View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12943_low_24 (Length: 496)

Name: NF12943_low_24
Description: NF12943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12943_low_24
NF12943_low_24
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (19-496)||(16931831-16932308)
chr4 (19-496)||(16934185-16934662)
chr4 (19-496)||(22782780-22783265)
chr4 (19-496)||(22780415-22780900)
chr4 (19-496)||(9176516-9176983)
chr4 (19-491)||(18846982-18847444)
chr4 (19-340)||(48486289-48486610)
chr4 (19-312)||(38928219-38928513)
chr4 (19-340)||(5198390-5198711)
chr4 (76-491)||(11008664-11009075)
chr4 (19-340)||(24888766-24889087)
chr4 (19-340)||(47274697-47275017)
chr4 (27-340)||(22802784-22803097)
chr4 (19-336)||(40091457-40091774)
chr4 (19-313)||(40637071-40637365)
chr4 (19-313)||(14633317-14633609)
chr4 (19-340)||(22800904-22801225)
chr4 (19-313)||(619489-619783)
chr4 (19-336)||(24878963-24879281)
chr4 (19-312)||(19095880-19096174)
chr4 (27-340)||(9174196-9174509)
chr4 (19-340)||(24880421-24880743)
chr4 (19-313)||(14787473-14787769)
chr4 (19-340)||(9148221-9148543)
chr4 (19-340)||(36919626-36919950)
chr4 (19-340)||(36921535-36921858)
chr4 (19-313)||(44599880-44600174)
chr4 (19-340)||(11434925-11435245)
chr4 (19-340)||(51015216-51015536)
chr4 (36-340)||(5637524-5637832)
chr4 (19-313)||(8631461-8631759)
chr4 (19-312)||(12395887-12396180)
chr4 (19-340)||(22044433-22044753)
chr4 (19-340)||(22046728-22047048)
chr4 (19-311)||(33415530-33415821)
chr4 (19-313)||(36378289-36378584)
chr4 (40-311)||(56030443-56030714)
chr4 (19-313)||(47868398-47868692)
chr4 (19-312)||(12400849-12401142)
chr4 (19-311)||(13543953-13544250)
chr4 (19-340)||(37089414-37089737)
chr4 (18-311)||(37313106-37313400)
chr4 (19-313)||(6764836-6765135)
chr4 (19-313)||(24348211-24348509)
chr4 (33-313)||(16453306-16453587)
chr4 (19-340)||(38409169-38409495)
chr4 (19-340)||(7941289-7941614)
chr4 (36-340)||(3824629-3824936)
chr4 (19-313)||(2484915-2485209)
chr4 (19-340)||(11006279-11006604)
chr4 (19-313)||(17662287-17662574)
chr4 (19-340)||(31849641-31849962)
chr4 (42-306)||(19322701-19322961)
chr4 (27-308)||(41997494-41997776)
chr4 (19-313)||(22132434-22132735)
chr4 (82-312)||(3937314-3937543)
chr4 (19-272)||(18709206-18709458)
chr4 (19-312)||(18537516-18537806)
chr4 (76-244)||(26086075-26086243)
chr4 (47-340)||(52942528-52942810)
chr4 (93-312)||(6132871-6133089)
chr4 (55-312)||(18409425-18409681)
chr4 (19-313)||(47210794-47211082)
chr4 (42-313)||(8756317-8756586)
chr4 (19-272)||(22134659-22134909)
chr4 (42-234)||(36380425-36380617)
chr4 (45-312)||(18534901-18535164)
chr4 (81-313)||(53405124-53405358)
chr4 (19-195)||(16455355-16455533)
chr4 (18-227)||(27499128-27499335)
chr4 (148-312)||(38270158-38270321)
chr4 (148-312)||(24446756-24446914)
chr4 (355-496)||(9174491-9174633)
chr4 (19-161)||(13547302-13547445)
chr4 (359-496)||(11006590-11006728)
chr4 (42-230)||(38890291-38890476)
chr4 (42-313)||(15032614-15032872)
chr4 (177-313)||(5100994-5101129)
chr4 (403-496)||(51015092-51015185)
chr4 (197-312)||(2891314-2891430)
chr4 (363-496)||(37089727-37089862)
chr4 (33-164)||(2891436-2891569)
chr4 (33-222)||(30136640-30136827)
chr4 (363-496)||(31849952-31850086)
chr4 (42-311)||(28453686-28453950)
chr4 (403-496)||(22044783-22044878)
chr4 (363-496)||(36919940-36920074)
chr4 (19-174)||(12102221-12102379)
chr4 (99-306)||(9863712-9863917)
chr4 (98-305)||(10112876-10113080)
chr4 (403-496)||(22803127-22803220)
chr4 (97-311)||(40999071-40999281)
chr4 (19-127)||(4215489-4215597)
chr4 (363-462)||(38409079-38409179)
chr4 (19-113)||(5635518-5635612)
chr4 (363-496)||(5637822-5637954)
chr4 (431-496)||(7941185-7941251)
chr4 (431-496)||(11434821-11434887)
chr4 (363-496)||(3824926-3825060)
chr4 (407-496)||(36921893-36921982)
chr4 (363-462)||(5198300-5198400)
chr4 (363-462)||(24888676-24888776)
chr4 (19-113)||(11437560-11437653)
chr4 (19-174)||(31983569-31983727)
chr4 (97-253)||(9022365-9022516)
chr4 (410-462)||(9148140-9148192)
chr4 (218-313)||(16186079-16186173)
chr4 (19-67)||(24446683-24446731)
chr4 (97-253)||(47151015-47151164)
chr4 (403-461)||(22047078-22047135)
chr4 (108-313)||(25357634-25357838)
chr4 (21-109)||(5101130-5101218)
chr4 (218-312)||(12102088-12102182)
chr4 (131-201)||(10114437-10114505)
chr4 (97-158)||(16185956-16186018)
chr4 (363-495)||(48486166-48486299)
chr4 (378-455)||(47868288-47868365)
chr4 (19-159)||(3982218-3982362)
chr4 (241-313)||(16455284-16455356)
chr4 (131-201)||(38208839-38208908)
chr4 (283-313)||(22134936-22134966)
chr4 (431-496)||(22801262-22801327)
chr4 (403-444)||(619841-619882)
chr4 (378-455)||(16689303-16689380)
chr4 (379-451)||(4556422-4556494)
chr4 (464-496)||(22048491-22048523)
chr4 (33-88)||(49088791-49088847)
chr4 (284-312)||(52043737-52043765)
chr4 (403-443)||(52942841-52942881)
[»] chr5 (116 HSPs)
chr5 (19-496)||(31542494-31542971)
chr5 (19-491)||(31179413-31179897)
chr5 (19-496)||(31544850-31545317)
chr5 (19-340)||(21947943-21948263)
chr5 (19-340)||(25921515-25921836)
chr5 (34-313)||(10529156-10529435)
chr5 (19-340)||(2818377-2818699)
chr5 (19-312)||(17072827-17073121)
chr5 (19-340)||(4236545-4236866)
chr5 (19-310)||(18511254-18511547)
chr5 (19-312)||(25904047-25904340)
chr5 (19-313)||(39854427-39854720)
chr5 (19-340)||(38882021-38882342)
chr5 (19-312)||(24126800-24127093)
chr5 (19-310)||(18509360-18509652)
chr5 (36-338)||(16776075-16776377)
chr5 (19-272)||(25804009-25804262)
chr5 (272-488)||(15354777-15355005)
chr5 (272-488)||(15357053-15357281)
chr5 (19-340)||(2174835-2175155)
chr5 (275-488)||(10757020-10757245)
chr5 (33-340)||(36402384-36402690)
chr5 (42-312)||(34530731-34531001)
chr5 (33-313)||(37705836-37706116)
chr5 (42-313)||(40221465-40221736)
chr5 (19-309)||(10474365-10474655)
chr5 (36-313)||(26097676-26097952)
chr5 (21-339)||(12555967-12556285)
chr5 (269-488)||(23664894-23665125)
chr5 (269-488)||(23793462-23793693)
chr5 (36-313)||(18468950-18469231)
chr5 (42-313)||(18596590-18596859)
chr5 (276-488)||(10749565-10749767)
chr5 (39-311)||(18466625-18466901)
chr5 (33-313)||(6756437-6756716)
chr5 (27-272)||(16092249-16092495)
chr5 (19-340)||(21684494-21684824)
chr5 (98-312)||(20042994-20043208)
chr5 (94-312)||(20044954-20045172)
chr5 (38-340)||(31466040-31466341)
chr5 (269-488)||(23667169-23667400)
chr5 (19-312)||(39398035-39398327)
chr5 (36-313)||(27912473-27912756)
chr5 (45-312)||(1189677-1189949)
chr5 (27-312)||(31472662-31472948)
chr5 (19-272)||(6745053-6745305)
chr5 (39-313)||(27910388-27910667)
chr5 (284-496)||(34477379-34477580)
chr5 (34-304)||(2954368-2954638)
chr5 (19-313)||(6747247-6747541)
chr5 (36-305)||(17818549-17818817)
chr5 (19-234)||(658395-658610)
chr5 (19-272)||(34477095-34477349)
chr5 (19-272)||(34479460-34479714)
chr5 (19-272)||(15552229-15552482)
chr5 (19-312)||(695833-696115)
chr5 (105-313)||(26098379-26098587)
chr5 (55-307)||(6661264-6661512)
chr5 (19-175)||(20505883-20506040)
chr5 (19-313)||(10586782-10587068)
chr5 (269-424)||(38960334-38960501)
chr5 (19-188)||(41585786-41585956)
chr5 (19-305)||(21288715-21288998)
chr5 (363-496)||(38881897-38882031)
chr5 (42-311)||(9020167-9020432)
chr5 (179-313)||(20507665-20507798)
chr5 (19-188)||(4410090-4410259)
chr5 (19-193)||(2723964-2724130)
chr5 (19-175)||(39798127-39798284)
chr5 (42-269)||(20053834-20054049)
chr5 (284-496)||(34479740-34479920)
chr5 (216-313)||(4410000-4410101)
chr5 (269-368)||(23742057-23742157)
chr5 (19-159)||(10757273-10757413)
chr5 (18-312)||(36208524-36208815)
chr5 (19-159)||(10749796-10749937)
chr5 (27-159)||(3373187-3373320)
chr5 (431-496)||(2174732-2174797)
chr5 (431-488)||(38960487-38960544)
chr5 (403-496)||(4236422-4236515)
chr5 (360-457)||(21684811-21684909)
chr5 (431-494)||(25921874-25921938)
chr5 (217-313)||(41585946-41586042)
chr5 (97-201)||(17413288-17413391)
chr5 (19-159)||(23665140-23665280)
chr5 (19-159)||(23793307-23793447)
chr5 (41-127)||(42770939-42771025)
chr5 (403-462)||(16775983-16776042)
chr5 (19-159)||(15354617-15354757)
chr5 (19-159)||(15356893-15357033)
chr5 (19-159)||(38960174-38960314)
chr5 (268-313)||(3373332-3373377)
chr5 (98-313)||(42770717-42770924)
chr5 (431-496)||(39797901-39797966)
chr5 (97-253)||(4754162-4754312)
chr5 (19-152)||(23741901-23742034)
chr5 (286-340)||(39798004-39798058)
chr5 (378-455)||(4409890-4409967)
chr5 (42-173)||(15143547-15143680)
chr5 (102-253)||(29748355-29748502)
chr5 (413-493)||(659850-659929)
chr5 (378-455)||(39854317-39854394)
chr5 (19-67)||(26098331-26098379)
chr5 (431-496)||(659765-659829)
chr5 (97-173)||(35430259-35430338)
chr5 (131-253)||(2144720-2144837)
chr5 (262-312)||(2723911-2723961)
chr5 (284-313)||(2144899-2144928)
chr5 (378-455)||(6744894-6744971)
chr5 (378-455)||(6747137-6747214)
chr5 (284-313)||(15552178-15552207)
chr5 (284-313)||(25803959-25803988)
chr5 (96-155)||(4897828-4897888)
chr5 (284-312)||(29748285-29748313)
chr5 (131-201)||(34033725-34033794)
chr5 (379-455)||(42238047-42238123)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (19-496)||(1046967-1047451)
chr7 (33-312)||(4295990-4296271)
chr7 (36-340)||(35555-35859)
chr7 (19-340)||(27306272-27306592)
chr7 (270-488)||(2935130-2935349)
chr7 (33-312)||(21679981-21680260)
chr7 (19-312)||(44724533-44724826)
chr7 (36-312)||(11355212-11355488)
chr7 (19-312)||(20137150-20137444)
chr7 (27-313)||(42331047-42331335)
chr7 (19-340)||(1049338-1049658)
chr7 (36-340)||(44490-44794)
chr7 (19-313)||(13099516-13099812)
chr7 (18-312)||(39146027-39146322)
chr7 (19-312)||(42223110-42223405)
chr7 (19-312)||(9680768-9681067)
chr7 (33-312)||(21678020-21678299)
chr7 (42-312)||(25276095-25276365)
chr7 (42-311)||(37412191-37412462)
chr7 (269-488)||(22136938-22137169)
chr7 (19-313)||(38393935-38394233)
chr7 (269-488)||(40551965-40552196)
chr7 (19-311)||(9679009-9679306)
chr7 (19-334)||(31435088-31435404)
chr7 (19-340)||(3878497-3878824)
chr7 (19-313)||(443548-443842)
chr7 (19-312)||(24748548-24748842)
chr7 (269-488)||(9027396-9027627)
chr7 (269-488)||(22107927-22108158)
chr7 (269-488)||(40549687-40549918)
chr7 (19-313)||(48457602-48457900)
chr7 (19-279)||(21592185-21592445)
chr7 (19-311)||(21990106-21990397)
chr7 (19-313)||(31155953-31156247)
chr7 (19-340)||(40836785-40837105)
chr7 (36-313)||(11757177-11757460)
chr7 (36-313)||(20299407-20299690)
chr7 (36-310)||(7470081-7470359)
chr7 (19-313)||(20297311-20297609)
chr7 (36-310)||(7472039-7472317)
chr7 (19-310)||(20625990-20626285)
chr7 (19-310)||(20629881-20630176)
chr7 (19-310)||(20642300-20642595)
chr7 (36-338)||(25542459-25542758)
chr7 (34-313)||(28487502-28487785)
chr7 (36-313)||(18345490-18345771)
chr7 (76-340)||(26804499-26804762)
chr7 (36-313)||(40946277-40946558)
chr7 (19-313)||(3035670-3035971)
chr7 (27-312)||(27832682-27832969)
chr7 (34-313)||(28485515-28485798)
chr7 (19-313)||(22828674-22828969)
chr7 (42-306)||(24258423-24258687)
chr7 (19-313)||(7349315-7349615)
chr7 (19-313)||(7351694-7351994)
chr7 (19-272)||(1849975-1850228)
chr7 (36-313)||(43253576-43253860)
chr7 (76-313)||(22251649-22251878)
chr7 (147-334)||(18567545-18567731)
chr7 (41-313)||(20091609-20091877)
chr7 (42-313)||(7188496-7188763)
chr7 (19-196)||(7092254-7092432)
chr7 (42-310)||(24817419-24817682)
chr7 (19-196)||(7094502-7094679)
chr7 (42-311)||(24465503-24465760)
chr7 (42-237)||(24813564-24813755)
chr7 (126-340)||(22392399-22392600)
chr7 (36-175)||(38396725-38396864)
chr7 (19-159)||(2935374-2935515)
chr7 (217-310)||(7092414-7092512)
chr7 (431-494)||(40837144-40837207)
chr7 (19-159)||(1606486-1606626)
chr7 (403-496)||(25542332-25542425)
chr7 (217-310)||(7094662-7094759)
chr7 (19-159)||(9027236-9027376)
chr7 (19-159)||(22137184-22137324)
chr7 (19-159)||(40552211-40552351)
chr7 (264-313)||(1606423-1606472)
chr7 (363-494)||(27306582-27306714)
chr7 (205-266)||(38396316-38396377)
chr7 (97-253)||(11081525-11081675)
chr7 (403-462)||(3878408-3878467)
chr7 (403-461)||(44401-44459)
chr7 (19-159)||(22108173-22108313)
chr7 (27-112)||(22393876-22393962)
chr7 (19-159)||(40549933-40550073)
chr7 (97-253)||(6048888-6049039)
chr7 (42-127)||(6348921-6349006)
chr7 (363-462)||(35465-35565)
chr7 (42-313)||(6332179-6332444)
chr7 (98-173)||(16297146-16297222)
chr7 (33-127)||(26295586-26295681)
chr7 (97-201)||(11084441-11084544)
chr7 (269-313)||(1849918-1849962)
chr7 (180-306)||(6348778-6348903)
chr7 (97-312)||(26210500-26210710)
chr7 (206-313)||(30906280-30906386)
chr7 (244-311)||(3677235-3677301)
chr7 (97-158)||(21369642-21369703)
chr7 (403-496)||(18567415-18567508)
chr7 (431-496)||(26804397-26804462)
chr7 (403-496)||(31435441-31435534)
chr7 (284-313)||(38396239-38396268)
chr7 (378-455)||(40946167-40946244)
[»] chr3 (149 HSPs)
chr3 (19-496)||(50493728-50494216)
chr3 (19-496)||(6063486-6063954)
chr3 (19-496)||(38210119-38210587)
chr3 (19-491)||(25388654-25389122)
chr3 (19-313)||(4308321-4308615)
chr3 (19-340)||(45882835-45883156)
chr3 (19-357)||(38889918-38890257)
chr3 (33-312)||(43423517-43423796)
chr3 (75-340)||(35777317-35777583)
chr3 (19-340)||(11170300-11170621)
chr3 (19-341)||(6065836-6066159)
chr3 (19-340)||(18099210-18099531)
chr3 (19-340)||(18096940-18097262)
chr3 (19-340)||(24979603-24979925)
chr3 (19-313)||(53917704-53917998)
chr3 (19-312)||(1626723-1627016)
chr3 (19-340)||(10956067-10956388)
chr3 (19-336)||(12268015-12268323)
chr3 (258-496)||(53896475-53896702)
chr3 (19-313)||(1313333-1313626)
chr3 (19-313)||(51943294-51943587)
chr3 (19-312)||(880491-880785)
chr3 (19-340)||(48361711-48362031)
chr3 (36-340)||(3859424-3859727)
chr3 (19-312)||(3314608-3314902)
chr3 (19-340)||(10958363-10958684)
chr3 (34-340)||(22114360-22114666)
chr3 (33-311)||(43421469-43421747)
chr3 (19-313)||(51727047-51727340)
chr3 (19-313)||(53915536-53915830)
chr3 (19-312)||(28102042-28102335)
chr3 (19-272)||(30005805-30006058)
chr3 (36-340)||(5191549-5191852)
chr3 (19-313)||(43226009-43226302)
chr3 (19-313)||(43228214-43228508)
chr3 (77-306)||(6561740-6561969)
chr3 (19-340)||(18162560-18162881)
chr3 (19-340)||(26720444-26720764)
chr3 (19-313)||(27101221-27101519)
chr3 (19-340)||(10084429-10084754)
chr3 (19-272)||(29956650-29956903)
chr3 (19-272)||(42990268-42990521)
chr3 (19-312)||(47148935-47149233)
chr3 (19-313)||(28761468-28761762)
chr3 (19-313)||(35917983-35918283)
chr3 (27-312)||(889821-890104)
chr3 (19-340)||(32264077-32264404)
chr3 (19-312)||(5926804-5927097)
chr3 (19-313)||(25533357-25533659)
chr3 (19-312)||(36011751-36012044)
chr3 (19-312)||(54691614-54691906)
chr3 (19-312)||(53468495-53468788)
chr3 (36-313)||(4103953-4104233)
chr3 (81-312)||(28100143-28100374)
chr3 (19-313)||(455826-456124)
chr3 (19-313)||(458203-458501)
chr3 (19-313)||(746674-746974)
chr3 (41-313)||(39715393-39715664)
chr3 (19-311)||(51674806-51675087)
chr3 (19-313)||(9604647-9604946)
chr3 (19-336)||(10191350-10191670)
chr3 (279-496)||(5899511-5899717)
chr3 (19-340)||(5522667-5522976)
chr3 (19-272)||(10621570-10621823)
chr3 (76-340)||(15780756-15781031)
chr3 (75-312)||(28180948-28181183)
chr3 (19-340)||(32218991-32219302)
chr3 (279-493)||(5886039-5886242)
chr3 (45-312)||(31151271-31151534)
chr3 (19-232)||(1321483-1321696)
chr3 (19-246)||(28413072-28413299)
chr3 (178-340)||(11163046-11163207)
chr3 (19-313)||(23633383-23633671)
chr3 (33-312)||(53591119-53591387)
chr3 (19-223)||(6484372-6484577)
chr3 (45-313)||(13420252-13420506)
chr3 (94-312)||(28137421-28137628)
chr3 (27-313)||(53597164-53597446)
chr3 (129-313)||(42992205-42992392)
chr3 (59-311)||(23636952-23637200)
chr3 (42-312)||(54884081-54884348)
chr3 (19-311)||(27635698-27635959)
chr3 (19-273)||(4666488-4666734)
chr3 (143-271)||(41849117-41849244)
chr3 (19-184)||(25688200-25688367)
chr3 (42-265)||(561840-562058)
chr3 (19-214)||(7606628-7606822)
chr3 (131-340)||(24177175-24177380)
chr3 (182-311)||(6231374-6231502)
chr3 (42-229)||(17795269-17795452)
chr3 (42-229)||(19103709-19103892)
chr3 (181-312)||(47701798-47701928)
chr3 (363-496)||(22114656-22114790)
chr3 (264-357)||(6719396-6719489)
chr3 (42-229)||(25635391-25635575)
chr3 (42-187)||(6231849-6231994)
chr3 (363-496)||(18099521-18099655)
chr3 (239-340)||(1321337-1321438)
chr3 (76-313)||(1673898-1674132)
chr3 (19-174)||(5886261-5886415)
chr3 (19-174)||(5899734-5899888)
chr3 (97-306)||(36871420-36871624)
chr3 (197-311)||(3306724-3306838)
chr3 (19-171)||(11168165-11168318)
chr3 (431-496)||(35777215-35777280)
chr3 (96-313)||(4560401-4560599)
chr3 (363-489)||(10956378-10956505)
chr3 (33-157)||(3306839-3306965)
chr3 (359-425)||(6066144-6066210)
chr3 (363-496)||(5191425-5191559)
chr3 (431-490)||(6066195-6066254)
chr3 (19-109)||(47701711-47701801)
chr3 (431-496)||(38889810-38889875)
chr3 (363-446)||(3859350-3859434)
chr3 (419-496)||(10085481-10085557)
chr3 (419-496)||(10192401-10192477)
chr3 (363-455)||(10958674-10958767)
chr3 (431-496)||(11162943-11163008)
chr3 (363-462)||(1321247-1321347)
chr3 (363-462)||(5522966-5523066)
chr3 (124-242)||(13419878-13419990)
chr3 (433-496)||(11170197-11170260)
chr3 (131-229)||(25633930-25634024)
chr3 (403-462)||(26720354-26720413)
chr3 (42-127)||(24181489-24181574)
chr3 (97-201)||(14634561-14634663)
chr3 (97-173)||(1620580-1620657)
chr3 (417-496)||(18097291-18097370)
chr3 (363-493)||(32264394-32264526)
chr3 (97-173)||(11066652-11066731)
chr3 (401-455)||(45882752-45882806)
chr3 (378-455)||(4308648-4308725)
chr3 (248-313)||(6484308-6484373)
chr3 (218-313)||(1618896-1618992)
chr3 (274-313)||(25690651-25690690)
chr3 (282-340)||(13893289-13893347)
chr3 (34-88)||(42992418-42992472)
chr3 (431-468)||(6719532-6719569)
chr3 (146-191)||(7606828-7606873)
chr3 (463-496)||(7606878-7606911)
chr3 (284-313)||(10621847-10621876)
chr3 (378-455)||(27101627-27101704)
chr3 (133-196)||(31021300-31021362)
chr3 (282-311)||(31021450-31021479)
chr3 (378-455)||(35918316-35918393)
chr3 (284-313)||(42990205-42990234)
chr3 (378-451)||(43228108-43228181)
chr3 (133-173)||(7768632-7768672)
chr3 (277-313)||(27101558-27101594)
[»] chr1 (117 HSPs)
chr1 (19-496)||(47179480-47179950)
chr1 (19-496)||(16225939-16226404)
chr1 (19-496)||(47177130-47177599)
chr1 (19-312)||(50307590-50307884)
chr1 (19-340)||(10399872-10400193)
chr1 (19-340)||(41646836-41647157)
chr1 (19-340)||(51749955-51750276)
chr1 (19-313)||(12302549-12302848)
chr1 (19-340)||(6822931-6823251)
chr1 (19-340)||(13214997-13215323)
chr1 (33-313)||(28998311-28998591)
chr1 (33-313)||(29004027-29004307)
chr1 (41-340)||(38925544-38925843)
chr1 (19-313)||(6995744-6996038)
chr1 (19-340)||(28207112-28207431)
chr1 (19-312)||(2617460-2617753)
chr1 (19-340)||(15823462-15823783)
chr1 (19-313)||(2949275-2949569)
chr1 (19-313)||(17324680-17324974)
chr1 (19-312)||(11457519-11457812)
chr1 (36-340)||(13761753-13762056)
chr1 (19-311)||(18307054-18307347)
chr1 (33-313)||(31422930-31423212)
chr1 (19-313)||(47906207-47906507)
chr1 (19-313)||(9241129-9241424)
chr1 (19-334)||(14098013-14098329)
chr1 (19-340)||(28840594-28840916)
chr1 (19-310)||(39932017-39932310)
chr1 (76-313)||(20302402-20302639)
chr1 (19-340)||(39462435-39462756)
chr1 (19-313)||(6756470-6756764)
chr1 (19-313)||(16428596-16428891)
chr1 (33-336)||(3579675-3579979)
chr1 (19-310)||(21948232-21948526)
chr1 (19-291)||(31425058-31425335)
chr1 (27-336)||(28842413-28842723)
chr1 (76-340)||(6823800-6824072)
chr1 (33-312)||(50248630-50248909)
chr1 (19-312)||(31489859-31490150)
chr1 (42-312)||(50076739-50077009)
chr1 (33-340)||(47451564-47451865)
chr1 (18-312)||(18839531-18839826)
chr1 (42-312)||(17186195-17186465)
chr1 (19-311)||(17318838-17319125)
chr1 (34-313)||(24325599-24325885)
chr1 (36-313)||(48665114-48665398)
chr1 (42-312)||(50078888-50079158)
chr1 (33-311)||(25251332-25251611)
chr1 (19-310)||(15294878-15295183)
chr1 (76-313)||(20291400-20291637)
chr1 (19-340)||(51752281-51752600)
chr1 (274-445)||(23783362-23783533)
chr1 (19-313)||(31735565-31735863)
chr1 (19-313)||(9459461-9459761)
chr1 (19-313)||(9463288-9463588)
chr1 (19-272)||(25127856-25128110)
chr1 (19-313)||(2510369-2510666)
chr1 (216-424)||(16231444-16231641)
chr1 (19-313)||(27336984-27337280)
chr1 (19-263)||(40133937-40134182)
chr1 (19-264)||(46431752-46431996)
chr1 (36-313)||(27339192-27339472)
chr1 (33-312)||(17324009-17324287)
chr1 (42-313)||(42922177-42922444)
chr1 (19-272)||(4131419-4131676)
chr1 (42-312)||(14183659-14183923)
chr1 (45-313)||(8347343-8347607)
chr1 (34-313)||(18800631-18800907)
chr1 (42-311)||(8349119-8349385)
chr1 (33-313)||(49495268-49495537)
chr1 (19-265)||(16432396-16432632)
chr1 (76-313)||(15669495-15669729)
chr1 (363-496)||(6823675-6823810)
chr1 (363-496)||(51752156-51752291)
chr1 (363-496)||(51749830-51749965)
chr1 (20-188)||(25248596-25248766)
chr1 (33-176)||(6115160-6115305)
chr1 (19-188)||(16231630-16231800)
chr1 (363-496)||(20302250-20302385)
chr1 (363-496)||(13761629-13761763)
chr1 (19-170)||(16429042-16429195)
chr1 (97-306)||(26520236-26520449)
chr1 (42-306)||(13125525-13125787)
chr1 (19-159)||(23785935-23786076)
chr1 (217-311)||(25248756-25248850)
chr1 (431-496)||(16231393-16231458)
chr1 (427-488)||(23783298-23783359)
chr1 (19-163)||(51757623-51757767)
chr1 (97-313)||(27916440-27916653)
chr1 (431-496)||(6822827-6822893)
chr1 (97-173)||(155788-155865)
chr1 (363-462)||(10400183-10400283)
chr1 (363-496)||(28840470-28840604)
chr1 (408-492)||(28842289-28842373)
chr1 (19-340)||(30790444-30790759)
chr1 (404-462)||(15823372-15823430)
chr1 (39-113)||(23816029-23816103)
chr1 (97-173)||(26613363-26613440)
chr1 (42-233)||(28279292-28279480)
chr1 (40-173)||(30738695-30738830)
chr1 (42-175)||(16561546-16561681)
chr1 (378-455)||(13449919-13449996)
chr1 (180-306)||(13127837-13127959)
chr1 (99-173)||(26332613-26332688)
chr1 (363-441)||(28207421-28207500)
chr1 (363-461)||(30790749-30790848)
chr1 (443-496)||(20291332-20291386)
chr1 (261-313)||(16431044-16431096)
chr1 (131-253)||(26332719-26332833)
chr1 (240-279)||(6115344-6115383)
chr1 (97-173)||(14353047-14353126)
chr1 (241-312)||(26613503-26613577)
chr1 (97-158)||(4144804-4144865)
chr1 (363-424)||(6822879-6822941)
chr1 (97-158)||(14997040-14997101)
chr1 (284-313)||(43104102-43104131)
chr1 (284-313)||(46432037-46432066)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (19-488)||(5987-6445)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (19-496)||(43081774-43082266)
chr8 (19-496)||(18810535-18811000)
chr8 (19-496)||(18812720-18813174)
chr8 (19-462)||(44720704-44721136)
chr8 (19-340)||(14807723-14808044)
chr8 (33-313)||(1225165-1225446)
chr8 (36-340)||(4423990-4424294)
chr8 (27-313)||(27911014-27911299)
chr8 (27-313)||(27957433-27957718)
chr8 (19-313)||(41384744-41385037)
chr8 (19-340)||(27826958-27827278)
chr8 (19-340)||(27829269-27829589)
chr8 (284-496)||(43079399-43079614)
chr8 (19-336)||(15072686-15073004)
chr8 (19-340)||(15067953-15068274)
chr8 (19-313)||(32339304-32339602)
chr8 (19-312)||(30480545-30480838)
chr8 (21-312)||(27106941-27107232)
chr8 (19-340)||(28251609-28251930)
chr8 (19-313)||(13858526-13858820)
chr8 (77-312)||(14477276-14477511)
chr8 (19-313)||(22684695-22685002)
chr8 (33-313)||(14419246-14419527)
chr8 (19-313)||(3874005-3874303)
chr8 (19-313)||(28283262-28283561)
chr8 (33-311)||(36865538-36865815)
chr8 (36-313)||(15809214-15809494)
chr8 (19-313)||(41382672-41382955)
chr8 (19-303)||(608735-609027)
chr8 (19-313)||(24873223-24873523)
chr8 (19-312)||(25952521-25952814)
chr8 (96-312)||(33541507-33541723)
chr8 (27-312)||(5372227-5372512)
chr8 (19-264)||(43079650-43079895)
chr8 (36-313)||(43530123-43530391)
chr8 (116-312)||(5622877-5623073)
chr8 (134-313)||(26775200-26775378)
chr8 (42-313)||(31162212-31162479)
chr8 (42-312)||(21482322-21482580)
chr8 (27-313)||(15185764-15186046)
chr8 (27-222)||(15956051-15956243)
chr8 (19-279)||(21480547-21480796)
chr8 (148-312)||(35872555-35872713)
chr8 (212-336)||(3886153-3886277)
chr8 (202-336)||(12517249-12517385)
chr8 (42-279)||(3005697-3005929)
chr8 (41-188)||(181622-181772)
chr8 (131-340)||(2468261-2468461)
chr8 (363-496)||(27826834-27826968)
chr8 (363-496)||(27829145-27829279)
chr8 (217-313)||(181536-181632)
chr8 (141-311)||(31035068-31035236)
chr8 (94-279)||(37214317-37214512)
chr8 (97-201)||(31573847-31573950)
chr8 (403-462)||(14807634-14807693)
chr8 (403-496)||(12517420-12517513)
chr8 (42-173)||(31578343-31578476)
chr8 (431-494)||(3886322-3886386)
chr8 (410-462)||(28251988-28252040)
chr8 (19-67)||(35872482-35872530)
chr8 (363-461)||(15067864-15067963)
chr8 (97-159)||(17847677-17847740)
chr8 (19-106)||(2468171-2468259)
chr8 (97-158)||(13985199-13985262)
chr8 (97-175)||(31035253-31035332)
chr8 (431-496)||(4423887-4423952)
chr8 (269-313)||(6375988-6376032)
chr8 (363-461)||(15072593-15072692)
chr8 (284-313)||(17847527-17847556)
chr8 (19-67)||(33541452-33541500)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (19-340)||(3922-4242)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (19-313)||(183683-183975)
scaffold0005 (19-313)||(51961-52257)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (19-491)||(4816273-4816749)
chr6 (20-340)||(15530166-15530485)
chr6 (19-312)||(3233772-3234065)
chr6 (19-340)||(9019877-9020198)
chr6 (19-340)||(11983071-11983392)
chr6 (19-313)||(1230291-1230585)
chr6 (19-355)||(20915398-20915736)
chr6 (268-496)||(26068590-26068830)
chr6 (19-313)||(28241363-28241657)
chr6 (19-312)||(3629906-3630199)
chr6 (27-312)||(13057173-13057459)
chr6 (268-496)||(26066319-26066559)
chr6 (19-310)||(3631979-3632271)
chr6 (19-313)||(3390357-3390652)
chr6 (33-340)||(15541196-15541503)
chr6 (36-305)||(14458826-14459093)
chr6 (19-340)||(15532723-15533044)
chr6 (47-312)||(25477253-25477518)
chr6 (19-338)||(14507218-14507536)
chr6 (75-340)||(30728926-30729191)
chr6 (19-340)||(32279948-32280269)
chr6 (264-488)||(29754983-29755219)
chr6 (19-313)||(12195557-12195851)
chr6 (279-491)||(33311011-33311235)
chr6 (279-491)||(33308742-33308966)
chr6 (19-312)||(13039733-13040027)
chr6 (36-313)||(30967176-30967456)
chr6 (83-340)||(19227514-19227771)
chr6 (19-307)||(19704609-19704905)
chr6 (19-313)||(2628928-2629226)
chr6 (38-313)||(30034664-30034943)
chr6 (19-272)||(26065005-26065254)
chr6 (19-272)||(26084974-26085223)
chr6 (19-312)||(24338488-24338783)
chr6 (42-312)||(22490618-22490889)
chr6 (18-313)||(3027894-3028186)
chr6 (29-312)||(12161609-12161889)
chr6 (27-313)||(26932612-26932906)
chr6 (44-306)||(17012029-17012287)
chr6 (165-340)||(1072066-1072240)
chr6 (34-312)||(14466312-14466581)
chr6 (33-279)||(15719666-15719901)
chr6 (166-312)||(32447505-32447651)
chr6 (197-340)||(8995430-8995573)
chr6 (19-253)||(16455467-16455698)
chr6 (182-313)||(17852520-17852650)
chr6 (19-170)||(1069760-1069913)
chr6 (166-305)||(13870612-13870749)
chr6 (19-191)||(5273258-5273431)
chr6 (401-496)||(8995307-8995402)
chr6 (401-496)||(9019754-9019849)
chr6 (403-496)||(19227803-19227896)
chr6 (403-496)||(14507569-14507664)
chr6 (19-174)||(12186113-12186271)
chr6 (97-312)||(19696420-19696633)
chr6 (19-201)||(15367123-15367303)
chr6 (42-175)||(26945258-26945393)
chr6 (19-159)||(26066166-26066307)
chr6 (19-159)||(29754751-29754892)
chr6 (19-159)||(33308988-33309128)
chr6 (145-313)||(15346369-15346524)
chr6 (36-159)||(33311257-33311380)
chr6 (363-456)||(11983382-11983476)
chr6 (19-159)||(26068437-26068578)
chr6 (202-312)||(10584105-10584210)
chr6 (97-201)||(20526896-20526999)
chr6 (97-201)||(22858075-22858178)
chr6 (378-455)||(26084818-26084895)
chr6 (363-462)||(30729181-30729281)
chr6 (240-313)||(12186330-12186405)
chr6 (99-173)||(11138423-11138499)
chr6 (269-313)||(18318004-18318048)
chr6 (97-172)||(28037851-28037927)
chr6 (403-462)||(15530516-15530575)
chr6 (33-113)||(15346525-15346605)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (36-340)||(19504405-19504708)
chr2 (19-312)||(19007560-19007853)
chr2 (19-336)||(22287378-22287695)
chr2 (19-340)||(27104691-27105010)
chr2 (76-340)||(40032157-40032421)
chr2 (33-312)||(28196557-28196836)
chr2 (19-340)||(42064407-42064727)
chr2 (36-340)||(13910104-13910407)
chr2 (19-313)||(45280026-45280321)
chr2 (19-313)||(42923551-42923847)
chr2 (19-340)||(21520735-21521058)
chr2 (19-340)||(6258858-6259178)
chr2 (269-488)||(36559067-36559298)
chr2 (19-312)||(17848365-17848653)
chr2 (36-311)||(19502070-19502345)
chr2 (19-340)||(6264190-6264508)
chr2 (55-311)||(15539553-15539809)
chr2 (19-340)||(24162265-24162575)
chr2 (19-313)||(42452702-42452994)
chr2 (269-488)||(45332384-45332615)
chr2 (19-313)||(23452279-23452577)
chr2 (19-340)||(43623622-43623931)
chr2 (19-272)||(45239019-45239271)
chr2 (33-312)||(17849037-17849317)
chr2 (33-312)||(14837193-14837467)
chr2 (42-312)||(11739625-11739895)
chr2 (76-309)||(3022086-3022319)
chr2 (19-312)||(31732818-31733100)
chr2 (33-312)||(44289123-44289403)
chr2 (18-312)||(11578149-11578439)
chr2 (77-304)||(34979679-34979906)
chr2 (19-313)||(35215628-35215932)
chr2 (19-272)||(35218005-35218258)
chr2 (269-445)||(36561344-36561532)
chr2 (27-340)||(18800363-18800665)
chr2 (158-340)||(22407591-22407772)
chr2 (146-312)||(22163117-22163282)
chr2 (76-272)||(38020162-38020348)
chr2 (19-311)||(20146650-20146941)
chr2 (33-313)||(22874061-22874330)
chr2 (19-181)||(5375388-5375550)
chr2 (27-222)||(28459239-28459435)
chr2 (403-496)||(19502405-19502498)
chr2 (403-496)||(19504739-19504832)
chr2 (177-313)||(5377630-5377769)
chr2 (42-313)||(17897311-17897578)
chr2 (363-496)||(24162565-24162700)
chr2 (363-496)||(27104567-27104701)
chr2 (410-488)||(36561539-36561617)
chr2 (55-201)||(27136203-27136349)
chr2 (98-340)||(35107192-35107427)
chr2 (93-188)||(38414197-38414291)
chr2 (19-159)||(36558906-36559047)
chr2 (19-159)||(36561183-36561324)
chr2 (19-159)||(45332223-45332364)
chr2 (19-119)||(22407496-22407596)
chr2 (97-175)||(40699429-40699508)
chr2 (77-313)||(37963039-37963263)
chr2 (97-253)||(43139359-43139509)
chr2 (218-311)||(38020064-38020157)
chr2 (363-496)||(21521048-21521182)
chr2 (403-462)||(42064317-42064376)
chr2 (363-456)||(13910397-13910491)
chr2 (241-313)||(12342673-12342746)
chr2 (97-159)||(17921769-17921833)
chr2 (19-106)||(7462990-7463077)
chr2 (42-158)||(20589763-20589881)
chr2 (97-158)||(28458949-28459011)
chr2 (363-455)||(6259168-6259261)
chr2 (19-96)||(22707795-22707872)
chr2 (269-311)||(20147040-20147082)
chr2 (117-201)||(27583479-27583562)
chr2 (99-174)||(26345661-26345738)
chr2 (42-159)||(15693974-15694094)
chr2 (363-462)||(22407762-22407862)
chr2 (19-66)||(22163064-22163111)
chr2 (97-173)||(30720732-30720811)
chr2 (97-158)||(2740941-2741002)
chr2 (97-173)||(34575230-34575308)
chr2 (431-496)||(43623968-43624033)
chr2 (264-313)||(40699229-40699278)
chr2 (284-312)||(20589581-20589609)
chr2 (27-91)||(23870957-23871021)
chr2 (284-340)||(28462593-28462649)
chr2 (99-201)||(35028606-35028707)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (19-312)||(79812-80105)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (19-313)||(41525-41819)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (36-340)||(14944-15248)
scaffold0131 (19-300)||(14424-14707)
scaffold0131 (363-462)||(14854-14954)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (36-340)||(69351-69658)
scaffold0025 (160-340)||(73207-73390)
scaffold0025 (149-192)||(73160-73203)
scaffold0025 (403-462)||(69688-69747)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (21-340)||(2805-3123)
scaffold0250 (363-496)||(2681-2815)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-310)||(79140-79431)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (19-313)||(11515-11809)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (269-488)||(21975-22206)
scaffold0140 (269-488)||(24250-24481)
scaffold0140 (19-159)||(22221-22361)
scaffold0140 (19-159)||(24496-24636)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (19-340)||(29086-29416)
scaffold0068 (360-457)||(29001-29099)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (362-496)||(12868-13002)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (34-313)||(1988-2272)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (19-272)||(34-287)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (42-313)||(15887-16154)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (42-312)||(85184-85453)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (85-312)||(35593-35819)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (42-311)||(16716-16981)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (42-303)||(1708-1958)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (202-313)||(1056-1167)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (19-195)||(1495-1671)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (59-306)||(4773-5016)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (97-158)||(57550-57613)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 16931831 - 16932308
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  16931831 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 16931929  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||    
T  16931930 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacagactctata 16932028  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16932029 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcct 16932128  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16932129 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgt 16932228  T
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932229 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 16932308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 16934185 - 16934662
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  16934185 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 16934283  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  16934284 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 16934382  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934383 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 16934482  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934483 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgacagcgcaccatcgt 16934582  T
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16934583 gccaggatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccatgttgcc 16934662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 22782780 - 22783265
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22782780 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 22782878  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  22782879 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 22782977  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa--------agtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 308  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||          || ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  22782978 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagta 22783077  T
Q  309 aaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22783078 aaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgc 22783177  T
Q  409 accatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783178 accatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 22783265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 22780415 - 22780900
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22780415 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtccca 22780513  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  22780514 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 22780612  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa--------agtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 308  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||          || ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780613 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagta 22780712  T
Q  309 aaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780713 aaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgc 22780812  T
Q  409 accatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780813 accatcgtgccacaatgagaccccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 22780900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 9176516 - 9176983
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  9176516 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9176614  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||    
T  9176615 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaag-agacaaactttata 9176713  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9176714 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaatgtctt 9176813  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcg 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||            | |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | | |||||||||||||    
T  9176814 gcttaaaaactgtaacaaatctgctttaaat-----------ttataacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatcg 9176902  T
Q  416 tgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176903 tgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 9176983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 18847444 - 18846982
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18847444 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 18847346  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  18847345 atctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 18847247  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18847246 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctt 18847147  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  |||  ||||||||||||    
T  18847146 gcttaaaatctgtaacaaatctgctttaaat-----------ttgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccccgcgagcgcaccatcg 18847058  T
Q  416 tgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacg 491  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  18847057 tgccacgatgcgaccccatcgtaccacgatttttccagtaccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacg 18846982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48486610 - 48486289
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48486610 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 48486511  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  48486510 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagataaactctatac 48486412  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  48486411 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 48486312  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  48486311 cttaaaatttggaacaaatctgc 48486289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 38928219 - 38928513
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928219 agagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 38928318  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38928319 atcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 38928418  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38928419 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaag 38928513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5198711 - 5198390
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5198711 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagcccca 5198612  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5198611 atctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 5198513  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  5198512 aaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 5198413  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  5198412 cttaaaatttggaacaaatctgc 5198390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 76 - 491
Target Start/End: Original strand, 11008664 - 11009075
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11008664 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11008763  T
Q  174 ccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc- 272  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  11008764 cccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 11008862  T
Q  273 ----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaa 368  Q
         ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||    
T  11008863 ctctcaaaatagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaat-----------ctgtaacaaa 11008950  T
Q  369 tctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaa 466  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||  | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11008951 tctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagtgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaa 11009050  T
Q  467 aaactaaaacctccatcgtgccacg 491  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||    
T  11009051 aaattgaaacctccattgtgccacg 11009075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24889087 - 24888766
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  24889087 agagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 24888988  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24888987 gtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 24888889  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24888888 aatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattg 24888789  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  24888788 cttaaaatttggaacaaatctgc 24888766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47275017 - 47274697
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47275017 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 47274918  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
       |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  47274917 gcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagtt-ccaaagagacaaact-tatac 47274820  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47274819 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattg 47274720  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  47274719 cttaaaatttgaaacaaatctgc 47274697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 340
Target Start/End: Original strand, 22802784 - 22803097
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  22802784 cctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 22802883  T
Q  127 c-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802884 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaacccta 22802982  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaat 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22802983 gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaat 22803082  T
Q  326 ctgtaacaaatctgc 340  Q
     || |||||||||||    
T  22803083 ttggaacaaatctgc 22803097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Original strand, 40091457 - 40091774
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40091457 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 40091556  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  40091557 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctaaac 40091655  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  40091656 aatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 40091755  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    |||||||| || |||||||    
T  40091756 cttaaaatttggaacaaat 40091774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40637365 - 40637071
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  40637365 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 40637266  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40637265 atctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 40637167  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40637166 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 40637071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14633609 - 14633317
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14633609 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 14633510  T
Q  119 atctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14633509 atctcttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctataca 14633411  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14633410 aactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 14633317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 22800904 - 22801225
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  22800904 agagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 22801003  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22801004 gcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 22801102  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  22801103 aaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 22801202  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  22801203 cttaaaatttgaaacaaatctgc 22801225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 619489 - 619783
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  619489 agagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagaccca 619588  T
Q  119 atctcttccgt-aaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  619589 atctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatgc 619687  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619688 aaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 619783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24879281 - 24878963
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  24879281 agagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 24879182  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24879181 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 24879083  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||       
T  24879082 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagccccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 24878983  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24878982 gcttaaaatttggaacaaat 24878963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19096174 - 19095880
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  19096174 agagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctcta 19096075  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19096074 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 19095975  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19095974 aaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 19095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 340
Target Start/End: Original strand, 9174196 - 9174509
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9174196 cctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttc 9174294  T
Q  127 c-gtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9174295 ccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctatacaaaccct 9174393  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaa 324  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9174394 agttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaa 9174493  T
Q  325 tctgtaacaaatctgc 340  Q
     |||||||||||||||    
T  9174494 actgtaacaaatctgc 9174509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24880743 - 24880421
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  24880743 agagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 24880644  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24880643 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 24880545  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||       
T  24880544 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgccccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 24880445  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  24880444 gcttaaaatttggaacaaatctgc 24880421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 14787473 - 14787769
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | ||    
T  14787473 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcaca 14787572  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  14787573 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaaaagacaaactctatac 14787671  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787672 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 14787769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9148543 - 9148221
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  9148543 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca 9148445  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9148444 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 9148346  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  9148345 aaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtat 9148246  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  9148245 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 9148221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 36919626 - 36919950
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  36919626 agagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtccca 36919725  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  36919726 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatcc 36919825  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatc--tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36919826 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtat 36919925  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  36919926 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 36919950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 36921535 - 36921858
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36921535 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 36921634  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36921635 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatac 36921734  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  36921735 aaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-ccccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagtat 36921833  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  36921834 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 36921858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 44599880 - 44600174
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44599880 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 44599978  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44599979 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 44600077  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600078 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 44600174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11435245 - 11434925
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  11435245 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 11435147  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  11435146 gactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 11435048  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  11435047 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 11434948  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  11434947 cttaaaatttggaacaaatctgc 11434925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51015536 - 51015216
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51015536 agagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 51015438  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  51015437 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaacactatac 51015339  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |    
T  51015338 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcg 51015239  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  51015238 cttaaaatttggaacaaatctgc 51015216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637832
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 5637722  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgta 330  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |    
T  5637723 ttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgga 5637822  T
Q  331 acaaatctgc 340  Q
    ||||||||||    
T  5637823 acaaatctgc 5637832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 8631461 - 8631759
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8631461 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 8631560  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  8631561 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 8631659  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8631660 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagtgaaagt 8631759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 12395887 - 12396180
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  12395887 agagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcaca 12395986  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  12395987 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctag-agacaaactctatac 12396085  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396086 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 22044433 - 22044753
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22044433 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 22044531  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22044532 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 22044630  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  22044631 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcg 22044730  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  22044731 cttaaaatttggaacaaatctgc 22044753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 22046728 - 22047048
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22046728 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 22046826  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  22046827 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaa-agacaaactctatac 22046925  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  22046926 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcg 22047025  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  22047026 cttaaaatttggaacaaatctgc 22047048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 33415530 - 33415821
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33415530 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctca 33415629  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33415630 atctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtt-ccaag-agacaaactctatac 33415727  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  33415728 aaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaa 33415821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36378584 - 36378289
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  | |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  36378584 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccc 36378485  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36378484 aatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctata 36378386  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36378385 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 36378289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56030714 - 56030443
Alignment:
Q  40 atatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagag 138  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  56030714 atatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaa 56030615  T
