View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12952_high_5 (Length: 679)

Name: NF12952_high_5
Description: NF12952
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12952_high_5
NF12952_high_5
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (214-669)||(1238-1693)
scaffold0440 (18-142)||(1765-1889)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (214-664)||(3811218-3811674)
chr7 (214-664)||(3817360-3817816)
chr7 (214-664)||(351441-351896)
chr7 (214-664)||(28421008-28421464)
chr7 (214-664)||(339035-339481)
chr7 (366-664)||(20238762-20239061)
chr7 (214-664)||(35148053-35148514)
chr7 (214-664)||(5849184-5849635)
chr7 (227-660)||(5979227-5979668)
chr7 (214-664)||(22741974-22742435)
chr7 (292-652)||(43539709-43540083)
chr7 (341-595)||(15843733-15843988)
chr7 (341-595)||(15860842-15861097)
chr7 (214-454)||(26383323-26383569)
chr7 (214-393)||(35152849-35153034)
chr7 (214-493)||(26380762-26381023)
chr7 (507-664)||(42767344-42767501)
chr7 (531-657)||(26383603-26383729)
chr7 (521-664)||(30219295-30219438)
chr7 (448-664)||(12803893-12804110)
chr7 (389-516)||(35150736-35150865)
chr7 (261-413)||(42767505-42767661)
chr7 (233-321)||(18666881-18666972)
chr7 (418-584)||(7608306-7608475)
chr7 (236-483)||(18656883-18657132)
chr7 (280-398)||(7608146-7608271)
chr7 (586-662)||(18666547-18666622)
chr7 (218-293)||(30219501-30219576)
chr7 (418-494)||(3677889-3677965)
chr7 (264-319)||(16914037-16914092)
chr7 (253-296)||(24689729-24689772)
chr7 (214-261)||(43539649-43539696)
chr7 (214-292)||(8824465-8824542)
chr7 (531-610)||(26381056-26381134)
chr7 (460-493)||(24690848-24690881)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (214-664)||(8650852-8651309)
chr6 (226-664)||(21190915-21191364)
chr6 (214-664)||(4580370-4580827)
chr6 (214-663)||(31756265-31756724)
chr6 (214-664)||(25353867-25354321)
chr6 (214-661)||(25343281-25343731)
chr6 (214-662)||(21770609-21771070)
chr6 (234-664)||(21197070-21197527)
chr6 (214-664)||(21783358-21783831)
chr6 (269-664)||(21789581-21789999)
chr6 (511-664)||(32035335-32035488)
chr6 (214-470)||(30905825-30906086)
chr6 (308-664)||(17581384-17581736)
chr6 (525-664)||(21782802-21782941)
chr6 (572-664)||(8662830-8662922)
chr6 (214-312)||(17581258-17581356)
chr6 (535-664)||(18778564-18778693)
chr6 (216-316)||(6096966-6097067)
chr6 (233-339)||(1105986-1106093)
chr6 (586-661)||(34603382-34603457)
chr6 (586-661)||(34724659-34724734)
chr6 (572-664)||(6097999-6098087)
chr6 (341-490)||(28728071-28728218)
chr6 (226-363)||(12801890-12802032)
chr6 (428-494)||(20745431-20745497)
chr6 (570-634)||(1106229-1106294)
chr6 (265-310)||(1283280-1283325)
chr6 (32-101)||(21173850-21173920)
chr6 (593-662)||(17900190-17900259)
chr6 (49-81)||(21173723-21173755)
chr6 (53-89)||(21311388-21311424)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (214-664)||(10760699-10761156)
chr3 (214-664)||(49151266-49151722)
chr3 (214-664)||(49157333-49157789)
chr3 (214-664)||(38449112-38449569)
chr3 (214-664)||(38455599-38456056)
chr3 (214-664)||(8331441-8331897)
chr3 (214-664)||(11839774-11840231)
chr3 (214-664)||(10244383-10244840)
chr3 (214-664)||(30051151-30051606)
chr3 (214-664)||(17055842-17056297)
chr3 (214-664)||(42191269-42191726)
chr3 (214-664)||(42197211-42197668)
chr3 (214-664)||(10238261-10238718)
chr3 (214-549)||(10769133-10769475)
chr3 (226-661)||(55003464-55003895)
chr3 (218-664)||(28964538-28964978)
chr3 (437-664)||(11846112-11846340)
chr3 (214-491)||(26429639-26429923)
chr3 (233-661)||(46656353-46656791)
chr3 (308-664)||(48128096-48128451)
chr3 (344-637)||(13444847-13445144)
chr3 (514-664)||(17593331-17593481)
chr3 (214-341)||(23138795-23138922)
chr3 (546-664)||(10766920-10767038)
chr3 (343-664)||(53069103-53069421)
chr3 (214-331)||(53071640-53071757)
chr3 (412-664)||(34300348-34300607)
chr3 (214-325)||(24643885-24643996)
chr3 (226-337)||(11846359-11846471)
chr3 (414-512)||(13837534-13837632)
chr3 (226-454)||(2982484-2982720)
chr3 (214-664)||(12108716-12109172)
chr3 (215-311)||(8474543-8474640)
chr3 (214-319)||(34300092-34300197)
chr3 (226-341)||(17601912-17602027)
chr3 (341-437)||(13367114-13367209)
chr3 (241-312)||(27103272-27103344)
chr3 (385-446)||(52222573-52222634)
chr3 (342-437)||(9760506-9760600)
chr3 (451-493)||(24643773-24643815)
chr3 (233-310)||(27088019-27088097)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (214-664)||(28525435-28525891)
chr5 (214-664)||(28531531-28531987)
chr5 (214-664)||(12686228-12686684)
chr5 (214-664)||(12692330-12692786)
chr5 (214-664)||(7389597-7390053)
chr5 (214-661)||(41296933-41297384)
chr5 (214-662)||(30771934-30772392)
chr5 (214-647)||(20499792-20500231)
chr5 (214-664)||(30384427-30384889)
chr5 (214-570)||(32094364-32094727)
chr5 (214-570)||(32097165-32097527)
chr5 (228-662)||(19059815-19060265)
chr5 (226-664)||(19066156-19066601)
chr5 (299-526)||(14609909-14610141)
chr5 (532-664)||(32094209-32094340)
chr5 (556-664)||(24054336-24054445)
chr5 (535-664)||(32097010-32097138)
chr5 (578-664)||(16215223-16215309)
chr5 (214-317)||(14609785-14609888)
chr5 (214-341)||(8706765-8706892)
chr5 (589-664)||(14610184-14610259)
chr5 (585-652)||(28542269-28542336)
chr5 (373-481)||(26318492-26318599)
chr5 (378-662)||(26509674-26509958)
chr5 (460-603)||(8706532-8706672)
chr5 (588-646)||(37896365-37896423)
chr5 (583-662)||(26316843-26316922)
chr5 (341-467)||(33753481-33753606)
chr5 (341-467)||(33849115-33849240)
chr5 (238-330)||(26509530-26509620)
chr5 (530-664)||(33848935-33849070)
chr5 (214-286)||(26318676-26318748)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (214-664)||(28682994-28683450)
chr2 (214-664)||(31002030-31002487)
chr2 (214-664)||(31008008-31008465)
chr2 (214-664)||(30964981-30965438)
chr2 (214-664)||(44716853-44717311)
chr2 (214-664)||(13455753-13456210)
chr2 (214-664)||(13461694-13462151)
chr2 (214-664)||(13149735-13150195)
chr2 (214-664)||(36750068-36750525)
chr2 (214-664)||(35084725-35085185)
chr2 (214-664)||(35090698-35091158)
chr2 (264-661)||(11048605-11049010)
chr2 (218-491)||(19879252-19879536)
chr2 (226-664)||(23343229-23343671)
chr2 (214-413)||(35439671-35439876)
chr2 (404-664)||(35438758-35439014)
chr2 (214-341)||(35442211-35442338)
chr2 (214-341)||(7771564-7771692)
chr2 (233-663)||(29832878-29833317)
chr2 (247-331)||(31651318-31651402)
chr2 (226-583)||(28765248-28765610)
chr2 (430-492)||(29034697-29034759)
chr2 (236-300)||(8342606-8342671)
chr2 (228-271)||(23283911-23283955)
chr2 (613-652)||(31651664-31651703)
chr2 (341-393)||(23284732-23284784)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (218-664)||(34739644-34740096)
chr1 (214-664)||(31051198-31051654)
chr1 (214-664)||(31057698-31058154)
chr1 (214-664)||(25387553-25388008)
chr1 (214-661)||(8092898-8093351)
chr1 (214-664)||(25381584-25382041)
chr1 (214-664)||(50305851-50306299)
chr1 (214-664)||(44409654-44410120)
chr1 (214-664)||(38152024-38152463)
chr1 (214-518)||(1077898-1078209)
chr1 (214-664)||(27954815-27955271)
chr1 (228-664)||(24926803-24927260)
chr1 (226-664)||(24963751-24964198)
chr1 (558-664)||(1078228-1078334)
chr1 (214-338)||(33458290-33458415)
chr1 (214-341)||(25275425-25275552)
chr1 (556-662)||(12183635-12183740)
chr1 (264-337)||(12183994-12184069)
chr1 (214-284)||(4280165-4280235)
chr1 (435-486)||(12183816-12183867)
chr1 (417-468)||(23254013-23254063)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (226-664)||(5542209-5542655)
chr8 (214-664)||(32890542-32890999)
chr8 (214-664)||(32896666-32897123)
chr8 (214-652)||(10699683-10700127)
chr8 (214-662)||(36818626-36819079)
chr8 (214-664)||(14417615-14418051)
chr8 (214-660)||(10705492-10705949)
chr8 (214-664)||(42993053-42993505)
chr8 (226-652)||(22219778-22220221)
chr8 (214-664)||(9934937-9935389)
chr8 (214-664)||(39735601-39736044)
chr8 (214-493)||(42033451-42033740)
chr8 (377-663)||(39727370-39727645)
chr8 (214-336)||(39727668-39727790)
chr8 (523-664)||(7771202-7771342)
chr8 (564-664)||(14799465-14799564)
chr8 (529-664)||(1882801-1882939)
chr8 (381-493)||(1883039-1883151)
chr8 (457-623)||(1171249-1171414)
chr8 (226-341)||(1883221-1883331)
chr8 (228-341)||(17954174-17954289)
chr8 (274-312)||(11641418-11641456)
chr8 (218-279)||(30890531-30890593)
chr8 (410-443)||(1171216-1171249)
chr8 (622-664)||(24250171-24250213)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (214-661)||(10739391-10739842)
chr4 (214-661)||(10953160-10953611)
chr4 (214-664)||(48160613-48161069)
chr4 (214-664)||(48166832-48167288)
chr4 (214-664)||(6257254-6257710)
chr4 (218-664)||(24287645-24288097)
chr4 (214-561)||(10733504-10733855)
chr4 (214-561)||(10947273-10947624)
chr4 (344-664)||(33458316-33458636)
chr4 (345-662)||(33461444-33461760)
chr4 (228-664)||(44831661-44832106)
chr4 (214-664)||(50168249-50168703)
chr4 (214-493)||(26957023-26957309)
chr4 (460-664)||(10733295-10733499)
chr4 (460-664)||(10947064-10947268)
chr4 (226-660)||(49976267-49976693)
chr4 (214-444)||(26971824-26972060)
chr4 (214-663)||(19686378-19686823)
chr4 (365-645)||(4632192-4632482)
chr4 (233-525)||(35177467-35177770)
chr4 (256-643)||(50155657-50156046)
chr4 (233-491)||(17627002-17627261)
chr4 (534-664)||(26963390-26963518)
chr4 (418-660)||(3769434-3769673)
chr4 (542-662)||(50427356-50427483)
chr4 (593-661)||(9237402-9237470)
chr4 (214-293)||(50426901-50426980)
chr4 (416-494)||(32284542-32284620)
chr4 (228-329)||(4632043-4632140)
chr4 (613-664)||(26956878-26956929)
chr4 (416-494)||(33045107-33045185)
chr4 (435-478)||(50427238-50427281)
chr4 (596-662)||(28704553-28704619)
chr4 (530-619)||(31986745-31986833)
chr4 (636-664)||(4632869-4632897)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (214-664)||(172939-173395)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (214-664)||(12049-12506)
scaffold0208 (226-664)||(6188-6633)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (214-664)||(668-1104)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (484-664)||(5465-5645)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (214-640)||(717-1174)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (214-398)||(13927-14117)
[»] scaffold0185 (3 HSPs)
scaffold0185 (214-407)||(5621-5821)
scaffold0185 (575-656)||(5945-6025)
scaffold0185 (435-498)||(5826-5889)
[»] scaffold0085 (2 HSPs)
scaffold0085 (558-662)||(38434-38536)
scaffold0085 (227-316)||(38095-38182)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1238
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1693 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 1594  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593 actcaatgagtggatgtccggatgacccggaataatggaaaatcctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 1494  T
Q  414 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatc 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1493 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatc 1394  T
Q  514 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 1294  T
Q  614 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcctttg 669  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293 acatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcctttg 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1889 - 1765
Alignment:
Q  18 agtataatccaaagcaaggaagacctgaaccatataacttgtgcattgtttatttttgtggttgcagattaatatatgacaatgtttcatgtgcatctnn 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1889 agtataatccaaagcaaggaagacctgaaccatataacttgtgcattgtttatttttgtggttgcagattaatatatgacaatgtttcatgtgcatctaa 1790  T
Q  118 nnnnngcatcttcactatgttgaaa 142  Q
         ||||||||||||||||||||    
T  1789 aaaaagcatcttcactatgttgaaa 1765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3811674 - 3811218
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811674 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 3811575  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3811574 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 3811475  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3811474 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 3811375  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811374 cagatcatcttctctcttttgttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 3811275  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811274 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 3811218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3817816 - 3817360
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817816 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatgaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 3817717  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3817716 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 3817617  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3817616 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 3817517  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817516 cagatcatcttctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 3817417  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817416 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 3817360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 351441 - 351896
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  351441 tatcaattgtcagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatgg 351540  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  351541 actcaatgagtggatgtccggatggcccattactggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 351640  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  351641 cgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 351740  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  351741 cagatcatctcctct-tttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgata 351839  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351840 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 351896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28421464 - 28421008
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  28421464 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 28421369  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  28421368 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 28421269  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28421268 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 28421169  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28421168 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatcctt 28421069  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421068 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 28421008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 339035 - 339481
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  339035 tatcaattgtcagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatgg 339134  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  339135 actcaatgagtggatgtccggatggcccattactggaataatgggaaa-cctaatggccatccaatataaaagaggtcatggtccccaatataccgtaca 339233  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  339234 cgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 339333  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  339334 cagatcatctcctctctttggttatcattgttgttgatgagag------------agctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttg 339421  T
Q  605 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339422 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 339481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 366 - 664
Target Start/End: Original strand, 20238762 - 20239061
Alignment:
Q  366 catcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggtt 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20238762 catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 20238861  T
Q  465 gaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctt 564  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20238862 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggctgccttgaaagctt 20238961  T
Q  565 tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238962 tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 20239061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35148514 - 35148053
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148514 tatcaattatgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattggatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 35148415  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgac------ccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       | |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  35148414 actcaatgagtggatgtccggatggctcattaacagaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatgatccccaatacaccgtaca 35148315  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tctattgtctgt 505  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  | | |||| |||    
T  35148314 tggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctgaccatattttgtgtgt 35148215  T
Q  506 ttcagatcatctcctctctt--tggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaata-ccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||||||| |  ||  |  |  || | ||||||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35148214 ttcagatcatcccaccttctcatatttgttgttgttgttacgagggctaccatgaaagctttatccaggtattcctaatacccctaattcttaatatcct 35148115  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148114 tgataaatcaaacgtgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 35148053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 5849184 - 5849635
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5849184 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 5849283  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |      |||||||||| |||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  5849284 actcaatgagtggatgttcggatggtccattaacggaataatgagaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtcctcaatataccgtaca 5849383  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtctgtt 506  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |||| | ||    
T  5849384 cggcaaactctcttttctccccatctgaagataacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagacgccgctaacatatgttgtgtatt 5849483  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||    ||||       |||||||||| |||||| | || | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5849484 tcagatcatagtttctc------catcgttgttgttgagagagctgtcattaaagcttcatccaggtattcctaatatcctaattcttgatatccttgat 5849577  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5849578 aaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttggttgcttccgc 5849635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 227 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 5979668 - 5979227
Alignment:
Q  227 ccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tga 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5979668 ccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgg 5979573  T
Q  323 gtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaata-taaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-a 414  Q
     ||||||| |||||| ||      | |||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||  ||| |    
T  5979572 atggatgttcggatggccaattaacagaataatgggaaagtctaatggtcatccaataataaaagaggttatggtccccaatacaccgtacacgacaata 5979473  T
Q  415 ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatca 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5979472 ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatca 5979373  T
Q  515 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5979372 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttaataaatcaaa 5979273  T
Q  615 catgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 660  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5979272 catgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatagtttgtttgctt 5979227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22742435 - 22741974
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22742435 tatcaactgtgagccttagttgattagtgataaaattaagtaataaggctattagatttctaattagataattaattaaatatataagtagttgatatgg 22742336  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  22742335 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtctccaatataccgtaca 22742236  T
Q  408 ccgc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattg------ 500  Q
      || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||          
T  22742235 tggcaaaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgatgaaaaaccaaatcagccgccgctaaccgtgttgatgttg 22742136  T
Q  501 ---tctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttg-ttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaa 596  Q
       | ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||   |||||| ||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  22742135 atatttgtttcagatcatctcctctct----ttatcgttgtttgtcaagagggctgccaccatagcttcatccaggtattcctaata-cctaatcctcaa 22742041  T
Q  597 tatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22742040 tat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttcagtttgcttccgc 22741974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 292 - 652
Target Start/End: Original strand, 43539709 - 43540083
Alignment:
Q  292 aatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggct 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||| || ||| |||||||  || | ||||||||||||| |    
T  43539709 aatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtctggatgacccattaacggaataacggaaaaccctaatggtcacccaatataaaagaggtt 43539808  T
Q  386 atggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctcc---ccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcag 482  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  43539809 atggtccccaatataccgtgcacggcaaactctctcttctccttcccatctgaagagaactttaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcag 43539908  T
Q  483 ccgccgctaactctatt--gtctgtttcagatcatc---tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattc 577  Q
     ||||||||||  ||||  || ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||   | ||||||| ||||||||||||    
T  43539909 tcgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacctcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggattgttatcaaagcttcatccaggtattc 43540008  T
Q  578 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 652  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43540009 ataataccctaatttttaatattcttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatatttt 43540083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 341 - 595
Target Start/End: Original strand, 15843733 - 15843988
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca-tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagag 439  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15843733 cggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaagag 15843832  T
Q  440 aacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgtt 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15843833 aacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggttattgttgtt 15843932  T
Q  540 gatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctta 595  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843933 gattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15843988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 341 - 595
Target Start/End: Original strand, 15860842 - 15861097
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca-tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagag 439  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15860842 cggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaagag 15860941  T
Q  440 aacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgtt 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15860942 aacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggttattgttgtt 15861041  T
Q  540 gatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctta 595  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861042 gattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15861097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 214 - 454
Target Start/End: Original strand, 26383323 - 26383569
