View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13069_low_3 (Length: 561)

Name: NF13069_low_3
Description: NF13069
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13069_low_3
NF13069_low_3
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (13-543)||(35054679-35055213)
chr1 (100-541)||(49967660-49968105)
chr1 (95-543)||(22402900-22403351)
chr1 (13-543)||(27329555-27330077)
chr1 (150-535)||(9783863-9784248)
chr1 (100-543)||(21718238-21718684)
chr1 (54-435)||(41212033-41212415)
chr1 (257-543)||(35522142-35522432)
chr1 (54-443)||(51627557-51627947)
chr1 (13-224)||(21859934-21860145)
chr1 (56-380)||(20177141-20177464)
chr1 (408-543)||(20346342-20346480)
chr1 (54-224)||(35522432-35522601)
chr1 (153-443)||(16645975-16646267)
chr1 (151-443)||(16656699-16656993)
chr1 (50-224)||(22366979-22367152)
chr1 (50-224)||(15861547-15861719)
chr1 (296-443)||(19603303-19603450)
chr1 (62-433)||(22143264-22143636)
chr1 (63-224)||(44035092-44035252)
chr1 (296-437)||(22829325-22829466)
chr1 (56-211)||(13376966-13377121)
chr1 (94-200)||(9784237-9784343)
chr1 (113-443)||(17608951-17609282)
chr1 (296-443)||(20955333-20955480)
chr1 (113-442)||(37233754-37234084)
chr1 (50-380)||(21194974-21195303)
chr1 (245-442)||(13376752-13376951)
chr1 (315-437)||(36356191-36356315)
chr1 (145-217)||(5768289-5768361)
chr1 (95-175)||(27674801-27674881)
chr1 (489-543)||(41212420-41212475)
chr1 (93-175)||(36356455-36356537)
chr1 (315-380)||(27675021-27675085)
chr1 (107-266)||(20445697-20445856)
chr1 (107-266)||(20531462-20531621)
chr1 (70-178)||(22829583-22829691)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (13-543)||(17100574-17101109)
chr3 (13-543)||(17101259-17101794)
chr3 (31-543)||(54423954-54424469)
chr3 (100-543)||(50111841-50112288)
chr3 (116-543)||(317301-317729)
chr3 (52-543)||(16995852-16996343)
chr3 (56-543)||(22144063-22144553)
chr3 (95-543)||(6154121-6154572)
chr3 (54-543)||(14304013-14304504)
chr3 (167-543)||(34439132-34439513)
chr3 (54-543)||(35123661-35124152)
chr3 (50-484)||(12349388-12349830)
chr3 (54-543)||(14295402-14295894)
chr3 (54-485)||(14298386-14298820)
chr3 (13-337)||(19260839-19261161)
chr3 (102-543)||(16181739-16182180)
chr3 (101-535)||(8631801-8632238)
chr3 (203-543)||(38527842-38528183)
chr3 (54-543)||(14301029-14301521)
chr3 (54-543)||(55440649-55441132)
chr3 (50-535)||(17522686-17523176)
chr3 (52-535)||(13817477-13817958)
chr3 (102-543)||(19570482-19570923)
chr3 (100-543)||(17938584-17939024)
chr3 (31-543)||(11060797-11061312)
chr3 (90-535)||(3578091-3578539)
chr3 (49-443)||(17139467-17139862)
chr3 (13-224)||(38167836-38168048)
chr3 (339-543)||(6146559-6146767)
chr3 (13-224)||(23492296-23492507)
chr3 (89-543)||(12560027-12560484)
chr3 (13-224)||(45581554-45581765)
chr3 (91-443)||(11328858-11329207)
chr3 (13-224)||(2844113-2844325)
chr3 (13-224)||(3992473-3992684)
chr3 (13-224)||(53770963-53771175)
chr3 (95-352)||(53898440-53898697)
chr3 (50-380)||(12488684-12489013)
chr3 (13-224)||(54038245-54038456)
chr3 (152-543)||(30207278-30207676)
chr3 (307-523)||(14527890-14528110)
chr3 (91-437)||(14059113-14059459)
chr3 (13-224)||(16261384-16261587)
chr3 (95-319)||(6146764-6146987)
chr3 (100-443)||(16880133-16880478)
chr3 (49-443)||(39656485-39656879)
chr3 (62-230)||(14528118-14528287)
chr3 (13-136)||(28558129-28558252)
chr3 (440-543)||(13835975-13836078)
chr3 (91-377)||(17191542-17191827)
chr3 (95-245)||(12349822-12349971)
chr3 (50-224)||(30152902-30153076)
chr3 (50-224)||(33341843-33342015)
chr3 (50-224)||(54685422-54685594)
chr3 (93-365)||(15876071-15876343)
chr3 (56-220)||(17956109-17956273)
chr3 (70-380)||(3576396-3576705)
chr3 (50-224)||(7853944-7854116)
chr3 (227-380)||(17204818-17204970)
chr3 (263-363)||(11196293-11196393)
chr3 (401-510)||(40939437-40939549)
chr3 (52-443)||(9590647-9591039)
chr3 (315-380)||(15517856-15517920)
chr3 (227-443)||(47784654-47784876)
chr3 (307-443)||(11882112-11882248)
chr3 (100-175)||(38811170-38811245)
chr3 (247-443)||(14080666-14080864)
chr3 (50-168)||(19946660-19946776)
chr3 (70-211)||(47784873-47785014)
chr3 (50-380)||(12952924-12953254)
chr3 (70-217)||(14814885-14815032)
chr3 (407-442)||(15550918-15550953)
chr3 (94-211)||(34559903-34560020)
chr3 (91-211)||(17204701-17204821)
chr3 (315-365)||(38810980-38811030)
chr3 (115-224)||(1990828-1990937)
chr3 (411-443)||(17960205-17960237)
chr3 (411-443)||(38810908-38810940)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (20-543)||(3894955-3895480)
chr7 (13-543)||(26070055-26070589)
chr7 (13-543)||(26093842-26094376)
chr7 (31-543)||(12369629-12370146)
chr7 (95-543)||(143651-144095)
chr7 (56-543)||(15822223-15822712)
chr7 (13-543)||(13862723-13863255)
chr7 (93-543)||(45451958-45452410)
chr7 (93-543)||(12758990-12759444)
chr7 (95-543)||(47289787-47290240)
chr7 (54-541)||(11287381-11287871)
chr7 (95-543)||(44865233-44865685)
chr7 (54-535)||(12247916-12248404)
chr7 (53-543)||(35094780-35095270)
chr7 (89-543)||(16569797-16570254)
chr7 (89-543)||(16595408-16595865)
chr7 (53-543)||(39046419-39046907)
chr7 (63-442)||(7283956-7284333)
chr7 (89-531)||(49047476-49047922)
chr7 (13-224)||(32494167-32494378)
chr7 (19-224)||(3049517-3049717)
chr7 (13-224)||(2190307-2190519)
chr7 (14-224)||(111390-111599)
chr7 (13-224)||(2028843-2029055)
chr7 (54-443)||(13274751-13275130)
chr7 (13-224)||(42056410-42056622)
chr7 (50-442)||(13377489-13377883)
chr7 (63-380)||(17223896-17224212)
chr7 (440-543)||(26069397-26069501)
chr7 (50-224)||(126375-126549)
chr7 (113-442)||(48356667-48356997)
chr7 (113-442)||(16914822-16915152)
chr7 (143-442)||(9838932-9839232)
chr7 (143-442)||(9611360-9611661)
chr7 (247-443)||(34241100-34241297)
chr7 (94-443)||(31501177-31501527)
chr7 (56-172)||(1937173-1937289)
chr7 (50-217)||(4484687-4484854)
chr7 (144-266)||(16919613-16919735)
chr7 (247-400)||(14271838-14271989)
chr7 (113-217)||(9723927-9724031)
chr7 (70-217)||(20583674-20583821)
chr7 (113-211)||(15358820-15358918)
chr7 (145-217)||(46474056-46474128)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (13-535)||(12837000-12837521)
chr4 (56-543)||(44055881-44056372)
chr4 (56-543)||(34395223-34395714)
chr4 (70-543)||(21959254-21959730)
chr4 (95-543)||(30457909-30458360)
chr4 (113-543)||(8872264-8872698)
chr4 (52-522)||(23269745-23270219)
chr4 (226-543)||(20813337-20813658)
chr4 (95-543)||(819721-820154)
chr4 (55-543)||(53704525-53705015)
chr4 (56-543)||(16732135-16732626)
chr4 (93-543)||(45458645-45459099)
chr4 (70-543)||(30232285-30232763)
chr4 (50-443)||(55376493-55376884)
chr4 (89-543)||(44346826-44347280)
chr4 (53-543)||(53907500-53907980)
chr4 (31-532)||(52265309-52265814)
chr4 (89-523)||(13809321-13809758)
chr4 (103-443)||(27960984-27961325)
chr4 (54-510)||(18494153-18494611)
chr4 (50-443)||(15044788-15045182)
chr4 (13-224)||(15272433-15272645)
chr4 (50-443)||(15109242-15109636)
chr4 (150-367)||(47535035-47535252)
chr4 (50-224)||(14951722-14951896)
chr4 (113-442)||(7185739-7186068)
chr4 (56-285)||(41165998-41166227)
chr4 (56-224)||(25119328-25119497)
chr4 (100-443)||(14901242-14901585)
chr4 (56-224)||(5682648-5682816)
chr4 (113-442)||(18276457-18276787)
chr4 (50-443)||(41256262-41256656)
chr4 (50-443)||(7964605-7964997)
chr4 (113-443)||(15013176-15013506)
chr4 (111-222)||(15675219-15675330)
chr4 (91-173)||(19821940-19822022)
chr4 (13-65)||(30232789-30232842)
chr4 (111-224)||(31115651-31115764)
chr4 (150-222)||(10104380-10104452)
chr4 (113-217)||(13590194-13590298)
chr4 (113-217)||(54398406-54398510)
chr4 (54-217)||(18238277-18238440)
chr4 (346-443)||(19821669-19821768)
chr4 (454-487)||(9199364-9199397)
chr4 (454-487)||(9252947-9252980)
chr4 (31-86)||(15851607-15851663)
chr4 (411-443)||(37956917-37956949)
chr4 (411-443)||(40885458-40885490)
chr4 (150-230)||(40885676-40885756)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (13-543)||(20711998-20712534)
chr5 (50-543)||(1167996-1168491)
chr5 (100-542)||(21397099-21397547)
chr5 (52-543)||(4865224-4865717)
chr5 (89-542)||(28261520-28261969)
chr5 (100-543)||(21906730-21907155)
chr5 (94-523)||(24182943-24183372)
chr5 (100-543)||(11336975-11337423)
chr5 (53-543)||(21646532-21647023)
chr5 (90-535)||(19405537-19405989)
chr5 (50-442)||(11584012-11584405)
chr5 (53-374)||(24475546-24475861)
chr5 (13-224)||(21650618-21650829)
chr5 (13-224)||(21204848-21205060)
chr5 (53-443)||(23493882-23494273)
chr5 (50-443)||(3673822-3674216)
chr5 (64-442)||(19862183-19862563)
chr5 (89-508)||(23466456-23466856)
chr5 (50-377)||(5450804-5451130)
chr5 (91-443)||(7728421-7728775)
chr5 (54-443)||(16595472-16595861)
chr5 (50-443)||(432423-432816)
chr5 (50-420)||(23981433-23981802)
chr5 (63-224)||(2031783-2031944)
chr5 (151-443)||(28902252-28902546)
chr5 (151-443)||(28938647-28938941)
chr5 (50-224)||(11342644-11342819)
chr5 (94-442)||(21617020-21617370)
chr5 (250-443)||(21310602-21310796)
chr5 (143-362)||(21222583-21222802)
chr5 (250-443)||(21297068-21297262)
chr5 (411-535)||(22662478-22662608)
chr5 (70-217)||(6456604-6456751)
chr5 (315-443)||(32966041-32966171)
chr5 (324-443)||(37983598-37983718)
chr5 (113-222)||(22053963-22054072)
chr5 (54-211)||(29917929-29918086)
chr5 (145-217)||(21109805-21109877)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (13-543)||(24517-25048)
scaffold0037 (13-224)||(94898-95109)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (13-543)||(18777069-18777587)
chr6 (13-532)||(18570203-18570723)
chr6 (56-543)||(32898756-32899248)
chr6 (95-544)||(16086022-16086475)
chr6 (121-543)||(16106547-16106973)
chr6 (103-543)||(18432656-18433098)
chr6 (95-543)||(22440940-22441388)
chr6 (102-539)||(13014503-13014943)
chr6 (90-374)||(31628268-31628552)
chr6 (50-540)||(18398899-18399392)
chr6 (13-224)||(15742341-15742555)
chr6 (13-224)||(23994845-23995057)
chr6 (13-224)||(26089659-26089869)
chr6 (13-224)||(18002617-18002827)
chr6 (91-443)||(25367129-25367483)
chr6 (93-442)||(21623171-21623522)
chr6 (407-543)||(25640351-25640491)
chr6 (56-360)||(18381660-18381964)
chr6 (56-224)||(35015278-35015446)
chr6 (100-442)||(22361660-22362002)
chr6 (452-543)||(31628556-31628646)
chr6 (250-543)||(15079501-15079795)
chr6 (195-443)||(21410943-21411191)
chr6 (52-219)||(25744331-25744498)
chr6 (56-224)||(19983412-19983580)
chr6 (107-329)||(28195101-28195324)
chr6 (100-443)||(33324703-33325047)
chr6 (46-285)||(25651193-25651432)
chr6 (247-443)||(18629501-18629698)
chr6 (100-443)||(35135905-35136249)
chr6 (150-443)||(17083092-17083384)
chr6 (150-224)||(18583377-18583451)
chr6 (100-443)||(16887684-16888029)
chr6 (318-443)||(33538263-33538389)
chr6 (107-222)||(35009569-35009684)
chr6 (247-380)||(17556977-17557107)
chr6 (50-217)||(34966827-34966994)
chr6 (100-168)||(18823565-18823633)
chr6 (100-168)||(18839420-18839488)
chr6 (50-129)||(18583295-18583372)
chr6 (315-435)||(15740454-15740576)
chr6 (91-173)||(25919614-25919696)
chr6 (510-543)||(25744278-25744311)
chr6 (101-224)||(15079820-15079944)
chr6 (316-360)||(25654350-25654394)
chr6 (411-443)||(25919936-25919968)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (31-543)||(20481546-20482059)
chr8 (56-543)||(41246624-41247113)
chr8 (95-543)||(37611674-37612125)
chr8 (54-543)||(20572983-20573474)
chr8 (158-544)||(20561420-20561810)
chr8 (89-539)||(22234600-22235051)
chr8 (52-543)||(19992849-19993339)
chr8 (90-509)||(21681002-21681426)
chr8 (266-543)||(25122618-25122896)
chr8 (347-543)||(20529642-20529843)
chr8 (13-224)||(274366-274577)
chr8 (13-224)||(641272-641483)
chr8 (13-224)||(827078-827289)
chr8 (13-224)||(16039002-16039213)
chr8 (54-531)||(39446567-39447048)
chr8 (90-298)||(20653944-20654152)
chr8 (56-380)||(23837164-23837487)
chr8 (90-284)||(20647882-20648076)
chr8 (60-442)||(21198046-21198429)
chr8 (13-172)||(24385916-24386076)
chr8 (13-224)||(39115199-39115409)
chr8 (168-443)||(22981351-22981623)
chr8 (91-364)||(38533650-38533923)
chr8 (63-224)||(41506930-41507091)
chr8 (50-360)||(26011455-26011764)
chr8 (113-442)||(15933321-15933651)
chr8 (113-442)||(5854637-5854967)
chr8 (63-224)||(24716983-24717144)
chr8 (227-380)||(17285341-17285493)
chr8 (315-443)||(15970046-15970174)
chr8 (345-437)||(7000525-7000616)
chr8 (454-543)||(20653823-20653912)
chr8 (94-442)||(23225973-23226319)
chr8 (91-217)||(22735958-22736084)
chr8 (143-380)||(29306470-29306706)
chr8 (70-217)||(38635768-38635915)
chr8 (407-531)||(21259298-21259426)
chr8 (95-172)||(25122542-25122618)
chr8 (54-162)||(20567333-20567440)
chr8 (54-162)||(20573526-20573633)
chr8 (94-443)||(23158167-23158511)
chr8 (52-211)||(27233193-27233352)
chr8 (94-380)||(23149785-23150068)
chr8 (272-443)||(33528607-33528779)
chr8 (54-141)||(20567195-20567281)
chr8 (50-123)||(29759902-29759975)
chr8 (315-443)||(31194216-31194346)
chr8 (145-217)||(24552690-24552762)
chr8 (50-217)||(18261591-18261758)
chr8 (251-358)||(25296319-25296426)
chr8 (251-358)||(25758339-25758446)
chr8 (50-211)||(33611179-33611340)
chr8 (406-443)||(38533967-38534004)
chr8 (145-217)||(18041652-18041724)
chr8 (145-217)||(45559057-45559129)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (13-543)||(36890475-36891010)
chr2 (13-543)||(25875713-25876244)
chr2 (93-544)||(271173-271626)
chr2 (56-543)||(25601990-25602482)
chr2 (93-543)||(4447924-4448377)
chr2 (54-531)||(28974013-28974494)
chr2 (52-543)||(23836499-23836990)
chr2 (56-433)||(32465824-32466199)
chr2 (56-542)||(27261772-27262260)
chr2 (54-435)||(24571195-24571574)
chr2 (90-510)||(22579688-22580106)
chr2 (49-443)||(67951-68347)
chr2 (13-220)||(9653021-9653229)
chr2 (13-220)||(21274174-21274380)
chr2 (392-543)||(17367119-17367276)
chr2 (91-443)||(31146072-31146426)
chr2 (93-360)||(43645896-43646163)
chr2 (13-86)||(16935518-16935591)
chr2 (13-86)||(17006178-17006251)
chr2 (316-443)||(722617-722743)
chr2 (56-224)||(22274689-22274856)
chr2 (70-266)||(25305425-25305622)
chr2 (56-224)||(22283922-22284089)
chr2 (31-211)||(23821731-23821912)
chr2 (31-211)||(23830810-23830991)
chr2 (113-245)||(6879460-6879591)
chr2 (63-442)||(19666501-19666880)
chr2 (100-443)||(19669002-19669346)
chr2 (262-443)||(23821533-23821714)
chr2 (262-443)||(23830612-23830793)
chr2 (50-217)||(19433452-19433618)
chr2 (107-222)||(25265520-25265635)
chr2 (315-380)||(24087345-24087409)
chr2 (50-217)||(6094676-6094843)
chr2 (100-175)||(3403-3478)
chr2 (150-336)||(22775206-22775392)
chr2 (150-336)||(22780584-22780770)
chr2 (93-175)||(24294685-24294767)
chr2 (396-437)||(17366958-17366999)
chr2 (50-285)||(9636705-9636940)
chr2 (146-222)||(24341519-24341595)
chr2 (70-217)||(24277741-24277888)
chr2 (293-380)||(25305634-25305720)
chr2 (315-443)||(3139-3269)
chr2 (315-364)||(24294496-24294545)
chr2 (407-443)||(7321837-7321873)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (56-543)||(22657-23148)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (13-543)||(4485-5017)
scaffold0447 (13-543)||(9099-9631)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (56-543)||(132039-132531)
scaffold0021 (89-542)||(88274-88732)
scaffold0021 (62-543)||(11659-12145)
scaffold0021 (213-510)||(16022-16324)
scaffold0021 (213-510)||(25553-25855)
scaffold0021 (13-68)||(88219-88274)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (13-543)||(7093-7626)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (102-543)||(7581-8027)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (89-543)||(1316-1772)
scaffold0359 (113-543)||(11445-11875)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (56-543)||(613-1103)
scaffold0673 (52-543)||(6638-7133)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (93-543)||(60809-61264)
scaffold0001 (56-543)||(70414-70903)
scaffold0001 (302-543)||(79679-79925)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (56-543)||(38264-38756)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (95-543)||(48153-48600)
scaffold0068 (95-543)||(61601-62048)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (56-543)||(254606-255095)
scaffold0011 (56-543)||(261212-261701)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (31-543)||(46106-46623)
scaffold0034 (49-543)||(40617-41116)
scaffold0034 (13-224)||(79784-79998)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (93-543)||(11360-11812)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (13-442)||(15367-15798)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (54-543)||(117753-118246)
scaffold0035 (54-543)||(109252-109745)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (52-534)||(14839-15319)
scaffold0083 (52-160)||(14179-14287)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (89-543)||(112337-112790)
scaffold0022 (91-443)||(102814-103168)
scaffold0022 (54-365)||(109554-109865)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (54-543)||(8951-9445)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (50-543)||(106-599)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (90-532)||(9937-10380)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (13-543)||(33587-34120)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (52-543)||(5040-5531)
scaffold0480 (89-543)||(8673-9130)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (49-535)||(372-864)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (50-510)||(21473-21933)
scaffold0120 (50-535)||(31172-31660)
scaffold0120 (332-535)||(47346-47554)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (100-543)||(11497-11945)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (56-535)||(85298-85781)
scaffold0014 (54-510)||(159266-159722)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (13-337)||(146523-146848)
scaffold0025 (143-442)||(53399-53699)
scaffold0025 (247-377)||(85690-85818)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (56-424)||(252902-253270)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (52-543)||(164177-164669)
scaffold0016 (56-224)||(162299-162468)
scaffold0016 (56-224)||(166385-166546)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (70-443)||(1-371)
scaffold0160 (63-162)||(3492-3591)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (153-543)||(70676-71071)
scaffold0031 (54-535)||(31008-31496)
scaffold0031 (113-360)||(97175-97422)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (50-442)||(1341-1732)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (54-523)||(1880-2352)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (164-543)||(4359-4738)
scaffold0740 (52-141)||(4269-4358)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (100-443)||(25222-25564)
scaffold0158 (50-342)||(24921-25210)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (100-442)||(10-351)
scaffold0310 (154-442)||(6304-6591)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (56-384)||(4907-5235)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (89-510)||(3318-3742)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (13-409)||(5863-6261)
scaffold0342 (57-224)||(572-739)
scaffold0342 (411-543)||(12590-12726)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (290-543)||(2857-3112)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (192-442)||(20274-20524)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (13-224)||(13507-13719)
scaffold0251 (13-224)||(21481-21693)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (13-224)||(55503-55715)
scaffold0032 (91-380)||(93730-94018)
scaffold0032 (315-442)||(104518-104645)
scaffold0032 (463-535)||(93648-93721)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (13-224)||(9628-9839)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (54-531)||(33529-34010)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (13-224)||(1099-1311)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (13-217)||(10094-10298)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (28-224)||(17525-17721)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (13-224)||(193609-193820)
scaffold0004 (13-224)||(186647-186861)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (13-224)||(6664-6870)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (29-224)||(14887-15083)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (250-442)||(19850-20041)
scaffold0122 (250-442)||(24154-24345)
scaffold0122 (63-160)||(24374-24471)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (13-197)||(19049-19233)
scaffold0039 (54-224)||(12641-12811)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (50-443)||(2210-2603)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (49-238)||(617-806)
scaffold0195 (107-266)||(19224-19383)
scaffold0195 (107-266)||(21308-21467)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (13-224)||(149-355)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (326-543)||(5467-5689)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (211-510)||(7927-8228)
scaffold0589 (89-169)||(7833-7913)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (408-543)||(8665-8803)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (56-442)||(76740-77128)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (13-148)||(22701-22836)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (52-266)||(32165-32379)
scaffold0091 (52-266)||(41924-42138)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (317-442)||(1-125)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (56-224)||(31401-31569)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (56-224)||(41275-41443)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (56-198)||(30057-30199)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (56-224)||(6204-6372)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (91-380)||(6983-7271)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (91-336)||(35479-35724)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (113-442)||(69480-69810)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (50-198)||(3261-3407)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (50-443)||(28497-28891)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (315-543)||(70097-70329)
scaffold0058 (100-224)||(70418-70543)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (63-360)||(2498-2795)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (100-446)||(8020-8367)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (315-543)||(89656-89886)
scaffold0026 (50-127)||(90054-90131)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (113-442)||(197147-197477)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (315-443)||(1241-1370)
scaffold0409 (315-443)||(9496-9625)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (63-336)||(6634-6907)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (13-433)||(11017-11438)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (151-222)||(89584-89655)
scaffold0028 (100-433)||(79549-79883)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (272-443)||(1439-1611)
scaffold0456 (272-443)||(8584-8756)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (315-535)||(10887-11111)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (143-442)||(31073-31373)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (54-207)||(2419-2572)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (63-217)||(282-436)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (145-222)||(51312-51389)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (13-127)||(147478-147590)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (251-442)||(43692-43884)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (107-219)||(41666-41778)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (323-443)||(22322-22443)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (107-222)||(13524-13639)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (113-211)||(4628-4726)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (145-201)||(22054-22110)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 35054679 - 35055213
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35054679 aatatctcaatccaacaattgagtaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcat 35054778  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  35054779 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcac 35054878  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  35054879 caattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat 35054978  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35054979 gtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtg 35055078  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  35055079 attatgatgaattttaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcat 35055178  T
Q  509 gtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35055179 gtcctcttctctctacccttttcttctcttgctcc 35055213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 100 - 541
Target Start/End: Original strand, 49967660 - 49968105
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49967660 atgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaaca 49967759  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  49967760 atgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca 49967859  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  49967860 tacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaa 49967959  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  49967960 attacaataagtgattacgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctaccttagacttcaattttgcttctagctcttctcccaactc 49968059  T
Q  497 ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct 541  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  49968060 ttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttctttcctcttgct 49968105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22403351 - 22402900
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22403351 aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaa 22403253  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||    
T  22403252 caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcat 22403155  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22403154 aacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata 22403055  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22403054 attgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaccttaggctttaattttgctcctaactcttct 22402955  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22402954 tccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttatcctcttgctcc 22402900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27330077 - 27329555
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  27330077 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttg---acaacaaattatgaatcatgca 27329981  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27329980 tacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattca 27329881  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccattttt--catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa 309  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||||||||| |||| | ||  || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||    
T  27329880 ccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaa 27329784  T
Q  310 catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat 407  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |          ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  27329783 catgtcatcataattggagcacgaattct----------aacaattaatcaatt-acacaattaaacacttattcatac-cataattgaaaaattgcaat 27329696  T
Q  408 aagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  27329695 aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagattgggcttcaattttactcctagctcttctctcaatcattgattc 27329596  T
Q  504 ttcaagtcctcttttctcta-cccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  27329595 ttcaagtcctcttctctctagctctttcctcctcttgctcc 27329555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 150 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9783863
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||    
T  9784248 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt---caacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat 9784152  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9784151 actttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatga 9784052  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt---- 445  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        
T  9784051 acaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagag 9783952  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9783951 taatcc--ctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcacccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct 9783863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 21718238 - 21718684
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21718238 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaaca 21718337  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21718338 tagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca 21718437  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aa 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  21718438 tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaa 21718536  T
Q  399 aattgcaataagtgattatgatgaattctaaccc----ccttatcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaac 494  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    |||||  |||| ||| || | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  21718537 aattgcaataa-tgattatattgaattctaatcccttacctta-gttagattagtctccctagcttatgcttcaatttagctcatagct-ttcccccaat 21718633  T
Q  495 ccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||    
T  21718634 cattgattcttcaagttcctcttctctttaaccctttcttcctcttgctcc 21718684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 41212033 - 41212415
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccact---taac 150  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||    |||    
T  41212033 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac 41212132  T
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata 250  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41212133 aacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatatttt-tacacatacccatttttcata 41212231  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41212232 ctttgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaa 41212331  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41212332 caattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccct 41212415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522142
Alignment:
Q  257 acatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatta 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35522432 acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta 35522333  T
Q  357 atcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc 451  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    |||| ||| ||     
T  35522332 atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatct 35522234  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  35522233 ccttagcttaggcttcaattttgctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc 35522142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 51627947 - 51627557
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||    
T  51627947 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaac 51627848  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  51627847 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatata-ccattttctcatac 51627750  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||| || | || ||||| |||  || |||  |||||||||| |||||| |||| || |  ||||||||    
T  51627749 tttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaac 51627650  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||| ||||  | || |||||||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51627649 aaataatcaattact-caattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 51627557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 21859934 - 21860145
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||     
T  21859934 aatatcctaatccaacaattgagaaaaactcataagcactcattttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaa 21860033  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||| ||||||| || | |||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  21860034 acccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 21860133  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  21860134 caattgagcata 21860145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 380
Target Start/End: Original strand, 20177141 - 20177464
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  20177141 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 20177240  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    ||||||| ||||| | |||   ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||    
T  20177241 caacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatacttt 20177339  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||| | |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  20177340 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat 20177439  T
Q  355 taatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  20177440 taatcaattact-caattaagcactt 20177464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 408 - 543
Target Start/End: Original strand, 20346342 - 20346480
Alignment:
Q  408 aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20346342 aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattct 20346441  T
Q  505 tcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20346442 tcaagtcctcttctctatacccttttctcctcttactcc 20346480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35522601 - 35522432
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||    
T  35522601 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaac 35522503  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35522502 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 443
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646267
Alignment:
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| || ||||| |||||  ||| ||||||    
T  16645975 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataatt-caacatatatcactttctcatac 16646073  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| ||||  || |||| ||||| |||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  16646074 tttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac 16646173  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16646174 aattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 16646267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Original strand, 16656699 - 16656993
Alignment:
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| ||||    
T  16656699 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat 16656797  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||| | | ||  || ||||||||||||||  || | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  16656798 actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga 16656897  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16656898 acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 16656993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 22366979 - 22367152
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || |  ||| ||    
T  22366979 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaa 22367078  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  22367079 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata 22367152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15861719 - 15861547
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || |  ||| ||    
T  15861719 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaatatgactaaa 15861620  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15861619 ca--aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 15861547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 443
Target Start/End: Original strand, 19603303 - 19603450
Alignment:
Q  296 ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat 394  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  19603303 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aataat 19603400  T
Q  395 tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19603401 tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattctagcccccttaccttag 19603450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22143636 - 22143264
Alignment:
Q  62 caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat 161  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||| || |||||||||    
T  22143636 caaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacat 22143537  T
Q  162 ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat 260  Q
    | ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||  |  || |  || | ||||||||||||||    
T  22143536 caattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacatttatacatactttgaacat 22143438  T
Q  261 gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
    | || |  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22143437 gcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatca 22143338  T
Q  361 attaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccc 433  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22143337 ttta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc 22143264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44035252 - 44035092
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | | ||||||  | |  ||| ||||||||||||| |    
T  44035252 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaac 44035154  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||| ||||||||    
T  44035153 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata 44035092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22829466 - 22829325
Alignment:
Q  296 ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat 394  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||  |||    
T  22829466 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aat 22829369  T
Q  395 tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta 437  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22829368 tgaaaaattgcactaaatgattatgatgaattctaaccccctta 22829325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13377121 - 13376966
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  13377121 tttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaa 13377022  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||| ||||| |||||   | | || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  13377021 caacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattca 13376966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9784343 - 9784237
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  9784343 caaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaaca 9784244  T
Q  194 acaacat 200  Q
    |||||||    
T  9784243 acaacat 9784237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 443
Target Start/End: Original strand, 17608951 - 17609282
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || ||||||     
T  17608951 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa 17609050  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||| ||| |  |||   |||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||  ||   || ||||| |||  ||| |    
T  17609051 catttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaata 17609149  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || |||    
T  17609150 tatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatcaactaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa 17609247  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17609248 atgattatgattgaattctaacccccttaccttag 17609282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20955480 - 20955333
Alignment:
Q  296 ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat 394  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || |||    
T  20955480 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaat 20955383  T
Q  395 tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20955382 tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattataacccccttaccttag 20955333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37234084 - 37233754
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||| ||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||||     
T  37234084 acccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaa 37233985  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || |||||||  ||||||| |||||  |||   |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  37233984 catttagagcata-attcaacatatatcactttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca 37233886  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  |||||||| || |||||||||| || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||  | | || |||||||| |||||| || |||    
T  37233885 tatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaacaattactcacttact-caattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaa 37233788  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37233787 atgattatgattgaattctaacccccttacctta 37233754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 380
Target Start/End: Original strand, 21194974 - 21195303
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||    
T  21194974 acccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 21195073  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||  || ||||||||| | ||||||| || || |||||| ||||| ||||||| || ||  | |||||  |||  ||    
T  21195074 caacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcaca 21195172  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21195173 tactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatg 21195272  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21195273 aacaattaatcactt-attcaattaagcactt 21195303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13376951 - 13376752
Alignment:
Q  245 ttcatactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcat 343  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||    
T  13376951 ttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcat 13376853  T
Q  344 ttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatc 439  Q
     |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13376852 ctatgaacaattaatcaattact-aaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacc 13376755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36356315 - 36356191
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag 410  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | ||     
T  36356315 catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaa 36356218  T
Q  411 tgattatgatgaattctaaccccctta 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36356217 tgattatgatgaattctaaccccctta 36356191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5768361 - 5768289
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5768361 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt 5768289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 27674801 - 27674881
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa 175  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  27674801 aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaa 27674881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 543
Target Start/End: Original strand, 41212420 - 41212475
Alignment:
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41212420 cccaatccttgattcttcaaatcctcttctctctaacccttatctcctcttgctcc 41212475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36356537 - 36356455
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa 175  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  36356537 acaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaa 36356455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Original strand, 27675021 - 27675085
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  27675021 catcataattggagcacgaattctaacagtcatgaacaaataatcaattact-caattaagcactt 27675085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 20445697 - 20445856
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || |    
T  20445697 atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa 20445796  T
Q  207 attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  || ||| ||| ||||||||||||||    
T  20445797 attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt 20445856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 20531462 - 20531621
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || |    
T  20531462 atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa 20531561  T
Q  207 attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  || ||| ||| ||||||||||||||    
T  20531562 attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt 20531621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22829691 - 22829583
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |  || | |||||||||||||  ||||| || ||     
T  22829691 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcacttaacaacaattacatcaatggaa 22829592  T
Q  170 catgaaact 178  Q
    |||||||||    
T  22829591 catgaaact 22829583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 17100574 - 17101109
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaa-caacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgc 110  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17100574 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtatccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgc 17100673  T
Q  111 atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17100674 atacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc 17100773  T
Q  211 accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17100774 accaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac 17100873  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  17100874 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataag 17100972  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17100973 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 17101072  T
Q  507 aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17101073 aagtcctcttctctctatccttctctactcttgctcc 17101109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 17101259 - 17101794
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaa-caacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgc 110  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17101259 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtatccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgc 17101358  T
Q  111 atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17101359 atacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc 17101458  T
Q  211 accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17101459 accaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac 17101558  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  17101559 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataag 17101657  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17101658 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 17101757  T
Q  507 aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17101758 aagtcctcttctctctatccttctctactcttgctcc 17101794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 54423954 - 54424469
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  54423954 ttgagcaaaactcataagtagccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataat 54424052  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca 230  Q
