View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1295-Insertion-4 (Length: 704)

Name: NF1295-Insertion-4
Description: NF1295
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1295-Insertion-4
NF1295-Insertion-4
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (336-704)||(49438830-49439199)
chr3 (5-337)||(11839707-11840041)
chr3 (9-338)||(17055773-17056104)
chr3 (5-336)||(10244317-10244650)
chr3 (7-336)||(10760633-10760964)
chr3 (7-336)||(49151458-49151788)
chr3 (7-336)||(49157525-49157855)
chr3 (5-337)||(8331631-8331964)
chr3 (5-337)||(10238194-10238528)
chr3 (7-336)||(38455535-38455864)
chr3 (5-336)||(42191203-42191536)
chr3 (5-336)||(42197145-42197478)
chr3 (7-337)||(38449047-38449377)
chr3 (7-336)||(30051085-30051415)
chr3 (7-333)||(55003398-55003722)
chr3 (44-336)||(11846046-11846340)
chr3 (119-332)||(17593268-17593481)
chr3 (151-336)||(10766854-10767038)
chr3 (7-336)||(48128030-48128353)
chr3 (23-336)||(13444920-13445227)
chr3 (5-330)||(53069043-53069364)
chr3 (7-154)||(10769133-10769283)
chr3 (7-336)||(28964726-28965042)
chr3 (147-269)||(34300485-34300607)
chr3 (21-112)||(13837534-13837625)
chr3 (116-314)||(46656638-46656839)
chr3 (7-98)||(26429639-26429731)
chr3 (359-485)||(49435168-49435300)
chr3 (9-269)||(12108716-12108977)
chr3 (211-336)||(24643534-24643665)
chr3 (19-100)||(34300348-34300429)
chr3 (454-551)||(49446471-49446568)
chr3 (58-100)||(24643773-24643815)
chr3 (454-523)||(49427600-49427669)
chr3 (626-699)||(49434992-49435065)
chr3 (25-97)||(46656538-46656610)
chr3 (14-87)||(2982458-2982531)
chr3 (416-476)||(49414824-49414884)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (11-336)||(1176-1503)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (7-336)||(3817294-3817624)
chr7 (5-336)||(28420942-28421274)
chr7 (7-339)||(3811149-3811482)
chr7 (7-336)||(351633-351962)
chr7 (7-336)||(20238796-20239127)
chr7 (7-336)||(339226-339547)
chr7 (5-336)||(5979156-5979490)
chr7 (112-336)||(42767277-42767501)
chr7 (5-336)||(35147986-35148324)
chr7 (7-314)||(43539823-43540140)
chr7 (7-337)||(5849376-5849703)
chr7 (10-200)||(15843796-15843988)
chr7 (10-200)||(15860905-15861097)
chr7 (55-336)||(12803893-12804176)
chr7 (7-336)||(22741901-22742243)
chr7 (136-336)||(26383603-26383806)
chr7 (126-295)||(30219269-30219438)
chr7 (5-100)||(35150761-35150856)
chr7 (12-331)||(26380935-26381239)
chr7 (25-189)||(7608306-7608475)
chr7 (191-267)||(18666547-18666622)
chr7 (5-61)||(26383513-26383569)
chr7 (12-101)||(3677876-3677965)
chr7 (6-90)||(18656883-18656967)
chr7 (67-100)||(24690848-24690881)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (5-337)||(12686161-12686494)
chr5 (5-336)||(12692264-12692596)
chr5 (7-340)||(28525365-28525699)
chr5 (7-336)||(28531465-28531795)
chr5 (10-336)||(7389531-7389858)
chr5 (5-336)||(41297123-41297453)
chr5 (5-336)||(30384359-30384701)
chr5 (12-336)||(30772133-30772460)
chr5 (137-336)||(32094142-32094340)
chr5 (5-335)||(19066091-19066427)
chr5 (140-336)||(32096943-32097138)
chr5 (161-327)||(24054336-24054502)
chr5 (5-175)||(32097165-32097338)
chr5 (12-336)||(19059747-19060079)
chr5 (5-175)||(32094364-32094537)
chr5 (183-346)||(16215147-16215309)
chr5 (5-252)||(20499982-20500231)
chr5 (194-330)||(14610184-14610321)
chr5 (5-131)||(14610013-14610141)
chr5 (7-314)||(26509696-26510002)
chr5 (190-257)||(28542269-28542336)
chr5 (188-314)||(26316796-26316922)
chr5 (193-331)||(37896286-37896423)
chr5 (67-208)||(8706532-8706672)
chr5 (275-330)||(8706454-8706508)
chr5 (18-88)||(26318492-26318561)
chr5 (5-79)||(33753476-33753550)
chr5 (21-79)||(33849110-33849168)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (7-336)||(8650786-8651117)
chr6 (5-336)||(4580304-4580637)
chr6 (5-336)||(25354055-25354388)
chr6 (11-336)||(21190849-21191179)
chr6 (5-336)||(25343468-25343805)
chr6 (12-338)||(31756194-31756528)
chr6 (116-337)||(32035268-32035488)
chr6 (130-336)||(21782736-21782941)
chr6 (21-336)||(21197004-21197329)
chr6 (178-336)||(8662764-8662921)
chr6 (5-339)||(21770537-21770881)
chr6 (19-331)||(17581491-17581797)
chr6 (140-336)||(18778564-18778760)
chr6 (5-290)||(21783337-21783640)
chr6 (5-290)||(21789560-21789863)
chr6 (178-336)||(6098000-6098158)
chr6 (191-312)||(34603337-34603457)
chr6 (191-312)||(34724614-34724734)
chr6 (5-83)||(30905819-30905896)
chr6 (229-335)||(6102693-6102803)
chr6 (178-239)||(1106232-1106294)
chr6 (5-101)||(20745401-20745497)
chr6 (174-267)||(17900190-17900282)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (7-336)||(32890734-32891065)
chr8 (7-337)||(32896858-32897190)
chr8 (5-337)||(5542142-5542476)
chr8 (5-337)||(9935125-9935456)
chr8 (5-336)||(14417785-14418114)
chr8 (7-336)||(36818818-36819147)
chr8 (29-333)||(42992989-42993294)
chr8 (7-336)||(10705683-10706020)
chr8 (7-257)||(10699875-10700127)
chr8 (7-329)||(22219706-22220041)
chr8 (19-336)||(39727300-39727609)
chr8 (7-336)||(39735531-39735862)
chr8 (128-336)||(7771202-7771408)
chr8 (169-337)||(14799398-14799564)
chr8 (134-336)||(1882734-1882939)
chr8 (10-100)||(42033650-42033740)
chr8 (11-100)||(1883039-1883128)
chr8 (227-336)||(24250171-24250278)
chr8 (250-331)||(1171414-1171493)
chr8 (16-228)||(1171215-1171414)
chr8 (282-336)||(10700132-10700186)
chr8 (279-336)||(39689782-39689838)
chr8 (238-310)||(31379430-31379502)
chr8 (236-308)||(31399047-31399119)
chr8 (259-336)||(42033856-42033930)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (7-336)||(28682928-28683258)
chr2 (5-336)||(36750258-36750591)
chr2 (5-336)||(13455943-13456276)
chr2 (5-336)||(13461884-13462217)
chr2 (5-336)||(44716787-44717121)
chr2 (21-336)||(31002237-31002554)
chr2 (21-337)||(31008215-31008533)
chr2 (7-336)||(30965173-30965505)
chr2 (36-331)||(13149674-13149968)
chr2 (7-331)||(35090637-35090966)
chr2 (7-330)||(35084665-35084993)
chr2 (11-338)||(35438691-35439014)
chr2 (20-336)||(11048536-11048851)
chr2 (5-336)||(23343398-23343737)
chr2 (9-98)||(19879446-19879536)
chr2 (136-336)||(29833188-29833384)
chr2 (37-99)||(29034697-29034759)
chr2 (244-336)||(1388003-1388093)
chr2 (38-100)||(29833079-29833142)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (7-338)||(34739832-34740164)
chr1 (7-336)||(25387487-25387818)
chr1 (5-336)||(50306041-50306365)
chr1 (5-336)||(25381518-25381851)
chr1 (7-336)||(31057890-31058220)
chr1 (7-302)||(31051390-31051687)
chr1 (7-302)||(8092862-8093159)
chr1 (19-337)||(44409859-44410187)
chr1 (19-336)||(24926738-24927062)
chr1 (163-336)||(1078228-1078400)
chr1 (16-336)||(24963685-24964013)
chr1 (25-336)||(27955025-27955336)
chr1 (5-312)||(38151981-38152279)
chr1 (5-123)||(1078088-1078209)
chr1 (161-336)||(12183562-12183740)
chr1 (12-85)||(33458145-33458218)
chr1 (42-93)||(12183816-12183867)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (5-336)||(10739322-10739654)
chr4 (5-336)||(10953091-10953423)
chr4 (5-336)||(24287830-24288161)
chr4 (7-336)||(33458249-33458580)
chr4 (5-336)||(6257188-6257521)
chr4 (7-336)||(48160805-48161132)
chr4 (7-336)||(48167024-48167351)
chr4 (59-336)||(10733229-10733507)
chr4 (59-336)||(10946998-10947276)
chr4 (7-336)||(33461380-33461705)
chr4 (6-336)||(49976432-49976763)
chr4 (5-336)||(50168439-50168769)
chr4 (5-166)||(10733504-10733667)
chr4 (5-166)||(10947273-10947436)
chr4 (139-336)||(26963324-26963518)
chr4 (20-269)||(44831661-44831919)
chr4 (25-250)||(4632246-4632482)
chr4 (16-305)||(19686341-19686625)
chr4 (218-337)||(26956811-26956929)
chr4 (7-100)||(26957023-26957117)
chr4 (241-336)||(4632869-4632963)
chr4 (178-302)||(3769587-3769710)
chr4 (198-298)||(9237402-9237502)
chr4 (147-267)||(50427356-50427483)
chr4 (5-314)||(50155802-50156100)
chr4 (30-130)||(35177666-35177770)
chr4 (25-98)||(17627002-17627075)
chr4 (247-331)||(34308060-34308142)
chr4 (5-101)||(33045089-33045185)
chr4 (23-101)||(32284542-32284620)
chr4 (25-100)||(3769434-3769509)
chr4 (230-331)||(55473133-55473230)
chr4 (7-51)||(26971824-26971869)
chr4 (135-224)||(31986745-31986833)
chr4 (206-261)||(35177806-35177861)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (5-336)||(605-934)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (5-336)||(172873-173205)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (5-336)||(6366-6699)
scaffold0208 (5-336)||(12239-12572)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (91-336)||(5465-5711)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (27-336)||(950-1261)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (24-332)||(38290-38600)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (180-297)||(5945-6061)
scaffold0185 (42-105)||(5826-5889)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 336 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 49439199 - 49438830
Alignment:
Q  336 agttgagactt-acattttggtttatttttgttgtgcagaatttcaagttttgatacacatgtcagcaaggacaaggaattatgatgtcatcagcagttt 434  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49439199 agttgagacttgacattttggtttatttttgttgtgcagaatttcaagttttgatacacatgtcagcaagaacaaggaattatgatgtcatcagcagttt 49439100  T
Q  435 accagatgccgatctcagccatattctctcttttctcccaactaaacaggttgttgccactagcgtcctatccaagagatggaagcatcaatggcgctca 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49439099 accagatgccgatctcagccatattctctcttttctcccaaccaaacaggttgttgccactagcgtcctatccaagagatggaagcatcaatggcgctca 49439000  T
Q  535 gttttcgatatcaacttaaccaacagcatatgcaaagaatatggagagtattacgaggaaataacattgaatactcaatatgcccttgatagctttaacg 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49438999 gttttcgatatcaacttaaccaacagcatatgcaaagaatatggagagtattgcgaggaaataacattgaatactcaatatgcccttgatagctttaacg 49438900  T
Q  635 agtttgtgcactccattctgctcaagctagattccatcaagagttttcacctcaaggttggatatggtag 704  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49438899 agtttgtgtactccattctgctcaagctagattccatcaagagttttcacctcaaggttggatatggtag 49438830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11840041 - 11839707
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11840041 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 11839942  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11839941 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 11839842  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11839841 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtatcatg 11839742  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11839741 aaatctgtttat-attaagacctaaatttccaacag 11839707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17056104 - 17055773
Alignment:
Q  9 cgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17056104 cgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgt 17056005  T
Q  109 gtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatcc 206  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056004 gtgtttcagatcatctcctatctttggttaccgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcc 17055905  T
Q  207 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17055904 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaaac 17055805  T
Q  307 tgtttttaattaagacctaaatttccaacagt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17055804 tgttttttattaagacctaaatttcgaacagt 17055773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10244650 - 10244317
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10244650 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 10244551  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10244550 attgtgtgtttcatatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaa 10244451  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244450 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatg 10244351  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  10244350 aaatctgtttat-attaagagctaaatttccaaca 10244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10760964 - 10760633
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10760964 accgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctat 10760865  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10760864 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 10760765  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10760764 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaa 10760665  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10760664 atctgtttttaa-taagacctaaatttccaaca 10760633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 49151458 - 49151788
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  49151458 accgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctatt 49151557  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49151558 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatat 49151657  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49151658 ccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 49151757  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49151758 tctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 49151788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 49157525 - 49157855
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  49157525 accgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctatt 49157624  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49157625 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatat 49157724  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49157725 ccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 49157824  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49157825 tctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 49157855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 8331631 - 8331964
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8331631 acactgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 8331730  T
Q  105 ttgtgtgtc--agatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8331731 ttgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgttgttgacgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaat 8331830  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8331831 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttataa 8331930  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  8331931 aatctatttat-attaagagctaaatttccaacag 8331964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10238528 - 10238194
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10238528 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 10238429  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10238428 attgtgtgtttcatatcatatcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaa 10238329  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238328 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatg 10238229  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  10238228 aaatctgtttat-attaagagctaaatttccaacag 10238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38455864 - 38455535
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38455864 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 38455765  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38455764 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 38455665  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38455664 tccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaa 38455565  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||   |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  38455564 atc---tttatattaagaccgaaatttccaaca 38455535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42191536 - 42191203
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42191536 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactct 42191437  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42191436 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 42191337  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42191336 tacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatg 42191237  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42191236 aaatctatttat-attaagacctatatttccaaca 42191203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42197478 - 42197145
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42197478 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactct 42197379  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42197378 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 42197279  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42197278 tacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatg 42197179  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42197178 aaatctatttat-attaagacctatatttccaaca 42197145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38449377 - 38449047
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38449377 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 38449278  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38449277 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 38449178  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38449177 tccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaa 38449078  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||   |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  38449077 atc---tttatattaagaccgaaatttccaacag 38449047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30051415 - 30051085
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  30051415 accgtacacggcaaactctctcttctgcccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgtcgctaactctatt 30051316  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30051315 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttattgttgtcgattagagggctgtaatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat 30051216  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051215 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgattataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 30051116  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30051115 tctgttttt-attaagacctaaattttcaaca 30051085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 55003722 - 55003398
