View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1293_low_22 (Length: 391)

Name: NF1293_low_22
Description: NF1293
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1293_low_22
NF1293_low_22
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-379)||(27395160-27395538)
chr2 (1-372)||(21699446-21699817)
chr2 (1-372)||(27779832-27780203)
chr2 (1-372)||(27819589-27819960)
chr2 (1-372)||(34158442-34158813)
chr2 (1-372)||(27120122-27120493)
chr2 (4-372)||(31889766-31890134)
chr2 (1-372)||(13932822-13933193)
chr2 (1-372)||(37682170-37682541)
chr2 (1-372)||(37697435-37697806)
chr2 (1-372)||(39048094-39048465)
chr2 (1-379)||(34865282-34865660)
chr2 (1-372)||(16825613-16825984)
chr2 (1-372)||(16895496-16895867)
chr2 (1-372)||(34294752-34295123)
chr2 (1-372)||(40237106-40237477)
chr2 (4-372)||(3786094-3786462)
chr2 (8-372)||(12712876-12713240)
chr2 (1-372)||(19412776-19413147)
chr2 (1-372)||(37928967-37929338)
chr2 (23-372)||(27430716-27431065)
chr2 (4-372)||(22924423-22924791)
chr2 (1-372)||(256928-257299)
chr2 (1-372)||(9346261-9346632)
chr2 (1-372)||(11631459-11631830)
chr2 (1-372)||(20841511-20841882)
chr2 (1-372)||(31879884-31880255)
chr2 (1-372)||(12659134-12659505)
chr2 (1-372)||(32053401-32053772)
chr2 (1-372)||(21673450-21673821)
chr2 (5-372)||(27807305-27807672)
chr2 (1-372)||(34271195-34271566)
chr2 (23-372)||(16165100-16165449)
chr2 (11-372)||(19452698-19453059)
chr2 (23-372)||(37948137-37948486)
chr2 (23-372)||(28885899-28886248)
chr2 (23-372)||(37381297-37381646)
chr2 (23-372)||(23124844-23125192)
chr2 (5-372)||(12590410-12590777)
chr2 (1-372)||(39893667-39894038)
chr2 (1-72)||(27828058-27828129)
chr2 (1-156)||(34701674-34701829)
chr2 (9-156)||(42394141-42394288)
chr2 (11-324)||(26723599-26723912)
chr2 (11-276)||(34533814-34534079)
chr2 (1-156)||(22949991-22950146)
chr2 (1-205)||(12384258-12384462)
chr2 (5-280)||(21759982-21760257)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (1-372)||(13520421-13520792)
chr6 (1-372)||(14141623-14141994)
chr6 (1-372)||(17088672-17089043)
chr6 (1-372)||(29505012-29505383)
chr6 (1-372)||(28164087-28164458)
chr6 (1-379)||(27358332-27358710)
chr6 (1-379)||(27448675-27449053)
chr6 (1-372)||(27625940-27626311)
chr6 (1-372)||(30554245-30554616)
chr6 (1-372)||(33372660-33373031)
chr6 (1-372)||(34460735-34461106)
chr6 (23-372)||(13295180-13295529)
chr6 (1-372)||(8901932-8902303)
chr6 (1-372)||(24301986-24302357)
chr6 (1-372)||(29553153-29553524)
chr6 (1-379)||(4528881-4529259)
chr6 (1-379)||(26112634-26113012)
chr6 (1-379)||(27011327-27011705)
chr6 (23-372)||(22931113-22931462)
chr6 (23-372)||(23853558-23853907)
chr6 (23-372)||(27022754-27023103)
chr6 (1-372)||(4776476-4776847)
chr6 (1-372)||(16753417-16753788)
chr6 (1-372)||(26921973-26922344)
chr6 (1-371)||(24867312-24867682)
chr6 (11-372)||(27286593-27286954)
chr6 (1-372)||(27061102-27061473)
chr6 (1-379)||(4541996-4542374)
chr6 (1-379)||(4720357-4720735)
chr6 (1-379)||(4761359-4761737)
chr6 (1-379)||(27197781-27198159)
chr6 (1-379)||(27251076-27251454)
chr6 (1-379)||(27488729-27489107)
chr6 (23-372)||(16940256-16940605)
chr6 (1-372)||(16677736-16678107)
chr6 (1-372)||(26774856-26775227)
chr6 (1-372)||(26789412-26789783)
chr6 (1-372)||(28211050-28211421)
chr6 (1-372)||(29576610-29576981)
chr6 (23-372)||(3699701-3700050)
chr6 (23-372)||(15420549-15420898)
chr6 (79-372)||(15408762-15409055)
chr6 (1-348)||(20172143-20172490)
chr6 (1-348)||(22163501-22163848)
chr6 (23-218)||(27180074-27180269)
chr6 (23-218)||(27268970-27269165)
chr6 (1-105)||(22455610-22455714)
chr6 (1-156)||(18212114-18212269)
chr6 (9-156)||(18120073-18120220)
chr6 (11-324)||(27545508-27545821)
chr6 (1-161)||(23971210-23971370)
chr6 (11-276)||(25707617-25707882)
chr6 (1-205)||(9135749-9135953)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-372)||(33878736-33879107)
chr5 (1-372)||(22892069-22892440)
chr5 (1-372)||(24586980-24587351)
chr5 (1-372)||(33296134-33296505)
chr5 (1-372)||(3793147-3793518)
chr5 (1-372)||(8661658-8662029)
chr5 (1-372)||(9321082-9321453)
chr5 (1-372)||(9546892-9547263)
chr5 (1-372)||(11552961-11553332)
chr5 (1-372)||(25203884-25204255)
chr5 (1-372)||(25268039-25268410)
chr5 (1-372)||(30155637-30156008)
chr5 (1-372)||(40469733-40470104)
chr5 (1-379)||(37767167-37767545)
chr5 (1-372)||(33519986-33520357)
chr5 (23-372)||(23629598-23629947)
chr5 (1-372)||(13182976-13183347)
chr5 (1-372)||(24727575-24727946)
chr5 (1-372)||(34620124-34620495)
chr5 (1-379)||(31435070-31435448)
chr5 (1-379)||(37354819-37355197)
chr5 (23-372)||(24973534-24973883)
chr5 (23-372)||(41678333-41678682)
chr5 (1-372)||(18496908-18497279)
chr5 (1-372)||(26484000-26484371)
chr5 (1-379)||(37667662-37668040)
chr5 (23-372)||(22995300-22995649)
chr5 (23-372)||(30938263-30938612)
chr5 (1-379)||(31822583-31822961)
chr5 (1-372)||(12135781-12136152)
chr5 (1-372)||(28652848-28653219)
chr5 (1-379)||(29887373-29887751)
chr5 (1-372)||(33781095-33781462)
chr5 (23-372)||(18124599-18124948)
chr5 (1-372)||(11327243-11327614)
chr5 (1-372)||(18371717-18372088)
chr5 (1-372)||(43081861-43082232)
chr5 (1-379)||(13321006-13321384)
chr5 (1-373)||(15755034-15755406)
chr5 (1-373)||(30033034-30033406)
chr5 (1-372)||(32592457-32592828)
chr5 (23-372)||(5641416-5641765)
chr5 (23-379)||(30172097-30172453)
chr5 (1-372)||(15654941-15655312)
chr5 (23-372)||(13438866-13439215)
chr5 (23-372)||(28955968-28956317)
chr5 (23-372)||(37758611-37758960)
chr5 (23-379)||(2514690-2515046)
chr5 (23-372)||(6877933-6878282)
chr5 (218-372)||(23895706-23895860)
chr5 (9-156)||(3483602-3483749)
chr5 (11-324)||(20388220-20388533)
chr5 (1-205)||(5439575-5439779)
chr5 (1-205)||(17957703-17957907)
chr5 (1-205)||(11943772-11943976)
chr5 (1-205)||(31520913-31521117)
chr5 (1-205)||(15784075-15784279)
chr5 (1-205)||(36375312-36375516)
chr5 (1-205)||(36999966-37000170)
chr5 (11-325)||(34469238-34469552)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (23-372)||(16446177-16446526)
chr7 (1-372)||(2776850-2777221)
chr7 (1-372)||(5143511-5143882)
chr7 (1-372)||(5161979-5162350)
chr7 (1-372)||(16747688-16748059)
chr7 (1-372)||(26511867-26512238)
chr7 (1-372)||(26666085-26666456)
chr7 (1-372)||(26681277-26681648)
chr7 (1-372)||(39209310-39209681)
chr7 (23-372)||(2106334-2106683)
chr7 (23-372)||(10913040-10913389)
chr7 (1-372)||(11420950-11421321)
chr7 (1-372)||(45390816-45391187)
chr7 (1-379)||(16044911-16045289)
chr7 (23-372)||(2158192-2158541)
chr7 (23-372)||(31086793-31087142)
chr7 (1-372)||(4202985-4203356)
chr7 (1-372)||(10842165-10842536)
chr7 (1-372)||(26316019-26316390)
chr7 (1-379)||(31560554-31560932)
chr7 (23-372)||(4141417-4141766)
chr7 (1-372)||(10845216-10845587)
chr7 (1-372)||(16514601-16514972)
chr7 (1-372)||(26271257-26271628)
chr7 (1-372)||(31127503-31127874)
chr7 (23-372)||(5131614-5131963)
chr7 (23-372)||(11444505-11444854)
chr7 (23-372)||(24588705-24589054)
chr7 (23-372)||(26534044-26534393)
chr7 (23-372)||(45734931-45735274)
chr7 (23-372)||(26516410-26516759)
chr7 (23-372)||(3448924-3449273)
chr7 (23-372)||(26438875-26439224)
chr7 (23-372)||(22145813-22146160)
chr7 (1-156)||(2557131-2557286)
chr7 (1-156)||(15193679-15193834)
chr7 (1-156)||(29090112-29090267)
chr7 (11-324)||(1892794-1893107)
chr7 (1-136)||(16127225-16127360)
chr7 (5-325)||(797741-798061)
chr7 (1-205)||(16392772-16392976)
chr7 (1-205)||(30369284-30369488)
chr7 (1-205)||(9469916-9470120)
chr7 (39-199)||(25727130-25727290)
chr7 (52-161)||(16238112-16238221)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-372)||(7559-7930)
scaffold0143 (1-372)||(19669-20040)
scaffold0143 (1-372)||(30892-31263)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (1-372)||(27159603-27159974)
chr4 (1-372)||(15231484-15231855)
chr4 (1-379)||(1903866-1904244)
chr4 (1-379)||(54837003-54837381)
chr4 (23-372)||(34185246-34185595)
chr4 (1-372)||(21973313-21973684)
chr4 (1-372)||(31122798-31123169)
chr4 (23-372)||(24116296-24116645)
chr4 (23-372)||(24588647-24588996)
chr4 (1-372)||(17016658-17017029)
chr4 (18-372)||(20334707-20335061)
chr4 (1-379)||(40101916-40102294)
chr4 (23-372)||(33670086-33670435)
chr4 (1-372)||(5009487-5009858)
chr4 (1-372)||(18313464-18313835)
chr4 (1-372)||(18796900-18797271)
chr4 (1-372)||(30757372-30757743)
chr4 (1-372)||(36340803-36341174)
chr4 (1-372)||(6573470-6573841)
chr4 (1-372)||(14102155-14102526)
chr4 (1-372)||(39854249-39854620)
chr4 (82-379)||(15384627-15384924)
chr4 (1-372)||(14668628-14668999)
chr4 (11-322)||(15281273-15281584)
chr4 (73-372)||(5698219-5698518)
chr4 (23-198)||(14759766-14759941)
chr4 (200-372)||(14755778-14755950)
chr4 (1-156)||(14725301-14725456)
chr4 (1-88)||(15387948-15388035)
chr4 (1-156)||(19767951-19768106)
chr4 (11-276)||(1881481-1881746)
chr4 (14-324)||(18044684-18044994)
chr4 (1-99)||(12515844-12515942)
chr4 (318-372)||(15278913-15278967)
chr4 (5-158)||(55784748-55784901)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (43-379)||(22757-23093)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-372)||(9635-10006)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-372)||(18713082-18713453)
chr8 (35-379)||(22077165-22077509)
chr8 (1-372)||(15771172-15771543)
chr8 (1-372)||(27605152-27605523)
chr8 (1-372)||(2133507-2133878)
chr8 (1-372)||(19657588-19657959)
chr8 (1-372)||(31358126-31358497)
chr8 (1-379)||(29832924-29833302)
chr8 (23-372)||(19691718-19692067)
chr8 (4-372)||(44564585-44564953)
chr8 (23-372)||(14561244-14561593)
chr8 (23-372)||(18794324-18794673)
chr8 (1-372)||(19204609-19204980)
chr8 (1-372)||(28358199-28358570)
chr8 (1-379)||(33262332-33262710)
chr8 (1-372)||(12088970-12089341)
chr8 (1-379)||(9358223-9358601)
chr8 (23-372)||(19678067-19678416)
chr8 (23-372)||(33245989-33246338)
chr8 (23-372)||(31486118-31486467)
chr8 (23-372)||(21344418-21344767)
chr8 (245-372)||(16286795-16286922)
chr8 (257-372)||(22136764-22136879)
chr8 (1-156)||(22412536-22412691)
chr8 (9-156)||(14212645-14212792)
chr8 (11-279)||(16768931-16769199)
chr8 (6-156)||(19844770-19844920)
chr8 (298-372)||(19913409-19913483)
chr8 (281-322)||(22136725-22136766)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-372)||(16180-16551)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (5-372)||(5714637-5715004)
chr3 (5-372)||(5766454-5766821)
chr3 (5-372)||(5725547-5725914)
chr3 (1-372)||(32294188-32294559)
chr3 (1-379)||(18228756-18229134)
chr3 (1-372)||(4627345-4627716)
chr3 (1-372)||(15889034-15889405)
chr3 (1-379)||(4420475-4420853)
chr3 (23-372)||(18303983-18304332)
chr3 (23-372)||(18334212-18334561)
chr3 (1-372)||(8215295-8215666)
chr3 (1-372)||(51785583-51785954)
chr3 (1-379)||(5470548-5470926)
chr3 (1-379)||(5592679-5593057)
chr3 (23-372)||(4687237-4687586)
chr3 (23-372)||(18273381-18273730)
chr3 (23-372)||(18288682-18289031)
chr3 (23-372)||(22383907-22384256)
chr3 (8-372)||(8285799-8286163)
chr3 (8-372)||(31032565-31032929)
chr3 (1-372)||(19698050-19698421)
chr3 (1-372)||(21678263-21678634)
chr3 (1-372)||(35884326-35884697)
chr3 (1-379)||(5017274-5017652)
chr3 (23-372)||(4792964-4793313)
chr3 (23-372)||(11106688-11107037)
chr3 (23-372)||(17981278-17981627)
chr3 (23-372)||(18054844-18055193)
chr3 (1-372)||(6205463-6205835)
chr3 (1-372)||(24331723-24332094)
chr3 (1-372)||(28112283-28112654)
chr3 (1-379)||(18246301-18246679)
chr3 (5-379)||(22867170-22867544)
chr3 (5-379)||(22882229-22882603)
chr3 (23-372)||(4725213-4725562)
chr3 (23-372)||(15737423-15737772)
chr3 (23-372)||(29145085-29145434)
chr3 (1-372)||(4343005-4343376)
chr3 (1-372)||(5653645-5654016)
chr3 (8-379)||(8299538-8299909)
chr3 (1-372)||(47027013-47027384)
chr3 (1-379)||(31960777-31961155)
chr3 (23-372)||(10399726-10400075)
chr3 (23-372)||(32442733-32443082)
chr3 (1-372)||(5605643-5606014)
chr3 (1-372)||(28024842-28025212)
chr3 (1-379)||(6539064-6539442)
chr3 (11-379)||(16620812-16621180)
chr3 (1-372)||(7076766-7077137)
chr3 (23-372)||(48469509-48469858)
chr3 (23-379)||(28342759-28343115)
chr3 (1-372)||(20069600-20069971)
chr3 (1-372)||(10646633-10647004)
chr3 (5-372)||(20573172-20573539)
chr3 (1-372)||(8000120-8000491)
chr3 (5-372)||(29661299-29661666)
chr3 (102-372)||(17973190-17973460)
chr3 (1-106)||(17992526-17992631)
chr3 (1-156)||(11924903-11925058)
chr3 (1-156)||(16431965-16432120)
chr3 (1-279)||(15919077-15919355)
chr3 (1-274)||(15592338-15592611)
chr3 (9-156)||(22960021-22960168)
chr3 (1-136)||(7088592-7088727)
chr3 (1-276)||(46380894-46381169)
chr3 (14-324)||(4450348-4450658)
chr3 (1-205)||(5950298-5950502)
chr3 (1-161)||(15705033-15705193)
chr3 (5-279)||(20443681-20443955)
chr3 (11-156)||(6571924-6572069)
chr3 (1-274)||(37260136-37260409)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (1-379)||(41789589-41789967)
chr1 (1-372)||(21894034-21894405)
chr1 (1-379)||(20336695-20337073)
chr1 (1-372)||(28153337-28153708)
chr1 (1-372)||(28588586-28588957)
chr1 (1-372)||(10966266-10966637)
chr1 (1-379)||(10948678-10949056)
chr1 (17-372)||(16204320-16204675)
chr1 (1-372)||(3644737-3645109)
chr1 (24-372)||(20464600-20464948)
chr1 (1-372)||(51641819-51642190)
chr1 (6-161)||(22489627-22489782)
chr1 (1-156)||(5628500-5628655)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-379)||(9621-9999)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (17-379)||(9660-10022)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-372)||(22477-22848)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-372)||(3666-4037)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-372)||(11214-11585)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (23-379)||(5458-5814)
scaffold0159 (248-379)||(10296-10427)
scaffold0159 (248-379)||(12452-12583)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-372)||(11548-11919)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (23-372)||(13192-13541)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (102-371)||(1979-2251)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (45-270)||(118721-118946)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-204)||(5125-5328)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (25-372)||(42990-43354)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (9-156)||(10825-10972)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (1-237)||(34661-34897)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (1-99)||(4969-5067)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-205)||(29769-29973)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27395160 - 27395538
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27395160 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttgggtgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaa 27395259  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395260 gctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattttgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 27395359  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395360 atcaccttgcctatcaacctcttgatgagtaccagccgactaagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 27395459  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27395460 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggcaaagga 27395538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21699817 - 21699446
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699817 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 21699718  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21699717 gctgctgttactgggaagattgcatgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 21699618  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21699617 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagagcc 21699518  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21699517 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21699446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 27779832 - 27780203
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779832 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27779931  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27779932 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27780031  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27780032 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 27780131  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27780132 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27780203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 27819589 - 27819960
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819589 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27819688  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27819689 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27819788  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27819789 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 27819888  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27819889 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27819960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 34158442 - 34158813
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158442 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34158541  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34158542 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 34158641  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34158642 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 34158741  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34158742 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34158813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 27120122 - 27120493
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120122 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27120221  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27120222 gctgctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27120321  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27120322 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaggactgtgaagaacc 27120421  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27120422 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27120493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31890134 - 31889766
Alignment:
Q  4 tctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31890134 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcg 31890035  T
Q  104 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31890034 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 31889935  T
Q  204 accttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgct 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  31889934 accttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgtt 31889835  T
Q  304 gattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31889834 gattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31889766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13933193 - 13932822
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933193 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcggcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 13933094  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13933093 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 13932994  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | | | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13932993 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaatcaattgaattcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 13932894  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13932893 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 13932822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37682541 - 37682170
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682541 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37682442  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37682441 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 37682342  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37682341 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 37682242  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37682241 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 37682170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37697806 - 37697435
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697806 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37697707  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37697706 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 37697607  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37697606 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 37697507  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37697506 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 37697435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39048465 - 39048094
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048465 tgctctagcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 39048366  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39048365 gctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 39048266  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39048265 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 39048166  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39048165 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 39048094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34865282 - 34865660
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865282 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34865381  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34865382 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 34865481  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34865482 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 34865581  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34865582 gttgattaatgaaggtccagatcccattagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 34865660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16825984 - 16825613
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16825984 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 16825885  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16825884 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 16825785  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16825784 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 16825685  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16825684 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16825613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16895496 - 16895867
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16895496 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 16895595  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16895596 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 16895695  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16895696 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 16895795  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16895796 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16895867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 34294752 - 34295123
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294752 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34294851  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34294852 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 34294951  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34294952 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactacgaagaacc 34295051  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
      |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34295052 attgatcgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34295123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 40237106 - 40237477
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237106 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 40237205  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40237206 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 40237305  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40237306 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 40237405  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40237406 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 40237477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Original strand, 3786094 - 3786462
Alignment:
Q  4 tctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3786094 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagct 3786193  T
Q  104 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3786194 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 3786293  T
Q  204 accttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgct 303  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  3786294 atcttgcttaccaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgtt 3786393  T
Q  304 gattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3786394 gattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgttaatgcttatgg 3786462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12713240 - 12712876
Alignment:
Q  8 gcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  12713240 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccg 12713141  T
Q  108 ttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcacct 207  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12713140 ttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcacct 12713041  T
Q  208 tgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgatt 307  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12713040 tgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgctgatt 12712941  T
Q  308 ggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12712940 gatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 12712876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19413147 - 19412776
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19413147 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 19413048  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19413047 gctgccgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 19412948  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19412947 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 19412848  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19412847 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19412776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 37928967 - 37929338
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928967 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37929066  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37929067 gctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 37929166  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37929167 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 37929266  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37929267 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagccagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 37929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27431065 - 27430716
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431065 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 27430966  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27430965 cacgttggcagatgcttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 27430866  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  27430865 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 27430766  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27430765 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27430716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22924791 - 22924423
Alignment:
Q  4 tctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924791 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 22924692  T
Q  104 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22924691 gttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 22924592  T
Q  204 accttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgct 303  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |    
T  22924591 atcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgacgaaccgtt 22924492  T
Q  304 gattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22924491 gattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22924423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 257299 - 256928
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257299 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 257200  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  257199 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 257100  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||  | | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  257099 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaatcaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 257000  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  256999 gctgattgatgaaggtccagatcttaatagtaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 256928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9346632 - 9346261
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346632 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 9346533  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9346532 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 9346433  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9346432 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 9346333  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  9346332 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggcttagtctttgatggcgctgtcaatgcttatgg 9346261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11631830 - 11631459
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11631830 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 11631731  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11631730 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 11631631  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11631630 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 11631531  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11631530 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11631459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 20841511 - 20841882
