View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12988_low_3 (Length: 557)

Name: NF12988_low_3
Description: NF12988
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12988_low_3
NF12988_low_3
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (78-511)||(4306516-4306946)
chr7 (216-464)||(9736879-9737129)
chr7 (216-464)||(14644482-14644732)
chr7 (225-464)||(7592947-7593190)
chr7 (216-464)||(14634782-14635032)
chr7 (216-464)||(33292181-33292431)
chr7 (216-464)||(15947377-15947627)
chr7 (225-464)||(15174481-15174724)
chr7 (282-458)||(19352599-19352774)
chr7 (202-464)||(32817917-32818179)
chr7 (196-458)||(11634340-11634603)
chr7 (200-316)||(48711432-48711550)
chr7 (62-159)||(11634643-11634741)
chr7 (387-464)||(13874492-13874568)
chr7 (216-276)||(28344139-28344200)
chr7 (225-256)||(14777367-14777398)
chr7 (225-256)||(15229505-15229536)
chr7 (387-464)||(14777518-14777596)
chr7 (387-464)||(15229656-15229734)
chr7 (385-444)||(48710031-48710091)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (220-464)||(26906250-26906493)
chr1 (200-433)||(21633500-21633732)
chr1 (216-464)||(14272022-14272272)
chr1 (216-464)||(14281888-14282138)
chr1 (236-521)||(28309963-28310236)
chr1 (241-464)||(5378428-5378654)
chr1 (260-422)||(30676766-30676930)
chr1 (387-464)||(21919435-21919512)
chr1 (236-422)||(15810030-15810217)
chr1 (282-453)||(40999050-40999221)
chr1 (216-347)||(3471058-3471191)
chr1 (39-121)||(21633337-21633420)
chr1 (207-254)||(21919580-21919626)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (197-491)||(23622845-23623127)
chr4 (225-464)||(3242291-3242534)
chr4 (225-464)||(54689917-54690160)
chr4 (225-464)||(54699348-54699591)
chr4 (216-464)||(20884453-20884703)
chr4 (225-464)||(26812449-26812692)
chr4 (225-464)||(26821916-26822159)
chr4 (282-464)||(3918069-3918250)
chr4 (282-464)||(37059089-37059270)
chr4 (202-464)||(50516502-50516764)
chr4 (198-358)||(16489950-16490101)
chr4 (282-464)||(15842902-15843083)
chr4 (216-433)||(11482248-11482467)
chr4 (366-464)||(18125416-18125514)
chr4 (333-432)||(45609499-45609598)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (200-464)||(42732581-42732842)
chr5 (225-433)||(31150670-31150868)
chr5 (225-433)||(5600532-5600730)
chr5 (225-433)||(5610178-5610376)
chr5 (225-464)||(24422218-24422461)
chr5 (225-464)||(30444833-30445076)
chr5 (216-464)||(11223309-11223558)
chr5 (225-464)||(24412769-24413012)
chr5 (200-430)||(26652541-26652768)
chr5 (200-430)||(26924126-26924353)
chr5 (225-464)||(30454205-30454448)
chr5 (282-464)||(18569042-18569223)
chr5 (216-464)||(33955504-33955754)
chr5 (225-464)||(30459263-30459506)
chr5 (225-464)||(22489126-22489369)
chr5 (216-458)||(20035932-20036176)
chr5 (216-465)||(20834364-20834615)
chr5 (385-464)||(22448334-22448413)
chr5 (305-430)||(22118140-22118265)
chr5 (225-464)||(13815377-13815617)
chr5 (196-458)||(24244053-24244316)
chr5 (196-458)||(24290677-24290940)
chr5 (62-159)||(24290980-24291078)
chr5 (384-464)||(37514863-37514943)
chr5 (72-159)||(13815686-13815772)
chr5 (62-159)||(24244356-24244454)
chr5 (282-464)||(4635948-4636129)
chr5 (387-432)||(1693703-1693748)
chr5 (285-433)||(16110887-16111037)
chr5 (207-254)||(22457797-22457843)
chr5 (387-432)||(17553829-17553874)
chr5 (225-325)||(17553934-17554025)
chr5 (207-254)||(22448479-22448525)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (200-464)||(31575415-31575676)
chr8 (282-475)||(15833953-15834145)
chr8 (216-464)||(42712182-42712432)
chr8 (216-464)||(12925287-12925537)
chr8 (216-464)||(20030112-20030362)
chr8 (225-478)||(7789068-7789325)
chr8 (216-464)||(20044751-20045001)
chr8 (282-464)||(20714072-20714253)
chr8 (196-464)||(18883164-18883433)
chr8 (196-464)||(18143433-18143702)
chr8 (225-464)||(25051067-25051307)
chr8 (196-458)||(18251743-18252006)
chr8 (72-160)||(18143741-18143828)
chr8 (225-464)||(25037030-25037270)
chr8 (385-458)||(4843732-4843805)
chr8 (216-422)||(12767564-12767772)
chr8 (385-458)||(18233031-18233104)
chr8 (385-458)||(18242482-18242555)
chr8 (62-159)||(18232703-18232801)
chr8 (62-159)||(18242154-18242252)
chr8 (62-159)||(18251605-18251703)
chr8 (385-464)||(12915563-12915642)
chr8 (387-464)||(33592138-33592215)
chr8 (387-464)||(33601777-33601854)
chr8 (327-464)||(24096079-24096217)
chr8 (97-159)||(25037339-25037400)
chr8 (97-159)||(25051376-25051437)
chr8 (74-159)||(18883473-18883557)
chr8 (327-430)||(24634014-24634117)
chr8 (196-273)||(18232841-18232917)
chr8 (196-273)||(18242292-18242368)
chr8 (388-433)||(42896184-42896229)
chr8 (225-273)||(4843921-4843968)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (197-491)||(54624581-54624863)
chr3 (225-491)||(17529838-17530094)
chr3 (268-493)||(32877856-32878080)
chr3 (225-433)||(48978622-48978816)
chr3 (225-433)||(48988162-48988356)
chr3 (225-520)||(19388712-19389002)
chr3 (225-464)||(24794550-24794793)
chr3 (225-464)||(28367657-28367900)
chr3 (225-464)||(28375475-28375718)
chr3 (225-464)||(28383297-28383540)
chr3 (225-464)||(28351724-28351967)
chr3 (216-464)||(5385623-5385873)
chr3 (282-433)||(38529212-38529362)
chr3 (216-474)||(13328272-13328532)
chr3 (216-433)||(46305609-46305827)
chr3 (227-464)||(4951537-4951777)
chr3 (216-422)||(23486974-23487182)
chr3 (366-464)||(4361520-4361618)
chr3 (241-376)||(7784100-7784237)
chr3 (225-256)||(17535002-17535033)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (197-491)||(99909-100191)
scaffold0021 (216-347)||(143102-143235)
scaffold0021 (282-464)||(124050-124230)
scaffold0021 (197-256)||(180832-180889)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (225-433)||(1800445-1800643)
chr2 (225-491)||(22632354-22632610)
chr2 (225-433)||(1790951-1791145)
chr2 (216-458)||(35877449-35877693)
chr2 (216-458)||(35884938-35885182)
chr2 (216-458)||(36724651-36724895)
chr2 (282-464)||(31710470-31710651)
chr2 (282-458)||(24022752-24022927)
chr2 (216-464)||(3396856-3397106)
chr2 (225-464)||(14273146-14273388)
chr2 (385-453)||(16446668-16446736)
chr2 (72-121)||(20011878-20011925)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (198-431)||(24520-24741)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (279-491)||(14791-15002)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (197-408)||(12414990-12415189)
chr6 (225-464)||(23895620-23895863)
chr6 (216-464)||(22066226-22066476)
chr6 (216-464)||(23884425-23884675)
chr6 (300-464)||(10259783-10259946)
chr6 (307-464)||(11421455-11421611)
chr6 (333-458)||(12173473-12173598)
chr6 (225-453)||(18420492-18420724)
chr6 (282-431)||(23110256-23110404)
chr6 (216-453)||(17512238-17512476)
chr6 (282-453)||(14102309-14102480)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (225-464)||(94435-94678)
scaffold0028 (225-464)||(103876-104119)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (216-464)||(2042-2292)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (225-478)||(3474-3731)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (240-455)||(27066-27289)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (225-464)||(30827-31070)
scaffold0040 (282-464)||(10045-10225)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (225-464)||(408269-408512)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (225-464)||(256901-257141)
scaffold0010 (74-159)||(256748-256832)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (385-464)||(2265-2344)
scaffold0053 (205-254)||(2410-2458)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (387-458)||(12558-12629)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (240-276)||(42161-42197)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4306946 - 4306516
Alignment:
Q  78 tcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctc--tatctatttgagtttgtgtttgtaaaatatcttctg----aga 171  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||    |||    
T  4306946 tcttcaacaaacataaacaaactccataatctctcactatattt---tgtctctcattatctctt-gagtttgtatttgtaaaatctcttttgtttgaga 4306851  T
Q  172 tattatttctcttaccnnnnnnnntcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttc 271  Q
    ||| |||| ||| |||        ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4306850 tatcattt-tctaaccaaaacaaatcaccatacaaagtgtaaa-ctaggtttcaagtctattgggcttaatagtttgatatagagttgttccaacctttc 4306753  T
Q  272 ttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagt 371  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  4306752 ttgtgtgatcaataattgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaa--catagtgctattcataagt 4306655  T
Q  372 ttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcatt 471  Q
    ||||||||    ||||||||| | || |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||    
T  4306654 ttctgatagttggatactatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaactaggataaatcttttgtgtgatcttt 4306555  T
Q  472 cttctctcatctctttatttttcatttaacacatttcaca 511  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4306554 cttctctcatctctttattttt-gtttaacatatttcaca 4306516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 9736879 - 9737129
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9736879 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 9736978  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  | |||| |||||||||||||||    |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9736979 atacaggggcta--cagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaactgaatactataatggataatctcacacgaa 9737076  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  9737077 gtgtggggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgt 9737129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14644732 - 14644482
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14644732 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 14644633  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14644632 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 14644535  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14644534 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14644482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 7592947 - 7593190
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  7592947 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag- 7593044  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7593045 gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatggataatctcacacgaggtgtgg 7593143  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  7593144 ggactggaagtagccaggtttggtgaaccaggataactctcttgtgt 7593190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14635032 - 14634782
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14635032 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 14634933  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   | |   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14634932 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagctgcatactatagtggataatctcacacgaa 14634835  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14634834 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14634782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33292431 - 33292181
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  33292431 ctagatctcaagtctattgggctcaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 33292332  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33292331 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 33292234  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  33292233 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 33292181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 15947627 - 15947377
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15947627 ctagatctcaaggctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 15947528  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15947527 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 15947430  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  15947429 gtgtggtgactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 15947377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 15174481 - 15174724
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||     