Q  139 attcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56030614 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaactctagttttgttgttgt 56030516  T
Q  239 ctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  56030515 cattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47868692 - 47868398
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  47868692 agagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 47868593  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47868592 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaggagacaaactctatac 47868494  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47868493 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 47868398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 12400849 - 12401142
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  12400849 agagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcaca 12400948  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  12400949 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccag-agacaaactctatac 12401047  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12401048 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13544250 - 13543953
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544250 agagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 13544151  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13544150 atctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 13544052  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544051 aaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 13543953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 37089414 - 37089737
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37089414 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 37089512  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  37089513 gcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ctaaagagacaaactctatac 37089611  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtc 314  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37089612 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtt 37089711  T
Q  315 ctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  37089712 ttgcttaaaatttggaacaaatctgc 37089737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 37313106 - 37313400
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  37313106 aagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcc 37313205  T
Q  117 caatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37313206 caatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctat 37313304  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  37313305 gcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaaa 37313400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6765135 - 6764836
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6765135 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 6765036  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag----gagacaaactct 213  Q
      |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||     ||||||||||||    
T  6765035 gcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactct 6764936  T
Q  214 atacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6764935 atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6764836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24348509 - 24348211
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24348509 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtccca 24348410  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24348409 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaag-agacaaactctatac 24348311  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348310 aaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24348211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16453587 - 16453306
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16453587 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgta 16453488  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16453487 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttgtacaaactctagtttt 16453389  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16453388 gttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaagt 16453306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38409495 - 38409169
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  38409495 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtccca 38409397  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  38409396 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 38409298  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409297 aaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 38409198  T
Q  312 gtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||   ||||||||| || |||||||||||    
T  38409197 gtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 38409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7941614 - 7941289
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7941614 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 7941515  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtg--tttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| | |  | ||||||||||||||    
T  7941514 gcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgct-cgtaagagacaaactctat 7941416  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7941415 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcccggtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaaagt 7941316  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
       ||||||||| || |||||||||||    
T  7941315 ttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 7941289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Original strand, 3824629 - 3824936
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  3824629 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 3824728  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824729 atagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 3824827  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaag-tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgt 329  Q
    |||  ||||||||||  || ||||||||||||||    ||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||     
T  3824828 ttgcttttctaaacc--tgtttcagccccctctatctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgg 3824925  T
Q  330 aacaaatctgc 340  Q
    |||||||||||    
T  3824926 aacaaatctgc 3824936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 2484915 - 2485209
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2484915 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtccca 2485013  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2485014 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 2485112  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2485113 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccccttctagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 2485209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 11006279 - 11006604
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   ||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11006279 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 11006377  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
      ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11006378 gcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 11006476  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc-----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006477 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 11006575  T
Q  312 gtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11006576 gtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 11006604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 17662287 - 17662574
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17662287 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 17662386  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||            | ||    
T  17662387 gtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaag------------agac 17662474  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662475 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17662574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 31849641 - 31849962
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  31849641 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctca 31849739  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccct-agtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31849740 gcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 31849838  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||       
T  31849839 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcctagtttgctctgatacaagacctatatttctagtaaaagtatc 31849938  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  31849939 gcttaaaatttggaacaaatctgc 31849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19322961 - 19322701
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  19322961 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 19322862  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  19322861 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 19322767  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19322766 ttctaaacccttgtttcatccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41997776 - 41997494
Alignment:
Q  27 cctccatttcactat-atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  41997776 cctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatctttt 41997677  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41997676 cccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaactct 41997578  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 308  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  41997577 agttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagta 41997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 22132434 - 22132735
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22132434 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 22132532  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  22132533 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt--cgaagagacaaactctatac 22132630  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc---------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 308  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||         |||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  22132631 aaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagta 22132730  T
Q  309 aaagt 313  Q
    |||||    
T  22132731 aaagt 22132735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 312
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937543
Alignment:
Q  82 agaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaa 180  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  181 accctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttg 280  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||     
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaa-acaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggttta 3937512  T
Q  281 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3937513 ctctgata-aaagtctatatttatagtaaaag 3937543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 18709206 - 18709458
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||    
T  18709206 agagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgca 18709304  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18709305 atctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 18709403  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18709404 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 18537516 - 18537806
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |    
T  18537516 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctc 18537615  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  18537616 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaa-gag-caaactctata 18537711  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537712 caaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18537806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 26086075 - 26086243
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26086075 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 26086174  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttct 244  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26086175 cctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtttttct 26086243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 340
Target Start/End: Original strand, 52942528 - 52942810
Alignment:
Q  47 gagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccgtaaccaagagattcaat 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||            |||||||||||| |||||    
T  52942528 gagtaatgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaccc------------gtaaccaagagactcaat 52942615  T
Q  146 cctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942616 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtt-tcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 52942714  T
Q  246 aacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttg--atacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || |||||||||||    
T  52942715 aacccttgtttcag-cccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgc 52942810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6133089 - 6132871
Alignment:
Q  93 cccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  6133089 cccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgtt 6132990  T
Q  192 tgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 291  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |   |||||||    
T  6132989 tgttgccaa-tagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttg-ttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  292 ggtctatatttatagtaaaag 312  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaag 6132871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 312
Target Start/End: Original strand, 18409425 - 18409681
Alignment:
Q  55 ttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatag 153  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  18409425 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatag 18409524  T
Q  154 tgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    |||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18409525 tgttcccgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagt-gacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 18409623  T
Q  254 attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
     ||||| || ||||||||||  |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409624 tttcag-cctctctatctcattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaag 18409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 47210794 - 47211082
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47210794 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 47210893  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  47210894 gcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaca------------caaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 47210980  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210981 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 47211080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 8756317 - 8756586
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaa-gaga 139  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  8756317 atgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagaga 8756416  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |    
T  8756417 ctcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac 8756512  T
Q  240 tttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    || ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8756513 tt-ctaaacccttgttttcagccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 8756586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 22134659 - 22134909
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  22134659 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtccca 22134757  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||    
T  22134758 gccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt--tgaagagacaaactctatac 22134855  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22134856 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36380617 - 36380425
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |     
T  36380617 atgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatac 36380518  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380517 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 312
Target Start/End: Original strand, 18534901 - 18535164
Alignment:
Q  45 atgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattca 143  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  18534901 atgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactca 18535000  T
Q  144 atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttc 243  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||     
T  18535001 atcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttt 18535094  T
Q  244 taaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||| |||||||    
T  18535095 taaacacttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaaag 18535164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53405358 - 53405124
Alignment:
Q  81 aagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttca 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  53405358 aagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctca 53405259  T
Q  180 aaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc---tctatctcaaag 276  Q
    || |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||    
T  53405258 aaacctagt-tttgtt-ctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctcaaag 53405161  T
Q  277 tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405160 tttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53405124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16455533 - 16455355
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  16455533 agagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 16455434  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455433 aatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt 16455355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27499335 - 27499128
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||   ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  27499335 aagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatattag---gttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcct 27499239  T
Q  117 caatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27499238 caatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctat 27499140  T
Q  216 acaaaccctagt 227  Q
    ||||||||||||    
T  27499139 acaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270321
Alignment:
Q  148 taatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaa 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaa-agacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 38270256  T
Q  248 cccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38270257 cccttgtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 38270321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446914
Alignment:
Q  148 taatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaa 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaag-agacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaa 24446849  T
Q  248 cccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24446850 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 355 - 496
Target Start/End: Original strand, 9174491 - 9174633
Alignment:
Q  355 aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccag 453  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9174491 aaaactgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccatgatttttccag 9174590  T
Q  454 tgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9174591 tgccttgcctaataaactaaaacctccatcgtgctacgttgcc 9174633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13547445 - 13547302
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  13547445 agagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctca 13547346  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547345 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 496
Target Start/End: Original strand, 11006590 - 11006728
Alignment:
Q  359 ctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 457  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006590 ctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 11006689  T
Q  458 ttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11006690 ttgcctaaaaaattgaaacctccatcgtgccacgttgcc 11006728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 38890291 - 38890476
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||     
T  38890291 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagac 38890390  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890391 tcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 15032614 - 15032872
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||  ||||||||     
T  15032614 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagac 15032713  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||          ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  15032714 tcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaacc-tca----------tttgttg-caaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 15032799  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  15032800 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctggtaccaagtctatatttatagtaaaagt 15032872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5101129 - 5100994
Alignment:
Q  177 tcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  5101129 tcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctcaagg 5101031  T
Q  277 tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5101030 tttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 5100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 51015185 - 51015092
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51015185 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 51015092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2891430 - 2891314
Alignment:
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttga-tacaaggtc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |  ||| ||||| |||    
T  2891430 ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaatgtc 2891331  T
Q  296 tatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||    
T  2891330 tatatttatagtaaaag 2891314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 37089727 - 37089862
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37089727 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctcac 37089826  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctc-catcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37089827 ctaaaaaactaaaacatctcatcgtgccacgttgcc 37089862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2891569 - 2891436
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  2891569 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgta 2891470  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaag 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2891469 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 2891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30136827 - 30136640
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgta 130  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||     
T  30136827 tttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtg 30136728  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacc 222  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  30136727 accaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 31849952 - 31850086
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31849952 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccaagatttttccagtgccttgc 31850051  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31850052 cc-caaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 31850086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28453950 - 28453686
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||  |  |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||     
T  28453950 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagac 28453851  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||  ||||| |     
T  28453850 tcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttcttgccaa-gag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc- 28453758  T
Q  241 ttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||  |||||  | ||||| ||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453757 ttctaaacccttgttttcag-actctctacctcaaggttcacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 28453686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 22044783 - 22044878
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc--ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22044783 cagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaaaatgaaacctccatcgtgccacgttgcc 22044878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 36919940 - 36920074
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36919940 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctactattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgacttg- 36920038  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  36920039 cctcaaaattgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 36920074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12102379 - 12102221
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  |    
T  12102379 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttc 12102280  T
Q  117 caatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||| ||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12102279 caatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9863917 - 9863712
Alignment:
Q  99 taattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgc 197  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  | |||| |||||||||||||    
T  9863917 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgc 9863820  T
Q  198 caaggagacaaactctatacaaaccctag-ttttgttgttgtctttctaaacccttg--attcagccccct-ctatctcaaagtttgctttgatacaagg 293  Q
    ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||   |||||| | || ||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  9863819 caag--aacaaactc--tacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttttcagctctctactatctcaaggtttcatctgatacaagg 9863725  T
Q  294 tctatatttatag 306  Q
    |||||||||||||    
T  9863724 tctatatttatag 9863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10113080 - 10112876
Alignment:
Q  98 ctaattctacccaaagccccaatctcttcc--gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  10113080 ctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaatct--caaccctagtgtttgtt 10112983  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaagg 293  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||  |||| | |||||| |||| | |||| | | |||||||| |    
T  10112982 gccaa-gag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttttcaactccctctctctcgaggtttacatctgatacaatg 10112888  T
Q  294 tctatatttata 305  Q
    ||||||||||||    
T  10112887 tctatatttata 10112876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 22803127 - 22803220
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22803127 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgagccacgatttttccagtgcctt-tcctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 22803220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 311
Target Start/End: Original strand, 40999071 - 40999281
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||   || |||||||||||||    
T  40999071 cctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatct--caatcctagtgtttgtt 40999168  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggt 294  Q
    | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||  |||||  | ||||| ||||| |||| || ||||| |||||    
T  40999169 gtcaa-gag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgac-gtctaaacccttgttttcag-actctctacctcaaggtttactctgatataaggt 40999264  T
Q  295 ctatatttatagtaaaa 311  Q
     ||||||||||||||||    
T  40999265 ttatatttatagtaaaa 40999281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4215597 - 4215489
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  4215597 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcaca 4215498  T
Q  119 atctcttcc 127  Q
    | |||||||    
T  4215497 acctcttcc 4215489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38409179 - 38409079
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38409179 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgccgccaacgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 38409080  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  38409079 c 38409079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Original strand, 5635518 - 5635612
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5635518 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 5635612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 5637822 - 5637954
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  | | |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  5637822 aacaaatctgcacccaaaa-tacgtttctgtttttcgctgccagctcaccatcatgccacgatgcgatcccatcgtgacatgatttttccagtgccttg- 5637919  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5637920 cctcaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 5637954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7941251 - 7941185
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7941251 ccatcgtgccaccatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 7941185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11434887 - 11434821
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11434887 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 11434821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 3824926 - 3825060
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||   || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  3824926 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgtcgccaacgcaccatcgtgccacgatgcgaccccattgtgccatgatttttccagtgctttg- 3825024  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  3825025 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccatgttgcc 3825060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 407 - 496
Target Start/End: Original strand, 36921893 - 36921982
Alignment:
Q  407 gcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  36921893 gcaccatcgtgccacaatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgacttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccatgttgcc 36921982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5198400 - 5198300
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5198400 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagagctttgc 5198301  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  5198300 c 5198300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24888776 - 24888676
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24888776 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 24888677  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  24888676 c 24888676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11437653 - 11437560
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11437653 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 11437560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 31983569 - 31983727
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    ||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||| |     
T  31983569 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtct 31983668  T
Q  117 caatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31983669 caatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9022516 - 9022365
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 194  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||  | | |||| ||||||||||    
T  9022516 cctaattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaa--tcccaaccatagtgtttgt 9022419  T
Q  195 tgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    |||||| |||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  9022418 tgccaa-gag---aattctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttg 9022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 9148192 - 9148140
Alignment:
Q  410 ccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9148192 ccatcgtgccacgatgcaaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 9148140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 16186079 - 16186173
Alignment:
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattc-agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16186079 aaaccctagttt-gttgtt-tgtttctaaacccttgtttttagccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 16186173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 24446683 - 24446731
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 67  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446683 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 24446731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Original strand, 47151015 - 47151164
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||| |||    
T  47151015 cctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttcaaccctagtgttggtt 47151112  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
     |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  47151113 accaa-gag-caaactctat--aaaccttagttttg-tgttggc-ttctaaacccttg 47151164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Original strand, 22047078 - 22047135
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22047078 cagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgcca-gatttttccagtgccttgc 22047135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25357838 - 25357634
Alignment:
Q  108 ccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttca-aaccctagtgtttgttgccaaggaga 205  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||    | |||   |||    
T  25357838 ccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtgt---ctcccacttaga 25357745  T
Q  206 caaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata 299  Q
     ||| ||| |  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||     |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25357744 gaaa-tctctctaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagcccctctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctata 25357648  T
Q  300 tttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||    
T  25357647 tttatagtaaaagt 25357634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5101218 - 5101130
Alignment:
Q  21 agcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctaccc 109  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  5101218 agcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12102182 - 12102088
Alignment:
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12102182 aaaccctagttt-gttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagcccccctctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaaag 12102088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10114505 - 10114437
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  10114505 accaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttgttgccaag 10114437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 16185956 - 16186018
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16185956 cctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 48486299 - 48486166
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||     
T  48486299 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccattgtgccacattgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttg- 48486201  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgc 495  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48486200 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgc 48486166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 47868365 - 47868288
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  47868365 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcactatcgtggcacgattagatccaatcgtggcacgatttttccagtg 47868288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 3982218 - 3982362
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcct-aattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||  |   || |||||||||||||| ||    
T  3982218 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcc 3982317  T
Q  117 caa-tctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||| |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3982318 caaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttc 3982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455284
Alignment:
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctcggtttgctctgatacaaagcctatattaatagcaaaagt 16455284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Original strand, 38208839 - 38208908
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  38208839 accaaaagactcaatcttaatagtgtttctccaagatgaatcaatctc--aaccctagtgtttgttgccaag 38208908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 313
Target Start/End: Original strand, 22134936 - 22134966
Alignment:
Q  283 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134936 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22134966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 22801262 - 22801327
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  22801262 ccatcgtgccacgatttttccagttccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgtcacgttgcc 22801327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 444
Target Start/End: Original strand, 619841 - 619882
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacga 444  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  619841 cagcgcaccattgtgccacgttgcgaccccatcgtgccacga 619882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 16689303 - 16689380
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    |||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  16689303 aaaaatacgtttttattttatcctcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttccagtg 16689380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 451
Target Start/End: Original strand, 4556422 - 4556494
Alignment:
Q  379 aaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttcc 451  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||    
T  4556422 aaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttcc 4556494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 464 - 496
Target Start/End: Original strand, 22048491 - 22048523
Alignment:
Q  464 aaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22048491 aaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 22048523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 49088847 - 49088791
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaag-agatgtcagtaagttacaagaataa 88  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  49088847 tttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Original strand, 52043737 - 52043765
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043737 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 52043765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 443
Target Start/End: Original strand, 52942841 - 52942881
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacg 443  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52942841 cagcgcatcatcgtgccacgttgtgaccccatcgtgccacg 52942881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31542971 - 31542494
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31542971 agagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 31542874  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31542873 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 31542775  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31542774 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctt 31542675  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  31542674 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatcg 31542575  T
Q  416 tgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542574 tgtctcgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 31542494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 491
Target Start/End: Original strand, 31179413 - 31179897
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  | | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31179413 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 31179511  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  31179512 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 31179610  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31179611 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcct 31179710  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaac------------aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtca 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31179711 gcttaaaatctataacaaatctgctttaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttacccgcca 31179810  T
Q  405 gcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179811 gcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacg 31179897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31545317 - 31544850
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31545317 agagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 31545219  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    || |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31545218 atttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 31545120  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31545119 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctt 31545020  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  31545019 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatct-----------gtaataaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatcg 31544931  T
Q  416 tgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544930 tgtctcgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 31544850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21948263 - 21947943
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21948263 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtccca 21948164  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21948163 gcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 21948065  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  21948064 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 21947966  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  21947965 cttaaaatttggaacaaatctgc 21947943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 25921515 - 25921836
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
T  25921515 agagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtccca 25921614  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25921615 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 25921713  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  25921714 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 25921813  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  25921814 cttaaaatttggaacaaatctgc 25921836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Original strand, 10529156 - 10529435
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaac 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10529156 ttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaac 10529255  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10529256 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgt 10529354  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10529355 tgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 10529435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 2818377 - 2818699
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2818377 agagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 2818476  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa-ccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
      || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2818477 gccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 2818575  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  2818576 caaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 2818675  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  2818676 gcttaaaatttggaacaaatctgc 2818699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17073121 - 17072827
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  17073121 agagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagcccc 17073022  T
Q  118 aatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17073021 aatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 17072923  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17072922 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 17072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4236866 - 4236545
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4236866 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 4236767  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4236766 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 4236668  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  4236667 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 4236568  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  4236567 cttaaaatttggaacaaatctgc 4236545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 18511254 - 18511547
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18511254 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtccca 18511353  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18511354 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 18511452  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18511453 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaa 18511547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25904340 - 25904047
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25904340 agagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagcccta 25904241  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25904240 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 25904142  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25904141 aatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 25904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39854720 - 39854427
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  39854720 agagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttcca 39854621  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39854620 gtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 39854522  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854521 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 39854427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38882342 - 38882021
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  38882342 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca 38882244  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  38882243 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaag-agacaaactctatac 38882145  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  38882144 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttc 38882045  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  38882044 gcttaaaatttggaacaaatctgc 38882021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24127093 - 24126800
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  24127093 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtccca 24126994  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24126993 atctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaag-agacaaactctatac 24126895  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24126894 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagccccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaag 24126800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 18509360 - 18509652
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18509360 agagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccca 18509459  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18509460 ttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 18509558  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509559 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16776377 - 16776075
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  16776377 cactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 16776279  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776278 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttatt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 16776180  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata-tttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaaca 333  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  16776179 ttgcctttgtaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaaca 16776080  T
Q  334 aatct 338  Q
    |||||    
T  16776079 aatct 16776075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25804262 - 25804009
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25804262 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 25804163  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25804162 atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 25804064  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25804063 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 272 - 488
Target Start/End: Original strand, 15354777 - 15355005
Alignment:
Q  272 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa------------ac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||            ||    
T  15354777 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 15354876  T
Q  360 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354877 tgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 15354976  T
Q  460 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354977 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 15355005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 272 - 488
Target Start/End: Original strand, 15357053 - 15357281
Alignment:
Q  272 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa------------ac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||            ||    
T  15357053 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 15357152  T
Q  360 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357153 tgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 15357252  T
Q  460 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357253 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 15357281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2175155 - 2174835
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2175155 agagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 2175057  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2175056 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 2174958  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    |    
T  2174957 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaaagcatcg 2174858  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  2174857 cttaaaatttggaacaaatctgc 2174835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 275 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 10757245 - 10757020
Alignment:
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa------------actgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||            |||||    
T  10757245 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatttgtaacaaaaactgt 10757146  T
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757145 aacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 10757046  T
Q  463 caaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10757045 caaaaaactaaaacctccatcgtgcc 10757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Original strand, 36402384 - 36402690
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  36402384 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaa 36402483  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36402484 ccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcg 36402582  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaa 331  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||    
T  36402583 tgattgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttg-aa 36402681  T
Q  332 caaatctgc 340  Q
    |||||||||    
T  36402682 caaatctgc 36402690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 34530731 - 34531001
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||     
T  34530731 atgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagac 34530830  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34530831 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcat 34530929  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34530930 ttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaag 34531001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 37705836 - 37706116
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  37705836 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaa 37705935  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37705936 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaagtctatacaaaccctagatttg 37706034  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37706035 tcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 37706116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40221736 - 40221465
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  40221736 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagac 40221637  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  40221636 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcca 40221538  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40221537 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaagt 40221465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Original strand, 10474365 - 10474655
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10474365 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtccca 10474464  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10474465 atctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 10474563  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 309  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10474564 aaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26097952 - 26097676