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26383323 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaatgaatatgg 26383422  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||    
T  26383423 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccctaatacaccggaca 26383522  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 454  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26383523 cggcaaactctctcttctccctatttgaagagaacttgaggcataaa 26383569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 214 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35153034 - 35152849
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35153034 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattcgatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 35152935  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35152934 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccc 35152849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 214 - 493
Target Start/End: Original strand, 26380762 - 26381023
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||     
T  26380762 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaaataataaggctattagatttctaattggataattaatt----------------gatatga 26380845  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 413  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||  |||    
T  26380846 actcaatgagtgcatgtccggatgacccata-taatgggaaatcttaatggtcatccaatataaaagag-ctatggtccccagtacatcagacacgacaa 26380943  T
Q  414 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26380944 actctctcttctcccgatctgaagaaaactttaggcataaaggtagcagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 26381023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 507 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42767501 - 42767344
Alignment:
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767501 tcagatcatcttctctctttgattatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgat 42767402  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42767401 aaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 42767344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 531 - 657
Target Start/End: Original strand, 26383603 - 26383729
Alignment:
Q  531 atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 630  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383603 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatcaaggtattcctaataccctaattcttagtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 26383702  T
Q  631 tcataatcatgttcaatgttttgtttg 657  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||    
T  26383703 tcatgatcatgttcaatattttgtttg 26383729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 521 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30219438 - 30219295
Alignment:
Q  521 ctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtc 620  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30219438 ctctttgtttatcgttgatgctgagatggttgtcatgaaagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtc 30219339  T
Q  621 gtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30219338 gtagatccgttcatattcatgttcaacgttttgtttgattccgc 30219295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 448 - 664
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12804110
Alignment:
Q  448 gcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattg---tctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatga 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||  | |||   | ||||||| |||| |||||||||||    ||||||||||  ||    
T  12803893 gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaaccatgttgatgtttgtttcaaatcacctcctctcttt----atcgttgttgtcga 12803988  T
Q  545 gagggatgccttgaaagctttatcc--aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgt 642  Q
    ||||| |||    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  12803989 gagggctgctaccaaagcttcatccccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatgttcatgt 12804088  T
Q  643 tcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  12804089 tcaatgttttgcttgcttccgc 12804110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 35150865 - 35150736
Alignment:
Q  389 gtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccg 488  Q
    |||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35150865 gtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccg 35150766  T
Q  489 ctaac--tctattgtctgtttcagatcatc 516  Q
    |||||  | | |||| ||||||||||||||    
T  35150765 ctaaccatattttgtgtgtttcagatcatc 35150736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42767661 - 42767505
Alignment:
Q  261 gctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggac-tcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatggga 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |      ||||||||| |||    
T  42767661 gctattagatttttaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttcaatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatagga 42767562  T
Q  354 aatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 413  Q
    || ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  42767561 aaccctaatggccat---atataaaagaggctatggtcccgaatataccgtacacggcaa 42767505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18666972 - 18666881
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggata---attaattaaatatttaattagttgatatggactcaatg 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18666972 ttgataagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgtatagttattaattaaatttttaattagttgatatggactcaatg 18666881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 418 - 584
Target Start/End: Original strand, 7608306 - 7608475
Alignment:
Q  418 tctcttctcccc-atctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtctgtttcagatca 514  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||  | ||  ||| ||||||||||||    
T  7608306 tctcttctcccccatcggaagagaacttgagtcataaaggtaccgatttaggaagtaccaaatcagtcgccgctaatccgcttatgtgtgtttcagatca 7608405  T
Q  515 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaatac 584  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  || | | |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  7608406 tctcatctctttggttatcattgttgatgagatgactgtcatcaaagctttattcagatatttctaatac 7608475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18657132 - 18656883
Alignment:
Q  236 attagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccgg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||   ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18657132 attagtgatcacattaagtaataaggctaattagatttttatttggataattaattattta---aattaattaatatggactctatgagtggatgtctgg 18657036  T
Q  335 atgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccc 428  Q
    |||||||        |||||||| |||||||||||  ||||| |  |  |||||||||| ||| |||||  | |||||||  |||||| ||||||||| |    
T  18657035 atgacccattaatacaataatggtaaatcctaatg-gcatcaca-ctgtaagaggctattgtctccaatgcaccatacacgacaaactttctcttctctc 18656938  T
Q  429 catctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagc 483  Q
    | |||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18656937 cgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcagc 18656883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 398
Target Start/End: Original strand, 7608146 - 7608271
Alignment:
Q  280 gataattaattaaatattt-aattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaa 372  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||      | |||||||  ||| ||||||| ||||| ||    
T  7608146 gataattaattaaatattttaattagttgatatggggttaatgagtggatgtccggatgacccattaatgaaataatgaaaaaccctaatgaccatccaa 7608245  T
Q  373 tataaaagaggctatggtccccaata 398  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  7608246 tataaaagatgttatggtccccaata 7608271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18666622 - 18666547
Alignment:
Q  586 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18666622 ctaattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgta-atctgatcataatcaagttcaatgttttgtttgcttcc 18666547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30219576 - 30219501
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa 293  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30219576 aattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataaagttattagatttctaattagatagttaattaaa 30219501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 494
Target Start/End: Original strand, 3677889 - 3677965
Alignment:
Q  418 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaact 494  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| | |||| |||||    
T  3677889 tctcttctctccatctgaagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaact 3677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16914092 - 16914037
Alignment:
Q  264 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa 319  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16914092 attaaatttctaattgaataattaattatatatttaattaattgatatgaactcaa 16914037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 296
Target Start/End: Original strand, 24689729 - 24689772
Alignment:
Q  253 gtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatat 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24689729 gtaataaggctattagatttttaatttgataattaattaaatat 24689772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 261
Target Start/End: Original strand, 43539649 - 43539696
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataagg 261  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43539649 tatcatttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagg 43539696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 292
Target Start/End: Original strand, 8824465 - 8824542
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaa 292  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8824465 tatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaattaggtaataaggatattagatttct-tttagataattaattaa 8824542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 610
Target Start/End: Original strand, 26381056 - 26381134
Alignment:
Q  531 atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 610  Q
    |||||||||| |||||||| || | | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26381056 atcgttgttgttgagagggttgtcatcaaagcttcatccag-tactcctaataccctaattcttagcatgcttgataaat 26381134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 493
Target Start/End: Original strand, 24690848 - 24690881
Alignment:
Q  460 cggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24690848 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 24690881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8651309 - 8650852
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651309 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 8651210  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8651209 acttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 8651110  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8651109 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 8651010  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651009 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 8650910  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650909 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 8650852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21191364 - 21190915
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21191364 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagt 21191265  T
Q  325 ggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actc 417  Q
    |||||| |||||| |||      ||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  21191264 ggatgttcggatggcccattaacggaataatgtgaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccttacacggcaatactc 21191165  T
Q  418 tctcttctccccatctgaagagaacttga---ggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatca 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21191164 tctcttctccccatctgaagagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcatatca 21191065  T
Q  515 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21191064 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatatctttgataaatcaaa 21190965  T
Q  615 catgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21190964 tatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 21190915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4580827 - 4580370
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  4580827 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 4580732  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  4580731 ggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 4580632  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  4580631 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgcg 4580532  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580531 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 4580432  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580431 tggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 4580370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 214 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31756724 - 31756265
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31756724 tatcaattgtgggtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaataattaattagttgatatgg 31756625  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc-----ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacac 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31756624 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaaggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcaaacac 31756525  T
Q  409 cgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtctgtt 506  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  31756524 gacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatattgtgtgtt 31756425  T
Q  507 tcagatcat---ctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||   ||||||||| ||  ||| |||| || |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31756424 tcagatcatcacctcctctctctgtgtatggttgctgttgagagggctgtcatgaaagctctatccagatattcataataccctaattcttaatatcctt 31756325  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31756324 gataattcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttatttgcttccg 31756265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 25353867 - 25354321
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  25353867 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttatt-ttggataattaatta----tttaattagttgatatg 25353961  T
Q  313 gactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcat 404  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| |||      ||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  25353962 gactcaacatgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgggaaactctaatggtcatctaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgt 25354061  T
Q  405 acaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25354062 acacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 25354161  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25354162 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-ctt 25354260  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25354261 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgctttgtttgcttccgc 25354321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 214 - 661
Target Start/End: Original strand, 25343281 - 25343731
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  25343281 tatcaattgtgaaccttaattgattagtgattaaattaagtaataaggctaattagatttatt-ttggataattaatta----tttaattagttgatatg 25343375  T
Q  313 gactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcat 404  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  ||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  25343376 gactcaacatgagtggatgttcggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatg-tccccaatacaccgt 25343474  T
Q  405 acaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25343475 acacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 25343574  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25343575 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgaaagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaatat-ctt 25343673  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343674 gataaatcaaaaatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 25343731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 214 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21771070 - 21770609
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771070 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatgg 21770971  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc-----cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacac 408  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||    
T  21770970 acttaatgagtggatgtccggatgaccattaacggaataatgggaaaccctaatggccaaccaatataaaagaggctacggtccccaatacaccgtacac 21770871  T
Q  409 cgc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tctat------- 498  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||           
T  21770870 ggcaaaactctctcttct--ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgttgatgaagttg 21770773  T
Q  499 -tgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt 594  Q
     ||| |||||||||||| ||||| ||  |  |||||   ||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  21770772 atgtttgtttcagatcacctcctatc--tccttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttattcagatattcctaata--ctaattctt 21770677  T
Q  595 aatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21770676 gatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttacttcc 21770609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 234 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21197527 - 21197070
Alignment:
Q  234 tgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtcc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197527 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtcc 21197428  T
Q  333 ggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-----------ac 415  Q
    ||||| ||      ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||           ||    
T  21197427 ggatggcccattaacggaataatgggaaaacctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactcggcaatac 21197328  T
Q  416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tctat--------tgtctgt 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||        ||| |||    
T  21197327 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgaagttgatgtttgt 21197228  T
Q  506 ttcagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    | || |||| ||||||||  |  |||||   ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  21197227 tccatatcacctcctctc--tccttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagatttatccaggtattcataata--ctaattcttgatatcct 21197132  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21197131 tgataaatcaaacatgttgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgcttccgc 21197070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21783831 - 21783358
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21783831 tatcaattgtgagtcttagtggattagtgatcaaattaagtaataaaactattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 21783732  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatg--gtccccaatatatcata 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||    
T  21783731 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatg-gcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgta 21783633  T
Q  406 caccgc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgta------ccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tct 496  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |      
T  21783632 cacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaaccgttg 21783533  T
Q  497 at--------tgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaatacc 585  Q
    ||        ||| ||||||| |||| ||||||||  |  |||||   ||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||      
T  21783532 atgaagttgatgtttgtttcaaatcacctcctctc--tccttatctttgttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaata-- 21783437  T
Q  586 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21783436 ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgc 21783358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 269 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21789999 - 21789581
Alignment:
Q  269 atttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||    
T  21789999 atttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaat 21789900  T
Q  363 gcccatcaaatataaaagaggctatggt--ccccaatatatcatacaccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgta- 458  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21789899 ggc-atccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaa 21789801  T
Q  459 -----ccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactct--at--------tgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatc---gttgttg 540  Q
         |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |  ||        ||| ||||||| |||| |||||||||    |||||   |||||||    
T  21789800 aggtgccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaaccgttgatgaagttgatgtttgtttcaaatcacctcctctctcc--ttatctttgttgttg 21789703  T
Q  541 atgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcat 640  Q
     |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21789702 ttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttat 21789605  T
Q  641 gttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21789604 gttcaatgttttgtttgcttccgc 21789581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 511 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32035488 - 32035335
Alignment:
Q  511 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaat 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32035488 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaat 32035389  T
Q  611 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035388 caaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 32035335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 214 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30906086 - 30905825
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30906086 tatcaattgtgagccttagttgattagtaaccaaataaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 30905987  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| |      | ||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||     
T  30905986 actctatgagtagatgtctggatgatcctttaacagaataatgggaaaccataatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtact 30905887  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaa 470  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  30905886 cgacaaactctctcttc-ccccatctgaagagaacttgaggcataaatataccaattgaggaa 30905825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 308 - 664
Target Start/End: Original strand, 17581384 - 17581736
Alignment:
Q  308 atatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  17581384 atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaataaccgtccaatataaaagaggctatggtccccaaactgt 17581482  T
Q  402 catacaccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa-ctctatt 499  Q
       ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||| |  |  |    
T  17581483 ---acacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgttgat 17581579  T
Q  500 gtctgtttcagatcatctcctctct-ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 598  Q
    || || ||||||||| |||||||||  | ||  | ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17581580 gtttgcttcagatcacctcctctctccttgtcgttgttgttgttgagagggctgtcatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaatt------- 17581672  T
Q  599 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581673 --cttggtaaatcaaacatgtcgtagatcctataataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 17581736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 525 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21782941 - 21782802
Alignment:
Q  525 ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782941 ttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag 21782842  T