T  15174481 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataagcctgctgaggttgataatacag- 15174578  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||| |||||||||| || || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  15174579 gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 15174677  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  15174678 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataaatctcctgtgt 15174724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 19352774 - 19352599
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||  || ||||||| | | ||||||||||||| || |    
T  19352774 aagaagtgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaa-cggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagc 19352676  T
Q  382 atgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  19352675 aggagactatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaaccagtataactctc 19352599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 464
Target Start/End: Original strand, 32817917 - 32818179
Alignment:
Q  202 tacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatca---agaattgtaaaagcct 298  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||| ||  |   | ||||||| ||||||    
T  32817917 tacaaagtgtaaa-ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttaagataggaaagttcgaacctttcttgtgcgaaaacaaaaaattgtagaagcct 32818015  T
Q  299 attgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggat 398  Q
       |||||||||||||||| |  ||  | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| |||||    
T  32818016 gcggaggttgataatacaggggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggat 32818113  T
Q  399 aatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  32818114 aatctcacacgaagtgtggggaccggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 32818179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11634603 - 11634340
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  11634603 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 11634505  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||  ||  |  ||| ||| ||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||||||  |||   |||||||    
T  11634504 gaagcctgctgaggttgataatacagaggtta--caaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaactgaatactat 11634407  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  11634406 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 11634340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48711550 - 48711432
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagc 296  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||     ||||||| || ||||    
T  48711550 catacaaagtgtaat-ctaggtctcaagtctattgtgcttaatagtttgagatagaaaagttttaacctttcttgtgtgaaagcaaagaattatagaagc 48711452  T
Q  297 ctattgaggttgataataca 316  Q
    || |||||||||||||||||    
T  48711451 ctgttgaggttgataataca 48711432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11634741 - 11634643
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11634741 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 11634643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Original strand, 13874492 - 13874568
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||  ||||| |||||||| |||| |||||    
T  13874492 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtag-cggattgggtgaaccaggataactctcctgtgt 13874568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 28344139 - 28344200
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtg 276  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  28344139 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccagcctttcttgtg 28344200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 256
Target Start/End: Original strand, 14777367 - 14777398
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777367 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 14777398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 256
Target Start/End: Original strand, 15229505 - 15229536
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229505 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 15229536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Original strand, 14777518 - 14777596
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccga-atttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||  |||||  ||||||||| ||||||||    
T  14777518 actatagtggaaaatctcacacaaagtgtgggaactagacgtagcccacattgggtgaactaggataaatatcttgtgt 14777596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Original strand, 15229656 - 15229734
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccga-atttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||  |||||  ||||||||| ||||||||    
T  15229656 actatagtggaaaatctcacacaaagtgtgggaactagacgtagcccacattgggtgaactaggataaatatcttgtgt 15229734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48710091 - 48710031
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgt-ggggactagaagtagccgaatttagtgaa 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  48710091 atactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtgaa 48710031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 220 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26906493 - 26906250
Alignment:
Q  220 gtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagag 319  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  26906493 gtctcaagtctatttgtcataatagtttgagaaagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagtctgctgaggttgataatacagag 26906394  T
Q  320 tgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtgggg 419  Q
    ||||| | |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  26906393 tgtaa-cagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaacaagatattataatggataatctcacacgaggtatgggg 26906295  T
Q  420 actagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  26906294 actagaagtagcctggtttggtgaaccaggataaatctcgtgtgt 26906250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 433
Target Start/End: Original strand, 21633500 - 21633732
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgat--caagaattgtaaaagcc 297  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||   |||| | | || |||||    
T  21633500 catacaaagtgtaat-ctaggtctcaagtctattgggcataatagtttgagatagaaaagttccaacatttcttgtgtgaaagcaaggaatttagaagcc 21633598  T
Q  298 tattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgga 397  Q
    |  |||||||||||||||||  |||   |||||| ||||||||||| ||| |  ||||| | ||| ||||||||||||  ||  |  |||||||| ||||    
T  21633599 tgctgaggttgataatacag-ttgt-tccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactagtagaatactatagtgga 21633696  T
Q  398 taatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21633697 taatctcacaaaaagtgtggggactagacgtagccg 21633732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14272272 - 14272022
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14272272 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacatttcctgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 14272173  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14272172 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 14272075  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14272074 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14272022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14282138 - 14281888
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14282138 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacatttcctgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 14282039  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14282038 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 14281941  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14281940 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14281888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28310236 - 28309963
Alignment:
Q  236 gcttaatagtttgagatagaattgt-tccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttat 334  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||| |||||||||||        |||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  28310236 gcttaatagtttgagatagggttgtgttcaaccttttttgagtgatcaagaa--------gcctgttaagggtaataatacagactgtaa-cggactgat 28310146  T
Q  335 ctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||   |||||  |||||||  ||  ||||||||||     
T  28310145 ctggtgtgatcaacaacttatagtgttattcggaagtttttgatagcaggatactatagtggataa--ccacacgtagtgtggaaaccggaagtagccg- 28310049  T
Q  435 atttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttatttttcatttaacacatttcacacactatcact 521  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28310048 gttaggtgaatcaggataaatctcttgtgttctttctcttctcccatctc-ttattttttgtttaacacacttcacacactatcact 28309963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5378654 - 5378428
Alignment:
Q  241 atagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctg 337  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||     |||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| || |||||| | |||| |||||    
T  5378654 atagtttgagaaagaattgtaacaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaa-cagactgatctg 5378556  T
Q  338 gtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaat 436  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |    
T  5378555 gtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggt 5378456  T
Q  437 ttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || ||||| |||||||| |||| |||||    
T  5378455 ttggtgaaccaggataattctcctgtgt 5378428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 422
Target Start/End: Original strand, 30676766 - 30676930
Alignment:
Q  260 ttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattata 356  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||  ||||    
T  30676766 ttccaacctttcttgtgtgaaagcaaagaattatataagtatgttgagattgataatacagagtgtaa-cagactgatcttgtgtgatcaagaacatata 30676864  T
Q  357 gttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggact 422  Q
    || ||||||| |||||||| ||| |   ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676865 gtgctattcataagtttcttatagctgaatattgtaatggataatctcacacgaagtgtggggact 30676930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 21919512 - 21919435
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  21919512 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaatcaggataactctcctgtgt 21919435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15810217 - 15810030
Alignment:
Q  236 gcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgt--gatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggactt 332  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||   | |||| |||||||| |||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  15810217 gcttaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctggttcaaagaattgtagaagcatgccgaagttgataatacag-gtgtaa-cggactg 15810121  T
Q  333 atctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgat-actataatggataatctcacacaaagtgtggggact 422  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15810120 atctggtgtgatcaagaccttatagtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtggataatctcacacgaggtgtggggact 15810030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40999221 - 40999050
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||| |  ||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||| | || |    
T  40999221 aagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaa-caaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgttagc 40999123  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataa 453  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||  ||| ||||| ||||||||    
T  40999122 aagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaaccaggataa 40999050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3471191 - 3471058
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3471191 ctagatctcaagtctattgggtttaatagtttgagataggaagagttctaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 3471092  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaa 347  Q
    |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3471091 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaa 3471058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Original strand, 21633337 - 21633420
