View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12952_low_28 (Length: 359)

Name: NF12952_low_28
Description: NF12952
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12952_low_28
NF12952_low_28
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (22-212)||(28382667-28382857)
chr2 (20-212)||(4453510-4453702)
chr2 (25-212)||(3377360-3377546)
chr2 (25-212)||(8688949-8689135)
chr2 (25-212)||(16486850-16487036)
chr2 (25-212)||(650767-650953)
chr2 (22-212)||(36712523-36712712)
chr2 (21-207)||(38579000-38579186)
chr2 (25-212)||(13111729-13111917)
chr2 (25-212)||(21865213-21865401)
chr2 (25-212)||(9886960-9887146)
chr2 (49-212)||(41322747-41322910)
chr2 (36-212)||(2546311-2546487)
chr2 (48-212)||(15521469-15521633)
chr2 (20-212)||(36999452-36999643)
chr2 (20-212)||(40024929-40025121)
chr2 (25-200)||(5039742-5039917)
chr2 (20-207)||(8815176-8815362)
chr2 (18-200)||(4038339-4038520)
chr2 (51-212)||(2266139-2266300)
chr2 (52-212)||(37356162-37356323)
chr2 (56-212)||(24402039-24402195)
chr2 (56-212)||(43507549-43507705)
chr2 (63-212)||(39167756-39167905)
chr2 (51-212)||(10839567-10839728)
chr2 (39-200)||(43135598-43135759)
chr2 (56-212)||(17263740-17263896)
chr2 (56-212)||(29514832-29514987)
chr2 (25-212)||(26911479-26911665)
chr2 (54-212)||(10393022-10393180)
chr2 (25-200)||(6760603-6760778)
chr2 (61-207)||(7400383-7400529)
chr2 (20-200)||(41796741-41796921)
chr2 (57-200)||(31616385-31616528)
chr2 (25-212)||(18212087-18212260)
chr2 (49-200)||(4385524-4385675)
chr2 (49-212)||(6232267-6232430)
chr2 (49-211)||(38880770-38880933)
chr2 (54-200)||(40869358-40869504)
chr2 (101-212)||(8070607-8070718)
chr2 (25-212)||(13527891-13528076)
chr2 (25-211)||(44275630-44275815)
chr2 (52-212)||(10727824-10727984)
chr2 (61-211)||(38842838-38842988)
chr2 (97-200)||(43285657-43285760)
chr2 (49-212)||(8339970-8340133)
chr2 (99-200)||(42132708-42132809)
chr2 (69-196)||(7213664-7213791)
chr2 (120-202)||(24019948-24020030)
chr2 (103-212)||(9053117-9053226)
chr2 (108-212)||(2047308-2047411)
chr2 (125-207)||(25071437-25071519)
chr2 (116-207)||(15250163-15250254)
chr2 (56-207)||(23356976-23357128)
chr2 (125-202)||(16669119-16669196)
chr2 (119-207)||(4055951-4056039)
chr2 (125-212)||(7823534-7823621)
chr2 (98-212)||(598931-599045)
chr2 (56-207)||(5520060-5520211)
chr2 (115-203)||(2221446-2221534)
chr2 (101-196)||(2758874-2758969)
chr2 (130-202)||(6222636-6222708)
chr2 (49-133)||(18710181-18710265)
chr2 (40-200)||(6153461-6153607)
chr2 (145-200)||(18710257-18710312)
chr2 (98-205)||(39675059-39675166)
chr2 (140-202)||(41877821-41877883)
chr2 (46-200)||(34884798-34884952)
chr2 (142-202)||(13761842-13761900)
chr2 (49-133)||(7569776-7569861)
chr2 (136-200)||(37674497-37674561)
chr2 (145-200)||(7569853-7569908)
chr2 (142-200)||(13351603-13351660)
chr2 (20-70)||(29514803-29514853)
chr2 (157-202)||(6807492-6807537)
chr2 (145-205)||(7511704-7511764)
chr2 (145-205)||(7515988-7516048)
chr2 (20-60)||(8702860-8702900)
chr2 (159-207)||(44525925-44525973)
chr2 (56-88)||(13761777-13761809)
chr2 (56-88)||(22375955-22375987)
chr2 (122-202)||(33850121-33850201)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (18-207)||(24793934-24794123)
chr5 (25-212)||(32382818-32383005)
chr5 (20-212)||(36685780-36685972)
chr5 (25-212)||(14647338-14647524)
chr5 (22-212)||(8023965-8024155)
chr5 (25-212)||(12774545-12774732)
chr5 (25-212)||(30299667-30299854)
chr5 (25-212)||(2236497-2236684)
chr5 (25-212)||(12713281-12713468)
chr5 (18-212)||(30412593-30412787)
chr5 (27-212)||(32381655-32381840)
chr5 (25-212)||(13228454-13228640)
chr5 (19-212)||(5591552-5591744)
chr5 (20-212)||(19525713-19525905)
chr5 (20-212)||(39744523-39744714)
chr5 (25-212)||(1711184-1711371)
chr5 (25-200)||(4221466-4221640)
chr5 (25-211)||(1174753-1174939)
chr5 (56-212)||(5997875-5998031)
chr5 (29-207)||(19956294-19956470)
chr5 (42-212)||(39275409-39275579)
chr5 (36-212)||(6603891-6604067)
chr5 (56-212)||(9160673-9160829)
chr5 (27-211)||(10697240-10697424)
chr5 (25-212)||(12363593-12363780)
chr5 (56-212)||(27130333-27130489)
chr5 (56-212)||(35235708-35235864)
chr5 (20-211)||(30774174-30774365)
chr5 (25-211)||(35236649-35236836)
chr5 (51-200)||(2671409-2671558)
chr5 (54-212)||(26699087-26699245)
chr5 (54-212)||(26968820-26968978)
chr5 (63-212)||(43402451-43402600)
chr5 (52-212)||(31168968-31169128)
chr5 (49-212)||(3037406-3037569)
chr5 (49-212)||(35639933-35640096)
chr5 (49-211)||(3670271-3670433)
chr5 (54-212)||(5381925-5382082)
chr5 (63-212)||(15530442-15530591)
chr5 (56-200)||(39246830-39246973)
chr5 (98-212)||(2178802-2178916)
chr5 (49-200)||(9587179-9587331)
chr5 (56-207)||(19347705-19347857)
chr5 (54-212)||(11062888-11063047)
chr5 (63-212)||(36027972-36028121)
chr5 (72-212)||(7651656-7651796)
chr5 (36-200)||(13156879-13157043)
chr5 (52-212)||(15443452-15443612)
chr5 (63-202)||(648538-648677)
chr5 (98-212)||(4379300-4379414)
chr5 (63-206)||(5521305-5521448)
chr5 (49-200)||(29392100-29392250)
chr5 (49-203)||(11663881-11664035)
chr5 (97-212)||(22977186-22977301)
chr5 (39-200)||(6893372-6893532)
chr5 (49-200)||(3669534-3669685)
chr5 (56-202)||(11100753-11100899)
chr5 (56-207)||(16474771-16474922)
chr5 (101-204)||(9627143-9627246)
chr5 (97-207)||(23920498-23920608)
chr5 (97-202)||(13936233-13936338)
chr5 (63-202)||(2497570-2497709)
chr5 (101-212)||(4875689-4875800)
chr5 (98-211)||(6280437-6280550)
chr5 (99-204)||(42323596-42323701)
chr5 (114-202)||(13921783-13921871)
chr5 (25-133)||(25872268-25872376)
chr5 (142-212)||(6349426-6349496)
chr5 (142-203)||(4657591-4657652)
chr5 (128-203)||(27005844-27005919)
chr5 (114-196)||(31407980-31408062)
chr5 (125-203)||(32321652-32321730)
chr5 (148-200)||(25872221-25872273)
chr5 (99-203)||(33694719-33694823)
chr5 (97-202)||(41471900-41472006)
chr5 (142-203)||(7896599-7896659)
chr5 (125-198)||(18480557-18480630)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (21-212)||(32541188-32541379)
chr8 (22-212)||(17115504-17115694)
chr8 (21-212)||(44827307-44827498)
chr8 (25-212)||(6338287-6338474)
chr8 (25-212)||(31478045-31478232)
chr8 (21-212)||(31581659-31581850)
chr8 (20-200)||(17081618-17081798)
chr8 (25-212)||(45141445-45141631)
chr8 (25-212)||(23676840-23677028)
chr8 (20-212)||(28716628-28716820)
chr8 (25-212)||(16422799-16422985)
chr8 (49-212)||(25023299-25023462)
chr8 (49-212)||(36681437-36681600)
chr8 (51-212)||(39702301-39702462)
chr8 (25-210)||(42142727-42142912)
chr8 (20-212)||(10618771-10618962)
chr8 (25-212)||(38171417-38171604)
chr8 (56-212)||(27781102-27781258)
chr8 (20-200)||(28709271-28709451)
chr8 (49-212)||(8270899-8271062)
chr8 (49-212)||(39871258-39871420)
chr8 (25-200)||(43276773-43276955)
chr8 (25-200)||(1893843-1894019)
chr8 (56-212)||(39320056-39320212)
chr8 (20-209)||(22877918-22878107)
chr8 (63-200)||(31688052-31688189)
chr8 (25-210)||(37560521-37560706)
chr8 (56-212)||(41693896-41694055)
chr8 (56-200)||(41313375-41313519)
chr8 (25-212)||(40223074-40223260)
chr8 (25-200)||(32099505-32099681)
chr8 (25-200)||(37587720-37587896)
chr8 (97-211)||(2642409-2642523)
chr8 (25-212)||(11298031-11298218)
chr8 (25-212)||(24652237-24652423)
chr8 (99-200)||(36112843-36112944)
chr8 (99-207)||(44157240-44157348)
chr8 (99-212)||(36590180-36590292)
chr8 (25-212)||(11741093-11741270)
chr8 (25-200)||(34395348-34395525)
chr8 (56-200)||(3427623-3427767)
chr8 (63-202)||(13969982-13970121)
chr8 (56-211)||(29189717-29189872)
chr8 (68-203)||(39746938-39747073)
chr8 (39-200)||(9210969-9211130)
chr8 (63-207)||(43849202-43849346)
chr8 (102-211)||(3511264-3511373)
chr8 (115-212)||(35243342-35243439)
chr8 (61-207)||(38780666-38780812)
chr8 (97-205)||(7378889-7378997)
chr8 (103-212)||(40551856-40551964)
chr8 (101-209)||(22957354-22957462)
chr8 (99-201)||(1363793-1363895)
chr8 (120-202)||(2855146-2855228)
chr8 (100-207)||(40045444-40045551)
chr8 (63-207)||(8436519-8436663)
chr8 (142-207)||(39677442-39677507)
chr8 (137-205)||(44263388-44263456)
chr8 (136-203)||(9370315-9370382)
chr8 (52-196)||(16831530-16831666)
chr8 (142-200)||(42203405-42203463)
chr8 (141-203)||(13888326-13888388)
chr8 (146-212)||(10651115-10651181)
chr8 (126-190)||(26293837-26293901)
chr8 (126-190)||(26307094-26307158)
chr8 (114-203)||(26036979-26037068)
chr8 (63-133)||(42203452-42203522)
chr8 (142-197)||(44318316-44318371)
chr8 (141-207)||(2773521-2773586)
chr8 (98-143)||(35151040-35151085)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (21-212)||(40563358-40563549)
chr3 (22-212)||(29081276-29081466)
chr3 (20-212)||(26540925-26541117)
chr3 (25-212)||(16127134-16127321)
chr3 (20-212)||(44845589-44845781)
chr3 (25-212)||(2579922-2580109)
chr3 (25-212)||(19948313-19948500)
chr3 (25-212)||(38185741-38185927)
chr3 (27-212)||(28676885-28677070)
chr3 (20-212)||(37528718-37528910)
chr3 (39-212)||(35499585-35499758)
chr3 (36-212)||(37088265-37088441)
chr3 (20-212)||(50499728-50499919)
chr3 (40-212)||(24536549-24536721)
chr3 (52-212)||(45345003-45345163)
chr3 (49-212)||(25570373-25570536)
chr3 (27-212)||(47897601-47897786)
chr3 (56-212)||(4240279-4240435)
chr3 (20-200)||(40480028-40480208)
chr3 (56-212)||(52794896-52795052)
chr3 (20-211)||(52857861-52858052)
chr3 (56-212)||(55305104-55305260)
chr3 (49-212)||(54672175-54672337)
chr3 (25-211)||(52166086-52166272)
chr3 (39-200)||(46247971-46248132)
chr3 (56-200)||(37713972-37714116)
chr3 (56-212)||(50317024-50317180)
chr3 (25-200)||(8872843-8873018)
chr3 (29-200)||(21707125-21707296)
chr3 (49-212)||(29718196-29718358)
chr3 (25-212)||(38891981-38892167)
chr3 (49-200)||(44748793-44748944)
chr3 (56-212)||(53779032-53779188)
chr3 (49-212)||(49853038-49853201)
chr3 (54-200)||(42217662-42217808)
chr3 (39-200)||(46318766-46318928)
chr3 (25-211)||(46972003-46972189)
chr3 (97-212)||(2121869-2121984)
chr3 (56-200)||(43525744-43525888)
chr3 (99-212)||(2851861-2851974)
chr3 (56-212)||(52225286-52225442)
chr3 (61-212)||(24628194-24628345)
chr3 (49-212)||(30864421-30864583)
chr3 (25-211)||(12063724-12063910)
chr3 (103-212)||(21603846-21603955)
chr3 (56-200)||(48942992-48943134)
chr3 (61-212)||(46627492-46627644)
chr3 (99-212)||(51709055-51709168)
chr3 (63-200)||(39876622-39876759)
chr3 (63-200)||(41246257-41246394)
chr3 (56-196)||(54541946-54542086)
chr3 (25-204)||(33391873-33392052)
chr3 (101-212)||(30548790-30548901)
chr3 (56-207)||(44947201-44947352)
chr3 (108-212)||(42497047-42497151)
chr3 (39-200)||(48378210-48378371)
chr3 (20-203)||(45368575-45368758)
chr3 (25-161)||(41785779-41785915)
chr3 (56-202)||(193398-193544)
chr3 (49-175)||(47173562-47173688)
chr3 (20-160)||(44545196-44545335)
chr3 (49-212)||(41518355-41518518)
chr3 (54-196)||(30814261-30814403)
chr3 (39-205)||(42465029-42465195)
chr3 (128-212)||(45693381-45693465)
chr3 (56-160)||(39469914-39470018)
chr3 (61-207)||(32026409-32026555)
chr3 (115-212)||(51003307-51003404)
chr3 (48-200)||(37489931-37490083)
chr3 (49-202)||(35100181-35100328)
chr3 (68-202)||(2598608-2598742)
chr3 (99-212)||(7041105-7041218)
chr3 (98-207)||(29203027-29203136)
chr3 (70-202)||(33897898-33898030)
chr3 (101-196)||(52595345-52595440)
chr3 (21-204)||(20450424-20450607)
chr3 (120-202)||(52868184-52868266)
chr3 (101-212)||(27446473-27446584)
chr3 (130-207)||(5506704-5506781)
chr3 (62-200)||(39719361-39719498)
chr3 (101-160)||(43740325-43740384)
chr3 (63-211)||(37713134-37713285)
chr3 (98-200)||(52931152-52931241)
chr3 (101-198)||(32982921-32983011)
chr3 (25-79)||(889683-889736)
chr3 (25-88)||(28394173-28394236)
chr3 (128-209)||(22257726-22257807)
chr3 (27-88)||(24536808-24536869)
chr3 (167-212)||(39470011-39470056)
chr3 (114-190)||(24350282-24350358)
chr3 (61-126)||(51950362-51950427)
chr3 (49-88)||(52363036-52363075)
chr3 (167-212)||(44545328-44545373)
chr3 (61-134)||(45693479-45693552)
chr3 (56-88)||(52788677-52788709)
chr3 (133-207)||(51980820-51980892)
chr3 (102-203)||(612099-612200)
chr3 (56-88)||(2187315-2187347)
chr3 (56-88)||(5505852-5505884)
chr3 (56-88)||(31558317-31558349)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (22-212)||(45906102-45906292)
chr4 (25-212)||(53407156-53407342)
chr4 (20-212)||(12233958-12234150)
chr4 (25-212)||(11600649-11600836)
chr4 (25-212)||(4517182-4517369)
chr4 (25-212)||(8829806-8829993)
chr4 (20-212)||(4392717-4392908)
chr4 (20-212)||(22038348-22038540)
chr4 (25-196)||(35777393-35777564)
chr4 (25-212)||(42116862-42117049)
chr4 (49-212)||(7706362-7706525)
chr4 (49-212)||(18582834-18582997)
chr4 (25-212)||(28307221-28307408)
chr4 (49-212)||(46895273-46895436)
chr4 (49-212)||(56372425-56372588)
chr4 (56-212)||(11151930-11152086)
chr4 (48-212)||(52669983-52670147)
chr4 (49-212)||(19513873-19514036)
chr4 (20-211)||(55764521-55764711)
chr4 (27-212)||(39087549-39087733)
chr4 (56-212)||(25440475-25440631)
chr4 (56-212)||(27397757-27397913)
chr4 (25-212)||(35822290-35822477)
chr4 (49-200)||(55495883-55496034)
chr4 (49-211)||(22892518-22892680)
chr4 (49-211)||(22944182-22944344)
chr4 (56-212)||(23867860-23868016)
chr4 (56-212)||(29413528-29413684)
chr4 (49-212)||(8941894-8942057)
chr4 (42-212)||(55856518-55856685)
chr4 (56-200)||(29663926-29664070)
chr4 (20-196)||(47417482-47417658)
chr4 (20-212)||(51011056-51011248)
chr4 (56-212)||(3009708-3009864)
chr4 (56-212)||(4939377-4939532)
chr4 (49-212)||(9043601-9043765)
chr4 (52-200)||(37115286-37115434)
chr4 (69-212)||(21369890-21370033)
chr4 (25-211)||(37970261-37970446)
chr4 (59-200)||(31678969-31679110)
chr4 (97-212)||(9031986-9032101)
chr4 (20-200)||(55828965-55829145)
chr4 (56-212)||(4355583-4355739)
chr4 (56-212)||(35468012-35468168)
chr4 (98-212)||(26826560-26826674)
chr4 (98-212)||(55358329-55358443)
chr4 (39-212)||(15635922-15636095)
chr4 (63-212)||(33114979-33115128)
chr4 (20-200)||(43225680-43225860)
chr4 (25-177)||(53273084-53273236)
chr4 (97-207)||(5465406-5465516)
chr4 (63-211)||(56270083-56270231)
chr4 (99-212)||(30366137-30366250)
chr4 (36-200)||(35580948-35581112)
chr4 (61-197)||(37831924-37832060)
chr4 (99-212)||(23162641-23162755)
chr4 (100-212)||(27185623-27185737)
chr4 (61-207)||(22430637-22430783)
chr4 (49-212)||(31338491-31338656)
chr4 (61-211)||(23113468-23113618)
chr4 (56-209)||(4391702-4391855)
chr4 (97-200)||(11050355-11050458)
chr4 (40-212)||(44442063-44442234)
chr4 (41-205)||(25235127-25235291)
chr4 (120-207)||(21633812-21633899)
chr4 (56-207)||(35190612-35190763)
chr4 (56-212)||(36008009-36008152)
chr4 (56-212)||(55684692-55684848)
chr4 (53-176)||(29656720-29656843)
chr4 (121-202)||(20148803-20148884)
chr4 (27-133)||(25199366-25199472)
chr4 (98-202)||(20511448-20511552)
chr4 (56-153)||(33005178-33005275)
chr4 (113-202)||(42085723-42085812)
chr4 (25-200)||(45780760-45780915)
chr4 (49-202)||(36196864-36197017)
chr4 (99-211)||(43078188-43078300)
chr4 (116-200)||(44525694-44525778)
chr4 (125-200)||(33005111-33005186)
chr4 (63-203)||(52707999-52708138)
chr4 (126-200)||(40497399-40497473)
chr4 (100-202)||(48056607-48056709)
chr4 (101-202)||(4465472-4465573)
chr4 (99-202)||(37047069-37047172)
chr4 (25-144)||(29656597-29656716)
chr4 (142-207)||(24954217-24954282)
chr4 (99-212)||(36486376-36486489)
chr4 (103-195)||(50502284-50502376)
chr4 (142-212)||(42124670-42124740)
chr4 (103-202)||(32101736-32101835)
chr4 (102-212)||(35842600-35842696)
chr4 (125-202)||(31435072-31435149)
chr4 (142-202)||(17715647-17715707)
chr4 (141-200)||(53224309-53224368)
chr4 (125-211)||(52713560-52713646)
chr4 (63-202)||(30562850-30562988)
chr4 (98-207)||(32948179-32948289)
chr4 (98-204)||(37337678-37337784)
chr4 (130-200)||(41864083-41864153)
chr4 (101-202)||(38048878-38048979)
chr4 (142-207)||(40119903-40119968)
chr4 (128-200)||(31953224-31953296)
chr4 (54-133)||(17715579-17715658)
chr4 (40-89)||(19169164-19169213)
chr4 (179-212)||(53274816-53274849)
chr4 (159-207)||(20530799-20530847)
chr4 (104-144)||(44525659-44525699)
chr4 (123-202)||(39068890-39068969)
chr4 (128-202)||(8716919-8716993)
chr4 (52-86)||(45520101-45520135)
chr4 (125-202)||(1031354-1031430)
chr4 (146-207)||(3932245-3932306)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (21-212)||(36246374-36246564)
chr7 (25-212)||(40637158-40637345)
chr7 (49-212)||(42587381-42587544)
chr7 (49-212)||(43254097-43254260)
chr7 (49-212)||(45686914-45687077)
chr7 (49-212)||(10312027-10312190)
chr7 (27-212)||(21374606-21374790)
chr7 (25-212)||(47470960-47471146)
chr7 (25-211)||(43134375-43134560)
chr7 (27-200)||(42375793-42375964)
chr7 (28-212)||(9487380-9487564)
chr7 (25-212)||(21741941-21742129)
chr7 (56-212)||(27089654-27089810)
chr7 (56-212)||(27188491-27188647)
chr7 (56-212)||(31511301-31511457)
chr7 (20-212)||(48313422-48313613)
chr7 (25-212)||(21254695-21254881)
chr7 (25-212)||(40258827-40259014)
chr7 (56-212)||(35587580-35587736)
chr7 (20-196)||(36436119-36436294)
chr7 (20-211)||(482981-483171)
chr7 (39-212)||(44743701-44743874)
chr7 (56-212)||(48832051-48832207)
chr7 (20-212)||(45222071-45222256)
chr7 (97-212)||(33026918-33027033)
chr7 (27-211)||(36407200-36407384)
chr7 (49-207)||(27655676-27655834)
chr7 (49-211)||(44596604-44596766)
chr7 (52-212)||(33203666-33203826)
chr7 (56-212)||(40106003-40106159)
chr7 (25-212)||(34709210-34709390)
chr7 (39-200)||(47587115-47587275)
chr7 (73-212)||(48590732-48590871)
chr7 (63-200)||(19832000-19832137)
chr7 (18-200)||(21313799-21313983)
chr7 (49-212)||(49148326-49148489)
chr7 (49-202)||(11466047-11466200)
chr7 (97-212)||(12345065-12345180)
chr7 (55-211)||(17844544-17844700)
chr7 (54-212)||(28425609-28425767)
chr7 (56-211)||(23029790-23029946)
chr7 (25-200)||(17192452-17192626)
chr7 (25-160)||(32168803-32168938)
chr7 (98-212)||(38531181-38531294)
chr7 (56-207)||(1342777-1342928)
chr7 (61-196)||(38481286-38481421)
chr7 (98-211)||(9485759-9485872)
chr7 (97-209)||(46879525-46879637)
chr7 (64-183)||(21316611-21316730)
chr7 (97-202)||(46757752-46757857)
chr7 (56-207)||(791336-791487)
chr7 (99-202)||(22642259-22642362)
chr7 (120-207)||(40893437-40893524)
chr7 (101-207)||(19757519-19757625)
chr7 (101-207)||(36612114-36612220)
chr7 (101-212)||(48620504-48620614)
chr7 (116-202)||(35000773-35000859)
chr7 (127-202)||(27869570-27869645)
chr7 (99-202)||(7884691-7884790)
chr7 (114-167)||(24170803-24170856)
chr7 (97-204)||(21740152-21740258)
chr7 (146-200)||(39698930-39698984)
chr7 (102-202)||(45672341-45672441)
chr7 (139-212)||(24170860-24170933)
chr7 (148-200)||(47584185-47584237)
chr7 (129-207)||(22621461-22621539)
chr7 (167-200)||(32168931-32168964)
chr7 (145-209)||(35669619-35669682)
chr7 (61-89)||(47584118-47584146)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (21-212)||(1917995-1918185)
chr1 (25-212)||(33524501-33524688)
chr1 (25-212)||(44909814-44910000)
chr1 (22-212)||(19898883-19899073)
chr1 (26-212)||(26204249-26204434)
chr1 (21-212)||(36301080-36301269)
chr1 (20-202)||(13121569-13121750)
chr1 (25-200)||(17046702-17046877)
chr1 (49-212)||(42064292-42064455)
chr1 (39-212)||(31150400-31150573)
chr1 (20-212)||(32368314-32368506)
chr1 (20-200)||(39826568-39826748)
chr1 (25-212)||(2497895-2498082)
chr1 (49-212)||(29586155-29586318)
chr1 (25-212)||(36838670-36838857)
chr1 (25-212)||(30774059-30774241)
chr1 (25-212)||(30721598-30721786)
chr1 (19-202)||(47134516-47134698)
chr1 (22-212)||(29704059-29704249)
chr1 (49-212)||(17499860-17500023)
chr1 (22-212)||(38676460-38676649)
chr1 (56-212)||(50351036-50351192)
chr1 (25-212)||(15313217-15313403)
chr1 (25-211)||(34319362-34319548)
chr1 (19-200)||(7710941-7711122)
chr1 (20-212)||(26843719-26843911)
chr1 (56-212)||(322869-323025)
chr1 (25-212)||(1507718-1507906)
chr1 (56-212)||(3270663-3270818)
chr1 (40-212)||(15348812-15348984)
chr1 (56-200)||(38967451-38967594)
chr1 (55-210)||(49220450-49220605)
chr1 (39-212)||(3660932-3661105)
chr1 (49-207)||(29374327-29374485)
chr1 (98-212)||(37703716-37703830)
chr1 (34-200)||(25601969-25602134)
chr1 (56-202)||(34086970-34087116)
chr1 (56-212)||(46369809-46369964)
chr1 (98-212)||(37672325-37672439)
chr1 (99-212)||(22098965-22099078)
chr1 (56-207)||(7781144-7781295)
chr1 (49-212)||(50171272-50171435)
chr1 (99-212)||(36043275-36043388)
chr1 (99-212)||(49185160-49185273)
chr1 (56-212)||(39583100-39583256)
chr1 (54-211)||(3391122-3391279)
chr1 (100-212)||(42614110-42614222)
chr1 (49-212)||(33561884-33562033)
chr1 (105-212)||(43727074-43727181)
chr1 (48-200)||(50540768-50540920)
chr1 (49-208)||(51422963-51423123)
chr1 (99-212)||(40887928-40888035)
chr1 (61-207)||(34318415-34318561)
chr1 (20-212)||(8221210-8221402)
chr1 (98-203)||(5697523-5697628)
chr1 (102-207)||(9769953-9770058)
chr1 (49-212)||(2479157-2479306)
chr1 (112-207)||(49822147-49822242)
chr1 (63-200)||(49240268-49240405)
chr1 (62-207)||(52703091-52703236)
chr1 (99-170)||(28429076-28429147)
chr1 (100-200)||(30495182-30495282)
chr1 (99-202)||(25134895-25134998)
chr1 (49-200)||(18347403-18347553)
chr1 (114-212)||(46928959-46929057)
chr1 (108-212)||(36379121-36379225)
chr1 (125-207)||(13570773-13570855)
chr1 (123-211)||(41004969-41005057)
chr1 (133-211)||(33151975-33152053)
chr1 (25-123)||(9169051-9169149)
chr1 (114-203)||(16085595-16085684)
chr1 (101-202)||(42963877-42963978)
chr1 (62-196)||(44718962-44719096)
chr1 (114-202)||(44956340-44956428)
chr1 (48-207)||(46087980-46088139)
chr1 (114-202)||(46056411-46056499)
chr1 (145-200)||(7024916-7024971)
chr1 (139-200)||(9169142-9169203)
chr1 (132-200)||(40719554-40719622)
chr1 (146-207)||(9894931-9894992)
chr1 (99-211)||(28868987-28869099)
chr1 (145-209)||(33632331-33632395)
chr1 (143-212)||(6814118-6814187)
chr1 (149-201)||(40935893-40935945)
chr1 (125-202)||(10628814-10628891)
chr1 (126-202)||(2028961-2029037)
chr1 (172-212)||(12891644-12891684)
chr1 (49-89)||(22099687-22099726)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (20-212)||(32731723-32731915)
chr6 (25-212)||(12297334-12297521)
chr6 (25-212)||(14227526-14227712)
chr6 (21-211)||(34232906-34233096)
chr6 (20-200)||(31100017-31100197)
chr6 (49-212)||(2442418-2442581)
chr6 (25-212)||(30811139-30811326)
chr6 (49-212)||(20804983-20805146)
chr6 (56-212)||(558360-558517)
chr6 (56-200)||(10856133-10856277)
chr6 (63-212)||(12432611-12432760)
chr6 (56-212)||(34685006-34685161)
chr6 (25-211)||(7317602-7317788)
chr6 (49-194)||(31451962-31452107)
chr6 (63-212)||(33540716-33540865)
chr6 (25-174)||(1806343-1806491)
chr6 (97-212)||(5681561-5681676)
chr6 (56-211)||(34439683-34439838)
chr6 (99-212)||(5943035-5943148)
chr6 (54-200)||(33453734-33453880)
chr6 (56-207)||(28076423-28076574)
chr6 (99-211)||(6709687-6709799)
chr6 (19-212)||(34903923-34904103)
chr6 (56-207)||(3108001-3108153)
chr6 (63-211)||(5301593-5301741)
chr6 (103-212)||(2970722-2970831)
chr6 (56-207)||(11015590-11015741)
chr6 (62-212)||(29823026-29823176)
chr6 (49-200)||(3636643-3636793)
chr6 (101-207)||(31049379-31049485)
chr6 (113-207)||(12140874-12140968)
chr6 (115-207)||(21894311-21894403)
chr6 (55-212)||(29414914-29415058)
chr6 (63-212)||(7292539-7292688)
chr6 (63-200)||(23648201-23648338)
chr6 (97-202)||(6104671-6104776)
chr6 (125-205)||(15591148-15591228)
chr6 (120-200)||(20563458-20563538)
chr6 (116-207)||(9896766-9896857)
chr6 (99-197)||(1225475-1225573)
chr6 (115-202)||(5893894-5893981)
chr6 (125-193)||(26561419-26561487)
chr6 (126-207)||(19415351-19415432)
chr6 (125-204)||(32563242-32563321)
chr6 (143-196)||(11443033-11443086)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (20-212)||(22559-22751)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (25-212)||(126750-126936)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (19-212)||(12707-12900)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (25-211)||(28-214)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (25-212)||(7027-7213)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (25-177)||(27159-27312)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (63-212)||(431265-431414)
scaffold0002 (101-203)||(119238-119340)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (99-212)||(63887-64000)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (18-212)||(28066-28269)
scaffold0197 (56-200)||(30179-30323)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (56-207)||(192013-192164)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (63-212)||(93376-93525)
scaffold0016 (125-202)||(84325-84402)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (97-200)||(53023-53126)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (98-200)||(5451-5552)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (18-88)||(36317-36387)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (49-212)||(41755-41898)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (120-207)||(72760-72847)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (126-200)||(4562-4636)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (120-202)||(9294-9376)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (126-207)||(10833-10914)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (21-167)||(8997-9143)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (146-207)||(1240-1301)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28382857 - 28382667
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  28382857 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 28382758  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382757 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28382667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4453702 - 4453510
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  4453702 aaggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 4453603  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4453602 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4453510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 3377360 - 3377546
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377360 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 3377458  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377459 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3377546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8689135 - 8688949
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689135 tctgtttggttaaccccaaaaag-agcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 8689037  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689036 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8688949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 16486850 - 16487036
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16486850 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 16486948  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16486949 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16487036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 650953 - 650767
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  650953 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttt-agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 650855  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650854 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 650767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36712712 - 36712523
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  36712712 ggctctgtttggttatccaaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 36712614  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36712613 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36712523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38579186 - 38579000
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  38579186 aggctctgtttggttaaccctaaaaaagaacttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 38579087  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38579086 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38579000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13111917 - 13111729
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgttt-ggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13111917 tctgtttgggaaaccccaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttggtaacactttttcacca 13111818  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111817 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 13111729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 21865213 - 21865401
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  21865213 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 21865312  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21865313 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21865401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 9886960 - 9887146
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9886960 tctgtttggttaacctaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 9887058  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9887059 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcataagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9887146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 41322747 - 41322910
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322747 agcttttagcttttatcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 41322846  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322847 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 41322910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2546487 - 2546311
Alignment:
Q  36 aaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 135  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2546487 aaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaaattttaaccatgagcttatagc 2546388  T
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2546387 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2546311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Original strand, 15521469 - 15521633
Alignment:
Q  48 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521469 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaaactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 15521568  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15521569 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 15521633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 36999452 - 36999643
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  36999452 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 36999550  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36999551 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 36999643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40025121 - 40024929
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||    
T  40025121 aagggtctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 40025022  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40025021 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgagcttatagcttatagcttctcac 40024929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 5039742 - 5039917
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5039742 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgt 5039841  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5039842 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5039917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 8815176 - 8815362
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  8815176 aagggtctatttggttaactcaaaaaag-agcctttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 8815274  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8815362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4038520 - 4038339
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttt 117  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       | |||||||||||||||||||    
