View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12946_low_5 (Length: 287)

Name: NF12946_low_5
Description: NF12946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12946_low_5
NF12946_low_5
[»] chr1 (334 HSPs)
chr1 (21-287)||(44233578-44233844)
chr1 (21-287)||(31760263-31760529)
chr1 (21-287)||(48542104-48542370)
chr1 (21-285)||(15475545-15475798)
chr1 (21-287)||(30361463-30361718)
chr1 (21-287)||(44054380-44054635)
chr1 (21-287)||(4489683-4489961)
chr1 (21-285)||(28225908-28226161)
chr1 (21-287)||(28068392-28068647)
chr1 (21-270)||(3047070-3047308)
chr1 (21-285)||(46233917-46234170)
chr1 (44-285)||(37093737-37093967)
chr1 (21-283)||(15907547-15907798)
chr1 (61-285)||(37093399-37093612)
chr1 (97-287)||(44054261-44054451)
chr1 (21-287)||(49457150-49457402)
chr1 (21-287)||(29033228-29033483)
chr1 (61-287)||(26769770-26769994)
chr1 (21-287)||(8895920-8896188)
chr1 (21-191)||(26769901-26770071)
chr1 (21-191)||(6979210-6979380)
chr1 (97-287)||(31760151-31760334)
chr1 (97-285)||(30361759-30361940)
chr1 (97-287)||(30361647-30361830)
chr1 (97-287)||(49457331-49457514)
chr1 (21-188)||(43106190-43106357)
chr1 (65-285)||(45501894-45502108)
chr1 (97-287)||(26769650-26769841)
chr1 (21-191)||(3994515-3994685)
chr1 (21-285)||(3770812-3771065)
chr1 (97-287)||(4489571-4489754)
chr1 (97-287)||(24179794-24179967)
chr1 (61-285)||(35720016-35720226)
chr1 (97-287)||(44233475-44233649)
chr1 (97-285)||(11335296-11335468)
chr1 (97-285)||(11493316-11493488)
chr1 (21-170)||(17580554-17580710)
chr1 (79-287)||(18605547-18605744)
chr1 (104-287)||(37093505-37093678)
chr1 (97-287)||(15475422-15475614)
chr1 (85-191)||(45502117-45502223)
chr1 (21-287)||(52468996-52469251)
chr1 (61-191)||(24180087-24180216)
chr1 (79-183)||(25729630-25729734)
chr1 (97-287)||(37093614-37093806)
chr1 (99-287)||(11335150-11335327)
chr1 (99-287)||(11493170-11493347)
chr1 (85-191)||(35719967-35720073)
chr1 (61-191)||(35719980-35720109)
chr1 (61-191)||(35720194-35720322)
chr1 (104-283)||(24179906-24180077)
chr1 (61-190)||(47534470-47534598)
chr1 (61-287)||(3770961-3771188)
chr1 (61-188)||(3771118-3771244)
chr1 (61-188)||(11335130-11335256)
chr1 (61-188)||(11493150-11493276)
chr1 (97-188)||(28068372-28068463)
chr1 (61-188)||(28225637-28225763)
chr1 (216-287)||(37093843-37093914)
chr1 (216-287)||(43106210-43106281)
chr1 (216-287)||(46234023-46234094)
chr1 (61-191)||(11335163-11335292)
chr1 (61-191)||(11493183-11493312)
chr1 (97-191)||(37093374-37093468)
chr1 (61-171)||(45501817-45501926)
chr1 (61-287)||(3047255-3047486)
chr1 (62-191)||(11335199-11335327)
chr1 (214-287)||(11335397-11335470)
chr1 (62-191)||(11493219-11493347)
chr1 (214-287)||(11493417-11493490)
chr1 (63-188)||(52468976-52469100)
chr1 (96-274)||(17925820-17925987)
chr1 (61-189)||(28225849-28225976)
chr1 (97-287)||(35720157-35720335)
chr1 (216-287)||(3047146-3047217)
chr1 (216-287)||(6979286-6979357)
chr1 (61-188)||(6979287-6979413)
chr1 (104-191)||(15475399-15475486)
chr1 (216-287)||(15475651-15475722)
chr1 (104-285)||(18605428-18605598)
chr1 (85-287)||(25729609-25729800)
chr1 (216-287)||(26769924-26769995)
chr1 (216-287)||(28226014-28226085)
chr1 (97-191)||(45501869-45501963)
chr1 (104-283)||(3416632-3416799)
chr1 (104-283)||(25829247-25829418)
chr1 (97-190)||(44054239-44054332)
chr1 (104-189)||(46233761-46233846)
chr1 (106-190)||(3047424-3047508)
chr1 (97-274)||(17925613-17925778)
chr1 (79-190)||(3771099-3771210)
chr1 (216-287)||(3994538-3994609)
chr1 (97-285)||(28225787-28225977)
chr1 (216-287)||(45501820-45501891)
chr1 (216-287)||(45502140-45502211)
chr1 (97-191)||(30361871-30361965)
chr1 (97-191)||(40360135-40360229)
chr1 (99-283)||(46675271-46675442)
chr1 (97-191)||(47534469-47534563)
chr1 (97-190)||(46233893-46233986)
chr1 (104-188)||(8896124-8896208)
chr1 (223-287)||(46233782-46233846)
chr1 (61-191)||(37093518-37093648)
chr1 (79-287)||(3047312-3047522)
chr1 (97-171)||(24179791-24179865)
chr1 (61-191)||(25729658-25729787)
chr1 (97-171)||(31760148-31760222)
chr1 (67-189)||(37093678-37093799)
chr1 (104-283)||(39465005-39465171)
chr1 (79-188)||(3047433-3047542)
chr1 (79-188)||(15475366-15475475)
chr1 (90-191)||(24180123-24180224)
chr1 (216-285)||(35719979-35720048)
chr1 (97-273)||(3047254-3047423)
chr1 (89-185)||(3994485-3994581)
chr1 (61-287)||(15475386-15475613)
chr1 (79-183)||(28225678-28225782)
chr1 (223-287)||(30361914-30361978)
chr1 (97-287)||(11335186-11335360)
chr1 (97-287)||(11493206-11493380)
chr1 (216-287)||(15907623-15907694)
chr1 (216-287)||(24180110-24180181)
chr1 (216-287)||(28225657-28225728)
chr1 (61-155)||(17925892-17925985)
chr1 (97-171)||(26769647-26769721)
chr1 (97-171)||(44233472-44233546)
chr1 (61-191)||(45501833-45501962)
chr1 (61-188)||(46233698-46233816)
chr1 (205-285)||(24180184-24180258)
chr1 (205-285)||(46675172-46675246)
chr1 (61-191)||(24180026-24180144)
chr1 (61-169)||(30361872-30361979)
chr1 (61-189)||(37093340-37093467)
chr1 (215-287)||(40360134-40360206)
chr1 (61-191)||(40360172-40360290)
chr1 (215-287)||(47534468-47534540)
chr1 (97-169)||(49457443-49457515)
chr1 (126-280)||(24180081-24180224)
chr1 (216-287)||(35720015-35720086)
chr1 (96-202)||(17925414-17925520)
chr1 (97-191)||(18605529-18605623)
chr1 (61-159)||(24180083-24180180)
chr1 (125-191)||(25829171-25829237)
chr1 (113-191)||(28225706-28225784)
chr1 (61-159)||(40360136-40360233)
chr1 (104-190)||(40360239-40360325)
chr1 (65-158)||(3416630-3416722)
chr1 (65-158)||(24179987-24180079)
chr1 (216-285)||(24180148-24180217)
chr1 (65-158)||(25829245-25829337)
chr1 (216-285)||(28225695-28225764)
chr1 (216-285)||(39465034-39465103)
chr1 (205-285)||(40360094-40360168)
chr1 (65-284)||(40360237-40360430)
chr1 (205-285)||(47534428-47534502)
chr1 (216-285)||(47534505-47534574)
chr1 (61-284)||(47534506-47534703)
chr1 (61-287)||(3770997-3771224)
chr1 (217-284)||(13556647-13556712)
chr1 (61-191)||(25829180-25829298)
chr1 (61-191)||(39464938-39465056)
chr1 (97-169)||(48542103-48542175)
chr1 (132-191)||(3416624-3416683)
chr1 (216-287)||(3994502-3994573)
chr1 (216-287)||(6979322-6979393)
chr1 (124-191)||(24180360-24180427)
chr1 (124-191)||(25828935-25829002)
chr1 (97-188)||(29033208-29033299)
chr1 (124-191)||(46675003-46675070)
chr1 (124-191)||(47534259-47534326)
chr1 (97-171)||(4489568-4489642)
chr1 (85-159)||(13556332-13556406)
chr1 (79-153)||(15907804-15907878)
chr1 (229-287)||(17580556-17580614)
chr1 (61-155)||(17925425-17925518)
chr1 (61-155)||(18605566-18605659)
chr1 (100-182)||(18605676-18605758)
chr1 (85-159)||(24180356-24180430)
chr1 (61-171)||(35720230-35720338)
chr1 (85-159)||(46675000-46675074)
chr1 (85-159)||(47534256-47534330)
chr1 (216-285)||(3416661-3416730)
chr1 (138-191)||(3416863-3416916)
chr1 (63-287)||(18605424-18605636)
chr1 (216-285)||(24179979-24180048)
chr1 (232-285)||(28225731-28225784)
chr1 (65-158)||(39465003-39465095)
chr1 (216-285)||(45502106-45502175)
chr1 (218-285)||(3416800-3416865)
chr1 (216-272)||(15907822-15907878)
chr1 (124-188)||(15910348-15910412)
chr1 (216-280)||(24180354-24180418)
chr1 (216-280)||(40360171-40360235)
chr1 (216-280)||(46675012-46675076)
chr1 (218-285)||(46675443-46675508)
chr1 (138-190)||(46675506-46675558)
chr1 (216-280)||(47534268-47534332)
chr1 (124-191)||(3416555-3416622)
chr1 (124-191)||(13556335-13556402)
chr1 (62-191)||(17925613-17925740)
chr1 (216-287)||(17925915-17925986)
chr1 (218-284)||(25829419-25829483)
chr1 (218-284)||(39465172-39465236)
chr1 (124-191)||(40359925-40359992)
chr1 (85-159)||(3416552-3416626)
chr1 (223-285)||(3416632-3416694)
chr1 (213-282)||(13556583-13556646)
chr1 (223-285)||(24180015-24180077)
chr1 (85-155)||(25828932-25829002)
chr1 (226-287)||(25829155-25829214)
chr1 (223-285)||(25829247-25829309)
chr1 (223-285)||(40360239-40360301)
chr1 (223-285)||(46233881-46233943)
chr1 (212-274)||(49740257-49740319)
chr1 (223-284)||(3416865-3416926)
chr1 (88-188)||(8896144-8896249)
chr1 (61-202)||(17925809-17925949)
chr1 (203-280)||(18605226-18605303)
chr1 (216-277)||(37093371-37093432)
chr1 (130-191)||(39464934-39464995)
chr1 (126-191)||(40360128-40360193)
chr1 (216-285)||(45501858-45501927)
chr1 (126-183)||(46675206-46675263)
chr1 (64-133)||(46675304-46675372)
chr1 (126-191)||(47534462-47534527)
chr1 (135-188)||(50501369-50501422)
chr1 (216-280)||(3416564-3416628)
chr1 (216-280)||(13556344-13556408)
chr1 (216-280)||(25828944-25829008)
chr1 (216-280)||(25829179-25829243)
chr1 (61-188)||(37093292-37093431)
chr1 (223-271)||(37093292-37093340)
chr1 (216-272)||(37093340-37093396)
chr1 (216-280)||(39464937-39465001)
chr1 (96-191)||(43106223-43106319)
chr1 (90-191)||(3416761-3416854)
chr1 (244-287)||(15910349-15910392)
chr1 (216-287)||(17925448-17925519)
chr1 (79-166)||(45502106-45502193)
chr1 (244-287)||(46233718-46233761)
chr1 (79-191)||(46233731-46233835)
chr1 (90-191)||(46675404-46675497)
chr1 (61-147)||(3994487-3994572)
chr1 (126-191)||(25829138-25829201)
chr1 (223-285)||(39465005-39465067)
chr1 (85-159)||(40359922-40359996)
chr1 (218-280)||(40359936-40359998)
chr1 (223-285)||(46675307-46675369)
chr1 (130-277)||(13556437-13556566)
chr1 (214-287)||(17925707-17925780)
chr1 (124-275)||(25829035-25829168)
chr1 (135-191)||(25829419-25829473)
chr1 (216-280)||(3047182-3047246)
chr1 (113-189)||(15907802-15907878)
chr1 (61-133)||(24179976-24180047)
chr1 (61-191)||(45501905-45502040)
chr1 (216-272)||(46233761-46233817)
chr1 (151-191)||(49740279-49740319)
chr1 (251-287)||(50501366-50501402)
chr1 (216-271)||(8896153-8896208)
chr1 (244-287)||(13556336-13556379)
chr1 (244-287)||(24180383-24180426)
chr1 (244-287)||(25828936-25828979)
chr1 (89-156)||(25829171-25829238)
chr1 (216-271)||(28068372-28068427)
chr1 (244-287)||(46675004-46675047)
chr1 (244-287)||(47534260-47534303)
chr1 (98-171)||(13556647-13556718)
chr1 (216-274)||(17925425-17925483)
chr1 (249-287)||(39464934-39464972)
chr1 (216-266)||(46675213-46675263)
chr1 (61-130)||(3416662-3416730)
chr1 (135-191)||(13556648-13556702)
chr1 (232-285)||(15907802-15907855)
chr1 (87-152)||(15910347-15910412)
chr1 (61-191)||(24180296-24180417)
chr1 (244-285)||(35719971-35720012)
chr1 (135-191)||(39465172-39465226)
chr1 (99-171)||(40360366-40360436)
chr1 (61-138)||(44233572-44233648)
chr1 (63-132)||(46233879-46233947)
chr1 (61-191)||(46675013-46675134)
chr1 (218-287)||(46675271-46675335)
chr1 (65-129)||(3416863-3416926)
chr1 (79-155)||(17925684-17925760)
chr1 (124-195)||(24180255-24180327)
chr1 (61-133)||(39465035-39465106)
chr1 (124-195)||(40360025-40360097)
chr1 (124-195)||(46675103-46675175)
chr1 (124-195)||(47534359-47534431)
chr1 (244-287)||(3416556-3416599)
chr1 (104-171)||(3416865-3416932)
chr1 (216-271)||(6979358-6979413)
chr1 (61-116)||(8896154-8896208)
chr1 (61-116)||(11335377-11335431)
chr1 (61-116)||(11493397-11493451)
chr1 (85-155)||(24180259-24180330)
chr1 (216-274)||(24180259-24180318)
chr1 (61-116)||(28068372-28068426)
chr1 (216-271)||(28225637-28225692)
chr1 (96-159)||(39464936-39464999)
chr1 (216-274)||(40360034-40360093)
chr1 (85-155)||(46675100-46675171)
chr1 (216-274)||(46675112-46675171)
chr1 (257-287)||(3416630-3416660)
chr1 (257-287)||(3416863-3416893)
chr1 (145-191)||(15907798-15907844)
chr1 (169-238)||(18605153-18605225)
chr1 (257-287)||(24180049-24180079)
chr1 (257-287)||(25829245-25829275)
chr1 (257-287)||(39465003-39465033)
chr1 (257-287)||(40360237-40360267)
chr1 (257-287)||(45502078-45502108)
chr1 (238-272)||(46233846-46233880)
chr1 (257-287)||(46675506-46675536)
chr1 (223-273)||(46675508-46675558)
chr1 (216-253)||(13556541-13556578)
chr1 (204-241)||(18605299-18605336)
chr1 (131-191)||(25829003-25829066)
chr1 (99-171)||(25829419-25829489)
chr1 (61-130)||(30361760-30361828)
chr1 (61-114)||(46675214-46675266)
chr1 (61-191)||(47534269-47534390)
chr1 (218-274)||(47534370-47534427)
chr1 (99-171)||(47534639-47534709)
chr1 (99-166)||(3416800-3416865)
chr1 (62-110)||(18605711-18605758)
chr1 (244-276)||(24180294-24180326)
chr1 (92-152)||(29033208-29033268)
chr1 (132-191)||(40359994-40360056)
chr1 (244-276)||(40360026-40360058)
chr1 (143-191)||(46233795-46233843)
chr1 (244-276)||(46675104-46675136)
chr1 (99-166)||(46675443-46675508)
[»] chr8 (221 HSPs)
chr8 (21-287)||(26415850-26416115)
chr8 (21-287)||(482718-482973)
chr8 (21-285)||(30699577-30699830)
chr8 (21-285)||(12986968-12987221)
chr8 (21-287)||(20187780-20188035)
chr8 (61-287)||(27719607-27719832)
chr8 (31-242)||(25486826-25487037)
chr8 (61-287)||(20819298-20819522)
chr8 (21-285)||(35393083-35393337)
chr8 (21-287)||(20206849-20207104)
chr8 (97-287)||(27719873-27720063)
chr8 (106-287)||(32137979-32138160)
chr8 (21-191)||(27719422-27719592)
chr8 (21-191)||(20819221-20819391)
chr8 (65-285)||(8352833-8353047)
chr8 (97-287)||(27719761-27719944)
chr8 (97-287)||(27719992-27720175)
chr8 (21-188)||(31097814-31097976)
chr8 (97-287)||(32138089-32138284)
chr8 (37-287)||(24757364-24757603)
chr8 (65-285)||(11020737-11020943)
chr8 (21-287)||(36781960-36782213)
chr8 (21-159)||(30655309-30655447)
chr8 (97-280)||(26415745-26415920)
chr8 (61-287)||(1104144-1104358)
chr8 (61-285)||(39780582-39780792)
chr8 (85-285)||(8352636-8352835)
chr8 (79-266)||(33411430-33411612)
chr8 (61-285)||(39780796-39781005)
chr8 (61-191)||(27719535-27719664)
chr8 (85-191)||(33411302-33411408)
chr8 (61-285)||(33411615-33411839)
chr8 (61-287)||(11020911-11021125)
chr8 (61-287)||(12987189-12987416)
chr8 (61-287)||(35392937-35393151)
chr8 (97-287)||(35392973-35393152)
chr8 (97-287)||(20819452-20819623)
chr8 (85-191)||(39780569-39780675)
chr8 (61-191)||(39780760-39780888)
chr8 (88-287)||(11020901-11021089)
chr8 (97-287)||(30656333-30656525)
chr8 (61-188)||(35392917-35393043)
chr8 (99-274)||(5458789-5458953)
chr8 (154-285)||(30656282-30656402)
chr8 (89-197)||(45084677-45084785)
chr8 (61-287)||(27719499-27719713)
chr8 (88-287)||(29998130-29998331)
chr8 (216-287)||(30699683-30699754)
chr8 (61-287)||(20187965-20188192)
chr8 (61-287)||(20207034-20207261)
chr8 (97-191)||(33411770-33411864)
chr8 (97-191)||(39780723-39780817)
chr8 (88-272)||(12987179-12987352)
chr8 (97-272)||(482625-482789)
chr8 (88-287)||(482561-482762)
chr8 (88-287)||(8353005-8353206)
chr8 (216-287)||(12987044-12987115)
chr8 (61-188)||(24757344-24757470)
chr8 (216-287)||(27719498-27719569)
chr8 (216-287)||(31097885-31097956)
chr8 (104-191)||(32834768-32834855)
chr8 (61-171)||(33411807-33411916)
chr8 (61-287)||(36782037-36782249)
chr8 (104-283)||(45084789-45084960)
chr8 (61-189)||(482625-482752)
chr8 (97-272)||(8352978-8353142)
chr8 (97-272)||(20187964-20188128)
chr8 (97-272)||(20207033-20207197)
chr8 (61-189)||(29998140-29998267)
chr8 (104-188)||(30699407-30699491)
chr8 (64-188)||(36782146-36782269)
chr8 (216-287)||(33411314-33411385)
chr8 (97-191)||(30699552-30699646)
chr8 (97-190)||(11020874-11020967)
chr8 (79-188)||(30656472-30656581)
chr8 (79-188)||(32834779-32834888)
chr8 (226-287)||(35393189-35393250)
chr8 (79-191)||(1104265-1104377)
chr8 (97-285)||(12987152-12987329)
chr8 (223-287)||(30699427-30699491)
chr8 (223-287)||(32834768-32834832)
chr8 (62-280)||(33411352-33411548)
chr8 (104-191)||(482538-482625)
chr8 (216-287)||(25486900-25486971)
chr8 (104-191)||(29998267-29998354)
chr8 (104-191)||(30656461-30656548)
chr8 (216-287)||(33411842-33411913)
chr8 (97-171)||(27720104-27720178)
chr8 (216-278)||(30655385-30655447)
chr8 (97-171)||(32138213-32138287)
chr8 (97-191)||(38098320-38098414)
chr8 (216-285)||(20819297-20819366)
chr8 (120-272)||(29998126-29998267)
chr8 (61-189)||(8353015-8353142)
chr8 (61-287)||(30656334-30656561)
chr8 (104-285)||(1104326-1104495)
chr8 (104-191)||(12987352-12987439)
chr8 (104-191)||(20188128-20188215)
chr8 (104-191)||(20207197-20207284)
chr8 (216-287)||(39780581-39780652)
chr8 (216-287)||(45084685-45084756)
chr8 (216-286)||(8352684-8352754)
chr8 (61-277)||(8352767-8352961)
chr8 (61-183)||(33411771-33411892)
chr8 (61-159)||(38098316-38098413)
chr8 (79-188)||(482505-482614)
chr8 (79-188)||(20188139-20188248)
chr8 (79-188)||(20207208-20207317)
chr8 (223-284)||(30699542-30699603)
chr8 (99-191)||(45084961-45085051)
chr8 (100-183)||(1104129-1104212)
chr8 (63-285)||(1104290-1104499)
chr8 (205-287)||(38098379-38098455)
chr8 (97-180)||(39780936-39781019)
chr8 (61-167)||(8352649-8352754)
chr8 (61-171)||(11021019-11021128)
chr8 (61-159)||(33411449-33411546)
chr8 (203-280)||(1104624-1104701)
chr8 (79-188)||(12987363-12987472)
chr8 (216-285)||(39780795-39780863)
chr8 (65-158)||(45084787-45084879)
chr8 (62-202)||(5458825-5458964)
chr8 (61-191)||(11020672-11020790)
chr8 (61-287)||(12987225-12987452)
chr8 (99-171)||(20819554-20819626)
chr8 (61-191)||(38098259-38098377)
chr8 (215-287)||(38098343-38098415)
chr8 (61-157)||(45084686-45084781)
chr8 (61-191)||(45084722-45084840)
chr8 (97-274)||(5458579-5458745)
chr8 (104-171)||(8353142-8353209)
chr8 (124-191)||(11020662-11020729)
chr8 (216-287)||(32834797-32834868)
chr8 (218-284)||(38098119-38098183)
chr8 (124-191)||(38098582-38098649)
chr8 (225-287)||(482525-482587)
chr8 (85-159)||(11020659-11020733)
chr8 (85-159)||(38098578-38098652)
chr8 (218-287)||(45084961-45085028)
chr8 (223-272)||(30699491-30699540)
chr8 (216-285)||(33411448-33411517)
chr8 (216-285)||(33411806-33411875)
chr8 (126-191)||(38098356-38098421)
chr8 (216-285)||(39780759-39780828)
chr8 (90-191)||(45084464-45084572)
chr8 (216-285)||(45084818-45084887)
chr8 (216-280)||(11020671-11020735)
chr8 (61-165)||(30699542-30699645)
chr8 (216-280)||(38098314-38098378)
chr8 (216-280)||(38098576-38098640)
chr8 (216-284)||(45084993-45085061)
chr8 (216-287)||(11020768-11020839)
chr8 (216-287)||(20188157-20188228)
chr8 (216-287)||(20207226-20207297)
chr8 (218-285)||(33411352-33411419)
chr8 (85-191)||(38098193-38098293)
chr8 (104-190)||(38098224-38098310)
chr8 (216-285)||(45084651-45084718)
chr8 (223-285)||(45084789-45084851)
chr8 (21-74)||(29997802-29997855)
chr8 (79-188)||(29998278-29998382)
chr8 (89-170)||(45084985-45085066)
chr8 (239-287)||(29998126-29998174)
chr8 (96-191)||(30655347-30655443)
chr8 (79-155)||(32137988-32138064)
chr8 (216-272)||(32834712-32834768)
chr8 (124-278)||(45084541-45084677)
chr8 (216-276)||(45084721-45084781)
chr8 (223-286)||(1104432-1104495)
chr8 (244-287)||(8352758-8352801)
chr8 (61-155)||(5458580-5458673)
chr8 (223-285)||(38098248-38098310)
chr8 (126-191)||(45084644-45084707)
chr8 (104-153)||(30699491-30699540)
chr8 (92-153)||(32834707-32834768)
chr8 (61-166)||(33411315-33411419)
chr8 (216-277)||(33411614-33411675)
chr8 (62-122)||(1104627-1104686)
chr8 (216-276)||(29998296-29998356)
chr8 (225-285)||(33411421-33411481)
chr8 (245-281)||(38098186-38098222)
chr8 (61-133)||(45084819-45084890)
chr8 (143-202)||(1104619-1104678)
chr8 (244-287)||(11020663-11020706)
chr8 (244-287)||(38098605-38098648)
chr8 (245-287)||(45084464-45084506)
chr8 (62-111)||(1104129-1104177)
chr8 (214-287)||(5458577-5458650)
chr8 (218-287)||(5458789-5458858)
chr8 (135-191)||(38098129-38098183)
chr8 (216-273)||(38098224-38098281)
chr8 (244-285)||(39780573-39780614)
chr8 (99-159)||(1104626-1104686)
chr8 (79-155)||(5458805-5458881)
chr8 (61-125)||(8352901-8352964)
chr8 (124-195)||(38098452-38098524)
chr8 (132-191)||(38098493-38098555)
chr8 (61-133)||(39780937-39781008)
chr8 (61-129)||(45084994-45085061)
chr8 (203-238)||(18575540-18575575)
chr8 (61-116)||(27719910-27719964)
chr8 (124-191)||(31097876-31097943)
chr8 (61-152)||(36782179-36782269)
chr8 (99-165)||(38098119-38098183)
chr8 (216-274)||(38098456-38098515)
chr8 (85-155)||(45084538-45084609)
chr8 (218-280)||(5458825-5458887)
chr8 (257-287)||(8352833-8352863)
chr8 (257-287)||(11020737-11020767)
chr8 (143-189)||(32834722-32834768)
chr8 (92-158)||(33411609-33411675)
chr8 (257-287)||(45084787-45084817)
chr8 (244-285)||(25486938-25486979)
chr8 (61-130)||(32138090-32138158)
chr8 (61-122)||(38098579-38098639)
chr8 (171-238)||(1104702-1104772)
chr8 (248-287)||(12987003-12987043)
chr8 (218-274)||(25486877-25486933)
chr8 (143-191)||(30699440-30699488)
chr8 (216-264)||(32834833-32834881)
chr8 (244-276)||(38098491-38098523)
[»] scaffold0562 (11 HSPs)
scaffold0562 (21-287)||(4902-5168)
scaffold0562 (21-285)||(6010-6263)
scaffold0562 (97-287)||(4790-4973)
scaffold0562 (61-287)||(5851-6078)
scaffold0562 (97-272)||(5915-6079)
scaffold0562 (216-287)||(6116-6187)
scaffold0562 (104-191)||(5827-5915)
scaffold0562 (79-188)||(5794-5904)
scaffold0562 (61-287)||(5814-6042)
scaffold0562 (61-152)||(5794-5885)
scaffold0562 (99-170)||(4788-4859)
[»] chr4 (418 HSPs)
chr4 (21-287)||(3874083-3874349)
chr4 (23-287)||(3931501-3931765)
chr4 (21-283)||(28867242-28867493)
chr4 (21-285)||(45884867-45885120)
chr4 (21-285)||(29923910-29924163)
chr4 (21-287)||(17445187-17445448)
chr4 (21-285)||(36224657-36224912)
chr4 (21-285)||(3875191-3875444)
chr4 (21-280)||(55282004-55282252)
chr4 (21-286)||(36432012-36432266)
chr4 (21-285)||(50621971-50622225)
chr4 (21-287)||(24744509-24744767)
chr4 (21-285)||(39677230-39677480)
chr4 (100-287)||(3931256-3931443)
chr4 (61-285)||(45885245-45885457)
chr4 (97-287)||(3931375-3931572)
chr4 (104-272)||(7327106-7327267)
chr4 (65-285)||(22169444-22169650)
chr4 (98-285)||(28573363-28573543)
chr4 (90-287)||(33960974-33961166)
chr4 (21-189)||(41764305-41764469)
chr4 (79-270)||(28573117-28573297)
chr4 (21-153)||(7554087-7554219)
chr4 (79-272)||(7553683-7553867)
chr4 (135-285)||(48868511-48868650)
chr4 (61-274)||(11381494-11381695)
chr4 (97-287)||(3873971-3874154)
chr4 (61-285)||(33961090-33961315)
chr4 (69-190)||(48873980-48874100)
chr4 (61-283)||(11005020-11005233)
chr4 (97-287)||(36224547-36224726)
chr4 (61-191)||(33961356-33961485)
chr4 (61-287)||(55281768-55281995)
chr4 (97-287)||(22169581-22169759)
chr4 (61-188)||(36224527-36224653)
chr4 (97-287)||(50622156-50622335)
chr4 (85-191)||(20492760-20492866)
chr4 (85-191)||(33961526-33961632)
chr4 (61-285)||(55281927-55282139)
chr4 (61-272)||(45885389-45885592)
chr4 (61-287)||(3875032-3875259)
chr4 (97-287)||(28867117-28867309)
chr4 (61-287)||(45885052-45885279)
chr4 (61-191)||(49331620-49331749)
chr4 (61-191)||(50622229-50622358)
chr4 (61-190)||(36308462-36308590)
chr4 (146-272)||(7553878-7553993)
chr4 (61-191)||(11005140-11005269)
chr4 (61-190)||(56162944-56163072)
chr4 (90-285)||(11005093-11005277)
chr4 (65-287)||(36308556-36308756)
chr4 (104-191)||(24744486-24744573)
chr4 (216-287)||(28867346-28867417)
chr4 (216-287)||(29923986-29924057)
chr4 (216-287)||(36224765-36224836)
chr4 (216-287)||(36432119-36432190)
chr4 (89-191)||(35949001-35949103)
chr4 (97-272)||(3875096-3875260)
chr4 (61-191)||(22169725-22169850)
chr4 (61-287)||(45885425-45885656)
chr4 (61-287)||(33961209-33961413)
chr4 (61-287)||(33961379-33961583)
chr4 (97-272)||(45885051-45885215)
chr4 (61-287)||(55281732-55281959)
chr4 (97-272)||(55281832-55281996)
chr4 (208-287)||(28573473-28573552)
chr4 (216-287)||(39677333-39677404)
chr4 (216-287)||(45884943-45885014)
chr4 (61-287)||(50622157-50622371)
chr4 (216-287)||(55282105-55282176)
chr4 (101-191)||(3931233-3931323)
chr4 (99-274)||(11309507-11309669)
chr4 (61-283)||(29932887-29933089)
chr4 (61-191)||(36224596-36224725)
chr4 (124-283)||(26488612-26488763)
chr4 (104-283)||(35948820-35948991)
chr4 (61-287)||(36308344-36308554)
chr4 (79-188)||(36431809-36431918)
chr4 (90-191)||(54202785-54202886)
chr4 (104-283)||(54202896-54203067)
chr4 (99-273)||(11381074-11381237)
chr4 (104-188)||(29924186-29924270)
chr4 (104-191)||(7327019-7327106)
chr4 (104-191)||(7553596-7553683)
chr4 (104-191)||(7553791-7553878)
chr4 (96-274)||(11309088-11309255)
chr4 (97-274)||(11309297-11309463)
chr4 (216-287)||(20492772-20492843)
chr4 (61-287)||(22169654-22169863)
chr4 (216-287)||(28573208-28573279)
chr4 (104-191)||(36431842-36431929)
chr4 (106-193)||(45885594-45885681)
chr4 (216-287)||(48874002-48874073)
chr4 (61-188)||(50622265-50622391)
chr4 (97-191)||(27767160-27767254)
chr4 (89-191)||(29933032-29933134)
chr4 (61-283)||(49331475-49331677)
chr4 (97-191)||(56162943-56163037)
chr4 (104-283)||(2492330-2492501)
chr4 (216-285)||(33961551-33961620)
chr4 (90-191)||(36308497-36308598)
chr4 (60-189)||(45885087-45885215)
chr4 (226-287)||(50622058-50622119)
chr4 (79-191)||(3931197-3931309)
chr4 (223-287)||(7327042-7327106)
chr4 (65-189)||(24744452-24744575)
chr4 (104-188)||(28867097-28867181)
chr4 (97-189)||(29924094-29924186)
chr4 (223-287)||(29924186-29924250)
chr4 (97-287)||(44878602-44878780)
chr4 (216-287)||(3875297-3875368)
chr4 (104-191)||(28573221-28573308)
chr4 (104-191)||(45885215-45885302)
chr4 (89-188)||(55281712-55281811)
chr4 (79-185)||(7553566-7553672)
chr4 (97-171)||(17445184-17445258)
chr4 (61-191)||(22169582-22169710)
chr4 (97-171)||(33960971-33961045)
chr4 (61-171)||(36308269-36308378)
chr4 (97-191)||(45885388-45885482)
chr4 (106-191)||(7554000-7554085)
chr4 (90-191)||(36308285-36308386)
chr4 (104-191)||(3875008-3875096)
chr4 (223-287)||(7327203-7327267)
chr4 (223-287)||(7553619-7553683)
chr4 (223-287)||(7553814-7553878)
chr4 (63-191)||(36224560-36224687)
chr4 (223-287)||(36431865-36431929)
chr4 (216-284)||(41764325-41764393)
chr4 (89-188)||(7326986-7327085)
chr4 (216-287)||(11005199-11005270)
chr4 (216-287)||(35949024-35949095)
chr4 (216-287)||(49331643-49331714)
chr4 (97-183)||(39677213-39677299)
chr4 (135-287)||(44878532-44878673)
chr4 (61-159)||(54202793-54202890)
chr4 (205-285)||(11005237-11005311)
chr4 (61-154)||(11309090-11309182)
chr4 (216-285)||(45885424-45885493)
chr4 (79-188)||(45885603-45885712)
chr4 (97-178)||(48868499-48868580)
chr4 (90-191)||(49331656-49331757)
chr4 (65-287)||(27766956-27767152)
chr4 (61-191)||(27767099-27767217)
chr4 (215-287)||(27767183-27767255)
chr4 (61-189)||(28867181-28867308)
chr4 (223-287)||(29933055-29933119)
chr4 (97-283)||(36308452-36308621)
chr4 (215-287)||(56162942-56163014)
chr4 (216-287)||(7327006-7327077)
chr4 (216-287)||(7553583-7553654)
chr4 (216-287)||(7553778-7553849)
chr4 (96-191)||(11381602-11381697)
chr4 (216-287)||(36308272-36308343)
chr4 (216-287)||(36431829-36431900)
chr4 (205-287)||(54202751-54202827)
chr4 (216-287)||(54202792-54202863)
chr4 (218-287)||(2492502-2492569)
chr4 (79-188)||(3874975-3875085)
chr4 (225-287)||(7554023-7554085)
chr4 (61-159)||(27767156-27767253)
chr4 (106-277)||(28573254-28573423)
chr4 (61-159)||(49331616-49331713)
chr4 (205-285)||(27767221-27767295)
chr4 (65-158)||(35948901-35948993)
chr4 (216-285)||(36308486-36308555)
chr4 (205-285)||(49331717-49331791)
chr4 (205-285)||(56162902-56162976)
chr4 (216-285)||(56162979-56163048)
chr4 (61-284)||(56162980-56163177)
chr4 (223-287)||(3931220-3931284)
chr4 (216-272)||(7554087-7554143)
chr4 (124-274)||(11381280-11381419)
chr4 (223-287)||(20492815-20492879)
chr4 (61-191)||(22169379-22169497)
chr4 (61-153)||(29924095-29924186)
chr4 (216-272)||(29924130-29924186)
chr4 (61-191)||(35948940-35949058)
chr4 (79-191)||(45885226-45885338)
chr4 (124-191)||(2492091-2492158)
chr4 (132-191)||(2492322-2492381)
chr4 (218-284)||(11004955-11005019)
chr4 (216-287)||(11005163-11005234)
chr4 (124-191)||(11005413-11005480)
chr4 (124-191)||(22169369-22169436)
chr4 (216-287)||(24744473-24744544)
chr4 (124-191)||(27767397-27767464)
chr4 (113-188)||(33115500-33115575)
chr4 (61-156)||(35949000-35949094)
chr4 (216-287)||(36308520-36308591)
chr4 (132-191)||(36308703-36308762)
chr4 (90-191)||(43957395-43957492)
chr4 (126-280)||(49331614-49331757)
chr4 (124-191)||(49331893-49331960)
chr4 (85-159)||(2492088-2492162)
chr4 (85-159)||(11005409-11005483)
chr4 (61-171)||(20492773-20492882)
chr4 (85-159)||(22169366-22169440)
chr4 (85-159)||(27767393-27767467)
chr4 (104-285)||(33961345-33961515)
chr4 (124-190)||(35949273-35949339)
chr4 (216-285)||(43957384-43957451)
chr4 (85-159)||(49331889-49331963)
chr4 (85-159)||(56162730-56162804)
chr4 (216-285)||(11381591-11381660)
chr4 (216-285)||(33961515-33961584)
chr4 (216-285)||(35948893-35948962)
chr4 (138-191)||(43957333-43957386)
chr4 (138-191)||(49331360-49331413)
chr4 (216-285)||(49331681-49331750)
chr4 (216-285)||(54202925-54202994)
chr4 (138-191)||(54203131-54203184)
chr4 (219-280)||(56162745-56162806)
chr4 (216-280)||(2492100-2492164)
chr4 (97-153)||(7327106-7327162)
chr4 (216-280)||(11005407-11005471)
chr4 (216-280)||(22169378-22169442)
chr4 (218-281)||(26488764-26488825)
chr4 (216-280)||(27767154-27767218)
chr4 (216-280)||(27767391-27767455)
chr4 (63-159)||(29933028-29933123)
chr4 (124-278)||(29933134-29933270)
chr4 (143-191)||(35948703-35948751)
chr4 (216-280)||(49331887-49331951)
chr4 (143-191)||(54202609-54202657)
chr4 (216-280)||(54202828-54202892)
chr4 (61-191)||(54202829-54202947)
chr4 (218-285)||(54203068-54203133)
chr4 (61-160)||(3931192-3931290)
chr4 (216-287)||(11309089-11309160)
chr4 (216-287)||(11381625-11381696)
chr4 (216-287)||(22169475-22169546)
chr4 (61-153)||(28573308-28573395)
chr4 (143-190)||(29932813-29932860)
chr4 (124-191)||(29933303-29933370)
chr4 (232-287)||(33115520-33115575)
chr4 (216-287)||(36308308-36308379)
chr4 (124-191)||(43957629-43957696)
chr4 (61-287)||(45885461-45885692)
chr4 (223-285)||(49331411-49331471)
chr4 (61-152)||(55281712-55281802)
chr4 (209-283)||(55542094-55542162)
chr4 (223-285)||(2492330-2492392)
chr4 (223-281)||(7553993-7554051)
chr4 (223-285)||(29932960-29933022)
chr4 (85-159)||(29933299-29933373)
chr4 (223-285)||(35948929-35948991)
chr4 (216-285)||(35949062-35949129)
chr4 (85-159)||(35949268-35949342)
chr4 (61-151)||(39677209-39677298)
chr4 (216-270)||(39677209-39677263)
chr4 (61-188)||(41764270-41764392)
chr4 (205-278)||(43957459-43957526)
chr4 (85-159)||(43957625-43957699)
chr4 (97-191)||(44878710-44878803)
chr4 (223-285)||(49331548-49331610)
chr4 (85-159)||(54202587-54202661)
chr4 (65-154)||(2492328-2492416)
chr4 (223-272)||(7327267-7327316)
chr4 (62-183)||(11309335-11309455)
chr4 (144-197)||(11309622-11309675)
chr4 (65-190)||(11381074-11381198)
chr4 (85-158)||(26488609-26488682)
chr4 (216-285)||(26488621-26488690)
chr4 (126-191)||(27767196-27767261)
chr4 (79-189)||(28573308-28573414)
chr4 (61-166)||(33961345-33961449)
chr4 (61-166)||(33961515-33961619)
chr4 (223-284)||(35948693-35948754)
chr4 (223-272)||(36431929-36431978)
chr4 (223-284)||(49331350-49331411)
chr4 (219-280)||(54202602-54202663)
chr4 (85-158)||(54202913-54202986)
chr4 (126-191)||(56162936-56163001)
chr4 (97-153)||(7553878-7553934)
chr4 (61-133)||(26488622-26488693)
chr4 (216-280)||(29933026-29933090)
chr4 (216-280)||(29933297-29933361)
chr4 (126-280)||(35948995-35949136)
chr4 (124-278)||(35949103-35949239)
chr4 (216-280)||(35949266-35949330)
chr4 (143-191)||(36308764-36308812)
chr4 (216-280)||(43957623-43957687)
chr4 (79-155)||(44878620-44878696)
chr4 (143-191)||(56162752-56162800)
chr4 (79-158)||(33961062-33961141)
chr4 (106-189)||(36431929-36432012)
chr4 (90-191)||(54203029-54203122)
chr4 (144-202)||(11381483-11381541)
chr4 (216-285)||(29933093-29933160)
chr4 (85-159)||(36308760-36308834)
chr4 (62-116)||(44878747-44878800)
chr4 (216-285)||(2492359-2492428)
chr4 (61-287)||(3874995-3875223)
chr4 (214-287)||(11309295-11309368)
chr4 (99-171)||(27766953-27767023)
chr4 (223-284)||(29932802-29932863)
chr4 (79-152)||(33115500-33115573)
chr4 (218-282)||(35948757-35948819)
chr4 (219-280)||(36308758-36308819)
chr4 (61-190)||(48868523-48868651)
chr4 (61-154)||(48873980-48874072)
chr4 (223-284)||(54203133-54203194)
chr4 (244-280)||(2492290-2492326)
chr4 (61-152)||(3874975-3875066)
chr4 (79-159)||(3931348-3931428)
chr4 (216-280)||(7327174-7327238)
chr4 (216-280)||(7553749-7553813)
chr4 (61-133)||(35948890-35948961)
chr4 (216-280)||(48868588-48868652)
chr4 (251-287)||(48868617-48868653)
chr4 (61-133)||(54202926-54202997)
chr4 (244-287)||(2492092-2492135)
chr4 (90-191)||(2492463-2492556)
chr4 (99-169)||(2492502-2492570)
chr4 (90-191)||(11004965-11005058)
chr4 (244-287)||(11005436-11005479)
chr4 (244-287)||(22169370-22169413)
chr4 (244-287)||(26488613-26488656)
chr4 (90-191)||(26488725-26488818)
chr4 (244-287)||(27767420-27767463)
chr4 (85-155)||(29933202-29933273)
chr4 (244-287)||(29933326-29933369)
chr4 (90-191)||(35948765-35948858)
chr4 (244-287)||(35949295-35949338)
chr4 (223-278)||(43957329-43957384)
chr4 (216-278)||(43957425-43957485)
chr4 (135-202)||(44878422-44878489)
chr4 (124-191)||(48874015-48874082)
chr4 (244-287)||(49331916-49331959)
chr4 (90-191)||(55542124-55542217)
chr4 (218-276)||(55542163-55542219)
chr4 (126-191)||(29933104-29933167)
chr4 (149-191)||(33115533-33115575)
chr4 (253-287)||(39677171-39677205)
chr4 (89-166)||(43957384-43957459)
chr4 (223-285)||(54202896-54202958)
chr4 (124-200)||(2492191-2492268)
chr4 (104-153)||(7327267-7327316)
chr4 (124-189)||(7554087-7554152)
chr4 (99-171)||(11004949-11005019)
chr4 (62-191)||(11381280-11381408)
chr4 (99-191)||(41764335-41764428)
chr4 (216-273)||(48873980-48874037)
chr4 (143-191)||(49331422-49331468)
chr4 (79-159)||(7553996-7554076)
chr4 (79-155)||(11309315-11309391)
chr4 (99-171)||(22169794-22169866)
chr4 (216-280)||(28573179-28573243)
chr4 (132-191)||(29933239-29933301)
chr4 (132-191)||(35949208-35949270)
chr4 (143-191)||(36431963-36432011)
chr4 (132-191)||(43957565-43957627)
chr4 (216-280)||(44878420-44878484)
chr4 (216-280)||(44878530-44878594)
chr4 (65-129)||(49331350-49331413)
chr4 (124-195)||(49331788-49331860)
chr4 (244-284)||(55542254-55542294)
chr4 (132-191)||(56162802-56162864)
chr4 (124-195)||(56162833-56162905)
chr4 (216-274)||(2492200-2492259)
chr4 (99-170)||(3873969-3874040)
chr4 (61-116)||(7327183-7327237)
chr4 (216-274)||(27767296-27767355)
chr4 (61-116)||(28573453-28573507)
chr4 (61-116)||(28867097-28867151)
chr4 (104-171)||(35948687-35948754)
chr4 (66-129)||(35948693-35948755)
chr4 (85-155)||(35949171-35949242)
chr4 (216-271)||(36431809-36431864)
chr4 (252-287)||(41764290-41764325)
chr4 (244-287)||(43957652-43957695)
chr4 (61-116)||(44878421-44878475)
chr4 (104-171)||(49331344-49331411)
chr4 (244-287)||(54202591-54202634)
chr4 (223-285)||(55542026-55542089)
chr4 (216-274)||(56162842-56162901)
chr4 (257-287)||(2492328-2492358)
chr4 (216-274)||(3931197-3931255)
chr4 (144-202)||(11309208-11309266)
chr4 (97-155)||(11309611-11309669)
chr4 (85-155)||(11381352-11381422)
chr4 (257-287)||(22169444-22169474)
chr4 (257-287)||(29932994-29933024)
chr4 (204-238)||(31445314-31445348)
chr4 (61-123)||(33961061-33961122)
chr4 (257-287)||(35948963-35948993)
chr4 (257-287)||(43957356-43957386)
chr4 (257-287)||(49331383-49331413)
chr4 (61-188)||(49331832-49331950)
chr4 (257-287)||(54203131-54203161)
chr4 (87-129)||(55542252-55542294)
chr4 (61-191)||(2492101-2492222)
chr4 (61-110)||(3931487-3931535)
chr4 (244-285)||(7554110-7554151)
chr4 (61-122)||(11005410-11005470)
chr4 (223-280)||(11381139-11381196)
chr4 (99-159)||(26488764-26488822)
chr4 (61-122)||(27767394-27767454)
chr4 (258-287)||(29932835-29932864)
chr4 (258-287)||(35948726-35948755)
chr4 (65-122)||(43957330-43957386)
chr4 (244-285)||(48874040-48874081)
chr4 (65-122)||(54203131-54203187)
chr4 (88-133)||(55542047-55542092)
chr4 (99-171)||(56163113-56163183)
chr4 (244-276)||(2492192-2492224)
chr4 (61-133)||(2492360-2492431)
chr4 (232-280)||(7553942-7553990)
chr4 (244-276)||(11005347-11005379)
chr4 (216-272)||(24744452-24744508)
chr4 (124-195)||(27767292-27767364)
chr4 (216-285)||(28573331-28573396)
chr4 (244-276)||(43957563-43957595)
chr4 (251-287)||(44878529-44878565)
chr4 (218-274)||(44878747-44878803)
chr4 (99-166)||(54203068-54203133)
chr4 (244-276)||(56162834-56162866)
[»] chr5 (235 HSPs)
chr5 (21-287)||(27770814-27771080)
chr5 (23-287)||(23191435-23191698)
chr5 (21-285)||(8836097-8836350)
chr5 (21-287)||(25031733-25031988)
chr5 (21-285)||(15472236-15472489)
chr5 (21-286)||(6230523-6230777)
chr5 (21-277)||(18186058-18186303)
chr5 (21-273)||(18617717-18617958)
chr5 (21-274)||(41742937-41743179)
chr5 (21-285)||(29296500-29296753)
chr5 (21-282)||(31377811-31378061)
chr5 (21-285)||(8335631-8335883)
chr5 (79-287)||(28349434-28349638)
chr5 (21-191)||(28349340-28349510)
chr5 (21-285)||(10691485-10691738)
chr5 (99-287)||(23191323-23191504)
chr5 (97-287)||(28349567-28349750)
chr5 (97-287)||(27770702-27770885)
chr5 (65-285)||(35065583-35065797)
chr5 (97-285)||(8335814-8335991)
chr5 (79-285)||(35065287-35065484)
chr5 (85-191)||(35065806-35065912)
chr5 (62-191)||(36484128-36484256)
chr5 (138-285)||(3390479-3390624)
chr5 (97-287)||(29296684-29296863)
chr5 (63-191)||(29296759-29296886)
chr5 (21-153)||(42675346-42675477)
chr5 (62-287)||(42674932-42675158)
chr5 (97-287)||(8835974-8836166)
chr5 (96-274)||(33569708-33569875)
chr5 (97-191)||(25031917-25032011)
chr5 (99-274)||(8781933-8782097)
chr5 (97-285)||(18186242-18186419)
chr5 (63-191)||(18186317-18186444)
chr5 (63-285)||(42675091-42675314)
chr5 (216-287)||(18617793-18617864)
chr5 (124-283)||(42222065-42222216)
chr5 (79-287)||(42674968-42675178)
chr5 (216-287)||(6230599-6230670)
chr5 (97-287)||(8335922-8336113)
chr5 (216-287)||(8836203-8836274)
chr5 (216-287)||(10691591-10691662)
chr5 (216-287)||(18186134-18186205)
chr5 (61-188)||(18618012-18618138)
chr5 (216-287)||(29296576-29296647)
chr5 (61-287)||(29296685-29296899)
chr5 (61-188)||(29296793-29296919)
chr5 (104-191)||(33591391-33591478)
chr5 (216-287)||(41743032-41743103)
chr5 (61-283)||(36483983-36484185)
chr5 (61-188)||(41742866-41742994)
chr5 (61-285)||(18186243-18186455)
chr5 (62-167)||(35065214-35065318)
chr5 (223-287)||(6230864-6230928)
chr5 (61-189)||(8836038-8836165)
chr5 (223-287)||(18617982-18618046)
chr5 (99-191)||(35065262-35065354)
chr5 (104-191)||(6230864-6230951)
chr5 (216-287)||(8335706-8335777)
chr5 (104-191)||(8835951-8836038)
chr5 (216-287)||(15472342-15472413)
chr5 (61-188)||(25031918-25032044)
chr5 (216-287)||(28349416-28349487)
chr5 (96-285)||(33591380-33591571)
chr5 (216-287)||(35065829-35065900)
chr5 (97-183)||(3390462-3390548)
chr5 (97-191)||(15472211-15472305)
chr5 (61-191)||(18186351-18186480)
chr5 (97-191)||(31377783-31377877)
chr5 (216-286)||(35065214-35065284)
chr5 (135-271)||(8782352-8782477)
chr5 (104-272)||(42675189-42675346)
chr5 (88-188)||(8336033-8336133)
chr5 (97-274)||(8782141-8782307)
chr5 (104-191)||(15472076-15472163)
chr5 (104-191)||(18617982-18618069)
chr5 (216-287)||(31377914-31377985)
chr5 (97-171)||(27770699-27770773)
chr5 (97-171)||(28349679-28349753)
chr5 (97-183)||(35065566-35065652)
chr5 (79-188)||(8835918-8836027)
chr5 (105-241)||(3390259-3390390)
chr5 (97-169)||(23191322-23191394)
chr5 (223-287)||(33591414-33591478)
chr5 (79-191)||(42675223-42675335)
chr5 (66-153)||(6230778-6230864)
chr5 (89-188)||(6230885-6230984)
chr5 (216-287)||(10691519-10691590)
chr5 (216-287)||(36484151-36484222)
chr5 (89-188)||(42674912-42675011)
chr5 (97-272)||(6230707-6230864)
chr5 (61-179)||(10691472-10691589)
chr5 (61-191)||(15472175-15472304)
chr5 (89-191)||(18618003-18618105)
chr5 (79-189)||(31377749-31377859)
chr5 (61-155)||(33569780-33569873)
chr5 (99-188)||(15472043-15472132)
chr5 (79-188)||(33591358-33591467)
chr5 (90-191)||(36484164-36484265)
chr5 (96-189)||(42675346-42675439)
chr5 (216-272)||(31377749-31377805)
chr5 (61-153)||(42675032-42675123)
chr5 (216-287)||(25031953-25032024)
chr5 (88-191)||(35065226-35065329)
chr5 (61-191)||(35065444-35065563)
chr5 (126-280)||(36484122-36484265)
chr5 (62-191)||(3390340-3390458)
chr5 (133-191)||(3390402-3390460)
chr5 (118-188)||(10691402-10691472)
chr5 (61-159)||(36484124-36484221)
chr5 (218-287)||(15472063-15472132)
chr5 (225-278)||(31377694-31377747)
chr5 (205-285)||(36484225-36484299)
chr5 (216-285)||(42675369-42675438)
chr5 (216-284)||(6230893-6230961)
chr5 (223-287)||(15472099-15472163)
chr5 (61-287)||(18617902-18618118)
chr5 (61-153)||(33591478-33591569)
chr5 (223-287)||(42675282-42675346)
chr5 (216-272)||(42675346-42675402)
chr5 (90-191)||(1421423-1421520)
chr5 (124-191)||(3390632-3390699)
chr5 (62-197)||(8781927-8782061)
chr5 (216-287)||(8835938-8836009)
chr5 (236-287)||(10691422-10691473)
chr5 (218-285)||(15472200-15472267)
chr5 (218-285)||(36484189-36484256)
chr5 (124-191)||(36484401-36484468)
chr5 (61-192)||(41742936-41743066)
chr5 (124-191)||(42221965-42222032)
chr5 (216-285)||(1421464-1421531)
chr5 (85-159)||(3390628-3390702)
chr5 (61-262)||(10691472-10691661)
chr5 (85-159)||(36484397-36484471)
chr5 (85-159)||(42221962-42222036)
chr5 (138-191)||(1421529-1421582)
chr5 (61-158)||(35065669-35065765)
chr5 (138-191)||(36483842-36483895)
chr5 (216-285)||(42222074-42222143)
chr5 (216-284)||(35065496-35065564)
chr5 (216-280)||(36484395-36484459)
chr5 (216-280)||(42221974-42222038)
chr5 (124-191)||(1421219-1421286)
chr5 (216-279)||(3390627-3390690)
chr5 (61-152)||(8336043-8336133)
chr5 (113-188)||(31377614-31377689)
chr5 (216-287)||(33569803-33569874)
chr5 (218-285)||(35065251-35065318)
chr5 (223-285)||(36483919-36483979)
chr5 (85-159)||(1421216-1421290)
chr5 (205-278)||(1421389-1421456)
chr5 (218-284)||(3390392-3390458)
chr5 (61-155)||(8335815-8335908)
chr5 (216-274)||(8782421-8782479)
chr5 (62-152)||(15472043-15472132)
chr5 (216-286)||(15472163-15472233)
chr5 (223-285)||(36484056-36484118)
chr5 (216-287)||(41742886-41742959)
chr5 (62-167)||(15472163-15472267)
chr5 (216-277)||(18186422-18186483)
chr5 (106-159)||(31377694-31377747)
chr5 (61-202)||(33569697-33569837)
chr5 (61-166)||(35065795-35065899)
chr5 (216-285)||(35065795-35065864)
chr5 (223-284)||(36483832-36483893)
chr5 (97-191)||(41742899-41742995)
chr5 (229-285)||(42222213-42222267)
chr5 (216-280)||(1421228-1421292)
chr5 (61-153)||(8335923-8336014)
chr5 (61-152)||(6230894-6230984)
chr5 (232-287)||(31377634-31377689)
chr5 (61-191)||(31377698-31377840)
chr5 (61-152)||(42674912-42675002)
chr5 (223-281)||(1421531-1421589)
chr5 (223-285)||(6230779-6230841)
chr5 (61-126)||(18186423-18186487)
chr5 (79-152)||(31377614-31377687)
chr5 (216-277)||(31377780-31377841)
chr5 (244-285)||(42222066-42222107)
chr5 (216-280)||(18617829-18617893)
chr5 (216-280)||(41743003-41743067)
chr5 (61-133)||(42222075-42222146)
chr5 (135-191)||(42675380-42675436)
chr5 (216-278)||(1421430-1421490)
chr5 (244-287)||(3390655-3390698)
chr5 (214-281)||(8782242-8782309)
chr5 (146-189)||(31377649-31377692)
chr5 (252-287)||(35065529-35065564)
chr5 (244-287)||(36484424-36484467)
chr5 (244-287)||(42221966-42222009)
chr5 (89-166)||(1421456-1421531)
chr5 (144-202)||(8782338-8782396)
chr5 (97-155)||(8782421-8782479)
chr5 (224-277)||(3390337-3390390)
chr5 (254-287)||(3390425-3390458)
chr5 (218-287)||(8782028-8782097)
chr5 (130-191)||(33591512-33591573)
chr5 (92-165)||(35065496-35065569)
chr5 (143-191)||(36483930-36483976)
chr5 (61-191)||(42221975-42222096)
chr5 (239-284)||(42222279-42222324)
chr5 (132-191)||(1421288-1421350)
chr5 (216-287)||(8335669-8335741)
chr5 (79-155)||(8782005-8782081)
chr5 (216-280)||(18186170-18186234)
chr5 (61-125)||(35065666-35065729)
chr5 (65-129)||(36483832-36483895)
chr5 (138-191)||(42222265-42222314)
chr5 (244-287)||(1421220-1421263)
chr5 (79-158)||(3390301-3390380)
chr5 (61-116)||(8782424-8782478)
chr5 (252-287)||(8782444-8782479)
chr5 (216-271)||(33591358-33591413)
chr5 (62-125)||(35065370-35065432)
chr5 (224-275)||(35065443-35065494)
chr5 (104-171)||(36483826-36483893)
chr5 (257-287)||(1421529-1421559)
chr5 (216-266)||(3390462-3390512)
chr5 (218-280)||(8781999-8782061)
chr5 (257-287)||(35065767-35065797)
chr5 (257-287)||(36483865-36483895)
chr5 (61-188)||(36484340-36484458)
chr5 (251-285)||(42675405-42675439)
chr5 (65-122)||(1421529-1421585)
chr5 (61-122)||(3390629-3390689)
chr5 (61-130)||(28349568-28349636)
chr5 (61-130)||(35065215-35065283)
chr5 (244-285)||(35065867-35065908)
chr5 (252-285)||(41742962-41742995)
chr5 (244-276)||(1421320-1421352)
chr5 (85-125)||(3390562-3390602)
chr5 (79-119)||(8782349-8782389)
chr5 (249-285)||(33591537-33591573)
chr5 (257-285)||(36483893-36483921)
chr5 (159-191)||(42222224-42222256)
[»] chr7 (229 HSPs)
chr7 (21-285)||(9869961-9870225)
chr7 (21-285)||(18676326-18676579)
chr7 (21-287)||(25105284-25105540)
chr7 (21-285)||(5543874-5544127)
chr7 (21-285)||(47455359-47455612)
chr7 (21-287)||(40186274-40186529)
chr7 (21-285)||(31587488-31587741)
chr7 (21-277)||(12848749-12848994)
chr7 (21-285)||(47020039-47020292)
chr7 (21-285)||(38742799-38743052)
chr7 (47-287)||(44509213-44509442)
chr7 (21-287)||(44291361-44291616)
chr7 (61-287)||(44062187-44062413)
chr7 (79-285)||(9740835-9741030)
chr7 (133-287)||(9869788-9869942)
chr7 (119-287)||(30888065-30888233)
chr7 (21-285)||(31622245-31622479)
chr7 (61-257)||(25105505-25105690)
chr7 (97-276)||(30887964-30888136)
chr7 (97-287)||(44062341-44062525)
chr7 (21-285)||(27902228-27902480)
chr7 (21-191)||(44062117-44062280)
chr7 (97-285)||(9869679-9869859)
chr7 (66-285)||(12725816-12726021)
chr7 (92-285)||(3888259-3888447)
chr7 (61-287)||(12725634-12725848)
chr7 (61-285)||(18676133-18676358)
chr7 (61-287)||(5543715-5543942)
chr7 (97-287)||(31622410-31622602)
chr7 (61-287)||(31587294-31587520)
chr7 (61-284)||(27902484-27902708)
chr7 (85-191)||(3887927-3888033)
chr7 (61-285)||(3888110-3888333)
chr7 (97-272)||(5543779-5543943)
chr7 (77-287)||(35598668-35598867)
chr7 (61-188)||(41118076-41118202)
chr7 (61-191)||(41118109-41118238)
chr7 (97-287)||(18676010-18676202)
chr7 (61-285)||(27902412-27902624)
chr7 (97-272)||(40186181-40186345)
chr7 (79-191)||(47019978-47020090)
chr7 (216-287)||(5543980-5544051)
chr7 (61-287)||(12725598-12725812)
chr7 (61-188)||(31587202-31587328)
chr7 (97-191)||(18676301-18676395)
chr7 (61-287)||(40186117-40186344)
chr7 (61-287)||(44291546-44291773)
chr7 (97-285)||(12725708-12725885)
chr7 (61-191)||(40430807-40430932)
chr7 (21-191)||(44509157-44509321)
chr7 (61-189)||(31587429-31587556)
chr7 (79-191)||(41118145-41118257)
chr7 (104-191)||(5543692-5543779)
chr7 (216-287)||(12848825-12848896)
chr7 (216-287)||(18676432-18676503)
chr7 (104-191)||(31587271-31587358)
chr7 (104-191)||(38742689-38742776)
chr7 (216-287)||(38742905-38742976)
chr7 (216-287)||(44062186-44062257)
chr7 (61-188)||(44509372-44509498)
chr7 (216-287)||(47455435-47455506)
chr7 (61-191)||(3888074-3888203)
chr7 (104-190)||(9740661-9740747)
chr7 (61-283)||(40430662-40430864)
chr7 (61-283)||(42076841-42077043)
chr7 (104-284)||(42697734-42697915)
chr7 (97-285)||(31587380-31587557)
chr7 (90-191)||(42076797-42076898)
chr7 (61-287)||(5543679-5543906)
chr7 (88-188)||(18675954-18676054)
chr7 (97-272)||(44291545-44291709)
chr7 (216-287)||(9740941-9741012)
chr7 (216-287)||(9870078-9870149)
chr7 (104-191)||(25105769-25105856)
chr7 (79-190)||(31587236-31587347)
chr7 (216-287)||(31587594-31587665)
chr7 (104-183)||(31622538-31622617)
chr7 (61-171)||(3888415-3888523)
chr7 (97-191)||(9869654-9869748)
chr7 (97-183)||(9869944-9870030)
chr7 (61-287)||(40186081-40186308)
chr7 (97-191)||(44509371-44509465)
chr7 (97-191)||(47020014-47020108)
chr7 (79-188)||(5543659-5543768)
chr7 (97-190)||(12848933-12849026)
chr7 (67-188)||(40186061-40186181)
chr7 (223-287)||(25105769-25105833)
chr7 (63-191)||(27902378-27902505)
chr7 (223-287)||(38742712-38742776)
chr7 (97-189)||(38742776-38742868)
chr7 (97-189)||(47455543-47455635)
chr7 (97-180)||(9740821-9740904)
chr7 (61-188)||(12848934-12849060)
chr7 (104-191)||(18675987-18676074)
chr7 (97-191)||(25105468-25105563)
chr7 (216-287)||(25105541-25105612)
chr7 (216-287)||(41118168-41118239)
chr7 (61-188)||(47019945-47020071)
chr7 (216-287)||(47020001-47020072)
chr7 (216-287)||(47020145-47020216)
chr7 (97-191)||(3888378-3888471)
chr7 (97-171)||(44062454-44062528)
chr7 (79-188)||(25105780-25105889)
chr7 (79-188)||(31622549-31622658)
chr7 (61-182)||(38742631-38742746)
chr7 (67-188)||(47455635-47455755)
chr7 (223-287)||(3888456-3888520)
chr7 (223-287)||(9869641-9869705)
chr7 (61-287)||(18675974-18676201)
chr7 (61-287)||(31587258-31587484)
chr7 (216-287)||(3887939-3888010)
chr7 (124-287)||(12725920-12726090)
chr7 (216-287)||(12848969-12849040)
chr7 (104-191)||(27902647-27902734)
chr7 (113-287)||(41118096-41118259)
chr7 (104-191)||(44291709-44291796)
chr7 (104-191)||(47455635-47455722)
chr7 (61-285)||(3887976-3888178)
chr7 (88-277)||(12725680-12725858)
chr7 (61-183)||(18676273-18676394)
chr7 (79-188)||(27902658-27902767)
chr7 (218-287)||(40430830-40430899)
chr7 (205-285)||(40430900-40430974)
chr7 (205-285)||(42076763-42076837)
chr7 (79-188)||(44291720-44291829)
chr7 (97-287)||(3111461-3111640)
chr7 (61-287)||(9740683-9740903)
chr7 (61-169)||(9869640-9869747)
chr7 (61-287)||(31622411-31622638)
chr7 (216-287)||(42076804-42076875)
chr7 (216-287)||(44509407-44509478)
chr7 (97-191)||(35598645-35598739)
chr7 (61-159)||(42076805-42076902)
chr7 (96-287)||(3111569-3111749)
chr7 (61-183)||(3111698-3111821)
chr7 (62-159)||(40430803-40430899)
chr7 (65-158)||(42697732-42697824)
chr7 (113-189)||(25105693-25105769)
chr7 (61-191)||(42697667-42697785)
chr7 (223-287)||(47455635-47455699)
chr7 (216-287)||(9740647-9740718)
chr7 (216-287)||(31587222-31587293)
chr7 (124-191)||(40431080-40431147)
chr7 (124-191)||(42076594-42076661)
chr7 (124-191)||(42697657-42697724)
chr7 (61-171)||(12725595-12725704)
chr7 (124-190)||(30888252-30888318)
chr7 (85-159)||(40431076-40431150)
chr7 (85-159)||(42076591-42076665)
chr7 (85-159)||(42697654-42697728)
chr7 (79-188)||(9740627-9740736)
chr7 (216-285)||(18676290-18676359)
chr7 (216-285)||(25105798-25105867)
chr7 (216-285)||(42697763-42697832)
chr7 (135-287)||(3111677-3111820)
chr7 (216-272)||(25105713-25105769)
chr7 (203-279)||(35598820-35598896)
chr7 (216-280)||(40430801-40430865)
chr7 (216-280)||(40431074-40431138)
chr7 (216-280)||(42076603-42076667)
chr7 (216-280)||(42076840-42076904)
chr7 (143-191)||(42077136-42077184)
chr7 (216-280)||(42697666-42697730)
chr7 (61-191)||(42697764-42697905)
chr7 (219-287)||(47455667-47455735)
chr7 (61-152)||(18675954-18676044)
chr7 (232-287)||(25105693-25105748)
chr7 (216-287)||(27902676-27902747)
chr7 (244-287)||(30888274-30888317)
chr7 (223-285)||(40430598-40430658)
chr7 (221-284)||(42077131-42077194)
chr7 (216-287)||(44291738-44291809)
chr7 (216-287)||(47019965-47020036)
chr7 (79-153)||(25105695-25105769)
chr7 (223-285)||(42076908-42076970)
chr7 (223-285)||(42697734-42697796)
chr7 (216-285)||(38742647-38742711)
chr7 (216-277)||(38742686-38742747)
chr7 (138-191)||(40430547-40430600)
chr7 (223-272)||(47455586-47455635)
chr7 (79-191)||(38742658-38742765)
chr7 (61-153)||(38742776-38742867)
chr7 (216-272)||(38742776-38742832)
chr7 (61-153)||(47455544-47455635)
chr7 (100-183)||(3111446-3111529)
chr7 (79-166)||(3887957-3888044)
chr7 (85-156)||(12726022-12726093)
chr7 (96-188)||(38742585-38742681)
chr7 (216-287)||(38742605-38742680)
chr7 (61-158)||(3888265-3888361)
chr7 (216-285)||(3888414-3888482)
chr7 (97-191)||(25105649-25105735)
chr7 (223-284)||(40430537-40430598)
chr7 (216-280)||(3111758-3111822)
chr7 (21-172)||(30888234-30888372)
chr7 (244-287)||(40431103-40431146)
chr7 (244-287)||(42076595-42076638)
chr7 (223-285)||(42077047-42077107)
chr7 (244-287)||(42697658-42697701)
chr7 (216-271)||(47019945-47020000)
chr7 (61-155)||(3111654-3111747)
chr7 (216-285)||(25105504-25105574)
chr7 (21-58)||(9741021-9741058)
chr7 (223-280)||(12848868-12848925)
chr7 (143-191)||(40430609-40430655)
chr7 (102-171)||(42077131-42077200)
chr7 (61-125)||(3888301-3888364)
chr7 (251-287)||(27902266-27902302)
chr7 (126-191)||(40430879-40430940)
chr7 (61-116)||(35598648-35598702)
chr7 (104-171)||(40430531-40430598)
chr7 (85-155)||(42076691-42076762)
chr7 (85-155)||(3111546-3111616)
chr7 (169-238)||(3111846-3111918)
chr7 (257-287)||(3888042-3888072)
chr7 (149-191)||(9740990-9741032)
chr7 (62-116)||(9869887-9869940)
chr7 (216-266)||(9869944-9869994)
chr7 (97-183)||(35598797-35598883)
chr7 (233-287)||(38742569-38742623)
chr7 (257-287)||(40430570-40430600)
chr7 (61-188)||(40431019-40431137)
chr7 (61-188)||(42076604-42076722)
chr7 (79-129)||(42077144-42077194)
chr7 (257-287)||(42697732-42697762)
chr7 (218-271)||(25105836-25105889)
chr7 (65-129)||(40430537-40430600)
chr7 (143-186)||(42077050-42077091)
chr7 (259-287)||(42077133-42077161)
[»] chr3 (479 HSPs)
chr3 (23-287)||(28554725-28554989)
chr3 (21-287)||(27449799-27450054)
chr3 (21-285)||(37126208-37126461)
chr3 (21-285)||(37821369-37821622)
chr3 (21-285)||(10659838-10660091)
chr3 (21-285)||(20607268-20607521)
chr3 (21-272)||(2446269-2446509)
chr3 (21-272)||(51754731-51754971)
chr3 (21-277)||(24349111-24349356)
chr3 (21-277)||(46528406-46528651)
chr3 (21-285)||(3019509-3019761)
chr3 (21-285)||(5273148-5273401)
chr3 (21-285)||(24406087-24406340)
chr3 (21-285)||(1545751-1546005)
chr3 (21-285)||(26975052-26975305)
chr3 (21-285)||(38252827-38253079)
chr3 (21-277)||(31655351-31655629)
chr3 (21-191)||(47698072-47698242)
chr3 (21-191)||(51166828-51166998)
chr3 (89-285)||(8828144-8828329)
chr3 (61-285)||(12227392-12227610)
chr3 (23-189)||(43972884-43973050)
chr3 (61-285)||(13287548-13287764)
chr3 (97-287)||(31655568-31655745)
chr3 (97-287)||(28554610-28554796)
chr3 (60-287)||(55273729-55273945)
chr3 (21-191)||(8828263-8828433)
chr3 (90-272)||(24349644-24349815)
chr3 (65-285)||(41113668-41113874)
chr3 (90-272)||(46528935-46529106)
chr3 (90-281)||(13287355-13287540)
chr3 (61-287)||(46528795-46529013)
chr3 (21-191)||(8068174-8068343)
chr3 (61-287)||(51166658-51166885)
chr3 (21-157)||(10471039-10471175)
chr3 (118-272)||(44378448-44378591)
chr3 (61-287)||(24349504-24349722)
chr3 (61-287)||(3019729-3019955)
chr3 (97-287)||(13287695-13287887)
chr3 (61-191)||(26229775-26229904)
chr3 (65-287)||(26229913-26230122)
chr3 (85-191)||(12227517-12227623)
chr3 (61-191)||(13287199-13287328)
chr3 (61-287)||(37126049-37126276)
chr3 (65-285)||(26229707-26229915)
chr3 (79-287)||(20607109-20607319)
chr3 (61-287)||(41113522-41113736)
chr3 (61-285)||(8827961-8828176)
chr3 (61-191)||(23151404-23151533)
chr3 (61-191)||(43219226-43219355)
chr3 (21-126)||(44378090-44378196)
chr3 (79-287)||(23151313-23151510)
chr3 (61-287)||(10660023-10660243)
chr3 (97-287)||(37821553-37821745)
chr3 (97-287)||(41457121-41457300)
chr3 (96-272)||(35923062-35923240)
chr3 (85-191)||(13287186-13287292)
chr3 (203-285)||(23151125-23151207)
chr3 (61-191)||(26230016-26230145)
chr3 (61-272)||(3019693-3019891)
chr3 (74-191)||(10048511-10048628)
chr3 (21-272)||(23151047-23151302)
chr3 (97-272)||(20607173-20607337)
chr3 (97-272)||(37126113-37126277)
chr3 (61-189)||(43972541-43972668)
chr3 (216-287)||(5273254-5273325)
chr3 (216-287)||(10659914-10659985)
chr3 (216-287)||(24349187-24349258)
chr3 (97-287)||(24406271-24406450)
chr3 (61-287)||(26229945-26230158)
chr3 (216-287)||(37126314-37126385)
chr3 (61-280)||(44378309-44378527)
chr3 (216-287)||(46528482-46528553)
chr3 (61-285)||(1545594-1545819)
chr3 (61-191)||(9746422-9746551)
chr3 (61-191)||(22497746-22497875)
chr3 (61-191)||(24349468-24349597)
chr3 (61-191)||(24406308-24406437)
chr3 (61-191)||(24406344-24406473)
chr3 (97-191)||(27449983-27450077)
chr3 (65-190)||(9746277-9746401)
chr3 (138-285)||(10470891-10471027)
chr3 (79-285)||(43972478-43972687)
chr3 (218-287)||(51166851-51166920)
chr3 (79-287)||(1545471-1545681)
chr3 (97-285)||(1545630-1545820)
chr3 (61-287)||(9746345-9746564)
chr3 (61-287)||(23151332-23151546)
chr3 (62-285)||(24349433-24349644)
chr3 (79-191)||(41113499-41113611)
chr3 (104-191)||(1545448-1545535)
chr3 (97-272)||(12227284-12227461)
chr3 (216-287)||(20607374-20607445)
chr3 (89-285)||(24349423-24349608)
chr3 (104-191)||(24349815-24349902)
chr3 (216-287)||(24406163-24406234)
chr3 (61-188)||(24406380-24406506)
chr3 (216-287)||(26975158-26975229)
chr3 (104-191)||(33583919-33584006)
chr3 (104-191)||(37126026-37126113)
chr3 (216-287)||(37821445-37821516)
chr3 (216-287)||(38252903-38252974)
chr3 (104-191)||(51166635-51166722)
chr3 (216-287)||(51754807-51754878)
chr3 (104-191)||(51754971-51755058)
chr3 (61-287)||(55273693-55273907)
chr3 (85-191)||(10048882-10048988)
chr3 (97-191)||(10660022-10660116)
chr3 (104-285)||(23151302-23151472)
chr3 (97-191)||(24349295-24349389)
chr3 (61-283)||(43219298-43219500)
chr3 (203-277)||(44378215-44378289)
chr3 (61-191)||(10048814-10048939)
chr3 (216-285)||(35923063-35923132)
chr3 (79-188)||(38253149-38253258)
chr3 (216-285)||(47698148-47698217)
chr3 (104-287)||(5272940-5273125)
chr3 (88-188)||(8827748-8827848)
chr3 (88-287)||(24406298-24406486)
chr3 (61-287)||(51166622-51166849)
chr3 (89-272)||(51166722-51166894)
chr3 (104-191)||(3019891-3019978)
chr3 (104-191)||(10660179-10660266)
chr3 (216-287)||(13287234-13287305)
chr3 (61-188)||(23151440-23151566)
chr3 (120-287)||(33583814-33583983)
chr3 (104-191)||(35923240-35923327)
chr3 (104-191)||(38253138-38253225)
chr3 (61-287)||(41113486-41113700)
chr3 (104-191)||(44378591-44378678)
chr3 (62-285)||(46528692-46528899)
chr3 (61-188)||(55273673-55273799)
chr3 (97-191)||(3019692-3019786)
chr3 (104-242)||(10048635-10048768)
chr3 (61-191)||(22497710-22497839)
chr3 (61-183)||(24349296-24349417)
chr3 (61-191)||(26229739-26229868)
chr3 (97-191)||(41113643-41113737)
chr3 (97-183)||(46528590-46528676)
chr3 (97-191)||(48478177-48478271)
chr3 (97-191)||(53019450-53019544)
chr3 (79-188)||(1545415-1545524)
chr3 (226-287)||(1545857-1545918)
chr3 (97-182)||(8828128-8828213)
chr3 (79-188)||(10660190-10660299)
chr3 (216-285)||(12227542-12227611)
chr3 (61-287)||(24349652-24349879)
chr3 (101-287)||(38253014-38253202)
chr3 (88-287)||(38253037-38253238)
chr3 (79-188)||(51166602-51166711)
chr3 (79-188)||(51754982-51755091)
chr3 (223-287)||(2446522-2446586)
chr3 (223-287)||(12227220-12227284)
chr3 (104-188)||(20607089-20607173)
chr3 (61-189)||(20607173-20607300)
chr3 (61-277)||(24349368-24349564)
chr3 (61-287)||(37126013-37126240)
chr3 (223-287)||(46529106-46529170)
chr3 (223-287)||(51754971-51755035)
chr3 (216-287)||(2446345-2446416)
chr3 (104-191)||(2446522-2446609)
chr3 (216-287)||(3019584-3019655)
chr3 (216-287)||(8068233-8068304)
chr3 (216-287)||(10048534-10048605)
chr3 (61-188)||(27449984-27450110)
chr3 (104-191)||(46529106-46529193)
chr3 (97-191)||(13287476-13287569)
chr3 (79-185)||(37125996-37126102)
chr3 (97-191)||(49804224-49804318)
chr3 (79-188)||(3019902-3020011)
chr3 (216-285)||(8828288-8828357)
chr3 (61-166)||(10048768-10048871)
chr3 (216-285)||(13287198-13287267)
chr3 (90-191)||(22497702-22497803)
chr3 (132-283)||(22497877-22498020)
chr3 (216-285)||(24349331-24349400)
chr3 (79-188)||(24349826-24349935)
chr3 (79-188)||(33583930-33584039)
chr3 (90-191)||(43219218-43219319)
chr3 (79-188)||(44378602-44378711)
chr3 (61-287)||(1545435-1545662)
chr3 (61-285)||(10048768-10048975)
chr3 (104-188)||(10470784-10470868)
chr3 (61-153)||(12227333-12227424)
chr3 (61-189)||(13287696-13287823)
chr3 (97-169)||(31655674-31655746)
chr3 (61-153)||(33583828-33583919)
chr3 (223-287)||(35923240-35923304)
chr3 (223-287)||(44378591-44378655)
chr3 (104-191)||(8827781-8827867)
chr3 (216-287)||(8828250-8828321)
chr3 (126-280)||(43219218-43219361)
chr3 (216-287)||(43972905-43972976)
chr3 (97-183)||(5273131-5273217)
chr3 (61-171)||(9746458-9746567)
chr3 (62-183)||(13287513-13287631)
chr3 (99-189)||(26975029-26975119)
chr3 (61-159)||(49804220-49804317)
chr3 (216-285)||(10048907-10048976)
chr3 (216-285)||(13287547-13287616)
chr3 (216-285)||(22497709-22497778)
chr3 (216-285)||(23151174-23151243)
chr3 (104-185)||(26974948-26975029)
chr3 (79-188)||(35923251-35923360)
chr3 (88-185)||(37821665-37821762)
chr3 (203-280)||(41454614-41454691)
chr3 (104-287)||(41457020-41457192)
chr3 (205-285)||(43219184-43219258)
chr3 (104-272)||(43972541-43972698)
chr3 (118-285)||(43972600-43972769)
chr3 (216-285)||(44378344-44378413)
chr3 (215-284)||(53019686-53019755)
chr3 (96-188)||(5272921-5273012)
chr3 (95-287)||(8827804-8827996)
chr3 (61-169)||(10048497-10048604)
chr3 (223-287)||(10470804-10470868)
chr3 (89-189)||(12227333-12227433)
chr3 (223-287)||(26974965-26975029)
chr3 (104-191)||(43972306-43972394)
chr3 (216-284)||(44378380-44378448)
chr3 (216-284)||(47698184-47698252)
chr3 (215-287)||(48478176-48478248)
chr3 (215-287)||(53019449-53019521)
chr3 (61-287)||(5272976-5273216)
chr3 (216-287)||(8068197-8068268)
chr3 (216-287)||(10048498-10048569)
chr3 (216-287)||(10660208-10660279)
chr3 (104-171)||(13287823-13287890)
chr3 (216-287)||(24349844-24349915)
chr3 (216-287)||(43219261-43219332)
chr3 (216-287)||(51755000-51755071)
chr3 (61-285)||(3019765-3019989)
chr3 (88-284)||(33583818-33584016)
chr3 (61-159)||(43219262-43219359)
chr3 (105-191)||(43972453-43972539)
chr3 (61-159)||(48478178-48478275)
chr3 (124-287)||(49804283-49804430)
chr3 (61-159)||(53019451-53019548)
chr3 (203-280)||(502311-502388)
chr3 (216-285)||(3019728-3019797)
chr3 (216-285)||(9746308-9746377)
chr3 (104-169)||(12227219-12227284)
chr3 (216-285)||(22497745-22497814)
chr3 (216-285)||(43219225-43219294)
chr3 (223-287)||(43972329-43972394)
chr3 (122-191)||(46528679-46528748)
chr3 (205-285)||(48478136-48478210)
chr3 (205-285)||(53019409-53019483)
chr3 (205-285)||(53019646-53019720)
chr3 (61-191)||(9746212-9746330)
chr3 (97-189)||(10470868-10470960)
chr3 (61-153)||(10470868-10470959)
chr3 (216-276)||(10471039-10471099)
chr3 (223-287)||(22497788-22497852)
chr3 (216-272)||(26975029-26975085)
chr3 (223-287)||(31655456-31655520)
chr3 (61-153)||(35923100-35923191)
chr3 (223-287)||(35923276-35923340)
chr3 (61-153)||(38253047-38253138)
chr3 (65-191)||(41113821-41113935)
chr3 (61-165)||(47698149-47698252)
chr3 (215-287)||(49804247-49804319)
chr3 (61-287)||(8827768-8827993)
chr3 (124-191)||(9746202-9746269)
chr3 (124-191)||(22497499-22497566)
chr3 (62-153)||(26975029-26975119)
chr3 (216-287)||(27450019-27450090)
chr3 (96-191)||(44378307-44378402)
chr3 (216-287)||(44378620-44378691)
chr3 (89-188)||(46529127-46529226)
chr3 (124-191)||(48477967-48478034)
chr3 (61-190)||(48478214-48478331)
chr3 (205-287)||(49804486-49804562)
chr3 (124-191)||(53019240-53019307)
chr3 (97-272)||(8827867-8828035)
chr3 (85-159)||(9746199-9746273)
chr3 (61-191)||(13287477-13287605)
chr3 (85-159)||(22497496-22497570)
chr3 (101-171)||(28554607-28554677)
chr3 (124-190)||(43219015-43219081)
chr3 (79-188)||(43972273-43972383)
chr3 (223-277)||(43972781-43972835)
chr3 (85-159)||(48477964-48478038)
chr3 (104-190)||(48478281-48478367)
chr3 (218-287)||(48478408-48478475)
chr3 (85-159)||(53019237-53019311)
chr3 (79-188)||(2446533-2446642)
chr3 (65-158)||(10048678-10048770)
chr3 (138-191)||(10048717-10048770)
chr3 (216-285)||(12227356-12227425)
chr3 (61-166)||(13287235-13287339)
chr3 (216-285)||(13287270-13287339)
chr3 (205-285)||(22497668-22497742)
chr3 (138-191)||(22498108-22498161)
chr3 (61-166)||(26229811-26229915)
chr3 (138-191)||(26717216-26717269)
chr3 (216-285)||(35923099-35923168)
chr3 (138-191)||(43219588-43219641)
chr3 (216-277)||(43972450-43972511)
chr3 (223-272)||(43972835-43972884)
chr3 (97-158)||(44378228-44378289)
chr3 (126-191)||(49804260-49804325)
chr3 (215-280)||(49804457-49804522)
chr3 (126-191)||(49804463-49804528)
chr3 (124-189)||(49804666-49804731)
chr3 (216-285)||(51166817-51166886)
chr3 (216-280)||(9746211-9746275)
chr3 (216-272)||(10470868-10470924)
chr3 (79-159)||(13287380-13287460)
chr3 (216-280)||(17338276-17338340)
chr3 (143-191)||(17338282-17338330)
chr3 (216-280)||(22497508-22497572)
chr3 (63-171)||(26230054-26230161)
chr3 (218-285)||(26717267-26717332)
chr3 (63-171)||(41113483-41113590)
chr3 (223-287)||(43972634-43972698)
chr3 (77-153)||(43972698-43972774)
chr3 (216-272)||(43972884-43972940)
chr3 (97-153)||(44378535-44378591)
chr3 (216-280)||(48477976-48478040)
chr3 (216-280)||(48478213-48478277)
chr3 (216-280)||(49804218-49804282)
chr3 (216-280)||(53019249-53019313)
chr3 (216-280)||(53019486-53019550)
chr3 (216-287)||(2446551-2446622)
chr3 (223-285)||(22498024-22498084)
chr3 (209-283)||(26717333-26717401)
chr3 (216-287)||(41113772-41113843)
chr3 (223-285)||(43219504-43219564)
chr3 (79-158)||(43972450-43972529)
chr3 (61-280)||(46528831-46529042)
chr3 (216-287)||(46529135-46529206)
chr3 (218-284)||(49804095-49804159)
chr3 (223-285)||(9746279-9746341)
chr3 (223-285)||(10048706-10048768)
chr3 (219-285)||(13287365-13287431)
chr3 (85-159)||(17338278-17338352)
chr3 (223-285)||(22497885-22497947)
chr3 (108-190)||(41457240-41457322)
chr3 (85-159)||(43219012-43219086)
chr3 (223-285)||(43219365-43219427)
chr3 (85-159)||(49804660-49804734)
chr3 (97-171)||(53019687-53019761)
chr3 (223-284)||(26717206-26717267)
chr3 (232-285)||(33583807-33583860)
chr3 (223-284)||(43219590-43219651)
chr3 (61-191)||(44378229-44378366)
chr3 (216-277)||(44378308-44378369)
chr3 (88-285)||(46528681-46528863)
chr3 (126-191)||(48478170-48478235)
chr3 (126-191)||(53019443-53019508)
chr3 (126-191)||(53019680-53019745)
chr3 (85-161)||(26229629-26229705)
chr3 (143-191)||(26229651-26229699)
chr3 (61-153)||(37821554-37821645)
chr3 (216-280)||(43219024-43219088)
chr3 (216-272)||(43972394-43972450)
chr3 (96-191)||(43972918-43973014)
chr3 (216-280)||(49804658-49804722)
chr3 (133-287)||(502078-502211)
chr3 (61-152)||(5272921-5273010)
chr3 (61-160)||(8068169-8068267)
chr3 (61-152)||(8827748-8827838)
chr3 (218-285)||(13287513-13287580)
chr3 (90-191)||(26717278-26717371)
chr3 (234-285)||(43972721-43972772)
chr3 (65-191)||(48478279-48478398)
chr3 (233-287)||(8828073-8828127)
chr3 (149-191)||(17332807-17332849)
chr3 (223-285)||(23151217-23151279)
chr3 (61-147)||(37821675-37821760)
chr3 (104-158)||(43972781-43972835)
chr3 (216-266)||(46528626-46528676)
chr3 (129-202)||(502172-502245)
chr3 (216-277)||(10048678-10048739)
chr3 (231-284)||(17332797-17332850)
chr3 (223-280)||(22497824-22497881)
chr3 (223-284)||(22498110-22498171)
chr3 (217-278)||(26229642-26229703)
chr3 (61-122)||(41454628-41454688)
chr3 (138-191)||(41457018-41457071)
chr3 (104-153)||(43972835-43972884)
chr3 (61-191)||(49804399-49804520)
chr3 (61-191)||(53019487-53019608)
chr3 (61-125)||(10048675-10048738)
chr3 (216-280)||(24349223-24349287)
chr3 (216-287)||(43972293-43972365)
chr3 (245-281)||(48478369-48478405)
chr3 (216-280)||(51754843-51754907)
chr3 (244-287)||(9746203-9746246)
chr3 (216-283)||(9746344-9746411)
chr3 (244-287)||(22497500-22497543)
chr3 (104-171)||(22498110-22498177)
chr3 (242-285)||(24349421-24349464)
chr3 (132-191)||(41113882-41113941)
chr3 (244-287)||(43219016-43219059)
chr3 (244-287)||(44378455-44378498)
chr3 (244-287)||(48477968-48478011)
chr3 (244-287)||(49804687-49804730)
chr3 (244-287)||(53019241-53019284)
chr3 (216-274)||(8068174-8068232)
chr3 (65-159)||(22497786-22497879)
chr3 (79-133)||(22497896-22497950)
chr3 (216-266)||(24349367-24349417)
chr3 (97-159)||(41454627-41454689)
chr3 (65-155)||(41457018-41457107)
chr3 (95-153)||(43972394-43972452)
chr3 (216-285)||(43972943-43973013)
chr3 (247-285)||(44378303-44378341)
chr3 (223-285)||(48478281-48478343)
chr3 (97-159)||(49804459-49804521)
chr3 (204-280)||(502066-502143)
chr3 (223-280)||(2446388-2446445)
chr3 (143-191)||(22498027-22498073)
chr3 (223-280)||(41113876-41113933)
chr3 (143-191)||(43219507-43219553)
chr3 (61-122)||(43972450-43972510)
chr3 (61-191)||(48477977-48478098)
chr3 (99-171)||(48478408-48478478)
chr3 (61-191)||(53019250-53019371)
chr3 (61-271)||(3019801-3020011)
chr3 (143-191)||(10048583-10048631)
chr3 (135-191)||(10470902-10470958)
chr3 (251-287)||(17338305-17338341)
chr3 (65-129)||(26717206-26717269)
chr3 (129-272)||(35923059-35923191)
chr3 (143-191)||(41454637-41454685)
chr3 (124-195)||(43219115-43219187)
chr3 (65-129)||(43219588-43219651)
chr3 (216-280)||(46528518-46528582)
chr3 (124-195)||(48478067-48478139)
chr3 (132-191)||(49804600-49804662)
chr3 (124-195)||(53019340-53019412)
chr3 (124-195)||(53019577-53019649)
chr3 (244-287)||(10048570-10048613)
chr3 (244-287)||(26229633-26229676)
chr3 (104-171)||(26717200-26717267)
chr3 (61-116)||(41457158-41457212)
chr3 (104-171)||(43219590-43219657)
chr3 (61-152)||(46529136-46529226)
chr3 (216-274)||(48478076-48478135)
chr3 (218-273)||(48478312-48478367)
chr3 (216-274)||(53019349-53019408)
chr3 (216-274)||(53019586-53019645)
chr3 (257-287)||(9746277-9746307)
chr3 (257-287)||(10048740-10048770)
chr3 (257-287)||(10470997-10471027)
chr3 (79-129)||(17332797-17332847)
chr3 (61-188)||(17338221-17338339)
chr3 (257-287)||(22498108-22498138)
chr3 (257-287)||(26717239-26717269)
chr3 (257-287)||(41113844-41113874)
chr3 (257-287)||(41113905-41113935)
chr3 (85-155)||(41457145-41457215)
chr3 (62-116)||(41457267-41457320)
chr3 (257-287)||(43219588-43219618)
chr3 (257-287)||(48478279-48478309)
chr3 (244-285)||(10048943-10048984)
chr3 (63-116)||(10470784-10470836)
chr3 (61-122)||(22497509-22497569)
chr3 (65-122)||(22498108-22498164)
chr3 (132-188)||(43219084-43219143)
chr3 (252-285)||(46529050-46529083)
chr3 (135-191)||(48478408-48478462)
chr3 (99-171)||(49804089-49804159)
chr3 (135-191)||(49804105-49804159)
chr3 (143-191)||(12227233-12227281)
chr3 (245-285)||(13287355-13287395)
chr3 (257-285)||(22498082-22498110)
chr3 (99-166)||(26717267-26717332)
chr3 (79-147)||(26974950-26975018)
chr3 (88-116)||(43219152-43219180)
chr3 (257-285)||(43219562-43219590)
chr3 (143-191)||(43972784-43972832)
chr3 (244-276)||(48478068-48478100)
chr3 (245-281)||(49804162-49804198)
chr3 (244-276)||(49804598-49804630)
chr3 (244-276)||(53019341-53019373)
chr3 (244-276)||(53019578-53019610)
[»] chr2 (200 HSPs)
chr2 (24-276)||(39429822-39430074)
chr2 (21-287)||(41568258-41568524)
chr2 (21-287)||(30786706-30786961)
chr2 (21-285)||(1222003-1222256)
chr2 (21-285)||(26479418-26479671)
chr2 (21-285)||(20115370-20115623)
chr2 (21-285)||(31546847-31547099)
chr2 (21-285)||(11979020-11979273)
chr2 (21-285)||(14287022-14287278)
chr2 (21-285)||(2357646-2357898)
chr2 (32-285)||(2371677-2371919)
chr2 (21-285)||(11123884-11124147)
chr2 (21-285)||(4049745-4049998)
chr2 (97-287)||(39429694-39429882)
chr2 (97-287)||(39429575-39429765)
chr2 (21-189)||(21866632-21866800)
chr2 (61-285)||(33965049-33965266)
chr2 (96-287)||(8105755-8105947)
chr2 (97-287)||(41568134-41568329)
chr2 (104-285)||(14286825-14286995)
chr2 (21-155)||(8105717-8105851)
chr2 (85-191)||(33965209-33965315)
chr2 (97-287)||(2371567-2371746)
chr2 (61-287)||(17977088-17977298)
chr2 (97-287)||(1221880-1222072)
chr2 (21-133)||(8114000-8114112)
chr2 (79-191)||(31546710-31546822)
chr2 (61-183)||(2371552-2371673)
chr2 (61-191)||(2379727-2379856)
chr2 (97-287)||(14286715-14286894)
chr2 (74-287)||(17977160-17977358)
chr2 (61-287)||(20115555-20115783)
chr2 (61-191)||(14286728-14286857)
chr2 (216-287)||(2371783-2371854)
chr2 (216-287)||(14287131-14287202)
chr2 (143-285)||(6036563-6036692)
chr2 (97-191)||(8105876-8105970)
chr2 (97-191)||(26479393-26479487)
chr2 (62-191)||(4049931-4050059)
chr2 (97-272)||(20115554-20115719)
chr2 (99-188)||(30786686-30786775)
chr2 (104-191)||(2357921-2358008)
chr2 (61-188)||(2357951-2358077)
chr2 (104-191)||(26479203-26479290)
chr2 (216-287)||(26479524-26479595)
chr2 (216-287)||(33965232-33965303)
chr2 (216-287)||(39429930-39430001)
chr2 (61-191)||(2371616-2371745)
chr2 (97-191)||(6036623-6036717)
chr2 (61-191)||(11123787-11123916)
chr2 (97-287)||(31546733-31546916)
chr2 (97-287)||(33964921-33965117)
chr2 (124-283)||(12243004-12243155)
chr2 (61-189)||(4049966-4050093)
chr2 (61-197)||(6036624-6036759)
chr2 (219-287)||(11124000-11124068)
chr2 (104-191)||(1221857-1221944)
chr2 (216-287)||(1222109-1222180)
chr2 (65-183)||(6036761-6036876)
chr2 (61-188)||(14286695-14286821)
chr2 (216-287)||(20115446-20115517)
chr2 (216-287)||(21866653-21866724)
chr2 (61-188)||(31546677-31546803)
chr2 (216-287)||(31546953-31547024)
chr2 (61-283)||(2379582-2379784)
chr2 (61-191)||(14286764-14286893)
chr2 (61-171)||(17977085-17977194)
chr2 (97-191)||(19390134-19390228)
chr2 (79-188)||(26479170-26479279)
chr2 (97-287)||(2357829-2358021)
chr2 (79-191)||(2357932-2358044)
chr2 (79-191)||(11123823-11123935)
chr2 (223-287)||(26479226-26479290)
chr2 (216-287)||(2357722-2357793)
chr2 (216-287)||(11979096-11979167)
chr2 (61-188)||(21866597-21866723)
chr2 (61-191)||(2371580-2371709)
chr2 (99-272)||(4049931-4050093)
chr2 (61-191)||(33965173-33965302)
chr2 (97-171)||(41568131-41568205)
chr2 (90-191)||(2379763-2379864)
chr2 (61-189)||(1221944-1222071)
chr2 (61-181)||(11123761-11123880)
chr2 (104-188)||(20115719-20115803)
chr2 (61-287)||(31546697-31546915)
chr2 (216-287)||(2379750-2379821)
chr2 (97-195)||(14286993-14287094)
chr2 (61-188)||(2371479-2371601)
chr2 (97-191)||(11979204-11979298)
chr2 (79-188)||(1221824-1221933)
chr2 (205-285)||(2379824-2379898)
chr2 (216-285)||(4049965-4050034)
chr2 (216-277)||(11979240-11979301)
chr2 (61-191)||(19390073-19390191)
chr2 (215-287)||(19390157-19390229)
chr2 (61-189)||(26479359-26479486)
chr2 (126-280)||(2379721-2379864)
chr2 (124-191)||(2380000-2380067)
chr2 (216-287)||(26479190-26479261)
chr2 (104-171)||(33964918-33964985)
chr2 (61-159)||(2379723-2379820)
chr2 (85-250)||(17977357-17977519)
chr2 (104-190)||(19390038-19390124)
chr2 (61-159)||(19390130-19390227)
chr2 (105-191)||(39429552-39429638)
chr2 (216-285)||(2379788-2379857)
chr2 (216-285)||(11123812-11123881)
chr2 (216-285)||(11123848-11123917)
chr2 (89-158)||(11979232-11979301)
chr2 (65-284)||(19389933-19390126)
chr2 (205-285)||(19390195-19390269)
chr2 (61-153)||(2357830-2357921)
chr2 (223-287)||(6036666-6036730)
chr2 (61-191)||(6036696-6036814)
chr2 (118-277)||(11123784-11123932)
chr2 (216-272)||(26479359-26479415)
chr2 (216-287)||(1221844-1221915)
chr2 (216-287)||(4050001-4050072)
chr2 (218-284)||(12243156-12243220)
chr2 (124-191)||(19390371-19390438)
chr2 (85-159)||(19390367-19390441)
chr2 (138-191)||(2379467-2379520)
chr2 (124-189)||(2380102-2380167)
chr2 (219-287)||(4049824-4049890)
chr2 (85-161)||(2379994-2380070)
chr2 (216-287)||(6036792-6036861)
chr2 (61-191)||(17977485-17977603)
chr2 (216-280)||(17977540-17977604)
chr2 (216-280)||(19390128-19390192)
chr2 (216-280)||(19390365-19390429)
chr2 (216-287)||(2357986-2358057)
chr2 (223-285)||(2379518-2379578)
chr2 (216-287)||(21866617-21866688)
chr2 (218-285)||(26479382-26479449)
chr2 (216-278)||(2379996-2380058)
chr2 (85-159)||(2380096-2380170)
chr2 (223-285)||(4050093-4050155)
chr2 (223-285)||(6036763-6036825)
chr2 (85-159)||(17977542-17977616)
chr2 (223-285)||(19390062-19390124)
chr2 (223-284)||(2379457-2379518)
chr2 (88-153)||(4050113-4050178)
chr2 (85-158)||(12243001-12243074)
chr2 (216-285)||(12243013-12243082)
chr2 (126-191)||(19390170-19390235)
chr2 (61-153)||(33964985-33965081)
chr2 (216-285)||(33965198-33965267)
chr2 (216-280)||(2380094-2380158)
chr2 (216-276)||(6036695-6036755)
chr2 (61-153)||(11123753-11123844)
chr2 (61-133)||(12243014-12243085)
chr2 (66-285)||(14286789-14286996)
chr2 (244-287)||(2380023-2380066)
chr2 (61-171)||(6036793-6036900)
chr2 (232-287)||(6036842-6036897)
chr2 (232-274)||(14286997-14287039)
chr2 (104-189)||(4050093-4050178)
chr2 (232-273)||(6036522-6036563)
chr2 (223-264)||(11123712-11123753)
chr2 (231-272)||(26479290-26479331)
chr2 (216-272)||(4050122-4050178)
chr2 (216-272)||(11123753-11123809)
chr2 (96-191)||(21866666-21866762)
chr2 (216-280)||(39429901-39429965)
chr2 (244-287)||(2380123-2380166)
chr2 (61-191)||(4050002-4050144)
chr2 (244-287)||(6034673-6034716)
chr2 (244-287)||(12243005-12243048)
chr2 (90-191)||(12243117-12243210)
chr2 (244-287)||(19390394-19390437)
chr2 (216-287)||(2371535-2371602)
chr2 (216-266)||(17977457-17977507)
chr2 (223-285)||(17977474-17977536)
chr2 (143-191)||(2379529-2379575)
chr2 (85-130)||(6034669-6034714)
chr2 (216-253)||(8114076-8114113)
chr2 (99-171)||(19389927-19389997)
chr2 (61-191)||(19390307-19390428)
chr2 (65-129)||(2379457-2379520)
chr2 (251-287)||(17977569-17977605)
chr2 (124-195)||(19390266-19390338)
chr2 (244-287)||(2371499-2371542)
chr2 (104-171)||(2379451-2379518)
chr2 (85-155)||(2379899-2379970)
chr2 (99-165)||(12243156-12243220)
chr2 (216-274)||(19390270-19390329)
chr2 (216-263)||(39429563-39429610)
chr2 (61-116)||(39429674-39429728)
chr2 (257-287)||(2379490-2379520)
chr2 (257-287)||(6036761-6036791)
chr2 (257-287)||(19390096-19390126)
chr2 (61-122)||(2379997-2380057)
chr2 (225-274)||(6036562-6036611)
chr2 (104-141)||(11123716-11123753)
chr2 (79-152)||(20115730-20115803)
chr2 (112-153)||(26479290-26479331)
chr2 (124-195)||(2379895-2379967)
chr2 (248-287)||(11979055-11979095)
chr2 (244-276)||(19390305-19390337)
chr2 (89-141)||(39429566-39429618)
[»] chr6 (210 HSPs)
chr6 (21-287)||(29516974-29517240)
chr6 (21-285)||(29863498-29863751)
chr6 (21-285)||(8063098-8063351)
chr6 (21-285)||(34475452-34475705)
chr6 (61-287)||(17595318-17595543)
chr6 (21-285)||(742422-742674)
chr6 (21-287)||(33490101-33490356)
chr6 (97-287)||(17595206-17595389)
chr6 (65-285)||(4170000-4170214)
chr6 (21-287)||(17595437-17595687)
chr6 (65-285)||(4210729-4210943)
chr6 (105-285)||(4170303-4170478)
chr6 (90-283)||(33130617-33130802)
chr6 (21-147)||(18676400-18676526)
chr6 (61-287)||(34475902-34476129)
chr6 (61-285)||(34475830-34476042)
chr6 (89-287)||(8063310-8063510)
chr6 (105-266)||(4211032-4211188)
chr6 (64-241)||(8660348-8660519)
chr6 (97-287)||(28470127-28470319)
chr6 (61-191)||(34476095-34476224)
chr6 (61-285)||(29881106-29881312)
chr6 (203-287)||(28470114-28470198)
chr6 (88-286)||(32938083-32938273)
chr6 (104-283)||(5545893-5546064)
chr6 (89-285)||(34475785-34475970)
chr6 (104-282)||(28470255-28470418)
chr6 (88-287)||(34475748-34475936)
chr6 (216-287)||(8063174-8063245)
chr6 (89-191)||(34476231-34476333)
chr6 (97-272)||(8063282-8063446)
chr6 (104-191)||(10790997-10791084)
chr6 (216-287)||(29863604-29863675)
chr6 (61-287)||(34475794-34476008)
chr6 (97-191)||(4170409-4170503)
chr6 (85-166)||(4169921-4170002)
chr6 (216-285)||(4169933-4170002)
chr6 (85-166)||(4210650-4210731)
chr6 (216-285)||(4210662-4210731)
chr6 (94-191)||(8660305-8660402)
chr6 (97-189)||(34475636-34475728)
chr6 (216-287)||(742527-742598)
chr6 (104-191)||(34476065-34476152)
chr6 (97-183)||(4170145-4170231)
chr6 (61-191)||(8660309-8660438)
chr6 (105-191)||(29517177-29517263)
chr6 (62-188)||(33490251-33490376)
chr6 (79-188)||(10791008-10791117)
chr6 (85-190)||(29881221-29881325)
chr6 (104-188)||(742279-742363)
chr6 (223-287)||(10790997-10791061)
chr6 (104-287)||(742299-742484)
chr6 (104-191)||(8063446-8063533)
chr6 (61-190)||(8933345-8933466)
chr6 (216-287)||(34475528-34475599)
chr6 (97-183)||(4210874-4210960)
chr6 (79-188)||(8063457-8063566)
chr6 (61-153)||(742363-742454)
chr6 (61-287)||(8063319-8063546)
chr6 (97-181)||(29863483-29863567)
chr6 (61-287)||(34476131-34476346)
chr6 (203-266)||(29863160-29863223)
chr6 (104-191)||(34475728-34475815)
chr6 (61-171)||(4170410-4170519)
chr6 (65-171)||(32937918-32938022)
chr6 (105-273)||(29881221-29881373)
chr6 (205-285)||(33130762-33130836)
chr6 (61-189)||(28470128-28470255)
chr6 (216-284)||(32937924-32937991)
chr6 (79-191)||(34476076-34476188)
chr6 (61-191)||(4170234-4170353)
chr6 (216-287)||(8660308-8660379)
chr6 (205-287)||(8933432-8933508)
chr6 (216-287)||(10791026-10791097)
chr6 (100-171)||(17595203-17595274)
chr6 (216-287)||(29517205-29517276)
chr6 (216-287)||(33130724-33130795)
chr6 (216-287)||(34476130-34476201)
chr6 (216-266)||(18676400-18676450)
chr6 (61-158)||(4210761-4210857)
chr6 (65-158)||(5545891-5545983)
chr6 (61-158)||(33130698-33130794)
chr6 (61-188)||(4210963-4211079)
chr6 (135-191)||(4210964-4211020)
chr6 (223-287)||(8707767-8707830)
chr6 (61-141)||(12712806-12712885)
chr6 (79-158)||(4170313-4170392)
chr6 (216-287)||(4170445-4170516)
chr6 (79-158)||(4211042-4211121)
chr6 (132-191)||(5545885-5545944)
chr6 (124-191)||(8933610-8933677)
chr6 (124-191)||(33130938-33131005)
chr6 (85-159)||(8933606-8933680)
chr6 (223-281)||(28470040-28470098)
chr6 (21-83)||(28913890-28913952)
chr6 (223-281)||(29863239-29863297)
chr6 (121-191)||(32938206-32938276)
chr6 (61-158)||(4170032-4170128)
chr6 (216-285)||(5545922-5545991)
chr6 (138-191)||(5546153-5546206)
chr6 (238-287)||(8669218-8669267)
chr6 (138-191)||(33130476-33130529)
chr6 (216-285)||(33130690-33130759)
chr6 (216-285)||(34476094-34476163)
chr6 (216-284)||(4170233-4170301)
chr6 (216-284)||(4210962-4211030)
chr6 (223-287)||(8660351-8660415)
chr6 (216-280)||(8933604-8933668)
chr6 (104-179)||(28470040-28470116)
chr6 (124-188)||(28913585-28913649)
chr6 (61-169)||(29517170-29517277)
chr6 (104-179)||(29863221-29863297)
chr6 (61-133)||(33130687-33130758)
chr6 (61-153)||(34475637-34475728)
chr6 (216-272)||(34475672-34475728)
chr6 (218-284)||(8933240-8933304)
chr6 (96-179)||(12712804-12712887)
chr6 (125-188)||(18676115-18676178)
chr6 (104-191)||(32937934-32938020)
chr6 (223-285)||(33130553-33130613)
chr6 (223-285)||(5545893-5545955)
chr6 (126-188)||(8933412-8933474)
chr6 (85-155)||(33130938-33131008)
chr6 (223-284)||(5546155-5546216)
chr6 (61-158)||(8660381-8660477)
chr6 (216-285)||(29881245-29881313)
chr6 (138-191)||(32937969-32938022)
chr6 (223-284)||(33130466-33130527)
chr6 (61-170)||(34476240-34476348)
chr6 (119-171)||(8669218-8669270)
chr6 (228-272)||(10790953-10790997)
chr6 (216-264)||(29863483-29863531)
chr6 (61-141)||(29863487-29863566)
chr6 (216-280)||(33130932-33130996)
chr6 (223-287)||(34475728-34475792)
chr6 (216-287)||(12712815-12712886)
chr6 (244-287)||(18676135-18676178)
chr6 (244-287)||(28913605-28913648)
chr6 (79-158)||(32938167-32938246)
chr6 (79-189)||(742363-742473)
chr6 (97-147)||(4211138-4211188)
chr6 (97-147)||(29863160-29863210)
chr6 (224-285)||(4211032-4211093)
chr6 (216-277)||(4211060-4211121)
chr6 (216-285)||(8660380-8660449)
chr6 (216-273)||(8933345-8933402)
chr6 (61-191)||(4170332-4170467)
chr6 (61-125)||(4210797-4210860)
chr6 (61-133)||(5545923-5545994)
chr6 (218-285)||(5546065-5546129)
chr6 (245-281)||(8933307-8933343)
chr6 (62-125)||(4170069-4170131)
chr6 (252-287)||(4170233-4170268)
chr6 (252-287)||(4210962-4210997)
chr6 (218-277)||(8660418-8660477)
chr6 (104-171)||(8707767-8707833)
chr6 (244-287)||(8933633-8933676)
chr6 (203-274)||(9576314-9576384)
chr6 (223-285)||(32938020-32938080)
chr6 (244-287)||(33130961-33131004)
chr6 (216-266)||(4210910-4210960)
chr6 (251-285)||(8660307-8660341)
chr6 (223-277)||(32937966-32938020)
chr6 (79-152)||(742279-742352)
chr6 (92-165)||(4170228-4170301)
chr6 (92-165)||(4210957-4211030)
chr6 (244-285)||(8933369-8933410)
chr6 (61-191)||(8933546-8933667)
chr6 (244-285)||(29881280-29881321)
chr6 (143-191)||(33130564-33130610)
chr6 (65-129)||(5546153-5546216)
chr6 (97-191)||(8933380-8933467)
chr6 (215-271)||(8933412-8933468)
chr6 (124-195)||(8933505-8933577)
chr6 (109-153)||(10790953-10790997)
chr6 (135-191)||(12712828-12712884)
chr6 (96-183)||(18676400-18676488)
chr6 (88-152)||(28913585-28913649)
chr6 (61-133)||(32938156-32938227)
chr6 (65-129)||(33130466-33130529)
chr6 (124-191)||(4169924-4169991)
chr6 (124-191)||(4210653-4210720)
chr6 (90-191)||(5546026-5546118)
chr6 (104-171)||(5546155-5546222)
chr6 (216-274)||(8933509-8933568)
chr6 (203-238)||(11590913-11590948)
chr6 (89-152)||(18676115-18676178)
chr6 (203-238)||(25143933-25143968)
chr6 (244-287)||(32938229-32938272)
chr6 (104-171)||(33130460-33130527)
chr6 (85-155)||(33130837-33130908)
chr6 (216-266)||(4170181-4170231)
chr6 (257-287)||(5545891-5545921)
chr6 (257-287)||(5546153-5546183)
chr6 (216-262)||(12712804-12712850)
chr6 (257-287)||(32937992-32938022)
chr6 (257-287)||(33130499-33130529)
chr6 (131-188)||(33130877-33130937)
chr6 (99-171)||(8933234-8933304)
chr6 (135-191)||(8933250-8933304)
chr6 (255-284)||(8944706-8944735)
chr6 (210-263)||(12712752-12712805)
chr6 (135-191)||(18676428-18676485)
chr6 (97-158)||(28470355-28470413)
chr6 (85-125)||(4211084-4211124)
chr6 (257-285)||(5546127-5546155)
chr6 (244-276)||(8933544-8933576)
chr6 (159-191)||(32938031-32938063)
chr6 (257-285)||(33130527-33130555)
chr6 (124-195)||(33130833-33130905)
[»] scaffold0041 (11 HSPs)
scaffold0041 (21-273)||(105283-105524)
scaffold0041 (85-277)||(105100-105281)
scaffold0041 (61-191)||(104995-105124)
scaffold0041 (61-188)||(104962-105088)
scaffold0041 (97-287)||(104982-105161)
scaffold0041 (216-287)||(105377-105448)
scaffold0041 (61-191)||(105031-105160)
scaffold0041 (216-287)||(105198-105269)
scaffold0041 (97-191)||(105247-105340)
scaffold0041 (61-285)||(105056-105268)
scaffold0041 (216-280)||(105348-105412)
[»] scaffold0057 (15 HSPs)
scaffold0057 (61-287)||(42123-42337)
scaffold0057 (61-188)||(42103-42229)
scaffold0057 (79-277)||(42169-42356)
scaffold0057 (214-285)||(42455-42526)
scaffold0057 (118-191)||(42373-42446)
scaffold0057 (216-285)||(42362-42431)
scaffold0057 (233-285)||(42305-42357)
scaffold0057 (233-285)||(42398-42450)
scaffold0057 (97-173)||(42448-42524)
scaffold0057 (79-173)||(42355-42449)
scaffold0057 (216-285)||(42269-42338)
scaffold0057 (61-133)||(42452-42523)
scaffold0057 (143-191)||(42466-42514)
scaffold0057 (216-256)||(42355-42395)
scaffold0057 (216-256)||(42448-42488)
[»] scaffold0189 (40 HSPs)
scaffold0189 (61-285)||(26671-26895)
scaffold0189 (61-191)||(26802-26931)
scaffold0189 (61-191)||(27075-27204)
scaffold0189 (61-191)||(27348-27477)
scaffold0189 (90-285)||(26755-26939)
scaffold0189 (90-191)||(27111-27212)
scaffold0189 (90-191)||(27384-27485)
scaffold0189 (216-287)||(26825-26896)
scaffold0189 (216-287)||(27098-27169)
scaffold0189 (216-287)||(27371-27442)
scaffold0189 (205-285)||(27172-27246)
scaffold0189 (205-285)||(27445-27519)
scaffold0189 (124-285)||(26899-27042)
scaffold0189 (216-285)||(27136-27205)
scaffold0189 (216-285)||(27409-27478)
scaffold0189 (126-280)||(27069-27212)
scaffold0189 (126-280)||(27342-27485)
scaffold0189 (124-191)||(27621-27688)
scaffold0189 (61-159)||(27071-27168)
scaffold0189 (61-159)||(27344-27441)
scaffold0189 (85-159)||(27617-27691)
scaffold0189 (138-191)||(26594-26647)
scaffold0189 (216-280)||(27615-27679)
scaffold0189 (61-284)||(26584-26823)
scaffold0189 (104-171)||(26578-26645)
scaffold0189 (244-287)||(27644-27687)
scaffold0189 (61-191)||(27011-27132)
scaffold0189 (61-191)||(27284-27405)
scaffold0189 (61-191)||(27557-27678)
scaffold0189 (124-195)||(27243-27315)
scaffold0189 (124-195)||(27516-27588)
scaffold0189 (85-155)||(26974-27045)
scaffold0189 (85-155)||(27247-27318)
scaffold0189 (216-274)||(27247-27306)
scaffold0189 (85-155)||(27520-27591)
scaffold0189 (216-274)||(27520-27579)
scaffold0189 (257-287)||(26617-26647)
scaffold0189 (257-285)||(26645-26673)
scaffold0189 (244-276)||(27282-27314)
scaffold0189 (244-276)||(27555-27587)
[»] scaffold1360 (4 HSPs)
scaffold1360 (203-287)||(600-684)
scaffold1360 (97-191)||(577-671)
scaffold1360 (23-86)||(697-760)
scaffold1360 (216-274)||(577-635)
[»] scaffold0081 (11 HSPs)
scaffold0081 (61-287)||(11783-11997)
scaffold0081 (79-191)||(11764-11876)
scaffold0081 (102-190)||(11931-12019)
scaffold0081 (203-285)||(11733-11815)
scaffold0081 (203-278)||(11479-11554)
scaffold0081 (62-122)||(11494-11553)
scaffold0081 (216-287)||(11782-11853)
scaffold0081 (99-161)||(11494-11556)
scaffold0081 (62-116)||(11964-12017)
scaffold0081 (143-191)||(11502-11550)
scaffold0081 (171-238)||(11408-11478)
[»] scaffold0237 (3 HSPs)
scaffold0237 (224-273)||(15-64)
scaffold0237 (105-154)||(15-64)
scaffold0237 (143-190)||(15-62)
[»] scaffold0548 (1 HSPs)
scaffold0548 (156-191)||(8734-8769)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 334)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44233844 - 44233578
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44233844 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 44233745  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44233744 tacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggtt 44233645  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44233644 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 44233578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31760529 - 31760263
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31760529 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttaaatttaggttagtgtaaattcagtttact 31760430  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31760429 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggtt 31760330  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31760329 agtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 31760263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48542370 - 48542104
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  48542370 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagttttcgtatgttcaatttaagttagtgtaaattcagtttacc 48542271  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  48542270 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatatagtatgtatataaaaggtt 48542171  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48542170 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48542104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15475798 - 15475545
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15475798 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 15475699  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  15475698 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 15475610  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475609 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 15475545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 30361463 - 30361718
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30361463 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 30361562  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  30361563 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 30361651  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30361652 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 30361718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44054635 - 44054380
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44054635 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 44054536  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  44054535 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 44054447  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44054446 agtgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatggaaattaagtttacttatgttcaattt 44054380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4489961 - 4489683
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttac------------gtatgttcaatttaggttagtgtaa 108  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| ||||||    
T  4489961 tgtatgtatataaaaatggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacattcaaatttacgtatgttcaatttaggttggtgtaa 4489862  T
Q  109 attcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgt 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4489861 attcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgt 4489762  T
Q  209 atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4489761 atataagaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaattt 4489683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28226161 - 28225908
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28226161 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 28226062  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||||||    
T  28226061 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------ttatgtatacaagaggtt 28225973  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28225972 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 28225908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28068647 - 28068392
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28068647 tgtatgtatataaaagaggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 28068548  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  28068547 tacattcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttaca-----------tatgtatataagaggtt 28068459  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28068458 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Original strand, 3047070 - 3047308
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3047070 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3047169  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  3047170 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 3047258  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagt 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3047259 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 3047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46234170 - 46233917
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46234170 tgtatgtatataaaagtggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 46234071  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  46234070 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 46233982  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46233981 attgtaaattcagtttacttacgttaaatctagattaatgtaaattaagtttacttatattcaat 46233917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37093967 - 37093737
Alignment:
Q  44 tgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaa 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  37093967 tgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgta 37093868  T
Q  144 aattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttaca 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  37093867 aattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtcagtgtaaattcaatttacttacg 37093779  T
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093778 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 37093737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 15907547 - 15907798
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15907547 tgtatgtatatacaagtgattagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 15907646  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  15907647 tacgttcaatttaggttaatataaattaagtttagttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 15907735  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15907736 agtgtaaattcagtttacttatgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttca 15907798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37093612 - 37093399
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  37093612 ggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttaaattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 37093513  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37093512 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 37093424  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37093423 taaattaagtttacttatgttcaat 37093399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44054451 - 44054261
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44054451 aggttagtgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatggaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatg 44054352  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44054351 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 44054261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 49457150 - 49457402
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49457150 tgtatgtatataaaaaaggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttattgtaaattcagtttact 49457249  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||              |||||||||||||||    
T  49457250 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgaaaatttagtttac--------------tgtatataagaggtt 49457335  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49457336 agtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 49457402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29033483 - 29033228
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29033483 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacg-atgttcaatttaggttagtgtaaattcaatttact 29033385  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt-aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggt 219  Q
    ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  29033384 tatattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggt 29033296  T
Q  220 tagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29033295 tagtgtaaattcagttttcttatttaaaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29033228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26769994 - 26769770
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  26769994 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttat- 26769897  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26769896 ttcaatttatgttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 26769797  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26769796 taaattaagtttacttacgttcaattt 26769770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 8895920 - 8896188
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8895920 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8896019  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataa 214  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || |    
T  8896020 tacattcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta 8896119  T
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     || |   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896120 -agtt---tgtaaattcagtttacttccgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8896188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26770071 - 26769901
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26770071 tgtatgtatataaaagggattagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 26769972  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26769971 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 26769901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 6979210 - 6979380
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6979210 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagattaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 6979309  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6979310 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 6979380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31760334 - 31760151
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  31760334 aggttagtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 31760242  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31760241 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31760151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 30361759 - 30361940
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||| ||    
T  30361759 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacatatg 30361851  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30361852 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 30361940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 30361647 - 30361830
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||| ||    
T  30361647 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacatatg 30361739  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30361740 tataacgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 30361830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 49457331 - 49457514
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  49457331 aggttagtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 49457423  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49457424 tatatagtatgtatataagaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 49457514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43106357 - 43106190
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43106357 tgtatgtatataaaagaggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 43106258  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43106257 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 43106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45502108 - 45501894
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  45502108 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaaagtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaagttca 45502010  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45502009 atataggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 45501915  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45501914 ttaagtttacttatgttcaat 45501894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26769841 - 26769650
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt--acatg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||  || |  || |     
T  26769841 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttatt-tagtttacgtatgtacgta 26769743  T
Q  195 tgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26769742 tgtatatagtatgtatataagaggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26769650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3994685 - 3994515
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3994685 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcattttaatgtatcttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3994586  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3994585 tacattcaatttaggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 3994515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 3770812 - 3771065
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3770812 tgtatgtatataaaaggggttaatgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagcttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3770911  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |  |    |||||| |||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||    
T  3770912 tacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggtt 3771000  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3771001 aatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 3771065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4489754 - 4489571
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||       || ||||||| | ||    
T  4489754 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatttaggtta-------ttaagtttacgtatg 4489662  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4489661 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttgtgttcaattt 4489571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24179967 - 24179794
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||         
T  24179967 aggttagtgtaaattcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcagtttaggttaatgtaaatttagtttac----- 24179879  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179878 ------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24179794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 35720016 - 35720226
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  35720016 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 35720114  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35720115 ttcaatctaggttaatgtaattttagtttacatgt-------------atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 35720201  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  35720202 taatttaagtttacttatgttcaat 35720226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44233649 - 44233475