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841511 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 20841610  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20841611 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 20841710  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20841711 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 20841810  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||   ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20841811 gttgatttaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 20841882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 31879884 - 31880255
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879884 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31879983  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31879984 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 31880083  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31880084 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcagccgatcgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 31880183  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31880184 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31880255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 12659134 - 12659505
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659134 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 12659233  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12659234 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 12659333  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12659334 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 12659433  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  12659434 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtatttgatggtgctgtcaatgcttatgg 12659505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 32053401 - 32053772
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32053401 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgattaagtatatctttgagaaa 32053500  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32053501 gctgctgttactggaaagatcgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcagaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 32053600  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32053601 atcatcttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgacttcccagatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 32053700  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32053701 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 32053772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21673821 - 21673450
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21673821 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaa 21673722  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21673721 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 21673622  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || | | | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  21673621 atcatcttgcttaccaacctcttgacgattaccaaccaattgaattcaatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 21673522  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21673521 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21673450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Original strand, 27807305 - 27807672
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27807305 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 27807404  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27807405 ccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 27807504  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  27807505 tcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttg 27807604  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27807605 attgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27807672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34271566 - 34271195
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271566 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34271467  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34271466 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 34271367  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  34271366 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaagtcaaaagactgcgaagaacc 34271267  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34271266 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34271195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 16165100 - 16165449
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16165100 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattg 16165199  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16165200 cacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacctct 16165299  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  16165300 tgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 16165399  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16165400 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16165449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19453059 - 19452698
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19453059 tgggccgccaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatataacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 19452960  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19452959 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 19452860  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
     || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19452859 ctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggt 19452760  T
Q  311 gaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19452759 gaaggtccggatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgttgtcaatgcttatgg 19452698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37948486 - 37948137
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37948486 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattg 37948387  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37948386 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttgtcaacctct 37948287  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || |||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37948286 tgatgattatcaaccgattgagttcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattagtgaaggtccagat 37948187  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  37948186 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcctatgg 37948137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 28885899 - 28886248
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28885899 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattg 28885998  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  28885999 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctct 28886098  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  28886099 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactacgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 28886198  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28886199 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28886248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 37381297 - 37381646
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37381297 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattg 37381396  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37381397 cacggtggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 37381496  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| ||||| || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  37381497 tgacgagtatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 37381596  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37381597 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 37381646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23125192 - 23124844
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125192 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 23125093  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23125092 cacgctggcagatgcttttatctgaatacgatattgtgttc-aaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctct 23124994  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  23124993 tgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 23124894  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23124893 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgtttatgg 23124844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Original strand, 12590410 - 12590777
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12590410 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 12590509  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12590510 ccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 12590609  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||  | | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  12590610 tcttgcttaccaacctcttgatgattaccaatcaattgaattcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaaccgttg 12590709  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12590710 attaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 12590777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 39893667 - 39894038
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39893667 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaa 39893766  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  39893767 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccg 39893866  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  39893867 atcatcttgcttaccaacctcttgacgattaccaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagagcc 39893966  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39893967 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 39894038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 27828058 - 27828129
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 72  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828058 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27828129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 34701674 - 34701829
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  34701674 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 34701773  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  34701774 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 34701829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 42394141 - 42394288
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  42394141 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 42394240  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  42394241 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 42394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26723912 - 26723599
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  26723912 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 26723813  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  26723812 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgacattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagc 26723713  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||  || |||||    
T  26723712 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttgaagatgaaagattgtgacgaaccattgtttggt 26723613  T
Q  311 gaaggaccagatcc 324  Q
    ||||| || |||||    
T  26723612 gaaggtcctgatcc 26723599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34534079 - 34533814
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  34534079 tgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 34533980  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  34533979 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaagggtagtattcttgctgaccatttagc 34533880  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtattt 276  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  34533879 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtattt 34533814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22949991 - 22950146
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  22949991 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 22950090  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22950091 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 22950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 12384258 - 12384462
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  12384258 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 12384357  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  12384358 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 12384457  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  12384458 atcac 12384462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21760257 - 21759982
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  21760257 ctagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccg 21760158  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    || | || || |  ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||| ||      | |  || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21760157 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattgagtatcgttcccggaaagcaatcaaaggcagtatccttgctgatca 21760058  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaa 280  Q
    | | ||| | |||||  |||| || || ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21760057 cttggctcaccaaccgattgaagactatcagcctatcaagttcgactttcctgatgaagagatcatgtatttgaaa 21759982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13520792 - 13520421
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520792 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 13520693  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13520692 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 13520593  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13520592 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 13520493  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13520492 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 13520421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14141994 - 14141623
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141994 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 14141895  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14141894 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 14141795  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14141794 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 14141695  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14141694 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 14141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17089043 - 17088672
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089043 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 17088944  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17088943 gcgactgttacagggaagattgcacgatggcagatgctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaatggcaatcaaaggtagcatccttgctg 17088844  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17088843 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccagccgattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactaagaagaacc 17088744  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  17088743 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgccgtcaatgcgtatgg 17088672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 29505012 - 29505383
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505012 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 29505111  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29505112 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 29505211  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29505212 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccccgatgaagagatcatgcatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 29505311  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29505312 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 29505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28164087 - 28164458
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164087 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28164186  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164187 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 28164286  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28164287 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagaaatcatgtacttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 28164386  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28164387 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28164458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27358710 - 27358332
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358710 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27358611  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27358610 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 27358511  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27358510 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27358411  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27358410 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27358332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27449053 - 27448675
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449053 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27448954  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27448953 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 27448854  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27448853 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27448754  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27448753 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27448675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27626311 - 27625940
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27626311 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaa 27626212  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27626211 gctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27626112  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27626111 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 27626012  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27626011 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27625940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30554616 - 30554245
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30554616 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 30554517  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30554516 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 30554417  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30554416 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 30554317  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30554316 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 30554245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33373031 - 33372660
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33373031 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaa 33372932  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33372931 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 33372832  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  33372831 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcagccgattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgcgaagaacc 33372732  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  33372731 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggcttagtctttgatggcgctgtcaatgcttatgg 33372660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34461106 - 34460735
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461106 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34461007  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34461006 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 34460907  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34460906 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 34460807  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34460806 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34460735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13295529 - 13295180
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295529 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 13295430  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13295429 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 13295330  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  13295329 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 13295230  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  13295229 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgttgtcaatgcttatgg 13295180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8902303 - 8901932
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8902303 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 8902204  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8902203 gctgctgttactgggaatattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 8902104  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8902103 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagagcc 8902004  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8902003 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 8901932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24302357 - 24301986
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302357 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 24302258  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24302257 gctgctgttactgggaagattgcacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 24302158  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24302157 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatcaaaagactgcgaagaacc 24302058  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24302057 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24301986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 29553153 - 29553524
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553153 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 29553252  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29553253 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 29553352  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  29553353 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaggactgcgaagaacc 29553452  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29553453 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 29553524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4528881 - 4529259
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528881 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4528980  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4528981 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 4529080  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4529081 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 4529180  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4529181 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 4529259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26113012 - 26112634
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113012 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26112913  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26112912 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 26112813  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26112812 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 26112713  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26112712 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 26112634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27011327 - 27011705
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011327 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27011426  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27011427 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 27011526  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27011527 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27011626  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27011627 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27011705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22931462 - 22931113
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931462 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 22931363  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22931362 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22931263  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  22931262 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 22931163  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22931162 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22931113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23853907 - 23853558
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853907 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 23853808  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  23853807 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 23853708  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  23853707 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 23853608  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23853607 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 23853558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 27022754 - 27023103
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022754 cgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 27022853  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27022854 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 27022953  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  27022954 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 27023053  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27023054 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27023103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 4776476 - 4776847
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776476 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4776575  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4776576 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 4776675  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4776676 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 4776775  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4776776 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4776847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16753417 - 16753788
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753417 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 16753516  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16753517 gcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 16753616  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16753617 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 16753716  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16753717 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggagtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16753788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 26921973 - 26922344
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921973 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26922072  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26922073 gcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26922172  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26922173 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 26922272  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26922273 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26922344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 24867312 - 24867682
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867312 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 24867411  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24867412 gctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 24867511  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24867512 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaatcaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 24867611  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatg 371  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24867612 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatg 24867682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27286954 - 27286593
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27286954 tgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctatta 27286855  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27286854 ctgggaagattgcacgttggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 27286755  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
     ||||||||||||||||| || || || | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27286754 ctatcaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggt 27286655  T
Q  311 gaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27286654 gaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27286593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 27061102 - 27061473
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061102 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27061201  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27061202 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27061301  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27061302 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtacttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 27061401  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27061402 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27061473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4542374 - 4541996