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||    
T  26097952 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaacca 26097853  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097852 agagactcattcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttg 26097755  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26097754 ttgccattctaaacctttatttcagccccctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 26097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 12555967 - 12556285
Alignment:
Q  21 agcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaa-gagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaa 119  Q
    ||||| ||||| |||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |  | ||||||||||| ||| | ||||    
T  12555967 agcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaa-ctccaa 12556065  T
Q  120 tctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12556066 tctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaag-agacaaactctataca 12556164  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgc 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  12556165 aactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgc 12556264  T
Q  319 ttaaaatctgtaacaaatctg 339  Q
    ||||| | || ||||||||||    
T  12556265 ttaaattttgaaacaaatctg 12556285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23665125 - 23664894
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  23665125 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23665026  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23665025 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23664926  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23664925 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgcc 23664894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 23793462 - 23793693
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  23793462 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23793561  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23793562 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23793661  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23793662 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgcc 23793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18469231 - 18468950
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||    
T  18469231 cactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaacca 18469132  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469131 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 18469033  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469032 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18468950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18596859 - 18596590
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  18596859 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 18596760  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596759 tcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 18596661  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |  || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18596660 t--tatacccttgtttcagccccctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 18596590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 276 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 10749767 - 10749565
Alignment:
Q  276 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |        |||||||||||||||||||||    
T  10749767 gtttgctttgatacaaggtctatatttatactaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctg--taaca--------aaaactgtaacaaatctgctc 10749678  T
Q  376 ccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaa 475  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749677 ccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaa 10749578  T
Q  476 cctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||    
T  10749577 cctccatcgtgcc 10749565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18466901 - 18466625
Alignment:
Q  39 tatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaaga 137  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  18466901 tatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaaga 18466802  T
Q  138 gattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 237  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18466801 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaag-agacaaactctatccaaaccctagttttgttgttg 18466703  T
Q  238 tctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466702 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 18466625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6756716 - 6756437
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  6756716 tttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat--gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgta 6756619  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756618 accaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccttagtttt 6756520  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6756519 gttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaaagtttaatatgatacaagatctatattaatagtaaaagt 6756437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 16092249 - 16092495
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16092249 cctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 16092348  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16092349 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg-caaagagacagactctatacaaaccct 16092447  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16092448 aattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 16092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 21684494 - 21684824
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21684494 agagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagcccca 21684592  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21684593 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 21684691  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  21684692 aaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 21684791  T
Q  308 aaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  21684792 aaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgc 21684824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042994
Alignment:
Q  98 ctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  20043108 ccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagcct 20043010  T
Q  297 atatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  20043009 atatttatagtaaaag 20042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044954
Alignment:
Q  94 ccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgttt 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  193 gttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaag 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  20045072 gttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaa 20044974  T
Q  293 gtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  20044973 gcctatatttatagtaaaag 20044954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 340
Target Start/End: Original strand, 31466040 - 31466341
Alignment:
Q  38 ctatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaag 136  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  31466040 ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaag 31466138  T
Q  137 agattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtt 236  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31466139 agactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgtcgtt 31466237  T
Q  237 gtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
       ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||    
T  31466238 acttttttaaacctttgtttcagccccttttatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttggaacaaat 31466337  T
Q  337 ctgc 340  Q
    ||||    
T  31466338 ctgc 31466341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23667400 - 23667169
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  23667400 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagttaaagtcatgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23667301  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23667300 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23667201  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23667200 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgcc 23667169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 39398035 - 39398327
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||    
T  39398035 agagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttcca 39398134  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39398135 atctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 39398233  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |   | ||||| || |||||||||||||||||    
T  39398234 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaag 39398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27912756 - 27912473
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||    
T  27912756 cactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaacca 27912657  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912656 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 27912558  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912557 ttgcctttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27912473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 312
Target Start/End: Original strand, 1189677 - 1189949
Alignment:
Q  45 atgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattca 143  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1189677 atgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactca 1189776  T
Q  144 atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1189777 atcataatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttc 1189875  T
Q  244 taaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189876 taaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 31472662 - 31472948
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||| ||||| | |   |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31472662 cctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctctt 31472761  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31472762 cccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccct 31472860  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31472861 agttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 31472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6745305 - 6745053
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6745305 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 6745206  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  6745205 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttatac 6745108  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6745107 aaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagccccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27910667 - 27910388
Alignment:
Q  39 tatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaaga 137  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||    
T  27910667 tatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaaga 27910568  T
Q  138 gattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910567 gattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 27910469  T
Q  238 tctttctaaacccttgattcagcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
     |||| |||| ||||| |||||||||      |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910468 cctttttaaa-ccttgtttcagcccccgctatctctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27910388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 284 - 496
Target Start/End: Original strand, 34477379 - 34477580
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaat 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           ||||||||||| |||||||||    
T  34477379 tgatacaaggtctatttttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgctcaaaatctgt-----------aacaaatctgcacccaaaaat 34477467  T
Q  384 acgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatc 483  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34477468 atgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatc 34477567  T
Q  484 gtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||    
T  34477568 gtgccacgttgcc 34477580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2954638 - 2954368
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaac 132  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  2954638 ttcactatatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaac 2954540  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  2954539 taagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgt 2954440  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 304  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||||    
T  2954439 tgctgtctttctaaacccttgtttcatactcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6747541 - 6747247
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6747541 agagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 6747443  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | |||||    
T  6747442 gtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc-tagtgtttgtttcaaag-agacaaattttatac 6747345  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6747344 aaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctttctctttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6747247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Original strand, 17818549 - 17818817
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaacca 134  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17818549 cactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaacca 17818648  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17818649 agagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttg 17818747  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 305  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  17818748 ttgcctttctaaactcttgtttcag-cccctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 658395 - 658610
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  658395 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 658494  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  658495 gcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaatagacaaactctatac 658593  T
Q  218 aaaccctagttttgttg 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  658594 aaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 34477095 - 34477349
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||    
T  34477095 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtccc 34477193  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  34477194 aatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctat 34477292  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34477293 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 34479460 - 34479714
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |    
T  34479460 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctc 34479558  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  34479559 aatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctat 34479657  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34479658 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15552482 - 15552229
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15552482 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 15552384  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||    
T  15552383 atctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agataaactctata 15552285  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15552284 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 696115 - 695833
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  696115 agagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 696016  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||            |||    
T  696015 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag------------ata 695929  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  695928 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Original strand, 26098379 - 26098587
Alignment:
Q  105 tacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagga 203  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26098379 tacccaaaaccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-a 26098477  T
Q  204 gacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||    
T  26098478 gacaaactctatacaaaccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatattta 26098577  T
Q  304 tagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||    
T  26098578 tagtaaaagt 26098587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 307
Target Start/End: Original strand, 6661264 - 6661512
Alignment:
Q  55 ttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatag 153  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  | |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  6661264 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 6661363  T
Q  154 tgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||||||| | ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6661364 tgtttcccatggtgaatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaagaa--caaactctatacataccctaattttcttgttgactt-ctaaacccttg 6661458  T
Q  254 attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 307  Q
     |||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6661459 tttcaaccctctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagt 6661512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 20505883 - 20506040
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  20505883 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 20505982  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20505983 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 20506040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10587068 - 10586782
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  10587068 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctca 10586970  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||          
T  10586969 atctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaact------ 10586876  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc---ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
         ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586875 -----ctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10586782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 424
Target Start/End: Original strand, 38960334 - 38960501
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaac------------aa 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||            ||    
T  38960334 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 38960433  T
Q  357 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgat 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38960434 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccaacgcaccatcgtgccacgat 38960501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 41585786 - 41585956
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41585786 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagcccca 41585885  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41585886 atctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21288998 - 21288715
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||        | ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| || |    
T  21288998 agagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaaga--------tgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtccta 21288907  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaacccta------gtgtttgttgccaaggagacaaact 211  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||      ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21288906 atctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttttc-aaggtgaatcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaact 21288809  T
Q  212 ctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 305  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||    
T  21288808 ctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccctctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38882031 - 38881897
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882031 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 38881932  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38881931 ctcaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 38881897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9020432 - 9020167
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |     
T  9020432 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaac 9020333  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  9020332 tcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaac-ttcaa-ccctagtgtttgttgccaag---agcaactctatacaaaccctacttttg-tgttg-cc 9020240  T
Q  241 ttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    | | |||||||||  |||||| ||||||| | ||| |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9020239 tcccaaacccttgttttcagctccctctagcacaaggtttacatctgatacaaggtatgtatttatagtaaaa 9020167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507798
Alignment:
Q  179 aaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtt 278  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtt 20507763  T
Q  279 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20507764 tactctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 20507798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4410259 - 4410090
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4410259 agagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 4410161  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  4410160 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2724130 - 2723964
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||         |||    
T  2724130 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------cca 2724040  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  2724039 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39798284 - 39798127
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||| ||||||||   ||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39798284 agagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccaca 39798185  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39798184 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 39798127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20054049 - 20053834
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccgtaaccaagagatt 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||      |||||||||| |    
T  20054049 atgatgagtaactttacaaaagagatatcgg---gttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca----aaccaagagact 20053957  T
Q  142 caatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||||| | |    
T  20053956 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacct--caaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactttatataaactctagtttttgtgttg-cct 20053862  T
Q  242 tctaaacccttgattcagccccctctat 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20053861 tctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 496
Target Start/End: Original strand, 34479740 - 34479920
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaat 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||| |||||||||    
T  34479740 tgatacaaggtctatttttatagtaaaggtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgctcaaaatctgtaacaaa-----------tctgcacccaaaaat 34479828  T
Q  384 acgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatc 483  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34479829 atgttttatttttatccgccagcgcacca---------------------tcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatc 34479907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410000
Alignment:
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 4410002  T
Q  312 gt 313  Q
    ||    
T  4410001 gt 4410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Original strand, 23742057 - 23742157
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgc-ttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaa 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  23742057 tctcaaagtttgctttgacacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgctttaaaacctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaa 23742156  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  23742157 a 23742157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10757413 - 10757273
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| || |  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10757413 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 10757315  T
Q  119 atctcttccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10757314 atctcttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36208815 - 36208524
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagcc 115  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||| |    
T  36208815 aagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtc 36208716  T
Q  116 ccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
     ||||||||||| || ||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||     ||||||||| | |   ||  || ||| || ||||     
T  36208715 tcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatcaacaac--aaccctagtttctcccgcttag-aga-aatctctc 36208620  T
Q  215 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    || |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208619 ta-aaaccctagttt-gttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10749937 - 10749796
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10749937 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 10749839  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10749838 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 3373187 - 3373320
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt- 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3373187 cctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 3373285  T
Q  126 ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3373286 ccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2174797 - 2174732
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2174797 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 2174732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Original strand, 38960487 - 38960544
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960487 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 38960544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4236515 - 4236422
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4236515 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccattgtgccacgatttttccagtgccttg-ccttaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 4236422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 457
Target Start/End: Original strand, 21684811 - 21684909
Alignment:
Q  360 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 457  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684811 tgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 21684909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 494
Target Start/End: Original strand, 25921874 - 25921938
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttg 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25921874 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttg 25921938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586042
Alignment:
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 41586042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 17413288 - 17413391
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttccgta-accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  17413288 cctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttgtt 17413385  T
Q  196 gccaag 201  Q
    ||||||    
T  17413386 gccaag 17413391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23665280 - 23665140
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23665280 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 23665183  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23665182 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 23793307 - 23793447
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23793307 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 23793404  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23793405 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770939
Alignment:
Q  41 tatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 127  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 42770939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16776042 - 16775983
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16776042 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcagtgctttgcc 16775983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 15354617 - 15354757
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  15354617 agagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 15354714  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15354715 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 15356893 - 15357033
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  15356893 agagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 15356990  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15356991 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 38960174 - 38960314
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||    
T  38960174 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctca 38960271  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38960272 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Original strand, 3373332 - 3373377
Alignment:
Q  268 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373332 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3373377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42770924 - 42770717
Alignment:
Q  98 ctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||| | ||||| ||||  | |||| ||||||||||||    
T  42770924 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaacc--ccaaccttagtgtttgttg 42770829  T
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtc 295  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||| ||     
T  42770828 ccaa-gag-caaattctatataaa-cctaattttg-tgttg-ccttccaaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttac-tcgatacaaagtt 42770735  T
Q  296 tatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42770734 tatatttatagtaaaagt 42770717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 39797966 - 39797901
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39797966 ccatcgtgccatgatttttccggtgccttgcctcaaaaactgaaacctccatcatgccacgttgcc 39797901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754162
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaatctc--aaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  4754214 gccaa-gag-caaactc--tacaaaccctagtgtttgtgttggcttt-taaacccttg 4754162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 23741901 - 23742034
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23741901 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 23741998  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagaga-ttcaatcctaata 152  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  23741999 atctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39798058 - 39798004
Alignment:
Q  286 atacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  39798058 atacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgc 39798004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4409967 - 4409890
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||  || || || ||| ||||||||||||||||    
T  4409967 aaaaatacgttttatttttatctgccatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaattgtggcacgatttttccagtg 4409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15143680 - 15143547
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||    
T  15143680 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagaga 15143581  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
     |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  15143580 ctcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748355
Alignment:
Q  102 ttctacccaaagcccc-aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgcc 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |  ||||||| |||||||||||    
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  199 aaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    || |||   || ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  29748404 aa-gag---aattctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttg 29748355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 493
Target Start/End: Original strand, 659850 - 659929
Alignment:
Q  413 tcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgtt 493  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  659850 tcgtgccacaatgcgacctcatcgtgccacgatttttccagtgacttgcc--tcaaactgaaacctccaatcgtgccacgtt 659929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39854394 - 39854317
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||||||||    
T  39854394 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgatgcgattcaaccgtgacacgatttttccagtg 39854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 26098331 - 26098379
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 67  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098331 agagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagat 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 659829 - 659765
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  659829 ccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcc--tcaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 659765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35430338 - 35430259
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttccgta-accaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35430338 cctaattctacccaaagacccgaatctcttccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Original strand, 2144720 - 2144837
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgt-ttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtt 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2144720 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtgttgttgccaa-gag-caaactc--tacaaaccctagtt 2144813  T
Q  229 ttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||  ||||| | |||||||||||||    
T  2144814 ttagtgttggc-ttctaaacccttg 2144837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723911
Alignment:
Q  262 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 2723911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Original strand, 2144899 - 2144928
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144899 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2144928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6744971 - 6744894
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  6744971 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtagcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 6744894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6747214 - 6747137
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||  || || |||||| ||||| ||||||||||    
T  6747214 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgacttttccagtg 6747137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15552207 - 15552178
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552207 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15552178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25803988 - 25803959
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803988 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4897888 - 4897828
Alignment:
Q  96 gcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtg 155  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  4897888 gcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29748313 - 29748285
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748313 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 29748285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Original strand, 34033725 - 34033794
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||||||||||||    
T  34033725 accaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa--tcccaacgctagtgtttgttgccaag 34033794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 42238123 - 42238047
Alignment:
Q  379 aaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  42238123 aaaatacgtttttgttttatcctcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttccagtg 42238047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 1046967 - 1047451
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1046967 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1047065  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1047066 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 1047164  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa--------agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||          || ||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1047165 aaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaa 1047264  T
Q  310 aagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgca 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1047265 aagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgca 1047364  T
Q  410 ccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047365 ccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 1047451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Original strand, 4295990 - 4296271
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4295990 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 4296089  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296090 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 4296189  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatac-aaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4296190 ttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaag 4296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35859 - 35555
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  35859 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 35760  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35759 agagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttg 35661  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  35660 ttgtctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 35561  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  35560 atctgc 35555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 27306272 - 27306592
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27306272 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtccca 27306371  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||     
T  27306372 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgtt-ccaaagagacaaactctata- 27306469  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  27306470 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 27306569  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  27306570 cttaaaatttggaacaaatctgc 27306592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 270 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2935349 - 2935130
Alignment:
Q  270 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaa-ctgtaacaaa 368  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2935349 ctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatctgtaacaaaaactgtaacaaa 2935250  T
Q  369 tctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaa 468  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935249 tctgctctcaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaa 2935150  T
Q  469 actaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2935149 actaaaacctccatcgtgcc 2935130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21680260 - 21679981
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taa 131  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21680260 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaa 21680161  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680160 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttg 21680062  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21680061 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 21679981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44724826 - 44724533
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44724826 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 44724727  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44724726 gcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 44724628  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724627 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 44724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11355488 - 11355212
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  11355488 cactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaacca 11355389  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355388 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 11355290  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11355289 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaag 11355212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 20137150 - 20137444
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20137150 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 20137249  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20137250 aatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctata 20137348  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20137349 caaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaag 20137444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 42331047 - 42331335
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42331047 cctccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 42331146  T
Q  127 c---gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccc 223  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  42331147 ccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaag-agacaaactctatacaaacct 42331245  T
Q  224 tagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42331246 tagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 42331335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 1049338 - 1049658
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1049338 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1049436  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  1049437 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaag-agacaaactctatac 1049535  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  1049536 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 1049635  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  1049636 cttaaaatttggaacaaatctgc 1049658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44794 - 44490
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  44794 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaacca 44695  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44694 aaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttg 44596  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  ||||    
T  44595 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggtacaa 44496  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  44495 atctgc 44490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 13099516 - 13099812
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaa-gagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13099516 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccc 13099615  T
Q  117 caatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13099616 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctat 13099714  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13099715 acaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 13099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 39146027 - 39146322
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  39146027 aagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttc 39146126  T
Q  117 caatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39146127 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctat 39146225  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39146226 acaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagccccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaag 39146322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42223405 - 42223110
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||    
T  42223405 agagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctcca 42223306  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42223305 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 42223206  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccc-cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42223205 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcatcccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 42223110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9681067 - 9680768
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  9681067 agagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctca 9680968  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9680967 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 9680868  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680867 aaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21678299 - 21678020
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaa 131  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  21678299 tttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaa 21678200  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678199 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttg 21678101  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21678100 atgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaag 21678020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25276365 - 25276095
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  25276365 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 25276266  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25276265 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 25276167  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25276166 ttctaaattattgttttagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 25276095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 37412191 - 37412462
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaa-gagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  37412191 atgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagaga 37412290  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37412291 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 37412390  T
Q  240 tttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37412391 attctaaacccttgtttcagccccctatatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22137169 - 22136938
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  22137169 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22137070  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137069 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22136970  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136969 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 22136938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38394233 - 38393935
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38394233 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 38394134  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38394133 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 38394035  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394034 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38393935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 40552196 - 40551965
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  40552196 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 40552097  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552096 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 40551997  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551996 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 40551965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9679306 - 9679009
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9679306 agagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 9679207  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9679206 atctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 9679108  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9679107 aaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 9679009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Original strand, 31435088 - 31435404
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||    
T  31435088 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttcc 31435187  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31435188 agcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 31435286  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  31435287 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatc 31435386  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||||||||| || |||||    
T  31435387 gcttaaaatttggaacaa 31435404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3878824 - 3878497
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  3878824 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 3878725  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3878724 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 3878626  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctat----atttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  3878625 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatattaatttatagtaaaa 3878526  T
Q  312 gtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||   ||||||||| || |||||||||||    
T  3878525 gtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 3878497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 443842 - 443548
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  443842 agagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtccca 443743  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  443742 atctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 443644  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  443643 aaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagctccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 443548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24748842 - 24748548
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  24748842 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccc 24748743  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24748742 aatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 24748644  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24748643 caaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttataataaaag 24748548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 9027396 - 9027627
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  9027396 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 9027495  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027496 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 9027595  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027596 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 9027627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22108158 - 22107927
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  22108158 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22108059  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108058 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22107959  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22107958 cttgcccaaaaaactaaaacctgcatcgtgcc 22107927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 40549918 - 40549687
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  40549918 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 40549819  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549818 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 40549719  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40549718 cttgcccaaaaaactaaaacctgcatcgtgcc 40549687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48457900 - 48457602
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48457900 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 48457801  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48457800 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 48457702  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48457701 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 48457602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Original strand, 21592185 - 21592445
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21592185 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 21592284  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21592285 atctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 21592383  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    ||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21592384 aaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaagttt 21592445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21990397 - 21990106
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21990397 agagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctca 21990298  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21990297 atctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 21990199  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21990198 aaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 31155953 - 31156247
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31155953 agagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 31156051  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  31156052 atctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 31156150  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31156151 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagt 31156247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 40836785 - 40837105