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||                | | ||    
T  44233649 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttatgtta----------------cgtatg 44233566  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44233565 tatatagtatgtatataagaggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 44233475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11335468 - 11335296
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         
T  11335468 aggttagtgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac----- 11335374  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11335373 ------gtatgtatacaagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttc-----atgttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 11335296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11493488 - 11493316
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         
T  11493488 aggttagtgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac----- 11493394  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11493393 ------gtatgtatacaagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttc-----atgttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 11493316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17580710 - 17580554
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcag------ 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  17580710 tgtatgtatataaaacgggttagtgtagtttacgcatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttttca 17580611  T
Q  115 -ttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttag 170  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17580610 atttactaacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttag 17580554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Original strand, 18605547 - 18605744
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18605547 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaagttaatgt 18605646  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    ||||| |||||||           ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  18605647 aaattaagtttac-----------gtatgtatataagagattagtgtgaattcagtctacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagcttacctat 18605735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37093678 - 37093505
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattta-gtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||               
T  37093678 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcaagtttac----------- 37093590  T
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||  |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093589 gtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttaaattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37093505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15475614 - 15475422
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  15475614 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 15475515  T
Q  197 t---atata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || || ||   |||| |  | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475514 ttcaatctaggttaatataaattaagtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15475422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45502223 - 45502117
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45502223 tatgttcaatttaggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattt 45502124  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  45502123 agtttac 45502117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52469251 - 52468996
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  52469251 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacg 52469152  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    || ||  |    | || | || ||||| ||||||||||  ||| || ||| |||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||    
T  52469151 tatgtatataagaggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcgatctagattaatgtaaattaagtttacttacgttca----atct-------aggtt 52469063  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52469062 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 52468996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24180216 - 24180087
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  24180216 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 24180118  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180117 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 24180087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25729734 - 25729630
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25729734 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 25729635  T
Q  179 aaatt 183  Q
    |||||    
T  25729634 aaatt 25729630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37093806 - 37093614
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  37093806 aggtcagtgtaaattcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 37093707  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093706 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37093614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11335327 - 11335150
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  11335327 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 11335228  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     |        || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11335227 ca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaattt 11335150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11493347 - 11493170
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  11493347 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 11493248  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     |        || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11493247 ca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaattt 11493170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 35719967 - 35720073
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  35719967 tatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatta 35720066  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  35720067 agtttac 35720073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 35719980 - 35720109
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  35719980 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 35720078  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35720079 tttaatttaggttaatgtaaatttagtttac 35720109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 35720194 - 35720322
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  35720194 ggttaatgtaattt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaa-ttaatgtaaattaagtttacttatg 35720291  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35720292 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 35720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24180077 - 24179906
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  24180077 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 24179980  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179979 tctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 24179906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 47534470 - 47534598
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  47534470 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 47534568  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47534569 ttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 47534598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 3770961 - 3771188
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  3770961 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 3771059  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | ||  || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  3771060 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 3771159  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3771160 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3771188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 3771118 - 3771244
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||     
T  3771118 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatg 3771216  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3771217 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 3771244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11335256 - 11335130
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  11335256 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 11335158  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11335157 tttaatttacgttaatgtaaatttagtt 11335130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11493276 - 11493150
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  11493276 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 11493178  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11493177 tttaatttacgttaatgtaaatttagtt 11493150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28068463 - 28068372
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28068463 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 28068372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28225763 - 28225637
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  28225763 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaactttacttatg 28225665  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28225664 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 28225637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37093914 - 37093843
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093914 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37093843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43106281 - 43106210
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43106281 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 43106210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46234094 - 46234023
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46234094 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46234023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11335292 - 11335163
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  11335292 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaca 11335194  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11335193 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11335163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11493312 - 11493183
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  11493312 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaca 11493214  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11493213 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11493183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37093468 - 37093374
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37093468 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 37093374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45501926 - 45501817
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  45501926 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttattgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 45501828  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  45501827 ttcaatttagg 45501817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 3047255 - 3047486
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagt----tcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttact 156  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3047255 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttact 3047353  T
Q  157 tatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatc 250  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |  ||   || |||    ||||| || | || |||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  3047354 tatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agttta---taaattcagtttacttacgttcaatc 3047449  T
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047450 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3047486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11335327 - 11335199
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11335327 gttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 11335229  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11335228 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 11335199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11335470 - 11335397
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11335470 agaggttagtgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11335397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11493347 - 11493219
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11493347 gttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 11493249  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11493248 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 11493219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11493490 - 11493417
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11493490 agaggttagtgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11493417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52469100 - 52468976
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  52469100 ttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 52469002  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52469001 caatttacgttaatgtaaatttagtt 52468976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17925987 - 17925820
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  17925987 taggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac---- 17925892  T
Q  196 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
           || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17925891 -------gtgtgtatataaaaggttagtgtcaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 17925820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28225976 - 28225849
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  28225976 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaactttacttatg 28225878  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28225877 ttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 28225849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 35720157 - 35720335
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  35720157 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaatttaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 35720256  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |        |  || |||    ||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35720257 t--------tcaatctaa----ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaattt 35720335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 3047146 - 3047217
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047146 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3047217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 6979286 - 6979357
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6979286 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 6979357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 6979287 - 6979413
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  6979287 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatc 6979385  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6979386 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 6979413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15475486 - 15475399
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15475486 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 15475399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15475722 - 15475651
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475722 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15475651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Original strand, 18605428 - 18605598
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||           |    
T  18605428 tgtaaattcagtttacctatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatattaaatttaggttaacgtaaattaagtttac-----------g 18605516  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18605517 tatgtttataagaggttagtgtgaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaat 18605598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25729800 - 25729609
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25729800 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattc 25729701  T
Q  185 agtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25729700 agtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattacgtttacttatgtttaa 25729612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26769995 - 26769924
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26769995 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26769924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28226085 - 28226014
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28226085 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28226014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45501963 - 45501869
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  45501963 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttattgtaaattcagtttac 45501869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 3416632 - 3416799
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||          
T  3416632 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgt------ 3416725  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416726 tcaatatataaaaggttattgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 3416799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 25829247 - 25829418
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  | ||     
T  25829247 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--tttaa 25829344  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25829345 tctagatataagaggtttgtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaactaaatttacttatgttca 25829418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44054332 - 44054239
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44054332 aggttagtgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaatttaattta 44054239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46233846 - 46233761
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46233846 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 46233761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Original strand, 3047424 - 3047508
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3047424 taaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttta 3047508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17925778 - 17925613
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  17925778 aggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgt- 17925680  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
               ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17925679 -----------tatataagatgttagtgtcaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 17925613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Original strand, 3771099 - 3771210
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3771099 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 3771198  T
Q  179 aaatttagttta 190  Q
    ||||| ||||||    
T  3771199 aaattaagttta 3771210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3994609 - 3994538
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3994609 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaattt 3994538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28225977 - 28225787
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  28225977 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaactttacttatg 28225878  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttag--tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |  |   || ||  ||   |  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28225877 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatcttggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaat 28225787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45501891 - 45501820
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45501891 aggttattgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45501820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45502211 - 45502140
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45502211 aggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45502140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 30361871 - 30361965
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30361871 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 30361965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 40360135 - 40360229
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40360135 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40360229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Original strand, 46675271 - 46675442
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |      
T  46675271 gttaatgtaaattcagtttagttatgttcaatcta-----atgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacg-- 46675363  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |  | | |  |||||| |||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675364 ttcaatctagatataaaaggttattgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 46675442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 47534469 - 47534563
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534469 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 47534563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46233986 - 46233893
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46233986 aggttattgtaaattcagtttacttacgttaaatctagattaatgtaaattaagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaattcagttta 46233893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 8896124 - 8896208
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8896124 tgtaaattcagtttacttccgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 8896208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46233846 - 46233782
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46233846 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46233782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37093648 - 37093518
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattc-agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||     
T  37093648 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttaa 37093550  T
Q  160 attcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37093549 attcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 37093518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Original strand, 3047312 - 3047522
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  3047312 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttacgttcaatctaggttaatgt 3047411  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||| |||||| |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3047412 aaattaagtttataaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttattt 3047511  T
Q  277 atgttcaattt 287  Q
    |||||||||||    
T  3047512 atgttcaattt 3047522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24179865 - 24179791
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24179865 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 24179791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25729787 - 25729658
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  25729787 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 25729689  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25729688 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 25729658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31760222 - 31760148
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31760222 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 31760148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37093799 - 37093678
Alignment:
Q  67 tgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  37093799 tgtaaattcaa-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 37093701  T
Q  167 ttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  37093700 ctaggttaatgtaaattaagttt 37093678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 39465005 - 39465171
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  39465005 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 39465102  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39465103 tctagatataagaggtttgtgtaaattcagttt-----------atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 39465171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 3047433 - 3047542
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  3047433 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttacgttaatgt 3047532  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  3047533 aaatttagtt 3047542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15475475 - 15475366
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  15475475 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaattt 15475376  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  15475375 aaatttagtt 15475366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24180224 - 24180123
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24180224 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 24180125  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  24180124 ac 24180123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 35719979 - 35720048
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719979 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 35720048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Original strand, 3047254 - 3047423
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaat----taagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttaca 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  3047254 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttact 3047353  T
Q  193 tgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    | |||  |    || |       |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047354 tatgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 3047423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3994581 - 3994485
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattta 185  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3994581 ttcaatttaggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaattta 3994485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15475613 - 15475386
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  15475613 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 15475515  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  15475514 ttcaatctaggttaatataaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 15475415  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475414 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15475386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28225782 - 28225678
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  28225782 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 28225683  T
Q  179 aaatt 183  Q
    |||||    
T  28225682 aaatt 28225678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 30361914 - 30361978
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361914 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30361978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11335360 - 11335186
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  11335360 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttca-----tgttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 11335266  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    ||||       |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11335265 ttca----atgt-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaattt 11335186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11493380 - 11493206
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  11493380 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttca-----tgttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 11493286  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    ||||       |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11493285 ttca----atgt-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaattt 11493206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 15907623 - 15907694
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15907623 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatataaattaagtttagttatgttcaattt 15907694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24180181 - 24180110
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24180181 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 24180110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28225728 - 28225657
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28225728 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaactttacttatgttcaattt 28225657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17925985 - 17925892
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  17925985 ggttaatgtaaattcag-tttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 17925892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26769721 - 26769647
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26769721 aggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 26769647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44233546 - 44233472
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44233546 aggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 44233472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45501962 - 45501833
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||      
T  45501962 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttattgtaaattcagtttacttacg 45501864  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45501863 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 45501833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46233816 - 46233698
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||        |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  46233816 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt--------ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 46233726  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46233725 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 46233698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24180258 - 24180184
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180258 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 24180184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 46675172 - 46675246
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675172 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 46675246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24180144 - 24180026
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  24180144 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 24180057  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180056 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 24180026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 30361872 - 30361979
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  30361872 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 30361970  T
Q  161 ttcaattta 169  Q
    |||||||||    
T  30361971 ttcaattta 30361979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37093467 - 37093340
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  37093467 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 37093369  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  37093368 tttaatctaggttaatgtaaattcagttt 37093340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 40360134 - 40360206
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40360134 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 40360206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 40360172 - 40360290
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  40360172 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 40360259  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40360260 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40360290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 47534468 - 47534540
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47534468 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 47534540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 49457443 - 49457515
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  49457443 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 49457515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24180224 - 24180081
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  24180224 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 24180136  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24180135 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 24180081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 35720015 - 35720086
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35720015 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaattt 35720086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17925520 - 17925414
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  17925520 taggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaggttactgtaaattaagtttacgtgt 17925421  T
Q  196 gtatata 202  Q
    |||||||    
T  17925420 gtatata 17925414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 18605529 - 18605623
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18605529 aggttagtgtgaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 18605623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24180180 - 24180083
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24180180 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 24180083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 25829171 - 25829237
Alignment:
Q  125 ttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829171 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 25829237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28225784 - 28225706
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28225784 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttac 28225706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 40360136 - 40360233
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40360136 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 40360233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Original strand, 40360239 - 40360325
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40360239 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 40360325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 3416630 - 3416722
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3416630 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 3416722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24180079 - 24179987
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  24180079 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 24179987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24180217 - 24180148
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24180217 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 24180148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 25829245 - 25829337
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  25829245 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 25829337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28225764 - 28225695
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28225764 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 28225695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 39465034 - 39465103
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39465034 aggttaatgtaaatttagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 39465103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 40360094 - 40360168
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40360094 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 40360168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 40360237 - 40360430
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |      ||    
T  40360237 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaat------ca 40360329  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||  |                 |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  40360330 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttga-----------------gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaa 40360410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 47534428 - 47534502
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534428 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 47534502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 47534505 - 47534574
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47534505 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 47534574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Original strand, 47534506 - 47534703
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |        
T  47534506 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaat---- 47534600  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |                 |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  47534601 --caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttga-----------------gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatg 47534679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 3770997 - 3771224
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt------- 153  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||           
T  3770997 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaatt 3771095  T
Q  154 ------acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattca 247  Q
          |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  3771096 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca--------attta---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 3771184  T
Q  248 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3771185 atttaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 3771224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 13556647 - 13556712
Alignment:
Q  217 ggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556647 ggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 13556712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 25829180 - 25829298
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  25829180 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactca-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 25829267  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829268 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 25829298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 39464938 - 39465056
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  39464938 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttagtttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 39465025  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39465026 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 39465056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48542175 - 48542103
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48542175 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 48542103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 3416624 - 3416683
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416624 tatgtcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3416683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3994573 - 3994502
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3994573 aggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3994502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 6979322 - 6979393
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6979322 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatcttcaattt 6979393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24180427 - 24180360
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180427 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 24180360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 25828935 - 25829002
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25828935 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 25829002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29033299 - 29033208
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29033299 aggttagtgtaaattcagttttcttatttaaaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 29033208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 46675003 - 46675070
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675003 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 46675070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 47534259 - 47534326
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534259 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 47534326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4489642 - 4489568
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  4489642 aggttagtgtaaattcagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttgtgttcaatttagg 4489568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 13556332 - 13556406
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  13556332 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacttat 13556406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 15907804 - 15907878
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15907804 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 15907878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17580614 - 17580556
Alignment:
Q  229 ttcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17580614 ttcaatttactaacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 17580556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17925518 - 17925425
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || |||| || |||||||||||||    
T  17925518 ggttaatgtaaattcag-tttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaggttactgtaaattaagtttac 17925425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 18605566 - 18605659
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  18605566 ggttaatgtaaattc-agtttacttatgctcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 18605659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 182
Target Start/End: Original strand, 18605676 - 18605758
Alignment:
Q  100 ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaat 182  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  18605676 ttagtgtgaattcagtctacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagcttacctatgttcaatttaggttagtgtaaat 18605758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24180430 - 24180356
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24180430 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 24180356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 35720230 - 35720338
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35720230 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaa-ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttata 35720327  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  35720328 ttcaatttagg 35720338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 46675000 - 46675074
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  46675000 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 46675074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 47534256 - 47534330
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  47534256 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 47534330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 3416661 - 3416730
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3416661 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 3416730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 3416863 - 3416916
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416863 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3416916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 287
Target Start/End: Original strand, 18605424 - 18605636
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||  || ||| || ||||| | ||||||||||||| ||| ||    
T  18605424 ttaatgtaaattcag-tttacctatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatattaaatttaggttaacgtaaattaagtttacgtatgtt 18605522  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgta 262  Q
     |    |||||| ||| |||||||||||| | |||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18605523 tataagaggttagtgtgaatttagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatctaggttaatgta 18605611  T
Q  263 aattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18605612 aattcagtttacttatgttcaattt 18605636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24180048 - 24179979
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24180048 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 24179979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28225784 - 28225731
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28225784 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 28225731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 39465003 - 39465095
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  39465003 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 39465095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45502175 - 45502106
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45502175 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 45502106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 3416800 - 3416865
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3416800 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 3416865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 15907822 - 15907878
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15907822 aggttaatgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 15907878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 188
Target Start/End: Original strand, 15910348 - 15910412
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15910348 gttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 15910412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24180418 - 24180354
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24180418 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 24180354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 40360171 - 40360235
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40360171 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 40360235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 46675012 - 46675076
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46675012 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 46675076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 46675443 - 46675508
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46675443 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 46675508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 190
Target Start/End: Original strand, 46675506 - 46675558
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675506 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 46675558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 47534268 - 47534332
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47534268 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 47534332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 3416555 - 3416622
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416555 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3416622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 13556335 - 13556402
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13556335 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttac 13556402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17925740 - 17925613
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat-ctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |  |||  ||   |||||| ||  |||| |||||||||||     
T  17925740 gttaatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgt--gttatataagatgttagtgtcaattcagtttacttatg 17925644  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17925643 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 17925613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17925986 - 17925915
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17925986 aggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 17925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Original strand, 25829419 - 25829483
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829419 gttaatgtaaattaagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 25829483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Original strand, 39465172 - 39465236
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39465172 gttaatgtaaatttagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 39465236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 40359925 - 40359992
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40359925 gttcaatttaagttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40359992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 3416552 - 3416626
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3416552 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 3416626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 3416632 - 3416694
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3416632 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 3416694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Original strand, 13556583 - 13556646
Alignment:
Q  213 aagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556583 aagaggtttgtgtaaattcagtttactta------atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 13556646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24180077 - 24180015
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24180077 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 24180015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Original strand, 25828932 - 25829002
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  25828932 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 25829002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Original strand, 25829155 - 25829214
Alignment:
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25829155 aaattaagtttact--cattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 25829214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 25829247 - 25829309
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25829247 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 25829309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 40360239 - 40360301
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40360239 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 40360301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46233943 - 46233881
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  46233943 tgtaaattaagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaat 46233881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 274
Target Start/End: Original strand, 49740257 - 49740319
Alignment:
Q  212 taagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49740257 taagatgttagtgtcaattcattttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 49740319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 3416865 - 3416926
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3416865 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 3416926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 8896144 - 8896249
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaa-----gtttacttatattcaatttaggttaatgtaaat 182  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||     |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  8896144 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttaagtttacttatgttccatttacgttaatgtaaat 8896243  T
Q  183 ttagtt 188  Q
    ||||||    
T  8896244 ttagtt 8896249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17925949 - 17925809
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |  ||  |    | |||| ||  |||| |||||||||||     
T  17925949 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtgtatataaaaggttagtgtcaatttagtttacttatg 17925851  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  17925850 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacatatttatata 17925809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 18605226 - 18605303
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18605226 gtatgtatatgagaggttagtgtaaattcagtttatgtttgttcaatttaggttaatgtaaattcagtgtacttatgt 18605303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37093432 - 37093371
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37093432 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 37093371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 39464934 - 39464995
Alignment:
Q  130 tctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39464934 tctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagtttaatgtaaatttagtttac 39464995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 40360128 - 40360193
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40360128 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 40360193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45501927 - 45501858
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  45501927 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttattgtaaattcagtttacttacgttcaat 45501858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 183
Target Start/End: Original strand, 46675206 - 46675263
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46675206 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 46675263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Original strand, 46675304 - 46675372
Alignment:
Q  64 taatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46675304 taatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 46675372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 47534462 - 47534527
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47534462 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 47534527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 50501369 - 50501422
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50501369 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 50501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 3416564 - 3416628
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3416564 aggttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 3416628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 13556344 - 13556408
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13556344 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacttatgt 13556408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 25828944 - 25829008
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25828944 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacctatgt 25829008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 25829179 - 25829243
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25829179 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactcatgt 25829243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37093431 - 37093292
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt------- 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||           
T  37093431 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttgtaaatt 37093333  T
Q  154 ------acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
          |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37093332 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 37093292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37093340 - 37093292
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37093340 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 37093292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37093396 - 37093340
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  37093396 aggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagttt 37093340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 39464937 - 39465001
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39464937 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagtttaatgtaaatttagtttacttatgt 39465001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43106319 - 43106223
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43106319 taggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 43106223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 3416761 - 3416854
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416761 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 3416852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 15910349 - 15910392
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15910349 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15910392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17925519 - 17925448
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17925519 aggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaattt 17925448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45502193 - 45502106
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  45502193 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 45502106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46233761 - 46233718
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46233761 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46233718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46233835 - 46233731
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  46233835 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt--------ttcaatttaggttaatgt 46233744  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  46233743 aaattaagtttac 46233731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 46675404 - 46675497
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675404 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 46675495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3994572 - 3994487
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  3994572 ggttaatgcaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatt 3994487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #244
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 25829138 - 25829201
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25829138 tcaatctatgttaatgcaaattaagtttact--cattcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 25829201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #245
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 39465005 - 39465067
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39465005 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaat 39465067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #246
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 40359922 - 40359996
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40359922 tatgttcaatttaagttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 40359996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #247
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 40359936 - 40359998
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40359936 gttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 40359998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #248
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 46675307 - 46675369
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  46675307 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 46675369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #249
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 277
Target Start/End: Original strand, 13556437 - 13556566
Alignment:
Q  130 tctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaa 228  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||    
T  13556437 tctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatgtaggttaatgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttagtgtaaa 13556523  T
Q  229 ttcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
     |||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13556524 ctcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 13556566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #250
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17925780 - 17925707
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  17925780 agaggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaattt 17925707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #251
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Original strand, 25829035 - 25829168
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||    
T  25829035 gttcaatctaggttaatgtaaatttaatttactttaccttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacatgt-------------atataagaggttag 25829121  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttact 275  Q
    |||||| |||||||||      |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25829122 tgtaaactcagtttac------tcaatctatgttaatgcaaattaagtttact 25829168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #252
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 25829419 - 25829473
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25829419 gttaatgtaaattaagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 25829473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #253
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 3047182 - 3047246
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3047182 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 3047246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #254
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 15907802 - 15907878
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15907802 agtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 15907878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #255
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24180047 - 24179976
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24180047 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 24179976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #256
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45502040 - 45501905
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt---tcaatct---atgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |  || |   | |||| || ||||| ||||||    
T  45502040 ggttaatgtaaattcag-tttacttaagttcaatataggttagtgtaaattcagtttacttacgtgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagttta 45501942  T
Q  155 cttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45501941 cttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 45501905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #257
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46233817 - 46233761
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46233817 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 46233761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #258
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 49740279 - 49740319
Alignment:
Q  151 tttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49740279 tttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 49740319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #259
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Original strand, 50501366 - 50501402
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50501366 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 50501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #260
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Original strand, 8896153 - 8896208
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8896153 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 8896208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #261
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 13556336 - 13556379
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556336 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 13556379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #262
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24180426 - 24180383
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180426 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24180383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #263
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 25828936 - 25828979
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25828936 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25828979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #264
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Original strand, 25829171 - 25829238
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttact 156  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  25829171 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact 25829238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #265
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28068427 - 28068372
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28068427 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 28068372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #266
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 46675004 - 46675047
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675004 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46675047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #267
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 47534260 - 47534303
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534260 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 47534303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #268
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 13556647 - 13556718
Alignment:
Q  98 ggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13556647 ggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 13556718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #269
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17925483 - 17925425
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17925483 aggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaggttactgtaaattaagtttac 17925425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #270
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 39464934 - 39464972
Alignment:
Q  249 tctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39464934 tctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 39464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #271
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 46675213 - 46675263
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46675213 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 46675263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #272
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Original strand, 3416662 - 3416730
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3416662 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 3416730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #273
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 13556648 - 13556702
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13556648 gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 13556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #274
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Original strand, 15907802 - 15907855
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15907802 agtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaactcagtttacttacgttcaat 15907855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #275
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 152
Target Start/End: Original strand, 15910347 - 15910412
Alignment:
Q  87 tgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  15910347 tgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 15910412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #276
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24180417 - 24180296
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  24180417 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 24180330  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24180329 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 24180296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #277
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Original strand, 35719971 - 35720012
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35719971 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 35720012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #278
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 39465172 - 39465226
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39465172 gttaatgtaaatttagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 39465226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #279
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 40360366 - 40360436
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40360366 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 40360436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #280
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44233648 - 44233572
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgtta 138  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  44233648 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttatgtta 44233572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #281
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46233947 - 46233879
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatct 132  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46233947 ttaatgtaaatt-aagtttacttatattcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatct 46233879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #282
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 46675013 - 46675134
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  46675013 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 46675100  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46675101 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 46675134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #283
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 46675271 - 46675335
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675271 gttaatgtaaattcagtttagttatgttcaatcta-----atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46675335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #284
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 3416863 - 3416926
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3416863 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 3416926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #285
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17925760 - 17925684
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  17925760 tttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac 17925684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #286
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24180327 - 24180255
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24180327 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 24180255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #287
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 39465035 - 39465106
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39465035 ggttaatgtaaatttag-tttacttatattcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 39465106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #288
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 40360025 - 40360097
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40360025 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 40360097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #289
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 46675103 - 46675175
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  46675103 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 46675175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #290
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 47534359 - 47534431
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47534359 gttcaatctaagttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 47534431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #291
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 3416556 - 3416599
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3416556 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttatttatgttcaattt 3416599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #292
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 3416865 - 3416932
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  3416865 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 3416932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #293
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Original strand, 6979358 - 6979413
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6979358 aggttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 6979413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #294
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 8896154 - 8896208
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8896154 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 8896208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #295
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11335431 - 11335377
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11335431 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 11335377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #296
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11493451 - 11493397
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11493451 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 11493397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #297
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24180330 - 24180259
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  24180330 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 24180259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #298
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24180318 - 24180259
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24180318 aggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 24180259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #299
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28068426 - 28068372
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28068426 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 28068372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #300
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28225692 - 28225637
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28225692 aggttaatgtaaattaactttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 28225637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #301
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 159
Target Start/End: Original strand, 39464936 - 39464999
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  39464936 taggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagtttaatgtaaatttagtttacttat 39464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #302
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 40360034 - 40360093
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40360034 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 40360093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #303
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Original strand, 46675100 - 46675171
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  46675100 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 46675171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #304
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 46675112 - 46675171
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  46675112 aggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 46675171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #305
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 3416630 - 3416660
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416630 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3416660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #306
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 3416863 - 3416893
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416863 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3416893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #307
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Original strand, 15907798 - 15907844
Alignment:
Q  145 attaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15907798 attaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaactcagtttac 15907844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #308
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Original strand, 18605153 - 18605225
Alignment:
Q  169 aggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatat---agtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18605153 aggttagtgtaaattcagtttacttatgtacatgaaagtatgtatatgagaggttagcgtaaattcagtttac 18605225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #309
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24180079 - 24180049
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180079 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24180049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #310
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 25829245 - 25829275
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829245 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25829275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #311
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 39465003 - 39465033
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39465003 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39465033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #312
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 40360237 - 40360267
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40360237 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 40360267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #313
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45502108 - 45502078
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45502108 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45502078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #314
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46233880 - 46233846
Alignment:
Q  238 cttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46233880 cttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 46233846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #315
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 46675506 - 46675536
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46675506 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #316
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Original strand, 46675508 - 46675558
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46675508 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 46675558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #317
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 253
Target Start/End: Original strand, 13556541 - 13556578
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctag 253  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13556541 aggttaatgtaaatttagtttacttacattcaatctag 13556578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #318
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 18605299 - 18605336
Alignment:
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18605299 tatgtatataagtggttagtgtaaatttagtttactta 18605336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #319
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Original strand, 25829003 - 25829066
Alignment:
Q  131 ctatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25829003 ctatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttaatttac 25829066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #320
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 25829419 - 25829489
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25829419 gttaatgtaaattaagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 25829489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #321
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Original strand, 30361760 - 30361828
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  30361760 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 30361828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #322
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Original strand, 46675214 - 46675266
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcag 114  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46675214 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcag 46675266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #323
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 47534269 - 47534390
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  47534269 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 47534356  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47534357 atgttcaatctaagttaatgtaaatttagtttac 47534390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #324
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Original strand, 47534370 - 47534427
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47534370 gttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 47534427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #325
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 47534639 - 47534709
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  47534639 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaacttagg 47534709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #326
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 3416800 - 3416865
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3416800 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 3416865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #327
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 110
Target Start/End: Original strand, 18605711 - 18605758
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaat 110  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18605711 gttaatgtaaatt-aagcttacctatgttcaatttaggttagtgtaaat 18605758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #328
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24180326 - 24180294
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24180326 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 24180294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #329
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29033268 - 29033208
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  29033268 aatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 29033208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #330
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 40359994 - 40360056
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40359994 tatgtcaatgtaaattaagtttatttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 40360056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #331
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 40360026 - 40360058
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40360026 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 40360058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #332
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46233843 - 46233795
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46233843 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 46233795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #333
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 46675104 - 46675136
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46675104 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 46675136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #334
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 46675443 - 46675508
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  46675443 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 46675508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 221)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26416115 - 26415850
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26416115 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagattaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 26416016  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26416015 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 26415916  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26415915 agtgtaaattcagtttactaac-ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 26415850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 482973 - 482718
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  482973 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 482874  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  482873 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 482785  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482784 agtataaattaagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 482718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30699830 - 30699577
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30699830 tgtatgtgtataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 30699731  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  30699730 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 30699642  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30699641 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 30699577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 12986968 - 12987221
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12986968 tgtatgtatataaaagggattagtgtagtttacgtatctaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 12987067  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  12987068 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 12987156  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12987157 agtgtaaattcagtttccttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 12987221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 20187780 - 20188035
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20187780 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattaaagtttacgtatgttgaatttaggttattgtaaattcagtttact 20187879  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  20187880 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 20187968  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20187969 agtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 20188035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719607 - 27719832
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  27719607 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaaatttacttatg 27719705  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27719706 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgtttaatctagattaatg 27719805  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27719806 taaattaagtttatttacgttcaattt 27719832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25487037 - 25486826
Alignment:
Q  31 taaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25487037 taaaaggggtcagtgtagtttacgtatgtcggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaat 25486938  T
Q  131 ctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaatt 230  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25486937 ctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtataaatt 25486838  T
Q  231 cagtttacttac 242  Q
    || |||||||||    
T  25486837 caatttacttac 25486826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 20819298 - 20819522
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  20819298 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 20819396  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20819397 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattc-gtttacttacgttcaatctaggttaatg 20819495  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20819496 taaattaagtttacttacgttcaattt 20819522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35393337 - 35393083
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaa-ttcagttcac 119  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  35393337 tgtatgtatataaaacgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacctatgttcaatttaaattagtgtaaaattcagtttac 35393238  T
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||||    
T  35393237 ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttac-----------gtatgtatataagaggt 35393149  T
Q  220 tagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35393148 tagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 35393083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 20206849 - 20207104
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  20206849 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattaaagtttacgtatgttgaatttagattaatgtaaattcagtttact 20206948  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  20206949 tacattaaatatagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 20207037  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20207038 agtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 20207104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719873 - 27720063
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27719873 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtg 27719972  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27719973 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttattaacgttcaattt 27720063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 32137979 - 32138160
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagta 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32137979 taaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagta 32138078  T
Q  206 tgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32138079 tgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 32138160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 27719422 - 27719592
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27719422 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 27719521  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27719522 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 27719592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 20819221 - 20819391
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20819221 tgtatgtatataaaaagggttagtgtagtttacgtatgtaggctaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 20819320  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20819321 tacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 20819391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 8352833 - 8353047
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  8352833 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttca 8352931  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8352932 atctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttccttacgttcaatctaggttaatgtaaa 8353026  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8353027 ttaagtttacttatgttcaat 8353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719761 - 27719944
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  27719761 aggttagtgtaaattcagtttacttacgtttaatctagattaatgtaaattaagtttatttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 27719853  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719854 tatatagtatgtatataagaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27719944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719992 - 27720175
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||       |||||||||  | ||    
T  27719992 aggttagtgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttattaacgttcaatttaggtta-------tttagtttaagtatg 27720084  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27720085 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27720175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 31097814 - 31097976
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31097814 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaagt-----ttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 31097908  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31097909 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 31097976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 32138089 - 32138284
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaat--gtaaattta-gtttacat 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||  |  || || || |     
T  32138089 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttatttagtttacgtatgtatatag 32138188  T
Q  194 gt--gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32138189 gtatgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 32138284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24757603 - 24757364
Alignment:
Q  37 gggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgt 136  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24757603 gggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtctgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggt 24757504  T
Q  137 taatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagttt 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||| |    
T  24757503 taatgtaaattcagtttacttacgttcaatcttggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtat 24757415  T
Q  237 acttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24757414 acttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24757364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 11020737 - 11020943
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  11020737 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaatttagtttacttacgttca 11020835  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11020836 atttaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttagtgtaaattcaggttagttacgttcaatctaggttaatgtaaa 11020922  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11020923 ttaagtttacttatgttcaat 11020943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 36781960 - 36782213
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  36781960 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact 36782059  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||  |    || |||       | |    
T  36782060 tacgttcaatctaggttaatg--tattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttca----atctat-------gat 36782146  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36782147 aatgtaaattcagtttacttatgttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 36782213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 30655309 - 30655447
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30655309 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 30655408  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  30655409 tacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttat 30655447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26415920 - 26415745
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  26415920 aggttagtgtaaattcagtttactaac-ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 26415829  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26415828 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaatttagtttgcttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgt 26415745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1104358 - 1104144
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  1104358 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 1104260  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  1104259 ttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac-----------gtatgtatataagagattagtgtgaattcagtctacgtacgttcaatctatgttaatg 1104171  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1104170 taaattaagtttacctatgttcaattt 1104144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 39780582 - 39780792
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||     
T  39780582 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatg 39780680  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39780681 ttcaatctaggttaatgtaattttagtttacatgt-------------atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 39780767  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39780768 taaattaagtttacttatgttcaat 39780792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 285
Target Start/End: Original strand, 8352636 - 8352835
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  8352636 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatta 8352735  T
Q  185 agtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||| | ||| |  | |||||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8352736 agtttacttatgt-tcaattatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaacgtaaatttagtttacttatgttcaa 8352834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 266
Target Start/End: Original strand, 33411430 - 33411612
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  33411430 tttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgt 33411529  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    ||||| ||||||| | |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33411530 aaattcagtttacttatgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 33411612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 39780796 - 39781005
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  39780796 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctag-ttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttaca 39780893  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||             |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39780894 ttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgtatatat-------------gaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatg 39780980  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39780981 taaattaagtttacttatgttcaat 39781005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 27719535 - 27719664
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  27719535 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 27719633  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27719634 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 27719664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 33411302 - 33411408
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33411302 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattt 33411401  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  33411402 agtttac 33411408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 33411615 - 33411839
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa-tctat-----gttaatgaaaattaagttta 154  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||     |||| || ||||| ||||||    
T  33411615 ggttaatgtaaattcag-tttacttaagttcaatataggttagtgtaaattcagtttacttacgtgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagttta 33411713  T
Q  155 cttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33411714 cttacgtttaatctaggttaatttaaattaagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 33411808  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411809 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33411839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 11020911 - 11021125
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  11020911 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 11021009  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||    
T  11021010 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagcttaatg 11021098  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11021099 taaattaagtttacttatgttcaattt 11021125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 12987189 - 12987416
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  12987189 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactaacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 12987287  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12987288 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 12987383  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12987384 ttaatgtaaattaagtttatttatgatcaattt 12987416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35393151 - 35392937
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  35393151 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttagg 35393053  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35393052 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatg 35392964  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35392963 taaattaagtttacttatgttcaattt 35392937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35393152 - 35392973