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  55003722 accgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaa---ccaaatcagccgccgctaactctatt 55003626  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    |||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55003625 gtgtatttcagatcatcttttctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccagatatttctaataccctaattcttaatat 55003526  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003525 acttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 55003426  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttcca 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55003425 tctgttttt-attaagacctaaatttcca 55003398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 44 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11846340 - 11846046
Alignment:
Q  44 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaa-tcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11846340 gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgt 11846241  T
Q  141 tgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcata 240  Q
    |||||||||||||| ||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846240 tgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcata 11846141  T
Q  241 atcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11846140 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattataaaatctg-ttttaattaagacctaaatttccaaca 11846046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 119 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17593481 - 17593268
Alignment:
Q  119 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17593481 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaa 17593382  T
Q  219 acatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaatta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  17593381 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcgattgatttacgattgttgaacatctattatgaaatatatttttaatta 17593282  T
Q  319 agacctaaatttcc 332  Q
    ||||||||||||||    
T  17593281 agacctaaatttcc 17593268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 151 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10767038 - 10766854
Alignment:
Q  151 agggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattca 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10767038 agggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccggtcataatcatgttca 10766939  T
Q  251 atgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10766938 atgttttgtttgcttccgctgttgatttataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttttaa-taagacctaaatttccaaca 10766854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48128353 - 48128030
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||    
T  48128353 accgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaacattgtt 48128254  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaa-taccctaattcttaata 203  Q
    || |||  ||||||| ||| | | |||    | |||||||| ||||||   |||| |||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  48128253 gtttgttccagatcacctcattttttt----accgttgttg-tgagagc--tgccatgaaagttttatc-aggtattccaaaataccctaattcttaata 48128162  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48128161 ttcttaataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgtttccgctattgattcataattgttgaacatgtttcatgaa 48128062  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48128061 atctgttttt-attgagacctaaatttccaaca 48128030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 336
Target Start/End: Original strand, 13444920 - 13445227
Alignment:
Q  23 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtg--tcagatcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||||    
T  13444920 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaaccctgttttgtggttcagatcat 13445019  T
Q  121 ctcctctc---tttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatca 217  Q
    | | ||||   |||| |||| ||||||  |||||| | || | |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13445020 cacatctcctctttgtttatggttgttactgagagagctgtcatgaatgttttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatca 13445119  T
Q  218 aacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  13445120 aacatgtcgtagatccgatcat----------aatgttttatttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttctatcaaatctattttt-att 13445208  T
Q  318 aagacctaaatttccaaca 336  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  13445209 tagacctaaatttctaaca 13445227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53069364 - 53069043
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  53069364 acaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaact----------aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccata 53069275  T
Q  105 ttgtgtgt----cagatcatctcctctctt--tggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccc-taattc 197  Q
    || |||||    ||||||||| |  ||  |  |  || | ||||||| | ||| |  | || |||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||    
T  53069274 ttttgtgtgtttcagatcatcacaccttctcatctttgttgttgttgttaagatgactaccatgaaagttttatccaggtattcttaatacccctgattc 53069175  T
Q  198 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  53069174 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttt 53069075  T
Q  298 tatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 330  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53069074 tataaaatctgttttt-attaagacctaaattt 53069043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10769283 - 10769133
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10769283 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 10769184  T
Q  106 tgtg--tgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggg 154  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769183 tgtgtatttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggg 10769133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 28964726 - 28965042
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat- 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |     
T  28964726 accgtacacggaaaactctctcttctccccatctgaagagaactcgaggcat--------cggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaacacttta 28964817  T
Q  106 --tgtgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagcttta-tccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
      | ||| ||||||||   ||| ||| |  | || |||| |  |||||||  | || | ||||||| | ||||| ||||||||||  | ||| | || ||    
T  28964818 tgtttgtttcagatca---cctttctctattcat-gttgcttttgagaggctt-ccatcaaagcttcaatccaggtattcctaatttc-taactattgat 28964911  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28964912 atctttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattc---attgttgaacatgttttatga 28965008  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28965009 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 28965042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 269
Target Start/End: Original strand, 34300485 - 34300607
Alignment:
Q  147 tgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcata 246  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  34300485 tgagagggttgccatgaaagcttaattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctttataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatg 34300584  T
Q  247 ttcaatgttttgtttgcttccgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34300585 ttcaatgttttgtttgcttccgc 34300607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Original strand, 13837534 - 13837625
Alignment:
Q  21 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837534 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt 13837625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Original strand, 46656638 - 46656839
Alignment:
Q  116 atcatctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgata 212  Q
    ||||||||||||| ||| ||   |||||||||| |||||||| || | ||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  46656638 atcatctcctctccttgttttagatcgttgttgttgagagggttgtcatgaaagcttcattcaggtatttctaataccctcattctcaatatcattgata 46656737  T
Q  213 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||  || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46656738 aatcaaacatatcgtagatccgatcataattatattgaatgttttatttacttcagctattaattcatatttattgaacatgttttatgaaatatgtttt 46656837  T
Q  313 ta 314  Q
    ||    
T  46656838 ta 46656839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26429731 - 26429639
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgcta 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26429731 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 26429639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 49435300 - 49435168
Alignment:
Q  359 atttttgttgtgcagaatttcaagttttgatacac------atgtcagcaaggacaaggaattatgatgtcatcagcagtttaccagatgccgatctcag 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||      |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |    
T  49435300 atttttgttgtgtagaatttcaatctttgatacaccctaaaatgtcatcaagaacaaggagttatgatgtcatcagtagtttaccagatgccattctctg 49435201  T
Q  453 ccatattctctcttttctcccaactaaacaggt 485  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49435200 ccatattctctcttttctcccaaccaaacaggt 49435168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12108977 - 12108716
Alignment:
Q  9 cgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac-tctattg 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| | | |||    
T  12108977 cgtacacggcaaactatcttttcttccgatctgaa-----cttgaggcataaaggtaccggttaaagaagaaccaaatcagtcgccgctaacctatgttg 12108883  T
Q  108 tgtgt--cagatcatctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    |||||  || |||| ||| |||||  | ||   | ||||  || | ||| || || | | | ||||| || ||| ||||| ||||||| ||||| |||||    
T  12108882 tgtgtttcatatcacctcatctctccgtttcagaccgttcatgttcagaaggttgtcattagagcttcattcaggtattcttaatacc-taattgttaat 12108784  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttg-tttgcttccgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12108783 atccttgataaatcaaacatgtcttagatcaaatcataatcatattcaatgttttgatttgcttccgc 12108716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24643665 - 24643534
Alignment:
Q  211 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcata------ttcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt--tatga 302  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24643665 taaataaaacatatcgtagatccgatcataatcataatcatgttcaatgttttatttacttccgctattgattcataaatgttgaacatgttttatatga 24643566  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24643565 agtttgtttt--attaagacctaaatttccaaca 24643534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 34300348 - 34300429
Alignment:
Q  19 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||    
T  34300348 aaactctctcatctcctcgtatgaagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaac 34300429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 49446568 - 49446471
Alignment:
Q  454 catattctctcttttctcccaactaaacaggttgttgccactagcgtcctatccaagagatggaagcatcaatggcgctcagttttcgatatcaactt 551  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||  | ||||| ||||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  49446568 catattctctcttttctccctaccaaacaagctgttgccactagtgtccttgcaaagaggtggatacatctatggtgctcagttctcgctatcaactt 49446471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24643815 - 24643773
Alignment:
Q  58 taaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24643815 taaaggtaccggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaac 24643773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 49427669 - 49427600
Alignment:
Q  454 catattctctcttttctcccaactaaacaggttgttgccactagcgtcctatccaagagatggaagcatc 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  49427669 catattatctcttttctcccaaccgaacaggcggttgccactagtgtcctttcgaagagatggacgcatc 49427600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 626 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 49435065 - 49434992
Alignment:
Q  626 gctttaacgagtttgtgcactccattctgctcaagctagattccatcaagagttttcacctcaaggttggatat 699  Q
    |||| |||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  49435065 gcttcaacgagtttgtgtactctgttttgttcaagctagattccatcaagagtttctggctcaaggttggatat 49434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Original strand, 46656538 - 46656610
Alignment:
Q  25 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgct 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||  |||||||    
T  46656538 tctcttctccccatctgaatagaattagagacataaaggtgccggttaaggaagagccaaatcaatcgccgct 46656610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2982531 - 2982458
Alignment:
Q  14 acggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatc 87  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||   |||| ||||||| |||||    
T  2982531 acggcgaactctcttttctccctatctgaagagaacttaagacataaagatacttattgaagaagaaccaaatc 2982458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 476
Target Start/End: Original strand, 49414824 - 49414884
Alignment:
Q  416 atgatgtcatcagcagtttaccagatgccgatctcagccatattctctcttttctcccaac 476  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  49414824 atgatgtgattagcagtttaccagatgctgtcctatgccatattctctcgtttctcccaac 49414884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1503 - 1176
Alignment:
Q  11 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1503 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgt 1404  T
Q  111 gt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatcctt 208  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1403 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 1304  T
Q  209 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctg 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1303 gataaatcaaacatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctg 1204  T
Q  309 tttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203 tttttaattaagacctaaatttccaaca 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3817624 - 3817294
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3817624 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 3817525  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3817524 gtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat 3817425  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3817424 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 3817325  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3817324 tctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 3817294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28421274 - 28420942
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28421274 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 28421175  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28421174 ttgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaat 28421075  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28421074 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 28420975  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  28420974 aatctgtttat-atcaagagctaaatttccaaca 28420942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3811482 - 3811149
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3811482 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 3811383  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3811382 gtgtgtttcagatcatcttctctcttttgttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat 3811283  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3811282 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 3811183  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaacagtt 339  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  3811182 tctgtttat-attaagacctacatttccaacagtt 3811149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 351633 - 351962
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  351633 accgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctatt 351732  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  351733 gtgtgtttcagatcatctcctct-tttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatat 351831  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351832 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 351931  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  351932 tctgtttat-attaagagctaaatttccaaca 351962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 20238796 - 20239127
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20238796 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 20238895  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20238896 tgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 20238995  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  20238996 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatgtatgattgttgaacatgttttatgaa 20239095  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20239096 atttgtttat-attaagacctaaatttccaaca 20239127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 339226 - 339547
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  339226 accgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctatt 339325  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||            |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  339326 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcattgttgttgatgagag------------agctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaa 339413  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339414 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatg 339513  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  339514 aaatctctttat-attaagagctaaatttccaaca 339547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5979490 - 5979156
