View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1297_high_78 (Length: 276)

Name: NF1297_high_78
Description: NF1297
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1297_high_78
NF1297_high_78
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (123-263)||(8215900-8216040)
chr5 (123-259)||(14717609-14717745)
chr5 (123-263)||(6251972-6252112)
chr5 (123-263)||(6739956-6740096)
chr5 (123-263)||(30297750-30297890)
chr5 (123-263)||(35342180-35342320)
chr5 (127-261)||(39002030-39002164)
chr5 (122-263)||(30863253-30863394)
chr5 (122-263)||(41282342-41282483)
chr5 (123-263)||(3352003-3352143)
chr5 (123-263)||(11000729-11000869)
chr5 (123-263)||(16095961-16096100)
chr5 (123-263)||(33760471-33760611)
chr5 (123-263)||(38964115-38964254)
chr5 (123-259)||(6600137-6600273)
chr5 (123-263)||(26593281-26593421)
chr5 (123-263)||(27457198-27457338)
chr5 (123-263)||(31710282-31710422)
chr5 (123-263)||(39824556-39824696)
chr5 (127-263)||(40074950-40075086)
chr5 (123-263)||(4015875-4016015)
chr5 (123-263)||(11692148-11692288)
chr5 (123-263)||(19659502-19659642)
chr5 (123-263)||(20079259-20079399)
chr5 (123-259)||(20408537-20408673)
chr5 (123-263)||(23128914-23129054)
chr5 (127-263)||(42993518-42993654)
chr5 (127-263)||(43166274-43166410)
chr5 (123-263)||(8689572-8689712)
chr5 (123-259)||(14952328-14952464)
chr5 (127-255)||(1052541-1052669)
chr5 (123-259)||(27116100-27116236)
chr5 (123-263)||(28078406-28078546)
chr5 (123-263)||(30208403-30208543)
chr5 (123-259)||(19398194-19398330)
chr5 (143-263)||(16752116-16752236)
chr5 (163-263)||(6331377-6331477)
chr5 (127-263)||(8694866-8695002)
chr5 (143-263)||(26035367-26035487)
chr5 (123-259)||(11935450-11935585)
chr5 (143-255)||(444962-445074)
chr5 (123-263)||(27509978-27510111)
chr5 (123-166)||(6332873-6332916)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (123-263)||(921022-921162)
chr2 (123-263)||(16246194-16246334)
chr2 (123-263)||(27328584-27328724)
chr2 (123-263)||(28650427-28650567)
chr2 (123-263)||(40854609-40854749)
chr2 (128-263)||(771981-772116)
chr2 (123-263)||(11949427-11949567)
chr2 (123-263)||(34253142-34253282)
chr2 (123-263)||(41500503-41500643)
chr2 (122-263)||(17134229-17134370)
chr2 (123-263)||(7378963-7379103)
chr2 (123-263)||(9276574-9276714)
chr2 (123-263)||(33865268-33865408)
chr2 (123-259)||(37838301-37838437)
chr2 (122-263)||(36444228-36444369)
chr2 (123-263)||(1106560-1106700)
chr2 (127-263)||(2456010-2456146)
chr2 (123-263)||(12759751-12759890)
chr2 (127-263)||(29737748-29737884)
chr2 (123-263)||(42629962-42630102)
chr2 (129-263)||(3430631-3430765)
chr2 (123-261)||(7297235-7297373)
chr2 (123-263)||(19180422-19180561)
chr2 (127-259)||(25087801-25087933)
chr2 (123-263)||(33106970-33107110)
chr2 (123-263)||(38751048-38751188)
chr2 (123-263)||(43249413-43249553)
chr2 (127-261)||(2314980-2315114)
chr2 (123-260)||(2056929-2057066)
chr2 (122-263)||(36211046-36211187)
chr2 (123-263)||(2094411-2094551)
chr2 (143-263)||(8396572-8396692)
chr2 (123-263)||(8899682-8899821)
chr2 (123-263)||(37732194-37732334)
chr2 (123-259)||(17484551-17484687)
chr2 (123-262)||(45124120-45124259)
chr2 (143-263)||(19916008-19916128)
chr2 (147-259)||(37654112-37654224)
chr2 (163-263)||(41178060-41178160)
chr2 (123-262)||(9331757-9331896)
chr2 (123-214)||(14630663-14630754)
chr2 (123-212)||(23671812-23671901)
chr2 (207-263)||(23672958-23673014)
chr2 (127-165)||(28216969-28217007)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (123-263)||(1469494-1469634)
chr7 (123-263)||(47281125-47281265)
chr7 (122-263)||(44544409-44544550)
chr7 (122-263)||(47219145-47219286)
chr7 (123-263)||(30876259-30876399)
chr7 (123-263)||(31684135-31684275)
chr7 (123-263)||(35600123-35600263)
chr7 (123-263)||(38427564-38427704)
chr7 (123-263)||(47271981-47272121)
chr7 (123-263)||(47294292-47294432)
chr7 (122-259)||(33884323-33884460)
chr7 (127-263)||(8162717-8162853)
chr7 (123-263)||(11476557-11476697)
chr7 (123-263)||(23842305-23842445)
chr7 (123-263)||(30798369-30798509)
chr7 (123-263)||(40851274-40851414)
chr7 (123-263)||(48628805-48628945)
chr7 (123-259)||(37393999-37394135)
chr7 (123-263)||(41113377-41113517)
chr7 (123-250)||(2960641-2960768)
chr7 (127-259)||(4923220-4923352)
chr7 (123-263)||(27364340-27364480)
chr7 (123-263)||(43752777-43752917)
chr7 (123-258)||(7336065-7336199)
chr7 (143-263)||(3797544-3797664)
chr7 (123-259)||(11050262-11050398)
chr7 (123-263)||(43968260-43968400)
chr7 (123-263)||(45723492-45723632)
chr7 (123-263)||(41139409-41139553)
chr7 (123-240)||(221298-221415)
chr7 (123-263)||(30971942-30972082)
chr7 (123-263)||(42979339-42979479)
chr7 (123-263)||(47119991-47120133)
chr7 (123-263)||(29248342-29248482)
chr7 (127-263)||(47579091-47579228)
chr7 (127-259)||(44800415-44800547)
chr7 (123-259)||(18353148-18353284)
chr7 (143-263)||(27774108-27774228)
chr7 (143-259)||(37354284-37354400)
chr7 (170-263)||(40520918-40521011)
chr7 (203-263)||(39034062-39034122)
chr7 (123-175)||(42888937-42888989)
chr7 (123-178)||(5106127-5106181)
chr7 (220-263)||(43025112-43025155)
chr7 (214-263)||(29739781-29739829)
chr7 (212-251)||(12583313-12583352)
chr7 (219-263)||(29739670-29739713)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (123-263)||(3408189-3408329)
chr6 (122-263)||(6503718-6503859)
chr6 (123-263)||(8178250-8178390)
chr6 (127-263)||(1915348-1915484)
chr6 (123-263)||(10256237-10256377)
chr6 (123-263)||(2707459-2707599)
chr6 (123-263)||(12626636-12626776)
chr6 (123-263)||(29050272-29050412)
chr6 (123-259)||(30379021-30379157)
chr6 (123-261)||(2390267-2390405)
chr6 (123-263)||(9382519-9382659)
chr6 (123-259)||(17943040-17943176)
chr6 (123-259)||(26393010-26393146)
chr6 (123-259)||(17428273-17428409)
chr6 (123-263)||(26230933-26231073)
chr6 (123-263)||(11133873-11134014)
chr6 (123-263)||(3258808-3258948)
chr6 (123-259)||(1077241-1077377)
chr6 (143-263)||(26936607-26936727)
chr6 (123-252)||(2598100-2598229)
chr6 (123-259)||(16193314-16193450)
chr6 (123-263)||(6785102-6785239)
chr6 (142-248)||(35223919-35224025)
chr6 (123-259)||(26196322-26196458)
chr6 (123-259)||(25820550-25820686)
chr6 (123-259)||(10931149-10931288)
chr6 (123-209)||(31375971-31376057)
chr6 (123-180)||(12612972-12613029)
chr6 (123-201)||(12612849-12612927)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (123-263)||(12196469-12196609)
chr4 (123-263)||(40988633-40988773)
chr4 (123-263)||(42273802-42273942)
chr4 (123-263)||(5227390-5227530)
chr4 (123-263)||(28264643-28264783)
chr4 (123-263)||(33807781-33807921)
chr4 (123-261)||(8882014-8882152)
chr4 (123-261)||(26017425-26017563)
chr4 (123-263)||(4544986-4545126)
chr4 (123-263)||(31591076-31591215)
chr4 (123-263)||(31973591-31973731)
chr4 (123-263)||(35930040-35930179)
chr4 (123-263)||(48707734-48707874)
chr4 (123-263)||(55517186-55517326)
chr4 (123-258)||(49118616-49118751)
chr4 (123-263)||(11795155-11795295)
chr4 (123-263)||(28812288-28812427)
chr4 (123-261)||(2055280-2055418)
chr4 (122-263)||(32118714-32118855)
chr4 (123-263)||(14564796-14564936)
chr4 (123-263)||(17847097-17847236)
chr4 (127-263)||(19496107-19496243)
chr4 (123-259)||(23135007-23135143)
chr4 (123-263)||(28159954-28160094)
chr4 (123-259)||(32317957-32318093)
chr4 (122-262)||(33174020-33174160)
chr4 (122-261)||(37381848-37381987)
chr4 (123-258)||(44490324-44490459)
chr4 (123-261)||(24458632-24458770)
chr4 (123-260)||(48149502-48149639)
chr4 (123-259)||(30467004-30467140)
chr4 (124-263)||(10588580-10588719)
chr4 (123-263)||(15985010-15985150)
chr4 (123-259)||(23553069-23553204)
chr4 (123-263)||(30141109-30141249)
chr4 (123-263)||(39995168-39995308)
chr4 (123-259)||(48551765-48551901)
chr4 (123-263)||(9339124-9339267)
chr4 (123-263)||(17993018-17993158)
chr4 (143-263)||(24623148-24623268)
chr4 (123-259)||(25734224-25734360)
chr4 (123-263)||(33693334-33693474)
chr4 (123-261)||(50276139-50276274)
chr4 (123-263)||(50542355-50542495)
chr4 (123-263)||(51371048-51371188)
chr4 (123-263)||(39700045-39700185)
chr4 (123-263)||(31208748-31208884)
chr4 (123-263)||(22298517-22298658)
chr4 (143-263)||(19168816-19168936)
chr4 (123-259)||(25730244-25730380)
chr4 (185-263)||(56555203-56555281)
chr4 (143-263)||(42549643-42549762)
chr4 (123-203)||(20534225-20534305)
chr4 (123-157)||(56555166-56555200)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (123-263)||(7651662-7651802)
chr1 (123-263)||(12143072-12143212)
chr1 (123-263)||(23767415-23767555)
chr1 (123-263)||(41106016-41106156)
chr1 (123-263)||(46825531-46825671)
chr1 (122-263)||(19274559-19274700)
chr1 (123-263)||(19315640-19315780)
chr1 (123-263)||(28425364-28425504)
chr1 (123-263)||(38473627-38473767)
chr1 (123-259)||(49094712-49094848)
chr1 (123-261)||(25988272-25988410)
chr1 (123-263)||(7553017-7553157)
chr1 (123-263)||(36157679-36157818)
chr1 (123-261)||(49814302-49814440)
chr1 (123-263)||(7608767-7608907)
chr1 (123-263)||(26549388-26549528)
chr1 (123-263)||(33674017-33674157)
chr1 (123-263)||(46051450-46051590)
chr1 (123-263)||(23228195-23228335)
chr1 (123-259)||(26069896-26070032)
chr1 (123-263)||(33325727-33325867)
chr1 (125-263)||(24204474-24204612)
chr1 (123-259)||(45350718-45350852)
chr1 (123-259)||(9962755-9962891)
chr1 (123-263)||(18892329-18892469)
chr1 (123-263)||(43396675-43396815)
chr1 (123-259)||(48669397-48669533)
chr1 (123-261)||(36781173-36781311)
chr1 (122-263)||(50533383-50533524)
chr1 (123-263)||(16705870-16706010)
chr1 (123-259)||(37216900-37217036)
chr1 (123-263)||(46095076-46095216)
chr1 (123-263)||(48802332-48802472)
chr1 (123-263)||(50689943-50690083)
chr1 (123-258)||(5400876-5401010)
chr1 (124-259)||(41982237-41982372)
chr1 (123-272)||(9878785-9878934)
chr1 (123-263)||(40721342-40721483)
chr1 (123-259)||(45670487-45670623)
chr1 (123-259)||(8141487-8141623)
chr1 (123-263)||(52146993-52147133)
chr1 (123-263)||(52349925-52350065)
chr1 (123-263)||(18917524-18917664)
chr1 (123-259)||(34971084-34971220)
chr1 (123-263)||(52067652-52067792)
chr1 (142-259)||(9974846-9974963)
chr1 (123-263)||(6711440-6711580)
chr1 (123-263)||(17983899-17984039)
chr1 (123-259)||(18782090-18782226)
chr1 (123-259)||(21965069-21965205)
chr1 (143-263)||(33194672-33194792)
chr1 (143-259)||(48319067-48319183)
chr1 (123-258)||(33714362-33714495)
chr1 (163-263)||(12964646-12964746)
chr1 (123-258)||(21929526-21929666)
chr1 (143-259)||(16506809-16506925)
chr1 (143-263)||(30281631-30281751)
chr1 (123-259)||(25800648-25800781)
chr1 (123-223)||(44978769-44978868)
chr1 (185-263)||(50099220-50099298)
chr1 (215-263)||(44979281-44979329)
chr1 (219-263)||(32373650-32373694)
chr1 (219-261)||(17989864-17989906)
chr1 (233-263)||(49973942-49973972)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (123-263)||(114-254)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (123-263)||(1017044-1017184)
chr3 (123-259)||(1687655-1687791)
chr3 (123-263)||(33151696-33151836)
chr3 (123-263)||(20813442-20813582)
chr3 (123-263)||(21564496-21564636)
chr3 (123-263)||(21656518-21656658)
chr3 (123-259)||(35346472-35346608)
chr3 (123-263)||(38446476-38446616)
chr3 (123-263)||(20086315-20086455)
chr3 (123-263)||(20760072-20760212)
chr3 (123-263)||(31122662-31122802)
chr3 (127-263)||(36314977-36315113)
chr3 (123-259)||(50287570-50287706)
chr3 (127-263)||(19664541-19664677)
chr3 (123-263)||(26455582-26455722)
chr3 (127-263)||(41250886-41251022)
chr3 (123-263)||(42107100-42107240)
chr3 (123-263)||(47329176-47329316)
chr3 (123-263)||(51562162-51562302)
chr3 (123-258)||(21890175-21890310)
chr3 (128-263)||(22851996-22852131)
chr3 (123-258)||(42016878-42017013)
chr3 (130-263)||(12748391-12748524)
chr3 (123-263)||(29677476-29677616)
chr3 (123-259)||(32650821-32650957)
chr3 (123-263)||(44798268-44798407)
chr3 (123-261)||(3697148-3697286)
chr3 (123-261)||(20913755-20913893)
chr3 (123-261)||(20921873-20922011)
chr3 (123-259)||(10618481-10618617)
chr3 (123-263)||(35608132-35608272)
chr3 (123-263)||(37247956-37248096)
chr3 (123-263)||(48651248-48651388)
chr3 (123-272)||(40922166-40922315)
chr3 (123-263)||(27070740-27070880)
chr3 (123-263)||(53196014-53196154)
chr3 (123-263)||(53925980-53926120)
chr3 (127-263)||(55164120-55164256)
chr3 (123-263)||(19268521-19268667)
chr3 (123-263)||(1448736-1448873)
chr3 (123-263)||(39069726-39069866)
chr3 (123-263)||(52821050-52821190)
chr3 (143-261)||(50977866-50977984)
chr3 (143-261)||(51080998-51081116)
chr3 (123-263)||(45380261-45380401)
chr3 (143-259)||(51475267-51475383)
chr3 (143-261)||(34019462-34019580)
chr3 (150-263)||(28699685-28699798)
chr3 (123-263)||(33473240-33473380)
chr3 (143-263)||(50364908-50365028)
chr3 (186-263)||(44152700-44152777)
chr3 (127-248)||(38924003-38924124)
chr3 (199-263)||(47473230-47473294)
chr3 (143-232)||(42641199-42641288)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (123-258)||(15847117-15847252)
chr8 (123-263)||(513308-513447)
chr8 (123-263)||(2533272-2533412)
chr8 (123-259)||(37933646-37933782)
chr8 (123-263)||(3875908-3876048)
chr8 (123-263)||(35443311-35443451)
chr8 (123-263)||(36400071-36400211)
chr8 (123-259)||(38107103-38107239)
chr8 (123-263)||(43806534-43806674)
chr8 (123-261)||(35884431-35884569)
chr8 (123-259)||(259982-260117)
chr8 (123-259)||(440844-440980)
chr8 (123-259)||(655804-655939)
chr8 (123-259)||(841539-841674)
chr8 (123-263)||(1293486-1293626)
chr8 (123-263)||(22683989-22684129)
chr8 (123-263)||(28707447-28707587)
chr8 (123-263)||(38633711-38633851)
chr8 (123-248)||(41536528-41536653)
chr8 (127-263)||(9056343-9056479)
chr8 (143-263)||(23935233-23935353)
chr8 (123-263)||(24430572-24430712)
chr8 (123-263)||(23972296-23972437)
chr8 (123-263)||(28496356-28496495)
chr8 (123-263)||(33651841-33651981)
chr8 (127-263)||(12010549-12010688)
chr8 (143-263)||(7434886-7435006)
chr8 (123-259)||(40301894-40302030)
chr8 (123-263)||(42988228-42988367)
chr8 (123-259)||(38208756-38208893)
chr8 (122-263)||(39513339-39513480)
chr8 (123-263)||(13797089-13797228)
chr8 (123-259)||(4649154-4649290)