Q  625 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782841 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 21782802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 572 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8662922 - 8662830
Alignment:
Q  572 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662922 gtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 8662830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Original strand, 17581258 - 17581356
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581258 tatcaattgtgagcctcaattgattagtgatcaaattaagtaataagactattatggttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 17581356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 535 - 664
Target Start/End: Original strand, 18778564 - 18778693
Alignment:
Q  535 ttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatca 633  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18778564 ttgttgttaagagggctgccatgaaagttttatccaggtattcctaaaacccctaattcttaatata-ttgataaatcaaatacgtcgtagatccgatca 18778662  T
Q  634 taatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18778663 taattatgttcaacgttttgtttgcttccgc 18778693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 316
Target Start/End: Original strand, 6096966 - 6097067
Alignment:
Q  216 tcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaa-ttggataattaattaaatatttaattagttgatatgga 314  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6096966 tcaattgtcagccttacttgattagtgatgaaattaagtaataaggctattaaatttctaattttgataattaattaaatatttaattagttgatatgga 6097065  T
Q  315 ct 316  Q
    ||    
T  6097066 ct 6097067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Original strand, 1105986 - 1106093
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatattt-aattagttgatatggactcaatgagtggatgtc 331  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  1105986 ttgattagtgttcaaattaaatgataaggctattaaatttttaactacataattaattaaatatttaaattaattaatatggattcaatgagtggatgtc 1106085  T
Q  332 cggatgac 339  Q
    ||||||||    
T  1106086 cggatgac 1106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 34603457 - 34603382
Alignment:
Q  586 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34603457 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgcttc 34603382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 34724734 - 34724659
Alignment:
Q  586 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34724734 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgcttc 34724659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 664
Target Start/End: Original strand, 6097999 - 6098087
Alignment:
Q  572 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||||||||| | |||||||    
T  6097999 gtattcctaataccctaattcttaacat-cttgataaatcaaacacgtcgtagatccgttc---ttcatgttcaatgttttgtctacttccgc 6098087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 490
Target Start/End: Original strand, 28728071 - 28728218
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagaga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |     
T  28728071 cggaataatgggaaaccctaatggccatcctatataat-gaggctatggtccccaatataccgtacacagcaaaaccgctcttctccccatctgaagcgc 28728169  T
Q  441 acttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgct 490  Q
    | ||  |||||  | ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  28728170 a-ttagggcatcgaggtaccggttgaggaagaacctaactagccgccgct 28728218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12802032 - 12801890
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggc-tattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atga 322  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||    | ||| ||||||||  ||||    
T  12802032 gccttaattgattagtgatcaatttaagtaataaagcttattagatttctatttagaatattaattaattatttaa----tggatttggactcaatatga 12801937  T
Q  323 gtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatg 363  Q
    ||||||||| |||||||||      |||||||||||||| |||||||    
T  12801936 gtggatgtctggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatg 12801890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 494
Target Start/End: Original strand, 20745431 - 20745497
Alignment:
Q  428 ccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaact 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20745431 ccatctgaagagaacttggggcttaaaagtaccgattgaggaaaaaccaaattagtcaccgctaact 20745497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 570 - 634
Target Start/End: Original strand, 1106229 - 1106294
Alignment:
Q  570 aggtattcctaataccct-aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 634  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1106229 aggtattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcat 1106294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Original strand, 1283280 - 1283325
Alignment:
Q  265 ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgata 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1283280 ttagatttctaattggataattaattatatatttaattaattgata 1283325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21173920 - 21173850
Alignment:
Q  32 caaggaagacctgaaccatataacttgtgcattgtttatttttgtggttgcagatta-atatatgacaatg 101  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  21173920 caaggaaggcttgaaccatataacttttgcattgcttgtttttgtggttgtggattagatatatgataatg 21173850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 17900259 - 17900190
Alignment:
Q  593 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  17900259 ttaatatccttgatggaccaaacatgttgtagattcgaacatatttatgtacaattttttgtttgcttcc 17900190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21173755 - 21173723
Alignment:
Q  49 atataacttgtgcattgtttatttttgtggttg 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21173755 atataacttgtgcattgtttgtttttgtggttg 21173723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21311424 - 21311388
Alignment:
Q  53 aacttgtgcattgtttatttttgtggttgcagattaa 89  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21311424 aacttgtgtattttttatttttgtggttgcagattaa 21311388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10761156 - 10760699
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761156 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 10761057  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10761056 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 10760957  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10760956 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtt 10760857  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760856 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 10760757  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10760756 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgc 10760699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 49151266 - 49151722
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151266 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 49151365  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  49151366 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 49151465  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49151466 tggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgttt 49151565  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49151566 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaata 49151665  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151666 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 49151722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 49157333 - 49157789
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157333 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 49157432  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  49157433 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 49157532  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49157533 tggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgttt 49157632  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49157633 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaata 49157732  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157733 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 49157789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38449569 - 38449112
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449569 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 38449470  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38449469 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 38449370  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38449369 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 38449270  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449269 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 38449170  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449169 aaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 38449112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38456056 - 38455599
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38456056 tatcaattgtgagtgttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 38455957  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38455956 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 38455857  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38455856 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 38455757  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455756 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 38455657  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455656 aaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 38455599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 8331441 - 8331897
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8331441 tatcaattgtggaccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggatataagatttctaattggataattaattaaatatttaatcagttgatatgg 8331540  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  8331541 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtaca 8331640  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8331641 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 8331740  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8331741 tagatcatctcctctctttggttatcgttgttgacgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgata 8331840  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331841 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 8331897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11840231 - 11839774
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  11840231 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 11840136  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  11840135 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 11840036  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11840035 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 11839936  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839935 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 11839836  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839835 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 11839774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10244840 - 10244383
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  10244840 tatcaattgtgagccttaattgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 10244745  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  10244744 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 10244645  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10244644 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 10244545  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10244544 tgtttcatatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatcct 10244445  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244444 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 10244383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30051606 - 30051151
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051606 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagatattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 30051507  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30051506 acttaacgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 30051408  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30051407 cggcaaactctctcttctgcccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgttt 30051308  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051307 cagatcatctcctctctttggttattgttgtcgattagagggctgtaatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 30051208  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30051207 aatcaaacatgtcgtagatctgattataatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 30051151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17056297 - 17055842
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17056297 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 17056202  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgacc-----cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcat 404  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17056201 ggactcaacatgagtggatgtccggatgcctattaacggaataatgggaaaccctaatggacatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgt 17056102  T
Q  405 acaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctg 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17056101 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtg 17056002  T
Q  505 tttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 604  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056001 tttcagatcatctcctatctttggttaccgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 17055902  T
Q  605 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055901 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 17055842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42191726 - 42191269
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  42191726 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 42191631  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  42191630 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 42191531  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42191530 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtg 42191431  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42191430 tgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataccct 42191331  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42191330 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgc 42191269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42197668 - 42197211
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  42197668 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 42197573  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  42197572 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 42197473  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42197472 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtg 42197373  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42197372 tgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataccct 42197273  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42197272 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgc 42197211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10238718 - 10238261
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  10238718 tatcaattgtgagccttaattgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 10238623  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  10238622 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 10238523  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10238522 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 10238423  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10238422 tgtttcatatcatatcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatcct 10238323  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238322 tgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 10238261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 10769475 - 10769133
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769475 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 10769376  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10769375 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 10769276  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10769275 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtatt 10769176  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769175 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggg 10769133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 226 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 55003895 - 55003464
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tg 321  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  55003895 gccttaatttattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatg 55003800  T
Q  322 agtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaac 415  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| | |      |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||    
T  55003799 agtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cgt------catccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacgacaaac 55003707  T
Q  416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55003706 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaa---ccaaatcagccgccgctaactctattgtgtatttcagatcat 55003610  T
Q  516 ctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaac 615  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  55003609 cttttctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccagatatttctaataccctaattcttaatatacttgataaattaaac 55003510  T
Q  616 atgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55003509 atgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttc 55003464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 218 - 664
Target Start/End: Original strand, 28964538 - 28964978
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964538 aattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagttattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc 28964637  T
Q  318 aatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgc 411  Q
    ||||||||||||||||||||  |      |||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |     
T  28964638 aatgagtggatgtccggatggtccattaacggaataatgagaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgga 28964737  T
Q  412 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctat-tgtctgtttcag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  28964738 aaactctctcttctccccatctgaagagaactcgaggcat--------cggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaacactttatgtttgtttcag 28964829  T
Q  511 atcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctt-tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaa 609  Q
    ||||   ||| ||| |  | || |||| |  ||||| || | || | |||||||  |||||||||||||||||   |||| | || ||||| ||||||||    
T  28964830 atca---cctttctctattcat-gttgcttttgaga-ggcttccatcaaagcttcaatccaggtattcctaat-ttctaactattgatatctttgataaa 28964923  T
Q  610 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964924 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 28964978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 437 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11846340 - 11846112
Alignment:
Q  437 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaa-tcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 535  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11846340 gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgt 11846241  T
Q  536 tgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcata 635  Q
    |||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846240 tgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcata 11846141  T
Q  636 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846140 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 11846112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 214 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26429923 - 26429639
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  26429923 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 26429828  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    || |||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26429827 gggctcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccagtataaaagaggctatggtccccaatataccg 26429728  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgcta 491  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26429727 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 26429639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 661
Target Start/End: Original strand, 46656353 - 46656791
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtcc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46656353 ttgattagtgatcaaattaagtaataaagctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgtactcgatgagtggatgtcc 46656452  T
Q  333 ggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctc 426  Q
    ||||||||      ||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||      ||||  |||||||||    
T  46656453 ggatgacctattaacggaataatgggaaaccctattggttatccaatataaaagaggttatggttcccaatacaccgta------aaacattctcttctc 46656546  T
Q  427 cccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac-tctattg-tctgtttc-----agatcatctcc 519  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||  |||||||  | | | ||| | ||||||     | |||||||||    
T  46656547 cccatctgaatagaattagagacataaaggtgccggttaaggaagagccaaatcaatcgccgctggcatatgttgatgtgtttcatattatatcatctcc 46656646  T
Q  520 tctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaaca 616  Q
    |||| ||| ||   |||||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46656647 tctccttgttttagatcgttgttgttgagagggttgtcatgaaagcttcattcaggtatttctaataccctcattctcaatatcattgataaatcaaaca 46656746  T
Q  617 tgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    | ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||    
T  46656747 tatcgtagatccgatcataattatattgaatgttttatttacttc 46656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 308 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 48128451 - 48128096
Alignment:
Q  308 atatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48128451 atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatatac 48128352  T
Q  402 catacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgt 501  Q
    | ||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  48128351 cgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaacattgttgt 48128252  T
Q  502 ctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcc-taataccctaattcttaatatc 600  Q
     |||| ||||||| |||     |||  ||| |||||||| |||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  48128251 ttgttccagatcacctc----atttttttaccgttgttg-tgaga--gctgccatgaaagttttat-caggtattccaaaataccctaattcttaatatt 48128160  T
Q  601 cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48128159 cttaataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgtttccgc 48128096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 344 - 637
Target Start/End: Original strand, 13444847 - 13445144
Alignment:
Q  344 aataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaac 442  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13444847 aataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaataggttatggtccccaatacaccgtacacaacgatattctctcttctccccatctgaagagaac 13444946  T
Q  443 ttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctc---tttggttatcgttgtt 539  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || | || ||||||||||| | ||||   |||| |||| ||||||    
T  13444947 ttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaaccctgttttgtggttcagatcatcacatctcctctttgtttatggttgtt 13445046  T
Q  540 gatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataat 637  Q
      |||||| | || | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13445047 actgagagagctgtcatgaatgttttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataat 13445144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 514 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17593481 - 17593331
