View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12986_high_1_N (Length: 501)

Name: NF12986_high_1_N
Description: NF12986
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12986_high_1_N
NF12986_high_1_N
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-498)||(16743991-16744489)
chr3 (80-448)||(14842487-14842856)
chr3 (80-448)||(12030073-12030443)
chr3 (80-448)||(2049777-2050147)
chr3 (86-374)||(17912483-17912771)
chr3 (70-448)||(13838852-13839232)
chr3 (69-411)||(15858986-15859331)
chr3 (69-384)||(51158008-51158325)
chr3 (209-374)||(2449238-2449404)
chr3 (80-367)||(15936634-15936922)
chr3 (312-496)||(19231982-19232169)
chr3 (80-367)||(15938476-15938764)
chr3 (328-448)||(19260749-19260869)
chr3 (87-449)||(15614808-15615170)
chr3 (4-189)||(15468520-15468706)
chr3 (80-374)||(45860773-45861068)
chr3 (80-374)||(13954890-13955185)
chr3 (80-374)||(13975722-13976017)
chr3 (4-189)||(22275099-22275285)
chr3 (80-362)||(55316187-55316471)
chr3 (413-491)||(15857120-15857198)
chr3 (80-362)||(41270043-41270327)
chr3 (416-496)||(3992873-3992953)
chr3 (72-340)||(16821099-16821369)
chr3 (416-496)||(55513193-55513273)
chr3 (87-222)||(47984624-47984759)
chr3 (87-222)||(48003198-48003333)
chr3 (416-496)||(2844514-2844594)
chr3 (87-222)||(47993911-47994046)
chr3 (87-222)||(48012484-48012619)
chr3 (416-496)||(54037976-54038056)
chr3 (416-496)||(17955832-17955916)
chr3 (416-496)||(7854305-7854385)
chr3 (1-54)||(2449391-2449444)
chr3 (416-477)||(45581954-45582016)
chr3 (317-358)||(14080715-14080756)
chr3 (80-129)||(19231945-19231994)
chr3 (295-448)||(54651642-54651796)
chr3 (432-489)||(17205019-17205076)
chr3 (416-489)||(38810868-38810941)
chr3 (416-448)||(2449152-2449184)
chr3 (416-448)||(16261777-16261809)
chr3 (416-448)||(16933869-16933901)
chr3 (416-448)||(17912398-17912430)
chr3 (69-101)||(22144532-22144564)
chr3 (416-448)||(23492696-23492728)
chr3 (416-448)||(38168237-38168269)
chr3 (416-448)||(53771365-53771397)
chr3 (434-489)||(12031849-12031904)
chr3 (109-230)||(12264932-12265053)
chr3 (416-489)||(13301323-13301396)
chr3 (416-489)||(13311979-13312052)
chr3 (432-489)||(17191879-17191936)
chr3 (109-224)||(11329098-11329214)
chr3 (416-448)||(11986080-11986112)
chr3 (295-367)||(11986173-11986245)
chr3 (416-448)||(13954804-13954836)
chr3 (416-448)||(14285289-14285321)
chr3 (1-73)||(18969976-18970048)
chr3 (416-448)||(19947026-19947058)
chr3 (416-448)||(30153265-30153297)
chr3 (416-448)||(33342204-33342236)
chr3 (416-448)||(45861122-45861154)
chr3 (416-448)||(51961031-51961063)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-374)||(22907214-22907588)
chr8 (80-496)||(16404852-16405268)
chr8 (87-448)||(16193643-16194005)
chr8 (80-448)||(43373392-43373761)
chr8 (70-448)||(24928716-24929096)
chr8 (209-374)||(5238184-5238350)
chr8 (209-374)||(24661248-24661414)
chr8 (209-374)||(43685643-43685809)
chr8 (83-374)||(17345540-17345832)
chr8 (87-362)||(24548956-24549233)
chr8 (87-362)||(6774258-6774535)
chr8 (80-358)||(21844576-21844856)
chr8 (80-358)||(21851969-21852249)
chr8 (80-362)||(30120690-30120974)
chr8 (416-496)||(274766-274846)
chr8 (416-496)||(641003-641083)
chr8 (416-496)||(826809-826889)
chr8 (416-496)||(24716714-24716794)
chr8 (80-299)||(222754-222975)
chr8 (80-299)||(736377-736598)
chr8 (80-299)||(860272-860493)
chr8 (1-54)||(5238144-5238197)
chr8 (1-54)||(24661401-24661454)
chr8 (1-54)||(43685603-43685656)
chr8 (84-362)||(16674392-16674672)
chr8 (416-496)||(39115598-39115678)
chr8 (70-224)||(23837154-23837308)
chr8 (69-191)||(41246613-41246735)
chr8 (416-448)||(5238404-5238436)
chr8 (416-448)||(22907128-22907160)
chr8 (416-448)||(24385652-24385684)
chr8 (416-448)||(24661162-24661194)
chr8 (416-448)||(43685863-43685895)
chr8 (72-142)||(13662492-13662561)
chr8 (432-489)||(17285543-17285600)
chr8 (432-489)||(21198005-21198062)
chr8 (1-50)||(22321597-22321646)
chr8 (317-358)||(23149985-23150026)
chr8 (317-358)||(23226076-23226117)
chr8 (416-448)||(2545265-2545297)
chr8 (416-448)||(3431176-3431208)
chr8 (416-448)||(22886654-22886686)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-374)||(26680089-26680463)
chr4 (69-496)||(54118120-54118551)
chr4 (69-448)||(13246386-13246769)
chr4 (84-448)||(15675009-15675381)
chr4 (242-448)||(122020-122226)
chr4 (84-448)||(10104170-10104523)
chr4 (209-374)||(10488659-10488825)
chr4 (209-374)||(16327926-16328092)
chr4 (87-347)||(31115603-31115865)
chr4 (80-358)||(10644187-10644467)
chr4 (80-374)||(13048221-13048517)
chr4 (312-448)||(33240901-33241043)
chr4 (80-362)||(47357622-47357906)
chr4 (80-211)||(111362-111493)
chr4 (416-496)||(25119059-25119139)
chr4 (342-448)||(31132545-31132657)
chr4 (1-54)||(10488619-10488672)
chr4 (1-54)||(16328079-16328132)
chr4 (416-496)||(5682380-5682460)
chr4 (177-358)||(40885570-40885753)
chr4 (432-489)||(47534933-47534990)
chr4 (83-158)||(7849970-7850044)
chr4 (80-224)||(15044794-15044938)
chr4 (416-489)||(41165808-41165881)
chr4 (135-224)||(41166083-41166172)
chr4 (416-448)||(14952085-14952117)
chr4 (416-448)||(15135907-15135939)
chr4 (416-448)||(15272211-15272243)
chr4 (416-448)||(16327840-16327872)
chr4 (416-448)||(16609013-16609045)
chr4 (416-448)||(26680517-26680549)
chr4 (69-101)||(44055870-44055902)
chr4 (137-224)||(7185981-7186068)
chr4 (416-448)||(8045272-8045304)
chr4 (317-357)||(13809511-13809551)
chr4 (416-448)||(16523146-16523178)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-374)||(7292905-7293279)
chr7 (68-448)||(13036938-13037322)
chr7 (80-448)||(16211733-16212103)
chr7 (80-489)||(3059933-3060344)
chr7 (80-448)||(11580661-11581035)
chr7 (80-448)||(36052634-36053003)
chr7 (87-374)||(47481031-47481320)
chr7 (209-374)||(11516324-11516490)
chr7 (209-374)||(15441564-15441730)
chr7 (209-374)||(30262129-30262295)
chr7 (80-367)||(18253842-18254130)
chr7 (87-373)||(13320988-13321278)
chr7 (83-356)||(16478968-16479244)
chr7 (80-374)||(25292338-25292633)
chr7 (80-362)||(10989378-10989661)
chr7 (80-358)||(13572644-13572924)
chr7 (98-362)||(13911024-13911292)
chr7 (80-363)||(2437425-2437710)
chr7 (416-496)||(32493898-32493978)
chr7 (83-446)||(295893-296257)
chr7 (1-54)||(15441717-15441770)
chr7 (1-54)||(30262282-30262335)
chr7 (416-496)||(126738-126818)
chr7 (1-54)||(11516284-11516337)
chr7 (416-496)||(1936869-1936949)
chr7 (416-496)||(111121-111201)
chr7 (382-489)||(13377819-13377924)
chr7 (417-496)||(7283908-7283987)
chr7 (332-374)||(14113989-14114031)
chr7 (332-374)||(14423639-14423681)
chr7 (342-448)||(36024372-36024485)
chr7 (432-489)||(13389693-13389750)
chr7 (416-448)||(2029244-2029276)
chr7 (416-448)||(7293333-7293365)
chr7 (416-448)||(11516544-11516576)
chr7 (416-448)||(14113903-14113935)
chr7 (416-448)||(15441478-15441510)
chr7 (379-448)||(15709428-15709501)
chr7 (69-101)||(15822691-15822723)
chr7 (416-448)||(30262043-30262075)
chr7 (416-448)||(42056188-42056220)
chr7 (416-448)||(371417-371449)
chr7 (416-448)||(3049905-3049937)
chr7 (416-448)||(13321334-13321366)
chr7 (416-444)||(15516765-15516793)
chr7 (433-489)||(16919870-16919926)
chr7 (69-224)||(17224075-17224230)
chr7 (416-448)||(25124450-25124482)
chr7 (416-448)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (1-374)||(37066-37440)
scaffold0078 (416-496)||(41632-41712)
scaffold0078 (416-448)||(36980-37012)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (83-498)||(41394191-41394609)
chr1 (80-448)||(20931312-20931682)
chr1 (80-448)||(20445646-20446019)
chr1 (80-448)||(20913004-20913367)
chr1 (80-448)||(20531411-20531783)
chr1 (69-448)||(20893551-20893933)
chr1 (80-448)||(37844374-37844746)
chr1 (209-374)||(51452589-51452755)
chr1 (80-447)||(22227777-22228146)
chr1 (80-447)||(22232474-22232843)
chr1 (87-362)||(2116228-2116506)
chr1 (242-449)||(45051554-45051759)
chr1 (416-496)||(21860334-21860414)
chr1 (80-362)||(5072388-5072672)
chr1 (80-362)||(18601118-18601402)
chr1 (416-490)||(44034829-44034903)
chr1 (87-167)||(45051416-45051496)
chr1 (1-54)||(51452549-51452602)
chr1 (382-489)||(27675086-27675191)
chr1 (416-496)||(41218728-41218808)
chr1 (416-447)||(15861327-15861358)
chr1 (70-101)||(49967607-49967638)
chr1 (432-489)||(13376711-13376768)
chr1 (432-489)||(20177513-20177570)
chr1 (317-358)||(22143361-22143402)
chr1 (416-448)||(51452809-51452841)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (69-496)||(19794581-19795011)
chr2 (80-448)||(36982364-36982737)
chr2 (80-448)||(462706-463075)
chr2 (80-496)||(20627190-20627609)
chr2 (80-448)||(8891209-8891581)
