View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13020_low_29 (Length: 236)

Name: NF13020_low_29
Description: NF13020
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13020_low_29
NF13020_low_29
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (7-236)||(22072913-22073142)
chr7 (11-236)||(16219611-16219834)
chr7 (11-229)||(811032-811248)
chr7 (22-236)||(16056343-16056554)
chr7 (7-229)||(47831807-47832027)
chr7 (7-236)||(67745-67971)
chr7 (11-236)||(18005650-18005873)
chr7 (11-229)||(44014182-44014395)
chr7 (7-177)||(34200786-34200951)
chr7 (22-236)||(12901338-12901551)
chr7 (10-130)||(3564363-3564482)
chr7 (7-177)||(11995983-11996148)
chr7 (7-177)||(16495402-16495567)
chr7 (7-177)||(28505254-28505419)
chr7 (7-177)||(15754843-15755008)
chr7 (7-130)||(13647325-13647447)
chr7 (7-131)||(2280117-2280238)
chr7 (7-127)||(38227481-38227599)
chr7 (10-130)||(48273392-48273511)
chr7 (7-127)||(12698831-12698951)
chr7 (7-127)||(9509189-9509308)
chr7 (7-127)||(16386249-16386369)
chr7 (10-127)||(18456415-18456530)
chr7 (10-130)||(456321-456439)
chr7 (10-130)||(11972496-11972614)
chr7 (10-130)||(14949166-14949284)
chr7 (10-130)||(15376757-15376875)
chr7 (10-130)||(16232520-16232638)
chr7 (10-130)||(16410059-16410177)
chr7 (10-130)||(18640272-18640390)
chr7 (26-229)||(20220090-20220290)
chr7 (10-130)||(20385167-20385285)
chr7 (10-130)||(21189639-21189757)
chr7 (14-130)||(24275175-24275289)
chr7 (10-130)||(32125491-32125609)
chr7 (10-130)||(41522917-41523035)
chr7 (10-130)||(41525379-41525497)
chr7 (11-130)||(11393331-11393448)
chr7 (7-130)||(18430709-18430830)
chr7 (7-127)||(26211995-26212115)
chr7 (22-187)||(1867937-1868101)
chr7 (29-187)||(12255733-12255892)
chr7 (10-130)||(24702238-24702356)
chr7 (10-130)||(27216860-27216978)
chr7 (10-130)||(44116509-44116627)
chr7 (22-189)||(14044761-14044928)
chr7 (22-189)||(14354791-14354958)
chr7 (10-123)||(16213684-16213795)
chr7 (10-170)||(17061919-17062077)
chr7 (10-130)||(3386333-3386451)
chr7 (7-127)||(10589039-10589158)
chr7 (10-119)||(13869346-13869453)
chr7 (7-187)||(19486686-19486865)
chr7 (22-130)||(15144037-15144143)
chr7 (9-108)||(40443393-40443490)
chr7 (7-77)||(27847881-27847951)
chr7 (10-130)||(13831373-13831491)
chr7 (30-187)||(15008441-15008597)
chr7 (179-229)||(16324175-16324225)
chr7 (10-130)||(24704688-24704803)
chr7 (14-130)||(38898420-38898535)
chr7 (7-131)||(10063816-10063939)
chr7 (10-60)||(20110556-20110606)
chr7 (152-212)||(9389615-9389675)
chr7 (93-236)||(15113028-15113170)
chr7 (13-76)||(18154894-18154956)
chr7 (35-136)||(14036282-14036384)
chr7 (35-136)||(14346312-14346414)
chr7 (33-79)||(48991206-48991252)
chr7 (11-60)||(14932802-14932851)
chr7 (11-60)||(15356237-15356286)
chr7 (11-60)||(15360351-15360400)
chr7 (26-130)||(12756715-12756817)
chr7 (93-177)||(15116565-15116648)
chr7 (10-60)||(26356106-26356156)
chr7 (10-60)||(26358558-26358608)
chr7 (11-60)||(19649557-19649606)
chr7 (8-60)||(2832509-2832561)
chr7 (28-76)||(9177718-9177766)
chr7 (74-130)||(26356027-26356083)
chr7 (74-130)||(26358479-26358535)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (7-236)||(38855146-38855372)
chr8 (7-229)||(6520368-6520587)
chr8 (11-229)||(21285601-21285817)
chr8 (11-223)||(23760751-23760961)
chr8 (22-223)||(983312-983512)
chr8 (19-229)||(21673716-21673924)
chr8 (7-177)||(5866230-5866395)
chr8 (7-177)||(21490995-21491160)
chr8 (7-131)||(16092340-16092463)
chr8 (7-177)||(17140916-17141081)
chr8 (26-229)||(37116366-37116569)
chr8 (7-127)||(18818411-18818530)
chr8 (26-236)||(20498581-20498790)
chr8 (8-127)||(28649046-28649164)
chr8 (7-127)||(7372778-7372897)
chr8 (26-229)||(17266893-17267096)
chr8 (11-187)||(26355643-26355815)
chr8 (4-121)||(6759255-6759371)
chr8 (7-127)||(21919002-21919121)
chr8 (7-121)||(23406379-23406492)
chr8 (7-177)||(21249384-21249550)
chr8 (7-177)||(21255222-21255388)
chr8 (7-127)||(20536208-20536327)
chr8 (7-127)||(21923930-21924049)
chr8 (7-127)||(22626736-22626854)
chr8 (26-223)||(24353039-24353235)
chr8 (10-130)||(14409488-14409606)
chr8 (7-131)||(22875065-22875187)
chr8 (10-130)||(1484402-1484520)
chr8 (10-130)||(5853336-5853454)
chr8 (10-130)||(15203275-15203393)
chr8 (14-130)||(16413360-16413474)
chr8 (10-130)||(20403227-20403345)
chr8 (10-130)||(22001753-22001871)
chr8 (7-177)||(17612062-17612231)
chr8 (26-177)||(17439458-17439609)
chr8 (7-85)||(18879275-18879352)
chr8 (7-108)||(31971257-31971356)
chr8 (10-130)||(20046239-20046357)
chr8 (10-130)||(41598188-41598306)
chr8 (14-187)||(13508027-13508199)
chr8 (7-108)||(16199666-16199765)
chr8 (7-127)||(21395984-21396101)
chr8 (7-127)||(21790477-21790594)
chr8 (10-130)||(4483281-4483398)
chr8 (10-130)||(4542417-4542535)
chr8 (90-229)||(22364745-22364882)
chr8 (14-187)||(13597559-13597731)
chr8 (7-127)||(21389454-21389571)
chr8 (7-127)||(21778780-21778897)
chr8 (7-108)||(45131019-45131117)
chr8 (10-131)||(26219717-26219835)
chr8 (10-130)||(19896265-19896386)
chr8 (10-131)||(26225291-26225409)
chr8 (14-115)||(45290754-45290853)
chr8 (4-119)||(19937061-19937174)
chr8 (8-130)||(26223917-26224037)
chr8 (23-119)||(15070571-15070665)
chr8 (10-130)||(14823774-14823891)
chr8 (26-79)||(19154936-19154989)
chr8 (26-130)||(19801426-19801527)
chr8 (10-130)||(25484319-25484430)
chr8 (9-127)||(18678104-18678221)
chr8 (90-136)||(40492844-40492890)
chr8 (8-76)||(23648554-23648621)
chr8 (9-127)||(32121734-32121851)
chr8 (94-177)||(18862430-18862512)
chr8 (94-177)||(21383896-21383978)
chr8 (94-177)||(21387316-21387398)
chr8 (94-177)||(21411189-21411271)
chr8 (94-177)||(21805681-21805763)
chr8 (94-177)||(21827799-21827881)
chr8 (93-189)||(14103165-14103260)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (7-236)||(21329391-21329618)
chr5 (7-236)||(21502049-21502277)
chr5 (7-236)||(26011929-26012154)
chr5 (26-236)||(20026834-20027043)
chr5 (11-187)||(21565546-21565720)
chr5 (11-176)||(22959489-22959649)
chr5 (7-177)||(19660791-19660956)
chr5 (7-187)||(19668898-19669073)
chr5 (7-127)||(21729066-21729185)
chr5 (7-127)||(21808391-21808510)
chr5 (7-130)||(9077952-9078074)
chr5 (26-229)||(22178120-22178323)
chr5 (7-116)||(21997547-21997655)
chr5 (10-127)||(24529223-24529339)
chr5 (7-127)||(24493569-24493687)
chr5 (7-127)||(25421532-25421651)
chr5 (26-176)||(22144068-22144217)
chr5 (7-129)||(1096467-1096588)
chr5 (7-127)||(8286844-8286964)
chr5 (7-127)||(13025311-13025429)
chr5 (7-127)||(13095495-13095613)
chr5 (7-127)||(23390498-23390617)
chr5 (7-106)||(36314577-36314675)
chr5 (10-131)||(22412187-22412306)
chr5 (10-130)||(264812-264930)
chr5 (10-130)||(10732984-10733102)
chr5 (10-130)||(20909012-20909130)
chr5 (7-127)||(25431395-25431513)
chr5 (10-130)||(39363384-39363502)
chr5 (10-130)||(29329934-29330052)
chr5 (10-130)||(42245409-42245527)
chr5 (10-130)||(36154827-36154942)
chr5 (10-130)||(20902053-20902172)
chr5 (7-127)||(22075018-22075138)
chr5 (10-119)||(39245136-39245243)
chr5 (10-130)||(2154658-2154776)
chr5 (10-130)||(11581243-11581361)
chr5 (10-130)||(29345980-29346098)
chr5 (10-119)||(10775731-10775838)
chr5 (10-130)||(29348453-29348571)
chr5 (10-130)||(29350926-29351044)
chr5 (13-119)||(18319089-18319193)
chr5 (10-119)||(31061068-31061175)
chr5 (10-119)||(38619434-38619541)
chr5 (7-187)||(40725853-40726032)
chr5 (10-130)||(32027393-32027511)
chr5 (7-78)||(21293020-21293090)
chr5 (14-130)||(37723910-37724023)
chr5 (10-94)||(20918028-20918110)
chr5 (11-119)||(23064512-23064618)
chr5 (60-164)||(29448055-29448159)
chr5 (10-60)||(20806854-20806904)
chr5 (13-119)||(24067110-24067214)
chr5 (11-60)||(26704075-26704124)
chr5 (11-60)||(26973808-26973857)
chr5 (23-77)||(26732884-26732937)
chr5 (74-131)||(20766118-20766174)
chr5 (116-177)||(21741486-21741545)
chr5 (21-107)||(18418594-18418678)
chr5 (94-177)||(10753603-10753685)
chr5 (9-60)||(17517269-17517320)
chr5 (94-177)||(21871525-21871607)
chr5 (94-177)||(21875805-21875887)
chr5 (94-177)||(22120149-22120231)
chr5 (26-77)||(26740697-26740747)
chr5 (146-177)||(36314685-36314716)
chr5 (26-76)||(15796438-15796487)
chr5 (60-127)||(18356367-18356432)
chr5 (34-94)||(21873277-21873336)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-229)||(6024-6244)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (7-236)||(23019408-23019633)
chr6 (22-236)||(19668386-19668599)
chr6 (7-177)||(28496427-28496592)
chr6 (7-177)||(29808838-29809003)
chr6 (22-187)||(25644335-25644500)
chr6 (11-236)||(19652199-19652420)
chr6 (22-178)||(9098465-9098620)
chr6 (7-177)||(1561303-1561468)
chr6 (7-130)||(29060540-29060662)
chr6 (7-131)||(20109140-20109261)
chr6 (7-127)||(16496244-16496363)
chr6 (8-135)||(18409821-18409947)
chr6 (7-130)||(25629354-25629476)
chr6 (7-106)||(27333241-27333339)
chr6 (7-106)||(27393981-27394079)
chr6 (7-130)||(20593773-20593895)
chr6 (7-121)||(20076700-20076812)
chr6 (8-130)||(30676754-30676874)
chr6 (10-170)||(22782227-22782385)
chr6 (7-127)||(17287798-17287917)
chr6 (7-130)||(19303540-19303661)
chr6 (10-130)||(12742317-12742435)
chr6 (10-130)||(18334636-18334754)
chr6 (10-130)||(19005046-19005164)
chr6 (10-130)||(19858963-19859081)
chr6 (7-127)||(20360962-20361081)
chr6 (10-130)||(24422547-24422665)
chr6 (10-130)||(25656629-25656747)
chr6 (10-130)||(33861794-33861912)
chr6 (10-130)||(33864278-33864396)
chr6 (7-108)||(20638304-20638404)
chr6 (7-229)||(22080640-22080846)
chr6 (10-130)||(2291224-2291342)
chr6 (10-130)||(8055029-8055147)
chr6 (7-127)||(22780229-22780348)
chr6 (10-130)||(25754809-25754927)
chr6 (10-130)||(26924684-26924802)
chr6 (8-130)||(34963371-34963491)
chr6 (7-187)||(8227453-8227632)
chr6 (10-130)||(1540955-1541073)
chr6 (10-130)||(1595549-1595667)
chr6 (10-130)||(20556936-20557054)
chr6 (10-130)||(25688502-25688620)
chr6 (7-79)||(16920679-16920751)
chr6 (26-229)||(23076749-23076952)
chr6 (7-79)||(35245586-35245658)
chr6 (13-119)||(16448582-16448686)
chr6 (10-130)||(3852061-3852179)
chr6 (19-111)||(4185839-4185930)
chr6 (26-130)||(18456735-18456837)
chr6 (26-130)||(18461895-18461997)
chr6 (7-75)||(22831503-22831571)
chr6 (7-69)||(25714417-25714478)
chr6 (26-229)||(35008167-35008370)
chr6 (19-111)||(4186379-4186470)
chr6 (177-236)||(27333179-27333238)
chr6 (177-236)||(27393919-27393978)
chr6 (26-108)||(18821866-18821946)
chr6 (26-70)||(11185524-11185568)
chr6 (151-229)||(28103799-28103877)
chr6 (11-228)||(31155301-31155514)
chr6 (90-189)||(18696570-18696667)
chr6 (59-187)||(18706356-18706483)
chr6 (9-60)||(19848063-19848114)
chr6 (28-79)||(33443068-33443118)
chr6 (94-177)||(22949384-22949466)
chr6 (94-177)||(22953340-22953422)
chr6 (94-177)||(23871828-23871910)
chr6 (94-177)||(23875784-23875866)
chr6 (9-60)||(23992429-23992480)
chr6 (94-177)||(27325388-27325470)
chr6 (11-60)||(19862978-19863027)
chr6 (11-60)||(19873120-19873169)
chr6 (19-59)||(4738626-4738666)
chr6 (4-48)||(19008799-19008843)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-236)||(32538-32762)
scaffold0034 (26-108)||(51904-51985)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (11-236)||(15470928-15471150)
chr3 (7-229)||(14234487-14234709)
chr3 (11-236)||(16097332-16097555)
chr3 (11-228)||(12174164-12174376)
chr3 (11-236)||(16103784-16104006)
chr3 (7-177)||(13210283-13210448)
chr3 (7-127)||(18438534-18438653)
chr3 (7-129)||(14972854-14972975)
chr3 (26-236)||(37251061-37251270)
chr3 (7-127)||(12399209-12399328)
chr3 (14-164)||(32307684-32307830)
chr3 (10-131)||(27165250-27165370)
chr3 (26-187)||(52523669-52523831)
chr3 (7-127)||(23083363-23083482)
chr3 (7-130)||(25476384-25476506)
chr3 (26-229)||(22110252-22110454)
chr3 (25-131)||(42386428-42386533)
chr3 (7-127)||(20698437-20698556)
chr3 (7-127)||(26686887-26687006)
chr3 (10-118)||(53301562-53301669)
chr3 (7-108)||(11424781-11424880)
chr3 (7-127)||(13442274-13442393)
chr3 (7-127)||(17487856-17487975)
chr3 (7-127)||(17499338-17499457)
chr3 (10-130)||(29172627-29172745)
chr3 (11-111)||(49668094-49668193)
chr3 (10-127)||(24153211-24153326)
chr3 (10-131)||(36166598-36166716)
chr3 (10-130)||(6469178-6469296)
chr3 (11-111)||(9512924-9513023)
chr3 (11-111)||(9520899-9520998)
chr3 (10-130)||(9707651-9707769)
chr3 (10-130)||(17463178-17463296)
chr3 (10-130)||(17672626-17672744)
chr3 (10-130)||(28848655-28848773)
chr3 (10-130)||(34159326-34159444)
chr3 (7-170)||(43550482-43550644)
chr3 (7-127)||(43840932-43841051)
chr3 (10-130)||(45606951-45607069)
chr3 (10-130)||(55476491-55476609)
chr3 (26-170)||(43925977-43926121)
chr3 (10-125)||(55500942-55501055)
chr3 (7-187)||(24340665-24340844)
chr3 (10-130)||(7781391-7781509)
chr3 (10-130)||(8899094-8899212)
chr3 (10-130)||(16454325-16454443)
chr3 (10-130)||(38961935-38962053)
chr3 (20-127)||(14572602-14572707)
chr3 (10-130)||(13151834-13151953)
chr3 (10-130)||(13154299-13154418)
chr3 (9-130)||(13544024-13544143)
chr3 (7-187)||(37642207-37642386)
chr3 (10-130)||(10247767-10247885)
chr3 (14-130)||(12567564-12567678)
chr3 (10-130)||(15977515-15977633)
chr3 (10-130)||(17446699-17446816)
chr3 (10-130)||(40213720-40213838)
chr3 (12-130)||(16282855-16282971)
chr3 (21-131)||(21618460-21618567)
chr3 (25-131)||(23274705-23274810)
chr3 (10-72)||(28194693-28194755)
chr3 (10-119)||(12119780-12119887)
chr3 (10-119)||(15412429-15412536)
