View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12968_low_20 (Length: 359)

Name: NF12968_low_20
Description: NF12968
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12968_low_20
NF12968_low_20
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (9-191)||(32741169-32741351)
chr6 (9-190)||(29518494-29518675)
chr6 (9-189)||(29518912-29519092)
chr6 (21-189)||(2378118-2378286)
chr6 (33-189)||(3409251-3409407)
chr6 (23-189)||(35210196-35210362)
chr6 (194-348)||(2102659-2102812)
chr6 (1-175)||(16454913-16455087)
chr6 (22-189)||(3409652-3409819)
chr6 (13-189)||(14748332-14748504)
chr6 (1-179)||(2578421-2578598)
chr6 (12-189)||(3415450-3415629)
chr6 (21-188)||(1846741-1846908)
chr6 (22-189)||(3058218-3058385)
chr6 (23-181)||(2579872-2580030)
chr6 (1-179)||(16454577-16454755)
chr6 (21-179)||(2377756-2377914)
chr6 (33-189)||(26544041-26544197)
chr6 (1-175)||(2843560-2843735)
chr6 (32-179)||(16107680-16107827)
chr6 (12-181)||(10074352-10074521)
chr6 (23-190)||(1127351-1127518)
chr6 (10-181)||(593694-593867)
chr6 (23-181)||(10073991-10074149)
chr6 (7-180)||(2578819-2578991)
chr6 (2-179)||(5832007-5832182)
chr6 (10-176)||(2579479-2579645)
chr6 (25-181)||(10073618-10073772)
chr6 (38-178)||(1950200-1950340)
chr6 (26-178)||(6999799-6999951)
chr6 (1-179)||(2579088-2579261)
chr6 (73-176)||(32460630-32460733)
chr6 (27-181)||(10911565-10911720)
chr6 (24-179)||(16108065-16108208)
chr6 (56-175)||(9062383-9062501)
chr6 (7-181)||(12071675-12071849)
chr6 (23-181)||(12092482-12092640)
chr6 (29-186)||(5958613-5958766)
chr6 (7-181)||(12085018-12085191)
chr6 (56-181)||(6071132-6071257)
chr6 (62-181)||(8481927-8482045)
chr6 (22-177)||(17135068-17135223)
chr6 (26-181)||(31714671-31714823)
chr6 (65-166)||(2975567-2975668)
chr6 (108-161)||(35210498-35210551)
chr6 (30-77)||(3409405-3409452)
chr6 (69-113)||(22605301-22605345)
chr6 (62-113)||(11637760-11637811)
chr6 (98-144)||(14789279-14789325)
chr6 (1-53)||(2975033-2975085)
chr6 (69-113)||(21130103-21130147)
chr6 (40-174)||(30618634-30618766)
chr6 (31-89)||(10902438-10902496)
chr6 (63-105)||(11638053-11638095)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (13-189)||(44290814-44290991)
chr1 (13-189)||(44290448-44290624)
chr1 (23-190)||(3537599-3537766)
chr1 (23-191)||(41759473-41759641)
chr1 (11-179)||(17294579-17294748)
chr1 (21-181)||(41142372-41142533)
chr1 (26-189)||(48588491-48588654)
chr1 (27-190)||(3550711-3550871)
chr1 (22-179)||(26661521-26661678)
chr1 (24-181)||(41157375-41157532)
chr1 (22-181)||(41156991-41157150)
chr1 (21-173)||(14318875-14319027)
chr1 (1-181)||(31767139-31767319)
chr1 (13-181)||(34364507-34364675)
chr1 (1-189)||(50052002-50052189)
chr1 (13-180)||(40082408-40082574)
chr1 (21-179)||(11977282-11977440)
chr1 (31-181)||(34364925-34365075)
chr1 (32-179)||(37556113-37556260)
chr1 (22-181)||(29798199-29798358)
chr1 (7-181)||(3875315-3875489)
chr1 (21-179)||(34649440-34649598)
chr1 (54-187)||(32594747-32594880)
chr1 (1-181)||(45084382-45084556)
chr1 (1-181)||(37850579-37850758)
chr1 (23-189)||(32168698-32168853)
chr1 (22-189)||(45493973-45494145)
chr1 (23-181)||(5319965-5320123)
chr1 (38-184)||(38804370-38804516)
chr1 (12-181)||(22077484-22077653)
chr1 (23-177)||(9955911-9956067)
chr1 (2-179)||(26661877-26662054)
chr1 (1-181)||(66450-66630)
chr1 (32-178)||(37555733-37555878)
chr1 (21-181)||(24600312-24600472)
chr1 (22-181)||(39066200-39066358)
chr1 (1-181)||(41184384-41184583)
chr1 (102-189)||(3537226-3537313)
chr1 (1-181)||(24131966-24132143)
chr1 (61-189)||(44043810-44043943)
chr1 (22-175)||(5575110-5575261)
chr1 (22-156)||(22077109-22077243)
chr1 (12-181)||(66078-66247)
chr1 (31-171)||(5528762-5528902)
chr1 (12-181)||(22077818-22077986)
chr1 (29-180)||(22793279-22793431)
chr1 (2-181)||(19283434-19283613)
chr1 (33-179)||(45839629-45839779)
chr1 (33-181)||(30630648-30630796)
chr1 (15-110)||(11977015-11977110)
chr1 (33-181)||(44685456-44685605)
chr1 (13-181)||(21378049-21378199)
chr1 (1-111)||(50051667-50051776)
chr1 (7-181)||(1188571-1188746)
chr1 (34-154)||(4956218-4956340)
chr1 (63-139)||(10351202-10351278)
chr1 (63-181)||(1187404-1187522)
chr1 (24-166)||(44091909-44092051)
chr1 (149-189)||(50051777-50051817)
chr1 (134-181)||(35154150-35154197)
chr1 (122-181)||(50469180-50469239)
chr1 (115-181)||(4878803-4878869)
chr1 (87-132)||(41184152-41184197)
chr1 (23-82)||(4266798-4266855)
chr1 (66-126)||(35154046-35154106)
chr1 (116-189)||(4266875-4266948)
chr1 (63-99)||(12466365-12466401)
chr1 (149-181)||(22077248-22077280)
chr1 (113-172)||(30630912-30630972)
chr1 (129-181)||(47379891-47379943)
chr1 (23-110)||(47380167-47380254)
chr1 (23-181)||(5996872-5997029)
chr1 (62-108)||(9956212-9956258)
chr1 (24-140)||(9499020-9499136)
chr1 (63-99)||(31973375-31973411)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (14-189)||(36178596-36178771)
chr2 (1-189)||(5542603-5542791)
chr2 (25-189)||(37106180-37106344)
chr2 (12-191)||(37105914-37106093)
chr2 (13-189)||(14745657-14745833)
chr2 (1-179)||(6421387-6421565)
chr2 (1-189)||(5542976-5543164)
chr2 (10-189)||(41283462-41283641)
chr2 (15-179)||(15880265-15880429)
chr2 (1-181)||(962598-962777)
chr2 (1-181)||(42514649-42514829)
chr2 (1-163)||(36178149-36178311)
chr2 (22-181)||(35580723-35580881)
chr2 (1-179)||(6712978-6713158)
chr2 (23-174)||(15511495-15511646)
chr2 (13-179)||(36005870-36006035)
chr2 (22-165)||(6422126-6422269)
chr2 (25-176)||(33731653-33731804)
chr2 (30-189)||(14745300-14745460)
chr2 (24-181)||(38796619-38796778)
chr2 (1-168)||(23346250-23346416)
chr2 (26-181)||(40679632-40679787)
chr2 (221-348)||(39182901-39183028)
chr2 (22-179)||(40733519-40733676)
chr2 (33-189)||(1769884-1770040)
chr2 (42-177)||(28254258-28254391)
chr2 (25-181)||(28531316-28531472)
chr2 (28-181)||(37632602-37632755)
chr2 (1-181)||(7598228-7598408)
chr2 (74-189)||(36178320-36178435)
chr2 (28-189)||(7598601-7598754)
chr2 (37-179)||(5367457-5367599)
chr2 (1-119)||(6421793-6421911)
chr2 (13-170)||(40163362-40163520)
chr2 (22-179)||(40733885-40734041)
chr2 (24-181)||(29676903-29677065)
chr2 (33-181)||(12529038-12529186)
chr2 (74-181)||(16542449-16542556)
chr2 (23-173)||(29676543-29676687)
chr2 (73-181)||(31468800-31468904)
chr2 (10-181)||(16590888-16591054)
chr2 (22-179)||(29874022-29874179)
chr2 (93-178)||(31899496-31899581)
chr2 (1-181)||(30313178-30313357)
chr2 (13-127)||(3673122-3673236)
chr2 (69-173)||(37895107-37895211)
chr2 (65-178)||(31259658-31259774)
chr2 (63-181)||(33561491-33561609)
chr2 (103-181)||(38796298-38796376)
chr2 (13-109)||(3672773-3672869)
chr2 (22-119)||(6421688-6421785)
chr2 (64-181)||(30323464-30323581)
chr2 (23-178)||(9231252-9231407)
chr2 (63-181)||(37894732-37894850)
chr2 (124-181)||(36785664-36785721)
chr2 (36-128)||(36784273-36784365)
chr2 (11-181)||(29873525-29873695)
chr2 (76-165)||(28254165-28254254)
chr2 (73-181)||(33953821-33953929)
chr2 (65-180)||(31385738-31385853)
chr2 (1-91)||(31899081-31899170)
chr2 (12-117)||(35580427-35580534)
chr2 (74-178)||(12910231-12910335)
chr2 (1-139)||(30312831-30312970)
chr2 (74-181)||(41678419-41678527)
chr2 (25-178)||(3594180-3594333)
chr2 (133-179)||(6421306-6421352)
chr2 (68-127)||(25390313-25390372)
chr2 (63-114)||(28226404-28226455)
chr2 (119-166)||(42515031-42515078)
chr2 (63-181)||(33954302-33954419)
chr2 (82-139)||(2336666-2336723)
chr2 (145-181)||(3673085-3673121)
chr2 (63-111)||(8904498-8904546)
chr2 (63-110)||(28226726-28226772)
chr2 (65-114)||(13792536-13792585)
chr2 (145-181)||(3672719-3672755)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-189)||(3669679-3669867)
chr8 (27-189)||(3670052-3670214)
chr8 (1-189)||(30441073-30441265)
chr8 (14-179)||(3038281-3038446)
chr8 (13-191)||(1014234-1014413)
chr8 (13-179)||(34835211-34835377)
chr8 (14-179)||(34834878-34835043)
chr8 (1-190)||(20870551-20870742)
chr8 (33-181)||(45122067-45122215)
chr8 (31-189)||(1013879-1014037)
chr8 (1-179)||(37544469-37544646)
chr8 (13-181)||(6876852-6877021)
chr8 (13-179)||(40518071-40518239)
chr8 (22-178)||(147454-147610)
chr8 (27-174)||(9482608-9482755)
chr8 (10-156)||(9483174-9483320)
chr8 (23-181)||(9608745-9608903)
chr8 (13-181)||(9309355-9309522)
chr8 (1-171)||(18371971-18372142)
chr8 (24-179)||(33113368-33113523)
chr8 (13-179)||(34835476-34835643)
chr8 (13-179)||(34835742-34835909)
chr8 (10-179)||(30359273-30359443)
chr8 (25-179)||(40518584-40518738)
chr8 (11-181)||(45121898-45122068)
chr8 (22-179)||(1513914-1514071)
chr8 (23-179)||(25561815-25561972)
chr8 (22-167)||(45122638-45122783)
chr8 (7-187)||(40579490-40579670)
chr8 (23-181)||(5915872-5916025)
chr8 (27-179)||(30359611-30359763)
chr8 (21-174)||(70272-70425)
chr8 (22-181)||(45123006-45123165)
chr8 (31-189)||(6731896-6732045)
chr8 (23-181)||(8918764-8918922)
chr8 (21-181)||(41972158-41972321)
chr8 (25-181)||(5420651-5420807)
chr8 (1-174)||(18371638-18371807)
chr8 (13-181)||(9308977-9309149)
chr8 (24-177)||(18380020-18380171)
chr8 (30-179)||(45121663-45121811)
chr8 (22-174)||(6651510-6651653)
chr8 (7-178)||(32640515-32640682)
chr8 (22-187)||(32305478-32305636)
chr8 (33-181)||(147829-147968)
chr8 (12-106)||(40579258-40579352)
chr8 (33-181)||(4154678-4154824)
chr8 (103-191)||(41416251-41416337)
chr8 (30-181)||(9507777-9507933)
chr8 (44-158)||(9609108-9609222)
chr8 (68-178)||(43274824-43274934)
chr8 (1-181)||(9620656-9620834)
chr8 (63-179)||(8794113-8794229)
chr8 (77-177)||(18372988-18373085)
chr8 (109-178)||(18372785-18372854)
chr8 (73-179)||(18372656-18372758)
chr8 (8-103)||(41129066-41129161)
chr8 (32-177)||(43398077-43398225)
chr8 (22-99)||(8919143-8919220)
chr8 (32-181)||(12283873-12284021)
chr8 (109-178)||(18372342-18372411)
chr8 (91-178)||(3037776-3037865)
chr8 (108-171)||(25561729-25561792)
chr8 (63-181)||(4154321-4154438)
chr8 (76-176)||(20130454-20130553)
chr8 (14-87)||(43274626-43274699)
chr8 (2-81)||(18372262-18372342)
chr8 (55-181)||(5274775-5274901)
chr8 (1-104)||(20995394-20995497)
chr8 (13-70)||(3037959-3038016)
chr8 (137-178)||(18372485-18372526)
chr8 (89-145)||(18373236-18373292)
chr8 (82-178)||(40991756-40991852)
chr8 (43-100)||(16524446-16524503)
chr8 (73-110)||(12156708-12156745)
chr8 (124-181)||(20995502-20995559)
chr8 (104-181)||(33831978-33832055)
chr8 (63-127)||(40417756-40417820)
chr8 (82-123)||(11442911-11442952)
chr8 (13-45)||(3038042-3038074)
chr8 (149-181)||(18645713-18645745)
chr8 (30-86)||(34629708-34629764)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (10-189)||(6500443-6500621)
chr5 (1-181)||(40296293-40296473)
chr5 (1-190)||(27502014-27502203)
chr5 (1-181)||(3294993-3295172)
chr5 (10-189)||(6500815-6500993)
chr5 (1-178)||(3295323-3295498)
chr5 (13-181)||(15370099-15370267)
chr5 (27-191)||(18603124-18603288)
chr5 (1-189)||(32487386-32487573)
chr5 (22-188)||(41170627-41170793)
chr5 (13-189)||(624188-624364)
chr5 (24-184)||(36492218-36492378)
chr5 (37-181)||(13415774-13415918)
chr5 (10-178)||(25327938-25328106)
chr5 (13-179)||(42405588-42405752)
chr5 (22-181)||(41632782-41632941)
chr5 (7-180)||(299490-299664)
chr5 (2-189)||(9498634-9498820)
chr5 (16-174)||(11416970-11417128)
chr5 (10-179)||(1028504-1028673)
chr5 (11-179)||(6224198-6224366)
chr5 (27-171)||(34753029-34753173)
chr5 (10-181)||(36568556-36568725)
chr5 (22-181)||(12662651-12662810)
chr5 (32-179)||(26074614-26074761)
chr5 (15-191)||(623808-623984)
chr5 (30-179)||(26075168-26075318)
chr5 (32-181)||(26074155-26074304)
chr5 (8-155)||(15370428-15370575)
chr5 (27-169)||(33747783-33747925)
chr5 (23-181)||(35150007-35150164)
chr5 (43-191)||(5723811-5723959)
chr5 (24-179)||(24489207-24489360)
chr5 (46-184)||(29549278-29549416)
chr5 (31-176)||(38427553-38427697)
chr5 (60-179)||(26074818-26074938)
chr5 (1-179)||(300961-301131)
chr5 (22-181)||(26590909-26591068)
chr5 (22-179)||(35167837-35167994)
chr5 (12-178)||(2411010-2411176)
chr5 (106-191)||(7768840-7768925)
chr5 (1-178)||(35914852-35915028)
chr5 (73-180)||(36521946-36522053)
chr5 (13-95)||(26900007-26900089)
chr5 (52-178)||(36522266-36522392)
chr5 (86-179)||(42508614-42508707)
chr5 (101-179)||(26074320-26074398)
chr5 (1-94)||(38427306-38427400)
chr5 (63-181)||(31509623-31509742)
chr5 (1-178)||(41635171-41635346)
chr5 (49-167)||(31509745-31509864)
chr5 (45-97)||(795254-795306)
chr5 (63-114)||(13042606-13042657)
chr5 (100-179)||(39309686-39309764)
chr5 (63-179)||(13786041-13786157)
chr5 (86-179)||(42524719-42524811)
chr5 (23-123)||(13785632-13785732)
chr5 (63-123)||(32445943-32446003)
chr5 (43-110)||(9498343-9498410)
chr5 (67-114)||(13112604-13112651)
chr5 (45-124)||(36527117-36527196)
chr5 (121-178)||(6225047-6225104)
chr5 (141-189)||(5660290-5660338)
chr5 (56-144)||(19275566-19275653)
chr5 (27-79)||(24489583-24489635)
chr5 (63-101)||(13042784-13042822)
chr5 (63-101)||(13112782-13112820)
chr5 (139-181)||(35150747-35150789)
chr5 (139-181)||(35151038-35151080)
chr5 (132-190)||(22298956-22299015)
chr5 (63-114)||(36389016-36389067)
chr5 (69-99)||(5963765-5963795)
chr5 (25-123)||(42435486-42435583)
chr5 (69-110)||(34103625-34103666)
chr5 (146-178)||(13785732-13785764)
chr5 (69-113)||(41341523-41341567)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (1-181)||(1085594-1085774)
chr7 (1-189)||(37532989-37533176)
chr7 (1-189)||(37533342-37533530)
chr7 (14-181)||(23368-23535)
chr7 (13-174)||(11845198-11845359)
chr7 (10-181)||(7517580-7517751)
chr7 (12-179)||(30244272-30244439)
chr7 (10-181)||(22567026-22567196)
chr7 (26-187)||(29157559-29157720)
chr7 (21-181)||(40094772-40094932)
chr7 (11-179)||(45433243-45433411)
chr7 (16-179)||(6054562-6054725)
chr7 (31-181)||(36939741-36939891)
chr7 (1-179)||(30245079-30245253)
chr7 (22-181)||(24177435-24177594)
chr7 (1-175)||(34218012-34218186)
chr7 (14-179)||(45434638-45434803)
chr7 (55-181)||(7554025-7554151)
chr7 (1-179)||(47129097-47129274)
chr7 (34-179)||(45754718-45754862)
chr7 (26-189)||(14681502-14681663)
chr7 (33-173)||(19122740-19122879)
chr7 (13-176)||(30032572-30032735)
chr7 (10-181)||(8128428-8128599)
chr7 (1-181)||(36622960-36623140)
chr7 (62-181)||(22566702-22566820)
chr7 (23-181)||(118299-118459)
chr7 (25-178)||(9901648-9901799)
chr7 (61-181)||(16569196-16569316)
chr7 (61-181)||(16596346-16596466)
chr7 (13-160)||(37167808-37167949)
chr7 (22-181)||(40230290-40230449)
chr7 (22-181)||(41854635-41854793)
chr7 (46-178)||(24838724-24838857)
chr7 (2-139)||(30253534-30253667)
chr7 (55-181)||(1085280-1085407)
chr7 (26-178)||(20599317-20599471)
chr7 (1-100)||(47129450-47129548)
chr7 (32-181)||(36534795-36534942)
chr7 (1-93)||(37532729-37532821)
chr7 (60-181)||(43241495-43241616)
chr7 (29-178)||(41910592-41910749)
chr7 (25-135)||(28300255-28300366)
chr7 (93-181)||(28301613-28301701)
chr7 (108-181)||(30245494-30245567)
chr7 (108-181)||(30255339-30255412)
chr7 (111-181)||(30244701-30244771)
chr7 (113-181)||(36109007-36109075)
chr7 (24-98)||(28300569-28300644)
chr7 (76-176)||(44361517-44361616)
chr7 (63-114)||(21416181-21416232)
chr7 (1-80)||(30244453-30244532)
chr7 (1-80)||(30253671-30253750)
chr7 (64-112)||(23569043-23569091)
chr7 (1-80)||(30245256-30245335)
chr7 (63-181)||(4124128-4124246)
chr7 (144-187)||(14681281-14681324)
chr7 (131-181)||(40094502-40094552)
chr7 (69-114)||(21619091-21619136)
chr7 (34-113)||(40094424-40094503)
chr7 (32-86)||(4719305-4719359)
chr7 (129-179)||(36967335-36967385)
chr7 (36-98)||(45755010-45755072)
chr7 (2-139)||(15902342-15902478)
chr7 (63-181)||(37345916-37346036)
chr7 (21-126)||(37393114-37393218)
chr7 (69-113)||(27391815-27391859)
chr7 (1-60)||(5825563-5825621)
chr7 (74-114)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (10-189)||(50630740-50630919)
chr4 (22-191)||(55933121-55933290)
chr4 (21-190)||(41370348-41370517)
chr4 (13-181)||(25483336-25483504)
chr4 (10-179)||(36629239-36629408)
chr4 (2-181)||(44620660-44620838)
chr4 (21-184)||(50002423-50002586)
chr4 (13-181)||(54017583-54017751)
chr4 (33-181)||(52884695-52884844)
chr4 (13-181)||(3340807-3340975)
chr4 (7-179)||(39792842-39793014)
chr4 (11-181)||(10245920-10246089)
chr4 (24-181)||(1731646-1731803)
chr4 (10-179)||(39404020-39404189)
chr4 (33-166)||(54108928-54109060)
chr4 (1-181)||(36608637-36608817)
chr4 (24-179)||(39404400-39404555)
chr4 (1-172)||(44621011-44621179)
chr4 (1-181)||(22027937-22028117)
chr4 (23-179)||(36572021-36572177)
chr4 (22-181)||(22183261-22183420)
chr4 (40-181)||(4955332-4955473)
chr4 (1-172)||(44620362-44620530)
chr4 (1-181)||(49076808-49076986)
chr4 (61-189)||(49880152-49880280)
chr4 (21-171)||(54343004-54343147)
chr4 (24-179)||(34646648-34646803)
chr4 (24-178)||(50459724-50459878)
chr4 (13-162)||(54936215-54936363)
chr4 (10-181)||(2740700-2740869)
chr4 (33-181)||(52884887-52885038)
chr4 (1-175)||(20825842-20826017)
chr4 (30-181)||(32941128-32941279)
chr4 (21-163)||(18932745-18932887)
chr4 (22-181)||(22028366-22028527)
chr4 (23-178)||(49302907-49303064)
chr4 (28-175)||(20826223-20826370)
chr4 (23-180)||(16888814-16888971)
chr4 (26-181)||(4390102-4390257)
chr4 (13-180)||(16889524-16889691)
chr4 (22-182)||(54108537-54108695)
chr4 (13-181)||(49076439-49076604)
chr4 (1-181)||(34004561-34004739)
chr4 (55-166)||(45496820-45496931)
chr4 (23-181)||(3244449-3244607)
chr4 (72-181)||(2741071-2741180)
chr4 (22-127)||(23817678-23817783)
chr4 (63-179)||(41707503-41707618)
chr4 (58-189)||(6975489-6975620)
chr4 (10-141)||(43827480-43827610)
chr4 (22-181)||(3341128-3341287)
chr4 (27-179)||(43174508-43174661)
