View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1293-Insertion-2 (Length: 921)

Name: NF1293-Insertion-2
Description: NF1293
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1293-Insertion-2
NF1293-Insertion-2
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (8-582)||(15676052-15676614)
chr5 (601-919)||(7440281-7440603)
chr5 (601-919)||(3631294-3631616)
chr5 (601-919)||(26525030-26525352)
chr5 (601-913)||(43348669-43348985)
chr5 (601-919)||(16823166-16823488)
chr5 (601-919)||(43358445-43358767)
chr5 (605-917)||(30772918-30773234)
chr5 (601-919)||(25701222-25701543)
chr5 (601-911)||(9595974-9596288)
chr5 (610-908)||(32304464-32304766)
chr5 (601-919)||(13013055-13013377)
chr5 (617-917)||(8074041-8074345)
chr5 (608-919)||(13084443-13084758)
chr5 (602-917)||(10925545-10925864)
chr5 (601-907)||(15374150-15374445)
chr5 (604-915)||(41084386-41084701)
chr5 (601-779)||(9737651-9737829)
chr5 (604-917)||(26296811-26297128)
chr5 (601-765)||(29390304-29390468)
chr5 (707-917)||(26784971-26785185)
chr5 (744-919)||(9737621-9737799)
chr5 (598-779)||(20656801-20656983)
chr5 (670-919)||(15374317-15374584)
chr5 (601-779)||(19577124-19577302)
chr5 (601-779)||(20487007-20487186)
chr5 (608-745)||(5844148-5844285)
chr5 (633-779)||(26785010-26785157)
chr5 (747-909)||(20487040-20487206)
chr5 (742-917)||(20656773-20656952)
chr5 (744-881)||(29390334-29390473)
chr5 (616-779)||(41817503-41817667)
chr5 (744-893)||(19577121-19577273)
chr5 (602-779)||(37042496-37042675)
chr5 (754-893)||(22578875-22579017)
chr5 (641-779)||(22578878-22579017)
chr5 (751-893)||(41817525-41817670)
chr5 (747-819)||(37042571-37042643)
chr5 (600-777)||(26683033-26683211)
chr5 (744-856)||(5844171-5844285)
chr5 (601-779)||(28662152-28662331)
chr5 (754-811)||(20071239-20071296)
chr5 (608-741)||(30050074-30050207)
chr5 (631-740)||(30062672-30062781)
chr5 (601-716)||(20071221-20071335)
chr5 (744-811)||(30050117-30050184)
chr5 (747-825)||(28662185-28662263)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (601-919)||(29125845-29126167)
chr3 (602-917)||(32270722-32271040)
chr3 (600-917)||(44254404-44254725)
chr3 (601-919)||(1092679-1093001)
chr3 (631-919)||(11231956-11232248)
chr3 (601-919)||(22729255-22729577)
chr3 (601-919)||(52202017-52202339)
chr3 (600-917)||(35083827-35084148)
chr3 (604-919)||(28952193-28952512)
chr3 (601-919)||(12251309-12251631)
chr3 (601-919)||(50527435-50527757)
chr3 (601-917)||(27742521-27742841)
chr3 (601-893)||(49657040-49657335)
chr3 (601-870)||(13594725-13594997)
chr3 (601-917)||(16908622-16908932)
chr3 (603-917)||(36633524-36633835)
chr3 (603-866)||(21259290-21259556)
chr3 (601-917)||(52571236-52571548)
chr3 (629-908)||(21259133-21259417)
chr3 (619-813)||(49169846-49170040)
chr3 (601-778)||(18163753-18163930)
chr3 (615-916)||(45045258-45045563)
chr3 (600-779)||(44205446-44205626)
chr3 (601-779)||(7160235-7160414)
chr3 (745-919)||(25246139-25246317)
chr3 (607-779)||(4618192-4618362)
chr3 (662-825)||(743958-744112)
chr3 (744-916)||(7160208-7160384)
chr3 (744-919)||(18163783-18163961)
chr3 (744-919)||(44205477-44205656)
chr3 (629-779)||(11231986-11232137)
chr3 (629-763)||(13594721-13594856)
chr3 (619-770)||(34660799-34660950)
chr3 (601-779)||(2618920-2619098)
chr3 (619-779)||(25246169-25246330)
chr3 (744-890)||(13594819-13594967)
chr3 (615-779)||(31174504-31174669)
chr3 (744-890)||(49169858-49170006)
chr3 (744-909)||(4618216-4618382)
chr3 (747-893)||(2618953-2619101)
chr3 (758-893)||(31174501-31174639)
chr3 (747-880)||(34660814-34660949)
chr3 (629-700)||(744030-744100)
chr3 (754-825)||(52499210-52499281)
chr3 (751-813)||(18657913-18657975)
chr3 (839-893)||(18657980-18658034)
chr3 (727-764)||(18657979-18658016)
chr3 (600-666)||(25894699-25894766)
chr3 (641-716)||(52499206-52499281)
chr3 (746-780)||(25894698-25894732)
chr3 (746-780)||(25911665-25911699)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (600-916)||(26293194-26293514)
chr2 (601-919)||(34983311-34983633)
chr2 (601-919)||(23869698-23870020)
chr2 (601-919)||(36435983-36436305)
chr2 (603-919)||(1020869-1021190)
chr2 (600-919)||(26860463-26860786)
chr2 (603-917)||(2249618-2249936)
chr2 (604-917)||(44545532-44545849)
chr2 (604-919)||(1114839-1115158)
chr2 (601-919)||(13615764-13616086)
chr2 (601-919)||(38527209-38527530)
chr2 (619-919)||(16194305-16194609)
chr2 (615-919)||(31392596-31392902)
chr2 (601-919)||(6749807-6750129)
chr2 (601-917)||(7366186-7366506)
chr2 (615-917)||(12995015-12995321)
chr2 (610-917)||(11764838-11765149)
chr2 (598-917)||(42016534-42016858)
chr2 (601-812)||(38763749-38763960)
chr2 (615-919)||(28745305-28745601)
chr2 (615-891)||(11935205-11935485)
chr2 (615-891)||(3836171-3836449)
chr2 (615-779)||(34494420-34494584)
chr2 (600-779)||(19283875-19284054)
chr2 (601-779)||(43471398-43471577)
chr2 (601-779)||(22674684-22674863)
chr2 (744-919)||(22674654-22674833)
chr2 (744-919)||(34494390-34494568)
chr2 (752-917)||(19283847-19284015)
chr2 (601-779)||(41699219-41699395)
chr2 (744-916)||(41699249-41699422)
chr2 (615-779)||(31643555-31643720)
chr2 (744-890)||(38763779-38763927)
chr2 (744-917)||(43471370-43471547)
chr2 (746-893)||(31643552-31643702)
chr2 (752-893)||(2077563-2077707)
chr2 (601-779)||(29141875-29142054)
chr2 (634-779)||(29035344-29035490)
chr2 (639-779)||(2077563-2077704)
chr2 (755-893)||(29141872-29142013)
chr2 (634-760)||(32099999-32100131)
chr2 (747-813)||(32099999-32100065)
chr2 (621-698)||(17526052-17526129)
chr2 (744-811)||(17526052-17526119)
chr2 (747-893)||(29035341-29035490)
chr2 (872-919)||(38763964-38764012)
chr2 (615-667)||(44788476-44788528)
chr2 (615-666)||(1538195-1538246)
chr2 (742-780)||(1538194-1538232)
chr2 (742-779)||(44788477-44788514)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (601-917)||(33011859-33012179)
chr1 (601-915)||(16692753-16693071)
chr1 (600-919)||(51139720-51140043)
chr1 (615-919)||(40428581-40428889)
chr1 (601-917)||(17285095-17285416)
chr1 (601-917)||(42372005-42372325)
chr1 (601-919)||(29981507-29981829)
chr1 (601-917)||(919512-919832)
chr1 (615-919)||(25298888-25299196)
chr1 (604-919)||(8086268-8086587)
chr1 (602-919)||(29169978-29170299)
chr1 (604-919)||(23177380-23177699)
chr1 (605-919)||(44052259-44052577)
chr1 (601-919)||(47561762-47562084)
chr1 (642-919)||(40567042-40567323)
chr1 (601-919)||(37125728-37126050)
chr1 (615-919)||(45836893-45837201)
chr1 (619-919)||(48708217-48708521)
chr1 (619-917)||(46224564-46224864)
chr1 (600-866)||(24544572-24544841)
chr1 (603-919)||(24790472-24790793)
chr1 (601-919)||(8530118-8530446)
chr1 (601-917)||(9042221-9042540)
chr1 (601-919)||(6849788-6850109)
chr1 (629-919)||(24542580-24542875)
chr1 (606-779)||(44317607-44317780)
chr1 (629-866)||(24542748-24542989)
chr1 (629-866)||(24542862-24543103)
chr1 (629-866)||(24542976-24543217)
chr1 (629-866)||(24543090-24543331)
chr1 (629-866)||(24543204-24543445)
chr1 (629-866)||(24543318-24543559)
chr1 (629-866)||(24543432-24543673)
chr1 (629-866)||(24543546-24543787)
chr1 (629-866)||(24543660-24543901)
chr1 (629-866)||(24543774-24544015)
chr1 (629-866)||(24543888-24544129)
chr1 (629-866)||(24544002-24544243)
chr1 (629-866)||(24544116-24544357)
chr1 (629-866)||(24544230-24544471)
chr1 (629-866)||(24544344-24544585)
chr1 (629-866)||(24544458-24544699)
chr1 (629-779)||(40567142-40567293)
chr1 (774-917)||(37343082-37343229)
chr1 (615-779)||(9246844-9247009)
chr1 (744-915)||(44317632-44317806)
chr1 (606-779)||(21852041-21852215)
chr1 (620-779)||(49001425-49001586)
chr1 (619-775)||(32540541-32540698)
chr1 (746-893)||(32540534-32540684)
chr1 (744-893)||(9246841-9246993)
chr1 (743-893)||(49001422-49001576)
chr1 (661-779)||(37343082-37343201)
chr1 (747-893)||(21852069-21852218)
chr1 (619-770)||(29055886-29056037)
chr1 (605-657)||(1243682-1243734)
chr1 (601-779)||(46601037-46601216)
chr1 (754-880)||(29055887-29056015)
chr1 (608-666)||(45807054-45807112)
chr1 (751-891)||(46601074-46601217)
chr1 (742-780)||(45807075-45807113)
chr1 (742-777)||(1243675-1243710)
chr1 (601-666)||(17879918-17879983)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (600-919)||(43117383-43117707)
chr8 (601-919)||(21434875-21435197)
chr8 (602-917)||(22658150-22658469)
chr8 (608-919)||(42555895-42556210)
chr8 (600-917)||(36060392-36060713)
chr8 (601-919)||(5589975-5590297)
chr8 (601-919)||(41837756-41838078)
chr8 (601-919)||(1098093-1098415)
chr8 (598-919)||(7242437-7242761)
chr8 (601-917)||(4231256-4231575)
chr8 (624-919)||(28564943-28565242)
chr8 (624-919)||(28572566-28572865)
chr8 (601-919)||(6316912-6317234)
chr8 (600-919)||(2317096-2317419)
chr8 (605-919)||(3886582-3886900)
chr8 (599-917)||(4697840-4698162)
chr8 (601-919)||(24796855-24797177)
chr8 (602-917)||(3659626-3659945)
chr8 (615-915)||(1183872-1184176)
chr8 (600-919)||(41388040-41388363)
chr8 (605-917)||(10092294-10092610)
chr8 (609-917)||(7012381-7012692)
chr8 (601-825)||(38567164-38567389)
chr8 (616-917)||(7413082-7413387)
chr8 (615-893)||(7421884-7422158)
chr8 (601-779)||(9830643-9830821)
chr8 (744-909)||(197268-197437)
chr8 (744-909)||(312105-312274)
chr8 (615-854)||(41169747-41169989)
chr8 (744-919)||(9830673-9830851)
chr8 (634-779)||(8996417-8996561)
chr8 (603-779)||(11635796-11635974)
chr8 (634-775)||(36108837-36108979)
chr8 (631-779)||(197268-197417)
chr8 (631-779)||(312105-312254)
chr8 (747-891)||(25642676-25642823)
chr8 (634-779)||(25642677-25642823)
chr8 (619-779)||(25382983-25383143)
chr8 (607-765)||(8995012-8995171)
chr8 (747-893)||(36108837-36108986)
chr8 (615-765)||(17836476-17836628)
chr8 (747-893)||(11635828-11635977)
chr8 (744-890)||(38567195-38567343)
chr8 (749-892)||(17836498-17836644)
chr8 (746-893)||(25382980-25383129)
chr8 (631-722)||(38567308-38567399)
chr8 (839-919)||(34934286-34934367)
chr8 (747-893)||(8995039-8995188)
chr8 (689-779)||(43073157-43073247)
chr8 (619-757)||(32017942-32018081)
chr8 (744-811)||(32018002-32018069)
chr8 (853-919)||(38567398-38567465)
chr8 (747-893)||(8996417-8996564)
chr8 (727-779)||(34934316-34934368)
chr8 (756-810)||(42559031-42559085)
chr8 (629-666)||(8996524-8996561)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (601-915)||(19081-19399)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (601-919)||(11450306-11450627)
chr6 (610-919)||(7021862-7022174)
chr6 (603-917)||(2660641-2660959)
chr6 (608-919)||(15469132-15469446)
chr6 (609-917)||(34127541-34127853)
chr6 (601-919)||(12698529-12698851)
chr6 (602-919)||(24130045-24130361)
chr6 (610-917)||(26468493-26468804)
chr6 (601-919)||(34023343-34023665)
chr6 (602-919)||(9078857-9079177)
chr6 (601-919)||(8560461-8560784)
chr6 (601-919)||(24635271-24635593)
chr6 (601-908)||(16461220-16461532)
chr6 (629-919)||(23258755-23259050)
chr6 (615-866)||(23258923-23259177)
chr6 (615-891)||(12996333-12996613)
chr6 (600-818)||(14883067-14883287)
chr6 (603-779)||(13405307-13405484)
chr6 (744-813)||(13405387-13405456)
chr6 (598-754)||(10290490-10290647)
chr6 (744-854)||(14883142-14883255)
chr6 (615-779)||(7536506-7536671)
chr6 (747-865)||(10290526-10290647)
chr6 (744-893)||(7536522-7536674)
chr6 (635-779)||(14882993-14883137)
chr6 (641-764)||(1398065-1398188)
chr6 (685-760)||(31968955-31969031)
chr6 (602-666)||(18234949-18235013)
chr6 (742-780)||(2399362-2399400)
chr6 (620-666)||(2399363-2399409)
chr6 (839-893)||(13405304-13405358)
chr6 (743-780)||(18234977-18235014)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (604-917)||(45350089-45350406)
chr7 (601-917)||(22723579-22723899)
chr7 (604-917)||(46027718-46028035)
chr7 (601-917)||(17166901-17167222)
chr7 (601-914)||(44467827-44468144)
chr7 (601-919)||(26873738-26874060)
chr7 (601-919)||(43859126-43859448)
chr7 (601-917)||(9624030-9624351)
chr7 (622-919)||(31065424-31065725)
chr7 (604-919)||(36358111-36358430)
chr7 (601-919)||(44723864-44724186)
chr7 (601-913)||(36675294-36675610)
chr7 (601-919)||(44142797-44143118)
chr7 (637-917)||(23469199-23469483)
chr7 (600-915)||(29075000-29075309)
chr7 (641-919)||(40055666-40055948)
chr7 (603-916)||(39976358-39976675)
chr7 (601-917)||(42241732-42242053)
chr7 (615-917)||(31428786-31429092)
chr7 (598-915)||(16834080-16834403)
chr7 (605-917)||(41367699-41368014)
chr7 (744-917)||(31931827-31932004)
chr7 (744-917)||(8461764-8461941)
chr7 (598-779)||(23562592-23562773)
chr7 (601-747)||(18104295-18104441)
chr7 (629-779)||(23469227-23469378)
chr7 (621-779)||(31931855-31932014)
chr7 (629-779)||(40055767-40055918)
chr7 (603-779)||(8461736-8461913)
chr7 (634-779)||(46828781-46828926)
chr7 (744-909)||(18104243-18104411)
chr7 (747-909)||(46828761-46828926)
chr7 (635-779)||(25174216-25174361)
chr7 (747-893)||(22499723-22499868)
chr7 (602-779)||(29502076-29502254)
chr7 (609-779)||(16649541-16649711)
chr7 (609-779)||(17623902-17624072)
chr7 (748-893)||(25174216-25174364)
chr7 (748-893)||(16649538-16649685)
chr7 (748-893)||(17623899-17624046)
chr7 (605-779)||(22499726-22499897)
chr7 (662-779)||(29663010-29663128)
chr7 (615-779)||(30781060-30781224)
chr7 (744-917)||(23562564-23562740)
chr7 (751-893)||(28754878-28755022)
chr7 (747-893)||(29502073-29502222)
chr7 (750-811)||(22566606-22566667)
chr7 (620-759)||(28754860-28754999)
chr7 (775-916)||(29663010-29663155)
chr7 (599-779)||(9013849-9014029)
chr7 (637-698)||(22566606-22566667)
chr7 (727-779)||(6961194-6961246)
chr7 (746-810)||(40883349-40883413)
chr7 (839-890)||(6961195-6961246)
chr7 (650-760)||(9014476-9014587)
chr7 (707-776)||(4248865-4248935)
chr7 (638-779)||(8727794-8727936)
chr7 (747-893)||(30781079-30781227)
chr7 (744-797)||(6961112-6961165)
chr7 (742-893)||(9013879-9014032)
chr7 (633-678)||(40883349-40883394)
chr7 (631-683)||(6961112-6961164)
chr7 (763-811)||(9014476-9014524)
chr7 (727-779)||(9021586-9021638)
chr7 (754-797)||(4249040-4249083)
chr7 (615-666)||(25303949-25304000)
chr7 (771-893)||(9021516-9021641)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (604-919)||(31581551-31581870)
chr4 (601-919)||(11650767-11651089)
chr4 (601-917)||(13612895-13613215)
chr4 (601-919)||(44745391-44745713)
chr4 (601-919)||(31663968-31664286)
chr4 (601-917)||(13233265-13233585)
chr4 (601-917)||(18491222-18491542)
chr4 (601-917)||(6755864-6756183)
chr4 (600-919)||(12700369-12700691)
chr4 (601-919)||(38141358-38141681)
chr4 (604-917)||(44134532-44134848)
chr4 (604-919)||(16925144-16925463)
chr4 (601-919)||(36584459-36584780)
chr4 (615-913)||(36954817-36955119)
chr4 (601-917)||(40228233-40228554)
chr4 (608-919)||(43564460-43564775)
chr4 (601-919)||(19653446-19653767)
chr4 (615-913)||(41832425-41832728)
chr4 (601-913)||(2654717-2655033)
chr4 (619-919)||(52581509-52581814)
chr4 (601-919)||(22647146-22647468)
chr4 (601-825)||(44817449-44817672)
chr4 (600-917)||(54795532-54795853)
chr4 (608-913)||(50767076-50767385)
chr4 (610-893)||(10096285-10096570)
chr4 (602-917)||(27270390-27270708)
chr4 (598-776)||(45669992-45670170)
chr4 (615-915)||(4632509-4632814)
chr4 (634-779)||(13857680-13857826)
chr4 (745-917)||(51001542-51001717)
chr4 (744-876)||(45670025-45670159)
chr4 (635-779)||(13869211-13869356)
chr4 (615-779)||(36801805-36801970)
chr4 (639-779)||(7638702-7638842)
chr4 (601-760)||(51001511-51001670)
chr4 (747-893)||(13857680-13857829)
chr4 (601-763)||(18707712-18707879)
chr4 (846-919)||(45670168-45670242)
chr4 (748-893)||(13869211-13869359)
chr4 (752-893)||(7638699-7638842)
chr4 (601-760)||(18735215-18735379)
chr4 (751-893)||(36801802-36801947)
chr4 (629-725)||(44817436-44817532)
chr4 (601-763)||(18668964-18669131)
chr4 (643-779)||(26653080-26653217)
chr4 (603-780)||(133388-133565)
chr4 (639-779)||(10393896-10394037)
chr4 (727-779)||(7776931-7776983)
chr4 (615-674)||(9046131-9046190)
chr4 (752-893)||(10393896-10394040)
chr4 (826-893)||(9046037-9046104)
chr4 (839-893)||(7776932-7776986)
chr4 (627-779)||(15632193-15632347)
chr4 (744-890)||(133416-133564)
chr4 (744-787)||(9046131-9046174)
chr4 (751-813)||(5734132-5734194)
chr4 (839-893)||(5734199-5734253)
chr4 (727-764)||(5734198-5734235)
chr4 (744-777)||(18735245-18735278)
chr4 (603-666)||(11975782-11975844)
chr4 (602-664)||(18714816-18714878)
chr4 (742-779)||(11975782-11975819)
chr4 (744-777)||(18668994-18669027)
chr4 (744-777)||(18714845-18714878)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (601-890)||(64969-65261)
scaffold0014 (629-916)||(65110-65402)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (600-917)||(1138-1459)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (619-825)||(331825-332031)
scaffold0002 (847-915)||(332441-332510)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (600-821)||(11212-11433)
scaffold0131 (744-860)||(11243-11361)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (754-811)||(303844-303901)
scaffold0003 (601-716)||(303826-303940)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (746-810)||(82871-82935)
scaffold0041 (633-678)||(82890-82935)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 582
Target Start/End: Original strand, 15676052 - 15676614
Alignment:
Q  8 tgcattaccttagcaacaaaagaatcaaagtgccaaacggacaaaatctccactcagctaaaaagatgaaggaaggctgatatttgtgcttcccttttta 107  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15676052 tgcattacattagcaccaaaagaatcaaaatgccaaacggacaaaatctccactcagctaaaaatatgaaggaaggctgatatttgtgcttcccttttta 15676151  T
Q  108 tttatcaaatgtcagaggcactccatatataaggtaaggatatgtgcctttcaattgggcactagacatacacttatagct-------ccttttgtcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |       ||||||||||||    
T  15676152 tttatcaaatgtcagaggcactccatgtataaggtaaggatatgtgccttttaattgggcactagacatacacttataagttataccaccttttgtcata 15676251  T
Q  201 gagagatgaacccaaaacgaatt-ggaaaaggatcgatcgaaacaaagtagcccctcgacca--aacaaaaattaatttgggaggaaaagtaagagatag 297  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  15676252 aagagatgaacccaaaacgaatttggaaaaggatcgatcctaaaaaagtagccccttgaccagaaaaaaaaaattatttgggaggaaaagtaaaagatag 15676351  T
Q  298 ttgatccatataacattgttgggcatacttttatttggagttaggggatcatcacattgaactttaaacaatcatatatgtgaaattaaacatcatattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||                      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15676352 ttgatccatataacattgttgggtatactt----------------------cacattgaactttaaacaattatatatgtgaaattaaacatcacattt 15676429  T
Q  398 tgagataaaattgtaaggtattgagtatatcccacttatataatgttgaaaattcattgtgctatcaaatgcgagactcttgcttacacttgatatacca 497  Q
    | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15676430 taagacaaaattttaaggtatggagtatatcccacttatgtaattgtgaaaattcattgtgctattaaatgcgagactcttgcttacacttgatatacta 15676529  T
Q  498 acaatttttcacttaagtttgagcaaattcattcatttgaatatggtccctctcaagtgaatgttttttcatcgaaatatatcca 582  Q
    | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15676530 ataattttcaacttaagtttgagctaattcattcatttgaatatggtccctctcaagtgaacgttttttcatcgaaatatatcca 15676614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 7440603 - 7440281
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7440603 ggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 7440504  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7440503 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 7440404  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa-tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7440403 tgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaattttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 7440304  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7440303 ttaattttagtggcccaccctga 7440281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 3631294 - 3631616
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3631294 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcc 3631393  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  3631394 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaagttttggt 3631493  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  3631494 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgggactttaaacaatttttcaatag 3631593  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  3631594 ttaattttagtggtccaccctga 3631616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 26525352 - 26525030
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26525352 ggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttttgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 26525253  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26525252 tgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagt 26525153  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  26525152 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaataa 26525053  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26525052 ttaattttagtggcccaccctga 26525030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 601 - 913
Target Start/End: Original strand, 43348669 - 43348985
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348669 ggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 43348768  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43348769 tgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggt 43348868  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43348869 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 43348968  T
Q  897 ttaattttagtggccca 913  Q
    |||||||||||||||||    
T  43348969 ttaattttagtggccca 43348985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 16823166 - 16823488
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16823166 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcc 16823265  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16823266 tgcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatatgattttatgtcggttttaggtttcggt 16823365  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16823366 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 16823465  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  16823466 ttaattttagtggtccaccctga 16823488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 43358445 - 43358767
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43358445 ggcccacccggaaaaatgaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 43358544  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43358545 tgcaaagtagtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttatacaattttatgtctgttttaggttacggt 43358644  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  43358645 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatag 43358744  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  43358745 ttaattttagtgacccatcctga 43358767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 605 - 917
Target Start/End: Original strand, 30772918 - 30773234
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  30772918 cacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgca 30773017  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgat 804  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30773018 aagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgat 30773117  T
Q  805 ccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca-tagttaa 900  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30773118 ccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaa 30773217  T
Q  901 ttttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||    
T  30773218 ttttagtggcccaccct 30773234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 25701543 - 25701222
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25701543 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcaagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcc 25701444  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25701443 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaa-tttatgtcggttttaggtttcggt 25701345  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25701344 tgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattttttagactttaaacaatttttcaatag 25701245  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25701244 ttaattttagtggcccaccctga 25701222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 601 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 9596288 - 9595974
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  9596288 ggcccacccaaaaaaattaaaaaatcaacgattatatgtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttagttgatccaaatttc 9596189  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9596188 tgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttgtgt 9596089  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatag 896  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  9596088 tgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaattttttaatag 9595989  T
Q  897 ttaattttagtggcc 911  Q
    |||||||||||||||    
T  9595988 ttaattttagtggcc 9595974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 32304766 - 32304464
Alignment:
Q  610 ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtg 709  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  32304766 ggaaaaattaaaaaatcaacgattataagtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtg 32304667  T
Q  710 gtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 809  Q
    ||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32304666 gtgtattggcccacccaaaaattgaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 32304567  T
Q  810 ttcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatttta 905  Q
    |||| | |||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  32304566 ttcccggaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaatttta 32304467  T
Q  906 gtg 908  Q
    |||    
T  32304466 gtg 32304464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 13013377 - 13013055
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13013377 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttaagcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttc 13013278  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  ||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13013277 tacaaaaaggtgtagtgtcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggt 13013178  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||  | |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13013177 tgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 13013078  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  13013077 ttaattttagtggtccaccctga 13013055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 617 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 8074345 - 8074041
Alignment:
Q  617 ttaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagt 716  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||||||    
T  8074345 ttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagt 8074246  T
Q  717 agcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgc 816  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8074245 ggtccacccaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcgagattttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgc 8074146  T
Q  817 aaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaattttagtggccc 912  Q
    ||| |||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  8074145 aaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtggccc 8074046  T
Q  913 accct 917  Q
    |||||    
T  8074045 accct 8074041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 608 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 13084758 - 13084443
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||      
T  13084758 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaa 13084659  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcca 807  Q
     |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13084658 aggtgcagtgtcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatcca 13084559  T
Q  808 aattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattt 903  Q
    |||| | |||||||||  | |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13084558 aatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 13084459  T
Q  904 tagtggcccaccctga 919  Q
    |||||| |||||||||    
T  13084458 tagtggtccaccctga 13084443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 602 - 917
Target Start/End: Original strand, 10925545 - 10925864
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10925545 gcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcct 10925644  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
      || |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10925645 acaaagtggtgtagtggtccacctgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggtt 10925744  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacc-ttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    ||||||||||   |||||||||||  |||| | |||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || |||||||| |||||    
T  10925745 gatccaaattttggcaaattggtgtagtggtctaccagaaaaatttaaataattcaattataggtctaacttgtgagactttaaataatttttcaatagt 10925844  T
Q  898 taattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10925845 taattttagtgacccaccct 10925864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 601 - 907
Target Start/End: Original strand, 15374150 - 15374445
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15374150 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattct 15374249  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||| | | |||| |  |||||||||||||||||||||| |               |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15374250 tgcaaagtggtgtaatggtccacccacaaatttaaataattcaattatatg---------------tttatacagttttatatcggttttaggtttcggt 15374334  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15374335 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 15374434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 604 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 41084701 - 41084386
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |     
T  41084701 ccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatagaattttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgc 41084602  T
Q  704 aaggtggtgtagtagccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
    || |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41084601 aaagtggtgtagtggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggtta 41084503  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacc-ttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    || |||||||| ||||| |||||  || | |||||    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |  |||    
T  41084502 attcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccggaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggtt 41084403  T
Q  899 aattttagtggcccacc 915  Q
    |||||||||||||||||    
T  41084402 aattttagtggcccacc 41084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 9737829 - 9737651
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9737829 ggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcc 9737730  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  9737729 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9737651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 604 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 26297128 - 26296811
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  26297128 ccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcaagatcttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgc 26297029  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaa-atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
    || |||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26297028 aaagtggtgtagtggcccatccaaaatatttaaataattcaattataggcctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttagatttcggttg 26296930  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    || |||||||| ||||| |||||  || | ||| ||   |||| |||| ||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||||||| |  |||    
