View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12978_high_8 (Length: 576)

Name: NF12978_high_8
Description: NF12978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12978_high_8
NF12978_high_8
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (20-565)||(40794427-40794972)
chr2 (20-556)||(26620422-26620961)
chr2 (20-556)||(27687342-27687884)
chr2 (20-556)||(32236723-32237246)
chr2 (20-154)||(26265752-26265886)
chr2 (20-118)||(13065007-13065105)
chr2 (20-118)||(37870409-37870507)
chr2 (20-118)||(27424179-27424277)
chr2 (20-118)||(27439223-27439321)
chr2 (20-117)||(17632435-17632532)
chr2 (20-108)||(39885511-39885599)
chr2 (20-108)||(39901087-39901175)
chr2 (33-118)||(24045211-24045296)
chr2 (23-110)||(12650934-12651021)
chr2 (23-110)||(12665855-12665942)
chr2 (23-110)||(34306406-34306493)
chr2 (23-117)||(28269507-28269601)
chr2 (23-110)||(34263607-34263694)
chr2 (23-107)||(39757378-39757462)
chr2 (23-118)||(20831483-20831575)
chr2 (23-107)||(28877595-28877679)
chr2 (23-107)||(28892805-28892889)
chr2 (23-103)||(23121413-23121491)
chr2 (23-107)||(4727324-4727405)
chr2 (23-107)||(15713535-15713616)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (20-565)||(34271279-34271823)
chr4 (20-565)||(15196286-15196831)
chr4 (20-557)||(6557410-6557947)
chr4 (20-565)||(40464197-40464744)
chr4 (20-489)||(4865135-4865599)
chr4 (20-118)||(18027773-18027871)
chr4 (20-118)||(40562930-40563028)
chr4 (23-117)||(9247838-9247932)
chr4 (23-110)||(13441035-13441122)
chr4 (27-117)||(19639624-19639714)
chr4 (23-110)||(14657048-14657135)
chr4 (23-110)||(14675482-14675569)
chr4 (23-107)||(17009408-17009492)
chr4 (23-110)||(14658802-14658889)
chr4 (20-107)||(20308793-20308880)
chr4 (23-107)||(17023373-17023457)
chr4 (481-565)||(22728169-22728253)
chr4 (23-103)||(22111626-22111704)
chr4 (481-557)||(1642494-1642570)
chr4 (23-52)||(1662934-1662963)
chr4 (23-107)||(5317201-5317282)
chr4 (489-557)||(17086355-17086422)
chr4 (78-110)||(30278263-30278295)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (20-565)||(26826201-26826747)
chr3 (20-565)||(37184819-37185368)
chr3 (20-565)||(16419490-16420028)
chr3 (20-566)||(35566498-35567044)
chr3 (20-565)||(1733180-1733724)
chr3 (385-565)||(8105970-8106150)
chr3 (20-474)||(4786543-4786979)
chr3 (20-474)||(4801381-4801817)
chr3 (20-154)||(16063649-16063783)
chr3 (20-110)||(19928311-19928401)
chr3 (23-117)||(4882854-4882948)
chr3 (23-117)||(8279153-8279247)
chr3 (23-117)||(8307963-8308057)
chr3 (23-117)||(11261164-11261258)
chr3 (23-117)||(18046613-18046707)
chr3 (23-117)||(18062676-18062770)
chr3 (23-117)||(22641610-22641704)
chr3 (20-117)||(14451768-14451865)
chr3 (20-108)||(9530389-9530477)
chr3 (20-108)||(10414060-10414148)
chr3 (20-108)||(11811932-11812020)
chr3 (23-117)||(8226839-8226933)
chr3 (23-117)||(8291314-8291408)
chr3 (23-117)||(15730790-15730884)
chr3 (23-117)||(15745875-15745969)
chr3 (23-107)||(1999619-1999703)
chr3 (20-108)||(8346449-8346537)
chr3 (23-110)||(4684356-4684443)
chr3 (23-110)||(18002968-18003055)
chr3 (23-117)||(5647158-5647252)
chr3 (35-117)||(34799718-34799800)
chr3 (23-110)||(4694440-4694527)
chr3 (23-110)||(10600616-10600703)
chr3 (23-117)||(5662581-5662674)
chr3 (23-108)||(3392300-3392383)
chr3 (23-103)||(9722119-9722197)
chr3 (23-103)||(35876128-35876206)
chr3 (23-103)||(4445422-4445500)
chr3 (23-103)||(4449585-4449663)
chr3 (23-76)||(19273859-19273912)
chr3 (23-103)||(35891198-35891276)
chr3 (23-103)||(4888835-4888913)
chr3 (23-103)||(28012991-28013069)
chr3 (23-103)||(28359789-28359867)
chr3 (23-107)||(18326261-18326342)
chr3 (23-107)||(18341360-18341441)
chr3 (23-104)||(6187906-6187984)
chr3 (23-107)||(4717221-4717302)
chr3 (23-107)||(4732401-4732482)
chr3 (23-107)||(32964184-32964265)
chr3 (88-148)||(19704778-19704836)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (20-565)||(32058-32603)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (20-565)||(18429425-18429970)
chr7 (20-565)||(39862308-39862853)
chr7 (35-565)||(14225641-14226169)
chr7 (20-565)||(39150359-39150903)
chr7 (20-564)||(6178352-6178897)
chr7 (20-556)||(15918827-15919347)
chr7 (177-555)||(6223110-6223489)
chr7 (20-148)||(4948245-4948373)
chr7 (20-118)||(35971883-35971981)
chr7 (20-118)||(35993295-35993393)
chr7 (20-115)||(18623078-18623173)
chr7 (20-118)||(14929973-14930071)
chr7 (23-117)||(15353421-15353515)
chr7 (23-110)||(11361210-11361297)
chr7 (23-117)||(2149963-2150057)
chr7 (23-117)||(2165174-2165268)
chr7 (23-117)||(4186253-4186347)
chr7 (23-117)||(20592646-20592740)
chr7 (20-107)||(5802049-5802136)
chr7 (23-110)||(13736218-13736305)
chr7 (20-119)||(18459687-18459786)
chr7 (20-108)||(30308328-30308416)
chr7 (23-110)||(2968845-2968932)
chr7 (23-110)||(5246190-5246277)
chr7 (23-108)||(11414454-11414539)
chr7 (23-110)||(10921521-10921608)
chr7 (23-108)||(11429438-11429523)
chr7 (481-565)||(4054664-4054748)
chr7 (481-565)||(15478885-15478969)
chr7 (23-103)||(18539097-18539175)
chr7 (23-103)||(18549606-18549684)
chr7 (23-118)||(18626931-18627023)
chr7 (23-76)||(36879208-36879261)
chr7 (23-108)||(5123657-5123739)
chr7 (23-108)||(5158610-5158692)
chr7 (20-107)||(18137682-18137767)
chr7 (481-557)||(16440296-16440372)
chr7 (481-557)||(16455197-16455273)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (22-565)||(21645424-21645964)
chr1 (20-556)||(18597586-18598122)
chr1 (20-118)||(24654767-24654865)
chr1 (23-117)||(21481477-21481571)
chr1 (20-108)||(20321454-20321542)
chr1 (23-110)||(18293509-18293596)
chr1 (23-110)||(18289106-18289193)
chr1 (26-76)||(21505743-21505793)
chr1 (23-107)||(47662898-47662979)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (20-565)||(166188-166733)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (20-565)||(16263871-16264414)
chr8 (20-565)||(24461435-24461980)
chr8 (20-559)||(30367285-30367826)
chr8 (20-556)||(19650523-19651060)
chr8 (20-556)||(19661568-19662105)
chr8 (20-559)||(29036344-29036881)
chr8 (20-565)||(22142882-22143409)
chr8 (20-412)||(16272614-16273000)
chr8 (20-474)||(18800661-18801095)
chr8 (20-118)||(12480085-12480183)
chr8 (20-118)||(23079208-23079306)
chr8 (20-117)||(14552984-14553081)
chr8 (20-117)||(14573808-14573905)
chr8 (20-117)||(19698497-19698595)
chr8 (23-110)||(19906613-19906700)
chr8 (20-110)||(555503-555593)
chr8 (23-117)||(16254418-16254512)
chr8 (20-108)||(14359561-14359649)
chr8 (23-108)||(28262901-28262986)
chr8 (23-107)||(21337322-21337406)
chr8 (23-107)||(21377283-21377367)
chr8 (23-110)||(2141999-2142086)
chr8 (23-110)||(5516484-5516571)
chr8 (23-110)||(18786539-18786626)
chr8 (20-98)||(15210369-15210447)
chr8 (34-110)||(2126841-2126917)
chr8 (23-108)||(27598574-27598657)
chr8 (23-108)||(27613626-27613709)
chr8 (23-76)||(33242278-33242331)
chr8 (23-76)||(33271622-33271675)
chr8 (23-76)||(14025297-14025350)
chr8 (23-76)||(15324416-15324469)
chr8 (23-76)||(15504785-15504838)
chr8 (23-103)||(31339637-31339715)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (20-566)||(34497067-34497612)
chr5 (20-552)||(30913143-30913660)
chr5 (20-154)||(25504247-25504381)
chr5 (20-154)||(35871496-35871630)
chr5 (20-154)||(18083771-18083906)
chr5 (20-118)||(16682591-16682689)
chr5 (21-118)||(570884-570981)
chr5 (20-118)||(15494638-15494736)
chr5 (23-117)||(20193725-20193819)
chr5 (20-108)||(35396582-35396670)
chr5 (23-110)||(3943848-3943935)
chr5 (20-107)||(23722684-23722771)
chr5 (23-110)||(24692834-24692921)
chr5 (23-117)||(32449540-32449634)
chr5 (23-110)||(30930036-30930123)
chr5 (23-110)||(30956919-30957006)
chr5 (23-108)||(18061655-18061740)
chr5 (23-107)||(22445611-22445695)
chr5 (23-107)||(22347536-22347620)
chr5 (481-565)||(23901678-23901762)
chr5 (35-108)||(29882009-29882082)
chr5 (481-565)||(23887036-23887119)
chr5 (20-103)||(11545786-11545867)
chr5 (20-103)||(11559845-11559926)
chr5 (23-103)||(33772951-33773029)
chr5 (23-103)||(33787903-33787981)
chr5 (23-103)||(41301536-41301614)
chr5 (23-148)||(20580190-20580313)
chr5 (23-103)||(37650954-37651033)
chr5 (481-557)||(22269542-22269618)
chr5 (23-103)||(23430740-23430817)
chr5 (23-107)||(22988489-22988570)
chr5 (23-107)||(23003556-23003637)
chr5 (23-148)||(25195469-25195591)
chr5 (481-557)||(22898297-22898373)
chr5 (88-148)||(25210831-25210889)
chr5 (88-148)||(25274983-25275041)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (68-565)||(9521-10019)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (20-556)||(7584638-7585177)
chr6 (193-564)||(22480574-22480945)
chr6 (284-565)||(26502249-26502530)
chr6 (20-564)||(20216508-20217040)
chr6 (20-564)||(22110530-22111062)
chr6 (20-564)||(18939941-18940457)
chr6 (20-118)||(31541468-31541566)
chr6 (20-108)||(16561942-16562030)
chr6 (23-117)||(3043473-3043567)
chr6 (20-108)||(27646487-27646575)
chr6 (23-110)||(15402080-15402167)
chr6 (23-110)||(15413867-15413954)
chr6 (23-110)||(15429460-15429547)
chr6 (23-118)||(22923858-22923953)
chr6 (23-118)||(22939570-22939665)
chr6 (23-118)||(23862015-23862110)
chr6 (20-107)||(26995418-26995505)
chr6 (20-107)||(27029740-27029827)
chr6 (20-117)||(24852081-24852179)
chr6 (20-117)||(24874107-24874205)
chr6 (23-117)||(34471391-34471485)
chr6 (23-110)||(18815035-18815122)
chr6 (23-110)||(19900609-19900696)
chr6 (24-107)||(26984518-26984601)
chr6 (24-107)||(27035581-27035664)
chr6 (462-564)||(27365917-27366019)
chr6 (462-564)||(27456264-27456366)
chr6 (23-108)||(12621360-12621445)
chr6 (23-107)||(13288704-13288788)
chr6 (23-107)||(13303671-13303755)
chr6 (23-107)||(24295325-24295409)
chr6 (23-107)||(24309343-24309427)
chr6 (23-103)||(32781123-32781201)
chr6 (20-76)||(16767693-16767749)
chr6 (23-148)||(20156136-20156257)
chr6 (23-148)||(22176575-22176696)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (410-559)||(14438-14587)
[»] scaffold1704 (1 HSPs)
scaffold1704 (20-118)||(657-755)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (20-118)||(18200-18298)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (23-117)||(20593-20687)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (23-110)||(11546-11633)
scaffold0089 (23-117)||(51766-51860)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (23-108)||(5266-5351)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (23-117)||(72864-72958)
[»] scaffold1665 (2 HSPs)
scaffold1665 (23-148)||(104-228)
scaffold1665 (384-481)||(442-539)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (24-113)||(11780-11869)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (23-104)||(13496-13577)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (23-103)||(4908-4987)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (481-557)||(179454-179530)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (481-557)||(18406-18482)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 463; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 40794972 - 40794427
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40794972 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 40794873  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40794872 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 40794773  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40794772 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaata 40794673  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40794672 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 40794573  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40794572 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 40794473  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40794472 aaaattaggccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 40794427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Original strand, 26620422 - 26620961
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26620422 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatagtcttgcaagaatttaaaaga 26620521  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  26620522 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaataaaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctatcctaatagaaatgagaatgatga 26620621  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaa---atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattga 316  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26620622 ggtgagatgctatgggatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattga 26620721  T
Q  317 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 416  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620722 atatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 26620821  T
Q  417 tagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagatt 516  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  26620822 tagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaatt 26620921  T
Q  517 cacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26620922 cacaaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 26620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27687884 - 27687342
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggattt-aaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27687884 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaattttaaaag 27687785  T
Q  119 atgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnn-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27687784 atgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctattctaatagaaatgagaatgat 27687685  T
Q  218 gtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattga 316  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27687684 gaggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattga 27687585  T
Q  317 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 416  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687584 atatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 27687485  T
Q  417 tagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatga--agaaaaatatggcatgaga 514  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |    
T  27687484 tagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaaaatatggcaagaaa 27687385  T
Q  515 ttcac-aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27687384 ttcacaaaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 27687342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Original strand, 32236723 - 32237246