chr4 (35-179)||(19504707-19504842)
chr4 (29-130)||(31691203-31691306)
chr4 (1-181)||(51768036-51768216)
chr4 (10-181)||(54741165-54741334)
chr4 (24-179)||(45489331-45489485)
chr4 (13-135)||(18879852-18879974)
chr4 (21-181)||(3700365-3700517)
chr4 (22-181)||(28034229-28034388)
chr4 (73-168)||(54017750-54017845)
chr4 (44-179)||(40067045-40067181)
chr4 (21-160)||(48111694-48111833)
chr4 (22-159)||(3271806-3271948)
chr4 (129-191)||(50788087-50788149)
chr4 (63-176)||(760194-760306)
chr4 (92-181)||(10246347-10246436)
chr4 (40-139)||(15841383-15841482)
chr4 (115-173)||(44620304-44620362)
chr4 (13-89)||(43174233-43174309)
chr4 (25-156)||(39698944-39699077)
chr4 (115-181)||(44621426-44621492)
chr4 (49-178)||(34544107-34544239)
chr4 (22-175)||(45489711-45489864)
chr4 (7-67)||(11702281-11702341)
chr4 (49-181)||(23556890-23557022)
chr4 (63-114)||(11197293-11197344)
chr4 (115-179)||(44620946-44621011)
chr4 (1-118)||(11783529-11783646)
chr4 (93-181)||(11348396-11348484)
chr4 (63-175)||(15841023-15841134)
chr4 (63-114)||(10396198-10396249)
chr4 (63-114)||(10396483-10396534)
chr4 (32-71)||(19895406-19895445)
chr4 (27-101)||(41370738-41370812)
chr4 (62-114)||(922485-922537)
chr4 (74-113)||(1868119-1868158)
chr4 (65-123)||(11706584-11706641)
chr4 (69-115)||(51681604-51681650)
chr4 (152-189)||(18932887-18932924)
chr4 (27-68)||(23817457-23817498)
chr4 (67-127)||(2891864-2891924)
chr4 (133-181)||(45050601-45050649)
chr4 (12-56)||(45496675-45496719)
chr4 (63-114)||(11197003-11197054)
chr4 (158-189)||(18933103-18933134)
chr4 (83-126)||(45484774-45484817)
chr4 (63-137)||(31249896-31249970)
chr4 (63-105)||(41707279-41707321)
chr4 (65-103)||(50788034-50788072)
chr4 (140-181)||(11706636-11706677)
chr4 (85-118)||(29802604-29802637)
chr4 (144-189)||(41370693-41370738)
chr4 (63-99)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (22-189)||(22304561-22304728)
chr3 (8-179)||(43346775-43346947)
chr3 (22-179)||(35946524-35946681)
chr3 (10-179)||(37990626-37990795)
chr3 (1-181)||(32589704-32589883)
chr3 (11-181)||(29644890-29645060)
chr3 (12-181)||(42342377-42342546)
chr3 (22-181)||(12114561-12114720)
chr3 (24-179)||(37990978-37991133)
chr3 (25-181)||(15772854-15773010)
chr3 (1-181)||(29644559-29644739)
chr3 (22-181)||(33803251-33803410)
chr3 (32-190)||(39389061-39389219)
chr3 (13-179)||(52634678-52634843)
chr3 (31-189)||(39934963-39935123)
chr3 (13-181)||(54017806-54017974)
chr3 (22-181)||(25739424-25739583)
chr3 (22-181)||(54018197-54018356)
chr3 (26-179)||(32462903-32463057)
chr3 (22-181)||(41359764-41359919)
chr3 (7-179)||(25755396-25755568)
chr3 (25-181)||(42342092-42342248)
chr3 (22-181)||(21832344-21832501)
chr3 (1-181)||(15773192-15773374)
chr3 (22-191)||(50612446-50612620)
chr3 (40-189)||(4823647-4823796)
chr3 (22-179)||(22303954-22304104)
chr3 (1-179)||(3135432-3135617)
chr3 (49-174)||(3135099-3135224)
chr3 (23-181)||(31190017-31190167)
chr3 (21-181)||(53577364-53577524)
chr3 (26-181)||(45395656-45395811)
chr3 (10-181)||(1634302-1634473)
chr3 (1-179)||(32462537-32462715)
chr3 (34-181)||(39914252-39914399)
chr3 (23-179)||(45901715-45901872)
chr3 (22-180)||(53117974-53118131)
chr3 (23-181)||(8327904-8328066)
chr3 (31-179)||(49336694-49336843)
chr3 (22-181)||(44160546-44160702)
chr3 (30-181)||(9240149-9240300)
chr3 (21-189)||(37726496-37726656)
chr3 (26-123)||(22303662-22303759)
chr3 (10-179)||(33175646-33175820)
chr3 (15-178)||(11661954-11662117)
chr3 (27-189)||(51886553-51886709)
chr3 (28-171)||(42584829-42584970)
chr3 (49-181)||(47964544-47964676)
chr3 (57-155)||(33362327-33362425)
chr3 (22-107)||(41359490-41359575)
chr3 (74-189)||(3384317-3384432)
chr3 (126-189)||(22304238-22304301)
chr3 (1-181)||(39336209-39336387)
chr3 (89-178)||(7767380-7767469)
chr3 (22-111)||(54017547-54017636)
chr3 (22-181)||(47964914-47965073)
chr3 (63-179)||(11661537-11661638)
chr3 (73-178)||(46546375-46546480)
chr3 (125-181)||(43346650-43346706)
chr3 (22-72)||(22304302-22304352)
chr3 (55-139)||(39336002-39336086)
chr3 (71-131)||(52634990-52635050)
chr3 (10-77)||(8328374-8328441)
chr3 (34-139)||(12749211-12749316)
chr3 (63-179)||(25991405-25991521)
chr3 (63-114)||(53596027-53596078)
chr3 (63-114)||(53596342-53596393)
chr3 (14-101)||(43978856-43978947)
chr3 (69-126)||(17731950-17732007)
chr3 (69-126)||(19033181-19033238)
chr3 (49-178)||(25317161-25317290)
chr3 (1-53)||(9239941-9239993)
chr3 (63-114)||(53596542-53596593)
chr3 (67-114)||(48127859-48127906)
chr3 (22-99)||(7766782-7766857)
chr3 (149-181)||(12747878-12747910)
chr3 (69-113)||(16871005-16871049)
chr3 (69-113)||(17735037-17735081)
chr3 (69-113)||(19036306-19036350)
chr3 (11-50)||(41360125-41360164)
chr3 (69-114)||(16143505-16143550)
chr3 (69-110)||(16869843-16869884)
chr3 (115-176)||(36986040-36986101)
chr3 (115-176)||(37011479-37011540)
chr3 (82-118)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (21-179)||(512-670)
scaffold0702 (21-189)||(145-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (13-179)||(1096-1262)
scaffold0391 (1-134)||(1661-1802)
scaffold0391 (130-181)||(3092-3143)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (22-181)||(47360-47519)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (32-181)||(5396-5546)
scaffold0734 (32-181)||(5777-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (61-181)||(5357-5477)
scaffold0078 (30-181)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (65-181)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (104-179)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (49-179)||(39459-39588)
scaffold0113 (56-179)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (103-187)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (103-143)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32741351 - 32741169
Alignment:
Q  9 atgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32741351 atgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggttta 32741252  T
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741251 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 32741169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29518675 - 29518494
Alignment:
Q  9 atgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29518675 atgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggttta 29518576  T
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518575 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 29518494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29519092 - 29518912
Alignment:
Q  9 atgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29519092 atgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggttta 29518993  T
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518992 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2378286 - 2378118
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2378286 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctctta 2378187  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378186 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 2378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35210362 - 35210196
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35210362 ggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttact 35210263  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210262 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2102812 - 2102659
Alignment:
Q  194 acaatcaagagaggcaacaatttgacaaaacattttcttcattgtgtcaataaacaaaatagtccaaatgagacaaagtgtataccctaggaacatgttc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2102812 acaatcaagagaggcaacaatttgacaaa-cattttcttcattgtgtcaataaacaaaatagtccaaatgagacaaagtgtataccctaggaacatgttc 2102714  T
Q  294 aacacggacagacttgaagttactcttcagctccacagcctcattgcacaggttc 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2102713 aacacggacggacttgaagttactcttcagctccacagcctcattgcacaggttc 2102659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16455087 - 16454913
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455087 gttggattatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 16454988  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454987 taggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3409819 - 3409652
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409819 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 3409720  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409719 ttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 14748332 - 14748504
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14748332 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatggg 14748427  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748428 tcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2578421 - 2578598
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2578421 gttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcta 2578520  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578521 tgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415450
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaaca 3415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1846908 - 1846741
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1846908 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctctta 1846809  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846808 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3058385 - 3058218
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3058385 gggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatac 3058286  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058285 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580030
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttact 2579971  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579972 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16454755 - 16454577
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16454755 gttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaa 16454656  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454655 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2377914 - 2377756
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377914 cgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 2377815  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377814 cttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2843735 - 2843560
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843735 gttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 2843636  T
Q  101 tgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843635 tgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 10074352 - 10074521
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10074352 aggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 10074451  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074452 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127351
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaacaa 1127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593867
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 10073991 - 10074149
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073991 ggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 10074090  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074091 tataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 2578819 - 2578991
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2578819 tcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtt 2578918  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578919 tatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832182
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |    
T  5832007 ttgggtcatgaggggagc-ctggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-t 5832104  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832105 ggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 2579479 - 2579645
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  | || ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2579479 tgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 2579578  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579579 gggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 10073618 - 10073772
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10073618 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttactta 10073717  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073718 taaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  38 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  138 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2579088 - 2579261
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |    
T  2579088 gttgggtcatgaggggagctcgggg-accgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagtta 2579186  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579187 tgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  173 acac 176  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  127 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108065
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  56 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 155  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  156 tgtgggacatataactcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 12071675 - 12071849
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  12071675 tcatgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtt 12071774  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071775 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 12092482 - 12092640
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  12092482 ggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcact 12092581  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092582 tataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958766
Alignment:
Q  29 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 128  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcaca----caagagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacca 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 12085018 - 12085191
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    |||||||||||||   || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12085018 tcatgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttt 12085117  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085118 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6071257 - 6071132
Alignment:
Q  56 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 155  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||| | |    
T  6071257 acaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaa 6071158  T
Q  156 tgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6071157 tgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  62 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  162 acatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Original strand, 17135068 - 17135223
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||  ||||||| |    
T  17135068 gggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgc 17135167  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 177  Q
    ||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135168 ttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714671
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttat 31714726  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714725 ataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 164  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  165 ta 166  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  62 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  98 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2975085 - 2975033
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 53  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2975085 gttggatcatgagaggagcgcgtgggacctgccacatcgaggctagaacaacc 2975033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Original strand, 30618634 - 30618766
Alignment:
Q  40 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    |||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  30618634 aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcct 30618731  T
Q  140 ttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
      ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618732 ccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 89  Q
    |||||||| |||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 44290814 - 44290991
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290814 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 44290913  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290914 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 44290448 - 44290624
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290448 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 44290547  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290548 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 190
Target Start/End: Original strand, 3537599 - 3537766
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3537599 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttact 3537698  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  3537699 cataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaacaa 3537766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759473