chr8 (123-259)||(36218782-36218917)
chr8 (143-263)||(29485287-29485406)
chr8 (143-261)||(6016207-6016325)
chr8 (185-263)||(24193356-24193433)
chr8 (123-183)||(24193131-24193191)
chr8 (198-257)||(8137180-8137239)
chr8 (127-161)||(8137240-8137274)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (123-263)||(218885-219026)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (123-263)||(252439-252579)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (123-259)||(5190-5325)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (123-259)||(5028-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (123-258)||(47967-48102)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (143-263)||(1994-2114)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (123-259)||(13099-13235)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (123-259)||(59609-59745)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (122-259)||(11362-11499)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (123-203)||(1877-1957)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (123-203)||(599-679)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (123-203)||(1914-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (123-203)||(3372-3452)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (210-263)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (213-263)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8216040 - 8215900
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216040 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8215941  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215940 tagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14717745 - 14717609
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717745 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14717646  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717645 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6252112 - 6251972
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6252112 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaat 6252013  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6252012 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 6739956 - 6740096
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6739956 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 6740055  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 30297750 - 30297890
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30297750 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaat 30297849  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35342320 - 35342180
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342320 aatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35342221  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342220 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Original strand, 39002030 - 39002164
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002030 gtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 39002129  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002130 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30863394 - 30863253
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863394 aaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30863295  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41282483 - 41282342
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41282483 aaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41282384  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41282383 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 3352003 - 3352143
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3352003 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 3352102  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3352103 tagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 11000729 - 11000869
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000729 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11000828  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11000829 tagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 16095961 - 16096100
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16095961 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16096059  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096060 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33760471 - 33760611
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760471 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33760570  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33760571 tagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 38964115 - 38964254
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964115 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38964214  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964215 tagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 6600137 - 6600273
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6600137 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6600236  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6600237 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 26593281 - 26593421
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593281 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26593380  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593381 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 27457198 - 27457338
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27457198 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaat 27457297  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27457298 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31710422 - 31710282
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31710422 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 31710323  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710322 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39824696 - 39824556
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39824696 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 39824597  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824596 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40075086 - 40074950
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40075086 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 40074987  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074986 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 4015875 - 4016015
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4015875 aatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 4015974  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4015975 tagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 11692148 - 11692288
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692148 aatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 11692247  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692248 tagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 19659502 - 19659642
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19659502 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaat 19659601  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19659602 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 20079259 - 20079399
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20079259 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 20079358  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20079359 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20408673 - 20408537
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20408673 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaat 20408574  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20408573 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 23128914 - 23129054
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23128914 aatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaat 23129013  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23129014 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 23129054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42993654 - 42993518
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993654 gtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 42993555  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42993554 catctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 43166274 - 43166410
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43166274 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaattagt 43166373  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43166374 catctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8689712 - 8689572
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689712 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8689613  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8689612 tagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14952464 - 14952328
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952464 aatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14952365  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14952364 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1052669 - 1052541
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1052669 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattact 1052570  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggat 255  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052569 catctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 27116100 - 27116236
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27116100 aatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaat 27116199  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27116200 tagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28078406 - 28078546
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078406 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28078505  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28078506 tagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 30208403 - 30208543
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30208403 aatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaat 30208502  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30208503 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 19398194 - 19398330
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  19398194 aatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaat 19398293  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19398294 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6331477 - 6331377
Alignment:
Q  163 taattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6331477 taattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctc 6331378  T
Q  263 t 263  Q
    |    
T  6331377 t 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8695002 - 8694866
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  8695002 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaattagt 8694903  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8694902 catgttcttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035487
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26035467 acaaatggtggataatgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11935585 - 11935450
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11935585 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaat 11935487  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11935486 tagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444962
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
Q  243 acaaatggtggat 255  Q
     ||||||||||||    
T  444974 gcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27510111 - 27509978
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||        |||| |   |||||||||    
T  27510111 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaaaa------ctaaaagg-acttaaaat 27510019  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510018 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6332916 - 6332873
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataat 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6332916 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagaatagttggtaat 6332873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 921162 - 921022
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921162 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 921063  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  921062 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 16246194 - 16246334
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16246293  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16246294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27328724 - 27328584
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27328724 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 27328625  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328624 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28650427 - 28650567
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28650526  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28650527 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40854749 - 40854609
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40854749 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40854650  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854649 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772116
Alignment:
Q  128 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  228 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 11949427 - 11949567
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11949427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatat 11949526  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949527 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34253282 - 34253142