T  4038520 caaagggtttgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttacaagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttt 4038422  T
Q  118 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4038421 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4038339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2266300 - 2266139
Alignment:
Q  51 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266300 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2266201  T
Q  151 ataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266200 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2266139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 37356162 - 37356323
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356162 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 37356261  T
Q  151 ataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356262 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37356323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24402195 - 24402039
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402195 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 24402096  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402095 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 24402039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43507705 - 43507549
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507705 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43507606  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507605 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43507549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 39167756 - 39167905
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167756 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39167855  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167856 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39167905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10839728 - 10839567
Alignment:
Q  51 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10839728 cttttagcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatcttatttcactagctt 10839629  T
Q  151 ataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10839628 ataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 10839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Original strand, 43135598 - 43135759
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43135598 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagctta 43135697  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43135698 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43135759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17263896 - 17263740
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17263896 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatgttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 17263797  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17263796 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 17263740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 29514832 - 29514987
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514832 agcttttagcttttagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccaagagcttatagcttatttcacgagcttataag 29514930  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29514987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 26911479 - 26911665
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26911479 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctctttggtaacactttttcaccat 26911577  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26911578 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 26911665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10393180 - 10393022
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10393180 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 10393081  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10393080 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagtttctcac 10393022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6760778 - 6760603
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6760778 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 6760679  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6760678 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6760603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7400529 - 7400383
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400529 ttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 7400430  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400429 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 7400383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41796921 - 41796741
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||       ||||||||| ||||||||||||     
T  41796921 aagggtctgtttggtaaaccaataaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgttttataaaaaaagctctgtttcgtaacactttttg 41796822  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41796821 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41796741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31616528 - 31616385
Alignment:
Q  57 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616528 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 31616429  T
Q  157 tatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31616428 tatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 31616385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 18212087 - 18212260
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212087 tctgtttggttaaccccaaaaaggagcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 18212186  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212187 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt--------------caagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 18212260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4385675 - 4385524
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4385675 agcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagc 4385576  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4385575 ttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 4385524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6232430 - 6232267
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6232430 agcttttagctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaatattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagc 6232331  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6232330 ttataagctatttttcagaagatatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcac 6232267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38880933 - 38880770
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38880933 agcttttaactcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgag 38880834  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38880833 tttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 38880770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40869504 - 40869358
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40869504 ttagcttatagcttatagtttataagctcatttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 40869405  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40869404 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40869358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8070718 - 8070607
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  8070718 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagttt 8070619  T
Q  201 atagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||    
T  8070618 atagcttctcac 8070607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13528076 - 13527891
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13528076 tctgtttggttaaccaaaaaaa--agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttcggtaacaccttttcaccat 13527979  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13527978 gagtttataacttatttcacaagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtaacgtttgaacttatagcttataacttctcac 13527891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 44275630 - 44275815
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |          | |||||||||||||||||| ||||     
T  44275630 tctgtttggtaaacctaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaat-tatgtttggtaacactttttgaccac 44275728  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275729 gagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagttattccaattagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 44275815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 10727824 - 10727984
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||       | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10727824 ttttaacttttagcttatagcttattagcccgtttgataaaaaaagttctgtttgataacactttttcatcataagcttatagcttatttcacgaactta 10727923  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10727924 taagctatttttcaaaaactattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 10727984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 38842838 - 38842988
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38842838 ttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataaactatt 38842937  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38842938 tttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttataacttctca 38842988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 43285657 - 43285760
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43285657 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 43285756  T
Q  197 gctt 200  Q
    ||||    
T  43285757 gctt 43285760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 8339970 - 8340133
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||      
T  8339970 agcttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacgaaaaaagttctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagtttattttacgaat 8340069  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8340070 ttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttaaagcttatagcttctcac 8340133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 42132708 - 42132809
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42132708 tctgtttggtaacaccttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagc 42132807  T
Q  199 tt 200  Q
    ||    
T  42132808 tt 42132809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7213791 - 7213664
Alignment:
Q  69 tagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7213791 tagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataatactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 7213692  T
Q  169 gctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7213691 gctattccaagtagcgtttgtgcttata 7213664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 24019948 - 24020030
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24019948 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24020030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9053226 - 9053117
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9053226 tttggtaacacttattcaccatgaactaatagtttatttcacgagcttataaactattcttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttac 9053127  T
Q  203 agcttctcac 212  Q
    ||||||||||    
T  9053126 agcttctcac 9053117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2047411 - 2047308
Alignment:
Q  108 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2047411 taacactttttcac-atgagtttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagttattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2047313  T
Q  208 ctcac 212  Q
    |||||    
T  2047312 ctcac 2047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 25071437 - 25071519
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25071437 gagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 25071519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 207
Target Start/End: Original strand, 15250163 - 15250254
Alignment:
Q  116 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15250163 tttcaccacgagcttatagcttatttctcgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 15250254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23357128 - 23356976
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatag-cttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||| ||||||||||  || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23357128 agcttatagcttataggcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttatat 23357029  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23357028 gctatttttcagaagctatttcaagtagcgtctgagcttatagcttttagctt 23356976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 16669119 - 16669196
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16669119 gagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16669196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 207
Target Start/End: Original strand, 4055951 - 4056039
Alignment:
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4055951 caccacgagcttatagcttatttcacgagcttattagctatttttcagacactattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagctt 4056039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7823621 - 7823534
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7823621 gagcttgtagcttatttcacgagcttataagctattttttataagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcatctcac 7823534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 598931 - 599045
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||| |||||||| |||||| || | ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  598931 ctctgcttggtaacgcttttttacaacgagtttatagtttatttcaaaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatag 599030  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
     ||||||| ||||||    
T  599031 tttatagcgtctcac 599045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5520211 - 5520060
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  5520211 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgtaaaaaaaaactctgtttagtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagtttataag 5520112  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5520111 ctatttttcagatgctattacaaatagcgtttgagcttatagcatatagctt 5520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 203
Target Start/End: Original strand, 2221446 - 2221534
Alignment:
Q  115 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2221446 ttttcaccatgagtttatagtttatttcacgagcttctaagctatttttcagacgctattccaagtaacgtttgaacttataacttata 2221534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 2758874 - 2758969
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2758874 tgtttggtgacagttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctattttttagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 2758969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6222708 - 6222636
Alignment:
Q  130 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||    
T  6222708 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagcagcatttgaacttatagcttat 6222636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Original strand, 18710181 - 18710265
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18710181 agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 18710265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6153607 - 6153461
Alignment:
Q  40 ccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 139  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6153607 ccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagttttgtttggtaaaacttttttaccatgagcttatagcttat 6153509  T
Q  140 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
                 ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6153508 -------------aagctatttttcagaagttattccaagtagtgtttgagcttatagctt 6153461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 18710257 - 18710312
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18710257 gagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 18710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Original strand, 39675059 - 39675166
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||     
T  39675059 ctctatttggtaaaacttttttacaatgaacttataacttatttcaagagtttataagatatttttcaaaagctgcttcaagtagcgtttgagcttataa 39675158  T
Q  198 cttatagc 205  Q
    ||||||||    
T  39675159 cttatagc 39675166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Original strand, 41877821 - 41877883
Alignment:
Q  140 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  41877821 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 41877883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Original strand, 34884798 - 34884952
Alignment:
Q  46 agtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 145  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||         ||||||||| |||   |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  34884798 agtagcttatagcttatagctgatagattataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttgataaaggttttccaccacgagtttatagtttatttcacg 34884897  T
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  34884898 agcttatagcctatttttcagactctattccaagtagtgtttcagcttatagctt 34884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 13761842 - 13761900
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13761842 cacgagcttataagctatttttcagaagtta--ccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13761900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Original strand, 7569776 - 7569861
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 133  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7569776 agcttttaactctcagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 7569861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 200
Target Start/End: Original strand, 37674497 - 37674561
Alignment:
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37674497 ttatttcacgagcttgtaaactatattttagacgctattccaagtagcgtttgagtttatagctt 37674561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 7569853 - 7569908
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  7569853 gagcttataagctatttttcagaagttattttaagtaacgtttgagcttatagctt 7569908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13351660 - 13351603
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13351660 cacgagtttataa-ctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 13351603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Original strand, 29514803 - 29514853
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttata 70  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29514803 aagggtctatttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttata 29514853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Original strand, 6807492 - 6807537
Alignment:
Q  157 tatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6807492 tatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6807537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7511764 - 7511704
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7511764 gagcttataagctatttttcaaaagctacttagagtagcatttgagcttatagcttatagc 7511704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7516048 - 7515988
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7516048 gagcttataagctatttttcaaaagctacttagagtagcatttgagcttatagcttatagc 7515988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8702900 - 8702860
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagctt 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8702900 aaggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagctt 8702860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44525973 - 44525925
Alignment:
Q  159 tttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44525973 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 44525925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 13761777 - 13761809
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13761777 agcttatagcttatagcttataagctcgtttga 13761809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 22375955 - 22375987
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22375955 agcttatagcttatagcttataagctcgtttga 22375987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33850201 - 33850121
Alignment:
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||   |||| | || | |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33850201 catgagcttatagcgtatttcactagtttatagcttattctccatacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttat 33850121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 24793934 - 24794123
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  24793934 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 24794033  T
Q  118 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794034 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24794123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 32382818 - 32383005
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32382818 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 32382917  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32382918 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32383005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 36685780 - 36685972
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  36685780 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 36685879  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685880 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36685972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14647524 - 14647338
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647524 tctgtttggttaacctaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 14647426  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647425 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 14647338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8024155 - 8023965
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  8024155 ggctctgtttggttatcccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 8024056  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8024055 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8023965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 12774545 - 12774732
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774545 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12774644  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12774645 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttctcac 12774732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 30299667 - 30299854
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299667 tctgtttagttaacccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 30299766  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299767 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30299854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2236684 - 2236497
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  2236684 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 2236585  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2236584 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2236497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 12713281 - 12713468
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713281 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12713380  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12713381 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatatcttctcac 12713468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30412787 - 30412593
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttt 117  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  30412787 caaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 30412688  T
Q  118 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30412687 tcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttctcac 30412593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32381840 - 32381655
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32381840 tgtttggttgaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatga 32381741  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32381740 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32381655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13228640 - 13228454
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13228640 tctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccat 13228542  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13228541 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 13228454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 5591552 - 5591744
Alignment:
Q  19 aaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||    
T  5591552 aaagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt 5591650  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591651 caccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5591744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 19525713 - 19525905
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||        ||||||||||||||||| |||||    
T  19525713 aagggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttaccttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttc 19525812  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525813 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19525905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39744714 - 39744523
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| ||||||    
T  39744714 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttgtaacattttttc 39744616  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39744615 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39744523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1711371 - 1711184
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711371 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 1711272  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711271 gagcttataacttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1711184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4221640 - 4221466
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4221640 tctgtttggttaactcaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 4221542  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4221541 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4221466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 1174753 - 1174939
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  1174753 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccat 1174852  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174853 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 1174939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5998031 - 5997875
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5998031 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 5997932  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5997875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19956470 - 19956294
Alignment:
Q  29 tttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 128  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956470 tttggttaacctaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 19956372  T
Q  129 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956371 ttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19956294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 39275409 - 39275579
Alignment:
Q  42 aaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 141  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39275409 aaaaaatagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttattt 39275508  T
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39275509 cacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39275579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6604067 - 6603891
Alignment:
Q  36 aaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 135  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6604067 aaccccaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccgtgagcttatagc 6603968  T
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603967 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 6603891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9160829 - 9160673
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160829 agcttttagcttttaacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 9160730  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160729 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9160673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 10697240 - 10697424
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10697240 tgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcatttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatga 10697339  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10697340 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctca 10697424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12363780 - 12363593
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||    
T  12363780 tctgtttggttaatccagaaaag-agcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 12363682  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12363681 tgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12363593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 27130333 - 27130489
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130333 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27130432  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27130489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35235864 - 35235708
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235864 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35235765  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235764 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35235708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30774365 - 30774174
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||     
T  30774365 aagggtctctttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttg 30774266  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30774265 accataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttttagcttctca 30774174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35236836 - 35236649
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35236836 tctgtttggtaaaccaaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcataaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgacca 35236737  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35236736 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 35236649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Original strand, 2671409 - 2671558
Alignment:
Q  51 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2671409 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagctt 2671508  T
Q  151 ataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2671509 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2671558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26699245 - 26699087
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26699245 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26699146  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699145 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 26699087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26968978 - 26968820