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 41759473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17294748 - 17294579
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc-gcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294748 gaggggagctcgggcgaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 17294649  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294648 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41142533 - 41142372
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41142533 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttt 41142434  T
Q  120 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142433 acttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588654
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaaca 48588654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550711
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaacaa 3550711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 26661521 - 26661678
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26661521 gggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcac 26661620  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661621 ttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157375
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41157150 - 41156991
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41157150 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttac 41157051  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157050 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14319027 - 14318875
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  14319027 cgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttctta 14318928  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318927 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 31767139 - 31767319
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  31767139 gttgggtcatgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcat 31767238  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767239 taggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34364675 - 34364507
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  34364675 ggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacgga 34364576  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364575 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 50052002 - 50052189
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  50052002 gttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaa 50052100  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052101 taggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40082574 - 40082408
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  40082574 ggggagctcggaggactatccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-ga 40082476  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082475 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11977440 - 11977282
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  11977440 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctctta 11977341  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977340 cttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34365075 - 34364925
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34365075 tccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 34364976  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364975 gttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556113
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  132 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29798358 - 29798199
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29798358 gggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttac 29798259  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798258 ttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 3875315 - 3875489
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3875315 tcatgaggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtt 3875414  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875415 tatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34649598 - 34649440
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |    
T  34649598 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgca 34649499  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649498 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 187
Target Start/End: Original strand, 32594747 - 32594880
Alignment:
Q  54 gcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32594747 gcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatct 32594846  T
Q  154 gatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594847 gatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45084556 - 45084382
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |      
T  45084556 gttgggtcatgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg- 45084458  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084457 -----ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 37850579 - 37850758
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||     
T  37850579 gttggatcatgaggggagctagggg-accgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacat 37850677  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850678 taggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Original strand, 32168698 - 32168853
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        
T  32168698 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct---- 32168793  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168794 --taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 45493973 - 45494145
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45493973 gggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttac 45494072  T
Q  122 ttataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494073 ttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaaca 45494145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  38 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  138 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 184  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 22077484 - 22077653
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22077484 aggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgg 22077583  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077584 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9956067 - 9955911
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-atgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9956067 ggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttac 9955968  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955967 ttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 26661877 - 26662054
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| |||| ||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661877 ttgggtcacgaggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 26661976  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26661977 cggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 66450 - 66630
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |    
T  66450 gttgggtcatgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggcca 66549  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66550 tatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 24600312 - 24600472
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  24600312 cggggaactgtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctctta 24600411  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600412 cttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 39066200 - 39066358
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||     
T  39066200 gggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttag 39066298  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066299 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 41184384 - 41184583
Alignment:
Q  1 gttggatca-tgaggggagcgcggggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac---cacactcttacccaaaac----- 90  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||         
T  41184384 gttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaaccttaa 41184483  T
Q  91 ---------cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41184484 ggctgaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537313
Alignment:
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24131966 - 24132143
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| || | || || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  24131966 gttgggtcatgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaa 24132062  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132063 tgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043943
Alignment:
Q  61 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  155 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaaca 44043943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5575261 - 5575110
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  5575261 gggggacattccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttac 5575164  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575163 ttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 22077109 - 22077243
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22077109 gggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttac 22077208  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22077209 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 66078 - 66247
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  66078 aggggagctcgggggattgtctacatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgg 66175  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttc-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66176 gtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077986
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  29 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  128 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283613
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19283434 ttgggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgat 19283533  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283534 gagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  133 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630796
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11977110 - 11977015
Alignment:
Q  15 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977110 ggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgc-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  132 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 21378049 - 21378199
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||                  ||||||||||||    
T  21378049 ggggagcgcaggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta------------------tgggtttatggg 21378130  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378131 tcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 50051667 - 50051776
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  50051667 gttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacatcgatgctagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataa 50051765  T
Q  101 tgggtttatgg 111  Q
    |||||||||||    
T  50051766 tgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 1188571 - 1188746
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcg-ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 105  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||  |||||| |||  ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  1188571 tcatgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagt 1188670  T
Q  106 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188671 ttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  34 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccg 154  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 1187404 - 1187522
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||    
T  1187404 agagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgaga 1187503  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1187504 catataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 166  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051817
Alignment:
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50051817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 181
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  134 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469239
Alignment:
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 132
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  87 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctta 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 126
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  66 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  116 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 181
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 181
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 47380167 - 47380254
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||  ||||||| ||||| || |||||  |||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47380167 ggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 5996872 - 5997029
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||| | |||||||  ||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| | |    
T  5996872 ggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctcatt 5996970  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996971 tataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  62 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  124 ataaggtgttcaacctt 140  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 36178596 - 36178771
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178596 gggagcgcgggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 36178695  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178696 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaaca 36178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5542603 - 5542791
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5542603 gttggatcatggggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 5542702  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542703 taggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106180
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37106180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37106093 - 37105914
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37106093 aggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgg 37105994  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37105993 gtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacccacaaa 37105914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 14745657 - 14745833
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745657 ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 14745756  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745757 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6421565 - 6421387
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421565 gttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaa 6421466  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421465 tgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5542976 - 5543164
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5542976 gttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaa 5543075  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543076 taggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5543164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 41283462 - 41283641
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41283462 tgaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttat 41283561  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283562 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15880429 - 15880265
Alignment:
Q  15 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880429 ggagctcggaggaacgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 15880330  T
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880329 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 962777 - 962598
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  962777 gttggatcatg-ggggagttcgggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaa 962679  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962678 tgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42514829 - 42514649
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  42514829 gttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcga 42514730  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514729 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 36178149 - 36178311
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36178149 gttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaa 36178248  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 163  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178249 tgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 35580723 - 35580881