T  26296929 attcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatgtaaacaattcaattatagatctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggtt 26296830  T
Q  899 aattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  26296829 aattttagcagcccaccct 26296811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 601 - 765
Target Start/End: Original strand, 29390304 - 29390468
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29390304 ggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 29390403  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 765  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29390404 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaga 29390468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 707 - 917
Target Start/End: Original strand, 26784971 - 26785185
Alignment:
Q  707 gtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcc 806  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26784971 gtggtgtagtggcccacccaaaaattgaaataattcaactataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcc 26785070  T
Q  807 aaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa--tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaat 901  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| || || ||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  26785071 aaattcccgcaaattggtgtagtggctca-ctcgaaaagtttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaat 26785169  T
Q  902 tttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||    
T  26785170 tttagtggcccaccct 26785185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 9737799 - 9737621
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||    
T  9737799 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 9737700  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9737699 tttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 9737621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 20656983 - 20656801
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20656983 catggcctatccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaat 20656884  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | | | ||  ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  20656883 ttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttt 20656801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 670 - 919
Target Start/End: Original strand, 15374317 - 15374584
Alignment:
Q  670 tcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattt 768  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15374317 tcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactt 15374416  T
Q  769 tatacaatttta-----------tgtcg--gttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa-tttaaataatt 852  Q
    || ||||||||            | | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||  ||| |||||||||||    
T  15374417 taaacaatttttcaatagttaattttagtagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaactgaaaaatttaaataatt 15374516  T
Q  853 caattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15374517 caattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccctga 15374584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 19577302 - 19577124
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19577302 ggcccacccggaaaaat-aaaaaattaacgattatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcc 19577204  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  19577203 cgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttt 19577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 20487007 - 20487186
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  20487007 ggcccactcgaaaaaattaaaaaattaacgatcataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcc 20487106  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || || |||||||||| || ||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20487107 tgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatttaaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttt 20487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 608 - 745
Target Start/End: Original strand, 5844148 - 5844285
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||      
T  5844148 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaa 5844247  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaat 745  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5844248 tggtgtggtggcccacccgaaaatttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 633 - 779
Target Start/End: Original strand, 26785010 - 26785157
Alignment:
Q  633 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-t 731  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||| || |||||||||| |    
T  26785010 tataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagt 26785109  T
Q  732 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26785110 ttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttt 26785157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 747 - 909
Target Start/End: Original strand, 20487040 - 20487206
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||   |||||    
T  20487040 ataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatt 20487139  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20487140 taaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattttagtgg 20487206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 742 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 20656952 - 20656773
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttg 838  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||       
T  20656952 caattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaa 20656853  T
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  20656852 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccct 20656773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 744 - 881
Target Start/End: Original strand, 29390334 - 29390473
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||    
T  29390334 attataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 29390433  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttg 881  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  29390434 tttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttg 29390473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 616 - 779
Target Start/End: Original strand, 41817503 - 41817667
Alignment:
Q  616 attaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtag 715  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  41817503 attaaaaaattaacgatcatatgtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtag 41817602  T
Q  716 tagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||    
T  41817603 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttt 41817667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 744 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 19577273 - 19577121
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaa 840  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |   ||    
T  19577273 attatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 19577174  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| || ||||||||||||    
T  19577173 atttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttttca 19577121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 37042675 - 37042496
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| ||||||| ||||||||     
T  37042675 gcccacccgaaaaaattaaaaaattgatgatcatagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattccc 37042576  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcg--aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | || |||| ||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  37042575 gcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaattaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 754 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578875
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataa 850  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||  ||||  || ||   ||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  851 ttcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttttca 22578875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 641 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578878
Alignment:
Q  641 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataa 739  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  740 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttt 22578878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 751 - 893
Target Start/End: Original strand, 41817525 - 41817670
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaa 847  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||   |||||||||    
T  41817525 gtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaa 41817624  T
Q  848 taattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||| || || || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  41817625 taattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttttca 41817670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 747 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042571
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaa 819  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaa 37042571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 26683211 - 26683033
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||   |||| |   ||| ||||      
T  26683211 tggcccacccggaaaaattaaaaaattaacaattataggtttattttgtgagattttaaacaattttgtgatgttttttgtttttagcacatcaaaatct 26683112  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataatt--caattataggtctattttgcgagattttatacaatt 777  Q
    || ||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26683111 ctataaagtggtgcagtggcccac-cgaaaaattaaaaaattaaaaattataggtctattttgtgagattttaaacaatt 26683033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 744 - 856
Target Start/End: Original strand, 5844171 - 5844285
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaa 841  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||   |||    
T  5844171 attataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccgaaaa 5844270  T
Q  842 tttaaataattcaat 856  Q
    |||||||||||||||    
T  5844271 tttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 28662152 - 28662331
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| || ||| |||||||      
T  28662152 ggcccacccggaaaaattaaaaaattaaccaccatagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttg 28662251  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtag-cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || ||  ||||||| | |  || |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  28662252 tgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttt 28662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071239
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatt 20071239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 30050207 - 30050074
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||  |||  ||||||| ||||||   |||| |    
T  30050207 ccggaaaaataaaaaaattaacgattataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaattttcgtaaag 30050108  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataatt 741  Q
    ||||||||| ||| ||   |||||||||||||||    
T  30050107 tggtgtagtggccaacctaaaaatttaaataatt 30050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 631 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 30062781 - 30062672
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa 730  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||   |||| |||||| ||| ||  ||| |||||    
T  30062781 attataggtctattttatgatattttatacaactttgtgtcggtttttagttttagttgattcaaattttcgtaaagtggtggagtggcaaacttgaaaa 30062682  T
Q  731 tttaaataat 740  Q
    ||||||||||    
T  30062681 tttaaataat 30062672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 601 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 20071335 - 20071221
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |    
T  20071335 ggcccactcggaaaaattaaaaatt-aacgattaaagatttattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttc 20071237  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagt 716  Q
      ||| ||||||||||    
T  20071236 cataaagtggtgtagt 20071221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 30050184 - 30050117
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||| ||||||    
T  30050184 attataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaatt 30050117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 747 - 825
Target Start/End: Original strand, 28662185 - 28662263
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg 825  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| |||||    
T  28662185 atagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtg 28662263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 29126167 - 29125845
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29126167 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcc 29126068  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29126067 tgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggt 29125968  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29125967 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 29125868  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29125867 ttaattttagtggcccaccctga 29125845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 602 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 32271040 - 32270722
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32271040 gcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattat--gtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcct 32270943  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270942 gcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 32270843  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttg--aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32270842 gatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 32270743  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32270742 ttaattttagtggcccaccct 32270722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 600 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 44254725 - 44254404
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44254725 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattatatatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattc 44254626  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44254625 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 44254526  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  44254525 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 44254426  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44254425 gttaattttagtggcccaccct 44254404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 1093001 - 1092679
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093001 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgggttttatgttttggttgatccaaattcc 1092902  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1092901 tgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggt 1092802  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  1092801 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctgatttgcgagacttaaaacaatttttcaatgg 1092702  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1092701 ttaattttagtggcccaccctga 1092679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 631 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 11232248 - 11231956
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  11232248 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 11232149  T
Q  731 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  11232148 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtg 11232049  T
Q  829 gccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11232048 gcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 11231956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 22729255 - 22729577
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22729255 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 22729354  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22729355 tacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 22729454  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtgg-cccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  22729455 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatgg 22729554  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  22729555 taaattttagtggcccaccctga 22729577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 52202017 - 52202339
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52202017 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttc 52202116  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52202117 tgcaaagtggtgtagtgacccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagt 52202216  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  52202217 tgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccactcaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaag 52202316  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52202317 ttaattttagtggcccaccctga 52202339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 600 - 917
Target Start/End: Original strand, 35083827 - 35084148
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35083827 tggcccacccggaaaaattaaaaaactaatgattataggtcaattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 35083926  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35083927 ctgtaaagtggtgtagtggtccacccgaaaagttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgg 35084026  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  35084027 ttgatccaaattcccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 35084126  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  35084127 gttaattttagtgacccaccct 35084148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 28952512 - 28952193
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28952512 ccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatgggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgc 28952413  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28952412 aaaggggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattacaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 28952313  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28952312 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatgggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagtta 28952213  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  28952212 attttagtggtccaccctga 28952193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 12251631 - 12251309
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12251631 ggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatataattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcc 12251532  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12251531 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttagatttcggt 12251432  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |   ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12251431 tgatccaaattccagcaaattggtgtaatggcccactcgaaaaatttaaataattcaactataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 12251332  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12251331 ttaattttagtggcccaccctga 12251309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 50527757 - 50527435
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50527757 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgtttatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 50527658  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50527657 tgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 50527558  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||    
T  50527557 tgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatag 50527458  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  50527457 ttaattttagtggcccactctga 50527435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 27742521 - 27742841
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27742521 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgcttataggtctattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttc 27742620  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27742621 tgcaaagtggtgtagtggcctatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggt 27742720  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  27742721 tgatcccaattcccgtaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaag 27742820  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  27742821 ttaattttagtggtccaccct 27742841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 601 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 49657335 - 49657040
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49657335 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctattttttgaaattttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 49657236  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49657235 tgcaaagtggtgtagtggtccacctgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 49657136  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49657135 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttca 49657040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 601 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 13594997 - 13594725
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13594997 ggcccacctgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcc 13594898  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13594897 tacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggt 13594798  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 870  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594797 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 13594725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 16908932 - 16908622
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908932 ggcccacccggaaaaataaaaaattcaacgattataggtctattttgcgagattttatg----------tcggttttatgttttggttgatccaaattcc 16908843  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
     | || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16908842 agcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgat 16908743  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16908742 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgctagactttaaacaatttttcaatag 16908643  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16908642 ttaattttagtggtccaccct 16908622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 603 - 917
Target Start/End: Original strand, 36633524 - 36633835
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633524 cccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctg 36633623  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
     || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36633624 caaagtggtgtagcggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatattatacaattttatgtcggttttagatttcggttg 36633723  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacc-ttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||    |||||||||||||||        ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||    
T  36633724 atccaaattcctgcaaattggtgtagtggtccaccagaaaaatttaaataattc-------ggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatggtt 36633816  T
Q  899 aattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  36633817 aattttagtggtccaccct 36633835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 603 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 21259556 - 21259290
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21259556 cccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctg 21259457  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
     || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21259456 caaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttg 21259357  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21259356 atccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 21259290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 52571548 - 52571236
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52571548 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 52571449  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52571448 tacaaagtggtgtagtggcccactcaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag--------caaatttatgtcggttttagatttcggt 52571357  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||| | | ||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  52571356 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtctacccaaaaaatttaaacaattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaaattttcaatag 52571257  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  52571256 ttaattttagtagtccaccct 52571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 629 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 21259417 - 21259133
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||  ||||    
T  21259417 caattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaa 21259318  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21259317 aaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 21259218  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtg 908  Q
     ||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21259217 atggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtg 21259133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 619 - 813
Target Start/End: Original strand, 49169846 - 49170040
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| | |    
T  49169846 aaaaaatcaacgattataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatgg 49169945  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49169946 cccacccgaaaatttaaataattcaattatgggtctattttgcaagactttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcc 49170040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 601 - 778
Target Start/End: Original strand, 18163753 - 18163930
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163753 ggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 18163852  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattt 778  Q
    || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  18163853 tgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaattt 18163930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 615 - 916
Target Start/End: Original strand, 45045258 - 45045563
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||| | ||  | |||||    
T  45045258 aattaaaaaatcaatgattatagatttattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgta 45045357  T
Q  715 gtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||   |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45045358 gtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcc 45045457  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcat-agttaattttagtggc 910  Q
    |||||| |||||  |||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  45045458 tgcaaagtggtgtagtggtccacccaaaaattcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaattttttataagataattttagtggc 45045557  T
Q  911 ccaccc 916  Q
    ||||||    
T  45045558 ccaccc 45045563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 600 - 779
Target Start/End: Original strand, 44205446 - 44205626
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt-gtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 698  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44205446 tggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaatt 44205545  T
Q  699 cctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | || || ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44205546 cttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 44205626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 7160414 - 7160235
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  7160414 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcc 7160315  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | ||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7160314 cgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 7160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 745 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246139
Alignment:
Q  745 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||   |||    
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacactga 25246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 607 - 779
Target Start/End: Original strand, 4618192 - 4618362
Alignment:
Q  607 cccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaag 706  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  ||     
T  4618192 cccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttat-tttttgttgatccaaactctttcaaa 4618290  T
Q  707 gtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618291 gt-gtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 4618362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 662 - 825
Target Start/End: Original strand, 743958 - 744112
Alignment:
Q  662 attttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  743958 attttgtgtcggttttatgttttggttgatcaaaattcctgt--------gtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgg 744049  T
Q  762 gagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg 825  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  744050 aagattttatacaattttacgtcgg-tttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 744112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 744 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 7160384 - 7160208
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||    
T  7160384 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 7160285  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaattttagtggcccaccc 916  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7160284 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgacccaccc 7160208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Original strand, 18163783 - 18163961
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||   |||    
T  18163783 attataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 18163882  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18163883 tttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattttcgtggcccaccctga 18163961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Original strand, 44205477 - 44205656
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaatttta-tgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaa 840  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||   ||    
T  44205477 attatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaa 44205576  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44205577 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 44205656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 629 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 11232137 - 11231986
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-a 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||| || |    
T  11232137 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 11232038  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  11232037 aaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttt 11231986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 629 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 13594856 - 13594721
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-a 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||| || || |    
