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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13069_high_2 (Length: 561)
Name: NF13069_high_2
Description: NF13069
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13069_high_2 |
 |  |
|
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
|
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 |  |  |
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| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (3 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0342 (3 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0260 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 35054679 - 35055213
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054679 |
aatatctcaatccaacaattgagtaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcat |
35054778 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35054779 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcac |
35054878 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054879 |
caattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat |
35054978 |
T |
 |
| Q |
313 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
35054979 |
gtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtg |
35055078 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35055079 |
attatgatgaattttaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcat |
35055178 |
T |
 |
| Q |
509 |
gtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35055179 |
gtcctcttctctctacccttttcttctcttgctcc |
35055213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 100 - 541
Target Start/End: Original strand, 49967660 - 49968105
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49967660 |
atgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaaca |
49967759 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
49967760 |
atgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
49967859 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49967860 |
tacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaa |
49967959 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc |
496 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
49967960 |
attacaataagtgattacgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctaccttagacttcaattttgcttctagctcttctcccaactc |
49968059 |
T |
 |
| Q |
497 |
ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct |
541 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
49968060 |
ttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttctttcctcttgct |
49968105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22403351 - 22402900
Alignment:
| Q |
95 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
194 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
22403351 |
aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
22403253 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
22403252 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcat |
22403155 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22403154 |
aacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata |
22403055 |
T |
 |
| Q |
393 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct |
488 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22403054 |
attgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaccttaggctttaattttgctcctaactcttct |
22402955 |
T |
 |
| Q |
489 |
cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22402954 |
tccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttatcctcttgctcc |
22402900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27330077 - 27329555
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27330077 |
aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttg---acaacaaattatgaatcatgca |
27329981 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27329980 |
tacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattca |
27329881 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccattttt--catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| |||||||||| |||| | || || |||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27329880 |
ccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaa |
27329784 |
T |
 |
| Q |
310 |
catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat |
407 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27329783 |
catgtcatcataattggagcacgaattct----------aacaattaatcaatt-acacaattaaacacttattcatac-cataattgaaaaattgcaat |
27329696 |
T |
 |
| Q |
408 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc |
503 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
27329695 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagattgggcttcaattttactcctagctcttctctcaatcattgattc |
27329596 |
T |
 |
| Q |
504 |
ttcaagtcctcttttctcta-cccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27329595 |
ttcaagtcctcttctctctagctctttcctcctcttgctcc |
27329555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 150 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9783863
Alignment:
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |||| |
|
|
| T |
9784248 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt---caacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat |
9784152 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
9784151 |
actttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatga |
9784052 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt---- |
445 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
9784051 |
acaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagag |
9783952 |
T |
 |
| Q |
446 |
tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9783951 |
taatcc--ctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcacccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct |
9783863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 21718238 - 21718684
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21718238 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaaca |
21718337 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
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| T |
21718338 |
tagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
21718437 |
T |
 |
| Q |
300 |
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398 |
Q |
| |
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| T |
21718438 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaa |
21718536 |
T |
 |
| Q |
399 |
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494 |
Q |
| |
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| T |
21718537 |
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21718633 |
T |
 |
| Q |
495 |
ccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |
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| T |
21718634 |
cattgattcttcaagttcctcttctctttaaccctttcttcctcttgctcc |
21718684 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 41212033 - 41212415
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150 |
Q |
| |
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|||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |
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| T |
41212033 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac |
41212132 |
T |
 |
| Q |
151 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
250 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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| T |
41212133 |
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41212231 |
T |
 |
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
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| T |
41212232 |
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41212331 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
435 |
Q |
| |
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|
| T |
41212332 |
caattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
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Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522142
Alignment:
| Q |
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356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
357 |
atcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc |
451 |
Q |
| |
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| T |
35522332 |
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35522234 |
T |
 |
| Q |
452 |
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543 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
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| T |
35522233 |
ccttagcttaggcttcaattttgctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc |
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T |
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Target: chr1; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 51627947 - 51627557
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153 |
Q |
| |
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| T |
51627947 |
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51627848 |
T |
 |
| Q |
154 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
51627847 |
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51627750 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
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| T |
51627749 |
tttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaac |
51627650 |
T |
 |
| Q |
352 |
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443 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | ||||||||||||| |||| | || |||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51627649 |
aaataatcaattact-caattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
51627557 |
T |
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Target: chr1; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 21859934 - 21860145
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112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21859934 |
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21860033 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
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| T |
21860034 |
acccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
21860133 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
21860134 |
caattgagcata |
21860145 |
T |
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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
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Target Start/End: Original strand, 20177141 - 20177464
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| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20177141 |
tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
20177240 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt |
254 |
Q |
| |
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| T |
20177241 |
caacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatacttt |
20177339 |
T |
 |
| Q |
255 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
354 |
Q |
| |
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| T |
20177340 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
20177439 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
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|||||||||| | ||||||||||||| |
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| T |
20177440 |
taatcaattact-caattaagcactt |
20177464 |
T |
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Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 20346342 - 20346480
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504 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20346342 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattct |
20346441 |
T |
 |
| Q |
505 |
tcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20346442 |
tcaagtcctcttctctatacccttttctcctcttactcc |
20346480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35522601 - 35522432
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| Q |
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attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
35522601 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaac |
35522503 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522502 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 443
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646267
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| Q |
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caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| || ||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
16645975 |
caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataatt-caacatatatcactttctcatac |
16646073 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||| ||||| ||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |
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|
| T |
16646074 |
tttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
16646173 |
T |
 |
| Q |
352 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16646174 |
aattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
16646267 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Original strand, 16656699 - 16656993
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| Q |
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aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16656699 |
aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat |
16656797 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | || || |||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |
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|
| T |
16656798 |
actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
16656897 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16656898 |
acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
16656993 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| || |
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|
| T |
22366979 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaa |
22367078 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367079 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 50 - 224
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| || |
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|
| T |
15861719 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaatatgactaaa |
15861620 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861619 |
ca--aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 443
Target Start/End: Original strand, 19603303 - 19603450
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ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
19603303 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aataat |
19603400 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19603401 |
tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattctagcccccttaccttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 62 - 433
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||| || ||||||||| |
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| T |
22143636 |
caaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacat |
22143537 |
T |
 |
| Q |
162 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat |
260 |
Q |
| |
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| T |
22143536 |
caattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacatttatacatactttgaacat |
22143438 |
T |
 |
| Q |
261 |
gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
| |
|
| || | || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22143437 |
gcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatca |
22143338 |
T |
 |
| Q |
361 |
attaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccc |
433 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22143337 |
ttta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc |
22143264 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
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63 |
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162 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | | |||||| | | ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
44035252 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaac |
44035154 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035153 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
44035092 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 22829466 - 22829325
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| Q |
296 |
ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| |
|
|
| T |
22829466 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aat |
22829369 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22829368 |
tgaaaaattgcactaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
22829325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13377121 - 13376966
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| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
13377121 |
tttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaa |
13377022 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| | | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377021 |
caacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattca |
13376966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 9784343 - 9784237
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94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
9784343 |
caaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaaca |
9784244 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
9784243 |
acaacat |
9784237 |
T |
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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
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Target Start/End: Original strand, 17608951 - 17609282
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113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17608951 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa |
17609050 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| || || ||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
17609051 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaata |
17609149 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
17609150 |
tatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatcaactaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
17609247 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17609248 |
atgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
17609282 |
T |
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296 |
ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||| |
|
|
| T |
20955480 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaat |
20955383 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20955382 |
tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattataacccccttaccttag |
20955333 |
T |
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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37234084 - 37233754
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37234084 |
acccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaa |
37233985 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
37233984 |
catttagagcata-attcaacatatatcactttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
37233886 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| |||||||| || |||||||||| || || ||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| | | || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
37233885 |
tatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaacaattactcacttact-caattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaa |
37233788 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37233787 |
atgattatgattgaattctaacccccttacctta |
37233754 |
T |
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Target: chr1; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 21194974 - 21195303
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||| |
|
|
| T |
21194974 |
acccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
21195073 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | ||||||| || || |||||| ||||| ||||||| || || | ||||| ||| || |
|
|
| T |
21195074 |
caacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcaca |
21195172 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
21195173 |
tactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatg |
21195272 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21195273 |
aacaattaatcactt-attcaattaagcactt |
21195303 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 13376951 - 13376752
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ttcatactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcat |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |
|
|
| T |
13376951 |
ttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcat |
13376853 |
T |
 |
| Q |
344 |
ttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatc |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13376852 |
ctatgaacaattaatcaattact-aaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacc |
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T |
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Target: chr1; HSP #29
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catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
36356315 |
catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaa |
36356218 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36356217 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
36356191 |
T |
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Target: chr1; HSP #30
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145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
5768361 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #31
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aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
175 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
27674801 |
aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaa |
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T |
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Q |
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|
||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
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41212420 |
cccaatccttgattcttcaaatcctcttctctctaacccttatctcctcttgctcc |
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T |
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acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
175 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
36356537 |
acaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaa |
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T |
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catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
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catcataattggagcacgaattctaacagtcatgaacaaataatcaattact-caattaagcactt |
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T |
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atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
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atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa |
20445796 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20445797 |
attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
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atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
20531462 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa |
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T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20531562 |
attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt |
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Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
22829691 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcacttaacaacaattacatcaatggaa |
22829592 |
T |
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catgaaact |
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Q |
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|
|
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22829591 |
catgaaact |
22829583 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 17100574 - 17101109
Alignment:
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Q |
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T |
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atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
210 |
Q |
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17100674 |
atacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc |
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T |
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accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
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| T |
17100774 |
accaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
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T |
 |
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311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
410 |
Q |
| |
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| T |
17100874 |
atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataag |
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T |
 |
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tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
17100973 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
17101072 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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| T |
17101073 |
aagtcctcttctctctatccttctctactcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 17101259 - 17101794
Alignment:
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110 |
Q |
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T |
 |
| Q |
111 |
atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
210 |
Q |
| |
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| T |
17101359 |
atacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc |
17101458 |
T |
 |
| Q |
211 |
accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17101459 |
accaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
17101558 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
410 |
Q |
| |
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| T |
17101559 |
atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataag |
17101657 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17101658 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
17101757 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |
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|
| T |
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aagtcctcttctctctatccttctctactcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 54423954 - 54424469
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
131 |
catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca |
230 |
Q |
| |
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|||| | ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
54424053 |
catccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca |
54424152 |
T |
 |
| Q |
231 |
acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagca |
330 |
Q |
| |
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|
|
| T |
54424153 |
acatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagca |
54424252 |
T |
 |
| Q |
331 |
cgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaac |
430 |
Q |
| |
|
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|
| T |
54424253 |
cgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaac |
54424352 |
T |
 |
| Q |
431 |
ccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctaccc |
526 |
Q |
| |
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|
| T |
54424353 |
ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgcgcctagctcttctcccaatccttgattctttaagtcctcttctctgtaccc |
54424452 |
T |
 |
| Q |
527 |
ttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424453 |
ttttctcctcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50112288 - 50111841
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
50112188 |
atgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttca |
50112089 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
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| T |
50112088 |
tacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
50111989 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc |
495 |
Q |
| |
|
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|
| T |
50111988 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcttcaca--c |
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T |
 |
| Q |
496 |
cttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
50111890 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 116 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 317729 - 317301
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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317729 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa |
317630 |
T |
 |
| Q |
216 |
ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgcc |
315 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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tttagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtc |
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T |
 |
| Q |
316 |
atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatt |
415 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
317530 |
atcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatt |
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T |
 |
| Q |
416 |
atgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcc |
512 |
Q |
| |
|
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|
| T |
317431 |
atgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcc |
317332 |
T |
 |
| Q |
513 |
tcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|| | |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
317331 |
tcatctctctacccttttctcctcttgctcc |
317301 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16996343 - 16995852
Alignment:
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16996343 |
ccattttcatcaaaacaccaaca-caactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
16996245 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
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|
| T |
16996244 |
acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatac |
16996146 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
|
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| T |
16996145 |
tttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaat |
16996046 |
T |
 |
| Q |
352 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttac |
448 |
Q |
| |
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| T |
16996045 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagcttaa |
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T |
 |
| Q |
449 |
tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16995946 |
tctacctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
16995852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144063
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |
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| T |
22144553 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaa |
22144454 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt |
253 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |
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|
| T |
22144453 |
caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactt |
22144355 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
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| T |
22144354 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacag |
22144256 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc |
450 |
Q |
| |
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| T |
22144255 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatc |
22144156 |
T |
 |
| Q |
451 |
cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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| T |
22144155 |
tctctagcttaggcttcaatttttcttctatctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcctctctctacccttttttcctcttgctcc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6154572 - 6154121
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194 |
Q |
| |
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6154572 |
aaattatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
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T |
 |
| Q |
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caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata--ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
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| |
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| T |
6154473 |
taacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-cataaactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaactattcat |
6154376 |
T |
 |
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293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
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| T |
6154375 |
aatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaata |
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T |
 |
| Q |
393 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct |
488 |
Q |
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| T |
6154275 |
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6154176 |
T |
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| Q |
489 |
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543 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |
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| T |
6154175 |
cccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttcttctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14304013 - 14304504
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14304013 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat |
14304111 |
T |
 |
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154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
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14304112 |
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T |
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| Q |
254 |
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353 |
Q |
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| T |
14304212 |
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14304311 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac |
448 |
Q |
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| T |
14304312 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaa |
14304410 |
T |
 |
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449 |
tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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14304411 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 167 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439132
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gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
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T |
 |
| Q |
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365 |
Q |
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| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
34439314 |
T |
 |
| Q |
366 |
tccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttag |
462 |
Q |
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| T |
34439313 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttaccttagtaggttaatctctctagcatag |
34439214 |
T |
 |
| Q |
463 |
gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
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34439213 |
gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcttctctctaatccttttctcctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 35123661 - 35124152
Alignment:
| Q |
54 |
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153 |
Q |
| |
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| T |
35123661 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
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T |
 |
| Q |
154 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
35123760 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccc--ttttcatacac |
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T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
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| T |
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tttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaaca |
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T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta |
447 |
Q |
| |
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| T |
35123958 |
attaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccctttaccttagttagatta |
35124056 |
T |
 |
| Q |
448 |
ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
35124057 |
atctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctctcaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 50 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12349830 - 12349388
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| |
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|
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12349830 |
acccattttcac-aaaccaaaaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatga |
12349732 |
T |
 |
| Q |
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cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattt |
244 |
Q |
| |
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| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |
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| T |
12349731 |
catatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaactt |
12349632 |
T |
 |
| Q |
245 |
ttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatt |
344 |
Q |
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| T |
12349631 |
ctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatt |
12349532 |
T |
 |
| Q |
345 |
tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----t |
440 |
Q |
| |
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|
| T |
12349531 |
tatggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
12349432 |
T |
 |
| Q |
441 |
taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc |
484 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
12349431 |
taggttaatctctctagcttaagcttcaatattgctcctagctc |
12349388 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14295402 - 14295894
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153 |
Q |
| |
|
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|
|
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14295501 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
251 |
Q |
| |
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| T |
14295502 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatac |
14295600 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14295601 |
tttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
14295700 |
T |
 |
| Q |
352 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt |
446 |
Q |
| |
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|
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| T |
14295701 |
aattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt |
14295798 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14295799 |
aatctccctagattagggttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 485
Target Start/End: Original strand, 14298386 - 14298820
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || || |
|
|
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attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat |
14298484 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
| |
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|
| T |
14298485 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactt |
14298584 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
14298585 |
tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
14298684 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
14298685 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaa |
14298783 |
T |
 |
| Q |
449 |
tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct |
485 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14298784 |
tctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctct |
14298820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19261161 - 19260839
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Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19261161 |
aatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaac---ttatttcataacaacaaattatgaatcatgca |
19261065 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
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| T |
19261064 |
tacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattca |
19260965 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19260964 |
ccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
19260865 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattt |
337 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19260864 |
tatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16182180 - 16181739
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201 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |
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| T |
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gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaat |
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T |
 |
| Q |
202 |
acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
|
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| T |
16182080 |
gcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttca |
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T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
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|
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| T |
16181983 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
16181884 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc |
496 |
Q |
| |
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||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |
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| T |
16181883 |
attacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-accc |
16181787 |
T |
 |
| Q |
497 |
ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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| T |
16181786 |
ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
16181739 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 101 - 535
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8632238
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T |
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aacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcat |
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Q |
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| T |
8631901 |
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T |
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400 |
Q |
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T |
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496 |
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T |
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497 |
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Q |
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ttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 203 - 543
Target Start/End: Original strand, 38527842 - 38528183
Alignment:
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Q |
| |
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38527842 |
cataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcat |
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T |
 |
| Q |
301 |
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400 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
401 |
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497 |
Q |
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| T |
38528039 |
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38528137 |
T |
 |
| Q |
498 |
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543 |
Q |
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38528138 |
tgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14301029 - 14301521
Alignment:
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54 |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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251 |
Q |
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T |
 |
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351 |
Q |
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T |
 |
| Q |
352 |
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446 |
Q |
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| T |
14301328 |
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14301425 |
T |
 |
| Q |
447 |
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543 |
Q |
| |
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| T |
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aatctccctagattagggttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 55441132 - 55440649
Alignment:
| Q |
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attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
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| T |
55441032 |
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55440933 |
T |
 |
| Q |
253 |
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352 |
Q |
| |
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| T |
55440932 |
ttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
55440833 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta |
447 |
Q |
| |
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| T |
55440832 |
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T |
 |
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543 |
Q |
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| T |
55440743 |
atctccctagcctaggcttcaattttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctttctaccctttt-tcctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522686
Alignment:
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Q |
| |
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17523176 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta |
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T |
 |
| Q |
