View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13042_low_12 (Length: 311)

Name: NF13042_low_12
Description: NF13042
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13042_low_12
NF13042_low_12
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (150-296)||(32766217-32766364)
chr2 (150-296)||(31091506-31091652)
chr2 (154-296)||(32764940-32765081)
chr2 (150-296)||(21733750-21733899)
chr2 (153-293)||(31090165-31090305)
chr2 (198-296)||(14704052-14704149)
chr2 (150-296)||(17330209-17330355)
chr2 (151-289)||(24459432-24459570)
chr2 (155-296)||(34037652-34037793)
chr2 (154-296)||(2910102-2910244)
chr2 (153-294)||(40000315-40000456)
chr2 (150-296)||(24458058-24458204)
chr2 (150-294)||(39016364-39016506)
chr2 (150-289)||(5914978-5915117)
chr2 (173-296)||(17466807-17466930)
chr2 (151-296)||(7073638-7073783)
chr2 (150-294)||(2911468-2911616)
chr2 (159-286)||(38853762-38853889)
chr2 (184-294)||(33161799-33161909)
chr2 (172-289)||(5914324-5914441)
chr2 (184-293)||(7412124-7412233)
chr2 (204-296)||(17466093-17466185)
chr2 (154-281)||(34582664-34582791)
chr2 (199-293)||(37607149-37607243)
chr2 (150-296)||(39015003-39015149)
chr2 (213-296)||(38984967-38985051)
chr2 (150-296)||(31814323-31814467)
chr2 (145-262)||(8420006-8420123)
chr2 (154-286)||(38854791-38854923)
chr2 (154-286)||(31443234-31443365)
chr2 (221-296)||(39999022-39999096)
chr2 (239-293)||(10728990-10729044)
chr2 (239-285)||(26586285-26586331)
chr2 (202-263)||(12746213-12746274)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (150-296)||(32898424-32898570)
chr8 (150-296)||(35177393-35177539)
chr8 (150-296)||(35178784-35178929)
chr8 (151-296)||(10407563-10407708)
chr8 (154-296)||(5738002-5738144)
chr8 (145-296)||(1952949-1953099)
chr8 (154-296)||(5965421-5965563)
chr8 (144-251)||(41753990-41754097)
chr8 (150-296)||(41754776-41754919)
chr8 (213-296)||(45476223-45476306)
chr8 (198-296)||(28619035-28619133)
chr8 (150-296)||(30134564-30134710)
chr8 (213-296)||(5736903-5736986)
chr8 (222-296)||(45476542-45476616)
chr8 (154-296)||(59554-59696)
chr8 (215-296)||(10406269-10406350)
chr8 (204-296)||(28524810-28524902)
chr8 (154-286)||(43539107-43539239)
chr8 (220-287)||(32565696-32565763)
chr8 (203-257)||(41121160-41121214)
chr8 (198-263)||(12637770-12637835)
chr8 (244-296)||(41122730-41122782)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (150-294)||(10332984-10333128)
chr1 (150-296)||(9339644-9339790)
chr1 (150-296)||(32665749-32665895)
chr1 (150-296)||(7945533-7945679)
chr1 (150-296)||(10333165-10333311)
chr1 (151-291)||(7944156-7944294)
chr1 (150-289)||(5782412-5782551)
chr1 (153-296)||(6612420-6612563)
chr1 (150-296)||(9341004-9341150)
chr1 (150-296)||(22856678-22856824)
chr1 (150-296)||(52440539-52440684)
chr1 (150-296)||(52439477-52439619)
chr1 (154-294)||(8975161-8975301)
chr1 (151-295)||(34088449-34088585)
chr1 (235-296)||(22857558-22857619)
chr1 (203-296)||(6613957-6614051)
chr1 (203-293)||(50107185-50107275)
chr1 (150-260)||(3117647-3117757)
chr1 (154-293)||(11060766-11060905)
chr1 (233-296)||(32664585-32664647)
chr1 (179-289)||(5783095-5783205)
chr1 (199-261)||(25037925-25037987)
chr1 (199-261)||(25043137-25043199)
chr1 (162-254)||(44019996-44020088)
chr1 (182-293)||(11829939-11830050)
chr1 (154-296)||(1407642-1407784)
chr1 (235-296)||(534518-534579)
chr1 (247-296)||(33342511-33342560)
chr1 (162-262)||(1001164-1001264)
chr1 (150-210)||(2923861-2923921)
chr1 (96-148)||(12173238-12173290)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (149-296)||(4592858-4593005)
chr5 (150-296)||(2464667-2464813)
chr5 (150-296)||(8074449-8074594)
chr5 (150-294)||(546017-546160)
chr5 (150-296)||(9538028-9538174)
chr5 (150-296)||(21069287-21069433)
chr5 (151-296)||(19182949-19183094)
chr5 (145-296)||(28591092-28591244)
chr5 (150-295)||(2466753-2466899)
chr5 (89-222)||(13651173-13651305)
chr5 (150-296)||(14891126-14891268)
chr5 (184-296)||(32641705-32641817)
chr5 (150-294)||(40612640-40612784)
chr5 (150-296)||(25590429-25590574)
chr5 (151-296)||(19186199-19186344)
chr5 (153-296)||(9537024-9537166)
chr5 (150-289)||(16611726-16611865)
chr5 (189-296)||(32640325-32640432)
chr5 (150-296)||(8075812-8075958)
chr5 (189-296)||(544685-544792)
chr5 (154-296)||(31947016-31947158)
chr5 (185-286)||(19271375-19271476)
chr5 (156-296)||(16978996-16979136)
chr5 (154-246)||(18400192-18400284)
chr5 (192-296)||(28589739-28589843)
chr5 (160-258)||(13483029-13483126)
chr5 (215-261)||(14881010-14881056)
chr5 (200-296)||(4594080-4594174)
chr5 (213-257)||(13483174-13483218)
chr5 (203-295)||(35538281-35538373)
chr5 (212-291)||(18004698-18004777)
chr5 (154-293)||(26327054-26327193)
chr5 (150-196)||(24900411-24900457)
chr5 (242-296)||(40611350-40611404)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (151-296)||(44333138-44333281)
chr7 (147-296)||(48646044-48646193)
chr7 (150-296)||(48777254-48777401)
chr7 (150-296)||(7258273-7258419)
chr7 (150-296)||(44334429-44334574)
chr7 (154-296)||(7259663-7259805)
chr7 (154-296)||(43457459-43457601)
chr7 (150-296)||(48788651-48788797)
chr7 (153-294)||(46286504-46286645)
chr7 (150-294)||(48647424-48647568)
chr7 (145-296)||(10899052-10899203)
chr7 (150-296)||(35727697-35727842)
chr7 (150-296)||(42477379-42477524)
chr7 (153-296)||(30924988-30925130)
chr7 (150-296)||(35729065-35729211)
chr7 (182-293)||(34888905-34889016)
chr7 (155-289)||(8375569-8375703)
chr7 (154-296)||(12223678-12223820)
chr7 (150-296)||(39708101-39708247)
chr7 (203-296)||(13578300-13578392)
chr7 (150-296)||(8048763-8048909)
chr7 (164-274)||(8374926-8375036)
chr7 (150-260)||(45583682-45583792)
chr7 (205-296)||(45584475-45584566)
chr7 (151-296)||(19433913-19434058)
chr7 (140-296)||(12220011-12220166)
chr7 (200-296)||(44529076-44529172)
chr7 (150-296)||(5930112-5930257)
chr7 (199-291)||(44530595-44530687)
chr7 (212-296)||(32793231-32793315)
chr7 (154-224)||(385662-385732)
chr7 (154-252)||(34704911-34705009)
chr7 (184-293)||(2677768-2677877)
chr7 (193-251)||(10894391-10894449)
chr7 (154-231)||(21062819-21062896)
chr7 (233-294)||(46287385-46287446)
chr7 (184-296)||(7509450-7509562)
chr7 (202-286)||(8879532-8879616)
chr7 (239-291)||(24287567-24287619)
chr7 (241-296)||(33060899-33060954)
chr7 (110-148)||(33474296-33474334)
chr7 (198-280)||(33607618-33607700)
chr7 (239-296)||(30917800-30917857)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (151-296)||(48572984-48573129)
chr3 (144-296)||(36278944-36279096)
chr3 (150-277)||(17700516-17700643)
chr3 (145-296)||(55388066-55388217)
chr3 (154-277)||(17701917-17702040)
chr3 (150-296)||(52316977-52317123)
chr3 (150-295)||(52318297-52318442)
chr3 (150-262)||(19114531-19114643)
chr3 (152-296)||(20464069-20464213)
chr3 (150-289)||(33428421-33428560)
chr3 (150-289)||(47118037-47118176)
chr3 (147-289)||(45600925-45601066)
chr3 (150-263)||(2592019-2592132)
chr3 (191-296)||(36280296-36280401)
chr3 (150-294)||(2591625-2591769)
chr3 (189-296)||(53959079-53959186)
chr3 (150-296)||(3671037-3671182)
chr3 (150-296)||(34263803-34263949)
chr3 (198-296)||(48574438-48574536)
chr3 (155-296)||(50753820-50753961)
chr3 (150-291)||(48808362-48808505)
chr3 (152-296)||(55389448-55389592)
chr3 (150-289)||(47075337-47075476)
chr3 (184-273)||(11773053-11773142)
chr3 (150-289)||(19115133-19115271)
chr3 (145-262)||(49261550-49261664)
chr3 (150-296)||(53957673-53957817)
chr3 (204-286)||(40205934-40206016)
chr3 (161-227)||(19331117-19331183)
chr3 (204-293)||(40206919-40207009)
chr3 (177-251)||(47427885-47427959)
chr3 (239-296)||(48809634-48809690)
chr3 (154-297)||(26652583-26652725)
chr3 (241-296)||(36827454-36827509)
chr3 (168-296)||(612230-612358)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (150-289)||(53771035-53771174)
chr4 (150-296)||(42278047-42278193)
chr4 (151-296)||(47878463-47878608)
chr4 (154-293)||(47874566-47874704)
chr4 (150-296)||(31844720-31844865)
chr4 (155-286)||(26172931-26173062)
chr4 (150-289)||(48740006-48740145)
chr4 (150-296)||(26170638-26170784)
chr4 (144-296)||(39868914-39869064)
chr4 (150-259)||(54574423-54574532)
chr4 (150-296)||(4703196-4703342)
chr4 (198-296)||(50694795-50694893)
chr4 (168-296)||(21623096-21623224)
chr4 (149-289)||(53770330-53770470)
chr4 (204-294)||(4701817-4701907)
chr4 (198-296)||(21621869-21621967)
chr4 (150-296)||(31844934-31845080)
chr4 (160-293)||(42391868-42392003)
chr4 (164-289)||(26685408-26685528)
chr4 (150-286)||(44158502-44158638)
chr4 (150-253)||(19051253-19051356)
chr4 (211-296)||(19050297-19050382)
chr4 (199-258)||(54574822-54574881)
chr4 (239-293)||(32244361-32244415)
chr4 (239-296)||(24753540-24753597)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (152-296)||(79073-79217)
scaffold0039 (150-296)||(79662-79808)
scaffold0039 (155-231)||(74357-74433)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (151-263)||(116054-116166)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (150-296)||(30747997-30748143)
chr6 (150-289)||(31218953-31219092)
chr6 (154-289)||(31219146-31219281)
chr6 (150-296)||(23507947-23508092)
chr6 (154-286)||(12676459-12676591)
chr6 (179-293)||(24621104-24621218)
chr6 (173-224)||(6468832-6468883)
chr6 (104-149)||(19645948-19645993)
chr6 (248-296)||(10855902-10855950)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (154-295)||(5601-5742)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32766364 - 32766217
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32766364 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32766265  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32766264 tatcactttagtccttgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32766217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31091652 - 31091506
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31091652 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 31091553  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31091552 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31091506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 32764940 - 32765081
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32764940 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctagttgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 32765039  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32765040 actttaatccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 32765081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21733899 - 21733750
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcat---gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21733899 gagcaaatagtcactctagtccctgactttgtacatcgttgtcacaaaggtccctgactcatcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttc 21733800  T
Q  247 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21733799 cgtcatcactttagttgttgcagttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 21733750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 31090165 - 31090305
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31090165 caaatagtcaatttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtccttgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttat 31090264  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
     | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  31090265 gattttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatga 31090305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Original strand, 14704052 - 14704149
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14704052 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctcactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 14704149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17330355 - 17330209
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  17330355 gagcaaatagtcgctttagtccttgattctgcagctcactgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcatttccgt 17330256  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17330255 tatcactttagtccatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 17330209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24459570 - 24459432
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||    
T  24459570 agcaaagagtcactttggtccctgactctgcatctcgctgtcacataggtccctgaatcaggattaaatacaaataagtctctgaccctgcacttctatt 24459471  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  24459470 atcactttagtccctgacattaaaaaaatatgttaagtg 24459432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34037793 - 34037652
Alignment:
Q  155 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||    
T  34037793 aatagtcactttagtccttgactctgcaccttgctgtcataaaggtccataactcaggattaaatacaaataagtctatgactctgcacttctgttatca 34037694  T