Alignment:
Q  39 atctctctcaaagcaaaaagccttcattctctct--caagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatattt 121  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21633337 atctctctcaaagcaaaa-gcaatcattctctctatcaagctctttaacaaacacaaacaaactccataatctctcactatattt 21633420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21919626 - 21919580
Alignment:
Q  207 agtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag 254  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919626 agtgtaaa-ctagttctcaagtctattgggcttaatagtttgagatag 21919580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 197 - 491
Target Start/End: Original strand, 23622845 - 23623127
Alignment:
Q  197 caccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23622845 caccatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagc 23622933  T
Q  297 ctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgg 396  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  23622934 ctgctgaggttgataatacagagtgtaa-cagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtgg 23623032  T
Q  397 ataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttattt 491  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  23623033 ataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctttcttctctcatctcttaattt 23623127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 3242534 - 3242291
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3242534 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 3242436  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  3242435 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 3242338  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  3242337 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 3242291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 54690160 - 54689917
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  54690160 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 54690062  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  54690061 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 54689964  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  54689963 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 54689917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 54699591 - 54699348
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  54699591 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 54699493  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  54699492 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 54699395  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  54699394 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 54699348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 20884703 - 20884453
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20884703 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 20884604  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20884603 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 20884506  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||| |||| |||||    
T  20884505 gtgtggggactggaagtagccgggtttggggaaccaggataactctcctgtgt 20884453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 26812449 - 26812692
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  26812449 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 26812546  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  26812547 gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 26812645  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26812646 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 26812692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 26821916 - 26822159
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  26821916 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 26822013  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  26822014 gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 26822112  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26822113 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 26822159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 3918069 - 3918250
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||| || |    
T  3918069 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatgctagtcagaagtttctgttagc 3918166  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  3918167 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 3918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 37059089 - 37059270
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||| ||||||||||||| || |    
T  37059089 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 37059186  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  37059187 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 37059270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 50516764 - 50516502
Alignment:
Q  202 tacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcct 298  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||     ||||||||||| |||||    
T  50516764 tacaaagtgtaaaa-tagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaagcaaagaattgtaacagcct 50516666  T
Q  299 attgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggat 398  Q
      |||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||| |||||   |||   |||||||| |||||    
T  50516665 gctgaggttgataataca-agggtta-cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttctaccaacggaatactatagtggat 50516568  T
Q  399 aatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||| | ||| |||||||| |||| |||||    
T  50516567 aatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggggaaccaggataactctcctgtgt 50516502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16490101 - 16489950
Alignment:
Q  198 accatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcc 297  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||| ||| ||| |    
T  16490101 accatacaaagcgtaa--ctagatctcaagtttattgggcttaatagtttgagatagaattttt------ttttttgtgtgatcaagaatcgtagaagtc 16490010  T
Q  298 tattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagt 358  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16490009 tgctgaggttgataatactgagtgtaa-cagactgatatggtgtgatcaacaaattatagt 16489950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 15843083 - 15842902
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  15843083 aagaattgtagaagcctgcttaggttgataatacag-gtgtaa-cagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagc 15842986  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  15842985 aagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaagataactctcctgtgt 15842902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 433
Target Start/End: Original strand, 11482248 - 11482467
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| |||||   |||||||||||    
T  11482248 ctagatctcaagtctattcggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagccggctgaggttgata 11482347  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| || ||||||||| || |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11482348 atacaggggtta--cggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatagtggataatctcacacgaa 11482445  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11482446 gtgtggggactagaagtagccg 11482467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18125514 - 18125416
Alignment:
Q  366 agaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||   || || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18125514 agaagtttttgttagcaggatactataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgt 18125416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 432
Target Start/End: Original strand, 45609499 - 45609598
Alignment:
Q  333 atctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagcc 432  Q
    |||||||||||||||  |  |||||| ||||||| ||||||||||||    ||||| ||| |||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||    
T  45609499 atctggtgtgatcaaggacatatagtgctattcaaaagtttctgatagttggataccatagtggataatctcatacgaagtgcgaggactggaagtagcc 45609598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 42732842 - 42732581
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagccta 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42732842 catacaaagtgtaaa-ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaagagtttcaacctttcttgtgtgatcaagaattgtagaagcctg 42732744  T
Q  300 ttgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggata 399  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||||||  || |   |||||||| ||||||    
T  42732743 ttgaggttgataatacag-gggttct-ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagctgaatactatagtggata 42732646  T
Q  400 atctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  42732645 atctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgt 42732581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31150868 - 31150670
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31150868 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 31150778  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  31150777 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 31150679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 5600532 - 5600730
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5600532 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 5600622  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  5600623 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactgg 5600721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 5610178 - 5610376
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5610178 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 5610268  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  5610269 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactgg 5610367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 24422218 - 24422461
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  24422218 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 24422316  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  24422317 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 24422414  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  24422415 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 24422461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30445076 - 30444833
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  30445076 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 30444979  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30444978 gtgttat-ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 30444880  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  30444879 ggactggaagtagccgggtttggtgaatcaggataactctcctgtgt 30444833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 11223309 - 11223558
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  11223309 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 11223408  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||||| |  ||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11223409 atacaggggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct-accactgtatactataatggataatctcacacgaa 11223505  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  11223506 gtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttttgtgt 11223558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 24412769 - 24413012
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  24412769 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 24412867  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  | |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  24412868 ggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 24412965  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  24412966 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 24413012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 430
Target Start/End: Original strand, 26652541 - 26652768
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagccta 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26652541 catacaaagtgtaaa-ctagatctcaagtctactgggcttaatagtttgagatagaagagttacaacctttcttgtgtgatcaagaattgtagaagtcca 26652639  T
