215)||(16052101-16052298)
chr1 (18-215)||(20089476-20089673)
chr1 (18-215)||(29078521-29078718)
chr1 (18-215)||(38829074-38829271)
chr1 (18-215)||(19715164-19715361)
chr1 (18-215)||(25897379-25897576)
chr1 (18-215)||(26663263-26663460)
chr1 (18-215)||(39260349-39260546)
chr1 (18-215)||(29288154-29288349)
chr1 (18-215)||(1168508-1168705)
chr1 (18-215)||(1940750-1940947)
chr1 (18-215)||(8120874-8121071)
chr1 (18-215)||(46760971-46761168)
chr1 (18-215)||(52753150-52753347)
chr1 (18-215)||(2347661-2347859)
chr1 (22-215)||(5215390-5215583)
chr1 (22-215)||(26580277-26580470)
chr1 (18-215)||(41928498-41928695)
chr1 (18-215)||(17591696-17591890)
chr1 (18-223)||(970527-970735)
chr1 (18-211)||(23498469-23498662)
chr1 (22-215)||(40092496-40092689)
chr1 (22-215)||(52696796-52696989)
chr1 (20-215)||(6765464-6765659)
chr1 (18-215)||(8079712-8079909)
chr1 (18-215)||(12682825-12683022)
chr1 (18-215)||(32671584-32671781)
chr1 (22-215)||(43905659-43905852)
chr1 (18-189)||(40149494-40149665)
chr1 (18-223)||(51359220-51359425)
chr1 (18-215)||(7145212-7145409)
chr1 (18-215)||(2473727-2473924)
chr1 (20-204)||(17587510-17587694)
chr1 (18-215)||(13996726-13996923)
chr1 (18-215)||(49146177-49146374)
chr1 (18-225)||(15203106-15203314)
chr1 (18-215)||(46409440-46409639)
chr1 (18-215)||(15717790-15717986)
chr1 (18-215)||(15554155-15554344)
chr1 (54-215)||(29695680-29695842)
chr1 (18-211)||(38171841-38172021)
chr1 (72-207)||(23322897-23323032)
chr1 (91-215)||(52086272-52086396)
chr1 (71-215)||(5217840-5217983)
chr1 (149-215)||(5675110-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (20-215)||(22956-23151)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (18-215)||(298-495)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (18-215)||(145248-145445)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (18-215)||(10243-10440)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (18-211)||(9-202)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (18-215)||(3715-3912)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (18-215)||(9-207)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29938265 - 29938059
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29938265 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 29938166  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29938165 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29938066  T
Q  217 ggggcca 223  Q
    |||||||    
T  29938065 ggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18594741 - 18594544
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594741 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 18594642  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18594641 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 18594544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14422907 - 14422699
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14422907 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 14422808  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  14422807 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaac 14422708  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  14422707 ggggccata 14422699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 144598 - 144401
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  144598 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 144499  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  144498 aaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaa 144401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 2042527 - 2042724
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042527 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 2042626  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2042627 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2042724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 24113169 - 24113366
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113169 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 24113268  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24113269 aaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 24113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39206790 - 39206593
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39206790 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatg 39206691  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39206690 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39206593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 35118034 - 35118240
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118034 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 35118133  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35118134 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 35118233  T
Q  217 ggggcca 223  Q
    |||||||    
T  35118234 ggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 10836762 - 10836955
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10836762 aatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaac 10836861  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10836862 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 10836955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13110608 - 13110411
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13110608 agagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatt 13110509  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13110508 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 13110411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 22260633 - 22260830
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22260633 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 22260732  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22260733 aaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 22260830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7791615 - 7791418
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7791615 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 7791516  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7791515 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaa 7791418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33278604 - 33278407
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33278604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33278505  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  || |||  ||||||||||||||||||||    
T  33278504 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaa 33278407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167355
Alignment:
Q  19 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  119 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaa 38167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 34679462 - 34679657
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34679462 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaa 34679561  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  34679562 actatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 34679657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7774968 - 7774774
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7774968 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatg 7774869  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  7774868 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatc 7774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 34842368 - 34842565
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34842368 agagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 34842467  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34842468 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 34842565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39218981 - 39218784
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39218981 agagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 39218882  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39218881 aagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39218784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7812199 - 7812005
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7812199 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 7812100  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7812099 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatc 7812005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4036051 - 4035854
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4036051 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 4035952  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4035951 aaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaa 4035854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41575717 - 41575520
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41575717 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 41575618  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41575617 aaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaa 41575520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 6144276 - 6144473
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6144276 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatg 6144375  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  6144376 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 6144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 44804947 - 44805140
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804947 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 44805046  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  44805047 aaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaat 44805140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5320768 - 5320562
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  5320768 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatg 5320669  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5320668 aaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaac 5320569  T
Q  217 ggggcca 223  Q
    |||||||    
T  5320568 ggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 34998899 - 34999095
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34998899 agagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 34998998  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 214  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  34998999 aaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8021915 - 8021726
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021915 agagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 8021824  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  8021823 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 8021726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42571795 - 42571601
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571795 agagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatg 42571698  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42571697 aaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 42571601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639289
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt----atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaat 28639289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36491361 - 36491164
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||    
T  36491361 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatg 36491262  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | || |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36491261 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaa 36491164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118052
Alignment:
Q  66 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  166 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 40118052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287225
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcta------------gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 33287225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783933
Alignment:
Q  83 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  183 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26783933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9807465 - 9807339
Alignment:
Q  17 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 116  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807465 cagagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 9807366  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttattta 143  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9807365 gaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 66182 - 66377
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgga-ggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 116  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  66182 agagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttat 66281  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | || ||||||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  66282 gaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatc 66377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322212
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||  |||| ||||   || ||| ||||  |||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaa 2322212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005173
Alignment:
Q  94 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 193  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  194 tgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaa 5005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220267
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaat 39220267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806880
Alignment:
Q  135 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaa 9806880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8042806 - 8042609
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8042806 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8042707  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8042706 aaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaa 8042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 37698132 - 37698329
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698132 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 37698231  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37698232 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 37698329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25999587 - 25999379
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25999587 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25999488  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25999487 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 25999388  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  25999387 ggggccata 25999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244122
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32244122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 20842337 - 20842534
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20842337 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatg 20842436  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20842437 aaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 20842534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 42307894 - 42308091
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42307894 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42307993  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42307994 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42308091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 54870165 - 54870360
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870165 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 54870264  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54870265 acgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaa 54870360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 15520131 - 15520328
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15520131 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 15520230  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520231 aaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 22174979 - 22175176
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22174979 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 22175078  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22175079 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 22175176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38856288 - 38856095
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38856288 aatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 38856189  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  38856188 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 38856095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 46452151 - 46452348
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46452151 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 46452250  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  46452251 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 46452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29445685 - 29445490
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  29445685 agaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaa 29445586  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29445585 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 29445490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 12117647 - 12117840
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12117647 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 12117746  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12117747 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 12117840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21581241 - 21581044
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21581241 agagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 21581142  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21581141 aaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 21581044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35226646 - 35226449
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35226646 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 35226547  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35226546 aaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaa 35226449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38934144 - 38933948
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934144 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatg 38934045  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38934044 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctcaaaataagccaatccaa 38933948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50529128 - 50528931
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50529128 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 50529029  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50529028 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 50528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 25494274 - 25494482
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25494274 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25494373  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  25494374 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 25494473  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  25494474 ggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32359458 - 32359261
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32359458 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 32359359  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32359358 aaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 44609322 - 44609519
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609322 agagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 44609421  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44609422 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 44609519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 42104963 - 42105155
Alignment:
Q  21 gaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104963 gaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaa 42105062  T
Q  121 ctatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  42105063 ctatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15520835 - 15520638
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15520835 agagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 15520736  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520735 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20699348 - 20699151
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20699348 agagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 20699249  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20699248 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20699151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26123013 - 26122816
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26123013 agagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 26122914  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26122913 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 26122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 48924992 - 48925187
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48924992 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatg 48925091  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||| | || |||  ||| ||||||||||||||||    
T  48925092 aaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaa 48925187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 54534317 - 54534512
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||     
T  54534317 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat- 54534414  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54534415 aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54534512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34700536 - 34700346
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700536 aatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 34700437  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34700436 tatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatc 34700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44688959 - 44688785
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44688959 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatg 44688861  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  44688860 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 44688785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 24835692 - 24835885
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24835692 aatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaac 24835791  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||   | ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24835792 tataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaa 24835885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2895388 - 2895191
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagct 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2895388 agagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 2895289  T
Q  114 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  2895288 tatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 2895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643219
Alignment:
Q  65 ggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 164  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  165 aggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaa 35643219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53028416 - 53028227
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53028416 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatg 53028317  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53028316 aaaatatgataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 53028227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16354541 - 16354390
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  16354541 aatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaac 16354442  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 173  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16354441 tatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 16354390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915931