Alignment:
Q  514 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17593481 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgcctcgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaa 17593382  T
Q  614 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593381 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 17593331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23138922 - 23138795
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138922 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 23138823  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23138822 acttaatgagtggatgtccggatgaccc 23138795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 546 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10767038 - 10766920
Alignment:
Q  546 agggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 645  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10767038 agggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccggtcataatcatgttca 10766939  T
Q  646 atgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10766938 atgttttgtttgcttccgc 10766920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 53069421 - 53069103
Alignment:
Q  343 gaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaa--gaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagaga 440  Q
    ||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  ||||||||||||| ||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069421 gaataatgggaaaccctaatgatcgtccaatataaaaaagaggctatggtcctcaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagaga 53069322  T
Q  441 acttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctatt--gtctgtttcagatcatctcctctctt--tggttatcgtt 536  Q
    ||| |          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |  ||  |  |  || | |||    
T  53069321 actag----------gtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacaccttctcatctttgttgtt 53069232  T
Q  537 gttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcata 635  Q
    |||| | ||| |  | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53069231 gttgttaagatgactaccatgaaagttttatccaggtattcttaatacccctgattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcata 53069132  T
Q  636 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069131 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 53069103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53071757 - 53071640
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  53071757 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatga 53071658  T
Q  314 actcaatgagtggatgtc 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53071657 actcaatgagtggatgtc 53071640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 412 - 664
Target Start/End: Original strand, 34300348 - 34300607
Alignment:
Q  412 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt---- 507  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |  |  | |||||        
T  34300348 aaactctctcatctcctcgtatgaagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaacccgttcttgtgttttcat 34300447  T
Q  508 --cagatcatctcctctct-ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 604  Q
      || |||| ||||||| | ||  | |  |||| || |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34300448 aacaaatcacctcctctgtgtttctgactgttgctgttgagagggttgccatgaaagcttaattcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttt 34300547  T
Q  605 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34300548 ataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 34300607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24643996 - 24643885
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24643996 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaacaaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgg 24643897  T
Q  314 actcaatgagtg 325  Q
    |||||| |||||    
T  24643896 actcaacgagtg 24643885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11846471 - 11846359
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 324  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11846471 gccttaatggattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatattgagtcaatgagt 11846372  T
Q  325 ggatgtccggatg 337  Q
    |||||||||||||    
T  11846371 ggatgtccggatg 11846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 414 - 512
Target Start/End: Original strand, 13837534 - 13837632
Alignment:
Q  414 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagat 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13837534 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagat 13837632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2982720 - 2982484
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctatt-agatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaat--ga 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||    
T  2982720 gccttatttgattagtgatcaaattaaataataaagatatttagatttctaattgaaaaattaattaaatatttaattagttgatataaactcaatacga 2982621  T
Q  323 gtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaact 416  Q
    ||  ||||| |||||||||       ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| || || ||||    
T  2982620 gtatatgtcaggatgacccattaaaagaataat-gaaaatcctaatgaccaacaaatataaaagaggtcatggtcccaaatataccatatacggcgaact 2982522  T
Q  417 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 454  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  2982521 ctcttttctccctatctgaagagaacttaagacataaa 2982484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12109172 - 12108716
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||    
T  12109172 tatcaattgtgatctttaattgattagtgataaaattaagtgataatgttataag-tttctaattagataattgattaaacatttgattaattgatatgg 12109074  T
Q  314 actcaat--gagtggatgtccggatgacccg------gaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcata 405  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||||| ||      |||||||| |||||   ||||  |||  ||||||||||||  || ||||| ||||| ||| ||    
T  12109073 actcaatatgagttgatgtctagatgactcgttaacggaataatgagaaataacaatggtcattcaatataaaagagagtacggtcctcaatacatcgta 12108974  T
Q  406 caccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtctg 504  Q
    ||| ||||||| ||| |||| || |||||||     ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||| ||    
T  12108973 cacggcaaactatcttttcttccgatctgaa-----cttgaggcataaaggtaccggttaaagaagaaccaaatcagtcgccgctaacctatgttgtgtg 12108879  T
Q  505 tttcagatcatctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcc 601  Q
    ||||| |||| ||| |||||  | ||   | ||||  || | ||| || || | | | ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12108878 tttcatatcacctcatctctccgtttcagaccgttcatgttcagaaggttgtcattagagcttcattcaggtattcttaatacc-taattgttaatatcc 12108780  T
Q  602 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttg-tttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12108779 ttgataaatcaaacatgtcttagatcaaatcataatcatattcaatgttttgatttgcttccgc 12108716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8474640 - 8474543
Alignment:
Q  215 atcaattgtgggcctt-agttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8474640 atcaattgtgggcctttaattgattagtgatcaaattaagtaataatgttattagatttataattcaataattaattaaatatttaattaattgatat 8474543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Original strand, 34300092 - 34300197
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34300092 tatcaattgtgagaattaattgattagtaattgaattaagtaataagactattaaatttttaattggataattaattaaatatttaattaattgatatga 34300191  T
Q  314 actcaa 319  Q
    ||||||    
T  34300192 actcaa 34300197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17602027 - 17601912
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atg 321  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17602027 gccttaattgattagtggtcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatg 17601932  T
Q  322 agtggatgtccggatgaccc 341  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  17601931 attggatgtccgaatgaccc 17601912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13367209 - 13367114
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaag 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||  | |||||||||||||||||||    
T  13367209 cggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaa-gaggctatggtccccaatataccgtacatagcaaaaccgctcttctccccatctgaag 13367114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27103344 - 27103272
Alignment:
Q  241 tgatcaaattaagtaataaggctatta-gatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27103344 tgatcaaataaagtaataagacaattaagattttaaattggataattaattaaatatttaattaattgatatg 27103272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 52222634 - 52222573
Alignment:
Q  385 tatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttga 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  52222634 tatggtctccaatatatcatacacaacaaactctattttctccccatccgaagagagcttga 52222573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Original strand, 9760506 - 9760600
Alignment:
Q  342 ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaag 437  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  | |||  | |||||||||||||||||||    
T  9760506 ggaataataggaaaccctaatggtcatccaatataaa-gaggatatggtccccaatataccgtacatagtaaaaccgctcttctccccatctgaag 9760600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24643815 - 24643773
Alignment:
Q  451 taaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac 493  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24643815 taaaggtaccggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaac 24643773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27088097 - 27088019
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctatta-gatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgata 310  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  27088097 ttgattaatgatcaaataaagtattaagacaattaagattttaaattggataattaattaaaaatctaattaattgata 27088019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28525891 - 28525435
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525891 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 28525792  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28525791 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 28525692  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  28525691 tggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgttt 28525592  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28525591 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaata 28525492  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525491 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 28525435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28531987 - 28531531
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531987 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 28531888  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  28531887 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtaca 28531788  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  28531787 tggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgttt 28531688  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28531687 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaata 28531588  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531587 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 28531531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12686684 - 12686228
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  12686684 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 12686589  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  12686588 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 12686489  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12686488 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 12686389  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12686388 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatcctt 12686289  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686288 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 12686228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12692786 - 12692330
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  12692786 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 12692691  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  12692690 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 12692591  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12692590 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 12692491  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12692490 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatcctt 12692391  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692390 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 12692330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7390053 - 7389597
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390053 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 7389954  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  7389953 acttaatgagtggatgttcggatgacccattaacggaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatggttcccaatatactgtaca 7389854  T
Q  408 ccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7389853 cggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtt 7389754  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7389753 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgat 7389655  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389654 aaatcaaacatgtcgtggatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 7389597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 214 - 661
Target Start/End: Original strand, 41296933 - 41297384
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41296933 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgg 41297032  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacccg------gaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  41297033 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtaca 41297132  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaact---tgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41297133 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaactacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 41297232  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41297233 gtttcagatcacctcctctccttggttatcgttgttgatgagagggttgccttgaaag------ccaggtattcctaataccctaattctttatatcctt 41297326  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41297327 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttc 41297384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 214 - 662
Target Start/End: Original strand, 30771934 - 30772392
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30771934 tatcagttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctataaagtttcttattggataattaattaaataattaattagttgatatgg 30772033  T
Q  314 actcaat--gagtggatgtccggatgacccg------gaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcata 405  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| ||| |||  |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  30772034 actcaatatgagtggatgtctggatgacccattaacagaataatgaaaaaccctgatgatcatccaatatagaagagactatggtccacaatatatcaga 30772133  T
Q  406 caccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtct 503  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || | |||| |    
T  30772134 cacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaaccctttgttgtgt 30772233  T
Q  504 gtttcagatcatctc-ctctct-ttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcc 601  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||| |||   |||||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30772234 gtttcagatcatcacaccttctcttgttta---ttgttgttgagagggctgccataaaaactttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatcc 30772330  T
Q  602 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatg-ttttgtttgcttcc 662  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30772331 ttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataatcatgttcattgtttttgtttgcttcc 30772392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 214 - 647
Target Start/End: Original strand, 20499792 - 20500231
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20499792 tatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaataagactattagatttctagtaagataattaattaaatatttaattaattgatatgg 20499891  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||      | |||||||| ||| |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  20499892 actcaatgagtggatgtctggatggcccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcatccaataaataagaggctatggtccccaatacaccgtaca 20499991  T
Q  408 ccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||    
T  20499992 cggcaaaactctctgttctctccatttgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaagaaccaaatcaaccgctgctaaccttcttgtttgtt 20500091  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||  ||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20500092 tcagatcgcctt-tctctctgtttatcgttgatgttgagagggctgccataaaagttttatccaggtatttctaatactctaattcttagtatccttgat 20500190  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 647  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20500191 aaatcaagtatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 20500231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30384889 - 30384427
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  30384889 tatcagttgtgagccttaattgattagtgattaaattaagtaataaggctattggatttctaattagataattaattaaatatttcattaatagatatgg 30384790  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgac------ccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    | |||||||||||||||| |||||||       ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||    
T  30384789 attcaatgagtggatgtctggatgactcattaacggaataatggaaaat-ctaatagtcatccaatataaaagagactatggt-cccaatacaccgtaca 30384692  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtctgtt 506  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||    
T  30384691 cggcaaacattctcttctccccatctgaagagaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaagctatgttgtgtgtt 30384592  T
Q  507 tc-----agatcatctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 598  Q
    ||     ||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||  ||||| | || |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30384591 tcagattagatcatctcctctccttgttttagatcgttgatggcgagagagttgtcacgaaagcttcatccaggtattcttaatacccttattcttaata 30384492  T
Q  599 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30384491 tccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcataatcgtgttcaatgttttgtttgcttccgc 30384427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 214 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32094727 - 32094364
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  32094727 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 32094632  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  32094631 ggactcaacatgagtgtatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctatggtcccaaatacaccg 32094532  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  32094531 tacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaactctattgtg 32094432  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatcca 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||  ||||| |||||||||    
T  32094431 tgtttcagatcatcttctctctttggttattgttgttgattaaagggctgctatgaaacctttatcca 32094364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 214 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32097527 - 32097165
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  32097527 tatcaattgtgagccttaattggttagtgatcaaattaaataataagctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatg 32097432  T
Q  313 gactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcat 404  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  32097431 gactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgt 32097332  T
Q  405 acaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    |||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32097331 acacggaaatactctctattctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgt 32097232  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatcca 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||    
T  32097231 gtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgattaaagggctgctatgaaagctttatcca 32097165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19060265 - 19059815
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaat--gagt 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  19060265 cttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagaatattaattaattaattaattaatggatatggactcaatatgagt 19060166  T
Q  325 ggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactct 418  Q
    ||||||| ||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  19060165 ggatgtctggatgtcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcagacacgacaaactct 19060066  T
Q  419 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctat---------tgtctgtttca 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |         ||| |||||||    
T  19060065 ctcttctcccgatatgaagagaacttgaggcataaaagtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgtgttgatgtggatgtttgtttca 19059966  T
Q  510 gatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctt--tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    ||||| || ||||||    ||||||||||||  ||||||| ||||   |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059965 gatcaccttctctct----ttatcgttgttgtcgagagggctgccaccaaagcttcatctccaggtatttctaataccctaattcttaatatccttgata 19059870  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19059869 aatcaaacatgtcgtagatccgtttatattcatgtttaatattttgtttgcttcc 19059815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19066601 - 19066156
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||  ||||||| |    ||||||| | |||||||| |  ||||||    
T  19066601 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttattagatttctatttagaatattaattga----ttaattaatggatatgga-tatatgagt 19066507  T
Q  325 ggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactct 418  Q
    ||||||| |||||||||      | |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| | |  ||||  ||||||||    
T  19066506 ggatgtctggatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaataggttgtggtccccaatacaccggacacgacaaactct 19066407  T
Q  419 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctatt-------gtctgtttcaga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | ||       || |||||||||    
T  19066406 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgccgctaaccgtgttgatgtgggtttgtttcaga 19066307  T
Q  512 tcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctt--tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaa 609  Q
    |||  | ||||||    ||||||||||||  ||||| | ||||   |||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19066306 tcactttctctct----ttatcgttgttgtcgagagagctgccaccaaagcttcatctcctggtattcctaataccataattcttaatatccttgataaa 19066211  T
Q  610 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19066210 tcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgcttaatgttttgtttgcttccgc 19066156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 299 - 526
Target Start/End: Original strand, 14609909 - 14610141
Alignment:
Q  299 aattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtcc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||| |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  14609909 aattaattgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggtcatctaatgtaaaagaggttatggtcc 14610007  T
Q  393 ccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa 492  Q
    |||||| | |  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14610008 ccaatacaccgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa 14610107  T