Q  255 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037693 ctttagttcccgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 34037652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 2910102 - 2910244
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||    
T  2910102 aaataatcactttagtctttgattttgcagctcgctgtcacatagatccctgactcgggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcctttgtc 2910201  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2910202 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 2910244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40000456 - 40000315
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40000456 caaattgtcactttggtccctgactctgcacctcgctgttacatagatccctgattgaggattaaatacaaataagtctctaaccctgcacttccgttat 40000357  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40000356 cactttattccctgacgttaagaaaatctgttaagtgatgat 40000315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 24458058 - 24458204
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||    
T  24458058 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctatcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtttctgactctacactttcgt 24458157  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  24458158 tatcactttagtctctaacgttaaaaaaatctattaagtgataatgt 24458204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39016506 - 39016364
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccct--gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||   || ||  |||||| |||||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  39016506 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacatacatctctctgactcaggattaaatacaaataagtc----actctgcacttcc 39016411  T
Q  248 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39016410 gttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 39016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5915117 - 5914978
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || ||||  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5915117 gagcaaatagtcactttagtccatgactctgcacctcgctttcaaataggtctttgactcagaattaaatacaaagaagtcactaactctgcacttccgt 5915018  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||| ||| |||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  5915017 tatcaccttaatccccgacgttaaataattctgttaagtg 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17466930 - 17466807
Alignment:
Q  173 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtta 272  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  17466930 tgactctgcacctcgctgtcacataagccgctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtctaagacgtta 17466831  T
Q  273 aaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  17466830 aataattctgttaagtgatgatgt 17466807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 7073638 - 7073783
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||| ||   |||| ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  7073638 agcaaatagtcactttagtccttcattctgcagcttactgtcgcataggtctctgattcgggattaaatacaaataagtctctgattctgcacttccgtt 7073737  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  7073738 atcactttagtccctgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 7073783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2911616 - 2911468
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | |||| |||| ||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2911616 gagcaaatagtcactttggtctctggttctgcagctcgctgtcacataaggccatgactcaaagttaaatataaataagtctctgactttgcacttccgt 2911517  T
Q  250 tatcactt----tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||||||    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2911516 tatcactttagttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 2911468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 286
Target Start/End: Original strand, 38853762 - 38853889
Alignment:
Q  159 gtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 258  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  || |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  38853762 gtcactttggtccctgactctacacttcattgtcataaaggtctctgactcaggattaaatacaaagtagtccctaaatgtgcacttccgttatcaattt 38853861  T
Q  259 agtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  38853862 agtcactgacgttaaataattatgttaa 38853889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 33161799 - 33161909
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 283  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || | |||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  33161799 ctcgttgtcacaaaggtctctgccttaggattaaatgcaaagaagtctcagactatgtacttccgttatcactttagtccttgacgttaaataattttgt 33161898  T
Q  284 taagtgatgat 294  Q
    |||||||||||    
T  33161899 taagtgatgat 33161909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Original strand, 5914324 - 5914441
Alignment:
Q  172 ctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtt 271  Q
    |||||| |||| |||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  5914324 ctgactttgcacctcgttgtgatataggtctctgactcacaattaaatacaaagaagtcagtgactttgcactcccgttatcactttagaccatgacgtt 5914423  T
Q  272 aaaaaattatgttaagtg 289  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  5914424 aaataattctgttaagtg 5914441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Original strand, 7412124 - 7412233
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 283  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||    
T  7412124 ctcgttgtcacatagatctctgactcaagattaaatataaagaagtcactgatagtgcacttccgttatcactttagtccctaacattaaataattatgt 7412223  T
Q  284 taagtgatga 293  Q
    ||||||||||    
T  7412224 taagtgatga 7412233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Original strand, 17466093 - 17466185
Alignment:
Q  204 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17466093 tgactcaggattaaatacaaagatatctctgactctgcacttccgttttcactttagtccctgacgtgaaacaattatgttaagtgatgatgt 17466185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34582791 - 34582664
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || | ||| |||  ||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  34582791 aaatggtcacgttagtccctgactctgcaccttgctgttacaaaggtcattgactcgggattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcacttccgttatc 34582692  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattat 281  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34582691 actttagtccctgacgttaaataattat 34582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 293
Target Start/End: Original strand, 37607149 - 37607243
Alignment:
Q  199 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  37607149 gtccctaactcatgattaaatacaaggtagtcctttaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgacgttatataattatgttaactgatga 37607243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 39015003 - 39015149
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| | |    
T  39015003 gagcaaataatcacttttgtccctgactctgcacctcgctgccacatagatccttgactcaggattaaatacaaatacgtctttgactctgcactttcat 39015102  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| ||||||   |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39015103 tatcattttagtttctaacgttaaaaatatttgttaagtgatgatgt 39015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38985051 - 38984967
Alignment:
Q  213 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaa-aaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38985051 attaaatacaaagaagtccttgactctgcacttccgttatcactttagtcactaacgttaaataaattatgttaagtgttgatgt 38984967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31814467 - 31814323
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||| ||| | |  |||| ||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||| |||||||||||    
T  31814467 gagcaaatagtcactttagtcatttactctgcacctcgctgttaaa--ggtctctgactcagaattaaatataaagaagtttttgactctgcacttccgt 31814370  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31814369 tatcactttagtccctagcattaaataattctgttaagtgatgatgt 31814323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Original strand, 8420006 - 8420123
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||    
T  8420006 aaaatgagtaaatggtcactttggtccctgactctgcatttcgcggtcacaaatgtccctgagtcaagattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcact 8420105  T
Q  245 tccgttatcactttagtc 262  Q
    || ||||||| |||||||    
T  8420106 tctgttatcagtttagtc 8420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 286
Target Start/End: Original strand, 38854791 - 38854923
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||||  ||||||    
T  38854791 aaatagtcactttggtccctgactctacacttcgttgtcataaaggtctttgactcaggattaaatacaaagtagttcctaaatgtgcacttatgttatc 38854890  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    | |||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  38854891 aatttagtcactgaagttaaataattatgttaa 38854923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31443365 - 31443234
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||  ||||| || ||||||||||||  ||||||| |   |||||||  ||||||    
T  31443365 aaatggtcactttagtctctgactctgcatctcgttgtcacaaaagtcattgacttataattaaatacaaagtagtccctga-agtgcacttatgttatc 31443267  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| || ||||||    
T  31443266 agtttagtctttgactttaaaaacttttgttaa 31443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 39999022 - 39999096
Alignment:
Q  221 caaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39999022 caaataagtccttgattttgcact-cggttatcactttaatctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 39999096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 10728990 - 10729044
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10728990 tgcacttccgttatcagtttagcccctgacgttaaaaacttatgttaactgatga 10729044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26586331 - 26586285
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  26586331 tgcacttccgttatcactttagtctctggcgttaaataattatgtta 26586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12746274 - 12746213
Alignment:
Q  202 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12746274 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcccttccgttatcactttagtcc 12746213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32898570 - 32898424
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32898570 gagcaaatagtcactttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32898471  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32898470 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32898424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 35177393 - 35177539
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35177393 gagcaaatagtcaatttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactccggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 35177492  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  35177493 tatcactttagtccctgacgttaaaataatctgttaagtgatgatgt 35177539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35178929 - 35178784
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35178929 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacatcgctgtcatattggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgt 35178830  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35178829 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 35178784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10407708 - 10407563
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||  |||||||| ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10407708 agcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcactgtcacataggtcattgacttaggattaaacacaaataagtccataactttgcacttccgtt 10407609  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10407608 atcactttagttcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10407563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5738144 - 5738002
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||| || ||||||||||||    
T  5738144 aaatggtcactttagttcctgactttgcatatcgttgtgacataggtccatgactcaagattaaatacaaagaagttattgactctgtacttccgttatc 5738045  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5738044 acttcagtctttggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 5738002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1953099 - 1952949
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || | || |||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| || |||    
T  1953099 aaaaagagtaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgttgtcatatagatctctgact-aggattacatacaaataagtctatgactctgtact 1953001  T