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247 |
Q |
| |
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17522979 |
T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
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| T |
17522978 |
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17522879 |
T |
 |
| Q |
348 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
17522878 |
gaacaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
17522781 |
T |
 |
| Q |
444 |
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535 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 13817477 - 13817958
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Q |
| |
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ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
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T |
 |
| Q |
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
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| T |
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acaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccatttt-catac |
13817671 |
T |
 |
| Q |
252 |
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349 |
Q |
| |
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| T |
13817672 |
actttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgt |
13817770 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt |
446 |
Q |
| |
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| T |
13817771 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggtt |
13817869 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
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| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
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| T |
13817870 |
aatctccctagcttagacttcaattttgctcatagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19570923 - 19570482
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201 |
Q |
| |
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gaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaat |
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T |
 |
| Q |
202 |
acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
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| T |
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gcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttca |
19570727 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
|
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| T |
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tacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
19570627 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc |
496 |
Q |
| |
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| T |
19570626 |
attacaa-aagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctccctagctaaggcttgaattttgctcctagct-taaccccaatcc |
19570530 |
T |
 |
| Q |
497 |
ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19570529 |
ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
19570482 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 17938584 - 17939024
Alignment:
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Q |
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17938683 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
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| T |
17938684 |
aagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccatg-cttta |
17938782 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
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| T |
17938783 |
tacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
17938882 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc |
495 |
Q |
| |
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| T |
17938883 |
attgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatcttagatggagtaatcc--ctagcttaagcttcaattttgctcctagctcaac-cacaacc |
17938979 |
T |
 |
| Q |
496 |
cttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
| T |
17938980 |
cttgattcttcaag---tcttctctctaccctttcctcctcttgctcc |
17939024 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11061312 - 11060797
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ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag |
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Q |
| |
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ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat |
11061213 |
T |
 |
| Q |
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catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttc |
229 |
Q |
| |
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| T |
11061212 |
caacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttc |
11061113 |
T |
 |
| Q |
230 |
aacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagag |
328 |
Q |
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| T |
11061112 |
aacatata-ccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagag |
11061015 |
T |
 |
| Q |
329 |
cacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattc |
426 |
Q |
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11060918 |
T |
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521 |
Q |
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| T |
11060917 |
caacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaagcttcagttttgctcctagctc-tcttccactccttgattcttcaagttccccttctctc |
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T |
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Q |
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11060818 |
taaccatttttcctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 3578091 - 3578539
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Q |
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T |
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287 |
Q |
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T |
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| Q |
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386 |
Q |
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T |
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482 |
Q |
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T |
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| Q |
483 |
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Q |
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T |
 |
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246 |
Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
 |
| Q |
347 |
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443 |
Q |
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Target: chr3; HSP #28
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
212 |
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224 |
Q |
| |
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38168036 |
ccaattgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #29
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Q |
| |
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atcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttac |
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T |
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Q |
| |
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6146568 |
T |
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535 |
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Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #30
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Q |
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T |
 |
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212 |
Q |
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| T |
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23492495 |
T |
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| Q |
213 |
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224 |
Q |
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| T |
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catttgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #31
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Q |
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T |
 |
| Q |
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287 |
Q |
| |
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12560286 |
T |
 |
| Q |
288 |
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386 |
Q |
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| T |
12560285 |
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12560187 |
T |
 |
| Q |
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481 |
Q |
| |
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| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| || | ||| |||| |||||||||| |||| ||| |
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| T |
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c-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaacttaagcttcaatttagctcatag |
12560088 |
T |
 |
| Q |
482 |
ctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| |||||||||||| |
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|
| T |
12560087 |
ttc-tcttccaatccttgattcttcaagttccccttctctctaacccttt-tcctcttgctcc |
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T |
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
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| T |
45581654 |
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45581752 |
T |
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| Q |
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224 |
Q |
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45581753 |
ccaattgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #33
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Q |
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caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattca |
11329108 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
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| T |
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11329009 |
T |
 |
| Q |
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388 |
Q |
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| T |
11329008 |
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11328916 |
T |
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| Q |
389 |
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443 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
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Q |
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T |
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tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
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Q |
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T |
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212 |
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Q |
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Q |
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T |
 |
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112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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212 |
ccaattgagcata |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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Q |
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aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaa |
53898598 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
53898597 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatttaatgcaactaac-acaattcaattattcat |
53898500 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53898499 |
aacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12489013 - 12488684
Alignment:
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
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| T |
12489013 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttag |
12488914 |
T |
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| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |
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| T |
12488913 |
caacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca |
12488815 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
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| T |
12488814 |
tactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattatg |
12488715 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
12488714 |
aacaattaattaatgact-caattaagcactt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54038456 - 54038245
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112 |
Q |
| |
|
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|
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aatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcat |
54038357 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |
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| T |
54038356 |
acccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcac |
54038257 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
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||||| |||||| |
|
|
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caatttagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 30207278 - 30207676
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250 |
Q |
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|
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|
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acaacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcata |
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T |
 |
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
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| T |
30207377 |
ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaa |
30207476 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt- |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |
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| T |
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taattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtta |
30207574 |
T |
 |
| Q |
446 |
---tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct |
541 |
Q |
| |
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|| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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gattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgct |
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T |
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Target: chr3; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527890
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405 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |
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|
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aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
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T |
 |
| Q |
406 |
ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgat |
501 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |
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|
| T |
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ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcccccaatccttgat |
14527913 |
T |
 |
| Q |
502 |
tcttcaag-tcctcttttctcta |
523 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| |
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|
| T |
14527912 |
tcttcaagttcctcttctctcta |
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T |
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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14059459 - 14059113
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190 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
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caacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattca |
14059360 |
T |
 |
| Q |
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tcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
14059359 |
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14059261 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca |
388 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
14059260 |
aacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaattagt-caattaagcacttattcatac- |
14059163 |
T |
 |
| Q |
389 |
aataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14059162 |
aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataaccccctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 16261384 - 16261587
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
16261575 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
16261576 |
caattgagcata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6146987 - 6146764
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194 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6146987 |
aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaa |
6146889 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
6146888 |
caacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaa-tacaattcaattattcat |
6146791 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatca |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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aacttcatacatctaaacatgtcatca |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 16880133 - 16880478
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
16880133 |
atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca |
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T |
 |
| Q |
200 |
taacataa-ttcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
16880233 |
tagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttc |
16880331 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
397 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
16880332 |
ttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaaacacttgttcatac-aacaattga |
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T |
 |
| Q |
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aaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
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Target Start/End: Original strand, 39656485 - 39656879
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Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | || || |||||||| | || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
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tacccattttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactta |
39656584 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttc |
247 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
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gcaacaaccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctc |
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T |
 |
| Q |
248 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
39656684 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattat |
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T |
 |
| Q |
348 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
39656784 |
gaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattgcactaaatgattatgatcaattctaactcccttaccttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 14528287 - 14528118
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
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caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacat |
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T |
 |
| Q |
162 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttca |
230 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528187 |
caattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaacaaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat |
28558228 |
T |
 |
| Q |
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acccaagccatgaattagcatcaa |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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acccaagccatgaattatcatcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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|
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ttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctattctctctaccattttctcctcttg |
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T |
 |
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ctcc |
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Q |
| |
|
|||| |
|
|
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ctcc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
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Q |
| |
|
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|
| T |
17191542 |
caacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacatgattcttatcacaattca |
17191641 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || |
|
|
| T |
17191642 |
gcaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatc |
17191740 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagca |
377 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
17191741 |
aacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagca |
17191827 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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Target Start/End: Complemental strand, 12349971 - 12349822
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194 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12349971 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
12349873 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt |
245 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
12349872 |
ctacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaacacacacccatttt |
12349822 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
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Target Start/End: Original strand, 30152902 - 30153076
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50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | ||| || |
|
|
| T |
30152902 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa |
30153001 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153002 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 33341843 - 33342015
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50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||| || |
|
|
| T |
33341843 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa |
33341940 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341941 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
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Target: chr3; HSP #54
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50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | | ||| || |
|
|
| T |
54685594 |
acccatttt-acaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa |
54685497 |
T |
 |
| Q |
150 |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685496 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
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Target Start/End: Original strand, 15876071 - 15876343
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93 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | | |
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|
| T |
15876071 |
acaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaac |
15876170 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
291 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| || ||| ||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||| | || | |
|
|
| T |
15876171 |
aacaacttatgataatccaacaatttgagtat-cattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaa |
15876269 |
T |
 |
| Q |
292 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
365 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15876270 |
caacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattaa |
15876343 |
T |
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Target: chr3; HSP #56
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Target Start/End: Complemental strand, 17956273 - 17956109
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
17956273 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
17956174 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956173 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
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Target: chr3; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 70 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576396
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169 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | | || | ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
3576705 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa |
3576606 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattca |
268 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||| ||||||| || ||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
3576605 |
catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttc |
3576507 |
T |
 |
| Q |
269 |
actaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcc |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
3576506 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-c |
3576408 |
T |
 |
| Q |
369 |
aattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
3576407 |
aattaagcactt |
3576396 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
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Target Start/End: Original strand, 7853944 - 7854116
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149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||| || |
|
|
| T |
7853944 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa |
7854041 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854042 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
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Target: chr3; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17204970
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ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
326 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
| Q |
327 |
agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
17204970 |
T |
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Target: chr3; HSP #60
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Target Start/End: Complemental strand, 11196393 - 11196293
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362 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196393 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaat |
11196294 |
T |
 |
| Q |
363 |
t |
363 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
11196293 |
t |
11196293 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc |
496 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
40939437 |
ttgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatcc |
40939535 |
T |
 |
| Q |
497 |
ttgattcttcaagt |
510 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
40939536 |
ttgattcttcaagt |
40939549 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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Target Start/End: Complemental strand, 9591039 - 9590647
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52 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
9591039 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaaca |
9590940 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| || |||| || | | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||| | ||| |||| |
|
|
| T |
9590939 |
acaacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcata-attcatatcataccactttcacata |
9590841 |
T |
 |
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || || |||||||||||||| || || || || ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
9590840 |
ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaa |
9590741 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
9590740 |
caattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttaccttag |
9590647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Original strand, 15517856 - 15517920
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| Q |
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catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15517856 |
catcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttact-caattaagcactt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784654
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ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
326 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
| Q |
327 |
agcacgaattttatca--tt--tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatg |
418 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
47784776 |
agcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatg |
47784679 |
T |
 |
| Q |
419 |
atgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47784678 |
atgaattctaacccccttaccttag |
47784654 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11882248 - 11882112
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| Q |
307 |
aaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttt-tcacacaaataattgaaaattgca |
405 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||| || || |
|
|
| T |
11882248 |
aaacataccatcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcacttattc-aattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttaca |
11882150 |
T |
 |
| Q |
406 |
ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11882149 |
ctaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
11882112 |
T |
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Target: chr3; HSP #66
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175 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38811245 |
atgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
38811170 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
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247 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
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Q |
| |
|
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| T |
14080666 |
catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta |
14080765 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
14080766 |
tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14080863 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
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Target Start/End: Original strand, 19946660 - 19946776
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149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || |
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|
| T |
19946660 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat |
19946757 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattga |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19946758 |
caacaacaacatcaattga |
19946776 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47785014 - 47784873
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70 |
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169 |
Q |
| |
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||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |
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|
| T |
47785014 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa |
47784915 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47784914 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
47784873 |
T |
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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Target Start/End: Original strand, 12952924 - 12953254
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| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| |
|
|
| T |
12952924 |
acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag |
12953023 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
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| T |
12953024 |
caacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcata |
12953122 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc-atttat |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || | | | || |
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|
| T |
12953123 |
tactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaacaactaat |
12953222 |
T |
 |
| Q |
348 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
12953223 |
gaacaattaatcacttact-caattaagcactt |
12953254 |
T |
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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814885
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70 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
169 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||| | || || |||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
14815032 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
14814933 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
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|
| T |
14814932 |
catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
14814885 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 407 - 442
Target Start/End: Original strand, 15550918 - 15550953
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| Q |
407 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15550918 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
15550953 |
T |
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Target: chr3; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 34559903 - 34560020
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| Q |
94 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| || || |||||| || |||| |||| | || |
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|
| T |
34559903 |
caaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaaca |
34560002 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34560003 |
actacataacataattca |
34560020 |
T |
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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Original strand, 17204701 - 17204821
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| Q |
91 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
190 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| || | ||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| | |
|
|
| T |
17204701 |
caacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaacatccattaaacatgattcctatcacaattca |
17204800 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
17204801 |
acaacaatatagcataattca |
17204821 |
T |
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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38811030 - 38810980
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38811030 |
catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattaa |
38810980 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 1990828 - 1990937
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| Q |
115 |
ccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcacca |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| || | ||||| || |||||| || | ||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1990828 |
ccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattcacaa |
1990927 |
T |
 |
| Q |
215 |
attgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
1990928 |
tttgagcata |
1990937 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17960237 - 17960205
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411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17960237 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
17960205 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38810940 - 38810908
Alignment:
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38810940 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
38810908 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 543
Target Start/End: Original strand, 3894955 - 3895480
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| Q |
20 |
caatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaag |
119 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3894955 |
caatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaag |
3895054 |
T |
 |
| Q |
120 |
ccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895055 |
ccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
3895154 |
T |
 |
| Q |
220 |
gcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatca |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3895155 |
gcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatca |
3895254 |
T |
 |
| Q |
320 |
taattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3895255 |
gaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga |
3895353 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctt |
516 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895354 |
tgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-cccaatccttgattcttcaagtcctctt |
3895452 |
T |
 |
| Q |
517 |
ttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895453 |
ctctctaacccttttctcctcttgctcc |
3895480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26070589 - 26070055
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070589 |
aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgca |
26070490 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070489 |
tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattca |
26070390 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26070389 |
ccaattaagcatattttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaac |
26070291 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata |
408 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070290 |
atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaata |
26070193 |
T |
 |
| Q |
409 |
agtgattatgatgaattctaaccc----ccttatcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct |
504 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070192 |
a-tgattatgatgaattctaaccccttacctta-gttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct |
26070095 |
T |
 |
| Q |
505 |
tcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26070094 |
tcaagtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc |
26070055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26094376 - 26093842
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094376 |
aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgca |
26094277 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094276 |
tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattca |
26094177 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26094176 |
ccaattaagcatattttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaac |
26094078 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata |
408 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094077 |
atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaata |
26093980 |
T |
 |
| Q |
409 |
agtgattatgatgaattctaaccc----ccttatcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct |
504 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26093979 |
a-tgattatgatgaattctaaccccttacctta-gttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct |
26093882 |
T |
 |
| Q |
505 |
tcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26093881 |
tcaagtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc |
26093842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12370146 - 12369629
Alignment:
| Q |
31 |
ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
12370146 |
ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataat |
12370047 |
T |
 |
| Q |
131 |
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Q |
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T |
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330 |
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T |
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12369747 |
T |
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12369647 |
T |
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543 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 143651 - 144095
Alignment:
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T |
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292 |
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143841 |
T |
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392 |
Q |
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489 |
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144041 |
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543 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15822712 - 15822223
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
156 |
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253 |
Q |
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| T |
15822612 |
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T |
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| Q |
254 |
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353 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
354 |
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450 |
Q |
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| T |
15822415 |
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15822316 |
T |
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| Q |
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543 |
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| T |
15822315 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13863255 - 13862723
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Q |
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T |
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| Q |
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211 |
Q |
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| T |
13863155 |
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13863056 |
T |
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| Q |
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310 |
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| T |
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13862956 |
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410 |
Q |
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| T |
13862955 |
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T |
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| Q |
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506 |
Q |
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| T |
13862859 |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45452410 - 45451958
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T |
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292 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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392 |
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| T |
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T |
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| Q |
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488 |
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| T |
45452112 |
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45452013 |
T |
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| Q |
489 |
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543 |
Q |
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Target Start/End: Original strand, 12758990 - 12759444
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| T |
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T |
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292 |
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| T |
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T |
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| Q |
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392 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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| T |
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543 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 47289787 - 47290240
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Q |
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T |
 |
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caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
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Q |
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| T |
47289886 |
caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcat |
47289983 |
T |
 |
| Q |
293 |
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392 |
Q |
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| T |
47289984 |
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47290083 |
T |
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| Q |
393 |
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487 |
Q |
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| T |
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attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattaggttaatctctctagtttagacttcaattttgctccaagctcttc |
47290183 |
T |
 |
| Q |
488 |
tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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47290184 |
tcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctgttctgctcttgctcc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 54 - 541
Target Start/End: Original strand, 11287381 - 11287871
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Q |
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attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
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T |
 |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
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| T |
11287481 |
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11287580 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
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| T |
11287581 |
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T |
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| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac |
448 |
Q |
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 |
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tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgct |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 44865233 - 44865685
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Q |
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T |
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192 |
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289 |
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44865332 |
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44865430 |
T |
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389 |
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44865530 |