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5979490 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactct 5979391  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5979390 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 5979291  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  5979290 catccttaataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatagtttgtttgctttcgctattgatttacgattgttcaacatgtattatg 5979191  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5979190 aaatctgtttttaattaagacctaaattttcaaca 5979156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 112 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42767501 - 42767277
Alignment:
Q  112 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgat 211  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767501 tcagatcatcttctctctttgattatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgat 42767402  T
Q  212 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttt 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42767401 aaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgttt 42767302  T
Q  312 ttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42767301 ttaattaagacctaaatttccaaca 42767277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35148324 - 35147986
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||    
T  35148324 acaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctgaccata 35148225  T
Q  105 ttgtgtgt----cagatcatctcctctctt--tggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccc-taattc 197  Q
    || |||||    ||||||||| |  ||  |  |  || | ||||||| |  ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35148224 ttttgtgtgtttcagatcatcccaccttctcatatttgttgttgttgttacgagggctaccatgaaagctttatccaggtattcctaatacccctaattc 35148125  T
Q  198 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  35148124 ttaatatccttgataaatcaaacgtgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttt 35148025  T
Q  298 tatgaaatctgtttttaattaagacct-aaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  35148024 tatgaaatctgttttt-attaagacataaaatttccaaca 35147986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 314
Target Start/End: Original strand, 43539823 - 43540140
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctcc---ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  43539823 accgtgcacggcaaactctctcttctccttcccatctgaagagaactttaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaaccat 43539922  T
Q  104 at----tgtgtgtcagatcat---ctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaatt 196  Q
    ||    ||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||   | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  43539923 attttgtgtgtttcagatcatcacctcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggattgttatcaaagcttcatccaggtattcataataccctaatt 43540022  T
Q  197 cttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgtt 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  43540023 tttaatattcttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatattttatttaattccgctattgattcataattattgaacatgtt 43540122  T
Q  297 ttatgaaatctgttttta 314  Q
     |||||||||||||||||    
T  43540123 ctatgaaatctgttttta 43540140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 5849376 - 5849703
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac-tctat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  5849376 accgtacacggcaaactctcttttctccccatctgaagataacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagacgccgctaacatatgt 5849475  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||| |  ||||||||    ||||       |||||||||| |||||| | || | | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  5849476 tgtgtatttcagatcatagtttctcc------atcgttgttgttgagagagctgtcattaaagcttcatccaggtattcctaatatcctaattcttgata 5849569  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacat-gttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||| |    
T  5849570 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttggttgcttccgctattgattcataatcattgaacataattttataa 5849669  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5849670 aatttgttttt-attaagacctaaatttgcaacag 5849703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 15843796 - 15843988
Alignment:
Q  10 gtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15843796 gtacacggcaaactctctattctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 15843895  T
Q  110 tg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattctta 200  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15843896 tgtttccgatcatctcctctctttggttattgttgttgattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15843988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 15860905 - 15861097
Alignment:
Q  10 gtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15860905 gtacacggcaaactctctattctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 15861004  T
Q  110 tg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattctta 200  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15861005 tgtttccgatcatctcctctctttggttattgttgttgattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15861097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 336
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12804176
Alignment:
Q  55 gcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattg-----tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||  | |||     ||| ||| |||| |||||||||||    ||||||||||  ||    
T  12803893 gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaaccatgttgatgtttgtttcaaatcacctcctctcttt----atcgttgttgtcga 12803988  T
Q  150 gagggatgccttgaaagctttatcc--agatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatat 247  Q
    ||||| |||    ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  12803989 gagggctgctaccaaagcttcatccccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatgttcatgt 12804088  T
Q  248 tcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12804089 tcaatgttttgcttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 12804176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22742243 - 22741901
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  | |    
T  22742243 accgtacatggcaaaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgatgaaaaaccaaatcagccgccgctaaccgtgt 22742144  T
Q  106 tg-----------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttg-ttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaatacccta 193  Q
    ||           ||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||   |||||| ||||   | ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  22742143 tgatgttgatatttgtttcagatcatctcctctct----ttatcgttgtttgtcaagagggctgccaccatagcttcatccaggtattcctaata-ccta 22742049  T
Q  194 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttg-------attcataattgt 286  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||       ||||||||||||    
T  22742048 atcctcaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttcagtttgcttccgctattgttgattcattcataattgt 22741950  T
Q  287 tgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  22741949 tgaacatgttttatgaaacctgttctt-attgagacctaaatttccaaca 22741901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 336
Target Start/End: Original strand, 26383603 - 26383806
Alignment:
Q  136 atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 235  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383603 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatcaaggtattcctaataccctaattcttagtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 26383702  T
Q  236 tcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtt---tttaattaagacctaaatttcc 332  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| ||| |||| |||||||||    
T  26383703 tcatgatcatgttcaatattttgtttgtttctgttgttgattcataattgttgaacatgtcttatgaaatctattctgttttatttagacttaaatttcc 26383802  T
Q  333 aaca 336  Q
    ||||    
T  26383803 aaca 26383806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30219438 - 30219269
Alignment:
Q  126 ctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtc 225  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30219438 ctctttgtttatcgttgatgctgagatggttgtcatgaaagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtc 30219339  T
Q  226 gtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgt 295  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  30219338 gtagatccgttcatattcatgttcaacgttttgtttgattccgctaatgattcataattattgaacatgt 30219269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35150856 - 35150761
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35150856 acaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccgctaac 35150761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 26380935 - 26381239
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||    
T  26380935 acacgacaaactctctcttctcccgatctgaagaaaactttaggcataaaggtagcagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-gtaagttgtg 26381033  T
Q  112 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgat 211  Q
    | |  |||| || |   |||  | |||||||||| |||||||| || | | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  26381034 t-atttcatatcat-ggtttcttcatcgttgttgttgagagggttgtcatcaaagcttcatccag-tactcctaataccctaattcttagcatgcttgat 26381130  T
Q  212 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttt 311  Q
    |||         | ||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26381131 aaa---------tagtagatctgatcatgatcatgttcaatattgtgtttgttttcccccttgattcataattgttgaacatgtcttatgaaatctattt 26381221  T
Q  312 ttaattaagacctaaatttc 331  Q
    |  ||| |||||||||||||    
T  26381222 t--atttagacctaaatttc 26381239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 7608306 - 7608475
Alignment:
Q  25 tctcttctcccc-atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactc---tat-tgtgtgtcagatca 119  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||  |   ||| ||||| ||||||||    
T  7608306 tctcttctcccccatcggaagagaacttgagtcataaaggtaccgatttaggaagtaccaaatcagtcgccgctaatccgcttatgtgtgtttcagatca 7608405  T
Q  120 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaatac 189  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  || | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  7608406 tctcatctctttggttatcattgttgatgagatgactgtcatcaaagctttattcagatatttctaatac 7608475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18666622 - 18666547
Alignment:
Q  191 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttcc 267  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18666622 ctaattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgta-atctgatcataatcaagttcaatgttttgtttgcttcc 18666547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 26383513 - 26383569
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 61  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26383513 acaccggacacggcaaactctctcttctccctatttgaagagaacttgaggcataaa 26383569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Original strand, 3677876 - 3677965
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaact 101  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||    
T  3677876 acacgacaaacattctcttctctccatctgaagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaact 3677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18656967 - 18656883
Alignment:
Q  6 caccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagc 90  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  18656967 caccatacacgacaaactttctcttctctccgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcagc 18656883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 24690848 - 24690881
Alignment:
Q  67 cggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24690848 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 24690881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12686494 - 12686161
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12686494 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 12686395  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12686394 ttgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaat 12686295  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12686294 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 12686195  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  12686194 aatctgtttat-atcaagagctaaatttccaacag 12686161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12692596 - 12692264
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12692596 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 12692497  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12692496 ttgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaat 12692397  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12692396 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 12692297  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  12692296 aatctgtttat-atcaagagctaaatttccaaca 12692264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28525699 - 28525365
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28525699 accgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctatt 28525600  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28525599 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatat 28525500  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28525499 ccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 28525400  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaacagttg 340  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28525399 tctgtttat-attaagacctaaatttccaacagttg 28525365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28531795 - 28531465
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28531795 accgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctatt 28531696  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28531695 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatat 28531596  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28531595 ccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaa 28531496  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28531495 tctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 28531465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7389858 - 7389531
Alignment:
Q  10 gtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgt 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7389858 gtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgt 7389759  T
Q  109 gtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatcc 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7389758 gtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc- 7389660  T
Q  207 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  7389659 ttgataaatcaaacatgtcgtggatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatt 7389560  T
Q  307 tgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7389559 tgtttat-attaagacctaaatttccaaca 7389531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 41297123 - 41297453
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaact---tgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41297123 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaactacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 41297222  T
Q  101 tctattgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattct 198  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||| |||||||||||||||||||||    
T  41297223 tctattgtgtgtttcagatcacctcctctccttggttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaag------ccaggtattcctaataccctaattct 41297316  T
Q  199 taatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgtttt 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  41297317 ttatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgtatt 41297416  T
Q  299 atgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  41297417 atgaaatctctttat-attaagacccaaatttccaaca 41297453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30384701 - 30384359
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaa-ctct 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |    
T  30384701 acaccgtacacggcaaacattctcttctccccatctgaagagaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaagctat 30384602  T
Q  104 attgtgtgtc-------agatcatctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaatacccta 193  Q
     ||||||||        ||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||  ||||| | || |  |||||||| |||||| ||||| |||||||||     
T  30384601 gttgtgtgtttcagattagatcatctcctctccttgttttagatcgttgatggcgagagagttgtcacgaaagcttcatccaggtattcttaataccctt 30384502  T
Q  194 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30384501 attcttaatatccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcataatcgtgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacat 30384403  T
Q  294 gttttatgaaatctgt-ttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30384402 gttttatgaaatctgtttttttattaaaacctaaatttccaaca 30384359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 30772133 - 30772460
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat----tg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |    ||    
T  30772133 acacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaaccctttgttgtg 30772232  T
Q  108 tgtgtcagatcatctcctct-ct-ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatc 205  Q
    ||| |||||||||| |  || || ||| |||| ||||||||   ||||| |||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30772233 tgtttcagatcatcacaccttctcttgtttattgttgttga---gagggctgccataaaaactttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatc 30772329  T
Q  206 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatg-ttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30772330 cttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataatcatgttcattgtttttgtttgcttccactgtttattcataattattgaacatgttttatgaaa 30772429  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30772430 tttattttt-attaagaactaaatttccaaca 30772460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32094340 - 32094142
Alignment:
Q  137 tcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 236  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32094340 tcgttgttgttgagagggctgctatgaaagctttattcaggtattcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctat 32094242  T
Q  237 cataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094241 cataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattataaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 32094142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19066427 - 19066091
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |     
T  19066427 acaccggacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgccgctaaccgtg 19066328  T
Q  105 ttg---------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaatacccta 193  Q
    |||         ||| ||||||||  | ||||||||    ||||||||||  ||||| | ||||   ||||||| |||  | | ||||||||||||| ||    
T  19066327 ttgatgtgggtttgtttcagatcactttctctcttt----atcgttgttgtcgagagagctgccaccaaagcttcatctcctggtattcctaataccata 19066232  T
Q  194 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||    
T  19066231 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgcttaatgttttgtttgcttccgctaatgatttataatcgttgaacat 19066132  T
Q  294 gttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaac 335  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19066131 ggtttatgaaatatgttttt-attaagacttaaatttccaac 19066091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32097138 - 32096943
Alignment:
Q  140 ttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 239  Q
    |||||| |||||||  |||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32097138 ttgttgttgagaggactgctatgaaagctttattcaggtaatcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcat 32097040  T
Q  240 aatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097039 aatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 32096943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Original strand, 24054336 - 24054502
Alignment:
Q  161 tgaaagctttatccagatattcctaata-ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgt 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24054336 tgaaagctttatccaggtattcctaatatcccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgt 24054435  T
Q  260 ttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaa 327  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24054436 ttgcttccgctatagatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttt-attaagacctaaa 24054502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32097338 - 32097165
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097338 acaccgtacacggaaatactctctattctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 32097239  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatcca 175  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||    
T  32097238 attgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgattaaagggctgctatgaaagctttatcca 32097165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19060079 - 19059747
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattg---- 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||        
T  19060079 acacgacaaactctctcttctcccgatatgaagagaacttgaggcataaaagtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgtgttgatgt 19059980  T
Q  108 -------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaataccctaattct 198  Q
           ||| |||||||| || ||||||||    ||||||||||  ||||||| ||||   ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  19059979 ggatgtttgtttcagatcaccttctctcttt----atcgttgttgtcgagagggctgccaccaaagcttcatctccaggtatttctaataccctaattct 19059884  T
Q  199 taatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgtttt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||| |||||||||||||| |   ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  19059883 taatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgtttatattcatgtttaatattttgtttgcttcccctaatgatttataatcgttgaatacgtttt 19059784  T
Q  299 atgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19059783 atgaaatatgttttt-attaagacctaaatttccaaca 19059747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32094537 - 32094364
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32094537 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaactct 32094438  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatcca 175  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||  ||||| |||||||||    
T  32094437 attgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttattgttgttgattaaagggctgctatgaaacctttatcca 32094364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215147
Alignment:
Q  183 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataa 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16215309 ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatccaatcataatcatgttaaatgttttgtttgcttccgctattgattcataa 16215210  T
Q  283 ttgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacagttgagactt 346  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16215209 ttgttgaatatgtgttatgaaatctgttttt-ataaagacctaaatttctaacaggtaagactt 16215147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 20499982 - 20500231
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||  |    
T  20499982 acaccgtacacggcaaaactctctgttctctccatttgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaagaaccaaatcaaccgctgctaacctt 20500081  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
     |||| |||  ||||||  ||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |||| | |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||     
T  20500082 cttgtttgtttcagatcgcctt-tctctctgtttatcgttgatgttgagagggctgccataaaagttttatccaggtatttctaatactctaattcttag 20500180  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaat 252  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20500181 tatccttgataaatcaagtatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 20500231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610321
Alignment:
Q  194 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  14610184 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatggtttatttgcttccgctattaattcataattgttgaacat 14610283  T
Q  294 gttttatgaaatctg-tttttaattaagacctaaattt 330  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14610284 gttttatgaaatctgtttttttgttaagacctaaattt 14610321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 14610013 - 14610141
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  14610013 acaccgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctt 14610112  T
Q  105 ttg--tgtgtcagatcatctcctctcttt 131  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  14610113 ttgtttgtttcagatcatctcctctcttt 14610141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 314
Target Start/End: Original strand, 26509696 - 26510002
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |  |||||||     
T  26509696 accgtacacggtaaactctcccttttcc--atctgatgagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaaatcagccgccaccgactctatg 26509793  T
Q  107 gtgtgt----cagatc---atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattctt 199  Q
     |||||    ||||||   || ||  ||||||    ||||||| || |||||||  || | | ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  26509794 ttgtgtatttcagatcgcgatttctcctctttcag-atcgttgatgttgagaggactgtcatcaaagcttcattcatatattcctaatacc-taattctt 26509891  T
Q  200 aatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgtttta 299  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||| || ||||||||||||||||||||| |   |  ||||||||  ||||||||||||||    
T  26509892 aatatc-ttgatgaatcaaatatgtcgtagtttatatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccac---tatttcataatgattgaacatgtttta 26509987  T
Q  300 tgaaatctgttttta 314  Q
    |||||||||||||||    
T  26509988 tgaaatctgttttta 26510002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542336
Alignment:
Q  190 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgtttt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  28542269 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagtttcgatcataatcatgttcaatgtttt 28542336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26316922 - 26316796
Alignment:
Q  188 accctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgtt 287  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||| |  || ||| | |||| ||    
T  26316922 accctaattattaataccgtagataaatcaaacatgtcctagatccaatcatattaatgttcaatgttttttttgcttccactattaatttaaaattatt 26316823  T
Q  288 gaacatgttttatgaaatctgttttta 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26316822 gaacatgttttatgaaatatgttttta 26316796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37896423 - 37896286
Alignment:
Q  193 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaaca 292  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||  ||||||||| ||| || || |    
T  37896423 aattattaatattcttgataaatcaatcatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaacattttatttacttctgctgttgattcatgattattaaata 37896324  T
Q  293 tgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttc 331  Q
    || |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||    
T  37896323 tgatttatgaaat-tcgttttatttaagacctaattttc 37896286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8706672 - 8706532
Alignment:
Q  67 cggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac----tctattgtgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttg 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    |||| || ||||| || || | ||    
T  8706672 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaaccccttcaatt-tgtttcagatcatctcctctctttcgt----gttgctgttgagatggttgtcatg 8706578  T
Q  163 aaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatcctt 208  Q
    ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706577 aaagcataattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 8706532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8706508 - 8706454
Alignment:
Q  275 attcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8706508 attcataattgttgaacatattttatgaaatctattttt-attaagacctaaattt 8706454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26318561 - 26318492
Alignment:
Q  18 caaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatca 88  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  26318561 caaactctctcttctccc-atctgaagagaacttatggtataaatgtaccggttgagaaagaaccaaatca 26318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 33753550 - 33753476
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 79  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33753550 acaccgtacacaccatactctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33753476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 33849168 - 33849110
Alignment:
Q  21 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 79  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33849168 actctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33849110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8651117 - 8650786
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8651117 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 8651018  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8651017 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 8650918  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650917 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaa 8650818  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  8650817 atctgtttat-attaagagctaaatttacaaca 8650786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4580637 - 4580304
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4580637 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 4580538  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4580537 attgcgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 4580438  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4580437 tatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatg 4580338  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4580337 aaatctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 4580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 25354055 - 25354388
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25354055 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 25354154  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25354155 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 25354254  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  25354255 tatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgctttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatg 25354353  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25354354 aaatctgtttttaattaagatctaaatttccaaca 25354388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21191179 - 21190849
Alignment:
Q  11 tacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttga---ggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21191179 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 21191080  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21191079 gtgtgtttcatatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatat 21190980  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21190979 ctttgataaatcaaatatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaa 21190880  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21190879 tctgtttataa-taagacctaaatttccaaca 21190849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 25343468 - 25343805
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25343468 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 25343567  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  25343568 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgaaagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaa 25343667  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaa----catgttt 297  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||    ||||| |    
T  25343668 tat-cttgataaatcaaaaatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgatttacgattgttgaacatgcatgtat 25343766  T
Q  298 tatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25343767 tatgaaatttgtttttaattaagatataaatttccaaca 25343805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31756528 - 31756194
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat----tg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    ||    
T  31756528 acacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatattgtg 31756429  T
Q  108 tgtgtcagatcatc---tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||| ||||||||||   |||||||| ||  ||| |||| || |||||||| || | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31756428 tgtttcagatcatcacctcctctctctgtgtatggttgctgttgagagggctgtcatgaaagctctatccagatattcataataccctaattcttaatat 31756329  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756328 ccttgataattcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttatttgcttccgttgttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 31756229  T
Q  305 tctgt-ttttaattaagacctaaatttccaacagt 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31756228 tctgtttttttattaagacctaaatttccaacagt 31756194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32035488 - 32035268
Alignment:
Q  116 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32035488 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaat 32035389  T
Q  216 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  32035388 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttat-a 32035290  T
Q  316 ttaagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32035289 ttaagacctaaatttccaacag 32035268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21782941 - 21782736
Alignment:
Q  130 ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782941 ttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag 21782842  T
Q  230 atccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatt 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21782841 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttat-attaagacctaaatt 21782743  T
Q  330 tccaaca 336  Q
    || ||||    
T  21782742 tctaaca 21782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21197329 - 21197004
Alignment:
Q  21 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac--tctat--------tgtgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||        ||| |    
T  21197329 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgaagttgatgttt 21197230  T
Q  111 gt--cagatcatctcctctctttggttatcg---ttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatc 205  Q
    ||  || |||| ||||||||  |  ||||||   |||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21197229 gttccatatcacctcctctc--tccttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagatttatccaggtattcataata--ctaattcttgatatc 21197134  T
Q  206 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaat 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21197133 cttgataaatcaaacatgttgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaat 21197034  T
Q  306 ctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  21197033 ctgttttt-actatgacctaaatttccaaca 21197004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8662921 - 8662764
Alignment:
Q  178 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgatt 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8662921 tattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 8662822  T
Q  278 cataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  8662821 cataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttat-attaagagctaaatttacaaca 8662764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21770881 - 21770537
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  21770881 acaccgtacacggcaaaactctctcttctcc--atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgt 21770784  T
Q  104 a-------ttg-----tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatg---agagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaata 188  Q