Q  300 ttgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggata 399  Q
      ||||||||||||||| || ||  | | ||| || |||||||||||| |  | ||||| ||| | ||||||||||  || |   |||||||| |||||     
T  26652640 ccgaggttgataataca-agggttct-gaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagctgaatactatagtggatt 26652737  T
Q  400 atctcacacaaagtgtggggactagaagtag 430  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26652738 atctcacacgaagtgtggggactggaagtag 26652768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 430
Target Start/End: Original strand, 26924126 - 26924353
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagccta 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26924126 catacaaagtgtaaa-ctagatctcaagtctactgggcttaatagtttgagatagaagagttacaacctttcttgtgtgatcaagaattgtagaagtcca 26924224  T
Q  300 ttgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggata 399  Q
      ||||||||||||||| || ||  | | ||| || |||||||||||| |  | ||||| ||| | ||||||||||  || |   |||||||| |||||     
T  26924225 ccgaggttgataataca-agggttct-gaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagctgaatactatagtggatt 26924322  T
Q  400 atctcacacaaagtgtggggactagaagtag 430  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26924323 atctcacacgaagtgtggggactggaagtag 26924353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30454448 - 30454205
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  30454448 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 30454351  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30454350 gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 30454252  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  30454251 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 30454205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 18569042 - 18569223
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || |    
T  18569042 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 18569139  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  18569140 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 18569223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33955754 - 33955504
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  33955754 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 33955655  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33955654 atacagtggtta--cgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 33955557  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  33955556 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 33955504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30459506 - 30459263
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||     
T  30459506 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgccgaggttgataatacag- 30459409  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30459408 gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 30459310  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  30459309 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 30459263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 22489126 - 22489369
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||     
T  22489126 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacag- 22489223  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  22489224 gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 22489322  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  22489323 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 22489369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 458
Target Start/End: Original strand, 20035932 - 20036176
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||     |||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  20035932 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaaccttttttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctaaggttgata 20036031  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    ||| || | || || ||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||  |     
T  20036032 atatagtg-gttat-ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatagtggataatctcacatgat 20036129  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  20036130 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 20036176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 465
Target Start/End: Original strand, 20834364 - 20834615
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||| | ||||||  ||||||||||     
T  20834364 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgacataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattggagaagcctgctgaggttgatt 20834463  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  || ||| ||||||| ||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| |||||||||||||||  |    
T  20834464 atacagtggtta--cgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgga 20834561  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtg 465  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20834562 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtg 20834615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22448413 - 22448334
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22448413 atactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcttgtgt 22448334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22118265 - 22118140
Alignment:
Q  305 gttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatct 403  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||    
T  22118265 gttgataatacaggatgtaa-cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgttagcaagacaactataatggataatct 22118167  T
Q  404 cacacaaagtgtggggactagaagtag 430  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  22118166 cacacgaggtgtggggactggaagtag 22118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815377
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa-aagcctattgaggttgataatacagagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||  |     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13815617 aagtttattgggcttaatagtttaagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataataca-agg 13815520  T
Q  321 gtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtgggga 420  Q
    || | | || | ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13815519 gtta-cagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgggga 13815421  T
Q  421 ctagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  13815420 ctggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 13815377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24244316 - 24244053
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  24244316 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaa-aattccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 24244218  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     || |||  |||||||||||||||||||  ||  |  ||| ||| ||||||||||| |  || ||||  |  | |||||||||||  |||   |||||||    
T  24244217 gaatcctgctgaggttgataatacagaggtta--caaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaactgaatactat 24244120  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  24244119 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 24244053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24290940 - 24290677
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  24290940 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaa-aattccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 24290842  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     || |||  |||||||||||||||||||  ||  |  ||| ||| ||||||||||| |  || ||||  |  | |||||||||||  |||   |||||||    
T  24290841 gaatcctgctgaggttgataatacagaggtta--caaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaactgaatactat 24290744  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  24290743 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 24290677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24291078 - 24290980
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24291078 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 24290980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 37514943 - 37514863
Alignment:
Q  384 gatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| ||||||||| |||||    
T  37514943 gatactatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaaccagtataaatctcatgtgt 37514863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13815772 - 13815686
Alignment:
Q  72 tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  13815772 tcaagctcttcaacaaacacaatcaaactccataagctctcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtctgtatttgtaaaa 13815686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24244454 - 24244356
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24244454 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgcttgtaaaa 24244356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 4635948 - 4636129
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||| || |    
T  4635948 aagaattgtagaagcctgctgaggttgataaaacag-gtgtaa-cggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtgctggtcagaagtttctgttagc 4636045  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| |||||||||||||   | |||||||||||  || ||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  4636046 aagacaactatagtggataatctcacgtgaggtgtggggactgaaaatagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgt 4636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1693748 - 1693703
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagcc 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1693748 actataatggaaaatctcacacaaagtgtggggactagacgtagcc 1693703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 433
Target Start/End: Original strand, 16110887 - 16111037
Alignment:
Q  285 aattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatg 384  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| | || |  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||  |||||| |||||  | |    
T  16110887 aattgtataaacctgttgatgttgataatacagaatgtaa-cagattggtctggtgtgatcaagaacatatagtgttattccaaagtttttgatagtagg 16110985  T
Q  385 atactataatggat---aatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  16110986 atactataatggatggtaatctcacacgaagtgtcgggactggaagtagccg 16111037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22457843 - 22457797
Alignment:
Q  207 agtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag 254  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457843 agtgtaaa-ctagatcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag 22457797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17553874 - 17553829
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagcc 432  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17553874 actatagtggaaaatctcacacaaagtgtggggactagacgtagcc 17553829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17554025 - 17553934
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||     |||||||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||| | ||||||| ||||||    
T  17554025 aagtctattgggcttaatagtttgagata----tg-----acctttcttgtgtgctcaagaattgtagaaacctactaaggttaacaatacagggtgtaa 17553935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22448525 - 22448479
Alignment:
Q  207 agtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag 254  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22448525 agtgtaaa-ctagatctaaagtctattgggcttaatagtttgagatag 22448479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31575676 - 31575415
Alignment:
Q  200 catacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagccta 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  31575676 catacaaagtgtaaa-ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaagagttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtagaagcttg 31575578  T
Q  300 ttgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggata 399  Q
     ||||||||||||||||| | ||  | ||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||||||  || |   |||||||| ||||||    
T  31575577 ctgaggttgataatacag-gggttct-ggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagctgaatactatagtggata 31575480  T
