View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13061_low_68 (Length: 272)

Name: NF13061_low_68
Description: NF13061
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13061_low_68
NF13061_low_68
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (12-255)||(28781027-28781270)
chr6 (12-255)||(28786166-28786409)
chr6 (12-255)||(28792287-28792530)
chr6 (12-255)||(26802330-26802573)
chr6 (13-255)||(27611059-27611301)
chr6 (13-255)||(27718436-27718678)
chr6 (13-255)||(27698551-27698793)
chr6 (13-255)||(27724902-27725144)
chr6 (13-254)||(27678835-27679076)
chr6 (12-254)||(27593076-27593318)
chr6 (12-255)||(27604761-27605004)
chr6 (19-255)||(27531260-27531496)
chr6 (12-254)||(26646368-26646610)
chr6 (12-254)||(26752336-26752578)
chr6 (13-254)||(27338122-27338363)
chr6 (13-254)||(27398862-27399103)
chr6 (55-255)||(27229120-27229320)
chr6 (13-254)||(27677671-27677912)
chr6 (12-254)||(26655878-26656120)
chr6 (12-254)||(26761849-26762091)
chr6 (13-254)||(31284177-31284418)
chr6 (13-254)||(27706459-27706700)
chr6 (19-248)||(28234459-28234688)
chr6 (13-249)||(25579613-25579849)
chr6 (19-255)||(26884051-26884287)
chr6 (13-249)||(25481636-25481872)
chr6 (13-249)||(26055820-26056056)
chr6 (13-249)||(26075790-26076026)
chr6 (13-249)||(26142759-26142995)
chr6 (13-254)||(26622865-26623106)
chr6 (13-254)||(26728843-26729084)
chr6 (14-254)||(26823729-26823969)
chr6 (25-249)||(25538434-25538658)
chr6 (13-249)||(26048739-26048975)
chr6 (13-249)||(26069908-26070144)
chr6 (25-254)||(26861505-26861734)
chr6 (13-225)||(28181032-28181244)
chr6 (13-245)||(28242702-28242934)
chr6 (19-248)||(28185261-28185490)
chr6 (13-248)||(28325376-28325611)
chr6 (12-248)||(28226845-28227081)
chr6 (22-139)||(25506975-25507092)
chr6 (19-164)||(26937073-26937218)
chr6 (12-200)||(26848603-26848791)
chr6 (13-164)||(28149917-28150067)
chr6 (13-164)||(28297770-28297921)
chr6 (13-164)||(28514152-28514303)
chr6 (84-212)||(26635621-26635749)
chr6 (84-212)||(26741587-26741715)
chr6 (85-213)||(29825957-29826085)
chr6 (19-212)||(28139472-28139665)
chr6 (12-248)||(26341990-26342226)
chr6 (120-248)||(27214312-27214440)
chr6 (120-248)||(27234788-27234916)
chr6 (13-237)||(28098426-28098650)
chr6 (28-245)||(26893543-26893760)
chr6 (106-211)||(26959097-26959202)
chr6 (84-212)||(26974983-26975111)
chr6 (112-248)||(27665273-27665409)
chr6 (84-199)||(26811453-26811568)
chr6 (105-212)||(26949592-26949699)
chr6 (118-206)||(26617263-26617351)
chr6 (118-206)||(26723191-26723279)
chr6 (14-248)||(2184183-2184417)
chr6 (118-212)||(25071590-25071684)
chr6 (94-135)||(28481232-28481273)
chr6 (94-135)||(29793656-29793697)
chr6 (169-248)||(27427816-27427895)
chr6 (94-143)||(29733186-29733235)
chr6 (94-242)||(29697465-29697613)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (12-255)||(13688-13931)
scaffold0277 (13-255)||(4728-4970)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (12-255)||(7413-7656)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (40-255)||(1-216)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (13-255)||(3478-3721)
scaffold0349 (13-255)||(14413-14654)
scaffold0349 (217-255)||(8062-8100)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (13-255)||(18699444-18699686)
chr4 (13-255)||(18679611-18679853)
chr4 (19-255)||(18724135-18724371)
chr4 (19-255)||(18731554-18731790)
chr4 (25-255)||(18655533-18655763)
chr4 (84-239)||(5091082-5091237)
chr4 (169-248)||(17989250-17989329)
chr4 (169-248)||(18073660-18073739)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (13-248)||(34620-34855)
scaffold0038 (13-245)||(42864-43096)
scaffold0038 (13-248)||(116691-116926)
scaffold0038 (12-248)||(27343-27579)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (13-199)||(268401-268587)
chr1 (13-254)||(28164406-28164647)
chr1 (13-254)||(28127723-28127965)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (13-199)||(29273827-29274013)
chr8 (84-248)||(31903746-31903910)
chr8 (28-143)||(16373134-16373249)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (13-225)||(58339-58551)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (12-239)||(3279592-3279819)
chr2 (94-248)||(17993822-17993976)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (55-162)||(16688992-16689099)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (169-248)||(59468-59547)
[»] scaffold0781 (1 HSPs)
scaffold0781 (196-248)||(91-143)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28781270 - 28781027
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  28781270 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgagg 28781171  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28781170 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaac 28781071  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781070 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 28781027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28786409 - 28786166
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  28786409 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgagg 28786310  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786309 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 28786210  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786209 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 28786166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28792530 - 28792287
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  28792530 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgagg 28792431  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792430 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 28792331  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792330 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 28792287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26802573 - 26802330
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||      
T  26802573 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatg 26802474  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26802473 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaac 26802374  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802373 cgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 26802330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 27611059 - 27611301
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  27611059 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27611158  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611159 gtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 27611258  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611259 gtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 27611301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 27718436 - 27718678
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  27718436 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27718535  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27718536 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaact 27718635  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718636 gtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 27718678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 27698551 - 27698793
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  27698551 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27698650  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698651 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 27698750  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27698751 gtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaa 27698793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 27724902 - 27725144
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  27724902 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27725001  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725002 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 27725101  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27725102 gtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 27725144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27679076 - 27678835
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679076 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 27678977  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27678976 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaacc 27678877  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||    
T  27678876 gtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggta 27678835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 27593076 - 27593318
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593076 atgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 27593175  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27593176 agtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaac 27593275  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||    
T  27593276 cgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggta 27593318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 27604761 - 27605004
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  27604761 atgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgaga 27604860  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27604861 agtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaac 27604960  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27604961 cgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 27605004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 27531260 - 27531496
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    |||||||    