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32236723 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatagtcttgcaagaatttaaaaga 32236822  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32236823 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaataccaaaaaggagaa-ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgt 32236921  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||    
T  32236922 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaacacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca 32237017  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaag-aaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
             ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32237018 ---------atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaaacacacaaatcataccaaaacagta 32237108  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  32237109 gcacaatcataaaatcaacatcacatctatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattca 32237208  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  32237209 caaaattaggtcgaaaagaacaaattaaacaagaaaat 32237246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 26265752 - 26265886
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26265752 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaagaatttaaaaga 26265851  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26265852 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 26265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13065105 - 13065007
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13065105 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 13065007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 37870409 - 37870507
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37870409 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 37870507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 27424179 - 27424277
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  27424179 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatggtatgttcttgcaaggaattaaaag 27424277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 27439223 - 27439321
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  27439223 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatggtatgttcttgcaaggaattaaaag 27439321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17632532 - 17632435
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17632532 catgtatcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 17632435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39885599 - 39885511
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39885599 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 39885511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39901175 - 39901087
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39901175 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 39901087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24045296 - 24045211
Alignment:
Q  33 tcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24045296 tcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 24045211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12651021 - 12650934
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12651021 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 12650934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12665942 - 12665855
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12665942 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 12665855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 34306406 - 34306493
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34306406 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagga 34306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 28269507 - 28269601
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28269507 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatatatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 28269601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 34263607 - 34263694
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34263607 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtctttcaagga 34263694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39757462 - 39757378
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39757462 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 39757378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20831575 - 20831483
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20831575 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-tta--gagtccattgtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 20831483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28877679 - 28877595
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28877679 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcccttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 28877595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28892889 - 28892805
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28892889 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcccttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 28892805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23121491 - 23121413
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23121491 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 23121413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 4727324 - 4727405
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4727324 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 4727405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 15713535 - 15713616
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15713535 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 15713616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 34271823 - 34271279
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34271823 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtccttcacatcgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaaggatttaaaaga 34271724  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271723 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaggaaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 34271625  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34271624 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 34271525  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271524 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataatcaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 34271425  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34271424 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatacggcaagaaattcac 34271325  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271324 aaaattaggccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 34271279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 15196286 - 15196831
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196286 catgcgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttaaatcaagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 15196385  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196386 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatagaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 15196485  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15196486 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaata 15196585  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196586 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccacgacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 15196685  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15196686 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgtacataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 15196785  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15196786 aaaattagtccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 15196831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 557
Target Start/End: Original strand, 6557410 - 6557947
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6557410 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 6557509  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557510 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 6557609  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6557610 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgcata 6557709  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557710 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaaaacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 6557809  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6557810 cacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 6557909  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    |||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  6557910 aaaattagaccaaaaagaacaatctaatcaagaaaata 6557947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 40464197 - 40464744
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40464197 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 40464296  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40464297 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatgcaaaaaagggcaaattgcaagaaataaaacctaatccaatagaaatgagaatgatgt 40464396  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40464397 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 40464496  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40464497 tgaaatggaatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacacatcataccaaaacagtag 40464596  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  40464597 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcac 40464696  T
Q  520 aaaa--ttatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||  ||| |  ||||  || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40464697 aaaaaattaggtaaaaaaaaaaaaattaatcaagaaaataacacctat 40464744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 4865599 - 4865135
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4865599 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 4865500  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865499 tgaatttaaactagcctaaaatattacataatcattggaaat------taaaaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 4865406  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4865405 ggtaagatgctatgagatgagtgaaaaatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggataaagcaatcaattgaata 4865306  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaag-aaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4865305 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaaagttgcttgaaatgcaaaaaacacacaaatcataccaaaacagta 4865206  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaat 489  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4865205 gcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaat 4865135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 18027773 - 18027871
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18027773 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 18027871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40563028 - 40562930
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40563028 catgtgtcggtgttcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 40562930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 9247838 - 9247932
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9247838 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 9247932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13441122 - 13441035
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13441122 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 13441035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Original strand, 19639624 - 19639714
Alignment:
Q  27 cggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19639624 cggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 19639714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14657135 - 14657048
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14657135 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgagga 14657048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14675569 - 14675482
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14675569 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgagga 14675482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17009492 - 17009408
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17009492 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 17009408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 14658802 - 14658889
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14658802 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcatgcaagga 14658889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20308880 - 20308793
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20308880 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 20308793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17023457 - 17023373
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17023457 gtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 17023373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 565
Target Start/End: Original strand, 22728169 - 22728253
Alignment:
Q  481 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22728169 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 22728253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 22111626 - 22111704
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  22111626 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 22111704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1642570 - 1642494
Alignment:
Q  481 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1642570 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatggcaagaaattcacaaaattagacaaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 1642494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 1662963 - 1662934
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcact 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1662963 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcact 1662934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5317282 - 5317201