Q  245 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1953000 tccgttatcactttagtctctgacgttaaataaatctgttaagtgatgatgt 1952949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5965563 - 5965421
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||| || |||| |||| | | || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||    
T  5965563 aaatagtcatttcagtctctgattttacacctcgttgtcacaaatgtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctttgactctgcacttccgttatc 5965464  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||  || |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  5965463 actttagtctctgacgttaaatgattatgttaagtaatgatgt 5965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 41753990 - 41754097
Alignment:
Q  144 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| | |||    
T  41753990 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctggttctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaacaagtccctgactctacac 41754089  T
Q  244 ttccgtta 251  Q
    || |||||    
T  41754090 tttcgtta 41754097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41754919 - 41754776
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||    
T  41754919 gagcaaatagtcactttaatcc-tgattctgcacctcgctgtcacatagatctctgactcaggattaaatacaaacaagttcctgactctacacttccgt 41754821  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41754820 tattactttag-ccctgccgttaaaaaa-actgttaagtgatgatgt 41754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 45476223 - 45476306
Alignment:
Q  213 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45476223 attaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttatcactttagtctctcccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45476306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Original strand, 28619035 - 28619133
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28619035 ggtccctgacccatgattaaatacaaagaaatcattgactctgcactttcgttatcactttagtctcggccgttaaataattttgttaagtgatgatgt 28619133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 30134564 - 30134710
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||||| ||    
T  30134564 gagcaaataatcactttagtccttaactctgcacctcgctgtcacaaaggtcccctactcatgattaaatacaaagaagtgtgtgactctgcacttctgt 30134663  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| |   |  ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30134664 tatcactttaatatctaacgttatataattatgttaggtgatgatgt 30134710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 5736903 - 5736986
Alignment:
Q  213 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5736903 attaaatacaaagaaatctctaactctacactttcgttatcactttagtccctcacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 5736986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45476616 - 45476542
Alignment:
Q  222 aaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45476616 aaataagtcgctgactctgcacttctcttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 45476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 59554 - 59696
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| | |  | |  || || |||    
T  59554 aaatagtcactttagtccctgactttacacctcgctgtcactttagtccctgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgggtagatctgtcatc 59653  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  59654 agtttagtccttacaattaaaaaattatgttaaccgatgatgt 59696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 10406269 - 10406350
Alignment:
Q  215 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10406269 taaataaaaacaagtctctgactctgcacttctattatcactttagtccctggtgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Original strand, 28524810 - 28524902
Alignment:
Q  204 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28524810 tgactcaggattaaatacaaagtaatccttgaatgtgcacttccgttatcattttagtctctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 28524902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 286
Target Start/End: Original strand, 43539107 - 43539239
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||| | | || |  || ||||||    
T  43539107 aaatagtcactttggtccctaactttgcacctcgctgtcactttagtccccgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgtgtatatctgttatc 43539206  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43539207 agtttaatccttaccgttaaaaaattctgttaa 43539239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32565763 - 32565696
Alignment:
Q  220 acaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaag 287  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  32565763 acaaagaagtcccaaattttgcactttcgttatcactttagtcattgatattaaataattatgttaag 32565696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Original strand, 41121160 - 41121214
Alignment:
Q  203 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||||    
T  41121160 ctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgactatgcacttctattatcactt 41121214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12637835 - 12637770
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 263  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12637835 ggtccctaactcaggattgaatacaaagtagttcctgaatgtgcacttccgttatcactttagtcc 12637770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41122782 - 41122730
Alignment:
Q  244 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||| |||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41122782 ttccattatcattttagtgtttgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 41122730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Original strand, 10332984 - 10333128
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10332984 gagcaaatagtcactttagtccctgactttgcacctcgttgtcacataggtccttgattcaggattaaatataaataagtcccttactctgcacttccgt 10333083  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  10333084 tatcattttagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 10333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 9339644 - 9339790
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  9339644 gagcaaatagtccctttagtccctgattctgcagctcgttgttacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccccgactctgcacttccgt 9339743  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9339744 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 9339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32665895 - 32665749
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  32665895 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttgactctgcacttccgt 32665796  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  32665795 tatcactttagtccctggcgttacaaaaatctgttaagtgatgatgt 32665749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7945679 - 7945533
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7945679 gagcaaataatcattttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgt 7945580  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7945579 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgctaagtgatgatgt 7945533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10333311 - 10333165
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||| || || |||| | |||| |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10333311 gagcaaatagtcactataatctctgattctgcagctcgctgttacataggtctctgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgt 10333212  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10333211 tatcactttagtctctagcgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10333165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 291
Target Start/End: Original strand, 7944156 - 7944294
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  7944156 agcaaatagtcact--agtccctgattttgcaactcgctgtcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtccttgactctgcactttcgtt 7944253  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  7944254 atcaatttagtccctaacgttaaaaaaatatgttaagtgat 7944294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Original strand, 5782412 - 5782551
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  5782412 gagcaaattgtcattttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgattatgcacttccct 5782511  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  5782512 tatcactttagtctctgacgttaaataattttattaagtg 5782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Original strand, 6612420 - 6612563
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  6612420 caaatagtcactttagtccctgactctgcacctcgctgttataaatgtctctgactcatgattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccattat 6612519  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6612520 cactttaatccctgacgttaaataattttgttaagtgattatgt 6612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9341150 - 9341004
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | | ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  9341150 gagcaaatagtcactttgatcatttattctgcatctcactatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactttgcacttctgt 9341051  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  9341050 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatctattaagtgatgatgt 9341004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 22856678 - 22856824
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22856678 gagcaaatggtcactttagtcactgactctgcaccacgttgttacaaagattcttgactcaggattaaatacaaagaagtctctaactctgcacttccgt 22856777  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22856778 tatcactttagtctccgacgttaaataattatgttaagtgattatgt 22856824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52440684 - 52440539
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  52440684 gagcaaataatcacattggtctctgactttgcacatcgctgtcacataggtccctgagtcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccat 52440585  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52440584 tatcactttagt-cttgacgttaaaaaaatgtgttaagtgatgatgt 52440539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 52439477 - 52439619
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||     || |||| ||||||    
T  52439477 gagcaaatagtcactttagcccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctggctcaggattaaatacagataagtc----tctctgcatttccgt 52439572  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52439573 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52439619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Original strand, 8975161 - 8975301
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | | | ||||||| |||||||    
T  8975161 aaatggtcactttggtccctaactttgcaccttgttgtcacaaaggtccctgactcaagattaaatataaagtagtccatgaatatgcactttcgttatc 8975260  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8975261 actttagtctttggcgttaaataattttgttaattgatgat 8975301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34088585 - 34088449
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||        ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |    
T  34088585 agcaaattgtcactttagtccctgactctacatctcgctgtcacaaaggtc--------atgattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccact 34088494  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34088493 atcactttaatccttgacattaaataattatgttaagtgatgatg 34088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22857619 - 22857558
Alignment:
Q  235 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22857619 actttgcacttccgttatcactttagtccatgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 22857558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6614051 - 6613957
Alignment:
Q  203 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcct-tgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6614051 ctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcagttatcattttagtcctccgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 6613957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 50107275 - 50107185
Alignment:
Q  203 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50107275 ctgattcaggattaaatacaaaatagtctctgaatgtgcacttccgttatcactttagtccttggcgttaaataattatgttaactgatga 50107185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 3117647 - 3117757
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| | |||||||||    
T  3117647 gagcaaatagtcattttagtccctaactcttcacatcgttatcacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaaatctctgactctccacttccgt 3117746  T
Q  250 tatcactttag 260  Q
    |||||||||||    
T  3117747 tatcactttag 3117757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11060905 - 11060766
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| | |  |||||| |||||||    