    |||| | |||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424053 catccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca 54424152  T
Q  231 acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagca 330  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54424153 acatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagca 54424252  T
Q  331 cgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaac 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54424253 cgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaac 54424352  T
Q  431 ccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctaccc 526  Q
    ||||||| |    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  54424353 ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgcgcctagctcttctcccaatccttgattctttaagtcctcttctctgtaccc 54424452  T
Q  527 ttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||    
T  54424453 ttttctcctcttgctcc 54424469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50112288 - 50111841
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50112288 atgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca 50112189  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  50112188 atgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttca 50112089  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50112088 tacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa 50111989  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc 495  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |    
T  50111988 attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcttcaca--c 50111891  T
Q  496 cttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  50111890 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc 50111841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 116 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 317729 - 317301
Alignment:
Q  116 caagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa 215  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  317729 caagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa 317630  T
Q  216 ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgcc 315  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  317629 tttagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtc 317531  T
Q  316 atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatt 415  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  317530 atcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatt 317432  T
Q  416 atgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcc 512  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317431 atgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcc 317332  T
Q  513 tcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  317331 tcatctctctacccttttctcctcttgctcc 317301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16996343 - 16995852
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||| | |||||  |||||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  16996343 ccattttcatcaaaacaccaaca-caactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 16996245  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16996244 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatac 16996146  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || |||||||     
T  16996145 tttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaat 16996046  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttac 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||     
T  16996045 aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagcttaa 16995947  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16995946 tctacctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 16995852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144063
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||    
T  22144553 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaa 22144454  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt 253  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  22144453 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactt 22144355  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  22144354 tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacag 22144256  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc 450  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||    
T  22144255 ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatc 22144156  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22144155 tctctagcttaggcttcaatttttcttctatctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcctctctctacccttttttcctcttgctcc 22144063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6154572 - 6154121
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6154572 aaattatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 6154474  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata--ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
     ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||    
T  6154473 taacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-cataaactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaactattcat 6154376  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  6154375 aatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaata 6154276  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6154275 attgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatatctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttct 6154176  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  6154175 cccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttcttctcttgctcc 6154121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14304013 - 14304504
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||  ||     
T  14304013 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14304111  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |   | ||||    
T  14304112 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactt 14304211  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14304212 tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa 14304311  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac 448  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||     
T  14304312 ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaa 14304410  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14304411 tctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 14304504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 167 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439132
Alignment:
Q  167 gatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34439513 gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt 34439414  T
Q  267 caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatc-taaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa 365  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  34439413 caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 34439314  T
Q  366 tccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttag 462  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||| || ||||||| |||    
T  34439313 tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttaccttagtaggttaatctctctagcatag 34439214  T
Q  463 gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34439213 gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcttctctctaatccttttctcctcttgctcc 34439132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 35123661 - 35124152
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||  || || ||||    
T  35123661 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 35123759  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact- 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||      
T  35123760 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccc--ttttcatacac 35123857  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  35123858 tttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaaca 35123957  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta 447  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    |||| |||    
T  35123958 attaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccctttaccttagttagatta 35124056  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35124057 atctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctctcaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 35124152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 50 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12349830 - 12349388
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatac-----ccaagccatgaattagcatcaataacacca 144  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||| |||| | ||||  |    
T  12349830 acccattttcac-aaaccaaaaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatga 12349732  T
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattt 244  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  12349731 catatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaactt 12349632  T
Q  245 ttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatt 344  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12349631 ctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatt 12349532  T
Q  345 tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----t 440  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |    
T  12349531 tatggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 12349432  T
Q  441 taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 484  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12349431 taggttaatctctctagcttaagcttcaatattgctcctagctc 12349388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14295402 - 14295894
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||    
T  14295402 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaac 14295501  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14295502 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatac 14295600  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14295601 tttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac 14295700  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt 446  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||    
T  14295701 aattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 14295798  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  14295799 aatctccctagattagggttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 14295894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 485
Target Start/End: Original strand, 14298386 - 14298820
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||  ||     
T  14298386 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14298484  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |   | ||||    
T  14298485 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactt 14298584  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14298585 tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa 14298684  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac 448  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||     
T  14298685 ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaa 14298783  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 485  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14298784 tctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctct 14298820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19261161 - 19260839
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19261161 aatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaac---ttatttcataacaacaaattatgaatcatgca 19261065  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  19261064 tacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattca 19260965  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19260964 ccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca 19260865  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattt 337  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  19260864 tatcatcataattagagcacgaattt 19260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16182180 - 16181739
Alignment:
Q  102 gaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||      
T  16182180 gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaat 16182081  T
Q  202 acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  16182080 gcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttca 16181984  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16181983 tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa 16181884  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||    
T  16181883 attacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-accc 16181787  T
Q  497 ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16181786 ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 16181739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 101 - 535
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8632238
Alignment:
Q  101 tgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||  | ||||||||     
T  8631801 tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa 8631900  T
Q  201 aacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcat 300  Q
    | |||||||||| || | ||||||||||||||| ||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8631901 agcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat 8632000  T
Q  301 acatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa 400  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8632001 acatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa 8632100  T
Q  401 ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  8632101 ttgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttaccttagatagagtaatcc--ctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcacccaatcc 8632197  T
Q  497 ttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8632198 ttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct 8632238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 203 - 543
Target Start/End: Original strand, 38527842 - 38528183
Alignment:
Q  203 cataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||    
T  38527842 cataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcat 38527938  T
Q  301 acatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38527939 acatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaaa 38528038  T
Q  401 ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 497  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528039 ttacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaagcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 38528137  T
Q  498 tgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38528138 tgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 38528183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 14301029 - 14301521
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||  |||    
T  14301029 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaac 14301128  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14301129 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatac 14301227  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14301228 tttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac 14301327  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt 446  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||    
T  14301328 aattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 14301425  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  14301426 aatctccctagattagggttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 14301521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 55441132 - 55440649
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || |    
T  55441132 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatc 55441033  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||    
T  55441032 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatact 55440933  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55440932 ttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca 55440833  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta 447  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||    
T  55440832 attaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-----------aattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatta 55440744  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  55440743 atctccctagcctaggcttcaattttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctttctaccctttt-tcctcttgctcc 55440649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522686
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacacc-actta 148  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |   |||||    
T  17523176 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta 17523078  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tc 247  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  17523077 gcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttgtt 17522979  T
Q  248 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17522978 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttat 17522879  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag--- 443  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  17522878 gaacaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 17522781  T
Q  444 -gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
      ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  17522780 tattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct 17522686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 52 - 535
Target Start/End: Original strand, 13817477 - 13817958
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  13817477 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 13817576  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  13817577 acaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccatttt-catac 13817671  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  13817672 actttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgt 13817770  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  13817771 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggtt 13817869  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    | || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13817870 aatctccctagcttagacttcaattttgctcatagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcct 13817958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19570923 - 19570482
Alignment:
Q  102 gaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata 201  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||      
T  19570923 gaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaat 19570824  T
Q  202 acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  19570823 gcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttca 19570727  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19570726 tacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa 19570627  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||||| ||    
T  19570626 attacaa-aagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctccctagctaaggcttgaattttgctcctagct-taaccccaatcc 19570530  T
Q  497 ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19570529 ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 19570482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 17938584 - 17939024
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  | ||||||||    
T  17938584 atgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaaca 17938683  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
     | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   ||||  ||| |    
T  17938684 aagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccatg-cttta 17938782  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17938783 tacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa 17938882  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||    
T  17938883 attgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatcttagatggagtaatcc--ctagcttaagcttcaattttgctcctagctcaac-cacaacc 17938979  T
Q  496 cttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17938980 cttgattcttcaag---tcttctctctaccctttcctcctcttgctcc 17939024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11061312 - 11060797
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |     
T  11061312 ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat 11061213  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttc 229  Q
    || ||| || | |||||| || |||||||||| ||||| |||||   ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11061212 caacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttc 11061113  T
Q  230 aacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagag 328  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  11061112 aacatata-ccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagag 11061015  T
Q  329 cacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattc 426  Q
    ||||||||| |||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11061014 cacgaatttcatcatccattaacaaataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatta-tgattatgatgaattc 11060918  T
Q  427 taacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctc 521  Q
     |||||||||| |    |||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  11060917 caacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaagcttcagttttgctcctagctc-tcttccactccttgattcttcaagttccccttctctc 11060819  T
Q  522 tacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || || ||| ||||||||||||    
T  11060818 taaccatttttcctcttgctcc 11060797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 90 - 535
Target Start/End: Original strand, 3578091 - 3578539
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||  ||||| ||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  3578091 acaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccaattttta--atcaacaacatgacttagcaacaacaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattc 3578187  T
Q  190 atcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
    | | |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  3578188 aaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatata-ctattttctcatactttgaacatgaaattcaactaataacaattcaatta 3578286  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |    
T  3578287 tccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaatcaatttacccaattaagcacttattccta 3578385  T
Q  387 caaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc 482  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3578386 c-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcatagc 3578484  T
Q  483 tcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  3578485 tc-tcttccaatccttgattcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct 3578539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 443
Target Start/End: Original strand, 17139467 - 17139862
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  17139467 taccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcactta 17139566  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt-t 246  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |    
T  17139567 gcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata-tttcaacatata-ccattttct 17139664  T
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||   | | |||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  17139665 catagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaatta 17139764  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17139765 tgaacacttaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 17139862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 38167836 - 38168048
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38167836 aatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgca 38167935  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38167936 tacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattca 38168035  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  38168036 ccaattgagcata 38168048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 339 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6146767 - 6146559
Alignment:
Q  339 atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttat 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6146767 atcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttac 6146668  T
Q  439 c----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcc 534  Q
    |    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  6146667 cttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctataaccctttcttc 6146568  T
Q  535 tcttgctcc 543  Q
    |||||||||    
T  6146567 tcttgctcc 6146559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 23492296 - 23492507
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  23492296 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcat 23492395  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  23492396 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcac 23492495  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    || |||||||||    
T  23492496 catttgagcata 23492507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12560484 - 12560027
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12560484 aacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcatatcacaatt 12560385  T
Q  189 tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
     | |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||       
T  12560384 caacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagta 12560286  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    || |||||||||  |||  || |||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  12560285 tcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcata 12560187  T
Q  387 caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag 481  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    |||| ||| || | ||| |||| |||||||||| |||| |||    
T  12560186 c-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaacttaagcttcaatttagctcatag 12560088  T
Q  482 ctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  12560087 ttc-tcttccaatccttgattcttcaagttccccttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 12560027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 45581554 - 45581765
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45581554 aatatcccaatccaacaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat 45581653  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  45581654 acccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattca 45581752  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  45581753 ccaattgagcata 45581765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11329207 - 11328858
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  11329207 caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattca 11329108  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |     
T  11329107 acaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatt 11329009  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca 388  Q
     | ||||| || |     |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||     
T  11329008 aacaactttatgc-----aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac- 11328916  T
Q  389 aataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11328915 aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 11328858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 2844113 - 2844325
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  2844113 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 2844212  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    |||||||||    
T  2844213 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattca 2844312  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  2844313 ccaattgagcata 2844325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 3992473 - 3992684
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  3992473 aatatcccaatccat-aattgagcaaaacacataagtatcaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 3992571  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  3992572 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 3992671  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  3992672 ccaattgagcata 3992684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 53770963 - 53771175
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  53770963 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 53771062  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  53771063 tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 53771162  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  53771163 ccaattgagcata 53771175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 95 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 53898697 - 53898440
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  53898697 aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaa 53898598  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  53898597 caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatttaatgcaactaac-acaattcaattattcat 53898500  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53898499 aacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca 53898440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12489013 - 12488684
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||  |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||     
T  12489013 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttag 12488914  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  12488913 caacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca 12488815  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||||    ||||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  12488814 tactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattatg 12488715  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  12488714 aacaattaattaatgact-caattaagcactt 12488684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54038456 - 54038245
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54038456 aatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcat 54038357  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    ||||||||||    
T  54038356 acccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcac 54038257  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||| ||||||    
T  54038256 caatttagcata 54038245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 543
Target Start/End: Original strand, 30207278 - 30207676
Alignment:
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga-gcatattttcaacacatatccatttttcata 250  Q
    |||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| | ||||| || ||||| |||||  ||| |||||    
T  30207278 acaacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcata 30207376  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |   ||||||    
T  30207377 ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaa 30207476  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt- 445  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    | | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  30207477 taattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtta 30207574  T
Q  446 ---tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct 541  Q
       || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30207575 gattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgct 30207674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 307 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527890
Alignment:
Q  307 aaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgca 405  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14528110 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca 14528012  T
Q  406 ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgat 501  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14528011 ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcccccaatccttgat 14527913  T
Q  502 tcttcaag-tcctcttttctcta 523  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  14527912 tcttcaagttcctcttctctcta 14527890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14059459 - 14059113
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  14059459 caacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattca 14059360  T
Q  191 tcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||  ||| |||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||  ||    
T  14059359 acaacaacatagcataattcatcaaattgagcata-tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatc 14059261  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca 388  Q
     | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||     
T  14059260 aacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaattagt-caattaagcacttattcatac- 14059163  T
Q  389 aataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta 437  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14059162 aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataaccccctta 14059113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 16261384 - 16261587
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||       |||||  |||||||||||||||||    
T  16261384 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaacttt------aacaa--aattatgaatcatgcat 16261475  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  16261476 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 16261575  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  16261576 caattgagcata 16261587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6146987 - 6146764
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6146987 aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaa 6146889  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    
T  6146888 caacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaa-tacaattcaattattcat 6146791  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatca 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6146790 aacttcatacatctaaacatgtcatca 6146764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 16880133 - 16880478
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16880133 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 16880232  T
Q  200 taacataa-ttcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  || | ||||||    
T  16880233 tagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttc 16880331  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga 397  Q
     | |||  ||||||  |||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || || ||||||    
T  16880332 ttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaaacacttgttcatac-aacaattga 16880429  T
Q  398 aaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16880430 aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 16880478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 443
Target Start/End: Original strand, 39656485 - 39656879
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| |  || || |||||||| | || ||| || | ||||||    
T  39656485 tacccattttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactta 39656584  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttc 247  Q
     ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||| ||    
T  39656585 gcaacaaccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctc 39656683  T
Q  248 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat 347  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||   || |||||| ||  ||||||  |||||||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  39656684 atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattat 39656783  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  39656784 gaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattgcactaaatgattatgatcaattctaactcccttaccttag 39656879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14528287 - 14528118
Alignment:
Q  62 caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat 161  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  14528287 caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacat 14528188  T
Q  162 ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttca 230  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14528187 caattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca 14528118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 28558129 - 28558252
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28558129 aatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaacaaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat 28558228  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  28558229 acccaagccatgaattatcatcaa 28558252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 440 - 543
Target Start/End: Original strand, 13835975 - 13836078
Alignment:
Q  440 ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttg 539  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13835975 ttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctattctctctaccattttctcctcttg 13836074  T
Q  540 ctcc 543  Q
    ||||    
T  13836075 ctcc 13836078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 377
Target Start/End: Original strand, 17191542 - 17191827
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| ||||  ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |    
T  17191542 caacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacatgattcttatcacaattca 17191641  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||  ||    
T  17191642 gcaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatc 17191740  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagca 377  Q
     | || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17191741 aacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagca 17191827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12349971 - 12349822
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12349971 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 12349873  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt 245  Q
    | ||    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  12349872 ctacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaacacacacccatttt 12349822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 30152902 - 30153076
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || | |||||| || |  ||| ||    
T  30152902 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 30153001  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  30153002 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 30153076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 33341843 - 33342015
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||    
T  33341843 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 33341940  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  33341941 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 33342015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54685594 - 54685422
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||    
T  54685594 acccatttt-acaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 54685497  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  54685496 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 54685422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 365
Target Start/End: Original strand, 15876071 - 15876343
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |    
T  15876071 acaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaac 15876170  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca 291  Q
    |||||| ||  ||||| || ||| ||||| ||   ||||| | |||||  ||| |||||||| ||||||  ||||  |  |||||||||||| |  || |    
T  15876171 aacaacttatgataatccaacaatttgagtat-cattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaa 15876269  T
Q  292 taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa 365  Q
     ||| |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15876270 caacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattaa 15876343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17956273 - 17956109
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  17956273 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 17956174  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||| |||||||||||    
T  17956173 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag 17956109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576396
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | | || |  ||||| ||||||||||||| ||  |     
T  3576705 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa 3576606  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattca 268  Q
    |||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||| ||||||| || ||| | |||||  ||| |||||| ||||||||| ||||      
T  3576605 catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttc 3576507  T
Q  269 actaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcc 368  Q
    || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||||||||| ||| | |    
T  3576506 accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-c 3576408  T
Q  369 aattaagcactt 380  Q
    ||||||||||||    
T  3576407 aattaagcactt 3576396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 7853944 - 7854116
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||    
T  7853944 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 7854041  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7854042 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgaacata 7854116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 380
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17204970
Alignment:
Q  227 ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag 326  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||  || | || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||    
T  17204818 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag 17204917  T
Q  327 agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  17204918 agcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt 17204970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11196393 - 11196293
Alignment:
Q  263 aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  11196393 aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaat 11196294  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  11196293 t 11196293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 510
Target Start/End: Original strand, 40939437 - 40939549
Alignment:
Q  401 ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40939437 ttgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatcc 40939535  T
Q  497 ttgattcttcaagt 510  Q
    ||||||||||||||    
T  40939536 ttgattcttcaagt 40939549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9591039 - 9590647
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||||  ||| | ||||||| ||||||| | || ||| || | |||||||||    
T  9591039 ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaaca 9590940  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata 250  Q
    ||||||||||| ||||| ||||   || |||| || | | |||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||   |||| |  |||  ||||    
T  9590939 acaacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcata-attcatatcataccactttcacata 9590841  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||  ||   || || || |||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  9590840 ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaa 9590741  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  ||| ||||  | ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9590740 caattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttaccttag 9590647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Original strand, 15517856 - 15517920
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  15517856 catcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttact-caattaagcactt 15517920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784654
Alignment:
Q  227 ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag 326  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||    
T  47784876 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag 47784777  T
Q  327 agcacgaattttatca--tt--tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatg 418  Q
    |||||||||| || ||  ||  | |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||    
T  47784776 agcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatg 47784679  T
Q  419 atgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  47784678 atgaattctaacccccttaccttag 47784654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11882248 - 11882112
Alignment:
Q  307 aaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttt-tcacacaaataattgaaaattgca 405  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||||| |||||| ||| || ||||||||||||  ||| ||||  |||| ||| || ||    
T  11882248 aaacataccatcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcacttattc-aattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttaca 11882150  T
Q  406 ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11882149 ctaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 11882112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38811245 - 38811170
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa 175  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38811245 atgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa 38811170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Original strand, 14080666 - 14080864
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||| ||    
T  14080666 catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta 14080765  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||  ||| |||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14080766 tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14080863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 19946660 - 19946776
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  || ||     
T  19946660 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 19946757  T
Q  150 caacaacaacatccattga 168  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  19946758 caacaacaacatcaattga 19946776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47785014 - 47784873
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |  | ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  47785014 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa 47784915  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||   ||||  |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  47784914 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca 47784873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 380
Target Start/End: Original strand, 12952924 - 12953254
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||     
T  12952924 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag 12953023  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| || || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || |||||||  ||||||| ||| |  |||   |    