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542374 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4542275  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  4542274 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgcca 4542175  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4542174 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 4542075  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4542074 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 4541996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4720735 - 4720357
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720735 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4720636  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4720635 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 4720536  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4720535 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 4720436  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4720435 gttgattaatgagggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 4720357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4761359 - 4761737
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761359 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4761458  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4761459 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 4761558  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4761559 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 4761658  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4761659 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 4761737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27197781 - 27198159
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197781 tgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27197880  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27197881 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27197980  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27197981 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27198080  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |  ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27198081 gtcgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27198159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27251454 - 27251076
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251454 tgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27251355  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27251354 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27251255  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27251254 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27251155  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |  ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27251154 gtcgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27488729 - 27489107
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488729 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27488828  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27488829 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 27488928  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27488929 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 27489028  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27489029 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 27489107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16940605 - 16940256
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16940605 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 16940506  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16940505 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctct 16940406  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  16940405 tgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 16940306  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16940305 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16940256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16677736 - 16678107
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16677736 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatgtctttgagaaa 16677835  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  16677836 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaagggcaatcaaaggtagcattcttgcag 16677935  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16677936 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 16678035  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16678036 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16678107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26775227 - 26774856
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26775227 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 26775128  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26775127 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26775028  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26775027 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 26774928  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26774927 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26774856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 26789412 - 26789783
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789412 tgctctagcttgggctgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26789511  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26789512 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26789611  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26789612 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 26789711  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26789712 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtgcggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26789783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28211050 - 28211421
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211050 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28211149  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28211150 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 28211249  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28211250 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 28211349  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28211350 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgttaatgcttatgg 28211421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 29576610 - 29576981
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29576610 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaa 29576709  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29576710 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 29576809  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29576810 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 29576909  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29576910 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 29576981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 3699701 - 3700050
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699701 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 3699800  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3699801 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 3699900  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  3699901 tgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 3700000  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3700001 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 3700050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15420898 - 15420549
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15420898 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattg 15420799  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15420798 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 15420699  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  15420698 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 15420599  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15420598 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15420549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15409055 - 15408762
Alignment:
Q  79 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggca 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15409055 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaaggga 15408956  T
Q  179 atcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttga 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15408955 atcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaa 15408856  T
Q  279 aatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15408855 aatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15408762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 20172143 - 20172490
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20172143 tgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaa 20172242  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20172243 cctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 20172342  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20172343 atcatcttgcctaccaacccctggatgattatcaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtttttgaaatcaaaagattgtgaagaacc 20172442  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtctt 348  Q
      ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20172443 attgattggtgaaggtccggatcccaatagcaagtggggactagtctt 20172490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22163848 - 22163501
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22163848 tgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaa 22163749  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22163748 cctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 22163649  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22163648 atcatcttgcctaccaacccctggatgattatcaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtttttgaaatcaaaagattgtgaagaacc 22163549  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtctt 348  Q
      ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  22163548 attgattggtgaaggtccggatcccaatagcaagtggggactagtctt 22163501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 27180074 - 27180269
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27180074 cgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 27180173  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaac 218  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27180174 cacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27269165 - 27268970
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269165 cgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 27269066  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaac 218  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27269065 cacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27268970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22455714 - 22455610
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455714 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 22455615  T
Q  101 gctgc 105  Q
    |||||    
T  22455614 gctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18212269 - 18212114
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  18212269 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 18212170  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18212169 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18212114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 18120073 - 18120220
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  18120073 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 18120172  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18120173 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18120220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 27545508 - 27545821
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  27545508 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 27545607  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||    
T  27545608 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattctggctgaccatttagc 27545707  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    ||||| ||||| |||||| || |||||    
T  27545708 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttaaagatgaaagattgtgacgaaccgttgtttggt 27545807  T
Q  311 gaaggaccagatcc 324  Q
    ||||| || |||||    
T  27545808 gaaggtcctgatcc 27545821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23971370 - 23971210
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  23971370 tgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaag 23971271  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgt 161  Q
     | ||| | ||||| | ||||||  | ||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  23971270 ccagctttaactggaaggattgcttgatggcagatgttattgtccgagtatgatattgtgt 23971210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 25707617 - 25707882
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||| | |    
T  25707617 tgggctgctaagcgtcttcgtcaataaatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatttttgagaagcctgctttaa 25707716  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  25707717 caggaagaattgctcgttggcagatgctattgtccgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaagggtagtattcttgctgaccatttggc 25707816  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtattt 276  Q
    |  ||||||  |||| || || |||||   |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25707817 tcgtcaaccaattgaagattatcagcctgttaagtttgattttccagatgaagagatcatgtattt 25707882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9135953 - 9135749
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  9135953 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 9135854  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  9135853 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgagtatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 9135754  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  9135753 atcac 9135749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33878736 - 33879107
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878736 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 33878835  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33878836 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 33878935  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33878936 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 33879035  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33879036 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33879107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 22892069 - 22892440
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892069 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcactatttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 22892168  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22892169 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgttg 22892268  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22892269 atcaccttgcctatcaaccgctcgatgagtatcagccgactaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgacgaacc 22892368  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22892369 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22892440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 24586980 - 24587351
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586980 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 24587079  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24587080 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 24587179  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24587180 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatcaaaagactgcgaagaacc 24587279  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24587280 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24587351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33296134 - 33296505
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296134 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 33296233  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33296234 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 33296333  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33296334 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcaatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 33296433  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33296434 gttgattggtgaaggtccagatcccaatggcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33296505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 3793147 - 3793518
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3793147 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggacccgatcaagtatatctttgagaaa 3793246  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3793247 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 3793346  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3793347 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 3793446  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3793447 gttgattgacgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 3793518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8662029 - 8661658
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662029 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 8661930  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8661929 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 8661830  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8661829 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 8661730  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8661729 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 8661658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 9321082 - 9321453
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9321082 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 9321181  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9321182 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 9321281  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9321282 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 9321381  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9321382 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 9321453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9547263 - 9546892
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547263 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 9547164  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9547163 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 9547064  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9547063 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 9546964  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9546963 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 9546892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 11552961 - 11553332
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552961 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 11553060  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11553061 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 11553160  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11553161 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 11553260  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11553261 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11553332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 25203884 - 25204255
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203884 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 25203983  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25203984 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 25204083  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25204084 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 25204183  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25204184 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 25204255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 25268039 - 25268410
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268039 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 25268138  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25268139 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 25268238  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25268239 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 25268338  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25268339 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 25268410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 30155637 - 30156008
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155637 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 30155736  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30155737 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 30155836  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30155837 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 30155936  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30155937 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 30156008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40470104 - 40469733
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470104 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 40470005  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40470004 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 40469905  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40469904 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 40469805  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40469804 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggcttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 40469733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37767545 - 37767167
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767545 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37767446  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37767445 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 37767346  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37767345 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttcccggatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 37767246  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37767245 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 37767167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33519986 - 33520357
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33519986 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 33520085  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33520086 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 33520185  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33520186 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 33520285  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33520286 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33520357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 23629598 - 23629947
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629598 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 23629697  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  23629698 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 23629797  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  23629798 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 23629897  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23629898 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 23629947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13183347 - 13182976
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183347 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 13183248  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13183247 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 13183148  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13183147 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 13183048  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
      |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13183047 attgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 13182976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 24727575 - 24727946
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24727575 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 24727674  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24727675 gctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 24727774  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24727775 atcatcttgcctaccaacctcttgacgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 24727874  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24727875 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24727946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 34620124 - 34620495
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620124 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 34620223  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34620224 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 34620323  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  34620324 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcagccgattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgcgaagaacc 34620423  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34620424 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34620495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31435070 - 31435448
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435070 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31435169  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31435170 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 31435269  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31435270 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 31435369  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31435370 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 31435448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37355197 - 37354819
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355197 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37355098  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37355097 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 37354998  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  37354997 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 37354898  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37354897 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 37354819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 24973534 - 24973883
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973534 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 24973633  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24973634 cacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 24973733  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24973734 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttcctcgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttggttggtgaaggtccagat 24973833  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24973834 cctaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24973883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 41678333 - 41678682
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41678333 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 41678432  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41678433 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 41678532  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| || || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  41678533 tgacgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgatcgatgaaggtccagat 41678632  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41678633 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 41678682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18497279 - 18496908
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497279 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 18497180  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18497179 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 18497080  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18497079 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 18496980  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18496979 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18496908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 26484000 - 26484371
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26484000 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 26484099  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26484100 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26484199  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26484200 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 26484299  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26484300 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26484371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37668040 - 37667662
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668040 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 37667941  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37667940 gcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 37667841  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  37667840 atcaccttgcttatcaacctcttaatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 37667741  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37667740 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 37667662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22995649 - 22995300