Q  493 ctctattgtctgtttcagatcatctcctctcttt 526  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14610108 cccttttgtttgtttcagatcatctcctctcttt 14610141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 532 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32094340 - 32094209
Alignment:
Q  532 tcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 631  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32094340 tcgttgttgttgagagggctgctatgaaagctttattcaggtattcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctat 32094242  T
Q  632 cataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094241 cataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 32094209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 556 - 664
Target Start/End: Original strand, 24054336 - 24054445
Alignment:
Q  556 tgaaagctttatccaggtattcctaata-ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054336 tgaaagctttatccaggtattcctaatatcccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgt 24054435  T
Q  655 ttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||    
T  24054436 ttgcttccgc 24054445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 535 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32097138 - 32097010
Alignment:
Q  535 ttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 634  Q
    |||||| |||||||  |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32097138 ttgttgttgagaggactgctatgaaagctttattcaggtaatcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcat 32097040  T
Q  635 aatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097039 aatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 32097010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 578 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215223
Alignment:
Q  578 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16215309 ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatccaatcataatcatgttaaatgttttgtttgcttccgc 16215223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 14609785 - 14609888
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14609785 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaactattagatttctagtaagataattaattaaacatttaattaattgatatgg 14609884  T
Q  314 actc 317  Q
    ||||    
T  14609885 actc 14609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8706892 - 8706765
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8706892 tatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataagacgattaaatttctaattagataatttattaaatatttaattaattgatatgg 8706793  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc 341  Q
    |  |||| ||||||| | | ||||||||    
T  8706792 atccaataagtggatatgcagatgaccc 8706765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 664
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610259
Alignment:
Q  589 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14610184 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatggtttatttgcttccgc 14610259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 585 - 652
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542336
Alignment:
Q  585 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28542269 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagtttcgatcataatcatgttcaatgtttt 28542336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26318599 - 26318492
Alignment:
Q  373 tataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaa 472  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |    
T  26318599 tatataagaggctatgatccccaatatatcggaaacgacaaactctctcttctccc-atctgaagagaacttatggtataaatgtaccggttgagaaaga 26318501  T
Q  473 accaaatca 481  Q
    |||||||||    
T  26318500 accaaatca 26318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 378 - 662
Target Start/End: Original strand, 26509674 - 26509958
Alignment:
Q  378 aagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaa 477  Q
    |||||| |||||||| | ||||| | ||||| | |||||||| ||| |||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  | |||    
T  26509674 aagaggttatggtccacgatataccgtacacggtaaactctcccttttcc--atctgatgagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaa 26509771  T
Q  478 atcagccgccgctaactctat--tgtctgtttcagatc---atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccagg 572  Q
    |||||||||| |  |||||||  ||| | |||||||||   || ||  ||||||    ||||||| || |||||||  || | | ||||||| || ||      
T  26509772 atcagccgccaccgactctatgttgtgtatttcagatcgcgatttctcctctttcag-atcgttgatgttgagaggactgtcatcaaagcttcattcata 26509870  T
Q  573 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26509871 tattcctaatacc-taattcttaatatc-ttgatgaatcaaatatgtcgtagtttatatcataattatgttcaatgttttgtttgcttcc 26509958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 8706672 - 8706532
Alignment:
Q  460 cggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattg-tctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttga 558  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |   | |||||||||||||||||||||||| ||    |||| || ||||| || || | |||    
T  8706672 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaaccccttcaatttgtttcagatcatctcctctctttcgt----gttgctgttgagatggttgtcatga 8706577  T
Q  559 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706576 aagcataattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 8706532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 37896423 - 37896365
Alignment:
Q  588 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaa 646  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37896423 aattattaatattcttgataaatcaatcatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaa 37896365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 26316922 - 26316843
Alignment:
Q  583 accctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  26316922 accctaattattaataccgtagataaatcaaacatgtcctagatccaatcatattaatgttcaatgttttttttgcttcc 26316843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33753606 - 33753481
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagaga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||| || || | | |||||  || |||||||||||||||||||  | ||||    
T  33753606 cggaataatgggaaaccctaatgaccatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacaccgtacacaccatactctctcttctccccatccaaggaga 33753508  T
Q  441 acttgaggcataaatgtaccggttgag 467  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33753507 acttgaggcataaaaataccgtttgag 33753481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33849240 - 33849115
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagaga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| ||| || || |   |||||  || |||||||||||||||||||  | ||||    
T  33849240 cggaataatgggaaaccctaatgactatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacactgtacacaccatactctctcttctccccatccaaggaga 33849142  T
Q  441 acttgaggcataaatgtaccggttgag 467  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33849141 acttgaggcataaaaataccgtttgag 33849115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 330
Target Start/End: Original strand, 26509530 - 26509620
Alignment:
Q  238 tagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||    || || || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  26509530 tagtgatcaaattaagtaacaagaatgattagatttctatttggataattaatta---tttaaaataattgatatgaactctatgagtggatgt 26509620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33849070 - 33848935
Alignment:
Q  530 tatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaa---catgtcgtagat 626  Q
    ||||||||||| |||||||  || | | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||    ||||||||||||    
T  33849070 tatcgttgttgttgagaggactgtcatcaaaacttcatcaaggtattcctaatacc-taattattagtatc-ttgatagatcaacatgcatgtcgtagat 33848973  T
Q  627 ccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
     ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  33848972 tcgatcatatccatgctcaaagttttttttgcttccgc 33848935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26318748 - 26318676
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataatt 286  Q
    |||||||| || | |||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| || || |||||||    
T  26318748 tatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataaagatattagatttttatttagataatt 26318676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28683450 - 28682994
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28683450 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaacatttaattagttgatatgg 28683351  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28683350 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 28683251  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  28683250 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaactctattgtgtgttt 28683151  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28683150 cagatcatccactctccttggttatcgttgttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgata 28683051  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683050 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 28682994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 31002030 - 31002487
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002030 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 31002129  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31002130 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 31002229  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  31002230 caacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtt 31002329  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31002330 tcagatcatctcctctttttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgat 31002429  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31002430 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 31002487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 31008008 - 31008465
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008008 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 31008107  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31008108 actcaatgagtggatgtccgaatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 31008207  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  31008208 caacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtt 31008307  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31008308 tcagatcatctcctctttttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgat 31008407  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31008408 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 31008465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 30964981 - 30965438
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30964981 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 30965080  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30965081 attcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaatcctaatggccatctaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 30965180  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  30965181 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtt 30965280  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30965281 tcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagatttatacaggtattcctaataccctaattcttaaaataattgat 30965380  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30965381 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 30965438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44717311 - 44716853
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44717311 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatataattagttgatatgg 44717212  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  44717211 acttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtaca 44717112  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44717111 cggcaatactatctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 44717012  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44717011 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggt 44716912  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt-gtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44716911 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttcttttgcttccgc 44716853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 13455753 - 13456210
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  13455753 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 13455848  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  13455849 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 13455948  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13455949 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtg 13456048  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13456049 tgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataccct 13456148  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13456149 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgc 13456210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 13461694 - 13462151
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  13461694 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 13461789  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  13461790 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 13461889  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13461890 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtg 13461989  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13461990 tgtttcagatcatctcctctctttggttatagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataccct 13462089  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13462090 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgc 13462151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13150195 - 13149735
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150195 tatcaattgtgggcattagttgattattgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 13150096  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  13150095 actcaatgagtggatgtacggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatctaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtaca 13149996  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctc-----cccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgt 501  Q
    | |||| | |||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149995 cggcaatattctctcttctcctcatctcatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgt 13149896  T
Q  502 ctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcc 601  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13149895 gtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagttttat-caggtattcttaataccctaattcttaatat-c 13149798  T
Q  602 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149797 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 13149735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 36750068 - 36750525
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  36750068 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta----tttaattagttgatat 36750163  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |     
T  36750164 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatacaccg 36750263  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36750264 tacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 36750363  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750364 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 36750463  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750464 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 36750525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35085185 - 35084725
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  35085185 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 35085090  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  35085089 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccg 35084990  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--------t 494  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |    
T  35084989 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatttat 35084890  T
Q  495 ctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt 594  Q
     |||||| ||||||||||||   ||||||  || |||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35084889 ttattgtttgtttcagatca---cctctc--tgtttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaattgtt 35084795  T
Q  595 aatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35084794 aatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgc 35084725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35091158 - 35090698
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  35091158 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 35091063  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
     |||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  35091062 agactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccg 35090963  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--------t 494  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |    
T  35090962 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatttat 35090863  T
Q  495 ctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt 594  Q
     |||||| ||||||||||||   ||||||  || |||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35090862 ttattgtttgtttcagatca---cctctc--tgtttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaattgtt 35090768  T
Q  595 aatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090767 aatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 35090698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 264 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 11049010 - 11048605
Alignment:
Q  264 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatc 357  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      |||||||||||||| |    
T  11049010 attagatttctgattagataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgggtggatgtctggatgacccattaacggaataatgggaaacc 11048911  T
Q  358 ctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaac----tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa 453  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048910 ctaatggcgatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaaccaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa 11048811  T
Q  454 atgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattg---tctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggga 550  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||   | |||||||||||| || ||||||    | || |||||||  |||||||     
T  11048810 aggtaccagttgaggaagaaccaaattagtcgccg-taactgtgttgatatttgtttcagatcaccttctctct----tgattgttgttgtcgagagggc 11048716  T
Q  551 tgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtt 650  Q
    || | | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11048715 tgtcataaaagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtacatcaaacatgacgtatatccaatcataatcatgttcaatgtt 11048616  T
Q  651 ttgtttgcttc 661  Q
    |||||||||||    
T  11048615 ttgtttgcttc 11048605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 218 - 491
Target Start/End: Original strand, 19879252 - 19879536
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19879252 aattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattaattgatattgactc 19879351  T
Q  318 aatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaat-----ataaaagaggctatggtccccaatatatcatac 406  Q
    |||||||| |||||| |||||||      ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||     |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  19879352 aatgagtgaatgtccagatgacccattaacggaataatgggaaa-cttaatggccatccaatataacataaaagaggttatggtcgccaatacatcgtac 19879450  T
Q  407 accgc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgcta 491  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  19879451 acggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaagaagaatcaaatcagccgccgcta 19879536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Original strand, 23343229 - 23343671
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattgga-taattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatga- 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||            | ||||||||||||||       
T  23343229 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagagtaattaattaa------------tggatatggactcaatata 23343316  T
Q  323 -gtggatgtccggatgacccg------gaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaac 415  Q
     |||||||||||||||||||       ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||||    
T  23343317 ggtggatgtccggatgacccattaacagaataatgg-aaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgggaaac 23343415  T
Q  416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctat---------tgtctgtt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |         ||| ||||    
T  23343416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgtgttgatgttgatgtttgtt 23343515  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctt--tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 604  Q
    |||||||| ||||||| |    |||| |||||||  ||||||| ||||   |||| ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23343516 tcagatcacctcctctat----ttattgttgttgtcgagagggctgccaccaaagtttcatctccatgtattcctaataccccaactcttaatatccttg 23343611  T
Q  605 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23343612 ataaatcaaacatgtcgtagattcgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 23343671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 214 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35439876 - 35439671
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35439876 tatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatga 35439777  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35439776 acttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 35439677  T
Q  408 ccgcaa 413  Q
    | ||||    
T  35439676 cggcaa 35439671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438758
Alignment:
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtc 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |  |||     
T  35439014 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgtt 35438915  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctc----tttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaata 598  Q
    |||||||||||| ||||||||    | | ||| | |||||||  |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||       
T  35438914 tgtttcagatcacctcctctctccttatcgttgttgttgttgtcgagacggctgccatgaaagctttatacaggtattcctaataccctatttccta--- 35438818  T
Q  599 tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35438817 ------gtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgc 35438758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35442338 - 35442211
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442338 tatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 35442239  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35442238 acttaatgagtggatgtccggatgaccc 35442211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7771692 - 7771564
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgata-tg 312  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7771692 tatcaattgtaagtcttagttgattactgatcaaattaagtaataaagctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatacgg 7771593  T
Q  313 gactcaatgagtggatgtccggatgaccc 341  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7771592 gactcgatgagtggacgtccggatgaccc 7771564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 663
Target Start/End: Original strand, 29832878 - 29833317
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc------aatgagtgg 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||||     
T  29832878 ttgattagtgataaaattaagtaataagactattagacttttaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgggaatgagtga 29832977  T
Q  327 atgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctct 420  Q
    ||||| | ||||||      | |||||||| |||| |||||||  |||   ||||||   | |||||||||||||||| |  | |      ||||||| |    
T  29832978 atgtcagaatgacccatcaacagaataatgagaaaccctaatggtcattcgatataa---atgctatggtccccaatacacgaca------aaactctat 29833068  T
Q  421 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaa-tcagccgccgctaactc--tattgtctgtttcagatca--- 514  Q