chr2 (80-496)||(43642833-43643250)
chr2 (84-448)||(24341309-24341681)
chr2 (209-374)||(19689401-19689567)
chr2 (209-374)||(23820168-23820334)
chr2 (209-374)||(14906440-14906606)
chr2 (87-374)||(25265390-25265679)
chr2 (209-374)||(20015108-20015274)
chr2 (80-374)||(17396653-17396948)
chr2 (83-324)||(7507894-7508138)
chr2 (80-362)||(19886661-19886945)
chr2 (352-448)||(22863169-22863267)
chr2 (416-496)||(22275045-22275125)
chr2 (416-496)||(22284278-22284358)
chr2 (417-496)||(15633538-15633617)
chr2 (8-54)||(19689554-19689600)
chr2 (1-54)||(14906593-14906646)
chr2 (1-54)||(20015068-20015121)
chr2 (1-54)||(23820128-23820181)
chr2 (416-449)||(19689314-19689347)
chr2 (432-489)||(43646232-43646289)
chr2 (416-448)||(9652796-9652828)
chr2 (416-448)||(14906354-14906386)
chr2 (135-191)||(19669279-19669335)
chr2 (416-448)||(23820388-23820420)
chr2 (416-447)||(25213372-25213403)
chr2 (416-448)||(7507757-7507789)
chr2 (416-448)||(17396567-17396599)
chr2 (437-489)||(19660221-19660273)
chr2 (416-448)||(20015328-20015360)
chr2 (416-448)||(28031134-28031166)
chr2 (382-448)||(31146073-31146138)
chr2 (69-101)||(32465813-32465845)
chr2 (416-448)||(33128372-33128404)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (80-448)||(48565-48935)
scaffold0023 (84-340)||(36065-36323)
scaffold0023 (416-448)||(61122-61154)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (80-448)||(1091-1462)
scaffold0266 (80-448)||(3508-3877)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (69-448)||(23153403-23153786)
chr6 (87-447)||(14626045-14626407)
chr6 (80-374)||(35009439-35009735)
chr6 (83-374)||(1657748-1658040)
chr6 (83-374)||(15862443-15862734)
chr6 (87-449)||(1650020-1650382)
chr6 (80-362)||(25175531-25175815)
chr6 (80-362)||(27653983-27654267)
chr6 (379-448)||(23148266-23148335)
chr6 (416-496)||(19983144-19983224)
chr6 (416-496)||(35015009-35015089)
chr6 (80-362)||(16825752-16826038)
chr6 (83-216)||(27740808-27740941)
chr6 (416-496)||(18583640-18583720)
chr6 (69-223)||(18381821-18381975)
chr6 (291-374)||(27751605-27751688)
chr6 (177-374)||(29665937-29666137)
chr6 (432-489)||(21623506-21623563)
chr6 (416-448)||(18002395-18002427)
chr6 (416-448)||(23995247-23995279)
chr6 (416-448)||(26090059-26090091)
chr6 (416-447)||(4991396-4991427)
chr6 (94-200)||(22361926-22362032)
chr6 (418-448)||(15742120-15742150)
chr6 (317-358)||(16887792-16887833)
chr6 (432-489)||(22361619-22361676)
chr6 (69-98)||(32898745-32898774)
chr6 (317-358)||(33324898-33324939)
chr6 (317-358)||(35136013-35136054)
chr6 (416-448)||(1657661-1657693)
chr6 (417-489)||(14152632-14152704)
chr6 (416-448)||(15862789-15862821)
chr6 (416-448)||(18823283-18823315)
chr6 (416-448)||(18839138-18839170)
chr6 (109-224)||(25367374-25367490)
chr6 (416-448)||(27751742-27751774)
chr6 (416-448)||(32276659-32276691)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (80-445)||(19173-19543)
scaffold0195 (80-374)||(21257-21553)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (80-449)||(36836-37209)
scaffold0077 (417-496)||(15319-15398)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (80-448)||(23506932-23507302)
chr5 (69-448)||(27182471-27182854)
chr5 (88-448)||(18530988-18531355)
chr5 (84-448)||(22053753-22054125)
chr5 (209-374)||(20623066-20623232)
chr5 (209-374)||(21233528-21233694)
chr5 (212-374)||(37052844-37053007)
chr5 (209-374)||(16536294-16536460)
chr5 (83-374)||(34939248-34939540)
chr5 (209-372)||(25900408-25900571)
chr5 (80-362)||(22366481-22366765)
chr5 (80-362)||(25426596-25426880)
chr5 (80-359)||(18777995-18778276)
chr5 (80-362)||(12342-12626)
chr5 (80-362)||(19499867-19500151)
chr5 (80-362)||(21073595-21073879)
chr5 (99-362)||(4199985-4200251)
chr5 (80-359)||(43443398-43443679)
chr5 (80-358)||(27009809-27010089)
chr5 (70-189)||(17471768-17471887)
chr5 (242-362)||(29188284-29188404)
chr5 (87-161)||(29190478-29190552)
chr5 (1-54)||(20623026-20623079)
chr5 (1-54)||(21233681-21233734)
chr5 (1-54)||(25900558-25900611)
chr5 (1-54)||(37052801-37052854)
chr5 (1-54)||(16536254-16536307)
chr5 (417-491)||(11584374-11584448)
chr5 (91-224)||(19862186-19862319)
chr5 (80-224)||(23493885-23494029)
chr5 (416-448)||(16105967-16105999)
chr5 (416-448)||(20623286-20623318)
chr5 (416-448)||(21233442-21233474)
chr5 (416-448)||(25900320-25900352)
chr5 (416-448)||(37053061-37053093)
chr5 (416-489)||(5450695-5450768)
chr5 (432-489)||(21222462-21222519)
chr5 (317-358)||(21310709-21310750)
chr5 (317-358)||(23981516-23981557)
chr5 (416-448)||(108728-108760)
chr5 (416-448)||(9730278-9730310)
chr5 (416-448)||(16536514-16536546)
chr5 (295-367)||(32950879-32950951)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (69-448)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (80-448)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (80-448)||(128095-128464)
scaffold0008 (99-340)||(31697-31942)
scaffold0008 (73-101)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (80-448)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (80-448)||(247366-247738)
scaffold0012 (416-448)||(34075-34107)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (80-448)||(12083-12450)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (70-448)||(171863-172242)
scaffold0001 (70-448)||(177566-177945)
scaffold0001 (69-101)||(70882-70914)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (80-448)||(8846-9215)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (80-448)||(123087-123460)
scaffold0011 (69-101)||(255074-255106)
scaffold0011 (69-101)||(261680-261712)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (80-448)||(26340-26710)
scaffold0162 (87-374)||(8180-8466)
scaffold0162 (432-489)||(6877-6934)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (80-438)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (84-448)||(8820-9192)
scaffold0025 (80-400)||(148688-149012)
scaffold0025 (348-448)||(146838-146938)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (70-448)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (242-446)||(51110-51314)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (80-367)||(48155-48443)
scaffold0049 (417-496)||(20493-20572)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (209-374)||(26892-27058)
scaffold0141 (209-367)||(22637-22796)
scaffold0141 (1-54)||(22597-22650)
scaffold0141 (1-54)||(26852-26905)
scaffold0141 (416-448)||(22857-22889)
scaffold0141 (416-448)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (209-374)||(1582-1748)
scaffold0124 (1-54)||(1735-1788)
scaffold0124 (416-448)||(1496-1528)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (242-448)||(89378-89586)
scaffold0028 (323-448)||(107708-107835)
scaffold0028 (109-191)||(79533-79616)
scaffold0028 (416-447)||(130880-130911)
scaffold0028 (317-358)||(79745-79786)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (87-374)||(41622-41911)
scaffold0125 (408-448)||(41957-41997)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (87-374)||(13480-13769)
scaffold0132 (416-496)||(42677-42754)
scaffold0132 (416-448)||(13824-13856)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (80-367)||(107715-108003)
scaffold0026 (80-358)||(64527-64812)
scaffold0026 (317-359)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (82-374)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (83-374)||(34460-34755)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (87-363)||(2936-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (87-340)||(9371-9626)
scaffold0215 (87-340)||(16269-16524)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (69-211)||(9338-9480)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (242-367)||(5660-5785)
scaffold0772 (416-448)||(5846-5878)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (80-339)||(42965-43226)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (80-324)||(5254-5498)
scaffold0022 (317-357)||(102923-102963)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (80-324)||(3690-3936)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (80-358)||(3-283)
scaffold0116 (416-496)||(30417-30497)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (80-340)||(14083-14344)
scaffold0139 (80-363)||(21115-21399)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (416-496)||(80187-80267)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (80-202)||(48482-48603)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (415-496)||(166116-166197)
scaffold0016 (415-490)||(162036-162111)