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995649 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 22995550  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22995549 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22995450  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  22995449 tgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgaggaaggtccagat 22995350  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22995349 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 30938263 - 30938612
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938263 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 30938362  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  30938363 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 30938462  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  30938463 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 30938562  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30938563 cccaatagcaagtggggtttggtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 30938612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31822961 - 31822583
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31822961 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 31822862  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31822861 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 31822762  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31822761 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 31822662  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31822661 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 31822583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 12135781 - 12136152
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12135781 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 12135880  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12135881 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 12135980  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12135981 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 12136080  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12136081 gttgattgagcaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 12136152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28652848 - 28653219
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652848 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28652947  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28652948 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcag 28653047  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28653048 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 28653147  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28653148 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28653219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29887751 - 29887373
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29887751 tgctctagcctgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtatatctttgagaaa 29887652  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29887651 gctgttgttactgggaagattgcactctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccg 29887552  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    || | || || || |||||||| ||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29887551 ataatctcgcctaccaacctctcgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 29887452  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29887451 attgattggtgaaggaccagatcccaatagcaagtgaggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 29887373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33781095 - 33781462
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781095 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 33781194  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33781195 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaa----caaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 33781290  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33781291 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 33781390  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33781391 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33781462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18124948 - 18124599
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18124948 cgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 18124849  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18124848 cacgctggcagatgctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 18124749  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||    
T  18124748 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccggat 18124649  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18124648 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18124599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 11327243 - 11327614
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327243 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 11327342  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11327343 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 11327442  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11327443 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 11327542  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11327543 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11327614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18372088 - 18371717
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18372088 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatcagatcaagtatatctttgagaaa 18371989  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18371988 gctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 18371889  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |   | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18371888 atcaccttgcttaccaacctcttgacgattaccaaccaatggaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 18371789  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18371788 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18371717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 43081861 - 43082232
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43081861 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaa 43081960  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43081961 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcag 43082060  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43082061 atcatcttgcttaccaacctcttgatgatcatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 43082160  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43082161 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 43082232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13321384 - 13321006
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321384 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 13321285  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  13321284 gcggccgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcgatcaaaggtagcatcctcgccg 13321185  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  13321184 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcaatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 13321085  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
      |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13321084 attgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 13321006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15755406 - 15755034
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15755406 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaa 15755307  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15755306 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 15755207  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15755206 atcaccttgcttatcaacctcttgacgattaccaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 15755107  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggc 373  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15755106 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgacggtgctgtcaatgcttatggc 15755034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 30033034 - 30033406
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30033034 tgctttagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaag 30033133  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30033134 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 30033233  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30033234 atcaccttgcttatcaacctcttgacgattaccaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 30033333  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggc 373  Q
    | |||||  |||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  30033334 gttgattaatgaaggtccagatcccgatagcaagtggggtttagtctttgacggtgctgtcaatgcttatggc 30033406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32592828 - 32592457
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592828 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 32592729  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32592728 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 32592629  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32592628 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcaacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 32592529  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32592528 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 32592457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 5641416 - 5641765
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5641416 cgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 5641515  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5641516 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctct 5641615  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||    
T  5641616 tgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagagccgttgattaatgaaggtccagat 5641715  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5641716 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5641765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Original strand, 30172097 - 30172453
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30172097 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattg 30172196  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  30172197 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 30172296  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  30172297 tgatgattaccaaccaattgagttcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 30172396  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30172397 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 30172453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15655312 - 15654941
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655312 tgctctggcctgggctgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 15655213  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15655212 gcggctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 15655113  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || || || | | | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15655112 atcaccttgcttaccaacctctcgacgattatcaaccaattgaatttgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 15655013  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15655012 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15654941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13439215 - 13438866
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13439215 cgcctgcgtcattatttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaagattg 13439116  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13439115 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 13439016  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  13439015 tgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 13438916  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13438915 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 13438866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28956317 - 28955968
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28956317 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgccgttactggaaagattg 28956218  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28956217 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 28956118  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  28956117 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagat 28956018  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28956017 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28955968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 37758611 - 37758960
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37758611 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattg 37758710  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37758711 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 37758810  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| || ||||| || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  37758811 tgacgattaccaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 37758910  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37758911 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 37758960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Original strand, 2514690 - 2515046
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  2514690 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattg 2514789  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  2514790 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 2514889  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  2514890 tgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgacgaaggtccagat 2514989  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2514990 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 2515046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 6877933 - 6878282
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  6877933 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattg 6878032  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6878033 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 6878132  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  6878133 tgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagat 6878232  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6878233 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 6878282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 23895706 - 23895860
Alignment:
Q  218 cctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggac 317  Q
    ||||||||||| || || || | | ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  23895706 cctcttgatgattatcaaccaattgagttcaatttcccagacgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgctaagaaccgttgattggtgaaggtc 23895805  T
Q  318 cagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  23895806 cagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgctgatgg 23895860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3483749 - 3483602
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  3483749 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 3483650  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  3483649 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 3483602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20388533 - 20388220
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  |  || | |    
T  20388533 tgggctgctatgcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccgactttaa 20388434  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  20388433 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagc 20388334  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||  || |||||    
T  20388333 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttaaaaatgaaagattgtgacgaaccattgtttggt 20388234  T
Q  311 gaaggaccagatcc 324  Q
    ||||| || |||||    
T  20388233 gaaggtcccgatcc 20388220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5439779 - 5439575
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  5439779 tgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 5439680  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  5439679 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 5439580  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  5439579 atcac 5439575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 17957703 - 17957907
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  17957703 tgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctgatatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 17957802  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | |  || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17957803 cccgctttgataggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 17957902  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  17957903 atcac 17957907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11943976 - 11943772
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  11943976 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 11943877  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11943876 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 11943777  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  11943776 atcac 11943772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 31520913 - 31521117
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  31520913 tgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 31521012  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  31521013 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatcggaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 31521112  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  31521113 atcac 31521117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15784279 - 15784075
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  15784279 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 15784180  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15784179 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 15784080  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  15784079 atcac 15784075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36375516 - 36375312
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || || || || ||||||||     
T  36375516 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaag 36375417  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  36375416 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 36375317  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  36375316 atcac 36375312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37000170 - 36999966
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || || || || ||||||||     
T  37000170 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaag 37000071  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  37000070 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 36999971  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  36999970 atcac 36999966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 34469238 - 34469552
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  34469238 tgggctgccaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgctttga 34469337  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| |  | || ||||||||||||| ||     || || || || |||||||| || || |||||||||||| | ||    
T  34469338 caggaagaattgcccggtggcagatgttactatccgaatatgatattgagtatcgtacccagaaagcgatcaaaggcagtatccttgctgatcacttggc 34469437  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
    | | |||||  |||| || || ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    ||||| ||||| ||||||||  | ||     
T  34469438 tcaccaaccaattgaagactatcagcccatcaagttcgactttcctgatgaagagattatgtatttgaagatgaaagattgtgacgaaccgctactcggg 34469537  T
Q  311 gaaggaccagatcct 325  Q
    ||||| |||||||||    
T  34469538 gaaggtccagatcct 34469552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16446526 - 16446177
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16446526 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 16446427  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446426 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacctct 16446327  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16446326 cgatgattaccagccgactaagttcgatttccccgatgaagagaacatgtatttgaaatcaaaagactgagaagaaccattgattggtgaaggtccagat 16446227  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16446226 cccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16446177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 2776850 - 2777221
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776850 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 2776949  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2776950 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 2777049  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2777050 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 2777149  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2777150 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 2777221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5143882 - 5143511
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143882 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5143783  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5143782 gcagccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 5143683  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5143682 atcatcttgcctaccaacctctcgatgattaccagccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 5143583  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5143582 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 5161979 - 5162350
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161979 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5162078  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5162079 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 5162178  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5162179 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 5162278  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5162279 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5162350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16748059 - 16747688
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748059 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 16747960  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16747959 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 16747860  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16747859 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 16747760  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16747759 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16747688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26512238 - 26511867
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512238 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26512139  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26512138 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26512039  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26512038 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 26511939  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26511938 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26511867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26666456 - 26666085
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666456 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26666357  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26666356 gctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26666257  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26666256 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 26666157  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26666156 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26666085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26681648 - 26681277
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681648 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 26681549  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26681548 gctgttgttactgggaagattgcacgcgggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26681449  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26681448 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 26681349  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26681348 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26681277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39209681 - 39209310
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209681 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 39209582  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39209581 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 39209482  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39209481 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 39209382  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39209381 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 39209310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2106683 - 2106334
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2106683 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 2106584  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  2106583 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 2106484  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2106483 tgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggtccagat 2106384  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2106383 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 2106334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10913389 - 10913040
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913389 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 10913290  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10913289 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 10913190  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  10913189 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 10913090  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10913089 cccaatagcaagtggagtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 10913040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11421321 - 11420950
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421321 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 11421222  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11421221 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 11421122  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11421121 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 11421022  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11421021 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtctagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11420950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 45390816 - 45391187
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390816 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 45390915  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45390916 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 45391015  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  45391016 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgcgaagaacc 45391115  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45391116 gttgattaatgaaggtccagatcccaacagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 45391187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16044911 - 16045289
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16044911 tgctctggcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaa 16045010  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16045011 gctgctgttactgggaagattgcacgctggtagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 16045110  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||||||  |||| ||||| || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16045111 atcatcttgcctaccaacctctcaatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaaaagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 16045210  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16045211 gttgattggtgaaggtccagatcccaacagcaagtgggggttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 16045289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 2158192 - 2158541
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2158192 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 2158291  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  2158292 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 2158391  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  2158392 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagattatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 2158491  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2158492 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 2158541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31087142 - 31086793
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087142 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 31087043  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31087042 cacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 31086943  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