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 193  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatgg-agtaaataagcccacata 12915931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529959
Alignment:
Q  83 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 182  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  183 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 50529959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24366228 - 24366145
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24366228 agagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatg 24366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13696992 - 13696914
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13696992 agagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128051
Alignment:
Q  89 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctc 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  189 acatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaa 49128051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 50528873 - 50528914
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528873 agaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaa 50528914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 33359083 - 33359291
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33359083 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33359182  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33359183 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 33359282  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  33359283 ggggccata 33359291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 933488 - 933295
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  933488 agagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 933389  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  933388 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaat 933295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3511526 - 3511329
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3511526 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3511427  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3511426 aaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaa 3511329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5281063 - 5280866
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5281063 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 5280964  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5280963 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 5280866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 43067966 - 43068163
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43067966 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatg 43068065  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  43068066 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 43068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 12097583 - 12097780
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12097583 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatg 12097682  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  12097683 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaa 12097780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 12101171 - 12101368
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12101171 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 12101270  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12101271 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 12101368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20346691 - 20346494
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20346691 agagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatg 20346592  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20346591 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20346494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 24792325 - 24792522
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24792325 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 24792424  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  24792425 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaa 24792522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 30181017 - 30181214
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30181017 agagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30181116  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30181117 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30181214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 42964989 - 42965186
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42964989 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42965088  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42965089 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42965186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 22649691 - 22649895
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22649691 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaat 22649790  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tccaacgggg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  22649791 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacgggg 22649890  T
Q  221 ccata 225  Q
    |||||    
T  22649891 ccata 22649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7164385 - 7164190
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7164385 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 7164286  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  7164285 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 7164190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 33846522 - 33846714
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33846522 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatg 33846616  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33846617 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 33846714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6394954 - 6394760
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6394954 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 6394855  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6394854 aaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 6394760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25748686 - 25748484
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25748686 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 25748587  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacgggg 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || | ||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25748586 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacgggg 25748487  T
Q  221 cca 223  Q
    |||    
T  25748486 cca 25748484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42204358 - 42204160
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42204358 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42204259  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42204258 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42204160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1803229 - 1803032
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  1803229 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatg 1803130  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1803129 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 1803032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 4477314 - 4477511
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4477314 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 4477413  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4477414 aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 4477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9452793 - 9452596
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  9452793 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatg 9452694  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9452693 aaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaa 9452596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32041745 - 32041548
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32041745 agagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatg 32041646  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  32041645 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 32041548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43156916 - 43156719
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  43156916 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatg 43156817  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43156816 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 43156719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15656115 - 15655918
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15656115 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 15656016  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15656015 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 15655918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48865836 - 48865662
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48865836 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 48865737  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttatggaagtatataagctca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48865736 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagctca 48865662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8630869 - 8630672
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8630869 agagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8630770  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||  |||||||||| | |||||||    
T  8630769 aaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaa 8630672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 36890823 - 36891019
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  36890823 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatg 36890922  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  36890923 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaa 36891019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38866743 - 38866550
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38866743 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaac 38866644  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  38866643 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaa 38866550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42673664 - 42673471
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42673664 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42673565  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42673564 aaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaa 42673471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 46891336 - 46891530
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46891336 aatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaac 46891435  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  46891436 tatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaa 46891530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4347475 - 4347279
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4347475 agagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 4347377  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4347376 aaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaa 4347279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 46134297 - 46134494
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  46134297 agagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatg 46134396  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46134397 aaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaa 46134494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17753803 - 17753593
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17753803 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 17753704  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  17753703 aaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaac 17753604  T
Q  217 ggggccatata 227  Q
    |||| ||||||    
T  17753603 ggggtcatata 17753593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 16894502 - 16894671