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34253282 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaatat 34253183  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253182 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 41500503 - 41500643
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41500503 aatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaat 41500602  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41500603 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17134370 - 17134229
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134370 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17134271  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17134270 gtagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7379103 - 7378963
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379103 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7379004  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379003 tagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9276714 - 9276574
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9276714 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 9276615  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9276614 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 9276574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33865268 - 33865408
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865268 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33865367  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33865368 tagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37838437 - 37838301
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37838437 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37838338  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37838337 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Original strand, 36444228 - 36444369
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36444228 aaatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaa 36444327  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36444328 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 1106560 - 1106700
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1106560 aatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1106659  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1106660 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2456146 - 2456010
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2456146 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaattagt 2456047  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2456046 catctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 12759751 - 12759890
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  12759751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcct-ctaacacccacttaaaat 12759849  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29737884 - 29737748
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  29737884 gtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaattagt 29737785  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737784 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42630102 - 42629962
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42630102 aatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 42630003  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42630002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430765
Alignment:
Q  129 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  229 tctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 7297235 - 7297373
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7297235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaat 7297334  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297335 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19180561 - 19180422
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19180561 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct-ctaacacccacttaaaat 19180463  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19180462 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25087801 - 25087933
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087801 gtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 25087900  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087901 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33106970 - 33107110
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33106970 aatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 33107069  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33107070 tagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 43249413 - 43249553
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249413 aatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43249512  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249513 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Original strand, 2314980 - 2315114
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2314980 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 2315079  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2315080 catctttttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2057066 - 2056929
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2057066 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaat 2056967  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 260  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2056966 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36211187 - 36211046
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36211187 aaattgtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 36211088  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36211087 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 2094411 - 2094551
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2094411 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaat 2094510  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2094511 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396692
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8396672 acaaatggtggataatgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8899821 - 8899682
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8899821 aatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaac 8899723  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8899722 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 37732194 - 37732334
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37732194 aatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37732293  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37732294 tagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 17484551 - 17484687
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  17484551 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaat 17484650  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17484651 tagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45124259 - 45124120
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  45124259 aatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaat 45124160  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124159 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916128
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  19916108 acaaattgtggataatgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654112
Alignment:
Q  147 tagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaa 246  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  247 atggtggataatg 259  Q
    ||| || ||||||    
T  37654124 atgatgaataatg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Original strand, 41178060 - 41178160
Alignment:
Q  163 taattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41178060 taattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgctc 41178159  T
Q  263 t 263  Q
    |    
T  41178160 t 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9331896 - 9331757
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||  | || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  9331896 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaagat 9331797  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9331796 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14630754 - 14630663
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacaccca 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14630754 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 212
Target Start/End: Original strand, 23671812 - 23671901
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23671812 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 263
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  207 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 165
Target Start/End: Original strand, 28216969 - 28217007
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataa 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28216969 gtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataa 28217007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 1469494 - 1469634
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469494 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1469593  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469594 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 47281125 - 47281265
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281125 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47281224  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281225 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44544550 - 44544409
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44544550 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 44544451  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44544450 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47219286 - 47219145
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47219286 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 47219187  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219186 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30876399 - 30876259
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30876399 aatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaat 30876300  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876299 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 31684135 - 31684275
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31684135 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 31684234  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31684235 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 35600123 - 35600263
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35600123 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 35600222  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600223 tagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 38427564 - 38427704
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427564 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38427663  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427664 tagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47272121 - 47271981
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272121 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 47272022  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47272021 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 47294292 - 47294432
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47294292 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataat 47294391  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294392 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33884460 - 33884323
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884460 aaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 33884361  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884360 ttagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 8162717 - 8162853
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162717 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 8162816  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8162817 catctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 11476557 - 11476697
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476557 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11476656  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11476657 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23842445 - 23842305
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23842445 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaat 23842346  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23842345 tagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 30798369 - 30798509
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798369 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30798468  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30798469 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40851414 - 40851274
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40851414 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40851315  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40851314 tagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48628945 - 48628805
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48628945 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 48628846  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628845 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 37393999 - 37394135
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37393999 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaat 37394098  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394099 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41113517 - 41113377