     ||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |  | |||| | |||| |||||       
T  29833069 attctctctgtctgaagagaacttgaaggataaatgtatcggttgaggaagaaccaaatttagccgccgctaacccgatgttgtgtatttcggatcacgg 29833168  T
Q  515 --tctcctctctttggtt---atcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaa 609  Q
      |||||||||  || ||   |||||||||| |||||||| || | | ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||| |||||||||    
T  29833169 tttctcctctc--tgattcagatcgttgttgttgagagggttgtcatcaaa-cttcatccaggtattcttaata-cctaattattgttat-cttgataaa 29833263  T
Q  610 tcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 663  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  29833264 tcaaacatgttgtcgatccgatcataattatgttcaatattttatttgtttccg 29833317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Original strand, 31651318 - 31651402
Alignment:
Q  247 aattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtc 331  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31651318 aattaagtaataaatcaattagatttttatgtagataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtcgatgtc 31651402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 583
Target Start/End: Original strand, 28765248 - 28765610
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaat--ga 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||   | ||| || |||||||| |||| ||  ||    
T  28765248 gccttaattgattagtgatcaaattaaatgataaggctaattatatttttatttggataattaactaa---tataaataattgatatgaactcgatatga 28765344  T
Q  323 gtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaact 416  Q
    ||| ||||  ||||||| |      |||||||||| |||  |||||| | ||  |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||  |||||     
T  28765345 gtgaatgtatggatgactcatcaacggaataatggaaaactctaatggcgattcaatataaaagaggcaatggtccc-attacaccatacacgacaaaca 28765443  T
Q  417 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatc 516  Q
     | | ||||| |  || |||||||| ||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||  | || |||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  28765444 ttatattctctcattccgaagagaatttgaggcatcaaggtacctattgaggaagaaccaaatcaatctcctctaaccttggtgtttgtttcagatcatc 28765543  T
Q  517 tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaata 583  Q
    | | || |||| ||||| |||||| ||| || | |||| | ||| | | ||||||||||||||||||    
T  28765544 ttcactatttgtttatcattgttgttgatagagctgccatcaaaacatcatccaggtattcctaata 28765610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 492
Target Start/End: Original strand, 29034697 - 29034759
Alignment:
Q  430 atctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  29034697 atctgaagagaacttgagacataaaggtaccagttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaa 29034759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8342671 - 8342606
Alignment:
Q  236 attagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8342671 attagtgatcaaattaaataataagattaattagatttctaattagataattaattatatgtttaa 8342606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Original strand, 23283911 - 23283955
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggc-tattagatt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23283911 cttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatt 23283955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 613 - 652
Target Start/End: Original strand, 31651664 - 31651703
Alignment:
Q  613 aacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 652  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31651664 aacatgtcataaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 31651703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 23284732 - 23284784
Alignment:
Q  341 cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccc 393  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23284732 cggaataatgtgaaactctaatggccatcaaatataaaagatgttatggtccc 23284784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 664
Target Start/End: Original strand, 34739644 - 34740096
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739644 aattgagggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactc 34739743  T
Q  318 aatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgc 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |    
T  34739744 aatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctgtggtccccaatataccgtacacgac 34739843  T
Q  412 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcaga 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34739844 aaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcaga 34739943  T
Q  512 tcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatc 611  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739944 tcattttctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatc 34740043  T
Q  612 aaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34740044 aaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 34740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 31051198 - 31051654
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051198 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 31051297  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31051298 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 31051397  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31051398 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 31051497  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31051498 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgaaagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaatat-cttgat 31051596  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051597 aaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 31051654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 31057698 - 31058154
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057698 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 31057797  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  31057798 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatacaatataaaagaggctatgatccccaatataccgtaca 31057897  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31057898 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtt 31057997  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31057998 ttagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaatat-cttgat 31058096  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058097 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 31058154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25388008 - 25387553
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  25388008 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 25387913  T
Q  312 ggactcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcata 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25387912 ggacttaatgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgta 25387813  T
Q  406 caccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctg 504  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25387812 cacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtg 25387713  T
Q  505 tttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387712 tttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgtttttaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttg 25387613  T
Q  605 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387612 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 25387553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 214 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 8093351 - 8092898
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8093351 tatcaattgtgagtcttagttgattaataatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatgtttaattagttgatatgg 8093252  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  8093251 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaacgatcatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgaaca 8093152  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactcta-ttgtctgtt 506  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8093151 cggcaaactctcttttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-ctagttgtttgtt 8093053  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8093052 tcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagaggactgctacaaaagctttatccaggtattcctcatacccaaattcttaatatccttgat 8092953  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8092952 aaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttc 8092898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25382041 - 25381584
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  25382041 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 25381946  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  25381945 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 25381846  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25381845 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 25381746  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381745 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 25381646  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381645 tggtaaatcaaacatttcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 25381584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 50305851 - 50306299
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  50305851 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 50305946  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  50305947 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 50306046  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50306047 tacacggcaaattctctcttctccccatctgaagagaacttgaggc-------taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 50306139  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50306140 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatat-ctt 50306238  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306239 gataaatcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 50306299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 44409654 - 44410120
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44409654 tatcaattgtgagccttaattgattagtgattaaattaggtaataaggctattaggtttctaattggataattaattaaatatttaattagttaatatgg 44409753  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||    
T  44409754 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgagaaaccctaatggccatccaatataaaagaggttatggtccccaatacactataca 44409853  T
Q  408 ccgc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tctat------ 498  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||          
T  44409854 cgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgaagtt 44409953  T
Q  499 --tgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatc---gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattct 593  Q
      ||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||   ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44409954 gatgtttgtttcagatcacctcctctc--tccttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttatccaggtattcctaata--ctaattct 44410049  T
Q  594 taatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44410050 tgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgc 44410120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38152463 - 38152024
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38152463 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatga 38152364  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||     |||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||    
T  38152363 actcaat-----gatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaatgaccatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtaca 38152270  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtctgtt 506  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | | |||| | ||    
T  38152269 cgacaaactcgttcttctccccatctaaagaaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaagaaccaaattagctgccgctaacgtatgttgtgtatt 38152170  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||    ||||       ||| |||||| |||||||  || | | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38152169 tcagatcatggtttctc------catcattgttgttgagaggattgtcatcaaagtttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgat 38152076  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||      | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38152075 aaatcaaacatgtcgtagatc------tgatcatgttcaatattttgtttgcttccgc 38152024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 214 - 518
Target Start/End: Original strand, 1077898 - 1078209
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  1077898 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 1077993  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  1077994 ggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 1078093  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1078094 tacacggcaatactctctcttctcaccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcggccgctaactctattgtg 1078193  T
Q  503 tgtttcagatcatctc 518  Q
    ||||||||||||||||    
T  1078194 tgtttcagatcatctc 1078209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 27954815 - 27955271
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27954815 tatcaattgtgaggcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaatttgataattaattaaatatttaattagttgatatgg 27954914  T
Q  314 actca--atgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcata 405  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||| | |      |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| | |||| |||||||||   || |    
T  27954915 actcaatatgagtggatgtatggatggctcattagtggaataatgggaaatcataatggtcatccaatataaaagatgttatgatccccaata---caca 27955011  T
Q  406 caccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac--tctattgtc 502  Q
    |||  ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||  | | ||||     
T  27955012 cacgacaatacattctcttctccccatctg-agagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaataactaaatcagtcgtcgttaacattttgttgtg 27955110  T
Q  503 tgtttcagatcatc---tcctctctttggttatcgttgttgatgagaggga--tgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaat 597  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  |  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || ||    
T  27955111 tgtttcagatcatcacatcctctctttctttatcgttgttgttgagagagagctatcatgaaagctttatccaggtcttcctaata-ccttattatttat 27955209  T
Q  598 atccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955210 atcctt-----atcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 27955271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 228 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24927260 - 24926803
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattgga--------taattaattaaatatttaattagttgatatggactca 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||        ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  24927260 cttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttataagatttctatttagaatattaattaattaattaattaattaattaatggatatggactca 24927161  T
Q  319 atgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgca 412  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||   | |    
T  24927160 atg-gtggatgtctggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatactccatacgtggaa 24927062  T
Q  413 aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctat---------tgtct 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  | |         ||| |    
T  24927061 aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcatataggtaccggttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgtgttgatgttgatgttt 24926962  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--caggtattcctaataccctaattcttaatatcc 601  Q
    ||||||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  24926961 gtttcagatcacctcctctct----ttatcgttgttgtcgagagtgctgccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaatacgttaattcttaatattc 24926866  T
Q  602 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24926865 ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattaatgttcaatgttttggttgcttccgc 24926803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24964198 - 24963751
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||  |||||||||    ||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  24964198 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagcttataagatttctatttagaatattaattaa----ttaattaatggatatgaactcaatgggt 24964103  T
Q  325 ggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactct 418  Q
    ||||||| | |||||||      |||| ||||| ||| ||||||   |||| ||||||||||| |||||| || |||| | | | ||    |||||||||    
T  24964102 ggatgtctgaatgacccattaacggaaaaatgg-aaaccctaattgtcatctaatataaaagatgctatgatcaccaagacaccgtatgtggcaaactct 24964004  T
Q  419 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattg---------tctgtttca 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   || |||||  | |||         | |||||||    
T  24964003 ctcttctccccatctgaagaggacttgaggcataaatgtactggttgaggaagaaccaaatcagtttccactaaccgtgttgatgttgatgtttgtttca 24963904  T
Q  510 gatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  24963903 gatcacctcctctcttt----atcgttgttgtcgagagggctaccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaatactttaattcttactattcttgata 24963808  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963807 aatcaaacatggcgtagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 24963751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 558 - 664
Target Start/End: Original strand, 1078228 - 1078334
Alignment:
Q  558 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 657  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078228 aaagctttatccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 1078327  T
Q  658 cttccgc 664  Q
    |||||||    
T  1078328 cttccgc 1078334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33458415 - 33458290
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  33458415 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataatgctattagatttctaactagataattacttaaatatttaattaactgatatgg 33458316  T
Q  314 actca-atgagtggatgtccggatga 338  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  33458315 actaatgtgagtggatgtccggatga 33458290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25275552 - 25275425
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  25275552 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatat 25275457  T
Q  312 ggactca--atgagtggatgtccggatgaccc 341  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25275456 ggactcaacatgagtggatgtccggatgaccc 25275425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 556 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12183740 - 12183635
Alignment:
Q  556 tgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtt 655  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12183740 tgaaagctttattcaggtattcctaatactcaaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataattatgttcaatattttgtt 12183642  T
Q  656 tgcttcc 662  Q
    |||||||    
T  12183641 tgcttcc 12183635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12184069 - 12183994
Alignment:
Q  264 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtccggatg 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12184069 attagatttctatttggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtagatgtccggatg 12183994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4280235 - 4280165
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataa 284  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  4280235 tatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagattattagatatctaatttgataa 4280165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12183867 - 12183816
Alignment:
Q  435 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgc 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  12183867 aagagaacttgaggcataaaggtagcggttgagaaataaccaaatcagtcgc 12183816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 468
Target Start/End: Original strand, 23254013 - 23254063
Alignment:
Q  417 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgagg 468  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23254013 ctctcttctccccatatgaaaagaacttgatgcataaatgta-cggttgagg 23254063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5542655 - 5542209
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542655 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagt 5542556  T
Q  325 ggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actc 417  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||    
T  5542555 ggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactc 5542456  T
Q  418 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatct 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5542455 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatct 5542356  T
Q  518 cctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacat 617  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542355 cccctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacat 5542256  T
Q  618 gtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542255 gtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 5542209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 32890542 - 32890999
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  32890542 tatcaattgtgacccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 32890637  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  32890638 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccg 32890737  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32890738 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 32890837  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890838 tgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 32890937  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890938 tggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 32890999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 32896666 - 32897123
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  32896666 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 32896761  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  32896762 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccg 32896861  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32896862 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 32896961  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896962 tgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 32897061  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897062 tggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 32897123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 214 - 652
Target Start/End: Original strand, 10699683 - 10700127
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699683 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaattaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 10699782  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  10699783 actcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggagtaatgggaaaccctaatggtcatcaaatataaaagagactatggtccccaatataccgtaca 10699882  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10699883 cggcaatactctctcttctctccatctgacgaaaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 10699982  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10699983 tcagatcatttcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagttttatccagatattcctaataccctaattcttaatat-cttgat 10700081  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700082 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 10700127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 214 - 662
Target Start/End: Original strand, 36818626 - 36819079
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  36818626 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggttaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 36818721  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  36818722 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccg 36818821  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36818822 tacacggcaaactctctcttctccccatctgatgagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgt 36818921  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36818922 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-ctt 36819020  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36819021 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttcc 36819079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 14417615 - 14418051