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  40836785 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 40836883  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  40836884 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 40836982  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        
T  40836983 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctcaatctccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcc 40837082  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  40837083 cttaaaatttggaacaaatctgc 40837105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11757460 - 11757177
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  11757460 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 11757361  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaa-ccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757360 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgtt 11757262  T
Q  234 gttgtctttctaaaccc-ttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757261 gttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20299690 - 20299407
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  20299690 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 20299591  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaa-ccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299590 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgtt 20299492  T
Q  234 gttgtctttctaaaccc-ttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299491 gttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20299407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 7470081 - 7470359
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||    
T  7470081 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaacca 7470180  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7470181 agagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 7470279  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7470280 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7470359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20297609 - 20297311
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20297609 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagcccca 20297510  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20297509 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaag-agacaaactctatac 20297411  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20297410 aaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagt 20297311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 7472039 - 7472317
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||    
T  7472039 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaacca 7472138  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7472139 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 7472237  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7472238 ttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7472317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20626285 - 20625990
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20626285 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtccca 20626186  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20626185 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaacagacaaactctatac 20626087  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20626086 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20625990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20630176 - 20629881
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20630176 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtccca 20630077  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20630076 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaacagacaaactctatac 20629978  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20629977 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20629881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20642595 - 20642300
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20642595 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtccca 20642496  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20642495 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaacagacaaactctatac 20642397  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20642396 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20642300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25542758 - 25542459
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  25542758 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaacca 25542660  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542659 agagactcaatcctaatagtctttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 25542562  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || || ||    
T  25542561 ttacctttctaaacctttgtttcagcccc-tctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaataa 25542463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28487785 - 28487502
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaac 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28487785 ttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaac 28487686  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28487685 caagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaag-agacaaactctatacaaactctagttttgt 28487587  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28487586 tgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagt 28487502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18345771 - 18345490
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||    
T  18345771 cactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaacca 18345672  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345671 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 18345573  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctat----ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345572 ttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctccctcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26804762 - 26804499
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26804762 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 26804663  T
Q  175 cttcaaacccta---gtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatct 271  Q
    | ||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26804662 cctcaaaccctactagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 26804564  T
Q  272 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  26804563 caaagtttact----cacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 26804499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40946558 - 40946277
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |    
T  40946558 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacta 40946459  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946458 agagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 40946360  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctct----atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40946359 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtccctctcaaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagtgaaagt 40946277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3035971 - 3035670
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3035971 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 3035872  T
Q  119 atctcttc----cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
      ||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3035871 gcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactcta 3035773  T
Q  215 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3035772 taaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 3035673  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  3035672 agt 3035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 27832682 - 27832969
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  27832682 cctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctctt 27832781  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27832782 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaa-gagacaaactctatacaaacctt 27832880  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagc-cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||    
T  27832881 agttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagctccactctatcacaaggtttgctctgatacacaacctatatttatagtaaaag 27832969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28485798 - 28485515
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaac 132  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |   |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28485798 ttcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaac 28485699  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485698 caagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgt 28485600  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485599 tgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28485515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 22828674 - 22828969
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  22828674 agagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 22828773  T
Q  118 aatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  22828774 aatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaag-agataaactctata 22828872  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22828873 caaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagt 22828969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24258687 - 24258423
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||||||||     
T  24258687 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagac 24258588  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24258587 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcct 24258489  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  24258488 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaaaacctatatttatag 24258423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 7349315 - 7349615
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  7349315 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 7349413  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  7349414 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 7349512  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7349513 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7349612  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  7349613 agt 7349615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 7351694 - 7351994
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7351694 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 7351792  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  7351793 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 7351891  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7351892 caaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaa 7351991  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  7351992 agt 7351994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1850228 - 1849975
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1850228 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtccca 1850129  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1850128 gcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 1850030  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1850029 aaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 43253576 - 43253860
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||  ||| |||||||| ||    
T  43253576 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatca 43253675  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253676 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 43253773  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagcc--------ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||        | |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253774 ttgtcattctaaaaccttgtttcagccctctttctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43253860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Original strand, 22251649 - 22251878
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||| |||||||||    
T  22251649 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaac 22251740  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa 274  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22251741 ccttaaaccctagtgtttgtt-ccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaa 22251839  T
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22251840 agtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagt 22251878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567545
Alignment:
Q  147 ctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaa 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 18567633  T
Q  247 acccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  18567632 acccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 18567545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Original strand, 20091609 - 20091877
Alignment:
Q  41 tatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  20091609 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20091708  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20091709 tttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaa-tag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttg-c 20091802  T
Q  240 tttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
     | | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20091803 ctccgaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagtaaaagt 20091877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7188763 - 7188496
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    ||||||| |||  |||||||||| || ||| |  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||||     
T  7188763 atgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagac 7188664  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  7188663 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttgact 7188568  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7188567 t-ctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 7188496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Original strand, 7092254 - 7092432
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7092254 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 7092353  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7092354 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 7092432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 24817419 - 24817682
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  24817419 atgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 24817518  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |     
T  24817519 tcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttg-caaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac- 24817612  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24817613 ttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatattaaa 24817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Original strand, 7094502 - 7094679
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7094502 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 7094601  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7094602 atctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgttg 7094679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24465760 - 24465503
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||| | ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||     
T  24465760 atgatgagtact-ttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagac 24465662  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||          |    
T  24465661 tcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa--ttc-aaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gat 24465575  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24465574 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Original strand, 24813564 - 24813755
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| | | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||     
T  24813564 atgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagac 24813663  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||   | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813664 tcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttcttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22392600 - 22392399
Alignment:
Q  126 ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  22392600 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaat-ag-caaattctatacaaacccta 22392506  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaat 325  Q
    ||||  ||        | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  22392505 gtttgatt--------tataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttacaat 22392414  T
Q  326 ctgtaacaaatctgc 340  Q
     || |||||||||||    
T  22392413 ttggaacaaatctgc 22392399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38396864 - 38396725
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  38396864 cactatatgatgagtaaagttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 38396766  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38396765 agagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacc 38396725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2935515 - 2935374
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935515 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 2935417  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2935416 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092512
Alignment:
Q  217 caaaccctagt-tttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7092512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 494
Target Start/End: Original strand, 40837144 - 40837207
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttg 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40837144 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttg 40837207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1606626 - 1606486
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1606626 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1606529  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1606528 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25542425 - 25542332
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25542425 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttcaagtgccttg-ccttaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 25542332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094759
Alignment:
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaa 7094759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 9027236 - 9027376
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  9027236 agagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9027333  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9027334 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22137324 - 22137184
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  22137324 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 22137227  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22137226 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40552351 - 40552211
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  40552351 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 40552254  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40552253 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1606472 - 1606423
Alignment:
Q  264 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606472 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 494
Target Start/End: Original strand, 27306582 - 27306714
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  27306582 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgctagcgcaccatcgtgccacgaagcgaccccatcgtgccacgatttttccaatgacttg- 27306680  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttg 494  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27306681 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttg 27306714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396316
Alignment:
Q  205 acaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctc 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11081675 - 11081525
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||| ||| ||||  || |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  11081675 cctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaatct--caaccctagtgtttgtt 11081578  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||| |||   || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11081577 gccaa-gag---aattctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttg 11081525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3878467 - 3878408
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3878467 cagcgtaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 3878408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 44459 - 44401
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44459 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccatgatttttccagtgctttgc 44401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22108313 - 22108173
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  22108313 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctca 22108216  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22108215 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22393962 - 22393876
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaa 112  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22393962 cctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40550073 - 40549933
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  40550073 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctca 40549976  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40549975 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6049039 - 6048888
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 194  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  | | || ||||||||||||    
T  6049039 cctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa--tcccaaacctagtgtttgt 6048942  T
Q  195 tgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    |||||| |||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6048941 tgccaa-gag---aattctttacaaaccctagttttgatgttggc-ttctaaacccttg 6048888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348921
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcc 6348921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35565 - 35465
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||  | | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35565 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgctatttgctgccagcgcacgatcgggccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 35466  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  35465 c 35465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6332444 - 6332179
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtccccc-gcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  6332444 atgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagaga 6332345  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
     |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||   || |||||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||| | ||||| | |     
T  6332344 ctcaatcttaatagtgttttccaaactgaatcaatct--caatcctagtgtttgttgccaa-gag-taaactctat--aaaccctag-tctgttg-tatg 6332253  T
Q  240 tttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6332252 tttataaacccttgtttccagccccctctctctc-aaggttactctgatacaagttttatatttatagtaaaagt 6332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 16297146 - 16297222
Alignment:
Q  98 ctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16297146 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26295681 - 26295586
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 127  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  26295681 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcc 26295586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084441
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||| ||||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaatct--caaccctattgtttgtt 11084447  T
Q  196 gccaag 201  Q
    ||||||    
T  11084446 gccaag 11084441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1849962 - 1849918
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849962 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtaaaagt 1849918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348778
Alignment:
Q  180 aaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtt 278  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaag-ag-caaactcgatacaaaccctagttttctt-ttttacttctaaacccttgttttcagtcctctctatctcaatgtt 6348807  T
Q  279 tgc-tttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    | | | ||||||||||| |||||||||||    
T  6348806 tacatctgatacaaggtttatatttatag 6348778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210500
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttca-aaccctagtgttt 192  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtg-tt 26210615  T
Q  193 gttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaa 291  Q
    |||||||| |||   || ||| |||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||| |||  ||||| || |||||| |||| | ||||||||||    
T  26210614 gttgccaa-gag---aattctctacaaaccctagttttgaggttg-gattctaaaaccttgtttcctccccc-ctctctcaaggtttacatttgatacaa 26210521  T
Q  292 ggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | |||||||||||| ||||||    
T  26210520 gttctatatttatactaaaag 26210500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 313
Target Start/End: Original strand, 30906280 - 30906386
Alignment:
Q  206 caaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||    
T  30906280 caaactctatacaaactctagttt-gttatt-tgtttctaaattcttgttttcagccccctctatctcaagatttactcttatacaaggtctatatttat 30906377  T
Q  305 agtaaaagt 313  Q
    || ||||||    
T  30906378 agcaaaagt 30906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3677301 - 3677235
Alignment:
Q  244 taaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3677301 taaacccttgtttcagcccc-tctatctccaagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaa 3677235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21369703 - 21369642
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21369703 cctaattttacccaa-gtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18567508 - 18567415
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    ||||||| |||| ||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  18567508 cagcgcaccatcgtgccaagttgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccactttgcc 18567415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26804462 - 26804397
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26804462 ccatcgtgccacgatttttccactgccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtaccacgttgcc 26804397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 31435441 - 31435534
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    ||||||| |||| ||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  31435441 cagcgcaccatcgtgccaagttgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccactttgcc 31435534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38396268 - 38396239
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396268 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38396239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40946244 - 40946167
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||| ||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  40946244 aaaaatatgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtgacacgatttttccagtg 40946167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 149)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 50494216 - 50493728
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  50494216 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca 50494118  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  50494117 atcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 50494019  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50494018 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcct 50493919  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaa-----------caaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50493918 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatttgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccag 50493819  T
Q  406 cgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493818 cgcaccatcgtgccacgatgagactccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 50493728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 6063486 - 6063954
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6063486 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 6063584  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||    
T  6063585 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaa-agacaaactctata 6063683  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtc 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063684 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtc 6063783  T
Q  315 ctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatc 414  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6063784 ttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaat-----------ctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagtccaccatc 6063872  T
Q  415 gtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6063873 gtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccattgtgccacgttgcc 6063954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38210587 - 38210119
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  38210587 agagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 38210489  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  38210488 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagataaactctata 38210390  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca---aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||  | || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38210389 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaaatagcct-gatacaaggcctatatttatagtaaaagt 38210291  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccat 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38210290 cttgcttaaaatctgtaacaaatctg-----------taacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcactat 38210202  T
Q  414 cgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210201 cgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 38210119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 25389122 - 25388654
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25389122 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtccca 25389024  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  25389023 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 25388926  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca---------aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| ||||          ||  | || | |||||||||||||||||||||||    
T  25388925 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagctctctctctctctctctctctcaaaatagcct-gatacaaggtctatatttatagt 25388827  T
Q  308 aaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcg 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  25388826 aaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa-----------tctgctcccaaaaatatgttttatttttatctgccagcg 25388738  T
Q  408 caccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388737 caccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacg 25388654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 4308321 - 4308615
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4308321 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 4308420  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4308421 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 4308519  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308520 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 4308615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45883156 - 45882835
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45883156 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 45883057  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  45883056 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgtt-ccaaagagacaaaatctatac 45882958  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  45882957 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 45882858  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| |  |||||||||||    
T  45882857 cttaaaattttcaacaaatctgc 45882835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38890257 - 38889918
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38890257 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 38890158  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  38890157 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatac 38890059  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890058 aaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgct---atacaaggtctatatttatagtaaaagt 38889962  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa 357  Q
       ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38889961 ttcgcttaaaatttggaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa 38889918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Original strand, 43423517 - 43423796
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43423517 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaa 43423616  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423617 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttg 43423715  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423716 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 75 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35777583 - 35777317
Alignment:
Q  75 agttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatca 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35777583 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 35777484  T
Q  173 accttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35777483 acccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35777385  T
Q  273 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35777384 aaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 35777317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11170621 - 11170300
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  11170621 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca 11170522  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11170521 gcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 11170423  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  11170422 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 11170323  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  11170322 cttaaaatttggaacaaatctgc 11170300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 6065836 - 6066159
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6065836 agagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 6065934  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  6065935 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaaatctata 6066033  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6066034 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttc 6066133  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6066134 tgcttaaaatctgtaacaaatctgct 6066159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 18099210 - 18099531
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18099210 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 18099309  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18099310 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 18099408  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  18099409 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaaagtctc 18099507  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  18099508 gcttaaaatttggaacaaatctgc 18099531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 18096940 - 18097262
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18096940 agagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 18097039  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18097040 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 18097138  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18097139 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctc 18097238  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  18097239 gcttaaaatttgaaacaaatctgc 18097262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24979925 - 24979603
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | | |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |    
T  24979925 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctc 24979826  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24979825 aatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 24979727  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  24979726 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtatt 24979627  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     |||||||| || |||||||||||    
T  24979626 acttaaaatttggaacaaatctgc 24979603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 53917704 - 53917998
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  53917704 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccca 53917803  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53917804 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 53917902  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53917903 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagccccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 1626723 - 1627016
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1626723 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccca 1626822  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  1626823 atctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagataaactctatac 1626921  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626922 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 10956067 - 10956388
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  10956067 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 10956166  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10956167 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 10956265  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  10956266 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatcttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattg 10956365  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  10956366 cttaaaatttggaacaaatctgc 10956388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Original strand, 12268015 - 12268323
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12268015 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 12268103  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12268104 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 12268203  T
Q  218 aaaccctag-ttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12268204 aaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctctatctcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagtatc 12268303  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  12268304 gcttaaaatttggaacaaat 12268323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 258 - 496
Target Start/End: Original strand, 53896475 - 53896702
Alignment:
Q  258 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  53896475 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgt------ 53896568  T
Q  358 actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 457  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53896569 -----aacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgcaagagcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtacc 53896663  T
Q  458 ttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896664 ttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 53896702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1313626 - 1313333
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1313626 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1313527  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1313526 atctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 1313428  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1313427 aaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 1313333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51943587 - 51943294
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  51943587 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagcccca 51943489  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  51943488 atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ctaaagagacaaactctatac 51943390  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943389 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 51943294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 880491 - 880785
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  880491 agagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagcccca 880590  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  880591 atctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatac 880690  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  880691 aaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcagacccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 48361711 - 48362031
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  48361711 agagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagcccca 48361810  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48361811 atctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaa-gagacaaactctatac 48361909  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  48361910 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagccccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 48362008  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  48362009 cttaaaatttggaacaaatctgc 48362031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3859727 - 3859424
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||    
T  3859727 cactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaacca 3859629  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859628 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 3859530  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  3859529 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaa 3859430  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  3859429 atctgc 3859424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3314902 - 3314608
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3314902 agagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagcccc 3314803  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3314802 aatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 3314704  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3314703 caaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 3314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 10958363 - 10958684
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  10958363 agagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtca 10958462  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10958463 gcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 10958561  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  10958562 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattg 10958661  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  10958662 cttaaaatttggaacaaatctgc 10958684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 22114360 - 22114666
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaac 132  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||    
T  22114360 ttcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaac 22114459  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114460 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgt 22114558  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaac 332  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||    
T  22114559 ttttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaac 22114658  T
Q  333 aaatctgc 340  Q
    ||||||||    
T  22114659 aaatctgc 22114666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 43421469 - 43421747
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  43421469 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaa 43421568  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421569 ccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaacactatacaaaccctagttttg 43421667  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43421668 ttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 51727047 - 51727340
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  51727047 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 51727146  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51727147 gcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 51727244  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727245 ataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 51727340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 53915536 - 53915830
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  53915536 agagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 53915635  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  53915636 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaaatctatac 53915734  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53915735 aaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53915830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 28102042 - 28102335
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28102042 agagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 28102141  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28102142 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 28102240  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  28102241 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggttactctaatacaacgcttatatttatagtaaaag 28102335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30006058 - 30005805
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30006058 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 30005959  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30005958 gcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 30005860  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30005859 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5191852 - 5191549
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  5191852 cactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5191754  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191753 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 5191655  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||    
T  5191654 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaa 5191555  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  5191554 atctgc 5191549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43226302 - 43226009
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43226302 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 43226203  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43226202 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaacgagacaaactctatac 43226104  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43226103 aaacg-tagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43226009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43228508 - 43228214
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  43228508 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca 43228409  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43228408 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 43228310  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43228309 aaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43228214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6561969 - 6561740
Alignment:
Q  77 ttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6561969 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 6561870  T
Q  176 ttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaa 275  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6561869 ctcaaaccccagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaag 6561771  T
Q  276 gtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6561770 gtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18162881 - 18162560
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  18162881 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccc 18162782  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  18162781 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtt-caaaagagacaaactctata 18162683  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgct-ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18162682 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--tccctctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtat 18162585  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  18162584 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 18162560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26720764 - 26720444
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26720764 agagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 26720665  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  26720664 gcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaatagacaaactctatac 26720567  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26720566 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattg 26720467  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  26720466 cttaaaatttggaacaaatctgc 26720444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 27101221 - 27101519
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27101221 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 27101320  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27101321 ttctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 27101419  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa----agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101420 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctatctcaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 10084429 - 10084754
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10084429 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccca 10084528  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10084529 gcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 10084627  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10084628 aaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctctatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagc 10084727  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
       ||||||||| || |||||||||||    
T  10084728 atcgcttaaaatttggaacaaatctgc 10084754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29956903 - 29956650
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29956903 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 29956804  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29956803 gcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 29956705  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29956704 aaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42990521 - 42990268
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990521 agagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 42990422  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42990421 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 42990323  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42990322 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 47148935 - 47149233
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47148935 agagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagaccca 47149034  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47149035 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc-aaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatac 47149133  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || |  | | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149134 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47149233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 28761468 - 28761762
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |    
T  28761468 agagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctc 28761567  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  28761568 aatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaag-ag-caaactatata 28761665  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28761666 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagt 28761762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 35917983 - 35918283
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||    
T  35917983 agagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattccca 35918082  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt-----tgccaaggagacaaactc 212  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||     | |||| |||||||||||    
T  35918083 gtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactc 35918182  T
Q  213 tatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35918183 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaag 35918282  T
Q  313 t 313  Q
    |    
T  35918283 t 35918283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 889821 - 890104
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  889821 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttc 889919  T
Q  127 c-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  889920 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaacccta 890019  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | ||  |||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  890020 ggtt--ttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 890104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 32264077 - 32264404
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaa-gagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  32264077 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttc 32264176  T