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35580723 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcac 35580821  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580822 ttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6713158 - 6712978
Alignment:
Q  1 gttggatca-tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggc 98  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6713158 gttggatcagtgagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagc 6713059  T
Q  99 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713058 aataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 36005870 - 36006035
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36005870 ggggagctcgagagactgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 36005969  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005970 tcctcttacttataaggtgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6422269 - 6422126
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6422269 gggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaa 6422170  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 165  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422169 ttataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745460
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgc-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaaca 14745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796778
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23346416 - 23346250
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23346416 gttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggcta 23346317  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 168  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346316 tgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679787
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 348
Target Start/End: Original strand, 39182901 - 39183028
Alignment:
Q  221 aaacattttcttcattgtgtcaataaacaaaatagtccaaatgagacaaagtgtataccctaggaacatgttcaacacggacagacttgaagttactctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  39182901 aaacattttcttcattgtgtcaacaaacaaaatagtccaaatgagacaaagtgtataccctaggaacatgttcgacactgactgacttgaagttactctt 39183000  T
Q  321 cagctccacagcctcattgcacaggttc 348  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  39183001 cagctccacagcctcattacaaaggttc 39183028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40733676 - 40733519
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40733676 gggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttac 40733577  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733576 ttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769884
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  42 gctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 141  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  142 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 177  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531472
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 37632602 - 37632755
Alignment:
Q  28 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37632602 ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataa 37632701  T
Q  128 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632702 aatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7598408 - 7598228
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  7598408 gttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggcta 7598309  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598308 tgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  174 cacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598601
Alignment:
Q  28 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  128 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaaca 7598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  37 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  137 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 6421812  T
Q  101 tgggtttatgggtcctctt 119  Q
    | |||||||||||||||||    
T  6421811 taggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 40163362 - 40163520
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg-caatgggtttatgg 111  Q
    ||||||| | || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||| ||||    
T  40163362 ggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgg 40163461  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163462 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40734041 - 40733885
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | ||||||||    
T  40734041 gggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttac 40733943  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733942 ttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676903
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 118  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  119 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  174 cacttgca 181  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  173 acacttgca 181  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16591054 - 16590888
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16591054 tgaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttat 16590955  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590954 gggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 29874022 - 29874179
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  29874022 gggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaa 29874121  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874122 ttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  93 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30313357 - 30313178
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30313357 gttgggtcacgaggagagcccgggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaa 30313258  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313257 tgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673122
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  3673236 ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgga 3673137  T
Q  113 tcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||||||||    
T  3673136 tcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 173
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  169 actca 173  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 178
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  162 acatataactcacactt 178  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  103 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3672869 - 3672773
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672869 ggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6421785 - 6421688
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 119  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421785 ggggtaccgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  64 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  164 atataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 181
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785721
Alignment:
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  36 atcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 128  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873695
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  || |||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  76 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 165  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  173 acacttgca 181  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31385853 - 31385738
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 164  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || || |||||||  |||     
T  31385853 agagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttctaaccgatgtcagact 31385754  T
Q  165 tataactcacacttgc 180  Q
    | ||||||||||||||    
T  31385753 tctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 31899081 - 31899170
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 91  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899081 gttggatcatgaggggagcttgggg-accgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Original strand, 35580427 - 35580534
Alignment:
Q  12 aggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35580427 aggggagctcgggggaaccgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagttta 35580525  T
Q  109 tgggtcctc 117  Q
    |||||||||    
T  35580526 tgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  174 cactt 178  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 30312970 - 30312831
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagca-agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    
T  30312970 gttgggtcacgaggggagctcgggggaccacccacattcaggccagagcaaccgcacaaattgagagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaa 30312871  T
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    ||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312870 ataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 181
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  172 cacacttgca 181  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || | ||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  68 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  119 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 33954302 - 33954419
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||  ||| || |||| |||||||||    
T  33954302 agagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtggga 33954400  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33954401 catataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  82 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  145 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  145 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3669867 - 3669679
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669867 gttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 3669768  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669767 tgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3669679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3670214 - 3670052
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3670214 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttata 3670115  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670114 aggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30441265 - 30441073
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441265 gttgggtcacgaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 30441166  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttactta----taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441165 tgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 30441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 3038281 - 3038446
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038281 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 3038380  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038381 ccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 1014234 - 1014413
Alignment:
Q  13 ggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||    
T  1014234 ggggagctcgggggaaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgg 1014333  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014334 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 1014413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835211
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34835043 - 34834878
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34835043 gggagcgcaagggatcatccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagt 34834944  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834943 catcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 20870551 - 20870742
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  20870551 gttgggtcatgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcag 20870650  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20870651 tgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaacaa 20870742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014037
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37544469 - 37544646
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37544469 gttgggtcatgaggggaactcgggg-atcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaa 37544567  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544568 tggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 6876852 - 6877021
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  6876852 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatggg 6876951  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 181  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876952 tcatcttatttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40518239 - 40518071
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40518239 ggggagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatggg 40518140  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518139 tccatttacttataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 147610 - 147454
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  147610 gggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttat 147511  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147510 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9608903 - 9608745
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  9608903 gggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttact 9608804  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608803 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9309522 - 9309355
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||    
T  9309522 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaaggg 9309424  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309423 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 18371971 - 18372142
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18371971 gttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagca 18372070  T
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372071 atgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835476
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835742
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30359443 - 30359273
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 108  Q
    |||||||||| || |||| || ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30359443 tgaggggagctcgagggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggttta 30359344  T
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359343 tgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 45121898 - 45122068
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45121898 gaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatg 45121997  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121998 agtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 1513914 - 1514071
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1513914 gggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttac 1514013  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514014 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 25561815 - 25561972
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25561815 ggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 25561914  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561915 ttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45122783 - 45122638
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45122783 gggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 45122684  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122683 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 40579490 - 40579670
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    ||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  40579490 tcatgtggggagcatggaggatcgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtt 40579589  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579590 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359611
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 70272 - 70425
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70272 cgggagaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctctta 70371  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70372 cttataagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45123165 - 45123006
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  45123165 gggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctt 45123066  T
Q  120 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123065 actta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731896
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||            
T  6732045 tccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact-------- 6731954  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6731953 -ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaaca 6731896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918922