T  13594856 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaa 13594757  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 763  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13594756 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcga 13594721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 619 - 770
Target Start/End: Original strand, 34660799 - 34660950
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |    
T  34660799 aaaaaattaacgatcataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtgg 34660898  T
Q  719 cccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 770  Q
     |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34660899 tccacccgaaaaatttaaat-attcaattataggtctattttgcgagacttta 34660950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 2618920 - 2619098
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||  |||||| |||| |||    
T  2618920 ggcccatccgaaaaaattaaaaaattaaccaccataggtctattttgcgagattttatacaatt--gtgttggttttaagtttctgttgattcaaactcc 2619017  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaat--ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2619018 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaattaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttt 2619098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 25246330 - 25246169
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |    
T  25246330 aaaaaatcaacgtttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgg 25246231  T
Q  719 cccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  25246230 tctacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttt 25246169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 744 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 13594967 - 13594819
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||   |||    
T  13594967 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 13594868  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  13594867 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 13594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 31174669 - 31174504
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| | | || |||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  31174669 aattaaaaaattatcgatcatagatctaccttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgta 31174570  T
Q  715 gtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || |  ||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31174569 gtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 31174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 744 - 890
Target Start/End: Original strand, 49169858 - 49170006
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||   |||||||||   |||    
T  49169858 attataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaa 49169957  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||    
T  49169958 tttaaataattcaattatgggtctattttgcaagactttatacaatttt 49170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 744 - 909
Target Start/End: Original strand, 4618216 - 4618382
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg-gtggtggcccaccttgaaat 842  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| || | |||| || || |||| |||||   ||||    
T  4618216 attatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggtttta-ttttttgttgatccaaactctttcaaagtgtgtagtggtccacccgaaaat 4618314  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4618315 ttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttttcaataattaattttagtgg 4618382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619101
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaat-- 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||   |||       
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgt--gttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttttca 2619101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 758 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 31174639 - 31174501
Alignment:
Q  758 ttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattca 854  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||  || ||   ||||||||||||||||    
T  31174639 ttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattca 31174540  T
Q  855 attatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||| || ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  31174539 attgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttttca 31174501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 880
Target Start/End: Original strand, 34660814 - 34660949
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||  |||| ||| ||   |||||    
T  34660814 ataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatt 34660913  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagacttt 880  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34660914 taaat-attcaattataggtctattttgcgagacttt 34660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 629 - 700
Target Start/End: Original strand, 744030 - 744100
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  744030 caattataggtctattttggaagattttatacaattttacgtcgg-tttaggtttcggttgatccaaattcc 744100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 754 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499210
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg 825  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| ||||| | ||||| |||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtg 52499210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 813
Target Start/End: Original strand, 18657913 - 18657975
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18657913 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcc 18657975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 839 - 893
Target Start/End: Original strand, 18657980 - 18658034
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18657980 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttca 18658034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 764
Target Start/End: Original strand, 18657979 - 18658016
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18657979 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 18658016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 25894766 - 25894699
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaa-tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25894766 tggcccacccggaaaaattaaaaaaatttacgactataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 25894699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 641 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499206
Alignment:
Q  641 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagt 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| || ||||| ||||| | | || ||||||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagt 52499206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 746 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 25894732 - 25894698
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25894732 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 746 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 25911699 - 25911665
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25911699 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25911665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 600 - 916
Target Start/End: Original strand, 26293194 - 26293514
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26293194 tggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 26293293  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26293294 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcgg 26293393  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  26293394 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 26293493  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccc 916  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26293494 gttaattttagtggcccaccc 26293514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 34983311 - 34983633
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34983311 ggcccacccggaaaaattgaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 34983410  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34983411 tgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 34983510  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34983511 tgatccaaattccagcaaattggtgtagtgacccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 34983610  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  34983611 ttaatttttgtggcccaccctga 34983633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 23869698 - 23870020
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23869698 ggcccaccccgaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattct 23869797  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23869798 tgcaaagtagtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtatattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 23869897  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23869898 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgaatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 23869997  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23869998 ttaattttagtggcccaccctga 23870020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 36436305 - 36435983
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36436305 ggcccacccaaaaaaattaaaaaattaacgattataagtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcc 36436206  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36436205 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggt 36436106  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36436105 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 36436006  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36436005 ttaattttagtggcccaccctga 36435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 603 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 1021190 - 1020869
Alignment:
Q  603 cccacccg-gaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1021190 cccacccgagaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcct 1021091  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1021090 gcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 1020991  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  || ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1020990 gattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagt 1020891  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1020890 taattttagtggcccaccctga 1020869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 26860786 - 26860463
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26860786 tggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattt 26860687  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||  || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26860686 ctacaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 26860587  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  || |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |    
T  26860586 ttgatcccaatttccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaa 26860487  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  26860486 gttaattttagtggcctaccctga 26860463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 603 - 917
Target Start/End: Original strand, 2249618 - 2249936
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2249618 cccacccgaaaaaattaaaaaatcaatgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctg 2249717  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
     || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2249718 caaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttg 2249817  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2249818 atccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtt 2249917  T
Q  899 aattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  2249918 aattttaatgacccaccct 2249936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 604 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 44545849 - 44545532
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  44545849 ccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgc 44545750  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44545749 aaagtggtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaagtttcggttga 44545650  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44545649 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 44545550  T
Q  900 attttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||| |||||||    
T  44545549 attttagtggtccaccct 44545532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 1115158 - 1114839
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1115158 ccactcggaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgc 1115059  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1115058 aaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttgattttaggtttcggttga 1114959  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1114958 tccaaattcctgcaaattggtgtagtggcctacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 1114859  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1114858 attttagtggcccaccctga 1114839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 13616086 - 13615764
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13616086 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcc 13615987  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13615986 tgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 13615887  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  13615886 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattcgcgagattttaaacaatttttcaatag 13615787  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||| ||  |||||||||    
T  13615786 ttaattttactgatccaccctga 13615764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 38527209 - 38527530
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38527209 ggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcc 38527308  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527309 tgcaaagtggtgtagtagcccacccgaaaatttaaataattcaattataggt-tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 38527407  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  38527408 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataatttatttataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatag 38527507  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  38527508 ttaattttcgtggcccactctga 38527530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 619 - 919
Target Start/End: Original strand, 16194305 - 16194609
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  16194305 aaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtgg 16194404  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16194405 cccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaa 16194504  T
Q  819 attggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccac 914  Q
    |||||||  || ||||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16194505 attggtgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccac 16194604  T
Q  915 cctga 919  Q
     ||||    
T  16194605 tctga 16194609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Original strand, 31392596 - 31392902
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31392596 aattaaaaaatcaacgattataagtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgta 31392695  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||      
T  31392696 gtggcccac-ccaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctc 31392794  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcatagttaattttagtggcc 911  Q
    |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31392795 gcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaagttaattttagtgacc 31392894  T
Q  912 caccctga 919  Q
    ||||||||    
T  31392895 caccctga 31392902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 6750129 - 6749807
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6750129 ggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctatttattgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttc 6750030  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6750029 tgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 6749930  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6749929 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacagtttttcaatag 6749830  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6749829 ttaattttagtggcccaccctga 6749807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 7366186 - 7366506
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7366186 ggcccatccgaaaaaataaaaaaatcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcc 7366285  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7366286 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatacatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgat 7366385  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| || |    
T  7366386 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatgg 7366485  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7366486 ttaattttagtggcccaccct 7366506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 615 - 917
Target Start/End: Original strand, 12995015 - 12995321
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  12995015 aattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgta 12995114  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  12995115 gtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttcc 12995214  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12995215 gcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggc 12995314  T
Q  911 ccaccct 917  Q
    |||||||    
T  12995315 ccaccct 12995321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 610 - 917
Target Start/End: Original strand, 11764838 - 11765149
Alignment:
Q  610 ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtg 709  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  11764838 ggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtg 11764937  T
Q  710 gtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 809  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  11764938 gtgtagtggtccacacaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaa 11765037  T
Q  810 ttcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatttta 905  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11765038 ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 11765137  T
Q  906 gtggcccaccct 917  Q
    |||| |||||||    
T  11765138 gtggtccaccct 11765149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 598 - 917
Target Start/End: Original strand, 42016534 - 42016858
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaa-aatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaa 696  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42016534 catggtccacccggaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaa 42016633  T
Q  697 ttcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttt 796  Q
    |||||| ||  || || ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42016634 ttcctgcaaattgatgcagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttt 42016733  T
Q  797 cggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc- 892  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||     
T  42016734 tggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagcggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttca 42016833  T
Q  893 atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  42016834 atagttaattttaatggctcaccct 42016858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 601 - 812
Target Start/End: Original strand, 38763749 - 38763960
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763749 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 38763848  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38763849 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 38763948  T
Q  801 tgatccaaattc 812  Q
    ||||||||||||    
T  38763949 tgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 28745601 - 28745305
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  28745601 aattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgta 28745503  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  28745502 gtggctcacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattccc 28745403  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||           | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28745402 gcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaatta-----------tgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggc 28745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 615 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 11935485 - 11935205
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11935485 aatttaaaaattaacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgta 11935386  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11935385 gtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggttttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcc 11935286  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggcccacc-ttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
     ||||| |||||   |||||||||    ||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  11935285 cgcaaagtggtgtattggcccaccagaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagactttaaacaattttt 11935205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 615 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 3836449 - 3836171
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
T  3836449 aattaaaaaatcaaggactatagatctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgta 3836350  T
Q  715 gt-agcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    || | ||  ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3836349 gtgaaccacctaaaaattttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcc 3836250  T
Q  814 tgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
     ||||| ||  || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  3836249 cgcaaagtgatgtagtgg-ccacccgaaaatttaaataattcaattatatatctattttacgaggctttaaacaattttt 3836171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 34494584 - 34494420
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34494584 aattaaaaaatcaacgattataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgta 34494485  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  34494484 gtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 34494420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 600 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 19284054 - 19283875
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19284054 tggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattc 19283955  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||    
T  19283954 ctgcaaagtggtgtagtgtcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttt 19283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 43471577 - 43471398
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  43471577 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattct 43471478  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | || |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43471477 cgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 43471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 22674863 - 22674684
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  22674863 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcc 22674764  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | ||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  22674763 cgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttt 22674684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 22674833 - 22674654
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||    
T  22674833 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22674734  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22674733 atttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 22674654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 34494568 - 34494390
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||    
T  34494568 attataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 34494469  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34494468 tttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 34494390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 752 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 19284015 - 19283847
Alignment:
Q  752 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaata 849  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||   |||||||||||    
T  19284015 tctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccgaaaatttaaata 19283916  T
Q  850 attcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19283915 attcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 19283847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 41699219 - 41699395
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41699219 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 41699318  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | ||     |||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41699319 cgcaa---attgtagaggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 41699395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 744 - 916
Target Start/End: Original strand, 41699249 - 41699422
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtggtggcccaccttgaaa-t 842  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | | || |||||   ||| |    
T  41699249 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaattg-tagaggtccacccgaaaaat 41699347  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccc 916  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41699348 ttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 41699422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 31643720 - 31643555
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||||| | || |||||||     
T  31643720 aattaaaaaatcaaccactatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtg 31643621  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31643620 gtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 31643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 744 - 890
Target Start/End: Original strand, 38763779 - 38763927
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||    
T  38763779 attataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 38763878  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  38763879 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 38763927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 744 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 43471547 - 43471370
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||  || | ||| ||   ||    
T  43471547 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 43471448  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  43471447 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccct 43471370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643552
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaat 842  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||| ||   ||||    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttca 31643552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 752 - 893
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077707
Alignment:
Q  752 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaat 848  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| ||| |  ||||  || ||   ||||||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  849 aattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttttca 2077707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 29142054 - 29141875
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| ||| || |||||||| || ||| |  ||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||     
T  29142054 ggcccatccgaaaaaattaaaatattaacgaccataagtcaattttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattct 29141955  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
      |||  || |||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29141954 cataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 29141875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035344
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tt 732  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||   | || ||||||||||  |||||||||||| ||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  733 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttt 29035344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 639 - 779
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077704
Alignment:
Q  639 tctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaat 737  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||   || |||| ||||| |  ||  | |||| |||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  738 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttt 2077704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 755 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141872
Alignment:
Q  755 attttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaa-tttaaataat 851  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    ||| || ||   |||||||||   ||| ||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  852 tcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttca 29141872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 634 - 760
Target Start/End: Original strand, 32099999 - 32100131
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag-----cccactcg-a 727  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||||||| |     ||||| || |    
T  32099999 ataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaa 32100098  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttg 760  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32100099 aaatttaaataattcaattatagatctattttg 32100131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 747 - 813
Target Start/End: Original strand, 32099999 - 32100065
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32099999 ataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcc 32100065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 621 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17526129 - 17526052
Alignment:
Q  621 aaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 698  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17526129 aaaattaacgattatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 744 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 17526119 - 17526052
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  17526119 attatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035341
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatt 843  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||  ||  ||||| |   |||||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | || |||| ||||||||||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttttca 29035341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 872 - 919
Target Start/End: Original strand, 38763964 - 38764012
Alignment:
Q  872 cgagactttgaacaatttttca-tagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38763964 cgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 38764012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44788528 - 44788476
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttg 667  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44788528 aattaaaaaattaacaattataggtctatttttcgagattttaaacaattttg 44788476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 615 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 1538246 - 1538195