chr3 (12-130)||(41123892-41124005)
chr3 (10-130)||(50242822-50242940)
chr3 (10-119)||(8499518-8499625)
chr3 (11-127)||(14576835-14576949)
chr3 (26-130)||(53070697-53070799)
chr3 (10-131)||(10556985-10557105)
chr3 (7-187)||(22147467-22147646)
chr3 (10-111)||(44494809-44494908)
chr3 (116-212)||(1465329-1465423)
chr3 (26-135)||(12377940-12378050)
chr3 (10-69)||(17737236-17737294)
chr3 (69-187)||(2051141-2051260)
chr3 (10-60)||(45577950-45578000)
chr3 (14-164)||(1644642-1644787)
chr3 (26-130)||(606324-606428)
chr3 (117-236)||(49389524-49389642)
chr3 (9-60)||(46822267-46822318)
chr3 (9-60)||(12511059-12511110)
chr3 (94-177)||(14501207-14501290)
chr3 (94-177)||(19776007-19776089)
chr3 (94-177)||(37439421-37439503)
chr3 (28-78)||(13919350-13919399)
chr3 (167-229)||(43927291-43927353)
chr3 (11-76)||(856140-856204)
chr3 (11-60)||(15878119-15878168)
chr3 (11-76)||(23077530-23077594)
chr3 (8-60)||(14665398-14665450)
chr3 (8-60)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-236)||(10542-10754)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (7-229)||(6535-6755)
scaffold0621 (22-236)||(8481-8696)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (11-229)||(12943-13159)
scaffold0138 (90-224)||(18143-18276)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (22-236)||(12288103-12288316)
chr4 (7-236)||(39706183-39706409)
chr4 (7-177)||(15551817-15551982)
chr4 (22-187)||(52243136-52243302)
chr4 (26-236)||(13744-13953)
chr4 (7-127)||(7798774-7798893)
chr4 (7-127)||(52873369-52873488)
chr4 (26-229)||(53082052-53082254)
chr4 (11-164)||(12774011-12774160)
chr4 (10-130)||(16377522-16377639)
chr4 (7-127)||(7088877-7088996)
chr4 (7-127)||(12902757-12902876)
chr4 (22-187)||(43198495-43198661)
chr4 (10-131)||(54798752-54798872)
chr4 (7-127)||(7893703-7893822)
chr4 (26-229)||(46640356-46640558)
chr4 (10-131)||(14280316-14280435)
chr4 (7-127)||(16270238-16270356)
chr4 (10-130)||(18215318-18215436)
chr4 (10-130)||(44928923-44929042)
chr4 (11-187)||(8846360-8846550)
chr4 (12-130)||(14038653-14038770)
chr4 (7-100)||(3096293-3096385)
chr4 (10-130)||(12351-12469)
chr4 (7-127)||(6899891-6900009)
chr4 (10-130)||(15118396-15118514)
chr4 (7-127)||(16239972-16240090)
chr4 (7-127)||(44052829-44052948)
chr4 (10-130)||(44773131-44773249)
chr4 (10-130)||(52312510-52312628)
chr4 (4-130)||(19242693-19242817)
chr4 (8-130)||(19618216-19618336)
chr4 (9-127)||(22636437-22636554)
chr4 (14-127)||(23374361-23374473)
chr4 (10-130)||(1837553-1837671)
chr4 (10-130)||(3515007-3515125)
chr4 (10-130)||(18239463-18239581)
chr4 (10-130)||(44615288-44615406)
chr4 (10-130)||(50222383-50222501)
chr4 (10-130)||(51463912-51464030)
chr4 (45-177)||(16596686-16596813)
chr4 (10-123)||(23803316-23803427)
chr4 (7-79)||(17046487-17046559)
chr4 (10-131)||(8574867-8574985)
chr4 (14-119)||(15355380-15355483)
chr4 (10-130)||(44102214-44102332)
chr4 (26-108)||(6190481-6190563)
chr4 (8-130)||(14970751-14970871)
chr4 (116-212)||(15099457-15099551)
chr4 (116-212)||(15190424-15190518)
chr4 (7-108)||(14053323-14053422)
chr4 (7-119)||(15367690-15367800)
chr4 (7-119)||(15370018-15370128)
chr4 (7-119)||(15371202-15371312)
chr4 (7-119)||(15373483-15373593)
chr4 (7-119)||(15402703-15402813)
chr4 (10-69)||(7641286-7641344)
chr4 (10-69)||(12610950-12611008)
chr4 (7-119)||(16223532-16223642)
chr4 (9-130)||(22353835-22353955)
chr4 (26-130)||(21815629-21815731)
chr4 (88-134)||(15464926-15464972)
chr4 (13-119)||(20149832-20149936)
chr4 (94-177)||(630728-630810)
chr4 (94-177)||(3331970-3332052)
chr4 (94-177)||(13812763-13812845)
chr4 (94-177)||(14953915-14953997)
chr4 (94-177)||(25690146-25690228)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-234)||(12766-12991)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (7-229)||(936-1155)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (11-236)||(22921763-22921986)
chr1 (26-236)||(21861463-21861672)
chr1 (11-187)||(33681011-33681185)
chr1 (26-223)||(21896162-21896358)
chr1 (11-187)||(22237631-22237805)
chr1 (8-130)||(50210212-50210333)
chr1 (7-177)||(14295507-14295672)
chr1 (23-177)||(20918620-20918769)
chr1 (11-187)||(20248283-20248454)
chr1 (10-127)||(34509783-34509899)
chr1 (26-236)||(50614009-50614219)
chr1 (26-236)||(50621837-50622047)
chr1 (14-164)||(21754052-21754198)
chr1 (7-170)||(45574846-45575008)
chr1 (26-236)||(16368180-16368388)
chr1 (26-229)||(50686630-50686833)
chr1 (26-187)||(35261023-35261180)
chr1 (26-229)||(41049936-41050138)
chr1 (22-236)||(52927876-52928076)
chr1 (7-127)||(27250731-27250850)
chr1 (22-186)||(16758664-16758828)
chr1 (10-130)||(13988866-13988984)
chr1 (10-130)||(21923335-21923453)
chr1 (7-127)||(22532269-22532388)
chr1 (10-130)||(23593779-23593897)
chr1 (7-110)||(20847173-20847275)
chr1 (10-129)||(31612313-31612430)
chr1 (9-130)||(21840766-21840885)
chr1 (7-127)||(21026680-21026799)
chr1 (10-130)||(21475131-21475249)
chr1 (10-130)||(29298137-29298254)
chr1 (10-130)||(433012-433128)
chr1 (10-122)||(22123119-22123230)
chr1 (10-130)||(29776688-29776806)
chr1 (7-83)||(38801433-38801508)
chr1 (26-188)||(16093825-16093987)
chr1 (8-130)||(16361915-16362035)
chr1 (10-170)||(21707167-21707325)
chr1 (10-170)||(21711709-21711867)
chr1 (7-119)||(13212917-13213027)
chr1 (8-76)||(20454606-20454673)
chr1 (4-119)||(15860064-15860177)
chr1 (4-119)||(21342090-21342203)
chr1 (10-119)||(16275419-16275526)
chr1 (11-228)||(21161720-21161932)
chr1 (10-119)||(21346961-21347068)
chr1 (116-229)||(35981589-35981700)
chr1 (116-212)||(49261448-49261542)
chr1 (60-177)||(22130863-22130975)
chr1 (8-127)||(22468698-22468816)
chr1 (115-212)||(20636956-20637051)
chr1 (11-60)||(21714546-21714595)
chr1 (28-177)||(26064959-26065107)
chr1 (13-119)||(40389157-40389261)
chr1 (83-177)||(51130639-51130729)
chr1 (8-127)||(20135188-20135306)
chr1 (94-177)||(1924914-1924996)
chr1 (94-177)||(20923928-20924010)
chr1 (93-130)||(12271639-12271676)
chr1 (8-60)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-236)||(6611-6838)
scaffold0333 (7-236)||(13991-14218)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (11-236)||(19268-19491)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (11-236)||(100378-100601)
scaffold0023 (11-228)||(40076-40291)
scaffold0023 (7-80)||(119875-119948)
scaffold0023 (10-130)||(94411-94529)
scaffold0023 (10-130)||(44454-44573)
scaffold0023 (14-130)||(17484-17598)
scaffold0023 (11-84)||(101503-101576)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (11-236)||(25175854-25176077)
chr2 (12-236)||(28405981-28406204)
chr2 (26-236)||(7626-7835)
chr2 (22-236)||(18786796-18787009)
chr2 (11-175)||(7679589-7679750)
chr2 (10-130)||(22105412-22105531)
chr2 (7-127)||(23060513-23060632)
chr2 (7-177)||(23071905-23072070)
chr2 (7-187)||(23708561-23708738)
chr2 (10-127)||(298816-298933)
chr2 (26-236)||(23791292-23791502)
chr2 (7-131)||(22337115-22337238)
chr2 (7-127)||(23076442-23076561)
chr2 (26-229)||(23207296-23207498)
chr2 (10-130)||(6725995-6726113)
chr2 (7-177)||(19671830-19671998)
chr2 (7-125)||(22731238-22731355)
chr2 (26-229)||(25108906-25109109)
chr2 (7-108)||(38136-38235)
chr2 (10-130)||(571397-571515)
chr2 (10-130)||(18808943-18809061)
chr2 (10-130)||(23130862-23130980)
chr2 (10-130)||(23133329-23133447)
chr2 (10-130)||(23135590-23135708)
chr2 (10-130)||(23709576-23709694)
chr2 (10-130)||(23712057-23712175)
chr2 (10-130)||(26505379-26505497)
chr2 (10-130)||(26507857-26507975)
chr2 (10-130)||(34402566-34402684)
chr2 (10-130)||(39682313-39682431)
chr2 (7-85)||(23285865-23285942)
chr2 (8-130)||(32214965-32215085)
chr2 (7-127)||(23660023-23660141)
chr2 (10-130)||(24367774-24367892)
chr2 (10-130)||(28577099-28577217)
chr2 (7-127)||(20309108-20309225)
chr2 (13-130)||(21155104-21155219)
chr2 (10-130)||(24898239-24898358)
chr2 (10-130)||(24900722-24900841)
chr2 (10-130)||(24903199-24903318)
chr2 (10-130)||(24905676-24905795)
chr2 (10-130)||(24908151-24908270)
chr2 (7-130)||(23103396-23103516)
chr2 (10-130)||(32039542-32039660)
chr2 (7-86)||(8946657-8946735)
chr2 (26-177)||(20520145-20520295)
chr2 (12-130)||(43137301-43137417)
chr2 (8-129)||(22134208-22134326)
chr2 (7-127)||(22738182-22738300)
chr2 (7-71)||(23040247-23040310)
chr2 (7-127)||(23654388-23654507)
chr2 (10-130)||(45029898-45030016)
chr2 (26-187)||(22413078-22413240)
chr2 (10-130)||(24529573-24529691)
chr2 (26-108)||(32451949-32452031)
chr2 (10-130)||(38967374-38967493)
chr2 (26-187)||(24697548-24697709)
chr2 (26-136)||(23004767-23004878)
chr2 (13-69)||(24643054-24643109)
chr2 (93-236)||(22459455-22459598)
chr2 (28-78)||(23287384-23287433)
chr2 (14-127)||(25616192-25616304)
chr2 (28-77)||(26392403-26392451)
chr2 (94-177)||(1283666-1283748)
chr2 (94-177)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (19-229)||(5655-5863)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (11-236)||(2539-2762)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (87-236)||(8094-8242)
scaffold0556 (19-236)||(6824-7036)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (11-229)||(14598-14814)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (11-229)||(1086-1302)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (22-236)||(10435-10647)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (9-236)||(62200-62422)
scaffold0028 (11-114)||(132662-132765)
scaffold0028 (10-130)||(136680-136798)
scaffold0028 (10-130)||(139149-139267)
scaffold0028 (10-130)||(144087-144205)
scaffold0028 (10-130)||(134211-134329)
scaffold0028 (10-130)||(141618-141736)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (19-236)||(129917-130132)
scaffold0010 (26-134)||(60710-60818)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-236)||(160688-160910)
scaffold0001 (14-130)||(501088-501202)
scaffold0001 (10-119)||(85635-85742)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-187)||(45735-45909)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (22-220)||(7983-8180)
scaffold0218 (54-175)||(29238-29354)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (22-187)||(22613-22776)
scaffold0037 (10-130)||(82072-82190)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (11-187)||(133-307)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (7-177)||(11292-11457)
scaffold0046 (7-177)||(1997-2162)
scaffold0046 (7-127)||(28414-28533)
scaffold0046 (7-63)||(4552-4608)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-130)||(3185-3306)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (26-236)||(136261-136471)
scaffold0021 (26-236)||(144969-145179)
scaffold0021 (8-130)||(174767-174886)
scaffold0021 (7-77)||(121766-121835)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (26-224)||(6188-6386)
scaffold0420 (26-73)||(13793-13840)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (11-236)||(2698-2923)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-236)||(12587-12795)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (10-177)||(15664-15826)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (7-177)||(1025-1190)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (26-229)||(128870-129072)
scaffold0022 (14-229)||(78328-78542)
scaffold0022 (10-131)||(116430-116548)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-131)||(3149-3271)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (30-229)||(38339-38538)
scaffold0139 (11-60)||(19980-20029)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (8-130)||(17214-17337)
scaffold0056 (26-130)||(79328-79430)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (65-236)||(2112-2281)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (22-134)||(27744-27855)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (14-130)||(26064-26179)
scaffold0122 (10-131)||(44705-44825)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-229)||(103539-103737)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (9-131)||(39479-39599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-131)||(75213-75333)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-131)||(38700-38820)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-127)||(4849-4968)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (22-134)||(16095-16206)
scaffold0357 (26-132)||(13147-13252)
scaffold0357 (26-78)||(2680-2732)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (7-177)||(34123-34288)
scaffold0175 (7-60)||(273-326)
scaffold0175 (57-127)||(13141-13211)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-143)||(15763-15898)
scaffold0020 (11-60)||(178898-178947)
scaffold0020 (198-236)||(15726-15764)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-127)||(51913-52032)
scaffold0011 (7-127)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-130)||(16113-16235)
scaffold0120 (7-127)||(32959-33077)
scaffold0120 (7-127)||(45928-46046)
scaffold0120 (7-69)||(17389-17450)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (26-236)||(53442-53651)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (26-229)||(19785-19987)
scaffold0080 (7-127)||(39913-40031)
scaffold0080 (94-177)||(48939-49021)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (26-229)||(97024-97227)