            |||     ||| |||||||| ||||| |||    |||||||||||| ||   |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  21770783 tgatgaagttgatgtttgtttcagatcacctcctatctcc--ttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttattcagatattcctaata 21770686  T
Q  189 ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttg 288  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |  || ||| |  |||||||    
T  21770685 c--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttacttcctctattaatttacgattgttg 21770588  T
Q  289 aacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacagtt 339  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21770587 atcatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaattttcaatagtt 21770537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Original strand, 17581491 - 17581797
Alignment:
Q  19 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat-tgtgtg--tcag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||  |   ||| ||  ||||    
T  17581491 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgttgatgtttgcttcag 17581590  T
Q  116 atcatctcctctctt-tggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaa 214  Q
    |||| |||||||||  | ||  | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||    
T  17581591 atcacctcctctctccttgtcgttgttgttgttgagagggctgtcatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt---------ggtaaa 17581681  T
Q  215 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttta 314  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||     
T  17581682 tcaaacatgtcgtagatcctataataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgattcataatagttgaacatgttttatgaattatgttttt- 17581780  T
Q  315 attaagacctaaatttc 331  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  17581781 atttagatctaaatttc 17581797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 336
Target Start/End: Original strand, 18778564 - 18778760
Alignment:
Q  140 ttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatca 238  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18778564 ttgttgttaagagggctgccatgaaagttttatccaggtattcctaaaacccctaattcttaatata-ttgataaatcaaatacgtcgtagatccgatca 18778662  T
Q  239 taatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatg-ttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18778663 taattatgttcaacgttttgtttgcttccgctattgattcataattattgaacatgtttttatgaaatttg-ttttaattaagacctaaatttccaaca 18778760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21783640 - 21783337
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggttgaggaagaactaaatcagccgccgct 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  21783640 acaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgtt 21783541  T
Q  98 aac--tctat----------tgtgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgat---gagagggatgccttgaaagctttatccagatattc 182  Q
    |||  |  ||          | ||| ||| |||| ||||||||  |  ||||| |||||| |   ||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||    
T  21783540 aaccgttgatgaagttgatgtttgtttcaaatcacctcctctc--tccttatctttgttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattc 21783443  T
Q  183 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataa 282  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |    
T  21783442 ctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacta 21783345  T
Q  283 ttgttgaa 290  Q
    ||||||||    
T  21783344 ttgttgaa 21783337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21789863 - 21789560
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggttgaggaagaactaaatcagccgccgct 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  21789863 acaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgtt 21789764  T
Q  98 aac--tctat----------tgtgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgat---gagagggatgccttgaaagctttatccagatattc 182  Q
    |||  |  ||          | ||| ||| |||| ||||||||  |  ||||| |||||| |   ||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||    
T  21789763 aaccgttgatgaagttgatgtttgtttcaaatcacctcctctc--tccttatctttgttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattc 21789666  T
Q  183 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataa 282  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |    
T  21789665 ctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacta 21789568  T
Q  283 ttgttgaa 290  Q
    ||||||||    
T  21789567 ttgttgaa 21789560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 336
Target Start/End: Original strand, 6098000 - 6098158
Alignment:
Q  178 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcc-tttgat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |   ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  6098000 tattcctaataccctaattcttaacatc-ttgataaatcaaacacgtcgtagatccgttctt---catgttcaatgttttgtctacttccgctatttgat 6098095  T
Q  277 tcataattgt---tgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  6098096 tcataattgttgttgaacatgttttatgaaatttgttttttattaagacctaagttttcaaca 6098158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34603457 - 34603337
Alignment:
Q  191 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaa 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||  |    
T  34603457 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgctt-cgctatttattcataattgttaca 34603359  T
Q  291 catgttttatgaaatctgtttt 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  34603358 catgttttattaaatatgtttt 34603337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34724734 - 34724614
Alignment:
Q  191 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaa 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||  |    
T  34724734 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgctt-cgctatttattcataattgttaca 34724636  T
Q  291 catgttttatgaaatctgtttt 312  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  34724635 catgttttattaaatatgtttt 34724614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 30905896 - 30905819
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacta 83  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  30905896 acaccgtactcgacaaactctctcttc-ccccatctgaagagaacttgaggcataaatataccaattgaggaagaacta 30905819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 335
Target Start/End: Original strand, 6102693 - 6102803
Alignment:
Q  229 gatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcc-tttgattcataattgt---tgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacct 324  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  6102693 gatccgttcatattgatgttcaatgttttgtctgcttccgctatttgattcatgattgttgttgaacatattttatgaaatatgttttttatgaagacct 6102792  T
Q  325 aaatttccaac 335  Q
    |||||||||||    
T  6102793 aaatttccaac 6102803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Original strand, 1106232 - 1106294
Alignment:
Q  178 tattcctaataccct-aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 239  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1106232 tattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcat 1106294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 20745401 - 20745497
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaact 101  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||| |||| || | |||||||||    
T  20745401 acaccgtacatggcatattctcacttatttccatctgaagagaacttggggcttaaaagtaccgattgaggaaaaaccaaattagtcaccgctaact 20745497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17900282 - 17900190
Alignment:
Q  174 cagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttcc 267  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||| |||| | || | |||| ||||||||||||||    
T  17900282 cagatattccaaatacc-tgattattaatatccttgatggaccaaacatgttgtagattcgaacatatttatgtacaattttttgtttgcttcc 17900190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 32890734 - 32891065
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32890734 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 32890833  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32890834 tgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 32890933  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32890934 tccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaa 32891033  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32891034 atctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 32891065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 32896858 - 32897190
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32896858 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 32896957  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32896958 tgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 32897057  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32897058 tccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaa 32897157  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32897158 atctgtttat-attaagacctaaatttccaacag 32897190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5542476 - 5542142
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5542476 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 5542377  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5542376 attgtgtgtttcagatcatctcccctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatctaggtattcctaataccctaattcttaa 5542277  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5542276 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattata 5542177  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  5542176 aaatctatttat-attaaaacctaaatttccaacag 5542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 9935125 - 9935456
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9935125 acaccgtacacgacaaactctct--tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaatcta 9935222  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9935223 ttgtgtgtttcagatcatctcctatctttggttaacgttgttgattagagggctgctatgaaagatttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 9935322  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935323 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 9935422  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9935423 aatctgttttt-attaagacctaaatttccaacag 9935456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 14417785 - 14418114
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  14417785 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaacta 14417884  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14417885 ttgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtcgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 14417984  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  14417985 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttaaacatgttttatga 14418081  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14418082 aatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 14418114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 36818818 - 36819147
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36818818 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgatgagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 36818917  T
Q  107 gtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36818918 gtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat 36819017  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  36819018 -cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccactattgattcataattgttgaacatgtattatgaga 36819116  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36819117 tttgtttat-attaagacctaaatttccaaca 36819147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42993294 - 42992989
Alignment:
Q  29 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42993294 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctc 42993195  T
Q  127 tctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42993194 tctttggttatcgttgttgatgagagggtggctacaaaagctttatcaaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcg 42993096  T
Q  227 tagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993095 tagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaa 42992996  T
Q  327 atttcca 333  Q
    |||||||    
T  42992995 atttcca 42992989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 10705683 - 10706020
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10705683 accgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttaagccataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctat 10705782  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10705783 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccaggtaatcctaataccctaattcttaata 10705882  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcata------ttcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||| ||||||| |    
T  10705883 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttacgctattgatttacgattgttaaacatgtat 10705981  T
Q  298 tatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705982 tatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 10706020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Original strand, 10699875 - 10700127
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10699875 accgtacacggcaatactctctcttctctccatctgacgaaaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 10699974  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699975 tgtgtgtttcagatcatttcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagttttatccagatattcctaataccctaattcttaata 10700074  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgtttt 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10700075 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 10700127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22220041 - 22219706
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  22220041 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaactttat 22219942  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatg----------agagggatgccttgaaagcttta-tccagatattcctaataccct 192  Q
    ||| |||  |||||||  |  | |||||| |||||||||||| ||          |||||| |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  22219941 tgtttgtttcagatcaattttt-tctttgtttatcgttgttgttggttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcaatccaggtattcctaataccct 22219843  T
Q  193 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgtttt-gtttgcttccgcctttgattcataattgttgaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||||||| | ||||||    
T  22219842 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaaagttttctttttcttctgctattgattcataactattgaac 22219743  T
Q  292 atgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatt 329  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22219742 atgttttatgaaatctcttttt-attaagacctaaatt 22219706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39727609 - 39727300
Alignment:
Q  19 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat---tgtgtgtcag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||     | ||| ||||    
T  39727609 aaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcagccgctaacccttgctgtttgtttcag 39727510  T
Q  116 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 215  Q
    |||| || ||||||||    | |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727509 atcaccttctctcttt----accgttgttgttgagagggttgccaagaaagttttttccaggtatttcttataccctaattcttaatatccttgataaat 39727414  T
Q  216 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttta- 314  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39727413 caaacatgt---------gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgttattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctatttttat 39727323  T
Q  315 -attaagacctaaatttccaaca 336  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  39727322 tattaagacctaaatttccaaca 39727300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39735862 - 39735531
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta- 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||      
T  39735862 accgtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagtacttgaggcataaatgtaccagttaaggaagaatcaaatcagccgccgctaacccttg 39735763  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    |||| |||  ||||||| || ||||||||    | |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  39735762 ttgtttgtttcagatcaccttctctcttt----accgttgttgttgagagggttgccatgaaat-tttatccaggtattccttataccctagttcttaat 39735668  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735667 atctttgataaatcaaacatgtcgtagatacaatcataatcatgttcaatattttatttacttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 39735568  T
Q  303 aatctgttttta--att-aagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  39735567 aatctatttttattattaaaaacctaaatttccaaca 39735531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 336
Target Start/End: Original strand, 7771202 - 7771408
Alignment:
Q  128 ctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7771202 ctttggttatcgttgttgatgagagggttgctacaaaagctt-atccaggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgt 7771300  T
Q  228 agatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaa 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7771301 agatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttat-attaagacctaaa 7771399  T
Q  328 tttccaaca 336  Q
    |||||||||    
T  7771400 tttccaaca 7771408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14799564 - 14799398
Alignment:
Q  169 ttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccg 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14799564 ttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 14799466  T
Q  269 cctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14799465 ctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttat-attaagacctaaatttccaacag 14799398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1882939 - 1882734
Alignment:
Q  134 ttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgt-aga 230  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1882939 ttatcgttgttgttgagagggctgccatgaaagcttcatctccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtcattaga 1882840  T