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26968978 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26968879  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26968878 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 26968820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 43402451 - 43402600
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402451 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43402550  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402551 tcaaaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43402600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31169128 - 31168968
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31169128 ttttagcttttagtttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 31169029  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31169028 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31168968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3037569 - 3037406
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||       | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3037569 agcttttagcttttaacttatagcttataagcttgtttgataaaaaaaggtatgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagc 3037470  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037469 ttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3037406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 35639933 - 35640096
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35639933 agcttttagtttttaacttataatttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagc 35640032  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35640033 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35640096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 3670271 - 3670433
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3670271 agcttttagctcttagcttatagcttatgagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgcgcttatagcttatttcacgagc 3670370  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670371 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 3670433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5382082 - 5381925
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5382082 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttataacttatttcatgagcttata 5381984  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5381983 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5381925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 15530442 - 15530591
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15530442 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 15530541  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530542 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15530591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39246973 - 39246830
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246973 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39246875  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39246874 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39246830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 2178802 - 2178916
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2178802 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 2178901  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  2178902 cttatagcttctcac 2178916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9587331 - 9587179
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587331 agcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 9587232  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9587231 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9587179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 19347705 - 19347857
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347705 agcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 19347804  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347805 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19347857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11063047 - 11062888
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11063047 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttggcaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcatgagcttat 11062948  T
Q  153 aagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11062947 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 11062888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36028121 - 36027972
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36028121 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttt 36028022  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36028021 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 36027972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 7651656 - 7651796
Alignment:
Q  72 cttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagct 171  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7651656 cttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagct 7651755  T
Q  172 attccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651756 atttcaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 7651796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13157043 - 13156879
Alignment:
Q  36 aaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 135  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||        |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13157043 aaccccaaaaaagagcttttagcttttaccttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccattaacttatagc 13156944  T
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13156943 ttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 13156879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 15443452 - 15443612
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443452 ttttaacttttagtttatagcttataagttcgtttgacaagtttagttttggttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 15443551  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443552 taaactatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15443612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 648538 - 648677
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648538 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 648637  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  648638 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 648677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 4379300 - 4379414
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  4379300 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataa 4379399  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    ||||||| |||||||    
T  4379400 cttatagtttctcac 4379414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Original strand, 5521305 - 5521448
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521305 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5521404  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagct 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5521405 tcagaagctattctaagtagcgtttgagtttatagcttatagct 5521448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29392250 - 29392100
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29392250 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagc 29392152  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29392151 ttataagctattttttaaaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 29392100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11664035 - 11663881
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11664035 agcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagtttatagcttatttcacgagc 11663936  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11663935 ttataagttatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttata 11663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22977301 - 22977186
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22977301 gctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttata 22977202  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  22977201 gcttatagcttctcac 22977186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6893532 - 6893372
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6893532 cccaaaaaagagctgttagctcttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagctta 6893434  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6893433 tttcacgagcttataaactagttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6893372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Original strand, 3669534 - 3669685
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  3669534 agcttttagctcttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccataaacttgtagcttatttcatgagc 3669633  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3669634 ttataagctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 3669685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11100899 - 11100753
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11100899 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgtctttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11100800  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11100799 ctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11100753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 16474771 - 16474922
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||   | | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16474771 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaatggtctcttaccacgagcttatagtttatttcacgagattataag 16474870  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16474871 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 16474922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9627246 - 9627143
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    
T  9627246 tgtttgataacacttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataactt 9627147  T
Q  201 atag 204  Q
    ||||    
T  9627146 atag 9627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 23920498 - 23920608
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  23920498 gctctgtttggtaactatctttcaccaggagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgaacttaga 23920597  T
Q  197 gcttatagctt 207  Q
    | |||||||||    
T  23920598 gtttatagctt 23920608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 13936233 - 13936338
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  13936233 gctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttata 13936332  T
Q  197 gcttat 202  Q
    ||||||    
T  13936333 gcttat 13936338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 2497570 - 2497709
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||| | |        ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2497570 agcttatagcttataagctcgtctaacaaaaaatgctctatttggtaatgctttttcaccatgagattataacttatttcacgagcttataagttatttt 2497669  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  2497670 tcaaaagctattctaaatagcgtttgagcttataacttat 2497709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 4875689 - 4875800
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4875689 tgtttggtaacatttttttactacgagtttatagtttattttaggagtttataagctattttttaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 4875788  T
Q  201 atagcttctcac 212  Q
    ||||||| ||||    
T  4875789 atagcttttcac 4875800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6280550 - 6280437
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||||||||    
T  6280550 ctctgtttgatgacgctttttcatcatgagcttatagtttatttcacgggtttataaactatttttcataagttatttcaagtagcatttaagcttatag 6280451  T
Q  198 cttatagcttctca 211  Q
    |||||| |||||||    
T  6280450 cttataacttctca 6280437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42323701 - 42323596
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||   |||| |||||| | |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  42323701 tctgtttggtaatgtttttgcaccataaccttataacatattttacgagtttataagctatttttcagacgctattctaagtagtgtttgagcttatagc 42323602  T
Q  199 ttatag 204  Q
    ||||||    
T  42323601 ttatag 42323596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Original strand, 13921783 - 13921871
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  13921783 ttttttaccacgaacttataacttatttcacgagcttaaaagctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgaacttataacttat 13921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25872376 - 25872268
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25872376 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcgtagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 25872277  T
Q  125 gagcttata 133  Q
    || ||||||    
T  25872276 gaacttata 25872268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Original strand, 6349426 - 6349496
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6349426 cacgagcttataaactatttttcagacgctattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttatcac 6349496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4657652 - 4657591
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4657652 cacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagagtttgagcttatagcttata 4657591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27005919 - 27005844
Alignment:
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  27005919 cttatagcttatttcaagagcttataacttattttccaaacgctatttcaagtaacgtttgagcttatagcttata 27005844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 31407980 - 31408062
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| || |||||    
T  31407980 tttttcagcacgagttaataacttatttcacgagcttataagctatttgtcagacgctattccaattagcgtttaagattata 31408062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32321730 - 32321652
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  32321730 gagcttatagcttatttcacgaacttacaacttatttttcagactctatttcaaataacgtttgagcttatagcttata 32321652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25872273 - 25872221
Alignment:
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25872273 cttataatttatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagctt 25872221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 33694719 - 33694823
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||| || || ||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  33694719 tctgtttgggaatagttttttaccacgagcttataatttattttacaagtttataagttatttttcagacgttattcgaagtagcgtttgagtctgtagc 33694818  T
Q  199 ttata 203  Q
    |||||    
T  33694819 ttata 33694823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41472006 - 41471900
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacact-ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttat 195  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  | ||| |||||||||||| |||||| ||   |||||| |||| |||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  41472006 gctctgtttggtaacagtcttttcacaacaaacttgtagcttatttcaggagcttttagcttattttccagacgctatttcaaatagtgtttgagcttat 41471907  T
Q  196 agcttat 202  Q
    |||||||    
T  41471906 agcttat 41471900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Original strand, 7896599 - 7896659
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  7896599 cacgagcttataagcta-ttttcaaacgctatttcaaatagcgtttgagtttatagcttata 7896659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18480630 - 18480557
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  18480630 gagcttatatcttatttcacaagcttatagtttattttttagacgctatctcaagtagcatttgagcttatagc 18480557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 32541188 - 32541379
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  32541188 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 32541287  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32541288 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32541379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 17115504 - 17115694
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  17115504 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 17115603  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17115604 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 17115694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44827498 - 44827307
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  44827498 aggctctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 44827399  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44827398 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44827307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 6338287 - 6338474
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6338287 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccat 6338386  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338387 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 6338474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 31478045 - 31478232
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478045 tctgtttggttaaccccaaaagagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 31478144  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478145 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31478232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 31581659 - 31581850
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  31581659 aggctctgtttggttatccaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 31581758  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581759 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31581850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 17081618 - 17081798
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  17081618 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 17081717  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17081718 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17081798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45141631 - 45141445
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141631 tctgtttggttaatccaaaaaag-agtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 45141533  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141532 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 23676840 - 23677028
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| |||||||||||||||||||||    
T  23676840 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctctttggtaacactttttcacca 23676939  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676940 tgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 23677028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 28716628 - 28716820
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  28716628 aagggtctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 28716727  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28716728 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28716820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 16422799 - 16422985
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16422799 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcctataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttagtaacactttttcatcat 16422897  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422898 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16422985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 25023299 - 25023462
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25023299 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 25023398  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25023399 ttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25023462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36681600 - 36681437
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681600 agcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 36681501  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681500 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36681437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 39702301 - 39702462
Alignment:
Q  51 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702301 cttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacataaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 39702400  T
Q  151 ataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702401 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39702462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42142912 - 42142727
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  42142912 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 42142813  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42142812 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagcttatagcttctc 42142727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 10618771 - 10618962
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||||||||||    
T  10618771 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttc 10618869  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618870 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 10618962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38171604 - 38171417
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38171604 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttgttcaccat 38171505  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171504 gagcttatagcttatttcacgagcttataagttgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 38171417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 27781102 - 27781258
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781102 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27781201  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781202 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27781258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 28709271 - 28709451
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  28709271 aagggtctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 28709370  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28709371 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28709451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 8270899 - 8271062
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8270899 agcttttagtttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagc 8270998  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8270999 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8271062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 39871258 - 39871420
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871258 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 39871356  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871357 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcac 39871420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43276955 - 43276773
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagct-------tataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  43276955 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttt 43276856  T
Q  118 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43276855 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 43276773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1894019 - 1893843
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||    
T  1894019 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 1893920  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1893919 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 1893843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39320212 - 39320056
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39320212 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39320113  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39320112 ctatttttcagaagctattccaagtagcgttcgagcttataacttatagcttctcac 39320056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22878107 - 22877918
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  22878107 aagggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 22878008  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22878007 accatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctcagtagcgtttgagcttatagcttatagtttct 22877918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31688189 - 31688052
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688189 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31688090  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31688089 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31688052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37560706 - 37560521
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| | |||    
T  37560706 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgatcat 37560607  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560606 gaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 37560521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41694055 - 41693896
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn---gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694055 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaatttttagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 41693956  T
Q  153 aagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41693955 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcac 41693896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Original strand, 41313375 - 41313519
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41313375 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 41313474  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41313475 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 41313519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40223260 - 40223074
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactttttcacc 122  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||  ||||    
T  40223260 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacacttt--cacc 40223163  T
Q  123 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223162 atgagcttatagcttatttcacgagcttataa-ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40223074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 32099505 - 32099681
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32099505 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctctgtttgataacactttttcacca 32099604  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32099605 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32099681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37587896 - 37587720
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||| |  ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||    
T  37587896 tctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 37587797  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37587796 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttttagctt 37587720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2642523 - 2642409
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2642523 gctctgtttggtaatattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2642424  T
Q  197 gcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||    
T  2642423 gcttatagcttctca 2642409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11298218 - 11298031
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11298218 tctgtttggtaacacccaaaaaagaggttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttcatcat 11298119  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298118 cagcttatagcttatttcacgagcttataagatatttttcagaagctattccaaataacgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11298031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 24652237 - 24652423
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24652237 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttacctcttatcttatagcttataagctcgtttgacaaagaaagttctgtttggtaacactttt-caccat 24652335  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24652336 gagcttatagcttatttcacgagcttataagccattttttagaagctatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcac 24652423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36112944 - 36112843
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36112944 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 36112845  T
Q  199 tt 200  Q
    ||    
T  36112844 tt 36112843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Original strand, 44157240 - 44157348
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44157240 tctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 44157339  T
Q  199 ttatagctt 207  Q
    |||||||||    
T  44157340 ttatagctt 44157348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 36590180 - 36590292
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36590180 tctgtttggtaacacttttttaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagctt-tagc 36590278  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  36590279 ttatagcttctcac 36590292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11741270 - 11741093
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |          ||| ||||||| |||||    
T  11741270 tctgtttggttaatctcaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaag----------taatacttttttaccat 11741181  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741180 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaatctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11741093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34395525 - 34395348
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395525 tctgtttggtaaaccttaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacactttttgacca 34395426  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctat-ttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  34395425 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttcagaagctattcaaagtagcgtttgaacttatagctt 34395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3427767 - 3427623
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427767 agcttatagcttataggttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataag 3427668  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3427667 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3427623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 13969982 - 13970121
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13969982 agcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 13970081  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13970082 tcagacgctattcgaagtagcgtttgagcttatagcttat 13970121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29189872 - 29189717
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29189872 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgataagaaaagctctgtttagtaacggttttttactacgagcttatagcttatttcacgagcttatatg 29189773  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29189772 ttatttttaagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctca 29189717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39747073 - 39746938
Alignment:
Q  68 atagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 167  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39747073 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcaga 39746974  T