scaffold0006 (26-229)||(106302-106505)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (26-131)||(1051-1155)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-127)||(13211-13330)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (7-134)||(8479-8605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-130)||(16599-16721)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (22-177)||(25121-25275)
scaffold0123 (90-187)||(620-715)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-127)||(3470-3589)
scaffold0292 (7-127)||(343-461)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (7-127)||(32942-33060)
scaffold0145 (7-127)||(38761-38879)
scaffold0145 (5-130)||(9744-9867)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (7-127)||(1851-1970)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (7-127)||(8535-8650)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (7-187)||(11464-11643)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (10-127)||(22886-23001)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (7-187)||(38198-38377)
scaffold0124 (94-177)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (7-127)||(1050-1169)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (10-130)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-130)||(20747-20865)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (7-131)||(4508-4630)
scaffold0228 (7-131)||(12090-12212)
scaffold0228 (7-131)||(22042-22164)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (10-130)||(37821-37939)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-111)||(23901-24000)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-131)||(25896-26018)
scaffold0026 (7-131)||(39858-39980)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (10-130)||(158494-158612)
scaffold0003 (10-130)||(339949-340065)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-127)||(6123-6245)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (11-114)||(32102-32205)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (7-127)||(10427-10544)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-130)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (10-130)||(4694-4812)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-236)||(7952-8161)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-99)||(4712-4803)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (10-130)||(13947-14065)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-130)||(16784-16902)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (57-229)||(54-226)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-77)||(1289-1359)
scaffold0106 (7-79)||(7266-7338)
scaffold0106 (10-76)||(15291-15356)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (8-130)||(11286-11406)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (7-110)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (7-187)||(17969-18148)
scaffold0247 (10-119)||(2184-2291)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-220)||(267679-267872)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (7-127)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-127)||(20910-21030)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (10-130)||(40400-40518)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-79)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-86)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-78)||(32067-32137)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (25-127)||(24304-24406)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (8-130)||(12293-12413)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (24-130)||(29946-30050)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (26-224)||(569-765)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (10-119)||(4214-4321)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (9-130)||(9241-9360)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (7-108)||(15485-15584)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (26-221)||(1706-1900)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (11-84)||(28813-28887)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-77)||(46995-47065)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-130)||(4300-4415)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (7-108)||(11464-11564)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (10-130)||(106-224)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-79)||(1098-1170)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (10-73)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-74)||(4888-4954)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (28-127)||(4545-4643)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (10-130)||(12064-12176)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (10-130)||(161133-161252)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (26-130)||(20423-20524)
scaffold0031 (7-127)||(128751-128869)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (13-119)||(1336-1440)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (26-111)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (65-187)||(225465-225585)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (11-60)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (11-60)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (71-130)||(3529-3588)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (26-69)||(11982-12024)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (83-177)||(2398-2488)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (94-177)||(6-88)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (8-43)||(27878-27913)
scaffold0130 (89-131)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (28-78)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (11-76)||(10575-10639)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (11-60)||(29558-29607)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-60)||(69794-69843)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (93-189)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073142
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaa 22073142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219611
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttac 16219637  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16219636 tgaaacaacaacagcaagataaacaa 16219611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811032
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttac 811051  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  811050 tgaaactacaacagcaaga 811032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056554
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16056441 acatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaa 16056539  T
Q  222 cagcaagacaaacaa 236  Q
    || ||||| ||||||    
T  16056540 catcaagataaacaa 16056554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832027
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatc-atcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggc 47832004  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  47832005 ttactgaaacaacaacaacaaga 47832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67971
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 67843  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 205  Q
     |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 67940  T
Q  206 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67941 ctcactgaaacaacaacagcaagataaacaa 67971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005873
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 18005846  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18005847 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 18005873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014395
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | ||   | |||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggctta 44014375  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44014376 ctgaaacaacaacagcaaga 44014395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200951
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901551
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  121 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 220  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  221 acagcaagacaaacaa 236  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaa 12901551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995983
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505254
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
      || ||| ||| |||   |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505320 ggatataaatcagcaa---ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754843
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15754843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647447
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280117
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227599
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698951
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509308
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386249
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || ||||  ||| ||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456415
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456439
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972614
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949166
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376757
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232638
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640390
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220090
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaaca 20220096  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  20220095 gtaaga 20220090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385167
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189639
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125609
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523035
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525497
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393331
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430830
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212115
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867937
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  29 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  128 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702356
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27216978
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116627
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044928
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14044858  T
Q  120 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044859 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354958
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14354888  T
Q  120 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354889 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  110 tgtaagtcaacaac 123  Q
    |  |||||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    || |||||| |||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386451
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486686
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  122 acatctcaa 130  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443490
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  128 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324225
Alignment:
Q  179 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 16324225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704803
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| |||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898420
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  114 agtcaa-caacatctcaa 130  Q
    |||||| |||||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063816
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatc 10063841  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
     ||   |||| ||||||||||||||    
T  10063840 gaacacaagtaaacaacatctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389615
Alignment:
Q  152 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactg 9389615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113170
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  193 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaa 15113170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  132 catca 136  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  132 catca 136  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  33 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116648
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacatta 15116648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26356027
Alignment:
Q  74 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26356027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358479
Alignment:
Q  74 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26358479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855146
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 38855176  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38855175 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 38855146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520587
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6520564  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6520565 ttactgaaacaacaacagcaaga 6520587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285817
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttac 21285798  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21285799 tgaaacaacaacaacaaga 21285817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760751
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
      || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggctta 23760765  T
Q  210 ctgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  23760764 ctgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983312
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 983414  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  983413 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaac 983316  T
Q  220 aaca 223  Q
    ||||    
T  983315 aaca 983312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673924
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  119 acaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaaca 217  Q
    ||||||||||||| ||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  21673815 acaacatctcaaatatc-aatat-aatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaaca 21673912  T
Q  218 acaacagcaaga 229  Q
    |||||| |||||    
T  21673913 acaacaacaaga 21673924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866230
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 5866230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491160
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092340
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141081
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 17141081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116569
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaaca 37116563  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  37116564 gtaaga 37116569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818411
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498790
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| |||||     
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacat 20498778  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||    
T  20498779 caagataaacaa 20498790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372897
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266893
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  125 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||||||||||| | || || || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatat-aattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  225 caaga 229  Q
     ||||    
T  17266897 taaga 17266893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355643
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | || ||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  104 atcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21919002
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  107 aaatgtaagtcaaca 121  Q
    || || |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249550
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21249482  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255388
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21255320  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536327
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923930
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626854
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353235
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||  | |  || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353137 atctcaaacatcgtata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409488
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875187
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484520
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853336
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203275
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413360
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403345
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001871
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612062
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879275
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971356
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046239
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598306
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508027
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  114 agtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199666
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483398
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542417
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364882
Alignment:
Q  90 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  190 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 22364882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597559
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  114 agtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||| ||||||||| |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131019
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219835
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896386
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225291
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaa 26225313  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  26225312 tacaagtcaacaacatctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290754
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 45290756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataag 19937077  T
Q  104 atcaaatgtaagtcaa 119  Q
    |||||||| |||||||    
T  19937076 atcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823891
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484319
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678104
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatct 127  Q
     || || ||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  90 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 136  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121851
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatct 127  Q
     || || ||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329391
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatc 21329520  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 21329421  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21329420 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 21329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502049
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 205  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 21502080  T
Q  206 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21502079 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 21502049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011929
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatc 26012058  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggc 26011959  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26011958 ttactgaaacaacaataacaagataaacaa 26011929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026834
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaa-cagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20026944 atcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactaca 20026847  T
Q  224 gcaagacaaacaa 236  Q
     ||||| ||||||    
T  20026846 acaagataaacaa 20026834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565720
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 21565720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959489
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 176  Q
    | || |||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660791
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatc 19660858  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660857 gaatataaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 19660791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669073
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729066
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808391
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178120
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaaca 22178126  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  22178125 gtaaga 22178120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  107 aaatgtaagt 116  Q
    ||||| ||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493687
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421651
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 176  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096588
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctca 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286844
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025429
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095613
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390498
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412306
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264812
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732984
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909130
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431513
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363502
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330052
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245409
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154827
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075138
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581243
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||| ||| ||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346098
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348571
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351044
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726032
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027511
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724023
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    | ||| |||||||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918028
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  111 gtaagtcaa 119  Q
    | |||||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 157  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  158 tatacaa 164  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  24067208 aagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  74 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418678
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 177
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  146 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 127
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873336
Alignment:
Q  34 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6024
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6146  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6047  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  6046 ttactgaaacaataacagcaaga 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019633
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 23019504  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggc 23019603  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23019604 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668599
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 219  Q
    ||||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19668485 caacatcac-aacatcatacgt-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaac 19668582  T
Q  220 aacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||| ||||||    
T  19668583 aacagcaagataaacaa 19668599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496427
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28496427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808838
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 29808838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644500
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  122 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652420
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 19652394  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||    
T  19652395 tggaacaataacagcaagataaacaa 19652420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098465
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  121 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaa 178  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561468