     ||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  31086942 cgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaggactgtgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 31086843  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31086842 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31086793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 4202985 - 4203356
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4202985 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaaatatatctttgagaaa 4203084  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4203085 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccg 4203184  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  4203185 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgagcc 4203284  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4203285 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4203356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10842536 - 10842165
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10842536 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 10842437  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10842436 cctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccg 10842337  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10842336 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 10842237  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10842236 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatgg 10842165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26316390 - 26316019
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26316390 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 26316291  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26316290 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26316191  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || |  || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26316190 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcgaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 26316091  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26316090 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26316019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31560932 - 31560554
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560932 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31560833  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31560832 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 31560733  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31560732 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 31560633  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | || ||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31560632 gttggttaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 31560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4141766 - 4141417
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4141766 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactggaaagattg 4141667  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4141666 cacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 4141567  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  4141566 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 4141467  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4141466 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4141417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 10845216 - 10845587
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10845216 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 10845315  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10845316 cctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccg 10845415  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10845416 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 10845515  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10845516 gttgattggtgaaggtctggatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatgg 10845587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16514972 - 16514601
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16514972 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatagatccgataaagtatatctttgagaaa 16514873  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16514872 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 16514773  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16514772 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 16514673  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
      |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16514672 attgatcgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16514601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26271628 - 26271257
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26271628 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 26271529  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26271528 gctgttgttacgggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 26271429  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26271428 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 26271329  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26271328 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26271257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 31127503 - 31127874
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127503 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31127602  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31127603 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 31127702  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31127703 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 31127802  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31127803 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtgaggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31127874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 5131614 - 5131963
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5131614 cgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattg 5131713  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  5131714 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 5131813  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  5131814 tgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgaggaaggtccagat 5131913  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5131914 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5131963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 11444505 - 11444854
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444505 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 11444604  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11444605 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 11444704  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  11444705 tgatgactatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 11444804  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11444805 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11444854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24589054 - 24588705
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24589054 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 24588955  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24588954 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctct 24588855  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  24588854 tgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 24588755  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24588754 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24588705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26534393 - 26534044
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534393 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 26534294  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26534293 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctct 26534194  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
     ||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26534193 cgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 26534094  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26534093 cccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26534044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 45734931 - 45735274
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734931 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat------tatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 45735024  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45735025 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 45735124  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  45735125 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 45735224  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45735225 cccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 45735274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 26516410 - 26516759
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  26516410 cgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattg 26516509  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26516510 cacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 26516609  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26516610 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 26516709  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26516710 cccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26516759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 3448924 - 3449273
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3448924 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattg 3449023  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  3449024 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 3449123  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  3449124 tgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagat 3449223  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3449224 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 3449273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 26438875 - 26439224
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  26438875 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcg 26438974  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26438975 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 26439074  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| || || || || | | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  26439075 tgacgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 26439174  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26439175 cccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 26439224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 22145813 - 22146160
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22145813 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 22145912  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22145913 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcgaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22146012  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||| | ||||||    
T  22146013 tgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaggaaccgttgattaatgaa-gtccagat 22146111  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22146112 cccaatagc-agtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22146160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 2557131 - 2557286
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  2557131 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 2557230  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  2557231 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 2557286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15193679 - 15193834
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  15193679 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 15193778  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  15193779 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 15193834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 29090112 - 29090267
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  29090112 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 29090211  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  29090212 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 29090267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1893107 - 1892794
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  1893107 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 1893008  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  1893007 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgacattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagc 1892908  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||  || |||||    
T  1892907 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgatttcccagatgaagagatcatgtatttgaagatgaaagattgtgacgaaccattgtttggt 1892808  T
Q  311 gaaggaccagatcc 324  Q
    ||||| || |||||    
T  1892807 gaaggtcctgatcc 1892794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16127360 - 16127225
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  16127360 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 16127261  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 136  Q
     | ||| | ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16127260 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 16127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 798061 - 797741
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  798061 ctagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaggatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccg 797962  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    || | || || |  ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||| || |    | |  || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  797961 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattgagtaccgttcccggaaagcaatcaaaggcagtatccttgctgatca 797862  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    | | ||| | |||||  |||| || || ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    ||||| ||||| ||||||||     
T  797861 cttggctcaccaaccaattgaagactatcagcccatcaagttcgactttcctgatgaagagattatgtatttgaagatgaaagattgtgacgaaccgcta 797762  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcct 325  Q
     | || ||||| |||||||||    
T  797761 ctcggggaaggtccagatcct 797741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16392976 - 16392772
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  16392976 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 16392877  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16392876 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 16392777  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  16392776 atcac 16392772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30369488 - 30369284
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  30369488 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 30369389  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||||||||| || || |||||||    
T  30369388 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtgccgttcccagaaggcaatcaaaggcagtatccttgctg 30369289  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  30369288 atcac 30369284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9469916 - 9470120
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  9469916 tgctctagcctgggctgccagacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 9470015  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  9470016 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 9470115  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  9470116 atcac 9470120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Original strand, 25727130 - 25727290
Alignment:
Q  39 tggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgct 138  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||  | ||| | || || |  ||||| |||||||||||| |    
T  25727130 tggttaatcacactacttggttgatgtccaaaatggacccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgctggcagatgtt 25727229  T
Q  139 cttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgct 199  Q
     |||||||| ||||||||||||| |   ||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  25727230 attgtctgagtatgatattgtgtaccgtactcagaaagccatcaagggtagtattcttgct 25727290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Original strand, 16238112 - 16238221
Alignment:
Q  52 aacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  |  || | ||||| | |||||| || ||||||||| | ||||| || |||    
T  16238112 aacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccaactttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtat 16238211  T
Q  152 gatattgtgt 161  Q
    ||||||||||    
T  16238212 gatattgtgt 16238221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 7559 - 7930
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7559 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 7658  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7659 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 7758  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7759 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 7858  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7859 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 7930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 19669 - 20040
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19669 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 19768  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19769 cctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccg 19868  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19869 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 19968  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19969 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatgg 20040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 30892 - 31263
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30892 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 30991  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30992 cctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 31091  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  31092 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatgtaaaatcaaaagactgcgaagaacc 31191  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31192 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatacttatgg 31263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27159974 - 27159603
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27159974 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27159875  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27159874 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 27159775  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27159774 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 27159675  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27159674 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 15231484 - 15231855
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231484 tgctctggcctgggccaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 15231583  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15231584 gctgctgttactggaaaggttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 15231683  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15231684 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccgactaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 15231783  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15231784 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15231855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 1903866 - 1904244
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903866 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 1903965  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1903966 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 1904065  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1904066 atcatcttgcctaccaacctcttaatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 1904165  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1904166 gttgattagtgaaggtccagatcccaatagcaagtgggggttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 1904244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 54837003 - 54837381
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837003 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 54837102  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54837103 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 54837202  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54837203 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 54837302  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54837303 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 54837381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34185595 - 34185246
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185595 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 34185496  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  34185495 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 34185396  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  34185395 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 34185296  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34185295 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 34185246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 21973313 - 21973684
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21973313 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 21973412  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21973413 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 21973512  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21973513 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 21973612  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21973613 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21973684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31123169 - 31122798
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31123169 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 31123070  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31123069 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 31122970  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31122969 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 31122870  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31122869 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31122798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 24116296 - 24116645
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24116296 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 24116395  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  24116396 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 24116495  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24116496 tgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggtccagat 24116595  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24116596 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24116645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24588996 - 24588647
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588996 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 24588897  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24588896 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttaccaacctct 24588797  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  24588796 tgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgaggaaggtccagat 24588697  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24588696 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgccgtcaatgcttatgg 24588647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 17016658 - 17017029
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016658 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 17016757  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17016758 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 17016857  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17016858 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 17016957  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17016958 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 17017029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20335061 - 20334707
Alignment:
Q  18 ccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaa 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335061 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaa 20334962  T
Q  118 gattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  20334961 gattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccctgcttaccaa 20334862  T
Q  218 cctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggac 317  Q
    ||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| |    
T  20334861 cctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccattgattgatgaaggtc 20334762  T
Q  318 cagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20334761 cagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 20334707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40102294 - 40101916
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102294 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 40102195  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40102194 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 40102095  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  40102094 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 40101995  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40101994 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 40101916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33670435 - 33670086
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670435 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 33670336  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33670335 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctct 33670236  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33670235 tgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattggtgaaggtccagat 33670136  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33670135 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33670086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 5009487 - 5009858
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5009487 tgctctggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 5009586  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5009587 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 5009686  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5009687 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 5009786  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5009787 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5009858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18313835 - 18313464
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313835 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 18313736  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18313735 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 18313636  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18313635 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 18313536  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | || ||| |||||  |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18313535 gttggttgatgaagatccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18313464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18797271 - 18796900
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797271 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 18797172  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18797171 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 18797072  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18797071 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 18796972  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18796971 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18796900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 30757372 - 30757743
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30757372 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 30757471  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30757472 gctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 30757571  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30757572 atcatcttgcttaccaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 30757671  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30757672 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 30757743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36341174 - 36340803
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341174 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 36341075  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36341074 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 36340975  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36340974 atcaccttgcttaccaacctcttgacgagtatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaggaacc 36340875  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36340874 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 36340803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 6573470 - 6573841
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573470 tgctttagtttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 6573569  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6573570 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 6573669  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6573670 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaatttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 6573769  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6573770 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 6573841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 14102155 - 14102526