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16894502 agaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 16894601  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16894602 actatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 16894671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 43021573 - 43021766
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||    
T  43021573 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatg 43021668  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||  || |||||||||||||||||    
T  43021669 aaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaa 43021766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828280
Alignment:
Q  76 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  176 agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaat 19828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006001
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaa 37006001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704986
Alignment:
Q  126 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaa 37704986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405030
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||   | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    || | |||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163825
Alignment:
Q  87 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 186  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  187 tcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaa 20163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849677
Alignment:
Q  78 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 165  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaa 36849677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655602
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||  |||| | ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaa 15655602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 225
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 225  Q
    |||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691512
Alignment:
Q  127 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaat 27691512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 3347526 - 3347723
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347526 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 3347625  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3347626 aaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 3347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 26946879 - 26947076
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946879 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 26946978  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  26946979 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 26947076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 6086602 - 6086799
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086602 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 6086701  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6086702 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 6086799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9459767 - 9459570
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9459767 agagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 9459668  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9459667 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaa 9459570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2837749 - 2837552
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  2837749 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatg 2837650  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2837649 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2837552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11167444 - 11167247
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167444 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 11167345  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11167344 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaa 11167247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30692055 - 30691858
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30692055 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30691956  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30691955 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30691858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 26704342 - 26704539
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26704342 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 26704441  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26704442 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaa 26704539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 17261076 - 17261273
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17261076 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 17261175  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17261176 aaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 17261273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18613742 - 18613545
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613742 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 18613643  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18613642 gaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaa 18613545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21893659 - 21893472
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21893659 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 21893560  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  21893559 aaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 21893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1153797 - 1153603
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1153797 agagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1153698  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1153697 aaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20726991 - 20726787
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20726991 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 20726892  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    ||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20726891 aaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 20726796  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  20726795 ggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 34887295 - 34887492
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  34887295 agagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatg 34887394  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34887395 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 34887492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955966
Alignment:
Q  31 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  131 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 3955966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699129
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaa 30699129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307208
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaa 16307208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 28199511 - 28199709
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  28199511 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatg 28199609  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28199610 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28199709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35198487 - 35198295
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35198487 agagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 35198388  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  35198387 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaat 35198295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33464533 - 33464399
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33464533 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33464434  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464433 aaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52992 - 52843
Alignment:
Q  66 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52992 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 52893  T
Q  166 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
     |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52892 tgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 53112 - 53001
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53112 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 53013  T
Q  118 aaactatgataa 129  Q
    ||||||||||||    
T  53012 aaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463708
Alignment:
Q  144 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 33463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165801
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaa 1165801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579044
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1579044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605771
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1605771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 9008060 - 9008257
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9008060 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 9008159  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9008160 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 9008257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 24105674 - 24105871
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105674 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 24105773  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24105774 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 24105871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420866
Alignment:
Q  19 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  119 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 27420866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 8374342 - 8374538
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8374342 agagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8374440  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  8374441 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaa 8374538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16069558 - 16069361
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16069558 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16069459  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16069458 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 16069361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 16737450 - 16737643
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16737450 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16737549  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16737550 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 16737643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 27679172 - 27679369
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27679172 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 27679271  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27679272 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 27679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31883349 - 31883152
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883349 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 31883250  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31883249 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 31883152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 3386493 - 3386686
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3386493 aatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 3386592  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3386593 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 3386686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 33491199 - 33491396
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33491199 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatg 33491298  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491299 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 33491396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4121142 - 4120945