Q  168 agctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39746973 tgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 39746938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Original strand, 9210969 - 9211130
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||        |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9210969 cccaaaaaagagcttttaattcttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctccgtttgataacactttttgaccatgagcttataactta 9211068  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9211069 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctatcccaagtagcgtttgagcttatagctt 9211130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43849346 - 43849202
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43849346 agcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttt 43849247  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849246 tcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 43849202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Original strand, 3511264 - 3511373
Alignment:
Q  102 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  3511264 gtttggtaatgctttttagccatgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctta 3511363  T
Q  202 tagcttctca 211  Q
    ||||||||||    
T  3511364 tagcttctca 3511373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35243439 - 35243342
Alignment:
Q  115 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35243439 ttttcaccacgagcttatatcttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35243342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 38780666 - 38780812
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38780666 ttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgacaatgatttttcaccacgaacttataacttattttacgagcttataaactatt 38780765  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780766 tttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38780812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 205
Target Start/End: Original strand, 7378889 - 7378997
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  7378889 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagtgtttgagcttata 7378988  T
Q  197 gcttatagc 205  Q
    |||||||||    
T  7378989 gcttatagc 7378997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 40551856 - 40551964
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40551856 tttggtaacattttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttat-agctatttttcagaagctatttcagatagcgtttgagcttatagtttat 40551954  T
Q  203 agcttctcac 212  Q
    | || |||||    
T  40551955 aactcctcac 40551964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 22957354 - 22957462
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  22957354 tgtttcgtaacatttttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagtttatagttt 22957453  T
Q  201 atagcttct 209  Q
    |||||||||    
T  22957454 atagcttct 22957462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1363895 - 1363793
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  1363895 tctgtttggtaatatttttttaccatgagcttataacttatttcacgagtttataagctattattcagacgctattctaagtagcgtttgaacttatagc 1363796  T
Q  199 tta 201  Q
    |||    
T  1363795 tta 1363793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 2855146 - 2855228
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2855146 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 2855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Original strand, 40045444 - 40045551
Alignment:
Q  100 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagct-atttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40045444 ctgtttggtaactgtttttcatcaagagcttatagctttttt-actagcttataagcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagc 40045542  T
Q  199 ttatagctt 207  Q
    |||||||||    
T  40045543 ttatagctt 40045551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8436663 - 8436519
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  8436663 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagttatttt 8436564  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  8436563 tcagatgctattacaaatatcgtttgaacttatagcttatagctt 8436519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 39677442 - 39677507
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39677442 cacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 39677507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 44263388 - 44263456
Alignment:
Q  137 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44263388 tatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 44263456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9370382 - 9370315
Alignment:
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9370382 ttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 9370315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 16831530 - 16831666
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||        | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||    
T  16831530 ttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttcagtttggtaacactttttcaccatgagcttatagct--------gagttta 16831621  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  16831622 taagctatttttcataagctattttaagtagcgtttgagcttata 16831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42203463 - 42203405
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42203463 cacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 42203405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 203
Target Start/End: Original strand, 13888326 - 13888388
Alignment:
Q  141 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13888326 tcacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcgtttaagcttatagcttata 13888388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Original strand, 10651115 - 10651181
Alignment:
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10651115 agcttataagctattttttagaagcaattttaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 10651181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 26293837 - 26293901
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgag 190  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26293837 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26293901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 26307094 - 26307158
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgag 190  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26307094 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26307158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26037068 - 26036979
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  26037068 ttttttaccacgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcagatgttattccaagttgcgtttgagtttatagcctata 26036979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42203522 - 42203452
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42203522 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttata 42203452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Original strand, 44318316 - 44318371
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||    
T  44318316 cacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcatttgagcttatag 44318371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2773586 - 2773521
Alignment:
Q  141 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  2773586 tcacgagcttataa-ctttttttgagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagctt 2773521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Original strand, 35151040 - 35151085
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttca 143  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35151040 ctctgtttggtaatattttttcaccacgagcttataacttatttca 35151085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40563549 - 40563358
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  40563549 aggctctgtttggttatccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 40563450  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40563449 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40563358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29081466 - 29081276
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  29081466 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 29081367  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081366 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29081276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 26540925 - 26541117
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  26540925 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 26541024  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26541025 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctcac 26541117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16127321 - 16127134
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127321 tctgattggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 16127222  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127221 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16127134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 44845589 - 44845781
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  44845589 aagggtctgtttggttaacctcaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 44845688  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845689 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44845781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2580109 - 2579922
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580109 tctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 2580010  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580009 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19948500 - 19948313
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19948500 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccat 19948401  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948400 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19948313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 38185741 - 38185927
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38185741 tctgtttggttaacctaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 38185839  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38185840 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctcac 38185927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28677070 - 28676885
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28677070 tgtttgggaaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 28676971  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28676970 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28676885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37528910 - 37528718
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  37528910 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 37528811  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37528810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 35499585 - 35499758
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35499585 cccaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 35499684  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35499685 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35499758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 37088265 - 37088441
Alignment:
Q  36 aaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 135  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37088265 aacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagc 37088364  T
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37088365 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37088441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 50499728 - 50499919
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       | | |||||||||||||||||||    
T  50499728 aagggtctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttc 50499826  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50499827 accataagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 50499919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24536721 - 24536549
Alignment:
Q  40 ccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 139  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536721 ccaaaaaagagcttttagctcttagcttagagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 24536622  T
Q  140 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536621 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 24536549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45345163 - 45345003
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45345163 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 45345064  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45345063 taagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45345003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 25570373 - 25570536
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25570373 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagc 25570472  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25570473 ttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25570536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47897786 - 47897601
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47897786 tgtttggttaaccgcaaaaaagagcttttaccttttagtttatagcttataaactcatttgacaaaaaaagctctgtttagtaacactttttcaccatga 47897687  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47897686 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 47897601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 4240279 - 4240435
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4240279 agcttttagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4240378  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4240379 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 4240435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40480208 - 40480028
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||    
T  40480208 aaggctctgtttggtacacctcaaaaatgagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 40480109  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40480108 accatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40480028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 52794896 - 52795052
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794896 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 52794995  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794996 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52795052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 52857861 - 52858052
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||     
T  52857861 aagggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataagctcgttttacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttg 52857960  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52857961 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctca 52858052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55305260 - 55305104
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305260 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 55305161  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305160 ctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 55305104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54672337 - 54672175
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54672337 agcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttga-gaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 54672239  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54672238 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataccttatagcttctcac 54672175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52166272 - 52166086
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||| |||||    
T  52166272 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatctctgtttggcaacactttttgaccat 52166173  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52166172 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctca 52166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46248132 - 46247971
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46248132 cccaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 46248033  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  46248032 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 46247971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37714116 - 37713972
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37714116 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 37714017  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37714016 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37713972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50317180 - 50317024
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||       | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50317180 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50317081  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50317080 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 50317024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 8872843 - 8873018
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8872843 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatactttttcaccat 8872942  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8872943 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 8873018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Original strand, 21707125 - 21707296
Alignment:
Q  29 tttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 128  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21707125 tttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaga 21707224  T
Q  129 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21707225 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 21707296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29718358 - 29718196
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29718358 agcttttagtttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-catcatgagcttatagcttatttcacgagc 29718260  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29718259 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29718196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38892167 - 38891981
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38892167 tctgtttggttaatctaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccat 38892069  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38892068 gagcttatagcttatttcacgagcctataagctatttttcagaaactattccaagtagcatttgagcttatagcttatatcttctcac 38891981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44748944 - 44748793
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748944 agcttttagcttttagcttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 44748845  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44748844 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44748793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 53779032 - 53779188
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53779032 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 53779131  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53779132 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttataacttctcac 53779188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49853201 - 49853038
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853201 agcttttaactcttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaggctatctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 49853102  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853101 ttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 49853038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 42217662 - 42217808
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42217662 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 42217761  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42217762 agctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 42217808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46318928 - 46318766
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctt 137  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46318928 cccaaaaaagagcttttatctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 46318829  T
Q  138 atttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46318828 atttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46318766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 46972003 - 46972189
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |          | |||||||||||||||||| |||||    
T  46972003 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatttatgtttggtaacactttttgaccat 46972102  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46972103 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 46972189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 2121869 - 2121984
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2121869 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2121968  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  2121969 gcttatagcttctcac 2121984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Original strand, 43525744 - 43525888
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525744 agcttttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43525843  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43525844 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43525888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 2851861 - 2851974
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2851861 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 2851960  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  2851961 ttatagcttctcac 2851974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 52225286 - 52225442
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52225286 agcttatagctcatagcttataagctcgtttgacaacaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 52225385  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52225386 ctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52225442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24628345 - 24628194
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628345 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatt 24628246  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24628245 tttcagaagctattccaagtaacatttgaacttatagcttatagcttctcac 24628194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 30864421 - 30864583
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30864421 agcttttaacttttagtttatagcttataagct-gtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccattagcttatagcttatttcacgagc 30864519  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30864520 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 30864583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12063910 - 12063724
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||          |||||||||||||||||||| |||||    
T  12063910 tctgtttggtaaactccaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttgaccat 12063811  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12063810 aagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatatcttatagcttctca 12063724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 21603846 - 21603955
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21603846 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctacttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21603945  T
Q  203 agcttctcac 212  Q
    ||||||||||    
T  21603946 agcttctcac 21603955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Original strand, 48942992 - 48943134
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48942992 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa--tctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48943089  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48943090 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48943134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46627644 - 46627492
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  46627644 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaggttataagctaa 46627545  T
Q  160 ttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46627544 ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 46627492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 51709055 - 51709168
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51709055 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagc 51709154  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    |||||| |||||||    
T  51709155 ttatagtttctcac 51709168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Original strand, 39876622 - 39876759
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39876622 agcttatagcttataagttcgtttgactaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39876721  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39876722 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39876759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Original strand, 41246257 - 41246394
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246257 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 41246356  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41246357 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41246394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54542086 - 54541946
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54542086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 54541987  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  54541986 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttata 54541946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 33391873 - 33392052
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  || |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33391873 tctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttaacttagagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 33391972  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatag 204  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33391973 gagcttatagtttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatag 33392052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 30548790 - 30548901
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30548790 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30548889  T
Q  201 atagcttctcac 212  Q
    | || |||||||    
T  30548890 acagtttctcac 30548901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44947352 - 44947201
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947352 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 44947253  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  44947252 ctatttttcagaagctattccaagcagtgtttgagcttatagcttatagctt 44947201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42497047 - 42497151
Alignment:
Q  108 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42497047 taacactttttcatcatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagttt 42497146  T
Q  208 ctcac 212  Q
    |||||    
T  42497147 ctcac 42497151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Original strand, 48378210 - 48378371
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  48378210 cccaaaaaagagcttttacctcttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacattttttcaccacgagtctatagctta 48378309  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48378310 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48378371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 45368575 - 45368758
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| ||||||     
T  45368575 aagggtctgtttggtaacacccaaaaaggagcttatagcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgctttttt 45368674  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  45368675 acaacaagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 45368758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 41785779 - 41785915
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41785779 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccat 41785878  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41785879 gagcttatagcttatttcatgagcttataggctattt 41785915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193544
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  193398 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 193497  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  193498 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 193544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Original strand, 47173562 - 47173688
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173562 agcttatagctcttagcttataggttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgataacgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 47173661  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattc 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47173662 ttataagctatttttcagaagctattc 47173688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 44545196 - 44545335
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||    
T  44545196 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 44545294  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44545295 accatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatt 44545335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 41518355 - 41518518
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41518355 agcttatagtttatagctgatagcttataagctcgtctgataaaaaaagctttctttggtaacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcaagagc 41518454  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41518455 ttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcgtctcac 41518518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30814403 - 30814261
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30814403 ttagcttatagcttatagcttttaagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttata 30814304  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    || |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30814303 agatatttttcggaaactattccaagtagcgtttgaacttata 30814261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42465195 - 42465029
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  42465195 cccaaaaaagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattatgtttggtaacattttttcggcatgagcttatagctta 42465096  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42465095 tttcacaagtttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagattatagcttatagc 42465029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45693465 - 45693381
Alignment:
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693465 cttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45693381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 39469914 - 39470018
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39469914 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 39470013  T
Q  156 ctatt 160  Q
    |||||    
T  39470014 ctatt 39470018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32026555 - 32026409
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||        |||||||||| |||   |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32026555 ttagcttatagcttataagttcgttcgacaaaaaaagctctgtttgataatggtttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatt 32026456  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32026455 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 32026409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 51003307 - 51003404