Q  231 tccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 330  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1882839 tccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcttaattgttgaacatgttctatgaaatctgttttatattaagacctaaattt 1882740  T
Q  331 ccaaca 336  Q
    ||||||    
T  1882739 ccaaca 1882734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 42033650 - 42033740
Alignment:
Q  10 gtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42033650 gtacacggcaaactctctcttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 42033740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1883128 - 1883039
Alignment:
Q  11 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1883128 tacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaac 1883039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 24250171 - 24250278
Alignment:
Q  227 tagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaa 326  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  24250171 tagatccgatcataataatgttcaatattttgtttgtttccgctattgattcatatttgttcaacatgttttatgaaatatgttttt--ttaagacctaa 24250268  T
Q  327 atttccaaca 336  Q
    |||| |||||    
T  24250269 attttcaaca 24250278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Original strand, 1171414 - 1171493
Alignment:
Q  250 aatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttc 331  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1171414 aatgttttgtttgcttccgcggttgaatcataattgttgaatatgtttcatgaaatctgtttt--attaagacctaaatttc 1171493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 1171215 - 1171414
Alignment:
Q  16 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac---tctattgtgtgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |  | ||| |    
T  1171215 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaac--------------taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgttgtttgttt 1171300  T
Q  113 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgata 212  Q
    |||||||  || ||||| || |||  |||| || |||||| | |||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  1171301 cagatcacatcatctctctgtttactgttgctgttgagagagctgccataaaagctttaaccaggtattcctaata-cctaattcttgttat-cttgata 1171398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Original strand, 10700132 - 10700186
Alignment:
Q  282 attgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700132 attgttaaacatgtattatgaaatatgtttttaattaagacctaaatttccaaca 10700186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Original strand, 39689782 - 39689838
Alignment:
Q  279 ataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  39689782 ataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttt-attaaaacctaagtctccaaca 39689838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31379502 - 31379430
Alignment:
Q  238 ataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtt 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  31379502 ataatcatgttcaatgttttatttgcctccgtcattgattcataattattaaacatgtgttatgaaatttgtt 31379430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31399119 - 31399047
Alignment:
Q  236 tcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctg 308  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  31399119 tcataatcatgttcaatgtattgtttgcctccactattgattcataattattgaacatatgttattaaatctg 31399047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Original strand, 42033856 - 42033930
Alignment:
Q  259 tttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| ||  |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  42033856 tttgcttctgctattgattcattgttgttgaa--tgttttatgaaatctatttttagt-aagacctaaatttccaaca 42033930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28683258 - 28682928
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  28683258 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaactctatt 28683159  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28683158 gtgtgtttcagatcatccactctccttggttatcgttgttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataa 28683059  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683058 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 28682959  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28682958 tctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 28682928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 36750258 - 36750591
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36750258 acaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 36750357  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36750358 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 36750457  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750458 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatg 36750557  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36750558 aaatctgttttt-attaagacttaaatttccaaca 36750591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 13455943 - 13456276
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13455943 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactct 13456042  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13456043 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 13456142  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13456143 tacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatg 13456242  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13456243 aaatctatttat-attaagacctatatttccaaca 13456276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 13461884 - 13462217
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13461884 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactct 13461983  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13461984 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 13462083  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13462084 tacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatg 13462183  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13462184 aaatctatttat-attaagacctatatttccaaca 13462217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44717121 - 44716787
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44717121 acaccgtacacggcaatactatctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 44717022  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44717021 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 44716922  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgtttt-gtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttat 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  44716921 tatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttcttttgcttccgctattgattgataaccgttgaacatgttttat 44716822  T
Q  301 gaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44716821 gatatctgttttt-attaagacctaaatttctaaca 44716787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 336
Target Start/End: Original strand, 31002237 - 31002554
Alignment:
Q  21 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31002237 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatc 31002336  T
Q  119 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31002337 atctcctctttttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaa 31002436  T
Q  219 acatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaatta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31002437 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaatta 31002536  T
Q  319 agacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31002537 agacctaaatttccaaca 31002554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 337
Target Start/End: Original strand, 31008215 - 31008533
Alignment:
Q  21 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31008215 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatc 31008314  T
Q  119 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31008315 atctcctctttttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaa 31008414  T
Q  219 acatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaatta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31008415 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaatta 31008514  T
Q  319 agacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31008515 agacctaaatttccaacag 31008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 30965173 - 30965505
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  30965173 accgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctat 30965272  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30965273 tgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagatttatacaggtattcctaataccctaattcttaaaa 30965372  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  30965373 taattgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttatgattgttgaacatgtattatgaa 30965472  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30965473 atctgtttttaattaagacctaaatttctaaca 30965505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13149968 - 13149674
Alignment:
Q  36 catctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctctctttgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13149968 catctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttgg 13149869  T
Q  134 ttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13149868 ttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagttttatc-aggtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatcc 13149771  T
Q  234 gatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttc 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13149770 gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttat-attaagacctaaatttc 13149674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35090966 - 35090637
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35090966 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctat 35090867  T
Q  106 tg----------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaat 195  Q
    |           ||| ||||||||   ||||||| |  |||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35090866 ttatttattgtttgtttcagatca---cctctctgt--ttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaat 35090772  T
Q  196 tcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgt 295  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35090771 tgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgt 35090672  T
Q  296 tttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttc 331  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35090671 tttatgaaatctgtttat-attaagacctaaatttc 35090637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35084993 - 35084665
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35084993 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctat 35084894  T
Q  106 tg----------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaat 195  Q
    |           ||| ||||||||   ||||||| |  |||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35084893 ttatttattgtttgtttcagatca---cctctctgt--ttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaat 35084799  T
Q  196 tcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgt 295  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35084798 tgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgt 35084699  T
Q  296 tttatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 330  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35084698 tttatgaaatctgtttat-attaagacctaaattt 35084665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438691
Alignment:
Q  11 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct--at-tg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  || |     
T  35439014 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgtt 35438915  T
Q  108 tgtgtcagatcatctcctctctt----tggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||| |||||||| |||||||||     | ||| | |||||||  |||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||    
T  35438914 tgtttcagatcacctcctctctccttatcgttgttgttgttgtcgagacggctgccatgaaagctttatacaggtattcctaataccctatttcctagta 35438815  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35438814 ---------aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataactgttgaacatgttttatgaa 35438724  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaacagt 338  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35438723 atttgtttt--attaaggcctaaatttccaacagt 35438691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11048851 - 11048536
Alignment:
Q  20 aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattg-----tgtgtca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| | |||     ||| |||    
T  11048851 aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaattagtcgccg-taactgtgttgatatttgtttca 11048753  T
Q  115 gatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaa 214  Q
    ||||| || |||||||     || |||||||  ||||||| || | | |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |    
T  11048752 gatcaccttctctcttg----attgttgttgtcgagagggctgtcataaaagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtaca 11048657  T
Q  215 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttta 314  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  11048656 tcaaacatgacgtatatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcagctattgattcataattgttggacatgttttatgaaatttattttta 11048557  T
Q  315 attaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  11048556 a-taagacctaaatttccaaca 11048536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 23343398 - 23343737
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |     
T  23343398 acaccgtacacgggaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgtg 23343497  T
Q  105 ttg-----------tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaataccc 191  Q
    |||           ||| |||||||| ||||||| |||    || |||||||  ||||||| ||||   |||| || |||  ||  ||||||||||||||    
T  23343498 ttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctattt----attgttgttgtcgagagggctgccaccaaagtttcatctccatgtattcctaataccc 23343593  T
Q  192 taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaac 291  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  23343594 caactcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattcgtaatcgttgaac 23343693  T
Q  292 atgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||| || || || |||| ||||||||| ||||    
T  23343694 atgttttatgaaatctcttctt-atcaagatctaaatttcaaaca 23343737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 19879446 - 19879536
Alignment:
Q  9 cgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgcta 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  19879446 cgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaagaagaatcaaatcagccgccgcta 19879536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 336
Target Start/End: Original strand, 29833188 - 29833384
Alignment:
Q  136 atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 235  Q
    |||||||||| |||||||| || | | ||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  29833188 atcgttgttgttgagagggttgtcatcaaa-cttcatccaggtattcttaatacc-taattattgttatc-ttgataaatcaaacatgttgtcgatccga 29833284  T
Q  236 tcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaac 335  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||| |||||   |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  29833285 tcataattatgttcaatattttatttgtttccgttattgattcacaattattaaacatgtattatgaaatctctttat-atttatacctaaatttctaac 29833383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Original strand, 29034697 - 29034759
Alignment:
Q  37 atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  29034697 atctgaagagaacttgagacataaaggtaccagttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaa 29034759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1388093 - 1388003
Alignment:
Q  244 atattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  1388093 atattcaatgttttgtttgtttccgttattgattcataattattgaa-atgttttatgaagtatattttt-attttgacctaaatttacaaca 1388003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 29833079 - 29833142
Alignment:
Q  38 tctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaa-tcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  29833079 tctgaagagaacttgaaggataaatgtatcggttgaggaagaaccaaatttagccgccgctaac 29833142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 34739832 - 34740164
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34739832 accgtacacgacaaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 34739931  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34739932 gtgtgtttcagatcattttctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttattcaggtattcctaataccctaattcttaatat 34740031  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34740032 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgatgaacatgttttatgaaa 34740131  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaacagt 338  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34740132 tctgtttat-attaagacctaaatttcctacagt 34740164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25387818 - 25387487
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25387818 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 25387719  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25387718 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtttttaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 25387619  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25387618 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatatttgttgaacatgttttatgaa 25387519  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  25387518 atctgtttat-attaagatctatatttccaaca 25387487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 50306041 - 50306365