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41972321 - 41972158
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 117  Q
    |||| ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  41972321 cgggagaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtccta 41972222  T
Q  118 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972221 tcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 18371638 - 18371807
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371638 gttgggtcatgaggagagctcgggggaaccgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 18371737  T
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
     |||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371738 -tgggtttatgggtcttcttacttaa----tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9309149 - 9308977
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9309149 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttat 9309051  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309050 gggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121811
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6651653 - 6651510
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||     
T  6651653 gggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta- 6651555  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
            | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6651554 --------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 32640515 - 32640682
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcggg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 105  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640515 tcatgaggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 32640614  T
Q  106 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||| ||||||||||| ||     ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640615 ttatcggtcctcttaccta-----tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32305636 - 32305478
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32305636 gggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttac 32305537  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305536 ttataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147829
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 40579258 - 40579352
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579258 aggggagctcgggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 4154678 - 4154824
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4154678 cacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgt 4154775  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154776 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416337
Alignment:
Q  103 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaacaaa 41416337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  130 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 181  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  44 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 143  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  144 tattttatccgatgt 158  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 178
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  68 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  168 aactcacactt 178  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 9620656 - 9620834
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||  ||||||||| || |||||||   |||| ||||||||||    
T  9620656 gttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaa 9620753  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620754 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  163 catataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 177
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  77 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  173 acacttg 179  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41129161 - 41129066
Alignment:
Q  8 catgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 103  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129161 catgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 128  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 177  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 8919143 - 8919220
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919143 gggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  109 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  91 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 178  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154438
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  4154420 catataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  76 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 43274626 - 43274699
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274626 gggagctcgggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 18372262 - 18372342
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt 81  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372262 ttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5274901 - 5274775
Alignment:
Q  55 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 154  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||||| |     
T  5274901 cacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattca 5274802  T
Q  155 atgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274801 atgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 20995394 - 20995497
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||  | ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20995394 gttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaa 20995493  T
Q  101 tggg 104  Q
    ||||    
T  20995494 tggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 3037959 - 3038016
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagac 70  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3037959 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  137 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  89 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 145  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  82 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  43 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 110
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 181
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  104 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 127
Target Start/End: Original strand, 40417756 - 40417820
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417756 agagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  82 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Original strand, 3038042 - 3038074
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggcta 45  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3038042 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggcta 3038074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 181
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 34629708 - 34629764
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccca 86  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  34629708 gtccacatcaaggccataactaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccca 34629764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6500621 - 6500443
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6500621 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaa 6500522  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500521 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 40296293 - 40296473
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40296293 gttgggtcatgagggaggcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaa 40296392  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296393 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27502014 - 27502203
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  27502014 gttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaa 27502113  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502114 taggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 27502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 3294993 - 3295172
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3294993 gttggatcatgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaa 3295092  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295093 tgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6500993 - 6500815
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6500993 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttat 6500894  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500893 gggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3295323 - 3295498
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3295323 gttggatcatgaggggagtgagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaa 3295421  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295422 ttggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15370267 - 15370099
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  15370267 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatggg 15370168  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370167 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603288
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaacaaa 18603288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32487573 - 32487386
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487573 gttgggtcatgggggaagcttgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaa 32487474  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487473 tgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41170793 - 41170627
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170793 gggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41170694  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170693 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 624364 - 624188
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  624364 ggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatggg 624265  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624264 tcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 624188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 184
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415918
Alignment:
Q  37 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  137 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25328106 - 25327938
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25328106 tgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttat 25328007  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328006 gggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 42405588 - 42405752
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  42405588 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgag 42405685  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405686 tccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41632941 - 41632782
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41632941 gggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttac 41632842  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632841 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 299664 - 299490
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgc-gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  299664 tcatgaggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagt 299565  T
Q  106 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299564 ttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 9498634 - 9498820
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9498634 ttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaat 9498732  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9498733 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaaca 9498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 11416970 - 11417128
Alignment:
Q  16 gagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11416970 gagcgagggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcc 11417069  T
Q  116 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417070 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 1028504 - 1028673
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||    
T  1028504 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttat 1028603  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028604 gggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6224366 - 6224198
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  6224366 gaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatg 6224267  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224266 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 36568556 - 36568725
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36568556 tgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttac 36568653  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568654 gggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 12662651 - 12662810
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||    
T  12662651 gggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttac 12662750  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662751 ttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074614
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 623984 - 623808
Alignment:
Q  15 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  623984 ggagctcgggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctc 623885  T
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623884 aacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 623808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074304
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15370575 - 15370428
Alignment:
Q  8 catgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 107  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15370575 catgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggttt 15370476  T
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370475 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 169  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35150164 - 35150007
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  35150164 ggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttact 35150066  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150065 tataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723959
Alignment:
Q  43 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  143 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 5723959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 24489207 - 24489360
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  24489207 gggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttacta 24489304  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489305 ataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 184
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  46 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 145  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  146 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 184  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074938
Alignment:
Q  60 gcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  159 gggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 301131 - 300961
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  301131 gttgggtcattaggggagttcggaggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaa 301032  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| ||        |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301031 tggatt--------ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 26590909 - 26591068
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  26590909 ggggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttac 26591008  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591009 ttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 35167837 - 35167994
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || |||    
T  35167837 gggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctac 35167936  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167937 ttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2411176 - 2411010
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |   |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2411176 aggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgg 2411077  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411076 gttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768840
Alignment:
Q  106 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaacaaa 7768840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35915028 - 35914852
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| | || ||| |  | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||    
T  35915028 gttgggtcatgagcggagct-gggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaa 35914930  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914929 tggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522053