Q  117 caatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32264177 cagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctat 32264275  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtt----tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264276 acaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 32264375  T
Q  312 gtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||   ||||||||| || |||||||||||    
T  32264376 gtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 32264404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 5926804 - 5927097
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || | | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  5926804 agagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtccca 5926903  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  5926904 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaatagacaaactctatac 5927002  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5927003 aaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25533659 - 25533357
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  25533659 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 25533560  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25533559 gcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 25533461  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533460 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaa 25533361  T
Q  310 aagt 313  Q
    ||||    
T  25533360 aagt 25533357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36012044 - 36011751
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||    
T  36012044 agagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcaca 36011945  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  36011944 atctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgtt-ctaaagagacaaactctatac 36011846  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36011845 aaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 36011751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 54691614 - 54691906
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  54691614 agagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagcccta 54691713  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54691714 atctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatac 54691812  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54691813 aaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 54691906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 53468495 - 53468788
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  53468495 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtccc 53468594  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  53468595 aatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttctt-ccaaagagacaaactctata 53468693  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53468694 caaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 53468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 4103953 - 4104233
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  4103953 cactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 4104051  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4104052 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaagctctatacaaaccctagttttgttg 4104150  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104151 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 4104233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 312
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100374
Alignment:
Q  81 aagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttca 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  180 aaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtt 28100341  T
Q  280 gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
     || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28100342 actctgatacaacgcttatatttatagtaaaag 28100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 456124 - 455826
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  456124 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 456026  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  456025 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 455927  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  455926 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 455827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 458501 - 458203
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  458501 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 458403  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  458402 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 458304  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  458303 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 458204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 746974 - 746674
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  746974 agagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 746876  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  746875 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 746777  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  746776 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 746677  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  746676 agt 746674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39715664 - 39715393
Alignment:
Q  41 tatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagaga 139  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715664 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 39715565  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39715564 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-tcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcc 39715466  T
Q  240 tttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39715465 tctctaaacccttatttcag-cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 39715393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 51674806 - 51675087
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||    
T  51674806 agagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatccca 51674905  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||             ||    
T  51674906 atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagg------------gac 51674993  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51674994 aaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaa 51675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 9604647 - 9604946
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  9604647 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9604746  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  9604747 acctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctt-tcaaagagacaaactctatac 9604845  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||      ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||    
T  9604846 aaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccctctatctctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagtgaaa 9604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Original strand, 10191350 - 10191670
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  10191350 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-a 10191448  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  10191449 gcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctataa 10191547  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc----tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191548 aaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctttatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10191647  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
       ||||||||| || |||||||    
T  10191648 atcgcttaaaatttggaacaaat 10191670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 279 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5899717 - 5899511
Alignment:
Q  279 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctccca 378  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||    
T  5899717 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatctgta-----------ccca 5899629  T
Q  379 aaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacct 478  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5899628 aaaatacgttttatttttatctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacat 5899529  T
Q  479 ccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5899528 ccatcgtgccacgttgcc 5899511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 5522667 - 5522976
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5522667 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 5522765  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||| | |||            | ||    
T  5522766 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaag------------agac 5522853  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  5522854 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 5522953  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  5522954 cttaaaatttgaaacaaatctgc 5522976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 10621570 - 10621823
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10621570 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 10621668  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  10621669 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 10621767  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10621768 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctctatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15781031 - 15780756
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15781031 gttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 15780932  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaact-----------ctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc 263  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15780931 cctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 15780833  T
Q  264 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  15780832 ctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 15780756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28181183 - 28180948
Alignment:
Q  75 agttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  28181183 agttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaa 28181084  T
Q  174 ccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca 273  Q
    || ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  28181083 ccctcaaatcccagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctca 28180987  T
Q  274 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28180986 aggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 28180948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32219302 - 32218991
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||    
T  32219302 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtccc 32219203  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||         
T  32219202 aatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt-acaaagagacaaact----- 32219109  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
          ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| | |||||  |    
T  32219108 ------ctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttatactgaaagtatt 32219015  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     |||||||| || |||||||||||    
T  32219014 acttaaaatttggaacaaatctgc 32218991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 279 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5886242 - 5886039
Alignment:
Q  279 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctccca 378  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||| ||||    
T  5886242 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa-----------tttgcaccca 5886154  T
Q  379 aaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacct 478  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  5886153 aaaatacgttttatttttatctgccagcgcaccatcgtaccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctaaaaaactaaaacat 5886054  T
Q  479 ccatcgtgccacgtt 493  Q
    |||||||||||||||    
T  5886053 ccatcgtgccacgtt 5886039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31151534 - 31151271
Alignment:
Q  45 atgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattca 143  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||    
T  31151534 atgagtaactttacaaaagagatatcagg--gttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactca 31151437  T
Q  144 atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  31151436 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttc 31151342  T
Q  244 taaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31151341 taaacccttgttttcagccccctctatctcgaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 31151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1321696 - 1321483
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1321696 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1321597  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1321596 gcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 1321498  T
Q  218 aaaccctagttttgt 232  Q
    |||||| ||||||||    
T  1321497 aaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 28413072 - 28413299
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28413072 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 28413170  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  28413171 atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctata 28413269  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28413270 caaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11163207 - 11163046
Alignment:
Q  178 caaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagt 277  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11163207 caaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagt 11163109  T
Q  278 ttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  11163108 ttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 11163046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23633671 - 23633383
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  23633671 agagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctc 23633573  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23633572 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaacactata 23633479  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23633478 caaaccctagttttcttgttggctt-ctaaatccttgttttagccctctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 23633383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53591387 - 53591119
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||    
T  53591387 tttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaa 53591288  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||           ||||||||||||||||    
T  53591287 ccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ctaaagag-----------acaaaccctagttttg 53591200  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53591199 ttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaaggtttacacttatacaatgtctatatttatagtaaaag 53591119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6484577 - 6484372
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  6484577 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaacccca 6484478  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  6484477 atctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacac 6484378  T
Q  218 aaaccc 223  Q
    ||||||    
T  6484377 aaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Original strand, 13420252 - 13420506
Alignment:
Q  45 atgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattca 143  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  13420252 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactca 13420351  T
Q  144 atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||              
T  13420352 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac--tc-aaccctagtgtttgttgccta-gaga-aaactctatacaaaccctagtttgatt---------- 13420436  T
Q  244 taaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13420437 taaacccttgtttcagcctcctatatctcaaggtttgctttgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 13420506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 312
Target Start/End: Original strand, 28137421 - 28137628
Alignment:
Q  94 ccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  28137421 ccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgttt 28137520  T
Q  193 gttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaag 292  Q
    ||| |||| ||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||     
T  28137521 gttcccaa-gagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaac 28137608  T
Q  293 gtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  28137609 gcatatatttatagtaaaag 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53597446 - 53597164
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||    |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  53597446 cctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctatt 53597347  T
Q  126 c-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  53597346 ctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac-ttcaa-ccctagtgtttgttgccaag-aga-aaactctatacaacccct 53597251  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597250 agttttcttgttgactta-taaacccttgtttcatcccc-tctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53597164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42992392 - 42992205
Alignment:
Q  129 taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42992392 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaag-agacaaactctatacaaaccctagtt 42992294  T
Q  229 ttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992293 ttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctcttaaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagt 42992205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23636952
Alignment:
Q  59 aaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtt 157  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| || | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  158 tcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattc 257  Q
    || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||     
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaa-gag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttt 23637006  T
Q  258 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| |||||    
T  23637005 agcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaa 23636952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54884348 - 54884081
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||   ||||||||| | ||||||||||||     
T  54884348 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaagagac 54884250  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  54884249 tcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagaaacaaactc--tacaaattctagttttgttgttgcct 54884153  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| |  |||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  54884152 ttctaaacccttgttcgagctccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttatggtaaaag 54884081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 27635698 - 27635959
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  27635698 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaagccc-- 27635795  T
Q  119 atctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
             |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||                   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27635796 ---------gtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccca-------------------ccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctataca 27635866  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | || |||||||||||||| ||||||||    
T  27635867 aaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4666734 - 4666488
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataag--tcccccgcctaattctacccaaagcc 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  4666734 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtc 4666635  T
Q  116 ccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||            |    
T  4666634 tcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaag------------a 4666547  T
Q  215 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca 273  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4666546 gacaaaccctatttttgttgttgtcttactagacccttctttcagccccctctatctca 4666488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  143 aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcttt 242  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttatt 41849146  T
Q  243 ctaaacccttgattcagccccctctatct 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41849145 ctaaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 25688200 - 25688367
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25688200 agagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 25688299  T
Q  118 aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccc 184  Q
    |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25688300 agcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 265
Target Start/End: Original strand, 561840 - 562058
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||     
T  561840 atgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagac 561939  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  561940 taaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacctg--aaccctagtgtttgttgccaag-aga-aaactctatacaaaccctagtttcat-gttgact 562034  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccct 265  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||    
T  562035 t-ctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 7606628 - 7606822
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7606628 agagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaat-agaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 7606726  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7606727 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177175
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaag-ag-caaactctatacaaaccctagtttt 24177285  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgt 329  Q
     |||||| | | |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||| ||     
T  24177284 cttgttgacat-ctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagtatcccttaaaatttgg 24177186  T
Q  330 aacaaatctgc 340  Q
    |||||||||||    
T  24177185 aacaaatctgc 24177175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  182 ccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||| |    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttac 6231404  T
Q  282 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6231403 actgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17795452 - 17795269
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  17795452 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagac 17795353  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttt 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||   | |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||    
T  17795352 tcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaa--aagcaaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19103892 - 19103709
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  19103892 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagac 19103793  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttt 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||   | |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||    
T  19103792 tcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaa--aagcaaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 312
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701928
Alignment:
Q  181 accctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttg 280  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  47701798 accctggtgtttgtt-ccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggttta 47701896  T
Q  281 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701897 cactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 47701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 22114656 - 22114790
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22114656 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccatcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgc 22114755  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22114756 ctcaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 22114790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Original strand, 6719396 - 6719489
Alignment:
Q  264 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa 357  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6719396 ctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtatcaaa 6719489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25635575 - 25635391
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  25635575 atgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 25635476  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttt 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||  | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25635475 taaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaa--tcccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6231994 - 6231849
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||     
T  6231994 atgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaatccc-aatctcttcccgtaaccaagagac 6231896  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctag 187  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6231895 tcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 18099521 - 18099655
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18099521 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctattgttcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttg- 18099619  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18099620 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 18099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1321438 - 1321337
Alignment:
Q  239 ctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  1321438 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 1321339  T
Q  339 gc 340  Q
    ||    
T  1321338 gc 1321337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1674132 - 1673898
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  1674132 gttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaa- 1674034  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctt-gattcagccccctctatctca 273  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||   |||||  | |||||  |||    
T  1674033 -tcctaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactatatacaaacactagttttcttgttaac-ttctaaacccttattttcag-actctctacatca 1673939  T
Q  274 aagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1673938 aggtttacttttgatacaagttctatatttatagtaaaagt 1673898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5886415 - 5886261
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5886415 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa-gacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 5886317  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5886316 atctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5899888 - 5899734
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5899888 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 5899790  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5899789 atcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 36871420 - 36871624
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||    
T  36871420 cctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaa--tcctaaccctggtgtttgtt 36871517  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtc 295  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||| ||  | | | |||| || |||||||||||     
T  36871518 gccaa-gag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc-ctccccctaggtttactatgatacaaggtt 36871613  T
Q  296 tatatttatag 306  Q
    |||||||||||    
T  36871614 tatatttatag 36871624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3306838 - 3306724
Alignment:
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 296  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |  |||||||| ||||    
T  3306838 ccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaatgtct 3306739  T
Q  297 atatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||    
T  3306738 atatttatagtaaaa 3306724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11168318 - 11168165
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  11168318 agagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattccca 11168219  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatc 171  Q
      ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11168218 gcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 35777280 - 35777215
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777280 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 35777215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 313
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560599
Alignment:
Q  96 gcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttag- 4560499  T
Q  195 tgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggt 294  Q
            ||||||||||||           |||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||    
T  4560500 --------agacaaactcta-----------gttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttactatgatacatagt 4560580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 363 - 489
Target Start/End: Original strand, 10956378 - 10956505
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956378 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 10956477  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgcca 489  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  10956478 cc-caaaactgaaacctccaatcgtgcca 10956505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3306965 - 3306839
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||    
T  3306965 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgta 3306866  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtt 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3306865 accaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 425
Target Start/End: Original strand, 6066144 - 6066210
Alignment:
Q  359 ctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6066144 ctgtaacaaatctgctcccaaaaatacattttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatg 6066210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5191559 - 5191425
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5191559 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttg- 5191461  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5191460 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgatgcc 5191425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 6066195 - 6066254
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccac 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066195 ccatcgtgccacgatgtttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccac 6066254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 47701711 - 47701801
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctaccc 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47701711 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38889875 - 38889810
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38889875 ccatcgtgccacgatttttccaatgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 38889810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3859434 - 3859350
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatt 446  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3859434 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatattattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatt 3859350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Original strand, 10085481 - 10085557
Alignment:
Q  419 cacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10085481 cacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttg-cctcaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 10085557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Original strand, 10192401 - 10192477
Alignment:
Q  419 cacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10192401 cacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttg-cctcaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 10192477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 455
Target Start/End: Original strand, 10958674 - 10958767
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958674 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattggctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 10958767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11163008 - 11162943
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11163008 ccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 11162943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1321347 - 1321247
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1321347 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcagtgctttgc 1321248  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  1321247 c 1321247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Original strand, 5522966 - 5523066
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5522966 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccattgtgccacgatttttccagtaccttgc 5523065  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  5523066 c 5523066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13419990 - 13419878
Alignment:
Q  124 ttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccc 223  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  13419990 ttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactc--tacaaaccc 13419897  T
Q  224 tagttttgttgttgtcttt 242  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  13419896 tagttttcttgttggcttt 13419878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11170260 - 11170197
Alignment:
Q  433 atcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11170260 atcgagccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaccgaaacctccatcgtgccacgttgcc 11170197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaa--tcccagccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26720413 - 26720354
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26720413 cagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 26720354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24181574 - 24181489
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 127  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24181574 atgatgagtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcc 24181489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 14634561 - 14634663
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||||    
T  14634561 cctaatgctacccaaagtctcaatctcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc-tcaa--cccagtgtttgtt 14634657  T
Q  196 gccaag 201  Q
    ||||||    
T  14634658 gccaag 14634663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 1620580 - 1620657
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1620580 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Original strand, 18097291 - 18097370
Alignment:
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18097291 gccactatgcgaccccatcgtgccacgatttttcctatgccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 18097370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 493
Target Start/End: Original strand, 32264394 - 32264526
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  | | |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    ||||||| |||||    
T  32264394 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcaagcccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgc 32264493  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgtt 493  Q
    |  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32264494 ctcaaaaactgaaacctccaatcgtgccacgtt 32264526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 45882806 - 45882752
Alignment:
Q  401 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45882806 gtcagcgcaccatcgtgccacgttgcaatcccatcgtggcacgatttttccagtg 45882752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 4308648 - 4308725
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  4308648 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 4308725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6484373 - 6484308
Alignment:
Q  248 cccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6484373 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaagt 6484308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 1618896 - 1618992
Alignment:
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1618896 aaaccctagttt-gttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctcaaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagt 1618992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 313
Target Start/End: Original strand, 25690651 - 25690690
Alignment:
Q  274 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25690651 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 25690690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13893347 - 13893289
Alignment:
Q  282 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||    
T  13893347 tttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgc 13893289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 42992472 - 42992418
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataa 88  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  42992472 ttcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42992418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 468
Target Start/End: Original strand, 6719532 - 6719569
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6719532 ccatcgtgccacgatttttccagtgcattgcctaaaaa 6719569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  146 cctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtt 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 496
Target Start/End: Original strand, 7606878 - 7606911
Alignment:
Q  463 caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7606878 caaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 7606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Original strand, 10621847 - 10621876
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621847 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10621876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 27101627 - 27101704
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||||||| || ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  27101627 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcttggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 27101704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 31021300 - 31021362
Alignment:
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  31021300 caagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttgttg 31021362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 311
Target Start/End: Original strand, 31021450 - 31021479
Alignment:
Q  282 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021450 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31021479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 35918316 - 35918393
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||| ||  || || ||||||| |||||||||||||||    
T  35918316 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcactattcgatccaatcgtgctacgatttttccagtg 35918393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42990234 - 42990205
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990234 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 42990205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 43228181 - 43228108
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||    
T  43228181 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttcc 43228108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Original strand, 27101558 - 27101594
Alignment:
Q  277 tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101558 tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 117)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 47179950 - 47179480
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47179950 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 47179852  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||    
T  47179851 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaag-agacaaactctata 47179753  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179752 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47179653  T
Q  313 tcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcacca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47179652 tcctgcttaaaatctgtaacaaatctacttaaaatctgtaa-----------caaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgcaagcgcacca 47179564  T
Q  413 tcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179563 tcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 47179480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16226404 - 16225939
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16226404 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 16226306  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16226305 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaag-agacaaactctata 16226207  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16226206 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctt 16226107  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16226106 gcttaaaatctgtaacaaatctacttaaaatctgtaa-----------caaatctgcaccc-aaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgt 16226019  T
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226018 gccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 16225939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 47177599 - 47177130
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  47177599 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca 47177501  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattca-atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||    
T  47177500 atctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaag-agacaaactctata 47177402  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177401 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47177302  T
Q  313 tcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcacca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47177301 tcctgcttaaaatctgtaacaaatctacttaaaatctgtaa-----------caaatctgctcccaaaaataggttttatttttatccgccagcgcacca 47177213  T
Q  413 tcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177212 tcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgccc-aaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 47177130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 50307590 - 50307884
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50307590 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 50307689  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50307690 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 50307789  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50307790 aaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatatatctcaaggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaaag 50307884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 10399872 - 10400193
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  10399872 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccca 10399971  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10399972 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatac 10400070  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |    
T  10400071 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagtttcg 10400170  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  10400171 cttaaaatttggaacaaatctgc 10400193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41647157 - 41646836
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  41647157 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgca 41647058  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41647057 atctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 41646959  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41646958 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 41646859  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  41646858 cttaaaatttggaacaaatctgc 41646836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51750276 - 51749955
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750276 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 51750177  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  51750176 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 51750078  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  51750077 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 51749978  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  51749977 cttaaaatttggaacaaatctgc 51749955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 12302549 - 12302848
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  12302549 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca 12302648  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12302649 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaa-gagacaaactctatac 12302747  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302748 aaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 12302847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6823251 - 6822931
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6823251 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 6823152  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  6823151 atctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaag-agacaaactctatac 6823054  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   |    
T  6823053 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcg 6822954  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  6822953 cttaaaatttggaacaaatctgc 6822931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13215323 - 13214997
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagaga----tgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    | ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13215323 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 13215224  T
Q  114 ccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactc 212  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13215223 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactc 13215125  T
Q  213 tatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215124 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 13215025  T
Q  313 tcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |   ||||||||| || |||||||||||    
T  13215024 tatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 13214997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 28998311 - 28998591
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28998311 tttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaa 28998410  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998411 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttg 28998509  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28998510 ttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 28998591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 29004027 - 29004307
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29004027 tttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaa 29004126  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004127 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttg 29004225  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29004226 ttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 29004307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 340
Target Start/End: Original strand, 38925544 - 38925843
Alignment:
Q  41 tatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  38925544 tatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaga 38925643  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 239  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38925644 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 38925742  T
Q  240 tttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctg 339  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || || |||||||    
T  38925743 tttctgaactcttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaataaatctg 38925842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 6995744 - 6996038
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6995744 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagcccca 6995843  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6995844 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 6995942  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6995943 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggccccctctatctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagt 6996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 28207112 - 28207431
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  28207112 agagcagccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagcccca 28207209  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||    
T  28207210 atctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttacac 28207308  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  28207309 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 28207408  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  28207409 cttaaaatttggaacaaatctgc 28207431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2617753 - 2617460
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2617753 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtccca 2617654  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2617653 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 2617555  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2617554 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 2617460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15823783 - 15823462
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  15823783 agagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 15823684  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15823683 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 15823585  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  15823584 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 15823485  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  15823484 cttaaaatttggaacaaatctgc 15823462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 2949275 - 2949569
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949275 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 2949374  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2949375 atctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 2949473  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  2949474 aaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagt 2949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 17324680 - 17324974
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17324680 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 17324779  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  17324780 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccatagagacaaactctatac 17324878  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  17324879 aaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagccccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagt 17324974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 11457519 - 11457812
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11457519 agagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaccccca 11457618  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11457619 atctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaat-caaactctatac 11457717  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457718 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 11457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13762056 - 13761753
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||    
T  13762056 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaacca 13761958  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13761957 agagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttg 13761859  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  13761858 ttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaa 13761759  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  13761758 atctgc 13761753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18307347 - 18307054
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18307347 agagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagcccc 18307248  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18307247 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttata 18307149  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18307148 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 18307054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 31422930 - 31423212
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  31422930 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgta 31423029  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31423030 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagtttt 31423129  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31423130 gttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagt 31423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47906507 - 47906207
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47906507 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 47906408  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47906407 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 47906309  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906308 aaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 47906209  T
Q  312 gt 313  Q
    ||    
T  47906208 gt 47906207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 9241129 - 9241424
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9241129 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagcccc 9241228  T