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  35393152 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttagg 35393053  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35393052 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 35392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 20819452 - 20819623
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||         
T  20819452 aggttagtgtaaattc-gtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttac----- 20819538  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
          | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20819539 ------gcatgtatataagatgttagtgtaaattcagtttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 20819623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 39780569 - 39780675
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39780569 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattt 39780668  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  39780669 agtttac 39780675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 39780760 - 39780888
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  39780760 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaatttagtttacttatg 39780857  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39780858 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 39780888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 11020901 - 11021089
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  11020901 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 11021000  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| | |||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11021001 ttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11021089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 30656333 - 30656525
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  30656333 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 30656432  T
Q  197 t---atatagtatgtatataa--gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || ||| ||  || |||   | |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30656433 ttcaatctag-attaatgtaaattaagtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30656525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35393043 - 35392917
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  35393043 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 35392945  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35392944 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 35392917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 5458789 - 5458953
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    ||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||           
T  5458789 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac------- 5458881  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5458882 ----gtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 5458953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 30656282 - 30656402
Alignment:
Q  154 acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctag 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30656282 acttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagcttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatatag 30656370  T
Q  254 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30656371 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 30656402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 45084677 - 45084785
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084677 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 45084776  T
Q  189 tacatgtgt 197  Q
    ||| |||||    
T  45084777 tacttgtgt 45084785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719499 - 27719713
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  27719499 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 27719597  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27719598 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----attt-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatg 27719686  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27719687 taaattaaatttacttatgttcaattt 27719713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 29998130 - 29998331
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |    
T  29998130 gttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcaat 29998229  T
Q  188 ttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998230 ttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaacttcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 29998325  T
Q  282 caattt 287  Q
    ||||||    
T  29998326 caattt 29998331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30699754 - 30699683
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699754 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30699683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 20187965 - 20188192
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||      
T  20187965 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 20188063  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20188064 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacctacgttcaatctagg 20188159  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20188160 ttaatgtaaactaagtttacttatgttcaattt 20188192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 20207034 - 20207261
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||      
T  20207034 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 20207132  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20207133 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacctacgttcaatctagg 20207228  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20207229 ttaatgtaaactaagtttacttatgttcaattt 20207261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 33411770 - 33411864
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33411770 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 33411864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 39780723 - 39780817
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39780723 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 39780817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 272
Target Start/End: Original strand, 12987179 - 12987352
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  12987179 gttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactaacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 12987278  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||| | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12987279 ttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 12987352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 482789 - 482625
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  482789 aggttagtataaattaagtttacttgcgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttagg 482690  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  482689 ttca----attt-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 482625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 482762 - 482561
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  482762 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatttaggttaatgtaaattcagt 482663  T
Q  188 ttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  482662 ttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatataaattaagtttacttatgtt 482567  T
Q  282 caattt 287  Q
    ||||||    
T  482566 caattt 482561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 8353005 - 8353206
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8353005 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatctaggttaatgtaaattccgt 8353104  T
Q  188 ttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||| |  ||   || |||    ||||| || |   |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8353105 ttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaa--gtt--tgtaaattcagtttaattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 8353200  T
Q  282 caattt 287  Q
    ||||||    
T  8353201 caattt 8353206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 12987044 - 12987115
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12987044 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 12987115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24757470 - 24757344
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  24757470 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtatacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 24757372  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24757371 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 24757344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 27719498 - 27719569
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719498 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27719569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 31097885 - 31097956
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097885 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 32834768 - 32834855
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32834768 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 32834855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 33411807 - 33411916
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  33411807 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatg 33411905  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  33411906 ttcaatttagg 33411916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 36782037 - 36782249
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| || ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  36782037 ggttaatgtaaatttag-tttacttacgttcaatctaggttaatgta--ttcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatg 36782133  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| || | ||||||||||| ||||||| |           ||||  |    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36782134 ttcaatctatgataatgtaaattcagtttactt-----------atgttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttagattaatg 36782222  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36782223 taaattaagtttacttatgttcaattt 36782249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 45084789 - 45084960
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  45084789 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 45084886  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  |||||| |||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084887 tctagatataaaaggttattgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 45084960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 482752 - 482625
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  482752 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 482654  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  482653 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 482625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 8352978 - 8353142
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |  |    
T  8352978 aggttagtgtaaattcagtttccttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttaag 8353077  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8353078 ttca----atct-------aggttaatgtaaattccgtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8353142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 20187964 - 20188128
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |    
T  20187964 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 20188063  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20188064 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 20188128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 20207033 - 20207197
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |    
T  20207033 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 20207132  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20207133 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 20207197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 29998140 - 29998267
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||      
T  29998140 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcaatttacttacg 29998238  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29998239 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 29998267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30699491 - 30699407
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30699491 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 30699407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Original strand, 36782146 - 36782269
Alignment:
Q  64 taatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattc 163  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36782146 taatgtaaattcag-tttacttatgttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttc 36782244  T
Q  164 aatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  36782245 aatttacattaatgtaaatttagtt 36782269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 33411314 - 33411385
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411314 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33411385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30699646 - 30699552
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30699646 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 30699552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 11020874 - 11020967
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11020874 aggttagtgtaaattcaggttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttta 11020967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 30656472 - 30656581
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  30656472 tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacattaatgt 30656571  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  30656572 aaatttagtt 30656581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 32834779 - 32834888
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32834779 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttacgttaatgt 32834878  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||| ||||||    
T  32834879 aaacttagtt 32834888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35393250 - 35393189
Alignment:
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393250 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35393189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1104377 - 1104265
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1104377 tttacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatctaggttaatgt 1104278  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  1104277 aaattcagtttac 1104265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 12987152 - 12987329
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||         
T  12987152 aggttagtgtaaattcagtttccttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac----- 12987246  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
      ||  || |  || |   |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12987247 --taacgt-tcaatct---aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 12987329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30699491 - 30699427
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699491 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30699427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 32834768 - 32834832
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32834768 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 32834832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 280
Target Start/End: Original strand, 33411352 - 33411548
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||          |||||||||||||||| |    
T  33411352 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatata----------aattaagtttacttatgt 33411440  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33411441 ttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgt 33411529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 482625 - 482538
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  482625 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 482538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25486971 - 25486900
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486971 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25486900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 29998267 - 29998354
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29998267 tgtaacttcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtgaattaagtttac 29998354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 30656461 - 30656548
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30656461 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 30656548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 33411842 - 33411913
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33411842 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 33411913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 27720104 - 27720178
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27720104 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 27720178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Original strand, 30655385 - 30655447
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30655385 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttat 30655447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 32138213 - 32138287
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32138213 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 32138287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098414 - 38098320
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098414 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 38098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 20819297 - 20819366
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20819297 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 20819366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 272
Target Start/End: Original strand, 29998126 - 29998267
Alignment:
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggt 219  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       ||||    
T  29998126 ttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atct-------aggt 29998214  T
Q  220 tagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998215 taatgtaaattcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 29998267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 8353015 - 8353142
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||      
T  8353015 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatctaggttaatgtaaattccgtttacttacg 8353113  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8353114 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8353142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 30656334 - 30656561
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  30656334 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 30656432  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||    
T  30656433 ttcaatctagattaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaa 30656532  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30656533 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30656561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1104495 - 1104326
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||           |    
T  1104495 tgtaaattcagtttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgttaaatt-aggttaacgtaaattaagtttac-----------g 1104408  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1104407 tatgtttataagaggttagtgtgaatttagtttacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 1104326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 12987352 - 12987439
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12987352 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgatcaatttagattaatgtaaattaagtttac 12987439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 20188128 - 20188215
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20188128 tgtaaattcagtttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 20188215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 20207197 - 20207284
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20207197 tgtaaattcagtttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 20207284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 39780581 - 39780652
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39780581 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39780652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 45084685 - 45084756
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45084685 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 45084756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 286
Target Start/End: Original strand, 8352684 - 8352754
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352684 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 8352754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 8352767 - 8352961
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||          |||| |||||||||||||||||     
T  8352767 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaacgtaaatttagtttacttatgttc----------aatgtaaattaagtttacttatg 8352855  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8352856 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtg 8352944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 33411771 - 33411892
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  33411771 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 33411869  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  33411870 ttcaatctaggttaatgtaaatt 33411892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38098413 - 38098316
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  38098413 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 38098316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 482614 - 482505
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  482614 tttacttacgttcaatctagcttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 482515  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  482514 aaatttagtt 482505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 20188139 - 20188248
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20188139 tttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 20188238  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  20188239 aaatttagtt 20188248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 20207208 - 20207317
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20207208 tttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 20207307  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  20207308 aaatttagtt 20207317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30699603 - 30699542
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699603 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 30699542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 191
Target Start/End: Original strand, 45084961 - 45085051
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084961 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 45085051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1104212 - 1104129
Alignment:
Q  100 ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1104212 ttagtgtgaattcagtctacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacctatgttcaatttaggttagtgtaaatt 1104129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1104499 - 1104290
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||| || ||||| | ||||||||||||| ||| ||    
T  1104499 ttaatgtaaattcag-tttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgttaaat-taggttaacgtaaattaagtttacgtatgtt 1104402  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgta 262  Q
     |    |||||| ||| |||||||||||| | ||| ||        || ||   ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1104401 tataagaggttagtgtgaatttagtttacttatgttta--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgta 1104313  T
Q  263 aattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  1104312 aattcagtttacttatgctcaat 1104290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38098455 - 38098379
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098455 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 38098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 39780936 - 39781019
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  39780936 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctagattagtgtaa 39781019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 8352649 - 8352754
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8352649 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 8352747  T
Q  161 ttcaatt 167  Q
    |||||||    
T  8352748 ttcaatt 8352754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 11021019 - 11021128
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||     
T  11021019 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagcttaatgtaaattaagtttacttatg 11021117  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  11021118 ttcaatttagg 11021128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 33411449 - 33411546
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  33411449 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttat 33411546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1104701 - 1104624
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1104701 gtatgtatatgagaagttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgt 1104624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 12987363 - 12987472
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12987363 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgatcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 12987462  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  12987463 aaatttagtt 12987472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 39780795 - 39780863
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39780795 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 39780863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 45084787 - 45084879
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45084787 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 45084879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 5458825 - 5458964
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  5458825 gttaatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgt 5458923  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  5458924 tcaatttaggttaatgtaaattaagtttacatatatatata 5458964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 11020672 - 11020790
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  11020672 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 11020759  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020760 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 11020790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 12987225 - 12987452
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || |||||  | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  12987225 ggttaatgtaaatt-aagtttactaacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg 12987323  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| |||||| |||   ||||| ||| ||||    
T  12987324 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgatcaatttagattaa 12987423  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12987424 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 12987452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 20819554 - 20819626
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20819554 gttagtgtaaattcagtttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttagg 20819626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098377 - 38098259
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||| ||||     
T  38098377 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttatttatg 38098290  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098289 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 38098259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38098415 - 38098343
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38098415 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 38098343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Original strand, 45084686 - 45084781
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  45084686 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactt 45084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 45084722 - 45084840
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||            ||| |||| |||||||||||||||||     
T  45084722 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttg-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 45084809  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084810 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 45084840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 5458579 - 5458745
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| |||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||         
T  5458579 aggttaatgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttatgttaatgtaaattaagtttac----- 5458673  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
          || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  5458674 ------gtgtgtatataagatgttagtgtcgattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagattac 5458745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 8353142 - 8353209
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8353142 tgtaaattcagtttaattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 8353209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 11020662 - 11020729
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020662 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 11020729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 32834797 - 32834868
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32834797 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaattt 32834868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38098183 - 38098119
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098183 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 38098119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098649 - 38098582
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098649 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 38098582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 482587 - 482525
Alignment:
Q  225 taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482587 taaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 482525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 11020659 - 11020733
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11020659 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 11020733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38098652 - 38098578
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  38098652 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 38098578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 45084961 - 45085028
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45084961 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 45085028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30699540 - 30699491
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699540 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 30699491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 33411448 - 33411517
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33411448 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 33411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 33411806 - 33411875
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33411806 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 33411875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098421 - 38098356
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38098421 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 38098356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 39780759 - 39780828
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39780759 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 39780828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 45084464 - 45084572
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat----ctatgttaatgaaaattaagtttac---ttatattcaatttaggttaatgtaaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||     ||||| |||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||    
T  45084464 tcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttacttatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaat 45084563  T
Q  183 ttagtttac 191  Q
    |||||||||    
T  45084564 ttagtttac 45084572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 45084818 - 45084887
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45084818 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 45084887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 11020671 - 11020735
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11020671 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 11020735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30699645 - 30699542
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  30699645 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 30699547  T
Q  161 ttcaa 165  Q
    |||||    
T  30699546 ttcaa 30699542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38098378 - 38098314
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38098378 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 38098314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38098640 - 38098576
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38098640 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 38098576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 45084993 - 45085061
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45084993 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 45085061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 11020768 - 11020839
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11020768 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaatttagtttacttacgttcaattt 11020839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 20188157 - 20188228
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20188157 aggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20188228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 20207226 - 20207297
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20207226 aggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20207297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 33411352 - 33411419
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33411352 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 33411419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098293 - 38098193
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||      || ||||| ||||||||||||||||     
T  38098293 tatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctacgttaatgtaaatttagtt------taatcaatctaggttaatgtaaatta 38098200  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  38098199 agtttac 38098193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38098310 - 38098224
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38098310 tgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctacgttaatgtaaatttagttta 38098224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 45084651 - 45084718
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084651 aggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 45084718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 45084789 - 45084851
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084789 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 45084851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 29997802 - 29997855
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaatt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29997802 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatt 29997855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 29998278 - 29998382
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||     ||||||||| ||||||||    
T  29998278 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtgaattaagtttac-----ttcaatttacgttaatgt 29998372  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  29998373 aaatttagtt 29998382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 170
Target Start/End: Original strand, 45084985 - 45085066
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttag 170  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  45084985 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttag 45085066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 287
Target Start/End: Original strand, 29998126 - 29998174
Alignment:
Q  239 ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998126 ttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29998174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Original strand, 30655347 - 30655443
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30655347 taggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttac 30655443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 32137988 - 32138064
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  32137988 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 32138064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 32834712 - 32834768
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32834712 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattaagttt 32834768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Original strand, 45084541 - 45084677
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||             ||||||||||||||||||    
T  45084541 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttag 45084627  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45084628 tgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttat 45084677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 45084721 - 45084781
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45084721 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactt 45084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1104495 - 1104432
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1104495 tgtaaattcagtttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgttaaatt 1104432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 8352758 - 8352801
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352758 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8352801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 5458580 - 5458673
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5458580 ggttaatgtaaatttag-tttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttatgttaatgtaaattaagtttac 5458673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38098310 - 38098248
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38098310 tgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 38098248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 45084644 - 45084707
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45084644 tcaatctaggttaatgcaaattaagtttact--tattcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 45084707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30699540 - 30699491
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30699540 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 30699491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 32834707 - 32834768
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32834707 aatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattaagttt 32834768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 33411315 - 33411419
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  33411315 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 33411413  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  33411414 ttcaat 33411419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 33411614 - 33411675
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33411614 aggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatataggttagtgtaaattcagtttactta 33411675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1104686 - 1104627
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1104686 gttagtgtaaattcag-tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttactta 1104627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 29998296 - 29998356
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29998296 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtgaattaagtttactt 29998356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 33411421 - 33411481
Alignment:
Q  225 taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33411421 taaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 33411481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38098222 - 38098186
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098222 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 38098186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 45084819 - 45084890
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45084819 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 45084890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1104678 - 1104619
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1104678 aaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgtatata 1104619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 11020663 - 11020706
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020663 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11020706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38098648 - 38098605
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098648 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 38098605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 45084464 - 45084506
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084464 tcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45084506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 1104177 - 1104129
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaatt 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1104177 gttaatgtaaatt-aagtttacctatgttcaatttaggttagtgtaaatt 1104129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Original strand, 5458577 - 5458650
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  5458577 agaggttaatgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaattt 5458650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 5458789 - 5458858
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  5458789 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaattt 5458858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098183 - 38098129
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38098183 gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 38098129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38098281 - 38098224
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38098281 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctacgttaatgtaaatttagttta 38098224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Original strand, 39780573 - 39780614
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39780573 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaat 39780614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1104686 - 1104626
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1104686 gttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttat 1104626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 5458805 - 5458881
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  5458805 tttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac 5458881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Original strand, 8352901 - 8352964
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    |||||||||||||| |  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8352901 ggttaatgtaaatttag-tttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt 8352964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38098524 - 38098452
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38098524 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 38098452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38098555 - 38098493
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38098555 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 38098493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 39780937 - 39781008
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  39780937 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatcta 39781008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 129
Target Start/End: Original strand, 45084994 - 45085061
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  45084994 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 45085061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 18575540 - 18575575
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18575540 gtatgtatataagaggttagtgtaaactcagtttac 18575575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 27719910 - 27719964
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27719910 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 27719964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 31097876 - 31097943
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31097876 gttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 31097943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 36782179 - 36782269
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||    
T  36782179 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacattaatgtaaatttagtt 36782269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38098183 - 38098119
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38098183 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 38098119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38098515 - 38098456
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38098515 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 38098456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Original strand, 45084538 - 45084609
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  45084538 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 45084609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 5458825 - 5458887
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5458825 gttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgt 5458887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 8352833 - 8352863
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352833 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8352863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 11020737 - 11020767
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020737 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11020767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 189
Target Start/End: Original strand, 32834722 - 32834768
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  32834722 aaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattaagttt 32834768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 158
Target Start/End: Original strand, 33411609 - 33411675
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  33411609 aattcaggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatataggttagtgtaaattcagtttactta 33411675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 45084787 - 45084817
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084787 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45084817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25486979 - 25486938
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25486979 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaat 25486938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Original strand, 32138090 - 32138158
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  32138090 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 32138158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38098639 - 38098579
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  38098639 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 38098579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1104772 - 1104702
Alignment:
Q  171 gttaatgtaaatttagtttacatgtgtatat---agtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  1104772 gttagtgtaaatttagtttacttatgtacatgagagtatgtatatgagaggttagcgtaaattaagtttac 1104702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 287
Target Start/End: Original strand, 12987003 - 12987043
Alignment:
Q  248 atctaggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12987003 atctaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaattt 12987043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25486933 - 25486877
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  25486933 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttac 25486877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30699488 - 30699440
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30699488 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 30699440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 264
Target Start/End: Original strand, 32834833 - 32834881
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  32834833 aggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttacgttaatgtaaa 32834881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38098523 - 38098491
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38098523 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 38098491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 11)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5168 - 4902
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5168 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagggtaatgtaaattcaagtttacgtatattcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 5069  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5068 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatattgtatgtatataagaggtt 4969  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4968 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 4902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6263 - 6010
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6263 tgtatgtatataaaagggattagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 6164  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  6163 tatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaatttatgttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 6075  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6074 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4973 - 4790
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||       ||||||||||| | ||    
T  4973 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggtt-------atttagtttacgtatg 4881  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  4880 tatataatatatatataagatgttagtgtaaattcagtttatttaggttcaatctagattaatataaattaagtttagtttttttcaattt 4790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6078 - 5851
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  6078 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttacttatg 5980  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5979 ttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 5884  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5883 ttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 5851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6079 - 5915
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||         
T  6079 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttac----- 5985  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
           |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5984 ------ttatgttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6187 - 6116
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6187 aggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaattt 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5915 - 5827
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg-ttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5915 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttac 5827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5904 - 5794
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgtt-aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatg 177  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5904 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttacgttaatg 5805  T
Q  178 taaatttagtt 188  Q
    |||||||||||    
T  5804 taaatttagtt 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6042 - 5814
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| || |||  |||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||      
T  6042 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttacttatgttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacg 5944  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt-a 257  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||| |    
T  5943 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttta 5844  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5843 atgtaaattaagtttacttatcttcaattt 5814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5885 - 5794
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttagg-ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  5885 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4859 - 4788
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttag 170  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| || | ||||||||||    
T  4859 gttagtgtaaattcagtttatttaggttcaatctagattaatataaattaagtttagtttttttcaatttag 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 418)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3874349 - 3874083
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3874349 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagggtaatgtaaattcaagtttacgtatattcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3874250  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3874249 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatattgtatgtatataagaggtt 3874150  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874149 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 3874083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3931765 - 3931501
Alignment:
Q  23 tatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3931765 tatgtatataaacggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttactta 3931666  T
Q  123 cgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3931665 cgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatatagtatgtatataagaggttag 3931566  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3931565 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3931501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28867493 - 28867242
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28867493 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 28867394  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  28867393 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 28867305  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28867304 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 28867242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 45884867 - 45885120
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45884867 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 45884966  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  45884967 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 45885055  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45885056 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctgggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 45885120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 29923910 - 29924163
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29923910 tgtatgtgtataaaaggggttaatgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 29924009  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  29924010 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 29924098  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29924099 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 29924163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17445448 - 17445187
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17445448 tgtatgtatataaaagaggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttagattagtgtaaattcagtttact 17445349  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac--atgtgtatatagtatgtatataagagg 218  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||       |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  17445348 tacgtttaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtt-------atttagtttacgtatatgtatataatatgtatataagagg 17445256  T
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445255 ttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 17445187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36224912 - 36224657
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36224912 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 36224813  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||     |||| ||||||||    
T  36224812 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac----gtatata-----tataaaagaggtt 36224722  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36224721 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttaattacgttcaat 36224657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3875444 - 3875191
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875444 tgtatgtatataaaagggattagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3875345  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  3875344 tatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaatttatgttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 3875256  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3875255 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 3875191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 55282252 - 55282004
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55282252 tgtatgtatataaaatgagttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 55282153  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  55282152 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 55282064  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55282063 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacgtatgt 55282004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36432266 - 36432012
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36432266 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatttaaattcaagtctacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 36432167  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||||    
T  36432166 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatataaatttagtttac-----------ctatgtatataagaggtt 36432078  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36432077 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttacgttcaatt 36432012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 50621971 - 50622225
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgt-aaattcagttcac 119  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  50621971 tgtatgtatataaaacgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttagattagtgtaaaattcagtttac 50622070  T
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||||    
T  50622071 ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttac-----------gtatgtatataagaggt 50622159  T
Q  220 tagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50622160 tagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaat 50622225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24744767 - 24744509
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24744767 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 24744668  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat---tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagag 217  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  24744667 tacatttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcatcaatttaggtttatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagag 24744579  T
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744578 gtcaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24744509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39677480 - 39677230
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39677480 tgtatgtatataaaatgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttattgtaaattcagtttact 39677381  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||    
T  39677380 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac--------------tgtatataagaggtt 39677295  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39677294 agtgtaaattcagtttacttgtgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 39677230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3931443 - 3931256
Alignment:
Q  100 ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  3931443 ttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtacattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtat 3931344  T
Q  200 atagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3931343 atagtatgtatataagaggctagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 45885245 - 45885457
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  45885245 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 45885343  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45885344 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 45885432  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  45885433 taaattcagtttacttacgttcaat 45885457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3931572 - 3931375
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaat-------ttagttt 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  3931572 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatagtaaatttagttt 3931473  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3931472 acgtatgtatatagtatttatataagagattagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtacattaagtttacttatgttcaattt 3931375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7327267 - 7327106
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||   |    
T  7327267 tgtaaattcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac----gtat---g 7327175  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327174 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7327106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 22169444 - 22169650
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  22169444 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttca 22169542  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22169543 atttaggttagtgtaaattcagtttacatgt-------------atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 22169629  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22169630 ttaagtttacttatgttcaat 22169650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28573543 - 28573363
Alignment:
Q  98 ggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          
T  28573543 ggttagtgtaaattcagtttatttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac------ 28573450  T
Q  198 atatagtatgtatataagaggttagtg----taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
         |||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573449 -----gtatgtatataagaggttggtgtaattaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 28573363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33961166 - 33960974
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  33961166 tcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatctaggtcagtgtaaattcagttt 33961067  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    || |    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33961066 actt----acat-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33960974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41764469 - 41764305
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41764469 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaagttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 41764370  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||    
T  41764369 tacgttcaatttaggttaatataaattaagtttacttatgttca----aggttaatgtaaattaagttt 41764305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28573297 - 28573117
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28573297 tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 28573198  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagt 270  Q
    | |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28573197 agatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 28573117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7554219 - 7554087
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7554219 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatttaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttact 7554120  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7554119 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7554087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7553867 - 7553683
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7553867 tttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 7553768  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt--aaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7553767 aaatttagtttaca-----------tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtagaaattaagttt 7553683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48868650 - 48868511
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48868650 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 48868562  T
Q  235 ttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48868561 ttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttagttatgttcaat 48868511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11381695 - 11381494
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  11381695 ggttaatgtaaattcag-tttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 11381597  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||           || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  11381596 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac-----------gtgtgtatataagaggttagtgtcaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatg 11381508  T
Q  261 taaattaagtttac 274  Q
    ||||||||||||||    
T  11381507 taaattaagtttac 11381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3874154 - 3873971
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||       ||||||||||| | ||    
T  3874154 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggtt-------atttagtttacgtatg 3874062  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  3874061 tatataatatatatataagatgttagtgtaaattcagtttatttaggttcaatctagattaatataaattaagtttagtttttttcaattt 3873971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33961315 - 33961090
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  33961315 ggttaatgtaaattcag-tttacttaaattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 33961217  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatat--agtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| |    |    || ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33961216 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacaaatgtaaattaagtttactcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaa 33961117  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||    
T  33961116 tgtaaattcagtttacttaagttcaat 33961090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48874100 - 48873980
Alignment:
Q  69 taaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattt 168  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48874100 taaattcaagtttac-tatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48874002  T
Q  169 aggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48874001 aggttaatgtaaatttagttta 48873980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11005233 - 11005020
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  11005233 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 11005135  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  11005134 ttcaatctagattaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggtttgtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 11005043  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11005042 taaattaagtttacttatgttca 11005020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36224726 - 36224547
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  36224726 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttaattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 36224627  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |        || ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36224626 ttca--------attta---ggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36224547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33961485 - 33961356
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  33961485 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 33961387  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33961386 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 33961356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55281995 - 55281768
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  55281995 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 55281897  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55281896 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttaccttcaatctagg 55281801  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281800 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 55281768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 22169581 - 22169759
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22169581 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 22169680  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    || ||        |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22169681 ttca----atcta--------gttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 22169759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36224653 - 36224527
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  36224653 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 36224555  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36224554 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 36224527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 50622156 - 50622335
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  50622156 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttagg 50622255  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    || |       |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50622256 ttca----atct-------aggttaatgtagattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 50622335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 20492760 - 20492866
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20492760 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatta 20492859  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  20492860 agtttac 20492866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33961632 - 33961526
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33961632 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaattt 33961533  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  33961532 agtttac 33961526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 55282139 - 55281927
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | |||| || ||||| ||||||||||      
T  55282139 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacg 55282041  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55282040 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 55281952  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  55281951 taaattcagtttacttacgttcaat 55281927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Original strand, 45885389 - 45885592
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      
T  45885389 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacg 45885487  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || ||  |||   |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45885488 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atctaattaa---gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatg 45885580  T
Q  261 taaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||    
T  45885581 taaattaagttt 45885592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3875259 - 3875032
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  3875259 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttacttatg 3875161  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3875160 ttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 3875065  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3875064 ttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 3875032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28867309 - 28867117
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  28867309 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcattctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 28867210  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28867209 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 28867117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 45885052 - 45885279
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  45885052 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctgggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatg 45885150  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45885151 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacatacgttcaatctagg 45885246  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885247 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45885279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49331749 - 49331620
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  49331749 ggttaatgtaaatt-aagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 49331651  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331650 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49331620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 50622229 - 50622358
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  50622229 ggttaatgtaaatt-aagtttacttaggttcaatctaggttaatgtagattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 50622327  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50622328 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 50622358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36308590 - 36308462
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  36308590 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 36308492  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36308491 ttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 36308462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7553993 - 7553878
Alignment:
Q  146 ttaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacatt 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7553993 ttaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcaatttacttacgtt 7553905  T
Q  246 caatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7553904 caatctaggttaatgtaaattaagttt 7553878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11005269 - 11005140
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  11005269 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 11005171  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005170 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 11005140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 56162944 - 56163072
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  56162944 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 56163042  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56163043 ttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 56163072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11005277 - 11005093
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005277 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 11005178  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    || | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11005177 acttatgttca----attt-------aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctagattaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 11005093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36308756 - 36308556
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| | |||  |    
T  36308756 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgtatata 36308658  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |   |||||| |||||||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  36308657 a--gaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaa 36308579  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36308578 ttaagtttacttatgttcaattt 36308556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24744573 - 24744486
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744573 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 24744486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28867417 - 28867346
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28867417 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28867346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 29923986 - 29924057
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29923986 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29924057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36224836 - 36224765
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36224836 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36224765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36432190 - 36432119
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36432190 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36432119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35949103 - 35949001
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35949103 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 35949004  T
Q  189 tac 191  Q
    |||    
T  35949003 tac 35949001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3875260 - 3875096
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||         
T  3875260 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttac----- 3875166  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
           |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875165 ------ttatgttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 3875096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 22169725 - 22169850
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22169725 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaat----gttaatgtaaattaagtttacttata 22169819  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22169820 ttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 22169850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 45885425 - 45885656
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  45885425 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 45885523  T
Q  161 ttcaat----ttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatc 250  Q
    ||||||    ||| ||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || |   |||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  45885524 ttcaatctaattaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaa--gtt--tttaaattcagtttacttacgttcaatc 45885619  T
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885620 tagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45885656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33961413 - 33961209
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||     
T  33961413 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatgta----------aattaagtttacttatg 33961325  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |    | ||   || ||       ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33961324 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactt----aaattcaatcta-------ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 33961236  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33961235 taaattaagtttacttatgttcaattt 33961209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33961583 - 33961379
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||     
T  33961583 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatgta----------aattaagtttacttatg 33961495  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33961494 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatg 33961406  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33961405 taaattaagtttacttatgttcaattt 33961379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 45885051 - 45885215
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  45885051 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctgggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatg 45885150  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885151 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 45885215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55281959 - 55281732
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  55281959 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 55281861  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt--acat---gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  | ||   || ||  ||   |  || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  55281860 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttaccttcaatcta---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggt 55281764  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281763 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 55281732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55281996 - 55281832
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  55281996 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 55281897  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281896 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 55281832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28573552 - 28573473
Alignment:
Q  208 tatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573552 tataaaaggggttagtgtaaattcagtttatttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28573473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39677404 - 39677333
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39677404 aggttattgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39677333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 45884943 - 45885014
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45884943 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 45885014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 50622157 - 50622371
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  50622157 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttagg 50622255  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  50622256 ttcaatctaggttaatgtagattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatg 50622344  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50622345 taaattaagtttacttatgttcaattt 50622371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55282176 - 55282105
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55282176 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 55282105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3931323 - 3931233
Alignment:
Q  101 tagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3931323 tagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 3931233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 11309507 - 11309669
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||           
T  11309507 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcattctacgttaatgtaaattcaatttac--atgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac------- 11309597  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11309598 ----gtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11309669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29933089 - 29932887
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  29933089 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 29933002  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |  | | |  |||||| |||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  29933001 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg--ttcaatctagatataaaaggttattgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 29932910  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29932909 taaattaagtttacttatgttca 29932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36224725 - 36224596
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  36224725 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttaattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 36224627  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36224626 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 36224596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Original strand, 26488612 - 26488763
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt 223  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||||||||| ||    
T  26488612 gttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggtttgt 26488709  T
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26488710 gtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 26488763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35948991 - 35948820
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  35948991 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 35948894  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  |||||| |||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948893 tctagatataaaaggttattgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 35948820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36308554 - 36308344
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat- 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||      
T  36308554 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttagttacg 36308456  T
Q  160 ---attcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt 256  Q
       ||||||| ||||||| |||   || | |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    
T  36308455 ttcattcaatctaggttagtgt---ttgaatttacatc----------atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttact------caatctaggtt 36308375  T
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36308374 aatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 36308344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36431918 - 36431809
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36431918 tttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 36431819  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  36431818 aaatttagtt 36431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 54202785 - 54202886
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202785 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 54202884  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  54202885 ac 54202886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 54202896 - 54203067
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| | ||| ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  54202896 tgtaaattaagtttatttatgttaaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 54202993  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202994 tctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 54203067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11381237 - 11381074
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    ||||||||||||| |||| || || |||||| ||| || |||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||           
T  11381237 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaagctacgtcaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac------- 11381145  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11381144 ----gtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttta 11381074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 29924186 - 29924270
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29924186 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 29924270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7327106 - 7327019
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7327106 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 7327019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7553683 - 7553596
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7553683 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 7553596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7553878 - 7553791
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7553878 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 7553791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 11309088 - 11309255
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  11309088 taggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt--atgt 11309185  T
Q  196 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |         |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11309186 g---------tgtatataaggggttagtgtcaattcagtttacttatgtttaatttaggttaacgtaaattaagtttac 11309255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 11309297 - 11309463
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||         
T  11309297 aggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac----- 11309391  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
          || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11309392 ------gtgtgtatataagatgttagtgtcaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaattttac 11309463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 20492772 - 20492843
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492772 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20492843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 22169654 - 22169863
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  22169654 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctag-ttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 22169751  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||         || | |  ||       |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  22169752 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac--------ttactttcaat-------gttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttagattaatg 22169836  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22169837 taaattaagtttacttatgttcaattt 22169863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28573279 - 28573208
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573279 aggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28573208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36431929 - 36431842
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36431929 tgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 36431842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Original strand, 45885594 - 45885681
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45885594 taaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacat 45885681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48874073 - 48874002
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48874073 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48874002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 50622265 - 50622391
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||| |||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  50622265 ggttaatgtagattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 50622363  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50622364 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 50622391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27767254 - 27767160
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767254 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27767160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29933134 - 29933032
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29933134 ttcaatctagattaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatt 29933035  T
Q  189 tac 191  Q
    |||    
T  29933034 tac 29933032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49331677 - 49331475
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  49331677 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 49331590  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||    
T  49331589 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcgatctaggttaatg 49331498  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  49331497 taaattaagtttacttatgttca 49331475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 56162943 - 56163037
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162943 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 56163037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 2492330 - 2492501
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || |   |  |     
T  2492330 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctagtttaatgtaaatttagttt--atttacgttcaa 2492427  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492428 tctagatataagaggtttgtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 2492501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33961620 - 33961551
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33961620 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36308598 - 36308497
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36308598 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 36308499  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  36308498 ac 36308497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Original strand, 45885087 - 45885215
Alignment:
Q  60 gggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  45885087 gggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttac 45885185  T
Q  160 attcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45885186 gttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 45885215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Original strand, 50622058 - 50622119
Alignment:
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50622058 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 50622119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3931309 - 3931197
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3931309 tttacttacgttcaatctaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 3931210  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||    
T  3931209 aaatttagtttac 3931197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7327106 - 7327042
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7327106 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaattt 7327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24744575 - 24744452
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24744575 aatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttca 24744477  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24744476 atttatgttaatgtaaatttagttt 24744452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28867181 - 28867097
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28867181 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 28867097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 29924094 - 29924186
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29924094 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 29924186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 29924186 - 29924250
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29924186 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29924250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 44878602 - 44878780
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||| || ||||||||| || || ||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||         
T  44878602 aggttagcgtgaattcagtttacatatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgctcaatttaagttaatgtaaattaagtttac----- 44878696  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
          ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44878697 ------gtatgtatataagaggttattgtgaattcagtttacgtacgttca-tcaaagttaatgtaaattaagtttacgtatgttcaattt 44878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3875368 - 3875297
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3875368 aggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaattt 3875297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28573308 - 28573221
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28573308 tgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 28573221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 45885215 - 45885302
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45885215 tgtaaattcagtttacatacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttac 45885302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 55281811 - 55281712
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55281811 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 55281712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7553672 - 7553566
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7553672 tttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 7553573  T
Q  179 aaattta 185  Q
    |||||||    
T  7553572 aaattta 7553566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17445258 - 17445184
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17445258 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 17445184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 22169582 - 22169710
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  22169582 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 22169680  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22169681 ttcaatcta-gttaatgtaaatttagtttac 22169710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33961045 - 33960971
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33961045 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 33960971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36308378 - 36308269
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  36308378 ggttaatgtaaatt-aagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 36308280  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  36308279 ttcaatttagg 36308269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 45885388 - 45885482
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45885388 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttac 45885482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7554085 - 7554000
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554085 taaattcagtttacttacgttcaatccagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 7554000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36308386 - 36308285
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36308386 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 36308287  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  36308286 ac 36308285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3875096 - 3875008
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg-ttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3875096 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttac 3875008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7327267 - 7327203
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327267 tgtaaattcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7327203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7553683 - 7553619
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553683 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7553619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7553878 - 7553814
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553878 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7553814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36224687 - 36224560
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  36224687 ttaatgtaaatt-aagtttaattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacatt 36224589  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36224588 caatctaggttaatgtaaattaagtttac 36224560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36431929 - 36431865
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36431929 tgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36431865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41764393 - 41764325
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41764393 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatataaattaagtttacttatgttcaa 41764325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7327085 - 7326986
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7327085 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 7326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11005270 - 11005199