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486 |
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44865531 |
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44865629 |
T |
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487 |
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543 |
Q |
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44865630 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12248404 - 12247916
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
252 |
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351 |
Q |
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T |
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445 |
Q |
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446 |
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535 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Original strand, 35094780 - 35095270
Alignment:
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T |
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| Q |
153 |
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251 |
Q |
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| T |
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T |
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351 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
352 |
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448 |
Q |
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| T |
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T |
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543 |
Q |
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| T |
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tctcctaagcttaagcttcaattttgctcctagct-taaccccaatacttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16570254 - 16569797
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Q |
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T |
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| Q |
189 |
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286 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
287 |
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385 |
Q |
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| T |
16570055 |
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T |
 |
| Q |
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480 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 16595408 - 16595865
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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286 |
Q |
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| T |
16595508 |
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16595606 |
T |
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| Q |
287 |
ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac |
385 |
Q |
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| T |
16595607 |
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T |
 |
| Q |
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480 |
Q |
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| T |
16595706 |
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T |
 |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39046907 - 39046419
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cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa |
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T |
 |
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252 |
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| T |
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T |
 |
| Q |
253 |
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352 |
Q |
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39046613 |
T |
 |
| Q |
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449 |
Q |
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| T |
39046612 |
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T |
 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7284333 - 7283956
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Q |
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T |
 |
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262 |
Q |
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T |
 |
| Q |
263 |
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362 |
Q |
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| T |
7284134 |
aattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaat |
7284035 |
T |
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| Q |
363 |
taatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
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7284034 |
tcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaaactaacccccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49047922 - 49047476
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Q |
| |
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aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt |
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T |
 |
| Q |
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tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
287 |
Q |
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caacaacaacataacataattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta |
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T |
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288 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
386 |
Q |
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| T |
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tcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcata |
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T |
 |
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caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag |
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Q |
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| T |
49047624 |
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T |
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| Q |
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ctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc |
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Q |
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ctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaacccttttc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32494378 - 32494167
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 |
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
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Q |
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T |
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213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 3049517 - 3049717
Alignment:
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19 |
ccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcataccca |
117 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049517 |
ccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcacgaaa------acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcataccca |
3049610 |
T |
 |
| Q |
118 |
agccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049611 |
agccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt |
3049710 |
T |
 |
| Q |
218 |
gagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
3049711 |
gagcata |
3049717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2190519 - 2190307
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2190519 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
2190420 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2190419 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
2190320 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
2190319 |
ccaattgagcata |
2190307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 111599 - 111390
Alignment:
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14 |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
111599 |
atatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatt-tgaatcatgcata |
111501 |
T |
 |
| Q |
114 |
cccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcacc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
111500 |
cccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcacc |
111401 |
T |
 |
| Q |
214 |
aattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
111400 |
aattgagcata |
111390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 2028843 - 2029055
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2028843 |
aatatccaaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
2028942 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
2028943 |
tacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcat-gcataattc |
2029041 |
T |
 |
| Q |
211 |
accaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
2029042 |
accaattgagcata |
2029055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Original strand, 13274751 - 13275130
Alignment:
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54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13274751 |
atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaac |
13274850 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13274851 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat----accac-------tttctcatact |
13274939 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
13274940 |
ttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
13275039 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13275040 |
attaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
13275130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42056622 - 42056410
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42056622 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
42056523 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42056522 |
tacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
42056423 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
42056422 |
ccaattgagcata |
42056410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 13377489 - 13377883
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
13377489 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttag |
13377588 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
13377589 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtata-attcaacatatatcactttctca |
13377687 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
13377688 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg |
13377787 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||| || ||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13377788 |
aacaattaatcgattact-caatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13377883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17224212 - 17223896
Alignment:
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162 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17224212 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
17224113 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
261 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17224112 |
aattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatg |
17224014 |
T |
 |
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
361 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| | |
|
|
| T |
17224013 |
aaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaattat |
17223914 |
T |
 |
| Q |
362 |
ttaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17223913 |
ttact-caattaagcactt |
17223896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 440 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26069501 - 26069397
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440 |
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538 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
26069501 |
ttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctttt |
26069402 |
T |
 |
| Q |
539 |
gctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
26069401 |
gctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 126375 - 126549
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | | ||| || |
|
|
| T |
126375 |
acccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaa |
126474 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126475 |
caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 48356667 - 48356997
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48356667 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa |
48356766 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
48356767 |
catttagagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
48356865 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
410 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||| ||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
48356866 |
tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaa |
48356964 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48356965 |
tgattatgattgaattctaacccccttacctta |
48356997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16915152 - 16914822
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16915152 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatgacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa |
16915053 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
| || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16915052 |
cgtttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaaca |
16914954 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
16914953 |
tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttacactaa |
16914856 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16914855 |
atgattgtgattgaattctaacccctttacctta |
16914822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 9838932 - 9839232
Alignment:
| Q |
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cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
9838932 |
cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacac |
9839030 |
T |
 |
| Q |
242 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
341 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9839031 |
tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac |
9839130 |
T |
 |
| Q |
342 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttat |
438 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| | | || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9839131 |
aactatgaacaattaatcacgtact-caattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttac |
9839228 |
T |
 |
| Q |
439 |
ctta |
442 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
9839229 |
ctta |
9839232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 9611360 - 9611661
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143 |
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240 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || |||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
9611360 |
cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataaca |
9611458 |
T |
 |
| Q |
241 |
atttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttat |
340 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9611459 |
ctttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaa |
9611558 |
T |
 |
| Q |
341 |
catttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| | | || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9611559 |
caactatgaacaattaatcacgtact-caattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctctta |
9611656 |
T |
 |
| Q |
438 |
tctta |
442 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
9611657 |
cctta |
9611661 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34241297 - 34241100
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| Q |
247 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
34241297 |
catacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaacta |
34241198 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34241197 |
tgaacaattaatcacttact-caattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
34241100 |
T |
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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 443
Target Start/End: Original strand, 31501177 - 31501527
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | | |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | || |
|
|
| T |
31501177 |
caaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaaca |
31501276 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| ||| |||||||| | |||| | ||||| ||| |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||| || |
|
|
| T |
31501277 |
acaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcacc |
31501375 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaat |
391 |
Q |
| |
|
|| ||||| || ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
31501376 |
aatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaatt |
31501474 |
T |
 |
| Q |
392 |
aattgaaaattgcaa-taagtgatta-tgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31501475 |
aa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttaccttag |
31501527 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||| ||| |
|
|
| T |
1937289 |
tttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa |
1937190 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcat |
172 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1937189 |
caacaaccattgatcat |
1937173 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Original strand, 4484687 - 4484854
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| | || ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | ||||| |
|
|
| T |
4484687 |
acccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
4484786 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||| ||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
4484787 |
caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatt |
4484854 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 16919613 - 16919735
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| Q |
144 |
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242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16919613 |
acttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcact |
16919711 |
T |
 |
| Q |
243 |
ttttcatactttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16919712 |
ttctcatattttgaacatgaaatt |
16919735 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14271989 - 14271838
Alignment:
| Q |
247 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || | || ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
14271989 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttga-caacta |
14271891 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
14271890 |
tgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaa |
14271838 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9724031 - 9723927
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
9724031 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
9723932 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
9723931 |
caatt |
9723927 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583674
Alignment:
| Q |
70 |
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169 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
20583821 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaa |
20583722 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
20583721 |
catgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
20583674 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 15358820 - 15358918
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || || |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15358820 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
15358918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 46474056 - 46474128
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
46474056 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
46474128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12837521 - 12837000
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12837521 |
aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaac---ttatttctca-caacaaatcatgaatcatgca |
12837426 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12837425 |
tacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattca |
12837326 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837325 |
ccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
12837226 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagt |
411 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12837225 |
tgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagt |
12837127 |
T |
 |
| Q |
412 |
gattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837126 |
gattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
12837027 |
T |
 |
| Q |
509 |
gtcctcttttctctacccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837026 |
gtcctcttctctctacccttttctcct |
12837000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 44055881 - 44056372
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| |
|
|
| T |
44055881 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaa |
44055980 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44055981 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttg |
44056080 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056081 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaa-aattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
44056179 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc |
451 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |
|
|
| T |
44056180 |
aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct |
44056279 |
T |
 |
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056280 |
ctctagcttaggtttcaattttgctcctagctcttctactaacccttgattcttcaaatcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
44056372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 34395223 - 34395714
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
34395223 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaa |
34395322 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt |
253 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |
|
|
| T |
34395323 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactt |
34395421 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395422 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaa |
34395520 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact |
449 |
Q |
| |
|
||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
34395521 |
ttaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat |
34395620 |
T |
 |
| Q |
450 |
ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
34395621 |
ctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacctttttctcctcttgctcc |
34395714 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 70 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21959730 - 21959254
Alignment:
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169 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
21959730 |
caacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgat |
21959631 |
T |
 |
| Q |
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catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaa |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21959630 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaattcaa |
21959532 |
T |
 |
| Q |
270 |
ctaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcca |
369 |
Q |
| |
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| T |
21959531 |
tcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcaccca |
21959432 |
T |
 |
| Q |
370 |
attaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggct |
465 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || |
|
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| T |
21959431 |
aataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagact |
21959332 |
T |
 |
| Q |
466 |
tcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21959331 |
tcaattttgctcctagctcttctcccaactcttgattcttcaagtcatcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
21959254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 30457909 - 30458360
Alignment:
| Q |
95 |
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194 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
30457909 |
aaataatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
30458007 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |
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| T |
30458008 |
caacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataa |
30458107 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
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| T |
30458108 |
cttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataat |
30458207 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc |
491 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |
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| T |
30458208 |
tcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagattttctctc |
30458307 |
T |
 |
| Q |
492 |
aacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
| T |
30458308 |
aaccctcgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
30458360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 113 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8872698 - 8872264
Alignment:
| Q |
113 |
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209 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8872698 |
acccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataatt |
8872599 |
T |
 |
| Q |
210 |
caccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa |
309 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8872598 |
caccaattgagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaa |
8872500 |
T |
 |
| Q |
310 |
catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
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| T |
8872499 |
catgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aa |
8872401 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatgatgaattctaaccccctta---tcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
| |
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|
| T |
8872400 |
gtgattatgatgaattctaacccccttactttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattcttc |
8872301 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
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| T |
8872300 |
aagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
8872264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 52 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23270219 - 23269745
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| || |||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
23270219 |
ccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaaca |
23270120 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |
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|
| T |
23270119 |
acaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccatttt-catac |
23270021 |
T |
 |
| Q |
252 |
--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23270020 |
actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga |
23269922 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt |
445 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23269921 |
acaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
23269822 |
T |
 |
| Q |
446 |
tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct |
522 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23269821 |
taatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaact-ccaatccttgattcttcaagttcctcttctctct |
23269745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 226 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813337
Alignment:
| Q |
226 |
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325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
20813559 |
T |
 |
| Q |
326 |
gagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
425 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
20813459 |
T |
 |
| Q |
426 |
ctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctc |
521 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20813458 |
ctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctc |
20813359 |
T |
 |
| Q |
522 |
tacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813358 |
tacccttttctcctcttgctcc |
20813337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 820154 - 819721
Alignment:
| Q |
95 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
194 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
820154 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
820059 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
820058 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacatttt-caca-----aac--------caac-aacaacaattcaattatccataa |
819974 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
819973 |
cttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataat |
819874 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcc |
490 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
819873 |
taaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcatagctcttctcc |
819774 |
T |
 |
| Q |
491 |
caacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
819773 |
caacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
819721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 55 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53705015 - 53704525
Alignment:
| Q |
55 |
ttttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaaca |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
53705015 |
ttttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaaca |
53704916 |
T |
 |
| Q |
155 |
acaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt |
254 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704915 |
acaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatacttt |
53704817 |
T |
 |
| Q |
255 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
354 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
53704816 |
gaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaat |
53704717 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactcc |
451 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
53704716 |
taatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttactcc |
53704617 |
T |
 |
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
53704616 |
cctaagcttaagcttcaattttactcctagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctctagctcc |
53704525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 16732135 - 16732626
Alignment:
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56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16732135 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
16732234 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
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| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||| |
|
|
| T |
16732235 |
cgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
16732334 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16732335 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
16732434 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataatt-gaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactc |
450 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||| || |
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| T |
16732435 |
aatcaattcacccaattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacctctttaccttagttagattaatc |
16732532 |
T |
 |
| Q |
451 |
cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16732533 |
tccctagtttaggcttcaattttggtcctagctc-tcttcacccccttgattcgtcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45459099 - 45458645
Alignment:
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93 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
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Q |
| |
|
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|
| T |
45459099 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaac |
45459000 |
T |
 |
| Q |
193 |
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292 |
Q |
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45458900 |
T |
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392 |
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45458800 |
T |
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488 |
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45458701 |
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543 |
Q |
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cccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttcttctcttgctcc |
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Target: chr4; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232285
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T |
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Q |
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30232663 |
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30232566 |
T |
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| Q |
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367 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
368 |
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460 |
Q |
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30232369 |
T |
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543 |
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Target: chr4; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 55376884 - 55376493
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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349 |
Q |
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55376685 |
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T |
 |
| Q |
350 |
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443 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr4; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 44346826 - 44347280
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Q |
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T |
 |
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287 |
Q |
| |
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| T |
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44347023 |
T |
 |
| Q |
288 |
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387 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |
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T |
 |
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484 |
Q |
| |
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| T |
44347124 |
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T |
 |
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Q |
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Target: chr4; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 53907980 - 53907500
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cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaa |
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T |
 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
53907880 |
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T |
 |
| Q |
253 |
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352 |
Q |
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| T |
53907784 |
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53907685 |
T |
 |
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353 |
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449 |
Q |
| |
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| T |
53907684 |
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T |
 |
| Q |
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ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
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Q |
| |
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| | |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
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53907593 |
ctcctaagcttaagcttcaattttgctcatagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcctttctctaaccattttctcctctagctcc |
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Target: chr4; HSP #17
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T |
 |
| Q |
131 |
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229 |
Q |
| |
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|| || || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |
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| T |
52265714 |
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52265616 |
T |
 |
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
52265615 |
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52265516 |
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 |
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427 |
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| |
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|
| T |
52265515 |
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52265418 |
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 |
| Q |
428 |
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522 |
Q |
| |
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| T |
52265417 |
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52265319 |
T |
 |
| Q |
523 |
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532 |
Q |
| |
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| || ||||| |
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| T |
52265318 |
aaccctttct |
52265309 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 89 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13809758 - 13809321
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|
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T |
 |
| Q |
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tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc |
286 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |
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| T |
13809658 |
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13809561 |
T |
 |
| Q |
287 |
ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac |
385 |
Q |
| |
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| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |
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| T |
13809560 |
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13809462 |
T |
 |
| Q |
386 |
acaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta |
480 |
Q |
| |
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| T |
13809461 |
ac-aataattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcc-ctagctcaagcttcaatttagccccta |
13809364 |
T |
 |
| Q |
481 |
gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctcta |
523 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
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|||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| |
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T |
 |
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cataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcata |
301 |
Q |
| |
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cataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataccacttcttcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatg |
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T |
 |
| Q |
302 |
catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa |
400 |
Q |
| |
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| T |
27961183 |
cattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaat |
27961280 |
T |
 |
| Q |
401 |
ttgcaata--agtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
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|| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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27961281 |
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Target: chr4; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 54 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18494611 - 18494153
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| |
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||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |
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attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaac |
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T |
 |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt--tcata |
250 |
Q |
| |
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|||| || | |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| |
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| T |
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aacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca-tttcaacatata-ccatttttctcata |
18494414 |
T |
 |
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
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| T |
18494413 |
ctttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaa |
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T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagca-cttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt |
445 |
Q |
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| T |
18494314 |
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18494217 |
T |
 |
| Q |
446 |
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510 |
Q |
| |
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|
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| T |
18494216 |
taatctccctagcttaagcctcaatttagctcctagat-ttcttccaatccttgattcttcaagt |
18494153 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
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Target Start/End: Original strand, 15044788 - 15045182
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149 |
Q |
| |
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| T |
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acccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag |
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T |
 |
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248 |
Q |
| |
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| T |
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15044986 |
T |
 |
| Q |
249 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
15044987 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg |
15045086 |
T |
 |
| Q |
349 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
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15045182 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
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Target Start/End: Complemental strand, 15272645 - 15272433
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
15272645 |
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15272546 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
15272545 |
tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
15272446 |
T |
 |
| Q |
212 |
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224 |
Q |
| |
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||||||||||||| |
|
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| T |
15272445 |
ccaattgagcata |
15272433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15109636 - 15109242
Alignment:
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149 |
Q |
| |
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| T |
15109636 |
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T |
 |
| Q |
150 |
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248 |
Q |
| |
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| T |
15109536 |
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15109438 |
T |
 |
| Q |
249 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
15109437 |
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15109338 |
T |
 |
| Q |
349 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
15109337 |
aataattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47535252 - 47535035
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248 |
Q |
| |
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|
| T |
47535252 |
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47535154 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
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|
| T |
47535153 |
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47535054 |
T |
 |
| Q |
349 |
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367 |
Q |
| |
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| T |
47535053 |
aacaattaatcatttaatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 14951722 - 14951896
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| Q |
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149 |
Q |
| |
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| T |
14951722 |
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14951821 |
T |
 |
| Q |
150 |
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224 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14951822 |
taacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185739
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||| | | |||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |
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|
| T |
7186068 |
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7185969 |
T |
 |
| Q |
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311 |
Q |
| |
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|| || | ||| | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||| |
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| T |
7185968 |
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7185870 |
T |
 |
| Q |
312 |
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410 |
Q |
| |
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| T |
7185869 |
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7185771 |
T |
 |
| Q |
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442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
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|
| T |
7185770 |
tgattatgatgaattctaacctccttacctta |
7185739 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 56 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41166227 - 41165998
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Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||| | ||||| | |||||||| || | | ||| ||||||||||||||| | | || ||| |||| |||||| |||||| |
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|
| T |
41166227 |
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41166128 |
T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