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41113517 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 41113418  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  41113417 tagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Original strand, 2960641 - 2960768
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960641 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2960740  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatgg 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960741 tagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923220
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 27364340 - 27364480
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364340 aatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 27364439  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364440 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 43752777 - 43752917
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43752777 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaat 43752876  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43752877 tagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7336199 - 7336065
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7336199 aatcgtttcaaaca-gttctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7336101  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7336100 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797664
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
      |||||||||||||||||||    
T  3797644 ttaaatggtggataatgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 11050262 - 11050398
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11050262 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaat 11050361  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11050362 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 43968260 - 43968400
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  43968260 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaat 43968359  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968360 tagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 45723492 - 45723632
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45723492 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 45723591  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723592 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 41139409 - 41139553
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata----gttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41139409 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctta 41139508  T
Q  219 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41139509 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 221415 - 221298
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221415 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 221316  T
Q  223 tagtcatctttttaggca 240  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  221315 tagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 30971942 - 30972082
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30971942 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 30972041  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30972042 tagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 42979339 - 42979479
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42979339 aatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaat 42979438  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42979439 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47120133 - 47119991
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata--gttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47120133 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaa 47120034  T
Q  221 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47120033 attagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248342
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 47579091 - 47579228
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataatt-gcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattag 225  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  47579091 gtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaa 47579190  T
Q  226 tcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579191 ccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 44800415 - 44800547
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44800415 gtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaattagt 44800514  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44800515 catctttttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18353284 - 18353148
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18353284 aatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaat 18353185  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18353184 tagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774108
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  27774128 gcaaatggtggataatgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354400
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
Q  243 acaaatggtggataatg 259  Q
     ||||||||||||||||    
T  37354384 gcaaatggtggataatg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  170 ttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034062
Alignment:
Q  203 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42888989 - 42888937
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttcctt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42888989 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5106181 - 5106127
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaa 178  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5106181 aatcgtttcaaacat-tcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 5106127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025112
Alignment:
Q  220 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctct 43025112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  214 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  212 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29739713 - 29739670
Alignment:
Q  219 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29739713 aaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctct 29739670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3408329 - 3408189
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408329 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 3408230  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408229 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6503859 - 6503718
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503859 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6503760  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503759 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 8178250 - 8178390
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178250 aatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8178349  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178350 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 1915348 - 1915484
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1915348 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaattaat 1915447  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915448 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10256377 - 10256237
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10256377 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 10256278  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10256277 tagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2707599 - 2707459
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2707599 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 2707500  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707499 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12626776 - 12626636
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12626776 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 12626677  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12626676 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29050412 - 29050272
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 29050313  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29050312 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30379157 - 30379021
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30379157 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 30379058  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30379057 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2390405 - 2390267
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  2390405 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataat 2390306  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390305 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9382659 - 9382519
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9382659 aatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 9382560  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9382559 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17943176 - 17943040
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943176 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17943077  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17943076 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 26393010 - 26393146
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26393010 aatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 26393109  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393110 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 17428273 - 17428409
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17428273 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 17428372  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17428373 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 26230933 - 26231073
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26230933 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 26231032  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231033 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11134014 - 11133873
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttcctt-gaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134014 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11133915  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11133914 ttagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 3258808 - 3258948
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-gataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3258808 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 3258906  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3258907 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1077377 - 1077241
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1077377 aatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 1077278  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1077277 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936607
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26936627 acaaatggtggataatactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 252
Target Start/End: Original strand, 2598100 - 2598229
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598100 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2598199  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 252  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598200 tactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16193450 - 16193314
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16193450 aatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 16193351  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16193350 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 6785102 - 6785239
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785102 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6785198  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||    
T  6785199 tagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 248
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224025
Alignment:
Q  142 tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
Q  242 gacaaat 248  Q
    | |||||    
T  35224019 gtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 26196322 - 26196458
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-gataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26196322 aatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaaa 26196420  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196421 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820686
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatg 25820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 10931149 - 10931288
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  10931149 aatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaat 10931247  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatg----acaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||    
T  10931248 tagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataatg 10931288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31376057 - 31375971
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31376057 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 180
Target Start/End: Original strand, 12612972 - 12613029
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaact 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12612972 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 12612849 - 12612927