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5317282 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtctggcaa 5317201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17086422 - 17086355
Alignment:
Q  489 tttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17086422 tttatgaagaaaa-tatgacaagaaattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 17086355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30278295 - 30278263
Alignment:
Q  78 gagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30278295 gagtcctaaatacatgttatggtcttgcaagga 30278263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 26826201 - 26826747
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826201 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 26826300  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826301 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 26826400  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26826401 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaata 26826500  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26826501 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtag 26826600  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc-aaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26826601 cacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattca 26826700  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26826701 caaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 26826747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 37184819 - 37185368
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37184819 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 37184918  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnn-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37184919 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 37185018  T
Q  219 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaa-atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37185019 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaa 37185118  T
Q  318 catgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37185119 tatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaaaacacaaatcataccaaaacagt 37185218  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggcatgagatt 516  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  37185219 agcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaaatatggcaagaaatt 37185318  T
Q  517 cac-aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||| |||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37185319 cacaaaaattagtccgaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 37185368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 16419490 - 16420028
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16419490 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatccattatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 16419589  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16419590 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaat-------taaaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 16419682  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16419683 cgtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgcaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaata 16419782  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16419783 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtag 16419882  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16419883 cacaataataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 16419982  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16419983 aaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 16420028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 566
Target Start/End: Original strand, 35566498 - 35567044
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35566498 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 35566597  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35566598 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaagaaaaa-ttgcaagaaataaaacctattctaatagaaatgagaatgatgt 35566696  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35566697 ggtgagatgctatgagatgggggaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaatataatatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 35566796  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataat-gagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35566797 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacatatttgagaagaaaagttgtttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 35566896  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35566897 gcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatattaattgttcataacatgtgcaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattca 35566996  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 566  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35566997 caaaattaggccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 35567044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 1733180 - 1733724
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1733180 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 1733279  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1733280 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaataccaaaaaggaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgt 1733378  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  1733379 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatatagcatgagtgatag-aaaaagtaatcaattgaata 1733477  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733478 tgaaatacaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaacatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 1733577  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggcatgagattca 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  1733578 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaacttatgaagaaaaaatatggcaagaaattca 1733677  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1733678 caaaattaggccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 1733724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 385 - 565
Target Start/End: Original strand, 8105970 - 8106150
Alignment:
Q  385 atgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8105970 atgcaagaaacacacaaattataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc 8106069  T
Q  485 aaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8106070 aaaacttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 8106150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 474
Target Start/End: Original strand, 4786543 - 4786979
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  4786543 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattg--tcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaaga 4786640  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgc---aagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             ||||   || ||||||||||||||||||||| || |   ||||    
T  4786641 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattagaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atga 4786736  T
Q  217 tgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattg 315  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||  ||  ||||| ||||     ||| ||||||||||    
T  4786737 tgtagtaaaatgctatgagatgagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgactgat-----aaaacaatcaattg 4786831  T
Q  316 aacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaaca 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  4786832 aacatgaaataaaatggtaaagaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaaca 4786920  T
Q  416 gtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 474  Q
    | |  |||||||||||||||  |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4786921 gcaacacaatcataaaatcagtatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4786979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 474
Target Start/End: Original strand, 4801381 - 4801817
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  4801381 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcatttacattg--tcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaaga 4801478  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgc---aagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             ||||   || ||||||||||||||||||||| || |   ||||    
T  4801479 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattagaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atga 4801574  T
Q  217 tgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattg 315  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||  ||  ||||| ||||     ||| ||||||||||    
T  4801575 tgtagtaaaatgctatgagatgagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgactgat-----aaaacaatcaattg 4801669  T
Q  316 aacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaaca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  4801670 aacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaaca 4801758  T
Q  416 gtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 474  Q
    | |  |||||||||||||||  |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4801759 gcaacacaatcataaaatcagtatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4801817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 16063649 - 16063783
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16063649 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 16063748  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16063749 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 16063783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 19928401 - 19928311
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928401 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4882948 - 4882854
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4882948 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 4882854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 8279153 - 8279247
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8279153 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8279247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 8307963 - 8308057
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8307963 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8308057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 11261164 - 11261258
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11261164 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 11261258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18046707 - 18046613
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18046707 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 18046613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18062770 - 18062676
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18062770 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 18062676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 22641610 - 22641704
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22641610 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 22641704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 14451768 - 14451865
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14451768 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctctacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14451865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9530477 - 9530389
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9530477 catgtgtcggtggtcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 9530389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10414148 - 10414060
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10414148 catgtgtcggtgcttttgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 10414060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11812020 - 11811932
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11812020 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 11811932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 8226839 - 8226933
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8226839 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8226933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8291408 - 8291314
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8291408 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8291314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 15730790 - 15730884
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15730790 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15730884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 15745875 - 15745969
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15745875 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15745969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1999703 - 1999619
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1999703 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 1999619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8346537 - 8346449
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8346537 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaag 8346449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4684443 - 4684356
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4684443 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 4684356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18003055 - 18002968
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18003055 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgatatggtcttgcaagga 18002968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5647252 - 5647158
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5647252 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacaagctatggtcttgcaaggaattaaaa 5647158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Original strand, 34799718 - 34799800
Alignment:
Q  35 gtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34799718 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacagtgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 34799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4694527 - 4694440