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005270 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11005199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35949095 - 35949024
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35949095 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 35949024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49331714 - 49331643
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49331714 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 49331643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39677299 - 39677213
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  39677299 aggttagtgtaaattcagtttacttgtgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 39677213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Original strand, 44878532 - 44878673
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44878532 gttaatgtaaatttagtttacgtatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac-----------gtatgtatataagaggttagcgtgaattcagt 44878620  T
Q  235 ttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| ||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  44878621 ttacatatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgctcaattt 44878673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 54202793 - 54202890
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54202793 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 54202890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11005311 - 11005237
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005311 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 11005237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 11309090 - 11309182
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11309090 ggttaatgtaaattcag-tttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttta 11309182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 45885424 - 45885493
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45885424 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 45885493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 45885603 - 45885712
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  45885603 tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacatatcttcaatttacgttaatgt 45885702  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  45885703 aaatttagtt 45885712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48868580 - 48868499
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  48868580 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttagttatgttcaatctaagttaatgt 48868499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49331757 - 49331656
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49331757 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 49331658  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  49331657 ac 49331656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27767152 - 27766956
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |      ||    
T  27767152 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaat------ca 27767060  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||  |                 |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27767059 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttga-----------------gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaa 27766979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27767217 - 27767099
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  27767217 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 27767130  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767129 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27767099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27767255 - 27767183
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27767255 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 27767183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28867308 - 28867181
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  28867308 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcattctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 28867210  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28867209 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 28867181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29933119 - 29933055
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29933119 tgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 29933055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36308621 - 36308452
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  36308621 aggttagtgtaaattcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatg 36308528  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |  |        || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  36308527 ttca--------attta---ggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttagttacgttca 36308452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 56162942 - 56163014
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56162942 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 56163014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7327077 - 7327006
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327077 aggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7327006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7553654 - 7553583
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553654 aggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7553583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7553849 - 7553778
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553849 aggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7553778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11381697 - 11381602
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11381697 taggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 11381602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36308343 - 36308272
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36308343 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 36308272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36431900 - 36431829
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36431900 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36431829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Original strand, 54202751 - 54202827
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54202751 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 54202827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 54202792 - 54202863
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54202792 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 54202863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 2492502 - 2492569
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492502 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2492569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3875085 - 3874975
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgtt-aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatg 177  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3875085 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttacgttaatg 3874986  T
Q  178 taaatttagtt 188  Q
    |||||||||||    
T  3874985 taaatttagtt 3874975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7554085 - 7554023
Alignment:
Q  225 taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554085 taaattcagtttacttacgttcaatccagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 7554023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27767253 - 27767156
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27767253 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 27767156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28573423 - 28573254
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atata 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||| |  ||   || ||    
T  28573423 taaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatcta 28573328  T
Q  203 g---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573327 ggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 28573254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49331713 - 49331616
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  49331713 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 49331616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27767295 - 27767221
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767295 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 27767221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35948993 - 35948901
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  35948993 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 35948901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36308555 - 36308486
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36308555 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 36308486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49331791 - 49331717
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49331791 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaat 49331717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 56162902 - 56162976
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162902 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 56162976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 56162979 - 56163048
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56162979 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 56163048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Original strand, 56162980 - 56163177
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |        
T  56162980 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaat---- 56163074  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |                 |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  56163075 --caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttga-----------------gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatg 56163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3931284 - 3931220
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3931284 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3931220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7554143 - 7554087
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554143 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7554087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11381419 - 11381280
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt 223  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||| |||||     
T  11381419 gttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttatgttaatgtaaattaagtttacatgtgta-----------tataagatgttagc 11381331  T
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    || |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11381330 gtcaattcagtttacttatgatcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11381280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 20492815 - 20492879
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492815 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20492879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 22169379 - 22169497
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  22169379 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 22169466  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169467 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22169497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 29924095 - 29924186
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29924095 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 29924186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 29924130 - 29924186
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29924130 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 29924186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35949058 - 35948940
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  35949058 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactca-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 35948971  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948970 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 35948940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Original strand, 45885226 - 45885338
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  45885226 tttacatacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 45885325  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  45885326 aaattaagtttac 45885338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 2492091 - 2492158
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492091 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2492158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 2492322 - 2492381
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492322 tatgtcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11005019 - 11004955
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005019 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 11004955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11005234 - 11005163
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11005234 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 11005163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11005480 - 11005413
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005480 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 11005413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 22169369 - 22169436
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169369 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22169436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24744544 - 24744473
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24744544 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 24744473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27767464 - 27767397
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767464 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27767397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33115575 - 33115500
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33115575 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 33115500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35949094 - 35949000
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttact 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  35949094 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact 35949000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36308591 - 36308520
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36308591 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 36308520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36308762 - 36308703
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36308762 tatgtcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36308703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43957492 - 43957395
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43957492 tcaatctaggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 43957397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49331757 - 49331614
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  49331757 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 49331669  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49331668 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 49331614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49331960 - 49331893
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331960 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49331893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 2492088 - 2492162
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2492088 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 2492162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11005483 - 11005409
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11005483 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 11005409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 20492773 - 20492882
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  20492773 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 20492871  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  20492872 ttcaatttagg 20492882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 22169366 - 22169440
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22169366 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 22169440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27767467 - 27767393
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27767467 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 27767393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33961515 - 33961345
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |  ||  |       
T  33961515 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttca--- 33961419  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
         || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33961418 -----atcta---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 33961345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35949339 - 35949273
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35949339 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 35949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43957451 - 43957384
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43957451 aggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 43957384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49331963 - 49331889
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  49331963 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 49331889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 56162730 - 56162804
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  56162730 tatgttcaatttagattagtgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 56162804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11381660 - 11381591
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11381660 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 11381591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33961584 - 33961515
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33961584 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 33961515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35948962 - 35948893
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35948962 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 35948893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43957386 - 43957333
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43957386 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 43957333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49331413 - 49331360
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331413 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49331360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49331750 - 49331681
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49331750 aggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 49331681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 54202925 - 54202994
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  54202925 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 54202994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 54203131 - 54203184
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54203131 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 54203184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 280
Target Start/End: Original strand, 56162745 - 56162806
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56162745 ttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 56162806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 2492100 - 2492164
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2492100 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 2492164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7327162 - 7327106
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7327162 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7327106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11005471 - 11005407
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11005471 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 11005407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 22169378 - 22169442
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22169378 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 22169442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 281
Target Start/End: Original strand, 26488764 - 26488825
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26488764 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 26488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27767218 - 27767154
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27767218 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 27767154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27767455 - 27767391
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27767455 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 27767391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29933123 - 29933028
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||    
T  29933123 ttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttacttat 29933028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29933270 - 29933134
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||             ||||||||||||||||||    
T  29933270 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttag 29933184  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29933183 tgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttat 29933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35948751 - 35948703
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948751 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 35948703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49331951 - 49331887
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49331951 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 49331887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 54202609 - 54202657
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202609 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 54202657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 54202828 - 54202892
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54202828 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 54202892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 54202829 - 54202947
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||| ||||     
T  54202829 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttatttatg 54202916  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202917 ttaaatttaggttaatgtaaatttagtttac 54202947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 54203068 - 54203133
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54203068 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 54203133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3931290 - 3931192
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3931290 ggtttatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtttacctata 3931192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 11309089 - 11309160
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11309089 aggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 11309160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11381696 - 11381625
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11381696 aggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 11381625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 22169475 - 22169546
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22169475 aggttaatgtaaatttagtttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaattt 22169546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28573395 - 28573308
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28573395 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 28573308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29932860 - 29932813
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29932860 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 29932813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29933370 - 29933303
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29933370 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttac 29933303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33115575 - 33115520
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115575 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33115520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36308379 - 36308308
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36308379 aggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 36308308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43957696 - 43957629
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43957696 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 43957629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 45885461 - 45885692
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctat----gttaatgaaaattaagtttact 156  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||     ||||||| ||||||||||||||    
T  45885461 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaattaagttaatgtaaattaagtttact 45885559  T
Q  157 tatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    || ||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  45885560 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttttaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 45885659  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45885660 ttaatgtaaattaagtttacatatcttcaattt 45885692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49331471 - 49331411
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49331471 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 49331411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55281802 - 55281712
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  55281802 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 55281712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 55542094 - 55542162
Alignment:
Q  209 atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55542094 atataaaaggttattgtaaattcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 55542162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 2492330 - 2492392
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2492330 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 2492392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7554051 - 7553993
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554051 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 7553993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29933022 - 29932960
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29933022 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 29932960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29933373 - 29933299
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||    
T  29933373 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttacttat 29933299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35948991 - 35948929
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35948991 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 35948929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35949129 - 35949062
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35949129 aggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 35949062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35949342 - 35949268
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  35949342 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttatttat 35949268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 39677298 - 39677209
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagt 151  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39677298 ggttagtgtaaattcag-tttacttgtgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 39677209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #251
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39677263 - 39677209
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagt 270  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39677263 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 39677209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #252
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41764392 - 41764270
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||     ||||||| ||||||||||| |||||     
T  41764392 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatttaggttaatataaattaagtttacttatgttcaag----gttaatgtaaattaagttttcttatg 41764298  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41764297 ttcaatttacgttaatgtaaattaagtt 41764270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #253
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43957526 - 43957459
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43957526 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttat 43957459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #254
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43957699 - 43957625
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  43957699 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 43957625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #255
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 44878710 - 44878803
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||| ||||||||| || |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44878710 aggttattgtgaattcagtttacgtacgttca-tcaaagttaatgtaaattaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttac 44878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #256
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49331610 - 49331548
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49331610 tgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 49331548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #257
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 54202587 - 54202661
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54202587 tatgttcaatttagattagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 54202661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #258
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Original strand, 2492328 - 2492416
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  2492328 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctagtttaatgtaaatttagttta 2492416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #259
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7327316 - 7327267
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7327316 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 7327267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #260
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 11309335 - 11309455
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |  ||  |    |||||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  11309335 gttaatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtgtatataagatgttagtgtcaattcagtttacttatgt 11309433  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11309434 tcaatttaggttaatgtaaatt 11309455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #261
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 11309622 - 11309675
Alignment:
Q  144 aattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11309622 aattcagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtgt 11309675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #262
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11381198 - 11381074
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | |||| ||  |||| ||||||||||| ||||    
T  11381198 aatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgttca 11381100  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11381099 atttaggttaatgtaaattaagttta 11381074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #263
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 158
Target Start/End: Original strand, 26488609 - 26488682
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  26488609 tatgttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 26488682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #264
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 26488621 - 26488690
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26488621 aggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 26488690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #265
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27767261 - 27767196
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27767261 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 27767196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #266
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28573414 - 28573308
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  28573414 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 28573319  T
Q  179 aaatttagttt 189  Q
    ||||| |||||    
T  28573318 aaattaagttt 28573308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #267
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33961449 - 33961345
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  33961449 ggttaatgtaaattcag-tttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 33961351  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  33961350 ttcaat 33961345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #268
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33961619 - 33961515
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  33961619 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaatttagtttacttatg 33961521  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  33961520 ttcaat 33961515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #269
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35948754 - 35948693
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35948754 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 35948693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #270
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36431978 - 36431929
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36431978 tgtaaattgagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattcagttt 36431929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #271
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49331411 - 49331350
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49331411 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 49331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #272
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 280
Target Start/End: Original strand, 54202602 - 54202663
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54202602 ttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 54202663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #273
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 158
Target Start/End: Original strand, 54202913 - 54202986
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54202913 tatgttaaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 54202986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #274
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 56162936 - 56163001
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  56162936 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 56163001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #275
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7553934 - 7553878
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7553934 aggttagtgtaaattcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7553878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #276
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 26488622 - 26488693
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26488622 ggttactgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 26488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #277
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29933090 - 29933026
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29933090 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttacttatgt 29933026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #278
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29933361 - 29933297
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29933361 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttacttatgt 29933297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #279
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35949136 - 35948995
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| |||    
T  35949136 tcaatctaggttaatgcaaattaagtttact--tattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgt 35949050  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35949049 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactcatgt 35948995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #280
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35949239 - 35949103
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||             ||||||||||||||||||    
T  35949239 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttag 35949153  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35949152 tgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttat 35949103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #281
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35949330 - 35949266
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35949330 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttatttatgt 35949266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #282
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36308812 - 36308764
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36308812 aaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36308764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #283
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43957687 - 43957623
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43957687 aggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 43957623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #284
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 44878620 - 44878696
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  44878620 tttacatatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttatgctcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 44878696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #285
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 56162752 - 56162800
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162752 aaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 56162800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #286
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33961141 - 33961062
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || | || ||||| ||||||||||    
T  33961141 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatctaggtcagtgtaaattcagtttactta 33961062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #287
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36432012 - 36431929
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| || || |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36432012 taaattaagtttacttatgttcaatgtaggtcaatgtaaattgagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattcagttt 36431929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #288
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 54203029 - 54203122
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54203029 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 54203120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #289
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11381541 - 11381483
Alignment:
Q  144 aattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11381541 aattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacatatttatata 11381483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #290
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29933160 - 29933093
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29933160 aggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctagattaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 29933093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #291
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36308834 - 36308760
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36308834 tatgttcaatttagattagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 36308760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #292
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Original strand, 44878747 - 44878800
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44878747 gttaatgtaaatt-aagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtt 44878800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #293
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 2492359 - 2492428
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  2492359 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctagtttaatgtaaatttagtttatttacgttcaat 2492428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #294
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3875223 - 3874995
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| || |||  |||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||      
T  3875223 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctatgttgatgtaaattaagtttacttatgttcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttacg 3875125  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt-a 257  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||| |    
T  3875124 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttta 3875025  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3875024 atgtaaattaagtttacttatcttcaattt 3874995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #295
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Original strand, 11309295 - 11309368
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  11309295 agaggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaattt 11309368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #296
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27767023 - 27766953
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27767023 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 27766953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #297
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29932863 - 29932802
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29932863 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttatttatgttcaa 29932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #298
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33115573 - 33115500
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  33115573 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 33115500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #299
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35948819 - 35948757
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35948819 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggctaatgtaaatttagtttacttatgttc 35948757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #300
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36308819 - 36308758
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36308819 ttagtgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 36308758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #301
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48868651 - 48868523
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | |||| || ||||| ||||||||||      
T  48868651 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacg 48868553  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48868552 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 48868523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #302
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48874072 - 48873980
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  48874072 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 48873980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #303
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 54203133 - 54203194
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54203133 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgctcaa 54203194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #304
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Original strand, 2492290 - 2492326
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492290 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 2492326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #305
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3875066 - 3874975
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttagg-ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  3875066 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatttaggtttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 3874975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #306
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3931428 - 3931348
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  3931428 tttacttacgttcaatctaggttaatgtacattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttat 3931348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #307
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7327238 - 7327174
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7327238 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 7327174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #308
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7553813 - 7553749
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7553813 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatatgt 7553749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #309
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35948961 - 35948890
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35948961 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 35948890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #310
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48868652 - 48868588
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48868652 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 48868588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #311
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48868653 - 48868617
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48868653 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48868617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #312
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 54202926 - 54202997
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54202926 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 54202997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #313
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 2492092 - 2492135
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492092 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2492135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #314
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 2492463 - 2492556
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2492463 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagttt 2492554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #315
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 2492502 - 2492570
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2492502 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 2492570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #316
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11005058 - 11004965
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11005058 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagttt 11004967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #317
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11005479 - 11005436
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005479 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11005436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #318
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 22169370 - 22169413
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169370 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 22169413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #319
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 26488613 - 26488656
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26488613 ttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26488656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #320
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 26488725 - 26488818
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26488725 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagttt 26488816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #321
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27767463 - 27767420
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767463 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27767420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #322
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29933273 - 29933202
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29933273 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 29933202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #323
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29933369 - 29933326
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29933369 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29933326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #324
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35948858 - 35948765
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35948858 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggctaatgtaaatttagttt 35948767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #325
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35949338 - 35949295
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35949338 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35949295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #326
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43957384 - 43957329
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43957384 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 43957329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #327
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43957485 - 43957425
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43957485 aggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttat 43957425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #328
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Original strand, 44878422 - 44878489
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  44878422 gttaatgtaaattcagtttaaatatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgtatata 44878489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #329
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48874082 - 48874015
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48874082 gttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 48874015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #330
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49331959 - 49331916
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331959 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 49331916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #331
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 55542124 - 55542217
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  55542124 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattcagttt 55542215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #332
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 276
Target Start/End: Original strand, 55542163 - 55542219
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55542163 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttactt 55542219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #333
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29933167 - 29933104
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  29933167 tcaatctaggttaatgcaaattaagtttact--tattcaatctagattaatgtaaattcagtttac 29933104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #334
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33115575 - 33115533
Alignment:
Q  149 agtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33115575 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 33115533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #335
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39677205 - 39677171
Alignment:
Q  253 ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39677205 ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39677171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #336
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43957459 - 43957384
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  43957459 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 43957384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #337
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 54202896 - 54202958
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54202896 tgtaaattaagtttatttatgttaaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 54202958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #338
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 200
Target Start/End: Original strand, 2492191 - 2492268
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtata 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2492191 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgtatata 2492268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #339
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7327316 - 7327267
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  7327316 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 7327267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #340
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7554152 - 7554087
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7554152 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 7554087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #341
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11005019 - 11004949
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11005019 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 11004949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #342
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11381408 - 11381280
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| || |  ||  |    ||||||  |  |||| |||||||||||      
T  11381408 gttaatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttatgttaatgtaaattaagtttacatgtgtatataagatgttagcgtcaattcagtttacttatga 11381310  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11381309 tcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11381280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #343
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41764428 - 41764335
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41764428 gttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatataaattaagtttac 41764335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #344
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48874037 - 48873980
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48874037 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 48873980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #345
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49331468 - 49331422
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331468 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #346
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7554076 - 7553996
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||| || |||||||  || ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7554076 tttacttacgttcaatccagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttat 7553996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #347
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 11309315 - 11309391
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  11309315 tttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11309391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #348
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 22169794 - 22169866
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| |||||||| |||| |||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22169794 gttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 22169866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #349
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28573243 - 28573179
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  28573243 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtagatttagtttacgtatgt 28573179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #350
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29933301 - 29933239
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29933301 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 29933239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #351
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35949270 - 35949208
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35949270 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 35949208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #352
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36432011 - 36431963
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  36432011 aaattaagtttacttatgttcaatgtaggtcaatgtaaattgagtttac 36431963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #353
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43957627 - 43957565
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43957627 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 43957565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #354
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 44878420 - 44878484
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44878420 aggttaatgtaaattcagtttaaatatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgt 44878484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #355
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 44878530 - 44878594
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44878530 aggttaatgtaaatttagtttacgtatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacgtatgt 44878594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #356
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 49331413 - 49331350
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  49331413 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 49331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #357
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49331860 - 49331788
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49331860 gttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttatgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 49331788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #358
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 284
Target Start/End: Original strand, 55542254 - 55542294
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55542254 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaa 55542294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #359
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 56162802 - 56162864
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56162802 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 56162864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #360
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 56162833 - 56162905
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  56162833 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 56162905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #361
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 2492200 - 2492259
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2492200 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 2492259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #362
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3874040 - 3873969
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttag 170  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| || | ||||||||||    
T  3874040 gttagtgtaaattcagtttatttaggttcaatctagattaatataaattaagtttagtttttttcaatttag 3873969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #363
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 7327237 - 7327183
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7327237 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 7327183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #364
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27767355 - 27767296
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27767355 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 27767296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #365
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28573507 - 28573453
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28573507 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 28573453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #366
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28867151 - 28867097
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  28867151 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 28867097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #367
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35948754 - 35948687
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  35948754 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 35948687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #368
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35948755 - 35948693
Alignment:
Q  66 atgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  35948755 atgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 35948693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #369
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35949242 - 35949171
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  35949242 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 35949171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #370
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36431864 - 36431809
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36431864 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 36431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #371
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41764325 - 41764290
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41764325 aggttaatgtaaattaagttttcttatgttcaattt 41764290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #372
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43957695 - 43957652
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43957695 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaattt 43957652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #373
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 44878421 - 44878475
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44878421 ggttaatgtaaattcag-tttaaatatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtt 44878475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #374
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 49331411 - 49331344
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  49331411 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 49331344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #375
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 54202591 - 54202634
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202591 ttcaatttagattagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 54202634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #376
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 55542026 - 55542089
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  55542026 tgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaatttaatttacttacgttcaat 55542089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #377
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 56162842 - 56162901
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  56162842 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 56162901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #378
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 2492328 - 2492358
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2492328 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2492358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #379
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3931255 - 3931197
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  3931255 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtttac 3931197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #380
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Original strand, 11309208 - 11309266
Alignment:
Q  144 aattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11309208 aattcagtttacttatgtttaatttaggttaacgtaaattaagtttacatatttatata 11309266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #381
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 11309611 - 11309669
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  11309611 aggttagtgtgaattcagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 11309669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #382
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11381422 - 11381352
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11381422 tatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttatgttaatgtaaattaagtttac 11381352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #383
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 22169444 - 22169474
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169444 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 22169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #384
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29933024 - 29932994
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29933024 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29932994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #385
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 31445314 - 31445348
Alignment:
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31445314 tatgtatataggaggttagtgtaaattcagtttac 31445348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #386
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33961122 - 33961061
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttac 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33961122 ggttaatgtaaattcag-tttacttaagttcaatctaggtcagtgtaaattcagtttacttac 33961061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #387
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35948993 - 35948963
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948993 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35948963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #388
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43957386 - 43957356
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43957386 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 43957356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #389
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49331413 - 49331383
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49331413 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 49331383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #390
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49331950 - 49331832
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  49331950 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 49331863  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  49331862 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 49331832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #391
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 54203131 - 54203161
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54203131 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 54203161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #392
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 55542252 - 55542294
Alignment:
Q  87 tgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55542252 tgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaa 55542294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #393
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 2492101 - 2492222
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||| ||||     
T  2492101 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttatttatt 2492188  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2492189 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 2492222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #394
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3931535 - 3931487
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaat 110  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3931535 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaat 3931487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #395
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7554151 - 7554110
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554151 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaat 7554110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #396
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11005470 - 11005410
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  11005470 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 11005410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #397
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11381196 - 11381139
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11381196 tgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgt 11381139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #398
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Original strand, 26488764 - 26488822
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  26488764 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttat 26488822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #399
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27767454 - 27767394
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  27767454 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 27767394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #400
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29932864 - 29932835
Alignment:
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29932864 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29932835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #401
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35948755 - 35948726
Alignment:
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948755 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35948726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #402
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43957386 - 43957330
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  43957386 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 43957330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #403
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48874081 - 48874040
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48874081 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 48874040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #404
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 54203131 - 54203187
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  54203131 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 54203187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #405
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 55542047 - 55542092
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  55542047 gttcaatctaggttagtgtaaatttaatttacttacgttcaatcta 55542092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #406
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 56163113 - 56163183
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  56163113 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaacttagg 56163183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #407
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 2492192 - 2492224
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2492192 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 2492224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #408
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 2492360 - 2492431
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2492360 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctagtttaatgtaaatttagtttatttacgttcaatcta 2492431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #409
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7553990 - 7553942
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7553990 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 7553942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #410
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11005379 - 11005347
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11005379 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 11005347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #411
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24744508 - 24744452
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  24744508 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagttt 24744452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #412
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27767364 - 27767292
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27767364 gttcagtctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 27767292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #413
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28573396 - 28573331
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28573396 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 28573331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #414
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43957595 - 43957563
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43957595 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 43957563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #415
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Original strand, 44878529 - 44878565
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44878529 taggttaatgtaaatttagtttacgtatgttcaattt 44878565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #416
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Original strand, 44878747 - 44878803
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44878747 gttaatgtaaattaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttac 44878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #417
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 54203068 - 54203133
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  54203068 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 54203133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #418
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 56162834 - 56162866
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56162834 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 56162866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 235)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27771080 - 27770814
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27771080 tgtatgtatataaaaggggttagtgtactttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgtttaatttaggttagtgtaaattcagtttact 27770981  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27770980 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtatatatagtatgtatataagaggtt 27770881  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27770880 aatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 27770814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23191698 - 23191435
Alignment:
Q  23 tatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23191698 tatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagggtaatgtaaattcaagtttacgtat-ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttactta 23191600  T
Q  123 cgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23191599 cgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagatgttag 23191500  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23191499 tgtaaattcagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 23191435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8836350 - 8836097
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8836350 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8836251  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  8836250 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 8836162  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8836161 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttacgttcaat 8836097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 25031733 - 25031988
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25031733 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 25031832  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  25031833 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaacgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 25031921  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25031922 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25031988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15472489 - 15472236
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15472489 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 15472390  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  15472389 tacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 15472301  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15472300 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 15472236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 6230523 - 6230777
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6230523 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 6230622  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  6230623 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 6230711  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6230712 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatt 6230777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 18186058 - 18186303
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18186058 tgtatgtatataaaatgggttactgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 18186157  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||    
T  18186158 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttac-----------gtatgtatataagaggtt 18186246  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18186247 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 18186303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 18617717 - 18617958
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18617717 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 18617816  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  18617817 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 18617905  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18617906 agtgtaaattcaatttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttta 18617958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41743179 - 41742937
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41743179 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 41743080  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  41743079 tacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 41742991  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41742990 aatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 41742937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 29296500 - 29296753
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  29296500 tgtatgtatataaaaagggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatattcaatctaggttaatgtaaattcagtttact 29296599  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  29296600 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 29296688  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29296689 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaat 29296753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31378061 - 31377811
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31378061 tgtatgtatataaaaggggttagtgtattttacgtatgtaggttaatataaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttagtataaattcagtttact 31377962  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||    
T  31377961 tacattcaatctatgttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta-----------tgtatgtatataagaggtt 31377873  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31377872 agtgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 31377811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 8335631 - 8335883
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8335631 tgtatgtatataaaaggggttagtg-agtttacgtatataggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttact 8335729  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  8335730 tacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 8335818  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8335819 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 8335883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Original strand, 28349434 - 28349638
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28349434 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 28349533  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28349534 aaatttagtttacat----atatagtatgtatataagaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttacttac 28349629  T
Q  279 gttcaattt 287  Q
    |||||||||    
T  28349630 gttcaattt 28349638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 28349340 - 28349510
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28349340 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtgtgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggtttgtgtaaattcagtttact 28349439  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28349440 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 28349510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10691738 - 10691485
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  10691738 tgtatgtatataaaaggggttggtgtagtttaggtatgtgggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttctatttaggttagtgtaaattcagtttact 10691639  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       || ||    
T  10691638 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttca----atct-------agatt 10691550  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691549 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 10691485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23191504 - 23191323
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||| | ||||    
T  23191504 gttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatgta 23191412  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23191411 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaattt 23191323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 28349567 - 28349750
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  28349567 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 28349659  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349660 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28349750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27770885 - 27770702
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||       |||||||||| | ||    
T  27770885 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaagtta-------tttagtttacgtatg 27770793  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770792 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27770702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35065797 - 35065583
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  35065797 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca 35065699  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || ||||||| | |||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35065698 atctaggttagtataaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaa 35065604  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  35065603 ttaagtttatttatgttcaat 35065583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 8335814 - 8335991
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||         
T  8335814 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac----- 8335908  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8335909 ------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 8335991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35065484 - 35065287
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  35065484 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact---gttcaatcta-gttaatgtaaattctgtttacttaagttcaatataggttagtgt 35065389  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    ||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35065388 aaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaagttagtgtaaattcagtttagttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttat 35065294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35065912 - 35065806
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35065912 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaattt 35065813  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  35065812 agtttac 35065806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36484256 - 36484128
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  36484256 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgt 36484158  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36484157 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36484128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3390624 - 3390479
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390624 aatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 3390530  T
Q  235 ttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3390529 ttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaat 3390479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 29296684 - 29296863
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |       
T  29296684 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttactt--- 29296780  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
            ||||  |    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29296781 --------atgttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29296863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 29296759 - 29296886
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29296759 ttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 29296857  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29296858 caatttaggttaatgtaaattaagtttac 29296886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42675477 - 42675346
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  42675477 tgtatgtatataaaagtggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttact 42675379  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42675378 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42675346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42675158 - 42674932
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  42675158 gttaatgtaaattcaa-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt 42675060  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtt--tacat---gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt 256  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  || ||   || ||  ||   |  || |   |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  42675059 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacattcaatct---aggttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttaggtt 42674963  T
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674962 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42674932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8836166 - 8835974
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  8836166 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 8836067  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8836066 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8835974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33569875 - 33569708
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  33569875 taggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac---- 33569780  T
Q  196 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
           || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33569779 -------gtgtgtatataagaggttagtgtcaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 33569708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 25031917 - 25032011
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25031917 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 25032011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8782097 - 8781933
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    ||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||           
T  8782097 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac------- 8782005  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8782004 ----gtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 8781933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 18186242 - 18186419
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||    
T  18186242 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatg 18186341  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |  |    || |       |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18186342 ttca----atct-------aggttaatttaaattcaatttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatcttcaat 18186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 18186317 - 18186444
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18186317 ttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatttaaattcaatttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatctt 18186415  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18186416 caatctaggttaatgtaaattaagtttac 18186444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42675314 - 42675091
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  42675314 ttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtt 42675216  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtt--tacat---gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtta 257  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  || ||   || ||  ||   |  ||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  42675215 caatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatataa---gttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatctaggtta 42675119  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42675118 atgtaaattcagtttacttacgttcaat 42675091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 18617793 - 18617864
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18617793 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18617864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Original strand, 42222065 - 42222216
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt 223  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||||||||||||    
T  42222065 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagt 42222162  T
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222163 gtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 42222216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42675178 - 42674968
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| || |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  42675178 tttacttacgttcaatataagttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 42675079  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675078 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42674983  T
Q  273 acttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||||    
T  42674982 acttatcttcaattt 42674968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 6230599 - 6230670
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6230599 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 6230670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 8335922 - 8336113
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |     
T  8335922 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaatt 8336021  T
Q  197 tatata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     |  ||  || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8336022 cagctacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8336113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8836274 - 8836203
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8836274 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8836203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10691662 - 10691591
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691662 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10691591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 18186134 - 18186205
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18186134 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 18618012 - 18618138
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||     
T  18618012 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggataatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatg 18618110  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18618111 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 29296576 - 29296647
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29296576 aggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29296647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 29296685 - 29296899
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  29296685 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatg 29296783  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  29296784 ttcaatccaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatg 29296872  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29296873 taaattaagtttacttatgttcaattt 29296899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 29296793 - 29296919
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  29296793 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 29296891  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29296892 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 29296919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33591478 - 33591391
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33591478 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 33591391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41743103 - 41743032
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41743103 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41743032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36484185 - 36483983
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  36484185 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 36484098  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  36484097 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 36484006  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36484005 taaattaagtttacttatgttca 36483983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41742994 - 41742866
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt--cacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41742994 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacactgacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttactta 41742896  T
Q  159 tattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41742895 tgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 41742866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 18186243 - 18186455
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  18186243 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatg 18186341  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||||| |  ||        |  || |||   |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18186342 ttcaatctaggttaatttaaattcaatttacttacgt--------tcaatctaa---gttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatctaggttaatg 18186430  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18186431 taaattaagtttacttatgttcaat 18186455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35065318 - 35065214
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35065318 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 35065220  T
Q  162 tcaatt 167  Q
    ||||||    
T  35065219 tcaatt 35065214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 6230864 - 6230928
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230864 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 6230928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8836165 - 8836038
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  8836165 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 8836067  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8836066 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8836038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 18617982 - 18618046
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18617982 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18618046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35065354 - 35065262
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35065354 gttagtgtaaattcagtttagttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 35065262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 6230864 - 6230951
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6230864 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 6230951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 8335706 - 8335777
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8335706 aggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8335777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8836038 - 8835951
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8836038 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaattaagtttac 8835951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15472413 - 15472342
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15472413 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15472342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 25031918 - 25032044
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  25031918 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 25032016  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25032017 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 25032044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 28349416 - 28349487
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349416 aggtttgtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28349487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33591571 - 33591380
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt--tacat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  || ||    
T  33591571 taggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaat 33591472  T
Q  194 ---gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
       || ||  ||   |  || |||   |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591471 tcagtttacttacgttcaatctaa---gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33591380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35065900 - 35065829
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065900 aggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35065829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3390548 - 3390462
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3390548 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 3390462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15472305 - 15472211
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  15472305 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttac 15472211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 18186351 - 18186480
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18186351 ggttaatttaaattcaa-tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 18186449  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18186450 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 18186480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31377877 - 31377783