Alignment:
Q  115 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51003307 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 51003404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37490083 - 37489931
Alignment:
Q  48 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||        ||||| |||| |||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37490083 tagcttatagcttatagctgatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctatttgttaaagattttccaccacgagcttatagcttatttcacgag 37489984  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37489983 cttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37489931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 35100181 - 35100328
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacga 146  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||         | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35100181 agcttttagttcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg- 35100279  T
Q  147 gcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
           ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35100280 -------agccatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35100328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 202
Target Start/End: Original strand, 2598608 - 2598742
Alignment:
Q  68 atagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2598608 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaaactctgtttggtaatgttttttcaccacaaacttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaga 2598707  T
Q  168 agctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2598708 agttattccaagtagcgtttgagcttataacttat 2598742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 7041105 - 7041218
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||     
T  7041105 tctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttaagcttatagt 7041204  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||| ||||||    
T  7041205 ttatagcgtctcac 7041218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29203136 - 29203027
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29203136 ctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatag 29203037  T
Q  198 cttatagctt 207  Q
    ||||||||||    
T  29203036 cttatagctt 29203027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33898030 - 33897898
Alignment:
Q  70 agcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaag 169  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33898030 agcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacg 33897931  T
Q  170 ctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33897930 ctattccaaatagcgtttgaacttataacttat 33897898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52595440 - 52595345
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  52595440 tgtttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcacaagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttggagcttata 52595345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 20450424 - 20450607
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||  ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| ||||| |    
T  20450424 aggctctgtttggcaagcccaaaaaacgagcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagtttttta 20450523  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatag 204  Q
    | |  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  20450524 caacaagtttataacttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattgcaagtagcgtttgtgcttataacttatag 20450607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52868266 - 52868184
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||    
T  52868266 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctatttcaagtagtgtttgagcttataacttat 52868184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 27446473 - 27446584
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagctt-atagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagct 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||| ||    
T  27446473 tgtttggtaacactttttcac-atgagctttatagcttatttcacgagtttatatgctatttttcagaagctatttcaaatagcgtctgagtttataact 27446571  T
Q  200 tatagcttctcac 212  Q
    |||| ||||||||    
T  27446572 tatatcttctcac 27446584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Original strand, 5506704 - 5506781
Alignment:
Q  130 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506704 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 5506781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 200
Target Start/End: Original strand, 39719361 - 39719498
Alignment:
Q  62 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||  ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39719361 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacgtttttt-acaacaagcttatagcttatttcacgagcttataagttatta 39719459  T
Q  162 ttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39719460 tgaagaagctattccaaatagcgtttgagtttatagctt 39719498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43740384 - 43740325
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43740384 tgtttggtaacagtttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 43740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37713285 - 37713134
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttg-gtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||| |||||  ||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37713285 agcttatggcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttgagtaacggttttttacaacgagcttatagtttattttacgagcttataaactattt 37713186  T
Q  162 ttcagaagctattccaggtagcgtttgagct--tatagcttatagcttctca 211  Q
    || ||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37713185 ttaagaagttattctaagtagcgtttgagcttatataacttatagcttctca 37713134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52931241 - 52931152
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52931241 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat-------------aagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatag 52931155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32983011 - 32982921
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | |||||||||||||    
T  32983011 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttat-------tttacgagcttataagctatttttcggaagctatttcaagtaatgcttgagcttatagc 32982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 889683 - 889736
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataag 79  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889683 tctgtttggttaaccctaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataag 889736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28394236 - 28394173
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28394236 tctgtttaattaaccccaaaaaagagcttttagcttttaccttataacttataagctcgtttga 28394173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Original strand, 22257726 - 22257807
Alignment:
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 209  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22257726 cttatagcttatttcataagcttattgcttatttttcaaatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttct 22257807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24536869 - 24536808
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    |||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536869 tgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga 24536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 39470011 - 39470056
Alignment:
Q  167 aagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39470011 aagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 39470056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24350358 - 24350282
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgag 190  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| || ||  |||||||||||    
T  24350358 tttttcaccacgagcttatagtttatttcacgagtttataaattatttttcagacgctgtttcaattagcgtttgag 24350282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 126
Target Start/End: Original strand, 51950362 - 51950427
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51950362 ttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 51950427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 88
Target Start/End: Original strand, 52363036 - 52363075
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52363036 agcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttga 52363075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 44545328 - 44545373
Alignment:
Q  167 aagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44545328 aagctattccaagtaacgtttgagcttataacttatagcttctcac 44545373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45693552 - 45693479
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatag 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||         || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693552 ttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactttatttggtaacactttttcaccatgagcttatag 45693479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 52788677 - 52788709
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52788677 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 52788709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 51980820 - 51980892
Alignment:
Q  133 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  51980820 agcttttttcacgagcttata-gct-tttttcagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatagctt 51980892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 612099 - 612200
Alignment:
Q  102 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    ||||||||||  ||||| || | |||||||||| || ||| |  |||||||||  |||||| || | || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  612099 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagtttcttttagaagcttataacttattttccatacgccatttcaagtagcgtttgagcttatagctta 612198  T
Q  202 ta 203  Q
    ||    
T  612199 ta 612200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2187347 - 2187315
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2187347 agcttttagcttatagcctataagctcgtttga 2187315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 5505852 - 5505884
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5505852 agcttatagcttatagcttataagctcgtttga 5505884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 31558349 - 31558317
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31558349 agctttgagcttatagcttataagctcgtttga 31558317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 45906102 - 45906292
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  45906102 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 45906201  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45906202 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45906292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 53407156 - 53407342
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407156 tctgtttggttaaccccaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 53407254  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407255 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 53407342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12234150 - 12233958
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  12234150 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 12234051  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12234050 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12233958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 11600649 - 11600836
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11600649 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccat 11600748  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11600749 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11600836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4517369 - 4517182
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4517369 tctgtttggttaatcccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccat 4517270  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517269 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4517182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8829993 - 8829806
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829993 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 8829894  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829893 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8829806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4392908 - 4392717
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  4392908 aagggtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 4392809  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392808 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4392717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22038540 - 22038348
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  22038540 aagggtctgtttggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 22038441  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22038440 accatgagcttatagcttatttctcgagcttataggctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttatagcttctcac 22038348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35777564 - 35777393
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777564 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 35777465  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35777464 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 35777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 42116862 - 42117049
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42116862 tctgtttgggaaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 42116961  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42116962 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42117049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 7706362 - 7706525
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7706362 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagc 7706461  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706462 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 7706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 18582834 - 18582997
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18582834 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagc 18582933  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18582934 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 18582997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 28307221 - 28307408
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28307221 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctcggtttgataacactttttcaccat 28307320  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28307321 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28307408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 46895273 - 46895436
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895273 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 46895372  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895373 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 46895436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 56372425 - 56372588
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56372425 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 56372524  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56372525 ttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 56372588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11152086 - 11151930
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11152086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11151987  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151986 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11151930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Original strand, 52669983 - 52670147
Alignment:
Q  48 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52669983 tagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 52670082  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670083 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52670147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19514036 - 19513873
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19514036 agcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 19513937  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19513936 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttttagcttatagcttatagcttctcac 19513873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 55764521 - 55764711
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||     
T  55764521 aagggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttca-aaaaaaagctctgtttggtaacactttttg 55764619  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55764620 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 55764711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39087733 - 39087549
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39087733 tgtttggttaacctaaaaaag-agcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 39087635  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39087634 gcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 39087549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25440631 - 25440475
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440631 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 25440532  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440531 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27397913 - 27397757
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397913 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27397814  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397813 ctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27397757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35822477 - 35822290
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  35822477 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 35822378  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35822377 gagcttacaacttatttcacgagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 35822290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 55496034 - 55495883
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55496034 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 55495935  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55495934 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55495883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 22892518 - 22892680
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892518 agcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagc 22892617  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892618 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 22892680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 22944182 - 22944344
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22944182 agcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagc 22944281  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22944282 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 22944344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23868016 - 23867860
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23868016 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 23867917  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23867916 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 23867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 29413528 - 29413684
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413528 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataag 29413627  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413628 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29413684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 8941894 - 8942057
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8941894 agcttttaacttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagc 8941993  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8941994 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 8942057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55856685 - 55856518
Alignment:
Q  42 aaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55856685 aaaaaggagcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaa---gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttattt 55856589  T
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55856588 cacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 55856518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Original strand, 29663926 - 29664070
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29663926 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 29664025  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29664026 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 29664070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47417658 - 47417482
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  47417658 aagggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 47417559  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47417558 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatctttcataagctattccaagcagcgtttgagcttata 47417482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51011248 - 51011056
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        | ||| ||||| ||||||||||    
T  51011248 aagggtctgtttggttaactcaaaaaag-agcttttagcttctagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaaagttctatttggcaacacttttt 51011150  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51011149 caccataagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 51011056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 3009708 - 3009864
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009708 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatttttttaccttgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3009807  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009808 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3009864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4939532 - 4939377
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939532 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4939434  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4939377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9043765 - 9043601
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc-accatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9043765 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacactttttccaccatgagcttataacttatttcacgag 9043666  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043665 cttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9043601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37115434 - 37115286
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37115434 ttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 37115335  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37115334 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37115286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 212
Target Start/End: Original strand, 21369890 - 21370033
Alignment:
Q  69 tagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369890 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 21369989  T
Q  169 gctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369990 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21370033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 37970261 - 37970446
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |         ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37970261 tctgtttggtaaaccaaaaaaatgagcttttagctcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttgaccat 37970359  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970360 gagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 37970446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 200
Target Start/End: Original strand, 31678969 - 31679110
Alignment:
Q  59 ttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31678969 ttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 31679068  T
Q  159 tttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31679069 tttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9032101 - 9031986
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9032101 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttata 9032002  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  9032001 gcttatagcttctcac 9031986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 55828965 - 55829145
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||     
T  55828965 aagggtctgttcggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttg 55829064  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55829065 accatgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55829145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4355739 - 4355583
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||        | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4355739 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4355640  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4355639 ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 4355583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 35468012 - 35468168
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35468012 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35468111  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35468112 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttataacatatagcttctcac 35468168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 26826560 - 26826674
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26826560 ctctgtttggtaacactttttcacgatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 26826659  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  26826660 cttatagcttctcac 26826674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55358443 - 55358329
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55358443 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 55358344  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  55358343 cttatagcttctcac 55358329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 15635922 - 15636095
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||       ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15635922 cccaaaaaagagcttttacctcttagcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaagctttgtttggtaacactttttcactatgagtttatagctta 15636021  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15636022 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgattttatagcttatagcttctcac 15636095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 33114979 - 33115128
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33114979 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 33115078  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115079 tcagaagctatttcaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33115128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43225860 - 43225680
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  43225860 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaag-agcttttagtttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 43225762  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43225761 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 43225680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 53273084 - 53273236
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53273084 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccat 53273183  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattcca 177  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53273184 gaacttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattcca 53273236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5465516 - 5465406
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5465516 gctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5465417  T
Q  197 gcttatagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  5465416 gcttatagctt 5465406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 56270231 - 56270083
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56270231 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 56270132  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56270131 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttatagcttctca 56270083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30366250 - 30366137
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30366250 tctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatatcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 30366151  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  30366150 ttatagcttctcac 30366137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35581112 - 35580948
Alignment:
Q  36 aaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 135  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  35581112 aacccaaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagt 35581013  T
Q  136 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35581012 ttatttcacgagcttataaactatttttcagaggctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 35580948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 37831924 - 37832060
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831924 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 37832023  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37832024 tttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatag 37832060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 23162641 - 23162755
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttg-agcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  23162641 tctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgaagcttatag 23162740  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    ||||||| |||||||    
T  23162741 cttatagattctcac 23162755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27185737 - 27185623
Alignment:
Q  100 ctgtttggt-aacactttttc-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27185737 ctgtttggttaacactttttctaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 27185638  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| ||||    
T  27185637 cttatagcttatcac 27185623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 22430637 - 22430783
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| |||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430637 ttagcttatagcttataagctcgttcgataaaaaaagctctatttgataatggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 22430736  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430737 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 22430783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31338656 - 31338491