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  1538246 aattaaaaaattaacaattataggtctattatgcgagattttaaacaatttt 1538195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 742 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1538232 - 1538194
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1538232 caattataggtctattatgcgagattttaaacaatttta 1538194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 742 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 44788514 - 44788477
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44788514 caattataggtctatttttcgagattttaaacaatttt 44788477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 33012179 - 33011859
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33012179 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 33012080  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33012079 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggt 33011980  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33011979 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatttttctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 33011880  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33011879 ttaattttagtggcccaccct 33011859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 601 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 16693071 - 16692753
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16693071 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 16692972  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692971 tacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 16692872  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  16692871 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatat 16692772  T
Q  897 ttaattttagtggcccacc 915  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16692771 ttaattttagtggcccacc 16692753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Original strand, 51139720 - 51140043
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51139720 tggcccaccccaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 51139819  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
     || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51139820 ttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttttacaattttatgtcggttttaggtttcgg 51139919  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  51139920 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 51140019  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  51140020 gttaattttagtggcccaccctga 51140043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 40428889 - 40428581
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40428889 aattaaaaaatcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgta 40428790  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40428789 gtagtccactcgaaaatttaaataattcaattatagttctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccc 40428690  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  40428689 gcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaattaaaataattcaattataaatttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggt 40428590  T
Q  911 ccaccctga 919  Q
    |||||||||    
T  40428589 ccaccctga 40428581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 17285416 - 17285095
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285416 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 17285317  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17285316 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggt 17285217  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttg--aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||    
T  17285216 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaata 17285117  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17285116 gttaattttagtggcccaccct 17285095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 42372005 - 42372325
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42372005 ggcccacccagaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcc 42372104  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42372105 tgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggt 42372204  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42372205 tgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattattgatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 42372304  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  42372305 ttaattttagcggcccaccct 42372325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 29981829 - 29981507
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29981829 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctactttgtgatattttatgcaattttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcc 29981730  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29981729 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggt 29981630  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29981629 tgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaacaattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 29981530  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29981529 ttaattttagtggcccaccctga 29981507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 919832 - 919512
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  919832 ggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 919733  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  919732 tgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttccat 919633  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || | ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  919632 tgatccaaattccagcaaattggtgtagtagtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatag 919533  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  919532 ttaattttagtcgcccaccct 919512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 25299196 - 25298888
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25299196 aattaaaaaataaatgattataggtctattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgta 25299097  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25299096 gtggcccaccggaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattccc 25298997  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25298996 gcaaattagtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggt 25298897  T
Q  911 ccaccctga 919  Q
    |||||||||    
T  25298896 ccaccctga 25298888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Original strand, 8086268 - 8086587
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8086268 ccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgactatagatctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgc 8086367  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8086368 aaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 8086467  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  8086468 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacacgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaattttttaatggtta 8086567  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  8086568 attttaatggcccaccctga 8086587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 919
Target Start/End: Original strand, 29169978 - 29170299
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29169978 gcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcct 29170077  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
      || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29170078 acaaagtggtgtagtagcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggtt 29170177  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||  ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  29170178 gatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaactataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagt 29170277  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29170278 taattttagtggcccaccctga 29170299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Original strand, 23177380 - 23177699
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  23177380 ccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgc 23177479  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23177480 aaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttga 23177579  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23177580 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagtta 23177679  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23177680 attttagtggcccaccctga 23177699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 605 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 44052577 - 44052259
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  44052577 cacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctaca 44052478  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgat 804  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44052477 aagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgat 44052378  T
Q  805 ccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaa 900  Q
     |||||||  |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44052377 tcaaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaa 44052278  T
Q  901 ttttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44052277 ttttagtggcccaccctga 44052259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 47561762 - 47562084
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47561762 ggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattac 47561861  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||| ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47561862 tgcaaagtgatgtagtgaaccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 47561961  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47561962 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 47562061  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  47562062 ttaattttagtggctcaccctga 47562084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 642 - 919
Target Start/End: Original strand, 40567042 - 40567323
Alignment:
Q  642 attttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataatt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  40567042 attttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagtt 40567141  T
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttg 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||       
T  40567142 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 40567241  T
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40567242 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 40567323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 37125728 - 37126050
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37125728 ggcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcc 37125827  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37125828 tgcaaagtggtacagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatatcagttttaggtttcggt 37125927  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  37125928 tgatcaaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 37126027  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37126028 ttaattttagtggcccaccctga 37126050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Original strand, 45836893 - 45837201
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  45836893 aattaaaaaatcaacgattataggtctatattgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgta 45836992  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45836993 gtggtccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcct 45837092  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  45837093 gcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagttgt 45837192  T
Q  911 ccaccctga 919  Q
    |||||||||    
T  45837193 ccaccctga 45837201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 619 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 48708521 - 48708217
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  48708521 aaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgg 48708422  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48708421 cccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaa 48708322  T
Q  819 attggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccac 914  Q
    |||||||  ||| | || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48708321 attggtgtagtgtctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccac 48708222  T
Q  915 cctga 919  Q
    |||||    
T  48708221 cctga 48708217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 619 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 46224864 - 46224564
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  46224864 aaaaaattaacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgg 46224765  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46224764 cccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaa 46224665  T
Q  819 attggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccac 914  Q
    |||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46224664 attggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattttagtggcccac 46224567  T
Q  915 cct 917  Q
    |||    
T  46224566 cct 46224564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 600 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544841 - 24544572
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24544841 tggcccaccccgaaaaattaaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattc 24544742  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544741 ctgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 24544642  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544641 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 603 - 919
Target Start/End: Original strand, 24790472 - 24790793
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790472 cccacccagaaaaataaaaaaatcaacgactataagtctgttttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 24790571  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggtttta-ggtttcggtt 801  Q
     || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  24790572 caaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttacgttttgggtt 24790671  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggc-ccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| | | |   |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24790672 gatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcaagcgaaaaatttaaataattcaattataggtcaaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggt 24790771  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  24790772 taattttagtggcacaccctga 24790793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 8530118 - 8530446
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  8530118 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattct 8530217  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag------attttatacaattttatgtcggttttaggt 794  Q
    || || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8530218 tgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttaattttatacaattttctgtcggttttaggt 8530317  T
Q  795 ttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  8530318 ttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaaactttatacaattttt 8530417  T
Q  892 c-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  8530418 caaaagttaattttagtggcccaccctga 8530446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 9042540 - 9042221
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9042540 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaataattataggtctaatttacgagattttatgcaattt-gtatcgattttatgttttggttgatccaaattcc 9042442  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9042441 tacaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggt 9042342  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||    
T  9042341 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatag 9042242  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  9042241 ttaattttagtggctcaccct 9042221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 6849788 - 6850109
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6849788 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttc 6849887  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6849888 tacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatatcggttttaggtttcggt 6849987  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  | ||||  || ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| |||     
T  6849988 tgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaaatttaaataattcaattataggt-taatttgtgagactttaaacaatttttcaataa 6850086  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6850087 ttaattttagtggcccaccctga 6850109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 629 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 24542875 - 24542580
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24542875 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24542776  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24542775 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24542676  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24542675 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatagttctaattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 24542580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 606 - 779
Target Start/End: Original strand, 44317607 - 44317780
Alignment:
Q  606 acccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaa 705  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44317607 acccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaa 44317706  T
Q  706 ggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317707 agtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24542989 - 24542748
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24542989 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24542890  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24542889 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24542790  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24542789 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24542748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543103 - 24542862
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543103 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543004  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543003 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24542904  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24542903 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24542862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543217 - 24542976
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543217 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543118  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543117 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543018  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543017 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24542976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543331 - 24543090
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543331 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543232  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543231 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543132  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543131 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543445 - 24543204
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543445 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543346  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543345 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543246  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543245 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543559 - 24543318
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543559 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543460  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543459 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543360  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543359 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543673 - 24543432
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543673 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543574  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543573 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543474  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543473 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543787 - 24543546
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543787 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543688  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543687 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543588  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543587 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24543901 - 24543660
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24543901 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543802  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543801 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543702  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543701 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544015 - 24543774
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544015 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24543916  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24543915 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543816  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543815 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544129 - 24543888
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544129 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544030  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544029 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24543930  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24543929 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24543888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544243 - 24544002
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544243 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544144  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544143 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24544044  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544043 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544357 - 24544116
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544357 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544258  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544257 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24544158  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544157 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544471 - 24544230
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544471 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544372  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544371 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24544272  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544271 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544585 - 24544344
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544585 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544486  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544485 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24544386  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544385 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 629 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24544699 - 24544458
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| || ||| ||||    
T  24544699 caattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaa 24544600  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  24544599 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgta 24544500  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24544499 gtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 24544458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 629 - 779
Target Start/End: Original strand, 40567142 - 40567293
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-a 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||| || |    
T  40567142 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 40567241  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40567242 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40567293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 774 - 917
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343229
Alignment:
Q  774 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa-tttaaataattcaattatatgtctaattt 870  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  871 acgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 37343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 9247009 - 9246844
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||    || ||||||||    
T  9247009 aattaaaaaattaaggattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgta 9246910  T
Q  715 gtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  9246909 gtggcccactcgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttt 9246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 744 - 915
Target Start/End: Original strand, 44317632 - 44317806
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||   |||    
T  44317632 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 44317731  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccacc 915  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44317732 tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 44317806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 779
Target Start/End: Original strand, 21852041 - 21852215
Alignment:
Q  606 acccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaa 705  Q
    ||||| || |||| |||||| ||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||  |||||    
T  21852041 acccgaaaaaatttaaaaattaacgatgataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaa 21852140  T
Q  706 ggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     |||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21852141 agtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 21852215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 620 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 49001586 - 49001425
Alignment:
Q  620 aaaaatcaacaattataggtctattttgcgaga--ttttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagta 717  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  49001586 aaaaattaataattataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtg 49001488  T
Q  718 gcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49001487 gtccatccgaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttt 49001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 619 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 32540698 - 32540541
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |   || |||||||| | |    
T  32540698 aaaaaattaacgactataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatgg 32540599  T
Q  719 cccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 775  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  32540598 cccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaa 32540541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 746 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540534
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaat 842  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||   ||||||| ||   ||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaaattttca 32540534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 744 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 9246993 - 9246841
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaa 840  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||  ||||||||| |   ||    
T  9246993 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 9246894  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9246893 atttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttttca 9246841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 743 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 49001576 - 49001422
Alignment:
Q  743 aattataggtctattttgcgaga--ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-cctt 837  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||  |||| ||| ||      
T  49001576 aattataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggttt-agttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccga 49001478  T
Q  838 gaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49001477 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttttca 49001422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 661 - 779
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343201
Alignment:
Q  661 aattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctatttt 759  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  760 gcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttt 37343201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 21852069 - 21852218
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || ||| |||||  |||||||| ||   |||||    
T  21852069 ataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 21852168  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21852169 taaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttca 21852218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 619 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 29056037 - 29055886
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||| ||| || |||||||| | |    
T  29056037 aaaaaattaacgattattgatttattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattgg 29055939  T
Q  719 cccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 770  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29055938 cccaaccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagacttta 29055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 605 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1243734 - 1243682
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagatttta 657  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1243734 cacccggaaaaattaaaaaattaacaattataggtctattttgcgagatttta 1243682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 46601037 - 46601216
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||| ||  || |||||||||| || |  |||| ||| |||||||||||||||   ||  |||| || |||||||    
T  46601037 ggcccatccggaaaaatttaaaaattaacgatcctatgtctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcc 46601136  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | || |||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46601137 cgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaatttt 46601216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 754 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 29056015 - 29055887
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggccca-ccttgaaatttaaataa 850  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||| ||   ||||||||||||    
T  29056015 tattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataa 29055917  T
Q  851 ttcaattatatgtctaatttacgagacttt 880  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  29055916 ttcaattataggtctattttgcgagacttt 29055887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 666