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  31377877 aggttagtgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattcagtttac 31377783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35065284 - 35065214
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065284 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 35065214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8782477 - 8782352
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||         |||||||||||||| ||||||||    
T  8782477 gttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac--gtgtatata---------taagaggttagtgtcaattcagt 8782389  T
Q  235 ttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8782388 ttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 8782352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42675346 - 42675189
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||  |       
T  42675346 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttca--- 42675250  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
     || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675249 -atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42675189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 8336033 - 8336133
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8336033 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagt 8336132  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  8336133 t 8336133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8782307 - 8782141
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||         
T  8782307 aggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaatttaatttacgtatgtttactttaggttaatgtaaattaagtttac----- 8782213  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
          || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8782212 ------gtgtgtatataagatgttagtgtcaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 8782141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15472163 - 15472076
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15472163 tgtaaatttagtttacttacgttcaatccaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 15472076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 18617982 - 18618069
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18617982 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggataatgtaaattaagtttac 18618069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31377985 - 31377914
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31377985 aggttagtataaattcagtttacttacattcaatctatgttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 31377914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27770773 - 27770699
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27770773 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 27770699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 28349679 - 28349753
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28349679 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 28349753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35065652 - 35065566
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35065652 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 35065566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8836027 - 8835918
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8836027 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 8835928  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  8835927 aaatttagtt 8835918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3390390 - 3390259
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagt 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |  ||     ||    
T  3390390 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttaaattcaatataggttagtgttaattcagtttacttacgt-----gt 3390296  T
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390295 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta 3390259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23191394 - 23191322
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23191394 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttatgttcaattta 23191322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33591478 - 33591414
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591478 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33591414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42675335 - 42675223
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42675335 tttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgt 42675236  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  42675235 aaattcagtttac 42675223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 6230778 - 6230864
Alignment:
Q  66 atgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6230778 atgtaaatt-aaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 6230864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 6230885 - 6230984
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6230885 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttacgttaatgtaaatttagtt 6230984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10691590 - 10691519
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691590 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10691519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36484222 - 36484151
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36484222 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 36484151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42675011 - 42674912
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42675011 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatcttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 42674912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 6230707 - 6230864
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||| | ||||| | ||    
T  6230707 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacattcaatt-------atgtaaattaaatttacttatg 6230799  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |        || ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230800 ttca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 6230864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10691589 - 10691472
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  10691589 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 10691491  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgta 179  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  10691490 ttcaatctaggttaatgta 10691472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15472304 - 15472175
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  15472304 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttacttatg 15472206  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
     ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  15472205 ctcaatctaggttaatgtagattaagtttac 15472175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 18618003 - 18618105
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18618003 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggataatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtt 18618102  T
Q  189 tac 191  Q
    |||    
T  18618103 tac 18618105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31377859 - 31377749
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31377859 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt 31377760  T
Q  179 aaatttagttt 189  Q
    ||||| |||||    
T  31377759 aaattaagttt 31377749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33569873 - 33569780
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33569873 ggttaatgtaaattcag-tttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 33569780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15472132 - 15472043
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15472132 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 15472043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33591467 - 33591358
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  33591467 tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctacgttaatgt 33591368  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  33591367 aaatttagtt 33591358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36484265 - 36484164
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36484265 tcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 36484166  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  36484165 ac 36484164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42675439 - 42675346
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42675439 taggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42675346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31377805 - 31377749
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31377805 aggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 31377749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42675123 - 42675032
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42675123 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42675032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 25031953 - 25032024
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25031953 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25032024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35065329 - 35065226
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  35065329 gttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 35065230  T
Q  188 ttac 191  Q
    ||||    
T  35065229 ttac 35065226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35065563 - 35065444
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||  ||          ||||||||||||||||     
T  35065563 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaaagta----------aattaagtttacttatg 35065475  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065474 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 35065444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36484265 - 36484122
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  36484265 tcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 36484177  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36484176 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 36484122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3390458 - 3390340
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||  ||          |||||||||||||||| |    
T  3390458 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaaagta----------aattaagtttacttatgt 3390370  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390369 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3390340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3390460 - 3390402
Alignment:
Q  133 atgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390460 atgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3390402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10691472 - 10691402
Alignment:
Q  118 acttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10691472 acttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttgatgtaaatttagtt 10691402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36484221 - 36484124
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36484221 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 36484124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15472132 - 15472063
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15472132 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15472063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31377747 - 31377694
Alignment:
Q  225 taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31377747 taaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 31377694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36484299 - 36484225
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36484299 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 36484225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42675438 - 42675369
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42675438 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 42675369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 6230893 - 6230961
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230893 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 6230961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15472163 - 15472099
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15472163 tgtaaatttagtttacttacgttcaatccaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 15472099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 18617902 - 18618118
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaa---tgaaaattaagtttactt 157  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| ||  ||||   || ||||| |||||||||    
T  18617902 ggttagtgtaaattcaa-tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttagttacgtt-aatataaattaagtttgtaaattcagtttactt 18617999  T
Q  158 atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtta 257  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || || ||   || |||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||    
T  18618000 acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca--------atttagga---taatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagatta 18618088  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618089 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18618118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33591569 - 33591478
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33591569 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 33591478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42675346 - 42675282
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42675346 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 42675282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42675402 - 42675346
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675402 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 42675346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 1421423 - 1421520
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421423 tcaatctaggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 1421518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3390699 - 3390632
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390699 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 3390632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8782061 - 8781927
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | |||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  8782061 gttaatgtaaattcaa-tttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacttatgt 8781963  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8781962 tcaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtgt 8781927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8836009 - 8835938
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8836009 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaattaagtttacttatgttcaattt 8835938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10691473 - 10691422
Alignment:
Q  236 tacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691473 tacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10691422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15472267 - 15472200
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15472267 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttacttatgctcaat 15472200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36484256 - 36484189
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36484256 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 36484189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36484468 - 36484401
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36484468 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36484401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41743066 - 41742936
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||  |    | ||||||| ||||||||||||||||      
T  41743066 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatataagaggttaatgtaaattaagtttacttacg 41742968  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttaca 192  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41742967 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaca 41742936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 42221965 - 42222032
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42221965 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42222032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 1421464 - 1421531
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1421464 aggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 1421531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3390702 - 3390628
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3390702 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 3390628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10691661 - 10691472
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      
T  10691661 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacg 10691563  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10691562 ttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttca--------attta---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatg 10691474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36484471 - 36484397
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36484471 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 36484397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 42221962 - 42222036
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42221962 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 42222036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 1421529 - 1421582
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421529 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 1421582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35065765 - 35065669
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  35065765 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtataaattcagtttactta 35065669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36483895 - 36483842
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36483895 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36483842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 42222074 - 42222143
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42222074 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 42222143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35065564 - 35065496
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35065564 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 35065496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36484459 - 36484395
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36484459 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 36484395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 42221974 - 42222038
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42221974 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 42222038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 1421219 - 1421286
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421219 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 1421286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3390690 - 3390627
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3390690 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 3390627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 8336043 - 8336133
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  8336043 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 8336133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31377689 - 31377614
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31377689 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttttcttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtt 31377614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33569874 - 33569803
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33569874 aggttaatgtaaattcagtttatgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 33569803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35065318 - 35065251
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35065318 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 35065251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36483979 - 36483919
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36483979 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 36483919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 1421216 - 1421290
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1421216 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 1421290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 278
Target Start/End: Original strand, 1421389 - 1421456
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1421389 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgcaaattaagtttacttat 1421456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3390458 - 3390392
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3390458 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 3390392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 8335815 - 8335908
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8335815 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 8335908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8782479 - 8782421
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8782479 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 8782421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15472132 - 15472043
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  15472132 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 15472043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15472233 - 15472163
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15472233 aggttaatctaaattaagtttacttatgctcaatctaggttaatgtagattaagtttacttatgttcaatt 15472163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36484118 - 36484056
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36484118 tgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 36484056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41742959 - 41742886
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttac--ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41742959 aggttaatgtaaattaagtttacactgacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41742886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15472267 - 15472163
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  15472267 gttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttacttatgctcaatctaggttaatgtagattaagtttacttatgt 15472169  T
Q  162 tcaatt 167  Q
    ||||||    
T  15472168 tcaatt 15472163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 18186422 - 18186483
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18186422 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 18186483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31377747 - 31377694
Alignment:
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31377747 taaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 31377694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33569837 - 33569697
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |  ||  |    | |||| ||  |||| |||||||||||     
T  33569837 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtgtatataagaggttagtgtcaattcagtttacttatg 33569739  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  33569738 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtgtatatata 33569697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35065899 - 35065795
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||     
T  35065899 ggttagtgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaatttagtttacttatg 35065801  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  35065800 ttcaat 35065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35065864 - 35065795
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35065864 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaatttagtttacttatgttcaat 35065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36483893 - 36483832
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36483893 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 36483832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41742995 - 41742899
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac--ttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  41742995 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacactgacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttac 41742899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 285
Target Start/End: Original strand, 42222213 - 42222267
Alignment:
Q  229 ttcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42222213 ttcagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 42222267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 1421228 - 1421292
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1421228 aggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 1421292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 8335923 - 8336014
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8335923 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8336014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 6230894 - 6230984
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||  || ||||||| ||||| ||||    
T  6230894 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttacgttaatgtaaatttagtt 6230984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31377689 - 31377634
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31377689 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttttcttatgttcaattt 31377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31377840 - 31377698
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt------- 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||           
T  31377840 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttttaaatt 31377742  T
Q  154 ------acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
          |||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31377741 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 31377698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42675002 - 42674912
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  42675002 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatcttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 42674912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Original strand, 1421531 - 1421589
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1421531 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgtt 1421589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 6230779 - 6230841
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6230779 tgtaaattaaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 6230841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 126
Target Start/End: Original strand, 18186423 - 18186487
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgtt 126  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18186423 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtt 18186487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31377687 - 31377614
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  31377687 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttttcttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtt 31377614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31377841 - 31377780
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31377841 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcgatctaggttaatgtaaattcagtttactta 31377780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Original strand, 42222066 - 42222107
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42222066 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 42222107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 18617829 - 18617893
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18617829 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 18617893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41743067 - 41743003
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41743067 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 41743003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 42222075 - 42222146
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42222075 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 42222146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42675436 - 42675380
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42675436 gttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 42675380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Original strand, 1421430 - 1421490
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1421430 aggttaatgcaaattaagtttactta--ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttat 1421490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3390698 - 3390655
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390698 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3390655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8782309 - 8782242
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8782309 agaggttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaatttaatttacgtatgtt 8782242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31377692 - 31377649
Alignment:
Q  146 ttaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31377692 ttaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 31377649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35065564 - 35065529
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065564 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35065529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36484467 - 36484424
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36484467 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36484424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 42221966 - 42222009
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42221966 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42222009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Original strand, 1421456 - 1421531
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1421456 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 1421531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8782396 - 8782338
Alignment:
Q  144 aattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  8782396 aattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttcacatatttatata 8782338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8782479 - 8782421
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  8782479 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 8782421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3390390 - 3390337
Alignment:
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3390390 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 3390337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3390458 - 3390425
Alignment:
Q  254 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390458 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3390425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8782097 - 8782028
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  8782097 gttagtgtaaatttagtttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaattt 8782028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33591573 - 33591512
Alignment:
Q  130 tctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33591573 tctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 33591512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35065569 - 35065496
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  35065569 aattcaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 35065496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36483976 - 36483930
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36483976 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 36483930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 42221975 - 42222096
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  42221975 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 42222062  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42222063 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 42222096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 284
Target Start/End: Original strand, 42222279 - 42222324
Alignment:
Q  239 ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42222279 ttactttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 42222324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 1421288 - 1421350
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1421288 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 1421350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 8335669 - 8335741
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattca-gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8335669 aggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaattt 8335741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8782081 - 8782005
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || || || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  8782081 tttacgtatgttcaatctacgttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac 8782005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 18186170 - 18186234
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  18186170 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttaatttacgtatgt 18186234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35065729 - 35065666
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35065729 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttagtataaattcagtttacttacgt 35065666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 36483895 - 36483832
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36483895 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 36483832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 42222265 - 42222314
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222265 aatgtaaattaagtttactt----tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42222314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 1421220 - 1421263
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1421220 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttgtgttcaattt 1421263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3390380 - 3390301
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || |||| ||  |||| ||||||||||    
T  3390380 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttaaattcaatataggttagtgttaattcagtttactta 3390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8782478 - 8782424
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8782478 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtt 8782424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8782479 - 8782444
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8782479 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 8782444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33591413 - 33591358
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33591413 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctacgttaatgtaaatttagtt 33591358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35065432 - 35065370
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    ||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35065432 gttaatgtaaattctg-tttacttaagttcaatataggttagtgtaaattcagtttacttacgt 35065370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35065494 - 35065443
Alignment:
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttact 275  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35065494 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact 35065443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36483893 - 36483826
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  36483893 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 36483826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 1421529 - 1421559
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421529 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1421559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3390512 - 3390462
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  3390512 aggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 3390462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8782061 - 8781999
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8782061 gttaatgtaaattcaatttacgtatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacgtatgt 8781999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35065797 - 35065767
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065797 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35065767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36483895 - 36483865
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36483895 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 36483865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36484458 - 36484340
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  36484458 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 36484371  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36484370 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 36484340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42675439 - 42675405
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42675439 taggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 42675405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 1421529 - 1421585
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  1421529 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 1421585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3390689 - 3390629
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3390689 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 3390629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Original strand, 28349568 - 28349636
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  28349568 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 28349636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35065283 - 35065215
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35065283 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 35065215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35065908 - 35065867
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35065908 ttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaat 35065867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41742995 - 41742962
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41742995 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 41742962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 1421320 - 1421352
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1421320 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 1421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3390602 - 3390562
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3390602 tatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt 3390562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8782389 - 8782349
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8782389 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagttcac 8782349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33591573 - 33591537
Alignment:
Q  249 tctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33591573 tctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 33591537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36483921 - 36483893
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36483921 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 36483893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Original strand, 42222224 - 42222256
Alignment:
Q  159 tattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42222224 tattcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 42222256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 229)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9870225 - 9869961
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9870225 tgtatgtatataaaaggggttagtgtattttacgtatgtatgttaatgtaaattcaattttacgtattttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 9870126  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9870125 tacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggtt 9870026  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9870025 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaat 9869961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18676579 - 18676326
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18676579 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 18676480  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  18676479 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 18676391  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676390 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 18676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 25105284 - 25105540
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25105284 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagtttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 25105383  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  25105384 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 25105472  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25105473 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaattt 25105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5544127 - 5543874
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5544127 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatttaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 5544028  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  5544027 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 5543939  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5543938 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 5543874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 47455359 - 47455612
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47455359 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 47455458  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||    
T  47455459 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gaatgtatataagaggtt 47455547  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47455548 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 47455612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40186529 - 40186274
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40186529 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagattaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 40186430  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  40186429 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 40186341  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40186340 agtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattaagtttacttacgttcaattt 40186274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31587741 - 31587488
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31587741 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttatgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 31587642  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  31587641 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactgatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 31587553  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  31587552 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgcaaattcagtttacttacgttcaat 31587488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 12848749 - 12848994
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12848749 tgtatgtatataaaaggggttaatgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 12848848  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  12848849 tacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 12848937  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12848938 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcactttactta 12848994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47020292 - 47020039
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47020292 tgtatgtagataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatataaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaatttagtttact 47020193  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  47020192 tacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 47020104  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47020103 agtgtaaatccagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 47020039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38743052 - 38742799
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38743052 tgtatgtatataaaagaggttggtgtagtttacgtatataggttaatgcaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 38742953  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  38742952 tacattcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 38742864  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38742863 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagattacttacgttcaat 38742799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 287
Target Start/End: Original strand, 44509213 - 44509442
Alignment:
Q  47 agtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaat 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44509213 agtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaat 44509312  T
Q  147 taagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattc 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  44509313 taagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattaagtttacttatgttc 44509401  T
Q  247 aatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44509402 aatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 44509442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 44291361 - 44291616
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  44291361 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattaaagtttacgtatgttgaatttagattaatgtaaattcagtttact 44291460  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  44291461 tacattaaatatagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 44291549  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44291550 agtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 44291616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 44062187 - 44062413
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  44062187 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatc 44062285  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaa-ttcagtttacttacattcaatctaggttaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44062286 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaatttgagtttacttacgttcaatctaggttaat 44062385  T
Q  260 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44062386 gtaaattaagtttacttacgttcaattt 44062413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9741030 - 9740835
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9741030 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaatttagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgt 9740931  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9740930 aaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttac 9740842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9869942 - 9869788
Alignment:
Q  133 atgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattca 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9869942 atgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtatattca 9869843  T
Q  233 gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9869842 gtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 9869788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30888233 - 30888065
Alignment:
Q  119 cttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagagg 218  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30888233 cttacgttcaatttaggttaatgtaaattaattttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagagg 30888134  T
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30888133 ttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttactttcaattt 30888065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 31622245 - 31622479
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31622245 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttac- 31622343  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
                      ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  31622344 ------------------atgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 31622414  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31622415 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 31622479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 257
Target Start/End: Original strand, 25105505 - 25105690
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  25105505 ggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaag 25105604  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtta 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25105605 ttcaatttaggttaatataaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtta 25105690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30888136 - 30887964
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  30888136 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttactttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 30888044  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30888043 tatatagtatgtatataagaggttagtggaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttactt 30887964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 44062341 - 44062525
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattc-agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | |    
T  44062341 aggttagtgtaaatttgagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtat 44062433  T
Q  196 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44062434 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcgatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaattt 44062525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27902228 - 27902480
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27902228 tgtatgtatataaaagggattagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatt-aagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 27902326  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||    
T  27902327 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtctacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttacgttca----atct-------aggtt 27902415  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27902416 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 27902480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 44062117 - 44062280
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||    
T  44062117 tgtatgtatacaaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtat-------ttaggttagtgtaaattcagtttact 44062209  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44062210 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 44062280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9869859 - 9869679
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||        || |||||| | ||    
T  9869859 aggttagtgtatattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaagtta--------tttgtttacgtatg 9869768  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9869767 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 9869679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12726021 - 12725816
Alignment:
Q  66 atgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  12726021 atgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaa 12725923  T
Q  166 tttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaat 265  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12725922 tttagtttagtgtaaattcagtttacatgt-------------atataagaggttagtgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaat 12725836  T
Q  266 taagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12725835 taagtttacttatgttcaat 12725816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Original strand, 3888259 - 3888447
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  3888259 aattcaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatagaggttagtgtaaattcagtttac 3888358  T
Q  192 atgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
     |  ||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3888359 ttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 3888447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12725848 - 12725634
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  12725848 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 12725750  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||     ||| |   || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12725749 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac----ttattttcaatct-------aggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatataggttaatg 12725661  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12725660 taaattaagtttacttatgttcaattt 12725634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18676358 - 18676133
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatta------------ 148  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||                
T  18676358 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattacgtttgtaaatt 18676260  T
Q  149 -agtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattca 247  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18676259 cagtttacttacgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttaa 18676171  T
Q  248 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676170 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 18676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5543942 - 5543715
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  5543942 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 5543844  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5543843 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 5543748  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543747 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5543715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 31622410 - 31622602
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  31622410 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttaattacg 31622509  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31622510 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31622602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31587520 - 31587294
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||     
T  31587520 ggttaatgcaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttccttatg 31587422  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt--atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || ||||  ||||| ||   || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31587421 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctagttaatgtaaat-tcagtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggt 31587326  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31587325 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31587294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Original strand, 27902484 - 27902708
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27902484 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaaatttacttata 27902582  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | |  ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27902583 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaa--tt--tgtaaattaagtttacttacgttcaatctagg 27902678  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27902679 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 27902708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 3887927 - 3888033
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3887927 tatgttcaatttaggttagtggaaattcagtttacttacgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattt 3888026  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  3888027 agtttac 3888033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 3888110 - 3888333
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  3888110 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaacctatgttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 3888208  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtta 257  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |  || |||    ||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  3888209 ttcaatctagg-taatgtaaattcagtttacgt-tcaatctaggttaatgtaaat-tcaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggtta 3888305  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3888306 atgtaaattcagtttacttaagttcaat 3888333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5543943 - 5543779
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  5543943 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 5543844  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543843 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 5543779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35598867 - 35598668
Alignment:
Q  77 aatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaat 176  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||| |  |||| ||  |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35598867 aatttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttaatttacttatgaacaatttagattaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaagttaat 35598768  T
Q  177 gtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||| |||| ||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35598767 gtaaattaagttaacat-----------atgtatataagaggttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacgt 35598679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41118202 - 41118076
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  41118202 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 41118104  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41118103 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 41118076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41118238 - 41118109
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  41118238 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 41118140  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41118139 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 41118109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18676202 - 18676010
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  18676202 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 18676103  T
Q  197 tatatagtatgt--atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |   || ||  || |||     |  ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676102 ttcaatctaggttaatgtaaattaattttgtaaattcagtttatttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18676010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 27902412 - 27902624
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  27902412 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 27902510  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |  ||        |  || |||   |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27902511 ttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttacgt--------tcaatctaa---gttaatgtaaattaaatttacttatattcaatctaggttaatg 27902599  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  27902600 taaattcagtttacttacgttcaat 27902624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40186345 - 40186181
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  40186345 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 40186246  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40186245 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 40186181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47020090 - 47019978
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47020090 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 47019991  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  47019990 aaattcagtttac 47019978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5544051 - 5543980
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544051 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5543980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12725812 - 12725598
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  12725812 ggttaatgtaaattcag-tttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatt 12725714  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |        | | |  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||  ||||||    
T  12725713 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactt--------actttcaatata---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaacttaatg 12725625  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12725624 taaattaagtttacttatgttcaattt 12725598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31587328 - 31587202
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||     
T  31587328 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatg 31587230  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31587229 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 31587202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18676395 - 18676301
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18676395 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 18676301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40186344 - 40186117
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  40186344 ggttagtgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 40186246  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40186245 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcaatttacttacgttcaatctagg 40186150  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40186149 ttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 40186117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 44291546 - 44291773
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||      
T  44291546 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 44291644  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44291645 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacctacgttcaatctagg 44291740  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44291741 ttaatgtaaactaagtttacttatgttcaattt 44291773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12725885 - 12725708
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  12725885 aggttagtgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttta---gt- 12725790  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
           || ||  |    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12725789 -------tacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttattttcaat 12725708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40430932 - 40430807
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  40430932 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 40430838  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40430837 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40430807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 44509157 - 44509321
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattc-agttcac 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||| ||||||||| |||| ||    
T  44509157 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatg-------taggttaatgtaaattcaagtttac 44509249  T
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
     || ||||||| || |||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44509250 gtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 44509321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31587556 - 31587429
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  31587556 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgcaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 31587458  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31587457 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 31587429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41118257 - 41118145
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41118257 tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 41118158  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  41118157 aaattaagtttac 41118145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5543779 - 5543692
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5543779 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 5543692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 12848825 - 12848896
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12848825 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 12848896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18676503 - 18676432
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676503 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18676432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31587358 - 31587271
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31587358 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 31587271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38742776 - 38742689
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38742776 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 38742689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38742976 - 38742905
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38742976 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 38742905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 44062186 - 44062257
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44062186 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 44062257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 44509372 - 44509498
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  44509372 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 44509470  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  44509471 ttaaatttacgttaatgtaaatttagtt 44509498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 47455435 - 47455506
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47455435 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 47455506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 3888074 - 3888203
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||      
T  3888074 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaacctatgttagtgtaaattcagtttacttacg 3888172  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3888173 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 3888203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9740747 - 9740661
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9740747 tgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagttta 9740661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40430864 - 40430662
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  40430864 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 40430777  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  40430776 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac--ttacattcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 40430685  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40430684 taaattaagtttacttatgttca 40430662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Original strand, 42076841 - 42077043
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  42076841 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 42076928  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  42076929 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 42077020  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42077021 taaattaagtttacttatgttca 42077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 284
Target Start/End: Original strand, 42697734 - 42697915
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  42697734 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 42697831  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta---cattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    | |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42697832 tctagatataaaaggttattgtaaattcagtttacttattcaattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 42697915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31587557 - 31587380
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  31587557 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgcaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 31587458  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31587457 ttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttccttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 31587380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 42076797 - 42076898
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42076797 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 42076896  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  42076897 ac 42076898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5543906 - 5543679
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  5543906 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 5543808  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  5543807 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 5543708  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543707 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5543679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18676054 - 18675954
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18676054 gttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagt 18675955  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  18675954 t 18675954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 44291545 - 44291709
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |    
T  44291545 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 44291644  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44291645 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 44291709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9741012 - 9740941
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9741012 aggttagtgtaaatttagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 9740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9870149 - 9870078
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9870149 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 9870078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 25105769 - 25105856
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25105769 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 25105856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31587347 - 31587236
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31587347 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 31587248  T
Q  179 aaatttagttta 190  Q
    ||||| ||||||    
T  31587247 aaattaagttta 31587236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31587665 - 31587594
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31587665 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactgatgttcaattt 31587594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Original strand, 31622538 - 31622617
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31622538 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatt 31622617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 3888415 - 3888523
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  3888415 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggtaa-tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatggaaattaagtttacttatg 3888512  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  3888513 ttcaatttagg 3888523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9869748 - 9869654
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9869748 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 9869654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9870030 - 9869944
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9870030 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 9869944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40186308 - 40186081
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  40186308 ggttaatataaatt-aagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 40186210  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt--acatgtgtatatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtta 257  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  | || |  || || | | ||  |    |||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||    
T  40186209 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaat-tcaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggtta 40186111  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40186110 atgtaaattaagtttacttatgttcaattt 40186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 44509371 - 44509465
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44509371 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 44509465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47020108 - 47020014
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47020108 aggttagtgtaaatccagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 47020014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5543768 - 5543659
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5543768 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 5543669  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  5543668 aaatttagtt 5543659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 12848933 - 12849026
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12848933 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcactttacttacattcaatataggttaatgtaaattaagttta 12849026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40186181 - 40186061
Alignment:
Q  67 tgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40186181 tgtaaattcaa-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 40186083  T
Q  167 ttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  40186082 ttacgttaatgtaaatttagtt 40186061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 25105769 - 25105833
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25105769 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 25105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 27902378 - 27902505
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  27902378 ttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtt 27902476  T
Q  163 caatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27902477 caatctaggttaatgtaaattcagtttac 27902505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38742776 - 38742712
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38742776 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 38742712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38742868 - 38742776
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38742868 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagattacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 38742776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 47455543 - 47455635
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47455543 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 47455635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9740904 - 9740821
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  9740904 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaa 9740821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 12848934 - 12849060
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||     
T  12848934 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcactttacttacattcaatataggttaatgtaaattaagtttatttatg 12849032  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12849033 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 12849060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18676074 - 18675987
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18676074 tgtaaattcagtttatttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 18675987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 25105468 - 25105563
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt-aagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25105468 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttac 25105563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 25105541 - 25105612
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25105541 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaagttcaattt 25105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41118239 - 41118168
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41118239 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 41118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47020071 - 47019945
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  47020071 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 47019973  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47019972 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 47019945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47020072 - 47020001
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47020072 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 47020001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47020216 - 47020145
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47020216 aggttagtgtaaatttagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 47020145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 3888378 - 3888471
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  3888378 aggttagtgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctagg-taatgtaaattcagtttac 3888471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 44062454 - 44062528
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44062454 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcgatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttagg 44062528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 25105780 - 25105889
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25105780 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctacgttaatgt 25105879  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  25105880 aaatttagtt 25105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 31622549 - 31622658
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31622549 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaattttacttatgttcaatttacgttaatgt 31622648  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  31622649 aaatttagtt 31622658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38742746 - 38742631
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  38742746 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttac-----atctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 38742653  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaat 182  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  38742652 ttcaatctaggttaatgtaaat 38742631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 47455635 - 47455755
Alignment:
Q  67 tgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47455635 tgtaaattcaa-tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 47455733  T
Q  167 ttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  47455734 ttacgttaatgtaaatttagtt 47455755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 3888456 - 3888520
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3888456 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatggaaattaagtttacttatgttcaattt 3888520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9869705 - 9869641
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869705 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 9869641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18676201 - 18675974
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  18676201 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 18676103  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt--acat---gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||  | ||   || ||| ||   |  || ||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  18676102 ttcaatctaggttaatgtaaattaattttgtaaattcagtttatttacgttcaattta---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggt 18676006  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676005 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18675974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31587484 - 31587258
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  31587484 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttccttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 31587386  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31587385 ttcaatctag-ttaatgtaaattcagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 31587287  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31587286 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31587258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 3887939 - 3888010
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887939 aggttagtggaaattcagtttacttacgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3888010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12726090 - 12725920
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-atgtgtatatagt------atgtatataaga 216  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||      ||||  |    |    
T  12726090 gttcaatttaggttattgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 12725991  T
Q  217 ggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12725990 ggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaattt 12725920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 12848969 - 12849040
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12848969 aggttaatgtaaattcactttacttacattcaatataggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 12849040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 27902647 - 27902734
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  27902647 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaagttaggttaaagtaaattaagtttac 27902734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41118259 - 41118096
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatat 212  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || |    
T  41118259 agtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------attt 41118168  T
Q  213 aagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41118167 a---ggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 44291709 - 44291796
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44291709 tgtaaattcagtttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 44291796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 47455635 - 47455722
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47455635 tgtaaattcaatttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttac 47455722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 3887976 - 3888178
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||     
T  3887976 ggtttatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatgta----------aattaagtttacttatg 3888064  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  3888065 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaacctatgttagtg 3888153  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  3888154 taaattcagtttacttacgttcaat 3888178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12725858 - 12725680
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  12725858 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagt 12725759  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||| | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725758 ttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaatttagtttacttattttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 12725680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18676394 - 18676273
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  18676394 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 18676296  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  18676295 ttcaatctaggttaatgtaaatt 18676273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 27902658 - 27902767
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||  || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27902658 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaagttaggttaaagtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 27902757  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  27902758 aaatttagtt 27902767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40430899 - 40430830
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40430899 gttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 40430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40430974 - 40430900
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40430974 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 40430900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 42076763 - 42076837
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42076763 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 42076837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 44291720 - 44291829
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44291720 tttacctacgttcaatctaggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 44291819  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  44291820 aaatttagtt 44291829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3111640 - 3111461
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||         
T  3111640 aggttagtatgaatttagtttagttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttatttatgttcaatttaagttaatgtaaattaattttac----- 3111546  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
          ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  3111545 ------gtatgtatataagagattagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatttatgttaatgtaaattaagcctacctaggttcaattt 3111461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9740903 - 9740683
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||      
T  9740903 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaa-------ttacttacg 9740812  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||   || |||    ||||| || | || |   |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9740811 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaactcagtttacttacgttcaatctagg 9740716  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9740715 ttaatgtaaattaagtttacttatattcaattt 9740683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9869747 - 9869640
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9869747 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 9869649  T
Q  161 ttcaattta 169  Q
    |||||||||    
T  9869648 ttcaattta 9869640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 31622411 - 31622638
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||      
T  31622411 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttaattacg 31622509  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31622510 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 31622609  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31622610 tgtaaattaattttacttatgttcaattt 31622638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 42076804 - 42076875
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42076804 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 42076875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 44509407 - 44509478
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44509407 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttaaattt 44509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35598739 - 35598645
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  35598739 aggttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacgtatgttcaatttagattagtgtacattaagtttac 35598645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 42076805 - 42076902
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42076805 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 42076902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3111749 - 3111569
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| ||  |||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||        
T  3111749 taggttaatgtaaattcagtttacgtatattcaatttagtttaatgtaaattcaatttacgtatgttaaatttaggttaacgtaaattaagtttac---- 3111654  T
Q  196 gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
           |||||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3111653 -------gtatgtttataagaggttagtatgaatttagtttagttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttatttatgttcaattt 3111569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3111821 - 3111698
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttca--atctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |   | || ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  3111821 ggttaatgtaatttcag-tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgtatatggtgtaggttaatgtaaattcagtttacgta 3111723  T
Q  159 tattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  3111722 tattcaatttagtttaatgtaaatt 3111698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40430899 - 40430803
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40430899 gttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 40430803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 42697732 - 42697824
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42697732 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 42697824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 25105693 - 25105769
Alignment:
Q  113 agttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25105693 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 25105769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 42697667 - 42697785
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  42697667 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 42697754  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697755 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42697785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 47455635 - 47455699
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47455635 tgtaaattcaatttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgtttaattt 47455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9740718 - 9740647
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9740718 aggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatgtttaattt 9740647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31587293 - 31587222
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31587293 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 31587222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40431147 - 40431080
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40431147 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40431080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 42076594 - 42076661
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42076594 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42076661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 42697657 - 42697724
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697657 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42697724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12725704 - 12725595
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||     
T  12725704 ggttaatgtaaattcag-tttacttactttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaacttaatgtaaattaagtttacttatg 12725606  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  12725605 ttcaatttagg 12725595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30888318 - 30888252
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30888318 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatataaattcagttta 30888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40431150 - 40431076
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40431150 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 40431076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 42076591 - 42076665
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42076591 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 42076665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 42697654 - 42697728
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42697654 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 42697728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9740736 - 9740627
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |    
T  9740736 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttatttatgtttaatttacgttaatat 9740637  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  9740636 aaatttagtt 9740627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18676359 - 18676290
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18676359 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 18676290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 25105798 - 25105867
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25105798 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 25105867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 42697763 - 42697832
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42697763 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 42697832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3111820 - 3111677
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagt 234  Q
    ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |         |||||| ||||||||||||    
T  3111820 gttaatgtaatttcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgtatatggtgt---------aggttaatgtaaattcagt 3111730  T
Q  235 ttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| || ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  3111729 ttacgtatattcaatttagtttaatgtaaattcaatttacgtatgttaaattt 3111677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 25105713 - 25105769
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25105713 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 25105769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35598896 - 35598820
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35598896 gtatgtatataagaggttagtgtgaatttaatttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttaatttacttatg 35598820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40430865 - 40430801
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40430865 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 40430801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40431138 - 40431074
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40431138 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 40431074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 42076603 - 42076667
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42076603 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 42076667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 42076840 - 42076904
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42076840 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 42076904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 42077136 - 42077184
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42077136 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42077184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 42697666 - 42697730
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42697666 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 42697730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 42697764 - 42697905
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatct---------atgttaatgaaaattaagt 151  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||         | |||| || ||||| |||    
T  42697764 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctagatataaaaggttattgtaaattcagt 42697862  T
Q  152 ttacttat---attcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697863 ttacttattcaattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 42697905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Original strand, 47455667 - 47455735
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47455667 ttaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 47455735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18676044 - 18675954
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  18676044 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 18675954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Original strand, 25105693 - 25105748
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25105693 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 25105748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 27902676 - 27902747
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27902676 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaagttaggttaaagtaaattaagtttacttatgttcaattt 27902747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30888317 - 30888274
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30888317 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30888274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40430658 - 40430598
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40430658 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 40430598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 42077131 - 42077194
Alignment:
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42077131 agtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 42077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 44291738 - 44291809
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44291738 aggttaatgtaaactaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 44291809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47020036 - 47019965
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47020036 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 47019965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 25105695 - 25105769
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  25105695 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 25105769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 42076908 - 42076970
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42076908 tgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 42076970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 42697734 - 42697796
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42697734 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 42697796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38742711 - 38742647
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38742711 aggttaatgtaaattaagtttacttacat-----ctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 38742647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38742747 - 38742686
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38742747 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttactta 38742686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40430600 - 40430547
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40430600 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttac 40430547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Original strand, 47455586 - 47455635
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47455586 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 47455635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38742765 - 38742658
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      || |||||||||||    
T  38742765 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttactta-----catctaggttaatgt 38742671  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  38742670 aaattaagtttac 38742658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38742867 - 38742776
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38742867 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagattacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 38742776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38742832 - 38742776
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38742832 aggttaatgtaaattaagattacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 38742776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 47455544 - 47455635
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47455544 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctagtttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 47455635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3111529 - 3111446
Alignment:
Q  100 ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3111529 ttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatttatgttaatgtaaattaagcctacctaggttcaatttaggttagtgtaaatt 3111446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Original strand, 3887957 - 3888044
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3887957 tttacttacgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 3888044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12726093 - 12726022