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt--caccatgagcttatagcttatttcacga 146  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||        ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  31338656 agcttatagctcttaactgatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttagtaacattttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgg 31338557  T
Q  147 gcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31338556 gcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31338491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23113618 - 23113468
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||        || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113618 ttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaaactttgattggtaatactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 23113519  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23113518 tttcagaagttattccaagtagcgtttgagtttataacttataacttctca 23113468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4391855 - 4391702
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4391855 agcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataag 4391756  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 209  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4391755 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 4391702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 11050355 - 11050458
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11050355 gctctgtttggtaatgctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 11050454  T
Q  197 gctt 200  Q
    ||||    
T  11050455 gctt 11050458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 44442063 - 44442234
Alignment:
Q  40 ccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 139  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44442063 ccaaaaaagagcttttaacttttagcttataatttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttattgcttat 44442162  T
Q  140 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44442163 ctcacgagctta-aaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 44442234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Original strand, 25235127 - 25235291
Alignment:
Q  41 caaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 140  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||| |||| |||        ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
T  25235127 caaaaaggagcttatagtttatagctgatagcttataagttcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatt 25235226  T
Q  141 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25235227 tcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 25235291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21633899 - 21633812
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633899 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 21633812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35190763 - 35190612
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  35190763 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacgcttttttacaacgagtttgtagcttatttcaggagcttataag 35190664  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35190663 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35190612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36008152 - 36008009
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||    
T  36008152 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat-------------aag 36008066  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36008065 ctgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 36008009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 55684692 - 55684848
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        ||| ||||||||||  |||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  55684692 agcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctttgtttggtaatgcttttttacaacgagcttctagcttatttcaggagcttataag 55684791  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55684792 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcgtctcac 55684848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29656843 - 29656720
Alignment:
Q  53 tttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29656843 tttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacagaaaaagttctgtttgttaacactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagctaat 29656744  T
Q  153 aagctatttttcagaagctattcc 176  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  29656743 aatttatttttcagaagctattcc 29656720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20148884 - 20148803
Alignment:
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  20148884 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 20148803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25199472 - 25199366
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199472 tgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 25199373  T
Q  127 gcttata 133  Q
    |||||||    
T  25199372 gcttata 25199366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 20511448 - 20511552
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20511448 ctctgtttgataacagttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttataa 20511547  T
Q  198 cttat 202  Q
    |||||    
T  20511548 cttat 20511552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33005275 - 33005178
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005275 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33005178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42085812 - 42085723
Alignment:
Q  113 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42085812 ctttttcaccacgaacttatagcttatttcacgagcttataagctttttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 42085723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45780915 - 45780760
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45780915 tctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccat 45780816  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||                    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45780815 gagct--------------------tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45780760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 36196864 - 36197017
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||   | | | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36196864 agcttatagtttatagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttgataattgtctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagc 36196963  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  36196964 ttataaactatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagcttatagcttat 36197017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43078300 - 43078188
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43078300 tctgtttggtaatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagc 43078201  T
Q  199 ttatagcttctca 211  Q
    ||||| |||||||    
T  43078200 ttataacttctca 43078188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 44525694 - 44525778
Alignment:
Q  116 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44525694 tttcactatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44525778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33005186 - 33005111
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33005186 gagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 33005111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52708138 - 52707999
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52708138 agcttatagcttataagctcgtttgatagaaaaaactctgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 52708039  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    ||||| | |||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  52708038 tcagatgttattacaagtaacg-ttgagcttatagcttata 52707999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497399
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40497473 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48056709 - 48056607
Alignment:
Q  100 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagct 199  Q
    ||||||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48056709 ctgtttggtaacaattttttacaacgaacttatagtttatttcacgaacttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagct 48056610  T
Q  200 tat 202  Q
    |||    
T  48056609 tat 48056607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4465573 - 4465472
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4465573 tgtttggtaacgtctttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctgttccaagtagcgtttgagcttgtagctt 4465474  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  4465473 at 4465472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 37047069 - 37047172
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  37047069 tctgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttattttaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaaatagcgtttgagcttatagc 37047168  T
Q  199 ttat 202  Q
    ||||    
T  37047169 ttat 37047172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29656716 - 29656597
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||     
T  29656716 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttaccttatagcttttaagctcgtttgacaagaaaagctctgtttggtaacactttttcaccac 29656617  T
Q  125 gagcttatagcttatttcac 144  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29656616 gagcttatagcttatttcac 29656597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24954282 - 24954217
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24954282 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24954217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36486489 - 36486376
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||    
T  36486489 tctgtttggtaatactttttcaccatgaatttatagtttattttatgagcttataaactatttttcataagctattttaagtaacgtttgaacttatagc 36486390  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||| ||||||||    
T  36486389 ttataacttctcac 36486376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 50502284 - 50502376
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttat 195  Q
    |||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50502284 tttggtaacggttttttacaacgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgagcttat 50502376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42124740 - 42124670
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42124740 cacgagcttataaactatctttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42124670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32101835 - 32101736
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32101835 tttggtaacggtcttttaccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttctaagacgttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32101736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35842696 - 35842600
Alignment:
Q  102 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||              ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35842696 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagattatttcgcgagcttataagc--------------tattccaagtagcgtttgagcttatagctta 35842611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 31435072 - 31435149
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  31435072 gagcttatagcttatttcacgagtttataagttatttttcatacgctattccaagtagcgtttgaggttataacttat 31435149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 17715647 - 17715707
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17715647 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagattatagcttat 17715707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 200
Target Start/End: Original strand, 53224309 - 53224368
Alignment:
Q  141 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53224309 tcacgagtttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 53224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 211
Target Start/End: Original strand, 52713560 - 52713646
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52713560 gagcttataacttatttcacaaacttataagttatttttaagacactattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 52713646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30562988 - 30562850
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        | | |||||||||||  ||||| || | || |||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  30562988 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacgattttttacaacgaacttataacttattttatgagca-ataagctatttt 30562890  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30562889 tcagatgctattacaagtagcgtttaagcttatagcttat 30562850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32948289 - 32948179
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaaca-ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||  ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  32948289 ctctgtttgataacaactttttcatcatgagtttatatcttattttatgatattataaagtatttttcagacgctattctaaatagcgtttgagcttata 32948190  T
Q  197 gcttatagctt 207  Q
    | |||||||||    
T  32948189 gtttatagctt 32948179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Original strand, 37337678 - 37337784
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||  ||||| |  || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  37337678 ctctgtttggtaacggttttttataataagcatatagcttatttcaggtacttataagctatttttcataagctacttcaagtagcgtttgaacttatag 37337777  T
Q  198 cttatag 204  Q
     ||||||    
T  37337778 tttatag 37337784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41864153 - 41864083
Alignment:
Q  130 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  41864153 tatagcttattttacgaacttataagctatttttaagaagctattccaaatagcgtttaagtttatagctt 41864083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38048979 - 38048878
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| ||||  ||||||| || || ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  38048979 tgtttgttaacgttttttcatcacgaacttataatttatttcacgagtttataaactatttttcagacgctattccaaatagcatttgagtttatagctt 38048880  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  38048879 at 38048878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 40119903 - 40119968
Alignment:
Q  142 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40119903 cacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcatttgagcttgtagcctatagctt 40119968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 31953224 - 31953296
Alignment:
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31953224 cttatagcttatttcacgactttataaactattttttagacattatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 31953296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 17715579 - 17715658
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  17715579 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttata 17715658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19169213 - 19169164
Alignment:
Q  40 ccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat 89  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19169213 ccaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgat 19169164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 212
Target Start/End: Original strand, 53274816 - 53274849
Alignment:
Q  179 gtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53274816 gtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 53274849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20530847 - 20530799
Alignment:
Q  159 tttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20530847 tttttgagaagttattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 20530799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 44525659 - 44525699
Alignment:
Q  104 ttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcac 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44525659 ttggtaacactttttcactatgagtttatagcttatttcac 44525699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 202
Target Start/End: Original strand, 39068890 - 39068969
Alignment:
Q  123 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| | |||| || ||| ||||||| |||||| |||||    
T  39068890 atgagcttataacttatttcaggagtttataacttatttttcagacgatatttcaagtaacgtttgatcttataacttat 39068969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8716993 - 8716919
Alignment:
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||   |||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||    
T  8716993 cttatagcttatttcaaaagcttatagtttattttccagaggctatttcaagtagtgtttgagcttatagtttat 8716919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 86
Target Start/End: Original strand, 45520101 - 45520135
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgttt 86  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45520101 ttttagctcttagcttatagcttataagctcgttt 45520135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 1031354 - 1031430
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  1031354 gagcttatagcttattttacgagtttataa-cttattttcagacgctatttcagatattgtttgagcttacagcttat 1031430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3932306 - 3932245
Alignment:
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3932306 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagctt 3932245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36246564 - 36246374
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  36246564 aggctctgtttggttaaccc-aaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 36246466  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246465 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36246374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40637345 - 40637158
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40637345 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggcaacactttttcaccat 40637246  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637245 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40637158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42587544 - 42587381
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587544 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 42587445  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587444 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42587381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 43254097 - 43254260
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254097 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 43254196  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254197 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43254260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45687077 - 45686914
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687077 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 45686978  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45686977 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45686914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10312190 - 10312027
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312190 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 10312091  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10312090 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatatcttatagcttctcac 10312027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Original strand, 21374606 - 21374790
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374606 tgtttggttaaccttaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatga 21374704  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374705 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21374790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47471146 - 47470960
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47471146 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcgtttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccat 47471048  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47471047 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 47470960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 43134375 - 43134560
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43134375 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttca-caaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 43134473  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43134474 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctca 43134560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42375964 - 42375793
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42375964 tgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttcaccatga 42375867  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42375866 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42375793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 9487380 - 9487564
Alignment:
Q  28 gtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgag 127  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9487380 gtttggttaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttactatgag 9487479  T
Q  128 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9487480 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 9487564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 21741941 - 21742129
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngct-ctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||| |||||||||    
T  21741941 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagattttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacaccttttcacca 21742040  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742041 tgagcttatagcttatttcacgagcttaaaagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21742129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27089810 - 27089654
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089810 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27089711  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089710 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27089654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 27188491 - 27188647
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188491 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27188590  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188591 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27188647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 31511301 - 31511457
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511301 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 31511400  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511401 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31511457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48313613 - 48313422
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||||||    
T  48313613 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaggttatagtttataagttcgtttga-caaaaaagctctgattggtaacactttttc 48313515  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313514 accatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagcttctcac 48313422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21254881 - 21254695
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21254881 tctgtttggttaacttaaaaaag-agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcactat 21254783  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21254782 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 21254695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 40258827 - 40259014
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40258827 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacagaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccat 40258926  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40258927 gagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40259014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 35587580 - 35587736
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587580 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35587679  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587680 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35587736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Original strand, 36436119 - 36436294
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  36436119 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatatcttataagctcgtttga-caaaaaagctatgtttggtaacactttttc 36436217  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36436218 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 36436294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 483171 - 482981
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||| |||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||| ||||||||||||||||||     
T  483171 aagggtctgtttggtaaacttaaaaaag-agcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttg 483073  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  483072 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 482981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 44743701 - 44743874
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44743701 cccaaaaaaaagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 44743800  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44743801 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagtttatagcttataacttctcac 44743874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48832207 - 48832051
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832207 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48832108  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832107 ctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 48832051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45222256 - 45222071
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||| |||||    
T  45222256 aagggtctgtttggttaaccccaaaaa--ag-----agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacaccttttc 45222164  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45222163 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttatagcttctcac 45222071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 33026918 - 33027033
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33026918 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 33027017  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  33027018 gcttatagcttctcac 33027033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 36407200 - 36407384
Alignment:
Q  27 tgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 126  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36407200 tgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttaactcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatga 36407299  T
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36407300 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 36407384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27655834 - 27655676
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27655834 agcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagc 27655735  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655734 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 27655676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 44596604 - 44596766
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44596604 agcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttcacaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagc 44596703  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44596704 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 44596766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33203826 - 33203666
Alignment:
Q  52 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 151  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33203826 ttttagcttttagtttatagtttataagttcctttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 33203727  T
Q  152 taagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33203726 taagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 33203666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40106159 - 40106003
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40106159 agcttttagctcttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 40106060  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40106059 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagtttatagcttctcac 40106003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 34709210 - 34709390
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||       || | ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34709210 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agtttgtttgactaaaaaagctctgtctggtaacactttttcaccat 34709302  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34709303 gagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 34709390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47587275 - 47587115
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47587275 cccaaaaaagagattttagcttttagcttatagcttataaactcgtctgataaaaaaaactctgtttggtaacactttt-caccatgagcttatagctta 47587177  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47587176 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 47587115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 48590732 - 48590871
Alignment:
Q  73 ttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagcta 172  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48590732 ttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagcta 48590831  T
Q  173 ttccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48590832 ttcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 48590871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19832137 - 19832000
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19832137 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19832038  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19832037 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19832000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21313983 - 21313799
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactt 115  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  21313983 caaagggtctgtttggtaatacccaaaaaagaacttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacactt 21313884  T
Q  116 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21313883 tttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21313799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 49148326 - 49148489
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49148326 agcttttagctcttagctaatagcttataagcttttttgacaaaaaaagctctgtttagtaacacttttccaccatgagcttatagcttatttcacgagc 49148425  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49148426 ttatgagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 49148489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11466200 - 11466047
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11466200 agcttatagtttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgaac 11466101  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11466100 ttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11466047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12345180 - 12345065
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  12345180 gctctgtttggtaacactttttcacgaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcatttgagcttata 12345081  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  12345080 gcttatagcttctcac 12345065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 211
Target Start/End: Original strand, 17844544 - 17844700
Alignment:
Q  55 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844544 tagcttatagtttatagtttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctatttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 17844643  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844644 gctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 17844700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28425767 - 28425609
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        | | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425767 ttagcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaatgttttgtttggtaactttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 28425668  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425667 agttatttttcataagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28425609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Original strand, 23029790 - 23029946
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029790 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacgaaaattagctttgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 23029889  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029890 actattattcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 23029946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17192626 - 17192452
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17192626 tctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccat 17192528  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17192527 gagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 17192452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 32168803 - 32168938
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168803 tctgtttggtaacgcccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 32168902  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168903 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 32168938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38531294 - 38531181
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  38531294 ctctgtttggtaacactttttcaccatgatctaatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagttatt-caagtagcgtttgagcttatag 38531196  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  38531195 cttatagcttctcac 38531181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 1342777 - 1342928
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1342777 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcagaagcttataag 1342876  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1342877 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 1342928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Original strand, 38481286 - 38481421
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38481286 ttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaacagctctgtttggtaacactttttcaccatgaatttatagcttatttcacgagtctataagctatt 38481385  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38481386 tttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttata 38481421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 9485759 - 9485872
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  9485759 ctctctttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctatttcaagtatcatttgagcttatag 9485858  T
Q  198 cttatagcttctca 211  Q
    ||||||| ||||||    
T  9485859 cttataggttctca 9485872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46879637 - 46879525
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  46879637 gctctgtctggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 46879538  T
Q  197 gcttatagcttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  46879537 gcttatagcttct 46879525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21316730 - 21316611
Alignment:
Q  64 gcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21316730 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaactctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcataagcttataagctattttt 21316631  T
Q  164 cagaagctattccaggtagc 183  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21316630 cagaagctattccaagtagc 21316611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 46757752 - 46757857
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  46757752 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 46757851  T
Q  197 gcttat 202  Q
    ||||||    
T  46757852 gcttat 46757857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 791487 - 791336
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||||| || | || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  791487 agcttatagtttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataag 791388  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  791387 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22642362 - 22642259
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22642362 tctgtttggtaacggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttaaacgctattctaagtagcatttgagcttatagc 22642263  T
Q  199 ttat 202  Q
    ||||    
T  22642262 ttat 22642259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Original strand, 40893437 - 40893524
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40893437 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40893524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19757625 - 19757519
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| |||| |||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  19757625 tgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttaattcaggagcttataagctatttttcaaaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 19757526  T
Q  201 atagctt 207  Q
    |||||||    
T  19757525 atagctt 19757519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36612220 - 36612114
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  36612220 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttttagcttatttcaggagtttataagctattttttagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 36612121  T
Q  201 atagctt 207  Q
    |||||||    
T  36612120 atagctt 36612114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 48620504 - 48620614
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||  ||    
T  48620504 tgtttggtaacactttt-catcatgagtttatagtttatttcacgagcttataaactatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcatataattt 48620602  T
Q  201 atagcttctcac 212  Q
    ||| ||||||||    
T  48620603 atatcttctcac 48620614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 202
Target Start/End: Original strand, 35000773 - 35000859
Alignment:
Q  116 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35000773 tttcatcaggagcttatagcttatttcacaagtttataaactatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35000859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27869645 - 27869570
Alignment:
Q  127 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27869645 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcggacgttattccaagtagcgtttgagtttatagcttat 27869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7884790 - 7884691
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7884790 tctgtttgttaatactttttcaccatgaacttatagcgtattttacgagc----aagttatttttgtgaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 7884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Original strand, 24170803 - 24170856
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24170803 tttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcaga 24170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21740258 - 21740152
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| |  |  |||||||||| ||||||    
T  21740258 gctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcagaagtttataagctatttttcagaaactacttgaaatagcgtttga-cttata 21740160  T
Q  197 gcttatag 204  Q
    ||||||||    
T  21740159 gcttatag 21740152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Original strand, 39698930 - 39698984
Alignment:
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39698930 agcttacaagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 39698984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 45672341 - 45672441
Alignment:
Q  102 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    |||| |||||| ||||| || | || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  45672341 gtttcgtaacaattttttacaacgaacttataatttattttacgaacttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagttta 45672440  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  45672441 t 45672441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 24170860 - 24170933
Alignment:
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24170860 tttcatgagcttataagctatttttcagacattattccaagtagtgcttgagcttataacttatagcttatcac 24170933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 47584185 - 47584237
Alignment:
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  47584185 cttataaactatttttcagaagttattccaaatagcgtttgagtttatagctt 47584237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22621539 - 22621461
Alignment:
Q  129 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||   |||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22621539 ttatagtttatttcaggagctcataacttatttttcagacattatttcaagcagcgtttgagcttataacttatagctt 22621461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Original strand, 32168931 - 32168964
Alignment:
Q  167 aagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32168931 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32168964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35669682 - 35669619
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 209  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  35669682 gagcttataa-ctttttttgagaagctatttcaagtatcttttgaacttatagcttatagcttct 35669619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 89
Target Start/End: Original strand, 47584118 - 47584146
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47584118 ttagcttatagcttataagctcgtttgat 47584146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 1917995 - 1918185
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  1917995 aggctctgtttggttaaccc-aaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 1918093  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1918094 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1918185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 33524501 - 33524688
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33524501 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 33524600  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33524601 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 33524688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 44909814 - 44910000
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44909814 tctgtttggttaaccccaaaaag-agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 44909912  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44909913 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44910000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19899073 - 19898883
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  19899073 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 19898974  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898973 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19898883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Original strand, 26204249 - 26204434
Alignment:
Q  26 ctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatg 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204249 ctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 26204347  T
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26204348 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 26204434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36301269 - 36301080
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  36301269 aggctctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttgataacactttttca 36301172  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301171 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36301080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13121750 - 13121569
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  13121750 aagggtctgtttggttaaccccaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 13121652  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13121651 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 17046702 - 17046877
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17046702 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccat 17046801  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17046802 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17046877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42064455 - 42064292
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064455 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 42064356  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064355 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42064292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31150573 - 31150400
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150573 cccaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttgggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 31150474  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150473 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31150400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32368506 - 32368314
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  32368506 aagggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 32368407  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32368406 accatgagcttataacttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32368314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 39826568 - 39826748
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  39826568 aagggtctgattggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 39826667  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39826668 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39826748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 2497895 - 2498082
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2497895 tctgtttagttaaccctaaaatagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccat 2497994  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2497995 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2498082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 29586155 - 29586318
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586155 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagc 29586254  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586255 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29586318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36838857 - 36838670
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36838857 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttctccat 36838758  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36838757 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36838670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 30774059 - 30774241
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30774059 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaa----gctctgtttggtaacactttttcaccat 30774153  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30774154 aagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30774241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30721786 - 30721598
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  30721786 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 30721687  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30721686 tgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30721598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47134698 - 47134516
Alignment:
Q  19 aaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  47134698 aaagggtctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 47134600  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  47134599 caccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 47134516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29704249 - 29704059
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  29704249 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttaatttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 29704150  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29704149 catgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29704059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17500023 - 17499860
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17500023 agcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 17499924  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17499923 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttatatcttctcac 17499860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 38676460 - 38676649
Alignment:
Q  22 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 121  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  38676460 ggctctgattgggaaaccccaaaaaa-agcttttagcttttaacttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 38676558  T
Q  122 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38676559 catgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 38676649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 50351036 - 50351192
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351036 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50351135  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50351136 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagcttctcac 50351192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 15313217 - 15313403
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15313217 tctgtttgggaaacccaaaaaaagaacttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccat 15313315  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15313316 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15313403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 34319362 - 34319548
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  34319362 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccat 34319461  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34319462 gaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 34319548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7711122 - 7710941
Alignment:
Q  19 aaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  7711122 aaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttt 7711023  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7711022 catcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7710941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 26843719 - 26843911
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| ||| ||||||||    
T  26843719 aagggtctgtttggaaaatccaaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttgataatactttttc 26843818  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26843819 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttataacttctcac 26843911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 322869 - 323025
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  322869 agcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 322968  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322969 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 323025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1507906 - 1507718
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    |||||||||| |  ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  1507906 tctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaagaagctctgtttggtaacactttttcacca 1507807  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507806 ttagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1507718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 3270663 - 3270818
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270663 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaa-tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3270761  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270762 ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3270818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 15348812 - 15348984
Alignment:
Q  40 ccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 139  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348812 ccaaaaaagagcttttagctctttgcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 15348911  T
Q  140 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15348912 ttcacgagcttataaattatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 15348984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38967594 - 38967451
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967594 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 38967496  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38967495 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49220605 - 49220450
Alignment:
Q  55 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49220605 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttacagcttatttcacgagcttataa 49220506  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 210  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220505 gctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 49220450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 3660932 - 3661105
Alignment:
Q  39 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 138  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3660932 cccaaaaaagagcttttagttcttagcttatagcttataagctcatttgacaacaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatctta 3661031  T
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3661032 tttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcac 3661105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Original strand, 29374327 - 29374485
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29374327 agcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagc 29374426  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29374427 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttatagctt 29374485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 37703716 - 37703830
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  37703716 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataa 37703815  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  37703816 cttatagcttctcac 37703830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 25601969 - 25602134
Alignment:
Q  34 ttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 133  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25601969 ttaacccaaaaaag-agcttttagctcttagcttataggttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtatcacttttttaccatgaccttata 25602067  T
Q  134 gcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25602068 gcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 25602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Original strand, 34086970 - 34087116
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34086970 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagctaatttcacgagcttataag 34087069  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34087070 ctatttttgagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 34087116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 46369809 - 46369964
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng--ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  46369809 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct---a 46369905  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46369906 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 46369964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37672439 - 37672325
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  37672439 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataa 37672340  T
Q  198 cttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||    
T  37672339 cttatagcttctcac 37672325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 22098965 - 22099078
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22098965 tctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 22099064  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  22099065 ttatagcttctcac 22099078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7781295 - 7781144
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781295 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 7781196  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781195 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 7781144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50171435 - 50171272
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50171435 agcttttcgcttttaatttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacacctttttaccatgagcttatagcttatttcacaagc 50171336  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50171335 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcac 50171272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36043388 - 36043275
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36043388 tctgtttggtaacagtttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattctaagtagcgtttgagcttatagc 36043289  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  36043288 ttatagcttctcac 36043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49185273 - 49185160
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49185273 tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataaactatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagc 49185174  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  49185173 ttatagcttctcac 49185160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 39583100 - 39583256
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  39583100 agcttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttaacgagtttataag 39583199  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39583200 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttataccttatagcttctcac 39583256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 211
Target Start/End: Original strand, 3391122 - 3391279
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3391122 ttagcttatagtctatagcttataagtttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgaacttatagtttatttcacgagcttata 3391221  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3391222 aactatttttcagaagctattccaagtaacgtttaagcttatagcttatagcttctca 3391279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42614222 - 42614110
Alignment:
Q  100 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagct 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42614222 ctgtttggtaacattttttcaccatgagcttctagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagct 42614123  T
Q  200 tatagcttctcac 212  Q
    |||||| ||||||    
T  42614122 tatagcatctcac 42614110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33562033 - 33561884
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33562033 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 33561934  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||              ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561933 ttataagc--------------tattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33561884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Original strand, 43727074 - 43727181
Alignment:
Q  105 tggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43727074 tggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgaacttatagcttatag 43727173  T
Q  205 cttctcac 212  Q
    ||||||||    
T  43727174 cttctcac 43727181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Original strand, 50540768 - 50540920
Alignment:
Q  48 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||       | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50540768 tagcttataacttatagcttatagcttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccataaacttatagcttatttcacgag 50540867  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50540868 tttataagctatttttcagaagctattacaagtagcgtttgagcttatagctt 50540920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 51423123 - 51422963
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||        | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51423123 agcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgag 51423024  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttc 208  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51423023 tttataaactattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttc 51422963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 40887928 - 40888035
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40887928 tctgtttggtaacactttttca------gcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 40888021  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  40888022 ttatagcttctcac 40888035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 34318415 - 34318561
Alignment:
Q  61 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34318415 ttagcttatagcttataagcttgttcgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataagctatt 34318514  T
Q  161 tttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34318515 tttcagatgctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 34318561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8221402 - 8221210
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    ||||||||||||||| || || | ||  |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||  |||||     
T  8221402 aaggctctgtttggtaaagccaagaagctagcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacggtttttt 8221303  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8221302 acaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaaactattccaaatagcgtttgaatttatagcttatagcttctcac 8221210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 203
Target Start/End: Original strand, 5697523 - 5697628
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5697523 ctctatttggtaacagttttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatac 5697622  T
Q  198 cttata 203  Q
    ||||||    
T  5697623 cttata 5697628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9770058 - 9769953
Alignment:
Q  102 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||     
T  9770058 gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaaataacgtttgagcttataacttc 9769959  T
Q  202 tagctt 207  Q
    ||||||    
T  9769958 tagctt 9769953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 2479157 - 2479306
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2479157 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttatcatgagtttatagcttatttcacgagc 2479256  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||              ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479257 ttat--------------aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2479306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49822242 - 49822147
Alignment:
Q  112 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49822242 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 49822147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49240405 - 49240268