T  27531260 atgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatg 27531359  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27531360 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 27531459  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531460 agtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 27531496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26646610 - 26646368
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  26646610 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatg 26646511  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26646510 agtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaac 26646411  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26646410 cgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26646368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26752578 - 26752336
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  26752578 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatg 26752479  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26752478 agtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaac 26752379  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26752378 cgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26752336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 27338122 - 27338363
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27338122 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27338221  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27338222 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaacc 27338321  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27338322 gtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggta 27338363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 27398862 - 27399103
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27398862 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27398961  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27398962 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaacc 27399061  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27399062 gtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggta 27399103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27229320 - 27229120
Alignment:
Q  55 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 154  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27229320 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcctctttgaagatcattgtcat 27229221  T
Q  155 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27229220 caatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggta 27229121  T
Q  255 a 255  Q
    |    
T  27229120 a 27229120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 27677671 - 27677912
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677671 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 27677770  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27677771 gtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaacc 27677870  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||    
T  27677871 gtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggta 27677912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26656120 - 26655878
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |      
T  26656120 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacg 26656021  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26656020 agtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaac 26655921  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26655920 cgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26655878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26762091 - 26761849
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |      
T  26762091 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacg 26761992  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26761991 agtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaac 26761892  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761891 cgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26761849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31284418 - 31284177
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  31284418 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcga 31284319  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31284318 gtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaacc 31284219  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    ||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31284218 ataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggta 31284177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 27706459 - 27706700
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706459 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 27706558  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||    
T  27706559 gtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaacc 27706658  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  |||||||||   || || ||||||||||| ||||||||    
T  27706659 gtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggta 27706700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234459
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25579849 - 25579613
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25579849 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 25579750  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  25579749 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagt 25579650  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579649 gttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26884287 - 26884051
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  26884287 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 26884188  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||    
T  26884187 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 26884088  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||    
T  26884087 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaa 26884051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25481872 - 25481636
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25481872 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 25481773  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  25481772 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaatt 25481673  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481672 gttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26056056 - 26055820
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  26056056 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaa 26055957  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  26055956 gtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaatt 26055857  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055856 gttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26076026 - 26075790
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  26076026 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaa 26075927  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  26075926 gtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaatt 26075827  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075826 gttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26142995 - 26142759
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26142995 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 26142896  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||       
T  26142895 gtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaattt 26142796  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142795 gttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26623106 - 26622865
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||    
T  26623106 tgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaa 26623007  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26623006 gtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaacc 26622907  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26622906 gtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26622865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26729084 - 26728843
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||    
T  26729084 tgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaa 26728985  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26728984 gtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaacc 26728885  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26728884 gtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26728843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26823969 - 26823729
Alignment:
Q  14 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaag 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||    
T  26823969 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgag 26823870  T
Q  114 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacca 213  Q
    |||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  26823869 tgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattca 26823770  T
Q  214 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26823769 taccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggta 26823729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25538658 - 25538434
Alignment:
Q  25 acaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtga 124  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25538658 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtga 25538559  T