Target Start/End: Original strand, 45807054 - 45807112
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45807054 ccggaaaaattaaaaaattaacaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 45807112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 891
Target Start/End: Original strand, 46601074 - 46601217
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaa 847  Q
    |||||||||| || |  |||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||   |||||||||    
T  46601074 gtctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaa 46601173  T
Q  848 taattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
    |||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  46601174 taattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaattttt 46601217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 742 - 780
Target Start/End: Original strand, 45807075 - 45807113
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45807075 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 45807113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 742 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 1243710 - 1243675
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatt 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1243710 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatt 1243675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 17879983 - 17879918
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  17879983 ggcccacccgggaaaattaaaaatttaataattatatgtttattttgcgagattttaaacaatttt 17879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Original strand, 43117383 - 43117707
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43117383 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 43117482  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcg 798  Q
    ||| || |||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43117483 ctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcg 43117582  T
Q  799 gttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-at 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  43117583 gttgatccaaattcctgcaaattggtttagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaat 43117682  T
Q  895 agttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  43117683 agttaattttagtggtccaccctga 43117707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 21434875 - 21435197
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21434875 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 21434974  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21434975 tgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 21435074  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa-tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21435075 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaagtttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 21435174  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  21435175 ttaattttagtggcccatcctga 21435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 602 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 22658469 - 22658150
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22658469 gcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcct 22658370  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22658369 gcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 22658270  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  22658269 gatcccaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagt 22658170  T
Q  898 taattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22658169 taattttaatggcccaccct 22658150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 608 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 42556210 - 42555895
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42556210 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaag 42556111  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcca 807  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42556110 tggtgcagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatcca 42556011  T
Q  808 aattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattt 903  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  42556010 aattcccgcaatttggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattt 42555911  T
Q  904 tagtggcccaccctga 919  Q
    || | |||||||||||    
T  42555910 taatagcccaccctga 42555895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 600 - 917
Target Start/End: Original strand, 36060392 - 36060713
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36060392 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattc 36060491  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36060492 ctggaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgg 36060591  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  36060592 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaata 36060691  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36060692 gttaattttagtggcccaccct 36060713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 5590297 - 5589975
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590297 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 5590198  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590197 tacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 5590098  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  5590097 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatgg 5589998  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  5589997 taaattttagtggcccaccctga 5589975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 41838078 - 41837756
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41838078 ggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattca 41837979  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41837978 tgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggt 41837879  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41837878 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatag 41837779  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  41837778 ttaattttagtggtccaccctga 41837756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 1098093 - 1098415
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098093 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcc 1098192  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1098193 tataaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggt 1098292  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtgg-cccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1098293 tgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 1098392  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1098393 ttaattttagtggcccaccctga 1098415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 598 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 7242761 - 7242437
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7242761 catggctcacccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaat 7242662  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttc 797  Q
    ||||| ||  |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7242661 tcctgcaaaatggtatagtggcccacccgaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttt 7242563  T
Q  798 ggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-a 893  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  7242562 ggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 7242463  T
Q  894 tagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7242462 tagttaattttagtggcccaccctga 7242437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 4231256 - 4231575
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4231256 ggcccacccgaaa-aattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcc 4231354  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4231355 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggt 4231454  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  4231455 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgccccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatag 4231554  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  4231555 ttaattttagtggtccaccct 4231575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 624 - 919
Target Start/End: Original strand, 28564943 - 28565242
Alignment:
Q  624 atcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccac 723  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28564943 atcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccac 28565042  T
Q  724 tcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 823  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28565043 ccgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 28565142  T
Q  824 tg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28565143 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 28565242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 624 - 919
Target Start/End: Original strand, 28572566 - 28572865
Alignment:
Q  624 atcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccac 723  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28572566 atcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccac 28572665  T
Q  724 tcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 823  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28572666 ccgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 28572765  T
Q  824 tg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28572766 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 28572865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 6316912 - 6317234
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  6316912 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattct 6317011  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  6317012 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagttttattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttaggtttcgga 6317111  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6317112 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 6317211  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  6317212 ttacttttagtggcccaccctga 6317234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Original strand, 2317096 - 2317419
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317096 tggcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattc 2317195  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
     || || |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2317196 atgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttagatttcgg 2317295  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||  || ||   |||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  2317296 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcacccgaaaaatttaaataattcagttatagatctagtttgcgagactttaaacaatttttcaata 2317395  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2317396 gttaattttagtggcccaccctga 2317419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 605 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 3886900 - 3886582
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3886900 cacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgca 3886801  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgat 804  Q
    | |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3886800 aagtggtgtagtggcccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgat 3886701  T
Q  805 ccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaa 900  Q
    || |||||| |||||||||||   || |||| ||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  3886700 cccaattcccgcaaattggtgtactgacccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgtgagactttaaacaattttttaaaagttaa 3886601  T
Q  901 ttttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3886600 ttttagtggcccaccctga 3886582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 599 - 917
Target Start/End: Original strand, 4697840 - 4698162
Alignment:
Q  599 atggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 698  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697840 atggcccatccgaaaaaattaaaaaatcaataattataggtttactttacaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 4697939  T
Q  699 cctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcg 798  Q
    |||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4697940 cctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcg 4698039  T
Q  799 gttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-at 894  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  4698040 gtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaat 4698139  T
Q  895 agttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4698140 agttaattttagtggcccaccct 4698162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 24797177 - 24796855
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797177 ggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 24797078  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24797077 tgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatataatttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggt 24796978  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24796977 tgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 24796878  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24796877 ttaattttagtggcccaccctga 24796855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 602 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 3659945 - 3659626
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3659945 gcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcct 3659846  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3659845 gcaaagtggtgtagtggcccacccggaaatttaaataattcaattataggtctgttttgcgagattttatacaattttatatcggttttaggtttcggtt 3659746  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    |||| ||||| | |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3659745 gatcaaaatttccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagt 3659646  T
Q  898 taattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3659645 taattttagtggtccaccct 3659626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 615 - 915
Target Start/End: Original strand, 1183872 - 1184176
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  1183872 aattaaaaaataaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgta 1183971  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1183972 gtggaccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccc 1184071  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1184072 gcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggc 1184171  T
Q  911 ccacc 915  Q
    |||||    
T  1184172 ccacc 1184176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Original strand, 41388040 - 41388363
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41388040 tggcccatccgaaaaaattaaaaaatcaactattataggtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattc 41388139  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388140 ctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 41388239  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  41388240 ttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaata 41388339  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  41388340 gttaattttagtggtccaccctga 41388363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 605 - 917
Target Start/End: Original strand, 10092294 - 10092610
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    |||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  10092294 cacccgaaaaaattaaaaatacaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgca 10092393  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgat 804  Q
    |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10092394 aaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagat 10092493  T
Q  805 ccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaa 900  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10092494 ccaaattcccgcaaattggtatagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaa 10092593  T
Q  901 ttttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||| ||||||    
T  10092594 ttttagtggctcaccct 10092610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 609 - 917
Target Start/End: Original strand, 7012381 - 7012692
Alignment:
Q  609 cggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggt 708  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7012381 cggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgatatcttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagt 7012480  T
Q  709 ggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaa 808  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7012481 ggtgtagtggtccaccctaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaa 7012580  T
Q  809 attcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatttt 904  Q
    ||||| ||||||||  || |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7012581 attcccgcaaattggagtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag-taatttt 7012679  T
Q  905 agtggcccaccct 917  Q
    ||||| |||||||    
T  7012680 agtggtccaccct 7012692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 601 - 825
Target Start/End: Original strand, 38567164 - 38567389
Alignment:
Q  601 ggcccaccc-ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38567164 ggcccacccaggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattc 38567263  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38567264 ctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 38567363  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg 825  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  38567364 ttgatccaaattcccgcaaattggtg 38567389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 616 - 917
Target Start/End: Original strand, 7413082 - 7413387
Alignment:
Q  616 attaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtag 715  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||    
T  7413082 attaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 7413181  T
Q  716 tagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7413182 tggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccc 7413280  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
     |||| |||||  || | ||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  7413281 tcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattttaatggc 7413380  T
Q  911 ccaccct 917  Q
    |||||||    
T  7413381 ccaccct 7413387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 615 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 7422158 - 7421884
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | || ||| ||||    
T  7422158 aattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgta 7422059  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      || |||||||| ||| |||||||    
T  7422058 gtgacccacccgaaaaatttaaata-ttcaattataggtctattttgcgagattttataaaattttatatc------agttttcggttaatctaaattcc 7421966  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
     ||||| |||||  |||  |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  7421965 cgcaaagtggtgtagtgatccacccaaaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttca 7421884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 601 - 779
Target Start/End: Original strand, 9830643 - 9830821
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9830643 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcc 9830742  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || || |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  9830743 tgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaatttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttt 9830821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 744 - 909
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197437
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||   ||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 197437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 744 - 909
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312274
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||   ||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 615 - 854
Target Start/End: Original strand, 41169747 - 41169989
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  | || ||||||||    
T  41169747 aattaaaaaatcaaagtttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgta 41169846  T
Q  715 gtagccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||  |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  41169847 gtgacccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcc 41169946  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattca 854  Q
     ||||| |||||  |||||||||    ||||||||||||||||    
T  41169947 cgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 744 - 919
Target Start/End: Original strand, 9830673 - 9830851
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||  |||    
T  9830673 attataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaa 9830772  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9830773 tttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattttagtggtccaccctga 9830851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996561
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tt 732  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||  |||||||| || | |  |||||| ||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcataaaa--tggtgtaggaggctatccgaaaaatt 8996514  T
Q  733 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8996515 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 603 - 779
Target Start/End: Original strand, 11635796 - 11635974
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaa-aaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |     
T  11635796 cccacccgaaaaaattaaataaatcaatgatcataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttcc 11635895  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | || ||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  11635896 gcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 11635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 634 - 775
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108979
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatt 732  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | || |||||||||| |||||  || ||||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  733 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 775  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaa 36108979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 631 - 779
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197417
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccca-ctcgaaa 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||| |   |||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  730 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 197417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 631 - 779
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312254
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccca-ctcgaaa 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||| |   |||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  730 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 312254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 747 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642676
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||| ||   |||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
    ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaattttt 25642676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642677
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| ||| | |||| || ||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  733 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaatttt 25642677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 619 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 25383143 - 25382983
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||| |||||    
T  25383143 aaaaaattaacgactataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtag 25383045  T
Q  719 cccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||  || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25383044 cccatccgaaaaatttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttt 25382983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 765
Target Start/End: Original strand, 8995012 - 8995171
Alignment:
Q  607 cccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaag 706  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    ||     
T  8995012 cccggaaaaattaaaaaattaacgaccataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaa 8995111  T
Q  707 gtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 765  Q
    ||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995112 gtgatgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 8995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108986
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||   |||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaaattttca 36108986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 615 - 765
Target Start/End: Original strand, 17836476 - 17836628
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattata-ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgt 713  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||| || ||| |||    
T  17836476 aattaaaaaattaataattataaggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgt 17836575  T
Q  714 agtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 765  Q
    ||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17836576 agtggcccatccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttacgaga 17836628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 11635828 - 11635977
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||  | ||| |||| ||   |||||    
T  11635828 ataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatt 11635927  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  11635928 taaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttca 11635977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 744 - 890
Target Start/End: Original strand, 38567195 - 38567343
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||   |||    
T  38567195 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaa 38567294  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  38567295 tttaaataattcgattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 38567343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 749 - 892
Target Start/End: Original strand, 17836498 - 17836644
Alignment:
Q  749 aggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaattta 845  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  || |||||||| ||   |||||||    
T  17836498 aggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaattta 17836597  T
Q  846 aataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc 892  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  17836598 aataatttaattataggtctattttacgagacaataaacaatttttc 17836644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 746 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382980
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaat 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||| ||   ||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||| | ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttttca 25382980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 631 - 722
Target Start/End: Original strand, 38567308 - 38567399
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccca 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||    
T  38567308 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccca 38567399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 839 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 34934367 - 34934286
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34934367 aaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 34934286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995188
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa-tt 843  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |  ||||||||||||   |||| || ||  ||||||||||   ||| ||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttgagcaatttttca 8995188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 689 - 779
Target Start/End: Original strand, 43073157 - 43073247
Alignment:
Q  689 gatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  43073157 gatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaatttaaatatttaaattataggtctattttgcaaaactttaaacaatttt 43073247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 32018081 - 32017942
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||| |   || |||| ||||| |    
T  32018081 aaaaaattaacgattataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtgg 32017982  T
Q  719 cccactcgaaa-atttaaataattcaattataggtctatt 757  Q
     ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  32017981 tccattcgaaattttttaacaattcaattataggtctatt 32017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 32018069 - 32018002
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  32018069 attataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatt 32018002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 853 - 919
Target Start/End: Original strand, 38567398 - 38567465
Alignment:
Q  853 caattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38567398 caattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 38567465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996564
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggt---ggtggcccaccttgaaatt 843  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||| ||||   || |||   ||   |||||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatt 8996514  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  8996515 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 8996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 34934368 - 34934316
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34934368 aaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 34934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 756 - 810
Target Start/End: Original strand, 42559031 - 42559085
Alignment:
Q  756 ttttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaat 810  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  42559031 ttttgtgagattttatacaattttgtgtcgattttaggtttcagcttatccaaat 42559085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 629 - 666
Target Start/End: Original strand, 8996524 - 8996561
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8996524 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 915
Target Start/End: Original strand, 19081 - 19399
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19081 ggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgatcataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggtttatccaaattcc 19180  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19181 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 19280  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||   |||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19281 tgatccaaattccaaaaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatag 19380  T
Q  897 ttaattttagtggcccacc 915  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19381 ttaattttagtggcccacc 19399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 11450627 - 11450306