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactc 36522045  T
Q  173 acacttgc 180  Q
    ||||||||    
T  36522046 acacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 95  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 178
Target Start/End: Original strand, 36522266 - 36522392
Alignment:
Q  52 ccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 151  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || |||    
T  36522266 ccgcacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctat 36522365  T
Q  152 ccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  36522366 ccaatgtgagacatataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  86 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38427400 - 38427306
Alignment:
Q  1 gttggatcat-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 94  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427400 gttggatcatcgaagggagctcgggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509623
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 161  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  162 acatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41635171 - 41635346
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||  || ||||||||  | | |||| |||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  41635171 gttggatcatgaggggagtgaggg--acagtccacattaaagatagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaa 41635268  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635269 tggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31509864 - 31509745
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 147  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  31509864 caaccgtacaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 31509765  T
Q  148 ttatccgatgtgggacatat 167  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  31509764 ctatccgatgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  45 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786157
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaa 13786139  T
Q  163 cat-ataactcacacttg 179  Q
    ||| || |||||||||||    
T  13786140 cataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  86 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 13785632 - 13785732
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  13785632 ggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattact 13785731  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  13785732 t 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  43 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  67 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  45 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  141 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  56 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 144  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactc 79  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  139 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  139 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299015
Alignment:
Q  132 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaacaa 22299015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 178
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785764
Alignment:
Q  146 ttttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacactt 13785764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 1085594 - 1085774
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085594 gttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 1085693  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085694 tgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 37532989 - 37533176
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37532989 gttgggtcacgatgggagcgcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaa 37533087  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533088 tgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37533176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 37533342 - 37533530
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533342 gttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 37533441  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533442 tggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 23368 - 23535
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23368 gggagctcgggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 23467  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23468 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11845359 - 11845198
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845359 ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatggg 11845260  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845259 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7517751 - 7517580
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517751 tgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 7517652  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517651 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30244439 - 30244272
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30244439 aggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatga 30244340  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244339 gtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 22567026 - 22567196
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22567026 tgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttat 22567125  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567126 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157559
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 40094772 - 40094932
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40094772 cgggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctctta 40094871  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094872 cttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433243
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6054725 - 6054562
Alignment:
Q  16 gagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6054725 gagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcc 6054626  T
Q  116 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054625 tcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30245253 - 30245079
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245253 gttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 30245158  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245157 tgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24177594 - 24177435
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24177594 gggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttac 24177495  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177494 ttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 34218012 - 34218186
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34218012 gttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaa 34218111  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218112 tgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45434803 - 45434638
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  45434803 gggagcgagggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggt 45434704  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434703 cctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7554151 - 7554025
Alignment:
Q  55 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554151 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 7554052  T
Q  155 atgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7554051 atgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47129274 - 47129097
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  47129274 gttggatcatgaggggagctcgggg-accgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcga 47129176  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129175 tgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  34 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 133  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  134 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681502
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 14681502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30032735 - 30032572
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  30032735 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatgga 30032636  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032635 tactcttacttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 8128428 - 8128599
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8128428 tgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttat 8128527  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128528 gggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622960
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtcatgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaa 36623041  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623040 tggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  62 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  162 acatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 118299 - 118459
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  118299 ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctctta 118398  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118399 cttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  61 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  161 gacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  61 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  161 gacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37167949 - 37167808
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  37167949 ggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatgga 37167850  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    ||||||||||       |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167849 tcctcttact------ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 40230290 - 40230449
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40230290 ggggaaccgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttac 40230389  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230390 ttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41854793 - 41854635
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| |    
T  41854793 gggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgc 41854694  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854693 ttataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 178
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  46 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  145 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 30253667 - 30253534
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30253667 ttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 30253572  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30253571 gagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  55 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 154  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  155 atgtgggacat-ataactcacacttgca 181  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 47129548 - 47129450
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129548 gttgggtcatgaggggagctcgggg-accgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 37532729 - 37532821
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532729 gttggatcacgaggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  60 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 159  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  160 ggacatataactcacacttgca 181  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  29 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 28300255 - 28300366
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28300255 ggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttactt 28300354  T
Q  124 ataaggtgttca 135  Q
    ||||||||||||    
T  28300355 ataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  93 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  108 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  76 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30244532 - 30244453
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 80  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244532 gttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30253750 - 30253671
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 80  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253750 gttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 112
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  64 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30245335 - 30245256
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 80  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245335 gttgggtcataaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  144 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  34 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccca 86  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  36 atcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 98  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15902478 - 15902342
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  15902478 ttgggtcacgaggggagtccgggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaac 15902380  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    | | ||||| ||  | | |||||||| |||||||||||    
T  15902379 gagcttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345916
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  163 c--atataactcacacttgca 181  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37393218 - 37393114
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||    
T  37393218 cgggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatctta 37393120  T
Q  121 cttata 126  Q
    ||||||    
T  37393119 cttata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 5825563 - 5825621
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaag 60  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5825563 gttgggtcatgaggg-agcttgggagaccgtccacatcaaggctagaacaaccgcacaag 5825621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 50630740 - 50630919
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630740 tgaggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 50630839  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50630840 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaaca 50630919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 55933121 - 55933290
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933121 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 55933220  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933221 ttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 55933290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41370517 - 41370348
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370517 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 41370418  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370417 cttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 41370348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25483504 - 25483336
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25483504 ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgga 25483405  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483404 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36629408 - 36629239
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36629408 tgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 36629309  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629308 gggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44620838 - 44620660
Alignment:
Q  2 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44620838 ttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat 44620739  T
Q  102 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620738 -ggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50002586 - 50002423
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50002586 cgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctctta 50002487  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 184  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002486 cttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017751
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54017682  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017683 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3340975 - 3340807
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3340975 ggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatggg 3340876  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340875 tcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 39792842 - 39793014
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39792842 tcatgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 39792941  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792942 tacggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10246089 - 10245920