scaffold0016 (416-489)||(116410-116483)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (242-362)||(13325-13445)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (416-496)||(31132-31212)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (80-202)||(26-147)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (416-490)||(5735-5809)
scaffold0686 (416-490)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (415-496)||(304-385)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (242-362)||(1304-1424)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (417-496)||(1701-1780)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (417-496)||(19802-19881)
scaffold0122 (417-496)||(24106-24185)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (80-129)||(1815-1863)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (88-157)||(3183-3252)
scaffold0361 (291-374)||(3370-3453)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (109-324)||(54412-54630)
scaffold0066 (109-153)||(45007-45051)
scaffold0066 (416-448)||(45338-45370)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (417-487)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (417-491)||(6261-6335)
scaffold0310 (417-454)||(4-41)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (69-224)||(76984-77139)
scaffold0053 (432-489)||(76699-76756)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (69-191)||(132420-132542)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (416-489)||(1363-1436)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (317-358)||(1546-1587)
scaffold0456 (317-358)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (317-358)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (249-367)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (317-358)||(70307-70348)
scaffold0058 (416-448)||(57392-57424)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (432-489)||(35816-35873)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (416-449)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (416-448)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (416-448)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (416-448)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (416-448)||(13285-13317)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (416-448)||(55904-55936)
scaffold0032 (416-448)||(108075-108107)
scaffold0032 (317-358)||(93773-93814)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (405-448)||(18015-18058)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (320-358)||(1348-1386)
scaffold0409 (320-358)||(9603-9641)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (432-489)||(442-499)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (69-98)||(7522-7551)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (317-358)||(22422-22463)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (69-98)||(38253-38282)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (135-191)||(2476-2532)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (317-357)||(10868-10908)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (416-448)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (416-448)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (416-448)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (416-448)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (416-448)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (416-448)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (416-448)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16744489 - 16743991
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744489 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 16744390  T
Q  101 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744389 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 16744290  T
Q  201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16744289 catagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaat 16744190  T
Q  300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744189 catacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaa 16744090  T
Q  400 aatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttctcc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16744089 aatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcc 16743991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
T  12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
T  2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
Q  86 caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||    
T  17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
Q  186 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 448
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839232
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
Q  268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
Q  368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858986
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
Q  367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 411  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttacaaaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
Q  266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 365  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
Q  366 atcatccataatcaaaatt 384  Q
    || |||||||| |||||||    
T  51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 312 - 496
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232169
Alignment:
Q  312 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 408  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  409 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 328 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  328 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 427  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  428 aagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 449
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615170
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 383  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 15615107  T
Q  384 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 449  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615108 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15468706 - 15468520
Alignment:
Q  4 aaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaacaccaacaacaa 102  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15468706 aaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaacaacaacaacaa 15468607  T
Q  103 ttcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  15468606 ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861068
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 45860871  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  45860872 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 45860971  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45860972 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975722
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13975919  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  13975918 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 13975819  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975818 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 22275099 - 22275285
Alignment:
Q  4 aaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaa 102  Q
    |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275099 aaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaa 22275198  T
Q  103 ttcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  22275199 ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 413 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  413 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatg 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992953
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
Q  72 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctatt 171  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | |    
T  16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
Q  172 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 268  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
Q  269 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844594
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955832
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgct----ctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatgattct 17955832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854385