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450627 ggcccacccggaaaaatttaaatatcaacgattatatatctattttgcgagatcttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 11450528  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450527 tgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattattggtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 11450428  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11450427 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagt 11450328  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11450327 taattttagtggcccaccctga 11450306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 610 - 919
Target Start/End: Original strand, 7021862 - 7022174
Alignment:
Q  610 ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtg 709  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7021862 ggaaaaattaaaaaattaatgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtg 7021961  T
Q  710 gtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 809  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7021962 atgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 7022061  T
Q  810 ttcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaattttag 906  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7022062 ttcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttag 7022161  T
Q  907 tggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||    
T  7022162 tggcccaccctga 7022174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 603 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 2660959 - 2660641
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2660959 cccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctg 2660860  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
     || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2660859 caaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttg 2660760  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2660759 atccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagtt 2660660  T
Q  899 aattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2660659 aattttagtggcccaccct 2660641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 608 - 919
Target Start/End: Original strand, 15469132 - 15469446
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  15469132 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaag 15469231  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcca 807  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15469232 tggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atccc 15469330  T
Q  808 aattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattt 903  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15469331 aattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattt 15469430  T
Q  904 tagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||    
T  15469431 tagtggcccaccctga 15469446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 609 - 917
Target Start/End: Original strand, 34127541 - 34127853
Alignment:
Q  609 cggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggt 708  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  34127541 cggaaaaattaaaaaatcaactattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagt 34127640  T
Q  709 ggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaa 808  Q
    |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34127641 ggtgtaatgccccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaa 34127740  T
Q  809 attcctgcaaattggtg--gtggcccaccttg-aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatttt 904  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  34127741 attcctgcaaattggtgtagtggcccacccggaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaatttt 34127840  T
Q  905 agtggcccaccct 917  Q
    |||||| ||||||    
T  34127841 agtggcgcaccct 34127853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 12698529 - 12698851
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaatt-aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698529 ggccgacccggaaaaatttaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 12698628  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698629 ctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattat-ggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcgcttttaggtttcgg 12698727  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  12698728 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 12698827  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  12698828 gttaattttagtggtccaccctga 12698851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 24130361 - 24130045
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24130361 gcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattata-----attttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 24130267  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24130266 gcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagtttttatacgattttatgccggttttaggtttcggtt 24130167  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24130166 gatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagt 24130067  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  24130066 taattttagtggtccaccctga 24130045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 610 - 917
Target Start/End: Original strand, 26468493 - 26468804
Alignment:
Q  610 ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtg 709  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||    
T  26468493 ggaaaaattaaaaaatcaactattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtg 26468592  T
Q  710 gtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaa 809  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26468593 gtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaa 26468692  T
Q  810 ttcctgcaaattggtg--gtgg-cccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatttta 905  Q
    |||| |||||||||||  |||| |  |||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26468693 ttcccgcaaattggtgtagtggacaaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 26468792  T
Q  906 gtggcccaccct 917  Q
    |||| |||||||    
T  26468793 gtggtccaccct 26468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 34023665 - 34023343
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34023665 ggcccacctgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttc 34023566  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34023565 tgcaaagtggtgtagtgtcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 34023466  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||  ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34023465 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgaaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 34023366  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34023365 ttaattttagtggcccaccctga 34023343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 9079177 - 9078857
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9079177 gcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcct 9079078  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt 801  Q
    | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9079077 gcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaga-tttaaacaattttacgtcggttttaggtttcggtt 9078979  T
Q  802 gatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagt 897  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  9078978 gatccaaatttccgcaaattggtgtagtggaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagt 9078879  T
Q  898 taattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  9078878 taattttagtagtccaccctga 9078857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 8560461 - 8560784
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8560461 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaaattgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcc 8560560  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8560561 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggt 8560660  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatg-tctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||  |||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||||| |||    
T  8560661 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataattcaattataggatctaatttgtaagactttaaacaatttttcaata 8560760  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8560761 gttaattttagtggcccaccctga 8560784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 24635593 - 24635271
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24635593 ggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcc 24635494  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  24635493 tgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggt 24635394  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24635393 tgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 24635294  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24635293 ttaattttaatggcccaccctga 24635271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 601 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 16461532 - 16461220
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461532 ggcccacccggaaatattaaaaaatcaacgattataagcctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 16461433  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtc-ggttttaggtttcgg 799  Q
    |  || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16461432 ttcaaagttgtgtagtggtccactcgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatataattttatgtcgggttttaggtttcag 16461333  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| | ||   |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  16461332 ttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtggcctatccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 16461233  T
Q  896 gttaattttagtg 908  Q
    |||||||||||||    
T  16461232 gttaattttagtg 16461220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 629 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 23259050 - 23258755
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| | |||  ||||    
T  23259050 caattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaa 23258951  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||      
T  23258950 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgta 23258851  T
Q  826 gtgg-cccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||| || |||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23258850 gtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 23258755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 615 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 23259177 - 23258923
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  || ||||    
T  23259177 aattaaaaaatcaacaattataggtccaacttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgta 23259078  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  23259077 gtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttct 23258978  T
Q  815 gcaaattggtg--gtgg-cccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtcta 866  Q
    |||||||||||  |||| || |||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23258977 gcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 23258923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 615 - 891
Target Start/End: Original strand, 12996333 - 12996613
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||   || ||||||||    
T  12996333 aattaaaaaatcaatgataatagatatattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgta 12996432  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataa-ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattc 812  Q
    ||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12996433 gtgacccacccgaaaaatttaaataaattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattc 12996532  T
Q  813 ctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaattttt 891  Q
    | ||||| |||||  |||| ||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  12996533 ccgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaattttt 12996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 600 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 14883287 - 14883067
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaa-tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttg-tgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  14883287 tggcccacccagaaaaattaaaaaaatcaacgattataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaat 14883188  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttc 797  Q
    ||| | || |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  14883187 tcccgcaaagtggtgtagtggcccaccaaaaaatttaaataattcatttttaggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttc 14883088  T
Q  798 ggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  14883087 ggttgatccaaattcccgcaa 14883067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 603 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 13405484 - 13405307
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||      
T  13405484 cccacccgaaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattccca 13405385  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | | |||  ||| | |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13405384 tgaagtgaagtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 13405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 744 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 13405456 - 13405387
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13405456 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcc 13405387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 754
Target Start/End: Original strand, 10290490 - 10290647
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttt-tggttgatccaaa 696  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||   |||||||||||    
T  10290490 catggcccacccagagaaattaaaaaattaacgatcataggtctactttgcgagattttatacaa-tttgtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaa 10290588  T
Q  697 ttcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtct 754  Q
    || ||| ||  ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290589 tttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 744 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 14883255 - 14883142
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaatttta-tgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaa 840  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||   ||    
T  14883255 attataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccaccaaaaa 14883156  T
Q  841 atttaaataattca 854  Q
    ||||||||||||||    
T  14883155 atttaaataattca 14883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Original strand, 7536506 - 7536671
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||||| ||||||  | || ||||||||    
T  7536506 aatttaaaaattaacgattatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgta 7536605  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7536606 atgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 7536671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 747 - 865
Target Start/End: Original strand, 10290526 - 10290647
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttc-ggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaat 842  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||   ||||    
T  10290526 ataggtctactttgcgagattttatacaa-tttgtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaat 10290624  T
Q  843 ttaaataattcaattatatgtct 865  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  10290625 ttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 744 - 893
Target Start/End: Original strand, 7536522 - 7536674
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||   || ||||||   |||    
T  7536522 attatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaa 7536621  T
Q  842 -tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  7536622 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttca 7536674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 635 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 14883137 - 14882993
Alignment:
Q  635 taggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-ttt 733  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||   |||| |||||| |||    
T  14883137 taggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgcaaga-ggtgtagtgatccacccgaaaaattt 14883039  T
Q  734 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  14883038 aaataatttaattataggtctattttgctaggctttaaacaatttt 14882993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 641 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 1398188 - 1398065
Alignment:
Q  641 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataa 739  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||   |||| |||||||  |  |||| | | |||||||||||||    
T  1398188 tattttacgagattttatccaattttgtgttggtttta-gatttagttgatctaaattttcgtaaagtggtgttttgtcccatttgaaaaatttaaataa 1398090  T
Q  740 ttcaattataggtctattttgcgag 764  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  1398089 tttaattataggtctattttgcgag 1398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 685 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 31969031 - 31968955
Alignment:
Q  685 ggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 760  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31969031 ggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttg 31968955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 666
Target Start/End: Original strand, 18234949 - 18235013
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18234949 gcccatccgaaaaaattaaaaaattaataattataggtatattttgcgagattttaaacaatttt 18235013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 742 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 2399400 - 2399362
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2399400 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttta 2399362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 620 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2399409 - 2399363
Alignment:
Q  620 aaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2399409 aaaaatgaacaattataggtctattctgcgagattttaaacaatttt 2399363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 839 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 13405358 - 13405304
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13405358 aaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 13405304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 743 - 780
Target Start/End: Original strand, 18234977 - 18235014
Alignment:
Q  743 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18234977 aattataggtatattttgcgagattttaaacaatttta 18235014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 604 - 917
Target Start/End: Original strand, 45350089 - 45350406
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45350089 ccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgc 45350188  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45350189 aaagtggtgtaatggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttga 45350288  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45350289 ttcaaattcccgcaaattggtgtagtgtcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 45350388  T
Q  900 attttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45350389 attttagtggcccaccct 45350406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 22723899 - 22723579
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22723899 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctactttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 22723800  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22723799 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggt 22723700  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22723699 tgatccaatttcccgcaaattggtgtagtggcccacccgcaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatag 22723600  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  22723599 ttaattttagtagtccaccct 22723579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 604 - 917
Target Start/End: Original strand, 46027718 - 46028035
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46027718 ccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgc 46027817  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  46027818 aaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttagatttaggttga 46027917  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  46027918 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtataatttgcgagactttaaacgatttttcaatagtta 46028017  T
Q  900 attttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46028018 attttagtggcccaccct 46028035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 17166901 - 17167222
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17166901 ggcccacccagaaaaattaaaaaatcaacaattatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 17167000  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    || || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167001 tgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 17167100  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  || |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |    
T  17167101 ttgatcccaattcccgcaaattgatgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaa 17167200  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17167201 gttaattttagtggcccaccct 17167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 44468144 - 44467827
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44468144 ggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcc 44468045  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  44468044 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcaat 44467945  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  44467944 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 44467845  T
Q  897 ttaattttagtggcccac 914  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44467844 ttaattttagtggcccac 44467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 26873738 - 26874060
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26873738 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 26873837  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  26873838 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaggttttatacaattttatgtcagttttagatttcgat 26873937  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26873938 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatag 26874037  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26874038 ttaattttagtggcccaccctga 26874060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 43859126 - 43859448
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43859126 ggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtcgaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 43859225  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43859226 tgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggt 43859325  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  43859326 tgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 43859425  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43859426 ttaattttagtggcccaccctga 43859448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 9624030 - 9624351
Alignment:
Q  601 ggcccacccgg-aagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9624030 ggcccacccgggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattc 9624129  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9624130 ctacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgg 9624229  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca-ta 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9624230 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcacta 9624329  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9624330 gttaattttagtggcccaccct 9624351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 622 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 31065725 - 31065424
Alignment:
Q  622 aaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccc 721  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  31065725 aaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcc 31065626  T
Q  722 actcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaatt 821  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31065625 acccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatt 31065526  T
Q  822 ggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||  |||||||| ||   |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31065525 ggtgcagtggcccacccgaaaaatttaaataaatcaattacaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccactct 31065426  T
Q  918 ga 919  Q
    ||    
T  31065425 ga 31065424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 36358430 - 36358111
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36358430 ccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgacattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgc 36358331  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36358330 aaagtggtgtagtggtccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttga 36358231  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36358230 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagtta 36358131  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36358130 attttagtggcccaccctga 36358111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 44724186 - 44723864
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44724186 ggcccacccggaaaaattaaaaaaccaactattataggtttattttgagagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcc 44724087  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724086 tgcaaagtggtgtagaggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 44723987  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44723986 tgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccatccgaagaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatag 44723887  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  44723886 ttaattttagtagcccaccctga 44723864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 601 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 36675610 - 36675294
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675610 ggcccatccgaaaaaattaaaaaattaatgattatagatctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 36675511  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36675510 tgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggt 36675411  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36675410 tgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaattttttaatag 36675311  T
Q  897 ttaattttagtggccca 913  Q
    |||||||||||||||||    
T  36675310 ttaattttagtggccca 36675294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 44142797 - 44143118
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44142797 ggcccatccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcc 44142896  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  44142897 tgcaaagtggtgtagtggccacctggaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagattttgat 44142995  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44142996 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 44143095  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44143096 ttaattttagtggcccaccctga 44143118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 637 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 23469483 - 23469199
Alignment:
Q  637 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaa 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  23469483 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccgaaaatttaaa 23469384  T
Q  737 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||     
T  23469383 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccat 23469284  T
Q  835 ct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23469283 ctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 23469199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 600 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 29075309 - 29075000
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29075309 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 29075210  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
     || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29075209 ttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgg 29075110  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtggtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagtt 898  Q
    ||||||||||||  ||     | |||||  ||  ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  29075109 ttgatccaaattggtg-----tagtggt--ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaattttttaatagtt 29075017  T
Q  899 aattttagtggcccacc 915  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29075016 aattttagtggtccacc 29075000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 641 - 919
Target Start/End: Original strand, 40055666 - 40055948
Alignment:
Q  641 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataat 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  40055666 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 40055765  T
Q  741 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-cctt 837  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||      
T  40055766 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaa 40055865  T
Q  838 gaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40055866 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcgcaccctga 40055948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 603 - 916
Target Start/End: Original strand, 39976358 - 39976675
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39976358 cccacccgaaaaaaataaaaaatcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattccta 39976457  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttg 802  Q
     || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||    
T  39976458 caaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattg 39976557  T
Q  803 atccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtt 898  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39976558 atccaaatttctgtaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagtt 39976657  T
Q  899 aattttagtggcccaccc 916  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39976658 aattttagtggcccaccc 39976675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 42242053 - 42241732
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaa-tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42242053 ggcccaccccgaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtttaatttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 42241954  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42241953 ctgcaaagtggtgtagtgactcacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgg 42241854  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || | ||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||    
T  42241853 ttgatccaaattcccggaaattggtgtagtcgtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttttcaata 42241754  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42241753 gttaattttagtggcctaccct 42241732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 615 - 917
Target Start/End: Original strand, 31428786 - 31429092
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  31428786 aattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgta 31428885  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||     