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  10246089 gaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat- 10245991  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10245990 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39404189 - 39404020
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  39404189 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttat 39404090  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404089 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 36608637 - 36608817
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36608637 gttgggtcacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaa 36608736  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608737 tggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404400
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44621179 - 44621011
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44621179 gttggatcatgagaggagcg---gggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaa 44621083  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621082 tgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 22027937 - 22028117
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22027937 gttgggtcatgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaa 22028036  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028037 tatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 22183261 - 22183420
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22183261 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 22183360  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183361 ttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  40 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  140 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44620530 - 44620362
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620530 gttggatcatgagaggagcg---gggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaa 44620434  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620433 tgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 49076808 - 49076986
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  49076808 gttgggtcatgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggtta 49076906  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076907 tgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49880280 - 49880152
Alignment:
Q  61 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49880280 caagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgg 49880181  T
Q  161 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880180 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Original strand, 54343004 - 54343147
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  54343004 cgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctctta 54343096  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343097 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 54936363 - 54936215
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936363 ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54936265  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936264 tcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740700
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaacc--acaagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884887
Alignment:
Q  33 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20826017 - 20825842
Alignment:
Q  1 gttggatcat-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20826017 gttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggct 20825918  T
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825917 aaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Original strand, 18932745 - 18932887
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18932745 cgggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 18932844  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 163  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932845 tttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 22028366 - 22028527
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22028366 gggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttac 22028465  T
Q  122 ttataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028466 taataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49303064 - 49302907
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac- 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49303064 ggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 49302965  T
Q  122 -ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302964 tttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  28 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  128 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 16888814 - 16888971
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  16888814 ggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttact 16888913  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888914 tataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 16889524 - 16889691
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  16889524 ggggagctcgagggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaa 16889623  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889624 tcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54108695 - 54108537
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  54108695 gggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtcctttta 54108597  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108596 cttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 49076439 - 49076604
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  49076439 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttatagg 49076535  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076536 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 34004561 - 34004739
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  34004561 gttgggtcatgagaggagctcgggagaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aa 34004659  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004660 tgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45496931 - 45496820
Alignment:
Q  55 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45496931 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccg 45496832  T
Q  155 atgtgggacata 166  Q
    ||||||||||||    
T  45496831 atgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 3244449 - 3244607
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3244449 ggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 3244548  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244549 tataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  72 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  172 cacacttgca 181  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 23817678 - 23817783
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23817678 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttac 23817777  T
Q  122 ttataa 127  Q
    ||||||    
T  23817778 ttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  163 catataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  58 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  158 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43827610 - 43827480
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  43827610 tgagggaagctcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttat 43827512  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  43827511 gggtcctcttatttataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3341287 - 3341128
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  3341287 gggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttac 3341188  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341187 ttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43174661 - 43174508
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  43174661 accgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttata 43174562  T
Q  127 aggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174561 aggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  35 catcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  135 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  29 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  127 aggt 130  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 51768036 - 51768216
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  51768036 gttgggtcatgagggaagtttgggagaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaa 51768135  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768136 tgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 54741165 - 54741334
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    |||||||||| || |||||| || |||  ||||||||||||||  |||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||    
T  54741165 tgaggggagcccgagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtat 54741262  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741263 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489485
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18879974 - 18879852
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  18879974 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatagg 18879875  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttca 135  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  18879874 tcatcttacttataaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3700517 - 3700365
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| |||    
T  3700517 cgggagaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------cctttta 3700426  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700425 cttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28034388 - 28034229
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||    
T  28034388 gggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcac 28034289  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034288 ttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  44 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 142  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  143 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 48111694 - 48111833
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||    
T  48111694 cgggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtcctttta 48111793  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111794 cttataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3271948 - 3271806
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3271948 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  120 actt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 159  Q
    ||||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271848 acttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788149
Alignment:
Q  129 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacaaa 50788149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 760306 - 760194
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||    
T  760306 agagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtggga 760208  T
Q  163 catataactcacac 176  Q
    ||||||||||||||    
T  760207 catataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  92 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 139
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  40 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43174309 - 43174233
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174309 ggggagctcgggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699077
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| ||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 156  Q
    || ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34544239 - 34544107
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 147  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  34544239 caaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccactttt 34544140  T
Q  148 ttatccgatgtggg--acatataactcacactt 178  Q
     ||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  34544139 ctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Original strand, 45489711 - 45489864
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || ||||||    
T  45489711 gggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttac 45489810  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 175  Q
    ||||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489811 ttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 11702281 - 11702341
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 67  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11702281 tcatgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 148  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 11783529 - 11783646
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11783529 gttgggtcatgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaa 11783628  T
Q  101 tgggtttatgggtcctct 118  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  11783629 taggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  93 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 175
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  163 catataactcaca 175  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  62 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 18932887 - 18932924
Alignment:
Q  152 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18932887 ccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaaca 18932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 23817457 - 23817498
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23817457 accgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  67 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 45496719 - 45496675
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgca 56  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45496719 aggggagctcgagggaccgtctacatcgaggctagaacaaccgca 45496675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 189
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  158 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  83 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 137  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 103
Target Start/End: Original strand, 50788034 - 50788072
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 103  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788034 agagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  140 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  85 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370693
Alignment:
Q  144 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaaca 41370693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22304728 - 22304561
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304728 gggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttac 22304629  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304628 ttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaaca 22304561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 43346775 - 43346947
Alignment:
Q  8 catgaggggagcg-cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43346775 catgaggggagcttcggaggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 43346874  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346875 tatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35946681 - 35946524
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35946681 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 35946582  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946581 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 37990626 - 37990795
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37990626 tgaggagagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 37990725  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990726 gagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32589883 - 32589704
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32589883 gttggatcatgaagggagcgagggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaa 32589784  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589783 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 29644890 - 29645060
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29644890 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 29644989  T
Q  111 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644990 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 42342377 - 42342546
Alignment:
Q  12 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42342377 aggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgg 42342476  T
Q  112 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342477 gtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 12114561 - 12114720
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12114561 gggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttac 12114660  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114661 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 37990978 - 37991133