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4121142 agagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 4121043  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4121042 aaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaa 4120945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19358731 - 19358534
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19358731 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatg 19358632  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19358631 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaa 19358534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33991345 - 33991152
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33991345 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 33991246  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  33991245 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaat 33991152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 38598453 - 38598650
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38598453 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 38598552  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  38598553 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaa 38598650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5203177 - 5202969
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5203177 agagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 5203078  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  5203077 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaac 5202978  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  5202977 ggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3921786 - 3921589
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3921786 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3921687  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  3921686 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaa 3921589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 20992149 - 20992342
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20992149 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatg 20992248  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20992249 aaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaat 20992342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 35782647 - 35782844
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35782647 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 35782746  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35782747 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaa 35782844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 26602945 - 26603116
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26602945 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatg 26603044  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26603045 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctca 26603116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27025161 - 27025005
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27025161 agagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatg 27025062  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27025061 aaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgg 27025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410484
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaa 31410484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992485
Alignment:
Q  88 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagct 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  188 c----acatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaa 20992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  82 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtata 181  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  182 taagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638175
Alignment:
Q  87 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||  |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  187 tcacata 193  Q
    |||||||    
T  31638181 tcacata 31638175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 35420427 - 35420478
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagg 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35420427 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagg 35420478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 157
Target Start/End: Original strand, 41818536 - 41818605
Alignment:
Q  88 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc 157  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818536 cttattaaaatacaatataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634593
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||  |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatc 25634593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516128
Alignment:
Q  89 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatg 19516128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 19913621 - 19913828
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913621 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 19913720  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19913721 aaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 19913820  T
Q  217 ggggccat 224  Q
    ||||||||    
T  19913821 ggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 15241019 - 15241216
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241019 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 15241118  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15241119 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15241216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20877249 - 20877052
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877249 agagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 20877150  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20877149 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20877052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38055359 - 38055150
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38055359 agagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 38055260  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  38055259 aaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 38055160  T
Q  217 ggggccatat 226  Q
    ||||||||||    
T  38055159 ggggccatat 38055150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 53717455 - 53717652
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53717455 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatg 53717554  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53717555 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 53717652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54189747 - 54189550
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54189747 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 54189648  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54189647 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54189550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14987992 - 14987797
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987992 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 14987893  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14987892 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 14987797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1617286 - 1617089
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1617286 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatg 1617187  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1617186 aaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 1617089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 1756755 - 1756952
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1756755 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1756854  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1756855 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 23776450 - 23776647
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23776450 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 23776549  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776550 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23776647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50353999 - 50353793
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50353999 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 50353900  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacgggg 220  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50353899 tatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 50353800  T
Q  221 ccatata 227  Q
    || ||||    
T  50353799 ccttata 50353793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 6611351 - 6611548
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6611351 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatg 6611450  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6611451 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaa 6611548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16700983 - 16700786
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700983 agagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 16700884  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16700883 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 16700786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704397
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 23704397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33704043 - 33703850
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704043 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 33703944  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33703943 aaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37464923 - 37464730
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37464923 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 37464824  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37464823 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 37464730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53875859 - 53875662
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  53875859 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttata 53875760  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53875759 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaa 53875662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54412830 - 54412633
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54412830 agagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatg 54412731  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54412730 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54412633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 45424527 - 45424722
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45424527 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 45424626  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45424627 actatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaa 45424722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055289
Alignment:
Q  24 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  124 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 50055289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 28032707 - 28032897
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28032707 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatac 28032806  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  28032807 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 28032897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 27488639 - 27488836
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27488639 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 27488738  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  27488739 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaa 27488836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423752
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 30423752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 44379178 - 44379375
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44379178 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 44379277  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||  ||||||||||| ||||||||    