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2449444 - 2449391
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2449444 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 477
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactcgctctagcttca 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa 19231994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 448
Target Start/End: Original strand, 54651642 - 54651796
Alignment:
Q  295 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaaca 393  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||| || | |  |||||||||||    
T  54651642 acaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaaca 54651741  T
Q  394 tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |  |||| |  | ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  54651742 tgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctta 54651796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810868
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 489
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031904
Alignment:
Q  434 aacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 208  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || ||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  12265053 ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 12264954  T
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaa 230  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  12264953 atttcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13301396 - 13301323
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | || || | |||||||||||||||||||    
T  13301396 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13312052 - 13311979
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | || || | |||||||||||||||||||    
T  13312052 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 17191879 - 17191936
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | | |||||||||||||||||    
T  17191879 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 207  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||| || |     
T  11329214 ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca 11329115  T
Q  208 caattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11329114 caattcaacaacaacat 11329098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11986245 - 11986173
Alignment:
Q  295 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986245 acaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 18969976 - 18970048
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 73  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  18969976 atcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22907588 - 22907214
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907588 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 22907489  T
Q  101 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907488 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 22907389  T
Q  201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22907388 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 22907289  T
Q  300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907288 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404852
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagctt 475  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
Q  476 cactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  16404872 cacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||    
T  16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 384  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
Q  385 catacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928716
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
Q  268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
Q  368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
T  24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
T  6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844576
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851969
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 5238144 - 5238197
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238144 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24661454 - 24661401
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661454 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 43685603 - 43685656
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685603 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674392
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac 16674574  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||    
T  16674573 atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac 16674474  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16674473 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||     
T  23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 191
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 41246711  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  41246712 acttaacaacaacaacatcaattg 41246735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
Q  72 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa 142  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa 13662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 17285543 - 17285600
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  | | |||||||||||||||||||    
T  17285543 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21198062 - 21198005
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  21198062 ctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22321646 - 22321597
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 50  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  22321646 atcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 26680089 - 26680463
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26680089 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatttcaccaaaacaccaacaac 26680188  T
Q  101 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680189 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 26680288  T
Q  201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26680289 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 26680388  T
Q  300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680389 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 69 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118120
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
Q  367 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactact 464  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
Q  465 cgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
     |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54118151 agctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 69 - 448
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
Q  367 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 84 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  442 tacctta 448  Q
    |||||||    
T  122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||   |    
T  10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
T  31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 347  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644467
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||  | |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048221
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||  |    
T  13048517 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca 13048419  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | |||||   ||| ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  13048418 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt 13048319  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048318 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 312 - 448
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
Q  312 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  410 ----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119059
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 448
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  436 cccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 10488619 - 10488672
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10488619 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 16328132 - 16328079