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4694527 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgaaagga 4694440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 10600703 - 10600616
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10600703 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagga 10600616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5662674 - 5662581
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5662674 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggt-ttgcaaggaattaaaa 5662581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3392383 - 3392300
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3392383 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaag 3392300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 9722119 - 9722197
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  9722119 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 9722197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 35876206 - 35876128
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  35876206 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 35876128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4445500 - 4445422
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4445500 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 4445422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4449663 - 4449585
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4449663 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 4449585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19273912 - 19273859
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19273912 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 19273859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 35891276 - 35891198
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  35891276 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgatatggtctt 35891198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4888913 - 4888835
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  4888913 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgttatggtctt 4888835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28013069 - 28012991
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  28013069 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgttcatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 28012991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28359867 - 28359789
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  28359867 gtgtcggtgcttgtgtcgatgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 28359789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18326342 - 18326261
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18326342 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 18326261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18341441 - 18341360
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18341441 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 18341360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6187984 - 6187906
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||    
T  6187984 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttg 6187906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4717302 - 4717221
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4717302 gtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacattg--tcctagatacattctatggtcttgcaa 4717221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4732482 - 4732401
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4732482 gtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacattg--tcctagatacattctatggtcttgcaa 4732401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 32964184 - 32964265
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32964184 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtctggcaa 32964265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19704836 - 19704778
Alignment:
Q  88 tacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19704836 tacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ggaatttaaacta-cctaaaatattacat 19704778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 32058 - 32603
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32058 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 32157  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32158 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaagggaaaattgcaagaagtaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 32257  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32258 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 32357  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgtttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 32457  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  32458 cacaatcataaaatcaacatcacatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcac 32557  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32558 aaaattaggtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 32603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18429970 - 18429425
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18429970 catgtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 18429871  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18429870 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaggaaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaacgagaatgatgt 18429772  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  18429771 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatagaaaaaagtaatcaattgaata 18429672  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18429671 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 18429572  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18429571 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcatgaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcac 18429472  T
Q  520 -aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
     ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18429471 aaaaattaggtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 18429425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 39862308 - 39862853
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39862308 catgtgtcggtgcttgtgtcgatgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 39862407  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39862408 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgatgt 39862507  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  39862508 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaata 39862607  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39862608 tggaatgaaatggtaaagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcatacaaaaacagtag 39862707  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  39862708 cacaatcataaaatcaacatcacacttaacataaaattgcgtactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattcac 39862807  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39862808 aaaattaggtcaaaaggaacaaattaatcaagaaaataacacctat 39862853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 565
Target Start/End: Original strand, 14225641 - 14226169
Alignment:
Q  35 gtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14225641 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagc 14225740  T
Q  135 ctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14225741 ctaaaatattacataaccattggaaata--aaaataaataaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgaagtggtaagatgctatga 14225838  T
Q  235 gatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggta 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  14225839 gatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaataaca 14225938  T
Q  335 aagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatc 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14225939 aagaaatgataagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatc 14226038  T
Q  435 aacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaa 534  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  14226039 aacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaagtttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaa 14226138  T
Q  535 ggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14226139 agaacaaattaatcaagaaaataacacctat 14226169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39150903 - 39150359
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150903 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 39150804  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39150803 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaggaaaaa-ttgcaagatataaaacttaacctaatagaaatgagaatgatgt 39150705  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  39150704 ggtaggatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaata 39150605  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150604 tggaatgaaatggtagagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 39150505  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  39150504 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaataaattcac 39150405  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39150404 aaaattaggtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 39150359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6178897 - 6178352
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6178897 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaggtacatgctatggtcttgcaaaaatttaaaaga 6178798  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178797 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccaatggaaatacaaaagagaaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 6178699  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaac 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6178698 ggtaagatgctataagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaa 6178599  T
Q  319 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6178598 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctaaaaatacaagaaaaacacaaatcataccaaaacagta 6178499  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  6178498 gcacaatcataaaaacaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaaattatgaagaaaaatatagcaagaaattca 6178399  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaa-caaattaaccaagaaaataacgccta 564  Q
    ||| ||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6178398 caacattagcctaaaaagaagcaaattaaccaagaaaataacaccta 6178352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Original strand, 15918827 - 15919347
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15918827 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaagga 15918926  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15918927 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgt 15919025  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||    
T  15919026 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaataagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca 15919121  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
             ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15919122 ---------atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacac--aaatcataccaaaacagtag 15919210  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  15919211 cacaatcataaaatcaacatcaaatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcac 15919310  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15919311 aaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 15919347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 177 - 555
Target Start/End: Original strand, 6223110 - 6223489
Alignment:
Q  177 ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6223110 ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatg 6223209  T
Q  277 aaaa-atataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaag 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223210 aaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaag 6223309  T
Q  376 ttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcata 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223310 ttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcata 6223409  T
Q  476 acatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaa 555  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6223410 acatgtgccaaaattcatgaaaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattagtctaaaaagaacaaattaatcaaaaaaa 6223489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4948373 - 4948245
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  4948373 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagagtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgaaaatttaaaaga 4948274  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4948273 tgaatttaaactagcctaaagtattacat 4948245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35971981 - 35971883
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35971981 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 35971883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35993393 - 35993295
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35993393 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 35993295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18623173 - 18623078
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18623173 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaa 18623078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 14929973 - 14930071
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14929973 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaagaattaaaag 14930071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 15353421 - 15353515
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15353421 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15353515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11361297 - 11361210
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11361297 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagga 11361210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2150057 - 2149963
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2150057 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 2149963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2165268 - 2165174