T  12953024 caacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcata 12953122  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc-atttat 347  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||||||||  |||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| || | | | ||    
T  12953123 tactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaacaactaat 12953222  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  12953223 gaacaattaatcacttact-caattaagcactt 12953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814885
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| |||||||  | || |||||||||| ||||| | || || ||||||||  | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| |     
T  14815032 caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 14814933  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||  |||||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||    
T  14814932 catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 14814885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 407 - 442
Target Start/End: Original strand, 15550918 - 15550953
Alignment:
Q  407 taagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15550918 taagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 15550953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 34559903 - 34560020
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    |||||||||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| || || |||||| || |||| |||| | ||    
T  34559903 caaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaaca 34560002  T
Q  194 acaacataacataattca 211  Q
    || |||||||||||||||    
T  34560003 actacataacataattca 34560020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Original strand, 17204701 - 17204821
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| | || ||| || |  ||||| ||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||| |    
T  17204701 caacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaacatccattaaacatgattcctatcacaattca 17204800  T
Q  191 tcaacaacataacataattca 211  Q
     |||||| ||| |||||||||    
T  17204801 acaacaatatagcataattca 17204821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38811030 - 38810980
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  38811030 catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattaa 38810980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 1990828 - 1990937
Alignment:
Q  115 ccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcacca 214  Q
    ||||||||||||| | || ||| || | | ||||||||||||||||||  || | |||||  || |||||| || | ||||||||||||| ||||||| |    
T  1990828 ccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattcacaa 1990927  T
Q  215 attgagcata 224  Q
     |||||||||    
T  1990928 tttgagcata 1990937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17960237 - 17960205
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17960237 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 17960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38810940 - 38810908
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38810940 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 38810908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 543
Target Start/End: Original strand, 3894955 - 3895480
Alignment:
Q  20 caatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaag 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3894955 caatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaag 3895054  T
Q  120 ccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3895055 ccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 3895154  T
Q  220 gcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatca 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3895155 gcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatca 3895254  T
Q  320 taattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga 419  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3895255 gaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga 3895353  T
Q  420 tgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctt 516  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3895354 tgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-cccaatccttgattcttcaagtcctctt 3895452  T
Q  517 ttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3895453 ctctctaacccttttctcctcttgctcc 3895480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26070589 - 26070055
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26070589 aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgca 26070490  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26070489 tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattca 26070390  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  26070389 ccaattaagcatattttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaac 26070291  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  26070290 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaata 26070193  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaaccc----ccttatcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    | ||||||||||||||||||||||    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070192 a-tgattatgatgaattctaaccccttacctta-gttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 26070095  T
Q  505 tcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26070094 tcaagtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc 26070055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26094376 - 26093842
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26094376 aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgca 26094277  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26094276 tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattca 26094177  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  26094176 ccaattaagcatattttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaac 26094078  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  26094077 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaata 26093980  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaaccc----ccttatcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    | ||||||||||||||||||||||    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26093979 a-tgattatgatgaattctaaccccttacctta-gttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 26093882  T
Q  505 tcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26093881 tcaagtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc 26093842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12370146 - 12369629
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  12370146 ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataat 12370047  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca 230  Q
     ||  | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12370046 tatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttca 12369947  T
Q  231 acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagca 330  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12369946 acagatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagca 12369847  T
Q  331 cgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaac 430  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  12369846 caaatttaatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaac 12369747  T
Q  431 ccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acc 525  Q
    ||||||| |    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12369746 ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctcctaaatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacc 12369647  T
Q  526 cttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||||||||||| ||||    
T  12369646 tttttctcctctttctcc 12369629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 143651 - 144095
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  143651 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcattaacaacatgacttaacaacaacaa------ttgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 143743  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||    
T  143744 caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttat 143841  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  143842 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactttttatacaaata 143941  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143942 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc 144041  T
Q  490 ccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  144042 ccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 144095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15822712 - 15822223
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||  || || ||||||    
T  15822712 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaa 15822613  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||    
T  15822612 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatata-ccatttt-catacattt 15822515  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15822514 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa 15822416  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc 450  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||    
T  15822415 ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatc 15822316  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15822315 tctctagcttagactttaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 15822223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13863255 - 13862723
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |  | ||||| ||  || ||| |    
T  13863255 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaa 13863156  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     |||||||||||| || |  | ||| || | |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  13863155 cacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattca 13863056  T
Q  212 -ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13863055 accaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaac 13862956  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13862955 atttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcacccaattaagc----ttcatacaaataattgaaaattacaataag 13862860  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13862859 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaacttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccattgattcttc 13862760  T
Q  507 aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13862759 aagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 13862723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45452410 - 45451958
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45452410 acaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatc 45452311  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  45452310 aacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccat 45452213  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  45452212 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata 45452113  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45452112 attgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctatagcttaggcttcaattttgctcctagctctctt 45452013  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcct-cttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
      || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45452012 --catcccttgattcttcaagtcctccttctctctaacccttttctcctcttgctcc 45451958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Original strand, 12758990 - 12759444
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | |    
T  12758990 acaaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcataattcacc 12759089  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  12759090 aacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccat 12759189  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12759190 aacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaata 12759289  T
Q  393 attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12759290 attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccctagcttagacttcaattttgctcctagctctct 12759389  T
Q  488 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12759390 t--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaactcttttctcctcttgctcc 12759444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 47289787 - 47290240
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||  |||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47289787 aaatcatgaatcatgca-acacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 47289885  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  47289886 caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcat 47289983  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47289984 aacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttttcatacaaata 47290083  T
Q  393 attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47290084 attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattaggttaatctctctagtttagacttcaattttgctccaagctcttc 47290183  T
Q  488 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47290184 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctgttctgctcttgctcc 47290240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 541
Target Start/End: Original strand, 11287381 - 11287871
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||    
T  11287381 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 11287480  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||    
T  11287481 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt 11287580  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11287581 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaa 11287680  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac 448  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||     
T  11287681 ttaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaa 11287778  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgct 541  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  11287779 tctccctagcttagacttcaattttgctcctagctc-tct-ccactccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgct 11287871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 44865233 - 44865685
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcca---ttgatcatgaaacttatcacaatttat 191  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| | |   || ||||||||||||||||||||| ||    
T  44865233 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcat 44865331  T
Q  192 caacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  44865332 caacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatt 44865430  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  44865431 cataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaa 44865530  T
Q  390 ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctt 486  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44865531 ataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctc 44865629  T
Q  487 ctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     | |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44865630 tttc--acccttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttttttcctcttgctcc 44865685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12248404 - 12247916
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||| |||||| ||||    
T  12248404 attttcatcaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaac 12248305  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  12248304 aacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ctattttctcatac 12248206  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12248205 tttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac 12248106  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt 445  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |    
T  12248105 aagtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 12248008  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag--tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  12248007 taatctccctagcttaggcttcaattttgctcctacctc-tcttccaatccttgattcttcaagtttccccttctctctaacccttttctcct 12247916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Original strand, 35094780 - 35095270
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||    
T  35094780 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaa 35094879  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttc-atac 251  Q
    ||||| || | |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||    
T  35094880 caacagcaac-attgatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatac 35094977  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  35094978 tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaac 35095076  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttac 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||     
T  35095077 aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaa 35095175  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || |   |||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35095176 tctcctaagcttaagcttcaattttgctcctagct-taaccccaatacttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 35095270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16570254 - 16569797
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16570254 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaatt 16570155  T
Q  189 tatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc 286  Q
     | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  16570154 caacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatata-ccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaatt 16570056  T
Q  287 ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac 385  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  16570055 atccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcat 16569957  T
Q  386 acaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta----tcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta 480  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    | |||| ||| || | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16569956 ac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagctccta 16569859  T
Q  481 gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  16569858 gctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 16569797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 16595408 - 16595865
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16595408 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaatt 16595507  T
Q  189 tatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc 286  Q
     | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  16595508 caacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatata-ccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaatt 16595606  T
Q  287 ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac 385  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  16595607 atccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcat 16595705  T
Q  386 acaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta----tcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta 480  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    | |||| ||| || | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16595706 ac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagctccta 16595803  T
Q  481 gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  16595804 gctc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 16595865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39046907 - 39046419
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    |||||||| |||| || ||||||||  | |||||  ||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||    
T  39046907 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 39046808  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||        
T  39046807 caacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-catatactcatttttcaa--- 39046713  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  39046712 ttgaacatacaattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca 39046613  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttact 449  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |    
T  39046612 attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaat 39046513  T
Q  450 ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | |   |||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39046512 ctcctaagcttaagcttcaattttgctcctagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctctagctcc 39046419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7284333 - 7283956
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||  || || |||||||||||||    
T  7284333 aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc 7284235  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgt 262  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||      
T  7284234 aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatac 7284135  T
Q  263 aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaat 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  7284134 aattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaat 7284035  T
Q  363 taatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  7284034 tcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7283956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49047922 - 49047476
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49047922 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt 49047823  T
Q  189 tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  | | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||      
T  49047822 caacaacaacataacataattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta 49047724  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    || | |||||||| |||  ||||||| ||| |||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  49047723 tcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcata 49047625  T
Q  387 caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag 481  Q
      || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| | || |||| | | |||||||||| ||||||||    
T  49047624 -taacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcc-ctagttcaagcttcaatttagctcctag 49047527  T
Q  482 ctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc 531  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  49047526 ctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaacccttttc 49047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32494378 - 32494167
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32494378 aatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat 32494279  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  32494278 acacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 32494179  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  32494178 caattgagcata 32494167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 3049517 - 3049717
Alignment:
Q  19 ccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcataccca 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||      ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049517 ccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcacgaaa------acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcataccca 3049610  T
Q  118 agccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3049611 agccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 3049710  T
Q  218 gagcata 224  Q
    |||||||    
T  3049711 gagcata 3049717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2190519 - 2190307
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  2190519 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 2190420  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  2190419 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 2190320  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  2190319 ccaattgagcata 2190307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 111599 - 111390
Alignment:
Q  14 atatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcata 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  111599 atatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatt-tgaatcatgcata 111501  T
Q  114 cccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcacc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  111500 cccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcacc 111401  T
Q  214 aattgagcata 224  Q
    |||||||||||    
T  111400 aattgagcata 111390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 2028843 - 2029055
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  2028843 aatatccaaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 2028942  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattc 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  2028943 tacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcat-gcataattc 2029041  T
Q  211 accaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||    
T  2029042 accaattgagcata 2029055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Original strand, 13274751 - 13275130
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||    
T  13274751 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaac 13274850  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    | |||       ||| |||||||    
T  13274851 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat----accac-------tttctcatact 13274939  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||   | | |||||| | |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  13274940 ttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca 13275039  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13275040 attaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 13275130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42056622 - 42056410
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42056622 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 42056523  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  42056522 tacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 42056423  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  42056422 ccaattgagcata 42056410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 13377489 - 13377883
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||     
T  13377489 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttag 13377588  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  13377589 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtata-attcaacatatatcactttctca 13377687  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  13377688 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg 13377787  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||||| |||| | |||| || ||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13377788 aacaattaatcgattact-caatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 13377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17224212 - 17223896
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  17224212 aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaacatc 17224113  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg 261  Q
     ||||| |||||  ||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17224112 aattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 17224014  T
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa 361  Q
     ||||  || ||||||||||||||  |||| |||||| | |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |     
T  17224013 aaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaattat 17223914  T
Q  362 ttaatccaattaagcactt 380  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  17223913 ttact-caattaagcactt 17223896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 440 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26069501 - 26069397
Alignment:
Q  440 ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctctt 538  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  26069501 ttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctttt 26069402  T
Q  539 gctcc 543  Q
    |||||    
T  26069401 gctcc 26069397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 126375 - 126549
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |  |  ||| ||    
T  126375 acccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaa 126474  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  126475 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 126549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 48356667 - 48356997
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| ||||||     
T  48356667 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa 48356766  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || |||||||  ||||||| ||| |  |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  48356767 catttagagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca 48356865  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||| ||||  |||  |||||| || |||     
T  48356866 tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaa 48356964  T
Q  411 tgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48356965 tgattatgattgaattctaacccccttacctta 48356997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16915152 - 16914822
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || |  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || ||||||     
T  16915152 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatgacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa 16915053  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    |  || ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  16915052 cgtttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaaca 16914954  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataa 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||| || || |||    
T  16914953 tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttacactaa 16914856  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16914855 atgattgtgattgaattctaacccctttacctta 16914822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 9838932 - 9839232
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca 241  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| |      
T  9838932 cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacac 9839030  T
Q  242 tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc 341  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9839031 tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 9839130  T
Q  342 atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttat 438  Q
    |  ||||||||||||||||  || | |||||||||||||  | | || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  9839131 aactatgaacaattaatcacgtact-caattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttac 9839228  T
Q  439 ctta 442  Q
    ||||    
T  9839229 ctta 9839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 9611360 - 9611661
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattg--agcatattttcaacacatatcc 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || ||   |||||| || ||||| ||| |     
T  9611360 cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataaca 9611458  T
Q  241 atttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttat 340  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  9611459 ctttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaa 9611558  T
Q  341 catttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta 437  Q
    ||  ||||||||||||||||  || | |||||||||||||  | | || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9611559 caactatgaacaattaatcacgtact-caattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctctta 9611656  T
Q  438 tctta 442  Q
     ||||    
T  9611657 cctta 9611661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34241297 - 34241100
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    |||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  34241297 catacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaacta 34241198  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34241197 tgaacaattaatcacttact-caattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 34241100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 443
Target Start/End: Original strand, 31501177 - 31501527
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | | |||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | ||    
T  31501177 caaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaaca 31501276  T
Q  194 acaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||||||| | ||||  | |||||  |||  |||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||  ||       
T  31501277 acaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcacc 31501375  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaat 391  Q
    || |||||  || |||||||  | ||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||| |||||| || || |||||||||||||  |||  ||| |    
T  31501376 aatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaatt 31501474  T
Q  392 aattgaaaattgcaa-taagtgatta-tgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  31501475 aa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttaccttag 31501527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1937289 - 1937173
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| |||||| |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || |  ||| |||| |||    
T  1937289 tttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa 1937190  T
Q  156 caacatccattgatcat 172  Q
    ||||| |||||||||||    
T  1937189 caacaaccattgatcat 1937173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 4484687 - 4484854
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||||| |||||||  | || ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | |||||    
T  4484687 acccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 4484786  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | |||||| ||| || |||||| |||||    
T  4484787 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatt 4484854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Original strand, 16919613 - 16919735
Alignment:
Q  144 acttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccat 242  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || ||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  |    
T  16919613 acttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcact 16919711  T
Q  243 ttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    || ||||| |||||||||| ||||    
T  16919712 ttctcatattttgaacatgaaatt 16919735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14271989 - 14271838
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||  || | || ||||| |||  ||||||  || |||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  14271989 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttga-caacta 14271891  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa 400  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  14271890 tgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaa 14271838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9724031 - 9723927
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || ||||||     
T  9724031 acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa 9723932  T
Q  213 caatt 217  Q
    |||||    
T  9723931 caatt 9723927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583674
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| |     
T  20583821 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaa 20583722  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||  || |||| |||| | |||||||||| || |||||| |||||    
T  20583721 catgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 20583674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 15358820 - 15358918
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||  |||||||||||||||||| ||| | |||||  |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  15358820 acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattca 15358918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 46474056 - 46474128
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| |||||    
T  46474056 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 46474128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12837521 - 12837000
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  12837521 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaac---ttatttctca-caacaaatcatgaatcatgca 12837426  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12837425 tacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattca 12837326  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12837325 ccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca 12837226  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagt 411  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  12837225 tgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagt 12837127  T
Q  412 gattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12837126 gattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 12837027  T
Q  509 gtcctcttttctctacccttttctcct 535  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12837026 gtcctcttctctctacccttttctcct 12837000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 44055881 - 44056372
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   || ||| ||||    
T  44055881 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaa 44055980  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44055981 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttg 44056080  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44056081 aacatgtaattcaactaacaacaattcaa-aattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 44056179  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||     
T  44056180 aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct 44056279  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44056280 ctctagcttaggtttcaattttgctcctagctcttctactaacccttgattcttcaaatcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 44056372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 34395223 - 34395714
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||    
T  34395223 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaa 34395322  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  34395323 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactt 34395421  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34395422 tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaa 34395520  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact 449  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||| |    
T  34395521 ttaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat 34395620  T
Q  450 ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34395621 ctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacctttttctcctcttgctcc 34395714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 70 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21959730 - 21959254
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    |||||||| || |||||  ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21959730 caacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgat 21959631  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21959630 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaattcaa 21959532  T
Q  270 ctaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcca 369  Q
      |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| | |||    
T  21959531 tcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcaccca 21959432  T
Q  370 attaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggct 465  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||||||||| ||    
T  21959431 aataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagact 21959332  T
Q  466 tcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21959331 tcaattttgctcctagctcttctcccaactcttgattcttcaagtcatcttctctctacccttttctcctcttgctcc 21959254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 30457909 - 30458360
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30457909 aaataatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 30458007  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  30458008 caacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataa 30458107  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30458108 cttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataat 30458207  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc 491  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  30458208 tcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagattttctctc 30458307  T
Q  492 aacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30458308 aaccctcgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 30458360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 113 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8872698 - 8872264
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataatt 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||||   |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  8872698 acccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataatt 8872599  T
Q  210 caccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  8872598 caccaattgagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaa 8872500  T
Q  310 catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  8872499 catgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aa 8872401  T
Q  410 gtgattatgatgaattctaaccccctta---tcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8872400 gtgattatgatgaattctaacccccttactttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattcttc 8872301  T
Q  507 aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8872300 aagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 8872264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 52 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23270219 - 23269745
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||  | |||||  ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  23270219 ccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaaca 23270120  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23270119 acaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccatttt-catac 23270021  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23270020 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 23269922  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt 445  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||    
T  23269921 acaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 23269822  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct 522  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23269821 taatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaact-ccaatccttgattcttcaagttcctcttctctct 23269745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 226 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813337
Alignment:
Q  226 tttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataatta 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20813658 tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta 20813559  T
Q  326 gagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatt 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813558 gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt 20813459  T
Q  426 ctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctc 521  Q
    |||||||||||| |    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20813458 ctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctc 20813359  T
Q  522 tacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20813358 tacccttttctcctcttgctcc 20813337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 820154 - 819721
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  820154 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 820059  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |     |||        |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  820058 caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacatttt-caca-----aac--------caac-aacaacaattcaattatccataa 819974  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  819973 cttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataat 819874  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcc 490  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  819873 taaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcatagctcttctcc 819774  T
Q  491 caacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  819773 caacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 819721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 55 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53705015 - 53704525
Alignment:
Q  55 ttttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaaca 154  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||    
T  53705015 ttttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaaca 53704916  T
Q  155 acaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53704915 acaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatacttt 53704817  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  53704816 gaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaat 53704717  T
Q  355 taatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactcc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  53704716 taatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttactcc 53704617  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53704616 cctaagcttaagcttcaattttactcctagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctctagctcc 53704525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 16732135 - 16732626
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  16732135 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 16732234  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||    
T  16732235 cgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg 16732334  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16732335 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 16732434  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataatt-gaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactc 450  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |    |||| ||| ||    
T  16732435 aatcaattcacccaattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacctctttaccttagttagattaatc 16732532  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |   |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16732533 tccctagtttaggcttcaattttggtcctagctc-tcttcacccccttgattcgtcaagttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc 16732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45459099 - 45458645
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |    
T  45459099 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaac 45459000  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    |||| || | ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||   | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  45458999 aacagcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctat 45458900  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  45458899 cacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata 45458800  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45458799 attgaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccc-ttaccttagttaggttaatctctttagcttagacttcaattttgctcctagcttttct 45458701  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45458700 cccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttcttctcttgctcc 45458645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232285