T  11060905 aaatggtcactttgatccttgactatgcacctcgctgtcacaaaggtccatgactcaaaattaaatacaaaatagtccctgaatgggcactttcgttatc 11060806  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11060805 actttagtccccgacgttaaataattctgttaactgatga 11060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Original strand, 32664585 - 32664647
Alignment:
Q  233 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32664585 taactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgttaagaaaat-tgttaagtgatgatgt 32664647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5783205 - 5783095
Alignment:
Q  179 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 278  Q
    |||| |||| |||||||| | |||  ||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||    
T  5783205 tgcacctcgctgtcacatagatcctcgactcagaattaaatacaaagaagtccatgactctgcacttccgttatcactttagtcactagcgttaaataat 5783106  T
Q  279 tatgttaagtg 289  Q
    | |||||||||    
T  5783105 tctgttaagtg 5783095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Original strand, 25037925 - 25037987
Alignment:
Q  199 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25037925 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Original strand, 25043137 - 25043199
Alignment:
Q  199 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25043137 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25043199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 254
Target Start/End: Original strand, 44019996 - 44020088
Alignment:
Q  162 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 254  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  44019996 actttggtccctgactttgcaactcgttgtcacaaaagtctctgactcaagattaaatataaagaagtctctgactctgcacttacgttatca 44020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 11829939 - 11830050
Alignment:
Q  182 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 281  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  11829939 atctcgttgtcacaaaggtcactaactcaagattaaatacaaattagtccttgtatatgcatttccgttattagtttaggctttgacgttaaaaacttat 11830038  T
Q  282 gttaagtgatga 293  Q
    ||||| ||||||    
T  11830039 gttaactgatga 11830050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 1407642 - 1407784
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||| || |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||  |||  || | | |||||||  ||||||    
T  1407642 aaataatcactttcatctctgactctgcaccttgttgtcacaaaggtccatgacttatgactaaatataaagtagtttctgaatatgcacttatgttatc 1407741  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1407742 actttagtccctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 1407784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 534579 - 534518
Alignment:
Q  235 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  534579 actttacacttctgttatcactttagtccctaccgttaaaaaaatctgttaagttatgatgt 534518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 33342511 - 33342560
Alignment:
Q  247 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342511 cgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 33342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Original strand, 1001164 - 1001264
Alignment:
Q  162 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 261  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||||||  |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  1001164 actttagtccatgactttgcacctcgttgccacaaaggtccatgactcgggattaaatacaaagtagtctctgaatgtgcacttctgttatcagtttagt 1001263  T
Q  262 c 262  Q
    |    
T  1001264 c 1001264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2923921 - 2923861
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| | |||||  |||||||||||||    
T  2923921 gagcaaatagtcactttagttcctaactttgcacctcgctatcacaaaggtccctgactca 2923861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12173290 - 12173238
Alignment:
Q  96 attatggatcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaa 148  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12173290 attatgggtcttgttaaccagtgccctcagggtaatggttaaggaaactaaaa 12173238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Original strand, 4592858 - 4593005
Alignment:
Q  149 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4592858 ggagcaaatagtcactttagtccctgattatgtagctcgctgtcacataagtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccg 4592957  T
Q  249 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4592958 ttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 4593005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 2464667 - 2464813
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2464667 gagcaaatagtcactttagtcactgattctgcagctcgctgtcatataggtccatgactcatgattaaatacaaataagtccctaactctgcacttacgt 2464766  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2464767 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 2464813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 8074449 - 8074594
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8074449 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctgtcacataagtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 8074548  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8074549 tatcactttagttcctgacgttaaaaaa-tcggttaagtgatgatgt 8074594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 546160 - 546017
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  546160 gagcaaatagtcactttagtccc-gattttgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacagataagtccttgactctgcacttccgt 546062  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  546061 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgat 546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9538174 - 9538028
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  9538174 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcatctcgttgtcatataggtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgattgtgcacttccgt 9538075  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9538074 tatcattttagtctctgatgttaaataattatgttaagtgattatgt 9538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 21069287 - 21069433
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  21069287 gagcaaatagtcactttagtctctgactctgcacctcgttgtcacagaggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccttgactctgcacttctgt 21069386  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    | |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21069387 tttcactttaatatatgccgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 21069433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 19182949 - 19183094
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  19182949 agcaaatagttactttagaacttgactttgcacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctgactctacacttccgtt 19183048  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19183049 atcactttagtccttgcgattaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 19183094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28591244 - 28591092
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  28591244 aaaaagagcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccctgactctgcact 28591145  T
Q  245 tccgttatcactttagtccttgccgtta-aaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28591144 tcctttatcactttagtccccgacgttacaaaaaatctgttaagtgatgatgt 28591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2466899 - 2466753
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2466899 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacctcgctatcacataggtcattgattcaggattaaataaaaataagtccctaactctgcacttccgt 2466800  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatg 295  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2466799 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatg 2466753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13651305 - 13651173
Alignment:
Q  89 tactagtattatggatcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgt 188  Q
    |||||||||||||||||||  | || | | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  13651305 tactagtattatggatcttactgacgaatgtcctcatggcaatggttaaggaaactaaaatgagcaaatagtcactttagtccttgactgtgcacct-gc 13651207  T
Q  189 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaataca 222  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13651206 tgtcacataggtccctgactcaggattaaataca 13651173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14891268 - 14891126
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    ||||| || ||| | |||||||||    
T  14891268 gagcaaatagtcactttggtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatgc----aagtctctgactctacacttccgt 14891173  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891172 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 14891126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32641817 - 32641705
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 283  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  32641817 ctcgttgtcacgtaggtcccttactcaagattaaatacaaataagttgctgactctgcacttccgttatcactttaatccctgacgttaaaaaaatatgt 32641718  T
Q  284 taagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||    
T  32641717 taagtgatgatgt 32641705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40612784 - 40612640
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||    
T  40612784 gagcaaatagtcactttagtccctgattttgcagctcactgtcacgtaggtccctgactcaggattaaatacagatattttcctgactctgcacttccgt 40612685  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    |||||||||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40612684 tatcactttaattcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 40612640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 25590429 - 25590574
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||    
T  25590429 gagcaaatagtcactttgttttctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcg-gattaaatacaaataagtctctgattctgcacttctgt 25590527  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590528 tatcactttaatctctgacgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 25590574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19186344 - 19186199
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||||||||| ||||||| |   || ||||||||   ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||    
T  19186344 agcaaatagtcattttagtctcatgctctgcatctcccagtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacatttccgtt 19186245  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19186244 atcactttagtccttgtcgttaaaacaatctgttaagcgatgatgt 19186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Original strand, 9537024 - 9537166
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  9537024 caaatggtgactttagtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgacttagaattaaatacaaagaagtca-tgactgtgcacttccattat 9537122  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9537123 cactttagtcactgacgttaaataattatggtaagtgatgatgt 9537166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Original strand, 16611726 - 16611865
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || | | |||||||||||    
T  16611726 gagcaaatggtcactttaattcttgactctacacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaagaagcctctgattatgcacttccgt 16611825  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  16611826 tatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaagtg 16611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Original strand, 32640325 - 32640432
Alignment:
Q  189 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 288  Q
    |||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  32640325 tgtcacataggaccataactcaggattaaatacaaataagtccctaactctaaacttctgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 32640424  T
Q  289 gatgatgt 296  Q
    ||||||||    
T  32640425 gatgatgt 32640432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8075958 - 8075812
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | | ||||||| |||    
T  8075958 gagcaaatagtcgctttggtcattgactctgcacctcgctgttagatagatccctgattcaagattaaatacaaaaaagtatctgattctgcactttcgt 8075859  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  8075858 tatcactttagtccctgacgtttaaaaaatctgttaagtgatgatgt 8075812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Original strand, 544685 - 544792
Alignment:
Q  189 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 288  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||   || | |||||||| ||||||||||    
T  544685 tgtcagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttataaatttagtttctgacattaaaaaaatatgttaagt 544784  T
Q  289 gatgatgt 296  Q
    ||| ||||    
T  544785 gattatgt 544792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31947158 - 31947016