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttact 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  12726093 tatgttcaatttaggttattgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact 12726022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38742681 - 38742585
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaa----gtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38742681 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaataaattaggtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaattaagtt 38742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38742680 - 38742605
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt----aaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  38742680 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaataaattaggtttacttatgttcaattt 38742605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 3888265 - 3888361
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  | |||| || ||||| ||||||||||    
T  3888265 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaagttcaatagaggttagtgtaaattcagtttactta 3888361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 3888414 - 3888482
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3888414 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctagg-taatgtaaattcagtttacttacgttcaat 3888482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 25105649 - 25105735
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||        ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25105649 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtta--------taagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 25105735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40430598 - 40430537
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40430598 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 40430537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3111822 - 3111758
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3111822 aggttaatgtaatttcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgt 3111758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30888372 - 30888234
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||             |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||    
T  30888372 tgtatatatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaa-------------tatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttact 30888286  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggt 172  Q
    || ||||||| || ||||||  ||||| |||||| |||  |||||| |||||    
T  30888285 tatgttcaatttaggttaatataaattcagtttatttacgttcaatctaggt 30888234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40431146 - 40431103
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40431146 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 40431103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 42076595 - 42076638
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42076595 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42076638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 42077047 - 42077107
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  42077047 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagctgacttatgttcaat 42077107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 42697658 - 42697701
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697658 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42697701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47020000 - 47019945
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  47020000 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 47019945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3111747 - 3111654
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || || || ||| ||| || ||||| | |||||||||||||    
T  3111747 ggttaatgtaaattcag-tttacgtatattcaatttagtttaatgtaaattcaatttacgtatgttaaatttaggttaacgtaaattaagtttac 3111654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 25105504 - 25105574
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattca-gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25105504 aggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaat 25105574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 9741058 - 9741021
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatg 58  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9741058 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatg 9741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Original strand, 12848868 - 12848925
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12848868 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 12848925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40430655 - 40430609
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40430655 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 40430609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 42077131 - 42077200
Alignment:
Q  102 agtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  42077131 agtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 42077200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Original strand, 3888301 - 3888364
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3888301 ggttaatgtaaattcag-tttacttaagttcaatagaggttagtgtaaattcagtttacttacgt 3888364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Original strand, 27902266 - 27902302
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27902266 taggttaatgtaaattaagtttacgtatgttcaattt 27902302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40430940 - 40430879
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  40430940 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat----gttaatgtaaattcagtttac 40430879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35598702 - 35598648
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  35598702 ggttaatgtaaatt-aagtttacgtatgttcaatttagattagtgtacattaagtt 35598648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40430598 - 40430531
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  40430598 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 40430531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Original strand, 42076691 - 42076762
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  42076691 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 42076762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3111616 - 3111546
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  3111616 tatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttatttatgttcaatttaagttaatgtaaattaattttac 3111546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3111918 - 3111846
Alignment:
Q  169 aggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatat---agtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3111918 aggttagtgtaaattcagtttacttatgtacatgaaagtatgtatatgagaggttagtgtaaattaagtttac 3111846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 3888042 - 3888072
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3888042 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3888072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9741032 - 9740990
Alignment:
Q  149 agtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9741032 agtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaatttagtttac 9740990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9869940 - 9869887
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9869940 gttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 9869887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9869994 - 9869944
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  9869994 aggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 9869944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35598883 - 35598797
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||| |||| | || ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  35598883 aggttagtgtgaatttaatttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttaatttacttatgaacaatttagattaatgtaaatt 35598797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38742623 - 38742569
Alignment:
Q  233 gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38742623 gtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaattaagttgacgtatgttcaattt 38742569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40430600 - 40430570
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40430600 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 40430570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40431137 - 40431019
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  40431137 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 40431050  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40431049 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 40431019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 42076604 - 42076722
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac---tt 157  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||           ||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  42076604 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact-----------tatgtcaatgtaaattaagtttacttatt 42076691  T
Q  158 atattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42076692 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 42076722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 129
Target Start/End: Original strand, 42077144 - 42077194
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  42077144 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 42077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 42697732 - 42697762
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697732 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42697762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Original strand, 25105836 - 25105889
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25105836 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctacgttaatgtaaatttagtt 25105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40430600 - 40430537
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  40430600 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 40430537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 186
Target Start/End: Original strand, 42077050 - 42077091
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttag 186  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42077050 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttag 42077091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 287
Target Start/End: Original strand, 42077133 - 42077161
Alignment:
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42077133 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 42077161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 479)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28554989 - 28554725
Alignment:
Q  23 tatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  28554989 tatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgcaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttg 28554890  T
Q  123 cgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554889 cgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgagtgtatatagtatgtatataagaggttag 28554790  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28554789 tttaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 28554725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 27449799 - 27450054
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27449799 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 27449898  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  27449899 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 27449987  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449988 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27450054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37126461 - 37126208
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37126461 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 37126362  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  37126361 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 37126273  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37126272 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 37126208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 37821369 - 37821622
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37821369 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 37821468  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  37821469 tacattcaatctaggttaatgtaagttaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 37821557  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37821558 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 37821622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 10659838 - 10660091
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10659838 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 10659937  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  10659938 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 10660026  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10660027 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 10660091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20607521 - 20607268
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20607521 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 20607422  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||     
T  20607421 tacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtc 20607333  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20607332 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 20607268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 2446269 - 2446509
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2446269 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 2446368  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  2446369 tacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttattttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 2446457  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446458 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 2446509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 51754731 - 51754971
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51754731 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 51754830  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  51754831 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 51754919  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51754920 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagttt 51754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 24349111 - 24349356
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24349111 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 24349210  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||    
T  24349211 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtttac-----------ttatgtatataagaggtt 24349299  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349300 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 24349356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 46528406 - 46528651
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46528406 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtacgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 46528505  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  46528506 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 46528594  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46528595 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 46528651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 3019509 - 3019761
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3019509 tgtatgtatataaaaggg-ttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 3019607  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  3019608 tacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttagttatgttcaatttagattaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 3019696  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3019697 agtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 3019761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5273401 - 5273148
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5273401 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 5273302  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  5273301 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtgtgtatataagaggtt 5273213  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5273212 actgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 5273148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 24406087 - 24406340
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24406087 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagattaatgtaaattcaagtttatgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 24406186  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  24406187 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 24406275  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24406276 agtgtaaattcagtttgcttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 24406340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1546005 - 1545751
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaa-ttcagttcac 119  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  1546005 tgtatgtatataaaacgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttagattagtgtaaaattcagtttac 1545906  T
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  1545905 ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaatttagtttaca-----------tatgtatataagaggt 1545817  T
Q  220 tagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1545816 tagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 1545751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26975305 - 26975052
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26975305 tgtatgtatataaaagaggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 26975206  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| |||    
T  26975205 tacattcaatctaggttaatttaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagatgtt 26975117  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26975116 agtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 26975052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 38252827 - 38253079
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38252827 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatttaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 38252926  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |    
T  38252927 tacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagagg-t 38253014  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38253015 agtgtaaattaagtttaatgacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 38253079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 31655351 - 31655629
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31655351 tgtatgtatataaaaggggttagtgtactttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 31655450  T
Q  121 tacgtt----------------------caatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    ||||||                      |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31655451 tacgttgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtata 31655550  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655551 tatagtatgtatataagaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttactta 31655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 47698072 - 47698242
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47698072 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 47698171  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47698172 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 47698242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51166998 - 51166828
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  51166998 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaagttagtgtaaattcagtttact 51166899  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51166898 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 51166828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8828329 - 8828144
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8828329 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattgagtttacttatgttcaatttaggtcaatgtaaatttagtt 8828230  T
Q  189 tacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8828229 tac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttgatgtaaattaagtttacttatgttcaat 8828144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12227610 - 12227392
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  12227610 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 12227512  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||| |  |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12227511 ttcaatataggttagtgtaaattcaatttacttacgc-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 12227417  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12227416 taaattaagtttacttatgttcaat 12227392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43973050 - 43972884
Alignment:
Q  23 tatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43973050 tatgtatataaaagtggttagtgtagtttacgtacgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttactta 43972951  T
Q  123 cgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43972950 tgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 43972884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287548 - 13287764
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||      
T  13287548 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat--aggttaatgtaaattaattttacttacg 13287644  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13287645 ttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 13287739  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13287740 taaattaagtttacttatgttcaat 13287764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 31655568 - 31655745
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||       |||||||||| | ||    
T  31655568 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcagtctaggttaatgtaaattaagtttactta------atttaggtta-------tttagtttacgtatg 31655654  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655655 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31655745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28554796 - 28554610
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  28554796 aggttagtttaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 28554704  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagt---gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28554703 tatatagtatgtatataagaggttagtagtgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 28554610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55273945 - 55273729
Alignment:
Q  60 gggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  55273945 gggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttat 55273846  T
Q  160 attcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaat 259  Q
     |||||| || ||||||||||||| || |||| | |||          || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  55273845 gttcaatctatgttaatgtaaattcaggttacttatgt----------taaat-ctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggataat 55273757  T
Q  260 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55273756 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 55273729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8828433 - 8828263
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8828433 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacggatgtttaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8828334  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
     || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  8828333 cacattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattgagtttac 8828263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 272
Target Start/End: Original strand, 24349644 - 24349815
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24349644 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagttt 24349743  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24349744 ac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatataaattaagttt 24349815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41113874 - 41113668
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  41113874 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacctatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttca 41113776  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41113775 atttaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 41113689  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    || |||||| ||| |||||||    
T  41113688 ttcagtttagttacgttcaat 41113668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 272
Target Start/End: Original strand, 46528935 - 46529106
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46528935 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagttt 46529034  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46529035 ac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatataaattaagttt 46529106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 281
Target Start/End: Original strand, 13287355 - 13287540
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  13287355 tcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagttt 13287454  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    || | |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13287455 acttatgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaattaagtttatttatgtt 13287540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 46528795 - 46529013
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  46528795 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 46528893  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    ||  || |   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46528894 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atcaatct---aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatg 46528986  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46528987 taaattaagtttacttatgttcaattt 46529013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8068343 - 8068174
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||    
T  8068343 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttattgtaaattaagtttact 8068245  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8068244 tattttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 8068174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51166885 - 51166658
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  51166885 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 51166787  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacat---gtgtatatag--ta-tgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |    |  || |||  || |||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51166786 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttactgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 51166691  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51166690 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51166658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10471175 - 10471039
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  10471175 tgtatgtatataaaatgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaatttaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagcttatt 10471076  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10471075 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 10471039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 44378448 - 44378591
Alignment:
Q  118 acttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagag 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  44378448 acttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttgcttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagag 44378536  T
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44378537 gttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 44378591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 24349504 - 24349722
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  24349504 ggttaatgtaaattcag-tttatttaagttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 24349602  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    ||  || ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24349603 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atcaatcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 24349695  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24349696 taaattaagtttacttatgttcaattt 24349722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 3019729 - 3019955
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  3019729 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 3019827  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3019828 ttcaatata-gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 3019922  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3019923 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 3019955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 13287695 - 13287887
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  13287695 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 13287794  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13287795 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 13287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 26229775 - 26229904
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26229775 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 26229873  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26229874 ttcaatataggttaatgtaaatttagtttac 26229904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Original strand, 26229913 - 26230122
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  26229913 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatcta-gttaatgtaaattcagtttacttactttca 26230010  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26230011 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atct-------agattaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaa 26230099  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26230100 ttaagtttaattatgttcaattt 26230122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12227623 - 12227517
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12227623 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattt 12227524  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  12227523 agtttac 12227517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 13287199 - 13287328
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  13287199 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 13287297  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13287298 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 13287328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37126276 - 37126049
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  37126276 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 37126178  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37126177 ttcaatctaggttaatgtatattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 37126082  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126081 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37126049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 26229707 - 26229915
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26229707 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 26229805  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26229806 atctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaa 26229894  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  26229895 tttagtttacttatgttcaat 26229915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20607319 - 20607109
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20607319 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgt 20607220  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20607219 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagttt 20607124  T
Q  273 acttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||    
T  20607123 acttatgttcaattt 20607109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113736 - 41113522
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  41113736 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 41113638  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||  |    || |       || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41113637 ttcaatctagattaatgtaaatttagtttacttatgttca----atct-------agattaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatg 41113549  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41113548 taaattaagtttacttaagttcaattt 41113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8828176 - 8827961
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||     
T  8828176 ggttgatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaat---gtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattgaggttacttatg 8828081  T
Q  161 ttcaattt-aggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctag-----g 254  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     |    
T  8828080 ttcaattttaagtcaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttagg 8827992  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8827991 ttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 8827961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 23151404 - 23151533
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  23151404 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttatg 23151502  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23151503 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 23151533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 43219226 - 43219355
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  43219226 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttacttatg 43219324  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219325 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 43219355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 44378090 - 44378196
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaa-tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcac 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44378090 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaagtttatgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttac 44378189  T
Q  120 ttacgtt 126  Q
    |||||||    
T  44378190 ttacgtt 44378196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Original strand, 23151313 - 23151510
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23151313 tttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaaattcaatctaggttaatgt 23151412  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    ||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23151413 aaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttat 23151501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 10660023 - 10660243
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  10660023 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 10660121  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| |   | |  |   |||| || | || |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10660122 ttcaatctaagttaatgtaaattcagtttacttacat-tcaatcttgtaaatta-agtt---tgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatg 10660216  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10660217 taaattaagtttacttatgttcaattt 10660243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 37821553 - 37821745
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt--tacat- 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  || ||     
T  37821553 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttgtaaatt 37821652  T
Q  194 --gtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
      || ||| ||   |  || |   |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37821653 cagtttatttacgttcaatct---aggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37821745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 41457121 - 41457300
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||         
T  41457121 aggttagtgtgaatttagttcacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatttaggttaatgtaaattcagtttac----- 41457215  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
          ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41457216 ------gtatgtatataagagattagcgtgaattcaatttacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagcttacgtatgttcaattt 41457300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 272
Target Start/End: Original strand, 35923062 - 35923240
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |      
T  35923062 taggttagtgtaaattcagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttac 35923161  T
Q  196 gt---atata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||   ||||| ||   |||| |  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35923162 gttcaatataggttaatataaattaagtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 35923240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 13287186 - 13287292
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||     
T  13287186 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta 13287285  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  13287286 agtttac 13287292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 285
Target Start/End: Original strand, 23151125 - 23151207
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23151125 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 23151207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 26230016 - 26230145
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  26230016 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctagattaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaattatg 26230114  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26230115 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 26230145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Original strand, 3019693 - 3019891
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  3019693 ggttagtgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 3019791  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||        |  |||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3019792 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt--------tcaatata----gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 3019879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10048628 - 10048511
Alignment:
Q  74 tcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggtt 173  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10048628 tcaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtt 10048529  T
Q  174 aatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |||||||    
T  10048528 aatgtaaattaagtttac 10048511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 23151047 - 23151302
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaattta---------------ggttagtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  || | ||||               ||||||||    
T  23151047 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgtaaatttagtttacgtatgtatataagaggttagtg 23151146  T
Q  106 taaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagta 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||  |    |    
T  23151147 taaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttatgttca----a 23151242  T
Q  206 tgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    | |       |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23151243 tct-------aggttaatttaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 23151302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20607337 - 20607173
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  20607337 aggtcagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 20607238  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607237 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 20607173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37126277 - 37126113
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  37126277 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 37126178  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126177 ttca----atct-------aggttaatgtatattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 37126113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43972668 - 43972541
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  43972668 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 43972570  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43972569 ttcaatataggttaatgtaaattaagttt 43972541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5273325 - 5273254
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273325 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5273254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 10659914 - 10659985
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659914 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10659985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 24349187 - 24349258
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349187 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24349258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 24406271 - 24406450
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  24406271 aggttagtgtaaattcagtttgcttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta---gt- 24406366  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
           || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406367 -------tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24406450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 26229945 - 26230158
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26229945 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctag-ttaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 26230042  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||         || | |  || |   |||||| |||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  26230043 ttcaatctagattaatgtaaattcagtttac--------ttactttcaatct---aggttaatgtaaattaagtttaattatgttcaatttaggttaatg 26230131  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26230132 taaattaagtttacttatgttcaattt 26230158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37126385 - 37126314
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126385 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37126314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 280
Target Start/End: Original strand, 44378309 - 44378527
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  44378309 ggttaatgtaaatt-aagtttacttaagttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 44378407  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||  |   |||||  |    |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  44378408 ttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttgcttatgttcaatttaggttaatg 44378507  T
Q  261 taaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  44378508 taaatttagtttacgtatgt 44378527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 46528482 - 46528553
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46528482 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 46528553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1545819 - 1545594
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  1545819 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 1545721  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  | || | ||  || || ||    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1545720 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaatttagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctagattaa 1545621  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1545620 tgtaaattaagtttacttctgttcaat 1545594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 9746422 - 9746551
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9746422 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 9746520  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  9746521 ttcaatctatgttaatgtaaattcagtttac 9746551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 22497746 - 22497875
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||     
T  22497746 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttactaatg 22497844  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22497845 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22497875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 24349468 - 24349597
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  24349468 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttatttaagttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacc 24349566  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24349567 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 24349597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 24406308 - 24406437
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  24406308 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 24406406  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24406407 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 24406437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 24406344 - 24406473
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  24406344 ggttaatgtaaatt-aagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 24406442  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24406443 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 24406473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 27449983 - 27450077
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27449983 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagcttaatgtaaattaagtttac 27450077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Original strand, 9746277 - 9746401
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9746277 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttca 9746375  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  9746376 atctaggttaatgtaaattcagttta 9746401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10471027 - 10470891
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagttta 237  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10471027 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaatttaatttac-----------gtatgtatataagaggttaatgtaaattaagttta 10470939  T
Q  238 cttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  10470938 cttacgttcaatctaggttaatataaattcagtttacttacgttcaat 10470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43972687 - 43972478
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43972687 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgt 43972588  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||| ||||||| |  ||   ||||||    ||||| || | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43972587 aaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaatta-agttt--ggtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 43972491  T
Q  273 acttatgttcaat 285  Q
    ||||| |||||||    
T  43972490 acttacgttcaat 43972478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51166920 - 51166851
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51166920 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51166851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1545681 - 1545471
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  1545681 tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttctgttcaatctaggttaatgt 1545582  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||| | ||||| |  ||   || |||    ||||| || |   |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545581 aaattaaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaa--gtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 1545486  T
Q  273 acttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||    
T  1545485 acttatgttcaattt 1545471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1545820 - 1545630
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  1545820 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 1545721  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1545720 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaatttagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 1545630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 9746345 - 9746564
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttac-----gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||     |||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  9746345 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcagttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 9746443  T
Q  156 ttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||         || | |  || |   |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  9746444 ttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac--------ttactttcaatct---aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgt 9746532  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9746533 taatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 9746564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 23151332 - 23151546
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  23151332 ggttactgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaaattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 23151430  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||            || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23151431 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac-----------ttacgttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatg 23151519  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23151520 taaattaagtttacttatgttcaattt 23151546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 285
Target Start/End: Original strand, 24349433 - 24349644
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||  |    
T  24349433 gttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttatttaagt 24349531  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt 261  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||     ||  |   || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24349532 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttac----ttaccttcaatct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 24349620  T
Q  262 aaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24349621 aaattaagtttacttatgttcaat 24349644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41113611 - 41113499
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41113611 tttacttatgttcaatctagattaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatttaggttaatgt 41113512  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  41113511 aaattaagtttac 41113499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1545535 - 1545448
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1545535 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 1545448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12227461 - 12227284
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  12227461 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 12227362  T
Q  197 t---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12227361 ttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 12227284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20607445 - 20607374
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607445 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20607374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 285
Target Start/End: Original strand, 24349423 - 24349608
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24349423 ttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtt 24349522  T
Q  189 tacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||    | ||   ||| |  || |   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24349523 ta----ttta---agt-tcaatct---aggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 24349608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 24349815 - 24349902
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24349815 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 24349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 24406163 - 24406234
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24406163 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaattt 24406234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 24406380 - 24406506
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  24406380 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 24406478  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24406479 ttaaatttacgttaatgtaaatttagtt 24406506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26975229 - 26975158
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26975229 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatttaaattaagtttacttatgttcaattt 26975158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 33583919 - 33584006
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33583919 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 33584006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37126113 - 37126026
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37126113 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 37126026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 37821445 - 37821516
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37821445 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaagttaagtttacttatgttcaattt 37821516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 38252903 - 38252974
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38252903 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaattt 38252974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51166722 - 51166635
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51166722 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 51166635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 51754807 - 51754878
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754807 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51754878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 51754971 - 51755058
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51754971 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 51755058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55273907 - 55273693
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  55273907 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcaggttacttatg 55273809  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |        || || ||   || |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  55273808 ttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttca--------atttagga---taatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatg 55273720  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  55273719 taaattaagtttacttatgttcaattt 55273693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10048988 - 10048882
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  10048988 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatcttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattc 10048889  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  10048888 agtttac 10048882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 10660022 - 10660116
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10660022 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 10660116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Original strand, 23151302 - 23151472
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||     || ||      
T  23151302 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac----ttaaattc 23151397  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
     || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23151398 aatct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 23151472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 24349295 - 24349389
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24349295 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 24349389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Original strand, 43219298 - 43219500
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  43219298 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 43219385  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  43219386 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatg 43219477  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43219478 taaattaagtttacttatgttca 43219500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 44378215 - 44378289
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44378215 gtatgtatataagaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 44378289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10048939 - 10048814
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  10048939 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttac----aatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 10048845  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  10048844 ttcaatctagattaatgtaaattcagtttac 10048814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 35923063 - 35923132
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35923063 aggttagtgtaaattcagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 35923132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 38253149 - 38253258
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38253149 tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 38253248  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  38253249 aaatttagtt 38253258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 47698148 - 47698217
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47698148 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 47698217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5273125 - 5272940
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    |||  ||  ||    
T  5273125 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtt----tgtaaattcag 5273030  T
Q  204 tatgtata---taa---gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |   ||   |||    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273029 tttccttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5272940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8827848 - 8827748
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8827848 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagt 8827749  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  8827748 t 8827748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 24406298 - 24406486
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  24406298 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 24406397  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24406398 ttacttacgttca----attt-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttaaattt 24406486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51166849 - 51166622
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  51166849 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttaca 51166751  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  51166750 ttcaatctaggttactgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 51166651  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51166650 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51166622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51166894 - 51166722
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51166894 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtt 51166795  T
Q  189 tacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||| | |||  |    || |       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51166794 tacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttactgtaaattaagttt 51166722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 3019891 - 3019978
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3019891 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 3019978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 10660179 - 10660266
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10660179 tgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 10660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 13287234 - 13287305
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13287234 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 13287305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 23151440 - 23151566
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  23151440 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 23151538  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23151539 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 23151566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 287
Target Start/End: Original strand, 33583814 - 33583983
Alignment:
Q  120 ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatata 213  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||   || |||    ||||| ||     
T  33583814 ttacgttcaatcttggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 33583913  T
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33583914 aa--gtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33583983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 35923240 - 35923327
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35923240 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 35923327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 38253138 - 38253225
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38253138 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 38253225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113700 - 41113486
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||     
T  41113700 ggttaatgtaaattcag-tttagttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctagattaatgtaaatttagtttacttatg 41113602  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |        | | |  || ||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  41113601 ttcaatctagattaatgtaaattcagtttactt--------actttcaatctaag---ttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatttaggttaatg 41113513  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41113512 taaattaagtttacttatgttcaattt 41113486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 44378591 - 44378678
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44378591 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtgtacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 44378678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 285
Target Start/End: Original strand, 46528692 - 46528899
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||  |    
T  46528692 gttaatgtaaatt-aagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatc----ttaatgtaaattaagtttacttacct 46528786  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgt 261  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46528787 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttatttacgttcaatctaggttaatgt 46528875  T
Q  262 aaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  46528876 aaattaagtttacttacgttcaat 46528899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 55273799 - 55273673
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  55273799 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatttaggataatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 55273701  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  55273700 ttcaatttacattaatgtaaatttagtt 55273673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 3019692 - 3019786
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3019692 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 3019786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10048768 - 10048635
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |    
T  10048768 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----g 10048674  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048673 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttac 10048635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 22497710 - 22497839
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||      
T  22497710 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttacttacg 22497808  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22497809 ttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttac 22497839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 24349296 - 24349417
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  24349296 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 24349394  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  24349395 ttcaatctaggttaatgtaaatt 24349417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 26229739 - 26229868
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  26229739 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 26229837  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26229838 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 26229868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41113737 - 41113643
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41113737 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 41113643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 46528590 - 46528676
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  46528590 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaatt 46528676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 48478177 - 48478271
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48478177 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 48478271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019450 - 53019544
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019450 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 53019544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1545524 - 1545415
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1545524 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 1545425  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  1545424 aaatttagtt 1545415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1545918 - 1545857
Alignment:
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545918 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1545857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8828213 - 8828128
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaat 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8828213 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttgatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaat 8828128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 10660190 - 10660299
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10660190 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 10660289  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  10660290 aaatttagtt 10660299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12227611 - 12227542
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12227611 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 12227542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 24349652 - 24349879
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||     
T  24349652 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtttacgtatg 24349750  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt--gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |  |    |||||| |||||||| ||||||| | |||  |   || ||  |||  |  | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24349751 tatataagaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatataaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaa 24349850  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349851 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24349879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 287
Target Start/End: Original strand, 38253014 - 38253202
Alignment:
Q  101 tagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtata 200  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    
T  38253014 tagtgtaaattaagtttaatgacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca 38253113  T
Q  201 tagtatgtatataagaggttag--tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
       || ||  ||   |  | ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253114 atctaggttaatgtaaattcagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 38253202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 38253037 - 38253238
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  38253037 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagt 38253136  T
Q  188 ttacatgtgta-tata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||  |  |  | | ||  || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253137 ttgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 38253236  T
Q  286 tt 287  Q
    ||    
T  38253237 tt 38253238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51166711 - 51166602
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51166711 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 51166612  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  51166611 aaatttagtt 51166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 51754982 - 51755091
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51754982 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 51755081  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  51755082 aaatttagtt 51755091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 2446522 - 2446586
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446522 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2446586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12227284 - 12227220
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12227284 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 12227220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20607173 - 20607089
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20607173 tgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 20607089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20607300 - 20607173
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  20607300 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 20607202  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20607201 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 20607173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 24349368 - 24349564
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||        | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  24349368 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcag--------cattcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacg 24349458  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||        |  ||||   |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24349459 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt--------tcaatat---aggttaatgtaaattcagtttatttaagttcaatctaggttaatg 24349547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37126240 - 37126013
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||      
T  37126240 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtatattcagtttacttacg 37126142  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  37126141 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 37126042  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126041 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 37126013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 46529106 - 46529170
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46529106 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatataaattaagtttacttatgttcaattt 46529170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 51754971 - 51755035
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754971 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51755035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 2446345 - 2446416
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2446345 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttattttcaattt 2446416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 2446522 - 2446609
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2446522 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtgaattaagtttac 2446609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 3019584 - 3019655
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3019584 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttagttatgttcaattt 3019655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8068304 - 8068233
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8068304 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttattgtaaattaagtttacttattttcaattt 8068233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10048605 - 10048534
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048605 aggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10048534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 27449984 - 27450110
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||     
T  27449984 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagcttaatgtaaattaagtttacttatg 27450082  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27450083 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 27450110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 46529106 - 46529193
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46529106 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 46529193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 13287476 - 13287569
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13287476 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaattaagtttatttatgttaaatctaggttaatgtaaattcagtttac 13287569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37126102 - 37125996
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37126102 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 37126003  T
Q  179 aaattta 185  Q
    |||||||    
T  37126002 aaattta 37125996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804318 - 49804224
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804318 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49804224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 3019902 - 3020011
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  3019902 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctacgttaatgt 3020001  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  3020002 aaatttagtt 3020011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8828357 - 8828288
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8828357 aggttagtgtaaattcagtttactcacattcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 8828288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10048871 - 10048768
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  10048871 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctagattaatgtaaattcagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaattaagtttacttatg 10048774  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  10048773 ttcaat 10048768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287198 - 13287267
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13287198 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 13287267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 22497702 - 22497803
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  22497702 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagttt 22497801  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  22497802 ac 22497803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Original strand, 22497877 - 22498020
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattc 231  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||||||||||||||||||||    
T  22497877 tatgtgaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattc 22497974  T
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22497975 agtttac------tcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttca 22498020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 24349331 - 24349400
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349331 aggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 24349400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 24349826 - 24349935
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  24349826 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttgatgt 24349925  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  24349926 aaatttagtt 24349935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 33583930 - 33584039
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  33583930 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttacgttaatgt 33584029  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  33584030 aaatttagtt 33584039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 43219218 - 43219319
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43219218 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagttt 43219317  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  43219318 ac 43219319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 44378602 - 44378711
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44378602 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtgtacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 44378701  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  44378702 aaatttagtt 44378711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1545662 - 1545435
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||      
T  1545662 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttctgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacg 1545564  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | ||  || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1545563 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaa 1545464  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545463 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1545435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10048975 - 10048768
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  10048975 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatcttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta-- 10048879  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10048878 --caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca--------atcta---gattaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctag-ttaatg 10048793  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10048792 taaattaagtttacttatgttcaat 10048768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10470868 - 10470784
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10470868 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 10470784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12227424 - 12227333
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12227424 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 12227333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 13287696 - 13287823
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  13287696 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 13287794  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13287795 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 13287823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 31655674 - 31655746
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31655674 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 31655746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 33583828 - 33583919
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33583828 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 33583919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 35923240 - 35923304
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35923240 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35923304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 44378591 - 44378655
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44378591 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtgtacttatgttcaattt 44378655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8827867 - 8827781
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8827867 tgtaaattcagttta-ttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaattaagtttac 8827781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8828321 - 8828250
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8828321 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattgagtttacttatgttcaattt 8828250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 43219218 - 43219361
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        |||||   ||||| |||    
T  43219218 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atata---ggttaatgt 43219306  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43219307 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 43219361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43972976 - 43972905
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43972976 aggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 43972905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5273217 - 5273131
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5273217 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 5273131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 9746458 - 9746567
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  9746458 ggttaatgtaaattcag-tttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcagtttacttatg 9746556  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  9746557 ttcaatttagg 9746567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 13287513 - 13287631
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13287513 gttaatgtaaatt-aagtttatttatgttaaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgt 13287611  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  13287612 tcaa--taggttaatgtaaatt 13287631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26975119 - 26975029
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26975119 gttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26975029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49804317 - 49804220
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  49804317 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 49804220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10048976 - 10048907
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10048976 aggttagtgtaaattaagtttacttatcttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaat 10048907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287547 - 13287616
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13287547 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 13287616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 22497709 - 22497778
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22497709 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 22497778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 23151174 - 23151243
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23151174 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctagcttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 23151243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26975029 - 26974948
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattta 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  26975029 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttctatttacgttaatgtaaattta 26974948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 35923251 - 35923360
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  35923251 tttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacattaatgt 35923350  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  35923351 aaatttagtt 35923360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Original strand, 37821665 - 37821762
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattta 185  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37821665 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaattta 37821762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 41454614 - 41454691
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41454614 gtatgtatatgagaggttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgt 41454691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 41457020 - 41457192
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||           |    
T  41457020 tgtaaattcagtttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgttaaatttagattaacgtaaattaagtttac-----------g 41457108  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41457109 tatgtttataagaggttagtgtgaatttagttcacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaattt 41457192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 43219184 - 43219258
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219184 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 43219258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43972698 - 43972541
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||  |       
T  43972698 tgtaaatgtagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttca--- 43972602  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
     || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43972601 -atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagttt 43972541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43972769 - 43972600
Alignment:
Q  118 acttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tata-gtatgtatataag 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |||| | ||  || ||  |        
T  43972769 acttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagtttgtaaatgtagtttacttacgttcaatct 43972670  T
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43972669 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaat 43972600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 44378344 - 44378413
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44378344 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 44378413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Original strand, 53019686 - 53019755
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019686 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 53019755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5273012 - 5272921
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273012 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta-gttaatgtaaatttagtt 5272921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8827996 - 8827804
Alignment:
Q  95 ttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatg 194  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||| |     
T  8827996 ttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtcaatgtaaatcaagtttacttatgtt-aatctaggttaatataaattcagtttactta 8827898  T
Q  195 tgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     ||   || |||    ||||| || | || |   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8827897 cgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagttta-ttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8827804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10048604 - 10048497
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  10048604 ggttaatgtaaattcag-tttacttactttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 10048506  T
Q  161 ttcaattta 169  Q
    |||||||||    
T  10048505 ttcaattta 10048497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10470868 - 10470804
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10470868 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 10470804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12227433 - 12227333
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12227433 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtt 12227334  T
Q  189 t 189  Q
    |    
T  12227333 t 12227333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26975029 - 26974965
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26975029 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttctattt 26974965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43972394 - 43972306
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttta-cttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43972394 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaccttatgttaaatttaggttaatataaattaagtttac 43972306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 44378380 - 44378448
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44378380 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatccaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 44378448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 47698184 - 47698252
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47698184 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 47698252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 48478176 - 48478248
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48478176 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 48478248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 53019449 - 53019521
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53019449 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 53019521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5273216 - 5272976
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatta------------ 148  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||                
T  5273216 ggttactgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttgtaaatt 5273118  T
Q  149 -agtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta 241  Q
     ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||   || |||    ||||| || | || |   |||||||||||||| ||||    
T  5273117 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttcctta 5273022  T
Q  242 cattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273021 cgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8068268 - 8068197
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8068268 aggttattgtaaattaagtttacttattttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8068197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10048569 - 10048498
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048569 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10048498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 10660208 - 10660279
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10660208 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10660279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 13287823 - 13287890
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13287823 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 13287890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 24349844 - 24349915
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349844 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 24349915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 43219261 - 43219332
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43219261 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 43219332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 51755000 - 51755071
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51755000 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 51755071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 3019765 - 3019989
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  3019765 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatata-gttaatgtaaattcagtttacttacg 3019862  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||    
T  3019863 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaa 3019962  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3019963 tgtaaattaagtttacttatgttcaat 3019989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 284
Target Start/End: Original strand, 33583818 - 33584016
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  33583818 gttcaatcttggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagt 33583917  T
Q  188 ttacatgtgta-tata-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||  |  |  | | ||  || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33583918 ttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 33584016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 43219262 - 43219359
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  43219262 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 43219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43972539 - 43972453
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  43972539 gtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 43972453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 48478178 - 48478275
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  48478178 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 48478275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49804430 - 49804283
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||          |||||||||    
T  49804430 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacatgtatata-ag----------agaggttag 49804342  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804341 tgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 49804283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 53019451 - 53019548
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  53019451 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 53019548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 502311 - 502388
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  502311 gtatgtatataagaggttagtgtgaattaagtttatgtacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacgtatgt 502388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 3019728 - 3019797
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3019728 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 3019797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 9746308 - 9746377
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9746308 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaat 9746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12227284 - 12227219
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaattta 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12227284 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta 12227219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 22497745 - 22497814
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22497745 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 22497814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 43219225 - 43219294
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43219225 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 43219294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43972394 - 43972329
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta-cttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43972394 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaccttatgttaaattt 43972329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Original strand, 46528679 - 46528748
Alignment:
Q  122 acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46528679 acgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 46528748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 48478136 - 48478210
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48478136 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 48478210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 53019409 - 53019483
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019409 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 53019483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 53019646 - 53019720
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019646 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 53019720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 9746212 - 9746330
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  9746212 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 9746299  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9746300 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 9746330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10470960 - 10470868
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10470960 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 10470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10470959 - 10470868
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10470959 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 10470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10471099 - 10471039
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10471099 aggttagtgtaaattcagcttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 10471039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 22497788 - 22497852
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22497788 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttactaatgttcaattt 22497852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26975085 - 26975029
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975085 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26975029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 31655456 - 31655520
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655456 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31655520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 35923100 - 35923191
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||    
T  35923100 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatataaattaagttt 35923191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 35923276 - 35923340
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35923276 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 35923340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 38253047 - 38253138
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  38253047 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 38253138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41113935 - 41113821
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41113935 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggtttgtgtaaattaagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatgttca 41113848  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41113847 atttaggttaatgtaaatttagtttac 41113821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 47698149 - 47698252
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  47698149 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 47698247  T
Q  161 ttcaa 165  Q
    |||||    
T  47698248 ttcaa 47698252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49804319 - 49804247
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49804319 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 49804247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8827993 - 8827768
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| | |||||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||      
T  8827993 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggtcaatgtaaatcaagtttacttatgtt-aatctaggttaatataaattcagtttacttacg 8827896  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaat 259  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || || ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||    
T  8827895 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattcagtttattacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaat 8827796  T
Q  260 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8827795 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 8827768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 9746202 - 9746269
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9746202 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 9746269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 22497499 - 22497566
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22497499 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22497566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26975119 - 26975029
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26975119 gttagtgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26975029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 27450019 - 27450090
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450019 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagcttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27450090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Original strand, 44378307 - 44378402
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44378307 taggttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaagtttac 44378402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 44378620 - 44378691
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44378620 aggttaatgtaaattaagtgtacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 44378691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 46529127 - 46529226