T  31428886 gtggtccacccgaaaatttaaataatttaattatagatctattttgcgagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattccc 31428985  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    | |||||||||  |||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  31428986 gtaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatgtaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttcagtagc 31429085  T
Q  911 ccaccct 917  Q
    |||||||    
T  31429086 ccaccct 31429092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 598 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 16834403 - 16834080
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16834403 catggcccatccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtttattttgtaaaattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaat 16834304  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtc--tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtt 795  Q
    | ||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16834303 ttctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctatattatgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtt 16834204  T
Q  796 tcggttgatccaaattcctgcaaatt--ggtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc 892  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||| |||| ||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16834203 tcgattgatccaaattctcacaaattggggtagtgtcccacccaaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttc 16834104  T
Q  893 -atagttaattttagtggcccacc 915  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16834103 aatagttaattttagtggcccacc 16834080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 605 - 917
Target Start/End: Original strand, 41367699 - 41368014
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  41367699 cacccggaaaaattaaaaaatcaata-ttataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctaca 41367797  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgat 804  Q
    | |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41367798 aagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcagttataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgat 41367897  T
Q  805 ccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagttaa 900  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41367898 ccaaatttccgcaaattggtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaa 41367997  T
Q  901 ttttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||    
T  41367998 ttttagtggcccaccct 41368014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 744 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 31932004 - 31931827
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   ||    
T  31932004 attataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 31931905  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31931904 atttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 31931827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 744 - 917
Target Start/End: Original strand, 8461764 - 8461941
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||   ||    
T  8461764 attataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 8461863  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8461864 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 8461941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 23562773 - 23562592
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||    
T  23562773 catggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtc-gaattaagttttgattgatccaaat 23562675  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | | | || |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23562674 ttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 23562592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 601 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18104441 - 18104295
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18104441 ggcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcc 18104343  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaatta 747  Q
     | ||  ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18104342 cgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaatta 18104295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 629 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 23469378 - 23469227
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagccca-ctcga 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | ||  ||||||||| ||||| ||  |    
T  23469378 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctgaa 23469279  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23469278 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttt 23469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 621 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 31932014 - 31931855
Alignment:
Q  621 aaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcc 720  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |    
T  31932014 aaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtc 31931915  T
Q  721 cactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31931914 cacccaaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttt 31931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 629 - 779
Target Start/End: Original strand, 40055767 - 40055918
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactc-ga 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||||| ||| |||||| |  |    
T  40055767 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaaa 40055866  T
Q  728 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40055867 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40055918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 603 - 779
Target Start/End: Original strand, 8461736 - 8461913
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  8461736 cccacctggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccg 8461835  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     ||  ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||||    
T  8461836 caaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttt 8461913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828781
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaattt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcgaaaattt 46828827  T
Q  734 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  46828826 aaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttt 46828781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 744 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 18104411 - 18104243
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaa 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||    
T  18104411 attataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaa 18104313  T
Q  841 atttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18104312 atttaaataattcaattaaagatctaatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattttagtgg 18104243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 747 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828761
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaattt 844  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||    ||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcgaaaattt 46828827  T
Q  845 aaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
    |||||| || ||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  46828826 aaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 46828761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 635 - 779
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174361
Alignment:
Q  635 taggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-ttt 733  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    || |||||||||| | |||| |||||| |||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  734 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 25174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 22499868 - 22499723
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaattt 844  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||       
T  22499868 ataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa--- 22499772  T
Q  845 aaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||| |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22499771 aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttttca 22499723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 602 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 29502254 - 29502076
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||     
T  29502254 gcccacccgaaaaatttaaaaaattaacgataataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattccc 29502155  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | || |||||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  29502154 gcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttt 29502076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 609 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 16649711 - 16649541
Alignment:
Q  609 cggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggt 708  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||| |||| || ||||||||||||| | || ||    
T  16649711 cggaaaaattaaaaaattaatgatcttaggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagt 16649612  T
Q  709 ggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||  |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16649611 ggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 16649541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 609 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 17624072 - 17623902
Alignment:
Q  609 cggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggt 708  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||| |||| || ||||||||||||| | || ||    
T  17624072 cggaaaaattaaaaaattaatgatcttaggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagt 17623973  T
Q  709 ggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||  |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17623972 ggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 17623902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 748 - 893
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174364
Alignment:
Q  748 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaattt 844  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  |||| ||| ||   ||||||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  845 aaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttca 25174364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 748 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 16649685 - 16649538
Alignment:
Q  748 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaattta 845  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  | ||  ||||   |||||||    
T  16649685 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaattta 16649586  T
Q  846 aataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16649585 aataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttca 16649538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 748 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 17624046 - 17623899
Alignment:
Q  748 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaattta 845  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  | ||  ||||   |||||||    
T  17624046 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaattta 17623947  T
Q  846 aataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  17623946 aataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttca 17623899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 605 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 22499897 - 22499726
Alignment:
Q  605 cacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgta 704  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||||| | |    
T  22499897 cacccggaaaatttaaaaaattaacgatcataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgca 22499798  T
Q  705 aggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    | |||||||||| ||||||   ||||   ||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22499797 aagtggtgtagtggcccacctaaaaa---aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttt 22499726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 662 - 779
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663128
Alignment:
Q  662 attttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 760  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||    || |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  761 cgagattttatacaatttt 779  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttt 29663128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Original strand, 30781060 - 30781224
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||| || |||| |||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||| | |||| |||||| |    
T  30781060 aattaaaaaattaacgatcatagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgca 30781158  T
Q  715 gtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     | | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  30781159 atggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 30781224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 744 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 23562740 - 23562564
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||| | |||||||||||| | ||||| |||||  || | |||||   |||    
T  23562740 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaagtttt-gattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 23562642  T
Q  842 -tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
     |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23562641 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 23562564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 751 - 893
Target Start/End: Original strand, 28754878 - 28755022
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaa 847  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| ||   ||| |||||    
T  28754878 gtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaa 28754976  T
Q  848 taattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | || |||| ||||||||||||    
T  28754977 taattcaattataagtctattttccaagtctttaaacaatttttca 28755022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 29502222 - 29502073
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||   |||||    
T  29502222 ataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 29502123  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||| ||| ||||||||    
T  29502122 taaataattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttttca 29502073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 750 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566606
Alignment:
Q  750 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 620 - 759
Target Start/End: Original strand, 28754860 - 28754999
Alignment:
Q  620 aaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagc 719  Q
    |||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  28754860 aaaaattaacgatcatatgtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggc 28754958  T
Q  720 ccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 759  Q
    |||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28754959 ccacccaaaaaaattaaataattcaattataagtctatttt 28754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 775 - 916
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663155
Alignment:
Q  775 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaattta 871  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  872 cgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccc 916  Q
    | ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccc 29663155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 779
Target Start/End: Original strand, 9013849 - 9014029
Alignment:
Q  599 atggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 698  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  9013849 atggccaacccagaaaaattaaaaaattaacaatcataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatt 9013948  T
Q  699 cctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     |   ||  || |||| | |||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  9013949 tc-ccaaaatgttgtaatggcccatccgaaaaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 637 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566606
Alignment:
Q  637 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatt 698  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 779
Target Start/End: Original strand, 6961194 - 6961246
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6961194 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 746 - 810
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883413
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaat 810  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaat 40883413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 839 - 890
Target Start/End: Original strand, 6961195 - 6961246
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6961195 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 650 - 760
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014587
Alignment:
Q  650 agattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattat 748  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||   | ||  ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  749 aggtctattttg 760  Q
    ||||||||||||    
T  9014576 aggtctattttg 9014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 4248935 - 4248865
Alignment:
Q  707 gtggtgtagtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaat 776  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4248935 gtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 638 - 779
Target Start/End: Original strand, 8727794 - 8727936
Alignment:
Q  638 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaa 736  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |  || ||||| |||| |||||  |  ||||||||||    
T  8727794 gtctattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaa 8727893  T
Q  737 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     ||||| ||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  8727894 caattcgattgtaggtctattttacgaaactttaaacaatttt 8727936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 30781079 - 30781227
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaa-tt 843  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| | | ||| |||||   ||| |||||   ||| ||    
T  30781079 atagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatt 30781177  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  30781178 taaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttca 30781227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 744 - 797
Target Start/End: Original strand, 6961112 - 6961165
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttc 797  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6961112 attatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttc 6961165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 742 - 893
Target Start/End: Original strand, 9013879 - 9014032
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaat-tggtggtggccca-ccttga 839  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| |   |||| | ||  ||||||| ||   |    
T  9013879 caatcataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcccaaaatgttgtaatggcccatccgaaa 9013978  T
Q  840 aatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9013979 aatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttca 9014032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 678
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883394
Alignment:
Q  633 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggtttta 678  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggtttta 40883394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 683
Target Start/End: Original strand, 6961112 - 6961164
Alignment:
Q  631 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttt 683  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6961112 attatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggttt 6961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 763 - 811
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014524
Alignment:
Q  763 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaatt 9014524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 727 - 779
Target Start/End: Original strand, 9021586 - 9021638
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9021586 aaaatttatataatttaattatagttctattttgcgagactttaaacaatttt 9021638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 4249083 - 4249040
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttc 797  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4249083 tattttgcaagattttatataattttatgccggttttaggtttc 4249040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 25304000 - 25303949
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  25304000 aattaaaaaattaacaattataggtctattatgtgagattttaaacaatttt 25303949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 771 - 893
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021641
Alignment:
Q  771 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaa-ttg-gtggtggcccaccttgaaa-tttaaataattcaattatatgtctaa 867  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||   ||| |||| |||||| |||||||  ||||     
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  868 tttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttttca 9021641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 31581870 - 31581551
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581870 ccaccccgaaaaattaaaaaaacaacgattataggtctattttgctagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 31581771  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31581770 aaagtagtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttga 31581671  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||| || ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31581670 tccaaattcccgcaaattggtgtactggctcatccgaaaaatttaaataactcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 31581571  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31581570 attttagtggcccaccctga 31581551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 11651089 - 11650767
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11651089 ggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattca 11650990  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11650989 tgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggt 11650890  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11650889 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatag 11650790  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  11650789 ttaattttagtggtccaccctga 11650767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 13613215 - 13612895
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13613215 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcc 13613116  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13613115 tacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggt 13613016  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca-tag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13613015 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactag 13612916  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13612915 ttaattttagtggcccaccct 13612895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 44745713 - 44745391
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44745713 ggcccatccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 44745614  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44745613 tgcaaagtggtgcagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 44745514  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccac-cttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |   ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44745513 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccactcaaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 44745414  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    || |||||||||| ||| |||||    
T  44745413 tttattttagtggtccatcctga 44745391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 31664286 - 31663968
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31664286 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggt----tttgcgagattttatgcaattttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcc 31664191  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31664190 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcggt 31664091  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31664090 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 31663991  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31663990 ttaattttagtggcccaccctga 31663968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 13233265 - 13233585
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233265 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 13233364  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233365 tgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 13233464  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||     
T  13233465 tgatccaaattcccgcaaatcggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaataa 13233564  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13233565 ttaattttagtggcccaccct 13233585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 18491222 - 18491542
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18491222 ggcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgtaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 18491321  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18491322 tgcaaagtggtgtagtgccccacccgaaaatttaaataatttaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 18491421  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18491422 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatgtttcaatag 18491521  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18491522 ttaattttagtgacccaccct 18491542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Original strand, 6755864 - 6756183
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6755864 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcc 6755963  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6755964 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatactattttatgtcggttttatgtttcggt 6756063  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcatagt 897  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  6756064 tgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccacccgaaaaatttaaatgattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaattttttaattgt 6756163  T
Q  898 taattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6756164 taattttagtggcccaccct 6756183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 600 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 12700691 - 12700369
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12700691 tggcccacccggaa-aattgaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattc 12700593  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12700592 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagttaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcgg 12700493  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||  || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  12700492 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 12700393  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12700392 gttaattttagtggcccaccctga 12700369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 38141681 - 38141358
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaa-tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38141681 ggcccacccggaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcaattttatgtttttgttgatccaaattc 38141582  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38141581 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 38141482  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccc-accttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||    
T  38141481 ttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgatactttaaataatttttcaata 38141382  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  38141381 gttaattttagtggcctaccctga 38141358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 604 - 917
Target Start/End: Original strand, 44134532 - 44134848
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44134532 ccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatttt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgc 44134630  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44134631 aaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttga 44134730  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccacct-tgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44134731 tccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 44134830  T
Q  900 attttagtggcccaccct 917  Q
    |||||| |||||||||||    
T  44134831 attttaatggcccaccct 44134848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 604 - 919
Target Start/End: Original strand, 16925144 - 16925463
Alignment:
Q  604 ccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgt 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16925144 ccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagactttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctac 16925243  T
Q  704 aaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttga 803  Q
    || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16925244 aaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttga 16925343  T
Q  804 tccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagtta 899  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||    
T  16925344 tccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 16925443  T
Q  900 attttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16925444 attttagtggcccaccctga 16925463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 36584459 - 36584780
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36584459 ggcccacccggaaaaat-aaaaaatcaataattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcc 36584557  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  36584558 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttagt 36584657  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  ||||| || ||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36584658 tgatccaaattcccgctaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaatatttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 36584757  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  36584758 ttaattttagtggcctaccctga 36584780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 615 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 36955119 - 36954817
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  36955119 aattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgta 36955020  T
Q  715 gtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcct 814  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  36955019 gtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatcccc 36954920  T
Q  815 gcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggc 910  Q
    |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36954919 gcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaatattagtggc 36954820  T
Q  911 cca 913  Q
    |||    
T  36954819 cca 36954817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 601 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 40228554 - 40228233