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16328132 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682380
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  177 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 273  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  274 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 47534990 - 47534933
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  47534990 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 178  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||   ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
Q  179 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165808
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
Q  135 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
Q  137 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13809551 - 13809511
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13809551 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 7292905 - 7293279
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292905 atcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 7293004  T
Q  101 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293005 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 7293104  T
Q  201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7293105 catagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 7293204  T
Q  300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7293205 catacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 68 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
Q  68 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
Q  266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 365  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
Q  366 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    || |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 489
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
T  3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
Q  377 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttc 476  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
Q  477 actttagctccta 489  Q
    ||||| |||||||    
T  3060332 acttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
Q  378 ---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||    
T  36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
T  47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
Q  284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 373
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt--aaaca 281  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||    
T  13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 373  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478968
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
Q  182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
Q  280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat 356  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||    
T  16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292338
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |   |||| ||| | || |||  |    
T  25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca 25292535  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |   | |||||| | |||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  25292534 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta 25292435  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292434 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572924
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911024
Alignment:
Q  98 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
T  13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
Q  198 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 293  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
T  13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
Q  294 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
T  13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437710
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 275  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
T  2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
Q  276 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 363  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
T  2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493898
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295893
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
T  296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 278  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
Q  279 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 377  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || |||||||||||||||||| || ||| ||     
T  296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
Q  378 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 446  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15441770 - 15441717
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441770 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 30262335 - 30262282
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262335 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 11516284 - 11516337
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516284 atcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936869
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111121
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 489
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377924
Alignment:
Q  382 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcacttt 481  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T
Q  482 agctccta 489  Q
    ||||||||    
T  13377917 agctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283908
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 7283908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  332 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  332 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 448
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024485
Alignment:
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  436 -cccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||    
T  36024472 ccccccttacctta 36024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 448
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  379 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttac 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 489
Target Start/End: Original strand, 16919870 - 16919926
Alignment:
Q  433 taacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  16919870 taacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||   | ||||||    
T  17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
T  17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37440 - 37066
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440 atcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 37341  T
Q  101 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 37241  T
Q  201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  37240 catagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaat 37141  T
Q  300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37140 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 83 - 498
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394609
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
Q  182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
Q  280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 379  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcact 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
Q  480 ttagctcctatgcttctcc 498  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  41394591 ttagctcctatgattctcc 41394609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531783
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
Q  367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
T  37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
Q  377 tc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228146
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 376  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22228075  T
Q  377 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228076 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232843
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 376  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22232772  T