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|
| T |
41166127 |
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41166029 |
T |
 |
| Q |
255 |
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285 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41166028 |
gaacatgaaatttcactaacaacaattcaat |
41165998 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25119497 - 25119328
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| || | ||| ||||||| |
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|
| T |
25119497 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaaca |
25119398 |
T |
 |
| Q |
155 |
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224 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25119397 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
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T |
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Target: chr4; HSP #29
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Q |
| |
|
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| T |
14901242 |
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14901341 |
T |
 |
| Q |
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298 |
Q |
| |
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| T |
14901342 |
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14901439 |
T |
 |
| Q |
299 |
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396 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| |
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| T |
14901440 |
atacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattga |
14901537 |
T |
 |
| Q |
397 |
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443 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14901538 |
aaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttaccttag |
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T |
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Target: chr4; HSP #30
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| || | | | || ||||| |
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|
| T |
5682816 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaacaa |
5682717 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
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||||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5682716 |
caacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||| ||| || |||||| |
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|
| T |
18276457 |
acccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactttgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaa |
18276556 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
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| T |
18276557 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
18276655 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
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| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| ||| |
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| T |
18276656 |
tatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacatact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatcgcactaa |
18276753 |
T |
 |
| Q |
410 |
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442 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18276754 |
atgattatgattgaattctaaccccgttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41256656 - 41256262
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
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Q |
| |
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| T |
41256656 |
acccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
41256557 |
T |
 |
| Q |
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caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
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| T |
41256556 |
caacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcaca |
41256458 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
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Q |
| |
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| T |
41256457 |
tactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatg |
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T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa-taagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
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| T |
41256358 |
aacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
41256262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7964997 - 7964605
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
7964997 |
acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
7964899 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| | ||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | ||| || |
|
|
| T |
7964898 |
caacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcaca |
7964800 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
7964799 |
tactt-gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatg |
7964701 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7964700 |
aacaattactcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
7964605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15013506 - 15013176
Alignment:
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || ||||||||| | ||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
15013506 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaa |
15013407 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || || | || || ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
15013406 |
caatttgagcataatt-cacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaaca |
15013309 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa-taa |
409 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| || || || || |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
15013308 |
tatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaa |
15013211 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15013210 |
atgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
15013176 |
T |
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Target: chr4; HSP #35
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Target Start/End: Complemental strand, 15675330 - 15675219
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| Q |
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atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
15675330 |
atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattc |
15675231 |
T |
 |
| Q |
211 |
accaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
15675230 |
accaattgagca |
15675219 |
T |
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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
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| Q |
91 |
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173 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
19822022 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg |
19821940 |
T |
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Target: chr4; HSP #37
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaa |
65 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30232842 |
aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaa |
30232789 |
T |
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Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 31115651 - 31115764
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| Q |
111 |
atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
31115651 |
atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattc |
31115750 |
T |
 |
| Q |
211 |
accaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
31115751 |
accaattgagcata |
31115764 |
T |
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Target: chr4; HSP #39
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Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104380
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| Q |
150 |
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222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104452 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13590298 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
13590199 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13590198 |
caatt |
13590194 |
T |
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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
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| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54398406 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa |
54398505 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
54398506 |
caatt |
54398510 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 54 - 217
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| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||||||| |
|
|
| T |
18238440 |
attttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac |
18238341 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
18238340 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
18238277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19821768 - 19821669
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| Q |
346 |
atgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttatctt |
441 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19821768 |
atgatcaattaatcaattactc-aattaagcacttattcata-aaacaattgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
19821671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 454 - 487
Target Start/End: Original strand, 9199364 - 9199397
Alignment:
| Q |
454 |
ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc |
487 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9199364 |
ctagcttaggcttcaatttagctcctagctcttc |
9199397 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 487
Target Start/End: Original strand, 9252947 - 9252980
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| Q |
454 |
ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc |
487 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9252947 |
ctagcttaggcttcaatttagctcctagctcttc |
9252980 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15851663 - 15851607
Alignment:
| Q |
31 |
ttgagcaaaattcataag-tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc |
86 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15851663 |
ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttc |
15851607 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
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Alignment:
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37956949 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
37956917 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
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| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40885490 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
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Alignment:
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||| ||| || || | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40885756 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 20711998 - 20712534
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20711998 |
aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcatcagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgca |
20712097 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20712098 |
tacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattca |
20712197 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20712198 |
ccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaaca |
20712297 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaa-taag |
410 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20712298 |
tgtcatcataattagagcacgaatttcatcatt-atgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataag |
20712396 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20712397 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
20712496 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20712497 |
aagttctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
20712534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 50 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1168491 - 1167996
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1168491 |
acccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag |
1168392 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
1168391 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctcat |
1168292 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1168291 |
actttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatga |
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T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---tt |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
1168191 |
acaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgat-atgatgaattctaacccccttaccttagtagatt |
1168093 |
T |
 |
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447 |
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543 |
Q |
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| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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1168092 |
aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 21397099 - 21397547
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T |
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294 |
Q |
| |
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T |
 |
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295 |
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394 |
Q |
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cttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataat |
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T |
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395 |
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490 |
Q |
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| T |
21397397 |
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T |
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491 |
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Q |
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21397497 |
caacccttgattcttcaagtcctcttct-ttaacccttttctcctcttgctc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Original strand, 4865224 - 4865717
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T |
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250 |
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T |
 |
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350 |
Q |
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| T |
4865423 |
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T |
 |
| Q |
351 |
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447 |
Q |
| |
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| T |
4865523 |
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T |
 |
| Q |
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ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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| T |
4865622 |
atctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-ccaaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttatttcctcttgctcc |
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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
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Target Start/End: Original strand, 28261520 - 28261969
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28261520 |
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T |
 |
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tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
288 |
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| |
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| T |
28261620 |
tatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatat----ttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcat |
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T |
 |
| Q |
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ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca |
388 |
Q |
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| T |
28261715 |
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28261814 |
T |
 |
| Q |
389 |
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485 |
Q |
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| T |
28261815 |
aataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctc- |
28261912 |
T |
 |
| Q |
486 |
tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctc |
542 |
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| T |
28261913 |
tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcatcttgctc |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 21906730 - 21907155
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T |
 |
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taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
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tagcataattcatcaattgaacatatttt------------------catactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttca |
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T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
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| T |
21906909 |
tatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
21907008 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc |
495 |
Q |
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| T |
21907009 |
attgtgataaatgattatgataaattct-acccccttaccttagttatattactctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccaaacc |
21907107 |
T |
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| Q |
496 |
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543 |
Q |
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| T |
21907108 |
cttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
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Target Start/End: Complemental strand, 24183372 - 24182943
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caaatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaa---catgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaaca |
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T |
 |
| Q |
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acaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccata |
293 |
Q |
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| T |
24183275 |
acaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatg |
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T |
 |
| Q |
294 |
acttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataa |
393 |
Q |
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| T |
24183175 |
acttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataa |
24183076 |
T |
 |
| Q |
394 |
ttg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct |
488 |
Q |
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| T |
24183075 |
ttgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tct |
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T |
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| Q |
489 |
cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctcta |
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Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
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cccaatccttgattcttcaagtcctcttctctcta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11337423 - 11336975
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| |
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|
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| T |
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T |
 |
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200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
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| T |
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11337225 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
397 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
398 |
aaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaa |
493 |
Q |
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| T |
11337125 |
aaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagctcaagcttcaattttgctcctagctc-tcccccaa |
11337027 |
T |
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| Q |
494 |
cccttgattcttcaa-gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
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11337026 |
tccttgattcttcaatttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc |
11336975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21647023 - 21646532
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Q |
| |
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cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaa |
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T |
 |
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caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac- |
251 |
Q |
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| T |
21646923 |
caacagcaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcat-acatacccatttt-cataca |
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T |
 |
| Q |
252 |
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350 |
Q |
| |
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| T |
21646825 |
cttttaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaa |
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T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gtta |
447 |
Q |
| |
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| T |
21646726 |
catttaatcaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagtaggtta |
21646628 |
T |
 |
| Q |
448 |
ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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21646627 |
atctctctagtttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctttaccattttctccttttgctcc |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 90 - 535
Target Start/End: Original strand, 19405537 - 19405989
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288 |
Q |
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ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac |
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aaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc |
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-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagc |
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tcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct |
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tc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct |
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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 11584012 - 11584405
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148 |
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245 |
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T |
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Target: chr5; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 24475546 - 24475861
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
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| T |
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| T |
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T |
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Target: chr5; HSP #15
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152 |
Q |
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| T |
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T |
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251 |
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| T |
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23494080 |
T |
 |
| Q |
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351 |
Q |
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| T |
23494081 |
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23494180 |
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 |
| Q |
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443 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr5; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 3673822 - 3674216
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149 |
Q |
| |
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| T |
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3673921 |
T |
 |
| Q |
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248 |
Q |
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| T |
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3674020 |
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 |
| Q |
249 |
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348 |
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| T |
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| Q |
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443 |
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T |
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Target: chr5; HSP #17
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Q |
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||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| | || |||||| | |||||| ||||||||||||| |
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| T |
19862183 |
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19862282 |
T |
 |
| Q |
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262 |
Q |
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| T |
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19862381 |
T |
 |
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362 |
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| |
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| T |
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19862481 |
T |
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442 |
Q |
| |
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| T |
19862482 |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #18
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Q |
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|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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23466555 |
T |
 |
| Q |
189 |
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286 |
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23466633 |
T |
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287 |
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385 |
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| |
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| T |
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23466731 |
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| Q |
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481 |
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| |
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| T |
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23466830 |
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508 |
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| |
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ctc-tcttccactccttgattcttcaa |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #19
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149 |
Q |
| |
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| T |
5451130 |
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5451031 |
T |
 |
| Q |
150 |
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248 |
Q |
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| T |
5451030 |
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5450932 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
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| T |
5450931 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatg |
5450832 |
T |
 |
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349 |
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377 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| | |||||||||| |
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| T |
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caacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattca |
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T |
 |
| Q |
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289 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca |
388 |
Q |
| |
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| T |
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accaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcataca |
7728718 |
T |
 |
| Q |
389 |
aataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
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| ||| ||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
7728719 |
acaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Original strand, 16595472 - 16595861
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
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443 |
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16595861 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 432423 - 432816
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Q |
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248 |
Q |
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| T |
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T |
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348 |
Q |
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443 |
Q |
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| T |
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432816 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 23981802 - 23981433
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
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| T |
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23981704 |
T |
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| Q |
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248 |
Q |
| |
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| T |
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23981605 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
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| T |
23981604 |
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23981505 |
T |
 |
| Q |
349 |
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420 |
Q |
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| T |
23981504 |
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23981433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Original strand, 2031783 - 2031944
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162 |
Q |
| |
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| T |
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2031882 |
T |
 |
| Q |
163 |
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224 |
Q |
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| T |
2031883 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2031944 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
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249 |
Q |
| |
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| T |
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 |
| Q |
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349 |
Q |
| |
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| T |
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28902450 |
T |
 |
| Q |
350 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
28902451 |
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28902546 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Original strand, 28938647 - 28938941
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249 |
Q |
| |
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|
| T |
28938647 |
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28938745 |
T |
 |
| Q |
250 |
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349 |
Q |
| |
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| T |
28938746 |
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28938845 |
T |
 |
| Q |
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443 |
Q |
| |
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| T |
28938846 |
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28938941 |
T |
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Target: chr5; HSP #27
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Q |
| |
|
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| T |
11342644 |
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11342743 |
T |
 |
| Q |
150 |
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224 |
Q |
| |
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| T |
11342744 |
caaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
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Target: chr5; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 21617020 - 21617370
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Q |
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||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | || |
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21617020 |
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21617119 |
T |
 |
| Q |
194 |
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292 |
Q |
| |
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| T |
21617120 |
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21617218 |
T |
 |
| Q |
293 |
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390 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21617219 |
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21617316 |
T |
 |
| Q |
391 |
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442 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
21617370 |
T |
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Target: chr5; HSP #29
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Q |
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|
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|
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actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatga |
21310697 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21310696 |
acaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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241 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||| | || || ||||||| || ||||| ||| | |
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|
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21222802 |
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21222704 |
T |
 |
| Q |
242 |
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341 |
Q |
| |
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| T |
21222703 |
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21222604 |
T |
 |
| Q |
342 |
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362 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21222603 |
aactatgaacaattaatcaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| | | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
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actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatga |
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T |
 |
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acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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Q |
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22662510 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctct---acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
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22662509 |
tagttctcccttctctctaacccttttctcct |
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Q |
| |
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caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
6456703 |
T |
 |
| Q |
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catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
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Q |
| |
|
||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
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| T |
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catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
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|
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T |
 |
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tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
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| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
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aattctaacccccttatcttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target Start/End: Complemental strand, 22054072 - 22053963
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113 |
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212 |
Q |
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|||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
22054072 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcac |
22053973 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22053972 |
caattgagca |
22053963 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
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54 |
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153 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| | |||| |||||||||| |||| ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| |||| |
|
|
| T |
29917929 |
atttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaac |
29918028 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29918029 |
aacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattca |
29918086 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
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217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
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cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
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Target Start/End: Complemental strand, 25048 - 24517
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112 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25048 |
aatatcccaattcaacaattgagcgaaat----aagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaat |
24953 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24952 |
acccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac |
24853 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24852 |
caattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacat |
24753 |
T |
 |
| Q |
313 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24752 |
gtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtg |
24653 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24652 |
attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattctgcaa |
24553 |
T |
 |
| Q |
509 |
gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24552 |
gtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc |
24517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 94898 - 95109
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| Q |
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112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
94898 |
aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
94997 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
94998 |
acccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
95097 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
95098 |
taattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 18777069 - 18777587
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777069 |
aatatcccaatccaacaattgaacaaaactcataagtatctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
18777168 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18777169 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac |
18777268 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
312 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777269 |
caattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
18777368 |
T |
 |
| Q |
313 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18777369 |
gtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaa-----------------caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtg |
18777451 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777452 |
attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
18777551 |
T |
 |
| Q |
509 |
gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18777552 |
gtcctcttctctctaacccttttcttctcttgctcc |
18777587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 532
Target Start/End: Original strand, 18570203 - 18570723
Alignment:
| Q |
13 |
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112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570203 |
aatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacactt-atttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
18570301 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18570302 |
acccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac |
18570401 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570402 |
caattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacat |
18570501 |
T |
 |
| Q |
313 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
18570502 |
gtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aattg |
18570600 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag |
509 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570601 |
attatgatgaattctaacccccttaccttagtatgttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-cccaatccttgattcttcaag |
18570699 |
T |
 |
| Q |
510 |
-tcctcttttctctacccttttct |
532 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
18570700 |
ttcctcttctctctaaccctttct |
18570723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 32898756 - 32899248
Alignment:
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
32898756 |
tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
32898855 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898856 |
caacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
32898955 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898956 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
32899055 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactcc |
451 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
32899056 |
aatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct |
32899155 |
T |
 |
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32899156 |
atctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttatcctcttgctcc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 95 - 544
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086475
Alignment:
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95 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
194 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
16086022 |
aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa |
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T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16086122 |
caacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataa |
16086221 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16086222 |
cttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaat |
16086321 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcc |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16086322 |
tgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctatttcttctcc |
16086421 |
T |
 |
| Q |
491 |
caacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcct |
544 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086422 |
caacccttgattcttcaagttctcttctctctacccttttctcctcttgctcct |
16086475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 121 - 543
Target Start/End: Original strand, 16106547 - 16106973
Alignment:
| Q |
121 |
catgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag |
220 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || |||| || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
16106547 |
catgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaag |
16106646 |
T |
 |
| Q |
221 |
catattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcat |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16106647 |
catattttcaacacatactcatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
16106746 |
T |
 |
| Q |
321 |
aattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106747 |
aattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgat |
16106846 |
T |
 |
| Q |
421 |
gaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctt |
516 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16106847 |
gaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttactcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctatt |
16106946 |
T |
 |
| Q |
517 |
ttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106947 |
ctctctacccttttctcctcttgctcc |
16106973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 103 - 543
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18433098
Alignment:
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103 |
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202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
18432656 |
aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaag |
18432755 |
T |
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302 |
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18432855 |
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401 |
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18432954 |
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497 |
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T |
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543 |
Q |
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18433054 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
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Target Start/End: Original strand, 22440940 - 22441388
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Q |
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T |
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294 |
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22441138 |
T |
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394 |
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22441238 |
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491 |