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgg 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12612849 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctgg 12612927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12196609 - 12196469
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196609 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12196510  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196509 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42273942 - 42273802
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42273942 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 42273843  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273842 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5227530 - 5227390
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5227530 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaat 5227431  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227430 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28264783 - 28264643
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28264783 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 28264684  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264683 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33807781 - 33807921
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33807781 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 33807880  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807881 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 8882014 - 8882152
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882014 aatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8882113  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882114 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26017563 - 26017425
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017563 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26017464  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26017463 tagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 4544986 - 4545126
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544986 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 4545085  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545086 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31591215 - 31591076
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591215 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 31591116  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591115 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31973731 - 31973591
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31973731 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 31973632  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31973631 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35930179 - 35930040
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930179 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35930080  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35930079 tagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 48707734 - 48707874
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48707734 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48707833  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707834 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 55517186 - 55517326
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517186 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 55517285  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517286 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49118751 - 49118616
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49118751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 49118652  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118651 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 11795155 - 11795295
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11795155 aatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 11795254  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795255 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11795295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28812288 - 28812427
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28812288 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 28812386  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28812387 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2055418 - 2055280
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2055418 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaagt 2055319  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055318 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32118855 - 32118714
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32118855 aaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaa 32118756  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118755 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14564936 - 14564796
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14564936 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 14564837  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14564836 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 17847097 - 17847236
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847097 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17847196  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17847197 tagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 19496107 - 19496243
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19496107 gtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaattagt 19496206  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19496207 catctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 23135007 - 23135143
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135007 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23135106  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23135107 tagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatg 23135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28159954 - 28160094
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28159954 aatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28160053  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28160054 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32318093 - 32317957
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32318093 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaat 32317994  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317993 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 262
Target Start/End: Original strand, 33174020 - 33174160
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174020 aaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33174119  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174120 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37381987 - 37381848
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37381987 aaatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaa 37381888  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37381887 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44490459 - 44490324
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44490459 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaagt 44490360  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490359 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 24458632 - 24458770
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24458632 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 24458731  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24458732 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48149639 - 48149502
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48149639 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaat 48149540  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149539 tactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 30467004 - 30467140
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30467004 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaat 30467103  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467104 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 124 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  124 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  224 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15985150 - 15985010
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15985150 aatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 15985051  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985050 cagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23553204 - 23553069
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23553204 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 23553106  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553105 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 30141109 - 30141249
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30141109 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaat 30141208  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30141209 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 39995168 - 39995308
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39995168 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaat 39995267  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39995268 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 48551765 - 48551901
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48551765 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaat 48551864  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48551865 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 9339124 - 9339267
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatt---tttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaa 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9339124 aatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaa 9339223  T
Q  220 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9339224 aattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 17993018 - 17993158
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17993018 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 17993117  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993118 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623148
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24623168 acaaatggtggataatgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 25734224 - 25734360
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25734224 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25734323  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25734324 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33693334 - 33693474
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33693334 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 33693433  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  33693434 tattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 50276139 - 50276274
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50276139 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 50276238  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50276239 tag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 50542355 - 50542495
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50542355 aatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 50542454  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50542455 taatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 51371048 - 51371188
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51371048 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 51371147  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51371148 tagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39700185 - 39700045
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39700185 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaat 39700086  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39700085 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31208884 - 31208748
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31208884 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaat 31208785  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||    ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31208784 tagtcatc----taaacatgataaatggtggataatgctct 31208748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22298658 - 22298517
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22298658 aatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22298559  T
Q  223 tagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22298558 tagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168936
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19168916 acaaatggtggataatgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25730380 - 25730244
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  25730380 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaat 25730281  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25730280 tagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Original strand, 56555203 - 56555281
Alignment:
Q  185 tttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555203 tttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549762
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  42549743 acaaa-ggtggaaaatgctct 42549762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20534305 - 20534225
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20534305 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 157
Target Start/End: Original strand, 56555166 - 56555200
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56555166 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7651802 - 7651662