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14102155 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 14102254  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14102255 gctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 14102354  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |   | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14102355 atcatcttgcttaccaacctcttgacgattaccaaccaatggaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 14102454  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  14102455 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgtttatgg 14102526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 39854249 - 39854620
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39854249 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 39854348  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39854349 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcag 39854448  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39854449 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaacc 39854548  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39854549 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 39854620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15384924 - 15384627
Alignment:
Q  82 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15384924 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatc 15384825  T
Q  182 aaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaat 281  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15384824 aaaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatgagtaccagccgactaagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaat 15384725  T
Q  282 caaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15384724 caaaagactgcgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggcaaagga 15384627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 14668628 - 14668999
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668628 tgctctggcctgggccgctaaacgtctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagatggatccgataaagtatatctttgagaaa 14668727  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14668728 gctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 14668827  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14668828 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatcaaaagactgcgaagaacc 14668927  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14668928 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 14668999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15281584 - 15281273
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15281584 tgggccgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 15281485  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15281484 ctgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 15281385  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
     || ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15281384 ctaccaaccgcttgatgattaccaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactacgaagaaccgttgattggt 15281285  T
Q  311 gaaggaccagat 322  Q
    ||||| ||||||    
T  15281284 gaaggtccagat 15281273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 73 - 372
Target Start/End: Original strand, 5698219 - 5698518
Alignment:
Q  73 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698219 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5698318  T
Q  173 aaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5698319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgt 5698418  T
Q  273 atttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5698419 atttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttaattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5698518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14759941 - 14759766
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759941 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 14759842  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759841 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgc 14759766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14755950 - 14755778
Alignment:
Q  200 gatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaac 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14755950 gatcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaac 14755851  T
Q  300 cgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14755850 cgttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 14755778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14725456 - 14725301
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  14725456 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 14725357  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14725356 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgaatatgatat 14725301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15388035 - 15387948
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtat 88  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  15388035 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtat 15387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19767951 - 19768106
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  19767951 tgctttagcttgggctgccaagcgtttccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 19768050  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  19768051 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 19768106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1881746 - 1881481
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  1881746 tgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 1881647  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  1881646 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaagggtagtattcttgctgaccatttagc 1881547  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtattt 276  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1881546 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtattt 1881481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 18044684 - 18044994
Alignment:
Q  14 gctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactg 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | || |    
T  18044684 gctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacag 18044783  T
Q  114 ggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgctta 213  Q
    | |  ||||| || ||||| ||| | ||||  || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| |    
T  18044784 gaagaattgctcgttggcaaatgttattgttcgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagctca 18044883  T
Q  214 tcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaa 313  Q
    ||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  18044884 tcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttaaagatgaaagactgtgacgaaccattgtttggtgaa 18044983  T
Q  314 ggaccagatcc 324  Q
    || || |||||    
T  18044984 ggtcctgatcc 18044994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12515844 - 12515942
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  12515844 tgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 12515942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15278967 - 15278913
Alignment:
Q  318 cagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15278967 cagatcccaatagcaagtggggattagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatgg 15278913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 55784748 - 55784901
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  55784748 ctagcctgggctgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggacccgatcaagtacatctttgagaaacccg 55784847  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattg 158  Q
    || | || || |  ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  55784848 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 55784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 43 - 379
Target Start/End: Original strand, 22757 - 23093
Alignment:
Q  43 gaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||    
T  22757 gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttg 22856  T
Q  143 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaata 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22857 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatgagtaccagccgacta 22956  T
Q  243 agttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22957 agttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagagtgcgaagaaccgctgattggtgaaggaccatatcctaatagcaaatggggatt 23056  T
Q  343 agtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23057 agtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggcaaagga 23093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 9635 - 10006
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9635 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 9734  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9735 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 9834  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9835 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 9934  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9935 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 10006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 18713082 - 18713453
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713082 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 18713181  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18713182 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 18713281  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18713282 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 18713381  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18713382 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18713453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 35 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22077509 - 22077165
Alignment:
Q  35 tatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22077509 tatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggcaaa 22077410  T
Q  135 tgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtacca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077409 tgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatgagtacca 22077310  T
Q  235 gccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaa 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22077309 gccgactaagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaagaccagatcctaatagcaaa 22077210  T
Q  335 tggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22077209 tggggattagtcttcgatggtgctgtcagcgcttatggcaaagga 22077165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 15771172 - 15771543
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771172 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 15771271  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15771272 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 15771371  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15771372 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 15771471  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15771472 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15771543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27605523 - 27605152
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605523 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 27605424  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27605423 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcg 27605324  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605323 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 27605224  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27605223 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 27605152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2133878 - 2133507
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133878 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 2133779  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2133778 gctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 2133679  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2133678 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 2133579  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2133578 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 2133507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19657959 - 19657588
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657959 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgccattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 19657860  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19657859 gttgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 19657760  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657759 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 19657660  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | || |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19657659 gttggttggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19657588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 31358126 - 31358497
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358126 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31358225  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31358226 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 31358325  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31358326 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 31358425  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31358426 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31358497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 29832924 - 29833302
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832924 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 29833023  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  29833024 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccg 29833123  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29833124 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 29833223  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29833224 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 29833302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 19691718 - 19692067
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691718 cgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 19691817  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19691818 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 19691917  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  19691918 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 19692017  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19692018 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19692067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Original strand, 44564585 - 44564953
Alignment:
Q  4 tctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564585 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 44564684  T
Q  104 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44564685 gttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 44564784  T
Q  204 accttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgct 303  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44564785 atctggcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatctgaaatcaaaagactgcgaagaaccgtt 44564884  T
Q  304 gattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44564885 gattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 44564953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 14561244 - 14561593
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561244 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 14561343  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14561344 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 14561443  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  14561444 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccaatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 14561543  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14561544 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 14561593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 18794324 - 18794673
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794324 cgcctgcgtcattatttgatgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18794423  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18794424 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 18794523  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  18794524 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 18794623  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18794624 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18794673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19204980 - 19204609
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19204980 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 19204881  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19204880 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 19204781  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19204780 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 19204681  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | | |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19204680 gttaattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19204609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28358570 - 28358199
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28358570 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 28358471  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28358470 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccg 28358371  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28358370 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 28358271  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28358270 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28358199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33262332 - 33262710
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262332 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 33262431  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  33262432 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccg 33262531  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  33262532 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 33262631  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33262632 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 33262710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12089341 - 12088970
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089341 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 12089242  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12089241 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 12089142  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12089141 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 12089042  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12089041 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgttaatgcttatgg 12088970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 9358223 - 9358601
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358223 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 9358322  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9358323 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcag 9358422  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9358423 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccgattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 9358522  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9358523 gttgattaatgaaggcccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 9358601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 19678067 - 19678416
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678067 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 19678166  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19678167 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 19678266  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  19678267 tgatgactatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaggaaccgttgattgatgaaggtccagat 19678366  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19678367 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19678416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 33245989 - 33246338
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33245989 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 33246088  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  33246089 cacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 33246188  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  33246189 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 33246288  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33246289 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 33246338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31486467 - 31486118
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31486467 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattg 31486368  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31486367 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 31486268  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| || ||||| || |   | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  31486267 tgacgattaccaaccaatggaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 31486168  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31486167 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31486118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21344767 - 21344418
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21344767 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaaccgcccagctcaagtatatctctgagaaagctgttgttactgggaagattg 21344668  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21344667 cacgctgacagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 21344568  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21344567 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 21344468  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21344467 cccaatagcaagtggggttaagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21344418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 16286795 - 16286922
Alignment:
Q  245 ttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattag 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16286795 ttcgatttccccgatgaagagatcatgtatgtaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattag 16286894  T
Q  345 tcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16286895 tctttgatggtgctgtcaatacttatgg 16286922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 372
Target Start/End: Original strand, 22136764 - 22136879
Alignment:
Q  257 gatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtg 356  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||    
T  22136764 gatgaagaggtcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggtccagatcccaataacaagtggggattattttttgatggtg 22136863  T
Q  357 ctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22136864 ctgtcaatgcttatgg 22136879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22412536 - 22412691
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  22412536 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 22412635  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22412636 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 22412691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 14212645 - 14212792
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  14212645 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 14212744  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  14212745 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 14212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 16768931 - 16769199
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  16768931 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaa 16769030  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    | || |  ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  16769031 caggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgacattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagc 16769130  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaa 279  Q
    | |||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16769131 tcatcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttgaa 16769199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 19844770 - 19844920
Alignment:
Q  6 tagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 105  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  19844770 tagcctgggctgccaaacgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagc 19844869  T
Q  106 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
    | | ||| | | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  19844870 tttaactagaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 19844920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19913483 - 19913409
Alignment:
Q  298 accgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19913483 accgttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19913409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 322
Target Start/End: Original strand, 22136725 - 22136766
Alignment:
Q  281 tcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22136725 tcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggtccagat 22136766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16180 - 16551
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180 tgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 16279  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16280 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 16379  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16380 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 16479  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16480 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Original strand, 5714637 - 5715004
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714637 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5714736  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714737 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5714836  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5714837 ccttgcttatcaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttg 5714936  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5714937 attaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5715004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5766821 - 5766454
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766821 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5766722  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5766721 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5766622  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5766621 ccttgcttatcaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttg 5766522  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5766521 attaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5766454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Original strand, 5725547 - 5725914
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725547 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5725646  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5725647 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5725746  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  5725747 ccttgcttatcaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaactgttg 5725846  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5725847 attaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5725914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 32294188 - 32294559
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294188 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 32294287  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32294288 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 32294387  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32294388 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 32294487  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32294488 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 32294559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18228756 - 18229134
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18228756 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 18228855  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18228856 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 18228955  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18228956 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 18229055  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18229056 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 18229134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 4627345 - 4627716
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4627345 tgctctagcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaa 4627444  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4627445 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 4627544  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4627545 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 4627644  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||    