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14417615 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatgg 14417714  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 413  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||  | ||| |  ||||   ||||      |||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  14417715 gctcaatgagtggatgttcggatgtccc--attaacg--aaat---aatggg----aaa---aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa 14417800  T
Q  414 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatc 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  14417801 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttcagatc 14417900  T
Q  514 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 613  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417901 atcttctctctttggttatcgtcgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 14418000  T
Q  614 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418001 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 14418051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 214 - 660
Target Start/End: Original strand, 10705492 - 10705949
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705492 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatgg 10705591  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  10705592 actcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatagtcatcaaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtaca 10705690  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10705691 cgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttaagccataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 10705790  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10705791 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatat-cttgat 10705889  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccg------atcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705890 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 10705949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42993505 - 42993053
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  42993505 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 42993410  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||      |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  42993409 ggactcaacatgagtggatgtccg-atggcccattaacggaataatgggaaaccctaatcgccatccaatataaaagaggttatggtccccaatataccg 42993311  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
     |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42993310 aacacggcaatactct---ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 42993214  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42993213 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggtggctacaaaagctttatcaaggtattcctaataccctaattcttaatat-ct 42993115  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993114 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 42993053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 226 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22220221 - 22219778
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22220221 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataagggtattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgaatg 22220122  T
Q  326 gatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actct 418  Q
    |||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  22220121 gatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactct 22220022  T
Q  419 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |     
T  22220021 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaactttattgtttgtttcagatca-att 22219923  T
Q  519 ctctctttggttatc----------gttgttgatgagagggatgccttgaaagctt-tatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
     | |||||| |||||          ||||||| |||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22219922 ttttctttgtttatcgttgttgttggttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcaatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 22219823  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22219822 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaaagtttt 22219778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 9934937 - 9935389
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    |||||||  |||||||    
T  9934937 tatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagctaattagatttctattttggataattaatta----tttaatttattgatat 9935032  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |     
T  9935033 ggactcaacatgagtggatatccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaatggccatccaa-ataaaagaggctatggtccccaatacaccg 9935130  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtct 503  Q
    |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9935131 tacacgacaaactct--cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaatctattgtgt 9935228  T
Q  504 gtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 603  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935229 gtttcagatcatctcctatctttggttaacgttgttgattagagggctgctatgaaagatttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 9935328  T
Q  604 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9935329 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgc 9935389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39736044 - 39735601
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39736044 tatcaattgtgagcattagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 39735945  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||          ||||    
T  39735944 actcaatcagtggatgtccggatgacccattaacggaataa-gggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctctggtaccg---------taca 39735855  T
Q  408 ccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactcta-ttgtctgt 505  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  39735854 cgacaaaactctctcttctccccatctgaagagtacttgaggcataaatgtaccagttaaggaagaatcaaatcagccgccgctaacccttgttgtttgt 39735755  T
Q  506 ttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttga 605  Q
    ||||||||| || ||||||||    | |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  39735754 ttcagatcaccttctctcttt----accgttgttgttgagagggttgccatgaaat-tttatccaggtattccttataccctagttcttaatatctttga 39735660  T
Q  606 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  39735659 taaatcaaacatgtcgtagatacaatcataatcatgttcaatattttatttacttccgc 39735601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 214 - 493
Target Start/End: Original strand, 42033451 - 42033740
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033451 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggttattagatttctaattagataattaattaaatatttaattagttgatatgg 42033550  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc----------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  42033551 actcaatgagtggatgtccggatggcccgcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaggaggctatggtccccaatacattg 42033650  T
Q  404 tacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42033651 tacacggcaaactctctcttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 42033740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 377 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 39727645 - 39727370
Alignment:
Q  377 aaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaacc 475  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39727645 aaagaggatatggtccccaatataccgtacacaacaaaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 39727546  T
Q  476 aaatcagccgccgctaactc-tattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggta 574  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||| |||||||||||| || ||||||    ||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||    
T  39727545 aaatcagcagccgctaacccttgctgtttgtttcagatcaccttctctct----ttaccgttgttgttgagagggttgccaagaaagttttttccaggta 39727450  T
Q  575 ttcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 663  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727449 tttcttataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt---------gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 39727370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39727790 - 39727668
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39727790 tatcaattgtgagacttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgg 39727691  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39727690 actcaatgagtggatgtccggat 39727668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 523 - 664
Target Start/End: Original strand, 7771202 - 7771342
Alignment:
Q  523 ctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7771202 ctttggttatcgttgttgatgagagggttgctacaaaagctt-atccaggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgt 7771300  T
Q  623 agatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7771301 agatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 7771342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 564 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14799564 - 14799465
Alignment:
Q  564 ttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799564 ttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 14799466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1882939 - 1882801
Alignment:
Q  529 ttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatc--caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtc-gtaga 625  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1882939 ttatcgttgttgttgagagggctgccatgaaagcttcatctccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtcattaga 1882840  T
Q  626 tccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1882839 tccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 1882801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1883151 - 1883039
Alignment:
Q  381 aggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatc 480  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||     
T  1883151 aggctatggtccccaatacacaatacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaatt 1883052  T
Q  481 agccgccgctaac 493  Q
    |||||||||||||    
T  1883051 agccgccgctaac 1883039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 457 - 623
Target Start/End: Original strand, 1171249 - 1171414
Alignment:
Q  457 taccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgcct 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||  || ||||| || |||  |||| || |||||| | ||||     
T  1171249 taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgttgtttgtttcagatcacatcatctctctgtttactgttgctgttgagagagctgcca 1171348  T
Q  556 tgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgta 623  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1171349 taaaagctttaaccaggtattcctaata-cctaattcttgttat-cttgataaatcaaatatgtcgta 1171414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1883331 - 1883221
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggc-tattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atga 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||        ||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  1883331 gccttacttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagaatattaa--------ttaattaatggatatggactcaatatga 1883240  T
Q  323 gtggatgtccggatgaccc 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1883239 gtggatgtccggatgaccc 1883221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 341
Target Start/End: Original strand, 17954174 - 17954289
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaatta----agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc--aatg 321  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||    
T  17954174 cttaattgattagtgatcagattactaaagtaataagcctattagatttctattt----aattaattaattaattaattagttgatatggactcaaaatg 17954269  T
Q  322 agtggatgtccggatgaccc 341  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  17954270 agtggatgttcagatgaccc 17954289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 312
Target Start/End: Original strand, 11641418 - 11641456
Alignment:
Q  274 taattggataattaattaaatatttaattagttgatatg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11641418 taattggataattaattaaatatttaattaattgatatg 11641456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30890593 - 30890531
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattg 279  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30890593 aattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaattaataagactaattagatttctaattg 30890531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Original strand, 1171216 - 1171249
Alignment:
Q  410 gcaaactctctcttctccccatctgaagagaact 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171216 gcaaactctctcttctccccatctgaagagaact 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 622 - 664
Target Start/End: Original strand, 24250171 - 24250213
Alignment:
Q  622 tagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24250171 tagatccgatcataataatgttcaatattttgtttgtttccgc 24250213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10739842 - 10739391
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10739842 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatgg 10739743  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  10739742 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataa--gaggctatggtccccaatacaccgtaca 10739645  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10739644 cggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 10739545  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739544 caaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 10739445  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739444 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 10739391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10953611 - 10953160
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10953611 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatgg 10953512  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  10953511 acttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataa--gaggctatggtccccaatacaccgtaca 10953414  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10953413 cggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 10953314  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953313 caaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 10953214  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953213 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 10953160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 48160613 - 48161069
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160613 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 48160712  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  48160713 actcaatgagtggatgttcggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 48160812  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  48160813 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtt 48160912  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48160913 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgat 48161011  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48161012 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgc 48161069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 48166832 - 48167288
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166832 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 48166931  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  48166932 actcaatgagtggatgttcggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 48167031  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  48167032 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtt 48167131  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48167132 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgat 48167230  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48167231 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgc 48167288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6257710 - 6257254
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6257710 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgg 6257611  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||      |||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  6257610 gctcaatgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtaca 6257512  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6257511 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 6257412  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6257411 tcagatcatctcctcactttggttatcgttgttgatgagagggctgctacgaaagctttatccaggtattcctaatatcctaattcttaacatccttgat 6257312  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257311 aaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 6257254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 218 - 664
Target Start/End: Original strand, 24287645 - 24288097
Alignment:
Q  218 aattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatggac 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  24287645 aattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaa----atatttaattagttgatatggac 24287740  T
Q  316 tcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  24287741 tcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatg-tccccaatacaccgtaca 24287839  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtt 506  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24287840 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtt 24287939  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24287940 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgat 24288039  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288040 aaatcaaacatgtcgtagatacgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 24288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 214 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 10733855 - 10733504
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10733855 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatgg 10733756  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  10733755 acttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataa--gaggctatggtccccaatacaccgtaca 10733658  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10733657 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgttt 10733558  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaag 561  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10733557 caaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaag 10733504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 214 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 10947624 - 10947273
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10947624 tatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatgg 10947525  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  10947524 acttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataa--gaggctatggtccccaatacaccgtaca 10947427  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10947426 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgttt 10947327  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaag 561  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10947326 caaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaag 10947273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 344 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33458636 - 33458316
Alignment:
Q  344 aataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaact 443  Q
    ||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33458636 aataatgcgaaaccctaacggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactttctcttctccccatctgaagagaact 33458537  T
Q  444 tgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatg 543  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33458536 tgaggcataaaggtatcggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatg 33458437  T
Q  544 agagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgtt 643  Q
    |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458436 agagggctgctaagaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgtt 33458337  T
Q  644 caatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  33458336 caatattttgtttgcttccgc 33458316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 345 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 33461760 - 33461444
Alignment:
Q  345 ataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaactt 444  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33461760 ataatgggaaaccctgatgatcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaaaagaactt 33461661  T
Q  445 gaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatga 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33461660 gaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttgattatcgttgttgatga 33461561  T
Q  545 gagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttc 644  Q
    ||||| |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33461560 gagggctgctgcaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgaccataatcatgttc 33461462  T
Q  645 aatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33461461 aatgttttgtttgcttcc 33461444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 228 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44832106 - 44831661
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtgga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44832106 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggttataagatttttaattagataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtgca 44832007  T
Q  328 tgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctc 421  Q
    ||||||||||  ||      |||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    |||||||||    
T  44832006 tgtccggatggtccattaacggaataattggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgaacac----aactctctc 44831911  T
Q  422 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactcta--ttgtctgtttcagatcatctc- 518  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||| |     
T  44831910 ttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgaggaagaaccacatcagccgtcgctaaccctattttgtgtgtttcagatcatcacc 44831811  T
Q  519 ----ctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaa 614  Q
        |||||| || |||||||||||| |||||||| ||   | ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44831810 ttctctctctctgtttatcgttgttgttgagagggttgttatcaaagcttcatctaggtattcttaataccctagttcttaatatccttgataaattaaa 44831711  T
Q  615 catgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  44831710 catgtcgtagattcgatcatattcatgttcaatgattaatttgcttccgc 44831661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 50168249 - 50168703
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168249 tatcaattgtgagtcttaattgattagtggtcaaatcaagtaacaaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 50168348  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||      | |||||||| ||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  50168349 actcaatgagtggatgaccgaatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcattcaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtaca 50168448  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactcta-ttgtctgtt 506  Q
    |   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||  |||| ||||    
T  50168449 cgcaaaactctcttttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccg-ttgaggaagaactaaatcaaccgccgctaatccttgttgtttgtt 50168547  T
Q  507 tcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgat 606  Q
    ||||||||  |||||||| || || | ||||||| |||| ||  |||| ||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  50168548 tcagatcacatcctctctctgattgttgttgttgttgagtggc-tgccatgaaagcctcaaccaggtattccttatacc-taattgttaatattcttgat 50168645  T