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50306041 acaccgtacacggcaaattctctcttctccccatctgaagagaacttgaggc-------taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 50306133  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  50306134 ttgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaat 50306233  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306234 atc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 50306332  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50306333 aatctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 50306365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25381851 - 25381518
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25381851 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 25381752  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25381751 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 25381652  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25381651 tatccttggtaaatcaaacatttcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatg 25381552  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  25381551 aaatctgtttat-attaagacctatatttccaaca 25381518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 31057890 - 31058220
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31057890 accgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctat 31057989  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31057990 tgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaata 31058089  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  31058090 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaa 31058188  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  31058189 atctgtttat-attaagacctaaatttctaaca 31058220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Original strand, 31051390 - 31051687
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31051390 accgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 31051489  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31051490 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgaaagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaata 31051589  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  31051590 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 31051687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8093159 - 8092862
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta-t 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  8093159 accgaacacggcaaactctcttttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-ctagt 8093061  T
Q  106 tgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  8093060 tgtttgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagaggactgctacaaaagctttatccaggtattcctcatacccaaattcttaata 8092961  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||    
T  8092960 tccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 8092862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 337
Target Start/End: Original strand, 44409859 - 44410187
Alignment:
Q  19 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta-------ttg---- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |        |||        
T  44409859 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgaagttgatgt 44409958  T
Q  108 -tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatg---agagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
     ||| |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  44409959 ttgtttcagatcacctcctctctcc--ttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgata 44410054  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44410055 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaa 44410154  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaacag 337  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44410155 atctgttttt-agtaagacctaaatttccaacag 44410187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24927062 - 24926738
Alignment:
Q  19 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattg----------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  | |||               
T  24927062 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcatataggtaccggttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgtgttgatgttgatgtt 24926963  T
Q  108 tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaataccctaattcttaatatc 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    ||||||||||  ||||| | ||||   ||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||     
T  24926962 tgtttcagatcacctcctctcttt----atcgttgttgtcgagagtgctgccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaatacgttaattcttaatatt 24926867  T
Q  206 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24926866 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattaatgttcaatgttttggttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatg-aat 24926768  T
Q  306 ctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24926767 ctgttttt-attaagacctaaattttcaaca 24926738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Original strand, 1078228 - 1078400
Alignment:
Q  163 aaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttg 262  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1078228 aaagctttatccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 1078327  T
Q  263 cttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1078328 cttccgctattgattaataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttat-attaagacctaaatttccaaca 1078400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24964013 - 24963685
Alignment:
Q  16 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattg-------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||   || |||||  | |||            
T  24964013 ggcaaactctctcttctccccatctgaagaggacttgaggcataaatgtactggttgaggaagaaccaaatcagtttccactaaccgtgttgatgttgat 24963914  T
Q  108 ---tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--cagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
       ||| |||||||| |||||||||||    ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||| |||  ||| ||||||||||||  ||||||||| |    
T  24963913 gtttgtttcagatcacctcctctcttt----atcgttgttgtcgagagggctaccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaatactttaattcttact 24963818  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24963817 attcttgataaatcaaacatggcgtagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatattcgttgaacatgttttatga 24963718  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  24963717 aatctgttttt-attaagatctaaattttcaaca 24963685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 336
Target Start/End: Original strand, 27955025 - 27955336
Alignment:
Q  25 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac--tctattgtgtgt--cagatcat 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||  | | ||||||||  ||||||||    
T  27955025 tctcttctccccatctga-gagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaataactaaatcagtcgtcgttaacattttgttgtgtgtttcagatcat 27955123  T
Q  121 c---tcctctctttggttatcgttgttgatgagaggga--tgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 215  Q
    |   ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  |  | |||||||||||||||| | ||||||||||| || || || ||||||||     ||    
T  27955124 cacatcctctctttctttatcgttgttgttgagagagagctatcatgaaagctttatccaggtcttcctaatacctta-ttatttatatcctt-----at 27955217  T
Q  216 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaa 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27955218 caaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt-atgattattaaacatgttttatgaaatctgttttt-a 27955315  T
Q  316 ttaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27955316 ttaagacctaaatttctaaca 27955336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38152279 - 38151981
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac-tct 103  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |    
T  38152279 acaccgtacacgacaaactcgttcttctccccatctaaagaaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaagaaccaaattagctgccgctaacgtat 38152180  T
Q  104 attgtg--tgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
     |||||  | |||||||||    ||||       ||| |||||| |||||||  || | | |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38152179 gttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcattgttgttgagaggattgtcatcaaagtttcattcaggtattcctaataccctaattcttaa 38152086  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||      | ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38152085 tatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc------tgatcatgttcaatattttgtttgcttccgctgttgattaataattgttgaacatgttttatg 38151992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 1078088 - 1078209
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1078088 acaccgtacacggcaatactctctcttctcaccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcggccgctaactct 1078187  T
Q  104 attgtgtg--tcagatcatctc 123  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  1078188 attgtgtgtttcagatcatctc 1078209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12183740 - 12183562
Alignment:
Q  161 tgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtt 260  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  12183740 tgaaagctttattcaggtattcctaatactcaaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataattatgttcaatattttgtt 12183642  T
Q  261 tgcttccgcctttgattcata-----attgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||| |  ||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12183641 tgcttccactattgattcataattatattgttgaacatattttatgaaatctattttt-attaagaactaaatttccaaca 12183562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33458218 - 33458145
Alignment:
Q  12 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||  || ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  33458218 acacggcaaactctctcttcttcccatacgaatagaactatagacataaagctaccagttgagaaagaactaaa 33458145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12183867 - 12183816
Alignment:
Q  42 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgc 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||    
T  12183867 aagagaacttgaggcataaaggtagcggttgagaaataaccaaatcagtcgc 12183816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10739654 - 10739322
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10739654 acaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 10739555  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10739554 ttgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 10739455  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739454 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10739355  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||| |||||||    
T  10739354 aatctgtttat-gttaagagctaaatgtccaaca 10739322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10953423 - 10953091
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10953423 acaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 10953324  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10953323 ttgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 10953224  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953223 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10953124  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||| |||||||    
T  10953123 aatctgtttat-gttaagagctaaatgtccaaca 10953091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 24287830 - 24288161
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24287830 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 24287929  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24287930 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 24288029  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288030 taaccttgataaatcaaacatgtcgtagatacgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatg 24288129  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  24288130 aaatctattt---attaagacctaaatttccaaca 24288161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33458580 - 33458249
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33458580 accgtacacgacaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 33458481  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33458480 gtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctaagaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat 33458381  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| | ||||||||    
T  33458380 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatatattatgaaa 33458281  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458280 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 33458249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6257521 - 6257188
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6257521 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 6257422  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6257421 attgtgtgtttcagatcatctcctcactttggttatcgttgttgatgagagggctgctacgaaagctttatccaggtattcctaatatcctaattcttaa 6257322  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6257321 catccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgatttatgattgttgaacatgtattatg 6257222  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6257221 aaatctatttat-attaagacctaaatttccaaca 6257188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 48160805 - 48161132
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  48160805 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctat 48160904  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48160905 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaata 48161004  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  48161005 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaa 48161100  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48161101 atctattttt-attaagacctaaatttctaaca 48161132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 48167024 - 48167351
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  48167024 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctat 48167123  T
Q  106 tgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaata 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48167124 tgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaata 48167223  T
Q  204 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaa 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  48167224 t-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttgaacatattttatgaa 48167319  T
Q  304 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48167320 atctattttt-attaagacctaaatttctaaca 48167351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10733507 - 10733229
Alignment:
Q  59 aaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733507 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggct 10733408  T
Q  157 gccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttt 256  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733407 gccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttt 10733308  T
Q  257 tgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||    
T  10733307 tatttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttat-gttaagagctaaatgtccaaca 10733229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10947276 - 10946998
Alignment:
Q  59 aaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10947276 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggct 10947177  T
Q  157 gccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttt 256  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10947176 gccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttt 10947077  T
Q  257 tgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||    
T  10947076 tatttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttat-gttaagagctaaatgtccaaca 10946998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33461705 - 33461380
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctatt 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33461705 accgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaaaagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctatt 33461606  T
Q  107 gtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 204  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33461605 gtgtgtttcagatcatctcatctctttgattatcgttgttgatgagagggctgctgcaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat 33461506  T
Q  205 ccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaa 304  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||||||||     || |||    
T  33461505 c-ttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgaccataatcatgttcaatgttttgtttgcttccactattgatttacgattgttgaacat-----ataaaa 33461412  T
Q  305 tctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  33461411 tatgtttttaattaagatttaaatttctaaca 33461380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 336
Target Start/End: Original strand, 49976432 - 49976763
Alignment:
Q  6 caccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta- 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||      
T  49976432 caccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaag-taccg-ttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctta 49976529  T
Q  105 --ttgtgtgtc--agatcatc---tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattc 197  Q
      ||||||||   ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||   | ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||     
T  49976530 ttttgtgtgtttgagatcatcacctcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggagtgttatcaaagcttcatctgg-tattcctaatactctaatta 49976628  T
Q  198 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt 297  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  49976629 tta---tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgctttcgctatcgattcataattgttgaatatgttt 49976725  T
Q  298 tatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  49976726 tatgaaatttgttttt-attaaaatctaaatttctaaca 49976763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 50168439 - 50168769