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||        ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49240405 agcttatagcttataagttcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcactatgaacttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 49240306  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  49240305 tcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagctt 49240268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52703236 - 52703091
Alignment:
Q  62 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52703236 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagttattt 52703137  T
Q  162 ttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52703136 ttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttttagctt 52703091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 28429076 - 28429147
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429076 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagc 28429147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30495282 - 30495182
Alignment:
Q  100 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagct 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  30495282 ctgtttggtaatactttttgaccatgagcttatagcttatttctagagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttcagcttatagct 30495183  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  30495182 t 30495182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 25134895 - 25134998
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  25134895 tctgtttggtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattttaagtagtgtttgagcttatagc 25134994  T
Q  199 ttat 202  Q
    ||||    
T  25134995 ttat 25134998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18347553 - 18347403
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||        ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18347553 agcttatagcttatagcttatagcttataagtttgtttga-caaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagc 18347455  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18347454 ttataagctatttttcagacactattccaagtagtgtttgagcttatagctt 18347403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46929057 - 46928959
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46929057 tttttcactaagaacttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattctaattagcgtttgtgcttatagcttatagcttctcac 46928959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36379225 - 36379121
Alignment:
Q  108 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36379225 taacacttttttacgatgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataactt 36379126  T
Q  208 ctcac 212  Q
    |||||    
T  36379125 ctcac 36379121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13570855 - 13570773
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13570855 gagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagctt 13570773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41005057 - 41004969
Alignment:
Q  123 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41005057 atgagtttatagcttatttcatgagcttataagttatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctca 41004969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 33151975 - 33152053
Alignment:
Q  133 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33151975 agcttatttcacgagcttataagctatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgagcttgtaacttatagcttctca 33152053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 9169051 - 9169149
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  9169051 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 9169149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16085684 - 16085595
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttata 203  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16085684 tttttcaccacgatcttatagtctattttacgagcttataagctatttttcagatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 16085595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 42963877 - 42963978
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  42963877 tgtttgataatactttttcactatgagcttataatttattttacgagtttataagctatttttgagaagctatttcaagtagcgtttgagcttacagctt 42963976  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  42963977 at 42963978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44719096 - 44718962
Alignment:
Q  62 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44719096 tagcttatagcttataagcttgtttggcaaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataaactattt 44718997  T
Q  162 ttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||    
T  44718996 ttcagacgctatttcaagtagcgtttaagcttata 44718962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Original strand, 44956340 - 44956428
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  44956340 ttttttaccatgagcttatagcttatttaacgagattataagttatttttcagatgctattccaagtagagtttgagcttataacttat 44956428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46088139 - 46087980
Alignment:
Q  48 tagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 147  Q
    |||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46088139 tagcttatagcttatagcagatagtttataagctcgtttgactagaaaagctctgtttgataatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgag 46088040  T
Q  148 cttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  46088039 tttataagctatttttcagacgttattccaagtaatatttgagcttgtagcttatagctt 46087980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 46056499 - 46056411
Alignment:
Q  114 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  46056499 tttttcaccacgaacttatagtttatttcacgagcttataagatatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcttatagcttat 46056411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 7024916 - 7024971
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7024916 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7024971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 9169142 - 9169203
Alignment:
Q  139 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9169142 tttcaccaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9169203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Original strand, 40719554 - 40719622
Alignment:
Q  132 tagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  40719554 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttatttcaagtagcgtttgagtttatagctt 40719622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 9894931 - 9894992
Alignment:
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9894931 agcttataagctatttttcagacgctattcaaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 9894992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28869099 - 28868987
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||   ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  28869099 tctgtttggtaaaggttttttacaacgagtttatagtttatttcacgagcttataaattatttttaagaaattatttcaagtaacgtttgagcttatagc 28869000  T
Q  199 ttatagcttctca 211  Q
    |||||| ||||||    
T  28868999 ttatagtttctca 28868987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 33632331 - 33632395
Alignment:
Q  145 gagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33632331 gagcttataagctatttttcagaagctattccaaacagcgtttgagcttattgctgatagcttct 33632395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 6814118 - 6814187
Alignment:
Q  143 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6814118 acgaacttataagttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttttcac 6814187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40935945 - 40935893
Alignment:
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctta 201  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40935945 ttataaactatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctta 40935893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10628891 - 10628814
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||   |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  10628891 gagcttatagtttattttactagcttataacttatttttcagacattatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 10628814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2029037 - 2028961
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||| || ||||| |||||    
T  2029037 agcttatagtttatttaacgagtttataaactatttttcagacgctatttcaagtaccgtttaagattataacttat 2028961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Original strand, 12891644 - 12891684
Alignment:
Q  172 attccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891644 attccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 12891684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22099726 - 22099687
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat 89  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099726 agcttttag-ttttagcttatagcttataagctcgtttgat 22099687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 32731723 - 32731915
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||    
T  32731723 aaggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 32731822  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32731823 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32731915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 12297334 - 12297521
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297334 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12297433  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297434 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12297521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14227712 - 14227526
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14227712 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaa-gctttgtttggtaacactttttcaccat 14227614  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14227613 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 14227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34233096 - 34232906
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  34233096 aggctctgtttggttatcccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 34232997  T
Q  121 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232996 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 34232906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31100197 - 31100017
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  31100197 aaggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 31100098  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31100097 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31100017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 2442418 - 2442581
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2442418 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 2442517  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2442518 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcac 2442581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30811326 - 30811139
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||  ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30811326 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccat 30811227  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30811226 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30811139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 20804983 - 20805146
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20804983 agcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 20805082  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20805083 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 20805146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Original strand, 558360 - 558517
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558360 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 558459  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558460 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 558517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Original strand, 10856133 - 10856277
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856133 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 10856232  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10856233 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 10856277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12432760 - 12432611
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432760 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12432661  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432660 tcagaagccattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12432611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34685161 - 34685006
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685161 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacattttcac-atgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34685063  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34685062 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 34685006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7317788 - 7317602
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |        |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7317788 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttcacagaaaaagctctgtttggtaacattttttgaccat 7317689  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7317688 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 7317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31452107 - 31451962
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31452107 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 31452008  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagctta 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31452007 ttataagctgtttttcagaagctattccaagtagtgtttgagctta 31451962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33540865 - 33540716
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33540865 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttt 33540766  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33540765 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33540716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1806491 - 1806343
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  1806491 tctgtttggttaacccaaaaaag-agcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgactaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccat 1806393  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1806392 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatt 1806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 5681561 - 5681676
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5681561 gctctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5681660  T
Q  197 gcttatagcttctcac 212  Q
     |||||||||||||||    
T  5681661 acttatagcttctcac 5681676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Original strand, 34439683 - 34439838
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34439683 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34439782  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34439783 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttacagcttctca 34439838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 5943035 - 5943148
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5943035 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagc 5943134  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  5943135 ttatagcttctcac 5943148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 33453734 - 33453880
Alignment:
Q  54 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453734 ttagcttatagcttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33453833  T
Q  154 agctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33453834 agctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 33453880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 28076423 - 28076574
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28076423 agcttatagcttatagcttataaactcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 28076522  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28076523 ctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28076574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6709799 - 6709687
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6709799 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaaattataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 6709700  T
Q  199 ttatagcttctca 211  Q
    |||||||||||||    
T  6709699 ttatagcttctca 6709687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 34903923 - 34904103
Alignment:
Q  19 aaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  34903923 aaagggtctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 34904022  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34904023 caccatgagcttatagct-------------tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 34904103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3108153 - 3108001
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta-tttcacgagcttataa 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3108153 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttataacttaatttcacgagcttataa 3108054  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3108053 gctatttttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 3108001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5301741 - 5301593
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||        | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301741 agcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagttctgtttggtaatgttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5301642  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5301641 tcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttatagcttctca 5301593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 2970722 - 2970831
Alignment:
Q  103 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2970722 tttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2970821  T
Q  203 agcttctcac 212  Q
    ||||||||||    
T  2970822 agcttctcac 2970831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 11015590 - 11015741
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11015590 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttacaag 11015689  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015690 ctatttttgagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 11015741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29823176 - 29823026
Alignment:
Q  62 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  29823176 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacattttttcaccatgagctaatagcttattttgcgagcttataagttattt 29823077  T
Q  162 ttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29823076 ttcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29823026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3636793 - 3636643
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3636793 agcttttagctcttaacttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaat-tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagc 3636695  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3636694 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgaacttatagctt 3636643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 31049379 - 31049485
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31049379 tgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagctt 31049478  T
Q  201 atagctt 207  Q
    |||||||    
T  31049479 atagctt 31049485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12140968 - 12140874
Alignment:
Q  113 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12140968 ctttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 12140874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 207
Target Start/End: Original strand, 21894311 - 21894403
Alignment:
Q  115 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894311 ttttcaccacgagattatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21894403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29415058 - 29414914
Alignment:
Q  55 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    
T  29415058 tagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat-------------aa 29414972  T
Q  155 gctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414971 gctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29414914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7292688 - 7292539
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||       |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7292688 agcttatagcttataagctcgtcggataaaaaaagctctgtttgataacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttt 7292589  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7292588 tcataagctacttcaagtaacgtttgagcttatagcttatagcgtctcac 7292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Original strand, 23648201 - 23648338
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||  || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648201 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 23648300  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  23648301 tcagaagctatttcaagtagcttctgagcttatagctt 23648338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6104776 - 6104671
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  6104776 gctctgtttggtaatggtctttcaccacgagcttatagcttatttcgcgagcttataagctatttttcagatactatttcaagtagcgtttgagcttata 6104677  T
Q  197 gcttat 202  Q
    ||||||    
T  6104676 gcttat 6104671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15591228 - 15591148
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15591228 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataacttatagc 15591148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Original strand, 20563458 - 20563538
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  20563458 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcatctgagcttatagctt 20563538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 207
Target Start/End: Original strand, 9896766 - 9896857
Alignment:
Q  116 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9896766 tttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagttaatagcttatagctt 9896857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 1225475 - 1225573
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  1225475 tctgtttgataacactttttcatcaagagcttatattttatttcacaagtttataagctattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatag 1225573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5893981 - 5893894
Alignment:
Q  115 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5893981 ttttcaccacaagcttttagcttattttactagcttataacttattttccagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 5893894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 26561419 - 26561487
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagctt 193  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  26561419 gagcttatagtttatttcaggagcttataacttatttttcaaacgctatttcaagtagcgtttgagctt 26561487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 19415351 - 19415432
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19415351 agcttatagcgtttttcacgagcttgttgcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttacagctt 19415432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32563321 - 32563242
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatag 204  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  32563321 gagcttataacttatttcagaagcttataatttatttttcagacgctatttcaaatagtgtttgagattataacttatag 32563242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Original strand, 11443033 - 11443086
Alignment:
Q  143 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  11443033 acgagcttataacctattttccagactctatttcaagtagcgtttgagcttata 11443086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 22559 - 22751
Alignment:
Q  20 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  22559 aagggtctgtttggttaacccgaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 22658  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22659 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 22751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 126936 - 126750
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  126936 tctgtttggttaacccaagaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 126838  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  126837 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgcttgagcttatagcttatagcttctcac 126750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12900 - 12707
Alignment:
Q  19 aaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  12900 aaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 12801  T
Q  119 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12800 caccatgagcttatagcttatttgacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagcttctcac 12707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 28
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  214 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 115  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 7027 - 7213
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  7027 tctgtttggttaacctcaaaaag-agcttttagtttttagcttatagcttttaagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccat 7125  T
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7126 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27312 - 27159
Alignment:
Q  25 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27312 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaataaagctatgtttggtaacactttttcacca 27213  T
Q  124 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattcca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27212 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattcca 27159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 431265 - 431414
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431265 agcttttagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 431364  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431365 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 119340 - 119238
Alignment:
Q  101 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  119340 tgtttagtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatcctattccaagtagagtttgagcttatagctt 119241  T
Q  201 ata 203  Q
    |||    
T  119240 ata 119238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 63887 - 64000
Alignment:
Q  99 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  63887 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 63986  T
Q  199 ttatagcttctcac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  63987 ttatagcttctcac 64000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28269 - 28066
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttt 117  Q
    |||||| |||||||||| |  | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  28269 caaagggtctgtttggtaacactcaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttt 28170  T
Q  118 tcaccatgagcttatagcttat---------ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28169 tcaccatgagcttatagcttataagctatttttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttc 28070  T
Q  209 tcac 212  Q
    ||||    
T  28069 tcac 28066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30323 - 30179
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323 agcttttagtttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 30224  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30223 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 192013 - 192164
Alignment:
Q  56 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  192013 agcttatagcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 192112  T
Q  156 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  192113 ctatttttgagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 192164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 93525 - 93376
Alignment:
Q  63 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93525 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttaaaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 93426  T
Q  163 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93425 tcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 93376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 84325 - 84402
Alignment:
Q  125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  84325 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 84402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 53126 - 53023
Alignment:
Q  97 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53126 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcctatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 53027  T
Q  197 gctt 200  Q
    ||||    
T  53026 gctt 53023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Original strand, 5451 - 5552
Alignment:
Q  98 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatag 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5451 ctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata-cttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 5549  T
Q  198 ctt 200  Q
    |||    
T  5550 ctt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 36317 - 36387
Alignment:
Q  18 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36317 caaaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 36387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41898 - 41755
Alignment:
Q  49 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  41898 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagct------------------- 41818  T
Q  149 ttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41817 -tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 41755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 72847 - 72760
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  72847 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 72760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4636
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4562 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 9294 - 9376
Alignment:
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 202  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  9294 accacgagctcatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10914
Alignment:
Q  126 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||    
T  10833 agcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgagcttacggtttatagctt 10914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9143 - 8997
Alignment:
Q  21 aggctctgtttggttaaccccaaaaagt-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 119  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||    |||||    
T  9143 aggctctgtttggt-aagaccaaaaagttagcttatagcttatagcggatagcttataagcttatttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgggttttc 9045  T
Q  120 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 167  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9044 accacgagcttatagtttatttcacaagtttataagctatttttcaga 8997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1240
Alignment:
Q  146 agcttataagctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttatagctt 207  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1301 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagctt 1240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University