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651802 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7651703  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651702 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12143212 - 12143072
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143212 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12143113  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143112 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 23767415 - 23767555
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767415 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23767514  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767515 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41106156 - 41106016
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41106156 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41106057  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46825671 - 46825531
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825671 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 46825572  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825571 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19274700 - 19274559
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274700 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 19274601  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19274600 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19315780 - 19315640
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19315780 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 19315681  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315680 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28425364 - 28425504
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28425364 aatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 28425463  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425464 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 38473627 - 38473767
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38473627 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 38473726  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473727 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 49094712 - 49094848
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094712 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49094811  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49094812 tagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 25988272 - 25988410
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25988272 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25988371  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988372 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 7553017 - 7553157
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553017 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7553116  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553117 tagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 36157679 - 36157818
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157679 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 36157777  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157778 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49814440 - 49814302
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814440 aatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49814341  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814340 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 7608767 - 7608907
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7608767 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 7608866  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608867 tagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26549528 - 26549388
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26549528 aatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 26549429  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26549428 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33674157 - 33674017
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674157 aatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33674058  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33674057 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46051590 - 46051450
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  46051590 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaac 46051491  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46051490 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 23228195 - 23228335
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23228195 aatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaat 23228294  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23228295 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26070032 - 26069896
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26070032 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaat 26069933  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069932 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33325867 - 33325727
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33325867 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaat 33325768  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325767 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204612
Alignment:
Q  125 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatta 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  225 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 45350718 - 45350852
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350718 aatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 45350815  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350816 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9962891 - 9962755
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9962891 aatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaat 9962792  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9962791 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18892469 - 18892329
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18892469 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaat 18892370  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892369 tagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43396815 - 43396675
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396815 aatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43396716  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  43396715 tagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 48669397 - 48669533
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48669397 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48669496  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48669497 tagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatg 48669533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 36781173 - 36781311
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36781173 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 36781272  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36781273 tagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 50533524 - 50533383
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50533524 aaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 50533425  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  50533424 ttagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16706010 - 16705870
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16706010 aatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaat 16705911  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16705910 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37217036 - 37216900
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  37217036 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaat 37216937  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37216936 tagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 46095076 - 46095216
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46095076 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaat 46095175  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46095176 tagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 48802332 - 48802472
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48802332 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaat 48802431  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48802432 tagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 50690083 - 50689943
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50690083 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50689984  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  50689983 tagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5401010 - 5400876
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5401010 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaat 5400911  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5400910 tagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  124 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  224 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 9878785 - 9878934
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  9878785 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaat 9878884  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctgtggtgctg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  9878885 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctg 9878934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40721483 - 40721342
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacaccc-acttaaaa 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  40721483 aatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaaa 40721384  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721383 ttaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 45670487 - 45670623
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-gataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45670487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaaa 45670585  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 8141487 - 8141623
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8141487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaat 8141586  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141587 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52147133 - 52146993
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52147133 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 52147034  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52147033 tattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 52349925 - 52350065
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52349925 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 52350024  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52350025 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34971220 - 34971084
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34971220 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaat 34971121  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34971120 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 52067652 - 52067792
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52067652 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 52067751  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52067752 tattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974846
Alignment:
Q  142 tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
Q  242 gacaaatggtggataatg 259  Q
    |  |||||||||||||||    
T  9974863 ggtaaatggtggataatg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6711580 - 6711440
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6711580 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6711481  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  6711480 tagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 17983899 - 17984039
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17983899 aatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaat 17983998  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17983999 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 18782090 - 18782226
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18782090 aatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaat 18782189  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18782190 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21965205 - 21965069
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21965205 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaat 21965106  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21965105 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194792
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  33194772 gcgaatggtggttaatgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  243 acaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Original strand, 33714362 - 33714495
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  33714362 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-acat 33714459  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33714460 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12964746 - 12964646
Alignment:
Q  163 taattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12964746 taattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataatgctc 12964647  T
Q  263 t 263  Q
    |    
T  12964646 t 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21929666 - 21929526
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcattttt-------ggtaccaaatctggctcctaacacccac 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21929666 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccac 21929567  T