Q  377 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232773 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116506
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
Q  187 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
Q  284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||| |||||    
T  2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 449
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051759
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccc 440  Q
    |||  || ||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  45051654 agtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaaccccc 45051750  T
Q  441 ttaccttaa 449  Q
    |||||||||    
T  45051751 ttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601118
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctat 490  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 51452549 - 51452602
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452549 atcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 489
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675191
Alignment:
Q  382 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcacttt 481  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T
Q  482 agctccta 489  Q
    ||||||||    
T  27675184 agctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218808
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 101
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13376768 - 13376711
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | | |||||||||||||||||    
T  13376768 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22143402 - 22143361
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22143402 ttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 69 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794581
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
Q  266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 365  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
Q  366 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactac 463  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
Q  464 tcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | |    
T  462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
Q  377 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627190
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | |    
T  20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
T  20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttc 476  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
Q  477 actttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  20627209 acttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891581
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642833
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||    
T  43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagctt 475  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
Q  476 cactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  43642853 cacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 84 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
T  24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396653
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca 17396850  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17396849 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 17396750  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396749 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
Q  182 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  352 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
Q  8 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689600 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14906646 - 14906593
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906646 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20015068 - 20015121
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015068 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 23820128 - 23820181
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23820128 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
Q  135 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 447
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Original strand, 19660221 - 19660273
Alignment:
Q  437 ccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  19660221 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146073
Alignment:
Q  382 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttacctta 31146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 340
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
T  36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| |    
T  3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 448
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
Q  367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626045
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
Q  284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 383  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
Q  384 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626108 tcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650020
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 383  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 1650083  T
Q  384 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 449  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650082 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175815
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||    
T  25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 379 - 448
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  379 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983144
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015009
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825752
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||   || |||  |    
T  16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca 16825940  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||   | |  |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  16825939 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 16825840  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16825839 gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |    
T  27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583720
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 223  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  291 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  177 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 274  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  275 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 372  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  373 at 374  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 447
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
Q  94 caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 192  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||||     
T  22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
Q  193 acaagaat 200  Q
    ||| ||||    
T  22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 418 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  418 gattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16887833 - 16887792
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16887833 ttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22361676 - 22361619
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |  | |||||||||||||||||||    
T  22361676 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 33324898 - 33324939
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33324898 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35136054 - 35136013
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35136054 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 489
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152704
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | || | || || | |||||||||||||||||||    
T  14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 14152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 207  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  25367490 ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca 25367391  T