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2165268 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 2165174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4186347 - 4186253
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186347 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaaggaattaaaa 4186253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20592740 - 20592646
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20592740 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20592646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 5802049 - 5802136
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5802049 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 5802136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 13736218 - 13736305
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736218 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactaatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 13736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Original strand, 18459687 - 18459786
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  18459687 catgtgtcgatgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacaacgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgagtaattaaaaga 18459786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30308416 - 30308328
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30308416 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 30308328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2968932 - 2968845
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2968932 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttataatgttcatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 2968845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5246277 - 5246190
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5246277 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 5246190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 11414454 - 11414539
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11414454 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatgggcttgcaag 11414539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 10921521 - 10921608
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10921521 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcgcttatagcgtccatagtcctttacactgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 10921608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 11429438 - 11429523
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11429438 gtgtcggtgattgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatgggcttgcaag 11429523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4054748 - 4054664
Alignment:
Q  481 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4054748 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 4054664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 481 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15478969 - 15478885
Alignment:
Q  481 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15478969 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattactcaagaaaataacacctat 15478885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18539175 - 18539097
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  18539175 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 18539097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18549684 - 18549606
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  18549684 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 18549606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18627023 - 18626931
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18627023 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-tta--gagtccattgtcctttacattgagtcctaactacatgctacggtcttgcaaggaattaaaag 18626931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 36879208 - 36879261
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36879208 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacat 36879261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5123739 - 5123657
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5123739 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaag 5123657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5158692 - 5158610
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5158692 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaag 5158610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18137767 - 18137682
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctc-gtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18137767 catgtgtcggtgctttgtgtctgtgtacatca-ttagggagtccatagtcctttacattg--tcctagatacattctatggtcttgcaa 18137682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Original strand, 16440296 - 16440372
Alignment:
Q  481 tgccaaaa-tttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16440296 tgccaaaactttatgaagaaaa-tatgacaagacattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 16440372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Original strand, 16455197 - 16455273
Alignment:
Q  481 tgccaaaa-tttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16455197 tgccaaaactttatgaagaaaa-tatgacaagaaattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 16455273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 565
Target Start/End: Original strand, 21645424 - 21645964
Alignment:
Q  22 tgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatg 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21645424 tgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgctagtatttaaaagatg 21645523  T
Q  122 aatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtgg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21645524 aatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaata---ataaaaaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgggaatgatgtgg 21645620  T
Q  222 taagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21645621 taagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatttaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatg 21645720  T
Q  322 aaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagta 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21645721 aaatgaaatggtatagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagca 21645820  T
Q  422 caatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21645821 caatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaa 21645920  T
Q  522 aattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21645921 aattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 21645964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18598122 - 18597586
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18598122 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 18598023  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598022 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccgttggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaagtaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 18597923  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18597922 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaagaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 18597823  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18597822 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgacatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtag 18597723  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18597722 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcac 18597623  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18597622 aaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 18597586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24654865 - 24654767
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24654865 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 24654767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21481571 - 21481477
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21481571 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 21481477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 20321454 - 20321542
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20321454 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 20321542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18293596 - 18293509
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293596 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 18293509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18289193 - 18289106
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289193 gtgtcggtgcttctgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagacctaaatacatgctatggtcttgcaagga 18289106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21505793 - 21505743
Alignment:
Q  26 tcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21505793 tcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacat 21505743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 47662898 - 47662979
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  47662898 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 47662979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 166733 - 166188
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166733 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 166634  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166633 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaattcaaaaaagggtaaattgcaagaattaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 166534  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  166533 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaata 166434  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166433 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgttttaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 166334  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  166333 cacaatcataaaatcaacatcacatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcac 166234  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  166233 aaaattaggtcaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 166188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16264414 - 16263871
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264414 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 16264315  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16264314 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaata-aaggaagggaaaattacaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgt 16264216  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  16264215 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-aaaaagtaatcaattgaata 16264117  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264116 tgaaatacaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 16264017  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16264016 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 16263917  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16263916 aaaattaggccaaaaagaacaaattaaacaagaaaataacacctat 16263871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Original strand, 24461435 - 24461980
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24461435 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcccaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 24461534  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24461535 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaagaaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctaatataaatgagaatgatgt 24461633  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24461634 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaata 24461733  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24461734 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaaggaacacacaaatcatatcaaaacagtag 24461833  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24461834 cacaatcataaaatcagcatcacatttaacataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcac 24461933  T
Q  520 -aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
     |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24461934 aaaaattagtccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 24461980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 559
Target Start/End: Original strand, 30367285 - 30367826
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30367285 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgtaaggatttaaaaga 30367384  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnn-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30367385 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgacg 30367484  T
Q  219 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaag-caagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30367485 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaacaatcaattgaa 30367584  T
Q  318 catgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30367585 tatggaatgaaatggtaaagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 30367684  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattc 517  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  30367685 agcacaatcataaaatcaacatcaaacttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattc 30367784  T
Q  518 acaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 559  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30367785 acaaaattaggtcaaaaggaacaaattaatcaagaaaataac 30367826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Original strand, 19650523 - 19651060
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650523 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 19650622  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaa-cctaatctaatagaaatgagaatgatg 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19650623 tgaatttaaactaacataaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 19650722  T
Q  219 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19650723 tggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaat 19650822  T