T  4627645 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttaatatttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4627716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15889405 - 15889034
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15889405 tgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccggtaaagtatatctttgagaaa 15889306  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15889305 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 15889206  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889205 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 15889106  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15889105 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 15889034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4420475 - 4420853
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420475 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4420574  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4420575 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 4420674  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  4420675 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaatc 4420774  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4420775 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 4420853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18304332 - 18303983
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304332 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18304233  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18304232 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 18304133  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  18304132 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 18304033  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18304032 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18303983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 18334212 - 18334561
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334212 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18334311  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  18334312 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctct 18334411  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  18334412 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 18334511  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18334512 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18334561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 8215295 - 8215666
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215295 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 8215394  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8215395 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 8215494  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  8215495 atcaccttgcttaccaacctcttgacgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgcgaagaacc 8215594  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  8215595 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggagtttagtctttgatggcgctgtcaatgcttatgg 8215666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 51785583 - 51785954
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51785583 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaa 51785682  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51785683 gctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 51785782  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51785783 atcatcttgcttaccaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 51785882  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51785883 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaacgcttatgg 51785954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5470548 - 5470926
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470548 tgctctagcgtgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5470647  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5470648 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 5470747  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5470748 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 5470847  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5470848 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 5470926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5593057 - 5592679
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593057 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5592958  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5592957 gctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 5592858  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||    
T  5592857 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactacgacgaacc 5592758  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5592757 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 5592679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 4687237 - 4687586
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687237 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 4687336  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4687337 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagacagtcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 4687436  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  4687437 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 4687536  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4687537 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4687586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18273730 - 18273381
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273730 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18273631  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18273630 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctct 18273531  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  18273530 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 18273431  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18273430 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18273381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18289031 - 18288682
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289031 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18288932  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18288931 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctct 18288832  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  18288831 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 18288732  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18288731 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18288682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22384256 - 22383907
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22384256 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 22384157  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22384156 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22384057  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  22384056 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 22383957  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22383956 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22383907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8286163 - 8285799
Alignment:
Q  8 gcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 107  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286163 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 8286064  T
Q  108 ttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcacct 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8286063 ttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatct 8285964  T
Q  208 tgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgatt 307  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8285963 tgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgatt 8285864  T
Q  308 ggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8285863 gatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgttgtcaatgcttatgg 8285799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31032929 - 31032565
Alignment:
Q  8 gcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 107  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032929 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 31032830  T
Q  108 ttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcacct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31032829 ttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatct 31032730  T
Q  208 tgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgatt 307  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || | | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31032729 tgcttaccaacctctagatgattatcaaccaattgagttcgttttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgatt 31032630  T
Q  308 ggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31032629 gatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 31032565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 19698050 - 19698421
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698050 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 19698149  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19698150 gctgctgttactgggaagattgcccgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 19698249  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19698250 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcaatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 19698349  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19698350 gttgattagtgaaggtcccgatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 19698421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 21678263 - 21678634
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678263 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 21678362  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21678363 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 21678462  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21678463 atcatcttgcctgccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 21678562  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21678563 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21678634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 35884326 - 35884697
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884326 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 35884425  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35884426 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaattaaaggtagcattcttgccg 35884525  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35884526 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 35884625  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35884626 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 35884697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5017274 - 5017652
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017274 tgctctagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5017373  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5017374 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 5017473  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  5017474 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 5017573  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5017574 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 5017652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4793313 - 4792964
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793313 cgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 4793214  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4793213 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 4793114  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  4793113 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatatatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 4793014  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4793013 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4792964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11107037 - 11106688
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107037 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 11106938  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  11106937 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 11106838  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| |||||  | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  11106837 tgatgattaccaatcaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 11106738  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11106737 cccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11106688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17981627 - 17981278
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17981627 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 17981528  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17981527 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 17981428  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  17981427 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatctgaaatccaaagactgtgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 17981328  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17981327 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 17981278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 18054844 - 18055193
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054844 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 18054943  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18054944 cacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 18055043  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  18055044 tgatgattaccaaccaattgagttcaatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 18055143  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18055144 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 18055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 6205463 - 6205835
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205463 tgctctggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 6205562  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6205563 gctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 6205662  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6205663 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 6205762  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtc-ttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6205763 gttgattgaagaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtcttttgatggtgctgtcaatgcttatgg 6205835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 24331723 - 24332094
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331723 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 24331822  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24331823 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 24331922  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24331923 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 24332022  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24332023 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 24332094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28112654 - 28112283
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28112654 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 28112555  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28112554 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 28112455  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28112454 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 28112355  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28112354 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28112283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18246301 - 18246679
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246301 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 18246400  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18246401 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 18246500  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18246501 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccttgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 18246600  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18246601 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 18246679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22867544 - 22867170
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22867544 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 22867445  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22867444 ccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatca 22867345  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  22867344 ccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttg 22867245  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22867244 attaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 22867170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22882603 - 22882229
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22882603 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 22882504  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22882503 ccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatca 22882404  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  22882403 ccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttg 22882304  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22882303 attaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 22882229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 4725213 - 4725562
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725213 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 4725312  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4725313 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggaaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 4725412  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  4725413 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 4725512  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  4725513 cccagtagcaagtggggtttagtctttgatggtgctatcaatgcttatgg 4725562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15737772 - 15737423
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737772 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 15737673  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15737672 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaatgtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 15737573  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  15737572 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 15737473  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  15737472 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgatgtcaatgcttatgg 15737423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29145434 - 29145085
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29145434 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttaccgggaagattg 29145335  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29145334 cacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 29145235  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  29145234 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 29145135  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  29145134 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgccgtcaatgcttatgg 29145085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4343376 - 4343005
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343376 tgctttagcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 4343277  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4343276 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 4343177  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4343176 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatcaaaagactgcgaagaacc 4343077  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | || ||| |||||  |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4343076 gttggttgatgaagatccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 5653645 - 5654016
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5653645 tgctctggcctgggccgctaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 5653744  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5653745 gctgttgttactgggaagattgcacgctgacaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 5653844  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| | ||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5653845 atcatcctgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 5653944  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5653945 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5654016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 8299538 - 8299909
Alignment:
Q  8 gcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 107  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299538 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 8299637  T
Q  108 ttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcacct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8299638 ttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagaattcttgccgatcatct 8299737  T
Q  208 tgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgatt 307  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  8299738 tgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgatt 8299837  T
Q  308 ggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  8299838 gatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaattcttatggcaaagga 8299909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 47027013 - 47027384
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47027013 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 47027112  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47027113 gctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 47027212  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47027213 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaactaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 47027312  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47027313 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtctagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 47027384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31961155 - 31960777
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961155 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 31961056  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  31961055 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaagacagcattcttgccg 31960956  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31960955 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 31960856  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31960855 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 31960777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 10399726 - 10400075
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10399726 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattg 10399825  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10399826 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacctct 10399925  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    | |||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||||    
T  10399926 taatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgatggaggaaggtccagat 10400025  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10400026 cccaatagcaagtggggtttagtgtttgatggtgctgtcaatgcttatgg 10400075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 32442733 - 32443082
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442733 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 32442832  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32442833 cacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 32442932  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    ||| || || || || | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  32442933 tgacgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 32443032  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32443033 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 32443082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5606014 - 5605643
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5606014 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 5605915  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5605914 gctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 5605815  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5605814 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaactaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 5605715  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5605714 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 5605643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28024842 - 28025212
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024842 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28024941  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28024942 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 28025041  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28025042 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 28025141  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28025142 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtgggg-ttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28025212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6539442 - 6539064
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539442 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 6539343  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6539342 gcggccgttacggggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 6539243  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  6539242 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcaacgaacc 6539143  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6539142 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 6539064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16621180 - 16620812
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16621180 tgggccgccaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcagataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 16621081  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16621080 ctaggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 16620981  T
Q  211 ttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggt 310  Q
     || ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16620980 ctaccaacctcttgacgattaccaaccaattaagttcgatttccccgatgaagacatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggt 16620881  T
Q  311 gaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  16620880 gaaggtccagatcctgatagcaagtggggattagtctttgatggtgatgtcaatgcttatggcaaagga 16620812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 7076766 - 7077137
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7076766 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaa 7076865  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7076866 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccg 7076965  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7076966 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 7077065  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  7077066 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtctagtctttgatggtgccgtcaatgcttatgg 7077137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 48469509 - 48469858
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  48469509 cgcctgcgtcattatttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattg 48469608  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  48469609 cgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcttaccaacctct 48469708  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  48469709 tgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 48469808  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48469809 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 48469858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Original strand, 28342759 - 28343115
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  28342759 cgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcg 28342858  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28342859 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctct 28342958  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  28342959 tgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagat 28343058  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28343059 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 28343115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 20069600 - 20069971
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069600 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 20069699  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20069700 gctgctgttactggaaagattgcacgctagcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 20069799  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || | | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20069800 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgaatttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 20069899  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20069900 gttgattgaggaaggtccggatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 20069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 10646633 - 10647004