Q  607 aaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168646 aaatcaaacatgtcgtatattcgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 50168703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 214 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26957309 - 26957023
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957309 tatcaattgtgagccttaattaattagtgatcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 26957210  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26957209 actcaatgagtggatgtccggatggctcattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtaca 26957110  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac 493  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26957109 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac 26957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 460 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10733499 - 10733295
Alignment:
Q  460 cggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaa 559  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10733499 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaa 10733400  T
Q  560 agctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 659  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10733399 aggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgct 10733300  T
Q  660 tccgc 664  Q
    |||||    
T  10733299 tccgc 10733295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 460 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10947268 - 10947064
Alignment:
Q  460 cggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaa 559  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10947268 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaa 10947169  T
Q  560 agctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 659  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10947168 aggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgct 10947069  T
Q  660 tccgc 664  Q
    |||||    
T  10947068 tccgc 10947064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 660
Target Start/End: Original strand, 49976267 - 49976693
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaat--ga 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||  |||||||||    ||||||| | |||||||| |||||  |     
T  49976267 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttttgtttagaatattaattaa----ttaattaatggatatggattcaatatgg 49976362  T
Q  323 gtggatgtccggatgacccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctct 422  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||      | ||||| |||||||||||||    
T  49976363 gtggatgtctggatgac--gtaataatggaaaaccctaatggccatccaatataaaagaggttatggtctccac-----cgtacacggcaaactctctct 49976455  T
Q  423 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac---tctattgtctgtttcagatcat---c 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | |||| ||||| |||||||   |    
T  49976456 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaa-gtacc-gttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaacccttattttgtgtgtttgagatcatcacc 49976553  T
Q  517 tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaaca 616  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||   | ||||||| || | |||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  49976554 tcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggagtgttatcaaagcttcat-ctggtattcctaatactctaa---ttattatccttgataaatcaaaca 49976649  T
Q  617 tgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49976650 tgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgctt 49976693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 214 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26972060 - 26971824
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972060 tatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataaggatattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 26971961  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |      ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  26971960 actcaatgagtggatgtctggatggtccattaacggaataat-ggaaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtccccaatataccgtaca 26971862  T
Q  408 ccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaactt 444  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26971861 cggcaatactctctcttctccccatctgaagagaactt 26971824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 214 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19686823 - 19686378
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  19686823 tatcgattgtgtgtcttaattgattagtgatcaaattaaataataagactgttaaatttataataaaataattaattgaatatttaattaattgatatga 19686724  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||      || ||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||| |||| || | ||||| |||  |||    
T  19686723 actcaagcagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatgagaaaccctactgaccatccaatataaaagagactatagt-ctcaatacatc--aca 19686627  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
      |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||| || |       |||||| |||||    
T  19686626 aggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacgaaccaaatcagctgctg------atattgtgtgttt 19686533  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| | |  || | | |||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  19686532 cagatcatcttctctctttggtgatcattgctgttgaaatgtctgtcatcaaagctttgttca-gtattcataatacccgaattcttaatatgcttgatt 19686434  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccg 663  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  19686433 aatcaagcatgttgtagatccgatgataattacgttcaatattttgtttgcttccg 19686378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 645
Target Start/End: Original strand, 4632192 - 4632482
Alignment:
Q  365 ccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggt 463  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||   ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4632192 ccatccaatataaaagaggttatggtccccaatatacagtacatgacaatactttctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggt 4632291  T
Q  464 tgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcaga-------tcatctcctctc---tttggttatcgttgttgatgagagggatgc 553  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||| | || | |||||||||       ||||| | ||||   |||| |||| ||||||| ||| |||| ||     
T  4632292 tgaggaagaaccaaatcagaagccgctaactatgttttgtgtttcagaattcagatcatcacatctcctatttgtttatggttgttgttgaaagggttgt 4632391  T
Q  554 cttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 645  Q
    | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632392 catgaaagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4632482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 525
Target Start/End: Original strand, 35177467 - 35177770
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaat--gagtggatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  35177467 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagttttctaattagataattatttaaatatttaatttgttgacatggactcaatacgagtgtatgt 35177566  T
Q  331 ccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctc-tctt 423  Q
    | ||||||||       ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||||  |||    || |  |    
T  35177567 ctggatgacctattaaaggaataatgagaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggttatagtcctcaatacaccgtacacaacaataaatcatggt 35177666  T
Q  424 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactcta--ttgtctgtttcagatcatctcctc 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  35177667 ctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgagaaataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttcagatcatcacctc 35177766  T
Q  522 tctt 525  Q
    ||||    
T  35177767 tctt 35177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 643
Target Start/End: Original strand, 50155657 - 50156046
Alignment:
Q  256 ataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataat 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |      || | ||||    
T  50155657 ataaggctattagatttttaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc---gagtggatgtccggatgatccattaacgaactaat 50155753  T
Q  350 gggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctc-ttctccccatctgaagagaacttgagg 448  Q
    | |||| | |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  50155754 gagaaaccataatgatcatccaatataaaagaagttatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaagg 50155853  T
Q  449 cataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagg 548  Q
    |||||| ||||| || ||| || || ||||||||||||||||||   | |||| ||||||| ||||  |||||||| |  || | |||| |  ||||  |    
T  50155854 cataaaggtaccagtcgagaaagaatcaaatcagccgccgctaatattgttgtttgtttcaaatcacatcctctctctaattgttgttgctattgag-tg 50155952  T
Q  549 gatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgtt 643  Q
    | | || ||||||| | | |||  ||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  50155953 gcttccatgaaagcctcaaccaaatattccttata-cgtaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtatatccgatcttaattatgtt 50156046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17627261 - 17627002
Alignment:
Q  233 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtcc 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  17627261 ttgattagtgattaaattaagtaataagcctattagatttccaattagataattaattaaatatttgattaattaatatggactcaatgaggggatgtca 17627162  T
Q  333 ggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctc 426  Q
    ||||||||      ||||||||| | ||| |||||||    | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |   |||||     ||  |||||||||    
T  17627161 ggatgacccattaacggaataattgaaaaccctaatggttgttaaatataaaagaggccatgatccccaatacacagtacac-----acattctcttctc 17627067  T
Q  427 cccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgcta 491  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||    
T  17627066 cccatctgaagagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaagaacaaaactagccgtcgcta 17627002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 534 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26963518 - 26963390
Alignment:
Q  534 gttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatca 633  Q
    ||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26963518 gttgttgttgagagggctaccataaaagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttca 26963421  T
Q  634 taatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26963420 tacttatgttcaatgttttgtttgcttccgc 26963390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 418 - 660
Target Start/End: Original strand, 3769434 - 3769673
Alignment:
Q  418 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtctgtttcagatca-- 514  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||| | ||||| ||||      
T  3769434 tctcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaacctatgttgtgtatttcacatcacg 3769533  T
Q  515 -tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 613  Q
     | || ||||| ||   ||||||| || |||||||    || | ||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  3769534 atttcttctctgtg---atcgttgctgttgagagga---ccatcaaagcctcattcaagtattcctaatacc-taattattaatatccttgattaatgaa 3769626  T
Q  614 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3769627 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 3769673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 542 - 662
Target Start/End: Original strand, 50427356 - 50427483
Alignment:
Q  542 tgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatc--------aaacatgtcgtagatccgatca 633  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||        |||||||||||| |||||||||    
T  50427356 tgagagggcttccatgaacgctatatccaggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaataaattaaacatgtcgtacatccgatca 50427455  T
Q  634 taatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50427456 taatcat-ttcaatgttttgattgcttcc 50427483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 593 - 661
Target Start/End: Original strand, 9237402 - 9237470
Alignment:
Q  593 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 661  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9237402 ttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatcatattcaatgttctgtttgcttc 9237470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Original strand, 50426901 - 50426980
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa 293  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||  ||||||||||||||    
T  50426901 tatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagttattaaattttcaatgagataattaattaaa 50426980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 494
Target Start/End: Original strand, 32284542 - 32284620
Alignment:
Q  416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaact 494  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32284542 tctctattctcctcatctgaagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaaatcagtcgccactaact 32284620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 4632043 - 4632140
Alignment:
Q  228 cttagttgattagtgatcaaattaagtaataagg-ctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtgg 326  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||    ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4632043 cttaattgattagtaatcaaattaagtaataaggtttattagatttctacttagagtattaattaa----ttaattagtggatatggact-aatgagtgg 4632137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 613 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26956929 - 26956878
Alignment:
Q  613 aacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  26956929 aacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttatttgcttccgc 26956878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 494
Target Start/End: Original strand, 33045107 - 33045185
Alignment:
Q  416 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaact 494  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  33045107 tctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcagccgccgttaact 33045185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 478
Target Start/End: Original strand, 50427238 - 50427281
Alignment:
Q  435 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaa 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50427238 aagagaagttgaggcataaatgtaccggttgagtaagaaccaaa 50427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 662
Target Start/End: Original strand, 28704553 - 28704619
Alignment:
Q  596 atatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  28704553 atatctttgatacatcaaacatgttgtagatctgatcatattcatgctcaatattttatttgtttcc 28704619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31986833 - 31986745
Alignment:
Q  530 tatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt 619  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||| | ||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  31986833 tatcgttgttgttgaaagggccgccatcaaaacttcattcagatattcctaatacc-taattattgttatccttgataaatcaaacatgt 31986745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 664
Target Start/End: Original strand, 4632869 - 4632897
Alignment:
Q  636 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632869 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 4632897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 173395 - 172939
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173395 tatcaattgtgggtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 173296  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |      ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  173295 actcaatgagtggatgtccggatgttctattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtata 173196  T
Q  408 ccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgttt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  173195 cggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 173096  T
Q  508 cagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgata 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  173095 cagatcatcttctctctttggttatcgttgttgataagagggctatcttgaaagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaatatccttgata 172996  T
Q  608 aatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  172995 aattaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgc 172939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Original strand, 12049 - 12506
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  12049 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatat 12144  T
Q  312 ggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatca 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  12145 ggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg 12244  T
Q  404 tacaccgcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12245 tacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtg 12344  T
Q  503 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatcct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12345 tgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagaggactgccttgaaagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaatatcct 12444  T
Q  603 tgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12445 tgataaatcaaacatgtcgtagattcgatcataattatgttcaatgttttatttgcttccgc 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 226 - 664
Target Start/End: Original strand, 6188 - 6633
Alignment:
Q  226 gccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tg 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6188 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatg 6283  T
Q  322 agtggatgtccggatgaccc------ggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa-a 414  Q
    |||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |    
T  6284 agtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaata 6383  T
Q  415 ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatca 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6384 ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatca 6483  T
Q  515 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484 tctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaa 6583  T
Q  615 catgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6584 catgttgtagattcagtcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 6633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 214 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1104 - 668
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1104 tatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatgg 1005  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacccggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaa 413  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||  | ||| |  ||||   ||||      |||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  1004 gctcaatgagtggatgttcggatgtccc--attaacg--aaat---aatggg----aaa---aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa 919  T
Q  414 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctattgtctgtttcagatc 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  918 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttcagatc 819  T
Q  514 atctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 613  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  818 atcttctctctttggttatcgtcgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa 719  T
Q  614 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  718 acatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 484 - 664
Target Start/End: Original strand, 5465 - 5645
Alignment:
Q  484 cgccgctaactctattgtctgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaata 583  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaata 5564  T
Q  584 ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 664  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5565 gcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgc 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 214 - 640
Target Start/End: Original strand, 717 - 1174
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  717 tatcaattgtgagcctcaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttaaaatcagataattgattaaatatttaattaactgatatgt 816  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcataca 407  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||      | ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  817 actcaatgagtgaatgtctagatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtaca 916  T
Q  408 ccgcaaactctc---------------------tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgc 486  Q
    |  |||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  917 cgacaaactctctcttctccccatctgaagagatcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataacggttgaggaagaaccaaatcagccgc 1016  T
Q  487 cgctaactc-tattgtctgtttcagatcatc---tcctctctttggttatcgttgttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaat 582  Q
    | ||||| | |  ||| |||||| |||||||    | ||||||   |||| |||| || |||||| | |||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  1017 cactaacccttggtgtgtgtttccgatcatcacaccttctcttgttttattgttgatgttgagagagctgccatgaaagttttatccagatatttctaat 1116  T
Q  583 accctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcat 640  Q
    || |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1117 actctaattgttaatatgcatgataagtcaaacatgtcgttgatccgatcataatcat 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Original strand, 13927 - 14117
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13927 tatcaatcgtgagccttaattgactagtgatcaaattaagtaataattctattagatttgtaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 14026  T
Q  314 actcaatgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaata 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14027 attcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaata 14117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 407
Target Start/End: Original strand, 5621 - 5821
Alignment:
Q  214 tatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgg 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5621 tatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatgactattagatttctaattcgataattaattaaatatttaattagttgatatgg 5720  T
Q  314 actca--atgagtggatgtccggatgacc------cggaataatgggaaatcctaatgcccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatatatcata 405  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||      | ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  5721 actcaatatgagtggatgttcggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaacggccattcaatataaaagaggctatggttcccaatacatcgta 5819  T
Q  406 ca 407  Q
    ||    
T  5820 ca 5821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 575 - 656
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6025
Alignment:
Q  575 ttcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 656  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5945 ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatattcatgttcaatgttttgttt 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 498
Target Start/End: Original strand, 5826 - 5889
Alignment:
Q  435 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagccgccgctaactctat 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||||    
T  5826 aagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaaccctat 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 558 - 662
Target Start/End: Original strand, 38434 - 38536
Alignment:
Q  558 aaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 657  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38434 aaagcttcatccaggtattcctaatacc-taattattaatattcttgataaa-caaacatgttgtagatccgatcataactatgttcaatgttttgtttg 38531  T
Q  658 cttcc 662  Q
    |||||    
T  38532 cttcc 38536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 38095 - 38182
Alignment:
Q  227 ccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta--ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggact 316  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| | | |||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  38095 ccttaattgaatagtgatcaaattaagtaacaaggttaatttagatttctattcgaataattaat----tatttaattaattgatatggact 38182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University