Q  319 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650823 atgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 19650922  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  19650923 gcacaatcataaaatcaacatcacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattca 19651022  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19651023 caaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 19651060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Original strand, 19661568 - 19662105
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661568 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 19661667  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaa-cctaatctaatagaaatgagaatgatg 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19661668 tgaatttaaactaacataaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 19661767  T
Q  219 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19661768 tggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaat 19661867  T
Q  319 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661868 atgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 19661967  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattca 518  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  19661968 gcacaatcataaaatcaacatcacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattca 19662067  T
Q  519 caaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19662068 caaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 19662105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29036881 - 29036344
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29036881 catgcgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcagttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagg 29036782  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29036781 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgt 29036683  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  29036682 ggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaattgaata 29036584  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29036583 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgagatacaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 29036484  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  29036483 cacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcac 29036384  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 559  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  29036383 aaaattaggtcaaaaaggacaaattaaacaagaaaataac 29036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22143409 - 22142882
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143409 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 22143310  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22143309 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatactaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgatg- 22143211  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagca--atcaattgaa 317  Q
                       |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  22143210 -------------------agtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaaaccatcaattgaa 22143130  T
Q  318 catgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143129 tatggaatgaaatggtagagaaatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 22143030  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattc 517  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22143029 agcacaatcataaaatcaacatcacacttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagggattc 22142930  T
Q  518 acaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22142929 acaaaattaggtcaaaaggaacaaattaatcaagaaaataacacctat 22142882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16273000 - 16272614
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16273000 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 16272901  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16272900 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaata-aaggaagggaaaattacaagaaataaaacctaatctattaaaaatgagaatgatgt 16272802  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16272801 ggtgagatgctatgaaatgagtgaaacatgagttcacaatgtttgcaaaacaagatgaaaaatataacttgagtgata-gaaaaagtaatcaattgaata 16272703  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaa 412  Q
    | ||||  || ||| ||||| || ||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  16272702 ttaaatacaagggtgaagaattggtgaaattaacc-agacattttgagaagaaaa-ttgcttaaaatg-aagaaac-ccccaatcataccaaa 16272614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18801095 - 18800661
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  18801095 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattg--tcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaaga 18800998  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             |   || ||||||||||||||||||||| || |   |||||||    
T  18800997 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattagaaatacaagagagaaaaattgcaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atgatgt 18800901  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaac 318  Q
     |||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||  ||  ||||||||||     ||| |||||||||||||    
T  18800900 agtaaaatgctatgagatgagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgagtgat-----aaaacaatcaattgaac 18800806  T
Q  319 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagta 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |    
T  18800805 atgaaatgaaatggtaacgaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagca 18800717  T
Q  419 gtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 474  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  18800716 atacaatcataaaatcagtatcacatataccatagaattacatactaattgttcat 18800661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 12480085 - 12480183
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12480085 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 12480183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23079306 - 23079208
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23079306 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 23079208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14553081 - 14552984
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14553081 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14552984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14573905 - 14573808
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14573905 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14573808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19698595 - 19698497
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcc-tttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19698595 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtccttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 19698497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 19906613 - 19906700
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19906613 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcctgcaagga 19906700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 555593 - 555503
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  555593 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccataatcctttacattgagtcctaaatacatactatggtcttgcaagga 555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 16254418 - 16254512
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16254418 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 16254512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 14359561 - 14359649
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14359561 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 14359649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28262986 - 28262901
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28262986 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 28262901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 21337322 - 21337406
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21337322 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 21337406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 21377283 - 21377367
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21377283 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 21377367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 2141999 - 2142086
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2141999 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagga 2142086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 5516484 - 5516571
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5516484 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttatattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 5516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 18786539 - 18786626
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786539 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatctcttatagcgtccatagtcctttacactgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 18786626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15210447 - 15210369
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  15210447 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgactcctagatacatgctatg 15210369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 110
Target Start/End: Original strand, 2126841 - 2126917
Alignment:
Q  34 cgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2126841 cgtgtcggtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgagttctagatacatgctatggtcttgcaagga 2126917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 27598574 - 27598657
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27598574 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaag 27598657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 27613626 - 27613709
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27613626 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaag 27613709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33242331 - 33242278
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33242331 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 33242278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33271675 - 33271622
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33271675 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 33271622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 14025297 - 14025350
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14025297 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 14025350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15324469 - 15324416
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15324469 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 15324416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15504838 - 15504785
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15504838 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 15504785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 31339637 - 31339715
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  31339637 gtgtcggtgcttgtgttggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgttatggtctt 31339715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 566
Target Start/End: Original strand, 34497067 - 34497612
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497067 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccgtagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 34497166  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaa--taaaacctaatctaatagaaatgagaatgat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34497167 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaggaaaa--ttgcaaaaaaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgat 34497264  T
Q  218 gtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34497265 gtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaataatgttagcaaaacaagatgaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaa 34497363  T
Q  318 catgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497364 tatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 34497463  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattc 517  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34497464 agaacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagagattc 34497563  T
Q  518 acaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctatg 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34497564 acaaaattatgccaaaaagaacaaattaaccaagaaaataacgtctatg 34497612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 552
Target Start/End: Original strand, 30913143 - 30913660
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30913143 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaggg 30913242  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30913243 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaggaaaa--ttgcaagaaataaaacttaatctagtagaaatgagaatgatgt 30913340  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaca 319  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||    
T  30913341 gttgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-agaaagtaatcaat---aca 30913436  T
Q  320 tgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtag 419  Q
             ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30913437 ---------atggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtag 30913527  T
Q  420 tacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcac 519  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  30913528 cacaatcataaaatcaacatcacatctatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcac 30913627  T
Q  520 aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaaga 552  Q
    ||||||| | | ||| ||||||||||| |||||    
T  30913628 aaaattaggtccaaaagaacaaattaaacaaga 30913660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 25504247 - 25504381
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25504247 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 25504346  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25504347 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 25504381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 35871496 - 35871630
