View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1292_low_46 (Length: 241)

Name: NF1292_low_46
Description: NF1292
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1292_low_46
NF1292_low_46
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (47-240)||(6594334-6594527)
chr7 (46-240)||(32060097-32060291)
chr7 (47-240)||(6592116-6592309)
chr7 (44-241)||(1560438-1560635)
chr7 (46-231)||(18388535-18388720)
chr7 (47-231)||(18391972-18392156)
chr7 (76-233)||(20344102-20344255)
chr7 (103-209)||(24790230-24790333)
chr7 (103-196)||(43503991-43504080)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (47-240)||(40380290-40380483)
chr5 (46-240)||(40382501-40382695)
chr5 (46-241)||(10593457-10593651)
chr5 (47-231)||(25078329-25078513)
chr5 (47-231)||(25136298-25136482)
chr5 (47-236)||(16544615-16544804)
chr5 (47-236)||(16546837-16547026)
chr5 (78-233)||(29720569-29720721)
chr5 (74-233)||(22536101-22536253)
chr5 (78-233)||(29722729-29722881)
chr5 (77-233)||(29750969-29751122)
chr5 (81-234)||(9789042-9789187)
chr5 (81-196)||(18441462-18441570)
chr5 (84-196)||(16409718-16409824)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (47-240)||(7122882-7123075)
chr4 (47-231)||(8395812-8395996)
chr4 (47-240)||(7125101-7125294)
chr4 (47-231)||(8393603-8393787)
chr4 (46-241)||(5138490-5138685)
chr4 (47-241)||(5136265-5136459)
chr4 (103-196)||(31495143-31495234)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (47-240)||(25421505-25421698)
chr6 (47-233)||(6027452-6027638)
chr6 (47-236)||(33341878-33342067)
chr6 (47-231)||(13154123-13154308)
chr6 (44-231)||(34167288-34167475)
chr6 (47-184)||(6136079-6136216)
chr6 (47-241)||(34165058-34165251)
chr6 (76-241)||(16555069-16555228)
chr6 (76-241)||(16578327-16578486)
chr6 (76-241)||(16616894-16617053)
chr6 (76-241)||(16631625-16631784)
chr6 (76-241)||(16653312-16653471)
chr6 (47-159)||(13159051-13159164)
chr6 (76-209)||(27648082-27648210)
chr6 (103-196)||(2171366-2171456)
chr6 (103-147)||(412374-412418)
chr6 (102-203)||(6097285-6097383)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (47-241)||(13655805-13655999)
chr2 (47-231)||(12647162-12647346)
chr2 (103-234)||(6266896-6267023)
chr2 (81-196)||(32289807-32289916)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (47-241)||(25637627-25637822)
chr3 (47-231)||(3617658-3617842)
chr3 (47-241)||(10211595-10211788)
chr3 (47-241)||(4598299-4598491)
chr3 (47-241)||(10209375-10209568)
chr3 (47-241)||(4600520-4600712)
chr3 (47-241)||(10056419-10056612)
chr3 (47-241)||(10058641-10058834)
chr3 (47-241)||(10060863-10061056)
chr3 (47-241)||(10063085-10063278)
chr3 (47-241)||(10065307-10065500)
chr3 (47-241)||(10067506-10067699)
chr3 (76-241)||(45283185-45283345)
chr3 (99-233)||(54635330-54635462)
chr3 (76-233)||(6716705-6716859)
chr3 (81-203)||(7779821-7779937)
chr3 (103-203)||(801321-801419)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (43-231)||(44203840-44204028)
chr1 (76-241)||(9036615-9036775)
chr1 (77-233)||(21054163-21054314)
chr1 (77-233)||(9987407-9987558)
chr1 (103-233)||(40282582-40282711)
chr1 (103-233)||(20622072-20622200)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (47-231)||(2380-2564)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (47-241)||(6472-6667)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (47-231)||(15290732-15290917)
chr8 (47-231)||(15471101-15471286)
chr8 (47-210)||(42575100-42575264)
chr8 (76-233)||(25690161-25690313)
chr8 (76-233)||(3439709-3439861)
chr8 (81-203)||(2627970-2628087)
chr8 (177-214)||(32902096-32902133)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (90-231)||(73-214)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (90-231)||(3545-3686)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (151-233)||(11042-11125)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 6594334 - 6594527
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6594334 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6594433  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594434 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 6594527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Original strand, 32060097 - 32060291
Alignment:
Q  46 ctgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32060097 ctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 32060196  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060197 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 32060291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 6592116 - 6592309
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6592116 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6592215  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6592216 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggag 6592309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 241
Target Start/End: Original strand, 1560438 - 1560635
Alignment:
Q  44 aactgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1560438 aactgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaga 1560537  T
Q  144 gtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560538 gtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 1560635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Original strand, 18388535 - 18388720
Alignment:
Q  46 ctgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388535 ctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 18388634  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388635 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 18388720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Original strand, 18391972 - 18392156
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  18391972 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtt 18392071  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392072 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 18392156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20344255 - 20344102
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaa---acaacaaaa 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |||| |||     
T  20344255 gatcgaaccacaccaatgcaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtg---tgtgcaagcaacaatcgacaaaaaac 20344162  T
Q  173 caccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20344161 cagcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac-acaatcacaagataaa 20344102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24790333 - 24790230
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24790333 atgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtg---cgtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggt 24790237  T
Q  203 gtgaaac 209  Q
    | |||||    
T  24790236 gagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Original strand, 43503991 - 43504080
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaa 196  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  43503991 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgt-gtgtgcaagcaataatcaacaaa--aacagctagatctaatctaggaa 43504080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40380483 - 40380290
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40380483 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 40380384  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380383 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 40380290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40382695 - 40382501
Alignment:
Q  46 ctgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40382695 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagt 40382596  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382595 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 40382501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10593651 - 10593457
Alignment:
Q  46 ctgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593651 ctgttgtgtatccccgtatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 10593552  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10593551 gtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 10593457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25078513 - 25078329
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25078513 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25078414  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078413 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 25078329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25136482 - 25136298
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25136482 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25136383  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136382 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 25136298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16544804 - 16544615
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaag-accggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16544804 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 16544705  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa 236  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16544704 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaa 16544615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16547026 - 16546837
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaag-accggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16547026 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagc 16546927  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa 236  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16546926 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaa 16546837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720569
Alignment:
Q  78 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 177  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29720624  T
Q  178 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 29720569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 22536101 - 22536253
Alignment:
Q  74 cggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || ||||||||    
T  22536101 cggatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgta---tgcaagcaacaatcaacaaaa 22536194  T
Q  173 caccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  22536195 -aacacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaac-acaatcacaagataaa 22536253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722729
Alignment:
Q  78 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 177  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29722784  T
Q  178 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 29722729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 29750969 - 29751122
Alignment:
Q  77 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  29750969 atcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 29751066  T
Q  177 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29751067 acctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtac-acaatcacaagataaa 29751122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789187
Alignment:
Q  81 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 180  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  9789042 aaccacaccaatacaaagtat---gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgt---gtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacct 9789134  T
Q  181 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac 234  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  9789135 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatac-acaagcacaagataaac 9789187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 196