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30232763 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 30232664  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattttt--catactttgaacatgtaattc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||||||||| |||| | ||     
T  30232663 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagttt 30232566  T
Q  268 aactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatc 367  Q
     || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |      
T  30232565 caccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-aca 30232468  T
Q  368 caattaagcactt-ttcacacaaataattg--aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagctt 460  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||||||| || |||||||||    
T  30232467 caattaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttaggttaatctctctagctt 30232369  T
Q  461 aggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30232368 agacttcaattttgctcctagctcttctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttcatcctcttgctcc 30232285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 55376884 - 55376493
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||    
T  55376884 acccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaa 55376785  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  55376784 caacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtatattttca-cacatacccatttttcat 55376686  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  55376685 acttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatga 55376586  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  55376585 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaa-aagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 55376493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 44346826 - 44347280
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  44346826 aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaatt 44346925  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
     || |||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  44346926 catgaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaatta 44347023  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacac 387  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  44347024 ttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatac 44347123  T
Q  388 aaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44347124 aaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaactcccttaccttagtagattaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctaactc 44347222  T
Q  485 ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44347223 -tctatc-acccttgattcttcaattcctcttctctctgacccttttctcctcttgctcc 44347280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53907980 - 53907500
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    |||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| | |||    
T  53907980 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaa 53907881  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||   |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  53907880 caacaaca---attgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatact 53907785  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53907784 ttgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca 53907685  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttact 449  Q
    |||        ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |    
T  53907684 att--------aatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaat 53907594  T
Q  450 ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | |   |||||| ||||||||||||||| ||||| |   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  53907593 ctcctaagcttaagcttcaattttgctcatagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcctttctctaaccattttctcctctagctcc 53907500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 52265814 - 52265309
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |     
T  52265814 ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat 52265715  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttc 229  Q
    || ||  || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  52265714 caacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatattt-c 52265616  T
Q  230 aacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagc 329  Q
    |||| ||| |  ||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||    
T  52265615 aacatataccactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagc 52265516  T
Q  330 acgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattct 427  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52265515 acgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattct 52265418  T
Q  428 aacccccttatctt----aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct 522  Q
    |||||||||| |||    || ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52265417 aacccccttaccttagtcagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatctttgattcttcaagttcctcttctctct 52265319  T
Q  523 acccttttct 532  Q
    | || |||||    
T  52265318 aaccctttct 52265309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13809758 - 13809321
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13809758 aacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt 13809659  T
Q  189 tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc 286  Q
     | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||     
T  13809658 caacaacaacatagcataattcaactaattgagcata-tttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaatt 13809561  T
Q  287 ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac 385  Q
      | | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  13809560 accaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcat 13809462  T
Q  386 acaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta 480  Q
    || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| | || |||||| | |||||||||| || ||||    
T  13809461 ac-aataattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcc-ctagctcaagcttcaatttagccccta 13809364  T
Q  481 gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctcta 523  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  13809363 gctc-tctcccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctcta 13809321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Original strand, 27960984 - 27961325
Alignment:
Q  103 aatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||||    
T  27960984 aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataa 27961083  T
Q  203 cataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcata 301  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  27961084 cataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataccacttcttcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatg 27961182  T
Q  302 catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa 400  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||     
T  27961183 cattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaat 27961280  T
Q  401 ttgcaata--agtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    || || ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27961281 ttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 27961325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18494611 - 18494153
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  18494611 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaac 18494512  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt--tcata 250  Q
    |||| || | |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  |||||    
T  18494511 aacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca-tttcaacatata-ccatttttctcata 18494414  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    |||||| |||| | ||  || ||||||||||||||  | |||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  18494413 ctttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaa 18494315  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagca-cttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt 445  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |    
T  18494314 caattgatcaatt-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 18494217  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 510  Q
    || || | |||||||| || ||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  18494216 taatctccctagcttaagcctcaatttagctcctagat-ttcttccaatccttgattcttcaagt 18494153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 15044788 - 15045182
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||     
T  15044788 acccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag 15044887  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  15044888 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca 15044986  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  15044987 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg 15045086  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa--taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||  ||   || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15045087 aacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag 15045182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15272645 - 15272433
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  15272645 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 15272546  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  15272545 tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 15272446  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  15272445 ccaattgagcata 15272433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15109636 - 15109242
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||     
T  15109636 acccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttag 15109537  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  15109536 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtata-attcaacatatatcactttctca 15109438  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |  |||||    
T  15109437 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattatg 15109338  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa--taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||  ||   || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15109337 aataattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag 15109242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47535252 - 47535035
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    |||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||| |||    
T  47535252 caacaacaacgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatcactttctca 47535154  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||||||||| || ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47535153 tactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatg 47535054  T
Q  349 aacaattaatcaattaatc 367  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  47535053 aacaattaatcatttaatc 47535035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 14951722 - 14951896
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || | |||||| || |  ||| ||    
T  14951722 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 14951821  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  14951822 taacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 14951896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185739
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | | |||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || ||||||     
T  7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcat 7185969  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || | ||| | || ||||| |||||  |||  |||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||  |||||    
T  7185968 catttagtgcacaatt-caacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaaca 7185870  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || |||     
T  7185869 tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa 7185771  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7185770 tgattatgatgaattctaacctccttacctta 7185739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41166227 - 41165998
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| | ||||||| | |||||  | |||||||| || | | ||| ||||||||||||||| | | || ||| |||| |||||| ||||||    
T  41166227 tttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 41166128  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  41166127 caacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 41166029  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaat 285  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  41166028 gaacatgaaatttcactaacaacaattcaat 41165998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25119497 - 25119328
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaaca 154  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| || |  ||| |||||||    
T  25119497 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaaca 25119398  T
Q  155 acaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||| ||||    
T  25119397 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata 25119328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 14901242 - 14901585
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||| | || ||| | || |||||| ||||||||||||| |||||  ||||  |||| ||||||| |  || ||||    
T  14901242 atgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaacaacaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataaca 14901341  T
Q  200 taacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||||||| || || ||||||||||  |||| |||||  ||| ||||||||  |||||| ||||  || ||||||||| ||||  || | || |||    
T  14901342 tatcataattcaacattttgagcatattta-aacatatatcactttctcatacttcaaacatgaaatttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttc 14901439  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- 396  Q
    ||||||  ||||||    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||     
T  14901440 atacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattga 14901537  T
Q  397 aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14901538 aaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttaccttag 14901585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5682816 - 5682648
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| || |  | | || |||||    
T  5682816 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaacaa 5682717  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  5682716 caacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 5682648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 18276457 - 18276787
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||| ||| | || ||| || | |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||| ||| || ||||||     
T  18276457 acccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactttgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaa 18276556  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||| ||||||||||| ||||  || |||||||||| |||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  18276557 catttagagcataatt-caacatataacactttcacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaaca 18276655  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  || | |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  18276656 tatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacatact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatcgcactaa 18276753  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18276754 atgattatgattgaattctaaccccgttacctta 18276787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41256656 - 41256262
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||| | ||| | |||||| |||||||| | || ||| || | | |||||    
T  41256656 acccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 41256557  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||   || ||||||||| | ||||||| || || |||||| ||||| ||||||| || ||  | |||||  |||  ||    
T  41256556 caacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcaca 41256458  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||    
T  41256457 tactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatg 41256359  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa-taagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||   || ||||  |||  |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41256358 aacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 41256262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7964997 - 7964605
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | ||||||     
T  7964997 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 7964899  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||| ||| ||| | |||||  || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||    
T  7964898 caacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcaca 7964800  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || |||||  ||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  7964799 tactt-gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatg 7964701  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7964700 aacaattactcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 7964605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15013506 - 15013176
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||| ||| ||| | |||||  || ||||||||| | ||||||| || || ||||||     
T  15013506 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaa 15013407  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    ||||| ||||||| || ||  | || ||  |||  |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| ||| | ||||    
T  15013406 caatttgagcataatt-cacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaaca 15013309  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa-taa 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||   || || || || |||||||| ||| |||    
T  15013308 tatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaa 15013211  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15013210 atgattatgattgaattctaacccccttaccttag 15013176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15675330 - 15675219
Alignment:
Q  111 atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc 210  Q
    |||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || |||||    
T  15675330 atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattc 15675231  T
Q  211 accaattgagca 222  Q
    ||||||||||||    
T  15675230 accaattgagca 15675219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19822022 - 19821940
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatg 173  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19822022 caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 19821940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 30232842 - 30232789
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaa 65  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30232842 aatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaa 30232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 224
Target Start/End: Original strand, 31115651 - 31115764
Alignment:
Q  111 atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc 210  Q
    |||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| ||  | |||||    
T  31115651 atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattc 31115750  T
Q  211 accaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||    
T  31115751 accaattgagcata 31115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104380
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca 222  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  10104452 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca 10104380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13590298 - 13590194
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || ||||||     
T  13590298 acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa 13590199  T
Q  213 caatt 217  Q
    |||||    
T  13590198 caatt 13590194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Original strand, 54398406 - 54398510
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| | | ||||||||||||| ||||||     
T  54398406 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa 54398505  T
Q  213 caatt 217  Q
    |||||    
T  54398506 caatt 54398510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18238440 - 18238277
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | ||  || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | |||||||||    
T  18238440 attttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac 18238341  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    ||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||    
T  18238340 aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 18238277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19821768 - 19821669
Alignment:
Q  346 atgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttatctt 441  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19821768 atgatcaattaatcaattactc-aattaagcacttattcata-aaacaattgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 19821671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 487
Target Start/End: Original strand, 9199364 - 9199397
Alignment:
Q  454 ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9199364 ctagcttaggcttcaatttagctcctagctcttc 9199397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 487
Target Start/End: Original strand, 9252947 - 9252980
Alignment:
Q  454 ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9252947 ctagcttaggcttcaatttagctcctagctcttc 9252980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15851663 - 15851607
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataag-tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc 86  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15851663 ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttc 15851607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 37956949 - 37956917
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37956949 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 37956917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40885490 - 40885458
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40885490 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 40885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40885756 - 40885676
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||    
T  40885756 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca 40885676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 20711998 - 20712534
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20711998 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcatcagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgca 20712097  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  20712098 tacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattca 20712197  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20712198 ccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaaca 20712297  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaa-taag 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20712298 tgtcatcataattagagcacgaatttcatcatt-atgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataag 20712396  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20712397 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 20712496  T
Q  507 aagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20712497 aagttctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 20712534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 50 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1168491 - 1167996
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||     
T  1168491 acccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 1168392  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  1168391 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctcat 1168292  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1168291 actttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatga 1168192  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---tt 446  Q
    |||||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||    
T  1168191 acaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgat-atgatgaattctaacccccttaccttagtagatt 1168093  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1168092 aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 1167996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 100 - 542
Target Start/End: Original strand, 21397099 - 21397547
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa---caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaaca 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21397099 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaca 21397198  T
Q  197 acataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||    
T  21397199 acaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataa 21397296  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21397297 cttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataat 21397396  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcc 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21397397 tgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctatcttaggcttcaatttttctcctagatcttctcc 21397496  T
Q  491 caacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctc 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  21397497 caacccttgattcttcaagtcctcttct-ttaacccttttctcctcttgctc 21397547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Original strand, 4865224 - 4865717
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaa-ttagcatcaataacaccacttaac 150  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | || ||  |||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||  | | |||    
T  4865224 ccattttcatcaaaacaccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaac 4865323  T
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata 250  Q
    ||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  4865324 aaccataacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacc-catacccatttttcata 4865422  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4865423 ctttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaa 4865522  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtta 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  4865523 caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggtta 4865621  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4865622 atctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-ccaaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttatttcctcttgctcc 4865717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 89 - 542
Target Start/End: Original strand, 28261520 - 28261969
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28261520 aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcataaaacatatcacaatt 28261619  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  28261620 tatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatat----ttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcat 28261714  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca 388  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  28261715 tcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcataca 28261814  T
Q  389 aataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 485  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28261815 aataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctc- 28261912  T
Q  486 tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctc 542  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28261913 tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcatcttgctc 28261969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Original strand, 21906730 - 21907155
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21906730 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacatca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca 21906826  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||                  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  21906827 tagcataattcatcaattgaacatatttt------------------catactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttca 21906908  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21906909 tatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa 21907008  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc 495  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21907009 attgtgataaatgattatgataaattct-acccccttaccttagttatattactctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccaaacc 21907107  T
Q  496 cttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21907108 cttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 21907155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 94 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 24183372 - 24182943
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   ||  || || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  24183372 caaatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaa---catgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaaca 24183276  T
Q  194 acaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccata 293  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  24183275 acaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatg 24183176  T
Q  294 acttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataa 393  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24183175 acttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataa 24183076  T
Q  394 ttg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24183075 ttgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tct 24182978  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctcta 523  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24182977 cccaatccttgattcttcaagtcctcttctctcta 24182943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11337423 - 11336975
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11337423 atgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca 11337324  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  11337323 taacataattcaccaaatgagcatattttcaacattta-ccatattctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc 11337225  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga 397  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  11337224 atacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattga 11337126  T
Q  398 aaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaa 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11337125 aaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagctcaagcttcaattttgctcctagctc-tcccccaa 11337027  T
Q  494 cccttgattcttcaa-gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  11337026 tccttgattcttcaatttcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcc 11336975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21647023 - 21646532
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |  ||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||| |||||    
T  21647023 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaa 21646924  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac- 251  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||     
T  21646923 caacagcaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcat-acatacccatttt-cataca 21646826  T
Q  252 -tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  21646825 cttttaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaa 21646727  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gtta 447  Q
    || |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||    
T  21646726 catttaatcaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagtaggtta 21646628  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  21646627 atctctctagtttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctttaccattttctccttttgctcc 21646532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 90 - 535
Target Start/End: Original strand, 19405537 - 19405989
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19405537 acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaatatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 19405636  T
Q  190 atcaacaacataacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
    | |||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  19405637 aacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaataattcaattat 19405736  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac 387  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  19405737 ccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac 19405836  T
Q  388 aaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc 482  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19405837 -aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagc 19405935  T
Q  483 tcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19405936 tc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttctcct 19405989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 11584012 - 11584405
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcata-cccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  | |  ||| |    
T  11584012 acccatttt-acaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaa 11584109  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataa---cataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  11584110 acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttc 11584209  T
Q  246 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattt 345  Q
      | ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| | || |     
T  11584210 atacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactc 11584309  T
Q  346 atgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11584310 atgaacaattaattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 11584405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 374
Target Start/End: Original strand, 24475546 - 24475861
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||    
T  24475546 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 24475645  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac- 251  Q
    ||||||||   |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  24475646 caacaaca---attgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-cataca 24475738  T
Q  252 -tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24475739 ctttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaa 24475837  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaa 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  24475838 caattaatcaattcatccaattaa 24475861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 21650618 - 21650829
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  21650618 aatatcccaatctaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcat 21650717  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    ||||||||||    
T  21650718 acccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcac 21650817  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  21650818 caattgagcata 21650829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 21204848 - 21205060
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21204848 aatatcccaattcaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 21204947  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  21204948 tacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaacaacaacaacaaatattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 21205047  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  21205048 ccaattgagcata 21205060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 443
Target Start/End: Original strand, 23493882 - 23494273
Alignment:
Q  53 cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||    
T  23493882 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaa 23493981  T
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | |||||| ||| | ||| |||||||    
T  23493982 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcata-tctcaacatatacctattcttcatac 23494080  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||   |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  23494081 tttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaac 23494180  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||| || ||  | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23494181 aattaattgattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttaccttag 23494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 3673822 - 3674216
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || |||||  ||| | ||| | ||||||||||||||| | ||||||  ||  | ||||     
T  3673822 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgcttag 3673921  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||    
T  3673922 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctca 3674020  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  3674021 tactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatg 3674120  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3674121 aacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 3674216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 442
Target Start/End: Original strand, 19862183 - 19862563
Alignment:
Q  64 aaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcc 163  Q
    ||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||||     
T  19862183 aaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatca 19862282  T
Q  164 attgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgt 262  Q
    ||||  |||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||     
T  19862283 attgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatga 19862381  T
Q  263 aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaat 362  Q
    ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  19862382 aatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcact 19862481  T
Q  363 taatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    || | ||||||||||||| |||| ||||  |||  |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19862482 tact-caattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 19862563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 508
Target Start/End: Original strand, 23466456 - 23466856
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23466456 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt 23466555  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt--tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc 286  Q
     |                    |||||||||||||| |||||||| | | |||||||  ||||||||||| |||| | ||  || ||||||||||||||     
T  23466556 ca--------------------accaattgagcata-tttcaacataca-ccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaatt 23466633  T
Q  287 ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac 385  Q
     | ||||||||| |||||  |||||||    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||     
T  23466634 at-cataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaatt-acacaattaatcacttattcat 23466731  T
Q  386 acaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag 481  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23466732 ac-aataattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 23466830  T
Q  482 ctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  23466831 ctc-tcttccactccttgattcttcaa 23466856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5451130 - 5450804
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| | |||   | |||||||| |||| | |||||| |||| ||||||     
T  5451130 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttag 5451031  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||    
T  5451030 caacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctca 5450932  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  5450931 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatg 5450832  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagca 377  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5450831 aacaattaatcaattact-caattaagca 5450804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Original strand, 7728421 - 7728775
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |    
T  7728421 caacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattca 7728520  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  ||    
T  7728521 acaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatc 7728619  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca 388  Q
       || ||||| |||  ||| ||  | |||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||    
T  7728620 accaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcataca 7728718  T
Q  389 aataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |  |||  ||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7728719 acaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 7728775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 443
Target Start/End: Original strand, 16595472 - 16595861
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  | |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || | || || ||||||||    
T  16595472 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaac 16595571  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    | | ||||| ||||| |||||| || | || |||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |  ||| ||||||||    
T  16595572 atctacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactt 16595670  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||| ||||   ||| ||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  16595671 tgaacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa 16595770  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16595771 ttagtcaattact-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 16595861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 432423 - 432816
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||  |  | ||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| | || ||| || | ||||||     
T  432423 acccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttctcatgatcaaatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttag 432522  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  | ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||    
T  432523 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcattttctca 432621  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||  || | |||| ||| |||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  432622 tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatg 432721  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    | |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  432722 atcaattaatcatttact-caattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 432816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23981802 - 23981433
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | ||||||     
T  23981802 acccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatca-caaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23981704  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||  |  || |  || | ||    
T  23981703 caacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacatttataca 23981605  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23981604 tactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcacttatg 23981505  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat 420  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23981504 aacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat 23981433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Original strand, 2031783 - 2031944
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||||||||| |    
T  2031783 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 2031882  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  2031883 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 2031944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Original strand, 28902252 - 28902546
Alignment:
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| ||||    
T  28902252 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat 28902350  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||| | | ||  || ||||||||||||||  || | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  28902351 actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga 28902450  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28902451 acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 28902546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 443
Target Start/End: Original strand, 28938647 - 28938941
Alignment:
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| ||||    
T  28938647 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat 28938745  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||| | | ||  || ||||||||||||||  || | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  28938746 actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga 28938845  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28938846 acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 28938941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 11342644 - 11342819
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || | |||||| || |  ||| ||    
T  11342644 acccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 11342743  T
Q  150 c-aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  11342744 caaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 11342819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 442
Target Start/End: Original strand, 21617020 - 21617370
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||    
T  21617020 caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaca 21617119  T
Q  194 acaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||||  | |||||| || || |||||||  ||||||| ||| |  |||   |||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||       
T  21617120 acaacatagaacaattcaacatttagagcata-gttcaacatataacactttcatatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcacc 21617218  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc-atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa 390  Q
    || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||| || ||    
T  21617219 aatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaacaattaatcccttact-caattaagcacttaatcatac-aa 21617316  T
Q  391 taattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21617317 taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 21617370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21310796 - 21310602
Alignment:
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21310796 actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatga 21310697  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21310696 acaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttag 21310602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21222802 - 21222583
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca 241  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||| | || || ||||||| || ||||| ||| |      
T  21222802 cacttagcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataatt-caacatataacac 21222704  T
Q  242 tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc 341  Q
    |||   |||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||  ||   || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  21222703 tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac 21222604  T
Q  342 atttatgaacaattaatcaat 362  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  21222603 aactatgaacaattaatcaat 21222583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21297262 - 21297068
Alignment:
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21297262 actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatga 21297163  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21297162 acaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 21297068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22662608 - 22662478
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22662608 tgattatgatgaattctatcccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaatttttctcctagctc-tctcccaatccttgattcttc 22662510  T
Q  507 aagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
     ||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  22662509 tagttctcccttctctctaacccttttctcct 22662478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Original strand, 6456604 - 6456751
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || |||  | | | |||||||||||||||||| ||| |     
T  6456604 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 6456703  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||  || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6456704 catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt 6456751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32966171 - 32966041
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || | || || |||||||||||    | | ||     
T  32966171 catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttatttatac-aacaattgaaaattcacactaaaaa 32966074  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32966073 tgattatgatgaattctaaccctcttaccttag 32966041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 443
Target Start/End: Original strand, 37983598 - 37983718
Alignment:
Q  324 tagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tg 421  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||||| ||    
T  37983598 tagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattg 37983696  T
Q  422 aattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  37983697 aattctaacccccttaccttag 37983718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22054072 - 22053963
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || |||||||    
T  22054072 acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcac 22053973  T
Q  213 caattgagca 222  Q
    ||||||||||    
T  22053972 caattgagca 22053963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 211
Target Start/End: Original strand, 29917929 - 29918086
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| || |||||| | |||| ||||||||||  |||| ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| ||||    
T  29917929 atttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaac 29918028  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||  || | |||||  || |||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  29918029 aacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattca 29918086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 21109805 - 21109877
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  21109805 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt 21109877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25048 - 24517
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  25048 aatatcccaattcaacaattgagcgaaat----aagtactcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaat 24953  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24952 acccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac 24853  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24852 caattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacat 24753  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24752 gtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtg 24653  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24652 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattctgcaa 24553  T
Q  509 gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24552 gtcctcttctctctaacccttttctccttttgctcc 24517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 94898 - 95109
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  94898 aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 94997  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  94998 acccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 95097  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
     |||||||||||    
T  95098 taattgagcata 95109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 18777069 - 18777587
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18777069 aatatcccaatccaacaattgaacaaaactcataagtatctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 18777168  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18777169 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac 18777268  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18777269 caattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat 18777368  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg 412  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18777369 gtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaa-----------------caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtg 18777451  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777452 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 18777551  T
Q  509 gtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18777552 gtcctcttctctctaacccttttcttctcttgctcc 18777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 532
Target Start/End: Original strand, 18570203 - 18570723
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18570203 aatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtactcattttcaccaaaccaacaacaacactt-atttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 18570301  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18570302 acccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcac 18570401  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  18570402 caattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacat 18570501  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtg 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  18570502 gtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aattg 18570600  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  18570601 attatgatgaattctaacccccttaccttagtatgttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctcaac-cccaatccttgattcttcaag 18570699  T
Q  510 -tcctcttttctctacccttttct 532  Q
     ||||||| |||||| || |||||    
T  18570700 ttcctcttctctctaaccctttct 18570723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 32898756 - 32899248
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  32898756 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32898855  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32898856 caacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg 32898955  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32898956 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 32899055  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactcc 451  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| ||     
T  32899056 aatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct 32899155  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32899156 atctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttatcctcttgctcc 32899248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 95 - 544
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086475
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||    
T  16086022 aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa 16086121  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    |||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16086122 caacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataa 16086221  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16086222 cttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaat 16086321  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcc 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16086322 tgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctatttcttctcc 16086421  T
Q  491 caacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcct 544  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16086422 caacccttgattcttcaagttctcttctctctacccttttctcctcttgctcct 16086475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 121 - 543
Target Start/End: Original strand, 16106547 - 16106973
Alignment:
Q  121 catgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag 220  Q
    ||||||||| ||| || ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||||||| ||    
T  16106547 catgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaag 16106646  T
Q  221 catattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcat 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16106647 catattttcaacacatactcatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat 16106746  T
Q  321 aattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat 420  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106747 aattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgat 16106846  T
Q  421 gaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctt 516  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16106847 gaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttactcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctatt 16106946  T
Q  517 ttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  16106947 ctctctacccttttctcctcttgctcc 16106973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 103 - 543
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18433098
Alignment:
Q  103 aatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |     
T  18432656 aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaag 18432755  T
Q  203 cataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatac 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  18432756 cataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatac 18432855  T
Q  303 atctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa-t 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  18432856 atctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaaaatt 18432954  T
Q  402 tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18432955 tgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctcttctcccaaccct 18433053  T
Q  498 tgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||    
T  18433054 tgattcttcaagtcctcttctct-aacccttttcacctattgctcc 18433098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 22440940 - 22441388
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  22440940 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaa 22441038  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |  ||||||||||  | |||||    
T  22441039 caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataa 22441138  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22441139 cttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataat 22441238  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc 491  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || |  |||||||| |||||||||| |||||||||||  |       
T  22441239 tgaaaattgcaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccatagcttagacttcaatttttctcctagctctctt--t 22441335  T
Q  492 aacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22441336 tacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 22441388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13014943 - 13014503
Alignment:
Q  102 gaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata 201  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  13014943 gaatcatgca-acccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaat 13014845  T
Q  202 acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcata 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13014844 gcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc-aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcata 13014746  T
Q  302 catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa--ataattgaaa 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  13014745 catctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaa 13014646  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccc 496  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  ||    
T  13014645 attacaataagtgattatgataaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttaaattttgctcctagctc-tccccaagtcc 13014547  T
Q  497 ttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttg 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13014546 ttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttg 13014503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 90 - 374
Target Start/End: Original strand, 31628268 - 31628552
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31628268 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 31628367  T
Q  190 atcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31628368 aacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc 31628467  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaa 374  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31628468 aataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaa 31628552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 540
Target Start/End: Original strand, 18398899 - 18399392
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | || ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||     
T  18398899 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttag 18398997  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tc 247  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||    
T  18398998 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata-ctattttctc 18399095  T
Q  248 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat 347  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  18399096 atactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat 18399195  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tt 441  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |    ||    
T  18399196 gaacaattagtcaattact-caattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttaccttagtt 18399293  T
Q  442 aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttg 539  Q
    || ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  || ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18399294 agattaatctccctagcttagacttcaattttgctcctagctctctt--caccccttgatttttcaagttcatcttctctctaacccttttctcctcttg 18399391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15742555 - 15742341
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15742555 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 15742456  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||    
T  15742455 acccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatt 15742356  T
Q  210 caccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||||    
T  15742355 caccaattgagcata 15742341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 23994845 - 23995057
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  23994845 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 23994944  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  23994945 tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 23995044  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  23995045 ccaattgagcata 23995057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 26089659 - 26089869
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  26089659 aatatctcaatccaacaattgagcaaaacacataagtattcattttcacccaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaa-ttatgaatcatgcat 26089757  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  26089758 acccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 26089857  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  26089858 caattgagcata 26089869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18002827 - 18002617
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  18002827 aatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtattcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagt-atgaatcatgcat 18002729  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||     
T  18002728 acccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcat 18002629  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  18002628 caattgagcata 18002617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25367483 - 25367129
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |    
T  25367483 caacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattca 25367384  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | | |  ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||  ||    
T  25367383 acaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatc 25367285  T
Q  290 -cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac 387  Q
      | ||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||    
T  25367284 aaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgct-caattaagcacttattcatac 25367186  T
Q  388 aaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     |||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25367185 -aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 21623171 - 21623522
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |  | ||  |||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  |||| ||||||| | |    
T  21623171 acaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaac 21623270  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca 291  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||  || |    
T  21623271 aacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaa 21623369  T
Q  292 taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa 390  Q
     |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||    
T  21623370 caacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aa 21623467  T
Q  391 taattga-aaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     |||||| ||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21623468 caattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 21623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 407 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25640491 - 25640351
Alignment:
Q  407 taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25640491 taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttggttaatctctctagattaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc 25640392  T
Q  504 ttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  25640391 ttcaagtcttcttctctttgacccttttctcctctagctcc 25640351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18381964 - 18381660
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||||||    
T  18381964 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 18381865  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| || ||||||  ||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  18381864 caacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 18381766  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||| ||||  || |||||| |||||||  || | ||||||||  ||  ||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||||    
T  18381765 gaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 18381666  T
Q  355 taatca 360  Q
    ||||||    
T  18381665 taatca 18381660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35015446 - 35015278
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  35015446 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 35015347  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  35015346 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 35015278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22362002 - 22361660
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  22362002 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaaca 22361903  T
Q  200 taacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||| || ||||  || ||  ||| |||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||  || | || |||    
T  22361902 tagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttc 22361804  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- 396  Q
    || |||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| || || |||||     
T  22361803 atgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattga 22361706  T
Q  397 aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22361705 aaaattacta-aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 22361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 543
Target Start/End: Original strand, 31628556 - 31628646
Alignment:
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31628556 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct-ctctccatccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 31628646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079501
Alignment:
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||| |||  || |||  |||| || ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  15079795 actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaatttaa-catctatga 15079699  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt- 445  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |     
T  15079698 ataattaatcaatta-tccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagtta 15079602  T
Q  446 ---tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgct 541  Q
       || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  15079601 gattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctttttcctcttgct 15079503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21411191 - 21410943
Alignment:
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||  || | ||    
T  21411191 caacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaa 21411093  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataa 393  Q
    |||||| |||  | ||||  |||||||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||| || |||||    
T  21411092 cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataa 21410995  T
Q  394 ttgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21410994 ttgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 21410943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25744498 - 25744331
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  25744498 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 25744399  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga 219  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  25744398 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga 25744331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19983580 - 19983412
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  19983580 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 19983481  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| ||| | | |||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  19983480 caacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcactaattgagcata 19983412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28195324 - 28195101
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaa-cttatcacaatttatcaacaacataacat 205  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||| |||  |||    
T  28195324 atgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcat 28195225  T
Q  206 aattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcataca 303  Q
    |||||| | ||||||||| |||| || || ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  28195224 aattcaactaattgagcacattt-catcatata-ccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcataca 28195127  T
Q  304 tctaaacatgccatcataattagagc 329  Q
    |  ||||||  |||||||||| ||||    
T  28195126 ttcaaacatatcatcataattggagc 28195101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 33324703 - 33325047
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | | |||| |    
T  33324703 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata 33324802  T
Q  200 taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| || ||  |  || |  || | || |||||||||||| || |  || ||||||||||||||  || | || |||    
T  33324803 tagcataattcatccaattgagcataatt-cataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcaacaatttc 33324900  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga 397  Q
    || |||  ||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | |||||||    
T  33324901 atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatac-attaattga 33324998  T
Q  398 a--aattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33324999 aataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 33325047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 285
Target Start/End: Original strand, 25651193 - 25651432
Alignment:
Q  46 aagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccac 145  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||  | || | ||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||    
T  25651193 aagtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac 25651292  T
Q  146 ttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccattt 244  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || |||||||  ||||||| ||| |  |||    
T  25651293 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacacttt 25651391  T
Q  245 ttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat 285  Q
      ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  25651392 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat 25651432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18629698 - 18629501
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18629698 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 18629599  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| |||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18629598 tgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 18629501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35136249 - 35135905
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | | |||| |    
T  35136249 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata 35136150  T
Q  200 taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| || ||  |  || |  || | || |||||||||||| || |  || ||||||||||||||  ||   || |||    
T  35136149 tagcataattcatccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttc 35136052  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- 396  Q
    || |||  ||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||     
T  35136051 atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaattaatcacttattcatac-aataattga 35135954  T
Q  397 -aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     |||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35135953 aaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 35135905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17083384 - 17083092
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||| | || ||||| |||||  |||  ||    
T  17083384 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-caacatatatcattttcaca 17083286  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  17083285 tactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatg 17083187  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  17083186 aacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttaccttag 17083092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 18583377 - 18583451
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  18583377 caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 18583451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16888029 - 16887684
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||   ||||||| ||| ||||| ||||   || |||| |||| | ||||||||    
T  16888029 atgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 16887930  T
Q  200 taacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||  |  || |  || | || |||||||||||| || |  || ||||||| ||||||  ||   || |||    
T  16887929 taacataattcacccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttc 16887831  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga 397  Q
    || |||  ||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  16887830 atgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttattcaattaatcacttattcatac-aataattga 16887733  T
Q  398 aaa---ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||    | | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16887732 aaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 16887684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33538389 - 33538263
Alignment:
Q  318 cataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatta 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||    
T  33538389 catagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta 33538291  T
Q  417 tga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33538290 tgattgaattctaacccccttaccttag 33538263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35009684 - 35009569
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| || |    
T  35009684 atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa 35009585  T
Q  207 attcaccaattgagca 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  35009584 attcaccaattgagca 35009569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17557107 - 17556977
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  17557107 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattagagcacgaa-tttaacaacta 17557010  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  17557009 tgaacaaataatcaatt-attcaattaagcactt 17556977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 34966827 - 34966994
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | ||  || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | |||||    
T  34966827 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 34966926  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  34966927 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatt 34966994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18823633 - 18823565
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||    
T  18823633 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 18823565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18839488 - 18839420
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||    
T  18839488 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 18839420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 18583295 - 18583372
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18583295 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta 18583372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Original strand, 15740454 - 15740576
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||    | | ||     
T  15740454 catcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagtacttattcatacaaa-aattgaaaatttacactaaaaa 15740551  T
Q  411 tgattatgatgaattctaaccccct 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  15740552 tgattatgatgaattctaactccct 15740576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Original strand, 25919614 - 25919696
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatg 173  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| ||  || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  25919614 caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatg 25919696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25744311 - 25744278
Alignment:
Q  510 tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25744311 tcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 25744278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079820
Alignment:
Q  101 tgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacat 200  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||| ||    
T  15079944 tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat 15079845  T
Q  201 aacataattca-ccaattgagcata 224  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  15079844 agcataattcacccaattgagcata 15079820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654394
Alignment:
Q  316 atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  25654350 atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatca 25654394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 443
Target Start/End: Original strand, 25919936 - 25919968
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25919936 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25919968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 20481546 - 20482059
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20481546 ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaa 20481645  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca 230  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20481646 catcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatca 20481745  T
Q  231 acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20481746 acacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagca 20481845  T
Q  331 cgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaa 429  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20481846 cgaatttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattttaa 20481942  T
Q  430 cccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctaccc 526  Q
    |||||||| ||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20481943 cccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctacctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaccc 20482042  T
Q  527 ttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||    
T  20482043 ttttctcctcttgctcc 20482059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 41246624 - 41247113
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  41246624 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 41246723  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||     
T  41246724 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctactttt 41246822  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41246823 aacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaatt 41246922  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccc 452  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| | || |    
T  41246923 aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttaccttagtaggtcaatctc 41247022  T
Q  453 tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41247023 tctagcttaggcttcaattttgctcctacctcttctccgaaccctt-attcttcaagtcctcttctctctaacccttttttcctcttgctcc 41247113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 37611674 - 37612125
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37611674 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 37611772  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||    
T  37611773 caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttat 37611870  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37611871 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaata 37611970  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc 489  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37611971 attgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctatcttaggcttcaattttgctcctagctcttctc 37612070  T
Q  490 ccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37612071 ccaacccttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttttctactcttgctcc 37612125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20573474 - 20572983
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||    
T  20573474 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573376  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||    
T  20573375 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcatacactt 20573276  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20573275 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa 20573176  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttac 448  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||     
T  20573175 ttaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaa 20573077  T
Q  449 tccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20573076 tctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtccttttctctctaacccttttctcctcttgctcc 20572983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 158 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561420
Alignment:
Q  158 acatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  20561810 acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa 20561711  T
Q  258 catgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20561710 catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa 20561611  T
Q  358 tcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccc 452  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || |    
T  20561610 tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctc 20561512  T
Q  453 tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcct 544  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  20561511 cctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttcttcctcttgctcct 20561420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 89 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22235051 - 22234600
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||  | |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22235051 aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaatt 22234952  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc 286  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  22234951 catcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaatt 22234855  T
Q  287 ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcaca 386  Q
     | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |    
T  22234854 attcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttatcata 22234755  T
Q  387 caaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagct 483  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||| || | | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22234754 caaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctcccaaacttagtcttcaattttgctcctagct 22234656  T
Q  484 cttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22234655 cttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaccattttctcctcttg 22234600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19993339 - 19992849
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||||||   | |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  19993339 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 19993240  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  19993239 acaacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catac 19993142  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  19993141 actttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatga 19993043  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---tt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||    
T  19993042 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaattataacccccttaccttagtagatt 19992945  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19992944 aatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctattctctctaacccttttctcctcttgctcc 19992849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 90 - 509
Target Start/End: Original strand, 21681002 - 21681426
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  21681002 acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattc 21681101  T
Q  190 atcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
    | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  21681102 aacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattat 21681201  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac 387  Q
    ||||||  | ||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||    
T  21681202 ccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac 21681301  T
Q  388 aaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc 482  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21681302 -aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttatttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagc 21681400  T
Q  483 tcttctcccaacccttgattcttcaag 509  Q
    || |||||||| |||||||||||||||    
T  21681401 tc-tctcccaatccttgattcttcaag 21681426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 266 - 543
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122896
Alignment:
Q  266 tcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa 365  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25122618 tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca 25122717  T
Q  366 tccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttag 462  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||    
T  25122718 tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttag 25122816  T
Q  463 gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25122817 gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg-ttcttcaagtccttttctctctacccttttctcctcttgctcc 25122896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529642
Alignment:
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tta 442  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    |||    
T  20529843 tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttaccttagtta 20529744  T
Q  443 ggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgct 541  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20529743 ggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgct 20529644  T
Q  542 cc 543  Q
    ||    
T  20529643 cc 20529642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 274366 - 274577
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  274366 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcat 274465  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  274466 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 274565  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||| ||||    
T  274566 caattgaacata 274577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 641483 - 641272
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  641483 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcat 641384  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  641383 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 641284  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||| ||||    
T  641283 caattgaacata 641272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 827289 - 827078
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  827289 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcat 827190  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  827189 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 827090  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||| ||||    
T  827089 caattgaacata 827078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16039213 - 16039002
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16039213 aatatcctaatccaacaattgagcaaaacacataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 16039114  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  16039113 atccaagccataaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 16039014  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
     |||||||||||    
T  16039013 taattgagcata 16039002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 39447048 - 39446567
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  39447048 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac 39446950  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |  || ||||||||    
T  39446949 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataacacttcttcatact 39446851  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  39446850 ttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaaca 39446751  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt 445  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |    
T  39446750 attaatcaattact-caattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 39446653  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc 531  Q
    || | || |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  39446652 taattcc-ctagctcaagcttcaatttagctcatagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaacccttttc 39446567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20654152 - 20653944
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||  || || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20654152 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 20654053  T
Q  190 atcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20654052 atcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc 20653953  T
Q  290 cataacttc 298  Q
    |||||||||    
T  20653952 cataacttc 20653944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 380
Target Start/End: Original strand, 23837164 - 23837487
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||||||    
T  23837164 tttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 23837263  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||    
T  23837264 caacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagtt-caacatatatcactttctcatacttt 23837362  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||| ||||  | |||||||||||||||  || | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23837363 gaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat 23837462  T
Q  355 taatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||    
T  23837463 taatcatttact-caattaagcactt 23837487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20648076 - 20647882
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  || || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20648076 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 20647977  T
Q  190 atcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20647976 atcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa 20647882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21198429 - 21198046
Alignment:
Q  60 accaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaac 159  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||  | | |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |  | ||  |||| |||||| ||||||||||    
T  21198429 accaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaacaacaac 21198330  T