Q  216 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21929566 ttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
Q  243 acaaatggtggataatg 259  Q
     ||||||||||||||||    
T  16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281631
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
      |||||||||||||||||||    
T  30281651 taaaatggtggataatgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25800781 - 25800648
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttt----tggtaccaaatctggctcctaacacccactta 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||      |||||||||||||    
T  25800781 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactta 25800689  T
Q  219 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25800688 aaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 44978769 - 44978868
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44978769 aatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaat 44978867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  185 tttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  215 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  219 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 261
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  219 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49973972 - 49973942
Alignment:
Q  233 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973972 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 49973942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 254 - 114
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 155  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1017184 - 1017044
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1017184 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 1017085  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017084 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1687791 - 1687655
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1687791 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1687692  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687691 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33151836 - 33151696
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151836 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33151737  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151736 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813582
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813442 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20813541  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813542 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21564636 - 21564496
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21564636 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaat 21564537  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21564536 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21656658 - 21656518
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656658 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 21656559  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21656558 tagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 35346472 - 35346608
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346472 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35346571  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346572 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38446616 - 38446476
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446616 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38446517  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38446516 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 20086315 - 20086455
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086315 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20086414  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20086415 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 20760072 - 20760212
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20760072 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 20760171  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20760172 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31122802 - 31122662
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31122802 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaat 31122703  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31122702 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 36314977 - 36315113
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36314977 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaattagt 36315076  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315077 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50287706 - 50287570
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50287706 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50287607  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287606 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664541
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26455722 - 26455582
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26455722 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 26455623  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26455622 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41251022 - 41250886
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41251022 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 41250923  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41250922 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 42107100 - 42107240
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107100 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42107199  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42107200 tagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 47329176 - 47329316
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329176 aatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47329275  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47329276 tagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51562302 - 51562162
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51562302 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 51562203  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562202 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21890310 - 21890175
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21890310 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaat 21890211  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890210 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851996
Alignment:
Q  128 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  228 atctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42017013 - 42016878
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42017013 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42016914  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42016913 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748391
Alignment:
Q  130 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  230 ctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 32650821 - 32650957
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650821 aatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 32650920  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32650921 tagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44798407 - 44798268
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798407 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 44798308  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44798307 tactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3697286 - 3697148
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3697286 aatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 3697187  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3697186 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 20913755 - 20913893
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20913755 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20913854  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20913855 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 20921873 - 20922011
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20921873 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20921972  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20921973 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 10618481 - 10618617
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10618481 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 10618580  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618581 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 35608132 - 35608272
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  35608132 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaact 35608231  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35608232 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37248096 - 37247956
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37248096 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37247997  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  37247996 tagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48651388 - 48651248
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48651388 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 48651289  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48651288 taatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 40922166 - 40922315
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40922166 aatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40922265  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctgtggtgctg 272  Q
    |||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  40922266 tagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatgttctttgttgctg 40922315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 27070740 - 27070880
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27070740 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaat 27070839  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27070840 tagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53196154 - 53196014
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53196154 aatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 53196055  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53196054 tagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 53925980 - 53926120
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53925980 aatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 53926079  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53926080 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 55164120 - 55164256
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55164120 gtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaattagt 55164219  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55164220 catctttttaggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19268667 - 19268521
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagca------tagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccact 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||      |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268667 aatcgttttaaacaagtcctaatgtagataacaataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccact 19268568  T
Q  217 taaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268567 taaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 1448736 - 1448873
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1448736 aatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1448832  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1448833 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39069866 - 39069726
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39069866 aatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaat 39069767  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39069766 tagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 52821050 - 52821190
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52821050 aatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaat 52821149  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52821150 tagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977866
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
Q  243 acaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50977884 acaaatggtggataatgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51080998
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
Q  243 acaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51081016 acaaatggtggataatgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 45380261 - 45380401
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-gataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45380261 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaaa 45380359  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45380360 ttagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
Q  243 acaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||    
T  51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019462
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
Q  243 acaaatggtggataatgct 261  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34019480 tcaaatggtggataatgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28699798 - 28699685
Alignment:
Q  150 atagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatg 249  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28699798 atagcttagtagataattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatg 28699699  T