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441570
Alignment:
Q  81 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  18441462 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacct 18441554  T
Q  181 agatctaatctaggaa 196  Q
    ||||||||||||||||    
T  18441555 agatctaatctaggaa 18441570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16409824 - 16409718
Alignment:
Q  84 cacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctag 182  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||| ||| |||||||| || |||||||    |||||||||| || |||||| |||| |||||||    
T  16409824 cacaccaatacaaagtat---gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg---gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctag 16409732  T
Q  183 atctaatctaggaa 196  Q
    ||||||||||||||    
T  16409731 atctaatctaggaa 16409718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7123075 - 7122882
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7123075 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7122976  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122975 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 7122882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8395996 - 8395812
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8395996 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 8395897  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395896 tattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 8395812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7125294 - 7125101
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7125294 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7125195  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125194 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 7125101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8393787 - 8393603
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8393787 tgttgtgaatccccggacctcaaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtt 8393688  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393687 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 8393603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5138685 - 5138490
Alignment:
Q  46 ctgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138685 ctgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaag 5138586  T
Q  145 tgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5138585 cttattgagcaagcaagagacaacaaaacatca-ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggaga 5138490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5136459 - 5136265
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5136459 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 5136360  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5136359 ttattgagcaagcaagagacaacaaaacatca-ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggaga 5136265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495234
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaa 196  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatcaa-caaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaa 31495234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421505
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25421698 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25421599  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421598 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag 25421505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6027638 - 6027452
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  6027638 tgttgtgaatccccggatctccaagactggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtg 6027539  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027538 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 6027452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Original strand, 33341878 - 33342067
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33341878 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 33341977  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaa 236  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  33341978 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaa 33342067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13154308 - 13154123
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13154308 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13154209  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154208 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 13154123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34167475 - 34167288
Alignment:
Q  44 aactgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167475 aactgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaa 34167376  T
Q  144 gtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
       ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167375 aaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 34167288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 6136079 - 6136216
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136079 tgttgtgaatccccggacctccaaggccggatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 6136178  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136179 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34165251 - 34165058
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34165251 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 34165152  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34165151 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 34165058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16555228 - 16555069
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16555228 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16555134  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16555133 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 16555069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Original strand, 16578327 - 16578486
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16578327 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16578421  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16578422 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 16578486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16617053 - 16616894
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16617053 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16616959  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16616958 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 16616894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16631784 - 16631625
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16631784 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16631690  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16631689 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 16631625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16653471 - 16653312
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16653471 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16653377  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16653376 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 16653312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13159164 - 13159051
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13159164 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13159065  T
Q  146 gtattgtgcaagca 159  Q
     ||||| |||||||    
T  13159064 ttattgagcaagca 13159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27648210 - 27648082
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  27648210 gatcgaaccacaccaatacaag----aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacac 27648116  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27648115 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaac 27648082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171456
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 196  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||| || ||||||||   |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 2171456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 412418 - 412374
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt 147  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  412418 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgt 412374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097383
Alignment:
Q  102 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||   ||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaacca-ctaacaaagtg---tgtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaa 6097380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Original strand, 13655805 - 13655999
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  13655805 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagta 13655904  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655905 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 13655999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Original strand, 12647162 - 12647346
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12647162 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 12647261  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647262 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 12647346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266896
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 202  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtg---tgtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagt 6266927  T
Q  203 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac 234  Q
    |  ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  6266926 gaaaaacacaatac-acaagcacaagataaac 6266896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289807
Alignment:
Q  81 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacc 179  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||| || |||||||    |||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg---gtgcaagcaataatcaacaataacaacacc 32289824  T
Q  180 tagatctaatctaggaa 196  Q
    |||||||||||||||||    
T  32289823 tagatctaatctaggaa 32289807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25637822 - 25637627
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25637822 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtg 25637723  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagc-aacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25637722 tattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggaga 25637627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3617842 - 3617658
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3617842 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 3617743  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617742 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 3617658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10211788 - 10211595
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10211788 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10211689  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211688 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 10211595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Original strand, 4598299 - 4598491