T  44379278 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaa 44379375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31969883 - 31969696
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31969883 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 31969784  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  31969783 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52139406 - 52139208
Alignment:
Q  17 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52139406 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 52139307  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52139306 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaa 52139208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 2481399 - 2481596
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2481399 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 2481498  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2481499 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2481596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15669385 - 15669188
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15669385 agagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatg 15669286  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15669285 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 15669188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30171782 - 30171585
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  30171782 agagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatg 30171683  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30171682 aaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 30171585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 40428711 - 40428904
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  40428711 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatg 40428810  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40428811 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaat 40428904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290148
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaa 43290148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 44784908 - 44785105
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44784908 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 44785007  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44785008 aaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 44785105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48910048 - 48909851
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  48910048 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatg 48909949  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48909948 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 48909851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 8591083 - 8591275
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8591083 agagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatg 8591182  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  8591183 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 37968748 - 37968942
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37968748 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 37968847  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  37968848 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 11639569 - 11639766
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11639569 agagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 11639668  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11639669 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaa 11639766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 35490764 - 35490961
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35490764 agagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 35490863  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  35490864 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 35490961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 27536095 - 27536288
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27536095 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 27536194  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27536195 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaa 27536288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 19164971 - 19165160
Alignment:
Q  25 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19164971 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactat 19165068  T
Q  125 gataaactatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19165069 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 19165160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 6688618 - 6688809
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |    
T  6688618 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca------g 6688711  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6688712 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaa 6688809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47632237 - 47632039
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47632237 agagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 47632138  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47632137 aaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaa 47632039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 8932169 - 8932366
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8932169 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 8932268  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  8932269 aaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaa 8932366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16704024 - 16703843
Alignment:
Q  17 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16704024 cagagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 16703925  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16703924 gaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 40680029 - 40680226
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40680029 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 40680128  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  40680129 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaa 40680226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375850
Alignment:
Q  24 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  124 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaa-tagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaa 44375850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53353265 - 53353060
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttat----taaaatatgacataagcagct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  53353265 agagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagct 53353166  T
Q  114 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcaca----tatgctcaaaataagcca 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || |    || |||||||||||||||    
T  53353165 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagcca 53353066  T
Q  210 atccaa 215  Q
    ||||||    
T  53353065 atccaa 53353060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 27583623 - 27583820
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27583623 agagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 27583722  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27583723 caactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaa 27583820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360435
Alignment:
Q  49 agctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaata-tgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  148 cccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28360435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 55344816 - 55345009
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || || |||    
T  55344816 agagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatg 55344915  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  55344916 caaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 55345009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  31 aggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagccccg---taaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  131 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 23269037 - 23269162
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23269037 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23269136  T
Q  118 aaactatgataaactatttttattta 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  23269137 aaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053448
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaa 50053448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 53408222 - 53408138
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgg-aggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53408222 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatg 53408138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265945
Alignment:
Q  135 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23265945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 9595893 - 9595982
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595893 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9595981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  72 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 154  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 23261877 - 23261937
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctga 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23261877 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548320
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 206  Q
    |||  |||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataag 44548320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 50055347 - 50055304
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055347 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 50055304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 48748260 - 48748197
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaa 81  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||    
T  48748260 agagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 213  Q
    || | |||| ||| | ||| |||   |||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Original strand, 55344684 - 55344715
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataa 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344684 agagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257407
Alignment:
Q  87 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 186  Q
    |||||||||| |||   |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||  |||| |||| |    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  187 tcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggccata 225  Q
    | |||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataagccaattcaatcgggccata 46257407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  76 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36907 - 36710
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36907 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 36808  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36807 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 36710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 6174831 - 6175028
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6174831 agagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatg 6174930  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6174931 aaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 6175028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42937922 - 42937724
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggctt-attaaaatatgacataagcagcttat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42937922 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttat 42937823  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42937822 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 42937724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 31517218 - 31517427