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109261
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20109261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496363
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409821
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 135  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  107 aaatgtaagtcaaca 121  Q
    ||||| || ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676754
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287798
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742435
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334636
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005164
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858963
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360962
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422665
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656747
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || |||| || ||| ||||||    
T  25656727 tgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861912
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638304
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  20638305 aa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080640
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatc 22080761  T
Q  107 aaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcag 204  Q
     |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||    
T  22080760 gaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttag 22080665  T
Q  205 gcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  22080664 gcttactgaaacaacaagagcaaga 22080640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291224
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055147
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780229
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754927
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924684
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963491
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227453
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540955
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595667
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556936
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920679
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076952
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  125 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  225 caaga 229  Q
     ||||    
T  23076948 taaga 23076952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245658
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852061
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185839
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 75  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008370
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  125 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  225 caaga 229  Q
     ||||    
T  35008366 taaga 35008370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 4186379 - 4186470
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186379 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333179
Alignment:
Q  177 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaa 27333179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393919
Alignment:
Q  177 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaa 27393919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103799
Alignment:
Q  151 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155301
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgc-aagtcatcgtgatataacaatatcgaa 31155417  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggctta 209  Q
    || || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||| | |||| || || |    
T  31155416 tgcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaacatcatcggattaaaaaatttagactca 31155320  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaag 228  Q
    ||| |||| ||||||||||    
T  31155319 ctggaacatcaacagcaag 31155301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 189
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  90 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  59 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  157 atatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 4738666 - 4738626
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 59  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738666 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 48  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32762
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 32634  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggc 32732  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32733 ttactgaaacaataacaacaagataaacaa 32762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471150
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttac 15471124  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15471125 tgaaacaacaacaacaagataaacaa 15471150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234709
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggc 14234684  T
Q  207 ttactga--aacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||  |||||||||| |||||    
T  14234685 ttactgaacaacaacaacaacaaga 14234709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097555
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 16097529  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaa 16097555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174164
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 209  Q
    | ||   ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtctta 12174183  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaag 228  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12174182 ctggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104006
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttac 16103980  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaa 16104006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210283
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     |||| || |||||||   || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972975
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctca 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251061
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251171 atctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaaca 37251074  T
Q  224 gcaagacaaacaa 236  Q
    | |||| ||||||    
T  37251073 gtaagataaacaa 37251061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399328
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307830
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  114 agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 164  Q
    | |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165370
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  124 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083363
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110252
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 22110258  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  22110257 gtaaga 22110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  125 tctcaaa 131  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687006
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  110 tgtaagtca 118  Q
    || ||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424781
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442393
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487975
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499457
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172627
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668094
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153211
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166716
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513023
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520998
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707651
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463296
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848655
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159444
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841051
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606951
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476609
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  110 tgtaagtcaacaacat 125  Q
    || |||||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340665
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781391
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899212
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454325
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961935
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572707
Alignment:
Q  20 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaa 14572699  T
Q  120 caacatct 127  Q
    ||||||||    
T  14572700 caacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151834
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154299
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544143
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642207
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247767
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567678
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446699
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| |||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282855
Alignment:
Q  12 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  112 taagtcaacaacatctcaa 130  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618567
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 21618556  T
Q  121 aacatctcaaa 131  Q
    |||||||||||    
T  21618557 aacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  125 tctcaaa 131  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124005
Alignment:
Q  12 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  112 taagtcaacaacatctcaa 130  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242940
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576835
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| |    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaatt 14576852  T
Q  111 gtaagtcaacaacatct 127  Q
    | |||||||||||||||    
T  14576851 gcaagtcaacaacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaa 10557082  T
Q  110 tgtaagtcaa-caacatctcaaa 131  Q
    || ||| ||| ||||||||||||    
T  10557083 tgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaa 44494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465329
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactg 1465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  124 atctcaaacatc 135  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  69 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  166 tatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644642
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||  |    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaataca 1644690  T
Q  114 agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 164  Q
    | ||||||| |||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1644689 a-tcaacaatatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  123 catctcaa 130  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389524
Alignment:
Q  117 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 216  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  217 aacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaa 49389524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927353
Alignment:
Q  167 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 43927353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10754
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 221  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 acatctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 10739  T
Q  222 cagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||| ||||||    
T  10740 cagcaagataaacaa 10754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6755
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 205  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcagg 6731  T
Q  206 cttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6732 cttactgaaacaacaacagcaaga 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8696
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  122 acatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 218  Q
    |||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| |||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaa 8678  T
Q  219 caacagcaagacaaacaa 236  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8679 catcagcaagataaacaa 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13159