Q  160 atccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaac 258  Q
    ||| ||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  21198329 atcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaac 21198231  T
Q  259 atgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaat 358  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21198230 atgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaat 21198131  T
Q  359 caattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21198130 caattact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatctta 21198046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24386076 - 24385916
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24386076 aatattccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttacttcataacaacaaaattatgaatcatgca 24385977  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcat 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24385976 tacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 24385916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 39115199 - 39115409
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  39115199 aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataaatactcattttcaccaa-ccaacaataacaatttatttctcaacaataaattatgaatcatgcat 39115297  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    || |||| ||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||||||||||    
T  39115298 acacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcac 39115397  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  39115398 caattgagcata 39115409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 168 - 443
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981623
Alignment:
Q  168 atcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22981351 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt 22981449  T
Q  267 caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaat 366  Q
       ||||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||| |     
T  22981450 tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaatt-ac 22981546  T
Q  367 ccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22981547 ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 22981623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 364
Target Start/End: Original strand, 38533650 - 38533923
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |    
T  38533650 caacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattca 38533749  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
     |||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||  |    
T  38533750 acaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattat 38533847  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta 364  Q
    | | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  38533848 caacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatta 38533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506930
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||||||||| |    
T  41507091 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 41506992  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  41506991 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 41506930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 360
Target Start/End: Original strand, 26011455 - 26011764
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | ||||||     
T  26011455 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 26011553  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||    
T  26011554 caacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcaca 26011652  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26011653 tactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatg 26011752  T
Q  349 aacaattaatca 360  Q
    ||||||||||||    
T  26011753 aacaattaatca 26011764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 15933321 - 15933651
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| ||||||     
T  15933321 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa 15933420  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || |||||  || |  |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  15933421 catttagagcataatt-caacatttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca 15933519  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || |||    
T  15933520 tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa 15933617  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  15933618 atgattatgatttaattctaacccccttacctta 15933651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 5854637 - 5854967
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || || |||     
T  5854637 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaa 5854736  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||| ||| |  |||   ||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  |||||    
T  5854737 catttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaaca 5854835  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || |||    
T  5854836 tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa 5854933  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  5854934 atgattatgattgaattctaacctccttacctta 5854967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24717144 - 24716983
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |  ||| |||| |||||||| |    
T  24717144 aaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaacaacaac 24717045  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  24717044 cattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 24716983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 380
Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285493
Alignment:
Q  227 ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag 326  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| ||| |||||||  |||||||||| |    
T  17285341 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg 17285440  T
Q  327 agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17285441 agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcactt 17285493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 15970046 - 15970174
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg 412  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| ||    
T  15970046 catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcatttattcatac-aataattgaaaaattgcactaaatg 15970143  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15970144 attatgatgaattccaacccccttaccttag 15970174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7000616 - 7000525
Alignment:
Q  345 tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7000616 tatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-aaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta 7000525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20653912 - 20653823
Alignment:
Q  454 ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  20653912 ctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcctaatccttgattcttcaagtcctcttctctctaaacctttcttcctcttgctcc 20653823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23226319 - 23225973
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | ||    
T  23226319 caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaca 23226220  T
Q  194 acaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  |  || |  || | ||||||||  ||||| || |  || |||||||| |||||  ||       
T  23226219 acaacataacataattcaatcatttgagcata-attcataagttaacacttatacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatc 23226121  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcac-ttttcacacaaat 391  Q
    || ||||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    | ||||||||| ||| |||||| || |||    
T  23226120 aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatc----attccaattaaacactttttcatac-aat 23226026  T
Q  392 aattg-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23226025 aattgaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccctttacctta 23225973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22736084 - 22735958
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |    
T  22736084 caacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatcca 22735985  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22735984 acaacaacatagtataattcatcaatt 22735958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Original strand, 29306470 - 29306706
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatcca 241  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||      
T  29306470 cacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcat 29306568  T
Q  242 tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc 341  Q
    |||  || |||||||||||  || |  || ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||   |||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  29306569 tttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaac 29306668  T
Q  342 atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    || |||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  29306669 atctatgaacaatcaatcactt-attcaattaagcactt 29306706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635768
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| || ||||  | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| |     
T  38635915 caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 38635816  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||  || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  38635815 catgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatt 38635768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21259426 - 21259298
Alignment:
Q  407 taagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgatt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |    
T  21259426 taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcc-ctagcttaagcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatccttgaat 21259329  T
Q  503 cttcaag-tcctcttttctct-acccttttc 531  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21259328 cttcaagttcctcttctctctaacccttttc 21259298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 172
Target Start/End: Original strand, 25122542 - 25122618
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcat 172  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25122542 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20567440 - 20567333
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||    
T  20567440 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20567342  T
Q  154 aacaacatc 162  Q
    |||||||||    
T  20567341 aacaacatc 20567333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20573633 - 20573526
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||    
T  20573633 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573535  T
Q  154 aacaacatc 162  Q
    |||||||||    
T  20573534 aacaacatc 20573526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 443
Target Start/End: Original strand, 23158167 - 23158511
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |||||| |||| ||||||  |||||||||| | ||||| ||||   || |||| |||| | ||    
T  23158167 caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaat---catcaacaacatcacttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaaca 23158263  T
Q  194 acaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   |||| |  |||  | || |||||| |||| ||||  || |||||||||||| |  ||      
T  23158264 acaacataacataattcaaccaattgagcata-attcatatcataccactttcacgtattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcac 23158362  T
Q  292 taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa 390  Q
    ||  ||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| ||||     
T  23158363 tagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caaataagcacttattcatacaac 23158461  T
Q  391 taattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     |   ||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  23158462 aa---gaaaattacactaaatgattataatgaattataactcccttatcttag 23158511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27233352 - 27233193
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||  |  | ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||    
T  27233352 ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 27233253  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  27233252 acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattca 27233193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 380
Target Start/End: Original strand, 23149785 - 23150068
Alignment:
Q  94 caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca 193  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||| | ||||| |||||  || |||| ||||   ||    
T  23149785 caaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---ca 23149881  T
Q  194 acaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca 291  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |  |||  |||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||| |  ||      
T  23149882 acaacttagcataattcaaccaattgagcataattcatac-cataccactttcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcac 23149980  T
Q  292 taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||  ||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  23149981 tagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt 23150068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528779
Alignment:
Q  272 aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat 371  Q
    ||||||||||||||  || | || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||| || || ||||    
T  33528607 aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat 33528705  T
Q  372 taagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33528706 taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 33528779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20567281 - 20567195
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca 141  Q
    |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567281 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca 20567195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Original strand, 29759902 - 29759975
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccat 123  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||   |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29759902 acccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat 29759975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31194346 - 31194216
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgca--ataag 410  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || || ||||||||| |||||  | ||     
T  31194346 catcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaatttgcactaaaaa 31194249  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  31194248 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttag 31194216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24552762 - 24552690
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  24552762 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt 24552690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18261758 - 18261591
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||  | || ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | |||||    
T  18261758 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 18261659  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||    
T  18261658 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 18261591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 25296319 - 25296426
Alignment:
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| ||||  || |||| |||||||||  ||  ||| ||||| |||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  25296319 ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa 25296418  T
Q  351 caattaat 358  Q
    ||||||||    
T  25296419 caattaat 25296426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 25758339 - 25758446
Alignment:
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| ||||  || |||| |||||||||  ||  ||| ||||| |||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  25758339 ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa 25758438  T
Q  351 caattaat 358  Q
    ||||||||    
T  25758439 caattaat 25758446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33611340 - 33611179
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||  | || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | ||||||     
T  33611340 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 33611241  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||   || | ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  33611240 caacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattca 33611179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 443
Target Start/End: Original strand, 38533967 - 38534004
Alignment:
Q  406 ataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38533967 ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 38534004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18041724 - 18041652
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  18041724 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt 18041652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45559129 - 45559057
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||    
T  45559129 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 45559057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36891010 - 36890475
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  36891010 aatatcccaatccaataatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgca 36890911  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36890910 tacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattca 36890811  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36890810 ccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac 36890712  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||    
T  36890711 atgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataag 36890613  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36890612 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctatagcttaggcttcaattttgctgctagctcttctcccaacctttgattcttc 36890513  T
Q  507 aagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  36890512 aagtcctcttctctctaaccatttccttctcttgctcc 36890475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25876244 - 25875713
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||   | |||| |||||    
T  25876244 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgca 25876145  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||||||| |  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  25876144 aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattca 25876045  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25876044 ccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaa 25875948  T
Q  310 catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  25875947 catgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aa 25875849  T
Q  410 gtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct-tctcccaacccttgattctt 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||   || ||||||||||    
T  25875848 gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcgtagctctatatc---actcttgattctt 25875752  T
Q  506 caagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25875751 caagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 25875713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 93 - 544
Target Start/End: Original strand, 271173 - 271626
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  271173 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac 271272  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  271273 aacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat 271372  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||    
T  271373 aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aata 271471  T
Q  393 attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  271472 attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctctct 271570  T
Q  488 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcct 544  Q
    |  || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  271571 t--caccctttgattcttcaagtcctcttctctctaaccattttctcctcttgctcct 271626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 25601990 - 25602482
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || ||||  || || ||||||    
T  25601990 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaacaa 25602089  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  25602090 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttg 25602189  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  25602190 aacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaatt 25602289  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact 449  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| |    
T  25602290 aatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat 25602388  T
Q  450 ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  25602389 ctccctagcttaggcttcaattttgctcatagctcttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacc-tttcttctcttgctcc 25602482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4448377 - 4447924
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |    
T  4448377 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaac 4448278  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4448277 aacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat 4448178  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||    
T  4448177 aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaata 4448078  T
Q  393 attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||||||      
T  4448077 attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagtttaggcttcaattttgcttctagctctct 4447979  T
Q  488 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4447978 t--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 4447924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 531
Target Start/End: Original strand, 28974013 - 28974494
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||| ||| || ||||||||  | |||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||    
T  28974013 attttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 28974112  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatact 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  28974113 aacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctcatact 28974211  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28974212 ttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca 28974311  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta 447  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||    
T  28974312 attaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatta 28974409  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc 531  Q
     || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  28974410 atctccctagcttagacttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttttc 28974494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23836990 - 23836499
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |  ||| ||||    
T  23836990 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaaca 23836891  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  23836890 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacatacccatttt-catac 23836792  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23836791 actttgaacatgtaattccactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 23836693  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gtt 446  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  23836692 acaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtatgtt 23836594  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  23836593 aatctcctaagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagt-ctcttctctctaaccattgtctcctcttgctcc 23836499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 433
Target Start/End: Original strand, 32465824 - 32466199
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  32465824 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32465923  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32465924 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatactttg 32466022  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32466023 aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt 32466122  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc 433  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  32466123 aatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaa-aagtgattatgatgaagactaacccc 32466199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 542
Target Start/End: Original strand, 27261772 - 27262260
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  27261772 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 27261871  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||       | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  27261872 caatatcaattgatcatgaaacttatca--atttctcatactttgagcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttg 27261968  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  27261969 aacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaatt 27262068  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttact 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    |||| ||| |    
T  27262069 aatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaat 27262167  T
Q  450 ccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctc 542  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  27262168 ctccctagcttaggcttcaatttagctcctagct-ttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgctcctcttgctc 27262260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24571574 - 24571195
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  24571574 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaac 24571476  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||     
T  24571475 aacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctcatacc 24571377  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||   |||| |||||||| |||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24571376 ttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaaca 24571277  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaa-attgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct 435  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24571276 attaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccct 24571195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22580106 - 22579688
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22580106 acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcagcaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt- 22580008  T
Q  190 atcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
      |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| |||||| |||| |||  | ||  || ||||||||||||||      
T  22580007 --caacaacaaagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcataccttgatcataaagtttcaccaacaacaattcaatta 22579911  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |    
T  22579910 tc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcata 22579813  T
Q  387 caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag 481  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22579812 c-aataattgaaaaattgcaat-agtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaaattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 22579715  T
Q  482 ctcttctcccaacccttgattcttcaagt 510  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  22579714 ctc-tcttccaa-tcttgattcttcaagt 22579688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 443
Target Start/End: Original strand, 67951 - 68347
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | ||||||    
T  67951 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 68050  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttc 247  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| ||    
T  68051 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 68149  T
Q  248 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat 347  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  68150 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat 68249  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaat---tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||   | | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68250 gaacaattaatctattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 68347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9653229 - 9653021
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  9653229 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattattcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 9653130  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    |||||||||    
T  9653129 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattca 9653030  T
Q  212 ccaattgag 220  Q
    |||||||||    
T  9653029 ccaattgag 9653021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21274380 - 21274174
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||     
T  21274380 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaaca-caacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgc- 21274283  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    |||||||||    
T  21274282 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattca 21274183  T
Q  212 ccaattgag 220  Q
    |||||||||    
T  21274182 ccaattgag 21274174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 392 - 543
Target Start/End: Original strand, 17367119 - 17367276
Alignment:
Q  392 aattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct------taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 485  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17367119 aattgaatattacaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctaattagtaggttaattc-tctagcttaggcttcaattttgctcgtagctct 17367217  T
Q  486 tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17367218 tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 17367276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31146426 - 31146072
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| |    
T  31146426 caacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaattgaacaggaatcttattacaattca 31146327  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||  ||    
T  31146326 acaaca-catagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatc 31146229  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca 388  Q
     | |||||||| |||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||    
T  31146228 aacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattact-cagttaagcacttattcataca 31146130  T
Q  389 aataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |  | |||||||||    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31146129 acaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 31146072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 360
Target Start/End: Original strand, 43645896 - 43646163
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| | |  ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||| || | |    
T  43645896 acaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaac 43645995  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca 291  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| ||||  || ||||||||| ||||  || |    
T  43645996 aacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaa 43646094  T
Q  292 taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
     |||||||| |||  ||||||  || ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  43646095 caacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatca 43646163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16935518 - 16935591
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc 86  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16935518 aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc 16935591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 17006178 - 17006251
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc 86  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17006178 aatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc 17006251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 443
Target Start/End: Original strand, 722617 - 722743
Alignment:
Q  316 atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgat 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||| ||||    
T  722617 atcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgcaaattgcactaaatgat 722714  T
Q  415 tatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  722715 tatgatgaattctaacccctttaccttag 722743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Original strand, 22274689 - 22274856
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||  || | |||||| || |  ||| |||| |||    
T  22274689 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgca-acccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa 22274787  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  22274788 caacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 22274856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 25305425 - 25305622
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||     
T  25305425 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattgaa 25305524  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaa-caacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    |||||  |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  25305525 catgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 25305622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Original strand, 22283922 - 22284089
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |  ||| |||| |||    
T  22283922 tttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatcaa 22284020  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
     |||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  22284021 aaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 22284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23821912 - 23821731
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataag-tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta 129  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| |    
T  23821912 ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatca 23821813  T
Q  130 gcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || ||||||    
T  23821812 tcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca 23821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23830991 - 23830810
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataag-tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta 129  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| |    
T  23830991 ttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatca 23830892  T
Q  130 gcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || ||||||    
T  23830891 tcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca 23830810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 6879460 - 6879591
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| ||||  ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||   ||||||||||    
T  6879460 acccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcac 6879559  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttt 245  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6879560 caattgagtatattttc-acacatacccatttt 6879591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Original strand, 19666501 - 19666880
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||||  |||||  | || ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | | || | |||||| |||||||||||||    
T  19666501 aaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatc 19666600  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg 261  Q
     ||||| ||||   || |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||  |  || |  || | |||||||||||||||    
T  19666601 aattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacacttatacatactttgaacatg 19666699  T
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa 361  Q
     || |  || || |||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  19666700 caaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaattaatcac 19666799  T
Q  362 ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||| || ||||||||| || |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19666800 ttattc-aattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 19666880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19669346 - 19669002
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||   |  |||| |||| | ||||||||    
T  19669346 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca 19669247  T
Q  200 taacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || |||||||| ||||||| |||||   ||||  |  || |  ||   ||||||| ||||||| ||||  || |||||||| |||||  ||   || |||    
T  19669246 tatcataattcaaccaattaagcat-gattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttc 19669148  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- 396  Q
    || |||  ||||||  || |||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || ||||||||     
T  19669147 atgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattga 19669050  T
Q  397 aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19669049 aaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttag 19669002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821533
Alignment:
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  23821714 taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac 23821615  T
Q  362 ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||| | |||||||||||||   ||  | |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  23821614 ttact-caattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttag 23821533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830612
Alignment:
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  23830793 taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac 23830694  T
Q  362 ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||| | |||||||||||||   ||  | |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  23830693 ttact-caattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttag 23830612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19433618 - 19433452
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||     
T  19433618 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag 19433520  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  19433519 caacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt 19433452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25265635 - 25265520
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    ||||||||||||||||||| | |  | ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| || |    
T  25265635 atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa 25265536  T
Q  207 attcaccaattgagca 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  25265535 attcaccaattgagca 25265520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24087409 - 24087345
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  24087409 catcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcacttact-caattaagcactt 24087345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 6094676 - 6094843
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaatt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |  ||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | ||||    
T  6094676 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatt-ccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctctta 6094774  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6094775 acaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt 6094843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3478 - 3403
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa 175  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3478 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22775392 - 22775206
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||  || |||| || |  ||||||| ||||   ||| |||    
T  22775392 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca 22775294  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt 336  Q
    ||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||   | | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  22775293 tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22780770 - 22780584
Alignment:
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||  || |||| || |  ||||||| ||||   ||| |||    
T  22780770 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca 22780672  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt 336  Q
    ||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||   | | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  22780671 tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24294767 - 24294685
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa 175  Q
    |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24294767 acaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa 24294685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 437
Target Start/End: Original strand, 17366958 - 17366999
Alignment:
Q  396 gaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17366958 gaaaattacaataagtgattatgattaattctaaccccctta 17366999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Original strand, 9636705 - 9636940
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||  | ||  || | |||| | ||| |||||||| | |||||| | || ||| || | | |||||    
T  9636705 acccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 9636804  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||  | |||||  |||  ||    
T  9636805 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcattttcaca 9636903  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat 285  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  9636904 tactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat 9636940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24341595 - 24341519
Alignment:
Q  146 ttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca 222  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24341595 ttaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca 24341519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Original strand, 24277741 - 24277888
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| | |||  ||||||||| |||||| | || ||| || | | ||||||||||||||||||  || |     
T  24277741 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaa 24277840  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
    |||||  || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  24277841 catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt 24277888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305720
Alignment:
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    |||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  25305634 aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-caattaagcactt 25305720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3269 - 3139
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttt-tcacacaaataattgaaaattg---caataag 410  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||| ||||  |||||||||||    | | ||     
T  3269 catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacataatcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaa 3172  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3171 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 3139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24294545 - 24294496
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta 364  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  24294545 catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatta 24294496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 7321837 - 7321873
Alignment:
Q  407 taagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7321837 taagtgattataatgaattctaacccccttaccttag 7321873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 22657 - 23148
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||    
T  22657 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaa 22756  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22757 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg 22856  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22857 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 22956  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||     
T  22957 aatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct 23056  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23057 ctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 23148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 4485 - 5017
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| ||| || ||| |    
T  4485 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa 4584  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  4585 cacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattca 4684  T
Q  212 -ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  4685 accaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaac 4784  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | |||    
T  4785 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaag 4881  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 4981  T
Q  508 agtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4982 agtcctcttctctctgcccttttctcctcttgctcc 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 9099 - 9631
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| ||| || ||| |    
T  9099 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa 9198  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  9199 cacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattca 9298  T
Q  212 -ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  9299 accaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaac 9398  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | |||    
T  9399 atgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaag 9495  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9496 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 9595  T
Q  508 agtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9596 agtcctcttctctctgcccttttctcctcttgctcc 9631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132039
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  132531 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 132432  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  132431 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg 132332  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  132331 aacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 132232  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactc 450  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    |||||||| ||    