Q  125 tttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtc 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    | |||||||||    
T  25538558 tttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtc 25538459  T
Q  225 agtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  25538458 actgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26048975 - 26048739
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  26048975 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaa 26048876  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||      
T  26048875 gtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaatt 26048776  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048775 gttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26070144 - 26069908
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  26070144 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaa 26070045  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||      
T  26070044 gtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaatt 26069945  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 249  Q
     | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069944 gttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26861734 - 26861505
Alignment:
Q  25 acaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtga 124  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||  | |||    
T  26861734 acaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttga 26861635  T
Q  125 tttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtc 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  26861634 tttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtc 26861535  T
Q  225 agtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | | || || ||||||||||| || |||||    
T  26861534 acttcctctgaaactgaggaatacctggta 26861505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28181244 - 28181032
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28181244 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 28181145  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  28181144 gtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacc 28181045  T
Q  213 atggcgagtgtca 225  Q
    ||  |||||||||    
T  28181044 ataacgagtgtca 28181032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28242934 - 28242702
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28242934 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 28242835  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    |||||||| | |  |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  28242834 gtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaacc 28242735  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 245  Q
    ||  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242734 ataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28185490 - 28185261
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28185490 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28185391  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||| ||||||| ||  ||    
T  28185390 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacg 28185291  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||    
T  28185290 agtgtcactacctctaaagctaaggaacac 28185261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28325611 - 28325376
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||  ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28325611 tgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 28325512  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||    |||| |||   |  |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  28325511 gtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaacc 28325412  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28325411 ataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28325376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28227081 - 28226845
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  28227081 atgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaa 28226982  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || |  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  28226981 agtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaac 28226882  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28226881 cataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507092
Alignment:
Q  22 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 121  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||||||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtg 25507074  T
Q  122 tgatttcatctcctcttt 139  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25507075 tgatttcatctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26937218 - 26937073
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  26937218 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatg 26937119  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 164  Q
    |||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937118 gtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26848791 - 26848603
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| || |||||||||  ||||||     
T  26848791 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgagg 26848692  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 200  Q
    || || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  26848691 agcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28150067 - 28149917
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28150067 tgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttgag-a 28149969  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 164  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  28149968 gtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggt 28149917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 28297770 - 28297921
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  28297770 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaa 28297869  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 164  Q
    |||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28297870 gtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28514303 - 28514152
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  28514303 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaa 28514204  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 164  Q
    |||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28514203 gtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28514152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26635749 - 26635621
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  26635749 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26635650  T
Q  184 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26635649 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26635621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26741715 - 26741587
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  26741715 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26741616  T
Q  184 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26741615 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26741587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29826085 - 29825957
Alignment:
Q  85 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaa 184  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    |||  ||||||||| |    
T  29826085 atcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagtta 29825986  T
Q  185 gagccttgtagagatttccggtaaaacca 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29825985 gagctttgtagagattgccggtaaaacca 29825957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28139665 - 28139472
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| |    
T  28139665 atgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacg 28139566  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||| || || | ||||||   ||||  |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  28139565 gtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaacc 28139472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 26341990 - 26342226
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  26341990 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgaca 26342089  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   ||||   |||||  | |||| ||| || |||||||    
T  26342090 agtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctatagatattgccagtaaaac 26342189  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26342190 catagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacac 26342226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214312
Alignment:
Q  120 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcga 219  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27214341  T
Q  220 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214340 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234916
Alignment:
Q  120 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcga 219  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  220 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234888 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 28098426 - 28098650
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    ||||  ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  28098426 tgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaa 28098525  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    | ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||   || |||   ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28098526 gggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaacc 28098625  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaa 237  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||    