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31517218 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 31517317  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31517318 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaac 31517417  T
Q  217 ggggccatat 226  Q
    ||||||||||    
T  31517418 ggggccatat 31517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 18806887 - 18807084
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18806887 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 18806986  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18806987 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 18807084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 3873247 - 3873444
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3873247 agagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3873346  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3873347 aaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 3873444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 33906054 - 33906247
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33906054 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 33906153  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  33906154 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaa 33906247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4016241 - 4016044
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4016241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 4016142  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4016141 aaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaa 4016044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39635654 - 39635457
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39635654 agagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatg 39635555  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39635554 aaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaa 39635457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5733601 - 5733407
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733601 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 5733502  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  5733501 aaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 26323189 - 26323386
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26323189 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 26323288  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26323289 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaa 26323386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  35 tacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  135 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggcc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 4232149 - 4232342
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4232149 aatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaac 4232248  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  4232249 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 4232342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 30270686 - 30270879
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270686 aatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 30270785  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  30270786 tatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaa 30270879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384126
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| |||  |||||||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 211
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066490
Alignment:
Q  23 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaact 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  123 atgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaat 16066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 28329844 - 28330037
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28329844 agaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaa 28329941  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28329942 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28330037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901337
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 19901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 1482906 - 1483099
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1482906 agagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1483005  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 212  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1483006 aaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatgg-agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 1483099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 30420182 - 30420367
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30420182 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaa------------gctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30420269  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30420270 aacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 2178772 - 2178927
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2178772 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 2178871  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 173  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2178872 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 2178927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 851199 - 851002
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  851199 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttata 851100  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  851099 aaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaa 851002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 16588783 - 16588976
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16588783 aatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16588882  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  16588883 tataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaa 16588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 44947552 - 44947738
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||    
T  44947552 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatg 44947644  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  44947645 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaat 44947738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429863
Alignment:
Q  19 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  119 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 173  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatg 429863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446769
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||  |||| ||||| || ||||  |||  |||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaa 42446769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101305
Alignment:
Q  78 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatg 22101305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585337
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  171 atg 173  Q
    |||    
T  3585339 atg 3585337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33510686 - 33510489
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33510686 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33510587  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33510586 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 33510489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 42370798 - 42371004
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42370798 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatg 42370897  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  42370898 aaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaac 42370997  T
Q  217 ggggcca 223  Q
    |||||||    
T  42370998 ggggcca 42371004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170644
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaa 1170644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16052298 - 16052101
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16052298 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16052199  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16052198 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 16052101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20089673 - 20089476
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089673 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 20089574  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20089573 aaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20089476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29078718 - 29078521
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29078718 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 29078619  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29078618 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 29078521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38829271 - 38829074
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38829271 agagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatg 38829172  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38829171 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaa 38829074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 19715164 - 19715361
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715164 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 19715263  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19715264 aaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaa 19715361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25897576 - 25897379
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25897576 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25897477  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25897476 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 25897379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26663460 - 26663263
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26663460 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatg 26663361  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663360 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26663263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 39260349 - 39260546
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39260349 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 39260448  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39260449 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39260546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29288349 - 29288154
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29288349 agagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 29288252  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29288251 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 29288154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1168705 - 1168508
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1168705 agagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1168606  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1168605 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 1168508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 1940750 - 1940947
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1940750 agagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatg 1940849  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1940850 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8121071 - 8120874
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8121071 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatg 8120972  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8120971 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaa 8120874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46761168 - 46760971
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46761168 agagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 46761069  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  46761068 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaa 46760971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 52753150 - 52753347