Q  118 aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241229 aatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctata 9241327  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9241328 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagcccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagt 9241424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Original strand, 14098013 - 14098329
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgtt-acaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |     
T  14098013 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctct 14098112  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14098113 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtt-ctaaagagacaaactctata 14098211  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  14098212 caaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagtcccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtatt 14098311  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaa 334  Q
     |||||||| || |||||    
T  14098312 acttaaaatttggaacaa 14098329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28840916 - 28840594
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28840916 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 28840818  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  28840817 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatac 28840719  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28840718 aaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgtatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtat 28840619  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  28840618 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 28840594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39932310 - 39932017
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  39932310 agagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 39932211  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39932210 gtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 39932112  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  39932111 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaa 39932017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20302639 - 20302402
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20302639 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 20302540  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa 274  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20302539 cctcaaaacctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 20302441  T
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20302440 agtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaagt 20302402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39462756 - 39462435
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39462756 agagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtccca 39462657  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39462656 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 39462558  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  39462557 aaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagccttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtatta 39462458  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  39462457 cttaaaatttggaacaaatctgc 39462435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6756764 - 6756470
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6756764 agagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6756665  T
Q  118 aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6756664 aatctcttctcgtaatcaagac--tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctata 6756567  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6756566 caaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcagtcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16428891 - 16428596
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  16428891 agagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccc 16428792  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16428791 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaag-agacaaactctata 16428693  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  16428692 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagt 16428596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 336
Target Start/End: Original strand, 3579675 - 3579979
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaa 131  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579675 tttcacta-atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaa 3579773  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579774 tcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttg 3579872  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcag--ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgt 329  Q
    ||| || |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||     
T  3579873 ttgctgcctttctgaacccttgtttcagccccccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagtatcgcttaaaatttgg 3579972  T
Q  330 aacaaat 336  Q
    |||||||    
T  3579973 aacaaat 3579979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 21948232 - 21948526
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21948232 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 21948331  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
       |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21948332 gcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 21948429  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948430 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaa 21948526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 31425058 - 31425335
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  31425058 agagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtccc 31425157  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagat---tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactct 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31425158 aatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactct 31425257  T
Q  214 atacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  31425258 atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacattgatacaa 31425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28842723 - 28842413
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  28842723 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc 28842625  T
Q  127 c-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28842624 ccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaacccta 28842526  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaa 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  28842525 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaa 28842426  T
Q  324 atctgtaacaaat 336  Q
    || || |||||||    
T  28842425 atttggaacaaat 28842413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6824072 - 6823800
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc--------gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatg 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6824072 gttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgtaatagtgtttcccaaggtg 6823973  T
Q  168 aatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcag-ccccctc 266  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6823972 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctc 6823874  T
Q  267 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  6823873 tatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 6823800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Original strand, 50248630 - 50248909
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  50248630 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaa 50248729  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  50248730 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatataaatcatagttttg 50248828  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248829 ttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31490150 - 31489859
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||    
T  31490150 agagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctca 31490051  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  31490050 atctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaact--atac 31489954  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31489953 aaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 31489859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 50076739 - 50077009
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||     
T  50076739 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagac 50076838  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076839 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtct 50076937  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50076938 ttctaaatccttgtttcagccctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47451865 - 47451564
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47451865 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaa 47451766  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| ||||||||||         | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451765 ccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttg 47451673  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaa 331  Q
    |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || || ||    
T  47451672 ttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaatatttggaa 47451573  T
Q  332 caaatctgc 340  Q
    |||||||||    
T  47451572 caaatctgc 47451564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18839826 - 18839531
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  18839826 aagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 18839727  T
Q  117 caatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18839726 cattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgtt-ccaaagagataaactctat 18839628  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839627 acaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagccccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaag 18839531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 17186195 - 17186465
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||     
T  17186195 atgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagac 17186294  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17186295 tcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 17186393  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  17186394 ttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaaag 17186465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17319125 - 17318838
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  17319125 agagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccc 17319026  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||      |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17319025 aatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gtttcccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctaaa 17318933  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17318932 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaa 17318838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24325885 - 24325599
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaac 132  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||    
T  24325885 ttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaac 24325786  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325785 caagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 24325687  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325686 tgttgcctttct-aacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24325599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48665398 - 48665114
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc--gtaacc 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  48665398 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaacc 48665299  T
Q  134 aagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48665298 aagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgtt 48665200  T
Q  234 gttgtctttctaaacccttgattca------gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||       |||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48665199 gttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 48665114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 50078888 - 50079158
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||     
T  50078888 atgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagac 50078987  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  50078988 ttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtct 50079086  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50079087 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 50079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 25251332 - 25251611
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25251332 tttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 25251431  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25251432 accgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaag-agacaaacgttatacaaaccctagtttt 25251530  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25251531 gttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 15294878 - 15295183
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15294878 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtccca 15294977  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  15294978 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaag-agacaaactctatac 15295076  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15295077 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatattta 15295176  T
Q  304 tagtaaa 310  Q
    |||||||    
T  15295177 tagtaaa 15295183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20291637 - 20291400
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20291637 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 20291538  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa 274  Q
    | ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  20291537 cctcaaaacttagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctctatctcaa 20291439  T
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291438 aatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20291400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51752600 - 51752281
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  51752600 agagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 51752502  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  51752501 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 51752404  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    || ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  51752403 aagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 51752304  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  51752303 cttaaaatttggaacaaatctgc 51752281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 274 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 23783533 - 23783362
Alignment:
Q  274 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgc 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23783533 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaatctgc 23783434  T
Q  374 tcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgat 445  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23783433 tcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 23783362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 31735565 - 31735863
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31735565 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 31735664  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  31735665 gcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 31735763  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatc----tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735764 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 9459461 - 9459761
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  9459461 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9459559  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  9459560 atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaag-agacaaactctata 9459658  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9459659 caaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 9459758  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  9459759 agt 9459761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 9463288 - 9463588
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  9463288 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9463386  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  9463387 atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaag-agacaaactctata 9463485  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9463486 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 9463585  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  9463586 agt 9463588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25128110 - 25127856
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |    
T  25128110 agagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctc 25128011  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  25128010 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaag-acacaaactctata 25127912  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25127911 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaggcccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 2510369 - 2510666
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || |    
T  2510369 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaa 2510467  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2510468 atctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 2510566  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510567 aaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2510666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 216 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231444
Alignment:
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtct 16231542  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16231541 tgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaa-----------caaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcg 16231453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 27336984 - 27337280
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  27336984 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcaca 27337082  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||     
T  27337083 gcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cctaagagacaaa-tctataa 27337180  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337181 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27337280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40134182 - 40133937
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  40134182 agagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctc 40134083  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40134082 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaattctata 40133984  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc 263  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40133983 caaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 46431752 - 46431996
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46431752 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 46431850  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  46431851 tcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatac 46431949  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc 264  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46431950 aaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 27339192 - 27339472
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |    
T  27339192 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaacta 27339290  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27339291 agagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaag-agacaaactctatacaaaccctagttttattg 27339389  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339390 ttgcctttctaagcccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27339472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17324287 - 17324009
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-ta 130  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||    
T  17324287 tttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccata 17324188  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17324187 ttcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctataaaaatc--agtttt 17324091  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17324090 gttgtggcctttctgaacccttgttttagccctctctatctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttataataaaag 17324009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42922444 - 42922177
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||     
T  42922444 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagac 42922345  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  42922344 tcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacct--caaccctagtgtttgttg-ctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 42922250  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42922249 ttctaaacccttatttcaaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagt 42922177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 4131419 - 4131676
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagaga----tgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    | ||| |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  4131419 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaag 4131518  T
Q  114 ccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactc 212  Q
     || |  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4131519 tcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactc 4131616  T
Q  213 tatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4131617 tatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccctctatctc 4131676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 14183659 - 14183923
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||     
T  14183659 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagac 14183758  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||   ||||| |     
T  14183759 tcaattataatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caacctctatacaaaccctagtttg--tgttg-ca 14183851  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14183852 ttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaag 14183923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Original strand, 8347343 - 8347607
Alignment:
Q  45 atgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattca 143  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  8347343 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactca 8347442  T
Q  144 atcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttc 243  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  8347443 atcataatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ctaaccttggtgtttgttgccaa-gag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttc 8347537  T
Q  244 taaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347538 taaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagt 8347607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Original strand, 18800631 - 18800907
Alignment:
Q  34 ttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| || || |    
T  18800631 ttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtga 18800730  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  18800731 cctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaag-ag-caaactctatacaaaccgtagttttc 18800826  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800827 ttgttgactt-ctaaacctttgtttcagccccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18800907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 8349119 - 8349385
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||  | |     
T  8349119 atgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaac 8349218  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |     
T  8349219 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac- 8349313  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8349314 ttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaaggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaa 8349385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 49495268 - 49495537
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  49495268 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtg 49495367  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||| ||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  49495368 accaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaac--tc-aaccatagtgtttgttgccaa-gag-caaactatatgcaaaccctagttt- 49495461  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
             ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49495462 -------gatttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 49495537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16432632 - 16432396
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||   |    
T  16432632 agagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttc 16432533  T
Q  118 aatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||            | |    
T  16432532 aatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaag------------aga 16432445  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccct 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16432444 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttctgccccct 16432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Original strand, 15669495 - 15669729
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669495 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 15669594  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagccccctctatctca 273  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || | | | ||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  15669595 c--ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactttatacaaaccctacttttg-tgctg-cctcccaaaccctagttttcagccccctctatccca 15669688  T
Q  274 aagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||| | | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15669689 atgtttacatctgctacaaggtctgtatttatagtaaaagt 15669729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6823810 - 6823675
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6823810 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcatgccacgatttttccagtgccttgc 6823711  T
Q  462 c-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6823710 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 6823675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 51752291 - 51752156
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752291 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcggccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 51752192  T
Q  462 c-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51752191 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 51752156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 51749965 - 51749830
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749965 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcactatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 51749866  T
Q  462 c-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51749865 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtaccacgttgcc 51749830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 25248596 - 25248766
Alignment:
Q  20 gagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  25248596 gagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctca 25248695  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25248696 atctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Original strand, 6115160 - 6115305
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||     
T  6115160 tttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtg 6115259  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacct 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6115260 accaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtgaatcaacct 6115305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16231800 - 16231630
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  16231800 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctca 16231702  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  16231701 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20302385 - 20302250
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20302385 aacaaatatgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgc 20302286  T
Q  462 c-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302285 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 20302250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13761763 - 13761629
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761763 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcacaccatcgtgccgcgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 13761664  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13761663 ctcaaaaactgaaacctccatcatgccacgttgcc 13761629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16429195 - 16429042
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  16429195 agagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattccc 16429096  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaat 170  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16429095 aatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 26520236 - 26520449
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-------gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtg 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||       || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   || | |||||    
T  26520236 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacct--caatcttagtg 26520333  T
Q  190 tttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcag-ccccctctatctcaaagtttgctttgat 287  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||    
T  26520334 tttgttgccaa-gag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccgttgttttcagcccccctctatctcaaggtttactctgat 26520430  T
Q  288 acaaggtctatatttatag 306  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26520431 acaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 306
Target Start/End: Original strand, 13125525 - 13125787
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||     
T  13125525 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagc 13125624  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata-caaaccctagttttgttgttgt 238  Q
     |||||||||| || |||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  13125625 ctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaacct--caaccctagtgtttgtcgccaa-gag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttgg 13125720  T
Q  239 ctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  13125721 c-ttcttaacccttgtttcagccccctttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatag 13125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23786076 - 23785935
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23786076 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 23785978  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23785977 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16231458 - 16231393
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231458 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 16231393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23783359 - 23783298
Alignment:
Q  427 gaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783359 gaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 23783298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51757767 - 51757623
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  51757767 agagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 51757669  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaa 163  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51757668 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27916653 - 27916440
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27916653 cctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaa--ttccaaccctagtgtttgtt 27916556  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt--cagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaag 292  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||    || | || | ||||| ||||| | ||||||||||     
T  27916555 gccaa-gag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgctggc-ttctaaacccttgttttctggctctctgtttctcacagtttacatttgatacaat 27916461  T
Q  293 gtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27916460 gtctatatttatagtaaaagt 27916440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6822893 - 6822827
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6822893 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 6822827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 155865 - 155788
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Original strand, 10400183 - 10400283
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10400183 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttatttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatatttccagtgctttgc 10400282  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  10400283 c 10400283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 28840604 - 28840470
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  28840604 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacaatttttccagtaccttg- 28840506  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28840505 cctaaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 28840470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 408 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28842373 - 28842289
Alignment:
Q  408 caccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgt 492  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28842373 caccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttg-cctaaaaactgaaacctccaatcgtgccacgt 28842289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 30790444 - 30790759
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |     
T  30790444 agagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtct 30790543  T
Q  117 caatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||| |    |  || ||| || |||||     
T  30790544 ccatctcttcgcgtaaccaaaagactca-tcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaaccac--aaccctagtgtctccctcttag-aga-aatctcta- 30790637  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtc 314  Q
      ||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30790638 --aaaccctagttta-ttgtt-tgtttctaaactcttgttttcagctccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 30790733  T
Q  315 ctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
      ||||||||| || |||||||||||    
T  30790734 tcgcttaaaatttggaacaaatctgc 30790759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15823430 - 15823372
Alignment:
Q  404 agcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15823430 agcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttctagtgctttgcc 15823372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23816103 - 23816029
Alignment:
Q  39 tatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23816103 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 23816029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 26613363 - 26613440
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26613363 cctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28279480 - 28279292
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||  |   |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||      
T  28279480 atgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaag 28279381  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 233  Q
     ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  28279380 ctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaa--tcccaaccctagtgtttgttgtcaa-gag-caaactc--tacaaaccctaattttgtt 28279292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 173
Target Start/End: Original strand, 30738695 - 30738830
Alignment:
Q  40 atatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaaga 137  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||    ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||    
T  30738695 atatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaaga 30738794  T
Q  138 gattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30738795 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16561681 - 16561546
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||  |   |||| |||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||    
T  16561681 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagaga 16561582  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16561581 cttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 16561546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Original strand, 13449919 - 13449996
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  13449919 aaaaatacgttttatttttatctaccatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 13449996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Original strand, 13127837 - 13127959
Alignment:
Q  180 aaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||| || ||||    
T  13127837 aaccctagtgtttgttgccaaaagga--aactctatataaaccctacttttcttgttggctt-ctaaacccttgtttcaacccc-tctctctaaaggttt 13127932  T
Q  280 gctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
     ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13127933 actccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 173
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332688
Alignment:
Q  99 taattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 441
Target Start/End: Original strand, 28207421 - 28207500
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgcca 441  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28207421 aacaaatctgcacccaaaaaaacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgttgtgaccccatcgtgcca 28207500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 461
Target Start/End: Original strand, 30790749 - 30790848
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30790749 aacaaatctgcactgaaaaatacgtttatgtttttcccctccagcgcaccatcgtgccacattgcgatcccatcgtgccacgttttttccagtgacttgc 30790848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20291386 - 20291332
Alignment:
Q  443 gatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20291386 gatttttccagtgccatgcctcaaaaaactgaaacctccaccgtgccacgttgcc 20291332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16431096 - 16431044
Alignment:
Q  261 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16431096 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 16431044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332833
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  | || |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaac--ccaaacctagtgtttgttgccaa-gag-caaactc--tacaaaccctattttt 26332812  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    | ||||| | |||||||||||||    
T  26332813 g-tgttggc-ttctaaacccttg 26332833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 279
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115383
Alignment:
Q  240 tttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttt 6115383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14353126 - 14353047
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14353126 cctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Original strand, 26613503 - 26613577
Alignment:
Q  241 ttctaaacccttgatt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26613503 ttctaaacccttgttttcagccccctctatctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagcaaaag 26613577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 6822941 - 6822879
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgat 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6822941 aacaaatctgcacccaaaaatacatttctattattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 6822879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14997101 cctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43104131 - 43104102
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104131 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43104102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Original strand, 46432037 - 46432066
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432037 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 46432066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6445 - 5987
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6445 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtccca 6347  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  6346 atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 6248  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6247 caaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 6148  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgt 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6147 gcttaaaaactgtaacaaatctgctttaaat-----------ttgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgt 6059  T
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6058 gccatgatgagaccccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 5987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 43082266 - 43081774
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  43082266 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca 43082168  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  43082167 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 43082069  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||                |||| ||  | || | ||||||||||||||||    
T  43082068 caaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctatctctctctccaaaatagcct-gatacaaggtctatat 43081970  T
Q  301 ttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43081969 ttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactataacaaatctgctcccaaagatacgttttatttttatcc 43081870  T
Q  401 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43081869 gccagcgtaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccactttgcc 43081774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18811000 - 18810535
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18811000 agagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca 18810902  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18810901 gcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaag-agacaaactctatac 18810803  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  18810802 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcc 18810703  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtg 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18810702 cttaaaatttgtaacaaatctgctcaaaat-----------ctgtaacaaatctgcacccaaaaatgtgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtg 18810614  T
Q  418 ccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18810613 ccacgatgtgaccccatcgtgccgcaatttttccagtgccttgcctaaaaaaataaaacctccatcgtgccacgttgcc 18810535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18813174 - 18812720
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  18813174 agagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcaca 18813076  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||       
T  18813075 gcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactcta--- 18812980  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
            |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  18812979 --------gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcc 18812888  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtg 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18812887 cttaaaatttgtaacaaatctgctcaaaatctgtaacaaa-----------tctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtg 18812799  T
Q  418 ccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812798 ccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 18812720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 44721136 - 44720704
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44721136 agagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 44721038  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt-cccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  44721037 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacagactctata 44720939  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44720938 caaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagtctt 44720839  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||| ||||   ||||  | | ||||||||||||||    
T  44720838 gcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaa-----------caaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttgctgccagcgcaccatcgt 44720750  T
Q  417 gccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44720749 gccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcc 44720704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14808044 - 14807723
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14808044 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 14807945  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14807944 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 14807846  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14807845 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 14807746  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  14807745 cttaaaatttggaacaaatctgc 14807723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1225446 - 1225165
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaa-gagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1225446 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgta 1225347  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1225346 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctttacaaaccctagtttt 1225248  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1225247 gttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaagt 1225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4424294 - 4423990
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4424294 cactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaacca 4424195  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424194 agagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagc-gacaaactctatacaaaccctagttttgttg 4424096  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  4424095 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 4423996  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  4423995 atctgc 4423990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27911299 - 27911014
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911299 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 27911200  T
Q  127 c-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27911199 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaacccta 27911101  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27911100 gttttgttgttg-ccttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27911014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27957718 - 27957433
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27957718 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 27957619  T
Q  127 c-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacccta 225  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27957618 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaacccta 27957520  T
Q  226 gttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27957519 gttttgttgttg-ccttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27957433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41385037 - 41384744
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  41385037 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctcca 41384938  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41384937 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 41384839  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41384838 aaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41384744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27827278 - 27826958
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  27827278 agagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtccca 27827180  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27827179 gcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 27827081  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  27827080 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcg 27826981  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  27826980 cttaaaatttggaacaaatctgc 27826958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27829589 - 27829269
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  27829589 agagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtccca 27829491  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27829490 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 27829392  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  27829391 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcg 27829292  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  27829291 cttaaaatttggaacaaatctgc 27829269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 284 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 43079614 - 43079399
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaa---ctgtaacaaatctgctcccaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||    
T  43079614 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcttaaaatctgtaaaaaaaaaactataacaaatctgctcccaaa 43079515  T
Q  381 aatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc 480  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079514 gatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtaccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc 43079415  T
Q  481 atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||    
T  43079414 atcgtgccacgttgcc 43079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15073004 - 15072686
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15073004 agagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtccca 15072905  T
Q  119 atc-tcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15072904 accctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctata 15072806  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15072805 caaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 15072706  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  15072705 gcttaaaatttggaacaaat 15072686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15068274 - 15067953
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  15068274 agagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 15068175  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15068174 acctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 15068076  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  15068075 aaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcg 15067976  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  15067975 cttaaaatttggaacaaatctgc 15067953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32339602 - 32339304
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32339602 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 32339503  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32339502 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 32339404  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339403 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 32339304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 30480545 - 30480838
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30480545 agagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctca 30480644  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30480645 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 30480743  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30480744 aaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 30480838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 27106941 - 27107232
Alignment:
Q  21 agcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaat 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27106941 agcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaat 27107040  T
Q  121 ctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaa 219  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27107041 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaa 27107139  T
Q  220 accctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107140 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 27107232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 28251609 - 28251930
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28251609 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtccca 28251708  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28251709 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 28251807  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  28251808 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaacccactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 28251907  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  28251908 cttaaaatttggaacaaatctgc 28251930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 13858526 - 13858820
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | |  | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13858526 agagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatataa-tgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagcccc 13858624  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13858625 aatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaag-agacaaactctata 13858723  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13858724 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 13858820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14477511 - 14477276
Alignment:
Q  77 ttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14477511 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaacc 14477412  T