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttac 13140  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13141 tgaaacaacaacagcaaga 13159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18143
Alignment:
Q  90 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  190 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacag 18143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288103
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288217 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 12288120  T
Q  220 aacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12288119 aacagcaagataaacaa 12288103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706183
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggc 39706213  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39706212 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 39706183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551982
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     || |||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243136
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  120 caacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13744
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  126 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  13854 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 13756  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
     |||| ||||||    
T  13755 aaagataaacaa 13744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798893
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082052
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 53082058  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  53082057 gtaaga 53082052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774160
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 164  Q
      || |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902876
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198495
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  121 aacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    || |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798752
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893822
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640356
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46640459 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataaca 46640362  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  46640361 gtaaga 46640356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280435
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270238
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215318
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928923
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846550
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata-------------- 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                  
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  97 --taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 8846550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  12 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  112 taagtcaacaacatctcaa 130  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096385
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12351
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900009
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239972
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052948
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773131
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312628
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242817
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  104 atcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636554
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatct 127  Q
     || || ||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374361
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || |    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  114 agtcaacaacatct 127  Q
    | ||||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837553
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515125
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239463
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615406
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222383
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463912
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  45 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  145 ctcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  110 tgtaagtcaacaac 123  Q
    || || ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574867
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  114 agtcaa 119  Q
    ||||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102332
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099551
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15099551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190518
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15190518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053323
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16223629  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
     |||| |||||||    
T  16223630 taatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353955
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| |||||||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
     |  || |||||||| ||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  88 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaa-cagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  20149930 aagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12991
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 12864  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggc 12963  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaac 234  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12964 ttactggaacaacaacagcaagataaac 12991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 936
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggc 959  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  958 ttactgaaacaacaacaacaaga 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921763
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aaca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 22921790  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22921789 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 22921763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861463
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||    
T  21861474 caagataaacaa 21861463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681185
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 33681185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896162
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaaca 21896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237805
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacat 22237805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  123 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | || |||||||   || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614009
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50614120 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50614022  T
Q  224 gcaagacaaacaa 236  Q
    | |||||||||||    
T  50614021 gtaagacaaacaa 50614009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621837
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50621948 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50621850  T
Q  224 gcaagacaaacaa 236  Q
    | |||||||||||    
T  50621849 gtaagacaaacaa 50621837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754198
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  114 agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 164  Q
    | |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368180
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  125 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||| ||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
     |||| ||||||    
T  16368191 taagataaacaa 16368180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686833
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 50686827  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  50686828 gtaaga 50686833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  126 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049936
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctcaa-catcatatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 41049942  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  41049941 gtaaga 41049936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927876
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||               
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat----------- 52927989  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 221  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  52927988 -catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 52927891  T
Q  222 cagcaagacaaacaa 236  Q
     ||||||| ||||||    
T  52927890 tagcaagataaacaa 52927876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250731
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758828
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 186  Q
    ||||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758763 caacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13988984
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923335
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532388
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
     | || || ||||||||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593779
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  107 aaat 110  Q
    ||||    
T  20847176 aaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612430
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctca 129  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026799
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475131
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298254
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433128
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  110 tgtaagtcaacaa 122  Q
    || ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776806
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 83  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  123 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 188  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362035
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707325
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711867
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 170  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13212930  T
Q  107 aaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||| |||||||    
T  13212929 aaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 15860080  T
Q  104 atcaaatgtaagtcaa 119  Q
    || ||||| |||||||    
T  15860079 attaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  104 atcaaatgtaagtcaa 119  Q
    |||||||| |||||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161932
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| ||    
T  21161818 gcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcac 21161914  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaag 228  Q
    || |||| ||||||||||    
T  21161915 tggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981589
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  216 caacaacagcaaga 229  Q
      |||||| |||||    
T  35981602 tgacaacatcaaga 35981589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261542
Alignment:
Q  116 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactg 49261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  160 tacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637051
Alignment:
Q  115 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 212  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactg 20637051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  127 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  40389255 aagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 177
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  83 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | || ||||| |||| |||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatct 127  Q
      || || ||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 130
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6838
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 6709  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  6710 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 6808  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6809 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 6838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14218