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||  | ||||||| || | | ||| ||| |  |||||||||||| |||||  | ||| |  ||||||||||||    
T  31947158 aaatagtcactttagtctctgattctgcactttgttgtcatatagattccttacttaaaattaaatacaaacaagtctatgactctagacttccgttatc 31947059  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31947058 actttagtcactgctgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Original strand, 19271375 - 19271476
Alignment:
Q  185 tcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtt 284  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||  ||||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  19271375 tcgttgtcacaagtgtcccaggctcatgattaaatataaagtagtcctttaatgtgcacttccgttatcagtttagtccatgacgttaaaaatttatgtt 19271474  T
Q  285 aa 286  Q
    ||    
T  19271475 aa 19271476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 296
Target Start/End: Original strand, 16978996 - 16979136
Alignment:
Q  156 atagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcac 255  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||  ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  16978996 atagtcactttagtccttgactttgcaccttgctgccacaaaggtcattgactcagaattaaatgcaaataagtccctaactctgtacttacgttatcat 16979095  T
Q  256 tttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||  |  ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16979096 tttagtctctaacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 16979136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Original strand, 18400192 - 18400284
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  18400192 aaatggtcactttagtccctgactctgcacctcactgtcacataggtccttgactcaggattaaataaaaagaagtcactgactctgcacttc 18400284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Original strand, 28589739 - 28589843
Alignment:
Q  192 cacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||||| |||||||||| || |||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  28589739 cacataggtccctgactcataattaaatacaaatacatttttgactttgtacttccgttaccattttagtctctgacgttaaaaaaatctgttaagtgat 28589838  T
Q  292 gatgt 296  Q
    |||||    
T  28589839 gatgt 28589843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 13483029 - 13483126
Alignment:
Q  160 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 258  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13483029 tcactttagtccc-gactctgtatctcgcattcagataggttcctgactcatgattaaatataaagaagtctcttactctgcactttcgttatcacttt 13483126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 261
Target Start/End: Original strand, 14881010 - 14881056
Alignment:
Q  215 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 261  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14881010 taaacacaaataagtccctgactctgcacttccgttatcactttagt 14881056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4594174 - 4594080
Alignment:
Q  200 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4594174 tccctgactcaggattaaatacaaataagt-catgactctgcacttccattatcac-ttaatcccttacgttaaaaagatctgttaagtgatgatgt 4594080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13483218 - 13483174
Alignment:
Q  213 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 257  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13483218 attaaatacaaacaagtctctgactttgcacttccgttatcactt 13483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35538373 - 35538281
Alignment:
Q  203 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| | | | | ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  35538373 ctgactcgtgattaaatacaaagtagttcttcaatgtgcacttccgttatcactttaatccttaatgttaaataattctgttaactgatgatg 35538281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 18004698 - 18004777
Alignment:
Q  212 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    ||||||||||||| | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  18004698 gattaaatacaaagaggtctatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgatgttaaatagttatgttaagtgat 18004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26327193 - 26327054
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| |||  |  || |   | ||||||||||| |||    
T  26327193 aaatagttattttggtcactgactctgcacctcgttgtcataagggctcctgactcaggattaaatataaaataacccttggatgtgcacttccgtaatc 26327094  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  26327093 agtttagtccttgacgttaaaaatttctgttaactgatga 26327054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24900457 - 24900411
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacat 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24900457 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacat 24900411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Original strand, 40611350 - 40611404
Alignment:
Q  242 acttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40611350 acttcccttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaggtgatgatgt 40611404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 44333138 - 44333281
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44333138 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgtt 44333237  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44333238 atcac--tagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 44333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 48646044 - 48646193
Alignment:
Q  147 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 246  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48646044 aaggagtaaatagtcactttggtccctgactatgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttc 48646143  T
Q  247 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48646144 cgttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatattaagtgatgatgt 48646193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 48777254 - 48777401
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  48777254 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacataagtccctgactcatgattaaatacaaataattccctgactctgcacttccgt 48777353  T
Q  250 tatcactttagtccttgccg-ttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48777354 tatcactttagtccatgacgtttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 48777401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 7258273 - 7258419
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  7258273 gagcaaatagtcactttggtccctgactctacacctcgttgtcacataggtccctaactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgt 7258372  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7258373 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7258419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44334574 - 44334429
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  44334574 gagcaaatagtcactttagttcctgattctgcagctcgctgttacataggtccctgactcatgattaaatataaataagtccctgactctgcacttccat 44334475  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334474 tatcactttagtccctgacattaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 44334429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7259805 - 7259663
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||||||||||||| || |||| | || | |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7259805 aaatagtcactttaatcgctgattttgtagctcgctgtcacatgggtctctgattcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgttatc 7259706  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7259705 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7259663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 43457459 - 43457601
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  43457459 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcgcataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccccgactctgcacttccgttatc 43457558  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||| | || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  43457559 actttagttcatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 43457601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48788797 - 48788651
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  48788797 gagcaaatagtcactttgatccttgactttgcacctcgctgtcacataggtccctgactcataattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgt 48788698  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  48788697 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaggtgatgatgt 48788651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Original strand, 46286504 - 46286645
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  46286504 caaatagtcactttagtccctgactcttcatctcgctgttagaaaggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttat 46286603  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46286604 cactttaatctctaccgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 46286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48647568 - 48647424
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||    
T  48647568 gagcaaatagtcactttagaccctgattctacagctcgctatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctcactctgcacttttgt 48647469  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48647468 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 48647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10899203 - 10899052
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| ||| |||| || ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10899203 aaaatgagtaaattgttactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacatagatccttgacccaggattaaatacaaataagtctctgactctgcact 10899104  T
Q  245 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10899103 tccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10899052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 35727697 - 35727842
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  35727697 gagcaaacagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacatccgt 35727796  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35727797 tatcactttagtcc-tgacgttaaaaatctctgttaagtgatgatgt 35727842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 42477379 - 42477524
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42477379 gagcaaataatcaatttggtccttgactctgcacctcgttgtcgcataggtctctgactcaggattaaatacaaataagt-cctgactctgcacttccgt 42477477  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42477478 tatcattttaatccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 42477524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30925130 - 30924988
Alignment:
Q  153 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  30925130 caaatagtcactttaatccctgattctgcagctcccagtcacataggtccttgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgttat 30925031  T
Q  253 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
     |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30925030 tactttagtctctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 30924988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35729211 - 35729065
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  35729211 gagcaaatagtcactttattccctgattttgcagctcgctgtcacataggtccttgacttaggattacatacaaataagtcactgactctgcacttccgc 35729112  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| |||||| || | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35729111 tatcactgtagtccctgacattaaataaatctgttaagtgatgatgt 35729065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34889016 - 34888905
Alignment:
Q  182 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 281  Q
    |||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34889016 atctcgctgtcacaaaggtctctcactcatgattaaatataaagatgtccttaactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgtttaataattat 34888917  T
Q  282 gttaagtgatga 293  Q
    ||||||||||||    
T  34888916 gttaagtgatga 34888905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8375703 - 8375569
Alignment:
Q  155 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  8375703 aatagtcacattagtccctgacttcgcaccgcactgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaagaagtttctgactctgcacttccgttatca 8375604  T
Q  255 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
     ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  8375603 atttagtccgcgacgttaaataattttgttaagtg 8375569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12223820 - 12223678
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||     
T  12223820 aaatggtcactttagtccctgacactgcacatcaatgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaagaagtccctgactctgcagttccgttatt 12223721  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12223720 actttagtcactgatgttaaataattctgttaagtgatgatgt 12223678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 39708101 - 39708247