Q  176 ttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaa 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  14477411 ctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaag 14477313  T
Q  276 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14477312 gtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 14477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 22684695 - 22685002
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaa---gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcc 115  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22684695 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22684794  T
Q  116 ccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  22684795 ccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt-ccaaaaagacaaactcta 22684893  T
Q  215 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22684894 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttat 22684993  T
Q  305 agtaaaagt 313  Q
    ||| |||||    
T  22684994 agtgaaagt 22685002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 14419246 - 14419527
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || | | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14419246 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 14419345  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419346 accaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaag-agacaaactctatacaaaccctagtttt 14419444  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14419445 tttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 14419527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3874303 - 3874005
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3874303 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 3874204  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3874203 gcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 3874105  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3874104 aaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccccgctatctctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 3874005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 28283262 - 28283561
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  28283262 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagcccca 28283360  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  28283361 atctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagtcaaactctatac 28283459  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283460 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 28283559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36865815 - 36865538
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  36865815 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtg 36865716  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865715 a---agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagtttt 36865620  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36865619 gttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 36865538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15809494 - 15809214
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||||    
T  15809494 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaacca 15809395  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809394 agagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa--agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 15809297  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809296 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15809214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41382955 - 41382672
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41382955 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 41382856  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||            |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  41382855 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagg-----------tgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaattctatac 41382768  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41382767 aaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagccccatctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41382672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 609027 - 608735
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  609027 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 608928  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  608927 gcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 608829  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 303  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  608828 aaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgatataaggtctatattta 608735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 24873223 - 24873523
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24873223 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 24873321  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24873322 atctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcccaag-agacaaactctata 24873420  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24873421 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 24873520  T
Q  311 agt 313  Q
    |||    
T  24873521 agt 24873523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25952814 - 25952521
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | | |    
T  25952814 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctc 25952715  T
Q  118 aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25952714 aatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactatata 25952616  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25952615 c-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaag 25952521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 33541507 - 33541723
Alignment:
Q  96 gcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 194  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33541507 gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 33541606  T
Q  195 tgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggt 294  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||    
T  33541607 t-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttacactgatacaatgt 33541705  T
Q  295 ctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33541706 ctatatttatagtaaaag 33541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 5372227 - 5372512
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  5372227 cctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctctt 5372326  T
Q  126 ccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5372327 cccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaa-gagacaaactctatataaaccct 5372425  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5372426 aattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaag 5372512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43079895 - 43079650
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43079895 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 43079797  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  43079796 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 43079698  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc 264  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43079697 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43530391 - 43530123
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||     
T  43530391 cactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccg 43530292  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||             ||||    
T  43530291 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctacac-------------gttg 43530206  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530205 ttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43530123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 312
Target Start/End: Original strand, 5622877 - 5623073
Alignment:
Q  116 ccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactcta 214  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  5622877 ccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaat-agacaaactcta 5622975  T
Q  215 tacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5622976 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaag 5623073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775200
Alignment:
Q  134 aagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgtt 26775280  T
Q  234 gttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26775279 gttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagt 26775200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31162479 - 31162212
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  31162479 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagac 31162380  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||  ||||||| | | |    
T  31162379 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaa-gag-caaactttatacaaacacta-atttgttgct-tgt 31162286  T
Q  241 ttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162285 ttctaaacctttgtttttagccccctctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31162212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21482580 - 21482322
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  21482580 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagac 21482481  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||   | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||          |    
T  21482480 tcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactttatacaaaccctagttt--------gat 21482394  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21482393 ttctaaacccttgtttcagtccactctatctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaag 21482322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 15185764 - 15186046
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||       ||||||    
T  15185764 cctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctctt 15185856  T
Q  126 cc-gtaaccaagagat--tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacc 222  Q
    || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  15185857 cccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactttatataaacc 15185955  T
Q  223 ctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15185956 atagttttgttattttctttctaaacccttgtttcagtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagt 15186046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15956243 - 15956051
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15956243 cctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 15956144  T
Q  126 -ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacc 222  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15956143 cccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21480796 - 21480547
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21480796 agagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaacccc 21480697  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  21480696 aatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaa-cctagtgtttgttgccaa-gag-caaactccata 21480602  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21480601 caaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccatctatctcaaggttt 21480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872713
Alignment:
Q  148 taatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaa 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaag-agacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaa 35872648  T
Q  248 cccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35872649 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35872713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 336
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886277
Alignment:
Q  212 ctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  312 gtcctgcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    ||   ||||||||| || |||||||    
T  3886253 gtatcgcttaaaatttggaacaaat 3886277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 12517249 - 12517385
Alignment:
Q  202 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctata 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12517249 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtatata 12517348  T
Q  300 tttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    | ||||||||||||   ||||||||| || |||||||    
T  12517349 tatatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaat 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Original strand, 3005697 - 3005929
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||     
T  3005697 atgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagac 3005796  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||   || ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||| |||| |||||| || | |    
T  3005797 tcaatgctaatagtgttttccaaagtgaatcaa---tccaaccctattgtttgttgttaa-gag-caaactctatacaaactctag-tttgttatt-tgt 3005889  T
Q  241 ttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagttt 279  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  3005890 ttctaaacccttgtttccagccccctctatctcaaggttt 3005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 181772 - 181622
Alignment:
Q  41 tatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc---gtaaccaaga 137  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||| ||||    
T  181772 tatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaaga 181674  T
Q  138 gattcaatcctaa-tagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
    || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  181673 gacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468461
Alignment:
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata----caaaccctag 226  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    |||||| |||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaag-ag-caaactctatatatacaaaccgtag 2468355  T
Q  227 ttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatc 326  Q
    |||  ||        |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||     
T  2468356 tttgatt--------tctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaacatt 2468447  T
Q  327 tgtaacaaatctgc 340  Q
    || |||||||||||    
T  2468448 tggaacaaatctgc 2468461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27826968 - 27826834
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgtttta-tttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||  |||||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27826968 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 27826869  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
       ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27826868 ttcaaaaaatgaaacctccatcgtgccacgttgcc 27826834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27829279 - 27829145
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgtttta-tttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||  |||||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27829279 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgttttgc 27829180  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27829179 ctcaaaaaatgaaacctccatcgtgccacgttgcc 27829145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181536
Alignment:
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 181536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31035236 - 31035068
Alignment:
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  31035236 tcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 31035142  T
Q  241 ttctaaacccttg-attcagccccctcta--tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||||||||| |||  |||||  | |||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035141 ttctaaaccattgttttcag-actctctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31035068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214512
Alignment:
Q  94 ccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  193 gttgccaaggagacaaactctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca 273  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37214408 gtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 37214506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 31573847 - 31573950
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||    
T  31573847 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tcccaaccatagtgtttgtt 31573944  T
Q  196 gccaag 201  Q
    ||||||    
T  31573945 gccaag 31573950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14807693 - 14807634
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14807693 cagcgcaccaccgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 14807634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 12517420 - 12517513
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12517420 cagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtacattg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 12517513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 31578343 - 31578476
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  31578343 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagaga 31578442  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31578443 ctcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 494
Target Start/End: Original strand, 3886322 - 3886386
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttg 494  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3886322 ccatcgtaccacgatttttccagtgtcttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttg 3886386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 462
Target Start/End: Original strand, 28251988 - 28252040
Alignment:
Q  410 ccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28251988 ccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 28252040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 35872482 - 35872530
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 67  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872482 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 35872530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15067963 - 15067864
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttttattt-ttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  15067963 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcgatcccatcgtggcatgatttttccagtggcttgc 15067864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17847740 - 17847677
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17847740 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 2468171 - 2468259
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattcta 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2468171 agagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 13985199 - 13985262
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13985199 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31035332 - 31035253
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  31035332 cctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaatcaacc 31035253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4423952 - 4423887
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  4423952 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttg-ccttaaaactgaaacctccaattgtgccacgttgcc 4423887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375988
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6375988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15072692 - 15072593
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||  | | |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15072692 aacaaatttgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcatgccacgttgcgatcccatcgtgacacgatttttctagtggcttgc 15072593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17847556 - 17847527
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847556 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17847527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 33541452 - 33541500
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagat 67  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33541452 agagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagat 33541500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4242 - 3922
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4242 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 4143  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
       |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  4142 gcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagtt-ccaaagagacaaact-tatac 4045  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4044 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattg 3945  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  3944 cttaaaatttgaaacaaatctgc 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 183683 - 183975
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  183683 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 183782  T
Q  119 atctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  183783 atctcttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctataca 183881  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  183882 aactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 183975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52257 - 51961
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | ||    
T  52257 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcaca 52158  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  52157 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaaaagacaaactctatac 52059  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52058 aaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 491
Target Start/End: Original strand, 4816273 - 4816749
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4816273 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 4816372  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  4816373 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 4816471  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||              |||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  4816472 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatattta 4816571  T
Q  304 tagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtc 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||  |   |    
T  4816572 tagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaa----------aaatctgtaacaaatctgcaccaaaaaatatgtttctgtttttgctacc 4816661  T
Q  404 agcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacg 491  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4816662 agcacaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtaccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacg 4816749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530485
Alignment:
Q  20 gagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaa 119  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  120 tctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctataca 15530363  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgc 318  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  15530364 aaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgc 15530463  T
Q  319 ttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||| || |||||| ||||    
T  15530464 ttaaaatttggaacaaacctgc 15530485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 3233772 - 3234065
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3233772 agagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctca 3233871  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  3233872 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatac 3233971  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3233972 aaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaag 3234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9020198 - 9019877
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020198 agagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 9020099  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9020098 atctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgtt-ccaaagagacaaactctatac 9020000  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  9019999 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcg 9019900  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  9019899 cttaaaatttggaacaaatctgc 9019877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 11983071 - 11983392
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11983071 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 11983170  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11983171 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 11983269  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  11983270 aaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 11983369  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||| || |||||||||||    
T  11983370 tttaaaatttgaaacaaatctgc 11983392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 1230291 - 1230585
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1230291 agagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1230390  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1230391 gcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 1230489  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1230490 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccctctctatctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 1230585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 20915398 - 20915736
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20915398 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtccca 20915496  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  20915497 atctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctata 20915595  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915596 caaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaatttagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20915694  T
Q  314 cctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaaca 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915695 cttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaaca 20915736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 268 - 496
Target Start/End: Original strand, 26068590 - 26068830
Alignment:
Q  268 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaa--- 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||       
T  26068590 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgctttaaatttgtaacaaatctgtaacaa 26068689  T
Q  365 ---------caaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068690 aaacggtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 26068789  T
Q  456 ccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068790 ccttgcccaaaaaactaaaacctccatcatgccacgttgcc 26068830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 28241363 - 28241657
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  28241363 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtccca 28241462  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28241463 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 28241561  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28241562 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 28241657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 3629906 - 3630199
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3629906 agagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagcccca 3630005  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3630006 atctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaag-agacaaactctatac 3630104  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630105 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccccctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaag 3630199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13057459 - 13057173
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13057459 cctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 13057360  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057359 cccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccct 13057261  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057260 agttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 13057173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 268 - 496
Target Start/End: Original strand, 26066319 - 26066559
Alignment:
Q  268 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa---------- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||              
T  26066319 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctactttaaatttgtaacaaatctgtaacaa 26066418  T
Q  358 --actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066419 aaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccattgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 26066518  T
Q  456 ccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066519 ccttgcccaaataactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 26066559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 3631979 - 3632271
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  3631979 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccc 3632078  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3632079 aatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctata 3632177  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632178 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 3632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3390652 - 3390357
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390652 agagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc 3390553  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3390552 aatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagaaaaactctata 3390454  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390453 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 3390357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Original strand, 15541196 - 15541503
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaa 131  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  15541196 tttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtga 15541295  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541296 ccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttatt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 15541394  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaa 331  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || ||    
T  15541395 tttttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtaacttaaaatttggaa 15541494  T
Q  332 caaatctgc 340  Q
    |||||||||    
T  15541495 caaatctgc 15541503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Original strand, 14458826 - 14459093
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  14458826 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 14458925  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458926 agagactcaatcctaatagtgtttcccaag--gaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 14459022  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 305  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14459023 ttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 15532723 - 15533044
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  15532723 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtccca 15532822  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  15532823 atctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctattgtttgtt-ccaaagaaacaaactttatac 15532921  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||        
T  15532922 aaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataa 15533021  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  15533022 cttaaaatttggaacaaatctgc 15533044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25477518 - 25477253
Alignment:
Q  47 gagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  25477518 gagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaat 25477419  T
Q  146 cctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25477418 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttcta 25477320  T
Q  246 aacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25477319 aacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 25477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 14507218 - 14507536
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  14507218 agagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca 14507316  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  14507317 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 14507415  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14507416 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 14507515  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatct 338  Q
    |||||||| || |||||||||    
T  14507516 cttaaaatttggaacaaatct 14507536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 340
Target Start/End: Original strand, 30728926 - 30729191
Alignment:
Q  75 agttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 173  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30728926 agttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 30729025  T
Q  174 ccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctca 273  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30729026 ccctcaaatcctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccctctatctca 30729124  T
Q  274 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  30729125 aggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtaccgcttaaaatttggaacaaatctgc 30729191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32280269 - 32279948
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatat-gatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  32280269 agagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtccc 32280170  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32280169 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaa-gagacaaactctata 32280071  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||       
T  32280070 caaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag-cccctctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagtatc 32279972  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  32279971 gcttaaaatttggaacaaatctgc 32279948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 264 - 488
Target Start/End: Original strand, 29754983 - 29755219
Alignment:
Q  264 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc-ttaaa----------atctgta 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          |||||||    
T  29754983 ctctctctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgccttaaatttgtaacaaatctgta 29755082  T
Q  353 acaaaa-ctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttcc 451  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29755083 acaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcc 29755182  T
Q  452 agtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755183 agtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 29755219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 12195557 - 12195851
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  12195557 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtccca 12195655  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  12195656 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 12195754  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195755 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12195851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 279 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 33311235 - 33311011
Alignment:
Q  279 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa------------actgtaaca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||            |||||||||    
T  33311235 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaaca 33311136  T
Q  367 aatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311135 aatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 33311036  T
Q  467 aaactaaaacctccatcgtgccacg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33311035 aaactaaaacctccatcgtgccacg 33311011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 279 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 33308966 - 33308742
Alignment:
Q  279 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaaactgtaacaaa---------- 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||              
T  33308966 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaaatgtaaca 33308867  T
Q  369 --tctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 466  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308866 aatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 33308767  T
Q  467 aaactaaaacctccatcgtgccacg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33308766 aaactaaaacctccatcgtgccacg 33308742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13040027 - 13039733
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |    
T  13040027 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctc 13039928  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13039927 aatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaag-agacaaactctata 13039829  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13039828 caaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 13039733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30967456 - 30967176
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||    
T  30967456 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaacca 30967357  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30967356 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttg 30967258  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagttt-gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967257 ttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcct--atacaaggtctatatttatagtaaaagt 30967176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 340
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227771
Alignment:
Q  83 gaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaa 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  182 ccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc 281  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  19227614 ccctagtgtttgat-ccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgc 19227712  T
Q  282 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||    
T  19227713 tctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 19227771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Original strand, 19704609 - 19704905
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaa-agagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19704609 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 19704708  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  19704709 aatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaag-agacaaactctat 19704807  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704808 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccatctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 19704905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 2628928 - 2629226
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  2628928 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtccca 2629026  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2629027 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaag-agacaaactctatac 2629125  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629126 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 2629225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 313
Target Start/End: Original strand, 30034664 - 30034943
Alignment:
Q  38 ctatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaag 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||     
T  30034664 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaat 30034763  T
Q  137 agattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtt 236  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30034764 tgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgtt 30034862  T
Q  237 gtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034863 gcctttctaaacccttgttttagctccctctatctctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 30034943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26065254 - 26065005
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26065254 agagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 26065156  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  26065155 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt----ccaaagagacaaactctatac 26065060  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26065059 aaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26085223 - 26084974
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26085223 agagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 26085125  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  26085124 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt----ccaaagagacaaactctatac 26085029  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085028 aaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 24338488 - 24338783
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| |      
T  24338488 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtctt 24338587  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccc-tagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||    
T  24338588 aatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaag-acacaaactttat 24338686  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338687 gcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490618
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctc-ttccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||    | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcct 22490691  T
Q  241 ttc-taaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  22490690 ttcaaaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttatggtaaaag 22490618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 3027894 - 3028186
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  3027894 aagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtct 3027993  T
Q  117 caatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3027994 caatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaactctat 3028089  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028090 acaaaccctagttttgt-gttgccttcc-aaacccttgttttcagccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3028186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Original strand, 12161609 - 12161889
Alignment:
Q  29 tccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc- 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| |||| | |||||||||||     
T  12161609 tccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttccc 12161708  T
Q  128 gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagt 227  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161709 gtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cca--gagacaaactctatacaaaccctagt 12161805  T
Q  228 tttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12161806 tttgttgttgcatttctaaacccttgtttcag-cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaag 12161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 26932612 - 26932906
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932612 cctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 26932710  T
Q  127 c-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26932711 ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaag-agacaaactctatacaaaccct 26932809  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| |||||||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26932810 agttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 26932906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17012287 - 17012029
Alignment:
Q  44 gatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattc 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  17012287 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactc 17012188  T
Q  143 aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcttt 242  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  17012187 aatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacct--caaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtt-tactt 17012094  T
Q  243 ctaaaccc-ttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  17012093 ctaaacccttttattcagacccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 165 - 340
Target Start/End: Original strand, 1072066 - 1072240
Alignment:
Q  165 atgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc 264  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||     
T  1072066 atgaatcaactcacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctcct 1072164  T
Q  265 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  1072165 tctatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 1072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14466581 - 14466312
Alignment:
Q  34 ttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaa 131  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  14466581 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaa 14466482  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa-ccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||            || |||||| ||||||||    
T  14466481 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaa------------tagacaaactctagtttt 14466394  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||  | | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14466393 gctgttgtctttctaaactcttgtttcaaccctctctatctcaaggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaaag 14466312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15719901 - 15719666
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  15719901 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatg 15719802  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||     
T  15719801 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaac--tc-aaccctagtgtttgttgccaa--aagcaaactctatacaaaccctagttt- 15719708  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagttt 279  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15719707 -------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttt 15719666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 32447505 - 32447651
Alignment:
Q  166 tgaatcaaccttcaaacc-ctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccc 264  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32447505 tgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 32447603  T
Q  265 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32447604 tctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 32447651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8995573 - 8995430
Alignment:
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||    
T  8995573 ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatct 8995474  T
Q  297 atatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  8995473 atatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 8995430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 16455467 - 16455698
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  16455467 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtccc 16455566  T
Q  118 aatctc-ttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||| |||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  16455567 aatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacc--acaaccctagtgttcgttgccaa-gaga-aaactctgta 16455662  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  16455663 caaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttg 16455698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852520
Alignment:
Q  182 ccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc 281  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  17852650 ccctagtgtttgtt-cgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 17852552  T
Q  282 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17852551 tctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 17852520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 1069760 - 1069913
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  1069760 agagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 1069859  T
Q  118 aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaat 170  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1069860 aatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 13870612 - 13870749
Alignment:
Q  166 tgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccct 265  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13870612 tgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaag-agacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cccct 13870709  T
Q  266 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 305  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13870710 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 5273258 - 5273431
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5273258 agagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 5273356  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtt 191  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  5273357 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 401 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8995402 - 8995307
Alignment:
Q  401 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8995402 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgccca-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 8995307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 401 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9019849 - 9019754
Alignment:
Q  401 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9019849 gtcagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgccca-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 9019754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 19227803 - 19227896
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  19227803 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaattgaaacctccatcatgccacgttgcc 19227896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 14507569 - 14507664
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttg--cccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14507569 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccaccatttttccagtgccttgtatcaaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 14507664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 12186113 - 12186271
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccc 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||| |     
T  12186113 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtct 12186212  T
Q  117 caatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12186213 caatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19696633 - 19696420
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| | || || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  19696633 cctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttgaaccctagtgattgtt 19696536  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg-attcagcc--ccctctatctcaaagtttgctttgatacaag 292  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||| ||||  |   |||||||    
T  19696535 gccaa-gag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccctccctctctctcaaggtttcatcatatacaag 19696440  T
Q  293 gtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19696439 gtctatatttatagtaaaag 19696420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15367303 - 15367123
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||| | | |  |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||   ||    
T  15367303 agagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttca 15367204  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    ||||||||| |  || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  15367203 atctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaag 15367123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26945393 - 26945258
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  26945393 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaga 26945294  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26945293 cttaatcctaatagtgtttcccaaggtgactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 26066166 - 26066307
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26066166 agagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca 26066264  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26066265 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 29754751 - 29754892
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  29754751 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtccca 29754849  T
Q  119 atctc-ttccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29754850 atctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33309128 - 33308988
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33309128 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccca 33309031  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33309030 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346369
Alignment:
Q  145 tcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttct 244  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||   |        |||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaag-ag-caaattttatacaaaccctagtttgaat--------tct 15346438  T
Q  245 aaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15346437 aaacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 15346369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33311380 - 33311257
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaacca 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33311380 cactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacca 33311283  T
Q  135 agaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  33311282 agagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 456
Target Start/End: Original strand, 11983382 - 11983476
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983382 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 11983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 26068437 - 26068578
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| ||||||| || |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  26068437 agagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtccca 26068535  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26068536 atctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10584210 - 10584105