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52753150 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 52753249  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52753250 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52753347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2347859 - 2347661
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatgacataagcagcttat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2347859 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttat 2347760  T
Q  117 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||  |||||||||| | |||||||    
T  2347759 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaa 2347661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5215583 - 5215390
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5215583 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaac 5215484  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5215483 tatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 5215390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 26580277 - 26580470
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26580277 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 26580376  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26580377 tatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26580470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 41928498 - 41928695
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41928498 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 41928597  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  41928598 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaa 41928695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17591890 - 17591696
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591890 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 17591791  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  17591790 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctc--aataagccaatccaa 17591696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 970527 - 970735
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  970527 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 970626  T
Q  118 aaac--tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-a 214  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  970627 aaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 970726  T
Q  215 acggggcca 223  Q
    |||||||||    
T  970727 acggggcca 970735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23498662 - 23498469
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23498662 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatg 23498563  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23498562 aaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaat 23498469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40092689 - 40092496
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40092689 aatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 40092590  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  40092589 tatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaa 40092496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52696989 - 52696796
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52696989 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 52696890  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52696889 tatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52696796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765464
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaa 6765464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 8079712 - 8079909
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8079712 agagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 8079811  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8079812 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12683022 - 12682825
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12683022 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 12682923  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12682922 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaa 12682825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32671781 - 32671584
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32671781 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 32671682  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32671681 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32671584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43905852 - 43905659
Alignment:
Q  22 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43905852 aatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 43905753  T
Q  122 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43905752 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaa 43905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40149665 - 40149494
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40149665 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttata 40149566  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40149565 aaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 40149494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 51359220 - 51359425
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51359220 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatg 51359319  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aac 216  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  51359320 aaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaac 51359418  T
Q  217 ggggcca 223  Q
    |||||||    
T  51359419 ggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7145409 - 7145212
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7145409 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 7145310  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc-aaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  7145309 aaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaa 7145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473727
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaa 2473727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 17587510 - 17587694
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587510 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 17587609  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaata 204  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  17587610 aatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 13996726 - 13996923
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13996726 agagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 13996825  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||   |||||||||||||||||||    
T  13996826 aaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaa 13996923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49146374 - 49146177
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  49146374 agagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 49146275  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49146274 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaa 49146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15203314 - 15203106
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  15203314 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatg 15203215  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tccaac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| | ||| |||||||| ||| || |||    
T  15203214 aaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaac 15203115  T
Q  217 ggggccata 225  Q
    |||||||||    
T  15203114 ggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46409639 - 46409440
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaac--cggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46409639 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 46409540  T
Q  116 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46409539 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 46409440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717790
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 15717790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 15554155 - 15554344
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  15554155 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatg 15554254  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||   |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  15554255 aa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 15554344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695680
Alignment:
Q  54 cttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 153  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  154 cacctttaaaaaggc-ttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||    |||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 29695680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38172021 - 38171841
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  38172021 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc-------------acataagcagcttatg 38171935  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||    
T  38171934 aaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaat 38171841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  72 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 171  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  172 tggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagc 207  Q
    ||| |||| ||||||  | ||| |||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086272
Alignment:
Q  91 attaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcac 190  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| | |||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  191 atatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaa 52086272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217983
Alignment:
Q  71 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 170  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  171 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaa 5217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675110
Alignment:
Q  149 ccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaa 5675110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23151
Alignment:
Q  20 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  120 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 23151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 298 - 495
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  298 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 397  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  398 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaa 495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 145248 - 145445
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145248 agagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 145347  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  145348 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 145445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10440 - 10243
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10440 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatg 10341  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| | || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10340 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaa 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 9 - 202
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatg 108  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||  |||||  |||||||||    
T  109 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaat 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3912 - 3715
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3912 agagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3813  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3812 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaa 3715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 9 - 207
Alignment:
Q  18 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  9 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatg 107  T
Q  118 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  108 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaa 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University