Q  250 gtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||    
T  28699698 gtggataatgctct 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 33473240 - 33473380
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33473240 aatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaat 33473339  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33473340 tagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152700
Alignment:
Q  186 ttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Original strand, 38924003 - 38924124
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  38924003 gtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaattaat 38924102  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaat 248  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  38924103 catctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473230
Alignment:
Q  199 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Original strand, 42641199 - 42641288
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 232  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641199 attgtatatagccaagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15847252 - 15847117
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847252 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 15847153  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15847152 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 513447 - 513308
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513447 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 513348  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  513347 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2533412 - 2533272
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2533412 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaat 2533313  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533312 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37933782 - 37933646
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933782 aatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37933683  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933682 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3876048 - 3875908
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3876048 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaat 3875949  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875948 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35443451 - 35443311
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443451 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35443352  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35443351 tagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 36400071 - 36400211
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  36400071 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaact 36400170  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400171 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38107239 - 38107103
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107239 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38107140  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38107139 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 43806534 - 43806674
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43806534 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaat 43806633  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43806634 tagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Original strand, 35884431 - 35884569
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35884431 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 35884530  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35884531 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 260117 - 259982
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260117 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 260018  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  260017 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 440980 - 440844
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  440980 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 440881  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  440880 tactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 655804 - 655939
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655804 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 655903  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  655904 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 841539 - 841674
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841539 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 841638  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  841639 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1293626 - 1293486
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1293626 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaat 1293527  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293526 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 22683989 - 22684129
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22683989 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22684088  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22684089 tagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28707447 - 28707587
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28707447 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaat 28707546  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707547 tagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 38633711 - 38633851
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38633711 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaat 38633810  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38633811 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Original strand, 41536528 - 41536653
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41536528 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41536627  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41536628 tagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 9056343 - 9056479
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9056343 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaattagt 9056442  T
Q  227 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9056443 catctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935233
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23935253 gcaaatggtggataatgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 24430572 - 24430712
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  24430572 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaat 24430671  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24430672 tagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 23972296 - 23972437
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23972296 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaat 23972395  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgac-aaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23972396 tagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactct 23972437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 28496356 - 28496495
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  28496356 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaat 28496454  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28496455 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33651981 - 33651841
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33651981 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 33651882  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33651881 tagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12010688 - 12010549
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtag---atagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12010688 gtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 12010589  T
Q  224 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12010588 agtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 40301894 - 40302030
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40301894 aatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaat 40301993  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301994 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 42988228 - 42988367
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42988228 aatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 42988326  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42988327 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38208893 - 38208756
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208893 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38208794  T
Q  223 tagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38208793 tagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Original strand, 39513339 - 39513480
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39513339 aaattgtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 39513438  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39513439 ttagtcatctttttaggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13797228 - 13797089
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13797228 aatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatttt-ggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaat 13797130  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  13797129 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctct 13797089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4649290 - 4649154
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  4649290 aatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaat 4649191  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4649190 tagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 36218782 - 36218917
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  36218782 aatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaat 36218880  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36218881 tagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016207
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
Q  243 acaaatggtggataatgct 261  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6016225 acaaatggtggataatgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  185 tttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193191
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcat 24193191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8137239 - 8137180
Alignment:
Q  198 ctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137239 ctggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8137274 - 8137240
Alignment:
Q  127 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137274 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttg 8137240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 219026 - 218885
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaaca-cccacttaaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  219026 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaaa 218927  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218926 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 252439 - 252579
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  252439 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 252538  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  252539 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5325 - 5190
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5325 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 5227  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 5028 - 5164
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5028 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaat 5127  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5128 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48102 - 47967
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48102 aatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 48003  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2114
Alignment:
Q  143 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
Q  243 acaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2094 acaaatggtggataatgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13235 - 13099
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 13136  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13135 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 59609 - 59745
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  59609 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 59708  T
Q  223 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  59709 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11499 - 11362
Alignment:
Q  122 aaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499 aaatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11400  T
Q  222 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11399 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1877
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1957 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 679 - 599
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  679 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Original strand, 1914 - 1994
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1914 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Original strand, 3372 - 3452
Alignment:
Q  123 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggct 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3372 aatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  210 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  213 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University