Alignment:
Q  202 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatt 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||     ||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||    
T  10584210 gagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatt 10584116  T
Q  302 tatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||    
T  10584115 tatagtaaaag 10584105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20526999 - 20526896
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20526999 cctaattctaccaaaagtcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaatct--caaccctagtgtttgtt 20526902  T
Q  196 gccaag 201  Q
    | ||||    
T  20526901 gtcaag 20526896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 22858075 - 22858178
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22858075 cctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaatct--caaccctagtgtttgtt 22858172  T
Q  196 gccaag 201  Q
     |||||    
T  22858173 accaag 22858178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 26084895 - 26084818
Alignment:
Q  378 aaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  26084895 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgatgcgattcaatcgtggcacgatttttccagtg 26084818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Original strand, 30729181 - 30729281
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  30729181 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcactatcgtgccacgttgtgaccccatcgtggcacgaaatttccagtgacttgc 30729280  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  30729281 c 30729281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 313
Target Start/End: Original strand, 12186330 - 12186405
Alignment:
Q  240 tttctaaacccttgatt-cagccccctctatctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12186330 tttctaaacccttgttttcagccccttctatctcaaggtttacatgtgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 12186405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  99 taattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18318048 - 18318004
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18318048 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 18318004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Original strand, 28037851 - 28037927
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatca 172  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || |||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28037851 cctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Original strand, 15530516 - 15530575
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  15530516 cagcacaccatcgtgccacgatgcggccccatcgtaccacgaattttcgagtgctttgcc 15530575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15346605 - 15346525
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaag 113  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||    
T  15346605 tttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaag 15346525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Original strand, 19504405 - 19504708
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccgtaaccaa 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19504405 cactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccgtaaccaa 19504504  T
Q  136 gagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504505 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 19504603  T
Q  236 tgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaa 335  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || ||||||    
T  19504604 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaa 19504703  T
Q  336 tctgc 340  Q
    |||||    
T  19504704 tctgc 19504708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19007853 - 19007560
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007853 agagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 19007754  T
Q  119 atctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19007753 atctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 19007655  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19007654 aaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaag 19007560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Original strand, 22287378 - 22287695
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||   ||    
T  22287378 agagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtca 22287477  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  22287478 atctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgtt-ccaaagagacagactctatac 22287576  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  22287577 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 22287676  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaat 336  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22287677 cttaaaatttggaacaaat 22287695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27105010 - 27104691
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27105010 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 27104912  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  27104911 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaag-agacaaactctatac 27104814  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  27104813 aaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcg 27104714  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  27104713 cttaaaatttggaacaaatctgc 27104691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 76 - 340
Target Start/End: Original strand, 40032157 - 40032421
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40032157 gttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 40032256  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa 274  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40032257 cctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 40032355  T
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||||||||    
T  40032356 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaacttggaacaaatctgc 40032421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28196836 - 28196557
Alignment:
Q  33 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  28196836 tttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataa 28196737  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196736 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttg 28196638  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28196637 ttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 28196557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42064727 - 42064407
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  42064727 agagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctca 42064629  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  42064628 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 42064530  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  42064529 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 42064430  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  42064429 cttaaaatttggaacaaatctgc 42064407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Original strand, 13910104 - 13910407
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  13910104 cactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaacca 13910202  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910203 agagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttg 13910301  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||    
T  13910302 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaa 13910401  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  13910402 atctgc 13910407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 45280026 - 45280321
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45280026 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 45280125  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45280126 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 45280224  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttg-tctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45280225 aaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagt 45280321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 42923551 - 42923847
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42923551 agagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 42923650  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42923651 atctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatac 42923749  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42923750 aaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcctcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 42923847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 21520735 - 21521058
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  21520735 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 21520834  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21520835 gcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 21520933  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcc 315  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  21520934 aagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtat 21521033  T
Q  316 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
     ||||||| | || |||||||||||    
T  21521034 cgcttaaattttggaacaaatctgc 21521058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 6258858 - 6259178
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6258858 agagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagcccc 6258957  T
Q  118 aatctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  6258958 aatct-tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttatt-ccaaatagacaaactctatac 6259055  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6259056 aaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcctcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcg 6259155  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  6259156 cttaaaatttggaacaagtctgc 6259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 36559067 - 36559298
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  36559067 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 36559166  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559167 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 36559266  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559267 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 36559298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17848653 - 17848365
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  17848653 agagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctca 17848558  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17848557 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatac 17848458  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | || |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17848457 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagccccctctatctcaaggattac--tgatacaaagcctatatttatagtaaaag 17848365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Original strand, 19502070 - 19502345
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||    
T  19502070 cactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaacca 19502169  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19502170 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctacacaaaccctagttttgttg 19502268  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502269 ttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 19502345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 6264190 - 6264508
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  6264190 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagcccc 6264289  T
Q  118 aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  6264290 aatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgta-ccaaagagacaaactctata 6264388  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcct 316  Q
    ||||||||    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |       
T  6264389 caaaccct----ttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 6264484  T
Q  317 gcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  6264485 gcttaaaatttggaacaaatctgc 6264508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 311
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539809
Alignment:
Q  55 ttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatag 153  Q
    |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  154 tgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttg 15539751  T
Q  254 attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
     |||| |||||| |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539752 tttcaaccccctatatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 24162265 - 24162575
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24162265 agagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 24162363  T
Q  119 atctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctataca 218  Q
             | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  24162364 ---------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctataca 24162453  T
Q  219 aaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgc 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  24162454 aaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgc 24162553  T
Q  319 ttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  24162554 ttaaaatttgaaacaaatctgc 24162575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42452994 - 42452702
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  42452994 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 42452895  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |  |||||||||| |||||    
T  42452894 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgtt---acagagacaaactttatac 42452798  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42452797 aaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagt 42452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Original strand, 45332384 - 45332615
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaa-tctgtaacaaatctgcttaaaat-----------ctgtaacaa 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||           |||||||||    
T  45332384 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaaatctataacaaatctgcctaaaatctgtaacaaatctgtaacaa 45332483  T
Q  357 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45332484 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgttccacgatttttccagttc 45332583  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332584 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 45332615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 23452279 - 23452577
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23452279 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtccca 23452378  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23452379 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 23452477  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452478 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 23452577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 43623622 - 43623931
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43623622 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 43623721  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||             ||||||||||||||||    
T  43623722 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt-------------gagacaaactctatac 43623808  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  43623809 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtattg 43623908  T
Q  318 cttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  43623909 cttaaaatttggaacaaatctgc 43623931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 45239019 - 45239271
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  45239019 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcttaattctaccaaaaacccca 45239118  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  45239119 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa--agagaaagtctatac 45239216  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  45239217 aaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctc 45239271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17849317 - 17849037
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  17849317 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgta 17849218  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17849217 accaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttctt-ccaaagaggcaaactctatacgaactctagtttt 17849119  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17849118 gttgttatctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaag 17849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14837467 - 14837193
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccgtaa 131  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||        
T  14837467 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttcc---- 14837372  T
Q  132 ccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttg 231  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14837371 -caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttg 14837274  T
Q  232 ttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14837273 ttgttgtcttttttaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 14837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Original strand, 11739625 - 11739895
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |   || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  11739625 atgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaa 11739724  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11739725 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgtt-ccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtct 11739823  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11739824 ttctaaacccttgttccagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 11739895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3022319 - 3022086
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3022319 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaac 3022220  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaa 274  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  3022219 cctcaaaccgtagtgtttgttgccaag-agacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagcctcctatatctcaa 3022121  T
Q  275 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 309  Q
     |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3022120 ggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 31732818 - 31733100
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  31732818 agagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccc 31732917  T
Q  118 aatctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||           ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31732918 aa-----------accaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaag-agacaaactctatac 31733005  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31733006 aaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaag 31733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Original strand, 44289123 - 44289403
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||||||   || | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  44289123 tttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgta 44289222  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44289223 accaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacagactctatacaaactctagtttt 44289321  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44289322 gttgttgccttcctaaacctttgttttagtcccctctatatcaaggtttgctatgatacaaaacctatatttatagtaaaag 44289403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 11578149 - 11578439
Alignment:
Q  18 aagagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccc 116  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11578149 aagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11578248  T
Q  117 caatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctat 215  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  11578249 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaa-gagaaaaattctat 11578343  T
Q  216 acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11578344 acaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccactctatctcaagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Original strand, 34979679 - 34979906
Alignment:
Q  77 ttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34979679 ttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 34979778  T
Q  176 ttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaa 275  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  34979779 ctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcagccccctctatctcaag 34979877  T
Q  276 gtttgctttgatacaaggtctatatttat 304  Q
    |||| |  | |||||| ||||||||||||    
T  34979878 gtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 35215628 - 35215932
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35215628 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 35215726  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  35215727 aactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 35215825  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc----------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  35215826 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatag 35215925  T
Q  307 taaaagt 313  Q
    |||||||    
T  35215926 taaaagt 35215932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 35218005 - 35218258
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  |||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35218005 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 35218103  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  35218104 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaag-agacaaactctata 35218202  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35218203 taaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 445
Target Start/End: Original strand, 36561344 - 36561532
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  36561344 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 36561443  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgat 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36561444 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 36561532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 340
Target Start/End: Original strand, 18800363 - 18800665
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800363 cctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctctt 18800462  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccct 224  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  18800463 cctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caacctctatacaaaccct 18800557  T
Q  225 agttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaa 324  Q
    || ||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||    
T  18800558 agctt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaa 18800649  T
Q  325 tctgtaacaaatctgc 340  Q
    | || |||||||||||    
T  18800650 tttggaacaaatctgc 18800665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407772
Alignment:
Q  158 tcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattc 257  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 22407689  T
Q  258 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  22407690 agcaccctatatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattttgaacaaatctgc 22407772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 22163117 - 22163282
Alignment:
Q  146 cctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttcta 245  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22163117 cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttgttgcctttcta 22163215  T
Q  246 aacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22163216 aatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 22163282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38020348 - 38020162
Alignment:
Q  76 gttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc-aatctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  38020348 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccccaat----------accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaac 38020259  T
Q  175 cttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38020258 cctcaaaccctagtgtttgtttccaag-agacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 20146650 - 20146941
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccc 117  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  20146650 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctc 20146749  T
Q  118 aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  20146750 aatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaa--tcccaaccatagtgtttgttgccaag--ggcaaactctata 20146845  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||     | |||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146846 caaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcaaactctctacctcttaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20146941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22874330 - 22874061
Alignment:
Q  33 tttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgta 130  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  22874330 tttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtg 22874231  T
Q  131 accaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagtttt 230  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||   | |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22874230 actaagagactcaatcctaatactgttttccaaggtgaatcaac---ccaaccatagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttt- 22874137  T
Q  231 gttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  22874136 -------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagt 22874061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Original strand, 5375388 - 5375550
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  5375388 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagt-ctccgcctaattctacccaaagtccca 5375486  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaa 181  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  5375487 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 222
Target Start/End: Original strand, 28459239 - 28459435
Alignment:
Q  27 cctccatttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  28459239 cctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactctt 28459338  T
Q  126 cc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaacc 222  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28459339 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaa-gagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 19502405 - 19502498
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19502405 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 19502498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 403 - 496
Target Start/End: Original strand, 19504739 - 19504832
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504739 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaattaaaacctccatcgtgccacgttgcc 19504832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 5377630 - 5377769
Alignment:
Q  177 tcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctc 272  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||    
T  5377630 tcaaaacctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctc 5377728  T
Q  273 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5377729 aaagtttgctctgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 5377769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 17897311 - 17897578
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||| | | |||||||||     
T  17897311 atgatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagac 17897410  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  17897411 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc-tcaa--cctagtgtttgttgcgaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac- 17897504  T
Q  241 ttctaaacccttgat-tcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||| | ||||  | ||||| |||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897505 ttctaaacccttgttctcag-actctctacctcaagttttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17897578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 24162565 - 24162700
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||  | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162565 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctaatattcgcagccagcgcacaatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 24162664  T
Q  462 c-caaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24162665 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 24162700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27104701 - 27104567
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104701 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttatgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 27104602  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27104601 ctcaaaaactgaaacctccatcgtgccacgttgcc 27104567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 410 - 488
Target Start/End: Original strand, 36561539 - 36561617
Alignment:
Q  410 ccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561539 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 36561617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 27136203 - 27136349
Alignment:
Q  55 ttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaata 152  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27136203 ttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaatcctaata 27136302  T
Q  153 gtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27136303 gtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaag 27136349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35107427 - 35107192
Alignment:
Q  98 ctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttg 196  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  | | |||||   |||||||||    
T  35107427 ctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaa--tcccaaccc---tgtttgttg 35107333  T
Q  197 ccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 296  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||     | ||||| ||||| |||| || |||||||| ||||    
T  35107332 ccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaactcttggttttagactctctacctcaaggtttactatgatacaatgtct 35107236  T
Q  297 atatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||    
T  35107235 atatttatagtaaaagtatcccttaaaatttggaacaaatctgc 35107192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 38414197 - 38414291
Alignment:
Q  93 cccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagt 188  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38414197 cccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc-tcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 36558906 - 36559047
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36558906 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 36559004  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36559005 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 36561183 - 36561324
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561183 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 36561281  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36561282 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 45332223 - 45332364
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  45332223 agagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 45332321  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45332322 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 22407496 - 22407596
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  22407496 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T
Q  119 a 119  Q
    |    
T  22407596 a 22407596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40699508 - 40699429
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40699508 cctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 313
Target Start/End: Original strand, 37963039 - 37963263
Alignment:
Q  77 ttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 175  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||  |||| ||||| | |||  ||||||||     
T  37963039 ttacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatcaaca 37963138  T
Q  176 ttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaa 275  Q
        |||| | |||||||||| |||| || |||||| || ||||||||||||||  ||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37963139 c---aaccatggtgtttgttgtcaag-ag-caaactatacacaaaccctagtttgatt--------tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaag 37963225  T
Q  276 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37963226 gtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagt 37963263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43139509 - 43139359
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
    |||||||||||| |||| | |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  43139509 cctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatct--caaccctagtgtttgtt 43139412  T
Q  196 gccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 253  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  43139411 gccaa-gag-caaactc--tacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttg 43139359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| | |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 21521048 - 21521182
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  21521048 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcgatcccatcgtggcacgatttttccagtggcttg- 21521146  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    |   |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21521147 cttcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 21521182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 42064376 - 42064317
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42064376 cagcgcaccatcgtgccacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcc 42064317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 456
Target Start/End: Original strand, 13910397 - 13910491
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910397 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacaatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 13910491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Original strand, 12342673 - 12342746
Alignment:
Q  241 ttctaaaccctt-gattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12342673 ttctaaaccctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagt 12342746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921769
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 7462990 - 7463077
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattcta 106  Q
    ||||||| |||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7462990 agagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagaga 139  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  140 ttcaatcctaatagtgttt 158  Q
     |||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 455
Target Start/End: Original strand, 6259168 - 6259261
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 455  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | || ||  ||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6259168 aacaagtctgcacccaaaaatatgtttctgttattcaccgccagcgcaccatcgtgtcacgttgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtg 6259261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 22707795 - 22707872
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg 96  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  22707795 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 311
Target Start/End: Original strand, 20147040 - 20147082
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147040 tctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20147082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Original strand, 27583479 - 27583562
Alignment:
Q  117 caatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaag 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| ||||||| |||||||||    
T  27583479 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca--ctcccaaccttagtgttcgttgccaag 27583562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345661
Alignment:
Q  99 taattctacccaaagcccc-aatctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaac 174  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693974
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccg-cctaattctacccaaag-ccccaatctcttcc-gtaaccaagag 138  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  139 attcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    | |  ||||||||||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttc 15693974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Original strand, 22407762 - 22407862
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  22407762 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccaacgcaccatcgtgccacgttgtgatcccatcgtgccacaattttttcactgacttgc 22407861  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  22407862 c 22407862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 22163064 - 22163111
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagaga 66  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22163064 agagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 30720732 - 30720811
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30720732 cctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2741002 - 2740941
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2741002 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 34575230 - 34575308
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc-ccaagatgaatcaa 173  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34575230 cctaattctacccaaagtcccgaatctttcccgagaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 43623968 - 43624033
Alignment:
Q  431 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43623968 ccatcgtgccacgattttttcagtgccttg-cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccatgttgcc 43624033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699229
Alignment:
Q  264 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagt 40699229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20589609 - 20589581
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589609 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 20589581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23871021 - 23870957
Alignment:
Q  27 cctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtc 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | | |  ||||||||||||||||    
T  23871021 cctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtc 23870957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 28462593 - 28462649
Alignment:
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||    
T  28462593 tgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgc 28462649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35028707 - 35028606
Alignment:
Q  99 taattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgc 197  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||   |||||||||||||||| |    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaatct--caaccctagtgtttgttac 35028610  T
Q  198 caag 201  Q
    ||||    
T  35028609 caag 35028606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 80105 - 79812
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  80105 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagcccca 80007  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  80006 atctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatac 79907  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  79906 aaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaag 79812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 41525 - 41819
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  41525 agagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtccca 41624  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41625 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 41723  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41724 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 41819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15248 - 14944
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaacca 134  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  15248 cactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaacca 15149  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15148 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttg 15050  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaa 334  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  15049 ttgcctttctaaatcattgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 14950  T
Q  335 atctgc 340  Q
    ||||||    
T  14949 atctgc 14944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 14424 - 14707
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  14424 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 14523  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  14524 gcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-tcaaagagacaaactctatac 14622  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  14623 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatctctcaaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14954 - 14854
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  | | ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14954 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgtcacgttgtgatcccatcgtgccacgaaatttccagtgacttgc 14855  T
Q  462 c 462  Q
    |    
T  14854 c 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Original strand, 69351 - 69658
Alignment:
Q  36 cactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaacca 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  69351 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaacca 69449  T
Q  135 agagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69450 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 69548  T
Q  235 ttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgta 330  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| || |    
T  69549 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttgga 69648  T
Q  331 acaaatctgc 340  Q
    ||||||||||    
T  69649 acaaatctgc 69658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73390
Alignment:
Q  160 ccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcag 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 73305  T
Q  260 ccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||||    
T  73306 ccccctctatctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaaagtatctcttaaaatttggaacaaatctgc 73390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 192
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73203
Alignment:
Q  149 aatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgttt 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 462
Target Start/End: Original strand, 69688 - 69747
Alignment:
Q  403 cagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 462  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  69688 cagcacaccatcgtgcaacgatgcgatcccattgtgctacgatttttccagtgctttgcc 69747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3123 - 2805
Alignment:
Q  21 agcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaat 120  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |      
T  3123 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagc 3025  T
Q  121 ctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaa 219  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3024 ctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatacaa 2926  T
Q  220 accctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgct 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  2925 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagtttcgct 2826  T
Q  320 taaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  2825 taaaatttggaacaaatctgc 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2681
Alignment:
Q  363 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2815 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttg- 2717  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctcc-atcgtgccacgttgcc 496  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2716 cctcaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcc 2681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 79431 - 79140
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  79431 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctca 79332  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79331 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatac 79233  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  79232 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaa 79140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 11515 - 11809
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11515 agagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtccca 11614  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  11615 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cgaaagagacaaactctatac 11713  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11714 aaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 11809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22206 - 21975
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  22206 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22107  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22007  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 21975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 269 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24250
Alignment:
Q  269 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa----------- 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||               
T  24481 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 24382  T
Q  358 -actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24381 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 24282  T
Q  457 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24281 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 24250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22361 - 22221
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  22361 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 22264  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22263 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24636 - 24496
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24636 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtccca 24539  T
Q  119 atctctt-ccgtaaccaagaga-ttcaatcctaatagtgtttc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24538 atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29416 - 29086
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  29416 agagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagcccca 29318  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatac 217  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  29317 acctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaag-agacaaactctatac 29219  T
Q  218 aaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  29218 aaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 29119  T
Q  308 aaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 340  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29118 aaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgc 29086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29099 - 29001
Alignment:
Q  360 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 457  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099 tgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 29001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 362 - 496
Target Start/End: Original strand, 12868 - 13002
Alignment:
Q  362 taacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgtcagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12868 taacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 12967  T
Q  462 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12968 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgccacgttgcc 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 1988
Alignment:
Q  34 ttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaac 132  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  | | |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  2272 ttcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaac 2173  T
Q  133 caagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2172 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaag-agacaaactctgtacaaaccctagttttgt 2075  T
Q  233 tgttgtctttctaaacccttgattcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||      |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2074 tgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 287 - 34
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||    
T  287 agagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctca 189  T
Q  119 atctcttc-cgtaaccaagagattc-aatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctata 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  188 atctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaag-agacaaactctata 90  T
Q  217 caaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  89 caaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 15887 - 16154
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||     
T  15887 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagac 15986  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  15987 tcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacct--caaccctagtgtttgttg-ctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 16081  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 313  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16082 ttctaaacccttatttcaaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagt 16154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 85453 - 85184
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||     
T  85453 atgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagac 85354  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85353 tcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 85255  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    || |||| ||||| |||  || | |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  85254 ttttaaatccttgtttc-tcctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaag 85184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35593
Alignment:
Q  85 ataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaacc 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  184 ctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctt 283  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |   |||||       
T  35719 ctagtgtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtac 35622  T
Q  284 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35621 tgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 16716 - 16981
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||     
T  16716 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgac 16815  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16816 tcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa--tcccaaccctagtgtttgttgccaa-gag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtct 16910  T
Q  241 ttctaaacccttg-attcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 311  Q
    ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16911 ttc-aaacccttgttttcagcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaaa 16981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 303
Target Start/End: Original strand, 1708 - 1958
Alignment:
Q  42 atgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctctt-ccgtaaccaagagat 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |     
T  1708 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaac 1807  T
Q  141 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  1808 tcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatcaacc--acaaccctagtgtttgttg----------aaactctatacaaaccctagttttcttgttgac- 1894  T
Q  241 ttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatattta 303  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1895 ttctaaacccttgtttcagccacctctatctctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1167
Alignment:
Q  202 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgattcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1056 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatt 1155  T
Q  302 tatagtaaaagt 313  Q
    |||||| |||||    
T  1156 tatagtgaaagt 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 1495 - 1671
Alignment:
Q  19 agagcaggcctccatttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagcccca 118  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1495 agagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1593  T
Q  119 atctcttcc-gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgtt 195  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1594 gcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4773
Alignment:
Q  59 aaaagagatgtcagtaagttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc-cgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtt 157  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5016 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 4917  T
Q  158 tcccaagatgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaa-cccttgatt 256  Q
    |||||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | |  ||||||| || ||  ||    
T  4916 tcccaacatgaatcaaact--caactctagtgtttgttgctga-gaga-aaacgctatataaaccctag-tttgttgct-tacttctaaatccttttttt 4823  T
Q  257 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 306  Q
    ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4822 cagacccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 57550 - 57613
Alignment:
Q  97 cctaattctacccaaagcccc-aatctcttccg-taaccaagagattcaatcctaatagtgttt 158  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  57550 cctaattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University