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4598299 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4598398  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598399 tattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 4598491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10209568 - 10209375
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  10209568 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10209469  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209468 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 10209375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Original strand, 4600520 - 4600712
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4600520 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4600619  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4600620 tattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaatcaacaatcacaagataaacaaggaga 4600712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10056612 - 10056419
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10056612 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10056513  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10056512 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10056419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10058834 - 10058641
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10058834 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10058735  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10058734 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10058641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10061056 - 10060863
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10061056 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10060957  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10060956 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10063278 - 10063085
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10063278 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10063179  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10063178 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10063085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10065500 - 10065307
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10065500 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10065401  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10065400 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10065307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10067699 - 10067506
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaaga-ccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10067699 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10067600  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggaga 241  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10067599 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggaga 10067506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45283345 - 45283185
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  45283345 gatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaataatcaacaaaacac 45283250  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  45283249 cacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaacaaggaga 45283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54635462 - 54635330
Alignment:
Q  99 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaacc 198  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54635462 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 54635364  T
Q  199 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  54635363 aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 54635330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6716859 - 6716705
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaac-aaaaca 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||    
T  6716859 gatcgaaccacaccaatgcaaagagt---gatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaaccaaaaca 6716764  T
Q  175 ccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  6716763 ccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaa 6716705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 203
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7779937
Alignment:
Q  81 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacc 179  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || |||||||| || ||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaag--taa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacc 7779913  T
Q  180 tagatctaatctaggaaccaagtg 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  7779914 tagatctaatctaggaaacaagtg 7779937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 801419 - 801321
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaccaa 200  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||  |||||||   |||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  801419 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaat-aaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaa 801324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44204028 - 44203840
Alignment:
Q  43 aaactgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaa 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44204028 aaactgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaa 44203929  T
Q  143 agtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203928 agtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 44203840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9036775 - 9036615
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9036775 gatcgaaccacaccaatgcaaaggat---gatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacac 9036680  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9036679 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggaga 9036615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21054314 - 21054163
Alignment:
Q  77 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  21054314 atcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 21054219  T
Q  177 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21054218 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 21054163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9987558 - 9987407
Alignment:
Q  77 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  9987558 atcgaaccacaccaatacgaaaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 9987463  T
Q  177 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  9987462 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatac-acaatcacaagataaa 9987407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282582
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag 201  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 40282613  T
Q  202 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  40282612 tgagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 40282582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 233
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622200
Alignment:
Q  103 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 202  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 20622170  T
Q  203 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    | |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20622171 gagaaacacaatac-acaatcacaagataaa 20622200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2564
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2380 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 2479  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2480 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6667 - 6472
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 146  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6667 tgttgtgaatccccgagtctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6568  T
Q  147 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat-aaacaaggaga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6567 tattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggaga 6472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15290917 - 15290732
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15290917 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15290818  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290817 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 15290732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15471286 - 15471101
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15471286 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15471187  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471186 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 15471101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 42575100 - 42575264
Alignment:
Q  47 tgttgtgaatccccggacctccaagacc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 145  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42575100 tgttgtgaatccccgagcctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 42575199  T
Q  146 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca 210  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42575200 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca 42575264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25690313 - 25690161
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  25690313 gatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaagaatcaacaaaacac 25690218  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  25690217 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac-acactcacaagataaa 25690161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3439861 - 3439709
Alignment:
Q  76 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 175  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||    
T  3439861 gatcgaaccacaccaatactaaaaa-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcaacaaaacac 3439766  T
Q  176 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  3439765 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaac-acaatcacaagataaa 3439709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627970
Alignment:
Q  81 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccac 178  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||| || |||||||    |||||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgg---gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacac 2627995  T
Q  179 ctagatctaatctaggaaccaagtg 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  2627994 ctagatctaatctaggaaacaagtg 2627970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902133
Alignment:
Q  177 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaa 32902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 73
Alignment:
Q  90 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 115  T
Q  190 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 73  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3686
Alignment:
Q  90 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 3644  T
Q  190 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3645 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata 3686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11125
Alignment:
Q  151 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctagg-aaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa 233  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaa 11125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University