T  132231 aatcaattcacccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttaccttagttaggttaatc 132132  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  132131 tctctagcttagacttcaatttttctcatagctcttctcccaacccttaattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 132039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 89 - 542
Target Start/End: Original strand, 88274 - 88732
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  88274 aacaacaaattatggatcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaatt 88373  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |    
T  88374 catcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattat 88473  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca 388  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  88474 tcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcataca 88573  T
Q  389 aataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta----tcttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  88574 aataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttattagattaatctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctc 88673  T
Q  485 ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctc 542  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  88674 ttctccgaacccttgattcttcaagtcctattctctctaaccctattctcctcttgctc 88732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 62 - 543
Target Start/End: Original strand, 11659 - 12145
Alignment:
Q  62 caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat 161  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  11659 caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacat 11758  T
Q  162 ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11759 caattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacat 11858  T
Q  261 gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11859 gaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatca 11958  T
Q  361 attaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccct 453  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||| |    |||| ||| || |     
T  11959 attgacccaattaagcacttattcatac-aataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaatctcc 12056  T
Q  454 ctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  12057 ctagcttaggcttcaatttaactcctagctcttct-ccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 12145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 213 - 510
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16324
Alignment:
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  16022 caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat 16121  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac-aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ata 408  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||  | |    
T  16122 gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattg-aaattgcaccaaa 16219  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16220 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattct 16318  T
Q  505 tcaagt 510  Q
    ||||||    
T  16319 tcaagt 16324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 213 - 510
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25855
Alignment:
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat 312  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  25553 caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat 25652  T
Q  313 gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac-aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ata 408  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||  | |    
T  25653 gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattg-aaattgcaccaaa 25750  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25751 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tcccccaatccttgattct 25849  T
Q  505 tcaagt 510  Q
    ||||||    
T  25850 tcaagt 25855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 88219 - 88274
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaacca 68  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  88219 aatatcccaatcaaacaattgaccaaaactcataagtactcattttcaccaaacca 88274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 7093 - 7626
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| ||| || ||| |    
T  7093 aatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa 7192  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcca-ttgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc 210  Q
     ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  7193 cacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattc 7292  T
Q  211 a-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaa 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  7293 aaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa 7392  T
Q  310 catgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataa 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||    
T  7393 catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaa 7489  T
Q  410 gtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7490 gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 7589  T
Q  507 aagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7590 aagtcctcttctctctgcccttttctcctcttgctcc 7626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 543
Target Start/End: Original strand, 7581 - 8027
Alignment:
Q  102 gaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  7581 gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaat 7680  T
Q  202 acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcata 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  7681 gcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcata 7780  T
Q  302 catctaaacat-gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa 400  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7781 catctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa 7880  T
Q  401 ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 497  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7881 ttacaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 7980  T
Q  498 tgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7981 tgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctctttctcc 8027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1772
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1316 aacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt 1415  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
     | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |    
T  1416 caacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattat 1515  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  1516 ccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcataca 1615  T
Q  389 aataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 484  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1616 aataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 1713  T
Q  485 ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1714 ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 1772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 113 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11875 - 11445
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  11875 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcac 11779  T
Q  213 caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11778 taattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaac 11680  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11679 atggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataag 11580  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  11579 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagct-taaccccaatccttgattcttca 11481  T
Q  508 agtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11480 agtcctcttctctctacccatttctcctcttgctcc 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 613
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||    
T  1103 tttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 1004  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1003 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatactttg 904  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  903 aacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatc 804  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccc 452  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  803 aatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttactctc 704  T
Q  453 tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  703 tctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttgaagtcctcttctctctactattttctcctcttgctcc 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7133 - 6638
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  7133 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 7034  T
Q  152 acaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    |||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  7033 acaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttca 6936  T
Q  249 t--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  6935 tacactctgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacata 6836  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccc--ccttatcttagg 444  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  6835 tgaacaattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccacctta-gttagg 6737  T
Q  445 ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6736 ttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcaagttcccttctctctacccttttctcctcttgctcc 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Original strand, 60809 - 61264
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  60809 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac 60908  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  60909 aacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcat 61008  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  61009 aacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata 61108  T
Q  393 attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttc 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  61109 attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaagttaatttctctagcttaagcttcaattttgctcctatctcttc 61208  T
Q  488 tcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  61209 tcccaactcttgattcttcaagtcctcttctctctatccttttctcctcttgctcc 61264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 70903 - 70414
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  70903 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 70804  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  70803 caacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttg 70704  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca-taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70703 aacatgtaattcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaat 70604  T
Q  355 taatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactc 450  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |    |||||||| ||    
T  70603 taatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaatgagttattatg----attctaacccccttaccttagttaggttaatc 70508  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  70507 tctctaggttaggcttcaattttgatcctagctcttctctgaacccttgattcctcaagtcctcttctcactaacccttttctcctcttgctcc 70414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 302 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79679
Alignment:
Q  302 catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaat 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79925 catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat 79826  T
Q  402 tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 497  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  79825 tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagcttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttactcctagctcttctctcaaccct 79726  T
Q  498 tgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  79725 tgattcctcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 79679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Original strand, 38264 - 38756
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  38264 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 38363  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||    
T  38364 caacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttg 38463  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  38464 aacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaatt 38563  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactcc 451  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||     
T  38564 aattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatct 38663  T
Q  452 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38664 ctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 38756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 48153 - 48600
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48153 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 48251  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  48252 caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa 48350  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48351 cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat 48450  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc 491  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48451 tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctccc 48548  T
Q  492 aacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48549 aacccttgattcttcaagtcttcttctctctacccttttctcctcttgctcc 48600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 95 - 543
Target Start/End: Original strand, 61601 - 62048
Alignment:
Q  95 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa 194  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  61601 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 61699  T
Q  195 caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  61700 caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa 61798  T
Q  295 cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat 394  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  61799 cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat 61898  T
Q  395 tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctccc 491  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61899 tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagtaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctccc 61996  T
Q  492 aacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  61997 aacccttgattcttcaagtcttcttctctctacccttttctcctcttgctcc 62048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 255095 - 254606
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| ||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||    
T  255095 tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 254996  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  254995 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt 254897  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  254896 tgaacatgtaattcaact-acaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaa 254798  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc 450  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||||||| ||    
T  254797 ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagtaggttaatc 254699  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  254698 tctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 254606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 261701 - 261212
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| ||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  || || ||||||    
T  261701 tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 261602  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  261601 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt 261503  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  261502 tgaacatgtaattcaact-actacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaa 261404  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactc 450  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||||||| ||    
T  261403 ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagtaggttaatc 261305  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  261304 tctctagcttagtcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcctcttgctcc 261212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 543
Target Start/End: Original strand, 46106 - 46623
Alignment:
Q  31 ttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattag 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |     
T  46106 ttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat 46205  T
Q  131 catcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttca 230  Q
    || ||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46206 caacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca 46305  T
Q  231 acacatatccatttttca--tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattaga 327  Q
     || | | ||| ||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46306 -cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattaga 46403  T
Q  328 gcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattct 427  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  46404 gtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattat 46502  T
Q  428 aacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct- 522  Q
    ||||| |||| |    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  46503 aaccctcttaccttaattaggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaaatcctcttctctcta 46602  T
Q  523 acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46603 acccttttctcctcttgctcc 46623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 543
Target Start/End: Original strand, 40617 - 41116
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | ||||||    
T  40617 tacccattttcaccaaaccaacaacaacagcttatttcaaattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 40716  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||||||    
T  40717 gcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttca 40814  T
Q  249 --tactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattt 345  Q
      |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40815 catactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcattt 40914  T
Q  346 atgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tt 441  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    ||    
T  40915 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtt 41013  T
Q  442 aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgc 540  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41014 aggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgc 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 79784 - 79998
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaat---ttatttccaaacaacaaattatgaatcatg 109  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  79784 aatatcccaatccaacaagtgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatg 79883  T
Q  110 catacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  79884 catacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataat 79982  T
Q  209 tcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  79983 tcaccaattgagcata 79998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 93 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11812 - 11360
Alignment:
Q  93 acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc 192  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  11812 acaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaac 11713  T
Q  193 aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat 292  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  11712 aacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccat 11613  T
Q  293 aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  11612 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaata 11514  T
Q  393 attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttct 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11513 attaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccataccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcc 11415  T
Q  489 cccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11414 ctccacccttgattcttcaagtactcttctctctacccatttctcctcttgctcc 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15798 - 15367
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  15798 aatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcat 15699  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||   |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  15698 acccaagccatgaattagcatctataacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataatt 15599  T
Q  210 caccaattgagcatattttcaacacatatcca-tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaa 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15598 caccaattgagcatattttc-acacatacccatttttttatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaa 15500  T
Q  309 acatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaata 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |    
T  15499 acatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaa-a 15401  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15400 agtgattatgatgaatgctaacccccttacctta 15367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 118246 - 117753
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||    
T  118246 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 118147  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | || ||||||||    
T  118146 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactt 118047  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  118046 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa 117947  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg---aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt 446  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||    
T  117946 ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 117849  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  117848 aatctccctaccttaggcatcaatttttctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaatccttttctcctcttgctcc 117753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 109745 - 109252
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||    
T  109745 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 109646  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||    
T  109645 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactt 109546  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  109545 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa 109446  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg---aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt 446  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||    
T  109445 ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 109348  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  109347 aatctccctaccttaggcatcaatttttctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctctctaatccttttctcctcttgctcc 109252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 534
Target Start/End: Original strand, 14839 - 15319
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  14839 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 14938  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  14939 acaacaaca---attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catac 15033  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      ||||||||||||||  |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15034 actttgaacatgtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 15132  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  15133 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggtt 15231  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttctcc 534  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15232 aatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttcccccaacccttgattcttcaagtcctcttctctctacccttttctcc 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Original strand, 14179 - 14287
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  |||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  14179 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 14278  T
Q  152 acaacaaca 160  Q
    |||||||||    
T  14279 acaacaaca 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 112790 - 112337
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  112790 aacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta---tcaacaacatgacttaacaacaacaacataaattgatcatgaaacttatcacaatt 112694  T
Q  189 tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
     |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  112693 catcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgt 112594  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca 388  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||     
T  112593 tcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatac- 112495  T
Q  389 aataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagct 483  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112494 aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct 112396  T
Q  484 cttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||  |  || |||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  112395 ctctt--caccccttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgctcctcttgctcc 112337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 103168 - 102814
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  103168 caacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattca 103069  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||  || || ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  103068 acaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattc-caccatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatc 102970  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca 388  Q
     | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||     
T  102969 aaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac- 102872  T
Q  389 aataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    || |||||||||||    ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  102871 aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttaccttag 102814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 365
Target Start/End: Original strand, 109554 - 109865
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||    
T  109554 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaac 109653  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||    
T  109654 aacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatact 109752  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    || |||||| ||||  | |||||||||||||||  || | ||||||||  ||  ||||||  ||||||| || || |||||||| || || |||| | ||    
T  109753 ttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcatacttggatcacgaattctaacaattatcatca 109852  T
Q  353 attaatcaattaa 365  Q
    |||||||||||||    
T  109853 attaatcaattaa 109865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 54 - 543
Target Start/End: Original strand, 8951 - 9445
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||    
T  8951 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 9050  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||    
T  9051 aacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt 9150  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9151 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaa 9250  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg--aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta 447  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    |||| |||    
T  9251 ttaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataa-tgattatgataaattctaacccccttaccttagttagatta 9348  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
     || | ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||    
T  9349 atctccctagcttagacttcaattttgctcctagctcaac-cccaattcttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgcttcctcttgctcc 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 50 - 543
Target Start/End: Original strand, 106 - 599
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||     
T  106 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat 203  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   |     
T  204 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatac 303  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    ||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  304 acttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 403  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt 446  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||    
T  404 acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttaccttagtaggtt 503  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |  ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  504 aatctccctagcttaggcttcaatttttctcctagctctctttc--accctttgttcttcaagtcctcttctctctaaccattttctcctcttgctcc 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 90 - 532
Target Start/End: Original strand, 9937 - 10380
Alignment:
Q  90 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  9937 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 10036  T
Q  190 atcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact--ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10037 aacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc--ttttcatactctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatta 10134  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacac 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  10135 tccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac 10234  T
Q  388 aaataattgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagc 482  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    |||| ||| || |  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10235 aaagaattgaaaatttgcaataa-tgattattatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccttagcttaggcttcaattt--ctcctagc 10331  T
Q  483 tcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctctacccttttct 532  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  10332 tc-tctcccattccttgattcttcaagtcctcttctctctaaccctttct 10380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 543
Target Start/End: Original strand, 33587 - 34120
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||  |  | ||||| |||||| ||| |    
T  33587 aatatctcaatccaacaatttgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaac---ttatttcacattatcaaatcatgaattatgaa 33683  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     |||| |||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  33684 caccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattca 33783  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    |||||| | |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||    
T  33784 ccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaaca 33883  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||     
T  33884 tgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaa 33982  T
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  33983 tgattatgatgaattctaatccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagct-ttcccccaatccttgattcttc 34081  T
Q  507 aag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  34082 aagttccttttctctctaaccctttcttcctcttgctcc 34120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5040
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||| ||    
T  5531 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagca 5432  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||      
T  5431 acaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttc-gcacata-cctattttcatac 5334  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5333 actttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatga 5235  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||    
T  5234 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagatt 5136  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5135 aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 5040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 89 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9130 - 8673
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9130 aacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt 9031  T
Q  189 tatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  9030 taacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaatta 8932  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |    
T  8931 tccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcata 8832  T
Q  387 caaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctccta 480  Q
    | |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8831 c-aataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcattttttctccta 8734  T
Q  481 gctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| ||||||||||||    
T  8733 gctc-tcttccaa-tcttgattcttcaagttcctcttctctcaaacccttt-tcctcttgctcc 8673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 49 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 864 - 372
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  864 taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta 765  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tc 247  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  764 gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctc 666  T
Q  248 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  665 atactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat 566  T
Q  348 gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----tt 441  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    ||    
T  565 gaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttaccttagtt 468  T
Q  442 aggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
    || ||| || | |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  467 agattaatctccctagattaggcttcaattttgatcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 50 - 510
Target Start/End: Original strand, 21473 - 21933
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||     
T  21473 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 21571  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tca 248  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  21572 caacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctca 21670  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21671 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg 21769  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttag 443  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||    
T  21770 aacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattataacccccttaccttagttag 21867  T
Q  444 gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 510  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21868 gttaatctctctaccttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgattcttcaagt 21933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 50 - 535
Target Start/End: Original strand, 31172 - 31660
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||     
T  31172 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 31270  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tca 248  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  31271 caacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctca 31369  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  31370 tactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatg 31468  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttag 443  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||    
T  31469 aacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 31566  T
Q  444 gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  31567 gttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgactcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct 31660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 332 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47346
Alignment:
Q  332 gaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaac 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47554 gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaac 47457  T
Q  431 ccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---a 523  Q
    ||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||   |    
T  47456 ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgactcttcaagttctcccttctctctaa 47358  T
Q  524 cccttttctcct 535  Q
    ||||||||||||    
T  47357 cccttttctcct 47346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 100 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11945 - 11497
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11945 atgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaaca 11846  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  11845 atgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttca 11746  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11745 tacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa 11646  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacc 495  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  11645 attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagcttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgttcctagctcaac-cccaatc 11547  T
Q  496 cttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||    
T  11546 cttgattcttcaagttcctcttctctctaacccttgcttcctcttgctcc 11497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 535
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85781
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||||||| || |||||||   | |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  85298 tttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 85397  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||    
T  85398 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttg 85497  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  85498 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaatt 85597  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctt----aggttactc 450  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    || ||| ||    
T  85598 aatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaatc 85695  T
Q  451 cctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcct 535  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||    
T  85696 tccctagcttagacttcaattttgctccttgct-ttct-ccactccttgattcttcaagttctcccttctctctaacccttttctcct 85781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 510
Target Start/End: Original strand, 159266 - 159722
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   || |||||| ||||    
T  159266 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatcaa---catcacttagcaac 159362  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  159363 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatact 159462  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  159463 ttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca 159562  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtta 447  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||    
T  159563 attaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatta 159660  T
Q  448 ctccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 510  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  159661 atctccctagcttaggcttcaattttgctccaagctc-tcttccactccttgattcttcaagt 159722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Original strand, 146523 - 146848
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  146523 aatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgca 146622  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  146623 tacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattca 146722  T
Q  212 ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  146723 ccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaaca 146822  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattt 337  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||    
T  146823 tgtcatcataattaaagcatgaattt 146848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 53399 - 53699
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | || || |||||||  ||||||| ||| |      
T  53399 cacttagcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcata-attcaacatataacac 53497  T
Q  242 tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc 341  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   ||  |||| |||  ||||||  |||||| ||||||||| ||||| || |    
T  53498 cttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaac 53597  T
Q  342 atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttat 438  Q
    |  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  53598 aactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttac 53695  T
Q  439 ctta 442  Q
    ||||    
T  53696 ctta 53699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 377
Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
Alignment:
Q  247 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta 346  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  85690 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta 85788  T
Q  347 tgaacaattaatcaattaatccaattaagca 377  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  85789 tgaacaattaatcactt-attcaattaagca 85818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 56 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 253270 - 252902
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||    
T  253270 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaaa 253171  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  253170 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttg 253071  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  253070 aaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaatt 252971  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaat 424  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252970 aatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaat 252902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 52 - 543
Target Start/End: Original strand, 164177 - 164669
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  164177 ccattttcaccaaaacaccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaaca 164276  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac 251  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  164277 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccatttt-catac 164374  T
Q  252 --tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  164375 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatga 164473  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggtt 446  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  164474 aaaattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggtt 164572  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  164573 aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct-taaccccaatcattgattcttcaagtccccttctctctaagccttttctcctcttgctcc 164669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 162468 - 162299
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac-aaca 154  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || | |||||| || |  ||| ||| ||||    
T  162468 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaaca 162369  T
Q  155 acaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  162368 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata 162299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 166546 - 166385
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |    ||||||||||    
T  166546 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaata----ttaacaacaa 166451  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  166450 caac---cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata 166385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 70 - 443
Target Start/End: Original strand, 1 - 371
Alignment:
Q  70 caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  || || ||||||||||||| ||||||    
T  1 caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat 100  T
Q  170 catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  101 catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattcaa 200  T
Q  270 ctaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcca 369  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  201 ccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatg---tcatcattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcaccca 297  T
Q  370 attaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  298 attaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 3492 - 3591
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| |||||||| |  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  || || |||||||||||||    
T  3492 aaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatc 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 153 - 543
Target Start/End: Original strand, 70676 - 71071
Alignment:
Q  153 caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcata 70774  T
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  70775 ctttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaa 70873  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggtt 446  Q
    | |||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||    
T  70874 ctattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 70972  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct---acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  70973 aatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagttctctcttctctttaacccttttctcctcttgctcc 71071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 535
Target Start/End: Original strand, 31008 - 31496
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| |||||| || ||||||||  | |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||| || || |    
T  31008 atttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagc 31107  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataa-ttcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac 251  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  31108 aacaacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatata-ccattttcttatac 31205  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31206 tttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 31304  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaa--cccccttatc----ttagg 444  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |    ||||     
T  31305 aaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccccttaccttagttaga 31403  T
Q  445 ttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt--cctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||    
T  31404 ttaatctccctagcttaggcttcaattttgatcctagctc-tcttccaatccttgattcatcaagttaccccttctctctaacccttttctcct 31496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 97422 - 97175
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||| | || |||  |||||||| ||| ||||| |||||| || |||| |||| | || ||||||| |||||||||     