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  46529127 ttcaatctaggttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttacgttgatgtaaatttagtt 46529226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 48477967 - 48478034
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48477967 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 48478034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 48478214 - 48478331
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  48478214 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 48478301  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48478302 ttcaatttaagttaatgtaaatttagttta 48478331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49804562 - 49804486
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49804562 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 49804486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019240 - 53019307
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019240 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 53019307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8828035 - 8827867
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgtta-----atgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||     ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  8828035 aggttagtgtaaactcagtttacttacgttcaatctaggttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtcaatgtaaatcaagtttac 8827936  T
Q  192 atgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
     | |||   || | |         |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8827935 ttatgt---taatct---------aggttaatataaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8827867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 9746199 - 9746273
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  9746199 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 9746273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 13287477 - 13287605
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| |||| | ||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  13287477 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctag-ttaatgtaaattaagtttatttatgttaaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 13287574  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13287575 ttcaatataggttaatgtaaattaagtttac 13287605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 22497496 - 22497570
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22497496 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 22497570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28554677 - 28554607
Alignment:
Q  101 tagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28554677 tagtgtaaattcagtttacttacgttaaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttagg 28554607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Original strand, 43219015 - 43219081
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219015 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 43219081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43972383 - 43972273
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcac-ttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatg 177  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||| ||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  43972383 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaccttatgttaaatttaggttaatataaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatg 43972284  T
Q  178 taaatttagtt 188  Q
    |||||||||||    
T  43972283 taaatttagtt 43972273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43972835 - 43972781
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43972835 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 43972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 48477964 - 48478038
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  48477964 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 48478038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Original strand, 48478281 - 48478367
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48478281 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttagttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 48478367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 48478408 - 48478475
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48478408 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48478475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 53019237 - 53019311
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  53019237 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 53019311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 2446533 - 2446642
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  2446533 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtgaattaagtttacttatgttcaatttacattaacgt 2446632  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  2446633 aaatttagtt 2446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10048770 - 10048678
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  10048770 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 10048678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10048770 - 10048717
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048770 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 10048717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12227425 - 12227356
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12227425 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 12227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 13287235 - 13287339
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  13287235 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 13287333  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  13287334 ttcaat 13287339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287270 - 13287339
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13287270 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 13287339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 22497668 - 22497742
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22497668 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 22497742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 22498108 - 22498161
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498108 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22498161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 26229811 - 26229915
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  26229811 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaatttagtttacttatg 26229909  T
Q  161 ttcaat 166  Q
    ||||||    
T  26229910 ttcaat 26229915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26717269 - 26717216
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717269 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 26717216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 35923099 - 35923168
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35923099 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 35923168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #298
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 43219588 - 43219641
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219588 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 43219641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #299
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43972511 - 43972450
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43972511 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 43972450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #300
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43972884 - 43972835
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43972884 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 43972835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #301
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 44378228 - 44378289
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44378228 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 44378289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #302
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804325 - 49804260
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49804325 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 49804260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #303
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49804522 - 49804457
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49804522 gaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 49804457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #304
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804528 - 49804463
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804528 tcaatcgaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 49804463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #305
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49804731 - 49804666
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804731 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 49804666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #306
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51166886 - 51166817
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51166886 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 51166817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #307
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 9746211 - 9746275
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9746211 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 9746275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #308
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10470924 - 10470868
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470924 aggttaatataaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 10470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #309
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 13287380 - 13287460
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  13287380 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttat 13287460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #310
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17338340 - 17338276
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17338340 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 17338276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #311
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17338330 - 17338282
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17338330 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 17338282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #312
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 22497508 - 22497572
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22497508 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 22497572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #313
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Original strand, 26230054 - 26230161
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26230054 ttaatgtaaattcag-tttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttaattatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 26230152  T
Q  163 caatttagg 171  Q
    |||||||||    
T  26230153 caatttagg 26230161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #314
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26717332 - 26717267
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26717332 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 26717267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #315
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41113590 - 41113483
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatatt 162  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||  |||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41113590 ttaatgtaaattcag-tttacttactttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 41113492  T
Q  163 caatttagg 171  Q
    |||||||||    
T  41113491 caatttagg 41113483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #316
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43972698 - 43972634
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43972698 tgtaaatgtagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 43972634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #317
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43972774 - 43972698
Alignment:
Q  77 aatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  43972774 aatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatataggttaatgtaaattaagttt 43972698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #318
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43972940 - 43972884
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43972940 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagttt 43972884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #319
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Original strand, 44378535 - 44378591
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44378535 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 44378591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #320
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 48477976 - 48478040
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48477976 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 48478040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #321
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 48478213 - 48478277
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48478213 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 48478277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #322
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49804282 - 49804218
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49804282 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 49804218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #323
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 53019249 - 53019313
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53019249 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 53019313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #324
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 53019486 - 53019550
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53019486 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 53019550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #325
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 2446551 - 2446622
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2446551 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtgaattaagtttacttatgttcaattt 2446622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #326
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 22498024 - 22498084
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22498024 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 22498084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #327
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26717401 - 26717333
Alignment:
Q  209 atataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717401 atataaaaggttattgtaaattcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 26717333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #328
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113843 - 41113772
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41113843 aggttaatgtaaatttagtttacctatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaattt 41113772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #329
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 43219504 - 43219564
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43219504 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 43219564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #330
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43972529 - 43972450
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  43972529 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 43972450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #331
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 280
Target Start/End: Original strand, 46528831 - 46529042
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  46528831 ggttaatgtaaattcag-tttatttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 46528929  T
Q  161 ttcaatt----taggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt 256  Q
    ||||||     |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |        || ||   | ||| |||||||| ||||||||||  |||||| || |||    
T  46528930 ttcaatcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca--------atcta---gattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgtt 46529018  T
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  46529019 aatgtaaatttagtttacgtatgt 46529042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #332
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 46529135 - 46529206
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46529135 aggttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaattt 46529206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #333
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49804159 - 49804095
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804159 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 49804095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #334
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 9746279 - 9746341
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9746279 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 9746341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #335
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10048768 - 10048706
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10048768 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 10048706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #336
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287365 - 13287431
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13287365 ttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 13287431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #337
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17338352 - 17338278
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17338352 tatgttgaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 17338278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #338
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 22497885 - 22497947
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22497885 tgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 22497947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #339
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 190
Target Start/End: Original strand, 41457240 - 41457322
Alignment:
Q  108 aattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  41457240 aattcaatttacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagcttacgtatgttcaatttagattagtgtaaattaagttta 41457322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #340
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 43219012 - 43219086
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43219012 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttatttat 43219086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #341
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 43219365 - 43219427
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43219365 tgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 43219427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #342
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49804734 - 49804660
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  49804734 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttgcttat 49804660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #343
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 53019687 - 53019761
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53019687 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 53019761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #344
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26717267 - 26717206
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26717267 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 26717206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #345
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Original strand, 33583807 - 33583860
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33583807 agtttatttacgttcaatcttggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33583860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #346
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 43219590 - 43219651
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43219590 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 43219651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #347
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 44378229 - 44378366
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatc--------tatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||        || ||||||| ||||||||||    
T  44378229 ggttagtgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttaaatcgttaaatctaggttaatgtaaattaagtt 44378327  T
Q  153 tacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44378328 tacttaagttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 44378366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #348
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 44378308 - 44378369
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44378308 aggttaatgtaaattaagtttacttaagttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 44378369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #349
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 285
Target Start/End: Original strand, 46528681 - 46528863
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||     |||||||||||| |||    
T  46528681 gttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat----cttaatgtaaattaagt 46528776  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||     ||  |   || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  46528777 ttac----ttaccttcaatct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttatttacgttcaat 46528863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #350
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 48478170 - 48478235
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48478170 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 48478235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #351
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019443 - 53019508
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53019443 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 53019508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #352
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019680 - 53019745
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53019680 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 53019745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #353
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 26229629 - 26229705
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26229629 tatgttcaatttgggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttacttatat 26229705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #354
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 26229651 - 26229699
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26229651 aaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttac 26229699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #355
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 37821554 - 37821645
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  37821554 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 37821645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #356
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 43219024 - 43219088
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43219024 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttatttatgt 43219088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #357
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43972450 - 43972394
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43972450 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttaaatctagattaatgtaaattaagttt 43972394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #358
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43973014 - 43972918
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43973014 taggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 43972918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #359
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49804722 - 49804658
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49804722 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttgcttatgt 49804658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #360
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Original strand, 502078 - 502211
Alignment:
Q  133 atgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg-ttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattc 231  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  502078 atgttagtgtaaattaagtctacgtatgttcaatttagggttaatgtaaattaagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattc 502166  T
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||           |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  502167 agttt-----------atctaggttaatataaatttagtttacttatgttcaattt 502211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #361
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5273010 - 5272921
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  5273010 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattta-gttaatgtaaatttagtt 5272921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #362
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8068267 - 8068169
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  8068267 ggttattgtaaatt-aagtttacttattttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtata 8068169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #363
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8827838 - 8827748
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  8827838 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 8827748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #364
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287513 - 13287580
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13287513 gttaatgtaaattaagtttatttatgttaaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 13287580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #365
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26717371 - 26717278
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717371 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagttt 26717280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #366
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43972772 - 43972721
Alignment:
Q  234 tttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43972772 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 43972721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #367
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 48478279 - 48478398
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||      || |||    
T  48478279 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttagttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt------taatca 48478371  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  48478372 atctaggttaatgtaaattaagtttac 48478398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #368
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8828127 - 8828073
Alignment:
Q  233 gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8828127 gtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattgaggttacttatgttcaattt 8828073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #369
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17332849 - 17332807
Alignment:
Q  149 agtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17332849 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 17332807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #370
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 23151217 - 23151279
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  23151217 tgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatttaaattcagtttacttacgttcaat 23151279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #371
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Original strand, 37821675 - 37821760
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  37821675 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatt 37821760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #372
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43972835 - 43972781
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  43972835 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 43972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #373
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 46528626 - 46528676
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46528626 aggttaatgtaaattaagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaatt 46528676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #374
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 502172 - 502245
Alignment:
Q  129 atctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatata 202  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  502172 atctaggttaatataaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatttaaattcagtttacgtatgtatata 502245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #375
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10048739 - 10048678
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10048739 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 10048678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #376
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17332850 - 17332797
Alignment:
Q  231 cagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17332850 cagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 17332797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #377
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Original strand, 22497824 - 22497881
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22497824 tgtaaattcagtttactaatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 22497881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #378
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 22498110 - 22498171
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22498110 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaa 22498171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #379
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 278
Target Start/End: Original strand, 26229642 - 26229703
Alignment:
Q  217 ggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26229642 ggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttggtttacttat 26229703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #380
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Original strand, 41454628 - 41454688
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41454628 ggttagtgtaaattcag-tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttactta 41454688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #381
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 41457018 - 41457071
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41457018 aatgtaaattcagtttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 41457071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #382
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43972884 - 43972835
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43972884 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 43972835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #383
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804520 - 49804399
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac---tt 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||           ||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  49804520 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttact-----------tatgtcaatgtaaattaagtttacttatt 49804433  T
Q  158 atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49804432 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 49804399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #384
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019487 - 53019608
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  53019487 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 53019574  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53019575 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 53019608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #385
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10048738 - 10048675
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10048738 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt 10048675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #386
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 24349223 - 24349287
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24349223 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtttacttatgt 24349287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #387
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43972365 - 43972293
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttac-ttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43972365 aggttaatgtaaattaagtttaccttatgttaaatttaggttaatataaattaagtttacttatgttcaattt 43972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #388
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Original strand, 48478369 - 48478405
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48478369 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 48478405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #389
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 51754843 - 51754907
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51754843 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 51754907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #390
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 9746203 - 9746246
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9746203 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 9746246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #391
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 9746344 - 9746411
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9746344 aggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttagttacgttca 9746411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #392
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 22497500 - 22497543
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22497500 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 22497543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #393
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 22498110 - 22498177
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22498110 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaacttagg 22498177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #394
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 285
Target Start/End: Original strand, 24349421 - 24349464
Alignment:
Q  242 cattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24349421 cattcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 24349464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #395
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41113941 - 41113882
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  41113941 tatgtcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtttgtgtaaattaagtttac 41113882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #396
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 43219016 - 43219059
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219016 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 43219059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #397
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 44378455 - 44378498
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44378455 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttgcttatgttcaattt 44378498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #398
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 48477968 - 48478011
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48477968 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48478011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #399
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49804730 - 49804687
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804730 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 49804687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #400
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 53019241 - 53019284
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019241 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 53019284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #401
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8068232 - 8068174
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8068232 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 8068174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #402
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 22497786 - 22497879
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22497786 aatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggtaaatgtaaattcagtttactaatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 22497879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #403
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 22497896 - 22497950
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22497896 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 22497950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #404
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 24349367 - 24349417
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24349367 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 24349417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #405
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Original strand, 41454627 - 41454689
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  41454627 aggttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttat 41454689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #406
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 41457018 - 41457107
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||| ||  |||| | |||||||||||||    
T  41457018 aatgtaaattcag-tttacgtatattcaatttaggttaatgtaaattcagtttacgtatgttaaatttagattaacgtaaattaagtttac 41457107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #407
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43972452 - 43972394
Alignment:
Q  95 ttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  43972452 ttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttaaatctagattaatgtaaattaagttt 43972394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #408
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43973013 - 43972943
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattca-gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43973013 aggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttatgttcaat 43972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #409
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Original strand, 44378303 - 44378341
Alignment:
Q  247 aatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44378303 aatctaggttaatgtaaattaagtttacttaagttcaat 44378341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #410
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 48478281 - 48478343
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48478281 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttagttatgttcaat 48478343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #411
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49804521 - 49804459
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  49804521 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 49804459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #412
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 280
Target Start/End: Original strand, 502066 - 502143
Alignment:
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg-ttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  502066 tatgtatatgagatgttagtgtaaattaagtctacgtatgttcaatttagggttaatgtaaattaagtttacgtatgt 502143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #413
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Original strand, 2446388 - 2446445
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2446388 tgtaaattaagtttacttattttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 2446445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #414
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 22498027 - 22498073
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498027 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 22498073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #415
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41113933 - 41113876
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41113933 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtttgtgtaaattaagtttacttatgt 41113876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #416
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 43219507 - 43219553
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219507 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 43219553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #417
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43972510 - 43972450
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43972510 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 43972450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #418
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 48477977 - 48478098
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  48477977 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 48478064  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48478065 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 48478098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #419
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 48478408 - 48478478
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48478408 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 48478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #420
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 53019250 - 53019371
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  53019250 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 53019337  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53019338 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 53019371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #421
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 271
Target Start/End: Original strand, 3019801 - 3020011
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt------- 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||           
T  3019801 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatatag-ttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaatt 3019898  T
Q  154 ------acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattca 247  Q
          |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||||   ||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  3019899 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca--------atttaag---ttaatgtaaattaagtttacttatgttca 3019987  T
Q  248 atctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3019988 atctacgttaatgtaaatttagtt 3020011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #422
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10048631 - 10048583
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10048631 aaatcaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 10048583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #423
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10470958 - 10470902
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  10470958 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatataaattcagtttac 10470902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #424
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17338341 - 17338305
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17338341 taggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 17338305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #425
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26717269 - 26717206
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  26717269 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 26717206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #426
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 272
Target Start/End: Original strand, 35923059 - 35923191
Alignment:
Q  129 atctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaa 228  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| ||||||    
T  35923059 atctaggttagtgtaaattcagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaa 35923147  T
Q  229 ttcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35923148 ttcagtttacttacgttcaatataggttaatataaattaagttt 35923191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #427
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 41454637 - 41454685
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41454637 aaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 41454685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #428
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 43219115 - 43219187
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43219115 gttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacatgt 43219187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #429
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 43219588 - 43219651
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43219588 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 43219651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #430
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 46528518 - 46528582
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46528518 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttatgttaatgtaaatttagtttacgtatgt 46528582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #431
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 48478067 - 48478139
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48478067 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 48478139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #432
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804662 - 49804600
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49804662 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 49804600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #433
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 53019340 - 53019412
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53019340 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 53019412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #434
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 53019577 - 53019649
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53019577 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 53019649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #435
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10048613 - 10048570
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10048613 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaattt 10048570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #436
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 26229633 - 26229676
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26229633 ttcaatttgggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26229676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #437
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26717267 - 26717200
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  26717267 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 26717200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #438
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 41457158 - 41457212
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41457158 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgctcaatttaggttaatgtaaattcagtt 41457212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #439
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 43219590 - 43219657
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  43219590 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 43219657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #440
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 46529136 - 46529226
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||| || ||| ||| ||||| ||||    
T  46529136 ggttaatataaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgtttaatttacgttgatgtaaatttagtt 46529226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #441
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 48478076 - 48478135
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48478076 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 48478135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #442
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 48478312 - 48478367
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48478312 gttaatgtaaatttagtttagttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 48478367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #443
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 53019349 - 53019408
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53019349 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 53019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #444
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 53019586 - 53019645
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53019586 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 53019645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #445
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 9746277 - 9746307
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9746277 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 9746307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #446
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10048770 - 10048740
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048770 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #447
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10471027 - 10470997
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10471027 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10470997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #448
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17332847 - 17332797
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17332847 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 17332797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #449
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17338339 - 17338221
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  17338339 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 17338252  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17338251 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 17338221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #450
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 22498108 - 22498138
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498108 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 22498138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #451
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26717269 - 26717239
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717269 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26717239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #452
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113874 - 41113844
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41113874 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41113844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #453
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113935 - 41113905
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41113935 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41113905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #454
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Original strand, 41457145 - 41457215
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  41457145 tatgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgctcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 41457215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #455
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Original strand, 41457267 - 41457320
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41457267 gttaatgtaaatt-aagcttacgtatgttcaatttagattagtgtaaattaagtt 41457320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #456
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 43219588 - 43219618
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219588 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 43219618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #457
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 48478279 - 48478309
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48478279 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 48478309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #458
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10048984 - 10048943
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10048984 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatcttcaat 10048943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #459
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10470836 - 10470784
Alignment:
Q  63 ttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10470836 ttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 10470784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #460
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Original strand, 22497509 - 22497569
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22497509 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 22497569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #461
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 22498108 - 22498164
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22498108 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 22498164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #462
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Original strand, 43219084 - 43219143
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43219084 tatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 43219143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #463
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Original strand, 46529050 - 46529083
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46529050 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaat 46529083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #464
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 48478408 - 48478462
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48478408 gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttagattaatgtaaattaagtttac 48478462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #465
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 49804159 - 49804089
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49804159 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 49804089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #466
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49804159 - 49804105
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  49804159 gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttagattaatgtaaattaagtttac 49804105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #467
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12227281 - 12227233
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12227281 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 12227233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #468
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Original strand, 13287355 - 13287395
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13287355 tcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 13287395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #469
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Original strand, 22498082 - 22498110
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498082 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 22498110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #470
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26717332 - 26717267
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  26717332 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 26717267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #471
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26975018 - 26974950
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| || || ||||||| |||||    
T  26975018 tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttctatttacgttaatgtaaatt 26974950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #472
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 116
Target Start/End: Original strand, 43219152 - 43219180
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219152 gttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 43219180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #473
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Original strand, 43219562 - 43219590
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43219562 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 43219590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #474
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43972832 - 43972784
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43972832 aaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 43972784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #475
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 48478068 - 48478100
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48478068 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 48478100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #476
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 49804198 - 49804162
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49804198 tcaatctaagttaatgtaaattaaatttacttatgtt 49804162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #477
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49804630 - 49804598
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49804630 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 49804598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #478
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 53019341 - 53019373
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53019341 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 53019373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #479
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 53019578 - 53019610
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53019578 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 53019610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 200)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39430074 - 39429822
Alignment:
Q  24 atgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttac 123  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39430074 atgtatataaaaggggtttatgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttac 39429975  T
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt 223  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39429974 gttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatatagtatgtatataagaggttagt 39429875  T
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39429874 gtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 39429822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41568524 - 41568258
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41568524 tgtatgtatataaaaggggttagtgcagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcagatttacgtattttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 41568425  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41568424 tagattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatggtatgtatataagaggtt 41568325  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41568324 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 41568258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30786961 - 30786706
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30786961 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 30786862  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| |||    
T  30786861 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaagtt 30786773  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30786772 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 30786706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1222256 - 1222003
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1222256 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 1222157  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  1222156 tacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 1222068  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1222067 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 1222003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26479671 - 26479418
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26479671 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagttgacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 26479572  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||    
T  26479571 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataacaggtt 26479483  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479482 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 26479418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 20115370 - 20115623
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20115370 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttcct 20115469  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  20115470 tacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 20115558  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20115559 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 20115623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31547099 - 31546847
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31547099 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgtttaatt-aggttagtgtaaattcagtttact 31547001  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  31547000 tacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 31546912  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31546911 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggataatgtaaattaagtttacttacgttcaat 31546847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 11979020 - 11979273
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  11979020 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatctaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcggtttacc 11979119  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  11979120 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 11979208  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11979209 agtgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaat 11979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14287278 - 14287022
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14287278 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 14287179  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||    
T  14287178 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatgtaagaggtt 14287090  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaa---attaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  14287089 actgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattattaagtttacttacgttcaat 14287022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 2357646 - 2357898
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2357646 tgtatgtatataaaagaggttagtgtaatttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 2357745  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||    
T  2357746 tacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattt-gtttac-----------gtatgtatataagaggtt 2357833  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2357834 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 2357898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2371919 - 2371677
Alignment:
Q  32 aaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatc 131  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2371919 aaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaatttaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatc 2371820  T
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattc 231  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2371819 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaatta 2371731  T
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2371730 agtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 2371677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11124147 - 11123884
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11124147 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttagattagtgtaaattcagtttact 11124048  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| |||    
T  11124047 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagatgtt 11123959  T
Q  221 agtgtaaattca----------gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11123958 agtgtaaattcagtttacttacgtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 11123884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 4049745 - 4049998
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4049745 tgtatatatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttagattagtgtaaattcagtttact 4049844  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||     ||||||||| |||    
T  4049845 tacattcaatttaagttaatgtaaattgagtttac--atgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac----gtatata-----tatataagatgtt 4049933  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4049934 agtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 4049998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39429882 - 39429694
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39429882 aggttagtgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttgt--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatg 39429785  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39429784 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaatccagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacatatgttcaattt 39429694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39429765 - 39429575
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39429765 aggttagtgtaaatccagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacatatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatg 39429666  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39429665 tatatagtatgtatataagaggttatcgtaaattcagtttacttactttcaatataggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39429575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21866800 - 21866632
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21866800 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgtttaatttaggttagtgtaaattcagtttact 21866701  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21866700 tacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaaagtaaattaagttt 21866632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33965266 - 33965049
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  33965266 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg 33965168  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33965167 ttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaa-ttcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 33965074  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33965073 taaattaagtttacttatgttcaat 33965049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Original strand, 8105755 - 8105947
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatg 194  Q
    |||||||  ||||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  8105755 taggttaacgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaccta 8105854  T
Q  195 tgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8105855 tgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaattt 8105947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41568329 - 41568134
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaat--gtaaattta-gtttacat 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||  |  || || || |     
T  41568329 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttatttagtttacgtatgtatatag 41568230  T
Q  194 gt--gtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41568229 gtatgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 41568134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14286995 - 14286825
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||           |    
T  14286995 tgtaaattaagtttacttatcttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaatttagtttac-----------g 14286907  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14286906 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 14286825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 8105717 - 8105851
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8105717 tgtatgtatataaaaggggttagtgtactttacgtatgtaggttaacgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8105816  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  8105817 tacgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 8105851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33965315 - 33965209
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33965315 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattt 33965216  T
Q  185 agtttac 191  Q
    |||||||    
T  33965215 agtttac 33965209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2371746 - 2371567
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  2371746 aggttagtgtaaattaagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 2371647  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |        |||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2371646 ttca--------atata---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2371567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17977298 - 17977088
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||        
T  17977298 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttact---- 17977204  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17977203 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----attt-------aggttaatataaattaagtttacttactttcaatctaggttaatg 17977115  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17977114 taaattaagtttacttatgttcaattt 17977088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1222072 - 1221880
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  1222072 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 1221973  T
Q  197 tatatagtatgt--atataa--gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | ||   || ||  || |||   | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221972 tttaatctaggttaatgtaaattaagtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1221880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 8114000 - 8114112
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8114000 tgtatgtatataaaaggggttagtgtactttacgtatgtaggttaacgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8114099  T
Q  121 tacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||    
T  8114100 tacgttcaatcta 8114112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31546822 - 31546710
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31546822 tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgt 31546723  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  31546722 aaattaagtttac 31546710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2371673 - 2371552
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  2371673 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 2371575  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2371574 ttcaatttaggttaatgtaaatt 2371552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2379856 - 2379727
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  2379856 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 2379758  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379757 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2379727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14286894 - 14286715
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  14286894 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 14286795  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    ||||       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14286794 ttca----atgt-------aggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 14286715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17977358 - 17977160
Alignment:
Q  74 tcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggtt 173  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17977358 tcaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtt 17977259  T
Q  174 aatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||||||| |||||||         || | |  || |   |||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17977258 aatgtaaattcagtttac--------ttactttcaatct---aggttaatgtaaattaagtttact----ttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 17977174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 20115555 - 20115783
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  20115555 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactcatg 20115653  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacat---gtgtatatagtatgtatataa--gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |    |  || ||| ||  || |||   | |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  20115654 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggattaatgtaaattaagtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatttagat 20115751  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20115752 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 20115783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14286857 - 14286728
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      
T  14286857 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttagg 14286759  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14286758 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 14286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2371854 - 2371783
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2371854 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2371783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14287202 - 14287131
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287202 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 14287131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 285
Target Start/End: Original strand, 6036563 - 6036692
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttac 242  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036563 aaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaattttagtttacatgt-------------atataagaggttagtgtaaattcagtttacttac 6036649  T
Q  243 attcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036650 gttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 6036692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 8105876 - 8105970
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8105876 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttgaatttacgttaatgtaaatttagtttac 8105970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26479487 - 26479393
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26479487 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 26479393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Original strand, 4049931 - 4050059
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  4049931 gttagtgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaggt 4050029  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4050030 tcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 4050059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 20115554 - 20115719
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||   ||    
T  20115554 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactcatg 20115653  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg-ttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20115654 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacattcaatctaggattaatgtaaattaagttt 20115719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30786775 - 30786686
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30786775 gttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 30786686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 2357921 - 2358008
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2357921 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 2358008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 2357951 - 2358077
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |     
T  2357951 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttttgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttttg 2358049  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2358050 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 2358077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26479290 - 26479203
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26479290 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 26479203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26479595 - 26479524
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479595 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26479524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33965303 - 33965232
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965303 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33965232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39430001 - 39429930
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39430001 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 39429930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2371745 - 2371616
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  2371745 ggttagtgtaaatt-aagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 2371647  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2371646 ttcaatataggttaatgtaaattcagtttac 2371616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 6036623 - 6036717
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6036623 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 6036717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11123916 - 11123787
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  11123916 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 11123818  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11123817 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 11123787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31546916 - 31546733
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||  |     |    
T  31546916 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggataatgtaaattaagtttacttacgttcaatctag-ttaatgtaaattaagtaaa-----g 31546823  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | ||   |||||  |    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31546822 tttact-tatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31546733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33965117 - 33964921
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat-----ttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||| |||||||    
T  33965117 aggttagtgtaa-ttcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaggttaatgtaaattcagtttac 33965019  T
Q  192 atgtgtatatagtatgtatataagaggttagt--gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     |  ||  |   || ||  ||   |  | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965018 ttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33964921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Original strand, 12243004 - 12243155
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagt 223  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||||||||| ||    
T  12243004 gttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataagaggtttgt 12243101  T
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243102 gtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 12243155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 4049966 - 4050093
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  4049966 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 4050064  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4050065 ttcaatttaggttaatgtaaattcagttt 4050093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 6036624 - 6036759
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  6036624 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 6036722  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6036723 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttgtgt 6036759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11124068 - 11124000
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11124068 ttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11124000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1221944 - 1221857
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1221944 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttac 1221857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1222180 - 1222109
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1222180 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1222109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 6036761 - 6036876
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  6036761 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatg--tattaagtttacttatgttca 6036857  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6036858 atttaggttaatgtaaatt 6036876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14286821 - 14286695
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  14286821 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 14286723  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14286722 ttcaatttacgataatgtaaatttagtt 14286695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 20115446 - 20115517
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20115446 aggttagtgtaaattcagtttccttacattcaatctaggttaatgtaaattgagtttacttatgttcaattt 20115517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21866724 - 21866653
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21866724 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 21866653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31546803 - 31546677
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  31546803 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 31546705  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31546704 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 31546677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31547024 - 31546953
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31547024 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31546953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2379784 - 2379582
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| ||||| |||||||||||     
T  2379784 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaatttagtttacttatg 2379697  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||  | | ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  2379696 ttcaatccaggttaatgtaaatttagtttacttacgttaaaactag--atataagatgttagtgtaaattcagtttact------caatctaggttaatg 2379605  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2379604 taaattaagtttacttatgttca 2379582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14286893 - 14286764
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  14286893 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 14286795  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14286794 ttcaatgtaggttaatgtaaattaagtttac 14286764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17977194 - 17977085
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  17977194 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatataaattaagtttacttactttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 17977096  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  17977095 ttcaatttagg 17977085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19390228 - 19390134
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390228 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 19390134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26479279 - 26479170
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26479279 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 26479180  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  26479179 aaatttagtt 26479170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 2357829 - 2358021
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |     
T  2357829 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaatt 2357928  T
Q  197 ta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
     | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2357929 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttttgttcaattt 2358021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Original strand, 2357932 - 2358044
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2357932 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttttgttcaatttaggttaatgt 2358031  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  2358032 aaattaagtttac 2358044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11123935 - 11123823
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11123935 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctaggttaatgt 11123836  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  11123835 aaattaagtttac 11123823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26479290 - 26479226
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479290 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26479226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 2357722 - 2357793
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2357722 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatctaaattaagtttacttacgttcaattt 2357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 11979096 - 11979167
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11979096 aggttagtgtaaattcggtttacctacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 11979167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21866723 - 21866597
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||     
T  21866723 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaaagtaaattaagtttccttatg 21866625  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21866624 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 21866597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2371709 - 2371580
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  2371709 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatataggttaatgtaaattcagtttacttacg 2371611  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2371610 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 2371580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 4049931 - 4050093
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||     
T  4049931 gttagtgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaggtt 4050030  T
Q  199 tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
     |        || ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4050031 ca--------atcta---ggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattcagttt 4050093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33965302 - 33965173
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  33965302 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacg 33965204  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33965203 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 33965173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41568205 - 41568131
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41568205 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 41568131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2379864 - 2379763
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2379864 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 2379765  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  2379764 ac 2379763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1222071 - 1221944
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  1222071 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 1221973  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  1221972 tttaatctaggttaatgtaaattaagttt 1221944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11123880 - 11123761
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  11123880 ggttaatgtaaatt-aaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 11123782  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaa 181  Q
    || ||| |||||| |||||||    
T  11123781 tttaatctaggttgatgtaaa 11123761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 20115719 - 20115803
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20115719 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 20115803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31546915 - 31546697
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagt-----ttac 155  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||     ||||    
T  31546915 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggataatgtaaattaagtttacttacgttcaatcta-gttaatgtaaattaagtaaagtttac 31546818  T
Q  156 ttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggt 255  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |||       |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  31546817 ttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca----atctat-------gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggt 31546729  T
Q  256 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31546728 taatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 31546697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2379821 - 2379750
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2379821 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 2379750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14287094 - 14286993
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaa---attaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacat 193  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14287094 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacat 14286995  T
Q  194 gt 195  Q
    ||    
T  14286994 gt 14286993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2371601 - 2371479
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    |||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||     
T  2371601 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaag----cttatgttcaatttagattaatataaattaagtttacttatg 2371507  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2371506 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 2371479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 11979204 - 11979298
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11979204 aggttagtgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 11979298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1221933 - 1221824
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  1221933 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatat 1221834  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||| ||||    
T  1221833 aaattaagtt 1221824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2379898 - 2379824
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379898 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 2379824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 4049965 - 4050034
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4049965 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaat 4050034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 11979240 - 11979301
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11979240 aggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 11979301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19390191 - 19390073
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  19390191 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 19390104  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390103 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 19390073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19390229 - 19390157
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19390229 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 19390157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26479486 - 26479359
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  26479486 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 26479388  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26479387 ttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26479359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2379864 - 2379721
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  2379864 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 2379776  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2379775 aaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 2379721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2380067 - 2380000
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2380067 gttcaatctaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2380000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26479261 - 26479190
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479261 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26479190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33964985 - 33964918
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33964985 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 33964918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2379820 - 2379723
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2379820 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 2379723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17977519 - 17977357
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||| | |||  ||   |||||| ||||||||     
T  17977519 tatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtgtacatgtatataa--gaggttagtgtaaattc 17977422  T
Q  185 agtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatc 250  Q
    ||||||| |   ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  17977421 agtttacttacttacgt-gtatgtatataagaggttagtgtaaattcaatttacctacgttcaatc 17977357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19390124 - 19390038
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19390124 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 19390038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19390227 - 19390130
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19390227 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 19390130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39429638 - 39429552
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39429638 gtaaattcagtttacttactttcaatataggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaagtttaatttac 39429552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2379857 - 2379788
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2379857 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 2379788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11123881 - 11123812
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11123881 aggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 11123812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11123917 - 11123848
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11123917 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttcaat 11123848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 11979232 - 11979301
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11979232 ttcaatctaggttactgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 11979301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19390126 - 19389933
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |      ||    
T  19390126 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttaat------ca 19390034  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||  |                 |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  19390033 atctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttga-----------------gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaa 19389953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19390269 - 19390195
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390269 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 19390195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 2357830 - 2357921
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2357830 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 2357921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 6036666 - 6036730
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6036666 tgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 6036730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 6036696 - 6036814
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||            ||| |||| |||||||||||||||||     
T  6036696 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttg-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatg 6036783  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036784 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 6036814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11123932 - 11123784
Alignment:
Q  118 acttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagag 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||  |        || ||   |    
T  11123932 acttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttacgttca--------atcta---g 11123844  T
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11123843 gttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 11123784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26479415 - 26479359
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479415 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26479359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1221915 - 1221844
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221915 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 1221844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 4050001 - 4050072
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4050001 aggttaatgtaaattaagtttacttaggttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaattt 4050072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Original strand, 12243156 - 12243220
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243156 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 12243220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19390438 - 19390371
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390438 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 19390371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19390441 - 19390367
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19390441 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 19390367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2379520 - 2379467
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379520 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2379467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2380167 - 2380102
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2380167 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 2380102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Original strand, 4049824 - 4049890
Alignment:
Q  219 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4049824 ttagtgtaaattcagtttacttacattcaatttaagttaatgtaaattgagtttac--atgttcaattt 4049890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2380070 - 2379994