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 14089  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 206  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14090 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 14188  T
Q  207 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14189 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 14218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19491
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggtta 19464  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19465 ctgaaacaacaacatcaagataaacaa 19491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100601
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggctta 100574  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  100575 ctgaaacaacaacaacaagataaacaa 100601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40076
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggctta 40095  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaag 228  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40094 ctgaaacaacaacatcaag 40076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94529
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17484
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176077
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 25176050  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25176051 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 25176077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406204
Alignment:
Q  12 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  112 taagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttac 210  Q
     || |||||||||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaa--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttac 28406178  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  28406179 taaaacaacaacagcaagataaacaa 28406204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7626
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaa 7638  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
    || || ||||||    
T  7637 catgataaacaa 7626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786796
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 219  Q
    |||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18786910 caacgtcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaac 18786813  T
Q  220 aacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||| || ||||||    
T  18786812 aacagcatgataaacaa 18786796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 175  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105531
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060632
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 23071972  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071971 gaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    || || || ||| | |||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298816
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791502
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 23791489  T
Q  224 gcaagacaaacaa 236  Q
     ||||| ||||||    
T  23791490 acaagataaacaa 23791502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337238
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076561
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||| ||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207498
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaaca 23207492  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  23207493 gtaaga 23207498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726113
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671998
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     || | |||| |||||||||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731238
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    || || || ||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109109
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 25109103  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  25109104 gtaaga 25109109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38136
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571515
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809061
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23130980
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133447
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135708
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709576
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712057
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505497
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26507975
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402566
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682431
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285942
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214965
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660141
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367892
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577217
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||| ||||||| ||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155104
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  113 aagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898239
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900722
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903199
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905676
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908151
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||  || ||| |||||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039542
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946735
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137417
Alignment:
Q  12 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  112 taagtcaacaacatctcaa 130  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134208
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||     
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 22134229  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctca 129  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  22134228 aatgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738182
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654388
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029898
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529573
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967493
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaa 38967471  T
Q  110 tgtaagtcaa-caacatctcaa 130  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  38967472 tgcaagtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  124 atctcaaacatca 136  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459455
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 191  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatat-aactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  192 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaa 22459455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616304
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || |    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  114 agtcaacaacatct 127  Q
    | ||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5863
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  119 acaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaaca 217  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  5754 acaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaaca 5851  T
Q  218 acaacagcaaga 229  Q
    |||||| |||||    
T  5852 acaacaacaaga 5863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2539
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatg-taaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 2566  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2565 ctgaaacaacatcagcaagataaacaa 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8242
Alignment:
Q  87 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  187 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaa 8242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 6824 - 7036
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatca 6922  T
Q  119 acaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 218  Q
    ||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| |||||    
T  6923 acaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaa 7018  T
Q  219 caacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  7019 caacagcaagataaacaa 7036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14598
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 209  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggctta 14618  T
Q  210 ctgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14617 ctgaaacaacaacagcaaga 14598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1302
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
      | |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaaacatcaaacat-aattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttac 1283  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    || |||||||||| |||||    
T  1284 tggaacaacaacaacaaga 1302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10435
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 221  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  10548 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 10450  T
Q  222 cagcaagacaaacaa 236  Q
    || ||||| ||||||    
T  10449 caacaagataaacaa 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62422
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatg-aaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattat-acaattcaggct 207  Q
    ||| |   ||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  62299 atgca---caacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggct 62393  T
Q  208 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  62394 tactgaaacaacaacagcaagataaacaa 62422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132765
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  111 gtaa 114  Q
    ||||    
T  132762 gtaa 132765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136798
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139267
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144205
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134329
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141736
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130132
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  119 acaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 218  Q
     |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||    
T  130016 tcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaa 130114  T
Q  219 caacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  130115 caacagcaagataaacaa 130132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  124 atctcaaacat 134  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160910
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 160884  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||    
T  160885 cgaaacaacaacaacaagataaacaa 160910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501202
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45735
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7983
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 219  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8081 caacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 7984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29238
Alignment:
Q  54 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  154 tgtatatacaattatataacat 175  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29259 tgtatatacaattatataacat 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22613
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  122 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22677 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82190
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 133 - 307
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11457
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2162
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136261
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 222  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 136275  T
Q  223 agcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||| ||||||    
T  136274 agcaagataaacaa 136261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144969
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 222  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 144983  T
Q  223 agcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||| ||||||    
T  144982 agcaagataaacaa 144969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||  || |||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6188
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 6189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2698