Q  208 caattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  25367390 caattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 445
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19543
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 445  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 449  Q
       |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15319
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||     
T  27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
Q  367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 88 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
Q  88 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||    
T  18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
Q  188 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 382  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |    
T  18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
Q  383 ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 84 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  212 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  311 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
Q  183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  || |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
Q  281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 372  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18777995
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  |    
T  18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 359  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4199985
Alignment:
Q  99 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
Q  199 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 295  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
T  4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
Q  296 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 362  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
T  4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443398
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |    ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 359  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010089
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471768
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||      
T  17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcag 17471788  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaat 189  Q
    ||| ||  ||||||||||||    
T  17471787 ttaacaataacaacatcaat 17471768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  342 agttggagcacgaatttagca 362  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20623026 - 20623079
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623026 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21233734 - 21233681
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233734 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25900611 - 25900558
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25900611 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 37052801 - 37052854
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37052801 atcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 16536254 - 16536307
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16536254 atcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 491
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatg 491  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 224
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
Q  91 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 189  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
Q  190 tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  19862285 tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 178  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 23493983  T
Q  179 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  23493984 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5450768 - 5450695
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  5450768 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 5450695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21222519 - 21222462
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  21222519 ctaacccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21310750 - 21310709
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21310750 ttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23981557 - 23981516
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  23981557 ttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 32950879 - 32950951
Alignment:
Q  295 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950879 acaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 69 - 448
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
T  41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
T  41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
Q  267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 366  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
Q  367 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |    
T  1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
T  1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
T  128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
Q  99 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
Q  199 atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 294  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
T  31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
Q  295 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 101
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
Q  73 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
T  6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
T  6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
Q  378 c--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
T  12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
Q  378 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12380 caaaatttcatacagcatttg-aaagttacaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 448
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172242
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
Q  268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
Q  368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 448
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177945
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
Q  268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
Q  368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
T  8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
Q  378 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
Q  378 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
T  8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6877
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||| ||||||    
T  6934 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
Q  378 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccc 438  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 84 - 448
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9192
Alignment:
Q  84 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| |||    
T  8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
Q  184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
Q  282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
Q  380 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 400
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149012
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | |    
T  148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
Q  378 --caaaattcatacaacatttgaaa 400  Q
       ||||||||||||||||||||||    
T  148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  348 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  448 a 448  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 448
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272362
Alignment:
Q  70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
Q  170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
Q  268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | |    
T  272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
Q  368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51110
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatctcct 51115  T
Q  442 tacct 446  Q
    |||||    