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10646633 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaa 10646732  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10646733 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 10646832  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10646833 atcacctggcttaccagcctctcgatgattatcaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 10646932  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10646933 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgacggtgctgtcaatgcttatgg 10647004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20573539 - 20573172
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573539 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 20573440  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20573439 ccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatca 20573340  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20573339 tcttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcttgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttg 20573240  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20573239 attaatgaaggcccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgccgtcaatgcttatgg 20573172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 8000120 - 8000491
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8000120 tgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaa 8000219  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8000220 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 8000319  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  8000320 atcacctggcttaccagcctctcgatgattatcaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcaaagaacc 8000419  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8000420 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgacggtgctgtcaatgcttatgg 8000491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29661666 - 29661299
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29661666 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 29661567  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29661566 ccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatca 29661467  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctg 304  Q
     |||||||| |||||||| ||||| || || || | | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  29661466 tcttgcttaccaacctctcgatgattatcaaccaattgaattcgacttccccgatgaagaaatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttg 29661367  T
Q  305 attggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29661366 attgaggaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 29661299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973190
Alignment:
Q  102 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctga 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  202 tcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccg 301  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccg 17973261  T
Q  302 ctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
     ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17973260 ttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 17973190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17992631 - 17992526
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17992631 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 17992532  T
Q  101 gctgct 106  Q
    ||||||    
T  17992531 gctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11925058 - 11924903
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  11925058 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttgagaag 11924959  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  11924958 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 11924903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16431965 - 16432120
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  16431965 tgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 16432064  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  16432065 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 16432120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15919077 - 15919355
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  15919077 tgctctggcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 15919176  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | |  |||| |||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||| ||      |||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  15919177 cccgctttgaaagggaggattgcccggtggcagatgttattgtccgagtatgatattgagtatcgttctcagaaagcaatcaaaggcagtattcttgctg 15919276  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaa 279  Q
    ||||| | ||| | ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  15919277 atcacttggctcaccaaccacttgaagactaccagcctatcaagtttgactttcccgatgaagagattatgtatctgaa 15919355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15592611 - 15592338
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  15592611 tgctctagcctgggttgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaag 15592512  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || |||| |||| | || ||||||||||| || || || |||||||||| || |    |||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  15592511 cccgctttgacagggaggatttcccggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccgttctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgctg 15592412  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtat 274  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  15592411 atcacctggctcaccaaccacttgaagactaccagcctatgaagtttgactttcccgatgatgagattatgtat 15592338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 22960021 - 22960168
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  22960021 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 22960120  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22960121 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 22960168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7088727 - 7088592
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  7088727 tgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaag 7088628  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 136  Q
     | ||| | ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7088627 ccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 7088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 46380894 - 46381169
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| | ||||||||| || || || || |||||||||    
T  46380894 tgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaaa 46380993  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||   || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  46380994 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcaagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 46381093  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtattt 276  Q
    ||||| | ||| | ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  46381094 atcacttggctcaccaaccgcttgaggactatcagcctattaagtttgactttcctgatgaagagattatgtattt 46381169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 4450348 - 4450658
Alignment:
Q  14 gctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactg 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||| | || |    
T  4450348 gctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacag 4450447  T
Q  114 ggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgctta 213  Q
    | |  ||||| || ||||| ||| | ||||  || ||||||||||| | |   ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| |    
T  4450448 gaagaattgctcgttggcaaatgttattgttcgagtatgatattgtctaccgcactcagaaagccatcaaaggtagtattcttgctgaccatttagctca 4450547  T
Q  214 tcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaa 313  Q
    ||||||  |||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  4450548 tcaaccaattgaagattatcagcctatcaagtttgattttccagatgaagagatcatgtatttaaagatgaaagactgtgacgaaccattgtttggtgaa 4450647  T
Q  314 ggaccagatcc 324  Q
    || || |||||    
T  4450648 ggtcctgatcc 4450658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5950502 - 5950298
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  5950502 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 5950403  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  5950402 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 5950303  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  5950302 atcac 5950298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 15705033 - 15705193
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||     
T  15705033 tgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggacccaatcaagtacatatttgagaag 15705132  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgt 161  Q
     | ||| | || || | |||||| |||||||||||| | || || || |||||||| ||||    
T  15705133 ccagctttaaccggaaggattgctcgctggcagatgttattatccgagtatgatatcgtgt 15705193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Original strand, 20443681 - 20443955
Alignment:
Q  5 ctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 104  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  20443681 ctagcctgggctgctaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctg 20443780  T
Q  105 ctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatca 204  Q
    || | || || |  ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||| ||     || || || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  20443781 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattgagtatcgtacccagaaagcaatcaaaggcagtatccttgctgatca 20443880  T
Q  205 ccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaa 279  Q
    | | ||| | |||||  |||| || || ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  20443881 cttggctcaccaaccaattgaagactatcagcccatcaagttcgactttcctgatgaagagattatgtatttgaa 20443955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 6571924 - 6572069
Alignment:
Q  11 tgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  6571924 tgggccgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaa 6572023  T
Q  111 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
    |||| | ||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  6572024 ctggaaggatcgctcgctggcaaatgttattgtccgagtatgatat 6572069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37260409 - 37260136
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |  | |||||  | |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  37260409 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatataattaatcacgctacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaag 37260310  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  37260309 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcaaatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 37260210  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtat 274  Q
    ||||| | ||| | ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  37260209 atcacttggctcaccaaccgcttgaagactatcaacctattaagtttgacttccctgatgaagagattatgtat 37260136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41789967 - 41789589
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41789967 tgctctagcttgggctgctaagcgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 41789868  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41789867 gcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 41789768  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41789767 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 41789668  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41789667 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtcttcgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 41789589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21894405 - 21894034
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894405 tgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 21894306  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894305 gcggctgttactgggaaggttgcacgctggcagatgctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 21894206  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21894205 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 21894106  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21894105 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 21894034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20337073 - 20336695
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337073 tgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 20336974  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20336973 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 20336874  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || | | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20336873 atcatcttgcctaccaaccccttgatgattaccaaccaattgagtttgatttcctcgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtaaagaacc 20336774  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20336773 gttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgctgatggcaaagga 20336695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28153337 - 28153708
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153337 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28153436  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28153437 gctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 28153536  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28153537 atcaccttgcttaccaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgacttccccgatgaagagatcatgtatttaaaatccaaagactgcgaagaacc 28153636  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28153637 gttgattaatgaaggcccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28153708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28588586 - 28588957
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588586 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 28588685  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28588686 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 28588785  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28588786 atcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattgagtttgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 28588885  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28588886 gttgattgatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 28588957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 10966266 - 10966637
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10966266 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 10966365  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10966366 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 10966465  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  10966466 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 10966565  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | ||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10966566 gttgattgaggaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 10966637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 10948678 - 10949056
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10948678 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 10948777  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10948778 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 10948877  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  10948878 atcatcttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 10948977  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10948978 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 10949056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16204675 - 16204320
Alignment:
Q  17 gccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16204675 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 16204576  T
Q  117 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatca 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  16204575 agattgcccgctggaagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16204476  T
Q  217 acctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaagga 316  Q
    |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||     
T  16204475 acctcttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagattgcgaagaaccgttgattagtgaaggt 16204376  T
Q  317 ccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  16204375 ccagatcccaatagcaagtggggtttagtcgttgatggtgctgtcaatgcttatgg 16204320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 3644737 - 3645109
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644737 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 3644836  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3644837 gcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcag 3644936  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3644937 atcatcttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaattcgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 3645036  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtc-ttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3645037 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaggtggggtttagtcttttgatggtgctgtcaatgcttatgg 3645109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 372
Target Start/End: Original strand, 20464600 - 20464948
Alignment:
Q  24 gcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20464600 gcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgc 20464699  T
Q  124 acgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||||||    
T  20464700 acgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcctgccaacctctt 20464799  T
Q  224 gatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatc 323  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  20464800 gatgattaccagccgattaagttcgattttcccgacgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccattgattggtgaaggtccagatc 20464899  T
Q  324 ctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20464900 ccaatagcaagtggggcctagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 20464948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 51641819 - 51642190
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51641819 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaa 51641918  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51641919 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 51642018  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |   | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51642019 atcatcttgcttaccaacctcttgacgattaccaaccaatggaattcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaacc 51642118  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51642119 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 51642190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 22489627 - 22489782
Alignment:
Q  6 tagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 105  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  22489627 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagc 22489726  T
Q  106 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgt 161  Q
    | | ||||| | |||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  22489727 tttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgt 22489782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5628655 - 5628500
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  5628655 tgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaaa 5628556  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5628555 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5628500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 9621 - 9999
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 9720  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9721 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 9820  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  9821 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 9920  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9921 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 9999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 9660 - 10022
Alignment:
Q  17 gccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggga 9759  T
Q  117 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  9760 agattgcaagctggcagatgctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 9859  T
Q  217 acctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaagga 316  Q
    |||| ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  9860 accttttgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattggtgaaggt 9959  T
Q  317 ccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9960 ccagatcccaatagcaagtggggactagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 10022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22848 - 22477
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22848 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaa 22749  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22748 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccg 22649  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || || | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22648 atcaccttgcttatcaacctcttgatgactatcaaccaattgaattcgacttcccagatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgtgaagaacc 22549  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22548 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 22477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 3666 - 4037
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3666 tgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaa 3765  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3766 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 3865  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3866 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaacc 3965  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3966 gttgatttatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtctagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 4037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11585 - 11214
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11585 tgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaa 11486  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11485 gctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 11386  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11385 atcatcttgcttaccaacctcttgatgattatcaaccaattgagttcgacttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 11286  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | | |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11285 gttaattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 11214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5814 - 5458
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  5814 cgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattg 5715  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  5714 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 5615  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  5614 tgatgattaccaaccaattgagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaaccgttgattgatgaaggtccagat 5515  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5514 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10296
Alignment:
Q  248 gatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtct 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10427 gatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtct 10328  T
Q  348 tcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10327 ttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 10296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12583 - 12452
Alignment:
Q  248 gatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtct 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12583 gatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaaccgttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtct 12484  T
Q  348 tcgatggtgctgtcaacgcttatggctaagga 379  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12483 ttgatggtgctgtcaatgcttatggcaaagga 12452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11919
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548 tgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 11647  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11648 gcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccg 11747  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11748 atcaccttgcttatcaacctcttgatgattaccaaccaattgaatttgatttccctgatgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgacgaacc 11847  T
Q  301 gctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11848 gttgattaatgaaggtccagatcccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgttaatgcttatgg 11919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Original strand, 13192 - 13541
Alignment:
Q  23 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  13192 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggcggccgttactgggaagattg 13291  T
Q  123 cacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctct 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13292 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 13391  T
Q  223 tgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaaccgctgattggtgaaggaccagat 322  Q
    |||||| ||||| || | | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  13392 tgatgattaccaaccaattgaattcgatttccccgacgaagagatcatgtatttgaaatccaaagactgcgaagaaccgttgattaatgaaggtccagat 13491  T
Q  323 cctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13492 cccaatagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 371
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2251
Alignment:
Q  102 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt---cttgc 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  199 tgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatcaaaagactgtgaagaa 298  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccaaccaattaagttcgatttccccgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaagactgcgaagaa 2178  T
Q  299 ccgctgattggtgaaggaccagatcctaatagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatg 371  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2179 ccgttgattggtgaaggtccagatcccaatagcaagtggggattagtctttgatggtgctgtcaatgcttatg 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118721
Alignment:
Q  45 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  145 tgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagccgaataag 244  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || | ||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgattaccgaccaattaag 118747  T
Q  245 ttcgatttccccgatgaggagatcat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  118746 ttcgatttccccgatgaagagatcat 118721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 5125
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||     
T  5328 tgctctagcctgggctgccaaacgccttcgtcattacctggtaaatcatactacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatcttcgagaag 5229  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5228 cctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccg 5129  T
Q  201 atca 204  Q
    ||||    
T  5128 atca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 42990
Alignment:
Q  25 cctgcgtc-attatttggt-gaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagt-atatctttgag-aaagctgctgttactgggaagat 120  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43354 cctgcgtctattatttggttgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagat 43255  T
Q  121 tgcacgctggcagatgc-tcttgtctgaatat-gatattgtgttc-aaaactc-aaaaggcaatcaaaggtagc--attcttgctgatca-ccttgctta 213  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||||    
T  43254 tgcacgttggcagatgctttttgtctgaatatagatattgtgttcaaaaactcaaaaaggcaatcaaaggtagctatttcttgccgatcattcttgctta 43155  T
Q  214 tcaacctc-ttgatgagt--accagccgaataagttcgatttccccgatgaggagatcatgtatttgaaatc-aaaagactgtgaagaaccgct-gattg 308  Q
     ||||||| ||||||| |   | | || | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||    
T  43154 ccaacctctttgatgatttatcaaaccaattgagttcgatttcctcgatgaagagatcatgtatttgaaatcaaaaagactgcgaagaaccgttaggttg 43055  T
Q  309 gtgaaggaccagatcctaa-tagcaaatggggattagtcttcgatggtgctgtcaacgcttatgg 372  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43054 gtgaaggtccagatcctaattagcaagtggggtttagtctttgatggtgctgtcaatgcttatgg 42990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 10825 - 10972
Alignment:
Q  9 cttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  10825 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 10924  T
Q  109 tactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatat 156  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  10925 aactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 10972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34897 - 34661
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  34897 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaag 34798  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | |||| |  | ||||||||||| || || || |||||||||| || | |  |||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  34797 cccgctttgacaggaaggatttcctggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccattctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgctg 34698  T
Q  201 atcaccttgcttatcaacctcttgatgagtaccagcc 237  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  34697 atcacctggctcaccaaccacttgaagactaccagcc 34661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4969
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5067 tgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 29769 - 29973
Alignment:
Q  1 tgctctagcttgggctgccaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | ||||||||| || | ||| || ||||||||     
T  29769 tgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaggtacatatttgagaag 29868  T
Q  101 gctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctg 200  Q
     | ||| | || || | ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  29869 cccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtaccgttcccagaaggcaattaaaggcagtattcttgctg 29968  T
Q  201 atcac 205  Q
    |||||    
T  29969 atcac 29973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University