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2380070 tatgttcaatctaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatat 2379994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 6036792 - 6036861
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6036792 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgt--attaagtttacttatgttcaattt 6036861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17977603 - 17977485
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||| ||||     
T  17977603 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttaattatg 17977516  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17977515 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 17977485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17977604 - 17977540
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17977604 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 17977540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19390192 - 19390128
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19390192 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 19390128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19390429 - 19390365
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19390429 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 19390365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 2357986 - 2358057
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2357986 aggttaatgtaaattaagtttacttttgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttttgttcaattt 2358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2379578 - 2379518
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2379578 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 2379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21866688 - 21866617
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21866688 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaaagtaaattaagtttccttatgttcaattt 21866617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26479449 - 26479382
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26479449 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 26479382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2380058 - 2379996
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2380058 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 2379996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2380170 - 2380096
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2380170 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttgcttat 2380096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 4050093 - 4050155
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4050093 tgtaaattcagtttatttacgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 4050155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 6036763 - 6036825
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6036763 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 6036825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17977616 - 17977542
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17977616 tatgtttaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 17977542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19390124 - 19390062
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19390124 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 19390062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2379518 - 2379457
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2379518 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 2379457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 153
Target Start/End: Original strand, 4050113 - 4050178
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  4050113 gttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattcagttt 4050178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 158
Target Start/End: Original strand, 12243001 - 12243074
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12243001 tatgttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 12243074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 12243013 - 12243082
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12243013 aggttactgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 12243082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19390235 - 19390170
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19390235 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 19390170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33965081 - 33964985
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttag-----tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  33965081 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 33964985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33965267 - 33965198
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33965267 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 33965198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2380158 - 2380094
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2380158 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttgcttatgt 2380094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 6036695 - 6036755
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6036695 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactt 6036755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11123844 - 11123753
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  11123844 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttgatgtaaaataagttt 11123753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 12243014 - 12243085
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12243014 ggttactgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 12243085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14286996 - 14286789
Alignment:
Q  66 atgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||| |  |     
T  14286996 atgtaaatt-aagtttacttatcttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaggttaatgtaaatttagtttacgtatgtatat 14286898  T
Q  166 tttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaat 265  Q
       |||||| |||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14286897 aagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaat 14286809  T
Q  266 taagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  14286808 tcagtttacttacgttcaat 14286789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2380066 - 2380023
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2380066 ttcaatctaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2380023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 6036793 - 6036900
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||     
T  6036793 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgta--ttaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaaatttacttatg 6036889  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  6036890 ttcaatttagg 6036900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Original strand, 6036842 - 6036897
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6036842 agtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 6036897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14287039 - 14286997
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287039 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 14286997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 189
Target Start/End: Original strand, 4050093 - 4050178
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  4050093 tgtaaattcagtttatttacgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattcagttt 4050178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Original strand, 6036522 - 6036563
Alignment:
Q  232 agtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036522 agtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 6036563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11123753 - 11123712
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11123753 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 11123712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26479331 - 26479290
Alignment:
Q  231 cagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479331 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26479290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 4050122 - 4050178
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  4050122 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaaattaatgtaaattcagttt 4050178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11123809 - 11123753
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  11123809 aggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttgatgtaaaataagttt 11123753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21866762 - 21866666
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || ||| ||| || |||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21866762 taggttaatgtaaattcaagtttacgtatgtttaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 21866666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39429965 - 39429901
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39429965 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 39429901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2380166 - 2380123
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2380166 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2380123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 4050002 - 4050144
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt------- 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||           
T  4050002 ggttaatgtaaatt-aagtttacttaggttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttgtaaatt 4050100  T
Q  154 ------acttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
          | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4050101 cagtttatttacgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 4050144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 6034673 - 6034716
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6034673 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 6034716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 12243005 - 12243048
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243005 ttcaatttaggttactgtaaattaagtttacttatgttcaattt 12243048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 12243117 - 12243210
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12243117 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaattaagttt 12243208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19390437 - 19390394
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390437 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 19390394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2371602 - 2371535
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  2371602 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaag----cttatgttcaattt 2371535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17977507 - 17977457
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17977507 aggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaatt 17977457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17977536 - 17977474
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17977536 tgtaaattaagtttaattatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 17977474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2379575 - 2379529
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379575 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 2379529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 6034669 - 6034714
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  6034669 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaat 6034714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 253
Target Start/End: Original strand, 8114076 - 8114113
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8114076 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctag 8114113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19389997 - 19389927
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19389997 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 19389927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19390428 - 19390307
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  19390428 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 19390341  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390340 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 19390307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2379520 - 2379457
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  2379520 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 2379457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17977605 - 17977569
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17977605 taggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 17977569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19390338 - 19390266
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19390338 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 19390266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2371542 - 2371499
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2371542 ttcaatttagattaatataaattaagtttacttatgttcaattt 2371499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2379518 - 2379451
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  2379518 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 2379451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2379970 - 2379899
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  2379970 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 2379899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 12243156 - 12243220
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12243156 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 12243220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19390329 - 19390270
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19390329 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 19390270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39429610 - 39429563
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaa 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  39429610 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaa 39429563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39429728 - 39429674
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39429728 ggttaatgtaaatt-aagtttacatatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 39429674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2379520 - 2379490
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379520 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 2379490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 6036761 - 6036791
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036761 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 6036791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19390126 - 19390096
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390126 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 19390096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2380057 - 2379997
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  2380057 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 2379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 6036562 - 6036611
Alignment:
Q  225 taaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6036562 taaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaattttagtttac 6036611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11123753 - 11123716
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatg 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11123753 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 11123716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Original strand, 20115730 - 20115803
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  20115730 tttacttacgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 20115803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26479331 - 26479290
Alignment:
Q  112 cagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26479331 cagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 26479290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2379967 - 2379895
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2379967 gttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 2379895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 287
Target Start/End: Original strand, 11979055 - 11979095
Alignment:
Q  248 atctaggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11979055 atctaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaattt 11979095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19390337 - 19390305
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19390337 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 19390305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39429618 - 39429566
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatg 141  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  39429618 ttcaatataggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatg 39429566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 210)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 29516974 - 29517240
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29516974 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacatatgttcaatttaggttagtgtcaattcagtttact 29517073  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  29517074 tacgttcaatctagattaatgtacattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatggatatagtatatatataagaggtt 29517173  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29517174 aaagtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29863751 - 29863498
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29863751 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtagtttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 29863652  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  29863651 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 29863563  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29863562 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 29863498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 8063098 - 8063351
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8063098 tgtatgtgtataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 8063197  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||    
T  8063198 tacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gcatgtatataagaggtt 8063286  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8063287 agtgtaaattcagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 8063351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 34475452 - 34475705
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34475452 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtatgttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 34475551  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||||    
T  34475552 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaggtttatttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatattagaggtt 34475640  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34475641 agtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 34475705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17595543 - 17595318
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||     
T  17595543 ggttaatgtaaattcaa-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatg 17595445  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17595444 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctatgttaatg 17595345  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17595344 taaattaagtttacttacgttcaattt 17595318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 742674 - 742422
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  742674 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacatatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 742575  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||| |    
T  742574 tacattcaatctaggttaatgtaaattgagttttcttatgttcaatttaggttaatataaatttagtatac-----------gtatgtatataagagg-t 742487  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  742486 actgtaaattaagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaat 742422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 33490101 - 33490356
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33490101 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcaggttact 33490200  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |  ||        |  || |||   |||    
T  33490201 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcagtttacttacgt--------tcaatctaa---gtt 33490289  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33490290 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33490356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17595389 - 17595206
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||| | ||    
T  17595389 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctatgttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggtta-------tttagtttacgtatg 17595297  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17595296 tatatagtatgtatataaaagattagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 17595206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 4170000 - 4170214
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  4170000 aatgtaaatt-aagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattcagtttacttacgttca 4170098  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4170099 atctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 4170193  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  4170194 ttaagtttatttatgttcaat 4170214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17595687 - 17595437
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||| |||    
T  17595687 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaaatttatgtatgttca-----ggttagtgtaaattcagtttact 17595593  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||  |    || |       |||||    
T  17595592 tacgttcaatctaggttaatataaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcaatttacttacgttca----atct-------aggtt 17595504  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595503 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggtttatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 17595437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 4210729 - 4210943
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  4210729 aatgtaaatt-aagtttacttatgtttaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttca 4210827  T
Q  165 atttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| |  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4210828 atctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 4210922  T
Q  265 ttaagtttacttatgttcaat 285  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  4210923 ttcagtttatttatgttcaat 4210943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 285
Target Start/End: Original strand, 4170303 - 4170478
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagt 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||     |     
T  4170303 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt-----gc 4170397  T
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170398 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 4170478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33130802 - 33130617
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130802 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 33130703  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    || |  |  |  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130702 acttacg--ttcaatctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 33130617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18676526 - 18676400
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18676526 tgtatgtatataaaatgggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgcaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 18676427  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  18676426 tacattcaatctaggttaatgtaaatt 18676400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 34475902 - 34476129
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34475902 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttata 34476000  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---atatagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctagg 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||   || |||    ||||| || |   |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34476001 ttcaatttaagttaatgtaaattaaatttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaa--gtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagg 34476096  T
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34476097 ttaatgtaaattaaatttacttatgttcaattt 34476129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 34475830 - 34476042
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  34475830 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcgatctaggttaatgtaaattaagtttacttacg 34475928  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||    
T  34475929 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaagttaatg 34476017  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| |||||||| |||||||    
T  34476018 taaattaaatttacttacgttcaat 34476042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 287
Target Start/End: Original strand, 8063310 - 8063510
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8063310 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtt 8063409  T
Q  189 tacatgtgt---atatag---tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 282  Q
    |||||  ||   || |||    ||||| || | || |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8063410 tacatacgttcaatctaggttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 8063505  T
Q  283 aattt 287  Q
    |||||    
T  8063506 aattt 8063510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Original strand, 4211032 - 4211188
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagt 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||     ||    
T  4211032 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttgacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt-----gt 4211126  T
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4211127 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 4211188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 8660348 - 8660519
Alignment:
Q  64 taatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattc 163  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  8660348 taatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttatgttaatgtatatttagtttacttatgttc 8660446  T
Q  164 aatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta 241  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660447 aatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt-----gtatgtagataagaggttagtgtaaattcagtttactta 8660519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Original strand, 28470127 - 28470319
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  28470127 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatg 28470226  T
Q  197 t---atat-agt--atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |   || | |||  ||||| || | || |   |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28470227 ttcaatctaagttaatgtaaatta-agtt---tgtaaattcagtttccttacgttcaatctaagttaatttaaattaagtttacttatgttcaattt 28470319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 34476095 - 34476224
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  34476095 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgttaattaagtttacttatg 34476193  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34476194 ttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 34476224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29881312 - 29881106
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |     
T  29881312 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctag-ttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta----tg 29881219  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    ||||   || ||        |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29881218 ttcaatttacgttaatgtaaattaagtttactt----atattcaatcta--------gttaatgtaaattcagtttacttactttcaatctaggttaatg 29881131  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29881130 taaattaagtttacttatgttcaat 29881106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Original strand, 28470114 - 28470198
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28470114 gtatatatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28470198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32938273 - 32938083
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32938273 gttcaatttaggttagtgtaaattaggtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatacaggttaatgtaaatttagt 32938174  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 286  Q
    |||| |  |  |  | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938173 ttacttacg--ttcaatctagatataagaggtttgtgtaaattcagtttac------tcaatctagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatt 32938083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 5545893 - 5546064
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  |     
T  5545893 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaa 5545990  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 283  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5545991 tctagatataagaggttagtgtaaattcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 5546064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 285
Target Start/End: Original strand, 34475785 - 34475970
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34475785 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtt 34475884  T
Q  189 tacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||| |  ||        |  || |   |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34475885 tacttacgt--------tcgatct---aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 34475970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Original strand, 28470255 - 28470418
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatag 203  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  28470255 tgtaaattcagtttccttacgttcaatctaagttaatttaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------g 28470343  T
Q  204 tatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttc 282  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28470344 tatatatataa-aggttagtgt-aattcag-ttacttacgttcaatctaggttaatgt-aattaagtttacttacgttc 28470418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 34475748 - 34475936
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagt 187  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||| | |||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34475748 gttcaatctaggtgaatgtaaattaagtttatttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagt 34475847  T
Q  188 ttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||| | |||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34475848 ttacttatgttca----attt-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcgatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaattt 34475936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 8063174 - 8063245
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8063174 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8063245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 34476231 - 34476333
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34476231 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttatttacgttcaatttatgttaaagtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtt 34476330  T
Q  189 tac 191  Q
    |||    
T  34476331 tac 34476333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Original strand, 8063282 - 8063446
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  8063282 aggttagtgtaaattcagtttacttaccttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatg 8063381  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8063382 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacatacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 8063446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 10790997 - 10791084
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10790997 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 10791084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29863675 - 29863604
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29863675 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29863604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 34475794 - 34476008
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  34475794 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttacg 34475892  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34475893 ttcgatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttca----attt-------aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatg 34475981  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34475982 taaattaagtttacttatattcaattt 34476008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 4170409 - 4170503
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  4170409 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcagtttac 4170503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Original strand, 4169921 - 4170002
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4169921 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 4170002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 4169933 - 4170002
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4169933 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 4170002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Original strand, 4210650 - 4210731
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4210650 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 4210731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 4210662 - 4210731
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210662 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 4210731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Original strand, 8660305 - 8660402
Alignment:
Q  94 tttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660305 tttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggctaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 8660402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 34475636 - 34475728
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34475636 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 34475728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 742598 - 742527
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  742598 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattgagttttcttatgttcaattt 742527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 34476065 - 34476152
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34476065 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 34476152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 4170145 - 4170231
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4170145 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 4170231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 8660309 - 8660438
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  8660309 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggctaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 8660407  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8660408 ttcaatttatgttaatgtatatttagtttac 8660438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Original strand, 29517177 - 29517263
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29517177 gtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 29517263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Original strand, 33490251 - 33490376
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33490251 gttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaagttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 33490349  T
Q  162 tcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33490350 tcaatttacgttaatgtaaatttagtt 33490376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 10791008 - 10791117
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10791008 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 10791107  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  10791108 aaatttagtt 10791117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29881325 - 29881221
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||     
T  29881325 tatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatcta-gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatta 29881227  T
Q  185 agttta 190  Q
    ||||||    
T  29881226 agttta 29881221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 742363 - 742279
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  742363 tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 742279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 10790997 - 10791061
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10790997 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10791061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 742484 - 742299
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgt---ata 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |  ||   ||     
T  742484 tgtaaattaagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatatagattaatgtaaattcagtttacttacgttcaatc 742385  T
Q  201 tagt---atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||    ||||| || |   |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742384 taggttaatgtaaattaa--gtt--tgtaaattcagtttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 742299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 8063446 - 8063533
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8063446 tgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttac 8063533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8933466 - 8933345
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  8933466 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtt-------gttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 8933375  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8933374 ttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 8933345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 34475528 - 34475599
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34475528 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaggtttatttatgttcaattt 34475599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 4210874 - 4210960
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4210874 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 4210960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 8063457 - 8063566
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8063457 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgt 8063556  T
Q  179 aaatttagtt 188  Q
    ||||||||||    
T  8063557 aaatttagtt 8063566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 742454 - 742363
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  742454 ggttaatgtaaatt-aaatttacttatgttcaatatagattaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 742363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 8063319 - 8063546
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||      
T  8063319 ggttaatgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacatacg 8063417  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-tatagt-atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |  |  | | || | | ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  8063418 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagattaa 8063517  T
Q  259 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8063518 tgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8063546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29863567 - 29863483
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaa 181  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  29863567 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 29863483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 34476131 - 34476346
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||      
T  34476131 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgttaattaagtttacttatgttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttacg 34476229  T
Q  161 tt-caatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaat 259  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||  |  ||  |    || |||       ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34476230 tttcaatctaggttaatgtaaattcagtttatttacgttca----atttat-------gttaaagtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaat 34476318  T
Q  260 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34476319 gtaaattaagtttacttatgttcaattt 34476346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29863223 - 29863160
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29863223 gtatatatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 29863160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 34475728 - 34475815
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34475728 tgtaaattcactatacttacgttcaatctaggtgaatgtaaattaagtttatttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 34475815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 4170410 - 4170519
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  4170410 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcagtttacttatg 4170508  T
Q  161 ttcaatttagg 171  Q
    |||||||||||    
T  4170509 ttcaatttagg 4170519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32938022 - 32937918
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattca 164  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32938022 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttac-ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca 32937925  T
Q  165 atttagg 171  Q
    | |||||    
T  32937924 acttagg 32937918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29881373 - 29881221
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagt 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |        
T  29881373 gtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagt----ttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca---- 29881282  T
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    || ||        |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29881281 atcta--------gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 29881221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33130836 - 33130762
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130836 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33130762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 28470128 - 28470255
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  28470128 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatg 28470226  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  28470227 ttcaatctaagttaatgtaaattaagttt 28470255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32937991 - 32937924
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32937991 aggttaatgtaaattcagtttacttac-ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 32937924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Original strand, 34476076 - 34476188
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34476076 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgt 34476175  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
     |||| |||||||    
T  34476176 taattaagtttac 34476188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 4170234 - 4170353
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||          || | |||||||||||||||||     
T  4170234 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttc----------aaagtaaattaagtttacttatg 4170322  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170323 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 4170353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 8660308 - 8660379
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660308 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggctaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8660379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8933508 - 8933432
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933508 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8933432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 10791026 - 10791097
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10791026 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 10791097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17595274 - 17595203
Alignment:
Q  100 ttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17595274 ttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttagg 17595203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 29517205 - 29517276
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29517205 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 29517276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33130795 - 33130724
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33130795 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 33130724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 34476130 - 34476201
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34476130 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgttaattaagtttacttatgttcaattt 34476201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18676450 - 18676400
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676450 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 18676400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 4210761 - 4210857
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  4210761 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 4210857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 5545891 - 5545983
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5545891 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactta 5545983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33130794 - 33130698
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33130794 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta 33130698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 4210963 - 4211079
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||          || | |||||||||||||||||     
T  4210963 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttc----------aaagtaaattaagtttacttatg 4211051  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211052 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 4211079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 4210964 - 4211020
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210964 gttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 4211020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 8707767 - 8707830
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707767 tgtaaattcaatttacttac-ttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8707830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12712885 - 12712806
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatg 141  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  12712885 ggttaatgtaaattcat-tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatattcaatttatgttaatg 12712806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 4170313 - 4170392
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4170313 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 4170392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 4170445 - 4170516
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4170445 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctatgttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 4170516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 4211042 - 4211121
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4211042 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttgacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 4211121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 5545885 - 5545944
Alignment:
Q  132 tatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5545885 tatgtcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 5545944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8933677 - 8933610
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933677 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 8933610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33131005 - 33130938
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33131005 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 33130938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8933680 - 8933606
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8933680 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 8933606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Original strand, 28470040 - 28470098
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28470040 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgtt 28470098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28913952 - 28913890
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttac 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28913952 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttac 28913890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29863297 - 29863239
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29863297 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgtt 29863239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32938276 - 32938206
Alignment:
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||| || |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938276 tacgttcaatttaggttagtgtaaattaggtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 32938206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 4170032 - 4170128
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  4170032 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaagttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttactta 4170128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 5545922 - 5545991
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5545922 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 5545991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 5546153 - 5546206
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546153 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 5546206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Original strand, 8669218 - 8669267
Alignment:
Q  238 cttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8669218 cttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8669267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33130529 - 33130476
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130529 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 33130476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33130759 - 33130690
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33130759 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 33130690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 34476094 - 34476163
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34476094 aggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 34476163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 4170233 - 4170301
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4170233 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 4170301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 4210962 - 4211030
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4210962 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 4211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 8660351 - 8660415
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8660351 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 8660415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8933668 - 8933604
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8933668 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 8933604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Original strand, 28470040 - 28470116
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat-attcaatttaggttaatgta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28470040 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgtttcaatttaggttaatgta 28470116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28913649 - 28913585
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28913649 gttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 28913585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 29517170 - 29517277
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||| |||||||||  ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  29517170 ggttaaagtaaattcag-tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 29517268  T
Q  161 ttcaattta 169  Q
    |||||||||    
T  29517269 ttcaattta 29517277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29863297 - 29863221
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat-attcaatttaggttaatgta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29863297 tgtaaattcagtttacttacgttcaatctagattaatgtaaattaaatttacttatgtttcaatttaggttaatgta 29863221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33130758 - 33130687
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33130758 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 33130687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 34475637 - 34475728
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34475637 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 34475728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 34475672 - 34475728
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34475672 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 34475728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8933304 - 8933240
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933304 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 8933240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12712887 - 12712804
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgta 179  Q
    ||||||| |||||||||| || || || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12712887 taggttaatgtaaattcattttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatattcaatttatgttaatgta 12712804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18676178 - 18676115
Alignment:
Q  125 ttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18676178 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 18676115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32938020 - 32937934
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32938020 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttac-ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 32937934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33130613 - 33130553
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33130613 tgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 33130553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 5545893 - 5545955
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5545893 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 5545955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8933474 - 8933412
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8933474 tcaatcgaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtt 8933412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33131008 - 33130938
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  33131008 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 33130938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 5546155 - 5546216
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546155 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 5546216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 8660381 - 8660477
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  8660381 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatttatgttaatgtatatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 8660477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29881313 - 29881245
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29881313 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatcta-gttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 29881245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32938022 - 32937969
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32938022 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 32937969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33130527 - 33130466
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33130527 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 33130466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 34476240 - 34476348
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  34476240 ggttaatgtaaattcag-tttatttacgttcaatttatgttaaagtaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 34476338  T
Q  161 ttcaatttag 170  Q
    ||||||||||    
T  34476339 ttcaatttag 34476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 171
Target Start/End: Original strand, 8669218 - 8669270
Alignment:
Q  119 cttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8669218 cttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 8669270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 272
Target Start/End: Original strand, 10790953 - 10790997
Alignment:
Q  228 attcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10790953 attcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 10790997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29863531 - 29863483
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaa 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29863531 aggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaa 29863483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29863566 - 29863487
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatg 141  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29863566 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatg 29863487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33130996 - 33130932
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33130996 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacctatgt 33130932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 34475728 - 34475792
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34475728 tgtaaattcactatacttacgttcaatctaggtgaatgtaaattaagtttatttatattcaattt 34475792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12712886 - 12712815
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12712886 aggttaatgtaaattcattttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatattcaattt 12712815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18676178 - 18676135
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676178 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 18676135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28913648 - 28913605
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28913648 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 28913605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32938246 - 32938167
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  32938246 tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatacaggttaatgtaaatttagtttactta 32938167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 742473 - 742363
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  742473 tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaaatttacttatgttcaatatagattaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 742374  T
Q  179 aaatttagttt 189  Q
    ||||| |||||    
T  742373 aaattaagttt 742363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Original strand, 4211138 - 4211188
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4211138 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 4211188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29863210 - 29863160
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaatt 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29863210 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaatt 29863160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Original strand, 4211032 - 4211093
Alignment:
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4211032 gtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagttgacttatgttcaat 4211093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 4211060 - 4211121
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4211060 aggttaatgtaaatttagttgacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 4211121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 8660380 - 8660449
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8660380 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttatgttaatgtatatttagtttacttatgttcaat 8660449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8933402 - 8933345
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8933402 aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttta 8933345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 4170332 - 4170467
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttca---atct---atgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   || |   | |||| || ||||| ||||||    
T  4170332 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtgcatgtatataagaggttagtgtaaattcagttta 4170430  T
Q  155 cttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4170431 cttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 4170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Original strand, 4210797 - 4210860
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4210797 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt 4210860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 5545923 - 5545994
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5545923 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 5545994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 5546065 - 5546129
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5546065 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttaggtta-tgtaaatttagtttacttatgttcaat 5546129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8933343 - 8933307
Alignment:
Q  245 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933343 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgtt 8933307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 125
Target Start/End: Original strand, 4170069 - 4170131
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4170069 gttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacttacgt 4170131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 287
Target Start/End: Original strand, 4170233 - 4170268
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170233 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 4170268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 287
Target Start/End: Original strand, 4210962 - 4210997
Alignment:
Q  252 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210962 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 4210997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 277
Target Start/End: Original strand, 8660418 - 8660477
Alignment:
Q  218 gttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8660418 gttaatgtatatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 8660477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 8707767 - 8707833
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8707767 tgtaaattcaatttacttac-ttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttagg 8707833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8933676 - 8933633
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933676 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 8933633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 274
Target Start/End: Original strand, 9576314 - 9576384
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  9576314 gtatgtatataagaggttagtgtaaactcagtttacgtaaatacaat-taagttattgtaaattcagtttac 9576384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32938080 - 32938020
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32938080 tgtaaattcagattactta--ttcaatttagattaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 32938020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33131004 - 33130961
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33131004 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33130961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 4210910 - 4210960
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4210910 aggttaatgtaaattcagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 4210960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 285
Target Start/End: Original strand, 8660307 - 8660341
Alignment:
Q  251 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660307 taggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 8660341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32938020 - 32937966
Alignment:
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32938020 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttactta 32937966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 742352 - 742279
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  742352 tttacttacgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 742279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 165
Target Start/End: Original strand, 4170228 - 4170301
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  4170228 aattcaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 4170301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 165
Target Start/End: Original strand, 4210957 - 4211030
Alignment:
Q  92 aatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaa 165  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  4210957 aattcaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 4211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8933410 - 8933369
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8933410 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaat 8933369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8933667 - 8933546
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  8933667 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 8933580  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8933579 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 8933546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29881321 - 29881280
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29881321 ttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 29881280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33130610 - 33130564
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130610 aaattcagtttacttat--tcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 33130564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 5546153 - 5546216
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  5546153 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 5546216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8933467 - 8933380
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933467 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagttg-------ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 8933380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8933468 - 8933412
Alignment:
Q  215 gaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtt 271  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8933468 gaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtt 8933412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8933577 - 8933505
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8933577 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 8933505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 10790953 - 10790997
Alignment:
Q  109 attcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttt 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10790953 attcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttt 10790997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12712884 - 12712828
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12712884 gttaatgtaaattcattttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 12712828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18676488 - 18676400
Alignment:
Q  96 taggttagtgtaaattca-gttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatt 183  Q
    ||||||| || ||||||| ||| || || ||||||| || |||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18676488 taggttaatgcaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 18676400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28913649 - 28913585
Alignment:
Q  88 gttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  28913649 gttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 28913585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32938227 - 32938156
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32938227 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatacaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatcta 32938156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33130529 - 33130466
Alignment:
Q  65 aatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaa 129  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  33130529 aatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaa 33130466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 4169924 - 4169991
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4169924 gttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 4169991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 4210653 - 4210720
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4210653 gttcaatttaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 4210720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 5546026 - 5546118
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||      ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5546026 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttca------gttaatgtaaattcagtttact--tattcaatttaggtt-atgtaaatttagttt 5546116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 5546155 - 5546222
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  5546155 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 5546222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8933568 - 8933509
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8933568 aggttaatgtaaatttagtttactttaccttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 8933509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 11590913 - 11590948
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11590913 gtatgtatataagaggttagtgtaaactcagtttac 11590948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18676178 - 18676115
Alignment:
Q  89 ttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  18676178 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 18676115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25143968 - 25143933
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25143968 gtatgtatatgagaggttagtgtaaattcagtttac 25143933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32938272 - 32938229
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32938272 ttcaatttaggttagtgtaaattaggtttacttatgttcaattt 32938229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33130527 - 33130460
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  33130527 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaacttagg 33130460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33130908 - 33130837
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  33130908 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 33130837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 4170181 - 4170231
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaatt 266  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4170181 aggttaatgtaaattaagtttatttatgttcaatctaggttaatgtaaatt 4170231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 5545891 - 5545921
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5545891 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5545921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Original strand, 5546153 - 5546183
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546153 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 5546183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12712850 - 12712804
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgta 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  12712850 aggttaatgtaaattcagtttacttatattcaatttatgttaatgta 12712804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32938022 - 32937992
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938022 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 32937992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33130529 - 33130499
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130529 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 33130499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33130937 - 33130877
Alignment:
Q  131 ctatgttaatgaaaattaagtttacttata---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33130937 ctatgtcaatgtaaattaagtttacttattatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtt 33130877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8933304 - 8933234
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8933304 gttaatgtaaattcagtttactta--ttcaatttagattaatgtaaattaagtttacttatgttcaacttagg 8933234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8933304 - 8933250
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8933304 gttaatgtaaattcagtttacttat--tcaatttagattaatgtaaattaagtttac 8933250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8944735 - 8944706
Alignment:
Q  255 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944735 ttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 8944706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12712805 - 12712752
Alignment:
Q  210 tataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaa 263  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  12712805 tataacaggtcagtgtgaattcagtttacttatgttcaatctagattaatgtaa 12712752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18676485 - 18676428
Alignment:
Q  135 gttaatgaaaatt-aagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18676485 gttaatgcaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttac 18676428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 28470355 - 28470413
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactta 158  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  28470355 aggttagtgtaa-ttcagtt-acttacgttcaatctaggttaatg-taattaagtttactta 28470413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Original strand, 4211084 - 4211124
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgt 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4211084 tatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgt 4211124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Original strand, 5546127 - 5546155
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546127 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 5546155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8933576 - 8933544
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8933576 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 8933544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32938063 - 32938031
Alignment:
Q  159 tattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32938063 tattcaatttagattaatgtaaatttagtttac 32938031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33130555 - 33130527
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130555 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 33130527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33130905 - 33130833
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33130905 gttcaatctaggttaatgtaaatttagttaactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 33130833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 11)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 105524 - 105283
Alignment:
Q  21 tgtatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  105524 tgtatgtatataaaaggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtttact 105425  T
Q  121 tacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  105424 tacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac-----------gtatgtatataagaggtt 105336  T
Q  221 agtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105335 agtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 105283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 105281 - 105100
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaattt 184  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  105281 tatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattt 105182  T
Q  185 agtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105181 agtttac-----------gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 105100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 105124 - 104995
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  105124 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 105026  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  105025 ttcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 104995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 105088 - 104962
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  105088 ggttaatgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatg 104990  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  104989 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 104962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 105161 - 104982
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  105161 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 105062  T
Q  197 tatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105061 ttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 104982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 105448 - 105377
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105448 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 105377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 105160 - 105031
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||      
T  105160 ggttagtgtaaattcag-tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacg 105062  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  105061 ttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 105031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 105269 - 105198
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105269 aggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 105198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 105340 - 105247
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  105340 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta-atatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttac 105247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 105268 - 105056
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||     
T  105268 ggttaatgtaaattc-agtttacttacgtttaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatg 105170  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |  |    |||||| |||||||| ||||||| |  ||  |    || |       |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  105169 tatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttca----atct-------aggttaatgtaaattcagtttacttacgtttaatctaggttaatg 105081  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  105080 taaattcagtttacttacgttcaat 105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 105412 - 105348
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  105412 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacgtatgt 105348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 15)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42337 - 42123
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  42337 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 42239  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||     ||| |   || |       |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42238 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac----ttattttcaatct-------aggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatataggttaatg 42150  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42149 taaattaagtttacttatgttcaattt 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42229 - 42103
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  42229 ggttaatgtaaatttag-tttacttattttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttactttcaatataggttaatgtaaattaagtttacttatg 42131  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42130 ttcaatttacgttaatgtaaatttagtt 42103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42356 - 42169
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  42356 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgt 42257  T
Q  179 aaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttactta 277  Q
    ||||| ||||||| | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42256 aaattcagtttacttatgttca----atct-------aggttaatgtaaatttagtttacttattttcaatctaggttaatgtaaattcagtttactta 42169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42526 - 42455
Alignment:
Q  214 agaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42526 agaggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 42455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42446 - 42373
Alignment:
Q  118 acttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42446 acttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 42373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42431 - 42362
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42431 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaat 42362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42357 - 42305
Alignment:
Q  233 gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42357 gtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 42305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42450 - 42398
Alignment:
Q  233 gtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42450 gtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 42398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42524 - 42448
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggtt 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  42524 aggttagtgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtt 42448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42449 - 42355
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggtt 173  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  42449 tttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtt 42355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42338 - 42269
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42338 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttacgttcaat 42269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42523 - 42452
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatcta 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42523 ggttagtgtaaatt-aagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatcta 42452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42514 - 42466
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42514 aaattaagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 42466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42395 - 42355
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt 256  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42395 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtt 42355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42488 - 42448
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggtt 256  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42488 aggttaatgtaaattaagtttacttacgttcaatctaggtt 42448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 40)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26895 - 26671
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  26895 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatg 26797  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttactta---cattcaatctaggtta 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |  | | |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||    
T  26796 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacg--ttcaatctagatataaaaggttattgtaaattcagtttacttattcaattcaatttaggtta 26699  T
Q  258 atgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26698 atgtaaatttagtttacttatgttcaat 26671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26931 - 26802
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  26931 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatg 26833  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26832 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 26802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27204 - 27075
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  27204 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 27106  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27477 - 27348
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  27477 ggttaatgtaaatt-aagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatg 27379  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27378 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26939 - 26755
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26939 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagttt 26840  T
Q  190 acatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    || | |||  |    || |       |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26839 acttatgttca----attt-------aggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaat 26755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27212 - 27111
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27212 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttt 27113  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  27112 ac 27111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27485 - 27384
Alignment:
Q  90 tcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27485 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagttt 27386  T
Q  190 ac 191  Q
    ||    
T  27385 ac 27384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26896 - 26825
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26896 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaattt 26825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27169 - 27098
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27169 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 27098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27442 - 27371
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27442 aggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaattt 27371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27246 - 27172
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27246 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 27172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27519 - 27445
Alignment:
Q  205 atgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519 atgtatataagaggttagtgtaaactcagtttact------caatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 27445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27042 - 26899
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttag 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||             ||||||||||||||||||    
T  27042 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac-------------atgtatataagaggttag 26956  T
Q  223 tgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26955 tgtaaactcagtttac------tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 26899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27205 - 27136
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27205 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 27136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27478 - 27409
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27478 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttcaat 27409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27212 - 27069
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  27212 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 27124  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27123 aaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 27069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27485 - 27342
Alignment:
Q  126 tcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgt 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  |        || ||   ||||| |||    
T  27485 tcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattcagtttacttatgttca--------atcta---ggttaatgt 27397  T
Q  226 aaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27396 aaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 27342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27688 - 27621
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27688 gttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 27621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27168 - 27071
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27168 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 27071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27441 - 27344
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27441 ggttaatgtaaattcag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 27344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27691 - 27617
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27691 tatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttat 27617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26647 - 26594
Alignment:
Q  138 aatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26647 aatgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 26594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27679 - 27615
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27679 aggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgt 27615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26823 - 26584
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctat---------gttaatgaaaattaagt 151  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||          |||| || ||||| |||    
T  26823 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttacttacgttcaatctagatataaaaggttattgtaaattcagt 26725  T
Q  152 ttacttat---attcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgta-----tatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttaca 243  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||      || | || || ||     | | | |||||||| ||||||||||      
T  26724 ttacttattcaattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatgttcaatgtaaattaagtttacttatgttcaatgtaaattaagtttacttatg 26625  T
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26624 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaa 26584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26645 - 26578
Alignment:
Q  104 tgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttagg 171  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26645 tgtaaattaagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacttatattcaacttagg 26578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27687 - 27644
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687 ttcaatttaggttagtgtaaattaagtttacttatgttcaattt 27644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27132 - 27011
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  27132 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 27045  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27044 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 27011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27405 - 27284
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  27405 ggttaatgtaaatttag-tttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 27318  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27317 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 27284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27678 - 27557
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||           ||| |||| |||||||||||||||||     
T  27678 ggttagtgtaaatt-aagtttacttatgttcaatttaggttaatgtaaatttagtttactta-----------tgtcaatgtaaattaagtttacttatt 27591  T
Q  161 ---ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27590 atgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttac 27557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27315 - 27243
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27315 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 27243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27588 - 27516
Alignment:
Q  124 gttcaatctatgttaatgaaaattaagtttactt-atattcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgt 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27588 gttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttacatgt 27516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27045 - 26974
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  27045 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 26974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27247
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  27318 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 27247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27306 - 27247
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27306 aggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 27247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27591 - 27520
Alignment:
Q  85 tatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactt-acgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttac 155  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  27591 tatgttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 27520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27579 - 27520
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttactt-acattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27579 aggttaatgtaaatttagtttactttacgttcaatctaggttagtgtaaattcagtttac 27520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26647 - 26617
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26647 aatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 26617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26673 - 26645
Alignment:
Q  257 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26673 aatgtaaattaagtttacttatgttcaat 26645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27314 - 27282
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27314 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 27282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27587 - 27555
Alignment:
Q  244 ttcaatctaggttaatgtaaattaagtttactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27587 ttcaatctaggttaatgtaaatttagtttactt 27555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 684 - 600
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  684 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 577
Alignment:
Q  97 aggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  671 aggttagtgtaaattcagtttacttacgttcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtttac 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 760 - 697
Alignment:
Q  23 tatgtatataaaaggggttattgtagtttacgtatgagggttaatgtaaattcaaatttacgta 86  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  760 tatgtatataaacggggttagtgtagtttacgtatgtaggttaatgtaaattcaagtttatgta 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 635 - 577
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttac 274  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  635 aggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaatttacgttaatgtaaatttagtttac 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 11)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 287
Target Start/End: Original strand, 11783 - 11997
Alignment:
Q  61 ggttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttata 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||   ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||     
T  11783 ggttaatgtaaattcaa-tttacttatgttcaatctaggttaaagtatattcagtttacttatactcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatg 11881  T
Q  161 ttcaatttaggttaatgtaaatttagtttacatgtgtatatagtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatg 260  Q
    || |||||| ||||||||||| | |||||||           ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11882 tttaatttaagttaatgtaaactaagtttac-----------gtatgtatataagagataagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctatgttaatg 11970  T
Q  261 taaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11971 taaattaagcttacgtatgttcaattt 11997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Original strand, 11764 - 11876
Alignment:
Q  79 tttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgt 178  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11764 tttacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatctaggttaaagtatattcagtttacttatactcaatttaggttaatgt 11863  T
Q  179 aaatttagtttac 191  Q
    ||||| |||||||    
T  11864 aaattcagtttac 11876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Original strand, 11931 - 12019
Alignment:
Q  102 agtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11931 agtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctatgttaatgtaaattaagcttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagttta 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 285
Target Start/End: Original strand, 11733 - 11815
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11733 gtatgtttataagaggttagtgtgaatttagtttacttatgtttaatctaggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaat 11815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 278
Target Start/End: Original strand, 11479 - 11554
Alignment:
Q  203 gtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttat 278  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11479 gtatgtatatgagaagttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttat 11554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 11494 - 11553
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagttcactta 122  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11494 gttagtgtaaattcag-tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttactta 11553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 11782 - 11853
Alignment:
Q  216 aggttagtgtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagtttacttatgttcaattt 287  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  11782 aggttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatctaggttaaagtatattcagtttacttatactcaattt 11853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Original strand, 11494 - 11556
Alignment:
Q  99 gttagtgtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagtttacttatat 161  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11494 gttagtgtaaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatat 11556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Original strand, 11964 - 12017
Alignment:
Q  62 gttaatgtaaattcaaatttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattcagtt 116  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11964 gttaatgtaaatt-aagcttacgtatgttcaatttaggttagtgtaaattaagtt 12017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Original strand, 11502 - 11550
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11502 aaattcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 11550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 238
Target Start/End: Original strand, 11408 - 11478
Alignment:
Q  171 gttaatgtaaatttagtttacatgtgtatat---agtatgtatataagaggttagtgtaaattcagtttac 238  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  11408 gttagtgtaaatttagtttacttatgtacatgagagtatgtatatgagaggttagcgtaaattaagtttac 11478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 15
Alignment:
Q  224 gtaaattcagtttacttacattcaatctaggttaatgtaaattaagttta 273  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64 gtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 15
Alignment:
Q  105 gtaaattcagttcacttacgttcaatctatgttaatgaaaattaagttta 154  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  64 gtaaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 15
Alignment:
Q  143 aaattaagtttacttatattcaatttaggttaatgtaaatttagttta 190  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  62 aaattcagtttacttatgttcaatctaggttaatgtaaattaagttta 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0548 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8769 - 8734
Alignment:
Q  156 ttatattcaatttaggttaatgtaaatttagtttac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8769 ttatattcaatttaggttaatgtaaattaagtttac 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University