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22441335 |
T |
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543 |
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22441336 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13014943 - 13014503
Alignment:
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201 |
Q |
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13014845 |
T |
 |
| Q |
202 |
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301 |
Q |
| |
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| T |
13014844 |
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13014746 |
T |
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| Q |
302 |
catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa--ataattgaaa |
399 |
Q |
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13014745 |
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13014646 |
T |
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| Q |
400 |
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496 |
Q |
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| T |
13014645 |
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T |
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| Q |
497 |
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Q |
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ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttg |
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T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 90 - 374
Target Start/End: Original strand, 31628268 - 31628552
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Q |
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| Q |
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289 |
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| T |
31628368 |
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31628467 |
T |
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| Q |
290 |
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374 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 540
Target Start/End: Original strand, 18398899 - 18399392
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Q |
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18398997 |
T |
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| Q |
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247 |
Q |
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| T |
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18399095 |
T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
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| T |
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18399195 |
T |
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| Q |
348 |
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441 |
Q |
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| T |
18399196 |
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18399293 |
T |
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442 |
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539 |
Q |
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| T |
18399294 |
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T |
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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15742555 - 15742341
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Q |
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|
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15742456 |
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 |
| Q |
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209 |
Q |
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| T |
15742455 |
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15742356 |
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 |
| Q |
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224 |
Q |
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| T |
15742355 |
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15742341 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 23994845 - 23995057
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Q |
| |
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| T |
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23994944 |
T |
 |
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| |
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| T |
23994945 |
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23995044 |
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| Q |
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224 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23995045 |
ccaattgagcata |
23995057 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 26089659 - 26089869
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112 |
Q |
| |
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| T |
26089659 |
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26089757 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
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| T |
26089758 |
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26089857 |
T |
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| Q |
213 |
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224 |
Q |
| |
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| T |
26089858 |
caattgagcata |
26089869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18002827 - 18002617
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
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| T |
18002728 |
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18002629 |
T |
 |
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224 |
Q |
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| T |
18002628 |
caattgagcata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
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190 |
Q |
| |
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caacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattca |
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T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
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| T |
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acaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatc |
25367285 |
T |
 |
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290 |
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387 |
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| T |
25367284 |
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25367186 |
T |
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388 |
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443 |
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25367185 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 21623171 - 21623522
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93 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
192 |
Q |
| |
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| T |
21623171 |
acaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaac |
21623270 |
T |
 |
| Q |
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aacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
291 |
Q |
| |
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| T |
21623271 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaa |
21623369 |
T |
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| Q |
292 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa |
390 |
Q |
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| T |
21623370 |
caacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aa |
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T |
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taattga-aaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
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Q |
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caattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 407 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25640491 - 25640351
Alignment:
| Q |
407 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc |
503 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25640491 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttggttaatctctctagattaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc |
25640392 |
T |
 |
| Q |
504 |
ttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25640391 |
ttcaagtcttcttctctttgacccttttctcctctagctcc |
25640351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18381964 - 18381660
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
18381964 |
tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa |
18381865 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18381864 |
caacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
18381766 |
T |
 |
| Q |
255 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
354 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||| ||||||| || | |||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||| || || | |||||||| |
|
|
| T |
18381765 |
gaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
18381666 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatca |
360 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18381665 |
taatca |
18381660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35015446 - 35015278
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
35015446 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
35015347 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015346 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22362002 - 22361660
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
22362002 |
atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaaca |
22361903 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| ||||||| || |||| || || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || | || ||| |
|
|
| T |
22361902 |
tagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttc |
22361804 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
396 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| || || ||||| |
|
|
| T |
22361803 |
atgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattga |
22361706 |
T |
 |
| Q |
397 |
aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22361705 |
aaaattacta-aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
22361660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 543
Target Start/End: Original strand, 31628556 - 31628646
Alignment:
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628556 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct-ctctccatccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
31628646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079501
Alignment:
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| |||| || ||||||||||||||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
15079795 |
actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaatttaa-catctatga |
15079699 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt- |
445 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
15079698 |
ataattaatcaatta-tccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagtta |
15079602 |
T |
 |
| Q |
446 |
---tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgct |
541 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
15079601 |
gattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttttcctcttgct |
15079503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21411191 - 21410943
Alignment:
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || | || |
|
|
| T |
21411191 |
caacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaa |
21411093 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataa |
393 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
21411092 |
cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataa |
21410995 |
T |
 |
| Q |
394 |
ttgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21410994 |
ttgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
21410943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25744498 - 25744331
Alignment:
| Q |
52 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
25744498 |
ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
25744399 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga |
219 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744398 |
acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19983580 - 19983412
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
19983580 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
19983481 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19983480 |
caacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcactaattgagcata |
19983412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28195324 - 28195101
Alignment:
| Q |
107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaa-cttatcacaatttatcaacaacataacat |
205 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
28195324 |
atgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcat |
28195225 |
T |
 |
| Q |
206 |
aattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcataca |
303 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| || || ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
28195224 |
aattcaactaattgagcacattt-catcatata-ccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcataca |
28195127 |
T |
 |
| Q |
304 |
tctaaacatgccatcataattagagc |
329 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
28195126 |
ttcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 33324703 - 33325047
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | | |||| | |
|
|
| T |
33324703 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata |
33324802 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || |||||||||||||| || | || ||| |
|
|
| T |
33324803 |
tagcataattcatccaattgagcataatt-cataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcaacaatttc |
33324900 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
397 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||||| |
|
|
| T |
33324901 |
atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatac-attaattga |
33324998 |
T |
 |
| Q |
398 |
a--aattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
| |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33324999 |
aataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
33325047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 285
Target Start/End: Original strand, 25651193 - 25651432
Alignment:
| Q |
46 |
aagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| | || | ||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | ||| |
|
|
| T |
25651193 |
aagtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac |
25651292 |
T |
 |
| Q |
146 |
ttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccattt |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| ||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
25651293 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacacttt |
25651391 |
T |
 |
| Q |
245 |
ttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
25651392 |
cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat |
25651432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18629698 - 18629501
Alignment:
| Q |
247 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
18629698 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
18629599 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18629598 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
18629501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35136249 - 35135905
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | | |||| | |
|
|
| T |
35136249 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata |
35136150 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || |||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
35136149 |
tagcataattcatccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttc |
35136052 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
396 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
35136051 |
atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaattaatcacttattcatac-aataattga |
35135954 |
T |
 |
| Q |
397 |
-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35135953 |
aaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
35135905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17083384 - 17083092
Alignment:
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||| | || ||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
17083384 |
caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-caacatatatcattttcaca |
17083286 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
17083285 |
tactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatg |
17083187 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17083186 |
aacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttaccttag |
17083092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 18583377 - 18583451
Alignment:
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583377 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
18583451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16888029 - 16887684
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
16888029 |
atgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
16887930 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || ||||||| |||||| || || ||| |
|
|
| T |
16887929 |
taacataattcacccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttc |
16887831 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
397 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
16887830 |
atgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttattcaattaatcacttattcatac-aataattga |
16887733 |
T |
 |
| Q |
398 |
aaa---ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16887732 |
aaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
16887684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33538389 - 33538263
Alignment:
| Q |
318 |
cataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatta |
416 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
33538389 |
catagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta |
33538291 |
T |
 |
| Q |
417 |
tga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33538290 |
tgattgaattctaacccccttaccttag |
33538263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35009684 - 35009569
Alignment:
| Q |
107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
35009684 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
35009585 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009584 |
attcaccaattgagca |
35009569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17557107 - 17556977
Alignment:
| Q |
247 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
17557107 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattagagcacgaa-tttaacaacta |
17557010 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17557009 |
tgaacaaataatcaatt-attcaattaagcactt |
17556977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 34966827 - 34966994
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||| |
|
|
| T |
34966827 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
34966926 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34966927 |
caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
34966994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18823633 - 18823565
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18823633 |
atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18823565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18839488 - 18839420
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18839488 |
atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18839420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 18583295 - 18583372
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta |
129 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583295 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta |
18583372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Original strand, 15740454 - 15740576
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | || || | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
15740454 |
catcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagtacttattcatacaaa-aattgaaaatttacactaaaaa |
15740551 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaaccccct |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15740552 |
tgattatgatgaattctaactccct |
15740576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Original strand, 25919614 - 25919696
Alignment:
| Q |
91 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatg |
173 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
25919614 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatg |
25919696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25744311 - 25744278
Alignment:
| Q |
510 |
tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25744311 |
tcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
25744278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079820
Alignment:
| Q |
101 |
tgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacat |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| || |
|
|
| T |
15079944 |
tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat |
15079845 |
T |
 |
| Q |
201 |
aacataattca-ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15079844 |
agcataattcacccaattgagcata |
15079820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654394
Alignment:
| Q |
316 |
atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
25654350 |
atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatca |
25654394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Original strand, 25919936 - 25919968
Alignment:
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25919936 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
25919968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 20481546 - 20482059
Alignment:
| Q |
31 |
ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481546 |
ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaa |
20481645 |
T |
 |
| Q |
131 |
catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca |
230 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20481646 |
catcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatca |
20481745 |
T |
 |
| Q |
231 |
acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagca |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481746 |
acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagca |
20481845 |
T |
 |
| Q |
331 |
cgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaa |
429 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20481846 |
cgaatttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattttaa |
20481942 |
T |
 |
| Q |
430 |
cccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctaccc |
526 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20481943 |
cccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctacctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaccc |
20482042 |
T |
 |
| Q |
527 |
ttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20482043 |
ttttctcctcttgctcc |
20482059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 41246624 - 41247113
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41246624 |
tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa |
41246723 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41246724 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctactttt |
41246822 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41246823 |
aacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaatt |
41246922 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccc |
452 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | || | |
|
|
| T |
41246923 |
aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttaccttagtaggtcaatctc |
41247022 |
T |
 |
| Q |
453 |
tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41247023 |
tctagcttaggcttcaattttgctcctacctcttctccgaaccctt-attcttcaagtcctcttctctctaacccttttttcctcttgctcc |
41247113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 37611674 - 37612125
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194 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
37611674 |
aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa |
37611772 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
37611773 |
caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttat |
37611870 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37611871 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaata |
37611970 |
T |
 |
| Q |
393 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc |
489 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37611971 |
attgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctatcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc |
37612070 |
T |
 |
| Q |
490 |
ccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37612071 |
ccaacccttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttttctactcttgctcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20573474 - 20572983
Alignment:
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54 |
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153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20573474 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20573376 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |
|
|
| T |
20573375 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcatacactt |
20573276 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20573275 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
20573176 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
20573175 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaa |
20573077 |
T |
 |
| Q |
449 |
tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573076 |
tctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtccttttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
20572983 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 158 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561420
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257 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||| |
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| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
258 |
catgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaa |
357 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa |
20561611 |
T |
 |
| Q |
358 |
tcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccc |
452 |
Q |
| |
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| T |
20561610 |
tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctc |
20561512 |
T |
 |
| Q |
453 |
tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcct |
544 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20561511 |
cctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcct |
20561420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 89 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22235051 - 22234600
Alignment:
| Q |
89 |
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188 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22235051 |
aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaatt |
22234952 |
T |
 |
| Q |
189 |
tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22234951 |
catcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaatt |
22234855 |
T |
 |
| Q |
287 |
ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcaca |
386 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |
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| T |
22234854 |
attcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttatcata |
22234755 |
T |
 |
| Q |
387 |
caaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagct |
483 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22234754 |
caaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctcccaaacttagtcttcaattttgctcctagct |
22234656 |
T |
 |
| Q |
484 |
cttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttg |
539 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22234655 |
cttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaccattttctcctcttg |
22234600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19993339 - 19992849
Alignment:
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
19993339 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
19993240 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19993239 |
acaacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catac |
19993142 |
T |
 |
| Q |
252 |
--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19993141 |
actttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatga |
19993043 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---tt |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
19993042 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaattataacccccttaccttagtagatt |
19992945 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19992944 |
aatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctattctctctaacccttttctcctcttgctcc |
19992849 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 90 - 509
Target Start/End: Original strand, 21681002 - 21681426
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189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21681002 |
acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattc |
21681101 |
T |
 |
| Q |
190 |
atcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
288 |
Q |
| |
|
| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
21681102 |
aacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattat |
21681201 |
T |
 |
| Q |
289 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac |
387 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
21681202 |
ccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac |
21681301 |
T |
 |
| Q |
388 |
aaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc |
482 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21681302 |
-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttatttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagc |
21681400 |
T |
 |
| Q |
483 |
tcttctcccaacccttgattcttcaag |
509 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21681401 |
tc-tctcccaatccttgattcttcaag |
21681426 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 266 - 543
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122896
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266 |
tcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
365 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
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T |
 |
| Q |
366 |
tccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttag |
462 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttag |
25122816 |
T |
 |
| Q |
463 |
gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122817 |
gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg-ttcttcaagtccttttctctctacccttttctcctcttgctcc |
25122896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529642
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347 |
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442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
20529843 |
tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttaccttagtta |
20529744 |
T |
 |
| Q |
443 |
ggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct |
541 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20529743 |
ggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgct |
20529644 |
T |
 |
| Q |
542 |
cc |
543 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
20529643 |
cc |
20529642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 274366 - 274577
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
274366 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcat |
274465 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
274466 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
274565 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |
|
|
| T |
274566 |
caattgaacata |
274577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 641483 - 641272
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
641483 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcat |
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T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
641383 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
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T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |
|
|
| T |
641283 |
caattgaacata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
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Target Start/End: Complemental strand, 827289 - 827078
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13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
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827289 |
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T |
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212 |
Q |
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T |
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224 |
Q |
| |
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| T |
827089 |
caattgaacata |
827078 |
T |
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Target: chr8; HSP #14
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
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|
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| T |
16039213 |
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16039114 |
T |
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| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
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16039014 |
T |
 |
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213 |
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224 |
Q |
| |
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||||||||||| |
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| T |
16039013 |
taattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 39447048 - 39446567
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153 |
Q |
| |
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39446950 |
T |
 |
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154 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
39446949 |
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39446851 |
T |
 |
| Q |
253 |
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352 |
Q |
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| T |
39446850 |
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39446751 |
T |
 |
| Q |
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445 |
Q |
| |
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| T |
39446750 |
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39446653 |
T |
 |
| Q |
446 |
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531 |
Q |
| |
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| T |
39446652 |
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39446567 |
T |
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Target: chr8; HSP #16
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Q |
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||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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289 |
Q |
| |
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| T |
20654052 |
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20653953 |
T |
 |
| Q |
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298 |
Q |
| |
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20653952 |
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T |
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Q |
| |
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| T |
23837164 |
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23837263 |
T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
23837264 |
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23837362 |
T |
 |
| Q |
255 |
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354 |
Q |
| |
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| T |
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23837462 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||| |
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| T |
23837463 |
taatcatttact-caattaagcactt |
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T |
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189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc |
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T |
 |
| Q |
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atcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647976 |
atcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
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T |
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159 |
Q |
| |
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|
| T |
21198429 |
accaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaacaacaac |
21198330 |
T |
 |
| Q |
160 |
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258 |
Q |
| |
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| T |
21198329 |
atcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaac |
21198231 |
T |
 |
| Q |
259 |
atgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaat |
358 |
Q |
| |
|
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| T |
21198230 |
atgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaat |
21198131 |
T |
 |
| Q |
359 |
caattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21198130 |
caattact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatctta |
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T |
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Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
24386076 |
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24385977 |
T |
 |
| Q |
112 |
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172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24385976 |
tacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatcat |
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T |
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115199 |
aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataaatactcattttcaccaa-ccaacaataacaatttatttctcaacaataaattatgaatcatgcat |
39115297 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
39115298 |
acacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcac |
39115397 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
39115398 |
caattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981623
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
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T |
 |
| Q |
267 |
caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaat |
366 |
Q |
| |
|
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| T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaatt-ac |
22981546 |
T |
 |
| Q |
367 |
ccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22981547 |
ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |
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|
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caacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattca |
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T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |
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|
| T |
38533750 |
acaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattat |
38533847 |
T |
 |
| Q |
289 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta |
364 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38533848 |
caacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatta |
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T |
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Q |
| |
|
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| T |
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aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac |
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T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41506991 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Q |
| |
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| T |
26011455 |
acccatttt-acaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
26011553 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | ||| || |
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|
| T |
26011554 |
caacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcaca |
26011652 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
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| T |
26011653 |
tactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatg |
26011752 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatca |
360 |
Q |
| |
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| T |
26011753 |
aacaattaatca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 15933321 - 15933651
Alignment:
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113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15933321 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa |
15933420 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15933421 |
catttagagcataatt-caacatttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
15933519 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
15933520 |
tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
15933617 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15933618 |
atgattatgatttaattctaacccccttacctta |
15933651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 5854637 - 5854967
Alignment:
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
5854637 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaa |
5854736 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5854737 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaaca |
5854835 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
5854836 |
tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
5854933 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
5854934 |
atgattatgattgaattctaacctccttacctta |
5854967 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Alignment:
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63 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
24717144 |
aaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaacaacaac |
24717045 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717044 |
cattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285493
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| Q |
227 |
ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
326 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
| Q |
327 |
agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcactt |
17285493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Original strand, 15970046 - 15970174
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| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
15970046 |
catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcatttattcatac-aataattgaaaaattgcactaaatg |
15970143 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15970144 |
attatgatgaattccaacccccttaccttag |
15970174 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #31
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345 |
tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7000616 |
tatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-aaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
7000525 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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| Q |
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543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20653912 |
ctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcctaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaaacctttcttcctcttgctcc |
20653823 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 94 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23226319 - 23225973
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| Q |
94 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | || |
|
|
| T |
23226319 |
caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaca |
23226220 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| | || | || | |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
23226219 |
acaacataacataattcaatcatttgagcata-attcataagttaacacttatacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatc |
23226121 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcac-ttttcacacaaat |
391 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
23226120 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatc----attccaattaaacactttttcatac-aat |
23226026 |
T |
 |
| Q |
392 |
aattg-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
23226025 |
aattgaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccctttacctta |
23225973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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Target Start/End: Complemental strand, 22736084 - 22735958
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190 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
22736084 |
caacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatcca |
22735985 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22735984 |
acaacaacatagtataattcatcaatt |
22735958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Original strand, 29306470 - 29306706
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| Q |
143 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatcca |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
29306470 |
cacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcat |
29306568 |
T |
 |
| Q |
242 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
341 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| || | || |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
29306569 |
tttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaac |
29306668 |
T |
 |
| Q |
342 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306669 |
atctatgaacaatcaatcactt-attcaattaagcactt |
29306706 |
T |
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Target: chr8; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635768
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caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
169 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
38635915 |
caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
38635816 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
38635815 |
catgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