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaatt-aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40228554 ggcccacccggaaaaatttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattc 40228455  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40228454 ctgcaaagtgttgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctatttggcgagattttatacgattttatgtcagttttaggtttcgg 40228355  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||  ||||||||  || |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  40228354 ttgatccaaattctcgcaaattgttgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagtatttaaacaatttttcaata 40228255  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  40228254 gttaattttagtggtccaccct 40228233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 608 - 919
Target Start/End: Original strand, 43564460 - 43564775
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  43564460 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaag 43564559  T
Q  708 tggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcca 807  Q
    || ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43564560 tgttgtagtgccccatccaaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcca 43564659  T
Q  808 aattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattt 903  Q
    |||||| |||||||||||  ||||  || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  43564660 aattcccgcaaattggtgtagtggaacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattt 43564759  T
Q  904 tagtggcccaccctga 919  Q
    |||||| |||||||||    
T  43564760 tagtggtccaccctga 43564775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 19653767 - 19653446
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19653767 ggcccacaccgaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 19653668  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |||||  | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19653667 tgtaaaatagtgtaatggcccacttgaaaatttaaataattcaattataggtcta-tttgtgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggt 19653569  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19653568 tgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataactcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatag 19653469  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  19653468 ttaattttagtggtccaccctga 19653446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 615 - 913
Target Start/End: Original strand, 41832425 - 41832728
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41832425 aattaaaaaattaacgattatatgtctattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgta 41832524  T
Q  715 gtagcccactcgaaaattt-aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    || |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41832525 gtggcccacccaaaacttttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattct 41832624  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
     |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41832625 cgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 41832724  T
Q  910 ccca 913  Q
    ||||    
T  41832725 ccca 41832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 601 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2655033 - 2654717
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2655033 ggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctagtttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcc 2654934  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2654933 tgcaaagtggtgtagtgacccatccgaaaatttaaatagttcaattataggtctattttatgagattttatacaattttacgtcggttttagatttcggt 2654834  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||||| |||| | |||||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2654833 tgatcccaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag 2654734  T
Q  897 ttaattttagtggccca 913  Q
    |||||||||||||||||    
T  2654733 ttaattttagtggccca 2654717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 619 - 919
Target Start/End: Original strand, 52581509 - 52581814
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  52581509 aaaaaatcaacgattataggtctattttgcaatattttatggagttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcg 52581608  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||    
T  52581609 cccatccaaaaatttaaataattcaattatatgtttattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaa 52581708  T
Q  819 attggtg--gtgg-ccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggccca 913  Q
    |||||||  |||| |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52581709 attggtgtagtggtcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 52581808  T
Q  914 ccctga 919  Q
    ||||||    
T  52581809 ccctga 52581814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 601 - 919
Target Start/End: Original strand, 22647146 - 22647468
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctatttt-gcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  22647146 ggcccatccagaaaaataaaaaaatcaacgactataggtttttttttgcgagattttatgcaattttgtgtcg-ttttatatttttgttgatccaaattc 22647244  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
     || || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22647245 atgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcgg 22647344  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaat-ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaa-tttttcata 895  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||     
T  22647345 ttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaattttttaatg 22647444  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  22647445 gttaatttcagtggcccaccctga 22647468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 601 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 44817672 - 44817449
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44817672 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttc 44817573  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || ||||| |||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44817572 tgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaat-attcaattataggtctattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgat 44817474  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg 825  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44817473 tgatccaaattcctgcaaattggtg 44817449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 600 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 54795853 - 54795532
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  54795853 tggcccatccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattc 54795754  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcg 798  Q
    | | || |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54795753 ccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcg 54795655  T
Q  799 gttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-at 894  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||  || | ||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |     
T  54795654 gttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaac 54795555  T
Q  895 agttaattttagtggcccaccct 917  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  54795554 ggttaattttagtggcccaccct 54795532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 608 - 913
Target Start/End: Original strand, 50767076 - 50767385
Alignment:
Q  608 ccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaagg 707  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | || |    
T  50767076 ccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaag 50767175  T
Q  708 tggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcc 806  Q
    ||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50767176 tggtgtagtggcccacccaaaaaatttaattaattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattc 50767274  T
Q  807 aaattcctgcaaattggtg--gtggcccacc-ttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaatt 902  Q
    ||||||| ||||| |||||  || | |||||    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||    
T  50767275 aaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccaaaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaatt 50767374  T
Q  903 ttagtggccca 913  Q
    |||||||||||    
T  50767375 ttagtggccca 50767385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 610 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 10096570 - 10096285
Alignment:
Q  610 ggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtg 709  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | || |||    
T  10096570 ggaaaaattaaaaaatcaacgattataggttcattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtg 10096471  T
Q  710 gtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaa 808  Q
    ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10096470 gtgtagt-gtccattcaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaa 10096372  T
Q  809 attcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||   || |||| ||||||||||||    
T  10096371 attcctgcaaaatggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttctaaggctttaaacaatttttca 10096285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 602 - 917
Target Start/End: Original strand, 27270390 - 27270708
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcct 701  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  27270390 gcccacccggaa-aattaaaaaatcaatgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattccc 27270488  T
Q  702 gtaaggtggtgtagtagcccactc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    |||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27270489 gtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatagatctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggt 27270587  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atag 896  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  || | ||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |  |    
T  27270588 tgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacgg 27270687  T
Q  897 ttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  27270688 ttaattttagtgatccaccct 27270708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 598 - 776
Target Start/End: Original strand, 45669992 - 45670170
Alignment:
Q  598 catggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 697  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45669992 catgtcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaat 45670091  T
Q  698 tcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaat 776  Q
    ||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45670092 tcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 615 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 4632814 - 4632509
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  4632814 aattaaaaaaacaacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgta 4632715  T
Q  715 gtagcccactcgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  4632714 gtggctcacgcgaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattatatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttc 4632615  T
Q  814 tgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtgg 909  Q
     || || |||||  |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  4632614 cgccaagtggtgtagtggaccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 4632515  T
Q  910 cccacc 915  Q
    ||||||    
T  4632514 cccacc 4632509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857826
Alignment:
Q  634 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatt 732  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  733 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13857826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 745 - 917
Target Start/End: Original strand, 51001542 - 51001717
Alignment:
Q  745 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaa 841  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||| ||   |||    
T  51001542 ttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatcc-aattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaa 51001640  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccct 917  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51001641 tttaaataattcaattataggtctaatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 51001717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 744 - 876
Target Start/End: Original strand, 45670025 - 45670159
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||   |||    
T  45670025 attataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 45670124  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgaga 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45670125 tttaaataattcaattatatgtctattttgcgaga 45670159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 635 - 779
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869356
Alignment:
Q  635 taggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaa-ttt 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| || ||| || ||| | |||| |||||| |||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  734 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13869356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 36801970 - 36801805
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgta 714  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||  | |||||    
T  36801970 aattaaaaaattaacgatcataagtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgta 36801871  T
Q  715 gtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  36801870 gtggcccacccgaaaaatttatataattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttt 36801805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 639 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638702
Alignment:
Q  639 tctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaata 738  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||  | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaattttaata 7638743  T
Q  739 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7638742 attccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7638702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 601 - 760
Target Start/End: Original strand, 51001511 - 51001670
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  51001511 ggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgtttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatcc-aattcc 51001609  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 760  Q
     | ||  ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51001610 cgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 51001670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 747 - 893
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857829
Alignment:
Q  747 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatt 843  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||| ||   |||||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  844 taaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttca 13857829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 601 - 763
Target Start/End: Original strand, 18707712 - 18707879
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatt----ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaa 696  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    ||||||||||   | |||| || | |||||||    
T  18707712 ggcccacccggcaaaattaaaaaattaacgattataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaa 18707811  T
Q  697 ttcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 763  Q
    || | | || |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18707812 tttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 846 - 919
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670242
Alignment:
Q  846 aataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccctga 919  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 45670242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 748 - 893
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869359
Alignment:
Q  748 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaattt 844  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||  |||| ||| ||   ||||||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  845 aaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttca 13869359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 752 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638699
Alignment:
Q  752 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaatttaaata 849  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||  ||||||||||   |||||| ||||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaattttaata 7638743  T
Q  850 attcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||| |||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7638742 attccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttttca 7638699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 601 - 760
Target Start/End: Original strand, 18735215 - 18735379
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgc----aattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaa 696  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||   | |||| |||| ||| |||    
T  18735215 ggcctacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaa 18735314  T
Q  697 ttcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 760  Q
    || |   || |||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18735315 tttccacaaagtggtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttg 18735379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 751 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 36801947 - 36801802
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaa 847  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| | |||  |||||||| ||   ||||||| |    
T  36801947 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttata 36801848  T
Q  848 taattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||||||| ||||||||||||    
T  36801847 taattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttttca 36801802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 629 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 44817532 - 44817436
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactc 725  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  44817532 caattataggtctattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccactc 44817436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 601 - 763
Target Start/End: Original strand, 18668964 - 18669131
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgc----aattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaa 696  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||   | |||| |||| ||| |||    
T  18668964 ggcccacctggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaa 18669063  T
Q  697 ttcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 763  Q
    || |   || || ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18669064 tttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18669131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 643 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653080
Alignment:
Q  643 ttttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaataatt 741  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| || ||| ||||||| || |  ||  || |||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
     |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaatttt 26653080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 780
Target Start/End: Original strand, 133388 - 133565
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctg 702  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |  || || ||||||  |    
T  133388 cccacctggaaaaattaaaaaattagcgattataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcg 133487  T
Q  703 taaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 780  Q
     || ||||| |||| ||||||   |||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  133488 caaagtggtttagtggcccacctaaaaaatttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttta 133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 639 - 779
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394037
Alignment:
Q  639 tctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcg-aaaatttaaat 737  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||| |   || |||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  738 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    || ||||||||| |||||| ||| |||| | || ||||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttt 10394037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 727 - 779
Target Start/End: Original strand, 7776931 - 7776983
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7776931 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 9046190 - 9046131
Alignment:
Q  615 aattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggt 674  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9046190 aattaaaaaattaacgattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggt 9046131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 893
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394040
Alignment:
Q  752 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaat 848  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| |  |||| |||||  |||||||| ||   ||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  849 aattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    || ||||||||| |||||  ||  |||||| | ||||||||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttttca 10394040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 826 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 9046104 - 9046037
Alignment:
Q  826 gtggcccaccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  9046104 gtggcccaccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttca 9046037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 839 - 893
Target Start/End: Original strand, 7776932 - 7776986
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7776932 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttca 7776986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 779
Target Start/End: Original strand, 15632193 - 15632347
Alignment:
Q  627 aacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccac-tc 725  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||  ||||||   | |||||||||||||| ||||||  ||  ||||| |     
T  15632193 aacaattgtaggtctattttacgagattttaaacaattttgcgacggttttagtttttggcaaaaccaaattcctgtaaagtggtgatgtgccccacttt 15632292  T
Q  726 gaaaatttaaataattcaatt-ataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  15632293 gaaaaattaaaaaattaaattcataggtctattttacgaggtgttaaacaatttt 15632347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 744 - 890
Target Start/End: Original strand, 133416 - 133564
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  || || ||||||  ||||| |||  | |||||||||||  |||    
T  133416 attataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaaa 133515  T
Q  842 tttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
     || ||||||||||| |||  |||| |||  |||||||| || ||||||    
T  133516 atttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttt 133564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 9046174 - 9046131
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggt 787  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9046174 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggt 9046131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 813
Target Start/End: Original strand, 5734132 - 5734194
Alignment:
Q  751 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 813  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5734132 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcc 5734194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 839 - 893
Target Start/End: Original strand, 5734199 - 5734253
Alignment:
Q  839 aaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 893  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  5734199 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttca 5734253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 764
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734235
Alignment:
Q  727 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5734198 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 5734235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 777
Target Start/End: Original strand, 18735245 - 18735278
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18735245 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 18735278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 11975844 - 11975782
Alignment:
Q  603 cccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 666  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  11975844 cccacccagaaaaattaaaaatt-aacaattataggtctattctgcgagattttaaacaatttt 11975782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 664
Target Start/End: Original strand, 18714816 - 18714878
Alignment:
Q  602 gcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 664  Q
    ||||| ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18714816 gcccatccgaaaaaatttaaaaattaacgattataggtctactttgcgagattttatacaatt 18714878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 742 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 11975819 - 11975782
Alignment:
Q  742 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 779  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11975819 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttt 11975782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 777
Target Start/End: Original strand, 18668994 - 18669027
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 777  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18668994 attataggtctactttgcgagattttatacaatt 18669027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 777
Target Start/End: Original strand, 18714845 - 18714878
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 777  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18714845 attataggtctactttgcgagattttatacaatt 18714878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 601 - 890
Target Start/End: Original strand, 64969 - 65261
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64969 ggcccacccggaaaaattaaaaaaacaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 65068  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 800  Q
    || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65069 tgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggt 65168  T
Q  801 tgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 890  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  65169 tgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 65261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 629 - 916
Target Start/End: Original strand, 65110 - 65402
Alignment:
Q  629 caattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |||||| ||||    
T  65110 caattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 65209  T
Q  729 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-- 825  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||      
T  65210 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgta 65309  T
Q  826 gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccaccc 916  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  65310 gtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccc 65402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 600 - 917
Target Start/End: Original strand, 1138 - 1459
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1138 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctacttttcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattc 1237  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
    ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 1337  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggccca-ccttgaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-ata 895  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||     
T  1338 ttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatttaatttgcgaaactttaaacagtttttcaatg 1437  T
Q  896 gttaattttagtggcccaccct 917  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1438 gtaaattttagtggcccaccct 1459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 619 - 825
Target Start/End: Original strand, 331825 - 332031
Alignment:
Q  619 aaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaggtggtgtagtag 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  331825 aaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtag 331924  T
Q  719 cccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa 818  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  331925 tccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaa 332024  T
Q  819 attggtg 825  Q
    |||||||    
T  332025 attggtg 332031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 847 - 915
Target Start/End: Original strand, 332441 - 332510
Alignment:
Q  847 ataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttc-atagttaattttagtggcccacc 915  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  332441 ataattcaattatagctctaatttgtaagactttaaacaatttttcaacagttaattttcgtggcccacc 332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 600 - 821
Target Start/End: Original strand, 11212 - 11433
Alignment:
Q  600 tggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212 tggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattc 11311  T
Q  700 ctgtaaggtggtgtagtagcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 799  Q
     || || ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312 gtgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaataattcaattatagatcaattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg 11411  T
Q  800 ttgatccaaattcctgcaaatt 821  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11412 ttgatccaaattcccgcaaatt 11433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 744 - 860
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11361
Alignment:
Q  744 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggcccaccttgaaa 841  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| |   |||    
T  11243 attatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaa 11342  T
Q  842 tttaaataattcaattata 860  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11343 tttaaataattcaattata 11361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303844
Alignment:
Q  754 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 811  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatt 303844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 601 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 303940 - 303826
Alignment:
Q  601 ggcccacccggaagaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcc 700  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |    
T  303940 ggcccactcggaaaaattaaaaatt-aacgattaaagatttattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttc 303842  T
Q  701 tgtaaggtggtgtagt 716  Q
      ||| ||||||||||    
T  303841 cataaagtggtgtagt 303826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 746 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82871
Alignment:
Q  746 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaat 810  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaat 82871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82890
Alignment:
Q  633 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggtttta 678  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggtttta 82890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University