Q  400 atctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  31575479 atctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcttgtgt 31575415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 282 - 475
Target Start/End: Original strand, 15833953 - 15834145
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||| | || |    
T  15833953 aagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaa-cgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagttagc 15834051  T
Q  382 atgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattcttc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  15834052 atgatactataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaaccaagataaatctcttgtgttataattcttc 15834145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 42712432 - 42712182
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  42712432 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 42712333  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  42712332 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 42712235  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  42712234 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 42712182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 12925287 - 12925537
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatca---agaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  12925287 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaaacaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 12925386  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12925387 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 12925484  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  12925485 gtgtggggactggaagtagtcgggtttcgtgaaccaggataactctcctgtgt 12925537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 20030112 - 20030362
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20030112 ctagatctcaagtctatttggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 20030211  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||| |   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20030212 atacagggatta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttataccaactgtatactatagtggataatctcacacgaa 20030309  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20030310 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgt 20030362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7789325 - 7789068
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7789325 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 7789227  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  | |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  7789226 ggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 7789129  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattcttctct 478  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  7789128 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattcttcttctct 7789068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 20044751 - 20045001
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20044751 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 20044850  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  20044851 atacaggggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatcgtggataatctcacacgaa 20044948  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  20044949 gtgtggggactggatgtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgt 20045001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 20714072 - 20714253
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  20714072 aagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaa-cagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagc 20714169  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  20714170 aagacaactataatggataatgtcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgt 20714253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18883433 - 18883164
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  18883433 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 18883335  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||| |||||   |||   |||||||    
T  18883334 gaagcctgctgaggttgataatacagagggta--cgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttctaccaactgaatactat 18883237  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  18883236 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 18883164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18143702 - 18143433
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  18143702 tcaccatacaaagcgtgaatttagttctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 18143604  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || || | | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||| |   |||   || ||||    
T  18143603 gaagcctactgaggttgataataca-agggtta-cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttttaccaactgaatgctat 18143506  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  18143505 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaagataactctcctgtgt 18143433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051067
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa-aagcctattgaggttgataatacagagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||     
T  25051307 aagtatattgggcttaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacagagg 25051209  T
Q  321 gtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtgggga 420  Q
     ||  | |||| ||||||||||||||| | ||||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25051208 tta--cagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggga 25051111  T
Q  421 ctagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || |||||||||  |||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  25051110 ctggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgt 25051067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 458
Target Start/End: Original strand, 18251743 - 18252006
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa 292  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     |||||||||||    
T  18251743 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaa 18251841  T
Q  293 -aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactat 391  Q
     || |||  |||||||||||||||||||  ||  |  ||| ||| ||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||||||  |||   |||||||    
T  18251842 gaatcctgctgaggttgataatacagaggtta--caaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaactgaatactat 18251939  T
Q  392 aatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  18251940 agtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaatcaggataactctc 18252006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18143828 - 18143741
Alignment:
Q  72 tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaat 160  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143828 tcaagctcttcaacaaacacaatcaaactccataagctctcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaat 18143741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037030
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa-aagcctattgaggttgataatacagagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||     
T  25037270 aagtatattgggcttaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacagagg 25037172  T
Q  321 gtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtgggga 420  Q
     ||  | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25037171 tta--cagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggga 25037074  T
Q  421 ctagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || |||||||||  |||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  25037073 ctggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgt 25037030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4843805 - 4843732
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  4843805 atactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttagtgaaccaggataactctc 4843732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 422
Target Start/End: Original strand, 12767564 - 12767772
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  12767564 ctagatctcaagtctattgagcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 12767663  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12767664 atacaggggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatctcacacgaa 12767761  T
Q  412 gtgtggggact 422  Q
     ||||||||||    
T  12767762 atgtggggact 12767772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 458
Target Start/End: Original strand, 18233031 - 18233104
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  18233031 atactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 18233104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 458
Target Start/End: Original strand, 18242482 - 18242555
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  18242482 atactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 18242555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 18232703 - 18232801
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18232703 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 18232801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 18242154 - 18242252
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18242154 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 18242252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 18251605 - 18251703
Alignment:
Q  62 tcattctctc--tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18251605 tcattctctcaatcaagctcttcaacaaacacattcaaactccataagctttcactatattta-ttgtatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 18251703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 464
Target Start/End: Original strand, 12915563 - 12915642
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  12915563 atactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 12915642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33592215 - 33592138
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| |||| |||||    
T  33592215 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgt 33592138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33601854 - 33601777
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| |||| |||||    
T  33601854 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgt 33601777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24096217 - 24096079
Alignment:
Q  327 ggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgt-ggggactaga 425  Q
    ||||| || |||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  24096217 ggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagcaagatactatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactgga 24096118  T
Q  426 agtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  24096117 agtagtcgagtttggtgaaccagaataaatctcctgtgt 24096079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25037400 - 25037339
Alignment:
Q  97 aactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25037400 aactccataagctcacactatattta-ttgtctctctatccttttgagattgtgtttgtaaaa 25037339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25051437 - 25051376
Alignment:
Q  97 aactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25051437 aactccataagctcacactatattta-ttgtctctctatccttttgagattgtgtttgtaaaa 25051376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18883557 - 18883473
Alignment:
Q  74 aagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18883557 aagctcttccacaaacacaatcaaactccataagctctcactagattta-ttgtatcattatctctttgagttcgtgtttgtaaaa 18883473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 430
Target Start/End: Original strand, 24634014 - 24634117
Alignment:
Q  327 ggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaa 426  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||||||  || |   |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  24634014 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagctgaatactatagtggataatatcacacgaagtgtggggactggaa 24634113  T
Q  427 gtag 430  Q
    ||||    
T  24634114 gtag 24634117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 273
Target Start/End: Original strand, 18232841 - 18232917