T  97422 acccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaattagtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaa 97323  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||   || || || |||  |||||    
T  97322 catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaaca 97224  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  97223 tatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatca 97175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 1341 - 1732
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||  || ||     
T  1341 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgacatag 1440  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||    
T  1441 caacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaatttctcat 1540  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  1541 actttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatagga 1640  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1641 acaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 523
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2352
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||  ||||| ||||    
T  1880 attttcaccaaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaac 1979  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccattttt-catac 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||    
T  1980 aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatata-ccattttcgcatac 2077  T
Q  252 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac 351  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  2078 tttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagc 2177  T
Q  352 aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta----tcttaggtt 446  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||| ||    
T  2178 aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttactttagttagatt 2275  T
Q  447 actccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctcta 523  Q
    | || | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2276 aatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagttc-tcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctcta 2352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 164 - 543
Target Start/End: Original strand, 4359 - 4738
Alignment:
Q  164 attgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatg 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  4359 attgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatg 4456  T
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4457 taattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa 4555  T
Q  362 ttaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttagg---ttactccctctagc 458  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| || | |||||    
T  4556 ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-acgtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtagattaatctccctagc 4654  T
Q  459 ttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4655 ttaggcttcaattttgctcctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Original strand, 4269 - 4358
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca 141  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4269 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 25222 - 25564
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25222 atgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaaca 25320  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   | ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25321 aaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttca 25420  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421 tacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa 25520  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  25521 attgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 24921 - 25210
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   | ||     
T  24921 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatat 25017  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat 249  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   |     
T  25018 caacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctac 25117  T
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatca 342  Q
    ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  25118 acttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca 25210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 10
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  351 atgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaaca 252  T
Q  200 taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca 299  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  251 aaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttca 152  T
Q  300 tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa 399  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  151 tacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa 52  T
Q  400 attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  51 attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6304
Alignment:
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt 253  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||    
T  6591 aacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactt 6492  T
Q  254 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  6491 tgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacag 6392  T
Q  354 ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6391 ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 6304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Original strand, 4907 - 5235
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  | || ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  4907 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 5006  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||| ||    
T  5007 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgtg 5106  T
Q  256 aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5107 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaatt 5206  T
Q  356 aatcaattaatccaattaagcacttttca 384  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  5207 aattaattcacccaattaagcacttttca 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 510
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3742
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3318 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt 3417  T
Q  189 tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc 287  Q
     | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |  ||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||      
T  3418 caactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaatta 3516  T
Q  288 tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca 386  Q
    |  |||||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  3517 taaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcata 3615  T
Q  387 caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctag 481  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    || |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  3616 caa-taattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatcttaagcttcaatttagctcctag 3714  T
Q  482 ctcttctcccaacccttgattcttcaagt 510  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  3715 ctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 3742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 5863 - 6261
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| ||| || ||| |    
T  5863 aatatctcaatccaacaatttgagcaaact-cataagtacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa 5961  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     || |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |    
T  5962 cactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataattta 6061  T
Q  212 -ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttc--atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  6062 accaattgagcatattttcaacatata-ccatttttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaa 6160  T
Q  309 acatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaat 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  6161 acatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaat 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 572
Alignment:
Q  57 ttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac 156  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |  | | || | ||||    
T  739 ttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaac 640  T
Q  157 aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  639 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 543
Target Start/End: Original strand, 12590 - 12726
Alignment:
Q  411 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    || || | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||  ||||||||||||    
T  12590 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtc-tcttccactccttgattcttc 12688  T
Q  507 aag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    ||| ||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  12689 aagttccccttctctctaaccctttttcctcttgctcc 12726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 290 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2857
Alignment:
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  3112 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa 3013  T
Q  390 ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatct---taggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctctt 486  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3012 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttagtctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct-ta 2915  T
Q  487 ctcccaacccttgattcttcaagtcctcttttctct-acccttttctcctcttgctcc 543  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2914 accccaatccttgattcttcaagtcatcttctctctaacccttttctcctcttgctcc 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 442
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20524
Alignment:
Q  192 caacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |     
T  20274 caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt 20372  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20373 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 20472  T
Q  390 ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  20473 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13719 - 13507
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13719 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 13620  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  13619 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 13520  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  13519 ccaattgagcata 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21693 - 21481
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21693 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacatataattatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgca 21594  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  21593 tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 21494  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  21493 ccaattgagcata 21481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 55503 - 55715
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  55503 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgca 55602  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  55603 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 55702  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  55703 ccaattgagcata 55715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 94018 - 93730
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||| |||   ||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  94018 caacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcacttattaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattta 93919  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct 288  Q
     |||| ||||| |||| ||||  || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||  |    
T  93918 acaac-acatagcatacttcaataatttgagcata-tttcaacaaata-ccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattat 93822  T
Q  289 ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattt-tatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
    | | |||||||| |||  | ||||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  93821 caaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcactt 93730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 104645 - 104518
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg 412  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || || ||||| |||||| || ||| ||    
T  104645 catcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaaattacactaaatg 104548  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  104547 attatgatgaattctaacccacttacctta 104518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 93721 - 93648
Alignment:
Q  463 gcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  93721 gcttcacttttgctcctagctct-ctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccctcttctcct 93648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9839 - 9628
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9839 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 9740  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| ||||    
T  9739 acccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcac 9640  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
     |||||||||||    
T  9639 taattgagcata 9628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 34010 - 33529
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  34010 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac 33912  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |  || ||||||||    
T  33911 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataacacttcttcatact 33813  T
Q  253 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca 352  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  33812 ttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaaca 33713  T
Q  353 attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc----ttaggt 445  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| |    
T  33712 attaatcaattact-caattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 33615  T
Q  446 tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcctcttttctct-acccttttc 531  Q
    || | || |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  33614 taattcc-ctagctcaagcttcaatttagctcatagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaacccttttc 33529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1099
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  1311 aatattccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgca 1212  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||    
T  1211 tacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 1112  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  1111 ccaattgagcata 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10094
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10298 aatatctcaatctaacaattgagcaaaacacataaatatccactttcaccaaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 10199  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |    
T  10198 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgc 10099  T
Q  213 caatt 217  Q
    |||||    
T  10098 caatt 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17721 - 17525
Alignment:
Q  28 caattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaat 127  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17721 caattgagcaaaacatataagtatccatttccaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaat 17622  T
Q  128 tagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  17621 tagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 17525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 193820 - 193609
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  193820 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgca 193721  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    |||||||||    
T  193720 tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattca 193622  T
Q  212 ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  193621 ccaattgagcata 193609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 186861 - 186647
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaat---ttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  186861 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcat 186762  T
Q  109 gcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    ||||||    
T  186761 gcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataat 186663  T
Q  209 tcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  186662 tcaccaattgagcata 186647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6870 - 6664
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||     ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6870 aatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 6776  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  6775 acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 6676  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  6675 caattgagcata 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 14887 - 15083
Alignment:
Q  29 aattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaat 127  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887 aattgagaaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaat 14986  T
Q  128 tagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  14987 tagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19850
Alignment:
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  20041 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 19942  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19941 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 19850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24154
Alignment:
Q  250 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga 349  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  24345 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 24246  T
Q  350 acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  24245 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 24154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24374
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaaca 160  Q
    |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  || || |||||||||||    
T  24471 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca 24374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19233 - 19049
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19233 aatatcccaattcaacaattgagcaaaactcataagtacctattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcat 19134  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19133 acccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12641
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||    
T  12811 attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac 12712  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  12711 aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgagcata 12641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2603 - 2210
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||  |||||| ||| |  |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||     
T  2603 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag 2504  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
     |||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| || ||  ||| |||    
T  2503 gaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatgtcactttctca 2405  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  2404 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatg 2305  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2304 attaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 2210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 617
Alignment:
Q  49 tacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  806 taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta 707  T
Q  149 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatat 238  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  706 gtaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatatat 617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 19224 - 19383
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || |    
T  19224 atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa 19323  T
Q  207 attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  || ||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  19324 attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt 19383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 21308 - 21467
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || |    
T  21308 atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa 21407  T
Q  207 attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt 266  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  || ||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  21408 attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt 21467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 355 - 149
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||     ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  355 aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcat 261  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  |     ||||||||||    
T  260 actcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcac 161  T
Q  213 caattgagcata 224  Q
    ||||||||||||    
T  160 caattgagcata 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 326 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5467
Alignment:
Q  326 gagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatga 422  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| | || |||||||||| || || |||  ||||||| ||||    
T  5689 gagcacaagttttaacatctatgaacaattaatcacttattc-aattaagcacttattcatataa-taattgaaaaattacactaaaatgattatcatga 5592  T
Q  423 attctaacccccttatcttag----gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctctttt 518  Q
    ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  5591 attataacccccttatcttagttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctaactcttctcccaacccttgattcttcaagttctcctat 5492  T
Q  519 ctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5491 ctctacccttatctcctcttgctcc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 510
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8228
Alignment:
Q  211 accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||  ||||    
T  7927 accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac 8025  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata 408  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  8026 ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgtaaaattgcaata 8123  T
Q  409 agtgattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||     
T  8124 aatgattacgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatccttgaatcg 8222  T
Q  505 tcaagt 510  Q
    ||||||    
T  8223 tcaagt 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Original strand, 7833 - 7913
Alignment:
Q  89 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7833 aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 7913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 408 - 543
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8803
Alignment:
Q  408 aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag---gttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8665 aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattct 8764  T
Q  505 tcaagtcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8765 tcaagtcctcttctctatacccttttctcctcttactcc 8803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 77128 - 76740
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||  || || | |||||| ||||||    
T  77128 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaa 77029  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatacttt 254  Q
    ||||||| ||||| |||||| || | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || ||||| |||||  ||| |||||||||    
T  77028 caacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatacttt 76930  T
Q  255 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 354  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||  || | || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  76929 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaat 76830  T
Q  355 taatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||  ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  76829 tactcaattact-caattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 76740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22836 - 22701
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattgagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22836 aatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcat 22737  T
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccactta 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22736 acccaaaccatgaattagcatccataacatcactta 22701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Original strand, 32165 - 32379
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  32165 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 32264  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- 249  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  32265 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttcatac 32362  T
Q  250 actttgaacatgtaatt 266  Q
    |||||||||||||||||    
T  32363 actttgaacatgtaatt 32379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42138 - 41924
Alignment:
Q  52 ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | |||||  |||||||||  | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
T  42138 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 42039  T
Q  152 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat-- 249  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  42038 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttcatac 41941  T
Q  250 actttgaacatgtaatt 266  Q
    |||||||||||||||||    
T  41940 actttgaacatgtaatt 41924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 317 - 442
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
Q  317 tcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatta 416  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1 tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatta 99  T
Q  417 tgatgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    
T  100 tgatgaacactaacccccttacctta 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31569 - 31401
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  31569 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 31470  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  31469 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 31401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Original strand, 41275 - 41443
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  41275 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 41374  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  41375 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 41443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 30057 - 30199
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||||    
T  30057 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaa 30156  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30157 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6372 - 6204
Alignment:
Q  56 tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || |  ||| ||||||||    
T  6372 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaacaa 6273  T
Q  156 caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  6272 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7271 - 6983
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| || |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||  |    
T  7271 caacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatcca 7172  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
      ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  7171 ataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatc 7073  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt 380  Q
     | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||    
T  7072 aacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatcatttact-caattaagcactt 6983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 336
Target Start/End: Original strand, 35479 - 35724
Alignment:
Q  91 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 190  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||| |||| || |    
T  35479 caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttca 35578  T
Q  191 tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc 289  Q
     |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||  ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  35579 acaacaacatagcataaatcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatc 35677  T
Q  290 cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt 336  Q
     |||||||||| |||  ||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  35678 aataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt 35724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Original strand, 69480 - 69810
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || ||||||     
T  69480 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa 69579  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||| ||| |  |||  |||||||| |||||| ||||  ||  |||||||||||||  |    || ||||| ||| ||||||    
T  69580 catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaaca 69678  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || |||    
T  69679 tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa 69776  T
Q  410 gtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  69777 atgattatgattgaattctaacccccttatctta 69810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 3261 - 3407
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||     
T  3261 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat 3358  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3359 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 28497 - 28891
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaa 149  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||  | ||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |  | ||| |||| ||||||     
T  28497 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 28595  T
Q  150 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca 248  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||| |||    
T  28596 caacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca 28694  T
Q  249 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg 348  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||| |  || | || ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||  || ||  | ||    
T  28695 tactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatgataacaactttg 28794  T
Q  349 aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
     ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| || || |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28795 gacaattaatcatttact-caattaagaacttattcatac-aacaattgaaaatttaaactaaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttag 28891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 70329 - 70097
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca-ataagt 411  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || | || |    
T  70329 catcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaatta-tacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaat 70232  T
Q  412 gattatgatgaattctaacccccttatcttaggt----tactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    || |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  70231 gattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcatttttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttca 70133  T
Q  508 ag-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    || ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70132 agttcctctactctctaccccttt-tcctcttgctcc 70097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 70543 - 70418
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||| |    
T  70543 atgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggtcctcatcataattcaacaacaata 70444  T
Q  200 taacataattca-ccaattgagcata 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  70443 taacataattcacccaattgagcata 70418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 360
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2795
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  | || ||||| |||| | ||| | |||||| |||||||| | || ||| || | |||||| |||||||||||||    
T  2498 aaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 2597  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg 261  Q
     ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| || || ||||||| || ||||| ||| |  |||   ||||||||||||||    
T  2598 aattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatg 2696  T
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 360  Q
     ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2697 caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatca 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 446
Target Start/End: Original strand, 8020 - 8367
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| | || ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||   || |||| ||||   ||||||||    
T  8020 atgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattccacaacaaca 8119  T
Q  200 taacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  | ||  |  || |  || | ||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||  ||   || |||    
T  8120 tagcataattcacccaattgagcataaat-cataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttc 8218  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga 397  Q
    || |||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  8219 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattga 8316  T
Q  398 aaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccccttatcttaggtt 446  Q
    ||| || || |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8317 aaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaggtt 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 89886 - 89656
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagt-g 412  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || |||   |    
T  89886 catcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaag 89790  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  89789 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tctttcaatccttgattcttcaa 89691  T
Q  509 g-tcctcttttctctacccttttctcctcttgctcc 543  Q
    | ||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  89690 gttccacttctctctaacccttt-tcctcttgctcc 89656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 90131 - 90054
Alignment:
Q  50 acccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||    
T  90131 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaat 90054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 197477 - 197147
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac 212  Q
    |||||| |||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||  | ||||||     
T  197477 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaa 197378  T
Q  213 caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca 311  Q
    || || ||||||| || ||||  ||| |  |||  |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||  || | || |||||||||  |||||    
T  197377 catttagagcataatt-caacttataacactttcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaaca 197279  T
Q  312 tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag 410  Q
    |  ||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| || |||     
T  197278 tatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaacaattaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa 197180  T
Q  411 tgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  197179 tgattatgattgaattctaacccccttacctta 197147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1241
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-t 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || |||  |    
T  1370 catcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatat 1273  T
Q  412 gattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1272 gattatgatgaattctaacccccttaccttag 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9625 - 9496
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-t 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || |||  |    
T  9625 catcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatat 9528  T
Q  412 gattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9527 gattatgatgaattctaacccccttaccttag 9496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 336
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6907
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||  |  |||||||||    
T  6634 aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttaggagtaacaacatc 6733  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg 261  Q
     ||||| |||||  |||| ||||||| | ||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| | || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  6734 aattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg 6832  T
Q  262 taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt 336  Q
     ||||  || ||||||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  6833 aaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt 6907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 11017 - 11438
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaatt-gagcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| ||||   ||| |    
T  11017 aatatcacaatccatcaatttgagcaaaactcacaagtacccatttttac-aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaa 11115  T
Q  112 tacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
     ||| ||||||||||| |  | ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||| ||| |||| ||||    
T  11116 cacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttca 11215  T
Q  212 ccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac 310  Q
     | ||| ||||||| || ||||| |||||  |||  || |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||  ||  ||||| |||  ||||    
T  11216 actatttgagcataatt-caacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaac 11314  T
Q  311 atgccatcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat 407  Q
    ||  |||||||||| || || ||||||| | || |||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || |    
T  11315 atatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacact 11412  T
Q  408 aagtgattatgatgaattctaacccc 433  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  11413 aaatgattatgatgaattataacccc 11438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89584
Alignment:
Q  151 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca 222  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  89655 aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca 89584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 433
Target Start/End: Original strand, 79549 - 79883
Alignment:
Q  100 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||   |  |||| |||| | ||||||||    
T  79549 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca 79648  T
Q  200 taacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc 298  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||  ||||  |  || |  ||   ||||||| ||||||| ||||  || | |||||| |||||  ||   || |||    
T  79649 tatcataattcaaccaattaagcata-attcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttc 79747  T
Q  299 atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- 396  Q
    || |||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || ||||||||     
T  79748 atgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattga 79845  T
Q  397 aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccc 433  Q
    |||||| || | || | |||||||||||||||||||||    
T  79846 aaaattacactaaaataattatgatgaattctaacccc 79883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1439
Alignment:
Q  272 aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat 371  Q
    ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1611 aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat 1513  T
Q  372 taagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| || || | || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1512 taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttag 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8584
Alignment:
Q  272 aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat 371  Q
    ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8756 aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat 8658  T
Q  372 taagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| || || | || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8657 taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttag 8584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 535
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11111
Alignment:
Q  315 catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag-tg 412  Q
    |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||  ||    
T  10887 catcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattatactaaaatg 10984  T
Q  413 attatgatgaattctaacccccttatc----ttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  10985 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-cctctagctctagcttcacttttgctcctagctc-tctcccaatctttgatccttcaa 11082  T
Q  509 g-tcctcttttctct-acccttttctcct 535  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11083 gttcctcttctctctaaccattttctcct 11111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 31073 - 31373
Alignment:
Q  143 cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga-gcatattttcaacacatatcca 241  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||| |||||| || |||||| || || | ||||| || ||||| ||| |      
T  31073 cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataatt-caacatataacac 31171  T
Q  242 tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc 341  Q
    |||  |||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||  ||   || ||||| |||  ||| ||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  31172 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaac 31271  T
Q  342 atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttat 438  Q
    |  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  31272 aactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttac 31369  T
Q  439 ctta 442  Q
    ||||    
T  31370 ctta 31373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2572
Alignment:
Q  54 attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | || ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||||    
T  2419 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 2518  T
Q  154 aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataa 207  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| |||||    
T  2519 aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 282 - 436
Alignment:
Q  63 aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc 162  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||||| |||   ||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  282 aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatc 381  T
Q  163 cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt 217  Q
     ||||| |||||  |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  382 aattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51389 - 51312
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca 222  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51389 cttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca 51312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 147478 - 147590
Alignment:
Q  13 aatatcccaatccagcaattga-gcaaaattcataagtacccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||  | || ||||| ||| || ||| |    
T  147478 aatatcccaatccaacaatttaagcaaaactcataagtacccattttcaccaaac---caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaa 147574  T
Q  112 tacccaagccatgaat 127  Q
     |||||||||||||||    
T  147575 cacccaagccatgaat 147590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43884 - 43692
Alignment:
Q  251 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 350  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||   || ||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||    
T  43884 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaa 43785  T
Q  351 caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaacccccttatctta 442  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || || ||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43784 caattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 43692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 41666 - 41778
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    |||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| || |    
T  41666 atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa 41765  T
Q  207 attcaccaattga 219  Q
    |||||||||||||    
T  41766 attcaccaattga 41778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22443 - 22322
Alignment:
Q  323 ttagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataatt-gaaaattgcaat-aagtgattatga 419  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||| || |||||||  |||||  || | || |||||||||    
T  22443 ttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaa-tcatccaattaatcacttattcatac-aataattaaaaaataacactaaaatgattatga 22346  T
Q  420 tgaattctaacccccttatcttag 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  22345 tgaattctaacccccttaccttag 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 13524 - 13639
Alignment:
Q  107 atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata 206  Q
    ||||||||||||| ||||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||| |||| | |||||||||| || |    
T  13524 atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa 13623  T
Q  207 attcaccaattgagca 222  Q
    ||||| ||||||||||    
T  13624 attcatcaattgagca 13639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4726
Alignment:
Q  113 acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca 211  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||  |||||||||||||||||| ||| | |||||  |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4628 acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattca 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22110
Alignment:
Q  145 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata 201  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  22054 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacata 22110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University