T  51114 tacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20572
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 22597 - 22650
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22597 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 26852 - 26905
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26852 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1788 - 1735
Alignment:
Q  1 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1788 atcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  440 cttacctta 448  Q
    |||||||||    
T  89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  323 catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 420  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  421 tatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  79533 ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 447
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 79745 - 79786
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  79745 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||    
T  41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
Q  284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 448
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  408 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
T  107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64527
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||     |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
Q  82 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |    
T  828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
Q  182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
T  728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
Q  280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
Q  83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
Q  182 acatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 278  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
T  34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
Q  279 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 363
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
Q  187 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
Q  284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 363  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
Q  87 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
Q  187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
Q  285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
Q  169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 367
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  342 agttggagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 339
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 339  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
T  5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 102963 - 102923
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  102963 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Original strand, 3 - 283
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
Q  277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30497
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatgattct 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| |  | |||  |    
T  14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21115
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  |    
T  21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
Q  278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 363  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
T  21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80267
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatca 202  Q
     |||||||| || ||||||||||    
T  48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 415 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
Alignment:
Q  415 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  415 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctat 490  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116410
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13325
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13346  T
Q  342 agttggagcacgaatttagca 362  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  13345 actaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
Q  180 caacatcaattgcacaagaatca 202  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
T  48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctat 490  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctat 490  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 415 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 304
Alignment:
Q  415 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  342 agttggagcacgaatttagca 362  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1780
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19802
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24106
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatgcttct 496  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
Q  80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa 1863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 157
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
Q  88 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
Q  291 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 324
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 208  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  54412 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 54511  T
Q  209 aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac 304  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  54512 atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac 54610  T
Q  305 acttattatcaattcatgca 324  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  54611 aattatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
Q  109 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca 153  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  45007 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca 45051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 487
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcc 487  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctcctatg 491  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  417 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 454  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||  | || |||    
T  77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 76756 - 76699
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  76756 ctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 132444  T
Q  168 tattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  132443 acttaacaacaacaacatcaattg 132420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1363
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||| ||||||||||||| |||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  249 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 346  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  347 gagcacgaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 93814 - 93773
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  93814 ttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 448
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  405 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1348
Alignment:
Q  320 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1386 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9641 - 9603
Alignment:
Q  320 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9641 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 442 - 499
Alignment:
Q  432 ctaacccccttaccttaattatctccaactactcgctctagcttcactttagctccta 489  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  442 ctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22422
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22463 ttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
Q  69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
Q  135 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Original strand, 10868 - 10908
Alignment:
Q  317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  10868 ttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  416 atgattatgataaagactaacccccttacctta 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University