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35871496 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 35871595  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35871596 tgaatttaaactaacctaaaatattacataaccat 35871630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18083906 - 18083771
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18083906 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 18083807  T
Q  120 tgaatttaaactagcct-aaaatattacataaccat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18083806 tgaatttaaactagcctaaaaatattacataaccat 18083771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16682689 - 16682591
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16682689 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 16682591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 570884 - 570981
Alignment:
Q  21 atgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  570884 atgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 570981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15494736 - 15494638
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15494736 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaagaattaaaag 15494638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 20193725 - 20193819
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20193725 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20193819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 35396582 - 35396670
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35396582 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 35396670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3943935 - 3943848
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3943935 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 3943848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 23722684 - 23722771
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23722684 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 23722771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 24692834 - 24692921
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24692834 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 24692921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 32449540 - 32449634
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32449540 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 32449634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30930123 - 30930036
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30930123 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 30930036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30957006 - 30956919
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30957006 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 30956919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 18061655 - 18061740
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18061655 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaag 18061740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22445695 - 22445611
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22445695 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 22445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22347620 - 22347536
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22347620 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 22347536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23901762 - 23901678
Alignment:
Q  481 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23901762 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 23901678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 29882009 - 29882082
Alignment:
Q  35 gtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29882009 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcatttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 29882082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23887119 - 23887036
Alignment:
Q  481 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23887119 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaat-cacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 23887036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11545867 - 11545786
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  11545867 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 11545786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11559926 - 11559845
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  11559926 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 11559845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33773029 - 33772951
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  33773029 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 33772951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33787981 - 33787903
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  33787981 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 33787903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41301614 - 41301536
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41301614 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctaattacattctatggtctt 41301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 20580190 - 20580313
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||    ||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  20580190 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtcctttacactttgtcctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 20580287  T
Q  122 aatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20580288 aatttaaacta-cctaaaatattacat 20580313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 37651033 - 37650954
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcc-tttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||| |||||| ||||||||||    
T  37651033 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatggtccttttacat--tgtcctagatacattctatggtctt 37650954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Original strand, 22269542 - 22269618
Alignment:
Q  481 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22269542 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatggcaagaaattcacaaaattagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 22269618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 23430740 - 23430817
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23430740 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgt-catagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 23430817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 22988489 - 22988570
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22988489 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 22988570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 23003556 - 23003637
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23003556 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaa 23003637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25195591 - 25195469
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  25195591 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 25195495  T
Q  122 aatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25195494 aatttaaacta-cctaaaatattacat 25195469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22898373 - 22898297
Alignment:
Q  481 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22898373 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatgacaagaaattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 22898297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25210889 - 25210831
Alignment:
Q  88 tacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25210889 tacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ggaatttaaacta-cctaaaatattacat 25210831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25275041 - 25274983
Alignment:
Q  88 tacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25275041 tacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ggaatttaaacta-cctaaaatattacat 25274983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10019 - 9521
Alignment:
Q  68 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnn 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  10019 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaa 9920  T
Q  168 nnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 267  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9919 aaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 9820  T
Q  268 agcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgag 367  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9819 aacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgag 9720  T
Q  368 aagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaat 467  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9719 aagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaat 9620  T
Q  468 tgttcataacatgtgcc-aaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9619 tgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7585177 - 7584638
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7585177 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 7585078  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnn-ttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7585077 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctatcctaatagaaatgagaatgatg 7584978  T
Q  219 tggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaa 317  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7584977 aggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaa 7584878  T
Q  318 catgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7584877 tatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagt 7584778  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattc 517  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  7584777 agcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgtcaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattc 7584678  T
Q  518 ac-aaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaat 556  Q
    || ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7584677 acaaaaattaggtcaaaaagaacaaattaaacaagaaaat 7584638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 193 - 564
Target Start/End: Original strand, 22480574 - 22480945
Alignment:
Q  193 ctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgag 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22480574 ctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgag 22480673  T
Q  293 tgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaaga 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22480674 tgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctcaaaatacaaga 22480773  T
Q  393 aacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattta 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22480774 aacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcataataattgttcataacatgtgccaaaattta 22480873  T
Q  493 tgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 564  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22480874 tgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattagtctaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacaccta 22480945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 284 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26502530 - 26502249
Alignment:
Q  284 taacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaacatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26502530 taacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 26502431  T
Q  384 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26502430 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgc 26502331  T
Q  484 caaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgcctat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26502330 caaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattatgccaaaaagaacaaattaatcaagaaaataacacctat 26502249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20217040 - 20216508
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20217040 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatttaaaaga 20216941  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgc--aagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgat 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||  || ||||||| |||||||||| ||  || || |||||    
T  20216940 tgaatttaaactagcctaaagtattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaataaaccctaatctaaaagggataaggatgat 20216842  T
Q  218 gtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattga 316  Q
    || |||| |||||||||||||||||||  |  |||| || |||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||     || ||| |||||||||||    
T  20216841 gtagtaaaatgctatgagatgagtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagt----tgataaaacaatcaattga 20216746  T
Q  317 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  20216745 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatga-----------aaataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacag 20216657  T
Q  417 tagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagatt 516  Q
     |  |||||||||||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || | |    
T  20216656 caacacaatcataaaatcagtatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatatggcaagaaaat 20216557  T
Q  517 cacaaaattatgcc--aaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 564  Q
    ||||| |||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  20216556 cacaatatta-gcctaaaaagaaacacatcaaccaagaaaataacaccta 20216508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22111062 - 22110530
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22111062 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatttaaaaga 22110963  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgc--aagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgat 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||  || ||||||| |||||||||| ||  || || |||||    
T  22110962 tgaatttaaactagcctaaagtattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaataaaccctaatctaaaagggataaggatgat 22110864  T
Q  218 gtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattga 316  Q
    || |||| |||||||||||||||||||  |  |||| || |||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||     || ||| |||||||||||    