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttctt 273  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18232841 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaa-aattccaacctttctt 18232917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 273
Target Start/End: Original strand, 18242292 - 18242368
Alignment:
Q  196 tcaccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttctt 273  Q
    ||||||||||||| || |   ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18242292 tcaccatacaaagagtgatcttagttctcaagtctattgggctgaatagtttgagatagaa-aattccaacctttctt 18242368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42896229 - 42896184
Alignment:
Q  388 ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  42896229 ctatagtggataatctcacacgaagtgtggagactggaagtagccg 42896184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843921
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttctt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagtttgagatagaa-aattccaacctttctt 4843921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 491
Target Start/End: Original strand, 54624581 - 54624863
Alignment:
Q  197 caccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |         |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  54624581 caccatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagatct---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagc 54624669  T
Q  297 ctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgg 396  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  54624670 ctgctgaggttgataatacagagtgtaa-cagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtgg 54624768  T
Q  397 ataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttattt 491  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  54624769 ataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctttcttctctcatctcttaattt 54624863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 225 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17530094 - 17529838
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17530094 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 17530004  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  17530003 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 17529905  T
Q  425 aagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttattt 491  Q
    | |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  17529904 acgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctctcttctctcatctcttaattt 17529838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 268 - 493
Target Start/End: Original strand, 32877856 - 32878080
Alignment:
Q  268 tttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcag 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32877856 tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa-cagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcag 32877954  T
Q  368 aagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtga 466  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||      
T  32877955 aagtttatgatagcatgatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttc 32878053  T
Q  467 tcattcttctctcatctctttattttt 493  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  32878054 tctctcttctctcatctcttaattttt 32878080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 48978622 - 48978816
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48978622 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 48978712  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  48978713 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgat----ggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 48978807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 48988162 - 48988356
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48988162 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 48988252  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  48988253 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgat----ggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 48988347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 520
Target Start/End: Original strand, 19388712 - 19389002
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaa-cctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgt 322  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||        ||||  ||||| | |||||||| ||||     
T  19388712 aagtctattaggattagtagtttgagataagagttgtttcaaacctttcttgtgtgatcatgaa--------gcctgctgaggataataatacatagtgc 19388803  T
Q  323 aatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgata-acatga-tactataatggataatctcacacaaagtgtgggga 420  Q
    |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  19388804 aatcagactgatatggtgtcatcaacaacttatagtgctattcagaagtttatgatatagctgaatactatagtcgataatctcacacgaagtgtgggga 19388903  T
Q  421 ctagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttatttttcatttaacacatttcacacactatcac 520  Q
    || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19388904 cttgaagtagccgattttggtgaaccaggataaaactcttgtgttctctttcttctcttatctc-ttaattttaacttaacacacttcacacactatcac 19389002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24794793 - 24794550
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  24794793 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 24794695  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  24794694 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 24794597  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  24794596 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 24794550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28367900 - 28367657
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  28367900 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 28367802  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28367801 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 28367704  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  28367703 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 28367657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28375718 - 28375475
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  28375718 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 28375620  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28375619 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 28375522  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  28375521 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 28375475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28383540 - 28383297
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  28383540 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 28383442  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28383441 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 28383344  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  28383343 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 28383297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28351967 - 28351724
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  28351967 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctaaggttgataatacaga 28351869  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28351868 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 28351771  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||| |||||    
T  28351770 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccagcataactctcctgtgt 28351724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 5385623 - 5385873
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  ||||||||||     
T  5385623 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgatg 5385722  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatg-atactataatggataatctcacacaa 410  Q
    |||||| |  ||  |  ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  5385723 atacagtggtta--catactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct-atcagctgtatactatagtggataatctcacacga 5385819  T
Q  411 agtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  5385820 agtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 5385873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38529362 - 38529212
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||| |||||| || |    
T  38529362 aagaattgtagaagcctactgaggttgataataca-agtgtaa-cagactcatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagc 38529265  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  38529264 aagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggcactggaagtagccg 38529212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13328532 - 13328272
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  13328532 ctagatctcaagtctactgggattaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgata 13328433  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    ||||| || || | |||||| ||||||||||||||| |  | |||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13328432 ataca-agggtta-cggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatagtggataatctcacacgaa 13328335  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattctt 474  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| || ||||| |||| ||||| || ||||||    
T  13328334 gtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaaccaagataactctcctgtgttattattctt 13328272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46305827 - 46305609
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  46305827 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 46305728  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||| | |||||||||||| || ||    
T  46305727 atacagtggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactaaagtggataatctca-acgaa 46305631  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  46305630 gtgtggggactggaagtagccg 46305609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 464
Target Start/End: Original strand, 4951537 - 4951777
Alignment:
Q  227 gtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttctt------gtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagt 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||      ||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||    
T  4951537 gtctatttggcttaatagtttgagatagaaaatttc-aacctttcttttgctagtgtg-taaagaattgtagaaggctgttgaggttgataatacag-gt 4951633  T
Q  321 gtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatac-tataatggataatctcacacaaagtgtgggg 419  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||| |  || |||| ||| |||||| |||||| || || || |  |||| ||||||||||||||| | ||||| ||    
T  4951634 gtaa-cagactgatctggtgtgaccaataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctcacacgaggtgtgagg 4951732  T
Q  420 actagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  4951733 acttgaagtagtcgagtttggtgaaccaagataactctcatgtgt 4951777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 422
Target Start/End: Original strand, 23486974 - 23487182
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||  |     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23486974 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaagctttcttgtgcaaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 23487073  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    ||||| || || | | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23487074 ataca-agggtta-cagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatctcacacgaa 23487171  T
Q  412 gtgtggggact 422  Q
     ||||||||||    
T  23487172 atgtggggact 23487182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4361618 - 4361520
Alignment:
Q  366 agaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||   || || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4361618 agaagtttttgttagcaggatactataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgt 4361520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7784237 - 7784100
Alignment:
Q  241 atagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctg 337  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||     |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  7784237 atagtttgagaaagaattgtaacaacctttcttgtaggaaggaaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaa-cagactgatctg 7784139  T