38635768 |
T |
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Target: chr8; HSP #37
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502 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
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taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcc-ctagcttaagcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatccttgaat |
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T |
 |
| Q |
503 |
cttcaag-tcctcttttctct-acccttttc |
531 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21259328 |
cttcaagttcctcttctctctaacccttttc |
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T |
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172 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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25122542 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20567440 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20567342 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
20567341 |
aacaacatc |
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T |
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attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20573633 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20573535 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
20573534 |
aacaacatc |
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T |
 |
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94 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||| |||| || |||| |||| | || |
|
|
| T |
23158167 |
caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaat---catcaacaacatcacttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaaca |
23158263 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | ||| | || |||||| |||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
23158264 |
acaacataacataattcaaccaattgagcata-attcatatcataccactttcacgtattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcac |
23158362 |
T |
 |
| Q |
292 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa |
390 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
23158363 |
tagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caaataagcacttattcatacaac |
23158461 |
T |
 |
| Q |
391 |
taattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
| ||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23158462 |
aa---gaaaattacactaaatgattataatgaattataactcccttatcttag |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 52 - 211
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
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Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||||| |
|
|
| T |
27233352 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca |
27233253 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27233252 |
acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
27233193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 380
Target Start/End: Original strand, 23149785 - 23150068
Alignment:
| Q |
94 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||| |||| || |
|
|
| T |
23149785 |
caaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---ca |
23149881 |
T |
 |
| Q |
194 |
acaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
291 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || |||| | ||| |||| |||||| |||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
23149882 |
acaacttagcataattcaaccaattgagcataattcatac-cataccactttcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcac |
23149980 |
T |
 |
| Q |
292 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23149981 |
tagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
23150068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528779
Alignment:
| Q |
272 |
aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
33528607 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat |
33528705 |
T |
 |
| Q |
372 |
taagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33528706 |
taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
33528779 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20567281 - 20567195
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20567281 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
20567195 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Original strand, 29759902 - 29759975
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| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccat |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29759902 |
acccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
29759975 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31194346 - 31194216
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgca--ataag |
410 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || || ||||||||| ||||| | || |
|
|
| T |
31194346 |
catcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaatttgcactaaaaa |
31194249 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31194248 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttag |
31194216 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24552762 - 24552690
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24552762 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt |
24552690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18261758 - 18261591
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| | || ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||| |
|
|
| T |
18261758 |
acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
18261659 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
18261658 |
caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
18261591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 25296319 - 25296426
Alignment:
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| ||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25296319 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa |
25296418 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaat |
358 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25296419 |
caattaat |
25296426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 25758339 - 25758446
Alignment:
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| ||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25758339 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa |
25758438 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaat |
358 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25758439 |
caattaat |
25758446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33611340 - 33611179
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || | || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
33611340 |
acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
33611241 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||| || | ||||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33611240 |
caacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattca |
33611179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 443
Target Start/End: Original strand, 38533967 - 38534004
Alignment:
| Q |
406 |
ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38533967 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
38534004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18041724 - 18041652
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18041724 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
18041652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45559129 - 45559057
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
45559129 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
45559057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36891010 - 36890475
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
36891010 |
aatatcccaatccaataatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgca |
36890911 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36890910 |
tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattca |
36890811 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890810 |
ccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
36890712 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36890711 |
atgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataag |
36890613 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36890612 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctatagcttaggcttcaattttgctgctagctcttctcccaacctttgattcttc |
36890513 |
T |
 |
| Q |
507 |
aagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
36890512 |
aagtcctcttctctctaaccatttccttctcttgctcc |
36890475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25876244 - 25875713
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
25876244 |
aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgca |
25876145 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25876144 |
aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattca |
25876045 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25876044 |
ccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaa |
25875948 |
T |
 |
| Q |
310 |
catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
25875947 |
catgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aa |
25875849 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct-tctcccaacccttgattctt |
505 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||| |
|
|
| T |
25875848 |
gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcgtagctctatatc---actcttgattctt |
25875752 |
T |
 |
| Q |
506 |
caagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875751 |
caagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
25875713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 93 - 544
Target Start/End: Original strand, 271173 - 271626
Alignment:
| Q |
93 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
271173 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac |
271272 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
271273 |
aacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat |
271372 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
271373 |
aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aata |
271471 |
T |
 |
| Q |
393 |
attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc |
487 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271472 |
attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctctct |
271570 |
T |
 |
| Q |
488 |
tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcct |
544 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271571 |
t--caccctttgattcttcaagtcctcttctctctaaccattttctcctcttgctcct |
271626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 25601990 - 25602482
Alignment:
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56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||| || || |||||| |
|
|
| T |
25601990 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaacaa |
25602089 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
25602090 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttg |
25602189 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25602190 |
aacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaatt |
25602289 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact |
449 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | |
|
|
| T |
25602290 |
aatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat |
25602388 |
T |
 |
| Q |
450 |
ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25602389 |
ctccctagcttaggcttcaattttgctcatagctcttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacc-tttcttctcttgctcc |
25602482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4448377 - 4447924
Alignment:
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93 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
4448377 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaac |
4448278 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4448277 |
aacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat |
4448178 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
4448177 |
aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaata |
4448078 |
T |
 |
| Q |
393 |
attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc |
487 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4448077 |
attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagtttaggcttcaattttgcttctagctctct |
4447979 |
T |
 |
| Q |
488 |
tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4447978 |
t--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
4447924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 531
Target Start/End: Original strand, 28974013 - 28974494
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
28974013 |
attttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
28974112 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatact |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28974113 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctcatact |
28974211 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28974212 |
ttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
28974311 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta |
447 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
28974312 |
attaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatta |
28974409 |
T |
 |
| Q |
448 |
ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc |
531 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28974410 |
atctccctagcttagacttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttc |
28974494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23836990 - 23836499
Alignment:
| Q |
52 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| |||| |
|
|
| T |
23836990 |
ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaaca |
23836891 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23836890 |
acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacatacccatttt-catac |
23836792 |
T |
 |
| Q |
252 |
--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
23836791 |
actttgaacatgtaattccactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga |
23836693 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gtt |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23836692 |
acaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtatgtt |
23836594 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
23836593 |
aatctcctaagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagt-ctcttctctctaaccattgtctcctcttgctcc |
23836499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 433
Target Start/End: Original strand, 32465824 - 32466199
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
32465824 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
32465923 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32465924 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatactttg |
32466022 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32466023 |
aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
32466122 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
433 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||| || |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
32466123 |
aatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaa-aagtgattatgatgaagactaacccc |
32466199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 542
Target Start/End: Original strand, 27261772 - 27262260
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
27261772 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
27261871 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
27261872 |
caatatcaattgatcatgaaacttatca--atttctcatactttgagcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttg |
27261968 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27261969 |
aacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaatt |
27262068 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact |
449 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |
|
|
| T |
27262069 |
aatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaat |
27262167 |
T |
 |
| Q |
450 |
ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctc |
542 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
27262168 |
ctccctagcttaggcttcaatttagctcctagct-ttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgctcctcttgctc |
27262260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24571574 - 24571195
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24571574 |
atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaac |
24571476 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
24571475 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctcatacc |
24571377 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
24571376 |
ttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
24571277 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaa-attgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24571276 |
attaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccct |
24571195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22580106 - 22579688
Alignment:
| Q |
90 |
acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22580106 |
acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcagcaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt- |
22580008 |
T |
 |
| Q |
190 |
atcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||| |||| ||| | || || |||||||||||||| |
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|
| T |
22580007 |
--caacaacaaagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcataccttgatcataaagtttcaccaacaacaattcaatta |
22579911 |
T |
 |
| Q |
288 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
22579910 |
tc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcata |
22579813 |
T |
 |
| Q |
387 |
caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag |
481 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
22579812 |
c-aataattgaaaaattgcaat-agtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaaattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag |
22579715 |
T |
 |
| Q |
482 |
ctcttctcccaacccttgattcttcaagt |
510 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22579714 |
ctc-tcttccaa-tcttgattcttcaagt |
22579688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 443
Target Start/End: Original strand, 67951 - 68347
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49 |
tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
67951 |
tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta |
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T |
 |
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149 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttc |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| || |
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|
| T |
68051 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc |
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T |
 |
| Q |
248 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
68150 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
68249 |
T |
 |
| Q |
348 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaat---tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
68250 |
gaacaattaatctattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
68347 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 9653229 - 9653021
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9653229 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattattcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
9653130 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9653129 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattca |
9653030 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgag |
220 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9653029 |
ccaattgag |
9653021 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21274380 - 21274174
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13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21274380 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaaca-caacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgc- |
21274283 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21274282 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattca |
21274183 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgag |
220 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21274182 |
ccaattgag |
21274174 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 17367119 - 17367276
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485 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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17367217 |
T |
 |
| Q |
486 |
tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17367218 |
tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
17367276 |
T |
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Target: chr2; HSP #16
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91 |
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190 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
31146426 |
caacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaattgaacaggaatcttattacaattca |
31146327 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31146326 |
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31146229 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca |
388 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
31146228 |
aacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattact-cagttaagcacttattcataca |
31146130 |
T |
 |
| Q |
389 |
aataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31146129 |
acaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
31146072 |
T |
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Target: chr2; HSP #17
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192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| || | | |
|
|
| T |
43645896 |
acaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaac |
43645995 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
291 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
43645996 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaa |
43646094 |
T |
 |
| Q |
292 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
43646095 |
caacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatca |
43646163 |
T |
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86 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16935518 |
aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc |
16935591 |
T |
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
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| Q |
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc |
86 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17006178 |
aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc |
17006251 |
T |
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Target: chr2; HSP #20
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414 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
722617 |
atcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgcaaattgcactaaatgat |
722714 |
T |
 |
| Q |
415 |
tatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
722715 |
tatgatgaattctaacccctttaccttag |
722743 |
T |
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Target: chr2; HSP #21
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | ||| |||| ||| |
|
|
| T |
22274689 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgca-acccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa |
22274787 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22274788 |
caacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 25305425 - 25305622
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70 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
169 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25305425 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattgaa |
25305524 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaa-caacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25305525 |
catgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 22283922 - 22284089
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56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| |||| ||| |
|
|
| T |
22283922 |
tttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatcaa |
22284020 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284021 |
aaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #24
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
23821912 |
ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatca |
23821813 |
T |
 |
| Q |
130 |
gcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
23821812 |
tcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca |
23821731 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 31 - 211
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31 |
ttgagcaaaattcataag-tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
23830991 |
ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatca |
23830892 |
T |
 |
| Q |
130 |
gcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
23830891 |
tcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca |
23830810 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6879460 |
acccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcac |
6879559 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6879560 |
caattgagtatattttc-acacatacccatttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| | || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | | || | |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19666501 |
aaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatc |
19666600 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || | || | || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666601 |
aattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacacttatacatactttgaacatg |
19666699 |
T |
 |
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
361 |
Q |
| |
|
|| | || || ||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666700 |
caaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
19666799 |
T |
 |
| Q |
362 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| || |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19666800 |
ttattc-aattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
19666880 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
19669346 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca |
19669247 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||| |||| | || | || ||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||| || || ||| |
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|
| T |
19669246 |
tatcataattcaaccaattaagcat-gattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttc |
19669148 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
396 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || |||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
19669147 |
atgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattga |
19669050 |
T |
 |
| Q |
397 |
aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
19669049 |
aaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttag |
19669002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821533
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| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
361 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
| Q |
362 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || | |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23821614 |
ttact-caattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttag |
23821533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830612
Alignment:
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
361 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
| Q |
362 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || | |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23830693 |
ttact-caattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttag |
23830612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19433618 - 19433452
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| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| |
|
|
| T |
19433618 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag |
19433520 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19433519 |
caacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt |
19433452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25265635 - 25265520
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| Q |
107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | | | ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
25265635 |
atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
25265536 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265535 |
attcaccaattgagca |
25265520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24087409 - 24087345
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| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24087409 |
catcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcacttact-caattaagcactt |
24087345 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 6094676 - 6094843
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| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaatt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | |||| |
|
|
| T |
6094676 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatt-ccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctctta |
6094774 |
T |
 |
| Q |
149 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
6094775 |
acaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
6094843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3478 - 3403
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100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
175 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
3478 |
atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
3403 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22775392 - 22775206
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| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||| || | ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
22775392 |
caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca |
22775294 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22775293 |
tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22780770 - 22780584
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| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||| || | ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
22780770 |
caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca |
22780672 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22780671 |
tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24294767 - 24294685
Alignment:
| Q |
93 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
175 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
24294767 |
acaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
24294685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 437
Target Start/End: Original strand, 17366958 - 17366999
Alignment:
| Q |
396 |
gaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
437 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17366958 |
gaaaattacaataagtgattatgattaattctaaccccctta |
17366999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Original strand, 9636705 - 9636940
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| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| |||||||| | |||||| | || ||| || | | ||||| |
|
|
| T |
9636705 |
acccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaa |
9636804 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||| | ||||| ||| || |
|
|
| T |
9636805 |
caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcattttcaca |
9636903 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat |
285 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9636904 |
tactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat |
9636940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24341595 - 24341519
Alignment:
| Q |
146 |
ttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341595 |
ttaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Original strand, 24277741 - 24277888
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| Q |
70 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
169 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
24277741 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaa |
24277840 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24277841 |
catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
24277888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305720
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| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
25305634 |
aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
25305720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3269 - 3139
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttt-tcacacaaataattgaaaattg---caataag |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
3269 |
catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacataatcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaa |
3172 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3171 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
3139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24294545 - 24294496
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta |
364 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24294545 |
catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatta |
24294496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 7321837 - 7321873
Alignment:
| Q |
407 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7321837 |
taagtgattataatgaattctaacccccttaccttag |
7321873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 22657 - 23148
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
22657 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaa |
22756 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22757 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
22856 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22857 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
22956 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc |
451 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |
|
|
| T |
22957 |
aatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct |
23056 |
T |
 |
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23057 |
ctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
23148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 4485 - 5017
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
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4485 |
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4584 |
T |
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211 |
Q |
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4684 |
T |
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310 |
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4784 |
T |
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311 |
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410 |
Q |
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4785 |
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4881 |
T |
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| Q |
411 |
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507 |
Q |
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4882 |
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4981 |
T |
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508 |
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543 |
Q |
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4982 |
agtcctcttctctctgcccttttctcctcttgctcc |
5017 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 9099 - 9631
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
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| T |
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T |
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211 |
Q |
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9298 |
T |
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310 |
Q |
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9398 |
T |
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410 |
Q |
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9495 |
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411 |
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507 |
Q |
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| T |
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T |
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508 |
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543 |
Q |
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9631 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132039
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Q |
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132531 |
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132432 |
T |
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| Q |
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255 |
Q |
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| Q |
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355 |
Q |
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132232 |
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| Q |
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450 |
Q |
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132132 |
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543 |
Q |
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| T |
132131 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 88274 - 88732
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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288 |
Q |
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88374 |
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88473 |
T |
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| Q |
289 |
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388 |
Q |
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| T |
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88573 |
T |
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| Q |
389 |
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484 |
Q |
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| T |
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88673 |
T |
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| Q |
485 |
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542 |
Q |
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| T |
88674 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 62 - 543
Target Start/End: Original strand, 11659 - 12145
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62 |
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161 |
Q |
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| T |
11659 |
caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacat |
11758 |
T |
 |
| Q |
162 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat |
260 |
Q |
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| T |
11759 |
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11858 |
T |
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| Q |
261 |
gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
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| T |
11859 |
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11958 |
T |
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| Q |
361 |
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453 |
Q |
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| T |
11959 |
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12056 |
T |
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| Q |
454 |
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543 |
Q |
| |
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| T |
12057 |
ctagcttaggcttcaatttaactcctagctcttct-ccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc |
12145 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 213 - 510
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16324
Alignment:
| Q |
213 |
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312 |
Q |
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|||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
313 |
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408 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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504 |
Q |
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| T |
16220 |
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16318 |
T |
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| Q |
505 |
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510 |
Q |
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| T |
16319 |
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16324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 213 - 510
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25855
Alignment:
| Q |
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caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
312 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
313 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac-aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ata |
408 |
Q |
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| T |
25653 |
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25750 |
T |
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| Q |
409 |
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504 |
Q |
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| T |
25751 |
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25849 |
T |
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| Q |
505 |
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510 |
Q |
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| T |
25850 |
tcaagt |
25855 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 88219 - 88274
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Q |
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88274 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 7093 - 7626
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Q |
| |
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aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa |
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T |
 |
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tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcca-ttgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
210 |
Q |
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7193 |
cacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattc |
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T |
 |
| Q |
211 |
a-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa |
309 |
Q |
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| T |
7293 |
aaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
7392 |
T |
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| Q |
310 |
catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa |
409 |
Q |
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| T |
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catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaa |
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T |
 |
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gtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
506 |
Q |
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| T |
7490 |
gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc |
7589 |
T |
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| Q |
507 |
aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aagtcctcttctctctgcccttttctcctcttgctcc |
7626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Original strand, 7581 - 8027
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102 |
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201 |
Q |
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| T |
7581 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaat |
7680 |
T |
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| Q |
202 |
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301 |
Q |
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7681 |
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7780 |
T |
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302 |
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400 |
Q |
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7781 |
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7880 |
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497 |
Q |
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| T |
7881 |
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7980 |
T |
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| Q |
498 |
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543 |
Q |
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| T |
7981 |
tgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctctttctcc |
8027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1772
Alignment:
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89 |
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188 |
Q |
| |
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| T |
1316 |
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1415 |
T |
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288 |
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| T |
1416 |
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1515 |
T |
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388 |
Q |
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| T |
1516 |
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1615 |
T |
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| Q |
389 |
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484 |
Q |
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| T |
1616 |
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1713 |
T |
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| Q |
485 |
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543 |
Q |
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| T |
1714 |
ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
1772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 113 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11875 - 11445
Alignment:
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
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|