T  28098626 ataccgagtgtcggtgcccctaaaa 28098650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893760
Alignment:
Q  28 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 127  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||| |  || |||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  128 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagt 227  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| |  |||||  | |||  |||||| || || ||||  || |||||||||   ||||||||||     
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaaaacgagtgtcaga 26893742  T
Q  228 gcccctaaaactgaggaa 245  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26893743 gcctctaaaattgaggaa 26893760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26959202 - 26959097
Alignment:
Q  106 ttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 205  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||    
T  26959202 ttgagaagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccgg 26959103  T
Q  206 taaaac 211  Q
    | ||||    
T  26959102 tgaaac 26959097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26975111 - 26974983
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |    
T  26975111 aatcctcgagtcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaa 26975012  T
Q  184 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26975011 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26974983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Original strand, 27665273 - 27665409
Alignment:
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27665273 agtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaac 27665372  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||   |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27665373 caaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27665409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  184 agagccttgtagagat 199  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26949699 - 26949592
Alignment:
Q  105 cttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccg 204  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||    
T  26949699 cttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccg 26949600  T
Q  205 gtaaaacc 212  Q
    || |||||    
T  26949599 gtgaaacc 26949592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617263
Alignment:
Q  118 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || ||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26617263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723191
Alignment:
Q  118 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || ||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184183
Alignment:
Q  14 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaag 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||  | || || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || | |||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataag 2184318  T
Q  114 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacca 213  Q
    ||||| ||| |||||| | |||| |||||| || | ||||||  |||| || | || |||  | | |   ||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  2184317 tgatgctgttatttcaccccctcgttgaagctcctcgtcatccttgaaagtgtggactccacttttacatagagcatcgtaaagattgccggtaaaacca 2184218  T
Q  214 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  2184217 tggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacac 2184183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25071684 - 25071590
Alignment:
Q  118 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||    
T  25071684 ggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaacc 25071590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 135
Target Start/End: Original strand, 28481232 - 28481273
Alignment:
Q  94 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 135  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481232 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 28481273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 135
Target Start/End: Original strand, 29793656 - 29793697
Alignment:
Q  94 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 135  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29793656 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 29793697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 27427816 - 27427895
Alignment:
Q  169 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  27427816 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 27427895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 143
Target Start/End: Original strand, 29733186 - 29733235
Alignment:
Q  94 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 143  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29733186 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaag 29733235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 29697465 - 29697613
Alignment:
Q  94 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 193  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||| |||| ||||| |||   | ||| ||||||  |||||| || |    
T  29697465 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcttcgccttttttaagctccttggcatccatgaaagttcgaactcctttgtcatcaagagctttct 29697564  T
Q  194 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgag 242  Q
     |||||  ||||| |||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||    
T  29697565 tgagataaccggtgaaaccatgacgagtatcctcgcctctaaaactgag 29697613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 13688 - 13931
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  13688 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgagg 13787  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13788 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaac 13887  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13888 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4970
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  4728 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcgga 4827  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4828 gggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 4927  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4928 gtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7656 - 7413
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  7656 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgagg 7557  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7556 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaac 7457  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7456 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Original strand, 1 - 216
Alignment:
Q  40 caaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 caaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 100  T
Q  140 gaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaact 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  101 gaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 200  T
Q  240 gaggaacacttggtaa 255  Q
     |||||||||||||||    
T  201 aaggaacacttggtaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 3478 - 3721
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  3478 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagg 3577  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3578 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 3677  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3678 cgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaa 3721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 14413 - 14654
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  14413 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaa-ggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 14511  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14512 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 14611  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14612 gtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaa 14654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8100
Alignment:
Q  217 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 18699444 - 18699686
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |    
T  18699444 tgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcga 18699543  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  18699544 gtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaacc 18699643  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18699644 gtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaa 18699686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 18679611 - 18679853
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |    
T  18679611 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcga 18679710  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18679711 gtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaacc 18679810  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
     |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18679811 gttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaa 18679853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 18724135 - 18724371
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  18724135 atgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18724234  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
    || |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  ||    