Q  338 gtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctg 376  Q
    |||||||||| |  |||||||  || ||| |||||||||    
T  7784138 gtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctg 7784100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17535033 - 17535002
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17535033 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 17535002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 491
Target Start/End: Original strand, 99909 - 100191
Alignment:
Q  197 caccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  99909 caccatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcatagaagc 99997  T
Q  297 ctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgg 396  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  99998 ttgttgaggttgataatacagagtgtaa-cagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactataatgg 100096  T
Q  397 ataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttattt 491  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  100097 ataatctcacacgtagtgtggggactggacatagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctctcttctctcatctcttaattt 100191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Original strand, 143102 - 143235
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagata-gaattgttccaacctttcttgtgtga---tcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  143102 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 143201  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaa 347  Q
    |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||    
T  143202 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaa 143235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 124050 - 124230
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||    
T  124050 aagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac 124147  T
Q  382 atgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
       |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||  |||| |||||||| |||| |||||    
T  124148 tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtaacaggatttgatgaaccaggataactctcctgtgt 124230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Original strand, 180832 - 180889
Alignment:
Q  197 caccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 256  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180832 caccatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaa 180889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 1800445 - 1800643
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1800445 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 1800535  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  1800536 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 1800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 491
Target Start/End: Original strand, 22632354 - 22632610
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22632354 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 22632444  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  22632445 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagcaggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 22632543  T
Q  425 aagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctctcatctctttattt 491  Q
    | |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  22632544 acgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctctcttctctcatctcttaattt 22632610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Original strand, 1790951 - 1791145
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1790951 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa 1791041  T
Q  325 tcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactag 424  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  1791042 -cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgat----ggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactgg 1791136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 458
Target Start/End: Original strand, 35877449 - 35877693
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  35877449 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 35877548  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35877549 atacagtggtta--cgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 35877646  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  35877647 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 35877693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 458
Target Start/End: Original strand, 35884938 - 35885182
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  35884938 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 35885037  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35885038 atacagtggtta--cgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 35885135  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  35885136 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 35885182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 458
Target Start/End: Original strand, 36724651 - 36724895
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  36724651 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 36724750  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36724751 atacagtggtta--cgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 36724848  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  36724849 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 36724895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31710651 - 31710470
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  31710651 aagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacag-gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagc 31710554  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  31710553 aagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaacaaggataactctcatgtgt 31710470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 282 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24022927 - 24022752
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  24022927 aagaattgtagaagcctgttgaggttgataatacag-gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagc 24022830  T
Q  382 atga-tactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||  ||| |||||  ||||||| ||||    
T  24022829 aagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggaattggaagtagccgggtttggtgaacgaggataactctc 24022752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 3396856 - 3397106
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     ||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  3396856 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattttagaagtctgctgaggttgata 3396955  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||  |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3396956 atacaatggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatagtggataatctcacacgaa 3397053  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  3397054 gtgtggggactagaagtagctgggtttggtgaaccatgataactctcctgtgt 3397106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 14273146 - 14273388
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagag 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| || |    
T  14273146 aagtctattgggcttaatagtttaagatagaaaa-ttccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatatag-g 14273243  T
Q  320 tgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggg 418  Q
    ||||| | |||| || ||||||||| || |  ||||||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  14273244 tgtaa-cagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgga 14273342  T
Q  419 gactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||  |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14273343 gactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcgtgtgt 14273388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 453
Target Start/End: Original strand, 16446668 - 16446736
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataa 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||    
T  16446668 atactatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtgatccaggataa 16446736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20011925 - 20011878
Alignment:
Q  72 tcaagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatattt 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20011925 tcaatctcttcaacaaacataagcaaactccataa--tctcactatattt 20011878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 431
Target Start/End: Original strand, 24520 - 24741
Alignment:
Q  198 accatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagcc 297  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||         ||||||||||||||| ||| |||||    
T  24520 accatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggtttaatagtttgatatagaacttttcc---------tgtgtgatcaagaatcgtagaagcc 24608  T
Q  298 tattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgga 397  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  24609 tgctgaggttgataatacagagtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggatactatagtgga 24707  T
Q  398 taatctcacacaaagtgtggggactagaagtagc 431  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  24708 taatctcacacgtagtgtggggactggacgtagc 24741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15002 - 14791
Alignment:
Q  279 atcaagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgat 378  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15002 atcaagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa-cagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgat 14904  T
Q  379 aacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaa-tctcttgtgtgatcattcttctc 477  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||  ||  | ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  14903 agcaggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccg-gttaggcgaaccaggataaattctcttgtgttctctttcttctc 14805  T
Q  478 tcatctctttattt 491  Q
    ||||||||| ||||    
T  14804 tcatctcttaattt 14791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 408
Target Start/End: Original strand, 12414990 - 12415189
Alignment:
Q  197 caccatacaaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatcaagaattgtaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12414990 caccatacaaagtgtaa--ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatagaact---------tttcttgtgtgatcaagaatcgtagaagc 12415078  T
Q  297 ctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatgg 396  Q
    ||  |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12415079 ctgctatggttaataatacagagtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgataagaggatactataatgg 12415177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 23895863 - 23895620
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  23895863 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 23895766  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  23895765 gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 23895667  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  23895666 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 23895620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 22066226 - 22066476
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22066226 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 22066325  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| |||| |||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22066326 atacagtggtta--cggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggataatctcacacgaa 22066423  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  22066424 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 22066476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 23884425 - 23884675
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23884425 ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 23884524  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  23884525 atacagtggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaactgcatactatagtggacaatctcacacgaa 23884622  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  23884623 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 23884675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10259946 - 10259783