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||  ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39708101 gagcatatagtcactttagtctctgactctgtacctcgccgtcacaaaggtccatgactcaagattgaatacaaagaagtcaccgactttgcacttccgt 39708200  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39708201 tatcactttagtccgtgatgttaaataattatgttatgtgataatgt 39708247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13578392 - 13578300
Alignment:
Q  203 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13578392 ctgactcagaattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttatcactttagtcc-tgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 13578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8048909 - 8048763
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||    
T  8048909 gagcaaatagtcactttaccctctgactctgcacctcgctgacacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaagtctccgactctgcacttccgt 8048810  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| || ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8048809 tatcactttaatctttaacgttaaataattctattaagtgatgatgt 8048763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 8374926 - 8375036
Alignment:
Q  164 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 263  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||     
T  8374926 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcagaattaaatacaaaaaagtttctgattttgcacttccgttatcactttagtct 8375025  T
Q  264 ttgccgttaaa 274  Q
    ||| |||||||    
T  8375026 ttgacgttaaa 8375036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 45583682 - 45583792
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  45583682 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagttcgctatcacataggtccctgactcagaattaaatacagataagttcctgattctgcacttccgt 45583781  T
Q  250 tatcactttag 260  Q
    |||||||||||    
T  45583782 tatcactttag 45583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45584566 - 45584475
Alignment:
Q  205 gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45584566 gactcaggattaaatacaaataagccaatgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45584475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19434058 - 19433913
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| |  |||  ||||||| |||    
T  19434058 agcaaattgtcactttagtccctaactctccatctcgttgtcacaaaggtctctgatttaggattaaatataaggaagtcaccgactccgcacttcagtt 19433959  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19433958 atcactttagtctatggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 19433913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Original strand, 12220011 - 12220166
Alignment:
Q  140 aaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaacttt 239  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| |    
T  12220011 aaacaaaaatgagcaaatgatcactttagtgtctagctatgcacctcgttgtcacaaagattcctgactcaagattaaatagaaagaagtctctgactct 12220110  T
Q  240 gcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12220111 gcacttctgatatcactttagt-cttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 12220166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 296
Target Start/End: Original strand, 44529076 - 44529172
Alignment:
Q  200 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  44529076 tccctgactcatgattaaatacaaataagtctccgactcaacacttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagcgatgatgt 44529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5930257 - 5930112
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||  || |  | | || |||||||||||    
T  5930257 gagcaaatggtcactttagtctcttactttgcacttcgctatcacaaaggtccctaactcaggattaaatacaagaaattttcga-ctgtgcacttccgt 5930159  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5930158 tatcactttagtccctgccattaaataattctgttaagtgatgatgt 5930112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44530687 - 44530595
Alignment:
Q  199 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  44530687 gtccccgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtcattggcgttaagttattctgttaagtgat 44530595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 32793231 - 32793315
Alignment:
Q  212 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||||||  | | | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32793231 gattaaatacaaataagtcattgattctgcatttcggttatcactttagtctttggcgttaaataattatgttaactgatgatgt 32793315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 385732 - 385662
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 224  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  385732 aaatggtcactttggtccttgactctgcatctcgttgtcacagaggtccctaactcatgattgaatacaaa 385662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 252
Target Start/End: Original strand, 34704911 - 34705009
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 252  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  34704911 aaatagtcactttagtctccgactctgcacctcgttgtcacaaaggcctctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactgtgtactttcgttat 34705009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2677877 - 2677768
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 283  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||  ||    
T  2677877 ctcgttgtcacaaaggtctatgactcatgattaaatacaaagtattccctaaatgtgcactttcgttatcagtttagtccctcgcgttaaaaactttagt 2677778  T
Q  284 taagtgatga 293  Q
    ||| ||||||    
T  2677777 taactgatga 2677768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Original strand, 10894391 - 10894449
Alignment:
Q  193 acatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 251  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10894391 acataggtccctgactcaagattaaatataaataagtctctaattctgcacttccgtta 10894449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 231
Target Start/End: Original strand, 21062819 - 21062896
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21062819 aaatggtcactttagtccctgactttgcacctcgctgtcataaaggtccttgactcaggattaaatacatagaagtcc 21062896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46287446 - 46287385
Alignment:
Q  233 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  46287446 taactctgcatttccgttatcactttagtctttggcgttaaaaaaatttgttaaatgatgat 46287385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7509562 - 7509450
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 283  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| |  | | |||||||||||||| ||||||  || || ||||||| |||| |||    
T  7509562 ctcgttgtcacaaaggtctttgattcatgattaaatataaagaagtctcagattctgcacttccgttattactttaacccctgacgttaaataattttgt 7509463  T
Q  284 taagtgatgatgt 296  Q
    |||||||| ||||    
T  7509462 taagtgattatgt 7509450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8879616 - 8879532
Alignment:
Q  202 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  8879616 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcatttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaa 8879532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 291
Target Start/End: Original strand, 24287567 - 24287619
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24287567 tgcacttaagttatcactttagtccttgacgttaaataattatgttaattgat 24287619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Original strand, 33060899 - 33060954
Alignment:
Q  241 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  33060899 cacttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaaatgatgatgt 33060954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 148
Target Start/End: Original strand, 33474296 - 33474334
Alignment:
Q  110 taaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaa 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33474296 taaccagtatcatcagggcaatggttaaggaaactaaaa 33474334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33607700 - 33607618
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaatta 280  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||    
T  33607700 ggtctctgattcaggattaaatacaaagaagtctctgattctgcacttccgttatcattttagaccctgacgttaaataatta 33607618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Original strand, 30917800 - 30917857
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30917800 tgcacttccattatcactttaatcctcgacgttaaataattatgctaactgatgatgt 30917857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 48572984 - 48573129
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  48572984 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagcctctgactctgcacttccgtt 48573083  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48573084 atcactttagtccttgacgttaaaaaaatttgttaagcgatgatgt 48573129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 296
Target Start/End: Original strand, 36278944 - 36279096
Alignment:
Q  144 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  36278944 taaatggagcaaatagtcactttagtccctgattatacagctcgttgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcac 36279043  T
Q  244 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36279044 ttccgttatcattttagtccctgacgttaaaaaattcttttaagtgatgatgt 36279096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 277
Target Start/End: Original strand, 17700516 - 17700643
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17700516 gagcaaatagtcactttagtctttgactctgcacctcgttgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 17700615  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaa 277  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17700616 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa 17700643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Original strand, 55388066 - 55388217
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  55388066 aaaatgagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttactgactctgcact 55388165  T
Q  245 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55388166 cccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 55388217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17702040 - 17701917
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17702040 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 17701941  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaa 277  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  17701940 actttagtccctgacgttaaaaaa 17701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 52316977 - 52317123
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  52316977 gagcaaataatcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttaactctgcacctccgt 52317076  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52317077 tatcattttagtccatgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52317123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 52318442 - 52318297
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |     
T  52318442 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacttcgctgtcacatagatccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttctga 52318343  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 295  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  52318342 tattactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatg 52318297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 19114531 - 19114643
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19114531 gagcaaatgatcactttagtccctgactctgcacttcgttgtcacagaggtccctgactcaagattaaatacaaagaagtcactaactttgcacttccgt 19114630  T
Q  250 tatcactttagtc 262  Q
    |||||||||||||    
T  19114631 tatcactttagtc 19114643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 296
Target Start/End: Original strand, 20464069 - 20464213
Alignment:
Q  152 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 251  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20464069 gcaaatggacactttagtccccgactctgcacctcgttgtcacaaaggtccctggctcatgattaaatacaaagaagtccctgactctgcacttctgtta 20464168  T
Q  252 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20464169 tcactttagtccacgacgttaaataactctgttaagtgatgatgt 20464213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33428560 - 33428421
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  33428560 gagcaaatggtcactttcgtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagtccttgactctgcatttccgt 33428461  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  33428460 tgtcactttagtcctcagcgttaaataattatgttaagtg 33428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47118176 - 47118037
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |||    