T  18724235 gtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacg 18724334  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18724335 agtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaa 18724371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 18731554 - 18731790
Alignment:
Q  19 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  18731554 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18731653  T
Q  119 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 218  Q
    || |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||||| |  ||    
T  18731654 gtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacg 18731753  T
Q  219 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18731754 agtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaa 18731790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Original strand, 18655533 - 18655763
Alignment:
Q  25 acaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtga 124  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   ||||||||| |||    
T  18655533 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttga 18655632  T
Q  125 tttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtc 224  Q
    ||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |  ||||||||    
T  18655633 tttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtc 18655732  T
Q  225 agtgcccctaaaactgaggaacacttggtaa 255  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18655733 actgcccctgaagctgaggaacacttggtaa 18655763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 5091082 - 5091237
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||       
T  5091082 aatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgt 5091181  T
Q  184 agagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaact 239  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||    
T  5091182 agagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 17989250 - 17989329
Alignment:
Q  169 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  17989250 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 17989329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18073739 - 18073660
Alignment:
Q  169 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18073739 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 18073660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34855 - 34620
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34855 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 34756  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  34755 gtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaacc 34656  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    || |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  34655 atagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43096 - 42864
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43096 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 42997  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    |||||||| | |  |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  42996 gtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaacc 42897  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 245  Q
    ||  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42896 ataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 116926 - 116691
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||  ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  116926 tgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaa 116827  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||    |||| |||   |  |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  116826 gtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaacc 116727  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  116726 ataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27579 - 27343
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  27579 atgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaa 27480  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || |  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  27479 agtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaac 27380  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27379 cataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 268401 - 268587
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  268401 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcga 268500  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 199  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268501 gtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 268587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 28164406 - 28164647
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  |    
T  28164406 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatga 28164505  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |  |||||||||||   ||| ||||| |||||||  || || |||||    
T  28164506 atgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaacc 28164605  T
Q  213 atggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164606 gtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggta 28164647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 28127723 - 28127965
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||    
T  28127723 tgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaa 28127822  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || | |||||||||||||  ||| |||||||||||||  || || ||||    
T  28127823 gtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaac 28127922  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 254  Q
    | |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  28127923 cgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggta 28127965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 29273827 - 29274013
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   |    
T  29273827 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcga 29273926  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 199  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29273927 gtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagat 29274013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903746
Alignment:
Q  84 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| | ||||||||| |||  |    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataa 31903811  T
Q  184 agagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||||||    
T  31903810 agagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacac 31903746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Original strand, 16373134 - 16373249
Alignment:
Q  28 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 127  Q
    ||||| |||||||||||  | |||| |||||||||  ||||||| | |   ||| |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  16373134 agttcatccaagcaaaagctagaagaggcatagttcgtagaaaatataattatacaaatcctagactcttcgattgccttaaaaagcgatggagtgatct 16373233  T
Q  128 catctcctctttgaag 143  Q
    |||||||| |||||||    
T  16373234 catctcctatttgaag 16373249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 58339 - 58551
Alignment:
Q  13 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  58339 tgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaa 58438  T
Q  113 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 212  Q
    |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  58439 gtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaacc 58538  T
Q  213 atggcgagtgtca 225  Q
    || ||||||||||    
T  58539 atagcgagtgtca 58551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3279819 - 3279592
Alignment:
Q  12 atgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgaga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||| |    
T  3279819 atgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggccttgaca 3279720  T
Q  112 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 211  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | ||||||||||| |||||||    
T  3279719 agtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagtaaaac 3279620  T
Q  212 catggcgagtgtcagtgcccctaaaact 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3279619 catagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 17993822 - 17993976
Alignment:
Q  94 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 193  Q
    |||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||| || |    
T  17993822 tcttcaatgctcttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttat 17993921  T
Q  194 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  17993922 agagattaccggtgaaaccatatcgagtatcggtacccctgaaactaatgaacac 17993976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16689099 - 16688992
Alignment:
Q  55 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 154  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||    
T  16689099 gcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcat 16689000  T
Q  155 caatgaag 162  Q
    ||||||||    
T  16688999 caatgaag 16688992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 59547 - 59468
Alignment:
Q  169 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  59547 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 59468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0781 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0781
Description:

Target: scaffold0781; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Original strand, 91 - 143
Alignment:
Q  196 agatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  91 agattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University