Alignment:
Q  300 ttgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggata 399  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  || || ||||||||| |||| |    
T  10259946 ttgaggtttataatacagggtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagcaggatactatagtggaga 10259848  T
Q  400 atctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| ||| |||| |||| |||||    
T  10259847 atcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaaccagaataattctcctgtgt 10259783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 11421611 - 11421455
Alignment:
Q  307 tgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcac 406  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11421611 tgataatacatggtgtaa-cagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgatactatagtggataatctcac 11421513  T
Q  407 acaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||||    
T  11421512 acgaggtgtggggactggaagtagccggatttgatgaactaggataattatcttgtgt 11421455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 458
Target Start/End: Original strand, 12173473 - 12173598
Alignment:
Q  333 atctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagcc 432  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  12173473 atctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgatactatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaagtagcc 12173572  T
Q  433 gaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    || ||| |||||  | ||||||||||    
T  12173573 gagtttggtgaactatgataaatctc 12173598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 453
Target Start/End: Original strand, 18420492 - 18420724
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttg-agatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc-----aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||  ||      |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  18420492 aagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctattgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 18420589  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |  |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| || |||||||||||| | |||| |    
T  18420590 gtgtaa-cggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtgtataatctcacacgaggtgtcg 18420688  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataa 453  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  18420689 ggactggaagtagccgggttttgtgaaccaggataa 18420724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23110404 - 23110256
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  23110404 aagaattttagaagcctgttgatgttgataatattgggtgtaatag-acttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagc 23110306  T
Q  382 atgatactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagc 431  Q
       |||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||    
T  23110305 cgaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaagtagc 23110256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17512476 - 17512238
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtg---atcaagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| |   |  |||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  17512476 ctagatctcaagtctattgggcttaatagttttagataggaaaagttccaacctttctcgtgcgtaaacaaagaattgtagaagcctgctaaggttgata 17512377  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| || ||  | |||| |||| |||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  17512376 atacagggt-ta--cagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaactgtatactatagtggataatctcacaagaa 17512280  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataa 453  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  17512279 gtgtggggactgaaagtagccgagtttggtgaaccaggataa 17512238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 453
Target Start/End: Original strand, 14102309 - 14102480
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||||| |  ||| ||| ||| ||| ||||||||| || |    
T  14102309 aagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacagg-ctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  382 atgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataa 453  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 14102480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 94678 - 94435
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  94678 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 94580  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  94579 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 94482  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  94481 ggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgt 94435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 104119 - 103876
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  104119 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 104021  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  104020 ggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 103923  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  103922 ggactggaattagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 103876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 464
Target Start/End: Original strand, 2042 - 2292
Alignment:
Q  216 ctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag-aattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaaaagcctattgaggttgata 311  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  2042 ctagatctcaagtctatttggcttaatagtttgagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgata 2141  T
Q  312 atacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaa 411  Q
    |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | |||||||| |   |||   |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2142 atacagggatta--cggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttataccaactgtatactatagtggataatctcacacgaa 2239  T
Q  412 gtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2240 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 478
Target Start/End: Original strand, 3474 - 3731
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3474 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 3572  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |  ||  | |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  3573 ggtta--cagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 3670  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgtgatcattcttctct 478  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||    
T  3671 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattcttcttctct 3731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27289 - 27066
Alignment:
Q  240 aatagtttgagatagaa-ttgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa-aagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttat 334  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  27289 aatagtttgagagagaaattgttccaacctttcttgtgcgaaagcaaagaattgtaataagcctgctgaggttgataatacagagtgtaa-cgaattgat 27191  T
Q  335 ctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactata----atggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtag 430  Q
    || |||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||||||||    |||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27190 ctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgatagttggatactatagtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtag 27091  T
Q  431 ccgaatttagtgaatcaggataaat 455  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  27090 ccgactttggtgagtcaggttaaat 27066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31070 - 30827
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  31070 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag- 30973  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||  || ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30972 gtgtta-ctgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtgttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 30874  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  30873 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 30827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 464
Target Start/End: Original strand, 10045 - 10225
Alignment:
Q  282 aagaattgtaaaagcctattgaggttgataatacagagtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataac 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  10045 aagaattgtagaagcctattgaggttgataatacag-gtgtaa-cagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagc 10142  T
Q  382 atga-tactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    | ||  |||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  10143 aagacaactatagtggataatctcacacggggtgtggggactggaa-tagccgtgtttggtgaaccaagataactctcatgtgt 10225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 408269 - 408512
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaattgttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtaaaagcctattgaggttgataatacaga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||     
T  408269 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgaagaggttgataatacag- 408366  T
Q  319 gtgtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgata-ctataatggataatctcacacaaagtgtgg 417  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  408367 gtgtta-cggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 408465  T
Q  418 ggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  408466 ggactggaagtagacgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257141
Alignment:
Q  225 aagtctattgggcttaatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtgtgatc---aagaattgtaa-aagcctattgaggttgataatacagagt 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |     ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||     
T  256901 aagtctattgggctgaatagtttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgcaaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacagagg 256999  T
Q  321 gtaatcggacttatctggtgtgatcaacaaattatagttctattcagaagtttctgataacatgatactataatggataatctcacacaaagtgtgggga 420  Q
     ||  || ||| ||||||||||||||| |  |||||||  |  | ||||||||||   |||   |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  257000 tta--cgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaactgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgggga 257097  T
Q  421 ctagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    || |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  257098 ctggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 257141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Original strand, 256748 - 256832
Alignment:
Q  74 aagctcttcaacaaatataagcaaactccataagctctcactatatttacttgtctctctatctatttgagtttgtgtttgtaaaa 159  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  256748 aagctcttcaacaaacgcaatcaaactccataagctctcactatattta-ttatatcattatctctttgagtttgtgtttgtaaaa 256832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2265
Alignment:
Q  385 atactataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctcttgtgt 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||| |||||    
T  2344 atactatagtggataatctcacaagaagtgtggggactagaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgt 2265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2458 - 2410
Alignment:
Q  205 aaagtgtaaagctaggtcttaagtctattgggcttaatagtttgagatag 254  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2458 aaagtgtaaa-ctagatctcaagtctattgggcttaatagtttgagatag 2410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12629 - 12558
Alignment:
Q  387 actataatggataatctcacacaaagtgtggggactagaagtagccgaatttagtgaatcaggataaatctc 458  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||    
T  12629 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctc 12558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42197 - 42161
Alignment:
Q  240 aatagtttgagatagaattgttccaacctttcttgtg 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42197 aatagtttgagaaagaattgttcaaacctttcttgtg 42161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University