T  47118176 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcatataagtccccgactcaggattaaatgcaaagaagtctctgactctgcactttcgt 47118077  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  47118076 tatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagtg 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45601066 - 45600925
Alignment:
Q  147 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  45601066 aaggagcaaatcgtcactttagtccctgactctgtccctcgctgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaagaagt-cctgactctgcacttc 45600968  T
Q  247 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  45600967 cgttatcactttagtccacgacgttaaataattctgttaagtg 45600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2592132 - 2592019
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  2592132 gagcaaatagtcactttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactcaatacttccgt 2592033  T
Q  250 tatcactttagtcc 263  Q
    ||||||||||||||    
T  2592032 tatcactttagtcc 2592019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36280401 - 36280296
Alignment:
Q  191 tcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtga 290  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  36280401 tcacataggtctctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtga 36280302  T
Q  291 tgatgt 296  Q
    ||||||    
T  36280301 tgatgt 36280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Original strand, 2591625 - 2591769
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  2591625 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccat 2591724  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
     ||||||||||||| ||  |||||   ||| ||||||||||||||    
T  2591725 gatcactttagtccctgatgttaagttattctgttaagtgatgat 2591769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 53959186 - 53959079
Alignment:
Q  189 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 288  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  53959186 tgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagttcatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 53959087  T
Q  289 gatgatgt 296  Q
    ||||||||    
T  53959086 gatgatgt 53959079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 3671037 - 3671182
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||  | |||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  3671037 gagcatatagtcacttta-tccttgactttgcacctctctatcacaaaggtctctgactcagaattaaatacaaataagtctatgactctccacttccgt 3671135  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671136 tatcactttaatccctgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 3671182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 34263803 - 34263949
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  34263803 gagcaaatagtcactttggcccctgactctgcacctcgctgtcacagaggtccttgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccat 34263902  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34263903 tatcactttaatccctgacattaaaaaaatatgttaagggatgatgt 34263949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48574536 - 48574438
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  48574536 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcactttcgttatcactttagtccttgacgttaaaaaaatcttttaaatgatgatgt 48574438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 296
Target Start/End: Original strand, 50753820 - 50753961
Alignment:
Q  155 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 254  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||  || ||| | |||||| |||||||    
T  50753820 aatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctaattcaggattaaatataaacaagtttctgactctacacttctgttatca 50753919  T
Q  255 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50753920 ctttagtccctgccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 50753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Original strand, 48808362 - 48808505
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcacttta--gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 247  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| |||| ||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48808362 gagcaaataatcactttatagtccctgattctgcagctcgctgttagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctaactctgcacttcc 48808461  T
Q  248 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 291  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||    
T  48808462 gttgtcactttagtcccggatgttaaaaaaatatgttaagtgat 48808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 55389592 - 55389448
Alignment:
Q  152 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 251  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  55389592 gcaaatagtcactttggtccctaactctgcacctcgctgtcacataggtcattgactcaaaattaaatacaattaagtccctgactctacacttccgtta 55389493  T
Q  252 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||    ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  55389492 tcactttagtccccaacgttacaacaatatgttaagtgatgatgt 55389448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47075476 - 47075337
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||    
T  47075476 gagcaaatggtcactttaatccttgactctgcacctcgttgtcacataggtccgtcactcaagattaaatacaaagaaacccctgactctacacttccgt 47075377  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  47075376 tatcactttagtctctgacgttaaataattttgttaagtg 47075337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11773142 - 11773053
Alignment:
Q  184 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaa 273  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11773142 ctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccgttatcactttagtccctggcgttaa 11773053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19115271 - 19115133
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||    
T  19115271 gagcaaatagtcactttagttcgtgactctgcacctcgatgtcacataggtccttcactcaggattaaatacaaagaagt-catgactctgcacttccgt 19115173  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    | | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  19115172 ttttactttagtccctaacgttaaataattctgttaagtg 19115133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49261664 - 49261550
Alignment:
Q  145 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |   ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| |||| |    
T  49261664 aaaaagagcaaatagtcactttagtccataattccacacattgttgtcacataggtccctgactcaggattaaataca---aagtctctaactctgcatt 49261568  T
Q  245 tccgttatcactttagtc 262  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49261567 tccgttatcactttagtc 49261550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 53957673 - 53957817
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |    
T  53957673 gagcaaatagtcactttagtacttgattctgcaactcgctgttacataggttcctgactcagga-taaatacaaataagtctatgactctgcacttccct 53957771  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    || || |||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53957772 taacaattt-ttccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 53957817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 286
Target Start/End: Original strand, 40205934 - 40206016
Alignment:
Q  204 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40205934 tgactcacgattaaaaacaaagtagtctctgaatgtgcacttccgttatcagtttagtcattggcgttaaaaaattatgttaa 40206016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 19331117 - 19331183
Alignment:
Q  161 cactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataa 227  Q
    |||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19331117 cactttcgttcctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataa 19331183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40207009 - 40206919
Alignment:
Q  204 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt-ccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | | | |||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40207009 tgactcatgattaagtataaattagtccttgaatgtgcatttccgttatcagtttagtcccttaacgttaaaaaattatgttaactgatga 40206919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Original strand, 47427885 - 47427959
Alignment:
Q  177 tgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 251  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47427885 tgtgcacctcgctgtcacataggtccttgactcaaaattaaatacaaagaagtccctgactgtgcacttacgtta 47427959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48809690 - 48809634
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48809690 tgcacttccgttatcactttagtccatgacg-taaaaaaatctgttaagtgatgatgt 48809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26652725 - 26652583
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||  ||||| | | | || |  || ||||||    
T  26652725 aaatagtcacttgggtccctgactttgcatctcgctgtcactttagtccctgacttaggataaaatacaaaatagtccatgaatgtgtatctctgttatc 26652626  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgtc 297  Q
    | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  26652625 agtttagtccttactgtt-aaaaattctgttaatcgatgatgtc 26652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36827509 - 36827454
Alignment:
Q  241 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36827509 cacttccgttatcactttagtctctgatgttaaataattttgttaagtgatgatgt 36827454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 296
Target Start/End: Original strand, 612230 - 612358
Alignment:
Q  168 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 267  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  | |||  || |||  |||||||||||| |||||| | | | || ||||  |||||||||||||| | |      
T  612230 gtccctgactatgcacctcgttgttacaaagatcctcgattcaaaattaaatacaaagaagtccgtgaatgtgtacttatgttatcactttagttcctca 612329  T
Q  268 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  612330 cattaaataattatgttaagtgatgatgt 612358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53771174 - 53771035
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  53771174 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagcccctgactctgcacttccgt 53771075  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  53771074 tatcactttagtcattgacgttaaataattctgttaagtg 53771035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 42278047 - 42278193
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42278047 gagcaaatagtcactttagtccttgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcgggattaaatacaaataagttcctgactctgcacttccgt 42278146  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42278147 tatcactttaatccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 42278193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47878608 - 47878463
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  47878608 agcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgttacataggtccctgactctggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgtt 47878509  T
Q  251 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  47878508 atcactttagtccatgacgttaataaaatctgttaagcgatgatgt 47878463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 293
Target Start/End: Original strand, 47874566 - 47874704
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  47874566 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctatcacataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgttatc 47874665  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  47874666 actttagtcc-tgatgttaaaaaaatatgttaaatgatga 47874704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 31844720 - 31844865
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  31844720 gagcaaatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtccctaactctacacttccct 31844819  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||| |||  || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  31844820 tatcactttggtcactgtcgtttaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 31844865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26173062 - 26172931
Alignment:
Q  155 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 254  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||   ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26173062 aatagtcactttagtccccaactatgcaccttactgtcagaaaggtccttgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgttatca 26172963  T
Q  255 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26172962 ctttagtccatgccgttaaaaaattatgttaa 26172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48740145 - 48740006
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  48740145 gagcaaatggtcactttagtccatgtctctgcacctcattgtcacgtagatccctgactcataattaaatacaaagaagtccccaactctgcacttctgt 48740046  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  48740045 tatcactttagtccctgacgttaaataattctgttaagtg 48740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 26170638 - 26170784