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| T |
11875 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcac |
11779 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
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| T |
11778 |
taattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaac |
11680 |
T |
 |
| Q |
311 |
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410 |
Q |
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| T |
11679 |
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11580 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca |
507 |
Q |
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| T |
11579 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagct-taaccccaatccttgattcttca |
11481 |
T |
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| Q |
508 |
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543 |
Q |
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| T |
11480 |
agtcctcttctctctacccatttctcctcttgctcc |
11445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 613
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56 |
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155 |
Q |
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| T |
1103 |
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1004 |
T |
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| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| T |
1003 |
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904 |
T |
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| Q |
256 |
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355 |
Q |
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| T |
903 |
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804 |
T |
 |
| Q |
356 |
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452 |
Q |
| |
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| T |
803 |
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704 |
T |
 |
| Q |
453 |
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543 |
Q |
| |
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| T |
703 |
tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttgaagtcctcttctctctactattttctcctcttgctcc |
613 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7133 - 6638
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
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|
| T |
7133 |
ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
7034 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
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||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
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| T |
7033 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttca |
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T |
 |
| Q |
249 |
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346 |
Q |
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| T |
6935 |
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6836 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccc--ccttatcttagg |
444 |
Q |
| |
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| T |
6835 |
tgaacaattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccacctta-gttagg |
6737 |
T |
 |
| Q |
445 |
ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
| T |
6736 |
ttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcaagttcccttctctctacccttttctcctcttgctcc |
6638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Original strand, 60809 - 61264
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Q |
| |
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| T |
60809 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac |
60908 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
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| T |
60909 |
aacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcat |
61008 |
T |
 |
| Q |
293 |
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392 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
61009 |
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61108 |
T |
 |
| Q |
393 |
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487 |
Q |
| |
|
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| T |
61109 |
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61208 |
T |
 |
| Q |
488 |
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543 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
61209 |
tcccaactcttgattcttcaagtcctcttctctctatccttttctcctcttgctcc |
61264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 70903 - 70414
Alignment:
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
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| T |
70903 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
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caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |
|
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| T |
70803 |
caacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttg |
70704 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca-taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
354 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
70703 |
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70604 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactc |
450 |
Q |
| |
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| T |
70603 |
taatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaatgagttattatg----attctaacccccttaccttagttaggttaatc |
70508 |
T |
 |
| Q |
451 |
cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70507 |
tctctaggttaggcttcaattttgatcctagctcttctctgaacccttgattcctcaagtcctcttctcactaacccttttctcctcttgctcc |
70414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 302 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79679
Alignment:
| Q |
302 |
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401 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
79925 |
catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
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T |
 |
| Q |
402 |
tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct |
497 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagcttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttactcctagctcttctctcaaccct |
79726 |
T |
 |
| Q |
498 |
tgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79725 |
tgattcctcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
79679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 38264 - 38756
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
38264 |
tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
38363 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
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|||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| |
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|
| T |
38364 |
caacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttg |
38463 |
T |
 |
| Q |
256 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
355 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
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| T |
38464 |
aacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaatt |
38563 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc |
451 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |
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|
| T |
38564 |
aattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct |
38663 |
T |
 |
| Q |
452 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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|
| T |
38664 |
ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 48153 - 48600
Alignment:
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95 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
194 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
48153 |
aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa |
48251 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
48252 |
caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa |
48350 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48351 |
cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat |
48450 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc |
491 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48451 |
tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctccc |
48548 |
T |
 |
| Q |
492 |
aacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48549 |
aacccttgattcttcaagtcttcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
48600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 61601 - 62048
Alignment:
| Q |
95 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
194 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
61601 |
aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa |
61699 |
T |
 |
| Q |
195 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
294 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
61700 |
caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa |
61798 |
T |
 |
| Q |
295 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
61799 |
cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat |
61898 |
T |
 |
| Q |
395 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc |
491 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61899 |
tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctccc |
61996 |
T |
 |
| Q |
492 |
aacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61997 |
aacccttgattcttcaagtcttcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
62048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 255095 - 254606
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
255095 |
tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
254996 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actt |
253 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
254995 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt |
254897 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
254896 |
tgaacatgtaattcaact-acaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaa |
254798 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc |
450 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || |
|
|
| T |
254797 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagtaggttaatc |
254699 |
T |
 |
| Q |
451 |
cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
254698 |
tctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
254606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 261701 - 261212
Alignment:
| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
261701 |
tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
261602 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actt |
253 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
261601 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt |
261503 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
261502 |
tgaacatgtaattcaact-actacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaa |
261404 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc |
450 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
261403 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagtaggttaatc |
261305 |
T |
 |
| Q |
451 |
cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
261304 |
tctctagcttagtcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc |
261212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 46106 - 46623
Alignment:
| Q |
31 |
ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
46106 |
ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat |
46205 |
T |
 |
| Q |
131 |
catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca |
230 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46206 |
caacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca |
46305 |
T |
 |
| Q |
231 |
acacatatccatttttca--tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattaga |
327 |
Q |
| |
|
|| | | ||| |||||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
46306 |
-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattaga |
46403 |
T |
 |
| Q |
328 |
gcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattct |
427 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
46404 |
gtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattat |
46502 |
T |
 |
| Q |
428 |
aacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct- |
522 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
46503 |
aaccctcttaccttaattaggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaaatcctcttctctcta |
46602 |
T |
 |
| Q |
523 |
acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46603 |
acccttttctcctcttgctcc |
46623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 543
Target Start/End: Original strand, 40617 - 41116
Alignment:
| Q |
49 |
tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
40617 |
tacccattttcaccaaaccaacaacaacagcttatttcaaattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta |
40716 |
T |
 |
| Q |
149 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |||||| |
|
|
| T |
40717 |
gcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttca |
40814 |
T |
 |
| Q |
249 |
--tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40815 |
catactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcattt |
40914 |
T |
 |
| Q |
346 |
atgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
40915 |
atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtt |
41013 |
T |
 |
| Q |
442 |
aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgc |
540 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41014 |
aggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgc |
41113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 79784 - 79998
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaat---ttatttccaaacaacaaattatgaatcatg |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79784 |
aatatcccaatccaacaagtgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatg |
79883 |
T |
 |
| Q |
110 |
catacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
79884 |
catacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataat |
79982 |
T |
 |
| Q |
209 |
tcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
79983 |
tcaccaattgagcata |
79998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11812 - 11360
Alignment:
| Q |
93 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
11812 |
acaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaac |
11713 |
T |
 |
| Q |
193 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
292 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11712 |
aacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccat |
11613 |
T |
 |
| Q |
293 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11612 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaata |
11514 |
T |
 |
| Q |
393 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct |
488 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11513 |
attaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccataccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcc |
11415 |
T |
 |
| Q |
489 |
cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11414 |
ctccacccttgattcttcaagtactcttctctctacccatttctcctcttgctcc |
11360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15798 - 15367
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15798 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcat |
15699 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataatt |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15698 |
acccaagccatgaattagcatctataacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataatt |
15599 |
T |
 |
| Q |
210 |
caccaattgagcatattttcaacacatatcca-tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaa |
308 |
Q |
| |
|
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| T |
15598 |
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T |
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408 |
Q |
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15499 |
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15401 |
T |
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442 |
Q |
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| T |
15400 |
agtgattatgatgaatgctaacccccttacctta |
15367 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 118246 - 117753
Alignment:
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153 |
Q |
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| T |
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T |
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253 |
Q |
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| T |
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118047 |
T |
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353 |
Q |
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117947 |
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446 |
Q |
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117849 |
T |
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447 |
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543 |
Q |
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| T |
117848 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 109745 - 109252
Alignment:
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153 |
Q |
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T |
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253 |
Q |
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| T |
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109546 |
T |
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| Q |
254 |
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353 |
Q |
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109446 |
T |
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446 |
Q |
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| T |
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T |
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447 |
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543 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
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Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
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Target Start/End: Original strand, 14839 - 15319
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Q |
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| T |
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14938 |
T |
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| Q |
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251 |
Q |
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| T |
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15033 |
T |
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252 |
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349 |
Q |
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| T |
15034 |
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T |
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| Q |
350 |
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446 |
Q |
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| T |
15133 |
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15231 |
T |
 |
| Q |
447 |
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Q |
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T |
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Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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Target Start/End: Original strand, 14179 - 14287
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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acaacaaca |
14287 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 112790 - 112337
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
189 |
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288 |
Q |
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| T |
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112594 |
T |
 |
| Q |
289 |
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388 |
Q |
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| T |
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112495 |
T |
 |
| Q |
389 |
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483 |
Q |
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| T |
112494 |
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T |
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| Q |
484 |
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543 |
Q |
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| T |
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ctctt--caccccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgctcctcttgctcc |
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T |
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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
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Target Start/End: Complemental strand, 103168 - 102814
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Q |
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|||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
103168 |
caacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattca |
103069 |
T |
 |
| Q |
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289 |
Q |
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| T |
103068 |
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102970 |
T |
 |
| Q |
290 |
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388 |
Q |
| |
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| T |
102969 |
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102872 |
T |
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| Q |
389 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
102871 |
aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttaccttag |
102814 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
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Q |
| |
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||||| ||||||| | |||||||| | ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |
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| T |
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atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaac |
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T |
 |
| Q |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
252 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
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| T |
109753 |
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109852 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaa |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
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109853 |
attaatcaattaa |
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T |
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Target: scaffold0338 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
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Target: scaffold0338; HSP #1
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Q |
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attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
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T |
 |
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154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
| |
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| T |
9051 |
aacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
9150 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
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| T |
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tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaa |
9250 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg--aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta |
447 |
Q |
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| T |
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ttaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataa-tgattatgataaattctaacccccttaccttagttagatta |
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T |
 |
| Q |
448 |
ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
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Q |
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atctccctagcttagacttcaattttgctcctagctcaac-cccaattcttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgcttcctcttgctcc |
9445 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 50 - 543
Target Start/End: Original strand, 106 - 599
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Q |
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| T |
106 |
acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
203 |
T |
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| Q |
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caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
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| T |
204 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatac |
303 |
T |
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| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
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| T |
304 |
acttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
403 |
T |
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| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt |
446 |
Q |
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| T |
404 |
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503 |
T |
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| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
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| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
504 |
aatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagctctctttc--accctttgttcttcaagtcctcttctctctaaccattttctcctcttgctcc |
599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 90 - 532
Target Start/End: Original strand, 9937 - 10380
Alignment:
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189 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9937 |
acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc |
10036 |
T |
 |
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287 |
Q |
| |
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| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
10037 |
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10134 |
T |
 |
| Q |
288 |
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387 |
Q |
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| T |
10135 |
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10234 |
T |
 |
| Q |
388 |
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482 |
Q |
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| T |
10235 |
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10331 |
T |
 |
| Q |
483 |
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532 |
Q |
| |
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| T |
10332 |
tc-tctcccattccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttct |
10380 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 33587 - 34120
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
33587 |
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33683 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
33684 |
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33783 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
33784 |
ccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaaca |
33883 |
T |
 |
| Q |
312 |
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410 |
Q |
| |
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| T |
33884 |
tgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaa |
33982 |
T |
 |
| Q |
411 |
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506 |
Q |
| |
|
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| T |
33983 |
tgattatgatgaattctaatccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagct-ttcccccaatccttgattcttc |
34081 |
T |
 |
| Q |
507 |
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543 |
Q |
| |
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||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
34082 |
aagttccttttctctctaaccctttcttcctcttgctcc |
34120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5040
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5531 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagca |
5432 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- |
249 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5431 |
acaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttc-gcacata-cctattttcatac |
5334 |
T |
 |
| Q |
250 |
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349 |
Q |
| |
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|
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| T |
5333 |
actttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatga |
5235 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
5234 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagatt |
5136 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5135 |
aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
5040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9130 - 8673
Alignment:
| Q |
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188 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9130 |
aacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt |
9031 |
T |
 |
| Q |
189 |
tatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
287 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9030 |
taacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaatta |
8932 |
T |
 |
| Q |
288 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
386 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8931 |
tccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcata |
8832 |
T |
 |
| Q |
387 |
caaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta |
480 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||| |
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| T |
8831 |
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8734 |
T |
 |
| Q |
481 |
gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8733 |
gctc-tcttccaa-tcttgattcttcaagttcctcttctctcaaacccttt-tcctcttgctcc |
8673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 49 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 864 - 372
Alignment:
| Q |
49 |
tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
148 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
864 |
taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta |
765 |
T |
 |
| Q |
149 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tc |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |
|
|
| T |
764 |
gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctc |
666 |
T |
 |
| Q |
248 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
665 |
atactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
566 |
T |
 |
| Q |
348 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
565 |
gaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
468 |
T |
 |
| Q |
442 |
aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
467 |
agattaatctccctagattaggcttcaattttgatcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct |
372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 50 - 510
Target Start/End: Original strand, 21473 - 21933
Alignment:
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
21473 |
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21571 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tca |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
21572 |
caacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctca |
21670 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21671 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
21769 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
21770 |
aacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattataacccccttaccttagttag |
21867 |
T |
 |
| Q |
444 |
gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt |
510 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21868 |
gttaatctctctaccttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgattcttcaagt |
21933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 50 - 535
Target Start/End: Original strand, 31172 - 31660
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
31172 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag |
31270 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tca |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31271 |
caacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctca |
31369 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31370 |
tactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatg |
31468 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
31469 |
aacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
31566 |
T |
 |
| Q |
444 |
gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31567 |
gttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgactcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct |
31660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 332 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47346
Alignment:
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332 |
gaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaac |
430 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaac |
47457 |
T |
 |
| Q |
431 |
ccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---a |
523 |
Q |
| |
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||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | |
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|
| T |
47456 |
ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgactcttcaagttctcccttctctctaa |
47358 |
T |
 |
| Q |
524 |
cccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
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| T |
47357 |
cccttttctcct |
47346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11945 - 11497
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100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
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| T |
11945 |
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T |
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299 |
Q |
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399 |
Q |
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11646 |
T |
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495 |
Q |
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11547 |
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543 |
Q |
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| T |
11546 |
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11497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 535
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85781
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56 |
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155 |
Q |
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| T |
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85397 |
T |
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156 |
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255 |
Q |
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355 |
Q |
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85597 |
T |
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450 |
Q |
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| T |
85598 |
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85695 |
T |
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535 |
Q |
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| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 510
Target Start/End: Original strand, 159266 - 159722
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Q |
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| T |
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159362 |
T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
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| T |
159363 |
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159462 |
T |
 |
| Q |
253 |
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352 |
Q |
| |
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| T |
159463 |
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159562 |
T |
 |
| Q |
353 |
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447 |
Q |
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| T |
159563 |
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159660 |
T |
 |
| Q |
448 |
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510 |
Q |
| |
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|| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
159661 |
atctccctagcttaggcttcaattttgctccaagctc-tcttccactccttgattcttcaagt |
159722 |
T |
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Target: scaffold0025 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
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Target Start/End: Original strand, 146523 - 146848
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Q |
| |
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||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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146622 |
T |
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| Q |
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211 |
Q |
| |
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| T |
146623 |
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146722 |
T |
 |
| Q |
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311 |
Q |
| |
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|
| T |
146723 |
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146822 |
T |
 |
| Q |
312 |
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337 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
146823 |
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146848 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 53399 - 53699
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241 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | || || ||||||| ||||||| ||| | |
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|
| T |
53399 |
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53497 |
T |
 |
| Q |
242 |
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341 |
Q |
| |
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| T |
53498 |
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53597 |
T |
 |
| Q |
342 |
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438 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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| T |
53598 |
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53695 |
T |
 |
| Q |
439 |
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442 |
Q |
| |
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|||| |
|
|
| T |
53696 |
ctta |
53699 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || || |
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|
| T |
85690 |
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85788 |
T |
 |
| Q |
347 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagca |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85789 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
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Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| || |
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| T |
253270 |
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253171 |
T |
 |
| Q |
156 |
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255 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |
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|
| T |
253170 |
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253071 |
T |
 |
| Q |
256 |
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355 |
Q |
| |
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| T |
253070 |
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252971 |
T |
 |
| Q |
356 |
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424 |
Q |
| |
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|||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
252970 |
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252902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Original strand, 164177 - 164669
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
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| T |
164177 |
ccattttcaccaaaacaccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaaca |
164276 |
T |
 |
| Q |
152 |
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251 |
Q |
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| T |
164277 |
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164374 |
T |
 |
| Q |
252 |
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349 |
Q |
| |
|
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| T |
164375 |
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164473 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt |
446 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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| T |
164474 |
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164572 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164573 |
aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct-taaccccaatcattgattcttcaagtccccttctctctaagccttttctcctcttgctcc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 162468 - 162299
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56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac-aaca |
154 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
162468 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaaca |
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T |
 |
| Q |
155 |
acaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162368 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
162299 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 166546 - 166385
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| Q |
56 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | |||||||||| |
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|
| T |
166546 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaata----ttaacaacaa |
166451 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
166450 |
caac---cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
166385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 70 - 443
Target Start/End: Original strand, 1 - 371
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70 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||||||||||| |||||| |
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| T |
1 |
caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat |
100 |
T |
 |
| Q |
170 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaa |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
101 |
catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattcaa |
200 |
T |
 |
| Q |
270 |
ctaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcca |
369 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |
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| T |
201 |
ccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatg---tcatcattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcaccca |
297 |
T |
 |
| Q |
370 |
attaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
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| T |
298 |
attaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag |
371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 3492 - 3591
Alignment:
| Q |
63 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
3492 |
aaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatc |
3591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 153 - 543
Target Start/End: Original strand, 70676 - 71071
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| Q |
153 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
70676 |
caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcata |
70774 |
T |
 |
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
70775 |
ctttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaa |
70873 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt |
446 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
70874 |
ctattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt |
70972 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70973 |
aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttctctcttctctttaacccttttctcctcttgctcc |
71071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 535
Target Start/End: Original strand, 31008 - 31496
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || | |
|
|
| T |
31008 |
atttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagc |
31107 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataa-ttcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |
|
|
| T |
31108 |
aacaacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatata-ccattttcttatac |
31205 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31206 |
tttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
31304 |
T |
 |
| Q |
352 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaa--cccccttatc----ttagg |
444 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |
|
|
| T |
31305 |
aaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccccttaccttagttaga |
31403 |
T |
 |
| Q |
445 |
ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt--cctcttttctct-acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31404 |
ttaatctccctagcttaggcttcaattttgatcctagctc-tcttccaatccttgattcatcaagttaccccttctctctaacccttttctcct |
31496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 97422 - 97175
Alignment:
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||| |||| | || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
97422 |
acccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaattagtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaa |
97323 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| ||||| |
|
|
| T |
97322 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaaca |
97224 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
97223 |
tatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatca |
97175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 1341 - 1732
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| || || |
|
|
| T |
1341 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgacatag |
1440 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |
|
|
| T |
1441 |
caacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaatttctcat |
1540 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
1541 |
actttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatagga |
1640 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1641 |
acaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
1732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 523
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2352
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
1880 |
attttcaccaaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaac |
1979 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccattttt-catac |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
1980 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatata-ccattttcgcatac |
2077 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
2078 |
tttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagc |
2177 |
T |
 |
| Q |
352 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta----tcttaggtt |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
2178 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttactttagttagatt |
2275 |
T |
 |
| Q |
447 |
actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctcta |
523 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
2276 |
aatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagttc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctcta |
2352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 164 - 543
Target Start/End: Original strand, 4359 - 4738
Alignment:
| Q |
164 |
attgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatg |
261 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4359 |
attgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatg |
4456 |
T |
 |
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4457 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
4555 |
T |
 |
| Q |
362 |
ttaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---ttactccctctagc |
458 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| |
|
|
| T |
4556 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-acgtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctccctagc |
4654 |
T |
 |
| Q |
459 |
ttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4655 |
ttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
4738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Original strand, 4269 - 4358
Alignment:
| Q |
52 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4269 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 25222 - 25564
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25222 |
atgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
25320 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25321 |
aaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
25420 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25421 |
tacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
25520 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25521 |
attgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag |
25564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 24921 - 25210
Alignment:
| Q |
50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | || |
|
|
| T |
24921 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatat |
25017 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
25018 |
caacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctac |
25117 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatca |
342 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
25118 |
acttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 10
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
351 |
atgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaaca |
252 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
251 |
aaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttca |
152 |
T |
 |
| Q |
300 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
151 |
tacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
52 |
T |
 |
| Q |
400 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
10 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6304
Alignment:
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
253 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
6591 |
aacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
6492 |
T |
 |
| Q |
254 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6491 |
tgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacag |
6392 |
T |
 |
| Q |
354 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6391 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
6304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Original strand, 4907 - 5235
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| | || ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
4907 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
5006 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
255 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5007 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgtg |
5106 |
T |
 |
| Q |
256 |
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355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaatt |
5206 |
T |
 |
| Q |
356 |
aatcaattaatccaattaagcacttttca |
384 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5207 |
aattaattcacccaattaagcacttttca |
5235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 510
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3742
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89 |
aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt |
3417 |
T |
 |
| Q |
189 |
tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
287 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3418 |
caactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaatta |
3516 |
T |
 |
| Q |
288 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
386 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
3517 |
taaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcata |
3615 |
T |
 |
| Q |
387 |
caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag |
481 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3616 |
caa-taattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatcttaagcttcaatttagctcctag |
3714 |
T |
 |
| Q |
482 |
ctcttctcccaacccttgattcttcaagt |
510 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3715 |
ctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt |
3742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 5863 - 6261
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111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
5863 |
aatatctcaatccaacaatttgagcaaact-cataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa |
5961 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |
|
|
| T |
5962 |
cactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataattta |
6061 |
T |
 |
| Q |
212 |
-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttc--atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaa |
308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6062 |
accaattgagcatattttcaacatata-ccatttttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaa |
6160 |
T |
 |
| Q |
309 |
acatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaat |
407 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6161 |
acatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaat |
6259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 572
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| Q |
57 |
ttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac |
156 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | | | || | |||| |
|
|
| T |
739 |
ttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaac |
640 |
T |
 |
| Q |
157 |
aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
639 |
aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 543
Target Start/End: Original strand, 12590 - 12726
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| Q |
411 |
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506 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12590 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtc-tcttccactccttgattcttc |
12688 |
T |
 |
| Q |
507 |
aag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12689 |
aagttccccttctctctaaccctttttcctcttgctcc |
12726 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 290 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2857
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| Q |
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389 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa |
3013 |
T |
 |
| Q |
390 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctt |
486 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3012 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttagtctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct-ta |
2915 |
T |
 |
| Q |
487 |
ctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914 |
accccaatccttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttttctcctcttgctcc |
2857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 442
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20524
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| Q |
192 |
caacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa |
389 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
390 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
20524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
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Target Start/End: Complemental strand, 13719 - 13507
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13719 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
13620 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13619 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
13520 |
T |
 |
| Q |
212 |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
13519 |
ccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21693 - 21481
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21693 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacatataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca |
21594 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21593 |
tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
21494 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
21493 |
ccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 55503 - 55715
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13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55503 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgca |
55602 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55603 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
55702 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
55703 |
ccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 94018 - 93730
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91 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
190 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
94018 |
caacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcacttattaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattta |
93919 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
288 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
93918 |
acaac-acatagcatacttcaataatttgagcata-tttcaacaaata-ccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattat |
93822 |
T |
 |
| Q |
289 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattt-tatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
93821 |
caaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcactt |
93730 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 315 - 442
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315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg |
412 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || || ||||| |||||| || ||| || |
|
|
| T |
104645 |
catcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaaattacactaaatg |
104548 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
104547 |
attatgatgaattctaacccacttacctta |
104518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
93721 |
gcttcacttttgctcctagctct-ctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctcttctcct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0574 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
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Target: scaffold0574; HSP #1
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| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9839 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
9740 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
9739 |
acccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcac |
9640 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
9639 |
taattgagcata |
9628 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
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Target Start/End: Complemental strand, 34010 - 33529
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54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
34010 |
atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac |
33912 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
33911 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataacacttcttcatact |
33813 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
33812 |
ttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaaca |
33713 |
T |
 |
| Q |
353 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt |
445 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
33712 |
attaatcaattact-caattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat |
33615 |
T |
 |
| Q |
446 |
tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc |
531 |
Q |
| |
|
|| | || |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33614 |
taattcc-ctagctcaagcttcaatttagctcatagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaacccttttc |
33529 |
T |
 |
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Target: scaffold0597 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
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Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1099
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111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1311 |
aatattccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgca |
1212 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1211 |
tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca |
1112 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
1111 |
ccaattgagcata |
1099 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10094
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13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10298 |
aatatctcaatctaacaattgagcaaaacacataaatatccactttcaccaaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
10199 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
10198 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgc |
10099 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
10098 |
caatt |
10094 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17721 |
caattgagcaaaacatataagtatccatttccaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaat |
17622 |
T |
 |
| Q |
128 |
tagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17621 |
tagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 193820 - 193609
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13 |
aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
193820 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgca |
193721 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
193720 |
tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattca |
193622 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
193621 |
ccaattgagcata |
193609 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 186861 - 186647
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
186861 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcat |
186762 |
T |
 |
| Q |
109 |
gcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
186761 |
gcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataat |
186663 |
T |
 |
| Q |
209 |
tcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
186662 |
tcaccaattgagcata |
186647 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0706 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:
Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
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Target Start/End: Complemental strand, 6870 - 6664
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6870 |
aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
6776 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6775 |
acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac |
6676 |
T |
 |
| Q |
213 |
caattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
6675 |
caattgagcata |
6664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
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Target Start/End: Original strand, 14887 - 15083
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29 |
aattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaat |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14887 |
aattgagaaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaat |
14986 |
T |
 |
| Q |
128 |
tagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14987 |
tagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19850
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actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
19850 |
T |
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Target: scaffold0122; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24154
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actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
350 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
24154 |
T |
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Target: scaffold0122; HSP #3
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aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaaca |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
24471 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca |
24374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
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Target: scaffold0039; HSP #1
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aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19233 |
aatatcccaattcaacaattgagcaaaactcataagtacctattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat |
19134 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19133 |
acccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa |
19049 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
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attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||| |
|
|
| T |
12811 |
attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac |
12712 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12711 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
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Target: scaffold0243; HSP #1
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50 |
acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
2603 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag |
2504 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||| ||| |
|
|
| T |
2503 |
gaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatgtcactttctca |
2405 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
2404 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatg |
2305 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2304 |
attaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
2210 |
T |
 |
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148 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
806 |
taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta |
707 |
T |
 |
| Q |
149 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatat |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
706 |
gtaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatatat |
617 |
T |
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206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
19224 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa |
19323 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19324 |
attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt |
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T |
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107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
21308 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa |
21407 |
T |
 |
| Q |
207 |
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266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21408 |
attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt |
21467 |
T |
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Target: scaffold0303; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
355 |
aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcat |
261 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
260 |
actcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcac |
161 |
T |
 |
| Q |
213 |
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224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
160 |
caattgagcata |
149 |
T |
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Target: scaffold0183 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
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Target: scaffold0183; HSP #1
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422 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| | || |||||||||| || || ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
5689 |
gagcacaagttttaacatctatgaacaattaatcacttattc-aattaagcacttattcatataa-taattgaaaaattacactaaaatgattatcatga |
5592 |
T |
 |
| Q |
423 |
attctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctttt |
518 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
5591 |
attataacccccttatcttagttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctaactcttctcccaacccttgattcttcaagttctcctat |
5492 |
T |
 |
| Q |
519 |
ctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5491 |
ctctacccttatctcctcttgctcc |
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T |
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Target: scaffold0589 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
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310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata |
408 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
409 |
agtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct |
504 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatccttgaatcg |
8222 |
T |
 |
| Q |
505 |
tcaagt |
510 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
8223 |
tcaagt |
8228 |
T |
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Target: scaffold0589; HSP #2
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat |
7913 |
T |
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Name: scaffold0260
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Target: scaffold0260; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
505 |
tcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8765 |
tcaagtcctcttctctatacccttttctcctcttactcc |
8803 |
T |
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Target: scaffold0053 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
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Target: scaffold0053; HSP #1
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || || || | |||||| |||||| |
|
|
| T |
77128 |
tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaa |
77029 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
77028 |
caacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatacttt |
76930 |
T |
 |
| Q |
255 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
354 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||| || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
76929 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaat |
76830 |
T |
 |
| Q |
355 |
taatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
76829 |
tactcaattact-caattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
76740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
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Target: scaffold0244; HSP #1
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112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22836 |
aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat |
22737 |
T |
 |
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
148 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22736 |
acccaaaccatgaattagcatccataacatcactta |
22701 |
T |
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Target: scaffold0091 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
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Target: scaffold0091; HSP #1
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
32165 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
32264 |
T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
32265 |
acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttcatac |
32362 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32363 |
actttgaacatgtaatt |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
42138 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
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T |
 |
| Q |
152 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
42038 |
acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttcatac |
41941 |
T |
 |
| Q |
250 |
actttgaacatgtaatt |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41940 |
actttgaacatgtaatt |
41924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
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Target: scaffold0876; HSP #1
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416 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatta |
99 |
T |
 |
| Q |
417 |
tgatgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
100 |
tgatgaacactaacccccttacctta |
125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0184; HSP #1
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tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
31569 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
31470 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31469 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0078; HSP #1
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tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
41275 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
41374 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41375 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0116; HSP #1
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
30057 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaa |
30156 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac |
198 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30157 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
30199 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6372 - 6204
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||||||| |
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| T |
6372 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaacaa |
6273 |
T |
 |
| Q |
156 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
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| T |
6272 |
caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7271 - 6983
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190 |
Q |
| |
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|||||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |
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| T |
7271 |
caacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatcca |
7172 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |
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| T |
7171 |
ataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatc |
7073 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
380 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
7072 |
aacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatcatttact-caattaagcactt |
6983 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 336
Target Start/End: Original strand, 35479 - 35724
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91 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
190 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| || | |
|
|
| T |
35479 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttca |
35578 |
T |
 |
| Q |
191 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35579 |
acaacaacatagcataaatcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatc |
35677 |
T |
 |
| Q |
290 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35678 |
aataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt |
35724 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 69480 - 69810
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |
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|
| T |
69480 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
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T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |
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|
| T |
69580 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaaca |
69678 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
409 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
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| T |
69679 |
tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
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T |
 |
| Q |
410 |
gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgattatgattgaattctaacccccttatctta |
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T |
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Target: scaffold0833 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:
Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
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Target Start/End: Original strand, 3261 - 3407
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149 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |
|
|
| T |
3261 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
3358 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3359 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
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Target Start/End: Original strand, 28497 - 28891
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acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa |
149 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28497 |
acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
28595 |
T |
 |
| Q |
150 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28596 |
caacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca |
28694 |
T |
 |
| Q |
249 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || | || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |
|
|
| T |
28695 |
tactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatgataacaactttg |
28794 |
T |
 |
| Q |
349 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
28795 |
gacaattaatcatttact-caattaagaacttattcatac-aacaattgaaaatttaaactaaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttag |
28891 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 70329 - 70097
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catcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca-ataagt |
411 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || | || | |
|
|
| T |
70329 |
catcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaatta-tacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaat |
70232 |
T |
 |
| Q |
412 |
gattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca |
507 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70231 |
gattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcatttttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttca |
70133 |
T |
 |
| Q |
508 |
ag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
70132 |
agttcctctactctctaccccttt-tcctcttgctcc |
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T |
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Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
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Target Start/End: Complemental strand, 70543 - 70418
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Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||| |||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| | |
|
|
| T |
70543 |
atgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggtcctcatcataattcaacaacaata |
70444 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattca-ccaattgagcata |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70443 |
taacataattcacccaattgagcata |
70418 |
T |
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Target: scaffold0700 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
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Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 360
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2795
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aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | |||||| |||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2498 |
aaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc |
2597 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| || || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2598 |
aattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatg |
2696 |
T |
 |
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
360 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2697 |
caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatca |
2795 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
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Target: scaffold0123; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 8020 - 8367
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| |||||| | || ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8020 |
atgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattccacaacaaca |
8119 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||| | || | || | || | ||||||||||||||| || | || |||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
8120 |
tagcataattcacccaattgagcataaat-cataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttc |
8218 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
397 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8219 |
atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattga |
8316 |
T |
 |
| Q |
398 |
aaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggtt |
446 |
Q |
| |
|
||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8317 |
aaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaggtt |
8367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 89886 - 89656
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315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagt-g |
412 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
89886 |
catcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaag |
89790 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
89789 |
attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tctttcaatccttgattcttcaa |
89691 |
T |
 |
| Q |
509 |
g-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc |
543 |
Q |
| |
|
| ||| ||| |||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
89690 |
gttccacttctctctaacccttt-tcctcttgctcc |
89656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 90131 - 90054
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50 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
90131 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaat |
90054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 197477 - 197147
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113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| | |||||| |
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|
| T |
197477 |
acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaa |
197378 |
T |
 |
| Q |
213 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
311 |
Q |
| |
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|| || ||||||| || |||| ||| | ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || | || ||||||||| ||||| |
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|
| T |
197377 |
catttagagcataatt-caacttataacactttcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaaca |
197279 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
410 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |
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| T |
197278 |
tatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaacaattaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa |
197180 |
T |
 |
| Q |
411 |
tgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
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| T |
197179 |
tgattatgattgaattctaacccccttacctta |
197147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1241
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-t |
411 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
1370 |
catcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatat |
1273 |
T |
 |
| Q |
412 |
gattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1272 |
gattatgatgaattctaacccccttaccttag |
1241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9625 - 9496
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-t |
411 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
9625 |
catcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatat |
9528 |
T |
 |
| Q |
412 |
gattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9527 |
gattatgatgaattctaacccccttaccttag |
9496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 336
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6907
Alignment:
| Q |
63 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
6634 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttaggagtaacaacatc |
6733 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
261 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||||| | ||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6734 |
aattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
6832 |
T |
 |
| Q |
262 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
336 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6833 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 11017 - 11438
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
11017 |
aatatcacaatccatcaatttgagcaaaactcacaagtacccatttttac-aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaa |
11115 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | | ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
11116 |
cacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttca |
11215 |
T |
 |
| Q |
212 |
ccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
310 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
11216 |
actatttgagcataatt-caacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaac |
11314 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgccatcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat |
407 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || || ||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || | |
|
|
| T |
11315 |
atatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacact |
11412 |
T |
 |
| Q |
408 |
aagtgattatgatgaattctaacccc |
433 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11413 |
aaatgattatgatgaattataacccc |
11438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89584
Alignment:
| Q |
151 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89655 |
aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 433
Target Start/End: Original strand, 79549 - 79883
Alignment:
| Q |
100 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
79549 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca |
79648 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || | || ||||||| ||||||| |||| || | |||||| ||||| || || ||| |
|
|
| T |
79649 |
tatcataattcaaccaattaagcata-attcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttc |
79747 |
T |
 |
| Q |
299 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
396 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
79748 |
atgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattga |
79845 |
T |
 |
| Q |
397 |
aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccc |
433 |
Q |
| |
|
|||||| || | || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79846 |
aaaattacactaaaataattatgatgaattctaacccc |
79883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1439
Alignment:
| Q |
272 |
aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
| Q |
372 |
taagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||| || || | || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttag |
1439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8584
Alignment:
| Q |
272 |
aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
| Q |
372 |
taagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||| || || | || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttag |
8584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 535
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11111
Alignment:
| Q |
315 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag-tg |
412 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
10887 |
catcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattatactaaaatg |
10984 |
T |
 |
| Q |
413 |
attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
10985 |
attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-cctctagctctagcttcacttttgctcctagctc-tctcccaatctttgatccttcaa |
11082 |
T |
 |
| Q |
509 |
g-tcctcttttctct-acccttttctcct |
535 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11083 |
gttcctcttctctctaaccattttctcct |
11111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 31073 - 31373
Alignment:
| Q |
143 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga-gcatattttcaacacatatcca |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||| |||||| || |||||| || || | ||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
31073 |
cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataatt-caacatataacac |
31171 |
T |
 |
| Q |
242 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
341 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||| || || ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
31172 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaac |
31271 |
T |
 |
| Q |
342 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttat |
438 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272 |
aactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttac |
31369 |
T |
 |
| Q |
439 |
ctta |
442 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
31370 |
ctta |
31373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:
Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2572
Alignment:
| Q |
54 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
2419 |
attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac |
2518 |
T |
 |
| Q |
154 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataa |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2519 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataa |
2572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 282 - 436
Alignment:
| Q |
63 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
162 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
282 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatc |
381 |
T |
 |
| Q |
163 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
382 |
aattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51389 - 51312
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51389 |
cttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 147478 - 147590
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcccaatccagcaattga-gcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
147478 |
aatatcccaatccaacaatttaagcaaaactcataagtacccattttcaccaaac---caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa |
147574 |
T |
 |
| Q |
112 |
tacccaagccatgaat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
147575 |
cacccaagccatgaat |
147590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43884 - 43692
Alignment:
| Q |
251 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
43884 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaa |
43785 |
T |
 |
| Q |
351 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43784 |
caattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
43692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 41666 - 41778
Alignment:
| Q |
107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
41666 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
41765 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattga |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
41766 |
attcaccaattga |
41778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22443 - 22322
Alignment:
| Q |
323 |
ttagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataatt-gaaaattgcaat-aagtgattatga |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||| || | || ||||||||| |
|
|
| T |
22443 |
ttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaa-tcatccaattaatcacttattcatac-aataattaaaaaataacactaaaatgattatga |
22346 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgaattctaacccccttatcttag |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22345 |
tgaattctaacccccttaccttag |
22322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 13524 - 13639
Alignment:
| Q |
107 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
13524 |
atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
13623 |
T |
 |
| Q |
207 |
attcaccaattgagca |
222 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13624 |
attcatcaattgagca |
13639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4726
Alignment:
| Q |
113 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
211 |
Q |
| |
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| T |
4628 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
4726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22110
Alignment:
| Q |
145 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
22054 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacata |
22110 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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