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatca----aa--cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattca 203  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    ||  ||||||   |||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaa---atgt-atatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatca 2731  T
Q  204 ggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2730 ggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 2698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12795
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  126 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||||| | | | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatat-aattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacag 12783  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||    
T  12784 caagataaacaa 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15826
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128870
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  125 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatat-aattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  225 caaga 229  Q
     ||||    
T  128874 taaga 128870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 78328 - 78542
Alignment:
Q  14 catcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| |    
T  78328 catcttcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-t 78425  T
Q  111 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 210  Q
    | || ||||||||||||||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  78426 gcaaatcaacaacatctcaa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttac 78523  T
Q  211 tgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  78524 tgaaacaacaacagtaaga 78542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116548
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3149
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38538
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  128 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 227  Q
    ||||||||| | || || |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38438 caaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 38536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  106 caaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2112
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 164  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  165 ttatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27744
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  122 acatctcaaacat 134  Q
    |||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  14 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  114 agtcaacaacatctcaa 130  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44705
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103539
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aac 103641  T
Q  121 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 220  Q
    ||||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  103640 aaca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 103548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39599
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75213
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38700
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16095
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  122 acatctcaaacat 134  Q
    |||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  126 ctcaaac 132  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34288
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  57 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15763
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 143  Q
     |||| |||||| || ||||  | |||||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15726
Alignment:
Q  198 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 15726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52032
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167980
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32959
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46046
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53442
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  126 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  53552 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 53454  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
     |||| ||||||    
T  53453 aaagataaacaa 53442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19785
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||| | ||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19888 atctc-agcatcataaat-aactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaaca 19791  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  19790 gtaaga 19785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40031
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97227
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 97221  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  97222 gtaaga 97227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106505
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 106499  T
Q  224 gcaaga 229  Q
    | ||||    
T  106500 gtaaga 106505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  126 ctcaaa 131  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13330
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8605
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 134  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25275
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  120 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25219 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  90 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3589
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 343 - 461
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatc 440  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || |||||||||||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33060
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38879
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| || | ||||||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  5 ggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 104  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  105 tcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1970
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8535
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23001
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |||||||||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1050
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13510
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20865
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4630
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12212
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22164
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37939
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23901
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26018
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 25993  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39980
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 39955  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158494
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6123
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  105 tcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    |||| || || ||| ||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32205
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  111 gtaa 114  Q
    ||||    
T  32202 gtaa 32205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4812
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7952
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  126 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 224  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcag 7964  T
Q  225 caagacaaacaa 236  Q
    ||||| ||||||    
T  7963 caagataaacaa 7952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4803
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14065
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16902
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Original strand, 54 - 226
Alignment:
Q  57 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  155 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 229  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaaga 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1359
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7338
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16382
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  107 aaat 110  Q
    ||||    
T  16379 aaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17969
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 187  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267872
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 220  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || |||||||||||||||||||    
T  267778 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaaca 267872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2071
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40518
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51654
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13575
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 86  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32137
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  124 atct 127  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || |||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  108 aatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 130
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30050
Alignment:
Q  24 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T
Q  124 atctcaa 130  Q
     ||||||    
T  30044 gtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 569 - 765
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 223  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  667 atc-ccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  110 tgtaagtcaa 119  Q
    || |||||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  9 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  109 atgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15485
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1706
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  124 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 221  Q
    ||||| ||||||| | || || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1801 atctc-aacatcatatat-aatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaa 1706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||     
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  113 aagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11464
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  11465 aa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 106 - 224
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1098
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5183
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 73  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12176
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  110 tgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161133
Alignment:
Q  10 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 109  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  110 tgtaagtcaa-caacatctcaa 130  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  126 ctcaa 130  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128869
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  |   |||| |||||||| |||| ||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatc 128848  T
Q  107 aaatgtaagtcaacaacatct 127  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  13 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  113 aagtcaa 119  Q
    |||||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 163  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  164 attatataacattaacaacaacat 187  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  71 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 130  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2398
Alignment:
Q  83 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  94 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 177  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Original strand, 27878 - 27913
Alignment:
Q  8 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 43  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  89 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 131  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  11 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  93 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University