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  50168439 acaccgtacacgcaaaactctcttttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccg-ttgaggaagaactaaatcaaccgccgctaatcctt 50168537  T
Q  105 -ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
     |||| |||  |||||||  |||||||| || || | ||||||| |||| ||  |||| ||||||| | | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  50168538 gttgtttgtttcagatcacatcctctctctgattgttgttgttgttgagtggc-tgccatgaaagcctcaaccaggtattccttatacc-taattgttaa 50168635  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50168636 tattcttgataaatcaaacatgtcgtatattcgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacgtgttttatg 50168735  T
Q  302 aaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50168736 taatctggtttt-attaagacctaaatttccaaca 50168769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10733667 - 10733504
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10733667 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactcta 10733568  T
Q  105 ttgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaag 166  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10733567 ttgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaag 10733504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10947436 - 10947273
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10947436 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactcta 10947337  T
Q  105 ttgtgtg--tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaag 166  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10947336 ttgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaag 10947273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26963518 - 26963324
Alignment:
Q  139 gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatca 238  Q
    ||||||| |||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26963518 gttgttgttgagagggctaccataaaagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttca 26963421  T
Q  239 taatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26963420 tacttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatttgttttt-attaagacctaaatttccaaca 26963324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44831919 - 44831661
Alignment:
Q  20 aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt----cag 115  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||    
T  44831919 aactctctcttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgaggaagaaccacatcagccgtcgctaaccctattttgtgtgtttcag 44831820  T
Q  116 atcatctcct-----ctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttga 210  Q
    |||||| |||     |||| || |||||||||||| |||||||| ||   | ||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44831819 atcatcaccttctctctctctgtttatcgttgttgttgagagggttgttatcaaagcttcatctaggtattcttaataccctagttcttaatatccttga 44831720  T
Q  211 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgc 269  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  44831719 taaattaaacatgtcgtagattcgatcatattcatgttcaatgattaatttgcttccgc 44831661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 4632246 - 4632482
Alignment:
Q  25 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt---------cag 115  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | || |||||         |||    
T  4632246 tctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagaagccgctaactatgttttgtgtttcagaattcag 4632345  T
Q  116 atcatctcctctc---tttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgata 212  Q
    |||||| | ||||   |||| |||| ||||||| ||| |||| || | |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4632346 atcatcacatctcctatttgtttatggttgttgttgaaagggttgtcatgaaagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatatc-ttgata 4632444  T
Q  213 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4632445 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4632482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19686625 - 19686341
Alignment:
Q  16 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtcag 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| || | ||    |  ||||| ||||    
T  19686625 ggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacgaaccaaatcagctgctgata----ttgtgtgtttcag 19686530  T
Q  116 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| | |  || | | |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  19686529 atcatcttctctctttggtgatcattgctgttgaaatgtctgtcatcaaagctttgttcag-tattcataatacccgaattcttaatatgcttgattaat 19686431  T
Q  216 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaat 305  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||   |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19686430 caagcatgttgtagatccgatgataattacgttcaatattttgtttgcttccgttattgatttatagttattgaacatgttttatgaaat 19686341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26956929 - 26956811
Alignment:
Q  218 aacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaatt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26956929 aacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgttttt-att 26956831  T
Q  318 aagacctaaatttccaacag 337  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26956830 aagacctaaatttccaacag 26956811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26957117 - 26957023
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26957117 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac 26957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 4632869 - 4632963
Alignment:
Q  241 atcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4632869 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattaataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 4632963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 302
Target Start/End: Original strand, 3769587 - 3769710
Alignment:
Q  178 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgatt 277  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||    
T  3769587 tattcctaatacc-taattattaatatccttgattaatgaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttaaattattgatt 3769685  T
Q  278 cataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  3769686 cataattattgaacatattttatga 3769710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Original strand, 9237402 - 9237502
Alignment:
Q  198 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttt 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||||  ||||||||||||    
T  9237402 ttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatcatattcaatgttctgtttgcttcgactattcattcataatcattgaacatgttt 9237501  T
Q  298 t 298  Q
    |    
T  9237502 t 9237502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 267
Target Start/End: Original strand, 50427356 - 50427483
Alignment:
Q  147 tgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatc--------aaacatgtcgtagatccgatca 238  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||        |||||||||||| |||||||||    
T  50427356 tgagagggcttccatgaacgctatatccaggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaataaattaaacatgtcgtacatccgatca 50427455  T
Q  239 taatcatattcaatgttttgtttgcttcc 267  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50427456 taatcat-ttcaatgttttgattgcttcc 50427483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Original strand, 50155802 - 50156100
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctctt-ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||   |    
T  50155802 acaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaaggcataaaggtaccagtcgagaaagaatcaaatcagccgccgctaatatt 50155901  T
Q  104 attg--tgtgtcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
     |||  ||| ||| ||||  |||||||| |  || | |||| |  ||||  || | || ||||||| | | ||| |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  50155902 gttgtttgtttcaaatcacatcctctctctaattgttgttgctattgag-tggcttccatgaaagcctcaaccaaatattccttata-cgtaattgttaa 50155999  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatg 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||            || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  50156000 tattcttgataaatcaaacatgtcgtatatccgatcttaa------------ttatgtttacttccgctattgattcataattgttgaacatgttttata 50156087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 35177666 - 35177770
Alignment:
Q  30 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat----tgtgtgtcagatcatctcct 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||    
T  35177666 tctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgagaaataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttcagatcatcacct 35177765  T
Q  126 ctctt 130  Q
    |||||    
T  35177766 ctctt 35177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17627075 - 17627002
Alignment:
Q  25 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  17627075 tctcttctccccatctgaagagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaagaacaaaactagccgtcgcta 17627002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34308142 - 34308060
Alignment:
Q  247 ttcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttc 331  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34308142 ttcaatattttgtatgcttccgctattgattcataattattgaacatgttttataaaatctgtttt--attaagacgtaaatttc 34308060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 33045089 - 33045185
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaact 101  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33045089 acaccgttcacgacgaattctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcagccgccgttaact 33045185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 32284542 - 32284620
Alignment:
Q  23 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaact 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  32284542 tctctattctcctcatctgaagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaaatcagtcgccactaact 32284620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 3769434 - 3769509
Alignment:
Q  25 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3769434 tctcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 3769509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 55473230 - 55473133
Alignment:
Q  230 atccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||   | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  55473230 atccaatcataatcatattcaatattttatttgcttccgctattgat---ttattattgaacatattttatgaaatttgtttct-attaagacctaaatt 55473135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 26971869 - 26971824
Alignment:
Q  7 accgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaactt 51  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26971869 accgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaactt 26971824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31986833 - 31986745
Alignment:
Q  135 tatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||| | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  31986833 tatcgttgttgttgaaagggccgccatcaaaacttcattcagatattcctaatacc-taattattgttatccttgataaatcaaacatgt 31986745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 261
Target Start/End: Original strand, 35177806 - 35177861
Alignment:
Q  206 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgttt 261  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35177806 cttgataaatctaatatgttgtatatccgattataatcatatttaatgttttgttt 35177861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 605
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  934 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaacta 835  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  834 ttgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtcgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 735  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  734 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcata---gttaaacatgttttatga 638  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  637 aatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 173205 - 172873
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactcta 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  173205 acaccgtatacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactcta 173106  T
Q  105 ttgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaat 202  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  173105 ttgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgttgttgataagagggctatcttgaaagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaat 173006  T
Q  203 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 302  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  173005 atccttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgtagaacatgttttatga 172906  T
Q  303 aatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    || |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  172905 aacctgtttat-attaagacctaaattttcaaca 172873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 6366 - 6699
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6366 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 6465  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6466 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaa 6565  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcat-aattgttgaacatgttttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6566 tatccttgataaatcaaacatgttgtagattcagtcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataaattgttgaacatggtttat 6665  T
Q  301 gaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  6666 gaaat-tgtttat-attaagagctaaatttccaaca 6699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 12239 - 12572
Alignment:
Q  5 acaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12239 acaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactct 12338  T
Q  104 attgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaa 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12339 attgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggactgccttgaaagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaa 12438  T
Q  202 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcat-aattgttgaacatgttttat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12439 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgatcataattatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataaattgttgaatatggtttat 12538  T
Q  301 gaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  12539 gaaat-tgtttat-attaagagctaaatttccaaca 12572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 336
Target Start/End: Original strand, 5465 - 5711
Alignment:
Q  91 cgccgctaactctattgtgtgt--cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaata 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5465 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaata 5564  T
Q  189 ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttg 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5565 gcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttg 5664  T
Q  289 aacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  5665 aacatgttttatgaaatctgtttat-atcaagagctaaatttccaaca 5711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 336
Target Start/End: Original strand, 950 - 1261
Alignment:
Q  27 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct---attgtgtgtcagatcatc-- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||     ||||| || |||||||      
T  950 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataacggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaacccttggtgtgtgtttccgatcatcac 1049  T
Q  122 -tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaac 220  Q
      | ||||||   |||| |||| || |||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  1050 accttctcttgttttattgttgatgttgagagagctgccatgaaagttttatccagatatttctaatactctaattgttaatatgcatgataagtcaaac 1149  T
Q  221 atgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||    |||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1150 atgtcgttgatccgatcataatcatatctaa---attgtttgctttcgatattgattcataatggttgaacatgttttatgaaatctgttttt-attaag 1245  T
Q  321 acctaaatttccaaca 336  Q
    | || |||||||||||    
T  1246 atctgaatttccaaca 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 332
Target Start/End: Original strand, 38290 - 38600
Alignment:
Q  24 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactct--attgtgtgtcagatca-- 119  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||     |||||||||| | ||  ||||| | |||||| |      
T  38290 ctctattcttcccatctgaagagaacttgagacataaaggtatcagttgaggaagaacta-----gccgccgctagccctttattgtatttcagattaga 38384  T
Q  120 ---tctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataa 213  Q
       ||||||||| ||| ||   ||| |||||| ||||| |  || | | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38385 taatctcctctccttgttttagatcattgttgttgagatgattgtcgtcaaagcttcatccaggtattcctaatacc-taattattaatattcttgataa 38483  T
Q  214 atcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgttttt 313  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38484 a-caaacatgttgtagatccgatcataactatgttcaatgttttgtttgcttccactgttgatttctaatgattgaacatgtcttatgaaatctggtttt 38582  T
Q  314 aattaagacctaaatttcc 332  Q
    | ||||  |||||||||||    
T  38583 atttaa-tcctaaatttcc 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6061
Alignment:
Q  180 ttcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgcctttgattca 279  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  5945 ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatattcatgttcaatgttttgtttaatgccgctattgattaa 6043  T
Q  280 taattgttgaacatgttt 297  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  6044 taattattgaacatgttt 6061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 5826 - 5889
Alignment:
Q  42 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctat 105  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||    
T  5826 aagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaaccctat 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University