T  22110863 gtagtaaaatgctatgagatgagtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagt----tgataaaacaatcaattga 22110768  T
Q  317 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  22110767 acatgaaatgaaatggtaaagaaatgatga-----------aaataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacag 22110679  T
Q  417 tagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagatt 516  Q
     |  |||||||||||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || | |    
T  22110678 caacacaatcataaaatcagtatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatatggcaagaaaat 22110579  T
Q  517 cacaaaattatgcc--aaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 564  Q
    ||||| |||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  22110578 cacaatatta-gcctaaaaagaaacacatcaaccaagaaaataacaccta 22110530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18940457 - 18939941
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  18940457 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatttagaaga 18940358  T
Q  120 tgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacnnnnnnnnnnnnnttgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgt 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18940357 tgaattcaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaa-aaataaaccctaacctaaaagaaatgaggatgatgt 18940260  T
Q  220 ggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaagcaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaac 318  Q
     |||| |||||||||||||||||||  |  |||| || |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||     ||| |||||||||||||    
T  18940259 agtaaaatgctatgagatgagtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagtgat-----aaaacaatcaattgaac 18940165  T
Q  319 atgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaag-aaacacacaaatcataccaaaacagt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||           | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||             
T  18940164 atgaaatgaaatggtgaagaaatgatga-----------aaataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaaacacctaaaccatac--------- 18940085  T
Q  418 agtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattc 517  Q
       ||||||||||| |||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |  || | ||| |||||||||| || |||||| || | ||    
T  18940084 ---acaatcataaattcagtatcacatataccatagaattgcatactaattgttcatgatacatgtctaaacttatgaagaacaacatggcaagaaaatc 18939988  T
Q  518 acaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgccta 564  Q
    |||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18939987 acaatattagcctaaaagagacaaattaaccaagaaaataacaccta 18939941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31541566 - 31541468
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31541566 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 31541468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16562030 - 16561942
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16562030 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 16561942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3043567 - 3043473
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3043567 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 3043473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27646575 - 27646487
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27646575 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 27646487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 15402080 - 15402167
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402080 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 15402167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 15413867 - 15413954
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15413867 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 15413954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 15429460 - 15429547
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15429460 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 15429547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 22923858 - 22923953
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22923858 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 22923953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 22939570 - 22939665
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22939570 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 22939665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 23862015 - 23862110
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23862015 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 23862110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26995505 - 26995418
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26995505 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 26995418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27029827 - 27029740
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27029827 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 27029740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24852179 - 24852081
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttaca-tcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24852179 catgtgtcggtgctcgtgttggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatttgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 24852081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24874205 - 24874107
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttaca-tcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24874205 catgtgtcggtgctcgtgttggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatttgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 24874107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 34471391 - 34471485
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34471391 gtgtcgttgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 34471485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 18815035 - 18815122
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18815035 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 18815122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 19900609 - 19900696
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19900609 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 19900696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26984601 - 26984518
Alignment:
Q  24 tgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26984601 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 26984518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27035664 - 27035581
Alignment:
Q  24 tgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27035664 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 27035581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 462 - 564
Target Start/End: Original strand, 27365917 - 27366019
Alignment:
Q  462 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |    
T  27365917 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaaccaattaatcaagaaaataacac 27366016  T
Q  562 cta 564  Q
    |||    
T  27366017 cta 27366019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 462 - 564
Target Start/End: Original strand, 27456264 - 27456366
Alignment:
Q  462 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataacgc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |    
T  27456264 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaagaaccaattaatcaagaaaataacac 27456363  T
Q  562 cta 564  Q
    |||    
T  27456364 cta 27456366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12621445 - 12621360
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12621445 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 12621360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 13288704 - 13288788
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13288704 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 13288788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 13303671 - 13303755
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13303671 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 13303755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 24295325 - 24295409
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24295325 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 24295409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 24309343 - 24309427
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24309343 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 24309427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 32781123 - 32781201
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  32781123 gtgtcggtgctggtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 32781201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Original strand, 16767693 - 16767749
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacat 76  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16767693 catgtatcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 16767749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20156257 - 20156136
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||      
T  20156257 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacatag-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaaga-- 20156162  T
Q  122 aatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20156161 aattaaaacta-cctaaaatattacat 20156136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 22176575 - 22176696
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||      
T  22176575 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacatag-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaaga-- 22176670  T
Q  122 aatttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22176671 aattaaaacta-cctaaaatattacat 22176696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 410 - 559
Target Start/End: Original strand, 14438 - 14587
Alignment:
Q  410 aaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaag-aaaaatatggc 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14438 aaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcacactaattgtccataacatgtaccaaaatttatgaagaaaaaatatggc 14537  T
Q  509 atgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaataac 559  Q
    | || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14538 aagaaattcacaaaattaggtcaaaa-gaacaaattaatcaagaaaataac 14587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1704 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1704
Description:

Target: scaffold1704; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 657 - 755
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  657 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18298 - 18200
Alignment:
Q  20 catgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18298 catgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 18200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 20593 - 20687
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20593 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 11546 - 11633
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11546 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagga 11633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 51766 - 51860
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51766 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 51860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 5266 - 5351
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5266 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 5351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 72864 - 72958
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  72864 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatatatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 72958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold1665
Description:

Target: scaffold1665; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 104 - 228
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||   |    
T  104 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacaaaacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaaaaattaaaagggaa 203  T
Q  123 atttaaactagcctaaaatattacat 148  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||    
T  204 attgaaacta-cctaaaatattacat 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 481
Target Start/End: Original strand, 442 - 539
Alignment:
Q  384 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagtacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgt 481  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  442 aatgcaagaaaccaacaattcatatcaaaacagtagcacaattataaaatcatcatcacattcaacatgaaattgcatattaatcgatcatgacatgt 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11869 - 11780
Alignment:
Q  24 tgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggattt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11869 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagattt 11780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Original strand, 13496 - 13577
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttg 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13496 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagccctagatacatgctatggtcttg 13577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 4908 - 4987
Alignment:
Q  23 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatggtgtccatagt-cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||| |||||| ||||||||||    
T  4908 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatggtccctttacat--tgtcctagatacattctatggtctt 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 179530 - 179454
Alignment:
Q  481 tgccaaaattt-atgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  179530 tgccaaaattttatgaagaaaa-tatgacaagaaattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 179454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 557
Target Start/End: Original strand, 18406 - 18482
Alignment:
Q  481 tgccaaaa-tttatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaggaacaaattaaccaagaaaata 557  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18406 tgccaaaactttatgaagaaaa-tatgacaagaaattcacaaacttagaccaaaaagaacaaattaatcaagaaaata 18482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University