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||  |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  26170638 gagcaaatagttagtttagtctctgactttgcacctcgttgttacaaaagtatctgacttaagattaaatacaaataagttccttactctgcacttccat 26170737  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26170738 tatcactttagtccatgctgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 26170784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 296
Target Start/End: Original strand, 39868914 - 39869064
Alignment:
Q  144 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 243  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |   ||| |||||    
T  39868914 taaaatgagtaaattgttactttagtctctgactctgcacctcgctgttacaaaggtccctgactcataattaaatacaaacaagttcg--actctgcac 39869011  T
Q  244 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39869012 ttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 39869064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 259
Target Start/End: Original strand, 54574423 - 54574532
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  54574423 gagcaaatagtcattttgcttcctcactctgcatctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcttaactctgcacttccgt 54574522  T
Q  250 tatcacttta 259  Q
    ||||||||||    
T  54574523 tatcacttta 54574532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4703342 - 4703196
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||  | ||| | |||||||||    
T  4703342 gagcaaattgtcactttagttactgactctacatctcgctgtcacataggtccctaactcagaattaaatacaaagaagtctttgactgtacacttccgt 4703243  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  || | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4703242 tatcactttagtctctggcattaaataattctattaagtgatgatgt 4703196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Original strand, 50694795 - 50694893
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50694795 ggtccctgactcaaaattaaatataaataagtttctgattctgcacttccgttatctctttagtccctgacgttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 50694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21623224 - 21623096
Alignment:
Q  168 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 267  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||  |     
T  21623224 gtccttgactctgcatctcgttgtcacaatgttccctgattcaggattaaatacaaaatagtccttgaatgtgcacttctgttatcactttagtccccga 21623125  T
Q  268 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21623124 cgttaaataattatgttaactaatgatgt 21623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Original strand, 53770330 - 53770470
Alignment:
Q  149 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 248  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||     
T  53770330 ggagtaaatggtcactttagtctctgactctgcacctcgcattcacataggttcctgactcagaattaaatacaaagaagtctatgactctgcacttcca 53770429  T
Q  249 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  53770430 ttatcactctagtctctgccgttaaataattctgttaagtg 53770470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 294
Target Start/End: Original strand, 4701817 - 4701907
Alignment:
Q  204 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 294  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4701817 tgacttatgattaaatacaaagaagtccccgactatgcacttccgctatcactttagtccctgatgttaaataattctgttaagtgatgat 4701907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Original strand, 21621869 - 21621967
Alignment:
Q  198 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21621869 ggtccctgactcaggattaaatacaaaatagtcattgaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgatgttaaataattatgttaactgatgatgt 21621967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31845080 - 31844934
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| || |     ||| | |||||||||    
T  31845080 gagcaaatactcactttagtttttgattttgcatcttgttgtcatataggtttctgactcaggattaaatacaaacaaattttagactctacacttccgt 31844981  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31844980 tatcattttcgtccttgcagttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31844934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42392003 - 42391868
Alignment:
Q  160 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcccta--actttgcacttccgttatcactt 257  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| |||||| ||    
T  42392003 tcactttagtctctgactccgcacctcactgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaattagtccctaataatgtgcacttcctttatcagtt 42391904  T
Q  258 tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    ||||||  | ||||||||| || | |||| ||||||    
T  42391903 tagtcccagacgttaaaaacttctattaactgatga 42391868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26685528 - 26685408
Alignment:
Q  164 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 263  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||     ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26685528 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctcact-----ttaaatacatagaagtccttgactatgcacttccgttatcactttagtct 26685434  T
Q  264 ttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
     || | ||||| |||| |||||||||    
T  26685433 ctgacattaaataattctgttaagtg 26685408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Original strand, 44158502 - 44158638
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||  ||    
T  44158502 gagcaaatggtcaatttagcccccgactctgcacctcgttgttacagaggttcctgactcaggattaaatacaaagaagtccctgactctatacttttgt 44158601  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  44158602 tattactttaatccctaacgttaaataattatgttaa 44158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19051356 - 19051253
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  19051356 gagcaaatggtcactttagtccctgactctacacctcgttggcacaaaggtcactgactcgagattaaatacaaagaagtctctgactctacactttcgt 19051257  T
Q  250 tatc 253  Q
    ||||    
T  19051256 tatc 19051253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 296
Target Start/End: Original strand, 19050297 - 19050382
Alignment:
Q  211 tgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19050297 tgattaaatacaaagaagtctcggactctgcacttccgttatcactttagtctccgacgttaaataattctattaagtgatgatgt 19050382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54574881 - 54574822
Alignment:
Q  199 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 258  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  54574881 gtccttgactcaggattaaatacaaataaatctctaactctgcacttctgttatcacttt 54574822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 32244361 - 32244415
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32244361 tgcacttccgttatcactttggtccataacgttaaataattatgttaagtgatga 32244415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24753597 - 24753540
Alignment:
Q  239 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24753597 tgcacttctgttatcactttagtcattcgcgttaaataattttgttaactgatgatgt 24753540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 296
Target Start/End: Original strand, 79073 - 79217
Alignment:
Q  152 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 251  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  79073 gcaaatagtcaatttagttcctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttgactcatgattaaataaaaagaagtccttgactttgcacctccgata 79172  T
Q  252 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79173 tcactttagtctttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 79217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 79808 - 79662
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||| |||  |    
T  79808 gagcaaatagtcactttaatccctgactcggcacctcgttgttacataagttcctgactcatgattaaatacaaagaagtctttgactctgcatttctat 79709  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  79708 tatcattttagtctttgacgttaaataattttattaagtgatgatgt 79662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 74433 - 74357
Alignment:
Q  155 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 231  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  74433 aatagtcagtttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctaactcatgattaaatacaaagaagtcc 74357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 263
Target Start/End: Original strand, 116054 - 116166
Alignment:
Q  151 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  116054 agcaaatagtcactttagttcctcattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactatgcacttccgtt 116153  T
Q  251 atcactttagtcc 263  Q
    |||||||||||||    
T  116154 atcactttagtcc 116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 30747997 - 30748143
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  30747997 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcacctcgctgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacactttcgt 30748096  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  30748097 tatcactttagtcgctgccgttaaaaaaaactattaagtgatgatgt 30748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Original strand, 31218953 - 31219092
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  31218953 gagcaaatggtcactttaatctctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactctgcacttccgt 31219052  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| |||| | |||||||    
T  31219053 tatcactttaatccctgatgttaaataattctcttaagtg 31219092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31219281 - 31219146
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||    
T  31219281 aaatggtcactttaatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtcattaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactcgacacttccgttatc 31219182  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 289  Q
    |||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  31219181 actttagtctctgacgttaaataattctcttaagtg 31219146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 23507947 - 23508092
Alignment:
Q  150 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | || |||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||| |    
T  23507947 gagcaaatagtcactttagtctctg-ctctacacctccctgtcacataggttcctgattcaggattaaatacaaacaaatctatgactttacacttcctt 23508045  T
Q  250 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  23508046 tatcactttagtccctgtcgttaaatttttttgttaagtgataatgt 23508092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12676591 - 12676459
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||    
T  12676591 aaatagtcactttgatatctgactctgcacctcgttgtcacaatggtctctgtctcaggattaaatacaaagtagtctctaaatgtgcacttttgttatc 12676492  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 286  Q
    | |||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  12676491 agtttagtctctggcattaaaaatttatgttaa 12676459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 24621104 - 24621218
Alignment:
Q  179 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 278  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |  || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |    
T  24621104 tgcatctcgttatcataaaggtccttgactcatgattaaatacaaagaaatctctaaatgcgcgcttccgttatcagtttagtcattgacattaaaaact 24621203  T
Q  279 tatgttaagtgatga 293  Q
    | | |||| ||||||    
T  24621204 tctattaactgatga 24621218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6468883 - 6468832
Alignment:
Q  173 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 224  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6468883 tgactctgcatatcgctgtcacaaaggtccctgactcatgattaaatacaaa 6468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 19645948 - 19645993
Alignment:
Q  104 tcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaag 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19645948 tcttgctaaccattgtcctcagggcaatggttaaggaaactaaaag 19645993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Original strand, 10855902 - 10855950
Alignment:
Q  248 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 296  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10855902 gttatcgctttagtccctgacgttaaataattatgttaagtgatcatgt 10855950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5742
Alignment:
Q  154 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 253  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  5601 aaattgtcactttagtcactcactttgcacctcgttgtgacaaatgtctctgactcagaattaaatacaaagaagtccctgactctacacttccgttatc 5700  T
Q  254 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 295  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5701 actttagtctctggcgttaaataattatgttatgtgatgatg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University