Alignment:
Q  24 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  37990978 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttactt 37991077  T
Q  124 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991078 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772854
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 15772911  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772910 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 29644559 - 29644739
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||   |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29644559 gttgggtcacgaggggagtttgggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaa 29644658  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644659 tgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 33803251 - 33803410
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33803251 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttac 33803350  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803351 ttatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389061
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  132 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 39389061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52634843 - 52634678
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634843 ggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 52634744  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634743 t-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935123
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaaca 39935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 54017806 - 54017974
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  54017806 ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgag 54017905  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017906 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 25739424 - 25739583
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  25739424 gggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttac 25739523  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739524 ttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 54018197 - 54018356
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  54018197 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttac 54018296  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018297 ttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  126 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 41359764 - 41359919
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359764 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41359863  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359864 ttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25755568 - 25755396
Alignment:
Q  7 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| ||    
T  25755568 tcatgaggggagttcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatt 25755469  T
Q  107 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755468 tatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342248
Alignment:
Q  25 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 21832344 - 21832501
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  21832344 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttac 21832441  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832442 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15773374 - 15773192
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 98  Q
    ||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15773374 gttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggc 15773275  T
Q  99 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773274 aatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 50612446 - 50612620
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcct 116  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| |||||    
T  50612446 gggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcct 50612545  T
Q  117 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612546 cttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 50612620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823647
Alignment:
Q  40 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  140 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaaca 4823647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 22303954 - 22304104
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22303954 gggggacaatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttac 22304053  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304054 ttataag-------acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3135432 - 3135617
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3135432 gttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaa 3135531  T
Q  101 tgggtttat--gggtcctcttac-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||  ||||||||||||     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135532 tgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31190167 - 31190017
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  31190167 ggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaact 31190076  T
Q  123 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190075 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 53577524 - 53577364
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  53577524 cgggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccactta 53577425  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
     || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577424 tttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 125  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 1634302 - 1634473
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1634302 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttat 1634400  T
Q  110 gggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634401 gggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 32462537 - 32462715
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32462537 gttggatcatgaggggagtttggggg-ccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaa 32462635  T
Q  101 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462636 taggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914252
Alignment:
Q  34 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  134 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45901872 - 45901715
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  45901872 ggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttact 45901773  T
Q  123 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901772 tataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Original strand, 53117974 - 53118131
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||    
T  53117974 gggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcac 53118072  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118073 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8328066 - 8327904
Alignment:
Q  23 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagca----agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  8328066 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctct 8327967  T
Q  119 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327966 tacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  31 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 44160546 - 44160702
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  44160546 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttat 44160642  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160643 ttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240149
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37726656 - 37726496
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||    
T  37726656 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctctta 37726565  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726564 cttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  26 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 33175646 - 33175820
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 107  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33175646 tgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagttt 33175745  T
Q  108 at---gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175746 attatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11662117 - 11661954
Alignment:
Q  15 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |     
T  11662117 ggagctcgtgggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgagg 11662019  T
Q  114 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11662018 cctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51886709 - 51886553
Alignment:
Q  27 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| | |||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51886709 accgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttacttata 51886616  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886615 tgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Original strand, 42584829 - 42584970
Alignment:
Q  28 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 127  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42584829 ccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T
Q  128 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 171  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584927 ggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 148  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 155
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  57 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 155  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 41359490 - 41359575
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41359490 gggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384432
Alignment:
Q  74 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  174 cacttgcaaaccaaca 189  Q
    | |||||| |||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaaca 3384432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304238
Alignment:
Q  126 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 22304238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 39336209 - 39336387
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgc-gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  39336209 gttggatcacgaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagca 39336305  T
Q  100 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336306 atgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  89 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Original strand, 54017547 - 54017636
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017547 gggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 47964914 - 47965073
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||| |  | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  47964914 gggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcac 47965013  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965014 ttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  163 catataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  73 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  173 acactt 178  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  125 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22304352 - 22304302
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304352 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 39336002 - 39336086
Alignment:
Q  55 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336002 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  71 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8328441 - 8328374
Alignment:
Q  10 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac 77  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328441 tgaggggagttcgtgggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  34 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 133  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  134 caacct 139  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  163 catataactcacacttg 179  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 43978856 - 43978947
Alignment:
Q  14 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 101  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978856 gggagctcgggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 148  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacactt 178  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9239993 - 9239941
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 53  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9239993 gttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacc 9239941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  63 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  67 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 7766782 - 7766857
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 99  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766782 gggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 181
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  149 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 50
Target Start/End: Original strand, 41360125 - 41360164
Alignment:
Q  11 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaaca 50  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41360125 gaggggagcccggggaaccgtccacatcgaggctagaaca 41360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  69 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  115 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 176  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 118
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  82 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 512 - 670
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512 cgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 611  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  612 cttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 145 - 308
Alignment:
Q  21 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||    
T  145 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctctta 239  T
Q  121 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  240 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1262
Alignment:
Q  13 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 112  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1096 ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 1195  T
Q  113 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1196 tcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1661 - 1802
Alignment:
Q  1 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcaca--------agcaagagagacaccacactcttacccaaaacct 92  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||         ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1661 gttgggtcacgaggggagctagggggactgcccacatcgaggctagaacaaccacacttgtgtgagagagagagagacaccacactcttaccaaaaacct 1760  T
Q  93 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1761 taaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 181
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47519 - 47360
Alignment:
Q  22 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47519 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttac 47420  T
Q  122 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47419 ttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 130  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5777
Alignment:
Q  32 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 126  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  127 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  61 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  161 gacatataactcacacttgca 181  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4982
Alignment:
Q  30 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  130 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 181  Q
    | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 181
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  65 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  163 catataactcacacttgca 181  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  104 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  49 caaccgcacaagcaagagagacacca-cactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  148 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 179  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39840
Alignment:
Q  56 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 155  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  156 tgtgggacatataactcacacttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  103 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 143
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  103 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 143  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University